View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20733_high_1 (Length: 574)

Name: NF20733_high_1
Description: NF20733
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20733_high_1
NF20733_high_1
[»] chr6 (199 HSPs)
chr6 (15-551)||(13913020-13913563)
chr6 (15-551)||(5845055-5845632)
chr6 (107-551)||(18834409-18834859)
chr6 (129-551)||(18826035-18826463)
chr6 (22-551)||(31572385-31572938)
chr6 (15-551)||(16123189-16123762)
chr6 (22-546)||(9933341-9933891)
chr6 (129-551)||(29765507-29765934)
chr6 (15-375)||(13928341-13928702)
chr6 (129-551)||(27166240-27166667)
chr6 (18-551)||(25787671-25788231)
chr6 (18-551)||(12827662-12828223)
chr6 (31-551)||(18925424-18925988)
chr6 (130-551)||(22308761-22309189)
chr6 (18-551)||(8653631-8654208)
chr6 (129-551)||(4292697-4293125)
chr6 (31-551)||(7375437-7375984)
chr6 (130-551)||(17745562-17746007)
chr6 (32-551)||(20029584-20030130)
chr6 (32-551)||(20062335-20062881)
chr6 (22-551)||(25518661-25519231)
chr6 (129-551)||(11147044-11147476)
chr6 (22-546)||(17741355-17741922)
chr6 (22-551)||(17042591-17043149)
chr6 (32-551)||(31542594-31543125)
chr6 (32-551)||(9122828-9123359)
chr6 (18-551)||(28251246-28251790)
chr6 (18-551)||(26044183-26044709)
chr6 (32-551)||(9112191-9112722)
chr6 (18-551)||(7750917-7751462)
chr6 (32-551)||(12854990-12855521)
chr6 (32-551)||(12865516-12866047)
chr6 (130-551)||(17064164-17064592)
chr6 (32-551)||(3661352-3661882)
chr6 (32-551)||(3672016-3672546)
chr6 (130-546)||(25686547-25686969)
chr6 (128-551)||(25986051-25986483)
chr6 (32-551)||(34806856-34807387)
chr6 (32-551)||(17984405-17984937)
chr6 (32-551)||(33199297-33199827)
chr6 (32-551)||(34817488-34818019)
chr6 (32-551)||(26864757-26865288)
chr6 (32-551)||(32961625-32962156)
chr6 (32-551)||(16959591-16960121)
chr6 (129-527)||(25735353-25735758)
chr6 (32-551)||(29384721-29385251)
chr6 (15-300)||(16122891-16123183)
chr6 (32-551)||(26875381-26875912)
chr6 (32-551)||(32972244-32972775)
chr6 (32-551)||(26025428-26025959)
chr6 (32-551)||(26036002-26036533)
chr6 (32-551)||(27341663-27342194)
chr6 (32-551)||(27402403-27402934)
chr6 (32-551)||(27413062-27413593)
chr6 (163-551)||(27505911-27506309)
chr6 (212-551)||(28356591-28356937)
chr6 (129-527)||(25679233-25679638)
chr6 (163-551)||(27372801-27373199)
chr6 (163-551)||(27463151-27463549)
chr6 (32-551)||(16930420-16930933)
chr6 (129-481)||(25675208-25675562)
chr6 (31-551)||(27474815-27475347)
chr6 (31-551)||(27384402-27384934)
chr6 (31-551)||(27504314-27504846)
chr6 (129-433)||(25722753-25723059)
chr6 (32-551)||(17982216-17982728)
chr6 (32-551)||(31982305-31982853)
chr6 (175-418)||(6158317-6158561)
chr6 (107-546)||(19289156-19289600)
chr6 (29-546)||(18498596-18499139)
chr6 (256-551)||(4630842-4631146)
chr6 (256-551)||(32300966-32301270)
chr6 (256-551)||(32311655-32311959)
chr6 (30-546)||(18555246-18555788)
chr6 (32-288)||(9321-9580)
chr6 (212-551)||(12716712-12717062)
chr6 (212-551)||(12727361-12727711)
chr6 (286-546)||(31931399-31931664)
chr6 (332-546)||(12953130-12953351)
chr6 (332-546)||(11205922-11206142)
chr6 (285-546)||(11235475-11235741)
chr6 (285-481)||(7586210-7586405)
chr6 (31-163)||(25800718-25800851)
chr6 (18-118)||(10547420-10547520)
chr6 (285-481)||(21128128-21128323)
chr6 (132-294)||(32761730-32761894)
chr6 (15-118)||(17745379-17745482)
chr6 (332-481)||(17608405-17608554)
chr6 (129-280)||(17577591-17577744)
chr6 (332-481)||(20635620-20635771)
chr6 (22-123)||(29765974-29766077)
chr6 (18-195)||(10971209-10971387)
chr6 (18-118)||(17577446-17577546)
chr6 (22-123)||(18825891-18825994)
chr6 (285-481)||(17047601-17047795)
chr6 (332-433)||(22386751-22386854)
chr6 (31-118)||(30119926-30120014)
chr6 (31-118)||(32761594-32761682)
chr6 (22-104)||(4293186-4293268)
chr6 (22-107)||(22309249-22309335)
chr6 (18-118)||(10402767-10402868)
chr6 (22-107)||(27166097-27166182)
chr6 (18-105)||(12382367-12382454)
chr6 (29-118)||(25735216-25735307)
chr6 (344-466)||(29917933-29918056)
chr6 (348-481)||(14051495-14051629)
chr6 (29-118)||(25686393-25686483)
chr6 (22-106)||(31931881-31931965)
chr6 (29-118)||(25675608-25675699)
chr6 (29-118)||(25679684-25679775)
chr6 (29-118)||(25722616-25722707)
chr6 (29-118)||(12952790-12952882)
chr6 (32-155)||(18726630-18726754)
chr6 (344-448)||(9717777-9717882)
chr6 (348-480)||(14070176-14070309)
chr6 (18-118)||(25986527-25986628)
chr6 (22-106)||(11206403-11206487)
chr6 (22-106)||(11235956-11236040)
chr6 (18-105)||(11146898-11146985)
chr6 (344-466)||(15954619-15954742)
chr6 (22-118)||(17064640-17064738)
chr6 (426-551)||(26022888-26023020)
chr6 (22-118)||(30401269-30401366)
chr6 (344-448)||(32544199-32544304)
chr6 (31-103)||(27373225-27373297)
chr6 (31-103)||(27463575-27463647)
chr6 (31-103)||(27506335-27506407)
chr6 (344-438)||(16877157-16877252)
chr6 (344-448)||(20488028-20488133)
chr6 (344-448)||(20730814-20730919)
chr6 (480-551)||(12353525-12353597)
chr6 (22-90)||(18834304-18834372)
chr6 (344-415)||(22076517-22076589)
chr6 (344-415)||(22802108-22802180)
chr6 (344-415)||(14100550-14100620)
chr6 (344-398)||(12423246-12423300)
chr6 (344-429)||(19623932-19624018)
chr6 (344-448)||(21235058-21235164)
chr6 (344-448)||(16265260-16265365)
chr6 (344-397)||(19066128-19066181)
chr6 (344-448)||(19086092-19086197)
chr6 (344-415)||(13435499-13435571)
chr6 (348-415)||(15531738-15531806)
chr6 (344-415)||(16336094-16336166)
chr6 (344-415)||(17381488-17381560)
chr6 (344-415)||(18435523-18435595)
chr6 (32-118)||(11049011-11049098)
chr6 (33-118)||(12716496-12716582)
chr6 (33-118)||(12727145-12727231)
chr6 (339-377)||(19625814-19625852)
chr6 (344-448)||(21618177-21618283)
chr6 (347-424)||(25594026-25594104)
chr6 (344-398)||(26589584-26589638)
chr6 (344-398)||(26972336-26972390)
chr6 (32-113)||(28573135-28573217)
chr6 (344-398)||(33352036-33352090)
chr6 (22-71)||(19289034-19289083)
chr6 (344-448)||(24116762-24116867)
chr6 (344-415)||(17316635-17316707)
chr6 (129-204)||(12952928-12953002)
chr6 (344-466)||(23284480-23284603)
chr6 (344-417)||(19482717-19482791)
chr6 (344-398)||(21625086-21625140)
chr6 (344-382)||(26943577-26943615)
chr6 (344-381)||(12348995-12349032)
chr6 (344-448)||(15302134-15302239)
chr6 (147-204)||(31931747-31931804)
chr6 (32-95)||(1905316-1905380)
chr6 (107-155)||(31931812-31931860)
chr6 (344-448)||(19833143-19833247)
chr6 (98-193)||(4631205-4631302)
chr6 (339-377)||(25592623-25592661)
chr6 (106-140)||(26589862-26589896)
chr6 (340-377)||(7812016-7812053)
chr6 (344-377)||(10640529-10640562)
chr6 (107-144)||(11235898-11235935)
chr6 (344-397)||(12715530-12715583)
chr6 (344-397)||(13602158-13602211)
chr6 (334-371)||(18172134-18172171)
chr6 (344-397)||(18378300-18378353)
chr6 (40-73)||(21235434-21235467)
chr6 (38-118)||(22527839-22527920)
chr6 (123-172)||(30401389-30401438)
chr6 (38-118)||(32300698-32300779)
chr6 (98-155)||(32300793-32300850)
chr6 (38-118)||(32311387-32311468)
chr6 (98-155)||(32311482-32311539)
chr6 (32-60)||(3383589-3383617)
chr6 (32-60)||(9772605-9772633)
chr6 (107-155)||(11206334-11206382)
chr6 (32-60)||(11992565-11992593)
chr6 (341-377)||(12348099-12348135)
chr6 (32-60)||(13055942-13055970)
chr6 (76-140)||(16264996-16265060)
chr6 (108-140)||(16877452-16877484)
chr6 (339-371)||(19875844-19875876)
chr6 (76-140)||(20730550-20730614)
chr6 (37-73)||(21128569-21128605)
chr6 (76-140)||(21235352-21235416)
[»] chr3 (238 HSPs)
chr3 (15-551)||(27883404-27883963)
chr3 (15-551)||(28169102-28169646)
chr3 (18-551)||(9390875-9391417)
chr3 (31-551)||(4404293-4404838)
chr3 (22-551)||(1053730-1054284)
chr3 (31-551)||(4456936-4457481)
chr3 (22-551)||(16076950-16077522)
chr3 (22-551)||(1064159-1064730)
chr3 (20-551)||(1783728-1784286)
chr3 (20-551)||(1794140-1794698)
chr3 (31-551)||(11216390-11216936)
chr3 (18-551)||(9380312-9380871)
chr3 (20-555)||(38314715-38315284)
chr3 (20-551)||(18851349-18851906)
chr3 (22-551)||(17281074-17281648)
chr3 (129-551)||(8739913-8740340)
chr3 (22-551)||(16670804-16671376)
chr3 (129-551)||(8995742-8996170)
chr3 (15-432)||(14321334-14321771)
chr3 (18-551)||(6490019-6490565)
chr3 (18-551)||(6500673-6501219)
chr3 (18-551)||(19887009-19887569)
chr3 (129-551)||(9006294-9006722)
chr3 (22-504)||(16665768-16666294)
chr3 (18-551)||(23635729-23636290)
chr3 (31-551)||(48337261-48337808)
chr3 (18-551)||(933647-934207)
chr3 (192-551)||(13261521-13261887)
chr3 (130-551)||(14581158-14581585)
chr3 (98-551)||(17909755-17910217)
chr3 (31-551)||(9535628-9536158)
chr3 (18-558)||(24706209-24706777)
chr3 (22-449)||(15216018-15216446)
chr3 (18-551)||(12237293-12237829)
chr3 (18-551)||(12249119-12249655)
chr3 (31-551)||(7804214-7804733)
chr3 (180-551)||(11163849-11164228)
chr3 (18-551)||(9993564-9994108)
chr3 (129-546)||(13199028-13199453)
chr3 (22-546)||(2246393-2246959)
chr3 (32-551)||(29460882-29461428)
chr3 (129-551)||(7794391-7794822)
chr3 (32-551)||(29471734-29472280)
chr3 (32-551)||(13382949-13383480)
chr3 (22-530)||(29933224-29933752)
chr3 (22-530)||(29982378-29982906)
chr3 (32-551)||(39672568-39673099)
chr3 (24-551)||(10626619-10627157)
chr3 (32-551)||(4174441-4174973)
chr3 (18-551)||(9981556-9982100)
chr3 (32-551)||(13372355-13372886)
chr3 (32-551)||(13393543-13394074)
chr3 (32-551)||(6220386-6220918)
chr3 (32-551)||(23757317-23757848)
chr3 (32-551)||(5520893-5521423)
chr3 (32-551)||(5536707-5537237)
chr3 (32-551)||(4743757-4744288)
chr3 (32-551)||(23647767-23648298)
chr3 (32-551)||(37759689-37760220)
chr3 (32-551)||(37866464-37866997)
chr3 (32-551)||(5510715-5511245)
chr3 (32-551)||(5547291-5547821)
chr3 (32-551)||(13121681-13122212)
chr3 (32-551)||(13131924-13132455)
chr3 (32-551)||(14465610-14466141)
chr3 (32-551)||(19778404-19778935)
chr3 (32-551)||(19789041-19789572)
chr3 (32-551)||(20672881-20673412)
chr3 (32-551)||(23767913-23768444)
chr3 (32-551)||(6180212-6180744)
chr3 (32-551)||(13557593-13558124)
chr3 (32-551)||(20683466-20683997)
chr3 (32-551)||(41683697-41684228)
chr3 (32-551)||(41694266-41694797)
chr3 (32-551)||(503853-504384)
chr3 (32-551)||(12286664-12287195)
chr3 (192-449)||(12567118-12567376)
chr3 (32-551)||(4754344-4754873)
chr3 (24-551)||(10654959-10655479)
chr3 (129-502)||(16391398-16391780)
chr3 (32-551)||(12296486-12297017)
chr3 (32-551)||(20721132-20721663)
chr3 (32-551)||(14476240-14476773)
chr3 (129-546)||(29947137-29947555)
chr3 (129-546)||(29996291-29996709)
chr3 (32-551)||(24383203-24383735)
chr3 (32-551)||(5865381-5865910)
chr3 (129-546)||(29905972-29906390)
chr3 (32-551)||(37885597-37886111)
chr3 (32-551)||(10099087-10099619)
chr3 (32-473)||(16476382-16476828)
chr3 (32-551)||(526200-526750)
chr3 (32-551)||(5579301-5579850)
chr3 (32-551)||(5627685-5628234)
chr3 (32-551)||(28313900-28314448)
chr3 (32-551)||(5875963-5876509)
chr3 (128-551)||(8774676-8775111)
chr3 (128-551)||(8785261-8785696)
chr3 (32-551)||(24659919-24660468)
chr3 (32-551)||(35187396-35187945)
chr3 (32-551)||(18484063-18484612)
chr3 (32-551)||(28324516-28325064)
chr3 (32-551)||(24670499-24671048)
chr3 (32-551)||(38194743-38195293)
chr3 (32-551)||(38205279-38205829)
chr3 (129-377)||(16348418-16348669)
chr3 (32-551)||(11272050-11272600)
chr3 (32-551)||(39372072-39372622)
chr3 (161-551)||(39382709-39383109)
chr3 (15-155)||(14254048-14254188)
chr3 (32-371)||(16493245-16493587)
chr3 (22-546)||(21736136-21736702)
chr3 (332-546)||(15651059-15651279)
chr3 (332-546)||(15662694-15662914)
chr3 (285-482)||(51989086-51989283)
chr3 (22-118)||(15226641-15226737)
chr3 (291-528)||(31113935-31114177)
chr3 (332-481)||(10529247-10529397)
chr3 (18-155)||(11167915-11168053)
chr3 (285-481)||(27172928-27173123)
chr3 (332-479)||(41045646-41045793)
chr3 (29-204)||(15662372-15662567)
chr3 (412-548)||(16386096-16386239)
chr3 (129-248)||(9092151-9092270)
chr3 (22-107)||(8758141-8758225)
chr3 (22-123)||(14581620-14581723)
chr3 (332-481)||(15850909-15851061)
chr3 (32-403)||(16487067-16487441)
chr3 (22-104)||(8995597-8995679)
chr3 (291-481)||(22151146-22151336)
chr3 (332-430)||(15833355-15833455)
chr3 (22-105)||(8739769-8739852)
chr3 (22-105)||(9092007-9092090)
chr3 (332-481)||(51340911-51341062)
chr3 (22-99)||(9006149-9006226)
chr3 (29-195)||(15650737-15650923)
chr3 (22-118)||(23680058-23680157)
chr3 (22-118)||(24052295-24052394)
chr3 (332-433)||(17021975-17022078)
chr3 (25-118)||(29905832-29905926)
chr3 (25-118)||(29946997-29947091)
chr3 (25-118)||(29996151-29996245)
chr3 (22-102)||(13198884-13198964)
chr3 (32-143)||(13604699-13604811)
chr3 (384-517)||(17961406-17961545)
chr3 (32-118)||(7607994-7608081)
chr3 (344-481)||(45861693-45861831)
chr3 (130-294)||(18006570-18006734)
chr3 (31-103)||(17961853-17961925)
chr3 (384-517)||(18006351-18006490)
chr3 (18-119)||(16348273-16348375)
chr3 (344-448)||(2561121-2561226)
chr3 (344-448)||(40799807-40799912)
chr3 (31-118)||(16391265-16391353)
chr3 (32-143)||(19531711-19531823)
chr3 (332-429)||(12752728-12752827)
chr3 (332-481)||(13148166-13148317)
chr3 (363-481)||(49990161-49990280)
chr3 (31-105)||(7794258-7794332)
chr3 (344-448)||(5213511-5213615)
chr3 (344-448)||(24775655-24775760)
chr3 (344-448)||(47405542-47405647)
chr3 (18-105)||(12858433-12858520)
chr3 (344-466)||(47207621-47207744)
chr3 (344-398)||(12726351-12726405)
chr3 (344-398)||(53056848-53056902)
chr3 (344-424)||(11909145-11909226)
chr3 (130-294)||(17961625-17961789)
chr3 (344-396)||(25398376-25398428)
chr3 (344-410)||(21605775-21605842)
chr3 (344-398)||(6090716-6090770)
chr3 (344-398)||(11868253-11868307)
chr3 (344-398)||(18121743-18121797)
chr3 (344-398)||(18142873-18142927)
chr3 (344-398)||(22140748-22140802)
chr3 (344-398)||(29855393-29855447)
chr3 (344-448)||(2784998-2785102)
chr3 (344-397)||(21636791-21636844)
chr3 (344-448)||(28582039-28582144)
chr3 (347-415)||(30054341-30054410)
chr3 (344-415)||(1728136-1728208)
chr3 (344-396)||(16032511-16032563)
chr3 (31-98)||(17909670-17909737)
chr3 (32-118)||(39383189-39383276)
chr3 (344-395)||(49553610-49553661)
chr3 (344-382)||(12388993-12389031)
chr3 (344-398)||(20646138-20646192)
chr3 (344-398)||(38177764-38177818)
chr3 (344-398)||(46796488-46796542)
chr3 (344-429)||(49666526-49666612)
chr3 (344-448)||(14955361-14955465)
chr3 (344-424)||(16658739-16658820)
chr3 (344-448)||(20627552-20627657)
chr3 (344-448)||(33583163-33583267)
chr3 (344-424)||(49642883-49642964)
chr3 (97-144)||(16391349-16391396)
chr3 (31-70)||(18006790-18006829)
chr3 (107-157)||(8758245-8758295)
chr3 (37-118)||(8775155-8775237)
chr3 (37-118)||(8785740-8785822)
chr3 (344-398)||(9700157-9700211)
chr3 (344-398)||(11223548-11223601)
chr3 (344-429)||(14393125-14393211)
chr3 (347-397)||(37412590-37412640)
chr3 (75-140)||(14392846-14392911)
chr3 (344-424)||(31303343-31303424)
chr3 (352-408)||(16812201-16812257)
chr3 (123-195)||(23680180-23680251)
chr3 (123-195)||(24052417-24052488)
chr3 (32-95)||(27244808-27244872)
chr3 (76-139)||(47405292-47405356)
chr3 (344-410)||(21640838-21640905)
chr3 (344-410)||(37467304-37467371)
chr3 (344-398)||(12963206-12963260)
chr3 (344-398)||(13780705-13780759)
chr3 (79-118)||(27173301-27173342)
chr3 (344-398)||(52920390-52920444)
chr3 (75-140)||(6090986-6091051)
chr3 (344-377)||(12968311-12968344)
chr3 (28-73)||(13148615-13148660)
chr3 (363-415)||(13824044-13824097)
chr3 (75-140)||(15903453-15903518)
chr3 (75-140)||(19249253-19249318)
chr3 (40-73)||(20627269-20627302)
chr3 (344-396)||(46349965-46350018)
chr3 (75-140)||(52920659-52920724)
chr3 (334-378)||(10851811-10851855)
chr3 (76-140)||(11223801-11223865)
chr3 (32-60)||(14392332-14392360)
chr3 (32-60)||(15094015-15094043)
chr3 (339-371)||(16880026-16880058)
chr3 (32-60)||(21155862-21155890)
chr3 (32-60)||(30399342-30399370)
chr3 (107-143)||(31113738-31113774)
chr3 (32-60)||(33773503-33773531)
chr3 (123-155)||(38177560-38177592)
chr3 (32-60)||(40288684-40288712)
chr3 (37-73)||(51988794-51988830)
[»] chr2 (151 HSPs)
chr2 (15-551)||(27978055-27978615)
chr2 (15-551)||(28064584-28065144)
chr2 (15-551)||(38585758-38586320)
chr2 (18-551)||(18768580-18769139)
chr2 (18-551)||(24414697-24415255)
chr2 (18-551)||(26867067-26867643)
chr2 (18-551)||(26879656-26880232)
chr2 (22-551)||(36784482-36785031)
chr2 (31-551)||(28721003-28721550)
chr2 (31-551)||(28731591-28732136)
chr2 (129-551)||(21172269-21172700)
chr2 (130-546)||(967309-967730)
chr2 (129-546)||(24275027-24275448)
chr2 (22-546)||(19497668-19498218)
chr2 (32-551)||(7005511-7006042)
chr2 (32-551)||(29244215-29244746)
chr2 (129-546)||(22774359-22774784)
chr2 (32-551)||(43093249-43093781)
chr2 (32-551)||(29254794-29255325)
chr2 (22-548)||(17968868-17969438)
chr2 (32-551)||(43082640-43083172)
chr2 (32-551)||(9773010-9773541)
chr2 (32-551)||(9897278-9897809)
chr2 (32-551)||(9907866-9908397)
chr2 (32-551)||(34477922-34478452)
chr2 (32-551)||(9762474-9763005)
chr2 (32-551)||(17857141-17857672)
chr2 (32-551)||(24327438-24327969)
chr2 (32-551)||(34789921-34790452)
chr2 (32-551)||(40222326-40222857)
chr2 (32-551)||(40251187-40251718)
chr2 (32-551)||(21650236-21650766)
chr2 (32-551)||(43355016-43355546)
chr2 (131-551)||(2561484-2561913)
chr2 (32-551)||(22914568-22915099)
chr2 (32-551)||(32217867-32218398)
chr2 (32-551)||(34804064-34804595)
chr2 (129-546)||(22763655-22764080)
chr2 (32-551)||(10266987-10267518)
chr2 (32-551)||(10277564-10278095)
chr2 (32-551)||(22960036-22960567)
chr2 (32-551)||(24338108-24338639)
chr2 (32-551)||(43345401-43345931)
chr2 (32-551)||(4209884-4210415)
chr2 (32-551)||(11388512-11389044)
chr2 (32-551)||(4220476-4221007)
chr2 (32-551)||(36251565-36252079)
chr2 (129-479)||(22779811-22780162)
chr2 (32-551)||(30488527-30489059)
chr2 (18-403)||(24425209-24425629)
chr2 (77-551)||(39169845-39170330)
chr2 (18-405)||(28374171-28374595)
chr2 (110-551)||(1098978-1099430)
chr2 (128-551)||(11394973-11395407)
chr2 (128-551)||(11405289-11405723)
chr2 (32-551)||(27221374-27221924)
chr2 (110-519)||(4099810-4100229)
chr2 (32-551)||(35274209-35274759)
chr2 (161-551)||(18392473-18392872)
chr2 (301-558)||(16768929-16769195)
chr2 (22-256)||(6081473-6081726)
chr2 (161-551)||(35252975-35253375)
chr2 (161-551)||(35263584-35263984)
chr2 (147-546)||(19312839-19313245)
chr2 (22-546)||(19356321-19356872)
chr2 (277-546)||(19299963-19300238)
chr2 (162-546)||(20646445-20646835)
chr2 (426-551)||(24427689-24427820)
chr2 (32-290)||(16777117-16777378)
chr2 (20-118)||(20417321-20417419)
chr2 (32-194)||(20070585-20070750)
chr2 (32-234)||(20236714-20236918)
chr2 (18-118)||(28379510-28379610)
chr2 (332-481)||(1083909-1084060)
chr2 (22-118)||(24275494-24275592)
chr2 (332-481)||(24814637-24814788)
chr2 (18-118)||(21172123-21172224)
chr2 (332-448)||(22755395-22755512)
chr2 (133-275)||(28379659-28379804)
chr2 (15-106)||(967156-967248)
chr2 (29-118)||(22764126-22764217)
chr2 (29-118)||(22774830-22774921)
chr2 (29-118)||(22780208-22780299)
chr2 (344-448)||(28711765-28711870)
chr2 (344-448)||(31800954-31801059)
chr2 (32-140)||(11394858-11394968)
chr2 (32-140)||(11405174-11405284)
chr2 (344-448)||(6574191-6574297)
chr2 (31-93)||(30795237-30795299)
chr2 (344-415)||(28550985-28551057)
chr2 (344-415)||(33074187-33074259)
chr2 (344-481)||(23392735-23392873)
chr2 (344-398)||(31968110-31968164)
chr2 (285-385)||(21025488-21025587)
chr2 (344-415)||(22776355-22776427)
chr2 (344-415)||(22781733-22781805)
chr2 (32-118)||(35253455-35253542)
chr2 (32-118)||(35264064-35264151)
chr2 (363-448)||(20152112-20152198)
chr2 (344-398)||(22802440-22802493)
chr2 (344-429)||(24377048-24377134)
chr2 (344-398)||(31328033-31328086)
chr2 (344-398)||(31334754-31334807)
chr2 (32-108)||(18392305-18392382)
chr2 (344-424)||(22188169-22188250)
chr2 (344-448)||(22317521-22317626)
chr2 (344-424)||(24575987-24576068)
chr2 (344-397)||(44840414-44840467)
chr2 (32-103)||(1098916-1098988)
chr2 (344-415)||(1587100-1587171)
chr2 (344-415)||(40332048-40332120)
chr2 (339-378)||(20568134-20568173)
chr2 (347-398)||(41121789-41121840)
chr2 (351-448)||(6392562-6392659)
chr2 (347-424)||(10009820-10009898)
chr2 (344-398)||(14581494-14581548)
chr2 (344-398)||(21537315-21537369)
chr2 (347-424)||(22258153-22258231)
chr2 (344-398)||(28701296-28701350)
chr2 (344-398)||(30557388-30557441)
chr2 (344-448)||(38781326-38781432)
chr2 (344-397)||(13964045-13964098)
chr2 (344-424)||(19540368-19540449)
chr2 (344-397)||(23234987-23235040)
chr2 (344-397)||(25037326-25037379)
chr2 (344-397)||(25041433-25041486)
chr2 (344-397)||(30666969-30667022)
chr2 (344-424)||(34322003-34322084)
chr2 (344-397)||(39037709-39037762)
chr2 (32-95)||(4100227-4100291)
chr2 (344-398)||(18376973-18377027)
chr2 (344-398)||(22455057-22455111)
chr2 (32-95)||(38208219-38208284)
chr2 (79-140)||(6573928-6573989)
chr2 (34-71)||(19297314-19297351)
chr2 (107-144)||(19297423-19297460)
chr2 (34-71)||(19312675-19312712)
chr2 (34-71)||(20646252-20646289)
chr2 (334-371)||(24440789-24440826)
chr2 (344-397)||(24779323-24779376)
chr2 (28-73)||(24814284-24814329)
chr2 (75-140)||(24850452-24850516)
chr2 (344-377)||(26619168-26619201)
chr2 (75-140)||(39037443-39037507)
chr2 (344-448)||(40782405-40782510)
chr2 (344-415)||(22785722-22785794)
chr2 (37-73)||(24793718-24793754)
chr2 (32-60)||(29699776-29699804)
chr2 (344-396)||(30621197-30621249)
chr2 (344-396)||(30623818-30623870)
chr2 (32-60)||(39169792-39169820)
[»] chr7 (180 HSPs)
chr7 (15-551)||(40054486-40055048)
chr7 (22-551)||(18441201-18441774)
chr7 (22-551)||(18419120-18419693)
chr7 (22-546)||(26209288-26209837)
chr7 (20-551)||(30049524-30050081)
chr7 (18-551)||(31116246-31116806)
chr7 (15-551)||(38593468-38594007)
chr7 (31-551)||(1367634-1368181)
chr7 (31-551)||(9170990-9171537)
chr7 (31-551)||(9159734-9160281)
chr7 (31-551)||(9170189-9170736)
chr7 (31-551)||(21769691-21770238)
chr7 (32-551)||(20491011-20491540)
chr7 (22-546)||(13682332-13682881)
chr7 (22-449)||(8933634-8934081)
chr7 (107-546)||(29590004-29590448)
chr7 (42-551)||(14745446-14745965)
chr7 (22-406)||(6043950-6044354)
chr7 (22-546)||(15216328-15216877)
chr7 (129-551)||(15888193-15888624)
chr7 (22-544)||(12733906-12734453)
chr7 (129-551)||(589217-589648)
chr7 (129-548)||(3476207-3476631)
chr7 (32-551)||(9433267-9433798)
chr7 (32-558)||(9443856-9444394)
chr7 (32-551)||(44280501-44281047)
chr7 (32-551)||(3165739-3166285)
chr7 (32-551)||(20989656-20990187)
chr7 (32-551)||(467347-467878)
chr7 (32-551)||(6866991-6867522)
chr7 (32-551)||(6877623-6878154)
chr7 (32-551)||(21002774-21003305)
chr7 (32-551)||(454565-455096)
chr7 (32-551)||(2705378-2705909)
chr7 (32-551)||(11096058-11096589)
chr7 (18-501)||(19985565-19986058)
chr7 (32-551)||(24930369-24930900)
chr7 (32-551)||(9085287-9085817)
chr7 (32-551)||(9095001-9095531)
chr7 (32-551)||(37344203-37344735)
chr7 (32-551)||(2715982-2716513)
chr7 (32-551)||(8617389-8617920)
chr7 (32-551)||(40041875-40042405)
chr7 (32-551)||(40052424-40052954)
chr7 (32-551)||(8627952-8628483)
chr7 (32-551)||(26653091-26653622)
chr7 (32-551)||(26699420-26699951)
chr7 (32-551)||(4222613-4223144)
chr7 (32-551)||(48710257-48710788)
chr7 (32-551)||(4212014-4212545)
chr7 (32-551)||(17949884-17950415)
chr7 (32-551)||(22089126-22089657)
chr7 (32-551)||(22099741-22100272)
chr7 (32-551)||(17960490-17961021)
chr7 (32-551)||(5685522-5686036)
chr7 (32-551)||(166885-167416)
chr7 (129-404)||(48382304-48382580)
chr7 (32-551)||(177477-178008)
chr7 (212-548)||(541091-541437)
chr7 (32-551)||(8001829-8002362)
chr7 (32-551)||(8012474-8013007)
chr7 (32-551)||(11005188-11005736)
chr7 (128-551)||(24734756-24735190)
chr7 (128-551)||(24744703-24745137)
chr7 (161-551)||(1987543-1987943)
chr7 (161-551)||(1998164-1998564)
chr7 (128-551)||(26389959-26390393)
chr7 (128-551)||(26400601-26401035)
chr7 (212-551)||(42865830-42866180)
chr7 (212-551)||(42876456-42876806)
chr7 (22-546)||(24882143-24882709)
chr7 (386-551)||(38403331-38403502)
chr7 (301-551)||(26294067-26294326)
chr7 (32-222)||(9261529-9261721)
chr7 (22-195)||(19193268-19193459)
chr7 (18-234)||(23264344-23264561)
chr7 (332-481)||(8999002-8999151)
chr7 (31-118)||(25201332-25201419)
chr7 (32-290)||(26290117-26290378)
chr7 (332-481)||(11087112-11087261)
chr7 (22-123)||(48382621-48382723)
chr7 (22-106)||(3476063-3476147)
chr7 (10-103)||(29590488-29590582)
chr7 (18-118)||(15888030-15888131)
chr7 (332-481)||(13174672-13174823)
chr7 (18-118)||(589693-589795)
chr7 (456-546)||(48382201-48382297)
chr7 (348-481)||(602661-602796)
chr7 (32-143)||(26389827-26389940)
chr7 (32-143)||(26400469-26400582)
chr7 (489-546)||(8933574-8933631)
chr7 (344-448)||(16112007-16112112)
chr7 (344-424)||(30944446-30944527)
chr7 (344-448)||(33691835-33691940)
chr7 (344-448)||(48237025-48237130)
chr7 (32-118)||(24244217-24244305)
chr7 (344-410)||(4821442-4821509)
chr7 (344-398)||(27871699-27871753)
chr7 (344-398)||(44467045-44467099)
chr7 (344-448)||(9069492-9069597)
chr7 (344-448)||(30945479-30945584)
chr7 (344-415)||(21283496-21283568)
chr7 (346-448)||(28622481-28622584)
chr7 (344-398)||(8182911-8182965)
chr7 (344-448)||(23280081-23280187)
chr7 (344-398)||(24788122-24788176)
chr7 (344-398)||(28409020-28409074)
chr7 (344-397)||(24794838-24794891)
chr7 (344-448)||(35952811-35952916)
chr7 (344-415)||(1292993-1293065)
chr7 (344-415)||(4494540-4494612)
chr7 (344-415)||(48806002-48806074)
chr7 (344-382)||(14426544-14426582)
chr7 (344-382)||(22578144-22578182)
chr7 (344-440)||(331583-331680)
chr7 (347-415)||(4412088-4412157)
chr7 (344-448)||(9709925-9710030)
chr7 (344-448)||(14193044-14193149)
chr7 (344-397)||(14425429-14425482)
chr7 (344-397)||(19339373-19339426)
chr7 (344-397)||(21692269-21692322)
chr7 (345-398)||(32264842-32264895)
chr7 (344-424)||(41842396-41842477)
chr7 (32-111)||(541511-541591)
chr7 (344-415)||(19711136-19711208)
chr7 (32-111)||(22493957-22494037)
chr7 (344-396)||(33605668-33605720)
chr7 (97-144)||(589650-589697)
chr7 (32-118)||(1988023-1988110)
chr7 (32-118)||(1998644-1998731)
chr7 (32-94)||(10561218-10561281)
chr7 (346-448)||(15467846-15467949)
chr7 (344-466)||(29935481-29935604)
chr7 (32-118)||(42866310-42866397)
chr7 (32-118)||(42876936-42877023)
chr7 (32-118)||(45922167-45922254)
chr7 (344-398)||(2265642-2265695)
chr7 (344-398)||(16316680-16316734)
chr7 (344-382)||(19237166-19237204)
chr7 (32-105)||(24450678-24450752)
chr7 (344-397)||(2913731-2913784)
chr7 (344-424)||(13138018-13138099)
chr7 (75-140)||(30026142-30026207)
chr7 (346-398)||(13894123-13894174)
chr7 (81-140)||(14425672-14425731)
chr7 (32-95)||(20311929-20311993)
chr7 (344-415)||(21695364-21695436)
chr7 (348-415)||(48062947-48063015)
chr7 (344-410)||(2500006-2500073)
chr7 (347-398)||(15704616-15704666)
chr7 (97-144)||(15888144-15888191)
chr7 (32-118)||(24735217-24735306)
chr7 (32-118)||(24745164-24745253)
chr7 (344-398)||(5000945-5000999)
chr7 (339-377)||(7488023-7488061)
chr7 (344-398)||(10883296-10883350)
chr7 (344-398)||(13018628-13018682)
chr7 (344-398)||(13260738-13260792)
chr7 (344-398)||(16310030-16310084)
chr7 (344-429)||(30025854-30025940)
chr7 (344-382)||(39284687-39284725)
chr7 (37-95)||(4821785-4821845)
chr7 (28-73)||(11086785-11086829)
chr7 (344-397)||(11319387-11319440)
chr7 (334-371)||(13172465-13172502)
chr7 (344-397)||(13302792-13302845)
chr7 (344-397)||(13648711-13648764)
chr7 (344-397)||(13880086-13880139)
chr7 (347-415)||(21381555-21381624)
chr7 (76-140)||(27871945-27872010)
chr7 (32-60)||(923311-923339)
chr7 (32-60)||(1193014-1193042)
chr7 (32-60)||(1776805-1776833)
chr7 (32-60)||(4347688-4347716)
chr7 (37-73)||(8998667-8998703)
chr7 (344-415)||(12174464-12174535)
chr7 (344-415)||(13730798-13730870)
chr7 (76-140)||(14426765-14426829)
chr7 (38-105)||(23649262-23649330)
chr7 (32-60)||(24095855-24095883)
[»] chr4 (157 HSPs)
chr4 (15-551)||(24713471-24714042)
chr4 (15-551)||(5873409-5873987)
chr4 (18-551)||(10695679-10696223)
chr4 (129-551)||(11535885-11536313)
chr4 (129-551)||(10300574-10301002)
chr4 (22-551)||(31266462-31267018)
chr4 (22-551)||(11515075-11515646)
chr4 (18-551)||(10909446-10909992)
chr4 (18-551)||(47151738-47152299)
chr4 (18-551)||(15207058-15207632)
chr4 (22-546)||(55651369-55651918)
chr4 (22-546)||(49001644-49002193)
chr4 (31-551)||(16317369-16317916)
chr4 (129-551)||(4987312-4987743)
chr4 (31-551)||(16305145-16305691)
chr4 (18-551)||(18077565-18078127)
chr4 (20-551)||(19581280-19581854)
chr4 (32-551)||(40454023-40454569)
chr4 (18-551)||(3390494-3391058)
chr4 (96-551)||(3370754-3371223)
chr4 (129-551)||(14835893-14836323)
chr4 (32-551)||(40470279-40470808)
chr4 (32-551)||(25657174-25657721)
chr4 (18-551)||(5022774-5023312)
chr4 (32-551)||(27814636-27815167)
chr4 (32-551)||(48371169-48371700)
chr4 (32-551)||(52703826-52704357)
chr4 (32-551)||(461195-461726)
chr4 (32-551)||(14843344-14843875)
chr4 (32-551)||(17918090-17918621)
chr4 (32-551)||(24027776-24028307)
chr4 (32-551)||(450614-451145)
chr4 (32-551)||(4948373-4948904)
chr4 (32-551)||(15560770-15561301)
chr4 (32-551)||(17928738-17929269)
chr4 (32-551)||(19954653-19955184)
chr4 (32-551)||(30926185-30926716)
chr4 (32-551)||(30936763-30937294)
chr4 (32-551)||(22007049-22007580)
chr4 (32-551)||(36018374-36018905)
chr4 (32-551)||(16266500-16267031)
chr4 (32-551)||(21996451-21996982)
chr4 (32-551)||(16255907-16256438)
chr4 (82-551)||(18752230-18752711)
chr4 (82-551)||(18762840-18763321)
chr4 (32-551)||(10740282-10740816)
chr4 (32-551)||(10954051-10954585)
chr4 (32-551)||(19944001-19944549)
chr4 (32-551)||(36028927-36029475)
chr4 (32-551)||(18129932-18130461)
chr4 (128-551)||(10750956-10751390)
chr4 (128-551)||(10964725-10965159)
chr4 (32-551)||(49518173-49518721)
chr4 (128-551)||(55745040-55745474)
chr4 (128-551)||(55755651-55756085)
chr4 (161-551)||(24640285-24640685)
chr4 (161-551)||(27656638-27657038)
chr4 (161-551)||(27667211-27667611)
chr4 (332-546)||(23509162-23509382)
chr4 (22-299)||(39525808-39526121)
chr4 (162-546)||(18006906-18007296)
chr4 (108-546)||(18774448-18774891)
chr4 (332-546)||(8997272-8997492)
chr4 (18-202)||(20648312-20648497)
chr4 (107-526)||(16819143-16819568)
chr4 (285-481)||(14778412-14778607)
chr4 (20-198)||(17198085-17198281)
chr4 (332-481)||(33378306-33378457)
chr4 (18-117)||(14835748-14835847)
chr4 (22-107)||(11519593-11519678)
chr4 (285-481)||(17993763-17993958)
chr4 (332-481)||(14710794-14710943)
chr4 (22-123)||(11536354-11536457)
chr4 (31-118)||(4987788-4987875)
chr4 (332-481)||(36210123-36210274)
chr4 (20-105)||(25009290-25009375)
chr4 (107-393)||(19243982-19244266)
chr4 (22-107)||(10301061-10301146)
chr4 (22-118)||(23509630-23509729)
chr4 (18-118)||(8182535-8182637)
chr4 (344-415)||(14604985-14605057)
chr4 (32-143)||(25089180-25089292)
chr4 (32-143)||(17276447-17276560)
chr4 (32-143)||(28066636-28066748)
chr4 (29-116)||(8996933-8997023)
chr4 (344-438)||(10692789-10692884)
chr4 (344-438)||(10906555-10906650)
chr4 (388-528)||(19242089-19242235)
chr4 (344-398)||(1672368-1672422)
chr4 (344-398)||(1674843-1674897)
chr4 (32-143)||(10750839-10750954)
chr4 (32-143)||(10964608-10964723)
chr4 (344-398)||(16853482-16853536)
chr4 (344-424)||(6517437-6517518)
chr4 (344-448)||(17398752-17398857)
chr4 (344-448)||(19884630-19884735)
chr4 (344-415)||(22190807-22190879)
chr4 (32-143)||(53442326-53442440)
chr4 (344-403)||(29121344-29121403)
chr4 (344-398)||(9751618-9751672)
chr4 (344-415)||(3105497-3105569)
chr4 (344-415)||(20977418-20977490)
chr4 (344-415)||(37435613-37435685)
chr4 (344-415)||(39419812-39419884)
chr4 (346-409)||(40860634-40860698)
chr4 (32-118)||(24640765-24640852)
chr4 (32-118)||(27657118-27657205)
chr4 (32-118)||(27667691-27667778)
chr4 (347-448)||(8105566-8105667)
chr4 (350-415)||(16848508-16848574)
chr4 (344-448)||(22675598-22675704)
chr4 (344-398)||(25651182-25651235)
chr4 (344-424)||(3395542-3395623)
chr4 (344-448)||(10072863-10072968)
chr4 (344-448)||(13576192-13576297)
chr4 (22-71)||(18774326-18774375)
chr4 (344-424)||(19911959-19912040)
chr4 (344-448)||(45833322-45833427)
chr4 (344-448)||(55380218-55380323)
chr4 (32-118)||(55744891-55744979)
chr4 (32-118)||(55755502-55755590)
chr4 (22-70)||(16819022-16819070)
chr4 (344-415)||(38513839-38513911)
chr4 (129-204)||(8997071-8997145)
chr4 (344-448)||(412929-413035)
chr4 (344-382)||(6641679-6641717)
chr4 (22-60)||(11542357-11542395)
chr4 (344-429)||(23750469-23750555)
chr4 (344-378)||(54679929-54679963)
chr4 (344-397)||(12811253-12811306)
chr4 (76-118)||(16819092-16819136)
chr4 (18-95)||(18752150-18752227)
chr4 (18-95)||(18762760-18762837)
chr4 (344-397)||(19666352-19666405)
chr4 (344-466)||(17247153-17247277)
chr4 (344-415)||(19621139-19621211)
chr4 (344-396)||(56533140-56533191)
chr4 (344-410)||(15475221-15475288)
chr4 (339-377)||(10661240-10661278)
chr4 (339-377)||(10875385-10875423)
chr4 (344-398)||(16632419-16632473)
chr4 (344-398)||(40846078-40846132)
chr4 (344-448)||(9140840-9140945)
chr4 (355-415)||(17700854-17700915)
chr4 (28-73)||(17993500-17993544)
chr4 (34-71)||(18006713-18006750)
chr4 (40-73)||(22675298-22675331)
chr4 (28-73)||(33378766-33378811)
chr4 (344-397)||(37985690-37985743)
chr4 (32-60)||(3188095-3188123)
chr4 (344-415)||(3499730-3499802)
chr4 (32-60)||(9914120-9914148)
chr4 (32-60)||(10088035-10088063)
chr4 (76-140)||(16940210-16940274)
chr4 (147-195)||(23509519-23509567)
chr4 (32-60)||(24651978-24652006)
chr4 (32-60)||(43346120-43346148)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (22-551)||(5298-5853)
scaffold0042 (22-354)||(12896-13265)
[»] chr1 (185 HSPs)
chr1 (23-551)||(18381623-18382161)
chr1 (20-551)||(39586918-39587475)
chr1 (15-551)||(17957189-17957762)
chr1 (15-551)||(9050166-9050745)
chr1 (34-551)||(20441031-20441575)
chr1 (32-551)||(4250294-4250823)
chr1 (129-546)||(14387955-14388378)
chr1 (129-551)||(11194897-11195325)
chr1 (129-551)||(47195210-47195641)
chr1 (31-551)||(39193805-39194352)
chr1 (129-546)||(18310801-18311224)
chr1 (18-551)||(35012870-35013413)
chr1 (129-549)||(7689284-7689715)
chr1 (129-544)||(675403-675822)
chr1 (32-551)||(147926-148472)
chr1 (32-551)||(154001-154547)
chr1 (130-528)||(41132446-41132849)
chr1 (32-551)||(4167206-4167737)
chr1 (32-531)||(5973732-5974259)
chr1 (32-551)||(5639439-5639970)
chr1 (32-551)||(12730494-12731025)
chr1 (32-551)||(12897712-12898243)
chr1 (32-551)||(5649996-5650527)
chr1 (32-551)||(12741087-12741618)
chr1 (32-551)||(21877714-21878245)
chr1 (32-551)||(33084509-33085039)
chr1 (32-551)||(19178906-19179438)
chr1 (32-551)||(12614045-12614576)
chr1 (32-551)||(12623510-12624041)
chr1 (32-551)||(21863608-21864139)
chr1 (277-551)||(20195670-20195949)
chr1 (110-551)||(23580134-23580586)
chr1 (131-404)||(12946818-12947091)
chr1 (32-551)||(36236158-36236689)
chr1 (32-551)||(36246705-36247236)
chr1 (32-551)||(2538483-2539013)
chr1 (32-551)||(3171569-3172101)
chr1 (32-551)||(3182171-3182703)
chr1 (32-551)||(10997513-10998044)
chr1 (32-551)||(4177862-4178376)
chr1 (32-551)||(19187785-19188298)
chr1 (98-551)||(21895149-21895613)
chr1 (22-546)||(46180581-46181131)
chr1 (32-551)||(38095023-38095555)
chr1 (32-551)||(38105648-38106180)
chr1 (32-551)||(51628898-51629447)
chr1 (89-551)||(5843767-5844241)
chr1 (128-551)||(7507249-7507683)
chr1 (128-551)||(7517846-7518280)
chr1 (128-551)||(51656274-51656708)
chr1 (128-551)||(5833165-5833600)
chr1 (161-551)||(35648551-35648951)
chr1 (128-551)||(47607756-47608191)
chr1 (128-551)||(47618364-47618799)
chr1 (161-551)||(35401025-35401425)
chr1 (161-551)||(35404252-35404652)
chr1 (256-551)||(35637994-35638299)
chr1 (129-546)||(20883711-20884134)
chr1 (332-546)||(23926888-23927108)
chr1 (107-528)||(28474075-28474499)
chr1 (285-546)||(22609960-22610226)
chr1 (332-546)||(20798894-20799114)
chr1 (15-118)||(21165242-21165345)
chr1 (285-541)||(45070639-45070900)
chr1 (285-481)||(5929604-5929799)
chr1 (285-482)||(44200911-44201108)
chr1 (20-118)||(47195686-47195784)
chr1 (285-481)||(19037907-19038103)
chr1 (332-479)||(19170363-19170512)
chr1 (285-481)||(28379896-28380090)
chr1 (332-481)||(17370942-17371093)
chr1 (285-481)||(52350670-52350865)
chr1 (332-481)||(20251675-20251824)
chr1 (20-105)||(24252938-24253023)
chr1 (29-123)||(11194760-11194856)
chr1 (22-123)||(18310657-18310760)
chr1 (332-481)||(22019236-22019387)
chr1 (332-481)||(22655377-22655528)
chr1 (22-123)||(14387811-14387914)
chr1 (22-118)||(20799361-20799460)
chr1 (34-123)||(22609690-22609781)
chr1 (285-396)||(23064935-23065045)
chr1 (332-448)||(22642828-22642946)
chr1 (291-481)||(26548247-26548437)
chr1 (22-123)||(12947135-12947238)
chr1 (347-481)||(21543929-21544064)
chr1 (30-106)||(675882-675958)
chr1 (22-118)||(23927324-23927423)
chr1 (31-105)||(26577040-26577114)
chr1 (344-448)||(2327482-2327587)
chr1 (344-448)||(32785979-32786084)
chr1 (22-118)||(20883566-20883665)
chr1 (18-118)||(7689136-7689239)
chr1 (32-143)||(7507702-7507815)
chr1 (32-143)||(7518299-7518412)
chr1 (344-481)||(25448608-25448746)
chr1 (344-448)||(1900278-1900383)
chr1 (344-448)||(22464851-22464956)
chr1 (344-415)||(36134156-36134228)
chr1 (32-143)||(51656158-51656272)
chr1 (344-398)||(22153841-22153895)
chr1 (344-398)||(35040150-35040204)
chr1 (344-448)||(22600224-22600329)
chr1 (344-415)||(21702780-21702852)
chr1 (110-290)||(30291884-30292066)
chr1 (349-448)||(38282500-38282600)
chr1 (344-398)||(2268515-2268569)
chr1 (22-72)||(20866995-20867045)
chr1 (344-398)||(22427399-22427453)
chr1 (344-429)||(30572149-30572235)
chr1 (344-398)||(37642232-37642286)
chr1 (344-424)||(7745132-7745213)
chr1 (367-431)||(24028751-24028816)
chr1 (344-415)||(19215578-19215650)
chr1 (346-409)||(21121108-21121172)
chr1 (344-415)||(21135202-21135274)
chr1 (344-415)||(23024754-23024826)
chr1 (344-448)||(39201034-39201137)
chr1 (344-415)||(46088955-46089027)
chr1 (32-118)||(5833644-5833731)
chr1 (344-398)||(14263493-14263548)
chr1 (32-118)||(35400858-35400945)
chr1 (32-118)||(35404085-35404172)
chr1 (32-118)||(35648384-35648471)
chr1 (32-118)||(47607625-47607712)
chr1 (32-118)||(47618233-47618320)
chr1 (344-398)||(2267073-2267127)
chr1 (344-398)||(44821587-44821641)
chr1 (344-398)||(48570273-48570327)
chr1 (344-448)||(10757354-10757459)
chr1 (107-172)||(20799290-20799354)
chr1 (344-448)||(28492446-28492551)
chr1 (344-448)||(29215730-29215835)
chr1 (344-424)||(33256393-33256474)
chr1 (344-424)||(33276565-33276646)
chr1 (344-415)||(16235338-16235410)
chr1 (32-111)||(19063523-19063603)
chr1 (344-415)||(21191907-21191979)
chr1 (344-415)||(21204965-21205036)
chr1 (344-448)||(23036569-23036676)
chr1 (344-410)||(35401779-35401847)
chr1 (32-118)||(35637732-35637819)
chr1 (344-398)||(10250970-10251024)
chr1 (500-546)||(20867059-20867105)
chr1 (344-397)||(1577852-1577905)
chr1 (344-397)||(22201778-22201831)
chr1 (347-415)||(34255561-34255630)
chr1 (347-398)||(2834673-2834725)
chr1 (344-396)||(12613856-12613908)
chr1 (32-95)||(21895633-21895697)
chr1 (32-103)||(30291822-30291894)
chr1 (344-415)||(42284594-42284666)
chr1 (97-144)||(7689235-7689282)
chr1 (106-204)||(19170141-19170236)
chr1 (343-397)||(20954514-20954568)
chr1 (344-397)||(21984580-21984634)
chr1 (344-398)||(26702171-26702225)
chr1 (76-106)||(45070394-45070424)
chr1 (32-95)||(46686593-46686658)
chr1 (344-448)||(7309753-7309857)
chr1 (79-140)||(12284693-12284754)
chr1 (344-377)||(18896639-18896672)
chr1 (28-73)||(22019685-22019729)
chr1 (131-172)||(22609824-22609865)
chr1 (28-73)||(22655827-22655872)
chr1 (334-375)||(23054373-23054414)
chr1 (40-73)||(25448243-25448276)
chr1 (28-73)||(26547943-26547988)
chr1 (344-424)||(30893049-30893130)
chr1 (40-140)||(35040404-35040505)
chr1 (34-71)||(45070336-45070373)
chr1 (28-73)||(52350407-52350451)
chr1 (76-140)||(2267310-2267374)
chr1 (32-60)||(5242113-5242141)
chr1 (32-60)||(5844288-5844316)
chr1 (506-546)||(5929534-5929574)
chr1 (32-60)||(11736882-11736910)
chr1 (32-60)||(11976373-11976401)
chr1 (37-73)||(23065283-23065319)
chr1 (32-60)||(23359080-23359108)
chr1 (107-155)||(23927269-23927317)
chr1 (32-60)||(25057000-25057028)
chr1 (32-60)||(36536809-36536837)
chr1 (506-546)||(44200841-44200881)
chr1 (107-155)||(45070445-45070492)
[»] chr5 (214 HSPs)
chr5 (22-551)||(105896-106453)
chr5 (18-551)||(34062395-34062954)
chr5 (18-551)||(34051734-34052293)
chr5 (31-551)||(21705901-21706448)
chr5 (31-551)||(17446622-17447185)
chr5 (31-551)||(17457238-17457801)
chr5 (31-551)||(21703054-21703584)
chr5 (18-551)||(34782649-34783191)
chr5 (18-551)||(37406414-37406982)
chr5 (31-551)||(36084249-36084796)
chr5 (18-551)||(34771704-34772246)
chr5 (31-558)||(24926058-24926612)
chr5 (22-551)||(20624527-20625099)
chr5 (22-481)||(21414201-21414697)
chr5 (32-548)||(42394786-42395311)
chr5 (18-551)||(23406221-23406781)
chr5 (18-551)||(43043596-43044157)
chr5 (132-551)||(19477908-19478336)
chr5 (31-551)||(36228527-36229074)
chr5 (18-551)||(20797470-20798031)
chr5 (132-551)||(19463878-19464306)
chr5 (22-546)||(20416681-20417230)
chr5 (18-551)||(10754284-10754828)
chr5 (31-551)||(20551603-20552150)
chr5 (129-551)||(24983346-24983777)
chr5 (32-551)||(8521630-8522176)
chr5 (32-551)||(1109071-1109617)
chr5 (32-551)||(27622691-27623222)
chr5 (129-551)||(31448456-31448889)
chr5 (32-551)||(1121829-1122375)
chr5 (32-551)||(27603342-27603873)
chr5 (129-551)||(31418565-31418998)
chr5 (129-551)||(20562244-20562660)
chr5 (129-551)||(30069831-30070262)
chr5 (32-551)||(22146326-22146857)
chr5 (32-551)||(9335761-9336291)
chr5 (32-551)||(9346348-9346878)
chr5 (31-481)||(43621862-43622343)
chr5 (32-551)||(5290500-5291031)
chr5 (32-551)||(7032050-7032583)
chr5 (32-551)||(15993253-15993784)
chr5 (32-551)||(22156909-22157440)
chr5 (32-551)||(31843764-31844295)
chr5 (32-551)||(39352293-39352824)
chr5 (32-551)||(15693956-15694486)
chr5 (32-551)||(24566895-24567425)
chr5 (32-551)||(16003815-16004346)
chr5 (32-551)||(40400824-40401355)
chr5 (129-548)||(32753875-32754302)
chr5 (32-551)||(6130594-6131125)
chr5 (32-551)||(9377386-9377917)
chr5 (32-551)||(23306650-23307181)
chr5 (32-551)||(24816810-24817341)
chr5 (32-551)||(24827398-24827929)
chr5 (32-551)||(40390162-40390693)
chr5 (32-551)||(24807718-24808248)
chr5 (32-551)||(30227422-30227952)
chr5 (32-551)||(30237949-30238479)
chr5 (32-551)||(42042590-42043120)
chr5 (32-551)||(42053165-42053695)
chr5 (32-551)||(14557941-14558473)
chr5 (32-551)||(14568578-14569110)
chr5 (32-551)||(23296082-23296613)
chr5 (32-551)||(23361915-23362447)
chr5 (32-551)||(27459966-27460497)
chr5 (32-551)||(27470365-27470896)
chr5 (32-551)||(6986102-6986634)
chr5 (32-551)||(14029848-14030380)
chr5 (32-551)||(14040401-14040933)
chr5 (32-551)||(39502064-39502594)
chr5 (88-551)||(23707305-23707778)
chr5 (32-551)||(27203615-27204129)
chr5 (32-551)||(35215310-35215842)
chr5 (163-551)||(22559376-22559773)
chr5 (123-551)||(36582482-36582921)
chr5 (123-551)||(36593037-36593476)
chr5 (32-551)||(5301071-5301590)
chr5 (32-418)||(39362119-39362509)
chr5 (18-406)||(23392474-23392898)
chr5 (128-551)||(6975710-6976144)
chr5 (32-551)||(39490874-39491387)
chr5 (32-549)||(23372316-23372848)
chr5 (32-551)||(22675903-22676452)
chr5 (128-551)||(22685909-22686343)
chr5 (128-551)||(15739869-15740304)
chr5 (128-551)||(15769029-15769464)
chr5 (32-551)||(27042136-27042685)
chr5 (32-551)||(35225877-35226426)
chr5 (32-551)||(40513913-40514463)
chr5 (161-551)||(14446923-14447323)
chr5 (161-551)||(14457535-14457935)
chr5 (32-551)||(27052760-27053310)
chr5 (256-551)||(17607093-17607397)
chr5 (256-551)||(17617707-17618011)
chr5 (256-551)||(31348567-31348871)
chr5 (256-551)||(31359181-31359485)
chr5 (256-551)||(36687728-36688032)
chr5 (256-551)||(36698294-36698598)
chr5 (161-551)||(33951724-33952124)
chr5 (32-385)||(31814968-31815325)
chr5 (212-551)||(17718905-17719255)
chr5 (212-551)||(17729557-17729907)
chr5 (256-551)||(37729176-37729480)
chr5 (256-551)||(37740492-37740796)
chr5 (285-546)||(13533743-13534009)
chr5 (285-546)||(20168127-20168393)
chr5 (22-546)||(13523016-13523582)
chr5 (20-256)||(21519837-21520091)
chr5 (332-546)||(35543235-35543455)
chr5 (128-546)||(36095556-36095978)
chr5 (128-546)||(36097013-36097435)
chr5 (20-157)||(21517504-21517641)
chr5 (333-481)||(40228557-40228705)
chr5 (285-481)||(13405014-13405209)
chr5 (345-481)||(40032869-40033005)
chr5 (381-551)||(31833639-31833817)
chr5 (332-481)||(1915315-1915465)
chr5 (344-481)||(11208087-11208225)
chr5 (426-551)||(39364685-39364817)
chr5 (332-481)||(20215205-20215356)
chr5 (332-481)||(23478266-23478417)
chr5 (22-106)||(13534225-13534309)
chr5 (18-118)||(19463730-19463830)
chr5 (18-118)||(19477760-19477860)
chr5 (332-481)||(25111967-25112118)
chr5 (332-481)||(25171058-25171209)
chr5 (29-106)||(35542879-35542956)
chr5 (22-118)||(32754348-32754446)
chr5 (18-106)||(31418420-31418508)
chr5 (18-106)||(31448311-31448399)
chr5 (31-113)||(20562111-20562194)
chr5 (31-105)||(24983836-24983910)
chr5 (344-481)||(32160663-32160801)
chr5 (32-143)||(15739701-15739813)
chr5 (32-143)||(15768861-15768973)
chr5 (32-143)||(23707193-23707305)
chr5 (344-448)||(4886952-4887057)
chr5 (344-398)||(20550876-20550930)
chr5 (344-398)||(33933248-33933302)
chr5 (344-448)||(15516900-15517004)
chr5 (18-118)||(30070307-30070408)
chr5 (344-415)||(7745795-7745867)
chr5 (344-415)||(10848736-10848808)
chr5 (344-415)||(28139570-28139642)
chr5 (39-143)||(22685801-22685907)
chr5 (347-429)||(30115942-30116025)
chr5 (344-398)||(9088950-9089004)
chr5 (344-398)||(14086641-14086695)
chr5 (344-398)||(33022645-33022699)
chr5 (344-448)||(89524-89629)
chr5 (344-448)||(26765429-26765533)
chr5 (344-448)||(26784284-26784389)
chr5 (344-397)||(35932108-35932161)
chr5 (32-118)||(14447403-14447490)
chr5 (32-118)||(14458015-14458102)
chr5 (32-118)||(33952204-33952291)
chr5 (344-398)||(11993869-11993923)
chr5 (344-398)||(13545614-13545668)
chr5 (344-398)||(29138508-29138562)
chr5 (344-398)||(30742962-30743015)
chr5 (344-398)||(31117858-31117912)
chr5 (344-398)||(42243662-42243715)
chr5 (32-140)||(23691679-23691789)
chr5 (427-551)||(23696988-23697120)
chr5 (344-448)||(26759080-26759184)
chr5 (22-71)||(36095398-36095447)
chr5 (22-71)||(36096855-36096904)
chr5 (347-410)||(25930261-25930325)
chr5 (344-415)||(35986334-35986406)
chr5 (344-426)||(19536403-19536486)
chr5 (344-410)||(41566536-41566603)
chr5 (344-398)||(3245543-3245597)
chr5 (344-429)||(21099806-21099892)
chr5 (344-398)||(25096928-25096981)
chr5 (344-398)||(25154898-25154951)
chr5 (344-429)||(28464441-28464527)
chr5 (98-144)||(30070264-30070310)
chr5 (344-397)||(21660194-21660247)
chr5 (76-137)||(28139825-28139886)
chr5 (147-204)||(35543050-35543107)
chr5 (344-415)||(9398836-9398908)
chr5 (107-155)||(13534156-13534204)
chr5 (38-118)||(17606877-17606957)
chr5 (344-396)||(21910539-21910591)
chr5 (344-396)||(23413076-23413128)
chr5 (32-103)||(36582924-36582996)
chr5 (32-103)||(36593479-36593551)
chr5 (345-415)||(17814931-17815002)
chr5 (107-190)||(20167950-20168031)
chr5 (22-73)||(40229004-40229054)
chr5 (344-398)||(6499220-6499274)
chr5 (32-95)||(6975612-6975677)
chr5 (344-398)||(12352897-12352951)
chr5 (339-373)||(16607518-16607552)
chr5 (344-398)||(23881048-23881102)
chr5 (517-551)||(43621819-43621853)
chr5 (28-73)||(13405431-13405475)
chr5 (38-118)||(17718695-17718776)
chr5 (38-118)||(17729347-17729428)
chr5 (344-415)||(23391705-23391778)
chr5 (412-481)||(23488412-23488481)
chr5 (334-371)||(26119922-26119959)
chr5 (40-73)||(33022981-33023014)
chr5 (40-73)||(33933636-33933669)
chr5 (107-172)||(35542977-35543041)
chr5 (76-118)||(36096925-36096969)
chr5 (98-155)||(36687553-36687610)
chr5 (98-155)||(36698119-36698176)
chr5 (37-73)||(1915745-1915781)
chr5 (76-140)||(4887257-4887321)
chr5 (344-396)||(21072342-21072394)
chr5 (32-60)||(24588533-24588561)
chr5 (108-144)||(36095520-36095556)
chr5 (108-144)||(36096977-36097013)
[»] chr8 (161 HSPs)
chr8 (18-551)||(18158287-18158846)
chr8 (15-551)||(40212845-40213418)
chr8 (18-551)||(18153768-18154326)
chr8 (30-546)||(3843560-3844101)
chr8 (18-551)||(18768809-18769386)
chr8 (18-551)||(23469148-23469710)
chr8 (18-551)||(16747033-16747608)
chr8 (22-548)||(20259311-20259862)
chr8 (22-548)||(21045941-21046492)
chr8 (31-551)||(19428958-19429507)
chr8 (31-551)||(19418383-19418930)
chr8 (97-551)||(19224965-19225428)
chr8 (18-534)||(23456992-23457536)
chr8 (32-551)||(30314399-30314945)
chr8 (129-551)||(31215046-31215477)
chr8 (32-551)||(20160932-20161478)
chr8 (32-551)||(20195989-20196535)
chr8 (32-551)||(3220662-3221193)
chr8 (32-551)||(19139310-19139841)
chr8 (32-551)||(209873-210403)
chr8 (32-551)||(252439-252969)
chr8 (32-551)||(723496-724026)
chr8 (32-551)||(848687-849217)
chr8 (32-551)||(29076761-29077291)
chr8 (32-551)||(29087012-29087542)
chr8 (32-551)||(32087989-32088519)
chr8 (32-551)||(26111261-26111793)
chr8 (32-551)||(26120939-26121471)
chr8 (32-551)||(32077416-32077946)
chr8 (32-551)||(15780429-15780960)
chr8 (32-551)||(15791018-15791549)
chr8 (32-551)||(241854-242384)
chr8 (129-546)||(23370591-23371007)
chr8 (18-481)||(1750201-1750670)
chr8 (32-551)||(6151100-6151632)
chr8 (32-551)||(6161055-6161586)
chr8 (18-551)||(6318241-6318766)
chr8 (32-551)||(18449400-18449931)
chr8 (32-551)||(36077965-36078497)
chr8 (32-551)||(36088551-36089083)
chr8 (32-551)||(9856191-9856722)
chr8 (32-551)||(9341174-9341706)
chr8 (32-551)||(43248356-43248878)
chr8 (126-551)||(36292949-36293385)
chr8 (126-551)||(36303552-36303988)
chr8 (212-551)||(19128778-19129127)
chr8 (29-546)||(22211088-22211632)
chr8 (18-297)||(28691193-28691473)
chr8 (128-551)||(9368318-9368752)
chr8 (285-546)||(7018358-7018624)
chr8 (128-551)||(3348443-3348877)
chr8 (128-551)||(3359040-3359474)
chr8 (22-542)||(22135551-22136097)
chr8 (284-523)||(30325227-30325473)
chr8 (256-481)||(6576466-6576693)
chr8 (258-551)||(44481121-44481423)
chr8 (258-551)||(44491737-44492039)
chr8 (161-551)||(13688418-13688818)
chr8 (332-546)||(22167046-22167266)
chr8 (32-248)||(30325013-30325231)
chr8 (24-275)||(16436773-16437025)
chr8 (162-448)||(19461090-19461376)
chr8 (162-448)||(19558768-19559054)
chr8 (18-118)||(23269582-23269682)
chr8 (20-118)||(26734706-26734804)
chr8 (367-551)||(795209-795401)
chr8 (332-528)||(23271227-23271430)
chr8 (332-481)||(8031927-8032077)
chr8 (291-480)||(40003123-40003312)
chr8 (332-481)||(28903353-28903503)
chr8 (22-123)||(22623060-22623163)
chr8 (30-118)||(3833231-3833321)
chr8 (335-481)||(17519168-17519316)
chr8 (32-155)||(19129167-19129291)
chr8 (32-195)||(795588-795754)
chr8 (332-481)||(21540845-21540996)
chr8 (22-118)||(23380812-23380910)
chr8 (18-118)||(31215522-31215623)
chr8 (22-106)||(7018093-7018177)
chr8 (332-466)||(29379486-29379622)
chr8 (22-118)||(23371053-23371151)
chr8 (30-123)||(3844297-3844392)
chr8 (22-118)||(22166700-22166799)
chr8 (344-481)||(45568021-45568159)
chr8 (32-140)||(6576275-6576384)
chr8 (344-448)||(15336208-15336313)
chr8 (344-448)||(15425273-15425378)
chr8 (344-448)||(15516577-15516682)
chr8 (344-430)||(36105139-36105226)
chr8 (344-445)||(45538559-45538661)
chr8 (18-105)||(19225438-19225526)
chr8 (344-448)||(23185346-23185452)
chr8 (344-448)||(1237563-1237668)
chr8 (344-448)||(21932809-21932914)
chr8 (29-106)||(23783833-23783912)
chr8 (32-143)||(3348324-3348441)
chr8 (32-143)||(3358921-3359038)
chr8 (344-398)||(6407703-6407757)
chr8 (344-398)||(16207283-16207337)
chr8 (344-398)||(17797399-17797453)
chr8 (347-415)||(14989574-14989643)
chr8 (344-448)||(24551200-24551305)
chr8 (344-448)||(30421549-30421654)
chr8 (344-415)||(13430748-13430820)
chr8 (353-448)||(18121235-18121331)
chr8 (344-415)||(19943194-19943266)
chr8 (32-118)||(13596230-13596317)
chr8 (32-118)||(13688251-13688338)
chr8 (347-398)||(18151769-18151820)
chr8 (344-398)||(9320546-9320599)
chr8 (344-398)||(22673755-22673809)
chr8 (344-398)||(40845507-40845561)
chr8 (107-172)||(3844230-3844295)
chr8 (344-415)||(43639741-43639814)
chr8 (107-155)||(3833176-3833224)
chr8 (344-398)||(602840-602894)
chr8 (129-195)||(23783708-23783773)
chr8 (339-377)||(26833034-26833072)
chr8 (344-397)||(21301000-21301053)
chr8 (107-172)||(23783748-23783812)
chr8 (344-397)||(24646316-24646369)
chr8 (344-397)||(39693513-39693566)
chr8 (347-410)||(17267438-17267502)
chr8 (344-415)||(21288362-21288434)
chr8 (32-95)||(23579594-23579658)
chr8 (344-410)||(18718965-18719032)
chr8 (344-395)||(43644876-43644927)
chr8 (32-95)||(9368785-9368850)
chr8 (344-398)||(17701722-17701776)
chr8 (347-397)||(19156174-19156224)
chr8 (344-398)||(25164047-25164101)
chr8 (98-193)||(44481483-44481580)
chr8 (98-193)||(44492099-44492196)
chr8 (107-144)||(7018198-7018235)
chr8 (28-73)||(8032360-8032404)
chr8 (344-397)||(12757883-12757936)
chr8 (344-397)||(16188962-16189015)
chr8 (28-73)||(17518823-17518867)
chr8 (344-424)||(17525849-17525930)
chr8 (28-73)||(18534828-18534872)
chr8 (344-377)||(18685517-18685550)
chr8 (344-377)||(18722766-18722799)
chr8 (344-377)||(18731111-18731144)
chr8 (34-71)||(19461517-19461554)
chr8 (34-71)||(19559195-19559232)
chr8 (344-448)||(24833177-24833281)
chr8 (28-73)||(28903811-28903856)
chr8 (363-415)||(33560354-33560407)
chr8 (28-73)||(40003537-40003582)
chr8 (344-417)||(1745115-1745190)
chr8 (32-60)||(5846660-5846688)
chr8 (32-60)||(15969147-15969175)
chr8 (339-371)||(17687986-17688018)
chr8 (344-415)||(18321279-18321351)
chr8 (344-380)||(23263732-23263768)
chr8 (32-60)||(23339425-23339453)
chr8 (40-72)||(30421231-30421263)
chr8 (32-60)||(31043325-31043353)
chr8 (32-60)||(34107414-34107442)
chr8 (32-60)||(36293435-36293463)
chr8 (32-60)||(36304038-36304066)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (22-551)||(11797-12370)
scaffold0407 (22-449)||(15628-16092)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (22-551)||(9969-10541)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (31-551)||(7462-8009)
scaffold0068 (31-551)||(10326-10856)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (15-551)||(51777-52361)
[»] scaffold0084 (6 HSPs)
scaffold0084 (129-546)||(56606-57030)
scaffold0084 (32-107)||(56472-56547)
scaffold0084 (365-424)||(464-524)
scaffold0084 (344-424)||(32443-32524)
scaffold0084 (344-391)||(417-464)
scaffold0084 (344-397)||(49318-49371)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (18-551)||(36413-36989)
[»] scaffold0017 (8 HSPs)
scaffold0017 (129-551)||(175327-175755)
scaffold0017 (129-372)||(180424-180667)
scaffold0017 (332-528)||(40373-40576)
scaffold0017 (22-104)||(175818-175900)
scaffold0017 (22-123)||(180709-180812)
scaffold0017 (162-528)||(58750-59122)
scaffold0017 (76-118)||(40085-40129)
scaffold0017 (107-143)||(40136-40172)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (129-551)||(32727-33157)
scaffold0047 (32-551)||(40178-40709)
scaffold0047 (18-117)||(32582-32681)
scaffold0047 (344-398)||(9888-9942)
[»] scaffold0012 (6 HSPs)
scaffold0012 (22-546)||(127654-128202)
scaffold0012 (129-546)||(140812-141235)
scaffold0012 (285-551)||(7632-7905)
scaffold0012 (22-118)||(141282-141378)
scaffold0012 (344-448)||(215569-215674)
scaffold0012 (32-60)||(64571-64599)
[»] scaffold0272 (3 HSPs)
scaffold0272 (18-551)||(13285-13861)
scaffold0272 (18-118)||(12980-13080)
scaffold0272 (129-195)||(13125-13192)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (32-551)||(53849-54378)
scaffold0028 (32-551)||(14584-15115)
scaffold0028 (344-398)||(5674-5728)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (31-551)||(1927-2473)
[»] scaffold0002 (8 HSPs)
scaffold0002 (130-505)||(117147-117530)
scaffold0002 (332-481)||(475309-475460)
scaffold0002 (332-481)||(481829-481980)
scaffold0002 (31-118)||(117576-117663)
scaffold0002 (332-481)||(156685-156836)
scaffold0002 (32-118)||(347337-347425)
scaffold0002 (97-172)||(347438-347514)
scaffold0002 (28-73)||(156342-156387)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (18-527)||(2824-3343)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (18-418)||(7775-8177)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (129-551)||(42344-42775)
scaffold0133 (32-551)||(31132-31664)
scaffold0133 (31-118)||(42211-42299)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (129-548)||(35543-35967)
scaffold0154 (22-118)||(36013-36111)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (131-551)||(6711-7141)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (31-481)||(17-504)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (15-398)||(1369-1755)
[»] scaffold0481 (2 HSPs)
scaffold0481 (130-546)||(12651-13073)
scaffold0481 (22-104)||(12506-12588)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (32-551)||(6567-7098)
[»] scaffold0201 (3 HSPs)
scaffold0201 (129-424)||(7366-7661)
scaffold0201 (18-190)||(7060-7250)
scaffold0201 (22-118)||(7707-7804)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (32-551)||(12356-12887)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (31-481)||(5910-6397)
[»] scaffold0739 (2 HSPs)
scaffold0739 (129-548)||(2000-2424)
scaffold0739 (22-118)||(2470-2567)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (129-557)||(19236-19688)
scaffold0099 (106-558)||(16719-17210)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (236-546)||(15737-16052)
scaffold0410 (22-118)||(7016-7114)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (309-510)||(40546-40753)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (18-378)||(34837-35233)
[»] scaffold0178 (2 HSPs)
scaffold0178 (32-297)||(27001-27271)
scaffold0178 (32-94)||(21706-21769)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (89-551)||(7961-8435)
scaffold0105 (89-551)||(36740-37214)
scaffold0105 (89-481)||(47374-47771)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (33-542)||(58313-58848)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (162-546)||(654-1044)
scaffold0090 (162-546)||(5034-5424)
scaffold0090 (76-106)||(1102-1132)
scaffold0090 (76-106)||(5482-5512)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (22-526)||(746-1276)
[»] scaffold0752 (5 HSPs)
scaffold0752 (259-546)||(1828-2120)
scaffold0752 (332-546)||(1213-1433)
scaffold0752 (22-71)||(2360-2409)
scaffold0752 (128-204)||(2176-2251)
scaffold0752 (76-106)||(2309-2339)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (22-294)||(2116-2424)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (29-546)||(58997-59539)
scaffold0007 (337-448)||(143031-143143)
[»] scaffold0163 (6 HSPs)
scaffold0163 (332-546)||(29481-29703)
scaffold0163 (31-118)||(36489-36577)
scaffold0163 (22-118)||(29952-30041)
scaffold0163 (129-204)||(29831-29906)
scaffold0163 (107-172)||(29880-29945)
scaffold0163 (123-163)||(36599-36639)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (332-546)||(28824-29046)
scaffold0001 (32-194)||(407934-408099)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (18-297)||(2550-2865)
scaffold0414 (344-396)||(7228-7282)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (18-234)||(19505-19722)
scaffold0334 (75-140)||(10048-10113)
[»] scaffold1102 (1 HSPs)
scaffold1102 (22-123)||(2776-2879)
[»] scaffold0226 (2 HSPs)
scaffold0226 (18-293)||(18895-19208)
scaffold0226 (18-118)||(28289-28390)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (285-481)||(61123-61318)
scaffold0005 (344-415)||(212321-212393)
scaffold0005 (18-71)||(3898-3951)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (129-316)||(69840-70027)
scaffold0040 (22-106)||(70087-70171)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (285-546)||(17820-18089)
scaffold0280 (344-424)||(2802-2883)
scaffold0280 (28-73)||(17515-17559)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (129-299)||(15127-15297)
scaffold0063 (22-118)||(15343-15441)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (18-118)||(5052-5152)
[»] scaffold0604 (2 HSPs)
scaffold0604 (129-304)||(1-176)
scaffold0604 (22-104)||(238-320)
[»] scaffold0655 (3 HSPs)
scaffold0655 (332-481)||(5018-5169)
scaffold0655 (32-143)||(8603-8717)
scaffold0655 (15-73)||(5467-5525)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (332-481)||(20436-20586)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (426-546)||(38120-38246)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (31-372)||(4221-4568)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (107-393)||(22030-22312)
[»] scaffold0774 (2 HSPs)
scaffold0774 (29-118)||(6053-6144)
scaffold0774 (285-366)||(6346-6426)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (18-237)||(53358-53581)
[»] scaffold0314 (2 HSPs)
scaffold0314 (97-231)||(20565-20700)
scaffold0314 (32-118)||(20465-20552)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (332-481)||(6581-6732)
scaffold0018 (28-73)||(6228-6273)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (332-481)||(61633-61784)
scaffold0010 (32-111)||(224290-224370)
[»] scaffold0544 (3 HSPs)
scaffold0544 (76-204)||(9674-9803)
scaffold0544 (420-546)||(9908-10040)
scaffold0544 (22-70)||(9604-9652)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (332-481)||(1731-1882)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (344-481)||(7185-7324)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (331-479)||(16858-17008)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (32-140)||(9144-9253)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (332-481)||(994-1145)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (332-481)||(1187-1338)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (332-481)||(11662-11812)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (344-481)||(38157-38294)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (32-144)||(17078-17191)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (344-424)||(165018-165099)
[»] scaffold0477 (2 HSPs)
scaffold0477 (256-372)||(6162-6278)
scaffold0477 (98-193)||(6006-6103)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (32-155)||(81821-81947)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (22-118)||(163601-163700)
scaffold0016 (130-204)||(163481-163554)
scaffold0016 (121-172)||(163530-163580)
scaffold0016 (344-415)||(690-763)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (344-481)||(3967-4106)
[»] scaffold2108 (1 HSPs)
scaffold2108 (32-105)||(72-145)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (344-424)||(15694-15775)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (481-546)||(16518-16583)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (32-143)||(22-134)
scaffold0772 (339-371)||(948-980)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (32-143)||(18405-18517)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (162-398)||(9281-9516)
scaffold0185 (28-73)||(9654-9698)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (344-430)||(3256-3343)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (381-481)||(1114-1214)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (344-398)||(9954-10008)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (344-398)||(34876-34930)
scaffold0056 (344-448)||(25737-25842)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (344-448)||(1771-1876)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (344-424)||(1869-1950)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (344-415)||(17837-17909)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (344-415)||(9122-9194)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (344-415)||(27501-27573)
scaffold0171 (75-140)||(27236-27301)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (344-398)||(15811-15865)
scaffold0247 (344-398)||(25471-25525)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (348-398)||(22661-22711)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (344-398)||(36847-36901)
scaffold0120 (344-398)||(42104-42158)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (344-398)||(21043-21097)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (344-398)||(99277-99331)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (344-398)||(37387-37441)
scaffold0022 (344-398)||(135447-135501)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (344-448)||(211334-211437)
scaffold0004 (343-397)||(377630-377684)
scaffold0004 (344-376)||(244356-244388)
scaffold0004 (75-140)||(220492-220556)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (344-398)||(90127-90181)
scaffold0003 (40-73)||(89812-89845)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (344-424)||(14606-14687)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (344-448)||(18965-19070)
scaffold0217 (344-415)||(22203-22275)
scaffold0217 (344-410)||(9532-9599)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (344-424)||(1618-1699)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (346-398)||(5991-6043)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (344-396)||(2763-2815)
scaffold0473 (76-140)||(2519-2584)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (344-415)||(7348-7420)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (32-118)||(4-91)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (339-378)||(31851-31890)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (344-438)||(78438-78533)
[»] scaffold1359 (4 HSPs)
scaffold1359 (344-382)||(727-765)
scaffold1359 (344-397)||(1827-1880)
scaffold1359 (81-140)||(1578-1637)
scaffold1359 (76-140)||(480-544)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (339-377)||(379-417)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (344-448)||(7639-7742)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (344-424)||(60761-60842)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (344-415)||(9873-9945)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (344-415)||(6812-6884)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (344-415)||(1657-1729)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (344-396)||(87672-87724)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (349-448)||(2918-3016)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (344-410)||(10180-10247)
scaffold0161 (344-410)||(14844-14911)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (349-415)||(84362-84429)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (344-409)||(893-958)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (344-429)||(9909-9995)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (344-397)||(13557-13610)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (344-415)||(5019-5091)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (344-415)||(5397-5469)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (344-410)||(103543-103611)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (344-410)||(18693-18760)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (344-398)||(5992-6046)
scaffold0364 (339-371)||(10474-10506)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (18-92)||(23054-23128)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (344-382)||(40638-40676)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (339-377)||(144911-144949)
[»] scaffold1900 (1 HSPs)
scaffold1900 (32-92)||(1194-1255)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (344-377)||(1323-1356)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (344-377)||(55-88)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (388-440)||(1310-1363)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (344-397)||(12195-12248)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (344-397)||(5762-5815)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (344-377)||(5633-5666)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (106-139)||(11631-11664)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (344-424)||(59974-60055)
[»] scaffold2082 (1 HSPs)
scaffold2082 (32-60)||(31-59)
[»] scaffold1390 (1 HSPs)
scaffold1390 (32-60)||(1862-1890)
[»] scaffold1212 (1 HSPs)
scaffold1212 (32-60)||(25-53)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (32-60)||(4960-4988)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (32-60)||(4035-4063)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (32-60)||(20318-20346)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (32-60)||(3-31)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (32-60)||(34816-34844)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 199)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13913563 - 13913020
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13913563 cataggcaagtcattcaattaaaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctagagtgctt 13913464  T
Q  115 ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13913463 ctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaa 13913364  T
Q  215 ctgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13913363 ctggagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 13913264  T
Q  314 tgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttg 413  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13913263 tgtccttcgataacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacaactctgcctg 13913164  T
Q  414 cagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaact 507  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13913163 cagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaact 13913064  T
Q  508 caacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13913063 caacaactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 13913020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5845632 - 5845055
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5845632 cataggaaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 5845533  T
Q  115 ctgagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
    |||| |                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5845532 ctgaagctaaagtgattctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaag 5845433  T
Q  198 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5845432 tgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctgagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 5845333  T
Q  297 gaagagcac-----------------tgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 379  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5845332 gaagagcacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 5845233  T
Q  380 tctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc- 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  5845232 tctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcaggaatgttcattcaagatgggaatgaatttgaagccgattcttcaaaggactgcacccaaatca 5845133  T
Q  479 -----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5845132 ggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 5845055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 551
Target Start/End: Original strand, 18834409 - 18834859
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18834409 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagta 18834508  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcact 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18834509 aatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacact 18834608  T
Q  307 gagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 406  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18834609 gggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 18834708  T
Q  407 ctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaa 500  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  18834709 ctgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttttcccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaa 18834808  T
Q  501 aggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18834809 aggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 18834859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 18826035 - 18826463
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826035 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 18826134  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18826135 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttatccttcgttatca 18826234  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  18826235 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttc 18826334  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826335 aagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactttacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 18826434  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18826435 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 18826463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31572938 - 31572385
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31572938 aagtcattcaatctcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaaatccaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctaaagtgcttctgaag 31572839  T
Q  121 taatgacgtcatcagaag-----------------cagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatca 203  Q
    ||||||||||||||||||                 ||||||  ||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31572838 taatgacgtcatcagaagtagaagttcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatca 31572739  T
Q  204 gtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagc 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  31572738 gtaaatttaaactaacgattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttgaaaagc 31572639  T
Q  304 actgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31572638 actgagtatttgtccttcgttatcagagttgacaaactacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacg 31572539  T
Q  404 gctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgat 497  Q
     |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||    
T  31572538 accatgcctgcagaaatgttctatcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgat 31572439  T
Q  498 caaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31572438 caaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 31572385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 16123189 - 16123762
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg--- 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  16123189 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctaaagtgttt 16123288  T
Q  112 --------------cttctgaggtaa-tgacgtcatcagaagcagaaga-----------ccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
                  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||            |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  16123289 ctgaagctggagtgcttctgaagtaaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcccatcagaagcaaagtttcatcagaagcgaaatcatcacc 16123388  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16123389 agaagctacaattaatcagttaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctctttttaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtat 16123488  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16123489 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 16123588  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc----- 478  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  16123589 cgctacaagacaagacaacatccatgccttcataaatgttccttcaagattgtaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtca 16123688  T
Q  479 -aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16123689 aagtattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 16123762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 9933341 - 9933891
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9933341 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 9933440  T
Q  119 ggtaatgacgtcat-----------------cagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
     |||||||||||||                 |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9933441 agtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgat 9933540  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9933541 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 9933640  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9933641 gcactgggtgcttgtccttctttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttctgtctatgctacaagacaagacaa 9933740  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||      |||||||||||||||    
T  9933741 caactctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaaggaatttgaagttgatccttcataggactacaccaaaatcaggcaaaagattactggtggatg 9933840  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  9933841 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacatctct 9933891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29765934 - 29765507
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||     
T  29765934 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagctataccatcaccagaagctacaagtgattagtaaatttaaactgaagattcaaaa 29765835  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29765834 gagctgtttttcgtttcaacatcgtctagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttgtccttcgttaaca 29765735  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  29765734 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctatcagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttc 29765635  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29765634 aagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactc-ttaga 29765536  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  29765535 cgtactaaaaatctcaacgtctctttcac 29765507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13928702 - 13928341
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13928702 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatctgaagcatctgaagaaaactgcgtttgaagctaaagtgctt 13928603  T
Q  115 ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13928602 ctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgatcagtaaatttaaa 13928503  T
Q  215 ctgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 313  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13928502 ctggagattcaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 13928403  T
Q  314 tgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 375  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13928402 tgtccttcgataacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtt 13928341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 27166240 - 27166667
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27166240 tcatcagaagcagaagactatcagaagcaaggtttcatcagaagttatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 27166339  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27166340 gagttgtttttcgtttcaacatcgtctagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgtgtacttgtccttcattatca 27166439  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  27166440 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactacactgttcttgtccacgctacaagacaagacaacggctctgcctgcagaattgttccttc 27166539  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27166540 aagataggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactcaacgactc-ttaga 27166638  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27166639 cgtgctaaacatctcaacgtctctttcac 27166667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25788231 - 25787671
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa--------- 108  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||             
T  25788231 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 25788132  T
Q  109 ---------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
             |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  25788131 gaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattt 25788032  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25788031 aatccgtatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 25787932  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25787931 gatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag 25787833  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  25787832 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 25787733  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25787732 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 25787671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12828223 - 12827662
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12828223 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 12828124  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||    
T  12828123 gaagctgaagtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcataagcgtaatcatcaccagaagctacattt 12828024  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12828023 aatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 12827924  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12827923 gatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 12827824  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  12827823 acaacagctatgcctgcagaatttgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 12827724  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827723 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 12827662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 18925424 - 18925988
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  18925424 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgcc 18925523  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg-----------------tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 194  Q
           | ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||                 |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18925524 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctac 18925623  T
Q  195 aattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtca 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18925624 aattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagtagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtca 18925723  T
Q  294 tttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 393  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18925724 tttggagaacacttagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 18925823  T
Q  394 caag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattac 486  Q
    |||| | |||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  18925824 caagaaaaacagtcatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 18925923  T
Q  487 tggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18925924 tggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 18925988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 130 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22309189 - 22308761
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatc-accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22309189 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagttatatcatccaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaaag 22309090  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  22309089 gagctgtttttcgtttcaaccttgtctaagagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgttcttcgttatca 22308990  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| |||    
T  22308989 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagctctacctgtagaaatattccttc 22308890  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22308889 aagatgggaatgaatttgaaattgattcctcaaaggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 22308790  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22308789 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 22308761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8654208 - 8653631
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgc----- 112  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  8654208 aggcaagtcaattaaattcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcctctg 8654109  T
Q  113 ------------ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg----------------tttcatcagaagtg-atatcat 181  Q
                |||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||   ||||                |||||||||||| | | ||||     
T  8654108 aagctggagtgcttctgaagtgatgacgtcattagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaaatcac 8654009  T
Q  182 caccagaagctacaattaatcagt-aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatgga 279  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||    
T  8654008 caccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgactaagaagaacgaagaattgaaaggga 8653909  T
Q  280 ggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653908 ggtatcaacggtcatttgaagagcactgaatacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 8653809  T
Q  380 tctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc- 478  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8653808 tctacgctacaagacaagacaaaagctatgcctgtagaaatgttccttcaaaacgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatca 8653709  T
Q  479 -----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8653708 ggcaaaggattattggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcaactcaacgtctctttcac 8653631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4293125 - 4292697
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4293125 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcacattttcatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 4293026  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| | ||||    
T  4293025 gagctatttttcgtttcaacctcatctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttcatca 4292926  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4292925 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaggacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 4292826  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4292825 aagatgggaatgaatttgaagctgatccttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaacttaacgactctttaga 4292726  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4292725 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 4292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 7375437 - 7375984
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  7375437 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgcccctgaagctgaagtgc 7375536  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  7375537 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcattagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattc 7375636  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7375637 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 7375736  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7375737 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 7375835  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
      ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  7375836 cagcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 7375935  T
Q  504 a-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375936 attccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 7375984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 130 - 551
Target Start/End: Original strand, 17745562 - 17746007
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17745562 catcagaagcagaagaccatcagaagcaatatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgttcagttaatttaaactgaagattcaaagt 17745661  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacgg-----------------tcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||    
T  17745662 agctgtttctcatttcaacctcgtccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcacggtcatttgaagagcactgagta 17745761  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17745762 cttgtccttcgttatcagagttgacaaagtagaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcc 17745861  T
Q  412 tgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| || ||||||||||    
T  17745862 tgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaatcattactggtgaataatcaaaggaa 17745961  T
Q  506 ctcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17745962 ctcaacgactctttagacgtgctaaacatctcaacgtctctttcac 17746007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 20029584 - 20030130
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgct 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||     
T  20029584 atttcaataggtcttggaagaataatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagctgaagtgca 20029683  T
Q  114 tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  20029684 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattca 20029783  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20029784 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagta 20029883  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  20029884 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 20029982  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20029983 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 20030082  T
Q  505 -actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20030083 ttccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 20030130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 20062335 - 20062881
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||     
T  20062335 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagctgaagtgca 20062434  T
Q  114 tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | |    
T  20062435 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaaatca 20062534  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20062535 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagta 20062634  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  20062635 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 20062733  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20062734 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 20062833  T
Q  505 -actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20062834 ttccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaatgtctctttcac 20062881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25519231 - 25518661
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  25519231 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttatgaa 25519132  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25519131 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 25519032  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  25519031 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttctcgttttaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaaagga-gtat 25518933  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518932 caacggtcatctgaaaagcactgggtgcttgtccttcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 25518834  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||        
T  25518833 gttacaagacaagacaacagctctgcctccagaaatgttccttcaagacaggaatgaatttgaagttgatccttcatagcacaacacccaaatcaggcaa 25518734  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25518733 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 25518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 11147044 - 11147476
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11147044 tcatcagatgcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaacaccagaagctacatataatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 11147143  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  11147144 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaa 11147243  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  11147244 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 11147343  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||    
T  11147344 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactctt 11147443  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11147444 tagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 11147476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 17741355 - 17741922
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaa-ctgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17741355 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaaactacgtctgaagctatgaagtgcttctga 17741454  T
Q  119 ggtaa------------------tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagt-----------------aaggtttcatcagaagtgatatcatca 183  Q
     ||||                  ||||||||||||||||||||| |||||||||||                 ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  17741455 agtaacaagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagtagaattccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatca 17741554  T
Q  184 ccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggta 283  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  17741555 ccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagagaatgaagaattgaaagggaggta 17741654  T
Q  284 tcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    |||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17741655 tcaacaatcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctcta-aagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 17741753  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc----- 478  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||         
T  17741754 cgctacaagacaatacaacatctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagca 17741853  T
Q  479 -aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17741854 taagattactggtgtatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 17741922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17043149 - 17042591
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||     
T  17043149 aagtcattaaattacaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaatccaaagcctctgaagaaaactgcgtctgaagttaggaagtgcttctgaa 17043050  T
Q  120 gt---------------aa----tgacgtcatcagaagc-agaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatta 199  Q
    ||               ||    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |     
T  17043049 gtgtttaagagcatctgaagttgtgacgtcatcagaagctagaagac-atcagaagcaagatatcatcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtg 17042951  T
Q  200 atcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaa 299  Q
    ||||||   || ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |    
T  17042950 atcagttgtttcaaactaaagatttaaaggagctgtttttcggttcgtcctcgtctagaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgca 17042851  T
Q  300 gagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
     ||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17042850 aagcactgggtacttgtctttcgttttcagcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagac 17042751  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtgg 492  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||    
T  17042750 aacagctctgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaatacttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtgg 17042651  T
Q  493 atgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17042650 atgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 17042591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 31542594 - 31543125
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  31542594 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgaagtc 31542693  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  31542694 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaacagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31542792  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  31542793 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 31542892  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  31542893 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 31542992  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  31542993 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 31543092  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31543093 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 31543125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9122828 - 9123359
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9122828 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9122927  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||| ||||    
T  9122928 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaag 9123026  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9123027 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9123126  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9123127 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 9123226  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||    
T  9123227 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagactctt 9123326  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9123327 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9123359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 28251246 - 28251790
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | | |||||||||    
T  28251246 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaatagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcagagtgcttct 28251345  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||  |  |||| |||||||||||| || || |||  | |||  |    
T  28251346 gaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatcctttaatc-a 28251444  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  28251445 aactgaagatttaaagtagctggttctccattcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaaca 28251544  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  28251545 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 28251643  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||  |||||    
T  28251644 tgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt-gatgatttaagga 28251742  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  28251743 attcaaacgactctttagacatgctgattatctcaacgtctctttcac 28251790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26044709 - 26044183
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  26044709 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgcttc 26044610  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaac 215  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||                  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||    
T  26044609 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagg-----------------tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccctatattcaaac 26044527  T
Q  216 tgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtactt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  26044526 tgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagtt 26044427  T
Q  315 gtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgc 414  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  26044426 gtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ctttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgc 26044328  T
Q  415 agaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaact 507  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  26044327 agaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaatgatcaaaggattt 26044228  T
Q  508 c-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26044227 caaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26044183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9112191 - 9112722
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9112191 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9112290  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||| ||||    
T  9112291 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaag 9112389  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9112390 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9112489  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||| |     
T  9112490 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcaaaatttgtacc 9112589  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||    
T  9112590 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagactctt 9112689  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9112690 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9112722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 7750917 - 7751462
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| | | |||||||||    
T  7750917 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattctaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgcttct 7751016  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  |  |||| |||||||||||| || || |||  | |||  ||    
T  7751017 gaagtgatgacgtcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aa 7751115  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||    
T  7751116 actgaagattcaaagtagctgtttctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcac 7751215  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
    |||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  7751216 ttgtctctctttactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcct 7751315  T
Q  413 gcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7751316 gcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggaa 7751415  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7751416 ttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7751462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12855521 - 12854990
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  12855521 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 12855422  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  12855421 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 12855323  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  12855322 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 12855223  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12855222 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12855123  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12855122 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12855023  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12855022 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12854990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12866047 - 12865516
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  12866047 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 12865948  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  12865947 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 12865849  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  12865848 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 12865749  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12865748 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12865649  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12865648 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12865549  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12865548 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12865516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 130 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17064592 - 17064164
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | ||| | |||||||||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||   || ||||| |||||| ||||     
T  17064592 catcagaagcagaagtc-atcagatgcaagatatcatcagaaactatatcatcaccagaagcttcaagtgatcagttgtttcaaactaaagatttaaagg 17064494  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  17064493 agctgtttttcggttcgtcctcgtctagaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggtacttgtctttcattttcag 17064394  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttc 428  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||    
T  17064393 cgttgacaaagtacaagtgtacaacaactacctccactactatgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttccttc 17064294  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttag 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17064293 aagatgggaatgaatttgaagttaatacttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttag 17064194  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17064193 acgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 17064164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3661882 - 3661352
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  3661882 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 3661783  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  3661782 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3661684  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  3661683 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 3661584  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  3661583 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 3661484  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  3661483 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 3661384  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3661383 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3661352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3672546 - 3672016
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  3672546 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 3672447  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  3672446 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3672348  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  3672347 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 3672248  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  3672247 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 3672148  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  3672147 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 3672048  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3672047 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3672016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 130 - 546
Target Start/End: Original strand, 25686547 - 25686969
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||| ||||| |    
T  25686547 catcaaaagcagaagtccatcaaaag-aatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttcaatg 25686645  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||       
T  25686646 aagctgtttctcgtttcaacctcgtctaaaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga- 25686744  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25686745 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctt 25686844  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25686845 caagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagaaaaagattactggtggatgatc-aaggaactcaacgactctttag 25686943  T
Q  522 acgtgctaa-tcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||   ||||||||||||||    
T  25686944 acgtgctaaggaatctcaacgtctct 25686969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25986483 - 25986051
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| || |||  | |||  ||||||||||| |||    
T  25986483 gtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcacaagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaa 25986385  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    |||||||| || ||  |||   ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  25986384 agtagctggttctcaattcggtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatatgaatagcactgagcatttgtccttcgtta 25986285  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |    
T  25986284 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 25986185  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  25986184 cttcaagatgggaataaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 25986085  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25986084 ttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 25986051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 34806856 - 34807387
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  34806856 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 34806955  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  34806956 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34807054  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  34807055 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 34807154  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  34807155 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34807254  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  34807255 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 34807354  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34807355 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 34807387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 17984405 - 17984937
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  17984405 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 17984504  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  17984505 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 17984603  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  17984604 gtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 17984703  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  17984704 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 17984803  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  17984804 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 17984903  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17984904 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 33199827 - 33199297
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  33199827 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 33199728  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||| |    
T  33199727 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaa-g 33199630  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  ||||||      
T  33199629 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcgttaat 33199530  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  33199529 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 33199430  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  33199429 ttcaagataggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 33199330  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33199329 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 33199297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 34817488 - 34818019
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  34817488 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 34817587  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  34817588 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34817686  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  34817687 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 34817786  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  34817787 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34817886  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  34817887 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 34817986  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34817987 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 34818019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26865288 - 26864757
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  26865288 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 26865189  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  26865188 atcagaagtagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26865090  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  26865089 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26864990  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcaga-aatgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||   ||| |     
T  26864989 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtaca 26864890  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||||    
T  26864889 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctt 26864790  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26864789 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 32961625 - 32962156
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  32961625 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 32961724  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  32961725 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32961823  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  32961824 tagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 32961923  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  32961924 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 32962023  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  32962024 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 32962123  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32962124 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 32962156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16960121 - 16959591
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  16960121 atttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 16960022  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16960021 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16959923  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  16959922 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 16959823  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  16959822 agagttgacaaagtacaagtgtgcaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 16959723  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  16959722 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 16959623  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16959622 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 16959591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 129 - 527
Target Start/End: Original strand, 25735353 - 25735758
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt--aaactgaagattcaa 226  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||    
T  25735353 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttcatcagaagttgtatcatcagcagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagtttcaa 25735452  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    || |||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||     
T  25735453 agaagctgtttctcgtgtcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 25735552  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25735553 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 25735651  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25735652 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatc-aaggaactcaacgactcttt 25735750  T
Q  520 agacgtgc 527  Q
    ||||||||    
T  25735751 agacgtgc 25735758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29385251 - 29384721
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  29385251 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 29385152  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||  ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||   | |||  |||||||||||||||||    
T  29385151 atcagaagcagaaagtcatcagaaacaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgattctttaatc-aaactgaagattcaaag 29385053  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  29385052 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 29384953  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  29384952 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 29384853  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| || ||||||  || |||||||||||    
T  29384852 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactcttt 29384753  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29384752 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 29384721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 16122891 - 16123183
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16122891 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctaaagtgctt 16122990  T
Q  115 ctgaggt-aatgacgtcatcagaag-----cagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaa 208  Q
    |||| || |||||| ||||||||||     |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16122991 ctgaagtaaatgacatcatcagaagctcatcagaagcccatcagaagcaaagtttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaa 16123090  T
Q  209 tttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16123091 tttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgttttaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaag 16123183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26875912 - 26875381
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  26875912 atttcaataggtctttgaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 26875813  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  26875812 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26875714  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  26875713 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26875614  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcaga-aatgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||   ||| |     
T  26875613 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtaca 26875514  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||||    
T  26875513 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctt 26875414  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26875413 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26875381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 32972244 - 32972775
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  32972244 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 32972343  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  32972344 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccaaaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32972442  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  32972443 tagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 32972542  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  32972543 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 32972642  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  32972643 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 32972742  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32972743 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 32972775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26025959 - 26025428
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  26025959 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 26025860  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  26025859 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26025761  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  26025760 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 26025661  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  26025660 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 26025561  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  26025560 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 26025461  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26025460 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26025428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26036533 - 26036002
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  26036533 atttcaataggtcttggaagaataatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 26036434  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  26036433 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26036335  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||| ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  26036334 ttgctgattctcaattcaatcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 26036235  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  26036234 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 26036135  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  26036134 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 26036035  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26036034 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26036002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27342194 - 27341663
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  27342194 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 27342095  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
T  27342094 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27341996  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  27341995 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27341896  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27341895 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27341796  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  27341795 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 27341696  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27341695 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27341663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27402934 - 27402403
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  27402934 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 27402835  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
T  27402834 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27402736  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  27402735 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27402636  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27402635 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27402536  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  27402535 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 27402436  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27402435 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27413593 - 27413062
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  27413593 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 27413494  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
T  27413493 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27413395  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  27413394 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27413295  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27413294 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27413195  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  27413194 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 27413095  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27413094 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27413062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 163 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27506309 - 27505911
Alignment:
Q  163 tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaaga 261  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | || |||  | |||  ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||| |||| |||||    
T  27506309 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27506211  T
Q  262 acgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27506210 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27506111  T
Q  362 tccactactctgt--ttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27506110 tccactactctgtttttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattctt 27506011  T
Q  459 caaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27506010 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27505911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Original strand, 28356591 - 28356937
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  28356591 aaactgaagatttaaagtagctggttctccattcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaac 28356690  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28356691 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 28356789  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||  ||||    
T  28356790 ctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt-gatgatttaagg 28356888  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  28356889 aattcaaacgactctttagacatgctgattatctcaacgtctctttcac 28356937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25679638 - 25679233
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt--aaactgaagattcaa 226  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||    
T  25679638 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttcatcagaagatctatcatcaccagaagctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttcaa 25679539  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    || || ||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||     
T  25679538 agaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaaggtaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 25679439  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     
T  25679438 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacatcagctcttcctgcagaaatgttcc 25679340  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25679339 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactagtagatgatc-aaggaactcaacgactcttt 25679241  T
Q  520 agacgtgc 527  Q
    ||||||||    
T  25679240 agacgtgc 25679233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27373199 - 27372801
Alignment:
Q  163 tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaaga 261  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | || |||  | |||  ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||| |||| |||||    
T  27373199 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27373101  T
Q  262 acgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373100 acgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27373001  T
Q  362 tccactactctgt--ttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27373000 tccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattctt 27372901  T
Q  459 caaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27372900 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27372801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27463549 - 27463151
Alignment:
Q  163 tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaaga 261  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | || |||  | |||  ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||| |||| |||||    
T  27463549 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27463451  T
Q  262 acgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463450 acgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27463351  T
Q  362 tccactactctgt--ttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27463350 tccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattctt 27463251  T
Q  459 caaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27463250 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27463151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16930933 - 16930420
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  16930933 atttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 16930834  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||| |||                ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||     
T  16930833 atcagaagcaaaagt---------------tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtt 16930750  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  ||    
T  16930749 gctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatag 16930650  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |  ||    
T  16930649 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacactc 16930550  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttag 521  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  16930549 aagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttag 16930450  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16930449 acgtgctgattatctcaacgtctctttcac 16930420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 129 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25675562 - 25675208
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt--aaactgaagattcaa 226  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||    
T  25675562 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttcatcagaagatctatcatcaccagaagctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttcaa 25675463  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    || || ||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||     
T  25675462 agaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 25675363  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25675362 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 25675264  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  25675263 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 25675208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27475347 - 27474815
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| | | ||||||||||| || |||||||    
T  27475347 aatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattccaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgcttctgaagtgatgacgt 27475248  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  |  |||| |||||||||||| || || |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27475247 catcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaa 27475149  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    ||||||||  | ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||    
T  27475148 agtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcttta 27475049  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||  |    
T  27475048 ctagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgc 27474949  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||      ||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  27474948 cttcaagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct 27474849  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27474848 ttagacgtgctgataatctcaacgtctctttcac 27474815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27384934 - 27384402
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| | | ||||||||||| || |||||||    
T  27384934 aatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattccaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgcttctgaagtgatgacgt 27384835  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  |  |||| |||||||||||| || || |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27384834 catcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaa 27384736  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    ||||||||  | ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||    
T  27384735 agtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcttta 27384636  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||  |    
T  27384635 ctagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgc 27384536  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||      ||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  27384535 cttcaagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct 27384436  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27384435 ttagacgtgctgataatctcaacatctctttcac 27384402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27504846 - 27504314
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| | | ||||||||||| || |||||||    
T  27504846 aatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattccaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgcttctgaagtgatgacgt 27504747  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  |  |||  |||||||||||| || || |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27504746 catcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatattttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaa 27504648  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    ||||||||  | ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||    
T  27504647 agtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcttta 27504548  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||  |    
T  27504547 ctagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgc 27504448  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||      ||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  27504447 cttcaagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct 27504348  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27504347 ttagacgtgctgataatctcaacgtctctttcac 27504314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 433
Target Start/End: Original strand, 25722753 - 25723059
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt--aaactgaagattcaa 226  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| | |||    
T  25722753 tcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttcatcagaagctgtatcatcaccagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagttgcaa 25722852  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    || |||||||| || | ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||     
T  25722853 agaagctgtttctcctgtcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtacttgtccttcattg 25722952  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25722953 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 25723051  T
Q  426 ttcaagat 433  Q
    ||||||||    
T  25723052 ttcaagat 25723059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 17982216 - 17982728
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  17982216 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 17982315  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  17982316 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 17982414  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    ||            | ||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  17982415 gtt-----------tatcaa--------agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 17982495  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  17982496 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17982595  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  17982596 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcagaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 17982695  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17982696 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17982728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 31982305 - 31982853
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  31982305 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 31982404  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |      
T  31982405 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc- 31982503  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  31982504 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 31982603  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  31982604 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 31982703  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  31982704 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 31982803  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31982804 gatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 31982853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6158561 - 6158317
Alignment:
Q  175 atatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattga 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  6158561 atatcatcaccagaagctacatttaatccatatatttaaactgaagatccaaagtagttgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattga 6158462  T
Q  274 aatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 373  Q
    || ||||||| |||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158461 aagggaggtaacaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccctcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 6158362  T
Q  374 tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa 418  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6158361 tttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 6158317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 546
Target Start/End: Original strand, 19289156 - 19289600
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  19289156 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaa 19289254  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtt-tcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcac 305  Q
     ||| || |||||   |||||  |||||| | | |   | ||||| | |||  ||| ||||| ||  ||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  19289255 gattcaatctgaaatctcaaaagagctgtctcttgaagttaacctcgcctaagagagcgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcac 19289354  T
Q  306 tgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 405  Q
    || || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  19289355 tgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagc 19289453  T
Q  406 tctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatca 499  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||    
T  19289454 tctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagtcgatccttcataggactacatccaaatcagacaaaagattactggtggatgatca 19289553  T
Q  500 aaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19289554 aaggaactcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 19289600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18499139 - 18498596
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------------aa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                    ||    
T  18499139 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaagttacaa 18499040  T
Q  109 gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaa 208  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| | |    
T  18499039 gtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagtggatcagaaga 18498940  T
Q  209 tttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactg 307  Q
    || || |||||   |||||  |||||  | ||    | ||||| |||||  ||| ||||| ||  ||| | | ||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  18498939 ttcaatctgaaatctcaaaagagctgaatcttaaagttaacctcgtctaagagagcgaaggatcaaaaggaaagtgacaacgttcatttgaaaagcactg 18498840  T
Q  308 agtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctc 407  Q
     || ||| | | || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  18498839 ggtgcttatacatcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaaataacagctc 18498741  T
Q  408 tgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaa 501  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  18498740 tgcctgcagaattgttccttcaagataagaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcagacaaaagattactggtggatgatcaaa 18498641  T
Q  502 ggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18498640 ggaactcaatgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctct 18498596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4631146 - 4630842
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4631146 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 4631047  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  4631046 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 4630947  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4630946 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 4630847  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  4630846 ttcac 4630842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 32300966 - 32301270
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32300966 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 32301065  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  32301066 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 32301165  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32301166 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 32301265  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  32301266 ttcac 32301270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 32311655 - 32311959
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32311655 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 32311754  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  32311755 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 32311854  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32311855 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 32311954  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  32311955 ttcac 32311959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18555788 - 18555246
Alignment:
Q  30 caatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------------aag 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                    |||    
T  18555788 caatttcaatagatcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaagtttcaag 18555689  T
Q  110 tgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaat 209  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | |     
T  18555688 tgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagaa 18555589  T
Q  210 ttaaactgaagattcaaagtagctgttttt---cgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcact 306  Q
    | ||  || |   |||||  ||||| || |   ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||  ||| ||  ||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  18555588 tcaatatggaatctcaaaagagctgattctttacgtt--aacctcgtctaaaagagcgaaggatcaaaaggggagtgccaacgttcatttgaaaagcact 18555491  T
Q  307 gagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 406  Q
    | || ||||| | || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18555490 gggtgcttgtacctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagct 18555392  T
Q  407 ctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaa 500  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||      | ||||| |||||||||| |    
T  18555391 ctgcctgcagaattgttccctcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggcaaaagtttactcgtggatgatcta 18555292  T
Q  501 aggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18555291 aggaactcaacgactctttagatgtgctaaaaatctcaacgtctct 18555246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 288
Target Start/End: Original strand, 9321 - 9580
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  9321 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtc 9420  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  9421 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 9520  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaac 288  Q
    || ||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9521 agttgtttctcgtttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaac 9580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Original strand, 12716712 - 12717062
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  12716712 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 12716811  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
     ||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  12716812 tcttgtctctctttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 12716911  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  12716912 cctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12717011  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12717012 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12717062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Original strand, 12727361 - 12727711
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  12727361 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 12727460  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
     ||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  12727461 tcttgtctctctttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 12727560  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  12727561 cctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12727660  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12727661 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 286 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31931664 - 31931399
Alignment:
Q  286 aacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacg 385  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || ||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||    
T  31931664 aacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcg 31931566  T
Q  386 ctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg---- 481  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||        
T  31931565 ctacaagacaagttaacaactctgcctgcagaattgttccttcaagttaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaa 31931466  T
Q  482 --attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31931465 atattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctct 31931399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 12953130 - 12953351
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  12953130 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaatacaagataacagctctgcctgtagaattgttccttcaag 12953229  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt-agacg 524  Q
    || ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12953230 ataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaagacg 12953329  T
Q  525 tgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  12953330 tgctaaaaatctcaacgtctct 12953351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11206142 - 11205922
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11206142 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctatgctacaacacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaag 11206043  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || |||||| |||||||  | ||| |||| || || | | |||||||||      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11206042 ataggaatggatttgaacttgatttttcatagtacaatatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctcaacgactctttagacgt 11205943  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||| |  ||||||||||||||    
T  11205942 gcttaagatctcaacgtctct 11205922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11235741 - 11235475
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  11235741 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaattacaagtgtacaaccactacctccactattctacttttgtctac 11235643  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| ||||| | | |||||||||        
T  11235642 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatttttcataggacaatatccaaatcaggcaa 11235543  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  11235542 aagattacaggtggatgatcaatggttctcaacgactctttagatgtgcttaagatctcaacgtctct 11235475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Original strand, 7586210 - 7586405
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7586210 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctac 7586308  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  7586309 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 7586405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25800851 - 25800718
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25800851 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagtgatgacgt 25800752  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt 163  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  25800751 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttt 25800718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 10547420 - 10547520
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547420 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 10547519  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  10547520 a 10547520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21128323 - 21128128
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  21128323 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccacgactctgtttgtgtctac 21128225  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21128224 gctacaagacaagataacatctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaatgcgattcttcataggacaacaaccaaatcagg 21128128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Original strand, 32761730 - 32761894
Alignment:
Q  132 tcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32761730 tcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagta 32761829  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat 294  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32761830 gttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 32761894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 17745379 - 17745482
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17745379 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaatgaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatattgctt 17745478  T
Q  115 ctga 118  Q
    ||||    
T  17745479 ctga 17745482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 17608405 - 17608554
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17608405 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttg-ttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaa 17608503  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17608504 gataggaatgaatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 17608554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 280
Target Start/End: Original strand, 17577591 - 17577744
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17577591 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaa 17577690  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17577691 gtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggag 17577744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20635771 - 20635620
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  20635771 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagcaatgttccttca 20635672  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20635671 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 20635620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29766077 - 29765974
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  29766077 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 29765978  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  29765977 gtaa 29765974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 10971209 - 10971387
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10971209 aggccagtcaagtaatttcaacaggtcttgatagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctg 10971308  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    | || |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  10971309 aagtgatgacgtcattagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctaca 10971387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 17577446 - 17577546
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577446 aggctagtcaagtaatttcaatttgtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattagaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 17577545  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  17577546 a 17577546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 18825891 - 18825994
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttctgag 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  18825891 aagttaatcaatttcaaaaggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 18825990  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  18825991 gtaa 18825994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17047795 - 17047601
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-ctctgtttttgtcta 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||   | | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||      
T  17047795 caacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtcttt---tttaagagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcct 17047699  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17047698 cgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatttgttccttcaagataggaatgaattttaagttaattctttaaaggactacatccaaatcagg 17047601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 332 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22386854 - 22386751
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  22386854 ttgacaaagtaccaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagtaatgttccttca 22386755  T
Q  430 agat 433  Q
    ||||    
T  22386754 agat 22386751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 30119926 - 30120014
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30119926 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcgtagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctga 30120014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 32761594 - 32761682
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32761594 aatttcaataggtctttgaagaacaatggaaagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctga 32761682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4293268 - 4293186
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4293268 aagtcattcaatttcaataggtcttgaaagaacaatggagagcaaaagaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 4293186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22309335 - 22309249
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22309335 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaaggaattcaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 22309249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 10402767 - 10402868
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10402767 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 10402866  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  10402867 ga 10402868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 27166097 - 27166182
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 107  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27166097 aagtcattcaatttaaataggtctgggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcatctgaagctaa 27166182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12382454 - 12382367
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12382454 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 12382367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 25735216 - 25735307
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25735216 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaaggaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttctga 25735307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 344 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 29918056 - 29917933
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  ||||||||| |    
T  29918056 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttcattcacaatgggaatgca 29917957  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
    ||||||  | |||||||| |||||    
T  29917956 tttgaaattgattcttcataggac 29917933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 481
Target Start/End: Original strand, 14051495 - 14051629
Alignment:
Q  348 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttg 446  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  |  ||||| |||||    
T  14051495 gtacagccacttcctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtttcttcaaattcagaatggatttg 14051594  T
Q  447 aagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  14051595 aaattaattcttcataggacaacatccaaatcagg 14051629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 25686393 - 25686483
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25686393 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagaaaacgaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 25686483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31931965 - 31931881
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31931965 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaacctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 31931881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25675699 - 25675608
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagca-aaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25675699 tcaatttcaataggtcttggaagaacagtggagagcagaaggaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttctga 25675608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25679775 - 25679684
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagca-aaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25679775 tcaatttcaataggtcttggaagaacagtggagagcagaaggaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttctga 25679684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 25722616 - 25722707
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25722616 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaaggaagctaaagcatctgaagaaaactgggtctgaagctaaaagtgcttctga 25722707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 12952790 - 12952882
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaa-gaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12952790 tcaatttcaataggtcttggaaagaacaatagagagcaaaggaatttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 12952882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18726754 - 18726630
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  18726754 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 18726655  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  18726654 atcagaagcagaaggtcatcagaag 18726630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9717882 - 9717777
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  9717882 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgatacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgga 9717783  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  9717782 tttgaa 9717777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 480
Target Start/End: Original strand, 14070176 - 14070309
Alignment:
Q  348 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttg 446  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  |  ||||| |||||    
T  14070176 gtacagccacttcctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtttcttcaaattcagaatggatttg 14070275  T
Q  447 aagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 480  Q
    ||  |||||||||| |||||  || |||||||||    
T  14070276 aaattaattcttcataggacatcatccaaatcag 14070309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25986628 - 25986527
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25986628 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctagagtgctcct 25986529  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  25986528 ga 25986527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11206487 - 11206403
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11206487 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaacgagagcaaaggaacctaaagcacctgaagaaaactacgtctgaagcta 11206403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11236040 - 11235956
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11236040 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagaaaaggaacctaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagcta 11235956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 11146898 - 11146985
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11146898 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagcaaaagaattctaagcatttgaagaaaactgcgtctgaagct 11146985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15954742 - 15954619
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  15954742 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatgca 15954643  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||    
T  15954642 tttgaaattaatccttcataggac 15954619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17064738 - 17064640
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  17064738 aagtcattaaattacaataggtcttggaagaacaatgaagaacaaaggaatccaaagcctctaaagaaaactgcgtctgaagttaggaagtgcttctga 17064640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 551
Target Start/End: Original strand, 26022888 - 26023020
Alignment:
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||| || |||||||||  || ||||||||||    
T  26022888 ttcaaaatgggaatgaatttaaacctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaataatcaaaggatttcaaacgactctt 26022987  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || || |||| || |||||||||||||||||||    
T  26022988 taaacttgctgattatctcaacgtctctttcac 26023020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 30401269 - 30401366
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta-aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30401269 aagttaatcaatttcaattggttttggtagaacaatagagagcaatgtaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgagtgcttctga 30401366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32544304 - 32544199
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  32544304 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 32544205  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  32544204 tttgaa 32544199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27373297 - 27373225
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27373297 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgcttctgaag 27373225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27463647 - 27463575
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27463647 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgcttctgaag 27463575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27506407 - 27506335
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27506407 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgcttctgaag 27506335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16877252 - 16877157
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||    
T  16877252 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgcctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaa 16877157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 20488028 - 20488133
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  20488028 aagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtatctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 20488127  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  20488128 tttgaa 20488133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 20730814 - 20730919
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| | || | |||||| ||||  ||| ||||| |    
T  20730814 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctctgcctacaaagatgttccttcacaatgtgaatgca 20730913  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  20730914 tttgaa 20730919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 480 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12353597 - 12353525
Alignment:
Q  480 ggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12353597 ggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctccttcac 12353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Original strand, 18834304 - 18834372
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaa 90  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18834304 aagttaatcaatttcaaaaggtcttggaagaacaatgaagagcgaaggaatccaaagcatctggagaaa 18834372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 22076517 - 22076589
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22076517 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22076589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22802180 - 22802108
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22802180 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22802108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 14100550 - 14100620
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  14100550 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaacaactctgcatgca 14100620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12423300 - 12423246
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12423300 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctccgctataagacaaga 12423246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19624018 - 19623932
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  19624018 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctttgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcaatgttccttca 19623932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21235164 - 21235058
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||  | |||||| ||||  |||||||||     
T  21235164 aagtgtacaaccactacctccactactctgatatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcgaagatgttccttcacaatgggaatgc 21235065  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  21235064 atttgaa 21235058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 16265260 - 16265365
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | || |||||||| |||| | |||||| |||   ||||||||| |    
T  16265260 aagtgtgcaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaaagatgttccttcgcaatgggaatgca 16265359  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  16265360 tttgaa 16265365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 19066128 - 19066181
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19066128 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 19066181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19086197 - 19086092
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||   | ||||||||    
T  19086197 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcatcaatgttccttcatacttggaatgaa 19086098  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  19086097 tttgaa 19086092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13435571 - 13435499
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13435571 aagtgtacaaccactacctccactactctatatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 13435499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 415
Target Start/End: Original strand, 15531738 - 15531806
Alignment:
Q  348 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15531738 gtacaaccactacctccactactctgtctttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 15531806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16336166 - 16336094
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16336166 aagtgtacaaccactatctacactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16336094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17381560 - 17381488
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  17381560 aagtgtacaatcactacctccactattctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 17381488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18435595 - 18435523
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18435595 aagtgtacaaccactacctccagtacactgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 18435523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11049098 - 11049011
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  11049098 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 11049011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Original strand, 12716496 - 12716582
Alignment:
Q  33 tttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  12716496 tttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 12716582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Original strand, 12727145 - 12727231
Alignment:
Q  33 tttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  12727145 tttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 12727231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19625852 - 19625814
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625852 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 19625814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21618283 - 21618177
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  | || |||||||| ||||  ||||||| |||   |||||||||     
T  21618283 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaataaaaatagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgc 21618184  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  21618183 atttgaa 21618177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 347 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25594104 - 25594026
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  25594104 tgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagaaaagaataacagctctgcttgcaataatgttc 25594026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26589638 - 26589584
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  26589638 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagacaaga 26589584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 26972336 - 26972390
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  26972336 aagtgtacaaccactacctccactactcagtatttgtctctgctacaagacaaga 26972390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28573217 - 28573135
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28573217 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgct 28573135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 33352036 - 33352090
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33352036 aagtgtacaatcactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 33352090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 19289034 - 19289083
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19289034 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 19289083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24116867 - 24116762
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| | ||  ||||||||| ||   |||||||| |    
T  24116867 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgccttcaacaatgttcttacatactgggaatgga 24116768  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  24116767 tttgaa 24116762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 17316635 - 17316707
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  17316635 aagtgtacaaccactatctgcactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 17316707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 12952928 - 12953002
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12952928 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 12953002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23284603 - 23284480
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||   | |||||| |    
T  23284603 aagtgtataaccattatctccactactcagtttgtgtctccgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgga 23284504  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||    
T  23284503 tttgaaattaatccttcataggac 23284480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19482791 - 19482717
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcaga 417  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  19482791 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctactaaaagacaagaataacagctctgcctgcaga 19482717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21625140 - 21625086
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  21625140 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtccgtgctacaagacaaga 21625086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26943615 - 26943577
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26943615 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtct 26943577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12349032 - 12348995
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12349032 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 12348995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15302239 - 15302134
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  |||||||||||| || ||||||| ||| ||||  ||||||| | ||   ||||||||||    
T  15302239 aagtgtacaaccactatctccactactcagttagtgtctctgctacaagacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatgaa 15302140  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  15302139 tttgaa 15302134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31931804 - 31931747
Alignment:
Q  147 catcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31931804 catcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 31931747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1905380 - 1905316
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  1905380 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 1905316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31931860 - 31931812
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31931860 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaag 31931812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 19833143 - 19833247
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||  |||   |||||||||     
T  19833143 aagtgtacaagcactacctccactactctgttttgtgtct--gcttcaaaacaagaaaaacagctctgcttgcaacaatgtttcttctcaatgggaatgc 19833240  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  19833241 atttgaa 19833247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4631302 - 4631205
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagcta 193  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  4631302 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 4631205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25592661 - 25592623
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25592661 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 25592623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26589896 - 26589862
Alignment:
Q  106 aaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26589896 aaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagca 26589862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7812053 - 7812016
Alignment:
Q  340 gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7812053 gtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 7812016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 10640529 - 10640562
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10640529 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttt 10640562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11235935 - 11235898
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11235935 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaag 11235898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 12715530 - 12715583
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  12715530 aagtgtagaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 12715583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13602211 - 13602158
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  13602211 aagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13602158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Original strand, 18172134 - 18172171
Alignment:
Q  334 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18172134 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 18172171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18378353 - 18378300
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  18378353 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaaaacaag 18378300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21235467 - 21235434
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21235467 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatc 21235434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 22527839 - 22527920
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  22527839 ataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 22527920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 172
Target Start/End: Original strand, 30401389 - 30401438
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||    
T  30401389 atgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcgaaatttcatcagaag 30401438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 32300698 - 32300779
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  32300698 ataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 32300779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 32300793 - 32300850
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32300793 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagccatcagaag 32300850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 32311387 - 32311468
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  32311387 ataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 32311468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 32311482 - 32311539
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32311482 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagccatcagaag 32311539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3383617 - 3383589
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3383617 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 3383589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 9772605 - 9772633
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772605 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 9772633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11206382 - 11206334
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  11206382 aagtgcctctgaagtaatgacgttatcagaagcagaagttcatcagaag 11206334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 11992565 - 11992593
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992565 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 11992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12348135 - 12348099
Alignment:
Q  341 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12348135 tacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 12348099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13055970 - 13055942
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13055970 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 13055942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 16264996 - 16265060
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||   ||||||||||||||||    
T  16264996 aagcatctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaagtggcgacgtcatcagaagca 16265060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16877484 - 16877452
Alignment:
Q  108 agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16877484 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagca 16877452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19875876 - 19875844
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19875876 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 19875844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 20730550 - 20730614
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20730550 aagcgtctgaagaaaactgctcatgaagacaaagtgctcctgaagtagtgacgtcatcagaagca 20730614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21128605 - 21128569
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21128605 aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 21128569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21235416 - 21235352
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  21235416 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaagtagcgacgtcatcagaagca 21235352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 238)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27883963 - 27883404
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883963 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 27883864  T
Q  115 ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag-----------------accatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27883863 ctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaat 27883764  T
Q  198 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27883763 tgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttg 27883664  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883663 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 27883564  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtg 491  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||    
T  27883563 acaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaaattgattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtg 27883464  T
Q  492 gatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27883463 gatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaacatctcaacgtctctttcac 27883404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 28169646 - 28169102
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28169646 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagtaatctgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 28169547  T
Q  115 ctgaggtaatgacgt-catcagaagcagaagac--catcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
     ||| |   ||  || | || |||| | | |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28169546 atgaagc--tggagtgcttctgaagta-atgacgtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaaggtacaattaatcagtgaatt 28169450  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28169449 taaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgag 28169350  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28169349 tacttgtcctgcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatg 28169250  T
Q  410 cttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaagg 503  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  28169249 cctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaatgattactggtggatgatcaaagg 28169150  T
Q  504 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28169149 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 28169102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 9390875 - 9391417
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9390875 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaataaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctcctg 9390974  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaact 216  Q
    | || |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9390975 aagtgatgatgtcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaact 9391074  T
Q  217 gaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttg 315  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  9391075 gaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagcgcactgagtatttg 9391174  T
Q  316 tccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  9391175 tccttcgttaacagagttgagaaagtacaaatgtaccaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgca 9391274  T
Q  416 gaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc 508  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9391275 gaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc 9391374  T
Q  509 aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391375 aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 9391417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4404838 - 4404293
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4404838 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagtgatgacgtc 4404739  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatca-----------------gaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    ||||||||||||||  |||||                 |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |    
T  4404738 atcagaagcagaagctcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcactagaagctacatttgatccgtaaattca 4404639  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4404638 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagta 4404539  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  4404538 cttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcc 4404439  T
Q  412 tgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  4404438 tgcagaaatgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtggatgatcaaaggaa 4404339  T
Q  506 ctcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4404338 ctcaacaactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttcac 4404293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1054284 - 1053730
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||                  
T  1054284 aagtcaatca-tttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctaataagtgcttctgaa 1054186  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
          ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||   |||||  |||||||||||||||||||||| | ||    
T  1054185 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacatcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttctatagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgat 1054086  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1054085 cagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcatttgaaga 1053986  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1053985 gcactaggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 1053886  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||    
T  1053885 cagctctgcctgtagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaagattactggtggatg 1053786  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1053785 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 1053730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4457481 - 4456936
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  4457481 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgtttctgaagtgatgacgtc 4457382  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-----------------aggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |                 |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  4457381 atcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatctgtaaattca 4457282  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4457281 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagta 4457182  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  4457181 cttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcc 4457082  T
Q  412 tgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  4457081 tgcagaaatgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaa 4456982  T
Q  506 ctcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4456981 ctcaacaactctttagacgtgctattcatctcaatgtctctttcac 4456936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16077522 - 16076950
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  16077522 aagtcaatctatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 16077423  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||                 ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16077422 gtaacaagtgcctctgaagtaatgaagtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 16077323  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16077322 cagaagctacaaatgatcagtaaattttaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaatgaagaattgaaagggaggtat 16077223  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16077222 caacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 16077123  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        
T  16077122 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcagcaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 16077023  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16077022 aagattactggtggatgatcaaagaaactcaacgactctttagacgtgctcaaaatctcaacgtctctttcac 16076950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1064730 - 1064159
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  1064730 aagtcaatca-tttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 1064632  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||                 ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1064631 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcattagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 1064532  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1064531 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 1064432  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064431 caacggtcgtttgaagagcactaggtatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 1064332  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        
T  1064331 gctacaagacaagacaacagctctacctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 1064232  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1064231 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaaagtctctttcac 1064159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 551
Target Start/End: Original strand, 1783728 - 1784286
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  1783728 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctggagtgcttctgaa 1783827  T
Q  120 gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta-----------------aggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |                 |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  1783828 gtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgat 1783927  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||    
T  1783928 ccgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggag 1784027  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  1784028 aaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaa 1784127  T
Q  400 a-acagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtgg 492  Q
    | |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||     
T  1784128 acacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtga 1784227  T
Q  493 atgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1784228 atgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 1784286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 551
Target Start/End: Original strand, 1794140 - 1794698
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  1794140 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctggagtgcttctgaa 1794239  T
Q  120 gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta-----------------aggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    || |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |                 |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  1794240 gtgatgacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaaacaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgat 1794339  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||    
T  1794340 ccgtaaatttaaactggagattcaaagtagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacgatcatttggag 1794439  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-a 398  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  1794440 aaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaa 1794539  T
Q  399 caacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtgg 492  Q
     ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||     
T  1794540 aaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtga 1794639  T
Q  493 atgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1794640 atgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 1794698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 11216390 - 11216936
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  11216390 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagttct 11216489  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | |||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| | ||||| |    
T  11216490 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctatatttgatccgcaaattca 11216589  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || ||||||    
T  11216590 aactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatgatcatttgaagtccattgagta 11216689  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  11216690 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 11216789  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11216790 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 11216889  T
Q  505 actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216890 tctcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 11216936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 9380312 - 9380871
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9380312 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaataaatttgaagcatctgaagaaaactgcttctgaagctaaagtgctcctg 9380411  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatta 199  Q
    | || |||||||||||||||||||||   ||||||||| |                  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  9380412 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttttcatcagaaccgatatcatcaccagaagctacattta 9380511  T
Q  200 atcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttga 298  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  9380512 atctgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcacttga 9380611  T
Q  299 agagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9380612 agcgcactgagtatttgtccttcgttaacatagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 9380711  T
Q  399 caacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtg 491  Q
    |||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  9380712 caacagccatgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 9380811  T
Q  492 gatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9380812 gatgatcaaaggatctcaacgactctttagacatgctaatcatctcaacgtctctttcac 9380871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 38315284 - 38314715
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct--- 116  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  38315284 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatttgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttcttgt 38315185  T
Q  117 ------gaggtaatgacgtcatcagaagcaga--------------aga--ccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagcta 193  Q
          || || ||||||||||||||||||||              |||  | |||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38315184 gcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagacgctcatcataagcagatgctatcagaagcaaggttttcatcagaagttaaatcatcaccagaagcta 38315085  T
Q  194 caattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtc 292  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  38315084 caattgatccgtaaatccaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtc 38314985  T
Q  293 atttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaag 392  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38314984 atttggagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 38314885  T
Q  393 acaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggatta 485  Q
    ||||| | |||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||      |||||||    
T  38314884 acaagaaaaacagtcatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctgtttcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 38314785  T
Q  486 ctggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactcct 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38314784 ctggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactcct 38314715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 20 - 551
Target Start/End: Original strand, 18851349 - 18851906
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------- 106  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |                 
T  18851349 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctaaagaaaactgcgtctgaagcaatagtgcttctgaa 18851448  T
Q  107 ----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
        |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||| || ||    
T  18851449 gctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaaataagattttcatcaaaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgat 18851548  T
Q  202 cagtaa-atttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaa 299  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18851549 cagtaatattcaatctgaagattcaaagtagctatttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgga 18851648  T
Q  300 gagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
     | |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18851649 aaacactgagtaaatgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagac 18851748  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtgga 493  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  18851749 aacagctatgcctgcaaaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctttaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgga 18851848  T
Q  494 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18851849 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 18851906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 17281074 - 17281648
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  17281074 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 17281173  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgt-----------------catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| ||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  17281174 gtaacaagtgcatctgaagtaatgacgtcatcagaagcaaaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 17281273  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaac-gaagaattgaaatggaggta 283  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  17281274 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaactgaagaattgaaagggaggta 17281373  T
Q  284 tcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17281374 tcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 17281473  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc----- 478  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||         
T  17281474 cgctacaagacaaaacaacagctatacctgcagaaatgttccttcaaaatgaaaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatctggca 17281573  T
Q  479 -aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct-aatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  17281574 aaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacatgctaaaaaatctcaacgtctctttcac 17281648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 8739913 - 8740340
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8739913 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagatttcatcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaaag 8740012  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8740013 gagttgtttttcgtttcaacctcgtctagaagaaagaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgttatca 8740112  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||    
T  8740113 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgctccttc 8740212  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8740213 aagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaacacaacgactc-ttaga 8740311  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8740312 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 8740340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 16670804 - 16671376
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttctgag 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16670804 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 16670903  T
Q  120 gtaatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatat------------------catcac 184  Q
    |||||||||                 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||                  ||||||    
T  16670904 gtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcaaaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagctatatcatcaccagaagctatatcatcac 16671003  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16671004 caaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctagaagaatgaagaattgaaagggaggtat 16671103  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||    
T  16671104 caacggtcatttgaagagcagtgggtatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactacttttctcttgtccac 16671203  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||        
T  16671204 actacaagacaagacaacagctctgcctgtagaattgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattcttcaaaggacttcacccaaatcaggcaa 16671303  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16671304 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacatctctttcac 16671376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 8995742 - 8996170
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8995742 tcatcagaagcagaagaccatcataagcacaatttcatcagaagctatatcatcaccataagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaag 8995841  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8995842 aagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttaaaagcactgagtatttgtccttcattatca 8995941  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  8995942 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 8996041  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996042 aagatgggaatgaatttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 8996141  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  8996142 cgtgctaaaaatatcaacgtctctttcac 8996170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 432
Target Start/End: Original strand, 14321334 - 14321771
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgc-- 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  14321334 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatctgaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctaaagtgcat 14321433  T
Q  113 ---------------ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaa 196  Q
                   |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14321434 ctgaagctggagtgcttctgaagtaatgacgttatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaa 14321533  T
Q  197 ttaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14321534 ttaatcagtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttgtcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatt 14321633  T
Q  296 t-gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 394  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14321634 ttgaagaacactgagtacttgtcctttgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 14321733  T
Q  395 aagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaaga 432  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  14321734 aagacaacaactcttcctgcagaaatgttccttcaaga 14321771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 6490019 - 6490565
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  6490019 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgcttc 6490118  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||    
T  6490119 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaa 6490218  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |     
T  6490219 actgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcag 6490318  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6490319 ttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcct 6490418  T
Q  413 gcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||     
T  6490419 gcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggat 6490518  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6490519 ttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6490565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 6500673 - 6501219
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  6500673 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgcttc 6500772  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||  || ||    
T  6500773 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatattttcaa 6500872  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |     
T  6500873 actgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcag 6500972  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6500973 ttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcct 6501072  T
Q  413 gcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||     
T  6501073 gcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggat 6501172  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6501173 ttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6501219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 19887009 - 19887569
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa--------- 108  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||             
T  19887009 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgattct 19887108  T
Q  109 ---------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
             |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19887109 gaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattt 19887208  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19887209 aatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 19887308  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19887309 gatagcactgagtatttgtacttcgttaacagagttgacaaagcacaagtgtacaaccactaactccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag 19887407  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||      ||||||||||    
T  19887408 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagtagtacacccaaatcaggcaaacgattactggt 19887507  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19887508 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 19887569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 9006294 - 9006722
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9006294 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcacaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaag 9006393  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9006394 aagctgtttttcgtttcaatctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggagatatcaacgggcattttaaaagcactgagtatttgtccttcattatca 9006493  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  9006494 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 9006593  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9006594 aagatgggaatgaatttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgaatctttaga 9006693  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9006694 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 9006722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 16665768 - 16666294
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||                  
T  16665768 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaatagcaaaggaatccaaaacatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 16665867  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatat------------------catca 183  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||                  |||||    
T  16665868 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagctatatcatcatcagaagctatatcatca 16665967  T
Q  184 ccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggta 283  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16665968 ccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctagaagaacgaagaattgaaagggaggta 16666067  T
Q  284 tcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  16666068 tcaacggtcatttgaagagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtcca 16666167  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag--- 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||       
T  16666168 cgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattcttcaaaggacttcacccaaatcaggca 16666267  T
Q  481 ---gattactggtggatgatcaaagga 504  Q
       ||||||||||||||||||||||||    
T  16666268 aaagattactggtggatgatcaaagga 16666294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23636290 - 23635729
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23636290 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 23636191  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |     
T  23636190 gaagctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcagggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattc 23636091  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23636090 aatccgtatattcaaactgaagatctaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 23635991  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | || |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23635990 gatagtactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 23635891  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  23635890 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggt 23635791  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23635790 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 23635729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 48337808 - 48337261
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  48337808 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagctgaagtgc 48337709  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     || || || ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  48337708 atcagaagtgatgacatcatcagaagcataagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattc 48337609  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  48337608 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcatcggtcatttggacagcactgagt 48337509  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  48337508 atttgtccttcgttaacagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 48337410  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  48337409 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaagg 48337310  T
Q  504 a-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48337309 attctaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 48337261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 934207 - 933647
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  934207 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 934108  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  934107 gaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaagattttcatcagaagcgatatcaccaccagaagctacattt 934008  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  934007 aatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttg 933908  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  933907 aagtgctctgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag 933809  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||    
T  933808 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaaactaattcttcaaaggactacatccaaatcagacaaaggattactggt 933709  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  933708 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctaatcatctcaacgtctctttcac 933647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 192 - 551
Target Start/End: Original strand, 13261521 - 13261887
Alignment:
Q  192 tacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacgg 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13261521 tacaattaatcagtgaatttaaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 13261620  T
Q  291 tcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaca 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13261621 tcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctaca 13261720  T
Q  391 agacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggatt 484  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  13261721 agacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 13261820  T
Q  485 actggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13261821 actagtggatgatcaaagggactcaacgaatctttagacgtgttaatcatctcaacgtctctttcac 13261887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 130 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14581585 - 14581158
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14581585 catcagaagcagaagtc-atcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 14581487  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  14581486 agctttttttcgtttcaacctcgtctagaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcatttacaaagcactgggtacttgtccttcattttcag 14581387  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttc 428  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||    
T  14581386 cgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaatttgttccttc 14581287  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581286 aagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggacttcatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 14581187  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14581186 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 14581158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 98 - 551
Target Start/End: Original strand, 17909755 - 17910217
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaa 196  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17909755 ctgaagctaaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacat 17909854  T
Q  197 ttaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatt 295  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17909855 ttaatctgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaactttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatt 17909954  T
Q  296 tgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 395  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17909955 tggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagaca 17910053  T
Q  396 agacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactg 488  Q
    |||||||| || ||| |||||||  | | | |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||      ||||||||||    
T  17910054 agacaacatctatgcctgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctaaaaggacaacacccaaatcaggaaaaggattactg 17910153  T
Q  489 gtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910154 gtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 17910217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9536158 - 9535628
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta-aagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |   ||| ||    
T  9536158 aatttcaataagtcttggaagaacaatggaaaacaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagc--tgaagt 9536061  T
Q  130 -catcagaagcagaagac--catcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
     |||| ||||  || |||  ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  9536060 gcatctgaagt-gatgacgtcatcagaagcaaggatttcattagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatcca 9535962  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||||| ||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9535961 aagtagttgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtt 9535862  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgtt 423  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||     
T  9535861 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 9535763  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 516  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  9535762 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactc 9535663  T
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535662 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 9535628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 558
Target Start/End: Original strand, 24706209 - 24706777
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24706209 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttc 24706308  T
Q  116 tgagg---------taatgacg-------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    ||| |         |  ||| |       |||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  24706309 tgaagctgaagtgcttctgaagcagaagctcattagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaaacgatatcatcaccagaagctacattt 24706408  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24706409 aatccgtatattcaaactgaagatcaaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 24706508  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24706509 gatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaag 24706608  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  24706609 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 24706708  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactccttta 558  Q
    | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  24706709 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattctctcaacgtctctttcacgccttta 24706777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Original strand, 15216018 - 15216446
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggt 121  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15216018 aagtcaatcaatttaaataggtattggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaaccgcgtctgaagctaaagtgcttatgaagt 15216117  T
Q  122 aatgacgtcatcagaagcagaagac--catcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaa 219  Q
    ||  |   | ||  |||  || ||   ||| ||||| |    |||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  15216118 aacaagtgcctctaaagt-gatgatgtcattagaagcagaagttcatcagaagctctatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgac 15216216  T
Q  220 gattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcct 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15216217 gattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagtgaggtatcaacgatcatttgaagagcactgggtacctgtcct 15216316  T
Q  320 tcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaa 419  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15216317 tcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaaa 15216416  T
Q  420 tgttctttcaagatgggaatgaatttgaag 449  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15216417 tgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 15216446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 12237293 - 12237829
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||    
T  12237293 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagtttaaagtgcttct 12237392  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaact 216  Q
    || || ||||||||||||||||        ||||||||| |     ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || | | |||||    
T  12237393 gaagtgatgacgtcatcagaaggt------catcagaagcagaaggtcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatagtcaaact 12237486  T
Q  217 gaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttg 315  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||    
T  12237487 gaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttg 12237586  T
Q  316 tccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  12237587 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaatagctatgcctgca 12237685  T
Q  416 gaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc 508  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12237686 gaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttc 12237785  T
Q  509 -aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12237786 aaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12237829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 12249119 - 12249655
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||    
T  12249119 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagtttaaagtgcttct 12249218  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaact 216  Q
    || || ||||||||||||||||        ||||||||| |     ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || | | |||||    
T  12249219 gaagtgatgacgtcatcagaaggt------catcagaagcagaaggtcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatagtcaaact 12249312  T
Q  217 gaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttg 315  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||    
T  12249313 gaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttg 12249412  T
Q  316 tccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12249413 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 12249511  T
Q  416 gaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat------caggattactggtggatgatcaaaggaactc 508  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12249512 gaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttc 12249611  T
Q  509 -aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12249612 aaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12249655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 7804214 - 7804733
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta-aagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||                
T  7804214 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctg------------ 7804301  T
Q  130 catcagaagcagaagac--catcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    |||| ||||  || |||  ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  7804302 catctgaagt-gatgacgtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaa 7804400  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  7804401 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 7804500  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||| |    
T  7804501 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 7804599  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgactct 517  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||    
T  7804600 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactct 7804699  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7804700 ttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 7804733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 180 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11164228 - 11163849
Alignment:
Q  180 atcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatgg 278  Q
    |||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  11164228 atcaccggaagctacatttgatccgcaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaaggg 11164129  T
Q  279 aggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11164128 aggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctt 11164029  T
Q  379 gtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgtt-ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat 477  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11164028 gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctacagaatttttgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat 11163929  T
Q  478 ------caggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11163928 taggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 11163849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 9993564 - 9994108
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| |||    
T  9993564 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgtttc 9993663  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||    
T  9993664 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaa 9993763  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |     
T  9993764 actgaagatccaaagtagctgtttcttatttca-ccttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcat 9993862  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9993863 ttgtcctacgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcct 9993961  T
Q  413 gcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9993962 gcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggat 9994061  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9994062 ttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9994108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 13199028 - 13199453
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  13199028 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattttaaactgaagtttcaaa 13199127  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||       
T  13199128 ggagctgtttttcgttttaacctcgtctaagagaacgatgaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttctttga- 13199226  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt--gtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  13199227 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgatcc 13199326  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13199327 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 13199426  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13199427 agacgtgctaaaaatctcaacgtctct 13199453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 2246959 - 2246393
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  2246959 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtggttcttaa 2246860  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcag-----------------aagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||                 ||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2246859 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcataagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 2246760  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||| ||| |||||||     
T  2246759 cagaagctacagttgatcagtatatttaaactaaagtttcaaaggagttgtttttcgttttaacctcgtctaagagaacgaaggattaaaagggaggtac 2246660  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  2246659 caacgttcatttgaaaagcactaggtgtttgtccttcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctat 2246561  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||        
T  2246560 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcataaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaa 2246461  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2246460 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 2246393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 29460882 - 29461428
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  29460882 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 29460981  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  29460982 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 29461081  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  29461082 aactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacggagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 29461181  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  29461182 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 29461280  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29461281 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 29461380  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29461381 tttcaaacgactctttagatgtgctaattatctcaacgtctctttcac 29461428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 7794391 - 7794822
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  7794391 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcaaaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaaa 7794490  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || ||||||||||     
T  7794491 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttagatagcactaagtatttttccttcgttaa 7794590  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  7794591 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 7794689  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgactctt 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||    
T  7794690 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctt 7794789  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7794790 tagacgtgaaaatcatctcaacgtctctttcac 7794822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 29471734 - 29472280
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  29471734 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 29471833  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  29471834 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 29471933  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  29471934 aactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacagagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 29472033  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  29472034 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 29472132  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29472133 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 29472232  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29472233 tttcaaacgactctttagatgtgctaattatctcaacgtctctttcac 29472280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 13382949 - 13383480
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13382949 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 13383048  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  13383049 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13383147  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||||| |||||||      
T  13383148 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctttcgttaat 13383247  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  13383248 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 13383347  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  13383348 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 13383447  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13383448 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13383480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 530
Target Start/End: Original strand, 29933224 - 29933752
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29933224 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagagcaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaac 29933323  T
Q  120 -----------------gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatc 202  Q
                     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||     
T  29933324 taacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatataatcaccagaagctacatttgatt 29933423  T
Q  203 agtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    |||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |    
T  29933424 agtttattttaaactgaagtttcaaaggagttgtttctcgtttcaaccttg------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaa 29933517  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||| |||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29933518 gcacggagtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 29933616  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggat 494  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29933617 tagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggat 29933716  T
Q  495 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaa 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29933717 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaa 29933752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 530
Target Start/End: Original strand, 29982378 - 29982906
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29982378 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagagcaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaac 29982477  T
Q  120 -----------------gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatc 202  Q
                     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||     
T  29982478 taacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatataatcaccagaagctacatttgatt 29982577  T
Q  203 agtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    |||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |    
T  29982578 agtttattttaaactgaagtttcaaaggagttgtttctcgtttcaaccttg------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaa 29982671  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||| |||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982672 gcacggagtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 29982770  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggat 494  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29982771 tagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggat 29982870  T
Q  495 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaa 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982871 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaa 29982906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 39672568 - 39673099
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39672568 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 39672667  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  39672668 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 39672766  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  39672767 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 39672866  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||       
T  39672867 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtatg 39672966  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  39672967 ttcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 39673066  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39673067 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39673099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 551
Target Start/End: Original strand, 10626619 - 10627157
Alignment:
Q  24 gtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |  |    
T  10626619 gtcaagcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcctctgaagaga 10626718  T
Q  124 tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatat--catcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaag 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  | ||  | ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||    
T  10626719 tgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaataccttcaccagaagctacatttgatcccttaatc-aaactgaag 10626817  T
Q  221 attcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcct 319  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||      
T  10626818 attcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgagcacttgtctc 10626917  T
Q  320 tcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcaga-a 418  Q
       ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      
T  10626918 ctattaacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagatt 10627017  T
Q  419 atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aac 511  Q
     ||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  10627018 ctgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagattattattcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaac 10627117  T
Q  512 gactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10627118 gactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10627157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 4174441 - 4174973
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4174441 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 4174540  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa---ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||   | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  4174541 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 4174639  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||     
T  4174640 gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 4174739  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  4174740 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtac 4174839  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat------caggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  4174840 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 4174939  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4174940 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4174973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 9981556 - 9982100
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| |||    
T  9981556 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgtttc 9981655  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||    
T  9981656 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaa 9981755  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |     
T  9981756 actgaagatccaaagtagctgtttcttatttca-ccttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcat 9981854  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
     |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  9981855 ctgtcctacgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacatctatgcct 9981953  T
Q  413 gcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9981954 gcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggat 9982053  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9982054 ttcaaatgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9982100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 13372355 - 13372886
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13372355 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 13372454  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  13372455 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13372553  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||||| |||||||      
T  13372554 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctttcgttaat 13372653  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  13372654 aaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 13372753  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  13372754 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 13372853  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13372854 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13372886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 13393543 - 13394074
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13393543 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 13393642  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  13393643 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgttttatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13393741  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  13393742 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 13393841  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  13393842 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 13393941  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  13393942 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 13394041  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13394042 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13394074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6220386 - 6220918
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  6220386 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgt 6220485  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  6220486 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 6220584  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||     
T  6220585 gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 6220684  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  6220685 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 6220784  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  6220785 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 6220884  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6220885 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6220918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23757848 - 23757317
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  23757848 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 23757749  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  23757748 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23757650  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||  || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  23757649 tagctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 23757550  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  23757549 agatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23757450  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  23757449 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 23757350  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23757349 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23757317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5521423 - 5520893
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  5521423 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 5521324  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5521323 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5521225  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  5521224 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5521125  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  5521124 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 5521025  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  5521024 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 5520925  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5520924 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5520893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5536707 - 5537237
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  5536707 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 5536806  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5536807 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5536905  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  5536906 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5537005  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  5537006 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 5537105  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  5537106 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 5537205  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5537206 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5537237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4744288 - 4743757
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  4744288 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 4744189  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  4744188 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 4744090  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  4744089 gtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 4743990  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |     
T  4743989 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtaca 4743890  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4743889 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4743790  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4743789 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4743757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23648298 - 23647767
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  23648298 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 23648199  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  23648198 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23648100  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  23648099 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 23648000  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  23647999 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23647900  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  23647899 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 23647800  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23647799 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23647767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37760220 - 37759689
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  37760220 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 37760121  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  37760120 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 37760022  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  37760021 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 37759922  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  37759921 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 37759822  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  37759821 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 37759722  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37759721 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 37759689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37866997 - 37866464
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa---ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   | ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  37866997 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacg 37866898  T
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||    
T  37866897 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaa 37866799  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    |||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||    
T  37866798 agtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 37866699  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgtt 423  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||     
T  37866698 atagtgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgta 37866599  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 516  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  37866598 cgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcgggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactc 37866499  T
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37866498 tttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 37866464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5511245 - 5510715
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  5511245 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 5511146  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5511145 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5511047  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  5511046 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5510947  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  5510946 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 5510847  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  5510846 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 5510747  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5510746 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5510715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5547291 - 5547821
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  5547291 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 5547390  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5547391 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5547489  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  5547490 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5547589  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||| ||| |      
T  5547590 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctacagaattgtacac 5547689  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  5547690 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 5547789  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5547790 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5547821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13122212 - 13121681
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  13122212 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 13122113  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  13122112 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13122014  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  13122013 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 13121914  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  13121913 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 13121814  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  13121813 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcct 13121714  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13121713 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13121681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13132455 - 13131924
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  13132455 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 13132356  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  13132355 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13132257  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  13132256 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 13132157  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  13132156 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 13132057  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  13132056 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcct 13131957  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13131956 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13131924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14466141 - 14465610
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  14466141 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 14466042  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  14466041 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14465943  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  14465942 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 14465843  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  14465842 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 14465743  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  14465742 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcct 14465643  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14465642 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14465610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19778935 - 19778404
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19778935 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19778836  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  19778835 atcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19778737  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| ||  |  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  19778736 tagctgattcccaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19778637  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  19778636 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19778537  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||| ||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  19778536 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgactctt 19778437  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19778436 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 19778404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19789572 - 19789041
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||    
T  19789572 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgatgtc 19789473  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  19789472 atcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19789374  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  19789373 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19789274  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  19789273 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19789174  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||| ||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  19789173 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgactctt 19789074  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19789073 tagacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 19789041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 20672881 - 20673412
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  20672881 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 20672980  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  20672981 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20673079  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  20673080 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 20673179  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  20673180 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 20673279  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  20673280 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 20673379  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20673380 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 20673412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23768444 - 23767913
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  23768444 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcatgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 23768345  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
     |||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  23768344 gtcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23768246  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||  || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  23768245 tagctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 23768146  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  23768145 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23768046  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  23768045 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 23767946  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23767945 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23767913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6180212 - 6180744
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  6180212 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctaaagtgatgacgt 6180311  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  6180312 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 6180410  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||     
T  6180411 gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 6180510  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||  ||| |    
T  6180511 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcataatttgtac 6180610  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| | |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  6180611 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcattggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 6180710  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6180711 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6180744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13558124 - 13557593
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  13558124 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 13558025  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  13558024 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttaatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13557926  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||| ||| |||||||  ||||||      
T  13557925 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcacggagcacttgtctctcgttaat 13557826  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  13557825 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcatgcagaatttgtacg 13557726  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  13557725 ttcaagatgggaatgagtttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 13557626  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13557625 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13557593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 20683466 - 20683997
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  20683466 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 20683565  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  20683566 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20683664  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  20683665 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 20683764  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  20683765 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 20683864  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  20683865 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 20683964  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  20683965 tagacgtgctgattatctcaacgtccctttcac 20683997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41684228 - 41683697
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  41684228 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 41684129  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  41684128 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 41684030  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  41684029 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 41683930  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  41683929 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 41683830  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  41683829 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 41683730  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41683729 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 41683697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41694797 - 41694266
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  41694797 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 41694698  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  41694697 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 41694599  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  41694598 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 41694499  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  41694498 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 41694399  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  41694398 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 41694299  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41694298 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 41694266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 503853 - 504384
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  503853 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 503952  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  503953 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 504051  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  || |||      
T  504052 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcattaat 504151  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  504152 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 504251  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  504252 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 504351  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  504352 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 504384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 12286664 - 12287195
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  12286664 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 12286763  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12286764 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12286862  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||   ||||||  ||||||      
T  12286863 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaat 12286962  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12286963 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12287062  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12287063 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12287162  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12287163 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12287195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 192 - 449
Target Start/End: Original strand, 12567118 - 12567376
Alignment:
Q  192 tacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacgg 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12567118 tacaattaatcagtgaatttaaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 12567217  T
Q  291 tcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaca 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12567218 tcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctaca 12567317  T
Q  391 agacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaag 449  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567318 agacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 12567376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4754873 - 4754344
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  4754873 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 4754774  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  4754773 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 4754675  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  4754674 gtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 4754575  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |     
T  4754574 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtaca 4754475  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4754474 ctcaagatgggaatgaatttgaag-ttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4754376  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  4754375 tagacgtgctgatta-ctcaacgtctctttcac 4754344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 551
Target Start/End: Original strand, 10654959 - 10655479
Alignment:
Q  24 gtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |  |    
T  10654959 gtcaagcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcctctgaagaga 10655058  T
Q  124 tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||                ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||    
T  10655059 tgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaa---------------atatcttcaccagaagctacatttgatcccttaatc-aaactgaagatt 10655142  T
Q  224 caaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcg 322  Q
    |||||||||||| | ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||         
T  10655143 caaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgagcacttgtctccta 10655242  T
Q  323 ttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcaga-aatg 421  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||   ||    
T  10655243 ttaacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattttg 10655342  T
Q  422 ttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
      | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  10655343 cgccttcaagatgggaatgaatttgaagattattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgac 10655442  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10655443 tctttcgacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10655479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 129 - 502
Target Start/End: Original strand, 16391398 - 16391780
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16391398 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaa 16391497  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||| | |||||||||||||     
T  16391498 gtagctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttggataacactgagcatttgtccttcgttaa 16391597  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  16391598 cagagttgacaaagtacaagtatacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatgtgtacc 16391697  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaag 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  16391698 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgagtacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaag 16391780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 12296486 - 12297017
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  12296486 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 12296585  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12296586 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12296684  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||   ||||||  ||||||      
T  12296685 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaat 12296784  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12296785 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12296884  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||| |||||    
T  12296885 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgcctctt 12296984  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12296985 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12297017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20721663 - 20721132
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  20721663 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 20721564  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  20721563 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20721465  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  20721464 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 20721365  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  20721364 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 20721265  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  20721264 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 20721165  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20721164 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 20721132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14476773 - 14476240
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  14476773 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 14476674  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  14476673 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14476575  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  14476574 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 14476475  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  14476474 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacactacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 14476375  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  14476374 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcct 14476275  T
Q  519 tagacgtgctaat--catctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  14476274 tagacgtgctgattatatctcaacgtctctttcac 14476240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 29947137 - 29947555
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  29947137 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaa 29947236  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||       
T  29947237 ggagctgtttctcgtttcaaccttg------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29947329  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  29947330 agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaattttcctt 29947429  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29947430 caagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 29947529  T
Q  522 acgtgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29947530 acgtgctaaagaatctcaacgtctct 29947555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 29996291 - 29996709
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  29996291 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaa 29996390  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||       
T  29996391 ggagctgtttctcgtttcaaccttg------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29996483  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  29996484 agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaattttcctt 29996583  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29996584 caagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 29996683  T
Q  522 acgtgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29996684 acgtgctaaagaatctcaacgtctct 29996709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24383203 - 24383735
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  24383203 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 24383302  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  24383303 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 24383401  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  24383402 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 24383501  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  24383502 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 24383601  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  24383602 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 24383701  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24383702 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24383735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5865381 - 5865910
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  5865381 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 5865480  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |     ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||     
T  5865481 atcagaagcagaacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtt 5865579  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  ||    
T  5865580 gctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatag 5865679  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  |    
T  5865680 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact 5865779  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  5865780 caagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttta 5865879  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5865880 gacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5865910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 29905972 - 29906390
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  29905972 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaa 29906071  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||       
T  29906072 ggagctgtttctcgtttcaaccttg------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgtaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29906164  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  29906165 agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaattttcctt 29906264  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906265 caagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 29906364  T
Q  522 acgtgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29906365 acgtgctaaagaatctcaacgtctct 29906390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37886111 - 37885597
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  37886111 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 37886012  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||| |||                ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  37886011 atcagaagcaaaagt---------------tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagta 37885928  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||    
T  37885927 gctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatag 37885828  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| | ||    
T  37885827 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgtt 37885728  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  37885727 caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttta 37885628  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37885627 gacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 37885597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10099619 - 10099087
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  10099619 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 10099520  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgata-tcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaaga-ttcaa 226  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  | | |   |||||||||||||| || |||  | |||  |||||||| | |||||    
T  10099519 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagatttcatcagaagcaaaagttggcaccagaagctacatttgatcttttaatc-aaactgaaaaattcaa 10099421  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    |||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||| |  || |||    
T  10099420 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgcctctcatta 10099321  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |    
T  10099320 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtac 10099221  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||  ||||||||  || |||||||||    
T  10099220 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactct 10099121  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10099120 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10099087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16476828 - 16476382
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16476828 atttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 16476729  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16476728 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16476630  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  16476629 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 16476530  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-ttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  16476529 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttcttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 16476430  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccc 473  Q
     |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16476429 ctcaccatgggaatgaatttgaagcttatccttcaaaggactacaccc 16476382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 526200 - 526750
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  526200 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 526299  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa---------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaat 209  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                     | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||    
T  526300 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaat 526399  T
Q  210 ttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactga 308  Q
      ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||    
T  526400 c-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 526498  T
Q  309 gtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctc 407  Q
    |  ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||      
T  526499 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 526598  T
Q  408 tgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  526599 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 526698  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  526699 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 526750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5579301 - 5579850
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  5579301 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 5579400  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  5579401 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 5579500  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  5579501 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5579599  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  5579600 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 5579699  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  5579700 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5579799  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5579800 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5579850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5627685 - 5628234
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  5627685 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 5627784  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  5627785 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 5627884  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  5627885 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5627983  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  5627984 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 5628083  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  5628084 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5628183  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5628184 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5628234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 28313900 - 28314448
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  28313900 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 28313999  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||      
T  28314000 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc- 28314098  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||     
T  28314099 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagc 28314198  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  28314199 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 28314298  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  28314299 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 28314398  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28314399 gatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 28314448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5875963 - 5876509
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  5875963 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 5876062  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta--aggtt---------------tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |  | ||                ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||    
T  5876063 atcagaagcagaacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aa 5876161  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  |    
T  5876162 actgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctc 5876261  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
    |||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||     
T  5876262 ttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcc 5876361  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||    
T  5876362 tgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaagga 5876461  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5876462 tttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5876509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8775111 - 8774676
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  8775111 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 8775013  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||  || ||    
T  8775012 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcatt 8774913  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  8774912 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt 8774813  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  8774812 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 8774713  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8774712 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 8774676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8785696 - 8785261
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  8785696 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 8785598  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||  || ||    
T  8785597 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcatt 8785498  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  8785497 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt 8785398  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  8785397 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 8785298  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8785297 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 8785261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24660468 - 24659919
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  24660468 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 24660369  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  24660368 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 24660269  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||| |||||    
T  24660268 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagctctgag 24660170  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  24660169 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 24660070  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  24660069 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24659970  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24659969 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24659919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35187945 - 35187396
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  35187945 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 35187846  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  35187845 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 35187746  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  35187745 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 35187647  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  35187646 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 35187547  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  35187546 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 35187447  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35187446 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 35187396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18484612 - 18484063
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  18484612 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 18484513  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||      
T  18484512 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc- 18484414  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  18484413 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagc 18484314  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  18484313 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 18484214  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  18484213 cctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 18484114  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18484113 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 18484063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 28324516 - 28325064
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  28324516 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 28324615  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||      
T  28324616 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc- 28324714  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||     
T  28324715 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagc 28324814  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  28324815 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 28324914  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  28324915 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 28325014  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28325015 gatttcaaacgactctttaaacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 28325064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24671048 - 24670499
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  24671048 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 24670949  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  24670948 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 24670849  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||| |||||    
T  24670848 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagctctgag 24670750  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  24670749 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcat 24670650  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  24670649 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24670550  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24670549 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24670499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38195293 - 38194743
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  38195293 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 38195194  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||     
T  38195193 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc 38195094  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  38195093 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 38194995  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  38194994 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 38194895  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  38194894 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 38194795  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38194794 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 38194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38205829 - 38205279
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  38205829 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 38205730  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||     
T  38205729 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc 38205630  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  38205629 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 38205531  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  38205530 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 38205431  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  38205430 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 38205331  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38205330 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 38205279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 377
Target Start/End: Original strand, 16348418 - 16348669
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16348418 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaa 16348517  T
Q  228 gtagct-gtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    |||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16348518 gtagcttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtctttcgtta 16348617  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
     |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16348618 acagagttgacaaaatacaagtgtgcaaccactacctccactactttgtttt 16348669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 11272050 - 11272600
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  11272050 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 11272149  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||     
T  11272150 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc 11272249  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||    
T  11272250 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgag 11272348  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
     |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  11272349 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 11272448  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  11272449 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 11272548  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11272549 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 11272600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39372622 - 39372072
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  39372622 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 39372523  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||     
T  39372522 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc 39372423  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |  | | |||||||    
T  39372422 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatagataacactgag 39372324  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
     |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  39372323 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 39372224  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  39372223 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 39372124  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39372123 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39372072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39383109 - 39382709
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  39383109 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 39383011  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39383010 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 39382911  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39382910 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 39382811  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39382810 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 39382711  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  39382710 ac 39382709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 14254048 - 14254188
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14254048 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatctgaagcatctgaagaaaactgcgtttgaagctaaagtgctt 14254147  T
Q  115 ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14254148 ctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 14254188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16493587 - 16493245
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16493587 atttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 16493488  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16493487 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16493389  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  16493388 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 16493289  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16493288 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 16493245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21736702 - 21736136
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  21736702 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaacctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgtttctgaa 21736603  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcag----------------aagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||                |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  21736602 gttacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcacc 21736503  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||| || ||||| | ||| || ||  |   |||||  |||||||| ||    | ||||| |||||  ||| ||||| ||  ||| ||| ||      
T  21736502 agaagctacagttgatcagaagattcaatctagaatctcaaaagagctgtttctttaagttaacctcgtctaagagagcgaaggatcaaaagggaagtgc 21736403  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |    
T  21736402 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctc 21736304  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||        
T  21736303 gctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgttcccacaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaa 21736204  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21736203 aagattactggtagatgatcaaaggaactcaacgacactttagacgtgctaaagatctcaacgtctct 21736136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 15651059 - 15651279
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||     
T  15651059 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaatttttccttcaaa 15651158  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651159 ataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 15651258  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||| ||||||    
T  15651259 gctaaaaatctcaatgtctct 15651279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 15662694 - 15662914
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||     
T  15662694 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaatttttccttcaaa 15662793  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15662794 ataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgaccctttagacgt 15662893  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  15662894 gctaaaaatctcaacgtctct 15662914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 285 - 482
Target Start/End: Original strand, 51989086 - 51989283
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  51989086 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaatctgtttgtgtctac 51989184  T
Q  385 gctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagga 482  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  51989185 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcagga 51989283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 15226641 - 15226737
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15226641 aagtcaatcaatttaaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 15226737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 291 - 528
Target Start/End: Original strand, 31113935 - 31114177
Alignment:
Q  291 tcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaca 390  Q
    ||||||||| ||||||  || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  31113935 tcatttgaaaagcactaggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctaca 31114033  T
Q  391 agacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggatt 484  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||      | ||||    
T  31114034 agacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagttaggaatggttttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagatt 31114133  T
Q  485 actggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct 528  Q
    | || || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31114134 aatgttgaatgatcaaaggttctcaacgactctttagacgtgct 31114177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10529397 - 10529247
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10529397 ttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaa 10529298  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  10529297 gataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 10529247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11168053 - 11167915
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaag-aaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  11168053 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgcttct 11167954  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11167953 gaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaag 11167915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27173123 - 27172928
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-ctctgtttttgtcta 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||  | |  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||      
T  27173123 caacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtctttattga--agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcct 27173026  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27173025 cgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatttgttctttcaagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacatccaaatcagg 27172928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 332 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41045793 - 41045646
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41045793 ttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaag 41045694  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 479  Q
     | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  41045693 ttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatca 41045646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 15662372 - 15662567
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc--taaagtgcttct---------- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||              
T  15662372 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctataaagtgcttctgaagtttcaa 15662471  T
Q  117 --------gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
            || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  15662472 gtgcctccgaagtaatgatgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagttacagttgatcag 15662567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16386239 - 16386096
Alignment:
Q  412 tgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||     
T  16386239 tgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaatctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggat 16386140  T
Q  506 ctca-acgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
     ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16386139 ttcatacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 9092151 - 9092270
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9092151 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagatttcatcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaaag 9092250  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaac 248  Q
     || ||||||||||||||||    
T  9092251 gagttgtttttcgtttcaac 9092270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 8758141 - 8758225
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8758141 aagtcaatca-tttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 8758225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14581723 - 14581620
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  14581723 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatccaaagcttctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 14581624  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  14581623 gtaa 14581620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 15851061 - 15850909
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaa-ccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | ||||||||||| |||    
T  15851061 ttgacaaagtacaaagtgtacaaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctccagaaatgttccttc 15850962  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  15850961 aagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 15850909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16487441 - 16487067
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  16487441 atttcattaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 16487342  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||| |     ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  16487341 catcagaagcagaaagtcatcaaaagcagaaagtcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagt 16487243  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||  ||||||  |||| |  |    
T  16487242 tgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataccactgagctcttgtctctcgtcaata 16487143  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaaca 403  Q
    || |||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  16487142 gagttgacacactacaagtgttcaaccagtacctccactactctgctttctgtctacgctcacagacaagacaaca 16487067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 8995597 - 8995679
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995597 aagtcactcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaatcctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 8995679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22151336 - 22151146
Alignment:
Q  291 tcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctac 389  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||||||   || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  22151336 tcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttca--atgagagttgacaaagtacaaagcgtacaaccactacctccacgattctgcttgtgtctacgctac 22151239  T
Q  390 aagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  22151238 aagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttctttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcagg 22151146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15833455 - 15833355
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15833455 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 15833356  T
Q  430 a 430  Q
    |    
T  15833355 a 15833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 8739769 - 8739852
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739769 aagtcattcaatttcaataggttttggaagaacaatagagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 8739852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 9092007 - 9092090
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9092007 aagtcattcaatttcaataggttttggaagaacaatagagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 9092090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 51341062 - 51340911
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  51341062 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaaatgttccttca 51340963  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| || || ||| ||||||||||    
T  51340962 gaataggaatggatttgaacgtgatccttcatagtacaacaaccaaatcagg 51340911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 9006149 - 9006226
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtct 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9006149 aagtcactcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaatcctaagcatctgaagaaaactgcgtct 9006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 15650737 - 15650923
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------------aa 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                    ||    
T  15650737 tcaatttcaataggtcttagaagaacaatagagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaagtacgtctgaagctataaagtgcttctgaagtttcaa 15650836  T
Q  109 gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15650837 gtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatgagaagcaagatttcgtcagaagctatatcatcaccagaagctaca 15650923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 23680058 - 23680157
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc-cgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23680058 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 23680157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 24052295 - 24052394
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc-cgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24052295 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 24052394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17022078 - 17021975
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17022078 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 17021979  T
Q  430 agat 433  Q
    ||||    
T  17021978 agat 17021975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 29905832 - 29905926
Alignment:
Q  25 tcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29905832 tcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcctctga 29905926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 29946997 - 29947091
Alignment:
Q  25 tcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29946997 tcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcctctga 29947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 29996151 - 29996245
Alignment:
Q  25 tcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29996151 tcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcctctga 29996245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Original strand, 13198884 - 13198964
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13198884 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaattgcgtctgaa 13198964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13604811 - 13604699
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagga-atccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |  ||||||||    
T  13604811 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagagattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaactgctcctgaagagatgacgtc 13604712  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  13604711 atcagaagcagaa 13604699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 384 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 17961545 - 17961406
Alignment:
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag--- 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||||||       
T  17961545 cgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatttgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaatcaggca 17961446  T
Q  481 ---gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 517  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961445 acagatcactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 17961406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 7607994 - 7608081
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7607994 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 7608081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 45861693 - 45861831
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac-aagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||||| |    
T  45861693 aagtgtacgaccactacctccactactatgtttatgtctacgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaataggaatgga 45861792  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  45861793 tttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 45861831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18006734 - 18006570
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaa-ctgaagattcaaag 228  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||  |||| |||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||| || |||||||||||    
T  18006734 catccgaagcagaagtc-atcagaagcaatatttcgtcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaagattcaaag 18006636  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat 294  Q
     |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  18006635 gagctgtttctcgtttcaatctcgtctagaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 18006570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17961925 - 17961853
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17961925 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaatccagagcatctgaagaaaactacgtctgaag 17961853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18006490 - 18006351
Alignment:
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag--- 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||||||       
T  18006490 cgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatttgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaatcaggca 18006391  T
Q  481 ---gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 517  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18006390 acagatcactggtggatgatcaaaggaacttaacgactct 18006351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Original strand, 16348273 - 16348375
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16348273 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctagagtgcttct 16348372  T
Q  117 gag 119  Q
    |||    
T  16348373 gag 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2561226 - 2561121
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| | ||||   |||||| ||||  |||||||||||    
T  2561226 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaa 2561127  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  2561126 tttgaa 2561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40799912 - 40799807
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  40799912 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 40799813  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  40799812 tttgaa 40799807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 16391265 - 16391353
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16391265 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctagagtgcttctga 16391353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19531823 - 19531711
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  19531823 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 19531724  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  19531723 atcagaagcagaa 19531711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 429
Target Start/End: Original strand, 12752728 - 12752827
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12752728 ttgacaaagtacaaagtgtacgaccactatctccacaactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaaaatgttccttca 12752827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 13148317 - 13148166
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  13148317 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaattgttccttca 13148218  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  13148217 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 13148166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 49990280 - 49990161
Alignment:
Q  363 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaa 461  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||||     
T  49990280 ccactactctgcttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcat 49990181  T
Q  462 aggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  49990180 aggacaacatccaaatcagg 49990161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 105
Target Start/End: Original strand, 7794258 - 7794332
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7794258 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactatgtctgaagct 7794332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5213615 - 5213511
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||| |    
T  5213615 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcgtgcaacaatgttccttctcaatgggaatgca 5213517  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  5213516 tttgaa 5213511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 24775655 - 24775760
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  24775655 aagtgtacaaccactacatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagtaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 24775754  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  24775755 tttgaa 24775760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 47405542 - 47405647
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  || |||||| |    
T  47405542 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgca 47405641  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  47405642 tttgaa 47405647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 12858433 - 12858520
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12858433 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaaaaacaatggaaagaaaaagaattctaagcatctgaataaaactgcgtctgaagct 12858520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 47207744 - 47207621
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| || || ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  47207744 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagttcagcctgcaacgatgttcattcacaatgggaatgca 47207645  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
    ||||||  | |||||||| |||||    
T  47207644 tttgaaattgattcttcataggac 47207621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 12726351 - 12726405
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12726351 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 12726405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 53056848 - 53056902
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53056848 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 53056902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 11909145 - 11909226
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  11909145 aagtgtacgaccactacctccactactttgtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttc 11909226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17961789 - 17961625
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaa-ctgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||  |||| |||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||| || | |||||||||    
T  17961789 catcagaagcagaagtc-atcagaagcaatatttcgtcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaggattcaaag 17961691  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat 294  Q
     || |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  17961690 gagttgtttcacgtttcaatctcatctagaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 17961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 25398376 - 25398428
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25398376 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaa 25398428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 21605775 - 21605842
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  21605775 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgc 21605842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6090770 - 6090716
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  6090770 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctgcaagacaaga 6090716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11868307 - 11868253
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11868307 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaaaacaaga 11868253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 18121743 - 18121797
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18121743 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctctgctacaagacaaga 18121797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 18142873 - 18142927
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  18142873 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctctgctacaagacaaga 18142927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22140802 - 22140748
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22140802 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22140748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29855447 - 29855393
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  29855447 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctctgctacaagacaaga 29855393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2785102 - 2784998
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||| |    
T  2785102 aagtgtacaaccactacctccactactctg-atttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaagaatgttccttctcaatgggaatgca 2785004  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  2785003 tttgaa 2784998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 21636791 - 21636844
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21636791 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 21636844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28582144 - 28582039
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  28582144 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctggtacaaaacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 28582045  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  28582044 tttgaa 28582039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 415
Target Start/End: Original strand, 30054341 - 30054410
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac-aagacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  30054341 tgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 30054410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 1728136 - 1728208
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  1728136 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 1728208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16032563 - 16032511
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  16032563 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacatgacaa 16032511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Original strand, 17909670 - 17909737
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  17909670 aatttgaataggtcttggaagaacaaaggaaagcaaaggaattcatagcatctaaagaaaactgcgtc 17909737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39383276 - 39383189
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  39383276 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 39383189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 49553610 - 49553661
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  49553610 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagaca 49553661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 12388993 - 12389031
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12388993 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 12389031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20646192 - 20646138
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  20646192 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 20646138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 38177764 - 38177818
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  38177764 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgactctgctacaagacaaga 38177818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 46796488 - 46796542
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  46796488 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaaga 46796542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Original strand, 49666526 - 49666612
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  49666526 aagtgtacaaccactatctccactactctgattctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttca 49666612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14955465 - 14955361
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| | || |||||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||| |    
T  14955465 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttatctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgca 14955367  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  14955366 tttgaa 14955361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 16658739 - 16658820
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  16658739 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 16658820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 20627552 - 20627657
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||| | |||| |||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  20627552 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttatctctgctacaagataagaaaaacaactctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 20627651  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  20627652 tttgaa 20627657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33583267 - 33583163
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  33583267 aagtgtacaaccactacctccaatactct-attttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 33583169  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  33583168 tttgaa 33583163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 49642883 - 49642964
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  49642883 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 49642964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Original strand, 16391349 - 16391396
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16391349 tctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaag 16391396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18006829 - 18006790
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagga 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18006829 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaagga 18006790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 157
Target Start/End: Original strand, 8758245 - 8758295
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta 157  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8758245 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagta 8758295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8775237 - 8775155
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  8775237 aataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 8775155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8785822 - 8785740
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  8785822 aataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 8785740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 9700157 - 9700211
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9700157 aagtgtataaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9700211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11223601 - 11223548
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  11223601 aagtgtacaaccactatctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 11223548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Original strand, 14393125 - 14393211
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  14393125 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcggcaatgttccttca 14393211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37412640 - 37412590
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37412640 tgtacaaccactatctccactactctgtttctgtcttcactacaagacaag 37412590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 14392846 - 14392911
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  14392846 gaagcatctgaagagaagtgctcctgaagttaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14392911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 31303424 - 31303343
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  31303424 aagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 31303343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16812257 - 16812201
Alignment:
Q  352 aaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  16812257 aaccactatctccactactttgtttttgtctctgctataagacaagaaaacagctct 16812201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 23680180 - 23680251
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23680180 atgacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccaaaagctaca 23680251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 24052417 - 24052488
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  24052417 atgacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccaaaagctaca 24052488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 27244808 - 27244872
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  27244808 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 27244872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 47405292 - 47405356
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaag-ctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagc 139  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47405292 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagc 47405356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21640905 - 21640838
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||||||| | |||||||||||    
T  21640905 aagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtctcttttacaagacaagaataacagctctgc 21640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37467371 - 37467304
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  37467371 aagtgtacaaccactatctccactacccagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgc 37467304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 12963206 - 12963260
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  12963206 aagtgtacaaccactatctccactactcagtatgtgtctctgctacaagacaaga 12963260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 13780705 - 13780759
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  13780705 aagtgtacaaccactatctccacgactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 13780759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27173342 - 27173301
Alignment:
Q  79 catctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27173342 catctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctga 27173301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 52920444 - 52920390
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  52920444 aagtatacaaccactacctctactaccctgtttttgtctctgatacaagacaaga 52920390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6091051 - 6090986
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  6091051 gaagcatctgaagagaagtgctcctgaagttaaagtgctcatgaagttatgacgtcatcagaagca 6090986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12968344 - 12968311
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12968344 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 12968311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13148660 - 13148615
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13148660 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 13148615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13824097 - 13824044
Alignment:
Q  363 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13824097 ccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 13824044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15903518 - 15903453
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || |||  || |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15903518 gaagcatctgaagagaagtgctccttaagtcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15903453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 19249253 - 19249318
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| | || |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19249253 gaagcatctgaagaaaagtggttctgaagttcaaatgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19249318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Original strand, 20627269 - 20627302
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20627269 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatc 20627302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 46349965 - 46350018
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||    
T  46349965 aagtgtacaaccactgcctccactactatgttctttgtctctgctacaagacaa 46350018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 52920724 - 52920659
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  52920724 gaagcatctgaagagaagtgctcctgaagtaaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 52920659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10851855 - 10851811
Alignment:
Q  334 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10851855 gacatagtacaattgtacaaccaccatctccactactctgttttt 10851811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11223865 - 11223801
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  11223865 aagcatctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 11223801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14392360 - 14392332
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14392360 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 14392332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 15094015 - 15094043
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15094015 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 15094043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16880058 - 16880026
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16880058 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 16880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 21155862 - 21155890
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155862 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 21155890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 30399370 - 30399342
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30399370 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 30399342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 143
Target Start/End: Original strand, 31113738 - 31113774
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaa 143  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31113738 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 31113774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 33773503 - 33773531
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33773503 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 33773531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 38177560 - 38177592
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38177560 atgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaag 38177592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40288712 - 40288684
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40288712 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 40288684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Original strand, 51988794 - 51988830
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51988794 aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 51988830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 151)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 27978055 - 27978615
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27978055 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaatactgcgtctgaagttaaagtgctt 27978154  T
Q  115 ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag-----------------accatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27978155 ctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagcccatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaag 27978254  T
Q  198 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27978255 tgttcaattaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 27978354  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978355 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 27978454  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  27978455 gacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 27978554  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978555 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 27978615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 28064584 - 28065144
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28064584 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaatactgcgtctgaagttaaagtgctt 28064683  T
Q  115 ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag-----------------accatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28064684 ctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagcccatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaag 28064783  T
Q  198 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28064784 tgttcaattaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 28064883  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28064884 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 28064983  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  28064984 gacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 28065083  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28065084 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 28065144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 38585758 - 38586320
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38585758 cataggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctaaagtgctt 38585857  T
Q  115 ctgaggtaa-tgacgtcatcagaagcagaaga-----------------ccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaa 196  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||                  |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38585858 ctgaagtaaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagaagaagcccatcagaagcaaggttttatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaa 38585957  T
Q  197 ttaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38585958 ttaatcagtaaatttaaactgtagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatt 38586057  T
Q  296 tgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38586058 tgaagagcactgagtacttgtccttctttaacatagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaaaagac 38586157  T
Q  395 aagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactg 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  38586158 aagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactg 38586257  T
Q  489 gtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38586258 gtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 38586320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 18768580 - 18769139
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18768580 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 18768679  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18768680 gaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattt 18768779  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18768780 aatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 18768879  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18768880 gatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaag 18768978  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  18768979 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 18769078  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769079 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 18769139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 24414697 - 24415255
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414697 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 24414796  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatta 199  Q
    | |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  24414797 aagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattg 24414896  T
Q  200 atcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttga 298  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  24414897 atttgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttgg 24414996  T
Q  299 agagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24414997 atagcactgagtatttgtccttcgttaacaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 24415095  T
Q  399 caacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtg 491  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    
T  24415096 caacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtg 24415195  T
Q  492 gatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415196 aatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 24415255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26867643 - 26867067
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867643 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaacggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 26867544  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg----------------tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||                |||||||||||| || |||| |    
T  26867543 aagctggagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcacc 26867444  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagt-aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26867443 accagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagcattgaaagggag 26867344  T
Q  281 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26867343 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgt 26867244  T
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc-- 478  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26867243 ccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 26867144  T
Q  479 ----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867143 gcaaaggattgttggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 26867067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26880232 - 26879656
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt--- 114  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  26880232 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttttg 26880133  T
Q  115 --------------ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag-------------taa-----ggtttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
                  |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||             |||     | |||||||||||| || |||| |    
T  26880132 aagctggagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaagatcatcataagcaaggttttcatcagaagcgaaatcacc 26880033  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagt-aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26880032 accagaagttacatttgatcagtaaaattcaacctgaagattcaaattagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggag 26879933  T
Q  281 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26879932 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttatccttcattaacaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgt 26879833  T
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc-- 478  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26879832 ccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 26879733  T
Q  479 ----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879732 acaaaggattgctggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 26879656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 36784482 - 36785031
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttctgag 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  36784482 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 36784581  T
Q  120 gta------------------atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    |||                  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |      |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36784582 gtaccaagtgtctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgat 36784681  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  36784682 cagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcatctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaa 36784781  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    ||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36784782 gcattggatacttgtccttcgctatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 36784881  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
           || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  36784882 -------gcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccctcaaatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatg 36784974  T
Q  496 atcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36784975 atcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 36785031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 28721003 - 28721550
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgagg--------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |             
T  28721003 aatttcaataggtcttggaagaacagtggaaagcaaaggaatactaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctgaagctgaagtgc 28721102  T
Q  121 --------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
            | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  28721103 atctggagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 28721202  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28721203 aaactcaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 28721302  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28721303 atctgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 28721401  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  28721402 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 28721501  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721502 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 28721550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 28731591 - 28732136
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgagg--------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |             
T  28731591 aatttcaataggtcttggaagaacagtggaaagcaaaggaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctgaagctgaagtgc 28731690  T
Q  121 --------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
            | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  28731691 atctggagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 28731790  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28731791 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacatcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 28731890  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28731891 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgt--aaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 28731987  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  28731988 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 28732087  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732088 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 28732136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 21172269 - 21172700
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21172269 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 21172368  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  21172369 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaa 21172468  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |     
T  21172469 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagaatttgtgcc 21172567  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  21172568 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctt 21172667  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172668 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 21172700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 130 - 546
Target Start/End: Original strand, 967309 - 967730
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  967309 catcagaagcagaaatccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 967408  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||    
T  967409 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-ag 967507  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  967508 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaaatgttccttca 967607  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagac 523  Q
    |||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  967608 agataggaatgaatttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagac 967707  T
Q  524 gtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  967708 gtgctaaaaatctcaacgtctct 967730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24275448 - 24275027
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24275448 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaa-tttaaactgaagtttcaaag 24275350  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   |    
T  24275349 gagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 24275251  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24275250 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 24275151  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || | ||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275150 aagataggaatgaatttgaatttgatccgtcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 24275051  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  24275050 cgtgctaaaaatctcaacgtctct 24275027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 19497668 - 19498218
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  19497668 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttttgaa 19497767  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||    
T  19497768 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctatagttgat 19497867  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatgg-aggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |  |||||  | ||||||| | | ||| || ||||  ||||| |||||||||     
T  19497868 cagtatatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatcccgtctaagaaaacgaaggactaaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaa 19497967  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaca 400  Q
    ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19497968 agcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctactctacaagacaagaca 19498066  T
Q  401 acagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggat 494  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||||      | ||||||||||||||    
T  19498067 acagctctgcctgcagaaatgttcctttaagataggaatgaatttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggat 19498166  T
Q  495 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19498167 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 19498218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 7005511 - 7006042
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  7005511 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctaaagtgatgacgtc 7005610  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  7005611 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 7005709  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  7005710 tagctgattctcaattcaatcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 7005809  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  7005810 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 7005909  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  7005910 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 7006009  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7006010 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7006042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29244746 - 29244215
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  29244746 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacatc 29244647  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  29244646 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29244548  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    || ||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  29244547 taactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 29244448  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  29244447 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 29244348  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  29244347 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 29244248  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29244247 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 29244215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22774784 - 22774359
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  22774784 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttgtcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttcaaa 22774685  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||      
T  22774684 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga 22774585  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22774584 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcct 22774486  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttta 520  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22774485 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttta 22774386  T
Q  521 gacgtgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22774385 gacgtgctaaaggatctcaacgtctct 22774359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43093781 - 43093249
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  43093781 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 43093682  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  43093681 atcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43093583  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat-ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| | ||||||||| |||||||  ||||||     
T  43093582 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 43093483  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaat-gttc 424  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| | || |    
T  43093482 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgtac 43093383  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  43093382 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 43093283  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43093282 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 43093249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29255325 - 29254794
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  29255325 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacatc 29255226  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  29255225 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29255127  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    || ||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  29255126 taactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 29255027  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  29255026 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 29254927  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  29254926 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 29254827  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29254826 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 29254794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 548
Target Start/End: Original strand, 17968868 - 17969438
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  17968868 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 17968967  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaaga----------------ccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
         |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||                |||||||||| ||| ||||||||||||   | ||||||||    
T  17968968 gtttcaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctgtgtcatcacc 17969067  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaattt--aaactgaagattcaaagtagctg-tttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||| || ||||  | ||||   |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  17969068 agaagctacagttgatcaaaatattttataactgaagtttcaaaggagctgttttttcgttttatcctcgtctgagaa-aacgaagaattgaaagggagg 17969166  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17969167 tatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgctcgtccttcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacatccactactctatttttgtc 17969265  T
Q  382 tacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag- 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  17969266 tacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcagg 17969365  T
Q  481 -----gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17969366 caaaagattaatggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 17969438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43083172 - 43082640
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  43083172 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 43083073  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  43083072 atcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcggaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43082974  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat-ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| | ||||||||| |||| ||  ||||||     
T  43082973 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttatctctcgttaa 43082874  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaat-gttc 424  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | || |    
T  43082873 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtac 43082774  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  43082773 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 43082674  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43082673 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 43082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9773010 - 9773541
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9773010 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 9773109  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9773110 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9773208  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9773209 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9773308  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9773309 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9773408  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9773409 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 9773508  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9773509 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9773541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9897278 - 9897809
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9897278 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9897377  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9897378 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9897476  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9897477 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9897576  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9897577 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9897676  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9897677 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 9897776  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9897777 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9897809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9907866 - 9908397
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9907866 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9907965  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9907966 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9908064  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9908065 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9908164  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9908165 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9908264  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9908265 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 9908364  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9908365 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9908397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 34478452 - 34477922
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  34478452 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 34478353  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  34478352 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34478254  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  34478253 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 34478154  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  34478153 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 34478054  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  34478053 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 34477954  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34477953 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 34477922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9762474 - 9763005
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9762474 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 9762573  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9762574 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9762672  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  9762673 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctttaat 9762772  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9762773 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9762872  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9762873 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 9762972  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9762973 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9763005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 17857141 - 17857672
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  17857141 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttgagcatctgaggaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 17857240  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  17857241 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 17857339  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  17857340 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 17857439  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  17857440 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 17857539  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  17857540 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 17857639  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17857640 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17857672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24327438 - 24327969
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  24327438 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactactcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 24327537  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24327538 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24327636  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  24327637 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 24327736  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||  ||| |     
T  24327737 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 24327836  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  24327837 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 24327936  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  24327937 tagacatgctgattatctcaacgtctctttcac 24327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 34789921 - 34790452
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34789921 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 34790020  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  34790021 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34790119  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| || |||||||  ||||||      
T  34790120 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgttaat 34790219  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  34790220 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34790319  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  34790320 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 34790419  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34790420 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 34790452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40222857 - 40222326
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40222857 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 40222758  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  40222757 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 40222659  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  40222658 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 40222559  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  40222558 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 40222459  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  40222458 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 40222359  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40222358 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40222326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40251718 - 40251187
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40251718 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 40251619  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  40251618 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 40251520  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  40251519 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 40251420  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  40251419 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 40251320  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  40251319 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 40251220  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40251219 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40251187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 21650236 - 21650766
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  21650236 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 21650335  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  21650336 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21650434  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  21650435 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 21650534  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  21650535 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 21650634  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  21650635 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 21650734  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21650735 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 21650766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43355546 - 43355016
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  43355546 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 43355447  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  43355446 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43355348  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  43355347 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 43355248  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  43355247 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 43355148  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  43355147 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 43355048  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43355047 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 43355016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 131 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2561913 - 2561484
Alignment:
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  2561913 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 2561814  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    |||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  2561813 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcacttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 2561714  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||| | ||    
T  2561713 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 2561615  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  2561614 caaagtgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactcttta 2561515  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2561514 gacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 2561484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 22914568 - 22915099
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  22914568 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 22914667  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22914668 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22914766  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  22914767 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22914866  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||  ||| |     
T  22914867 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtaca 22914966  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22914967 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22915066  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22915067 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22915099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32218398 - 32217867
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  32218398 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 32218299  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| | |||  ||||| |||||||||||    
T  32218298 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctatgtttgatcatttaatc-aaactaaagattcaaag 32218200  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  32218199 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 32218100  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  32218099 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 32218000  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  32217999 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 32217900  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32217899 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 32217867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 34804064 - 34804595
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34804064 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 34804163  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  34804164 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34804262  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| || |||||||  ||||||      
T  34804263 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgttaat 34804362  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  34804363 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34804462  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  34804463 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 34804562  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  34804563 tagacgtggtgattatctcaacgtctctttcac 34804595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22764080 - 22763655
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  22764080 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttttcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttcaaa 22763981  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||      
T  22763980 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga 22763881  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |    
T  22763880 -agagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaccagctctacctgcagaaatgttcct 22763782  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttta 520  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || | ||| ||||  ||| |||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22763781 tcaagataggaatggatttgaacttgatccgtcataggagaacatccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttta 22763682  T
Q  521 gacgtgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22763681 gacgtgctaaaggatctcaacgtctct 22763655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10267518 - 10266987
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  10267518 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 10267419  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  10267418 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10267320  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  10267319 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10267220  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  10267219 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10267120  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  10267119 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 10267020  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10267019 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10266987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10278095 - 10277564
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  10278095 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 10277996  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  10277995 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10277897  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  10277896 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10277797  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  10277796 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10277697  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  10277696 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 10277597  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10277596 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10277564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 22960036 - 22960567
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  22960036 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 22960135  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22960136 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22960234  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  22960235 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22960334  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||  ||| |     
T  22960335 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtaca 22960434  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22960435 ctcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22960534  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22960535 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22960567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24338108 - 24338639
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  24338108 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctaaagtgatgacgtc 24338207  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||| |||||||||    
T  24338208 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgatgattcaaag 24338306  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||| |||| |||||||  ||||||      
T  24338307 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcattgagcacttgtctctcgttaat 24338406  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  24338407 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 24338506  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||| ||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  24338507 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgactctt 24338606  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  24338607 tagacatgctgattatctcaacgtctctttcac 24338639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43345931 - 43345401
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  43345931 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 43345832  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  43345831 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43345733  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  43345732 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 43345633  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  43345632 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 43345533  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  43345532 tcaagatggaaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 43345433  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43345432 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 43345401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4210415 - 4209884
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  4210415 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 4210316  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| || |||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  4210315 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttattagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4210217  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  4210216 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4210117  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  4210116 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4210017  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4210016 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4209917  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4209916 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4209884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 11388512 - 11389044
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  11388512 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 11388611  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  11388612 catcagaagcaaaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 11388710  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||     
T  11388711 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 11388810  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  11388811 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 11388910  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  11388911 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 11389010  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11389011 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 11389044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4221007 - 4220476
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  4221007 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 4220908  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  4220907 atcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagttacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4220809  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  4220808 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4220709  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  4220708 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4220609  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4220608 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4220509  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4220508 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4220476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 36251565 - 36252079
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  36251565 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 36251664  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||| |||                ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  36251665 atcagaagcaaaagt---------------tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagta 36251748  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||    
T  36251749 gctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatag 36251848  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  |    
T  36251849 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact 36251948  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  36251949 caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttta 36252048  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36252049 gacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36252079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 129 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22780162 - 22779811
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  22780162 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttgtcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttcaaa 22780063  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||      
T  22780062 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga 22779963  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22779962 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcct 22779864  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 479  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22779863 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatca 22779811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 30488527 - 30489059
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  30488527 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 30488626  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  30488627 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 30488725  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  30488726 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 30488825  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  30488826 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 30488925  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  30488926 actcaagatgggaacgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 30489025  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30489026 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 30489059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 403
Target Start/End: Original strand, 24425209 - 24425629
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24425209 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 24425308  T
Q  118 agg-----------------taatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | ||||||                 ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  24425309 aagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatc 24425408  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24425409 accagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaagggagg 24425508  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24425509 tatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtc 24425607  T
Q  382 tacgctacaagacaagacaaca 403  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  24425608 cacgctacaagacaagacaaca 24425629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 77 - 551
Target Start/End: Original strand, 39169845 - 39170330
Alignment:
Q  77 agcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtg 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||      
T  39169845 agcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagca 39169944  T
Q  175 atatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattga 273  Q
    ||||| ||||||||||| ||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||||||||||||||    
T  39169945 atatcttcaccagaagcaacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattga 39170043  T
Q  274 aatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 373  Q
    || ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170044 aagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 39170143  T
Q  374 tttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacac 471  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39170144 ttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacac 39170243  T
Q  472 ccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39170244 ccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39170330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Original strand, 28374171 - 28374595
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaact-----------------gcgtctg 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||                 |||||||    
T  28374171 aggcaagtcaaataatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaactcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcgtctg 28374270  T
Q  101 aagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta------------------aggtttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||| |                  || ||||||||||||  | ||||||    
T  28374271 aagctggagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcaccagaagcagaaggtcatcagaaacaaagttttcatcagaagcaaaatcatc 28374370  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    |||||||| |||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  28374371 accagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggaag 28374470  T
Q  281 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28374471 gtatcaacggtcagttggagagcactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 28374570  T
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagc 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  28374571 ccacgctacaagacaagacaacagc 28374595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 551
Target Start/End: Original strand, 1098978 - 1099430
Alignment:
Q  110 tgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaa 207  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |    
T  1098978 tgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatccttta 1099077  T
Q  208 atttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcact 306  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||    
T  1099078 atc-aaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 1099176  T
Q  307 gagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagc 405  Q
    ||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1099177 gagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 1099276  T
Q  406 tctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatc 498  Q
      ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||    
T  1099277 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 1099376  T
Q  499 aaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1099377 aaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 1099430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 11394973 - 11395407
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  11394973 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 11395071  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  11395072 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 11395171  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  11395172 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 11395271  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  11395272 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11395371  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11395372 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 11395407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 11405289 - 11405723
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  11405289 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 11405387  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  11405388 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 11405487  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  11405488 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 11405587  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  11405588 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 11405687  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11405688 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 11405723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27221924 - 27221374
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  27221924 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 27221825  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||     
T  27221824 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc 27221725  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  27221724 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27221626  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  27221625 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27221526  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  27221525 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 27221426  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27221425 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27221374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 110 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 4100229 - 4099810
Alignment:
Q  110 tgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaa 207  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |    
T  4100229 tgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatccttta 4100130  T
Q  208 atttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcact 306  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||    
T  4100129 atc-aaactaaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 4100031  T
Q  307 gagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagc 405  Q
    ||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4100030 gagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 4099931  T
Q  406 tctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatc 498  Q
      ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||    
T  4099930 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 4099831  T
Q  499 aaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    ||||||  |||||| ||||||    
T  4099830 aaaggatttcaacgtctcttt 4099810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35274759 - 35274209
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  35274759 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 35274660  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||     
T  35274659 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc 35274560  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||    
T  35274559 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgag 35274461  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
     |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  35274460 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 35274361  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  35274360 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 35274261  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35274260 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 35274209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Original strand, 18392473 - 18392872
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  18392473 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 18392571  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392572 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 18392671  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18392672 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttgattct 18392771  T
Q  458 tcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttca 550  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18392772 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctctttca 18392871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 301 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 16769195 - 16768929
Alignment:
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagac 399  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16769195 agcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagac 16769096  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtgg 492  Q
    |||||   ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||     
T  16769095 aacagtcatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggaccacacccaaatcaggcaaagtattactggtga 16768996  T
Q  493 atgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactccttta 558  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16768995 ataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgccttta 16768929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6081726 - 6081473
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  6081726 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 6081627  T
Q  120 gtaatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatc 202  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || | |||    
T  6081626 gtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcaccagaagctatatcatcaccagaagctataagtgatc 6081527  T
Q  203 agtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta 256  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6081526 ggtaaatttaaactgacgatacaaaggagctgtttttcgtttcaaccttgtcta 6081473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35253375 - 35252975
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  35253375 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 35253277  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35253276 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 35253177  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35253176 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 35253077  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35253076 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 35252977  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  35252976 ac 35252975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35263984 - 35263584
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  35263984 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 35263886  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263885 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 35263786  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35263785 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 35263686  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35263685 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 35263586  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  35263585 ac 35263584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 546
Target Start/End: Original strand, 19312839 - 19313245
Alignment:
Q  147 catcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgt-ttc 245  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||| |  ||||||  |||||| | | |  ||     
T  19312839 catcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttaatcagaagattcaatctggaatttcaaaagagctgtctcttgaattt 19312938  T
Q  246 aaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa 345  Q
    ||||| |||||  ||| ||||| ||  ||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||    
T  19312939 aacctcgtctaagagagcgaaggatcaaaagggatgtttcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaa 19313037  T
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaattt 445  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  19313038 gtgtacaaccactatctccacaactctgagtgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatagaaatgaattt 19313137  T
Q  446 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt-agacgtgctaatcatctca 538  Q
    |||| | || ||||| ||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||    
T  19313138 gaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactcaacgactctttaagacgtgcttaagatctca 19313237  T
Q  539 acgtctct 546  Q
    ||||||||    
T  19313238 acgtctct 19313245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19356872 - 19356321
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||                   
T  19356872 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacctaaagtatatgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgtttttgaa 19356773  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  19356772 gttataagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 19356673  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg-aa 299  Q
    ||| | ||| ||  || |   |||||  |||||||| ||    | ||||| |||||  ||| ||||| ||  ||| ||| ||  ||||| ||||||| ||    
T  19356672 cagaagattcaatttggaatctcaaaagagctgtttctttaagttaacctcgtctaagagagcgaaggatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaa 19356573  T
Q  300 gagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
     ||||||| || ||||||| || ||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||  || |||||||||||      
T  19356572 aagcactgggtgcttgtccctcatt-gaagagttggcaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtctcctcgttacaagacaagtt 19356474  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtgga 493  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||      |||||||| ||||    
T  19356473 aacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactgatgga 19356374  T
Q  494 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19356373 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctct 19356321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 277 - 546
Target Start/End: Original strand, 19299963 - 19300238
Alignment:
Q  277 ggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 376  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19299963 ggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacaactctgagt 19300061  T
Q  377 ttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 476  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||    
T  19300062 gtgtctacgctaccagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagtttatccttcataggactacatccaaa 19300161  T
Q  477 tcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt-agacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19300162 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactcaacgactctttaagacgtgcttaagatctcaacgtctct 19300238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 546
Target Start/End: Original strand, 20646445 - 20646835
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgt-ttttcgtttcaaccttgtctagaag 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||| || ||||||  || ||| |||| | || ||||| |||||  ||    
T  20646445 ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctggagtttcaaaagagttgtcttttggatttaacctcgtctaagag 20646544  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||| | | ||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646545 agcgaaggactaaaagggaggtgccaacgttaatttgaaaagcactgggtgcttgtccttgttga--agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 20646642  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 460  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||||    
T  20646643 ctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaaaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttca 20646742  T
Q  461 aaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgc-taatcatctcaacgtctct 546  Q
     ||||| ||| |||||| ||      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  20646743 taggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctcaacgactctttagacgtgcttaaagatctcaacgtctct 20646835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 426 - 551
Target Start/End: Original strand, 24427689 - 24427820
Alignment:
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24427689 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactcttt 24427788  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24427789 agacgtgctaatcatcttaacgtctctttcac 24427820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16777378 - 16777117
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  16777378 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaaatgcttctgaagtaatgacgtc 16777279  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | || | |||||||||||||||||    
T  16777278 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 16777180  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacgg 290  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16777179 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacgg 16777117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 20417321 - 20417419
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20417321 gcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaatgcttctga 20417419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 20070585 - 20070750
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20070585 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 20070684  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20070685 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctac 20070750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20236918 - 20236714
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20236918 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 20236819  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | || | |||||||||||||||||    
T  20236818 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 20236720  T
Q  229 tagctg 234  Q
    ||||||    
T  20236719 tagctg 20236714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 28379510 - 28379610
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28379510 aggctagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaactcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcgtctg 28379609  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  28379610 a 28379610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1084060 - 1083909
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1084060 ttgacaaagtacaaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 1083961  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1083960 gaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 1083909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24275592 - 24275494
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  24275592 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaacagcgtctgaagctatgaagtgcttctga 24275494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 24814637 - 24814788
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24814637 ttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 24814736  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24814737 gaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 24814788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 21172123 - 21172224
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21172123 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcgaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 21172222  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  21172223 ga 21172224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 332 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22755512 - 22755395
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaag-tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22755512 ttgacaaagtacaaggtgtacgaccactacttccactactctgtttt-gtctgcgctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaaatgttccttca 22755414  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaa 448  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  22755413 agataggaatggatttgaa 22755395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 275
Target Start/End: Original strand, 28379659 - 28379804
Alignment:
Q  133 cagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagta 230  Q
    ||||||||||||  ||||||||  || |||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28379659 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagta 28379758  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaa 275  Q
    |||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28379759 gctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaa 28379804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 967156 - 967248
Alignment:
Q  15 cataggca-agtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  967156 cataggcatagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacagtagaaagcaaaggaatctaaaacatctaaagaaaactgcgtctgaagcta 967248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22764217 - 22764126
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22764217 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaaggaagctaaagtatctgaagaaaacagcgtctgaagctgaaagtgcttctga 22764126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22774921 - 22774830
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22774921 tcaatttaaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaaggaagctaaagcatctgaagaaaacagcgtctgaagctaaaagtgcttctga 22774830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22780299 - 22780208
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780299 tcaatttaaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaaggaagctaaagcatctgaagaaaacagcgtctgaagctaaaagtgcttctga 22780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 28711765 - 28711870
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  28711765 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctaaaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatgga 28711864  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  28711865 tttgaa 28711870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 31800954 - 31801059
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  31800954 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 31801053  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  31801054 tttgaa 31801059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 11394858 - 11394968
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  11394858 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 11394957  T
Q  130 catcagaagca 140  Q
    |||||||||||    
T  11394958 catcagaagca 11394968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 11405174 - 11405284
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  11405174 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 11405273  T
Q  130 catcagaagca 140  Q
    |||||||||||    
T  11405274 catcagaagca 11405284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 6574191 - 6574297
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  |||||||||     
T  6574191 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgc 6574290  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  6574291 atttgaa 6574297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 30795299 - 30795237
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaact 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  30795299 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaact 30795237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 28550985 - 28551057
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  28550985 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 28551057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33074259 - 33074187
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  33074259 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 33074187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 23392735 - 23392873
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || | |||| |    
T  23392735 aagtgtacaaccactacttccattactctaagtttgtctctgctacaagacaatgataacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaatagaaatgga 23392834  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  23392835 tttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 23392873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 31968110 - 31968164
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31968110 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 31968164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 385
Target Start/End: Original strand, 21025488 - 21025587
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||    
T  21025488 caacgttcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacttcctccacgactctgcttgtgtctac 21025586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 22776355 - 22776427
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22776355 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22776427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 22781733 - 22781805
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22781733 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35253542 - 35253455
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  35253542 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 35253455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 35264151 - 35264064
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  35264151 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 35264064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 448
Target Start/End: Original strand, 20152112 - 20152198
Alignment:
Q  363 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaa 448  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20152112 ccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 20152198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22802493 - 22802440
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  22802493 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 22802440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24377134 - 24377048
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  24377134 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaataatgttccttca 24377048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 31328033 - 31328086
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  31328033 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 31328086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 31334754 - 31334807
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  31334754 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 31334807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Original strand, 18392305 - 18392382
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18392305 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaa 18392382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 22188169 - 22188250
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  22188169 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 22188250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22317626 - 22317521
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  22317626 aagtatacaaccactacctccactattcagtttttatctctgctgcaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgga 22317527  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  22317526 tttgaa 22317521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24576068 - 24575987
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  24576068 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 24575987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 44840467 - 44840414
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  44840467 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctataagacaag 44840414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Original strand, 1098916 - 1098988
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1098916 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgcttctgaag 1098988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 1587100 - 1587171
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  1587100 aagtgtacaaccactatctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1587171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40332120 - 40332048
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca-agacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  40332120 aagtgtacaaccactaactccattactctgtttttgtctctgctacaagacacggataacagctctgcctgca 40332048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20568173 - 20568134
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568173 agtacaattgtacaaccactacctccactactctgttttt 20568134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 41121789 - 41121840
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||    
T  41121789 tgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaggacaaga 41121840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6392659 - 6392562
Alignment:
Q  351 caaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaa 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | || |||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  6392659 caaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 6392562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 424
Target Start/End: Original strand, 10009820 - 10009898
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  10009820 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 10009898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14581548 - 14581494
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  14581548 aagtgtacaaccactatctccacttctctgattttgtctctgctacaagacaaga 14581494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 21537315 - 21537369
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  21537315 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctttgctacaagacaaga 21537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22258231 - 22258153
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  22258231 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 22258153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 28701296 - 28701350
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  28701296 aagtgtacaaccattacctccactactttgtttttgtccctgctacaagacaaga 28701350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 30557388 - 30557441
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  30557388 aagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtctctgctacaagacaaga 30557441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38781432 - 38781326
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactct-gtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||| | ||||  |||||||||     
T  38781432 aagtgtacaaccactacatccactactctattttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgtcccttcacaatgggaatgg 38781333  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  38781332 atttgaa 38781326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 13964045 - 13964098
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  13964045 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13964098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19540449 - 19540368
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  19540449 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaaggcaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 19540368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23235040 - 23234987
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  23235040 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 23234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 25037326 - 25037379
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  25037326 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 25037379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 25041433 - 25041486
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  25041433 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 25041486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 30667022 - 30666969
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  30667022 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 30666969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 34322003 - 34322084
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  34322003 aagtgtacaaccactatcttcactactctatttttgtttctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttc 34322084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 39037709 - 39037762
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  39037709 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacatgacaag 39037762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4100291 - 4100227
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  4100291 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 4100227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 18376973 - 18377027
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  18376973 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 18377027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 22455057 - 22455111
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  22455057 aagtgtacaaccagtacctccactactcagtttgtgtctctgctacatgacaaga 22455111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38208284 - 38208219
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg--agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  38208284 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 38208219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Original strand, 6573928 - 6573989
Alignment:
Q  79 catctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  6573928 catctgaagaaaaatgcttctgaagacaaagtgctcctaaagtagtgacgtcatcagaagca 6573989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 19297314 - 19297351
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19297314 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 19297351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Original strand, 19297423 - 19297460
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19297423 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaag 19297460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 19312675 - 19312712
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19312675 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 19312712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 20646252 - 20646289
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20646252 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 20646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Original strand, 24440789 - 24440826
Alignment:
Q  334 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24440789 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 24440826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24779376 - 24779323
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  24779376 aagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 24779323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 24814284 - 24814329
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24814284 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 24814329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 24850452 - 24850516
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24850452 gaagcatctgaagaaaagtgctcctgaag-tcaagtgctcctgaagtaatgacgtcgtcagaagca 24850516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 26619168 - 26619201
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26619168 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 26619201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 39037443 - 39037507
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39037443 gaagcatctgaagagaagtgctactgaagttaa-gtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 39037507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40782510 - 40782405
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| | ||||  ||||||| | ||   ||||||||||    
T  40782510 aagtgtacaaccactatctccaatacttagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctacctgcaacaatgttcctacatactgggaatgaa 40782411  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  40782410 tttgaa 40782405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 22785722 - 22785794
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22785722 aagtgtataaccactatctccactactctgtctttatctctactacaagacaaggataacagctctgcctgca 22785794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Original strand, 24793718 - 24793754
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24793718 aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 24793754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 29699776 - 29699804
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29699776 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 29699804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30621249 - 30621197
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  30621249 aagtgtaaaaccactatctccactactcagtttgtgtctccgctacaacacaa 30621197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30623870 - 30623818
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  30623870 aagtgtaaaaccactatctccactactcagtttgtgtctccgctacaacacaa 30623818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 39169792 - 39169820
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39169792 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 39169820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 180)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 40054486 - 40055048
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40054486 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctaaagtgctt 40054585  T
Q  115 ctgaggt------------------aatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaa 196  Q
    |||| |                   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40054586 ctgaagctggagtgcttctaaagtaaatgacgtcatcataagcagaagcccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaa 40054685  T
Q  197 ttaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40054686 ttaatcagtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatt 40054785  T
Q  296 tgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40054786 tgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 40054885  T
Q  395 aagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactg 488  Q
    ||||||||| |  ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  40054886 aagacaacaaccatgcctgcataaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactg 40054985  T
Q  489 gtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40054986 gtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 40055048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18441774 - 18441201
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  18441774 aagtcaataaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 18441675  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcaga-----------------agcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18441674 gtaacaagtgcatctgaagtaatgacgtcatcagaagcaaaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 18441575  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18441574 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagttgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 18441475  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441474 caacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 18441375  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        
T  18441374 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 18441275  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18441274 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 18441201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18419693 - 18419120
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  18419693 aagtcaataaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 18419594  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18419593 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 18419494  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18419493 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagttgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 18419394  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18419393 caacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttattagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 18419294  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        
T  18419293 gctacaagacaaaacaacagctcttcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 18419194  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18419193 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 18419120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 26209288 - 26209837
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  26209288 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 26209387  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  26209388 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 26209487  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26209488 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 26209587  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26209588 gcactgggtgcttgtccttcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaa 26209686  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  26209687 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatg 26209786  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26209787 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 26209837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30050081 - 30049524
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  30050081 gcaagtcaagtaatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctggagtgcttctgaa 30049982  T
Q  120 gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta-----------------aggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    || |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |                 |||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  30049981 gtgatgaggtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcataagcgaaatcatcaccagaagctacaattgat 30049882  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||    
T  30049881 ccgtaaatttaaactggagattcaaattagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacagtcatttggag 30049782  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-ac 399  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  30049781 aaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaa 30049682  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtgga 493  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |    
T  30049681 aacagccatgcctgcagaaatgttcattcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaa 30049582  T
Q  494 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049581 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 30049524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 31116246 - 31116806
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31116246 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaatgattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcgtct 31116345  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  31116346 gaagctgaaatgcttttgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattt 31116445  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31116446 aatccgtaaattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 31116545  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31116546 gatagcactaagtatttgtccttcgttagcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 31116645  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  31116646 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggt 31116745  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116746 gaatgatcaaaggatttcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 31116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 38593468 - 38594007
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38593468 cataggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 38593567  T
Q  115 ctgaggt-----------------aatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaa 196  Q
    |||| ||                 |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38593568 ctgaagtttgagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaa 38593667  T
Q  197 ttaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatt 295  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38593668 ttaatcagtaaatttatattggagattcaaagtagctggttcttgtttcaacctcgtctaataagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatt 38593767  T
Q  296 tgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38593768 tgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagaca 38593867  T
Q  396 agacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggattactggtggatg 495  Q
    ||| |||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |         || ||||         | |||||||||||||||||    
T  38593868 agataacagtcatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagtt---------aacgact-------ctttaggattactggtggatg 38593951  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38593952 atcaaaggaactcaacaactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 38594007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1368181 - 1367634
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  1368181 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagctgaagtgc 1368082  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  1368081 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattc 1367982  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1367981 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 1367882  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1367881 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 1367783  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  1367782 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 1367683  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1367682 atttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 1367634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9171537 - 9170990
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct---------------- 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  9171537 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgctcctgaagctgaagtgc 9171438  T
Q  114 -tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  9171437 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 9171338  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9171337 aaactgaaaattcaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 9171238  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9171237 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaagacaacagctatgc 9171139  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  9171138 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 9171039  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9171038 atttcaaacgactctttagacatgctaatcatctcaacgtctctttcac 9170990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9160281 - 9159734
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct---------------- 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  9160281 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgctcctgaagctgaagtgc 9160182  T
Q  114 -tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  9160181 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 9160082  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9160081 aaactgaaaattcaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagt 9159982  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9159981 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaaaacaacagctatgc 9159883  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||    
T  9159882 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttaaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtgaatgatcaaagg 9159783  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159782 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 9159734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9170736 - 9170189
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct---------------- 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  9170736 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgctcctgaagctgaagtgc 9170637  T
Q  114 -tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  9170636 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 9170537  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9170536 aaactgaaaattcaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcantgagt 9170437  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9170436 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaanacaacagctatgc 9170338  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||    
T  9170337 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttnaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaangattactggtgaatgatcaaagg 9170238  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9170237 atttcaaacgactctttagacntgctaatcatctcaacgtctctttcac 9170189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 21769691 - 21770238
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  21769691 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagctgaagtgc 21769790  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||     
T  21769791 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatacgtaaattc 21769890  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21769891 aaactggagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 21769990  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  21769991 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgc 21770089  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  21770090 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 21770189  T
Q  504 a-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21770190 attccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 21770238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20491540 - 20491011
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  20491540 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtc 20491441  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  20491440 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 20491341  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    |||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | | ||||| | ||||||||||||| ||    
T  20491340 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacaacgctgagcatttgtccttcgttaaca 20491241  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||| | ||    
T  20491240 gagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgcctt 20491142  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  20491141 caagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactcttta 20491042  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20491041 gacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 20491011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13682881 - 13682332
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  13682881 aagttaatcaatttcagtaggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtggttctgaa 13682782  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  13682781 gtttcaagtgcctctgaagtgatgacgtcattagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 13682682  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  13682681 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaa 13682582  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
     ||||| || ||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13682581 tcactgggtgcttgtccttctctga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaa 13682483  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatg 495  Q
    ||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  13682482 cagctattcctgcagaaatgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttaatccttcacaagactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatg 13682383  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13682382 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 13682332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8934081 - 8933634
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||                   
T  8934081 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcatctgaagctatgaagtgcttctgaa 8933982  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  8933981 gtctcaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 8933882  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8933881 cagtaaatttaaactgaagttttaatggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 8933782  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933781 gcactgggtgcttgtccttctttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 8933682  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaag 449  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8933681 cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaag 8933634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 107 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29590448 - 29590004
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  29590448 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagga 29590349  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcact 306  Q
     ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  29590348 catttaaactgaagtttcaaaggagttgtttttcgttttaatctcgtctaaaagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcact 29590249  T
Q  307 gagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 406  Q
    | || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29590248 gggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 29590150  T
Q  407 ctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaa 500  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  29590149 ctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcatatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaa 29590050  T
Q  501 aggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29590049 aggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 29590004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 551
Target Start/End: Original strand, 14745446 - 14745965
Alignment:
Q  42 gtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcag 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14745446 gtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcag 14745545  T
Q  142 aagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttc 240  Q
    |||  ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||   |  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14745546 aaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagctatatcatcaccagatgctacatttaattcatttattcaaactgaagatccaaagtagatgtttctc 14745645  T
Q  241 gtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaa 339  Q
      ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14745646 aattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaa 14745745  T
Q  340 gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaa 438  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  14745746 atacaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccctcaagatgggaa 14745845  T
Q  439 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaat 531  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  14745846 tgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat 14745945  T
Q  532 catctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||||    
T  14745946 tatctcaacgtctctttcac 14745965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 406
Target Start/End: Original strand, 6043950 - 6044354
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  6043950 aagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 6044049  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||    
T  6044050 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcacaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgat 6044149  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  6044150 cagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaag 6044249  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6044250 gcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 6044349  T
Q  402 cagct 406  Q
    |||||    
T  6044350 cagct 6044354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 15216877 - 15216328
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  15216877 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 15216778  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  15216777 gtttcaagtgcctctgaagtgatgacgtcattagaagcagaagtccatcagaagcgaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 15216678  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || || ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |    
T  15216677 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctatttttcgttttaatctcgtttaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggccatttgagaa 15216578  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15216577 gcactgggtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaa 15216479  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||||||||      ||||||||||| |||    
T  15216478 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatctgtcataggactacacccaaatcaggcaatagattactggtgaatg 15216379  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15216378 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 15216328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 15888193 - 15888624
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  15888193 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaa 15888292  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||     
T  15888293 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaa 15888392  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  15888393 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaatttgtgcc 15888491  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  15888492 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctt 15888591  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15888592 tagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 15888624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 544
Target Start/End: Original strand, 12733906 - 12734453
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  12733906 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctaaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 12734005  T
Q  120 gtaa------------------tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    ||||                  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    | |||||||||  |||||||||||| |||||| | || ||    
T  12734006 gtaacaagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagtccatcagaagctatatcatcaccataagctatagttgat 12734105  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12734106 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 12734205  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || ||||||||||  |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12734206 gcactgggtgcttgtccttctctga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacgctataagacaagacaa 12734304  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||      |||||||||||||||    
T  12734305 caactctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaataaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaagagattactggtggatg 12734404  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtct 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12734405 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtct 12734453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 589648 - 589217
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  589648 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 589549  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  589548 gtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaa 589449  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||| |     
T  589448 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctaggcctgcagaatttgtgcc 589350  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  589349 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggatcactggtgattgatcaaaggatttcaaacgactctt 589250  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  589249 tagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 589217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 129 - 548
Target Start/End: Original strand, 3476207 - 3476631
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  3476207 tcatcagaaccagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaag 3476306  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||| ||  |  || ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |   |    
T  3476307 gagctgtttttcattatattctcgtctaaaagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctga-a 3476405  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3476406 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 3476505  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3476506 aagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaggattaatggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 3476605  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    
T  3476606 cgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 3476631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9433798 - 9433267
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9433798 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9433699  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  |||||||||||   ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9433698 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaaacaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9433600  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9433599 tagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9433500  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9433499 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 9433400  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  9433399 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 9433300  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9433299 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9433267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 9444394 - 9443856
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9444394 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatatgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9444295  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9444294 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9444196  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9444195 tagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9444096  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9444095 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtgttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 9443996  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  9443995 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 9443896  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactccttta 558  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9443895 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacaccttta 9443856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44281047 - 44280501
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  44281047 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 44280948  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  44280947 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 44280848  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  44280847 aactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 44280748  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  44280747 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 44280649  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44280648 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 44280549  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44280548 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 44280501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3166285 - 3165739
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  3166285 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 3166186  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  3166185 tttgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 3166086  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  3166085 aactaaagatccaaagtagttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 3165986  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      
T  3165985 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaggtatgtc 3165887  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3165886 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 3165787  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3165786 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 3165739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20990187 - 20989656
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20990187 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 20990088  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  20990087 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20989989  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    ||||||  | ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| | |||||  ||||||      
T  20989988 tagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgttaat 20989889  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  20989888 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 20989789  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  20989788 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 20989689  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20989688 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 20989656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 467347 - 467878
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  467347 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 467446  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  467447 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 467545  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  467546 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 467645  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  467646 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 467745  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  467746 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 467845  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  467846 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 467878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6866991 - 6867522
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |   ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  6866991 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgggcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 6867090  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  6867091 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6867189  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  6867190 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6867289  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  6867290 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 6867389  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  6867390 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgactctt 6867489  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6867490 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6867522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6877623 - 6878154
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |   ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  6877623 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgggcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 6877722  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  6877723 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6877821  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  6877822 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6877921  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  6877922 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 6878021  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  6878022 ttcaagttgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgactctt 6878121  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6878122 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6878154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 21002774 - 21003305
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  21002774 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 21002873  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  21002874 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21002972  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    ||||||  | ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  21002973 tagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 21003072  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  | | |     
T  21003073 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttctacc 21003172  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||    
T  21003173 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaatggatttcaaacgaatctt 21003272  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21003273 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 21003305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 454565 - 455096
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  454565 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 454664  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  454665 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 454763  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  454764 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 454863  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  454864 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 454963  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  454964 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 455063  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  455064 tagacgtgctgattatcttaacgtctctttcac 455096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 2705378 - 2705909
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  2705378 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 2705477  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  2705478 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 2705576  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  2705577 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 2705676  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||  ||| |     
T  2705677 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtaca 2705776  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  2705777 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 2705876  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2705877 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 2705909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11096589 - 11096058
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11096589 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 11096490  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  |||   ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  11096489 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaataatttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 11096391  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  11096390 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 11096291  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  11096290 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 11096191  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  11096190 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 11096091  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11096090 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 11096058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 501
Target Start/End: Original strand, 19985565 - 19986058
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| |  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19985565 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcttgatagaacaatgaaaggcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctg 19985664  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatca-gtaaatttaaac 215  Q
    | |  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || | |  ||||    
T  19985665 aagagatgacgtgatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcacccgaagctacatttaatcaagttattcaaaac 19985764  T
Q  216 tgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtactt 314  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |   ||||| ||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||    
T  19985765 ttaagatccaaagtagttgtttcttaattcaatcttatctaagaggaacgaagaaatgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgaacattt 19985864  T
Q  315 gtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgc 414  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  19985865 gtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgc 19985964  T
Q  415 agaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  19985965 agaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 19986058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24930369 - 24930900
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  24930369 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 24930468  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24930469 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24930567  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  24930568 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 24930667  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||  ||| |     
T  24930668 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 24930767  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  24930768 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 24930867  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24930868 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24930900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9085817 - 9085287
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  9085817 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 9085718  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9085717 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9085619  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  9085618 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9085519  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  9085518 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9085419  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  9085418 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 9085319  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9085318 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9085287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9095531 - 9095001
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  9095531 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 9095432  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9095431 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9095333  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  9095332 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9095233  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  9095232 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9095133  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  9095132 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 9095033  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9095032 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9095001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37344735 - 37344203
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg-agagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  37344735 atttcaataggtcttggaagaacaatgggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgt 37344636  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  37344635 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 37344537  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||| |  ||||||     
T  37344536 gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgcctctcgttaa 37344437  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  37344436 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 37344337  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  37344336 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaagactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 37344237  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37344236 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 37344203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 2715982 - 2716513
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  2715982 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 2716081  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  2716082 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 2716180  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  2716181 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 2716280  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  2716281 agagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 2716380  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  2716381 ctcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 2716480  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2716481 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 2716513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8617920 - 8617389
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  8617920 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 8617821  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  8617820 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8617722  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  8617721 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 8617622  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  8617621 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8617522  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  8617521 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 8617422  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8617421 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 8617389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40041875 - 40042405
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  40041875 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 40041974  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  40041975 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40042073  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  40042074 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 40042173  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  40042174 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 40042273  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  40042274 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 40042373  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40042374 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40042405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40052424 - 40052954
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  40052424 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 40052523  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  40052524 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40052622  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  40052623 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 40052722  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  40052723 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 40052822  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  40052823 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 40052922  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40052923 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40052954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8628483 - 8627952
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  8628483 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 8628384  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  8628383 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8628285  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  8628284 tagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 8628185  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  8628184 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8628085  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  8628084 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 8627985  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8627984 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 8627952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 26653091 - 26653622
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  26653091 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 26653190  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||| ||||||||||||    
T  26653191 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaacggaagattcaaag 26653289  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  26653290 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26653389  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  26653390 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 26653489  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  26653490 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 26653589  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26653590 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26653622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 26699420 - 26699951
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  26699420 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 26699519  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||| ||||||||||||    
T  26699520 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaacggaagattcaaag 26699618  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  26699619 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26699718  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  26699719 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 26699818  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  26699819 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 26699918  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26699919 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26699951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4223144 - 4222613
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  4223144 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 4223045  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  4223044 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4222946  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  4222945 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4222846  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  4222845 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4222746  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4222745 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4222646  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4222645 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4222613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 48710257 - 48710788
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  48710257 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 48710356  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  48710357 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 48710455  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  48710456 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 48710555  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  48710556 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 48710655  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  48710656 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 48710755  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48710756 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 48710788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4212545 - 4212014
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  4212545 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 4212446  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  4212445 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4212347  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  4212346 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4212247  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  4212246 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4212147  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4212146 ctcaagatggaaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4212047  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4212046 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4212014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 17949884 - 17950415
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  17949884 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 17949983  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  17949984 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17950082  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  17950083 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 17950182  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  17950183 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17950282  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  17950283 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 17950382  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  17950383 tagacgtgctgattatcgcaacgtctctttcac 17950415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22089657 - 22089126
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  22089657 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 22089558  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22089557 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22089459  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  22089458 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22089359  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||   ||| |||||||  ||| |     
T  22089358 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacagtcatgcctgcagaatttgtaca 22089259  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22089258 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22089159  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22089158 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22089126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22100272 - 22099741
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  22100272 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 22100173  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22100172 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22100074  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  22100073 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22099974  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |  ||| |||||||  ||| |     
T  22099973 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacaaccatgcctgcagaatttgtaca 22099874  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22099873 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22099774  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22099773 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22099741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 17960490 - 17961021
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  17960490 atttcaatagatcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 17960589  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  17960590 atcagaagcagaaggtcatccgaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17960688  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  17960689 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 17960788  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  17960789 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17960888  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  17960889 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 17960988  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17960989 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17961021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5686036 - 5685522
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  5686036 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 5685937  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    ||||||||||            |||   | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | ||   |||||||||||||||||||    
T  5685936 atcagaagca------------aag---gttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaaac-aaactgaagattcaaagta 5685853  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||    
T  5685852 gctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatag 5685753  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| | ||    
T  5685752 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgtt 5685653  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5685652 caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttta 5685553  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5685552 gacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 167416 - 166885
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |  ||||||||    
T  167416 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaactgcttctgaagagatgacgtc 167317  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  167316 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 167218  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  167217 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 167118  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  167117 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 167018  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  167017 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 166918  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  166917 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 166885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 129 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48382580 - 48382304
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48382580 tcatcagaagcagaagtccgtcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgctcagtaaatttaaactgaagtttcaaag 48382481  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  48382480 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattaaaagggatgtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 48382381  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaagacaagacaacag 404  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48382380 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccgctacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaagacaacag 48382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 178008 - 177477
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |  ||||||||    
T  178008 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaactgcttctgaagagatgacgtc 177909  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||   |||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  177908 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcattatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 177810  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  177809 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 177710  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  177709 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 177610  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  177609 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 177510  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  177509 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 177477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 212 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 541437 - 541091
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  541437 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 541338  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  541337 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatg 541238  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||    
T  541237 cctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaag 541138  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  541137 gatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 541091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 8001829 - 8002362
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaaga-aaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  8001829 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagctaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 8001928  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || |||||||||||||    
T  8001929 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaa 8002027  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||     
T  8002028 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaa 8002127  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  8002128 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 8002227  T
Q  425 -tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgactc 516  Q
       ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||||    
T  8002228 aactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactc 8002327  T
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8002328 tttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 8002362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 8012474 - 8013007
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaaga-aaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  8012474 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagctaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 8012573  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || |||||||||||||    
T  8012574 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaa 8012672  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||     
T  8012673 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaa 8012772  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  8012773 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 8012872  T
Q  425 -tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgactc 516  Q
       ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||||    
T  8012873 aactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactc 8012972  T
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8012973 tttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 8013007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11005736 - 11005188
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  11005736 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 11005637  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||      
T  11005636 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc- 11005538  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||     
T  11005537 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagc 11005438  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  11005437 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 11005338  T
Q  410 cttgcagaaat-gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | ||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  11005337 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 11005238  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11005237 gatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 11005188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24735190 - 24734756
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  24735190 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 24735092  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  24735091 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 24734992  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  24734991 attagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 24734892  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  24734891 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24734792  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24734791 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24734756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24745137 - 24744703
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  24745137 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 24745039  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  24745038 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 24744939  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  24744938 attagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 24744839  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  24744838 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 24744739  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24744738 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24744703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1987943 - 1987543
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  1987943 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 1987845  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987844 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 1987745  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1987744 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 1987645  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1987644 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 1987545  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  1987544 ac 1987543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1998564 - 1998164
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  1998564 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 1998466  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998465 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 1998366  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1998365 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 1998266  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1998265 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 1998166  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  1998165 ac 1998164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 26389959 - 26390393
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  26389959 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 26390057  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  26390058 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 26390157  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  26390158 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 26390257  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  26390258 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26390357  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26390358 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26390393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 26400601 - 26401035
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  26400601 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 26400699  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  26400700 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 26400799  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  26400800 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 26400899  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  26400900 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 26400999  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26401000 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26401035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 42866180 - 42865830
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  42866180 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagc 42866081  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  42866080 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 42865981  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| ||||||    
T  42865980 cctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaa 42865881  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42865880 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 42865830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 42876806 - 42876456
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  42876806 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagc 42876707  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  42876706 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 42876607  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| ||||||    
T  42876606 cctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaa 42876507  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42876506 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 42876456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 24882143 - 24882709
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  24882143 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgtttctgaa 24882242  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcag----------------aagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
         |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||                |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  24882243 gttacaagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcacc 24882342  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt--ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggta 283  Q
    |||||||||| || ||||| | ||| || |||||   |||||  ||||||||  ||   || ||||| |||||  ||| ||||  ||  ||| ||| ||     
T  24882343 agaagctacagttgatcagaagattcaatctgaaatctcaaaagagctgtttcattaagtt-aacctcgtctaagagagcgaacgatcaaaagggaagtg 24882441  T
Q  284 tcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
     ||||| ||||||||| |||| || || ||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||      
T  24882442 ccaacgttcatttgaaaagcaatgggtgcttgtccctcatta-aagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaacgaccctgagtgtgtcct 24882540  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag--- 480  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||       
T  24882541 cgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggca 24882640  T
Q  481 ---gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24882641 aaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctct 24882709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 386 - 551
Target Start/End: Original strand, 38403331 - 38403502
Alignment:
Q  386 ctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag----- 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||         
T  38403331 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 38403430  T
Q  481 -gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38403431 agattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 38403502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 301 - 551
Target Start/End: Original strand, 26294067 - 26294326
Alignment:
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagac 399  Q
    ||||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26294067 agcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaac 26294166  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtgg 492  Q
    ||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||     
T  26294167 aacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgt 26294266  T
Q  493 atgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26294267 ataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 26294326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Original strand, 9261529 - 9261721
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  9261529 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtc 9261628  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagat 222  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||    
T  9261629 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagat 9261721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19193459 - 19193268
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagt----------- 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  19193459 aagtcaatcaatttaaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttatgaagt 19193360  T
Q  111 -------gcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19193359 aacaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctaca 19193268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 23264344 - 23264561
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  23264344 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaacgaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctg 23264443  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaac 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | || | ||||    
T  23264444 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaac 23264542  T
Q  216 tgaagattcaaagtagctg 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23264543 tgaagattcaaagtagctg 23264561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 8999002 - 8999151
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8999002 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaag 8999101  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8999102 ataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 8999151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 25201332 - 25201419
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25201332 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 25201419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 290
Target Start/End: Original strand, 26290117 - 26290378
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  26290117 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 26290216  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | || | ||||| |||||||||||    
T  26290217 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaa-tcaaactaaagattcaaag 26290315  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacgg 290  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26290316 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 26290378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 11087112 - 11087261
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||    
T  11087112 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacactacaagacaagataacagctctgcctgcataaatgttcctttaag 11087211  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  11087212 ataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 11087261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 48382723 - 48382621
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta-aagtgcttctgagg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |    
T  48382723 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaattgtgtctgaagctaggagtgcttctgaag 48382624  T
Q  121 taa 123  Q
    |||    
T  48382623 taa 48382621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 3476063 - 3476147
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3476063 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagcta 3476147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29590582 - 29590488
Alignment:
Q  10 agtagcataggcaa-gtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29590582 agtaccataggcaaagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaatgaatctaaagcatctgaagaaaactgcatctgaag 29590488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 15888030 - 15888131
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15888030 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaaaaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaaggaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 15888129  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  15888130 ga 15888131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 13174672 - 13174823
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||  ||||    
T  13174672 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtctctacactacaagacaagaaaaacagctttgcatgcagaaatgttacttca 13174771  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  13174772 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacttccaaatcagg 13174823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 589795 - 589693
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  589795 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttc 589696  T
Q  116 tga 118  Q
    |||    
T  589695 tga 589693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 48382297 - 48382201
Alignment:
Q  456 cttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  48382297 cttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacatgctaaaaatctcaacgtctct 48382201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 602796 - 602661
Alignment:
Q  348 gtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaattt 445  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||  |  ||||| ||||    
T  602796 gtacaaccacttcctccactactctgttctttgtctacgctacaggacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcaaattcagaatggattt 602697  T
Q  446 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  602696 gaaatcaattcttcataggactatatccaaatcagg 602661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 26389827 - 26389940
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  26389827 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 26389926  T
Q  130 catcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  26389927 catcagaagcagaa 26389940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 26400469 - 26400582
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  26400469 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 26400568  T
Q  130 catcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  26400569 catcagaagcagaa 26400582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8933631 - 8933574
Alignment:
Q  489 gtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8933631 gtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 8933574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 16112007 - 16112112
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  16112007 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcataatgggaatgca 16112106  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  16112107 tttgaa 16112112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 30944446 - 30944527
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  30944446 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttc 30944527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 33691835 - 33691940
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  33691835 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 33691934  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  33691935 tttgaa 33691940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 48237025 - 48237130
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  || |||||| |    
T  48237025 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgca 48237124  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  48237125 tttgaa 48237130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 24244217 - 24244305
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24244217 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttatagtgcttctga 24244305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4821509 - 4821442
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  4821509 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgc 4821442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27871753 - 27871699
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27871753 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 27871699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44467099 - 44467045
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44467099 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 44467045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9069597 - 9069492
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  9069597 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatgga 9069498  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  9069497 tttgaa 9069492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 30945479 - 30945584
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  |||||||  |||  ||||||||| |    
T  30945479 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccctcagaatgggaatgca 30945578  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  30945579 tttgaa 30945584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 21283496 - 21283568
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  21283496 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 21283568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 448
Target Start/End: Original strand, 28622481 - 28622584
Alignment:
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatt 444  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |||    
T  28622481 gtgtacaaccactacctctacttctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatt 28622580  T
Q  445 tgaa 448  Q
    ||||    
T  28622581 tgaa 28622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8182965 - 8182911
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8182965 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 8182911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 23280081 - 23280187
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| |||| | |||||| ||||  |||||||||     
T  23280081 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgc 23280180  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  23280181 atttgaa 23280187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24788176 - 24788122
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24788176 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 24788122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28409074 - 28409020
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  28409074 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 28409020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 24794838 - 24794891
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24794838 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 24794891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 35952811 - 35952916
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||  |    
T  35952811 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctctactacaagacaagaataacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaataca 35952910  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  35952911 tttgaa 35952916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1293065 - 1292993
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  1293065 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1292993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4494612 - 4494540
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4494612 aagtgtacaaccgctacctccactactctctttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 4494540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 48806002 - 48806074
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  48806002 aagtgtacaaccactacttccactactctgattttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcatgca 48806074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14426582 - 14426544
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426582 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 14426544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 22578144 - 22578182
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578144 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 22578182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 331680 - 331583
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||   |||||| ||||  |||||||||    
T  331680 aagtgtacaaccactacctccactacacagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatg 331583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 415
Target Start/End: Original strand, 4412088 - 4412157
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  4412088 tgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctactacaagacaaggaaaacagctctgcctgca 4412157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 9709925 - 9710030
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||  ||||  ||||||||| |    
T  9709925 aagtgtaaaaccactacatccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgtttattcacaatgggaatgca 9710024  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  9710025 tttgaa 9710030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14193149 - 14193044
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||| | ||||||||| | ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  14193149 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgttaaaagacaagaaaaacagctcttcctgcaaccatgttccttcacaatgggaatgga 14193050  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  14193049 tttgaa 14193044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14425482 - 14425429
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14425482 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctttgcaacaagacaag 14425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 19339373 - 19339426
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  19339373 aagtgtacaaccactacctccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 19339426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21692322 - 21692269
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  21692322 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 21692269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 32264842 - 32264895
Alignment:
Q  345 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32264842 agtgtacaaccagtacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 32264895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 41842396 - 41842477
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  41842396 aagtgtacaaccactacctgcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 41842477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 541591 - 541511
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  541591 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtg 541511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 19711136 - 19711208
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  19711136 aagtgtacaaccactatttccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 19711208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Original strand, 22493957 - 22494037
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  22493957 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtg 22494037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33605720 - 33605668
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  33605720 aagtgtacaaccactaccttcactactatgtttttgtctctgctacaagacaa 33605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 589697 - 589650
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  589697 tctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaag 589650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1988110 - 1988023
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  1988110 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 1988023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1998731 - 1998644
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  1998731 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 1998644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10561281 - 10561218
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  10561281 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactg 10561218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15467949 - 15467846
Alignment:
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatt 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| | ||||||| | | ||||   |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  15467949 gtgtacaaccattacctccactactctgaatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttacctgcaacgatgttccttcaaaatgggaatggatt 15467850  T
Q  445 tgaa 448  Q
    ||||    
T  15467849 tgaa 15467846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 466
Target Start/End: Original strand, 29935481 - 29935604
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||   | |||||| |    
T  29935481 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgga 29935580  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||    
T  29935581 tttgaaattaatccttcataggac 29935604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42866397 - 42866310
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  42866397 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 42866310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42877023 - 42876936
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  42877023 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 42876936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 45922167 - 45922254
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  45922167 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 45922254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 2265642 - 2265695
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  2265642 aagtgtacaaccactacctccactgctctg-ttttgtctttgctacaagacaaga 2265695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 16316680 - 16316734
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  16316680 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 16316734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 19237166 - 19237204
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19237166 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 19237204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24450752 - 24450678
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24450752 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct 24450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 2913731 - 2913784
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  2913731 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 2913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 13138018 - 13138099
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  13138018 aagtgtacaaccactatctccattactcagtttatgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 13138099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30026207 - 30026142
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  30026207 gaagcatctgaagagaagtgcttctgaagtaaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 30026142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 398
Target Start/End: Original strand, 13894123 - 13894174
Alignment:
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  13894123 gtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaaga 13894174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14425731 - 14425672
Alignment:
Q  81 tctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14425731 tctgaagaaaactgctacngaagacaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14425672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 20311929 - 20311993
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  20311929 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 20311993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21695436 - 21695364
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  21695436 aagtgtacaaccagtacctcaactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 21695364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 415
Target Start/End: Original strand, 48062947 - 48063015
Alignment:
Q  348 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  48062947 gtacaaccactatctccattactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 48063015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2500073 - 2500006
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  2500073 aagtgtacaaccactttctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgc 2500006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 15704616 - 15704666
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  15704616 tgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 15704666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Original strand, 15888144 - 15888191
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  15888144 tctgaagctgaagtgcttctgaagggatgacgtcatcagaagcagaag 15888191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24735306 - 24735217
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg---agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | |  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  24735306 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 24735217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24745253 - 24745164
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg---agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | |  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  24745253 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 24745164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 5000945 - 5000999
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||    
T  5000945 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctactacaagacaaga 5000999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Original strand, 7488023 - 7488061
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7488023 agtacaactgtacaaccactatctccactactctgtttt 7488061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 10883296 - 10883350
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||    
T  10883296 aagtgtacaatcactacctccactactcagtttgcgtctctgctacaagacaaga 10883350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 13018628 - 13018682
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  13018628 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctgtgctacaggacaaga 13018682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 13260738 - 13260792
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||    
T  13260738 aagtgtacaaccactatctccactacccagtttgtgtctctgctacaagacaaga 13260792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 16310030 - 16310084
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  16310030 aagtgtacaaccactatctacactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 16310084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30025940 - 30025854
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  30025940 aagtgtacaaccaatatctctactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttccttca 30025854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 39284687 - 39284725
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39284687 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtct 39284725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4821845 - 4821785
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc--cgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||| |||||||||||||||    
T  4821845 aataggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaatcaataaagcgtctgaagaaaactgc 4821785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 11086785 - 11086829
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11086785 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 11086829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11319440 - 11319387
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  11319440 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctactacaagacaag 11319387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Original strand, 13172465 - 13172502
Alignment:
Q  334 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13172465 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 13172502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13302845 - 13302792
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  13302845 aagtgtacaaccactatcaccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13302792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13648764 - 13648711
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  13648764 aagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtgtctctgctacaagacaag 13648711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13880139 - 13880086
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  13880139 aagtgtacaaccactatctccactactcactttgtgtctctgctacaagacaag 13880086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 415
Target Start/End: Original strand, 21381555 - 21381624
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21381555 tgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgcaacaagacaaggataacagctctgcctgca 21381624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27872010 - 27871945
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27872010 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtgtgaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagca 27871945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 923339 - 923311
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  923339 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 923311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1193042 - 1193014
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1193042 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 1193014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1776833 - 1776805
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1776833 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 1776805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 4347688 - 4347716
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347688 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 4347716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Original strand, 8998667 - 8998703
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8998667 aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 8998703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 12174464 - 12174535
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  12174464 aagtgtacaaccactacctttagtactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 12174535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 13730798 - 13730870
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||| || || |||||||||||||    
T  13730798 aagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctctgttacaagacaaggataatagctctgcttgca 13730870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14426829 - 14426765
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  14426829 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 14426765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23649330 - 23649262
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23649330 ataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct 23649262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24095883 - 24095855
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24095883 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 24095855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 157)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24714042 - 24713471
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa------- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  24714042 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatcttaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 24713943  T
Q  108 -----agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag-----------------accatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||     
T  24713942 ctgaaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagcgatatcatcact 24713843  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24713842 agaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagttgtttcttgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtat 24713743  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24713742 taacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc-ac 24713644  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------ 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||          
T  24713643 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 24713544  T
Q  479 aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713543 aggattactggtagatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 24713471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5873987 - 5873409
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5873987 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 5873888  T
Q  115 ctgagg-----------------taatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatc 179  Q
    |||| |                 ||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||    
T  5873887 ctgaagctggagtgcttatgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctgatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcaaaagcgaaatc 5873788  T
Q  180 atcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5873787 atcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaagctgaagattcaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggg 5873688  T
Q  279 aggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5873687 aggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcattaacatagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttttt 5873588  T
Q  379 gtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5873587 gtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaaattgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatc 5873488  T
Q  479 ------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5873487 aggcaaaggattactggtggatgatccaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctttttcac 5873409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10696223 - 10695679
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa--gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  10696223 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaaagcatctgaagaaaaatgtgtctgaagctgaagtgcctc 10696124  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| || | ||||||| || ||    
T  10696123 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaa 10696024  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10696023 actgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtac 10695924  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  10695923 ttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagccatgcct 10695824  T
Q  413 gcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaac 506  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695823 gcagaattgttccttcgagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaac 10695724  T
Q  507 tcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695723 tcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 10695679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11536313 - 11535885
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536313 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 11536214  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11536213 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatca 11536114  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11536113 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 11536014  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536013 aagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 11535914  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11535913 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 11535885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10301002 - 10300574
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10301002 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcacgatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 10300903  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10300902 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgagtatttgtccttcgttatca 10300803  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10300802 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 10300703  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10300702 aagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 10300603  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10300602 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 10300574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 31266462 - 31267018
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttct--- 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||       
T  31266462 aagtcaatcaatttcaataggttttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaataaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctaaa 31266561  T
Q  117 ---------------gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
                   || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  31266562 gtaacaagtgtctctgaagtaatgacatcatcagaagtagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccaaaagttacaagtgat 31266661  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |    
T  31266662 cagtaaatttaaactgaatattcaaagaagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaaagaacgaagaattgtaaaggaggtatcaacggtcatttggata 31266761  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31266762 gcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaagacaagacaa 31266861  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  31266862 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatg 31266961  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct-aatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31266962 atcaaagaaactcaacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctctttcac 31267018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 11515646 - 11515075
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  11515646 aagtcaatcaatttcaataggtcttgaaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaaatgcttctgaa 11515547  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11515546 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 11515447  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11515446 cagaagctacaagtgatcagt-aatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 11515348  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515347 caacggtcatttgaaaagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttaacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 11515248  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        
T  11515247 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 11515148  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11515147 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 11515075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10909992 - 10909446
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa--gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  10909992 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaaagcatctgaagaaaaatgtgtctgaagctgaagtgcctc 10909893  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| || | ||||||| || ||    
T  10909892 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaa 10909793  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10909792 actgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtac 10909693  T
Q  313 ttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgctt 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10909692 ttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcct 10909593  T
Q  413 gcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||     
T  10909592 gcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggat 10909493  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10909492 ttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 10909446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 47151738 - 47152299
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa--gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47151738 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttc 47151837  T
Q  116 tgagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
    ||| |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| |    
T  47151838 tgaagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaagattttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatt 47151937  T
Q  198 taatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatt 295  Q
    | |  |||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47151938 tgaatagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatt 47152037  T
Q  296 tgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 395  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47152038 tggagagccctgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagaca 47152137  T
Q  396 agacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactgg 489  Q
    |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    
T  47152138 agacaacaaccatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgg 47152237  T
Q  490 tggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152238 tggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 47152299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 15207058 - 15207632
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207058 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 15207157  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagac-----------------catcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | |||| ||||||||||||||||| |                 ||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||    
T  15207158 aagctgaagtgcctctgatgtgatgatgtcatcagaagcagaagcccatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatc 15207257  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15207258 accagaagttacatttaatcagtaaatataaactgaagtttcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagg 15207357  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15207358 tatcaacggtcatttggaaagcactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtc 15207456  T
Q  382 tacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc--- 478  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  15207457 cacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 15207556  T
Q  479 ---aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207557 caaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 15207632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 55651918 - 55651369
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  55651918 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 55651819  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  55651818 gtaacaagtgcctctgaagtaacgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagttacaattgat 55651719  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  55651718 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgttcatttgaaaa 55651619  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55651618 gcactgggtgcttgtccttcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 55651520  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  55651519 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaatttgatccttcataggactacacccaaatcagtcaaaagattactggtggatg 55651420  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55651419 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 55651369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 49001644 - 49002193
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  49001644 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 49001743  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||    
T  49001744 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcgtcagaagcagaagtccatcagaagtaagatttcatcagaagctatttcatcaccagaagctacagttgat 49001843  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  49001844 cagaaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttgaaaa 49001943  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    ||| || || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49001944 gcattgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 49002042  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||      ||||| |||||||||    
T  49002043 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatg 49002142  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49002143 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 49002193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16317916 - 16317369
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa------------------gtgc 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||                  ||||    
T  16317916 aatttcaataggtcgtggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctgaaaaaaattgcgtctgaagctaaaagtgcttctgaagctggagtgc 16317817  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta-aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | | |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  16317816 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcagatgggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaattt 16317717  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  16317716 aaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagt 16317617  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctg 409  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||    
T  16317616 atttgtccttcgttaacagagttgacgaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatg 16317517  T
Q  410 cttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaagg 503  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  16317516 cctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaagg 16317417  T
Q  504 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16317416 aaatcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 16317369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4987743 - 4987312
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttc-atcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4987743 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttgatcaggagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagattcaaa 4987644  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  4987643 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaa 4987544  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  4987543 gagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 4987444  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987443 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 4987344  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4987343 agacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 4987312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16305691 - 16305145
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa------------------gtgc 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||    
T  16305691 aatttcaataggtcgtggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttctgaagctggagtgc 16305592  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||||  ||||||||| |     |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  16305591 ttctgaagtgataacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaattta 16305492  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16305491 aactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagta 16305392  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |  |||    
T  16305391 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtataagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacaaccatgc 16305292  T
Q  411 ttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaagga 504  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  16305291 ctgcagaaatgttccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaagga 16305192  T
Q  505 actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305191 aatcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 16305145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 18077565 - 18078127
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18077565 aggctagtcaagtaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttc 18077664  T
Q  116 tgagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
    ||| |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18077665 tgaagctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatt 18077764  T
Q  198 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18077765 taatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 18077864  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    | | ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18077865 ggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaa 18077964  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactgg 489  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    
T  18077965 gacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgg 18078064  T
Q  490 tggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18078065 tgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 18078127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19581854 - 19581280
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19581854 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaa 19581755  T
Q  120 g-----------------taatgacgtcatcagaagcagaa-----------------gaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
    |                 | |||||||||||||||||||||                 |  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19581754 gctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcac 19581655  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagt-aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggt 282  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19581654 cagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggt 19581555  T
Q  283 atcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19581554 atcaacgatcatttggaaaacactgagtacttgtcctttgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcc 19581455  T
Q  383 acgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc---- 478  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  19581454 acgctacaagacaagaaaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagac 19581355  T
Q  479 --aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19581354 aaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttcac 19581280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40454023 - 40454569
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  40454023 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 40454122  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  40454123 tctggagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagtaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattca 40454222  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  40454223 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagca 40454322  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  40454323 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 40454421  T
Q  412 tgcaga-aatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    ||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40454422 tgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 40454521  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40454522 tttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40454569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3391058 - 3390494
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt--- 114  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||       
T  3391058 aggcaaatcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaatgaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 3390959  T
Q  115 ---ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg----------------tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagcta 193  Q
       |||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||   ||||                |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3390958 aagctgaagtgatgacatcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcggaatcatcaccagaagcta 3390859  T
Q  194 caattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtc 292  Q
     |||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3390858 taattaattcgt-tatttaaactgaagatccaaagtagctgtttcttatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtc 3390760  T
Q  293 atttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaag 392  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3390759 atttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaag 3390660  T
Q  393 acaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggatta 485  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||    
T  3390659 acaagacaacagctatgcatgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 3390560  T
Q  486 ctggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3390559 ctggtgggtgatcaaagaaactcaacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 3390494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 96 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3371223 - 3370754
Alignment:
Q  96 gtctgaagctaaagtgcttctgagg------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccaga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |      | |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||    
T  3371223 gtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgatgacgtcgtcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcggaatcatcaccaga 3371124  T
Q  189 agctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaa 287  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3371123 agctacaattaattcgtta-tttaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaa 3371025  T
Q  288 cggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgct 387  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3371024 cggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgct 3370925  T
Q  388 acaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------ag 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||    
T  3370924 acaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaag 3370825  T
Q  481 gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3370824 gattactggtgggtgatcaaagaaactcaacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 3370754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 14835893 - 14836323
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  14835893 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaa 14835992  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  14835993 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaa 14836092  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  14836093 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 14836191  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14836192 ttcaagatgggaatgaatttaaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactcttt 14836291  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836292 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 14836323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40470279 - 40470808
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt- 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||     
T  40470279 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagc--tgaagtg 40470376  T
Q  130 catcagaagcagaagac--catcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    |||| | ||  || |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  40470377 catctggagt-gatgacgtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaa 40470475  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtta 325  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  40470476 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 40470575  T
Q  326 tcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcaga-aatgttc 424  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |    
T  40470576 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgc 40470674  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  40470675 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactct 40470774  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40470775 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40470808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25657721 - 25657174
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  25657721 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 25657622  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  25657621 tctggagtgatgacgtcatcagaagcagaaggttatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattca 25657522  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  25657521 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggtcatttggatagcactgagca 25657422  T
Q  312 cttgtccttcgttatca-gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
     ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25657421 tttgtccttcgttaacaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 25657323  T
Q  411 ttgcagaaat-gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     ||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  25657322 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 25657223  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25657222 atttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 25657174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5023312 - 5022774
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||    
T  5023312 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgcttct 5023213  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaa 214  Q
    || || ||||||||||||||||        ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||    
T  5023212 gaagtgatgacgtcatcagaaggt------catcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaa 5023119  T
Q  215 ctgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 313  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |    
T  5023118 ctgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagt 5023019  T
Q  314 tgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttg 413  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5023018 tgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctg 5022920  T
Q  414 cagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaac 506  Q
    ||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||      
T  5022919 cagaatatgtgcctttaagatgggaatgaatttggagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatt 5022820  T
Q  507 tc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5022819 tcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5022774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 27814636 - 27815167
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  27814636 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 27814735  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  27814736 atcagaaacagaaggtcatcagaagcaaagattttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27814834  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  27814835 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtataaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 27814934  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27814935 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttatgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 27815034  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27815035 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 27815134  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27815135 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27815167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 48371700 - 48371169
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  48371700 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 48371601  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  48371600 atcagaagcagaaggtcattagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 48371502  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  48371501 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggggggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 48371402  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||| |     
T  48371401 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcataatttgtacc 48371302  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  48371301 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 48371202  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48371201 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 48371169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 52704357 - 52703826
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  52704357 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 52704258  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  52704257 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 52704159  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  52704158 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 52704059  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  52704058 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 52703959  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  52703958 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 52703859  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52703858 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 52703826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 461726 - 461195
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  461726 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 461627  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  461626 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 461528  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  461527 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 461428  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  461427 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 461328  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  461327 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 461228  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  461227 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 461195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 14843344 - 14843875
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14843344 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 14843443  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  14843444 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14843542  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  14843543 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 14843642  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  14843643 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 14843742  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  14843743 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 14843842  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14843843 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14843875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17918621 - 17918090
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  17918621 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaaggtgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 17918522  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  17918521 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17918423  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  17918422 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 17918323  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  17918322 agagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17918223  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  17918222 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 17918123  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17918122 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17918090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24027776 - 24028307
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  24027776 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctccttaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 24027875  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24027876 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24027974  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  24027975 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 24028074  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||  ||| |     
T  24028075 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtaca 24028174  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  24028175 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggattatcaaaggatttcaaacgactctt 24028274  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24028275 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24028307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 451145 - 450614
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  451145 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaattgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 451046  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  451045 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 450947  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||| ||  ||||||      
T  450946 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttatctctcgttaat 450847  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  450846 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 450747  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  450746 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 450647  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  450646 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 450614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4948904 - 4948373
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4948904 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 4948805  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  4948804 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcaaaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4948706  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  4948705 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 4948606  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||| |     
T  4948605 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatatgtaca 4948506  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4948505 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgaccacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4948406  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4948405 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4948373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 15560770 - 15561301
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  15560770 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 15560869  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  15560870 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15560968  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  15560969 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 15561068  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  15561069 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15561168  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  15561169 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 15561268  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15561269 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 15561301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17929269 - 17928738
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  17929269 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaaggtgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 17929170  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||| |||| ||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  17929169 atcaaaagcggaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17929071  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  17929070 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 17928971  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  17928970 agagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17928871  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  17928870 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 17928771  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17928770 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17928738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 19954653 - 19955184
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19954653 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19954752  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  19954753 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19954851  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  19954852 tagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19954951  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  19954952 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactcttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19955051  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  19955052 ttcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaaccaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 19955151  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19955152 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 19955184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 30926185 - 30926716
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30926185 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 30926284  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  30926285 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30926383  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  30926384 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 30926483  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  30926484 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 30926583  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  30926584 ctcaagatgggaatgaatttaaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 30926683  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30926684 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 30926716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 30936763 - 30937294
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30936763 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaaaaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 30936862  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  30936863 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30936961  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  30936962 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 30937061  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  30937062 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 30937161  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  30937162 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 30937261  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30937262 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 30937294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22007580 - 22007049
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22007580 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 22007481  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||| |||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22007480 atcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22007382  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| ||  |  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  22007381 tagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 22007282  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  22007281 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22007182  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22007181 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22007082  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22007081 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22007049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36018905 - 36018374
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  36018905 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 36018806  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  36018805 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttttaatc-aaactgaagattcaaag 36018707  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  36018706 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 36018607  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  36018606 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36018507  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  36018506 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 36018407  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36018406 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36018374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16267031 - 16266500
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  16267031 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 16266932  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16266931 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16266833  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  16266832 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 16266733  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  16266732 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 16266633  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  16266632 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 16266533  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16266532 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 16266500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21996982 - 21996451
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21996982 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 21996883  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||| |||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  21996882 atcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21996784  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| ||  |  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  21996783 tagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 21996684  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  21996683 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21996584  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  21996583 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 21996484  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21996483 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 21996451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16256438 - 16255907
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  16256438 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 16256339  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16256338 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16256240  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  16256239 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 16256140  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  16256139 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaacttgtaca 16256040  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  16256039 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 16255940  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16255939 taaacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 16255907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 551
Target Start/End: Original strand, 18752230 - 18752711
Alignment:
Q  82 ctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttca--tcagaagtga--t 176  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||   |||||||  |  |    
T  18752230 ctgaagaaaactgctcctgaagttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaat 18752329  T
Q  177 atcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaa 275  Q
    ||| ||||||||| || || || |||  | |||  || ||||||||| |||||||| | || ||  |||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18752330 atcttcaccagaaactgcatttgatctcttaatc-aatctgaagatttaaagtagccgattctccattcagccttatctaagtagaacgaagaattgaaa 18752428  T
Q  276 tggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||  || || || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18752429 gggaggtatcaacggtcatttgaattgctctaagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-t 18752527  T
Q  376 tttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccca 474  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752528 tttgtccacgctacaagacaaggcaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccca 18752627  T
Q  475 aatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||      ||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18752628 aatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 18752711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 551
Target Start/End: Original strand, 18762840 - 18763321
Alignment:
Q  82 ctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttca--tcagaagtga--t 176  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||   |||||||  |  |    
T  18762840 ctgaagaaaactgctcctgaagttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaat 18762939  T
Q  177 atcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaa 275  Q
    ||| ||||||||| || || || |||  | |||  || ||||||||| |||||||| | || ||  |||| |||| |||| | | |||||||||||||||    
T  18762940 atcttcaccagaaactgcatttgatctcttaatc-aatctgaagatttaaagtagccgattctccattcagccttatctaagtataacgaagaattgaaa 18763038  T
Q  276 tggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18763039 gggaggtatcaacggtcatttgaatagctctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-t 18763137  T
Q  376 tttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccca 474  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763138 tttgtccacgctacaagacaaggcaacagttatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccca 18763237  T
Q  475 aatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||      ||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18763238 aatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 18763321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 10740282 - 10740816
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa----ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||    
T  10740282 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgac 10740381  T
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  10740382 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 10740480  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||   || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  10740481 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 10740580  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  10740581 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 10740680  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat------caggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  10740681 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10740780  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10740781 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10740816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 10954051 - 10954585
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa----ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||    
T  10954051 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgac 10954150  T
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  10954151 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 10954249  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||   || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  10954250 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 10954349  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  10954350 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 10954449  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat------caggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  10954450 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10954549  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10954550 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10954585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 19944001 - 19944549
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19944001 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19944100  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||      
T  19944101 atcagaagcagaaggtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc- 19944199  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || || | |||||||||     
T  19944200 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgagc 19944299  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  19944300 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctataagacaaaacaacagccatg 19944399  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  19944400 cctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 19944499  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19944500 gatttcaaatgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 19944549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36029475 - 36028927
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  36029475 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 36029376  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||      
T  36029375 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttttaatc- 36029277  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  36029276 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 36029177  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  36029176 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 36029077  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  36029076 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 36028977  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36028976 gatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36028927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 18129932 - 18130461
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  18129932 atttcattaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 18130031  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||| |     ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  18130032 catcagaagcagaaagtcatcaaaagcagaaagtcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagt 18130130  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | || || | |||||||||  ||||||  ||||||  |    
T  18130131 tgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaaggat-atatggatagcactgagctcttgtctctcgttaata 18130229  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctt 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |      
T  18130230 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacac 18130329  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  18130330 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 18130429  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18130430 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 18130461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 10750956 - 10751390
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  10750956 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 10751054  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  10751055 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 10751154  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  10751155 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 10751254  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  10751255 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10751354  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10751355 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10751390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 10964725 - 10965159
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  10964725 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 10964823  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  10964824 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 10964923  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  10964924 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 10965023  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  10965024 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 10965123  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10965124 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10965159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 49518721 - 49518173
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  49518721 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 49518622  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |      
T  49518621 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc- 49518523  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  49518522 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 49518423  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  49518422 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 49518323  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||    
T  49518322 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 49518223  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49518222 gatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 49518173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 55745040 - 55745474
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  55745040 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 55745138  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  55745139 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatt 55745238  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  55745239 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 55745338  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||    
T  55745339 acactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgact 55745438  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  55745439 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 55745474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 55755651 - 55756085
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  55755651 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 55755749  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  55755750 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatt 55755849  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  55755850 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 55755949  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga-actcaacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||||    
T  55755950 acactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgact 55756049  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  55756050 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 55756085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24640685 - 24640285
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  24640685 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 24640587  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24640586 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 24640487  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24640486 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 24640387  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24640386 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 24640287  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  24640286 ac 24640285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27657038 - 27656638
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  27657038 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 27656940  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656939 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 27656840  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27656839 cctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 27656740  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27656739 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 27656640  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  27656639 ac 27656638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27667611 - 27667211
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  27667611 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 27667513  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667512 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 27667413  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27667412 cctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 27667313  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27667312 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 27667213  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  27667212 ac 27667211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23509382 - 23509162
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23509382 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 23509283  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23509282 ataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttggacgt 23509183  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  23509182 gctaaaaatctcaacgtctct 23509162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 39525808 - 39526121
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  39525808 aagtcaattaatttcattaggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 39525907  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  39525908 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 39526007  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39526008 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttc-tttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 39526106  T
Q  285 caacggtcatttgaa 299  Q
    |||||||||||||||    
T  39526107 caacggtcatttgaa 39526121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 546
Target Start/End: Original strand, 18006906 - 18007296
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgt-ttttcgtttcaaccttgtctagaag 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||| || ||||||  || ||| |||| | || ||||| |||||  ||    
T  18006906 ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctggagtttcaaaagagttgtcttttggatttaacctcgtctaagag 18007005  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||| | | ||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007006 agcgaaggactaaaagggaggtgccaacgttaatttgaaaagcactgggtgcttgtccttgttga--agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 18007103  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 460  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || |||||    
T  18007104 ctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaaaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttca 18007203  T
Q  461 aaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgc-taatcatctcaacgtctct 546  Q
     ||||| ||| |||||| ||      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18007204 taggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctcaacgactctttagacgtgcttaaagatctcaacgtctct 18007296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 546
Target Start/End: Original strand, 18774448 - 18774891
Alignment:
Q  108 agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaa 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||| | |     
T  18774448 agtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatctgaag 18774546  T
Q  208 atttaaactgaagattcaaagtagctgt---ttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagca 304  Q
    ||| || |||||   |||||  ||||||   |||  |||  ||||| |||||  ||| | ||| ||  ||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  18774547 attcaatctgaaatctcaaaagagctgtctctttaagtt--aacctcgtctaagagagcaaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagca 18774644  T
Q  305 ctgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 404  Q
    ||| ||  ||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  18774645 ctgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaaatacaattgtacaaccactatctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacag 18774743  T
Q  405 ctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatc 498  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||    
T  18774744 ctctgcctgcataattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatc 18774843  T
Q  499 aaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18774844 aaaggaactcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 18774891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 8997272 - 8997492
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  8997272 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagttctgcctgcagaagtgttccttcaag 8997371  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    |  ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8997372 acaggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttggacgt 8997471  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  8997472 gctaaaaatctcaacgtctct 8997492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Original strand, 20648312 - 20648497
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  20648312 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctg 20648411  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatc 202  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20648412 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatc 20648497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 526
Target Start/End: Original strand, 16819143 - 16819568
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16819143 aagtgcctctgaagaaatgacgtcatcagaagcagaagtc-atcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaa 16819241  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtt-tcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga-gca 304  Q
     ||| || |||||   |||||  || ||| | | |   | ||||| |||||  | | ||||  || |||| |||| |  ||||| ||||||||| | |||    
T  16819242 gattcaatctgaaatctcaaaagagttgtctcttgaagttaacctcgtctaagaaagcgaaagatcgaaagggagttgccaacgttcatttgaaaaagca 16819341  T
Q  305 ctgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 404  Q
    ||| || |||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   |||||||||||||| |||||    
T  16819342 ctgggtgcttgtcctttattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacag 16819440  T
Q  405 ctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatc 498  Q
    |||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||      ||||| ||||||||||||    
T  16819441 ctctgcctgcagaattgttcccacaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatc 16819540  T
Q  499 aaaggaactcaacgactctttagacgtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16819541 aaaggaactcaacgactctttggacgtg 16819568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Original strand, 14778412 - 14778607
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  14778412 caacgttcattagaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctac 14778510  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  14778511 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 14778607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 17198085 - 17198281
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgct------ 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  17198085 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctaaagtgcttctgaa 17198184  T
Q  114 -----------tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
               ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17198185 gctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaatt 17198281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 33378457 - 33378306
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  33378457 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcagaaatgttccttca 33378358  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  33378357 agataggaatggatttgaacgtgattcttcataggacaacatccaaatcagg 33378306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Original strand, 14835748 - 14835847
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14835748 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgtagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 14835847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11519678 - 11519593
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11519678 aagtcaatcaatttcaataggtcttgaaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 11519593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Original strand, 17993763 - 17993958
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  17993763 caacgttcacttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctac 17993861  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17993862 gctacaagacaagataatagctctgcctgcagaaatgtcccttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 17993958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 14710794 - 14710943
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  14710794 ttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctatagaaatgttccttcaag 14710893  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  14710894 aaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 14710943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11536457 - 11536354
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  11536457 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagcaattcaaagaatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 11536358  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  11536357 gtaa 11536354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4987875 - 4987788
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4987875 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaactcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaaactaaaatgcttctga 4987788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 36210123 - 36210274
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  36210123 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataaatgttccttca 36210222  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  36210223 agataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 36210274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25009375 - 25009290
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25009375 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 25009290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19244266 - 19243982
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  19244266 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaac--ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaa 19244170  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgtttt---tcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagc 303  Q
     ||| ||  ||||| |||||| | ||||||||   | |||| ||||| |||||  ||| ||||  | | ||| | |||| |||||| ||||||||| |||    
T  19244169 gattcaatttgaagtttcaaa-tggctgttttatttggttttaacctcgtctaagagagcgaaagactcaaaggaaggtgtcaacgttcatttgaaaagc 19244071  T
Q  304 actgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 393  Q
    |||| || ||||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  19244070 actgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 19243982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10301146 - 10301061
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10301146 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaatacaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagttaa 10301061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23509729 - 23509630
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23509729 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 23509630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 8182535 - 8182637
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8182535 aggctagtcaagtaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttc 8182634  T
Q  116 tga 118  Q
    |||    
T  8182635 tga 8182637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 14604985 - 14605057
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  14604985 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 14605057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25089292 - 25089180
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  25089292 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 25089193  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  25089192 atcagaagcagaa 25089180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17276560 - 17276447
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  17276560 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 17276461  T
Q  130 catcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  17276460 catcagaagcagaa 17276447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28066748 - 28066636
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  || |||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  28066748 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctaaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 28066649  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  28066648 atcagaagcagaa 28066636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 8996933 - 8997023
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8996933 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaatggaatttaaaaacatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttct 8997023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10692884 - 10692789
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  |||||||    
T  10692884 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaa 10692789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10906650 - 10906555
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  |||||||    
T  10906650 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaa 10906555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 388 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242089
Alignment:
Q  388 acaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------g 481  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| |||||||||      |    
T  19242235 acaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcattcataggacaacatccaaatcaggaaaaag 19242136  T
Q  482 attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct 528  Q
    || | ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19242135 atcattggtaaatgatcaaaggttctcaacgactctttagacgtgct 19242089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1672422 - 1672368
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1672422 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1672368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1674897 - 1674843
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1674897 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1674843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 10750839 - 10750954
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa----ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||    
T  10750839 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgac 10750938  T
Q  128 gtcatcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||||    
T  10750939 gtcatcagaagcagaa 10750954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 10964608 - 10964723
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa----ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||    
T  10964608 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgac 10964707  T
Q  128 gtcatcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||||    
T  10964708 gtcatcagaagcagaa 10964723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16853536 - 16853482
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16853536 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16853482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 6517518 - 6517437
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  6517518 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttc 6517437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 17398752 - 17398857
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||  ||||   |||||||| |    
T  17398752 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaatgca 17398851  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  17398852 tttgaa 17398857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19884735 - 19884630
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  |||| |||| |    
T  19884735 aagtgtacaaccactatctccactaatctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatggaaatgca 19884636  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  19884635 tttgaa 19884630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22190879 - 22190807
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac-aagacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  22190879 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 22190807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 53442440 - 53442326
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa---ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  53442440 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacg 53442341  T
Q  129 tcatcagaagcagaa 143  Q
    ||||| |||||||||    
T  53442340 tcatcggaagcagaa 53442326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29121403 - 29121344
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  29121403 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgttacaagacaagaaaaca 29121344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 9751618 - 9751672
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9751618 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 3105497 - 3105569
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  3105497 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaaggcaaggataacagctctgcctgca 3105569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20977490 - 20977418
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  20977490 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 20977418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 37435613 - 37435685
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  37435613 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctataagacaagaaaaacagctctgcctgca 37435685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 39419812 - 39419884
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  39419812 aagtgtacaaccactacttccattactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 39419884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 40860698 - 40860634
Alignment:
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctg 409  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  40860698 gtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctg 40860634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24640852 - 24640765
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  24640852 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 24640765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27657205 - 27657118
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  27657205 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 27657118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27667778 - 27667691
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  27667778 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 27667691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 347 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8105667 - 8105566
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaattt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  8105667 tgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcattt 8105569  T
Q  446 gaa 448  Q
    |||    
T  8105568 gaa 8105566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16848574 - 16848508
Alignment:
Q  350 acaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16848574 acaaccactacctccactactctgtttttgtctctcctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16848508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 22675598 - 22675704
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| | || |||||||| | ||  ||||||| ||||  |||||||||     
T  22675598 aagtgtacaaccactacctccactactcagttttttgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctacaacaatgttccttcacaatgggaatgc 22675697  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  22675698 atttgaa 22675704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 25651182 - 25651235
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  25651182 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 25651235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3395623 - 3395542
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  3395623 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 3395542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10072968 - 10072863
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| | |||||| || | |||| | |||||| ||||  ||||||||| |    
T  10072968 aagtgtacaaccactatctccactactatgtttttgtctctgctataagacaagaaaaacagccctacctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgca 10072869  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  10072868 tttgaa 10072863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 13576192 - 13576297
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||  ||||  ||||||||| |    
T  13576192 aagtgtaaaaccactacatccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgtttattcacaatgggaatgca 13576291  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  13576292 tttgaa 13576297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 18774326 - 18774375
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18774326 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 18774375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 19911959 - 19912040
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||    
T  19911959 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgcctctgctacaagacaagaataacagctctacttgcaacaatgttc 19912040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 45833427 - 45833322
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| | |||| |||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  45833427 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttggtctctgctacaaaacaagaaaaacaactctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 45833328  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  45833327 tttgaa 45833322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 55380323 - 55380218
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||   | ||||||||    
T  55380323 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaataataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgaa 55380224  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  55380223 tttgaa 55380218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 55744891 - 55744979
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg--agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  55744891 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 55744979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 55755502 - 55755590
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg--agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  55755502 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 55755590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Original strand, 16819022 - 16819070
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagga 70  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16819022 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaagga 16819070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 38513911 - 38513839
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  38513911 aagtgtacaaccactactttcactactctgtttttgtctctgctacaagacgagaaaaacagctctgcctgca 38513839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 8997071 - 8997145
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8997071 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 8997145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 413035 - 412929
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||   |||||| ||||  |||||||||     
T  413035 aagtgtacaaccactgcctccactactctgttctttgtctttgctacaaaacaagaaaaacagttctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgc 412936  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  412935 atttgaa 412929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6641717 - 6641679
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6641717 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttatgtct 6641679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11542395 - 11542357
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11542395 aagtcaatcaatttcaataggtcttggcagaacaatgga 11542357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23750555 - 23750469
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  23750555 aagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttca 23750469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54679963 - 54679929
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679963 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 54679929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 12811253 - 12811306
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  12811253 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 12811306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Original strand, 16819092 - 16819136
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16819092 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 16819136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Original strand, 18752150 - 18752227
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  18752150 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagtattccaagcatctgaagaaaactgc 18752227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Original strand, 18762760 - 18762837
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  18762760 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagtattccaagcatctgaagaaaactgc 18762837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19666405 - 19666352
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  19666405 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 19666352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17247277 - 17247153
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||| | |||||||||||  ||| | |||||  ||||  |||||||||     
T  17247277 aagtgtacaaccactgcctccactactctgttttttgtctctactacaaggcaagaaaaacagctctgccagcaaagatgttacttcacaatgggaatgc 17247178  T
Q  442 atttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
    |||||||  | || |||||||||||    
T  17247177 atttgaaattgatccttcaaaggac 17247153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 19621139 - 19621211
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19621139 aagtgtacaaccactatctccactattcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 19621211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 56533140 - 56533191
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  56533140 aagtgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaa 56533191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 15475221 - 15475288
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgc 410  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  15475221 aagtgtacaaccaatacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgc 15475288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Original strand, 10661240 - 10661278
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10661240 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 10661278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Original strand, 10875385 - 10875423
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10875385 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 10875423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16632473 - 16632419
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||  ||||||||||||||    
T  16632473 aagtgtacaaccactacctccaccaatcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 16632419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40846132 - 40846078
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||    
T  40846132 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtatctctgctacaagacaaga 40846078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9140945 - 9140840
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||  |||| ||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||  | ||   ||||||||||    
T  9140945 aagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctgctataagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttctacatactgggaatgaa 9140846  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  9140845 tttgaa 9140840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 415
Target Start/End: Original strand, 17700854 - 17700915
Alignment:
Q  355 cactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  17700854 cactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 17700915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 17993500 - 17993544
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17993500 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 17993544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 18006713 - 18006750
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18006713 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 18006750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Original strand, 22675298 - 22675331
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22675298 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatc 22675331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33378811 - 33378766
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33378811 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 33378766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 37985690 - 37985743
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  37985690 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaag 37985743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 3188095 - 3188123
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3188095 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 3188123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 3499730 - 3499802
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  | ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  3499730 aagtgtacaaccactacttctactactctgagtttgtctctgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 3499802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 9914120 - 9914148
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914120 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 9914148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 10088035 - 10088063
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10088035 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 10088063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16940274 - 16940210
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||    
T  16940274 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagttaaagtgctcttgaagtgatgacgtaatcagaagca 16940210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23509567 - 23509519
Alignment:
Q  147 catcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23509567 catcataagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 23509519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24652006 - 24651978
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24652006 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 24651978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 43346120 - 43346148
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346120 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 43346148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5853 - 5298
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  5853 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 5754  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
          ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||    
T  5753 gtttcaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgat 5654  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |    
T  5653 cagtaaaattaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaa 5554  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5553 gcactgggtaattgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 5454  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  5453 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatg 5354  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5353 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 5298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13265 - 12896
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  13265 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 13166  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13165 gtttcaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 13066  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  13065 cagaagctacaagtgatcagtaaaattaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggagatat 12966  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaac 354  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12965 caacggtcggttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaac 12896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 185)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 551
Target Start/End: Original strand, 18381623 - 18382161
Alignment:
Q  23 agtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18381623 agtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagaccaaaggaattttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagt 18381722  T
Q  122 aatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaa 219  Q
     ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| || | ||||||| || ||||||||    
T  18381723 gatgacgtcatcagaagcagaagctaatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaa 18381822  T
Q  220 gattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcc 318  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18381823 gattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttggagagccctgagtacttgtcc 18381922  T
Q  319 ttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa 418  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18381923 ttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa 18382022  T
Q  419 atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacg 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18382023 atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggaactcaacg 18382122  T
Q  513 actctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18382123 actctttagacgtgttaatcatctcaacgtctctttcac 18382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 20 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39587475 - 39586918
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39587475 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaa 39587376  T
Q  120 g-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    |                 | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||    
T  39587375 gctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcggaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaattatcaccagaagctacaattgat 39587276  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||    
T  39587275 ccataagtttaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggag 39587176  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-ac 399  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  39587175 aacactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaa 39587076  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtgga 493  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||    
T  39587075 aacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtgga 39586976  T
Q  494 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586975 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 39586918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17957762 - 17957189
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa------- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  17957762 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctaaagtgctt 17957663  T
Q  108 ----------agtgcttctgaggtaa-tgacgtcatcagaagcagaaga-----------ccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
              ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||            |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  17957662 ctgaagctggagtgcatctgaagtaaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcccatcagaagcaaagtttcatcagaagcgaaatcatcacc 17957563  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17957562 agaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtat 17957463  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17957462 caacggtcatttgaagagcactgagtatttgtccttctttatcagagtttacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcta 17957363  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg-- 481  Q
    | ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  17957362 cactacaagacaagaaaacaaccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccatatcaggca 17957263  T
Q  482 ----attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17957262 aagaattactggtggaagatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatttcaacgtctctttcac 17957189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 9050166 - 9050745
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg--- 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  9050166 cataggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 9050265  T
Q  112 --------------cttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag-----------------accatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatc 179  Q
                  ||||||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||    
T  9050266 ctgaagctggagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatc 9050365  T
Q  180 atcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || || ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||    
T  9050366 atcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaatttggagattcaaagtagctggttctcatttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaaggg 9050465  T
Q  279 aggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050466 aggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcattctttaacaaagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 9050565  T
Q  378 tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9050566 tgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatggtaatgaatttgaagctattttttcaaaggactacacccaaat 9050665  T
Q  478 cagg------attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050666 caggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaattcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 9050745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 34 - 551
Target Start/End: Original strand, 20441031 - 20441575
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgt------------------ctgaagctaaagtgcttc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                  ||||||||| ||||||||    
T  20441031 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtttgaagcttaaagtgcttctgaagctagagtgcttc 20441130  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaa 214  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  20441131 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattctaa 20441230  T
Q  215 ctgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 313  Q
     | |||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  20441231 ttaaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacatcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatt 20441330  T
Q  314 tgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttg 413  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |     
T  20441331 tttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgccta 20441430  T
Q  414 cagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaac 506  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||     
T  20441431 cagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaat 20441530  T
Q  507 tcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20441531 tcaacgactctttagacgtgcttatcatctcaacgtctctttcac 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 4250294 - 4250823
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4250294 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcatctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 4250393  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  4250394 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 4250493  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  4250494 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 4250593  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||    
T  4250594 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 4250692  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  4250693 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactcttta 4250792  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4250793 gacgtgctaattatctcaacatctctttcac 4250823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 14387955 - 14388378
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14387955 tcatcaaaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaag 14388054  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  14388055 gagctgtttttcgttctaacctcgtctaaaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 14388154  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14388155 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 14388254  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388255 aagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 14388354  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  14388355 cgtgctaaaaatctcaacgtctct 14388378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 11194897 - 11195325
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11194897 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac-agaagctgcaattgatcagtatatttaaactgaagattcaaag 11194995  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11194996 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtctttcgttatca 11195095  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  11195096 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaaatgttccttc 11195195  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttag 521  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11195196 aagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacactcaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttag 11195295  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11195296 acgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 11195325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 47195641 - 47195210
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  47195641 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactggagattcaaa 47195542  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||     
T  47195541 gtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaa 47195442  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||||     
T  47195441 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaatgttcc 47195342  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47195341 ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcgaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 47195242  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47195241 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 47195210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 39193805 - 39194352
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  39193805 aatttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagcttaagtgc 39193904  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  39193905 atcttaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 39194004  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  39194005 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggttatttggatagcactgagt 39194104  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  39194105 atctgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 39194203  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  39194204 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 39194303  T
Q  504 a-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194304 attccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 39194352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 18310801 - 18311224
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  18310801 tcatcagaaacagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaatttgaagtttcaaag 18310900  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  18310901 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaaagaacgaaggattgaaaggaagatatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 18311000  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  18311001 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaaatgttccttc 18311100  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||      | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18311101 aagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtgaatgatcaaagaaactcaacgactctttaga 18311200  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  18311201 cgtgctaaaaatctcaacgtctct 18311224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35013413 - 35012870
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  35013413 aggctagtcaagaaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaacgaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctg 35013314  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaac 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||    
T  35013313 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaac 35013215  T
Q  216 tgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtactt 314  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||    
T  35013214 tgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcactt 35013115  T
Q  315 gtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgc 414  Q
    |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  35013114 gtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgc 35013015  T
Q  415 agaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaact 507  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35013014 agaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggattt 35012915  T
Q  508 c-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35012914 caaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 35012870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 129 - 549
Target Start/End: Original strand, 7689284 - 7689715
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaag-taaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaa 226  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  7689284 tcatcagaagcagaaggtcaacagaagctaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 7689383  T
Q  227 agtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag-tacttgtccttcgtt 324  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  7689384 agtagctgtttctcatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagttatttgtccttcgtt 7689483  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgtt 423  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||     
T  7689484 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 7689582  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 516  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || |||| |||    
T  7689583 ccttcaagatgtgaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacggctc 7689682  T
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7689683 tttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 7689715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 129 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 675822 - 675403
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  675822 tcatcagaagca-aagtccaccagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgaacagaatatttaaactgaagtttcaaag 675724  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||| || || |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||   |    
T  675723 gagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaggacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactcggtgcttgtccttcattga-a 675625  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  675624 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 675525  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    || |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  675524 aaaatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 675425  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtct 544  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  675424 cgtgctaaaaatctcaacgtct 675403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 147926 - 148472
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  147926 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 148025  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  148026 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 148125  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  148126 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaagtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 148225  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  148226 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 148324  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||    
T  148325 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaagga 148424  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  148425 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 148472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 154001 - 154547
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  154001 atttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 154100  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  154101 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 154200  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  154201 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 154300  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  154301 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtataaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 154399  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  154400 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 154499  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  154500 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 154547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 130 - 528
Target Start/End: Original strand, 41132446 - 41132849
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  41132446 catcagaagtagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaatg 41132545  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||| ||   ||    
T  41132546 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgggtgtttgtccttctttga-ag 41132644  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  41132645 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaactgttccttca 41132744  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagac 523  Q
    | |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41132745 aaatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaatgactctttagac 41132844  T
Q  524 gtgct 528  Q
     ||||    
T  41132845 atgct 41132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4167737 - 4167206
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4167737 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 4167638  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  4167637 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4167539  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  4167538 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 4167439  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||  ||| |     
T  4167438 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacg 4167339  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  4167338 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 4167239  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4167238 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4167206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5974259 - 5973732
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  5974259 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 5974160  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  5974159 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 5974060  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt-gaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | | | |||||     
T  5974059 aactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcattttggacaacgctgagc 5973960  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5973959 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactgcctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 5973861  T
Q  411 ttgcagaaat-gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     ||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  5973860 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 5973761  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaat 531  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||    
T  5973760 atttcaaacgactctttagacgtgctaat 5973732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5639439 - 5639970
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  5639439 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 5639538  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5639539 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5639637  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  5639638 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 5639737  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||  ||| |     
T  5639738 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacg 5639837  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  5639838 ttcaagatgggaatgaatttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 5639937  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5639938 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5639970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12731025 - 12730494
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12731025 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 12730926  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12730925 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12730827  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  12730826 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12730727  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12730726 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12730627  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12730626 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12730527  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12730526 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12730494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 12897712 - 12898243
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12897712 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 12897811  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12897812 atcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12897910  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  12897911 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12898010  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12898011 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12898110  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12898111 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12898210  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12898211 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12898243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 5649996 - 5650527
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  5649996 atttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 5650095  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5650096 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5650194  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  5650195 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 5650294  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||  ||| |     
T  5650295 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacg 5650394  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  5650395 ttcaagatgggaatgaatttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 5650494  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5650495 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12741618 - 12741087
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12741618 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 12741519  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||| |||||||||||||    
T  12741518 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaattgaagattcaaag 12741420  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  12741419 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12741320  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12741319 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12741220  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12741219 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12741120  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12741119 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12741087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21878245 - 21877714
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  21878245 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 21878146  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  21878145 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21878047  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |  | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  21878046 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatagatagcactgagcacttgtctctcgttaat 21877947  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  21877946 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21877847  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  21877846 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 21877747  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21877746 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 21877714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 33085039 - 33084509
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtca 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||     |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  33085039 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaatttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtca 33084940  T
Q  132 tcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || ||   | |||  ||||||||||||||||||    
T  33084939 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgattttttaatc-aaactgaagattcaaagt 33084841  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    ||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  |    
T  33084840 agctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaata 33084741  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctt 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| | |    
T  33084740 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctattttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgt 33084641  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  33084640 tcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 33084541  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33084540 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 33084509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19179438 - 19178906
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19179438 atttcaataggtcttggaagcacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19179339  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  19179338 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19179240  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat-ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||| | |||||| || |||||||  ||||||     
T  19179239 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggagttatcaacggatatattggatagcactaagcacttgtctctcgttaa 19179140  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaat-gttc 424  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | || |    
T  19179139 tatagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtac 19179040  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  19179039 gttcaagatgggaatgaatttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 19178940  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19178939 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 19178906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 12614045 - 12614576
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  12614045 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 12614144  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12614145 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12614243  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  12614244 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 12614343  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12614344 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12614443  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12614444 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12614543  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12614544 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12614576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 12623510 - 12624041
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  12623510 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 12623609  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12623610 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12623708  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||      
T  12623709 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatatcactgagcacttgtctctcattaat 12623808  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12623809 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12623908  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12623909 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12624008  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12624009 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12624041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21864139 - 21863608
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  21864139 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 21864040  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  21864039 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21863941  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  21863940 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 21863841  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  21863840 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtttacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21863741  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  21863740 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 21863641  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21863640 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 21863608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 277 - 551
Target Start/End: Original strand, 20195670 - 20195949
Alignment:
Q  277 ggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20195670 ggaggtatcaacggtcatttgaagagcactaggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttc 20195769  T
Q  377 ttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 476  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  20195770 ttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccatcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaa 20195869  T
Q  477 tcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20195870 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaa-aatctcaacgtctctttcac 20195949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 110 - 551
Target Start/End: Original strand, 23580134 - 23580586
Alignment:
Q  110 tgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaa 207  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |    
T  23580134 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatccttta 23580233  T
Q  208 atttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcact 306  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||    
T  23580234 atc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 23580332  T
Q  307 gagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagc 405  Q
    ||| |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580333 gagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagc 23580432  T
Q  406 tctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatc 498  Q
      ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  23580433 catgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatc 23580532  T
Q  499 aaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23580533 aaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23580586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12947091 - 12946818
Alignment:
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12947091 atcagaagcagaagatcatcagaagcacgatttcatcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaagga 12946992  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcaga 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12946991 gctgtttttcgtttcaacctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtatttatccttcgttatcaga 12946892  T
Q  331 attgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 404  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12946891 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 12946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 36236158 - 36236689
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  36236158 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 36236257  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||  | || | ||||||||||||||||    
T  36236258 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcctttaa-tcaaactgaagattcaaa 36236356  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| ||  ||||||  ||||||     
T  36236357 gttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaa 36236456  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |     
T  36236457 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtaca 36236556  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  36236557 ctcaagatgggaaggaatttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 36236656  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36236657 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36236689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 36246705 - 36247236
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  36246705 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 36246804  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||  | || | ||||||||||||||||    
T  36246805 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcctttaa-tcaaactgaagattcaaa 36246903  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| ||  ||||||  ||||||     
T  36246904 gttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaa 36247003  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttct 425  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |     
T  36247004 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtaca 36247103  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  36247104 ctcaagatgggaaggaatttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 36247203  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36247204 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36247236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2539013 - 2538483
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||| |  |||| |||    
T  2539013 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcttgaagagatgatgtc 2538914  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  2538913 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 2538815  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  2538814 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 2538715  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||   ||| |      
T  2538714 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagttttgtacac 2538615  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  2538614 tcaagatgggaatgaatttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 2538515  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2538514 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 2538483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3172101 - 3171569
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  3172101 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 3172002  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  3172001 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3171903  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  3171902 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 3171803  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  3171802 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtaca 3171703  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  3171702 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 3171603  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3171602 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3171569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3182703 - 3182171
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  3182703 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 3182604  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  3182603 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3182505  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  3182504 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 3182405  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  3182404 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtaca 3182305  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  3182304 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 3182205  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3182204 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3182171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 10997513 - 10998044
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  10997513 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 10997612  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    || |||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  10997613 attagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 10997711  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  10997712 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 10997811  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  10997812 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10997911  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  10997912 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 10998011  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  10998012 tagaagtgctgattatctcaacgtctctttcac 10998044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4178376 - 4177862
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  4178376 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagcggaagtgcttctgaagtgatgacgtc 4178277  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||| |||                ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  4178276 atcagaagcaaaagt---------------tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagta 4178193  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||    
T  4178192 gctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatag 4178093  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||  ||| | ||    
T  4178092 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcaaaatttgtacgtt 4177993  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  4177992 caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttta 4177893  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4177892 gacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 4177862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19188298 - 19187785
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19188298 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19188199  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||                 |||| |||| |||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  19188198 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaa-----------------tatcttcactagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagta 19188117  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat-ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    | || || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| | ||||||||| |||||||  ||||||  |    
T  19188116 gttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttgtctctcgttaata 19188017  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctt 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| | |    
T  19188016 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgt 19187917  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  19187916 tcaagatgggaatgaatttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 19187817  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19187816 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 19187785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21895613 - 21895149
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||     
T  21895613 ctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacg 21895514  T
Q  196 attaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat 294  Q
     || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  21895513 tttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatat 21895415  T
Q  295 ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaaga 393  Q
     || | ||||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21895414 atggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaga 21895315  T
Q  394 caagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattac 486  Q
    ||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||    
T  21895314 caaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcac 21895215  T
Q  487 tggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21895214 tggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 21895149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 46180581 - 46181131
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||                   
T  46180581 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacctaaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctatgaagtgtttctgaa 46180680  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  46180681 gttacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 46180780  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    ||| | ||| || ||| |   |||||  || ||||| ||    | ||||| |||||  ||| ||||| ||  ||| ||| ||  ||||| |||||||||     
T  46180781 cagaagattcaatctggaatctcaaaagagttgtttctttaagttaacctcgtctaagagagcgaaggatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaa 46180880  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaca 400  Q
    ||||||| || ||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  |    
T  46180881 agcactgggtgcttgtccctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcttcgctacaagacaagtta 46180979  T
Q  401 acagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggat 494  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  46180980 acagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggat 46181079  T
Q  495 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46181080 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctct 46181131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38095555 - 38095023
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  38095555 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 38095456  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || ||||||||||||||    
T  38095455 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaag 38095357  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| || ||||  || |||      
T  38095356 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacctgtctctcattaat 38095257  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  38095256 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 38095157  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  38095156 actcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 38095057  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38095056 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 38095023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 38106180 - 38105648
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  38106180 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 38106081  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || ||||||||||||||    
T  38106080 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaag 38105982  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| || ||||  || |||      
T  38105981 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacctgtctctcattaat 38105882  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  38105881 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 38105782  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  38105781 actcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 38105682  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38105681 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 38105648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 51628898 - 51629447
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  51628898 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 51628997  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  51628998 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 51629097  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  51629098 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 51629196  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  51629197 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 51629296  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  51629297 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 51629396  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51629397 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 51629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5844241 - 5843767
Alignment:
Q  89 aaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcacca 186  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||    
T  5844241 aaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcacca 5844142  T
Q  187 gaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatc 285  Q
    ||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5844141 gaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatc 5844043  T
Q  286 aacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctac 384  Q
    |||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5844042 aacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctac 5843943  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc---- 478  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||        
T  5843942 gctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggc 5843843  T
Q  479 --aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5843842 aaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5843767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7507683 - 7507249
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  7507683 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccattaatc-aaactgaagattca 7507585  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  7507584 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 7507485  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  7507484 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 7507385  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  7507384 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7507285  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7507284 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7507249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7518280 - 7517846
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  7518280 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccattaatc-aaactgaagattca 7518182  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  7518181 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 7518082  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  7518081 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 7517982  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  7517981 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 7517882  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7517881 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7517846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 51656274 - 51656708
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  51656274 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 51656372  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  51656373 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 51656472  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  51656473 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 51656572  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  51656573 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 51656672  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51656673 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 51656708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5833600 - 5833165
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  5833600 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 5833502  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  5833501 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatt 5833402  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  5833401 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 5833302  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  5833301 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 5833202  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5833201 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5833165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Original strand, 35648551 - 35648951
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  35648551 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 35648649  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35648650 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 35648749  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35648750 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 35648849  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35648850 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 35648949  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  35648950 ac 35648951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 47607756 - 47608191
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  47607756 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 47607854  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| || | || ||  ||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  47607855 aagttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcttt 47607954  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  47607955 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 47608054  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  47608055 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 47608154  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47608155 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 47608191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 47618364 - 47618799
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  47618364 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 47618462  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| || | || ||  ||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  47618463 aagttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcttt 47618562  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  47618563 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 47618662  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  47618663 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 47618762  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47618763 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 47618799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Original strand, 35401025 - 35401425
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  35401025 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 35401123  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35401124 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 35401223  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35401224 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 35401323  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  35401324 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgattatctcaacgtctctttc 35401423  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  35401424 ac 35401425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Original strand, 35404252 - 35404652
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  35404252 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 35404350  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35404351 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 35404450  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35404451 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 35404550  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  35404551 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgattatctcaacgtctctttc 35404650  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  35404651 ac 35404652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 35637994 - 35638299
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35637994 agaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacagatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 35638093  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagcta 452  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |     
T  35638094 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttt 35638193  T
Q  453 attcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctc 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  35638194 attcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacctgctgattatctcaacgtctc 35638293  T
Q  546 tttcac 551  Q
    ||||||    
T  35638294 tttcac 35638299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 20883711 - 20884134
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || |||||  ||||||     
T  20883711 tcatcagaaccagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaaatttcaaaa 20883810  T
Q  229 tagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
     ||||| || ||  | | |||||  ||||  ||| ||||| ||  ||| | | || |||||| || |||||| |||||| ||| | | | | || ||       
T  20883811 gagctgattctttatgttaacctcatctaagagagcgaaggatcaaaaggaaagtgtcaacgttcgtttgaaaagcactaagtgcctttacctcattga- 20883909  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | ||| ||    
T  20883910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattagctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgccagcagaattcttcctt 20884009  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20884010 caagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaacagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttgg 20884109  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||   |||||||||||||    
T  20884110 acgtgctaaaagtctcaacgtctct 20884134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23927108 - 23926888
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  23927108 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctacagaaatgttccttcaag 23927009  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || |||||| |||||||  | || ||| | |||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23927008 ataggaatggatttgaacgtgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactcaacgactctttggacgt 23926909  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  23926908 gctaaaaatctcaacgtctct 23926888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28474499 - 28474075
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||| |    
T  28474499 aagtgcatctaaagtaatgacgtcatcagaagcagaactc-atcagaagcaaagtt-catcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatcagaa 28474402  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcac 305  Q
     ||| || |||||| |||||| | ||||||| || | || ||||| |||||  ||| ||||  | | ||| | ||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  28474401 gattcaatctgaagtttcaaa-tggctgtttattggatttaacctcgtctaagagagcgaaagactcaaaggaaggtgccaacgttcatttgaaaagcac 28474303  T
Q  306 tgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 405  Q
    || || ||||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28474302 tgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagc 28474204  T
Q  406 tctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatca 499  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||| | ||||  |||||||    
T  28474203 tctgcctgcagaaatgttcctttaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatca 28474104  T
Q  500 aaggaactcaacgactctttagacgtgct 528  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28474103 aaggttctcaacgactctttagacgtgct 28474075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 546
Target Start/End: Original strand, 22609960 - 22610226
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |    
T  22609960 caacgctcatttgaaaagcactgagtgcttgtacctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctc 22610058  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | || ||| | |||||||||| ||||||||        
T  22610059 gctacaagacaatataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaatttgatcctttataggactacactcaaatcaggcaa 22610158  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22610159 aagattactgatggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 22610226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20799114 - 20798894
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  20799114 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 20799015  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799014 ataggaatgaatttgaagttgatcctctataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 20798915  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||    |||||||||||||    
T  20798914 gctataattctcaacgtctct 20798894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21165345 - 21165242
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165345 cataggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 21165246  T
Q  115 ctga 118  Q
    ||||    
T  21165245 ctga 21165242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 285 - 541
Target Start/End: Original strand, 45070639 - 45070900
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |    
T  45070639 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcctgtccttcattga-agagttgacaaattacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctc 45070737  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||        
T  45070738 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaa 45070837  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacg 541  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  45070838 aagattagtggtgaatgatcaaaggaactcaacgattctttagacgtgcttaagatctcaacg 45070900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5929799 - 5929604
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  5929799 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtcctttattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctac 5929701  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  5929700 gctacaagacaagacaccagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 5929604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 285 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44201108 - 44200911
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44201108 caacgttcatttgaaaagcactgagtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtcta 44201010  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagga 482  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  44201009 cgctacaagacaagataacaactttgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatctttcataggacaacatccaaatcagga 44200911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47195784 - 47195686
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47195784 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 47195686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19038103 - 19037907
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  19038103 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcactga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctgc 19038005  T
Q  385 gctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  19038004 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcagg 19037907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 332 - 479
Target Start/End: Original strand, 19170363 - 19170512
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19170363 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcgttca 19170462  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 479  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  19170463 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatca 19170512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28380090 - 28379896
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||    
T  28380090 caacgttcgtttgaaaagcattgagtgcttgtccttctttg--agagttgacaaagtacaagtgtacaaccagtacctccacgactctaattgtgtctac 28379993  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  28379992 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 28379896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17371093 - 17370942
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17371093 ttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaaatgttccttca 17370994  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
     ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17370993 tgataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 17370942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Original strand, 52350670 - 52350865
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  52350670 caacgttcacttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctac 52350768  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  52350769 gctacaagacaagataatagctctgcctgcagaaatgtcccttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 52350865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20251824 - 20251675
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20251824 ttgacaaagtgcaagggtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctatgctacaaaacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaag 20251725  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20251724 ataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 20251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24253023 - 24252938
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253023 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 24252938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 11194760 - 11194856
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgaggtaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  11194760 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtcggaagctaagaagtgcttctgaagtaa 11194856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 18310657 - 18310760
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag--ctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||     
T  18310657 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctctaaagtggttctgaa 18310756  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  18310757 gtaa 18310760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22019387 - 22019236
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22019387 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaaatgttccttca 22019288  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  22019287 agataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcagg 22019236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22655528 - 22655377
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22655528 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttccttca 22655429  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  22655428 agataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacatccaaatcagg 22655377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 14387811 - 14387914
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag--ctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||     
T  14387811 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacccaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctctaaagtggttctgaa 14387910  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  14387911 gtaa 14387914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20799460 - 20799361
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaag-aaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20799460 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 20799361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 123
Target Start/End: Original strand, 22609690 - 22609781
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgaggtaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  22609690 ttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaagtaa 22609781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23065045 - 23064935
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23065045 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctac 23064947  T
Q  385 gctacaagacaa 396  Q
    ||||||||||||    
T  23064946 gctacaagacaa 23064935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22642946 - 22642828
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22642946 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacggtacaagacaagataaacagttctgcctgcagaaatgttccttca 22642847  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaa 448  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  22642846 agataggaatggatttgaa 22642828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 481
Target Start/End: Original strand, 26548247 - 26548437
Alignment:
Q  291 tcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctac 389  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||    
T  26548247 tcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttc--tataagagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgacactgcctctgtctacgctac 26548344  T
Q  390 aagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||| ||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||  || ||||||||||    
T  26548345 aagacaggataaacagctctgtctgcataaatgttctttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacagcatccaaatcagg 26548437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12947238 - 12947135
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||     
T  12947238 aagtcattcaatgtcactaggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaatccaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagccaagaagtgcttctgaa 12947139  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  12947138 gtaa 12947135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21544064 - 21543929
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaattt 445  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  21544064 tgtacgaccactacctccactactttgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaaatgttccttcaagttaggaatggattt 21543965  T
Q  446 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||  | |||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  21543964 gaacatgattctttataggacaacatccaaatcagg 21543929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 675958 - 675882
Alignment:
Q  30 caatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  675958 caatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaaggaaactgcgtctaaagcta 675882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23927423 - 23927324
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23927423 aagttaatcaatttcaatagatcttggaagaacaatagagagcaaaggaatttaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 23927324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26577114 - 26577040
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26577114 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaacaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 26577040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 2327482 - 2327587
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  2327482 aagtgtacaaccactacctccactactctggttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcttgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 2327581  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  2327582 tttgaa 2327587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 32785979 - 32786084
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||| |    
T  32785979 aagtgtacaaccactatctccactactatgtttttgtctccgctaaaagacaagaaaaacagctctgcttgcaaagatgttccttcacaatgggaatgca 32786078  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  32786079 tttgaa 32786084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 20883566 - 20883665
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20883566 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagttatttaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 20883665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 7689136 - 7689239
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaag-aaaactgcgtctgaagc-taaagtgctt 114  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7689136 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaataatggagagcaaaaagaattctaagcatctgaagaaaaactgcgtctgaagcttaaagtgctt 7689235  T
Q  115 ctga 118  Q
    ||||    
T  7689236 ctga 7689239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7507815 - 7507702
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  7507815 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 7507716  T
Q  130 catcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  7507715 catcagaagcagaa 7507702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7518412 - 7518299
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  7518412 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 7518313  T
Q  130 catcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||    
T  7518312 catcagaagcagaa 7518299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 25448608 - 25448746
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  25448608 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 25448707  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  25448708 tttgaaattgatccttcataggacaacaaccatatcagg 25448746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1900383 - 1900278
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||| ||| |    
T  1900383 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatattccttcacaatggggatgga 1900284  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  1900283 tttgaa 1900278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 22464851 - 22464956
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||  ||||||||| |    
T  22464851 aagtgtacatccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgca 22464950  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  22464951 tttgaa 22464956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 36134228 - 36134156
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  36134228 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36134156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 51656158 - 51656272
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa---ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  51656158 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacg 51656257  T
Q  129 tcatcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||||    
T  51656258 tcatcagaagcagaa 51656272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22153895 - 22153841
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22153895 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35040204 - 35040150
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35040204 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 35040150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 22600224 - 22600329
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  22600224 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatgga 22600323  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  22600324 tttgaa 22600329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21702852 - 21702780
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  21702852 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 21702780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Original strand, 30291884 - 30292066
Alignment:
Q  110 tgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaa 207  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |    
T  30291884 tgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatccttta 30291983  T
Q  208 atttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacgg 290  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30291984 a-tcaaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 30292066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38282600 - 38282500
Alignment:
Q  349 tacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttga 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | || |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  38282600 tacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaatagctctgcttgcaacaatgttccttcacaatgggaatggatttga 38282501  T
Q  448 a 448  Q
    |    
T  38282500 a 38282500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2268569 - 2268515
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2268569 aagtgtacaaccactacctcgactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 2268515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 20866995 - 20867045
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaat 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20866995 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaat 20867045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 22427399 - 22427453
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22427399 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaaga 22427453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30572235 - 30572149
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  30572235 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtttctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttca 30572149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37642286 - 37642232
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37642286 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 37642232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 7745132 - 7745213
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  7745132 aagtgtacaaccactacctccactactctgctattgccttcgctacatgacaagaaaaacagctttgcctgcagaaatgttc 7745213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 431
Target Start/End: Original strand, 24028751 - 24028816
Alignment:
Q  367 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24028751 tactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaaatgttccttcaag 24028816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19215650 - 19215578
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  19215650 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 19215578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 409
Target Start/End: Original strand, 21121108 - 21121172
Alignment:
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctg 409  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  21121108 gtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctg 21121172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 21135202 - 21135274
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21135202 aagtgtacaaccactaaatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 21135274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23024826 - 23024754
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23024826 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcatgca 23024754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 39201034 - 39201137
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaat 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||||||||||| ||||   |||||  ||||  ||||||||| ||    
T  39201034 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtttctgctacaacacaa-aaaacagctctgcctgcaacgatgtttcttcacaatgggaatgcat 39201132  T
Q  444 ttgaa 448  Q
    |||||    
T  39201133 ttgaa 39201137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 46089027 - 46088955
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  46089027 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctactagacaaggataacagctctgcctgca 46088955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5833731 - 5833644
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  5833731 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 5833644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 14263493 - 14263548
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  14263493 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaaga 14263548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 35400858 - 35400945
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  35400858 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 35400945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 35404085 - 35404172
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  35404085 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 35404172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 35648384 - 35648471
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  35648384 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 35648471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 47607625 - 47607712
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  47607625 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 47607712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 47618233 - 47618320
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  47618233 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 47618320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2267127 - 2267073
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  2267127 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctactacaagacaaga 2267073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 44821587 - 44821641
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44821587 aagtgtacaactactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 44821641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 48570273 - 48570327
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  48570273 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaggacaaga 48570327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10757459 - 10757354
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||   | ||||||||    
T  10757459 aagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcattgttccttcatacttggaatgaa 10757360  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  10757359 tttgaa 10757354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20799354 - 20799290
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  20799354 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagtaaag-ttcatcagaag 20799290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 28492446 - 28492551
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||| | || |||||||| ||||  ||||||||| ||   ||||||||||    
T  28492446 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctactagacaagaataatagctctgcctgcaacaatgttcttacatactgggaatgaa 28492545  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  28492546 tttgaa 28492551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29215835 - 29215730
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||  |    
T  29215835 aagtgtacaatcactagctccactactctgtttttgtctctgctacaaggcaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatata 29215736  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  29215735 tttgaa 29215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 33256393 - 33256474
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  33256393 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 33256474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 33276565 - 33276646
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  33276565 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 33276646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 16235338 - 16235410
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16235338 aagtgtacaacaactacctccactactccttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16235410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Original strand, 19063523 - 19063603
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  19063523 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtg 19063603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 21191907 - 21191979
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||| | ||||||| ||||||||    
T  21191907 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaggacaagaataacagctatgcttgca 21191979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 21204965 - 21205036
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  21204965 aagtgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctgtgctacaagacaaggataacagctcttcttgca 21205036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 23036569 - 23036676
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg--tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  |||||||||    
T  23036569 aagtgtacaaccactacctcctctactttgtttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatg 23036668  T
Q  441 aatttgaa 448  Q
     |||||||    
T  23036669 gatttgaa 23036676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35401847 - 35401779
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  35401847 aagtgtacaaccactacctccactactatgttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgc 35401779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 35637732 - 35637819
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  35637732 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 35637819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10251024 - 10250970
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10251024 aagtgtacaaccattatctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 10250970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 546
Target Start/End: Original strand, 20867059 - 20867105
Alignment:
Q  500 aaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  20867059 aaggaactcaacgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctct 20867105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 1577905 - 1577852
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  1577905 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 1577852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 22201778 - 22201831
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  22201778 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 22201831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 415
Target Start/End: Original strand, 34255561 - 34255630
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  34255561 tgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 34255630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2834725 - 2834673
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2834725 tgtacaaccactgcctccactactctgttctttgtctctgctacaagacaaga 2834673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 12613856 - 12613908
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  12613856 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttgtgtctctgctacaggacaa 12613908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21895697 - 21895633
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  21895697 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 21895633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Original strand, 30291822 - 30291894
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30291822 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatatgaagaaaactgcttctgaag 30291894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42284666 - 42284594
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  42284666 aagtgtacaaccactacctccactattatgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 42284594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Original strand, 7689235 - 7689282
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7689235 tctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaag 7689282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 19170141 - 19170236
Alignment:
Q  106 aaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||  |||||||||||   ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  19170141 aaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaaagttcatcagaagcaag--ttcatcagaagctttat-atcaccagaagctacagttcatcag 19170236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 397
Target Start/End: Original strand, 20954514 - 20954568
Alignment:
Q  343 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  20954514 caagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtttctctgctacaagacaag 20954568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21984634 - 21984580
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactc-tgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  21984634 aagtgtacaaccactacttccactactcttttttttgtctctgctacaagacaag 21984580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 26702171 - 26702225
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||  ||||||||||||||    
T  26702171 aagtgtacaaccactacctccactacttagtatgtgtctctgctacaagacaaga 26702225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 106
Target Start/End: Original strand, 45070394 - 45070424
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45070394 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 45070424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 46686593 - 46686658
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg--agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  46686593 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 46686658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7309857 - 7309753
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||  ||||||| |||   || ||||||||    
T  7309857 aagtgtacaaccactacctccaatactctg-ttgtgtatctgctacaagacaagaaaaacagttctgcgtgcaacaatgttccttcccaattggaatgaa 7309759  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  7309758 tttgaa 7309753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12284754 - 12284693
Alignment:
Q  79 catctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||| || |||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12284754 catctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 12284693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 18896639 - 18896672
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18896639 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 18896672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22019729 - 22019685
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22019729 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 22019685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Original strand, 22609824 - 22609865
Alignment:
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22609824 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaag 22609865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22655872 - 22655827
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22655872 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 22655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23054414 - 23054373
Alignment:
Q  334 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 375  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23054414 gacatagtacaattgtacaaccactaccttcactactctgtt 23054373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Original strand, 25448243 - 25448276
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25448243 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatc 25448276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 26547943 - 26547988
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26547943 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 26547988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30893130 - 30893049
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  30893130 aagtgtacaaccactatctccactactaagtttgtgtctctactacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 30893049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35040505 - 35040404
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaag 138  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |  || || |||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||| ||  |||||||||||||||    
T  35040505 aggtcttagaagaacaataaagagcaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcatgaagtggtgacgtcatcagaag 35040406  T
Q  139 ca 140  Q
    ||    
T  35040405 ca 35040404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 45070336 - 45070373
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45070336 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 45070373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 52350407 - 52350451
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52350407 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 52350451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2267374 - 2267310
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  2267374 aagcatatgaagaaaactgcttctgaagacatagtgctcctgaagtagtgacgtcattagaagca 2267310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5242141 - 5242113
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5242141 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 5242113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5844316 - 5844288
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5844316 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 5844288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5929574 - 5929534
Alignment:
Q  506 ctcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5929574 ctcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 5929534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11736910 - 11736882
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11736910 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 11736882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11976401 - 11976373
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11976401 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 11976373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23065319 - 23065283
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23065319 aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 23065283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 23359080 - 23359108
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23359080 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 23359108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23927317 - 23927269
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23927317 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaag 23927269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25057028 - 25057000
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25057028 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 25057000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 36536809 - 36536837
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36536809 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 36536837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 44200881 - 44200841
Alignment:
Q  506 ctcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  44200881 ctcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 44200841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Original strand, 45070445 - 45070492
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45070445 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaga-catcagaag 45070492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 214)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 105896 - 106453
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttctgag 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  105896 aagtcaatcaatctcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 105995  T
Q  120 gtaa------------------tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    ||||                  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||    
T  105996 gtaacaaatgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagagcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgat 106095  T
Q  202 cagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  106096 cagtaaattttaaactgaagattcaaatgagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaa 106195  T
Q  301 agcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaca 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  106196 agcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagaca 106295  T
Q  401 acagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggat 494  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  106296 acagctctgcctgtagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggat 106395  T
Q  495 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct-aatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  106396 gatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctctttcac 106453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 34062395 - 34062954
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa--------- 108  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  34062395 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaacgtgcttct 34062494  T
Q  109 ---------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
             |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34062495 gaagctggagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaatt 34062593  T
Q  199 aatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
     ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34062594 gatccgtaaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 34062693  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34062694 ggagaacactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 34062793  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  34062794 gacaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 34062893  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34062894 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttcac 34062954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 34051734 - 34052293
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa--------- 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  34051734 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagtaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttct 34051833  T
Q  109 ---------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
             |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34051834 gaagctggagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaatt 34051932  T
Q  199 aatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
     ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34051933 gatccgtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 34052032  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34052033 ggagaacactgagtacttgtccttcattaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctatttttgtctacgctacaagacaa 34052132  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  34052133 gacaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagttggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 34052232  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34052233 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttcac 34052293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21706448 - 21705901
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  21706448 aatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaagaaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgcc 21706349  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt- 211  Q
           | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||     
T  21706348 tctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattc 21706249  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21706248 aaactgaagattcaaagtagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactgagt 21706149  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21706148 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 21706049  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  21706048 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagg 21705949  T
Q  504 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21705948 aactcaacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 21705901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17447185 - 17446622
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  17447185 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctaaaagtgc 17447086  T
Q  121 --------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg----------------tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 194  Q
            | ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17447085 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 17446986  T
Q  195 aattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtca 293  Q
    | || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17446985 atttgatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtataagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 17446886  T
Q  294 tttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 393  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446885 tttggagaacactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 17446786  T
Q  394 caagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattact 487  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  17446785 caagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattact 17446686  T
Q  488 ggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446685 ggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttcac 17446622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17457801 - 17457238
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  17457801 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctaaaagtgc 17457702  T
Q  121 --------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg----------------tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 194  Q
            | ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||                |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17457701 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctac 17457602  T
Q  195 aattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtca 293  Q
    | || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17457601 atttgatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 17457502  T
Q  294 tttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 393  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17457501 tttggagaacactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtatacgctacaaga 17457402  T
Q  394 caagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattact 487  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  17457401 caagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattact 17457302  T
Q  488 ggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17457301 ggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttcac 17457238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21703584 - 21703054
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt- 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||     
T  21703584 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagaaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagc--tgaagtg 21703487  T
Q  130 catcagaagcagaagac--catcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattca 225  Q
    | || ||||  || |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  21703486 cctctgaagt-gatgacgtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 21703388  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21703387 aagtagctgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactaagtatttgtccttcgtt 21703288  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgtt 423  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||     
T  21703287 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 21703188  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 517  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703187 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 21703088  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21703087 ttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 21703054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 34782649 - 34783191
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  34782649 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctg 34782748  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaact 216  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||    
T  34782749 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaact 34782848  T
Q  217 gaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttg 315  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||    
T  34782849 gaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttg 34782948  T
Q  316 tccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  34782949 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgca 34783047  T
Q  416 gaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc 508  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34783048 gaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttc 34783147  T
Q  509 -aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34783148 aaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 34783191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 37406414 - 37406982
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg------ 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  37406414 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctcaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 37406513  T
Q  112 -----------cttctgaggtaatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
               ||||||| |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||    
T  37406514 aagctggagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcaacatcatc 37406613  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37406614 accagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagg 37406713  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
    ||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37406714 tatcaacggtca-------aacactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtc 37406806  T
Q  382 tacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc--- 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  37406807 tacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaattgttccttcaagatgagaattaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 37406906  T
Q  479 ---aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37406907 caaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgttattcatctcaacgtctctttcac 37406982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 36084249 - 36084796
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgagg--------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |             
T  36084249 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcgtagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctgaagctgaagtgc 36084348  T
Q  121 --------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
            | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  36084349 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 36084448  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36084449 aaactgaatatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 36084548  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36084549 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacatgacaagacaacagctatgc 36084647  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  36084648 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 36084747  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084748 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 36084796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 34771704 - 34772246
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  34771704 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctg 34771803  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaact 216  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||    
T  34771804 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaact 34771903  T
Q  217 gaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttg 315  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||    
T  34771904 gaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttg 34772003  T
Q  316 tccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  34772004 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgca 34772102  T
Q  416 gaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc 508  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34772103 gaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttc 34772202  T
Q  509 -aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  34772203 aaacgactctttagacgtgatgattatctcaacgtctctttcac 34772246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 31 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 24926612 - 24926058
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct------------------aaagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||                  |||||||    
T  24926612 aatttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaattgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagctaaagtgc 24926513  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  24926512 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 24926413  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24926412 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaaaggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 24926313  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  24926312 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacacctatgc 24926214  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  24926213 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 24926114  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactccttta 558  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24926113 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcacaccttta 24926058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 20624527 - 20625099
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa------------- 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20624527 aagtcaatcaatttcaatgggtcttggaagaacaatggagagcaaagaaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgtttctgaag 20624626  T
Q  109 ------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taag---------------gtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
          |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||                ||||||||||||  |||||||||||    
T  20624627 taacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagttcatcagaagcacaatttcatcagaagctatatcatcacc 20624726  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatc 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  20624727 agaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaaaggagcagtttttcgtttcaacctcatctaagagaatgaagaattgaaagggaggtatc 20624826  T
Q  286 aacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacg 385  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20624827 aacggtcatttgaaaggcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtctacg 20624926  T
Q  386 ctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag----- 480  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||         
T  20624927 ctacaagacaagaaaacagctatgcctgcagaaatgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 20625026  T
Q  481 -gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct-aatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20625027 agattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctctttcac 20625099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 22 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21414697 - 21414201
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttctgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  21414697 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 21414598  T
Q  120 gtaa------------------tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagt-----------------aaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
    ||||                  ||||||||||||||||||||| |||||||||||                 ||| |||||||||||   ||||||||||    
T  21414597 gtaacatgtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagtagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaacctatatcatcac 21414498  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21414497 cagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 21414398  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21414397 caacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 21414298  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21414297 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcagg 21414201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 42394786 - 42395311
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  42394786 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 42394885  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  42394886 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 42394985  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  42394986 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 42395085  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||    
T  42395086 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-tctg-ttttgtccacactacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 42395183  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  42395184 caagatggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactcttta 42395283  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42395284 gacgtgctaattatctcaacgtctcttt 42395311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 23406221 - 23406781
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa--------- 108  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  23406221 aggcaaatcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttct 23406320  T
Q  109 ---------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
             |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  23406321 gaagctggagtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgtaatcatcaccagaagcttcaatt 23406420  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
     ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23406421 gattcgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttg 23406520  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  23406521 gatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaat 23406619  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  23406620 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 23406719  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406720 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 23406781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43044157 - 43043596
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43044157 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaactacgtctgaagcttaaagtgcttct 43044058  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43044057 gaagctgaagtgcttctgaaatgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattt 43043958  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43043957 aattcgtatattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 43043858  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43043857 gatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtccacgctacaagacaag 43043758  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||    
T  43043757 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggt 43043658  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43043657 ggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 43043596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 132 - 551
Target Start/End: Original strand, 19477908 - 19478336
Alignment:
Q  132 tcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19477908 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagta 19478007  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19478008 gctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacag 19478107  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttc 428  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | |||    
T  19478108 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttc 19478207  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478208 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 19478307  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19478308 cgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 19478336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 36228527 - 36229074
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgagg--------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |             
T  36228527 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaggaattcgaagcatctgtagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctgaagctgaagtgc 36228626  T
Q  121 --------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
            | |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  36228627 atctgaagtgatgacgccatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattc 36228726  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  36228727 aaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgtaagggaggtatcaacggtcatttggataacactgagt 36228826  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  36228827 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgccacaagacaagacaacagctatgc 36228925  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  36228926 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 36229025  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229026 atttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 36229074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 20797470 - 20798031
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20797470 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttct 20797569  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  20797570 gaagctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaagattttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattt 20797669  T
Q  199 aatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    ||||  || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20797670 aatccatatattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 20797769  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20797770 gatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctgcaagacaag 20797869  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  20797870 acaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 20797969  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20797970 gaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 20798031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 132 - 551
Target Start/End: Original strand, 19463878 - 19464306
Alignment:
Q  132 tcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19463878 tcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttttcatcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagta 19463977  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  19463978 gctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacaa 19464077  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttc 428  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | |||    
T  19464078 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttc 19464177  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464178 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 19464277  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19464278 cgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 19464306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Original strand, 20416681 - 20417230
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  20416681 aagttaatcaatttcaattggttttggaagaacaatagagagcaaagaaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctataaagtgcttctgaa 20416780  T
Q  120 gtaa------------------tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    ||||                  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  20416781 gtaacaagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 20416880  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||  | |||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20416881 cagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttctaatatcgtctaagaaaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 20416980  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20416981 gcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 20417079  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| | |||||||      ||||| |||||||||    
T  20417080 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagagaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatctaaatcaggcaaaagattattggtggatg 20417179  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20417180 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 20417230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 10754284 - 10754828
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  10754284 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgcttc 10754383  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||    
T  10754384 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaa 10754483  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtact 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |    
T  10754484 actgaagatccaaagtagctgtttcttatttcaaccttatctagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatt 10754583  T
Q  314 tgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttg 413  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10754584 tgtcctacgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctg 10754682  T
Q  414 cagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaac 506  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||      
T  10754683 cagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaatgatt 10754782  T
Q  507 tc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10754783 tcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 10754828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 20551603 - 20552150
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct---------------- 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  20551603 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgctcctgaagctgaagtgc 20551702  T
Q  114 -tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  20551703 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagagaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattc 20551802  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20551803 aaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 20551902  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20551903 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 20552001  T
Q  411 ttgcaga-aatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     ||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||| |    
T  20552002 ctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatg 20552101  T
Q  504 aactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20552102 atttcaaacaactctttagacttgctaatcatctcaacgtctctttcac 20552150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24983777 - 24983346
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24983777 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 24983678  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||     
T  24983677 gtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcattaa 24983578  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||| |     
T  24983577 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcc 24983479  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  24983478 ttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctt 24983379  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983378 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 24983346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 8521630 - 8522176
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |              
T  8521630 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 8521729  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  8521730 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 8521829  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |    
T  8521830 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgatca 8521929  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  8521930 tttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 8522028  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  8522029 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtgaatgatcaaatga 8522128  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8522129 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 8522176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1109617 - 1109071
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  1109617 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 1109518  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  1109517 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 1109418  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  1109417 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 1109318  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  1109317 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 1109219  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1109218 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 1109119  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1109118 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 1109071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27623222 - 27622691
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27623222 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 27623123  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  27623122 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27623024  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  27623023 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 27622924  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27622923 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 27622824  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27622823 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 27622724  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27622723 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27622691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 31448456 - 31448889
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31448456 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaa 31448555  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||| ||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||| ||||     
T  31448556 gtagctatttatcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttggttaa 31448655  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  31448656 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgc 31448755  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  31448756 cttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 31448855  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31448856 ttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 31448889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1122375 - 1121829
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |              
T  1122375 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaaccgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 1122276  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  1122275 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 1122176  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  1122175 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaatgtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 1122076  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  1122075 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 1121977  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1121976 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 1121877  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1121876 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 1121829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27603873 - 27603342
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  27603873 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgtcgtc 27603774  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  27603773 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccataagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27603675  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  27603674 tagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 27603575  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27603574 agagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 27603475  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27603474 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 27603375  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27603374 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27603342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 31418565 - 31418998
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  31418565 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtatattcaaactaaagatccaaa 31418664  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| ||  |||||  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||||     
T  31418665 gtagctgtttctcaattcaatattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcattgagcatttgtccttcgttaa 31418764  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  | | |    
T  31418765 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttatgc 31418864  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  31418865 cttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 31418964  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31418965 ttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 31418998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 20562244 - 20562660
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  20562244 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 20562343  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||     
T  20562344 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgttaa 20562443  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||              | |    
T  20562444 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatg--------------cct 20562528  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||| ||  || ||| |||||||    
T  20562529 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactcttt 20562628  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20562629 agacttgctaatcatctcaacgtctctttcac 20562660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30070262 - 30069831
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||| ||||    
T  30070262 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcttcaccagaagctacatttgatccattaatc-aaactgaagatccaaa 30070164  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||      
T  30070163 gtagctggttctcaattcagtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgttga 30070064  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  30070063 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 30069964  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  30069963 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcataggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 30069864  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30069863 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 30069831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 22146326 - 22146857
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  22146326 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgcttctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 22146425  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22146426 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22146524  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  22146525 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22146624  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  22146625 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22146724  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22146725 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22146824  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22146825 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22146857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9335761 - 9336291
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  9335761 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 9335860  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9335861 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9335959  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  9335960 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9336059  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  9336060 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9336159  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  9336160 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 9336259  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9336260 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9336291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9346348 - 9346878
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  9346348 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 9346447  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9346448 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9346546  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  9346547 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9346646  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  9346647 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9346746  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  9346747 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 9346846  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9346847 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9346878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 43622343 - 43621862
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  43622343 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgaagcttaagtgc 43622244  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtt-----------tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||           |||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||    
T  43622243 atctgaagtgataacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattttat 43622144  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt-gaa 299  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  43622143 ccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcagcactatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttgga 43622044  T
Q  300 gagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43622043 tagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagac 43621945  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621944 aacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 43621862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5291031 - 5290500
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||| || || |||||    
T  5291031 atttcaataggtcttagaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaagtgattctgaagtgatcacgtc 5290932  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    || |||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  5290931 attagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5290833  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  5290832 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 5290733  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  5290732 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 5290633  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5290632 ttcaagatggtaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 5290533  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5290532 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5290500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7032583 - 7032050
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  7032583 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 7032484  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||| |||||||||||||    
T  7032483 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaattgaagattcaaag 7032385  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  7032384 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgagagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 7032285  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt---tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgtt 423  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||     
T  7032284 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 7032185  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 516  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  7032184 cgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactc 7032085  T
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7032084 tttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7032050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15993784 - 15993253
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15993784 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 15993685  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  15993684 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15993586  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    || ||| |||||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  15993585 taactgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 15993486  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  15993485 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaatctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15993386  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  15993385 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 15993286  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15993285 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 15993253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 22156909 - 22157440
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  22156909 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 22157008  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  22157009 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22157107  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  22157108 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22157207  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  22157208 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22157307  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  22157308 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 22157407  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22157408 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22157440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 31843764 - 31844295
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  31843764 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 31843863  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  31843864 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31843962  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  31843963 tagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 31844062  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  31844063 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 31844162  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  31844163 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 31844262  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31844263 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 31844295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 39352293 - 39352824
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  39352293 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 39352392  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  39352393 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 39352491  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  39352492 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 39352591  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  39352592 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 39352691  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||    
T  39352692 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaagaatttcaaacgactctt 39352791  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39352792 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39352824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15694486 - 15693956
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  15694486 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 15694387  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  15694386 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15694288  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  15694287 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 15694188  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  15694187 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 15694088  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  15694087 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 15693988  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15693987 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 15693956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24566895 - 24567425
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  24566895 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 24566994  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24566995 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24567093  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  24567094 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24567193  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  24567194 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 24567293  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  24567294 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 24567393  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24567394 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24567425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16004346 - 16003815
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16004346 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 16004247  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16004246 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16004148  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| || |||||||  ||||||      
T  16004147 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgttaat 16004048  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  16004047 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 16003948  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  16003947 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 16003848  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16003847 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 16003815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40400824 - 40401355
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40400824 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 40400923  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  40400924 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40401022  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  |||| |      
T  40401023 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtaaat 40401122  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||  ||| |     
T  40401123 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 40401222  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  40401223 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 40401322  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40401323 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40401355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 129 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 32754302 - 32753875
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa--actgaagattcaa 226  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |  ||||||| |||||    
T  32754302 tcatcagaagca-aagtccatcagaagcaacatttcatcagaagctgtatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattttataactgaagtttcaa 32754204  T
Q  227 agtagctgttttt--cgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgt 323  Q
    || ||||||||||  ||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  | || ||||||| |    
T  32754203 aggagctgtttttttcgttttatcctcgtctgagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatgctcgtccttcat 32754105  T
Q  324 tatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgtt 423  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32754104 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaaatgtt 32754006  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 517  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||      ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32754005 ccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggaaaaagattaatggtagatgatcaaaggaactcaacgactct 32753906  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32753905 ttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 32753875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6130594 - 6131125
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  6130594 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 6130693  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  6130694 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 6130792  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  6130793 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 6130892  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  6130893 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 6130992  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  6130993 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 6131092  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6131093 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6131125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9377917 - 9377386
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  9377917 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 9377818  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  9377817 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9377719  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  9377718 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9377619  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9377618 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9377519  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9377518 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 9377419  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9377418 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9377386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 23306650 - 23307181
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  23306650 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 23306749  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  23306750 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23306848  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  23306849 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 23306948  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  23306949 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23307048  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  23307049 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 23307148  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23307149 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23307181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24817341 - 24816810
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaa-aggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  24817341 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaatagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 24817242  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24817241 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24817143  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  24817142 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24817043  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  24817042 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24816943  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  24816942 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 24816843  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24816842 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24816810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24827929 - 24827398
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  24827929 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 24827830  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  24827829 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24827731  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  24827730 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24827631  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  24827630 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24827531  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  24827530 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 24827431  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24827430 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24827398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40390162 - 40390693
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40390162 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 40390261  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  40390262 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40390360  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  || |  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| || | |||||  |||| |      
T  40390361 tagctgattctcaatttagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcaattgtctctcgtaaat 40390460  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaat-gttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| | || |     
T  40390461 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 40390560  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  40390561 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 40390660  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40390661 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40390693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 24807718 - 24808248
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  24807718 atttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 24807817  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  24807818 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactcaagattcaaag 24807916  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  24807917 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24808016  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  24808017 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 24808116  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  24808117 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 24808216  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24808217 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 24808248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30227952 - 30227422
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  30227952 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 30227853  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  30227852 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30227754  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| ||  ||||||  ||||||      
T  30227753 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 30227654  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  30227653 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 30227554  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  30227553 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 30227454  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30227453 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 30227422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30238479 - 30237949
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  30238479 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 30238380  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  30238379 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30238281  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| ||  ||||||  ||||||      
T  30238280 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 30238181  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  30238180 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 30238081  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  30238080 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 30237981  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30237980 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 30237949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 42042590 - 42043120
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  42042590 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 42042689  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  42042690 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 42042788  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| ||  ||||||  ||||||      
T  42042789 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 42042888  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  42042889 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 42042988  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  42042989 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 42043088  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42043089 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 42043120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 42053165 - 42053695
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  42053165 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 42053264  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  42053265 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 42053363  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||| ||  ||||||  ||||||      
T  42053364 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 42053463  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  42053464 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 42053563  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  42053564 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 42053663  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  42053664 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 42053695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14558473 - 14557941
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  14558473 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 14558374  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  14558373 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 14558275  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  14558274 gtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 14558175  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  14558174 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 14558075  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  14558074 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 14557975  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14557974 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14557941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14569110 - 14568578
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  14569110 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 14569011  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  14569010 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 14568912  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  14568911 gtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 14568812  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  14568811 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 14568712  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  14568711 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 14568612  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14568611 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14568578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 23296082 - 23296613
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  23296082 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 23296181  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  23296182 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23296280  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  23296281 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 23296380  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  23296381 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23296480  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  23296481 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 23296580  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23296581 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23296613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 23361915 - 23362447
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  23361915 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 23362014  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  23362015 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23362113  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  23362114 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 23362213  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||||     
T  23362214 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 23362313  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  23362314 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 23362413  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23362414 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23362447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 27459966 - 27460497
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  27459966 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 27460065  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  27460066 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27460164  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  27460165 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 27460264  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27460265 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27460364  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  27460365 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 27460464  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27460465 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27460497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 27470365 - 27470896
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  27470365 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 27470464  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  27470465 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27470563  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  27470564 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 27470663  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  27470664 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27470763  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  27470764 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 27470863  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27470864 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27470896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6986102 - 6986634
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  6986102 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 6986201  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||| |||    
T  6986202 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaa 6986300  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    ||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  6986301 gtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 6986400  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  6986401 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 6986500  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  6986501 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 6986600  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6986601 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6986634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 14029848 - 14030380
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  14029848 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 14029947  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  14029948 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 14030046  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  14030047 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 14030146  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  14030147 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 14030246  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  14030247 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 14030346  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14030347 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14030380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 14040401 - 14040933
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  14040401 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 14040500  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  14040501 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 14040599  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  14040600 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 14040699  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  14040700 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 14040799  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  14040800 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 14040899  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14040900 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14040933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39502594 - 39502064
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  39502594 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 39502495  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |     ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  39502494 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagt 39502396  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  |    
T  39502395 tgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaata 39502296  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctt 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |      
T  39502295 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacac 39502196  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  39502195 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 39502096  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39502095 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39502064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 88 - 551
Target Start/End: Original strand, 23707305 - 23707778
Alignment:
Q  88 aaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | |||||||||||   ||||| |||||    
T  23707305 aaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcacc 23707404  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23707405 agaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtat 23707503  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtcta 383  Q
    ||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23707504 caacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcta 23707603  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc----- 478  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||         
T  23707604 cgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggca 23707703  T
Q  479 -aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23707704 aaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 23707778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 27203615 - 27204129
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  27203615 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 27203714  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    |||||||||| |||                ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  27203715 atcagaagcaaaagt---------------tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagta 27203798  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||  ||    
T  27203799 gctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatag 27203898  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  |    
T  27203899 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacact 27203998  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  27203999 caagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttta 27204098  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||    
T  27204099 gacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 27204129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 35215310 - 35215842
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  35215310 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 35215409  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  | |||||||||||||||    
T  35215410 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-atactgaagattcaaag 35215508  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    | |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  35215509 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 35215608  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  35215609 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 35215708  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  35215709 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 35215808  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35215809 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 35215842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 163 - 551
Target Start/End: Original strand, 22559376 - 22559773
Alignment:
Q  163 tcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaaga 261  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||  ||| || | |||||    
T  22559376 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaaga 22559474  T
Q  262 acgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22559475 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggttagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 22559574  T
Q  362 tccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 459  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22559575 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttc 22559674  T
Q  460 aaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22559675 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22559773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36582921 - 36582482
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaag 220  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||    
T  36582921 atgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaag 36582823  T
Q  221 attcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcct 319  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || || | ||||||||  |||||||      
T  36582822 attcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgaccacttgtctc 36582723  T
Q  320 tcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa 418  Q
    || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  36582722 tcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa 36582623  T
Q  419 -atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aa 510  Q
      |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||    
T  36582622 tttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaa 36582523  T
Q  511 cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36582522 cgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36582482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36593476 - 36593037
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaag 220  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||    
T  36593476 atgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaag 36593378  T
Q  221 attcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcct 319  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || || | ||||||||  |||||||      
T  36593377 attcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgaccacttgtctc 36593278  T
Q  320 tcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa 418  Q
    || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  36593277 tcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa 36593178  T
Q  419 -atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aa 510  Q
      |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||    
T  36593177 tttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaa 36593078  T
Q  511 cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36593077 cgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36593037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 5301590 - 5301071
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  5301590 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 5301491  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagta 230  Q
    ||||||||||            |||   | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||||    
T  5301490 atcagaagca------------aag---gttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagta 5301407  T
Q  231 gctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcag 329  Q
    |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||||   ||||||  ||    
T  5301406 gctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtttctcgttaatag 5301307  T
Q  330 aattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaa-----cagctctgcttgcagaaat-gt 422  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||  |||  |||||| | ||    
T  5301306 agctgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaagacaacagccatgccagcagaagttgt 5301207  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  5301206 acgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgact 5301107  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5301106 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 5301071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 418
Target Start/End: Original strand, 39362119 - 39362509
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39362119 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaagtgcttctgaagtgatgacgtc 39362218  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  39362219 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcccttaatc-aaactgaagattcaaag 39362317  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  39362318 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 39362417  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa 418  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  39362418 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaa 39362509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 23392474 - 23392898
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaa--------- 108  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  23392474 aggcaaatcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgcttct 23392573  T
Q  109 ---------gtgcttctgaggtaatgacgtcatcag-----------------aagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcat 181  Q
             |||| ||||| || |||||||||||||                 |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||    
T  23392574 gaagctggagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgtaatcat 23392673  T
Q  182 caccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    ||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23392674 caccagaagtttcaattgattcgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggag 23392773  T
Q  281 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23392774 gtatcaaaggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgt 23392872  T
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagct 406  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  23392873 ccacgctacaagacaagacaacagct 23392898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 6975710 - 6976144
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  6975710 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 6975808  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    ||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  6975809 aagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 6975908  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  6975909 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 6976008  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  6976009 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 6976108  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6976109 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6976144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39491387 - 39490874
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  39491387 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 39491288  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||              ||   ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  39491287 catcagaagcagaa--------------ag---tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagt 39491206  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||  |    
T  39491205 tgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaata 39491106  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctt 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |      
T  39491105 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacac 39491006  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  39491005 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 39490906  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39490905 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39490874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 549
Target Start/End: Original strand, 23372316 - 23372848
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  23372316 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 23372415  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | || | |||||||||||||||||    
T  23372416 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 23372514  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  23372515 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 23372614  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaa-ccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaa---tgt 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||| | || |||   |||    
T  23372615 agagttgacaaagtacaagtgtacaacccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagaaaaaacaacagccatgcct-caaaaattttgt 23372713  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||      ||||  |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  23372714 tcactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaaggactacccccaaatcaggcaaaggaacactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 23372813  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  23372814 tctttagacgggctgattatctcaacgtctctttc 23372848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 22675903 - 22676452
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  22675903 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 22676002  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  22676003 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 22676102  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||     
T  22676103 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaa 22676201  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
      ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  22676202 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 22676301  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  22676302 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22676401  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22676402 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22676452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 22685909 - 22686343
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  22685909 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 22686007  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||   ||||||  |||||    
T  22686008 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgtt 22686107  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  22686108 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 22686207  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  22686208 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 22686307  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22686308 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 22686343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 15739869 - 15740304
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  15739869 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 15739967  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  15739968 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 15740067  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  15740068 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 15740167  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  15740168 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 15740267  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15740268 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 15740304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 15769029 - 15769464
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  15769029 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattca 15769127  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || ||    
T  15769128 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 15769227  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  15769228 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 15769327  T
Q  423 tc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgac 514  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  15769328 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgac 15769427  T
Q  515 tctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15769428 tctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 15769464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27042685 - 27042136
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  27042685 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 27042586  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |     
T  27042585 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc 27042486  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  27042485 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27042387  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
     |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  27042386 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27042287  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    || |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  27042286 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27042187  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27042186 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27042136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 35225877 - 35226426
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  35225877 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 35225976  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||      
T  35225977 atcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc- 35226075  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  35226076 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagc 35226175  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  35226176 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 35226275  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  35226276 cctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 35226375  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35226376 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 35226426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40514463 - 40513913
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  40514463 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 40514364  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--------------------ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||                    | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||     
T  40514363 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc 40514264  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | |||||||    
T  40514263 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgag 40514165  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
     |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  40514164 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40514065  T
Q  409 gcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    || |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  40514064 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 40513965  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40513964 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40513913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14447323 - 14446923
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatca-gtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-ga 258  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  ||||  | |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||    
T  14447323 tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctgtaa--tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaaga 14447226  T
Q  259 agaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccact 358  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14447225 agaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccact 14447126  T
Q  359 acctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  14447125 acctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 14447026  T
Q  456 cttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14447025 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14446926  T
Q  549 cac 551  Q
    |||    
T  14446925 cac 14446923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 14457935 - 14457535
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatca-gtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-ga 258  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  ||||  | |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||    
T  14457935 tttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctgtaa--tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaaga 14457838  T
Q  259 agaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccact 358  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14457837 agaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccact 14457738  T
Q  359 acctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  14457737 acctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 14457638  T
Q  456 cttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14457637 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14457538  T
Q  549 cac 551  Q
    |||    
T  14457537 cac 14457535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27053310 - 27052760
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  27053310 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 27053211  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagta-------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatt 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |                   || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | | |     
T  27053210 catcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc 27053111  T
Q  211 taaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||    
T  27053110 -aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcattcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27053012  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgt-acaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctc 407  Q
     |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||      
T  27053011 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgttacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 27052912  T
Q  408 tgcttgcagaaat-gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaa 500  Q
    ||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||    
T  27052911 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 27052812  T
Q  501 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27052811 aggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 27052760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 17607093 - 17607397
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17607093 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 17607192  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  17607193 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 17607292  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17607293 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 17607392  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  17607393 ttcac 17607397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 17617707 - 17618011
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17617707 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 17617806  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  17617807 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 17617906  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17617907 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 17618006  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  17618007 ttcac 17618011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 31348567 - 31348871
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31348567 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 31348666  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  31348667 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 31348766  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31348767 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 31348866  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  31348867 ttcac 31348871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 31359181 - 31359485
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31359181 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 31359280  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  31359281 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 31359380  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31359381 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 31359480  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  31359481 ttcac 31359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 36687728 - 36688032
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36687728 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 36687827  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  36687828 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 36687927  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36687928 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 36688027  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  36688028 ttcac 36688032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Original strand, 36698294 - 36698598
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36698294 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 36698393  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  36698394 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttta 36698493  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    | |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36698494 tccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 36698593  T
Q  547 ttcac 551  Q
    |||||    
T  36698594 ttcac 36698598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 33952124 - 33951724
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  33952124 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 33952026  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33952025 gaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 33951926  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33951925 cctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcccgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 33951826  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33951825 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 33951726  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  33951725 ac 33951724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 385
Target Start/End: Original strand, 31814968 - 31815325
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  31814968 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 31815067  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  31815068 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31815166  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    ||| || || ||  ||||  | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  31815167 tagttgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 31815266  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacg 385  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31815267 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacg 31815325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Original strand, 17718905 - 17719255
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  |     
T  17718905 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgc 17719004  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  17719005 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 17719104  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  17719105 cctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17719204  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17719205 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17719255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Original strand, 17729557 - 17729907
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  |     
T  17729557 aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgc 17729656  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  17729657 acttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 17729756  T
Q  410 cttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaa 501  Q
    | |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| ||||||    
T  17729757 cctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17729856  T
Q  502 ggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17729857 ggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 17729907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37729480 - 37729176
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37729480 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 37729381  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagcta 452  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |     
T  37729380 actacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttt 37729281  T
Q  453 attcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctc 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37729280 attcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatc-tctcaacgtctc 37729182  T
Q  546 tttcac 551  Q
    ||||||    
T  37729181 tttcac 37729176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 37740796 - 37740492
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37740796 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 37740697  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagcta 452  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |     
T  37740696 actacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttt 37740597  T
Q  453 attcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctc 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37740596 attcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatc-tctcaacgtctc 37740498  T
Q  546 tttcac 551  Q
    ||||||    
T  37740497 tttcac 37740492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 285 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13534009 - 13533743
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| || ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||  |    
T  13534009 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctc 13533911  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||        
T  13533910 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaa 13533811  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  13533810 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgcttaagatcgcaacgtctct 13533743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 285 - 546
Target Start/End: Original strand, 20168127 - 20168393
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |    
T  20168127 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctc 20168225  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||        
T  20168226 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccctcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaa 20168325  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20168326 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 20168393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13523582 - 13523016
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  13523582 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaacctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgtttctgaa 13523483  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagacca----------------tcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
         |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||                ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  13523482 gttacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcttcagaagaaagatttcatcagaagctatatcatcacc 13523383  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgt-ttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    ||||| |||| || ||||| | ||| || |||||   |||||  || ||| | ||    | |||||||||||  ||| ||||| ||  ||| ||| ||      
T  13523382 agaagatacagttgatcagaagattcaatctgaaatctcaaaagagttgtctcttgaagttaaccttgtctaagagagcgaaggatcaaaagggaagtgc 13523283  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||  |||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||  |    
T  13523282 caacgttcatttgaaaagtactgggtgattgtccctcatta-aagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctc 13523184  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||        
T  13523183 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatctttcataggactacacccaaatcaggcaa 13523084  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13523083 aagattattggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 13523016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 21519837 - 21520091
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  21519837 gcaagtcaagtaatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctggagtgcttctgaa 21519936  T
Q  120 gtaatgacgtcatcagaagcagaa-----------------gaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    || |||||||||||||||||||||                 |  ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  21519937 gtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgat 21520036  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta 256  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21520037 ccgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtcta 21520091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 35543235 - 35543455
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  35543235 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcgacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 35543334  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    ||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35543335 atatgaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattacttgtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 35543434  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  35543435 gctaaagatctcaacgtctct 35543455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 546
Target Start/End: Original strand, 36095556 - 36095978
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||| || |||||   |||||    
T  36095556 gtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccggaagctacagttgatcagaagattcaatctgaaatctcaaa 36095654  T
Q  228 gtagctgtttttcgtt-tcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
      |||||| | | |   | ||||| |||||  ||| ||||  || |||| |||| |  ||||| || |||||| ||||||| || |||||||||  ||      
T  36095655 agagctgtctcttgaagttaacctcgtctaagagagcgaaagatcgaaagggagttgccaacgttcttttgaaaagcactgcgtgcttgtcctttattga 36095754  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |    
T  36095755 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaattgttcct 36095853  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttta 520  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  36095854 tcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctcaacgaatcttta 36095952  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  36095953 gacgtgcttaagatctcaacgtctct 36095978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 546
Target Start/End: Original strand, 36097013 - 36097435
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||| || |||||   |||||    
T  36097013 gtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccggaagctacagttgatcagaagattcaatctgaaatctcaaa 36097111  T
Q  228 gtagctgtttttcgtt-tcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
      |||||| | | |   | ||||| |||||  ||| ||||  || |||| |||| |  ||||| || |||||| ||||||| || |||||||||  ||      
T  36097112 agagctgtctcttgaagttaacctcgtctaagagagcgaaagatcgaaagggagttgccaacgttcttttgaaaagcactgcgtgcttgtcctttattga 36097211  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |    
T  36097212 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaattgttcct 36097310  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttta 520  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  36097311 tcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctcaacgaatcttta 36097409  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  36097410 gacgtgcttaagatctcaacgtctct 36097435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 21517504 - 21517641
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  21517504 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaatgaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctggagtgcttctgaa 21517603  T
Q  120 gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta 157  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21517604 gtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagta 21517641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 333 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 40228705 - 40228557
Alignment:
Q  333 tgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaaga 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40228705 tgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaaga 40228606  T
Q  433 tgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  40228605 taggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 40228557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 13405209 - 13405014
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  13405209 caacgttcattagaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctac 13405111  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||  | || |||||  |||| ||| ||||||||||    
T  13405110 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcattggacaacatccaaatcagg 13405014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 345 - 481
Target Start/End: Original strand, 40032869 - 40033005
Alignment:
Q  345 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatt 444  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  40032869 agtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcttgcagaaatgttccttcaagataggaatggatt 40032968  T
Q  445 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  40032969 tgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 40033005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 381 - 551
Target Start/End: Original strand, 31833639 - 31833817
Alignment:
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaat-gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc- 478  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31833639 ctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatca 31833738  T
Q  479 -----aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
         ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31833739 ggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 31833817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1915465 - 1915315
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  1915465 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacaactctgcctgcagaaatgttccttcaa 1915366  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1915365 gataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 1915315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 11208087 - 11208225
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| |    
T  11208087 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaaaataagaatgga 11208186  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  11208187 tttgaacttaattcttcataggacaacatccaaatcagg 11208225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 426 - 551
Target Start/End: Original strand, 39364685 - 39364817
Alignment:
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  39364685 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 39364784  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39364785 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 39364817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 20215205 - 20215356
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20215205 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 20215304  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20215305 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 20215356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23478417 - 23478266
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  23478417 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaaatgttccttca 23478318  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  23478317 agataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacaaccaaatcagg 23478266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13534309 - 13534225
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13534309 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 13534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 19463730 - 19463830
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19463730 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattctatgcatctgaagaaaactgcatctgaagctatagtgcttctg 19463829  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  19463830 a 19463830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 19477760 - 19477860
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19477760 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattctatgcatctgaagaaaactgcatctgaagctatagtgcttctg 19477859  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  19477860 a 19477860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 25111967 - 25112118
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25111967 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 25112066  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  25112067 taataggaatggatttgaatgtgatccttcataagacaacaaccaaatcagg 25112118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 25171058 - 25171209
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25171058 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 25171157  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  25171158 taataggaatggatttgaatgtgatccttcataagacaacaaccaaatcagg 25171209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 35542879 - 35542956
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35542879 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 35542956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32754446 - 32754348
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  32754446 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaaacatctgaagaaaactgcatctgaagttatgaagtgcttctga 32754348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 31418420 - 31418508
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31418420 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagcta 31418508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 31448311 - 31448399
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448311 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaaaaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 31448399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 20562111 - 20562194
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20562111 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactacgtctgaagcttaaagtgct 20562194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24983910 - 24983836
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983910 aatttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 24983836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 32160801 - 32160663
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||  | |  || |||||| |    
T  32160801 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcccttagaataggaatgga 32160702  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32160701 tttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 32160663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 15739701 - 15739813
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  15739701 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 15739800  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  15739801 atcagaagcagaa 15739813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 15768861 - 15768973
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  15768861 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 15768960  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  15768961 atcagaagcagaa 15768973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 23707193 - 23707305
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  23707193 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 23707292  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  23707293 atcagaagcagaa 23707305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4887057 - 4886952
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||  |    
T  4887057 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaataca 4886958  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  4886957 tttgaa 4886952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20550930 - 20550876
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20550930 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 20550876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33933302 - 33933248
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33933302 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 33933248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15517004 - 15516900
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||| |    
T  15517004 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgca 15516906  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  15516905 tttgaa 15516900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30070408 - 30070307
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  30070408 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttagaagaacaatgaaaagcaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagctagagtgctcct 30070309  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  30070308 ga 30070307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 7745795 - 7745867
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  7745795 aagtgtacaaccactacctccactactcggtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7745867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10848808 - 10848736
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  10848808 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 10848736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28139642 - 28139570
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  28139642 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 28139570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Original strand, 22685801 - 22685907
Alignment:
Q  39 taggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||    
T  22685801 taggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcaga 22685900  T
Q  137 agcagaa 143  Q
    |||||||    
T  22685901 agcagaa 22685907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 429
Target Start/End: Original strand, 30115942 - 30116025
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  30115942 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttca 30116025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9089004 - 9088950
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9089004 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 14086641 - 14086695
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14086641 aagtgtacaaccgctacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 14086695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33022699 - 33022645
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  33022699 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 33022645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 89524 - 89629
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||   | ||||||||    
T  89524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcatcaatgttccttcatacttggaatgaa 89623  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  89624 tttgaa 89629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26765533 - 26765429
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||| |    
T  26765533 aagtgtacaaccactgcctccactactctg-ttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgca 26765435  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  26765434 tttgaa 26765429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26784389 - 26784284
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||| | || | |||||||| |    
T  26784389 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtgtctgctacaagacaagaataacaactctgcctgcaaaaatgttcctacatgctgggaatgga 26784290  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  26784289 tttgaa 26784284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 35932108 - 35932161
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35932108 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 35932161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14447490 - 14447403
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  14447490 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 14447403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14458102 - 14458015
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  14458102 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 14458015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33952291 - 33952204
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  33952291 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 33952204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11993923 - 11993869
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11993923 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaaaacaaga 11993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 13545614 - 13545668
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  13545614 aagtgtacaaccaccacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 13545668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 29138508 - 29138562
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  29138508 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaaga 29138562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30743015 - 30742962
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  30743015 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 30742962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31117912 - 31117858
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31117912 aagtgtacatccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 31117858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42243715 - 42243662
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  42243715 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 42243662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 23691679 - 23691789
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa---tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||   |  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  23691679 atttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagaaaaagaaaattttgaa-catctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagaaatgacg 23691777  T
Q  129 tcatcagaagca 140  Q
    |||||| |||||    
T  23691778 tcatcaaaagca 23691789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 551
Target Start/End: Original strand, 23696988 - 23697120
Alignment:
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaa-ggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaa-ctcaacgactctt 518  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||||||||||      || |||||||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  23696988 tcaagatgggaaggaatttgaaggtttttctttaaaaggactccacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattcaaaacgactctt 23697087  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  23697088 tagacgtgctgattatttcaacgtctctttcac 23697120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26759184 - 26759080
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||| ||||  || |||||| |    
T  26759184 aagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatattccttcataataggaatgca 26759086  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  26759085 tttgaa 26759080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 36095398 - 36095447
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36095398 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 36095447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 36096855 - 36096904
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36096855 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 36096904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Original strand, 25930261 - 25930325
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  25930261 tgtacaaccactatctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgc 25930325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 35986334 - 35986406
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  35986334 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 35986406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 19536403 - 19536486
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  19536403 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttctt 19536486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 41566536 - 41566603
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  41566536 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgc 41566603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 3245543 - 3245597
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3245543 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctactacaagacaaga 3245597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Original strand, 21099806 - 21099892
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| || |||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  21099806 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaggataacaactatgcttgcaacaatgttccttca 21099892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 25096928 - 25096981
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  25096928 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaaga 25096981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 25154898 - 25154951
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  25154898 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaaga 25154951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Original strand, 28464441 - 28464527
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  28464441 aagtgtacaaccactatctctactactctgtttttgtctctactataagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttca 28464527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30070310 - 30070264
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30070310 ctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaag 30070264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21660247 - 21660194
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  21660247 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 21660194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28139886 - 28139825
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||    
T  28139886 aagcatctgaagaaaactgctcctgaagataaactgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 28139825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 35543050 - 35543107
Alignment:
Q  147 catcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35543050 catcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 35543107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 9398836 - 9398908
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  9398836 aagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 9398908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13534204 - 13534156
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13534204 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaag 13534156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 17606877 - 17606957
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  17606877 ataggtcctggaagaacaatggaaagaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 17606957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21910591 - 21910539
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  21910591 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaa 21910539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 23413076 - 23413128
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  23413076 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaa 23413128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36582996 - 36582924
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  36582996 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaag 36582924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36593551 - 36593479
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  36593551 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaag 36593479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17815002 - 17814931
Alignment:
Q  345 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  17815002 agtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaaggcaaggataacagctctgcctgca 17814931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Original strand, 20167950 - 20168031
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaag 190  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20167950 aagtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaag-tcatcagaagcaaag-ttcatcagaagctatatcatcaccagaag 20168031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 40229054 - 40229004
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40229054 aagttaatcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 40229004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6499274 - 6499220
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  6499274 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 6499220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 6975612 - 6975677
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg--agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  6975612 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 6975677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 12352897 - 12352951
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  12352897 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 12352951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16607552 - 16607518
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16607552 agtacaagtgtacaaccactatctccactactctg 16607518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23881102 - 23881048
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||    
T  23881102 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaaga 23881048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 517 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43621853 - 43621819
Alignment:
Q  517 tttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43621853 tttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 43621819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13405475 - 13405431
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13405475 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 13405431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 17718695 - 17718776
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  17718695 ataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 17718776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 17729347 - 17729428
Alignment:
Q  38 ataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  17729347 ataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgctcctga 17729428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 23391705 - 23391778
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23391705 aagtgtacaatcactatctgcactactctgttttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 23391778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23488481 - 23488412
Alignment:
Q  412 tgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  23488481 tgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 23488412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Original strand, 26119922 - 26119959
Alignment:
Q  334 gacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26119922 gacatagtacaattgtacaaccactacctccactactc 26119959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33023014 - 33022981
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33023014 aggtcttggaagaacaatcgagagcaaaggaatc 33022981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33933669 - 33933636
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33933669 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatc 33933636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Original strand, 35542977 - 35543041
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||    
T  35542977 aagtgcctctgaagttatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaag-ttcatcagaag 35543041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Original strand, 36096925 - 36096969
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36096925 aagcatatgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 36096969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 36687553 - 36687610
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36687553 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagccatcagaag 36687610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 36698119 - 36698176
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36698119 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagccatcagaag 36698176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1915781 - 1915745
Alignment:
Q  37 aataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1915781 aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 1915745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4887321 - 4887257
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| ||||||||||||||   || ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  4887321 aagcgtctgaagaaaactgttcctaaagataaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 4887257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 21072342 - 21072394
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  21072342 aagtgtacaaccactatctctactactcagtttgtgtctctgctacaagacaa 21072394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24588561 - 24588533
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588561 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 24588533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 36095520 - 36095556
Alignment:
Q  108 agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36095520 agtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaag 36095556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 36096977 - 36097013
Alignment:
Q  108 agtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36096977 agtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaag 36097013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 161)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18158846 - 18158287
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18158846 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggactttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 18158747  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttc-atcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatta 199  Q
    | |                 | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| ||     
T  18158746 aagctgaagtgctcatgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagaaaggtttttatcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttg 18158647  T
Q  200 atcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18158646 atcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagatgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 18158547  T
Q  298 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18158546 gagagaactgagtacttgtccttcgttaacggagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccactctacaagacaag 18158447  T
Q  398 acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtg 491  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  18158446 acaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 18158347  T
Q  492 gatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18158346 gatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 18158287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 40212845 - 40213418
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg--- 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  40212845 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagctaaagtgctt 40212944  T
Q  112 --------------cttctgaggtaa-tgacgtcatcagaagcagaaga-----------ccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcacc 185  Q
                  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||            |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  40212945 ctgaagcttgagtgcttctgaagtaaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgaaatcatcacc 40213044  T
Q  186 agaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctag-aagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40213045 agaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtat 40213144  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40213145 caacggccgtttgaagagcactgcgtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtcta 40213244  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg-- 481  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40213245 cactacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggca 40213344  T
Q  482 ----attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40213345 aagaattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacctgctaatcatctcaacgtctctttcac 40213418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18154326 - 18153768
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154326 aggcaagtcaagtaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatttaaa-catctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 18154228  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatca-----------------gaagtaaggtttc--atcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  |||||                 |||| |||||||   ||||||||  | |||||||||||||| |||| ||    
T  18154227 aagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcataagcagaaggtcatcagaagcaaggttttttatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacattt 18154128  T
Q  199 aatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18154127 gatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 18154028  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18154027 ggagagcactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 18153928  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggt 490  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  18153927 gacaacagctatgcctgca-aattgttccttcaagataggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 18153829  T
Q  491 ggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153828 ggatgatcaaaggaactcaacaactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 18153768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 3844101 - 3843560
Alignment:
Q  30 caatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------------aag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                    |||    
T  3844101 caatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaagtaacaag 3844002  T
Q  110 tgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaat 209  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3844001 tgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaat 3843902  T
Q  210 ttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3843901 ttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactggg 3843802  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    | |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3843801 tgcttgtccttcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 3843703  T
Q  410 cttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaagg 503  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  3843702 cctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 3843603  T
Q  504 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3843602 aactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 3843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 18768809 - 18769386
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768809 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 18768908  T
Q  117 gagg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taagg----------------tttcatcagaagtgatatcat 181  Q
    || |                 | ||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||                |||||||||||| || |||||    
T  18768909 gaagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcat 18769008  T
Q  182 caccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  18769009 caccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtcttagaagaacgaagaattgacagggag 18769108  T
Q  281 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769109 gtatcaacggtcatttgaagaacactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 18769208  T
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc- 478  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18769209 ccacgctacaagataagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 18769308  T
Q  479 -----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18769309 ggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 18769386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 23469148 - 23469710
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23469148 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatttgaagaaaactgtgtctgaagcttaaagtgcttct 23469247  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||                  || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  23469248 gaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttgtcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattt 23469347  T
Q  199 aatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23469348 aatccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggtcattt 23469447  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    | | ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23469448 ggatagcactgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaa 23469547  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactgg 489  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||    
T  23469548 gacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactgg 23469647  T
Q  490 tggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469648 tgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 23469710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16747608 - 16747033
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747608 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 16747509  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagc-----------------agaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | |||||||||||||||||                 |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16747508 aagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaactcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagtgaaatcatc 16747409  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16747408 accagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagg 16747309  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16747308 tatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtc 16747210  T
Q  382 tacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc-- 478  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  16747209 cacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcag 16747110  T
Q  479 ----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747109 gcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 16747033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 22 - 548
Target Start/End: Original strand, 20259311 - 20259862
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  20259311 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 20259410  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  20259411 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgat 20259510  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20259511 tagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 20259610  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| ||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20259611 gcactgggtgcttgtccttcatt-gaagagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaa 20259709  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||| ||||| |||    
T  20259710 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaattcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatg 20259809  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20259810 atcaaaggaaatcaacgactttttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 20259862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 22 - 548
Target Start/End: Original strand, 21045941 - 21046492
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  21045941 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 21046040  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  21046041 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgat 21046140  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaaga 301  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21046141 tagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaa 21046240  T
Q  302 gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa 401  Q
    |||||| || |||||||||| ||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21046241 gcactgggtgcttgtccttcatt-gaagagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaa 21046339  T
Q  402 cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||| ||||| |||    
T  21046340 cagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatgaattcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatg 21046439  T
Q  496 atcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21046440 atcaaaggaaatcaacgactttttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 21046492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19429507 - 19428958
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  19429507 aatttcaataggtcttagaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtactcctgaagctgaagtgc 19429408  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  19429407 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattc 19429308  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19429307 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagt 19429208  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    | || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19429207 atttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatg 19429108  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||    
T  19429107 cctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaag 19429008  T
Q  503 ga-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19429007 gattccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 19428958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19418930 - 19418383
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  19418930 aatttcaataggtcttagaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtactcctgaagctgaagtgc 19418831  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt 211  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  19418830 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattc 19418731  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19418730 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagt 19418631  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  19418630 atttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagccatgc 19418532  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||    
T  19418531 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagg 19418432  T
Q  504 a-actcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418431 attccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 19418383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 97 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19225428 - 19224965
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19225428 tctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 19225329  T
Q  196 attaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat 294  Q
     ||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19225328 tttaatccatatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 19225229  T
Q  295 ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 394  Q
    ||| | ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19225228 ttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagac 19225130  T
Q  395 aagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattact 487  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||    
T  19225129 aagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggacaacacccaaatcaggcaaaggattact 19225030  T
Q  488 ggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225029 ggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 19224965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 534
Target Start/End: Original strand, 23456992 - 23457536
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23456992 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatttgaagaaaactgtgtctgaagcttaaagtgcttct 23457091  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagta------------------aggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaatt 198  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||                  || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  23457092 gaagtgatgacgttatcagaagcagaagctcatcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttgtcatcataagcgatatcatcaccagaagctacattt 23457191  T
Q  199 aatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23457192 aatccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggtcattt 23457291  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    | | ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23457292 ggatagcactgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaa 23457390  T
Q  397 gacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactgg 489  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||    
T  23457391 gacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactgg 23457490  T
Q  490 tggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 534  Q
    || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23457491 tgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcat 23457536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 30314399 - 30314945
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |              
T  30314399 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcttctgaagctgaagtgca 30314498  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  30314499 tctgaagtgatgacgtcaacagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 30314598  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| || || |    
T  30314599 aactgaagattcaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatttggatagcgcttagca 30314698  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||     
T  30314699 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcc 30314797  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30314798 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 30314897  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30314898 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 30314945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31215477 - 31215046
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  31215477 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccataaattcaaactgaagatccaaa 31215378  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||     
T  31215377 gtagctgtttctcttttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaactgtcatttgat-agcactgagcatttgtccttcattaa 31215279  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  | | |     
T  31215278 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctataagacaagacaacagctatgcctgcataatttatgcc 31215179  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||| ||  || ||| ||||||    
T  31215178 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaagatttcaaacaactctt 31215079  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31215078 tagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 31215046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 20160932 - 20161478
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  20160932 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 20161031  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  20161032 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 20161131  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  20161132 aactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 20161231  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  20161232 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 20161330  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20161331 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 20161430  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20161431 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 20161478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20196535 - 20195989
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  20196535 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgca 20196436  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
           | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || ||| |    
T  20196435 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattca 20196336  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  20196335 aactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagca 20196236  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  20196235 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtc 20196137  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    |||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20196136 tgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 20196037  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20196036 tttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 20195989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3221193 - 3220662
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3221193 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 3221094  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  3221093 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3220995  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  3220994 tagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaagtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 3220895  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  3220894 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 3220795  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  3220794 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 3220695  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3220694 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3220662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19139841 - 19139310
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19139841 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19139742  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  19139741 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19139643  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  19139642 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19139543  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  19139542 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 19139443  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  19139442 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 19139343  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19139342 tagacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 19139310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 209873 - 210403
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  209873 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 209972  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  209973 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 210071  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  210072 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 210171  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  210172 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 210271  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  210272 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 210371  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  210372 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 210403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 252969 - 252439
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  252969 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 252870  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  252869 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 252771  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  252770 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 252671  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  252670 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 252571  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  252570 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 252471  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  252470 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 252439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 723496 - 724026
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  723496 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 723595  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  723596 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 723694  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  723695 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 723794  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  723795 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 723894  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  723895 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 723994  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  723995 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 724026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 848687 - 849217
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  848687 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 848786  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  848787 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 848885  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  848886 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 848985  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  848986 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 849085  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  849086 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 849185  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  849186 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 849217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29077291 - 29076761
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  29077291 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 29077192  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  29077191 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29077093  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  29077092 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 29076993  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  29076992 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 29076893  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  29076892 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 29076793  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29076792 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 29076761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29087542 - 29087012
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  29087542 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 29087443  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  29087442 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29087344  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  29087343 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 29087244  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  29087243 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 29087144  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  29087143 tcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 29087044  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29087043 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 29087012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 32087989 - 32088519
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  32087989 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 32088088  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  32088089 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32088187  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  32088188 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 32088287  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  32088288 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 32088387  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  32088388 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 32088487  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32088488 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 32088519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26111793 - 26111261
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  26111793 atttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattataagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 26111694  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  26111693 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26111595  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | |||||||||||||||||||  |||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  26111594 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 26111495  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||  ||| |     
T  26111494 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacaacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 26111395  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  26111394 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 26111295  T
Q  519 t-agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26111294 taagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 26111261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26121471 - 26120939
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  26121471 atttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 26121372  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  26121371 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26121273  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    ||| || || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  26121272 tagttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 26121173  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  26121172 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 26121073  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  26121072 ttcaagatgggaataaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 26120973  T
Q  519 t-agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26120972 taagacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 26120939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 32077416 - 32077946
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  32077416 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 32077515  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  32077516 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32077614  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtc-tagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| |||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  32077615 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 32077714  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  32077715 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 32077814  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  32077815 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 32077914  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32077915 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 32077946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 15780429 - 15780960
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15780429 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 15780528  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  | |||||||||||||||    
T  15780529 atcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-atactgaagattcaaag 15780627  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||   | ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || || | |||||||||||||||||  ||||||      
T  15780628 tagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgagtacttgtctctcgttaat 15780727  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  15780728 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15780827  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  15780828 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 15780927  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  15780928 tagacgtgctgagtatctcaacgtctctttcac 15780960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 15791018 - 15791549
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15791018 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 15791117  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  15791118 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15791216  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||   | ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  15791217 tagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 15791316  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  15791317 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15791416  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  15791417 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 15791516  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  15791517 tagacgtgctgagtatctcaacgtctctttcac 15791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 242384 - 241854
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  242384 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 242285  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||| |    
T  242284 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaatg 242186  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  242185 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 242086  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |      
T  242085 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 241986  T
Q  427 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  241985 tcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactcttt 241886  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  241885 agacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 241854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23371007 - 23370591
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23371007 tcatcagaagca-aagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaaatttcaaag 23370909  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
     ||||||||||||||| | |||  ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||       
T  23370908 gagctgtttttcgttttatcctcatctgagaa-aacgaagaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttc-tttga 23370811  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  23370810 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt-----ctacaagacaagacaacacctctgcctacagaaatgttcctt 23370716  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
     ||||| ||||||||||  ||| | || ||||  |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23370715 taagataggaatgaattcaaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggaaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 23370616  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  23370615 acgtgctaaaaatctcaacgtctct 23370591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1750670 - 1750201
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | | |||||||||    
T  1750670 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaatagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcagagtgcttct 1750571  T
Q  117 gaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||  |  |||| |||||||||||| || || ||   | ||| ||    
T  1750570 gaagtgatgaagtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatatcttaatcta 1750471  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    | ||||||||| |||||||||| || ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  1750470 a-ctgaagatttaaagtagctggttctcaactcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagca 1750372  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||     
T  1750371 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcc 1750272  T
Q  412 tgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750271 tgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcagg 1750201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6151632 - 6151100
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  6151632 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 6151533  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  6151532 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6151434  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctag--aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||     
T  6151433 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaa 6151334  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  6151333 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 6151234  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  6151233 actcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 6151134  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6151133 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6151100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6161586 - 6161055
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  6161586 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 6161487  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  6161486 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6161388  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  || |||      
T  6161387 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 6161288  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||| |||||||  ||| |     
T  6161287 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaaacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtaca 6161188  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  6161187 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 6161088  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6161087 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 6161055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 6318241 - 6318766
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  6318241 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctg 6318340  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactg 217  Q
    | || ||||||||||||||||||                | | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  || |||    
T  6318341 aagtgatgacgtcatcagaagca----------------aggttttcatcagaagctatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aatctg 6318423  T
Q  218 aagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgt 316  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || | ||||||||| | ||||    
T  6318424 aagattcaaagtagctggttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtaccaacggtcatatggatagcactgagcatttgt 6318523  T
Q  317 ccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcag 416  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  6318524 ccctcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcat 6318623  T
Q  417 aa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc- 508  Q
    ||  |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  6318624 aatttgtgtcctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttca 6318723  T
Q  509 aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6318724 aacgactctttagacgttctgattatctcaacgtctctttcac 6318766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18449931 - 18449400
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  18449931 atttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 18449832  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  18449831 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 18449733  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaa-ccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  18449732 tagctgattctcaattcagtcctattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 18449633  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  18449632 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 18449533  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  18449532 ctcaaaatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 18449433  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18449432 tagacgtgctgactatctcaacgtctctttcac 18449400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36078497 - 36077965
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  36078497 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 36078398  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  36078397 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36078299  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  36078298 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 36078199  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  36078198 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36078099  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  36078098 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 36077999  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36077998 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36077965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36089083 - 36088551
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  36089083 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 36088984  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  36088983 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36088885  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||      
T  36088884 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 36088785  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc- 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  36088784 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36088685  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  36088684 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 36088585  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36088584 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36088551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 9856191 - 9856722
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  9856191 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaataaaactgctcctgaagctgaagtgctcctgaagagatgacgtc 9856290  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  9856291 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 9856389  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  9856390 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggagatatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9856489  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  9856490 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9856589  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  9856590 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 9856689  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9856690 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9856722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9341706 - 9341174
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  9341706 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 9341607  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  9341606 catcagaagcagaaaatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 9341508  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  9341507 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 9341408  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  9341407 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 9341308  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  9341307 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 9341208  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9341207 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9341174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43248878 - 43248356
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  43248878 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 43248779  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | || | |||||||||||||||||    
T  43248778 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 43248680  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  43248679 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 43248580  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  43248579 agagttgacaaagtacaagtgtacaa---------ccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 43248489  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  43248488 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 43248389  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43248388 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 43248356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 126 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36293385 - 36292949
Alignment:
Q  126 acgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagatt 223  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||    
T  36293385 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagatt 36293287  T
Q  224 caaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcg 322  Q
    ||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||    
T  36293286 caaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcg 36293187  T
Q  323 ttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-at 420  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |    
T  36293186 ttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattt 36293087  T
Q  421 gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacga 513  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||    
T  36293086 gtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 36292987  T
Q  514 ctctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36292986 ctctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36292949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 126 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36303988 - 36303552
Alignment:
Q  126 acgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagatt 223  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||    
T  36303988 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagatt 36303890  T
Q  224 caaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcg 322  Q
    ||||||||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||    
T  36303889 caaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcg 36303790  T
Q  323 ttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-at 420  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |    
T  36303789 ttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattt 36303690  T
Q  421 gttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacga 513  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||    
T  36303689 gtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacga 36303590  T
Q  514 ctctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36303589 ctctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 36303552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 212 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19129127 - 19128778
Alignment:
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||   ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||     
T  19129127 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattctgtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 19129028  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19129027 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatg 19128928  T
Q  410 cttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaag 502  Q
    | |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||    
T  19128927 cctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtggataatcaaag 19128828  T
Q  503 gaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||  || |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19128827 gatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 19128778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 546
Target Start/End: Original strand, 22211088 - 22211632
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgaggta---- 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||         
T  22211088 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaagtttcaa 22211187  T
Q  123 --------------atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaa 208  Q
                  |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| | |    
T  22211188 gtgcctctgaaatgatgacgtcatcagaagtagaagttcatcagaagcaagaattcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagtggatcagaaga 22211287  T
Q  209 tttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactg 307  Q
    || || |||||   |||||  ||||| || ||  | | || ||||||||  ||| ||||| ||  ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||    
T  22211288 ttcaatctgaaatctcaaaagagctggttctttatgttaaacttgtctaagagagcgaaggatcaaaatggaagtgtcaacgttcatttgaaaaacactg 22211387  T
Q  308 agtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctc 407  Q
     || ||||| | || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  22211388 ggtgcttgtacctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagccc 22211486  T
Q  408 tgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaa 501  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  22211487 tgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaa 22211586  T
Q  502 ggaactcaacgactcttt-agacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22211587 ggaactcaacgactctttaagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 22211632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28691473 - 28691193
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28691473 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcatctg 28691374  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactg 217  Q
    | || ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  28691373 aagtgatgacatcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactg 28691274  T
Q  218 aagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||||  ||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28691273 aagatctaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 28691193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9368752 - 9368318
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||    
T  9368752 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattca 9368654  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  9368653 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 9368554  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  9368553 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 9368454  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  9368453 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 9368354  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9368353 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 9368318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 285 - 546
Target Start/End: Original strand, 7018358 - 7018624
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7018358 caacgttcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctac 7018456  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||        
T  7018457 gctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaa 7018556  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7018557 aagattattggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 7018624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 3348443 - 3348877
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  || |||||||||||    
T  3348443 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aatctgaagattca 3348541  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  3348542 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 3348641  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  3348642 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 3348741  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  3348742 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3348841  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3348842 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3348877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 3359040 - 3359474
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattca 225  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  || |||||||||||    
T  3359040 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aatctgaagattca 3359138  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  |||||    
T  3359139 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 3359238  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgt 422  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  |||    
T  3359239 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 3359338  T
Q  423 tctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgact 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  3359339 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgact 3359438  T
Q  516 ctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3359439 ctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 3359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 542
Target Start/End: Original strand, 22135551 - 22136097
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaa-gaaaactgcgtctgaagcta-------------- 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||                  
T  22135551 aagttaatcattttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatttaaagcatctgaatgaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 22135650  T
Q  107 ------aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaa 200  Q
          |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |    
T  22135651 agtttcaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagttacagttga 22135750  T
Q  201 tcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtt-tcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaa 299  Q
    |||| | ||| || |||||   |||||| |||||| | | |   | || || |||||  | | | ||| ||  ||| | | ||  ||| | |||||||||    
T  22135751 tcagaagattcaatctgaaatctcaaag-agctgtctcttgaagttaatctcgtctacgaaagcaaaggatcaaaaggaaagtgccaaagttcatttgaa 22135849  T
Q  300 gagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
     ||||||| || ||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||||||||     
T  22135850 aagcactgggtgcttgtacctcgttca-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaagat 22135948  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtgga 493  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  22135949 aacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtgga 22136048  T
Q  494 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22136049 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgt 22136097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 284 - 523
Target Start/End: Original strand, 30325227 - 30325473
Alignment:
Q  284 tcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    |||||||||||||| | ||| || || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  30325227 tcaacggtcatttggatagcgcttagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtcct 30325325  T
Q  384 cgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc---- 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  30325326 cgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 30325425  T
Q  479 --aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagac 523  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  30325426 aaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagac 30325473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 481
Target Start/End: Original strand, 6576466 - 6576693
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| | |||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6576466 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 6576565  T
Q  356 actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6576566 actacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagctta 6576665  T
Q  454 ttcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576666 ttcttcaaaggactacacccaaatcagg 6576693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44481423 - 44481121
Alignment:
Q  258 aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccac 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44481423 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 44481324  T
Q  358 tacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  44481323 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 44481224  T
Q  456 cttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  44481223 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgtttatctcaacgtctcttt 44481124  T
Q  549 cac 551  Q
    |||    
T  44481123 cac 44481121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 44492039 - 44491737
Alignment:
Q  258 aagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccac 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44492039 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 44491940  T
Q  358 tacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  44491939 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 44491840  T
Q  456 cttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  44491839 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgtttatctcaacgtctcttt 44491740  T
Q  549 cac 551  Q
    |||    
T  44491739 cac 44491737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 551
Target Start/End: Original strand, 13688418 - 13688818
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaa 259  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | |||    
T  13688418 tttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaa 13688516  T
Q  260 gaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccacta 359  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||  || || | | ||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688517 ggacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 13688616  T
Q  360 cctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 456  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13688617 cctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattc 13688716  T
Q  457 ttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13688717 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 13688816  T
Q  550 ac 551  Q
    ||    
T  13688817 ac 13688818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 22167046 - 22167266
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22167046 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagataagataacagctttgcctgcagaattgttccttcaag 22167145  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22167146 atgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 22167245  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  22167246 gctaaaaatctcaacgtctct 22167266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Original strand, 30325013 - 30325231
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  30325013 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtc 30325112  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  30325113 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 30325212  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaac 248  Q
    |||||||| || |||||||    
T  30325213 agctgtttctcatttcaac 30325231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 16436773 - 16437025
Alignment:
Q  24 gtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  |    
T  16436773 gtcaagcaatttcaataggtcttggaagaacaataaaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagaga 16436872  T
Q  124 tgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagat 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||  | || | |||||||||||    
T  16436873 tgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatccctcaa-tcaaactgaagat 16436971  T
Q  223 tcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgt-ctagaagaacgaagaattgaaa 275  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||  ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  16436972 tcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaa 16437025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19461376 - 19461090
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgt-ttcaaccttgtctagaag 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || |||||| ||||||  |||||| ||| |  || ||||| |||||  ||    
T  19461376 ttcattagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaagag 19461277  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19461276 agcgaaggattaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccactac 19461178  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaa 448  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  19461177 ctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaatataggaatagatttgaa 19461090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19559054 - 19558768
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgt-ttcaaccttgtctagaag 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || |||||| ||||||  |||||| ||| |  || ||||| |||||  ||    
T  19559054 ttcattagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaagag 19558955  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19558954 agcgaaggattaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccactac 19558856  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaa 448  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  19558855 ctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaatataggaatagatttgaa 19558768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 23269582 - 23269682
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269582 aggcaagtcaataaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 23269681  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  23269682 a 23269682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 26734706 - 26734804
Alignment:
Q  20 gcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26734706 gcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 26734804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 367 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 795401 - 795209
Alignment:
Q  367 tactctgtttttg-tctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagga 465  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  795401 tactctgttttcggtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaagga 795302  T
Q  466 ctacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  795301 ctacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 795209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Original strand, 23271227 - 23271430
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23271227 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgcctgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaa 23271326  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacg 524  Q
    ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||| | ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23271327 gataggaatggatttgaatttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctcaacgactctttagacg 23271426  T
Q  525 tgct 528  Q
    ||||    
T  23271427 tgct 23271430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8032077 - 8031927
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8032077 ttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaaatgttccttcaa 8031978  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8031977 gataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 8031927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 40003312 - 40003123
Alignment:
Q  291 tcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctac 389  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||||||   || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  40003312 tcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttca--atgagagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgactgtgtctacgctac 40003215  T
Q  390 aagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 480  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  40003214 aagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacgtaattcttcttaggacaacatccaaatcag 40003123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28903503 - 28903353
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28903503 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactagctccactactctgtttt-gtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 28903405  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  28903404 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 28903353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 22623060 - 22623163
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  22623060 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagccaagaagtgcttctgaa 22623159  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  22623160 gtaa 22623163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3833321 - 3833231
Alignment:
Q  30 caatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3833321 caatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 3833231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 335 - 481
Target Start/End: Original strand, 17519168 - 17519316
Alignment:
Q  335 acaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaaga 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  17519168 acaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaaatgttccttcaaga 17519267  T
Q  433 tgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  17519268 taggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcagg 17519316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19129291 - 19129167
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19129291 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 19129192  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  19129191 atcagaagcagaaggtcatcagaag 19129167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 795754 - 795588
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  795754 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 795655  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    |||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  795654 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctaca 795588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21540996 - 21540845
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  21540996 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataaatgttccttca 21540897  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21540896 gaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 21540845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23380910 - 23380812
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23380910 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagaacaaaggaatctaaagcatcagaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 23380812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31215623 - 31215522
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttct 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31215623 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaagaattccaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttatagtgcttct 31215524  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  31215523 ga 31215522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 7018093 - 7018177
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7018093 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagcaaaagaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 7018177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 332 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 29379622 - 29379486
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  29379622 ttgacaaagtagaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcagaaatgttccttca 29379523  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggac 466  Q
     ||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||||    
T  29379522 ggataggaatggatttgaacataatccttcataggac 29379486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23371151 - 23371053
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23371151 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagaaaaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactacgtctgaagctatgaagtgcttctga 23371053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3844392 - 3844297
Alignment:
Q  30 caatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgaggtaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  3844392 caatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaaacatctgaagaaaactgagtctggagctatgaagtgcttctgaagtaa 3844297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 22166700 - 22166799
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaa-gaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22166700 aagttaatcattttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatttaaagcatctgaatgaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 22166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 45568021 - 45568159
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||| |    
T  45568021 aagtgtacgaccactaccttcactactctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatgga 45568120  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  45568121 tttgaatgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 45568159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 6576275 - 6576384
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  6576275 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 6576374  T
Q  131 atcagaagca 140  Q
    ||||||||||    
T  6576375 atcagaagca 6576384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 15336208 - 15336313
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  15336208 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 15336307  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  15336308 tttgaa 15336313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 15425273 - 15425378
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  15425273 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 15425372  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  15425373 tttgaa 15425378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 15516577 - 15516682
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  15516577 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 15516676  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  15516677 tttgaa 15516682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36105226 - 36105139
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  36105226 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttctttcaa 36105139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 445
Target Start/End: Original strand, 45538559 - 45538661
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  45538559 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 45538658  T
Q  443 ttt 445  Q
    |||    
T  45538659 ttt 45538661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19225526 - 19225438
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225526 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 19225438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 23185346 - 23185452
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag--acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| | |||| | |||||| ||||  |||||||||     
T  23185346 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctcttcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgc 23185445  T
Q  442 atttgaa 448  Q
    |||||||    
T  23185446 atttgaa 23185452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1237668 - 1237563
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  1237668 aagtgtacaaccactacctccactactctgttgttgtctctgctacaagagaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 1237569  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  1237568 tttgaa 1237563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21932914 - 21932809
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  21932914 aagtgtacaaccactacctccactactcagtgtttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 21932815  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  21932814 tttgaa 21932809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23783912 - 23783833
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaa-gaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaa-gaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23783912 tcaatttcaataggtcttcgaaagaacaatagagagcaaaggaatttaaagcatctgaatgaaaactgcgtctgaagcta 23783833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 3348324 - 3348441
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa------ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||    
T  3348324 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatg 3348423  T
Q  126 acgtcatcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3348424 acgtcatcagaagcagaa 3348441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 3358921 - 3359038
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa------ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||    
T  3358921 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatg 3359020  T
Q  126 acgtcatcagaagcagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3359021 acgtcatcagaagcagaa 3359038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6407757 - 6407703
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6407757 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 6407703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16207337 - 16207283
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16207337 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16207283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17797453 - 17797399
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  17797453 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctataagacaaga 17797399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 415
Target Start/End: Original strand, 14989574 - 14989643
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  14989574 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 14989643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24551305 - 24551200
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| | ||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  24551305 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctacaacgatgttccttcacaatgggaatgca 24551206  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  24551205 tttgaa 24551200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 30421549 - 30421654
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||| | |||| | |||||| ||||  || |||||| |    
T  30421549 aagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgcaacaagacaagaaaaacagctcttcctgcatagatgttccttcacaataggaatgca 30421648  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  30421649 tttgaa 30421654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 13430748 - 13430820
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13430748 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 13430820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 448
Target Start/End: Original strand, 18121235 - 18121331
Alignment:
Q  353 accactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaa 448  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  18121235 accactacctcaactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaa 18121331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19943266 - 19943194
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  19943266 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttggtctctcctacaagacaagaaaaccagctctgcctgca 19943194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 13596230 - 13596317
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  13596230 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 13596317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 13688251 - 13688338
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  13688251 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctga 13688338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 18151769 - 18151820
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18151769 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 18151820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9320599 - 9320546
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  9320599 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 9320546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22673809 - 22673755
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22673809 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaaga 22673755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 40845507 - 40845561
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40845507 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagagaaga 40845561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3844295 - 3844230
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3844295 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtgcatcataagcaagatttcatcagaag 3844230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43639814 - 43639741
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  43639814 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 43639741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3833224 - 3833176
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3833224 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaag 3833176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 602840 - 602894
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  602840 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 602894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23783773 - 23783708
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23783773 tcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 23783708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26833072 - 26833034
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26833072 agtataagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 26833034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21301053 - 21301000
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  21301053 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 21301000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23783812 - 23783748
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||    
T  23783812 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaag-ttcatcagaag 23783748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24646369 - 24646316
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  24646369 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 24646316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 39693566 - 39693513
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  39693566 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 39693513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17267502 - 17267438
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgc 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||    
T  17267502 tgtacaaccactatctccactactcagtttttgtctctgccacaagacaaggataacagctctgc 17267438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21288434 - 21288362
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21288434 aagtgtacaaccactacttccactactttgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 21288362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 23579594 - 23579658
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  23579594 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 23579658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18719032 - 18718965
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||| | |||||||||||    
T  18719032 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctaaaagacaagaataacagctctgc 18718965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43644927 - 43644876
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  43644927 aagtgtacaaccactacctccactactcggtttgtgtctctgctacaggaca 43644876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 9368850 - 9368785
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgg--agagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  9368850 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgc 9368785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17701776 - 17701722
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  17701776 aagtttacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 17701722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19156224 - 19156174
Alignment:
Q  347 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  19156224 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 19156174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25164101 - 25164047
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  25164101 aagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtgtctctgctacaagacaaga 25164047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44481580 - 44481483
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagcta 193  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  44481580 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 44481483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44492196 - 44492099
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagcta 193  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  44492196 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 44492099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Original strand, 7018198 - 7018235
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7018198 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaag 7018235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 8032404 - 8032360
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8032404 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 8032360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 12757883 - 12757936
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  12757883 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctactacaagacaag 12757936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16189015 - 16188962
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||||||    
T  16189015 aagtgtacaaccactatctccactactcagtatgtgtctctgctacaagacaag 16188962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 17518823 - 17518867
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17518823 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 17518867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 17525849 - 17525930
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||   ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  17525849 aagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctactacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 17525930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 18534828 - 18534872
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18534828 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 18534872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 18685517 - 18685550
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18685517 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18685550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 18722766 - 18722799
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18722766 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18722799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 18731111 - 18731144
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18731111 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18731144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19461554 - 19461517
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19461554 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 19461517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19559232 - 19559195
Alignment:
Q  34 ttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19559232 ttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaa 19559195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 24833177 - 24833281
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| || |  ||||||||| |    
T  24833177 aagtgtacaaccactacctccattactct-attttgtctctgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttcctttacaatgggaatgca 24833275  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  24833276 tttgaa 24833281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 28903856 - 28903811
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28903856 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 28903811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 415
Target Start/End: Original strand, 33560354 - 33560407
Alignment:
Q  363 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  33560354 ccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 33560407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 40003582 - 40003537
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40003582 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 40003537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1745190 - 1745115
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag--acaacagctctgcttgcaga 417  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  1745190 aagtgtacaacaactacttccactactctgtttctgtatctactacaagacaagaaaaaacagctctgcctgcaga 1745115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5846688 - 5846660
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5846688 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 5846660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 15969147 - 15969175
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15969147 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 15969175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17688018 - 17687986
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17688018 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 17687986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 18321279 - 18321351
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18321279 aagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctctactacaagacaagaataacagctctgcctgca 18321351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 380
Target Start/End: Original strand, 23263732 - 23263768
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23263732 aagtgtacaaccactacctccactaccatgtttttgt 23263768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23339453 - 23339425
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339453 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 23339425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 72
Target Start/End: Original strand, 30421231 - 30421263
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaat 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30421231 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaat 30421263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 31043325 - 31043353
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31043325 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 31043353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 34107414 - 34107442
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34107414 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 34107442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36293463 - 36293435
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36293463 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 36293435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36304066 - 36304038
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36304066 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 36304038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 11797 - 12370
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-------------- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  11797 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 11896  T
Q  108 ------agtgcttctgaggtaatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
          ||||| ||||| |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11897 gtaacaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 11996  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11997 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtat 12096  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097 caacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 12196  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||        
T  12197 gctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 12296  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  12297 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatttcaacgtctctttcac 12370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Original strand, 15628 - 16092
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa--agtgcttct--- 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||       
T  15628 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttcttaa 15727  T
Q  117 ---------------gaggtaatgacgt-----------------catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
                   || ||||||||||                 ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15728 gtaccaagtgcctatgaagtaatgacgtcataagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatctgaagcaagatttcatcagaagctatatcatcac 15827  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  15828 cagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgattttcgtttcaacctcatctaagggaacgaagaattgaaagggaggtat 15927  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15928 caacggtcatttgaaaagcaatggatacttgtcattcaatataaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctacactactctgtttttgtctac 16027  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaag 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16028 gctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 16092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 22 - 551
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10541
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------- 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  9969 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctataaagtgcttctgaa 10068  T
Q  107 -----aagtgcttctgaggtaatgacgt-----------------catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcac 184  Q
         |||||| ||||| ||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||    
T  10069 gtttcaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaaactatatcatcac 10168  T
Q  185 cagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtat 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10169 cagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgttttttgtctcaacctcgtataagagaacgaagaattgaaagggaggtat 10268  T
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10269 caacggtcgtttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctac 10368  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag---- 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        
T  10369 gctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctttaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 10468  T
Q  481 --gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  10469 aagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagatgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 7462 - 8009
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              
T  7462 aatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaagaaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagctgaagtgcc 7561  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt- 211  Q
           | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||     
T  7562 tctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattc 7661  T
Q  212 aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7662 aaactgaagattcaaagtagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactgagt 7761  T
Q  311 acttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 410  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7762 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 7861  T
Q  411 ttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagg 503  Q
     |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  7862 ctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagg 7961  T
Q  504 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7962 aactcaacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 8009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 10326 - 10856
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt- 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||     
T  10326 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagaaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagc--tgaagtg 10423  T
Q  130 catcagaagcagaagac--catcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattca 225  Q
    | || ||||  || |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  10424 cctctgaagt-gatgacgtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 10522  T
Q  226 aagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 324  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  10523 aagtagctgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactaagtatttgtccttcgtt 10622  T
Q  325 atcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgtt 423  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||     
T  10623 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 10722  T
Q  424 ctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 517  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10723 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactct 10822  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10823 ttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttcac 10856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Original strand, 51777 - 52361
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  51777 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttgaaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaattacatctgaagctaaagtgctt 51876  T
Q  115 ctgaggt------------------aatgacgt-----------------catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatc 179  Q
    |||| |                   ||||||||                 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  51877 ctgaagctgaagtgcttctaaagtaaatgacgtcatcagaagtagaagcccatcagaagcagaagtccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgaaatc 51976  T
Q  180 atcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatgg 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||    
T  51977 atcaccagaagctacaactaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaataagaacgaagaattgaaaggg 52076  T
Q  279 aggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52077 aggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 52176  T
Q  378 tgt----ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccc 473  Q
    |||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52177 tgtctacctacgctgcaagacaagataacagctctgcctgcataaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccc 52276  T
Q  474 aaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||      |||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52277 aaatcaggcaaaggattactgatgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttaatcatctcaacgtctctttcac 52361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 6)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Original strand, 56606 - 57030
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  56606 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccataagctacaagtgatcagtaaatttacactgacgattcaaag 56705  T
Q  229 tagctg-tttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | | | || ||||||||||||    
T  56706 gagctggtttttcgtttcaacctcgtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcacggggaaattttccttcgttatc 56805  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  56806 agatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctt 56905  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56906 caagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 57005  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  57006 acgtgctaaaaatctcaacgtctct 57030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 56472 - 56547
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56472 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcaaagcatctgaagaaaactgcgtctcaagctaa 56547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 424
Target Start/End: Original strand, 464 - 524
Alignment:
Q  365 actactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  464 actactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttc 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 32524 - 32443
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgcaaaaatgttc 32443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 391
Target Start/End: Original strand, 417 - 464
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  417 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtcttcgctacaa 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 49371 - 49318
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  49371 aagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 49318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 36413 - 36989
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtc-----------------tg 100  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||                 ||    
T  36413 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattagaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 36512  T
Q  101 aagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatca-----------------gaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatc 182  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||                 |||| ||||||| ||||||||| || ||||||    
T  36513 aagctaaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcaaaagcatatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatc 36612  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  36613 accagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaga 36712  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 381  Q
     ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36713 catcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttaacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 36812  T
Q  382 tacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc-- 478  Q
     ||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36813 cacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 36912  T
Q  479 ----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36913 gcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 36989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 8)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 175755 - 175327
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  175755 tcatcagaagcagaagagcatcagaaggacatttttatcagaagctgtatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 175656  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| | ||||    
T  175655 gagctatttttcgtttcaacctagtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttcatca 175556  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  175555 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaggacaagacaacagctttgtttgcagaaatgttccttc 175456  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175455 aagatgggaatgaatttgaagctgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 175356  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  175355 cgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 175327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 129 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 180667 - 180424
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  180667 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcacatttttatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 180568  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| | ||||    
T  180567 gagctatttttcgtttcaacctagtctaagagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttcatca 180468  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 372  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180467 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 180424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Original strand, 40373 - 40576
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  40373 ttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaaatgttccttcaa 40472  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacg 524  Q
    ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||| | ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40473 gataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctcaacgactctttagacg 40572  T
Q  525 tgct 528  Q
    ||||    
T  40573 tgct 40576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 175900 - 175818
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  175900 aagtcattcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaatccaaagcatctgaagaaaactgcatctgaagc 175818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 180812 - 180709
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  180812 aagtcattcaatttcaataggttttgtaagaacaatggagagcaaaagaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagccaagaagtgcttctgaa 180713  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  180712 gtaa 180709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 528
Target Start/End: Original strand, 58750 - 59122
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaag 260  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||| || |||||| |||||| | ||||||| || | || ||||| |||||  ||    
T  58750 ttcatcagaagctatatcgtcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaagtttcaaa-tggctgtttattggatttaacctcgtctaagag 58848  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||  | | ||| | ||||  ||||| ||||||||| ||||||| || ||| || || |||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  58849 agcgaaagactcaaacgaaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttatcttttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaatcactac 58947  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 459  Q
    |||||| | |||| || ||| | | |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||    
T  58948 ctccacgaatctgcttgtgtttgcactacgagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttc 59047  T
Q  460 aaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct 528  Q
    | | ||| ||| |||||||||      ||| | ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  59048 ataagacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctcaacgactctttagacgtgct 59122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Original strand, 40085 - 40129
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaag--ctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  40085 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagttttaaagtgcttctga 40129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 143
Target Start/End: Original strand, 40136 - 40172
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaa 143  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40136 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 40172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 32727 - 33157
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  32727 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaa 32826  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  32827 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaa 32926  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |     
T  32927 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 33025  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33026 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaacgactcttt 33125  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33126 agacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 33157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 40178 - 40709
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40178 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 40277  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  40278 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40376  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  40377 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 40476  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  40477 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 40576  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  40577 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 40676  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40677 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 40709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Original strand, 32582 - 32681
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32582 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgtagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 32681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9942 - 9888
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||    
T  9942 aagtgtaaaaccactacctccactactatgtttgtgtctctgctacaggacaaga 9888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 6)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 128202 - 127654
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgag-- 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  128202 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaacc 128103  T
Q  120 -----------------gtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatc 202  Q
                     || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  128102 ctcaaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatc 128003  T
Q  203 agtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagag 302  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  128002 agtaaatctaaactgaagtttcaaaggaggtgtctttcgtttcaaccttgtctaagagaacgaataattaaaagggaggtatcaacggtcatttaaaaag 127903  T
Q  303 cactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaac 402  Q
    ||||| || |||||||||| ||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  127902 cactgggtgcttgtccttcatt-gaagatttgactaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaac 127804  T
Q  403 agctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatga 496  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||      ||||||||||||||||    
T  127803 agctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaacgattactggtggatga 127704  T
Q  497 tcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  127703 tcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 127654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 129 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 141235 - 140812
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  141235 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcactagaaactacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaaag 141136  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     || ||| |||| |||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||  ||||||||| ||   |    
T  141135 gagttgtctttcctttccatcttgtctaagagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacagtcatttaaaaagcactgggtgtttgtccttcattgaaa 141036  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  141035 -agtttacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 140937  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140936 aagatgggaatgagtttgaagttgatccttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 140837  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  140836 acgtgctaaaaatctcaacgtctct 140812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 285 - 551
Target Start/End: Original strand, 7632 - 7905
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  7632 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttatcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgagtgtgtctgc 7730  T
Q  385 gctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag--- 480  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||       
T  7731 gctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgttcattcaagatatgaatgaatttgaacttgatgcttcataggacaacatccaaatcaggca 7830  T
Q  481 ---gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgc-taatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
       ||| | ||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7831 aaagatcattggtaaatgatcaaaggttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctttcac 7905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 141378 - 141282
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  141378 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctcaagtgcttctga 141282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 215569 - 215674
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||   |||||||| |    
T  215569 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttcgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttctttcacattgggaatgca 215668  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  215669 tttgaa 215674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 64571 - 64599
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  64571 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 64599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13861
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 13384  T
Q  118 agg-----------------taatgacg-----------------tcatcagaagcagaagaccatcagaag-taaggtttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | ||||||                 |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||| |    
T  13385 aagctggagtgcttttgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcacc 13484  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagt-aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggag 280  Q
    |||||||| |||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||| || | |||||||||| |||| ||||    
T  13485 accagaagttacatttgattagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttctcatttcaacctcatctaaggaaaacgaagaatcgaaagggag 13584  T
Q  281 gtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 380  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13585 gtatcaacggtcatttcagaagcactgagtatttgtccttcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgt 13684  T
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc-- 478  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  13685 ccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataattattccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcag 13784  T
Q  479 ----aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13785 gcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtggtaatcatctcaacgtctctttcac 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 12980 - 13080
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12980 aggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 13079  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  13080 a 13080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 13125 - 13192
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaag-taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  13125 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttaca 13192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 53849 - 54378
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||    
T  53849 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacatc 53948  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  || | | ||||||||||| ||||||    
T  53949 atcagaagcagaaggaaatcagaagcaagattttcatcaaaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatactcaaactgaagatccaaagt 54048  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    |||||||| || |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||| ||||| ||    
T  54049 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtcctgcgttaaca 54148  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||    
T  54149 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 54247  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  54248 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactcttta 54347  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54348 gacgtgctaattatctcaacgtctctttcac 54378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15115 - 14584
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15115 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 15016  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaagg--tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||  | ||   |||| ||||||||||||    
T  15015 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaaac-aaacggaagattcaaag 14917  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  14916 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 14817  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  14816 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgctttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 14717  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14716 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 14617  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14616 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 14584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 5674 - 5728
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5674 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 31 - 551
Target Start/End: Original strand, 1927 - 2473
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct---------------- 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||                    
T  1927 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactacgtctgaagcttaaagtgctcctgaagctgaagtgc 2026  T
Q  114 -tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |     ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  2027 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaagctcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattca 2126  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagta 311  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2127 aactgaagataaaaagtagatgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagta 2226  T
Q  312 cttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgct 411  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2227 tttgtccttcgttaacagagttgacaaaatacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgct 2325  T
Q  412 tgcaga-aatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaagga 504  Q
    ||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2326 tgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccaaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 2425  T
Q  505 actc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
       | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2426 ttacaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcac 2473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 8)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 130 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 117530 - 117147
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  117530 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 117431  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  117430 tagctggttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttaac 117331  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||    
T  117330 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccgctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaattgttcctt 117231  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  117230 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaa 117147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 475309 - 475460
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  475309 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 475408  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  475409 agataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcagg 475460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 481829 - 481980
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  481829 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 481928  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  481929 agataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcagg 481980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 117663 - 117576
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  117663 aatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatccaaagaatctgaagaaagctgcgtctgaagctaaagcacttctga 117576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 156685 - 156836
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  156685 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaattgttccttca 156784  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  156785 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 156836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 347337 - 347425
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  347337 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaaaaaaactgcgtctgaagcttatagtgcttctga 347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Original strand, 347438 - 347514
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaag 172  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  347438 tctgaagttgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaag 347514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 156342 - 156387
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  156342 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 156387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 3343 - 2824
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  3343 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaagaattccaagcatctaaagaaaactgctcctgaagttgaagtgcttctg 3244  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaac 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||    
T  3243 aagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaggtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattaatccatatattcaaac 3144  T
Q  216 tgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtactt 314  Q
    ||||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || || | ||    
T  3143 tgaaggtccaaagtagctgtttctcatttcaacctaatctaagaagaacgaagaagtgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctcttagcattt 3044  T
Q  315 gtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgc 414  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3043 gtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccaatacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgc 2945  T
Q  415 agaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaact 507  Q
    ||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2944 agaatttgtgccctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggattt 2845  T
Q  508 c-aacgactctttagacgtgc 527  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  2844 caaacgactctttagacgtgc 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 418
Target Start/End: Original strand, 7775 - 8177
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7775 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaaggaattcgatgcatctgaagaaaattgcatctgaagctagagtgcttctg 7874  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaact 216  Q
    | || |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||    
T  7875 aagtgatgacgtcgtcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagatacaattgatttgtaaattcaaact 7974  T
Q  217 gaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttg 315  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||    
T  7975 gaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggttagctctgagtatttg 8074  T
Q  316 tccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8075 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 8174  T
Q  416 gaa 418  Q
    |||    
T  8175 gaa 8177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 129 - 551
Target Start/End: Original strand, 42344 - 42775
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  42344 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaa 42443  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  42444 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaa 42543  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| |     
T  42544 cagagttgacaacgtacaagtgtacaacgactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaagacaagacatcagctatgcctgcagaatttgtgcc 42642  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  42643 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctt 42742  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42743 tagacgtgctaatcatctcaacgtctccttcac 42775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31664 - 31132
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa--ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| |  ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  31664 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagtaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgt 31565  T
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
T  31564 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 31466  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 326  Q
    || |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||  ||||||  ||||||     
T  31465 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaa 31366  T
Q  327 cagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc 424  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |    
T  31365 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 31266  T
Q  425 tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactct 517  Q
      ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  31265 actcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactct 31166  T
Q  518 ttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31165 ttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 42211 - 42299
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42211 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgctcctga 42299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 129 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35967 - 35543
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  35967 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaaatttcaaag 35868  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||| ||  | ||| |||||  ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   |    
T  35867 gagctgtttttcattatatcctcgtctaagagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttga-a 35769  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35768 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 35669  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35668 aagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 35569  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    
T  35568 cgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 35543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36111 - 36013
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36111 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 36013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 131 - 551
Target Start/End: Original strand, 6711 - 7141
Alignment:
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 229  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  6711 atcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaact 6810  T
Q  230 agctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
    |||||||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||| ||    
T  6811 agctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactaagcatttgtccttcgttaaca 6910  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttcttt 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||    
T  6911 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 7010  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttta 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  7011 caagatgggaatgaatttgaagctaattctttaaaggactacacccaaaccaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggttttcaaacgactcttta 7110  T
Q  521 gacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7111 gacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 504 - 17
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg---------- 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |              
T  504 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagttaaagtgcttctgaagctgaagtgcc 405  T
Q  121 -------taatgacgtcatcagaagca-----------------gaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
           | ||||||||||||||||||                 ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  404 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttttatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 305  T
Q  196 attaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcat 294  Q
    ||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  304 attgattcgtatattcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctagtctaagaaaaatgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcat 205  T
Q  295 ttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 394  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  204 ttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac 105  T
Q  395 aagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104 aagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaataaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 398
Target Start/End: Original strand, 1369 - 1755
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgc-- 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1369 cataggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaataatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt 1468  T
Q  113 ---------------ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaat 197  Q
                   |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||           |||||     |||||||||||||||||||||    
T  1469 ctgaagctggagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcataagctcatcagaag-----------cagaaa----atcatcaccagaagctacaat 1553  T
Q  198 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcattt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1554 taatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctatttctcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcattt 1653  T
Q  297 gaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1654 gaagaacactgagtacttgtccttcattattagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 1753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 130 - 546
Target Start/End: Original strand, 12651 - 13073
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta-aactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  12651 catcagaagcagaaatccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattttgaactgaagtttcaaag 12750  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     ||||||||||||||| || || |||||  | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| || ||   |    
T  12751 gagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaaaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctctttga-a 12849  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||    
T  12850 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcatgaaaaaatgttccttc 12949  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12950 aagataggaatgaatttgaagttgatacttcaaaggactacaaccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttaga 13049  T
Q  523 cgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||    
T  13050 cgtgctaaaaatcccaacgtctct 13073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 12506 - 12588
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatatagagcaaaggaagacaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 12588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Original strand, 6567 - 7098
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  6567 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 6666  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  6667 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6765  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  6766 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6865  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  6866 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 6965  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  6966 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 7065  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7066 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 129 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7661 - 7366
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7661 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaaag 7562  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 328  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  7561 gagctgtctttcgtttcaaccttgtctaagagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 7462  T
Q  329 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7461 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataaatgttc 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7250 - 7060
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgctt--- 114  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  7250 aggcaagtaaattaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatttgaagcatctaaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 7151  T
Q  115 --------------ctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaag 190  Q
                  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7150 aagctggagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaag 7060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7804 - 7707
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaagaaagctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12887 - 12356
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12887 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtc 12788  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  12787 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12689  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
    |||||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||||      
T  12688 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12589  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttct 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |     
T  12588 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctactctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12489  T
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  12488 ctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 12389  T
Q  519 tagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12388 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 12356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 481
Target Start/End: Original strand, 5910 - 6397
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgct---------------- 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||                    
T  5910 aatttaaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaaccgcgtctgaagcttaaagtgctcctgaagctgaagtgc 6009  T
Q  114 -tctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagacca-----------------tcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 194  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||                 ||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6010 ctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcataagaagcagaaggtcttcagaagcaaggttttcatcagaagcgtaatcatcaccagaagctac 6109  T
Q  195 aattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtca 293  Q
    |||| ||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6110 aattgatttgtaaa-ttcaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacataatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 6208  T
Q  294 tttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 393  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6209 tatgaaaagcactgagtatttgtccttcgttaacagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 6308  T
Q  394 caagacaacagctctgcttgcagaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6309 caagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttaaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 129 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2000
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |   |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  2424 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcagtatttcctcataagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaag 2325  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatc 327  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || | | |||||| ||       
T  2324 gagctgtttttcgttttaacctcgtctgagaa-aacgtaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctttccttctttga- 2227  T
Q  328 agaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttcttt 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  2226 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctt 2127  T
Q  428 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttag 521  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||| ||      ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2126 caagataggaatgaatttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaattaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaactcaacgactctttag 2027  T
Q  522 acgtgctaatcatctcaacgtctcttt 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  2026 acgtgctaaaaatctcaacgtctcttt 2000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2567 - 2470
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta-aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  2567 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagaacaaaggaatctaaagcatctgaagaaagctgcgtctgaagctatgagtgcttctga 2470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 129 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 19688 - 19236
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagac-catcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactg-aagattc 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||| |    
T  19688 tcatcagaagcagaagtctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgtaagatcc 19589  T
Q  225 aaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaa-cgaagaatt-gaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttc 321  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19588 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaaacgaagaattagaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttc 19489  T
Q  322 gttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt--ctacgctacaagacaagacaacagc-tctgctt----gc 414  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | | ||| |     |    
T  19488 attaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgttccaacgctacaagacaagacaacaccttatgcctcgacac 19389  T
Q  415 agaa-atgttctttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttc-aaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaa 505  Q
     |||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19388 cgaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaaattcctcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggat 19289  T
Q  506 ctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcactccttt 557  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19288 ttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcacaccttt 19236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 558
Target Start/End: Original strand, 16719 - 17210
Alignment:
Q  106 aaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaag-cagaagacc-atcagaagtaaggttt-catcagaagt-gatatcatcacc-agaag-ctacaatta 199  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  16719 aaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagacagaagctctatcagaagcaaggttttcatcagaagtcgatatcatcacccagaagtctacattta 16818  T
Q  200 atcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagct-gtttttcgtttcaaccttg-tcta-gaagaacgaagaattgaaat-ggaggta-tcaa-cggtc 292  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  16819 atccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagcttgtttctcatttcaacctttatctaagaagaacgaagaattgaaaaaggaggtaatcaaacggtc 16918  T
Q  293 atttg-aagagcactgagtacttgtccttcgttat--cagaattgacaaagtacaagt-gtacaacc-actacctccactactctgtttttgt-ctacgc 386  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16919 atttggaatagcactgagtatttgtccttcgttttaacagagttgacaaagtacaagtagtacaacccactacctccactactctgtttttgtccaacgc 17018  T
Q  387 tacaagacaagacaacagctctg---cttgcagaaa--tgttctttc-aagatgggaatgaa--tttgaagctaattcttcaaagga-ctacacccaaat 477  Q
    ||||||||||||||||| || ||   | | ||  ||  ||| | ||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17019 tacaagacaagacaacacctatgcctcgtacacgaatttgtgccttcaaagatgggaatgaaattttgaagttaattcctcaaaggacctacacccaaat 17118  T
Q  478 c------aggatt-actggtggatgatcaaaggaact--caacgact-ctttagacgtgctaatc-atctcaacgtctctttcactccttta 558  Q
    |      |||||| ||||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17119 caggcaaaggattaactggtgaatgatcaaaggaatttcaaacgactactttagacgtgctaatcaatctcaacgtctctttcacaccttta 17210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 236 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16052 - 15737
Alignment:
Q  236 ttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattga 335  Q
    ||||| |||||| || |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| ||||    
T  16052 ttttcatttcaatctcgtctaagaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttga 15954  T
Q  336 caaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgg 435  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  15953 caaggtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaag 15854  T
Q  436 gaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgcta 529  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15853 gaatgaattagaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgttcta 15754  T
Q  530 atcatctcaacgtctct 546  Q
    |  ||||||||||||||    
T  15753 aaaatctcaacgtctct 15737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7114 - 7016
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  7114 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaatctaaagcatctgaagaaaactgcatctgaagctatgaagtgcttctga 7016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 309 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40753 - 40546
Alignment:
Q  309 gtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctct 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40753 gtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctct 40654  T
Q  409 gcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaag 502  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||    
T  40653 gcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaag 40554  T
Q  503 gaactcaa 510  Q
    ||||||||    
T  40553 gaactcaa 40546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 34837 - 35233
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34837 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaaaaaaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 34936  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaa-----------------gaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | |||||||||||||||||||||                 |  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  34937 aagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatc 35036  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  35037 accagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaga 35136  T
Q  282 tatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
     ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35137 catcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 35233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27271 - 27001
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa---ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27271 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacg 27172  T
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||| ||||| ||||    
T  27171 tcatcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttttcatcagaagtgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaa 27072  T
Q  228 gtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttg 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27071 gtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 27001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21769 - 21706
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  21769 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactg 21706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8435 - 7961
Alignment:
Q  89 aaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcacca 186  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||    
T  8435 aaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcacca 8336  T
Q  187 gaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatc 285  Q
    ||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8335 gaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatc 8237  T
Q  286 aacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctac 384  Q
    |||||  || || | | ||||||| ||||| |  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8236 aacggatatatggataacactgagcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctac 8137  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc---- 478  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||        
T  8136 gctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 8037  T
Q  479 --aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8036 aaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctctttcac 7961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 551
Target Start/End: Original strand, 36740 - 37214
Alignment:
Q  89 aaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcacca 186  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||    
T  36740 aaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcacca 36839  T
Q  187 gaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatc 285  Q
    ||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36840 gaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatc 36938  T
Q  286 aacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctac 384  Q
    |||||  || || | | ||||||| ||||| |  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36939 aacggatatatggataacactgagcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctac 37038  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatc---- 478  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||        
T  37039 gctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 37138  T
Q  479 --aggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcac 551  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  37139 aaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctctttcac 37214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 481
Target Start/End: Original strand, 47374 - 47771
Alignment:
Q  89 aaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcacca 186  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||  ||||||    
T  47374 aaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcacca 47473  T
Q  187 gaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatc 285  Q
    ||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47474 gaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatc 47572  T
Q  286 aacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctac 384  Q
    |||||  || || | | ||||||| ||||| |  || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47573 aacggatatatggataacactgagcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctac 47672  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaa-atgttc-tttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47673 gctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcagg 47771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 58848 - 58313
Alignment:
Q  33 tttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------------aagtgc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||                    ||||||    
T  58848 tttcaataggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagatataaagtgcttctgaagttacaagtgc 58749  T
Q  113 ttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaattta 212  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |    
T  58748 ctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcaaaagcaagatttcatcagatgctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattca 58649  T
Q  213 aactgaagattcaaagtagctgt---ttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgag 309  Q
    | |||||   ||| |  ||||||   |||  |||  ||||| |||||  ||| ||||  ||  ||| ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  58648 atctgaaatctcataagagctgtctctttaagtt--aacctcgtctaagagagcgaacgatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaaagcactggg 58551  T
Q  310 tacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 409  Q
    | ||||| | || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  58550 tgcttgttcctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctg 58452  T
Q  410 cttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaagg 503  Q
    | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  58451 cctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 58352  T
Q  504 aactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgt 542  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  58351 aactcaacgactctttagtcgtgctaaagatctcaacgt 58313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 162 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1044 - 654
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgt-ttcaaccttgtctagaag 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||| | |||||||  |||||| | | |  || ||||| |||||  ||    
T  1044 ttcatcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctcttgaatttaacctcgtctaagag 945  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  944 agcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 846  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 460  Q
    |||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | || |||||    
T  845 ctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaattgttccttcaagataggaatgattttgaagttgatccttca 746  T
Q  461 aaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
     ||||||||| |||||||      | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  745 taggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactcaacgactctttaaacgtgcttaagatctcaacgtctct 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 162 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5424 - 5034
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgt-ttcaaccttgtctagaag 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||| | |||||||  |||||| | | |  || ||||| |||||  ||    
T  5424 ttcatcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctcttgaatttaacctcgtctaagag 5325  T
Q  261 aacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactac 360  Q
    | ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5324 agcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 5226  T
Q  361 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 460  Q
    |||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | || |||||    
T  5225 ctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaattgttccttcaagataggaatgattttgaagttgatccttca 5126  T
Q  461 aaggactacacccaaatc------aggattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
     ||||||||| |||||||      | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  5125 taggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactcaacgactctttaaacgtgcttaagatctcaacgtctct 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1102
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1132 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5512 - 5482
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5512 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 5482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1276 - 746
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  1276 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcacaggaacctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaa 1177  T
Q  120 gt------------------aatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaat 201  Q
    ||                  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  1176 gtttcaagtgcctctgaagaaatgacgtcatcagaagcagaagtc-atcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 1078  T
Q  202 cagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtt-tcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaag 300  Q
    ||| | ||| || |||||   |||||  || ||| | | |   | ||||| |||||  | | ||||  || |||| |||| |  ||||| |||||||||     
T  1077 cagaagattcaatctgaaatctcaaaagagttgtctcttgaagttaacctcgtctaagaaagcgaaagatcgaaagggagttgccaacgttcatttgaaa 978  T
Q  301 a-gcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagac 399  Q
    | |||||| || |||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||||     
T  977 aagcactgggtgcttgtcctttattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagat 879  T
Q  400 aacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtgga 493  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||      ||||| |||||||    
T  878 aacagctctgcctgcagaattgttcccacaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtgga 779  T
Q  494 tgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  778 tgatcaaaggaactcaacgactctttggacgtg 746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 259 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 2120 - 1828
Alignment:
Q  259 agaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccact 358  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2120 agaacgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccact 2022  T
Q  359 acctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 458  Q
    |||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  2021 acctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctt 1922  T
Q  459 caaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    || ||||||| | |||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1921 cataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgcttaaaatctcaacgtctct 1828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1433 - 1213
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1433 ttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 1334  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 525  Q
    || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333 ataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgt 1234  T
Q  526 gctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||| |  ||||||||||||||    
T  1233 gcttaaaatctcaacgtctct 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2409 - 2360
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2409 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaataaaagagagcaaaggaa 2360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2251 - 2176
Alignment:
Q  128 gtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2251 gtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 2176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2339 - 2309
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2339 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 2309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 2116 - 2424
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgagg- 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  2116 aagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaagc 2215  T
Q  121 ----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagt-----------------aagg-tttcatcagaagtgatatcatcacca 186  Q
                    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||                 |||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  2216 tgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagcccatcagaagtagaagcccatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcacta 2315  T
Q  187 gaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggaggtatc 285  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2316 gaagttacatttaatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagtagccgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatc 2415  T
Q  286 aacggtcat 294  Q
    |||||||||    
T  2416 aacggtcat 2424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 546
Target Start/End: Original strand, 58997 - 59539
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--------------------aa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||                    ||    
T  58997 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaaccatctgaagaaaattgcgtctgaagctatgaagtgcttctgaagttacaa 59096  T
Q  109 gtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaa 208  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||| | |    
T  59097 gtgcctctgaagttatgacgtcatcagaagcagaagttcatcaggagcaacatttcatcagaagctataccatcaccagaagctacagttgatcagaaga 59196  T
Q  209 tttaaactgaagattcaaagtagctgt-ttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactg 307  Q
    || || |||||   |||||  |||||| | ||      ||||| |||||  ||| ||||| ||  ||| | | ||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  59197 ttcaatctgaaatctcaaaagagctgtctcttgaagataacctcgtctaagagagcgaaggatcaaaaggaaagtgccaacgttcatttgaaaagcactg 59296  T
Q  308 agtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctc 407  Q
     || ||| | | || ||   ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  59297 ggttctttttcctcatt-gaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccattatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctc 59395  T
Q  408 tgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaa 501  Q
    ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||      |||||||||||||||||||||    
T  59396 tgcctgcagaattg-tccttcaagataggaatgaatttgaagttcatccttcataggactacacctaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaa 59494  T
Q  502 ggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  59495 ggaactcaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctct 59539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 143143 - 143031
Alignment:
Q  337 aaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaag-acaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||    
T  143143 aaagtacaagtgtacaaccactacctccactacttagtttttgtctatgctacaagaaaaaaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgg 143044  T
Q  436 gaatgaatttgaa 448  Q
    ||||| |||||||    
T  143043 gaatggatttgaa 143031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 6)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29703 - 29481
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  29703 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 29604  T
Q  432 atgggaatgaatttgaagctaattcttcaa-aggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacg 524  Q
    || ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  29603 ataggaatgaatttgaagttgatccttcaataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacaactgtttggacg 29504  T
Q  525 tgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||| ||  ||||||||||||||    
T  29503 tgctaaaaaatctcaacgtctct 29481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 36489 - 36577
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc-taaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36489 aatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcgtagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctga 36577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30041 - 29952
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30041 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaa---------aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 29952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29906 - 29831
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29906 tcatcagaagcaaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 29831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29945 - 29880
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||   |||||||||||    
T  29945 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaagttcatcagaag 29880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Original strand, 36599 - 36639
Alignment:
Q  123 atgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  36599 atgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttt 36639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 28824 - 29046
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaagtgtacaaccacta-cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  28824 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactatcctctacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctttaa 28923  T
Q  431 gatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag------gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacg 524  Q
    ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28924 gattggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacg 29023  T
Q  525 tgct-aatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||| ||  ||||||||||||||    
T  29024 tgctaaaaaatctcaacgtctct 29046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 407934 - 408099
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  407934 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctaaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 408033  T
Q  131 atcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctac 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  408034 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctac 408099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2865 - 2550
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2865 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaactcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 2766  T
Q  118 agg-----------------taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag----------taagg--------tttcatcagaagtgatatcatc 182  Q
    | |                 | ||||||||||||||||||||||  |||||||||          | |||        |||||||||||| || ||||||    
T  2765 aagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaagctcatcaggtgcaaggttttcatcagaagcgaaatcatc 2666  T
Q  183 accagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtct-agaagaacgaagaattgaaatggagg 281  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2665 accagaagctacaattgatttttaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagg 2566  T
Q  282 tatcaacggtcatttg 297  Q
    ||||||||||||||||    
T  2565 tatcaacggtcatttg 2550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 7228 - 7282
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctac-gctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7228 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttatgtctgctgctacaagacaa 7282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19722
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  19505 aggctagtcaagaaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaacgaattccaagcatctgaagaaaactactcctgaagctgaagtgcttctg 19604  T
Q  118 aggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaa--ggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaac 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |||  | || | ||||    
T  19605 aagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaac 19703  T
Q  216 tgaagattcaaagtagctg 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19704 tgaagattcaaagtagctg 19722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10113 - 10048
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  10113 gaagcatctgaagagaaatgcttctgaagtcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1102 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1102
Description:

Target: scaffold1102; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 2776 - 2879
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  2776 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaa 2875  T
Q  120 gtaa 123  Q
    ||||    
T  2876 gtaa 2879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 18895 - 19208
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaa-gcatctgaagaaaactgcgtct----------------- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||                     
T  18895 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 18994  T
Q  100 gaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaag---acca--------------tcagaagtaaggttt-catcagaagtgatatcat 181  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||              ||||||| ||||||| |||||||||  | |||||    
T  18995 gaagctgaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcaccagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcat 19094  T
Q  182 caccagaagctacaattaatcagtaaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatgga 279  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19095 caccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggga 19194  T
Q  280 ggtatcaacggtca 293  Q
    ||||||||||||||    
T  19195 ggtatcaacggtca 19208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 28289 - 28390
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttct 28388  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  28389 ga 28390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 285 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 61318 - 61123
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 384  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  61318 caacgttcattagaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctac 61220  T
Q  385 gctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  61219 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 61123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 212393 - 212321
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  212393 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3951 - 3898
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa 71  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3951 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgtagagcaaaggaa 3898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 70027 - 69840
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  70027 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaag 69928  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgt 316  Q
     ||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  69927 gagctgtttttcgttataacctcgtctgagagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttaaaaagcactgggtgcttgt 69840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 70171 - 70087
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70171 aagttaataaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaacccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta 70087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 285 - 546
Target Start/End: Original strand, 17820 - 18089
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 383  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  17820 caacgttcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttcattg--agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtcta 17917  T
Q  384 cgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag-- 480  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||      
T  17918 cgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacatccaaatcaggc 18017  T
Q  481 ----gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgct--aatcatctcaacgtctct 546  Q
        ||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  18018 aaaagatcaatggtgaatgatcaaaggttctcaacgactttatagacgtgcttaaaagatctcaacgtctct 18089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 2802 - 2883
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  2802 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaataatgttc 2883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 17515 - 17559
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17515 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15297 - 15127
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15297 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctgtatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactgaagtttcaaag 15198  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaa 299  Q
     ||||||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  15197 gagctgtttttcattttaacctcgtttaagagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaa 15127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15441 - 15343
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  15441 aagttaatcaatttcaatagttcttggaagaacaatagagagcaaagtaatctaaagcatctgaagaaaactgcttctgaagctatgaagtgcttctga 15343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5152 - 5052
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctg 117  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5152 aggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcatctgaagctaaagtgcttctg 5053  T
Q  118 a 118  Q
    |    
T  5052 a 5052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 1
Alignment:
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  176 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaag 77  T
Q  229 tagctgtttttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagca 304  Q
     ||||||||||||||  | ||| |||||  ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  76 gagctgtttttcgttatatcctcgtctaagagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 238
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  320 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagc 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5169 - 5018
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5169 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcgtgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 5070  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  5069 agataggaatggatttgaacatgattcttcataggacaacatccaaatcagg 5018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 8603 - 8717
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa---ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||| |  ||||||    
T  8603 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagccaaactgctcctgaagagatgacg 8702  T
Q  129 tcatcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||||    
T  8703 tcatcagaagcagaa 8717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 5525 - 5467
Alignment:
Q  15 cataggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5525 catagacaagttgatcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 20436 - 20586
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| || ||||    
T  20436 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaaatg-tccttca 20534  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20535 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 426 - 546
Target Start/End: Original strand, 38120 - 38246
Alignment:
Q  426 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 519  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38120 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttt 38219  T
Q  520 agacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  38220 agacgtgctaaagatctcaacgtctct 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 372
Target Start/End: Original strand, 4221 - 4568
Alignment:
Q  31 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaa-agtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||| |||||||||||  ||  |||||| | | ||||||||||| || ||||||    
T  4221 aatttcaacaagtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaaatcctaagcgtctgaagaaaaacgctcctgaagttcagagtgcttctgaagtgatgacg 4320  T
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtga--tatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||  |  |||| |||||||||||| || || |||  | |||  |||||||||||||    
T  4321 tcatcagaagcagaagatcattagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattc 4419  T
Q  225 aaagtagctgtttttcgtttcaaccttgtcta-gaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgt 323  Q
    ||||||| ||  | ||  ||||  ||| || | ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  || || | ||||||||| |||||||  ||||    
T  4420 aaagtagatgaatctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaatcgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgt 4519  T
Q  324 tatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 372  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520 taatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22312 - 22030
Alignment:
Q  107 aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagta 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22312 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaac--ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaa 22216  T
Q  207 aatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcac 305  Q
     ||| ||  ||||| |||||| | ||||||| || |||| ||||| |||||  ||| ||||  | | ||| | |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22215 gattcaatttgaagtttcaaa-tggctgtttattggttttaacctcgtctaagagagcgaaagactcaaaggaaggtgtcaacgttcatttgaaaagcac 22117  T
Q  306 tgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 393  Q
    || || ||||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  22116 tgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 22030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 6053 - 6144
Alignment:
Q  29 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6053 tcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatctaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctatgaagtgcttctga 6144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 366
Target Start/End: Original strand, 6346 - 6426
Alignment:
Q  285 caacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 366  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| || ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6346 caacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 6426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 53581 - 53358
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 115  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| |||    
T  53581 aggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgtttc 53482  T
Q  116 tgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggttt--catcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaa 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||    
T  53481 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaa 53382  T
Q  214 actgaagattcaaagtagctgttt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  53381 actgaagatccaaagtagctgttt 53358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 20565 - 20700
Alignment:
Q  97 tctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaagg-tttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctaca 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20565 tctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 20664  T
Q  196 attaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtag 231  Q
     ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  20665 tttaatccatgtattcaaactgaagatccaaagtag 20700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 20465 - 20552
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20465 atttcaataggtcttggaagaataatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgcttctga 20552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 6581 - 6732
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6581 ttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 6680  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  6681 gaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 6732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Original strand, 6228 - 6273
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6228 atcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 6273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 61784 - 61633
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  61784 ttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctacaaaaatgttccttca 61685  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  61684 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 61633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Original strand, 224290 - 224370
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  224290 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtg 224370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 9674 - 9803
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta-aagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| ||||      
T  9674 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagtttcaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaaatttcatccgaagct 9773  T
Q  175 atatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9774 atatcatcaccagaagctacagttgatcag 9803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 420 - 546
Target Start/End: Original strand, 9908 - 10040
Alignment:
Q  420 tgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg------attactggtggatgatcaaaggaactcaacga 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||| || | ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908 tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactgcatctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaacga 10007  T
Q  514 ctctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10008 ctctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Original strand, 9604 - 9652
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaagga 70  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9604 aagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaagga 9652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1882
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  | |||||||| ||||    
T  1731 ttgacaaagtacgaagtttacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctaaaaaaatgttccttca 1830  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  1831 agataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcagg 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 7324 - 7185
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||     
T  7324 aagtgtacgaccactacctccacttctctgttttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaaagttccttcaagataggaatgg 7225  T
Q  442 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  7224 atttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 7185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17008 - 16858
Alignment:
Q  331 attgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttc 428  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  17008 attgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataaatgttccttc 16909  T
Q  429 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 479  Q
    |  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  16908 agaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatca 16858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 9144 - 9253
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9144 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtc 9243  T
Q  131 atcagaagca 140  Q
    ||||||||||    
T  9244 atcagaagca 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 994 - 1145
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  994 ttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttccttca 1093  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1094 taataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Original strand, 1187 - 1338
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1187 ttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttccttca 1286  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
      || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1287 taataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcagg 1338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 11812 - 11662
Alignment:
Q  332 ttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| || || ||||    
T  11812 ttgacaaagtacaaagtgtaaaaccactacctccactactctg-ttttgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaattgatccttca 11714  T
Q  430 agatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  11713 agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaactaccaaatcagg 11662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 38157 - 38294
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||| |    
T  38157 aagtgtacgaccactacctccactactctg-ttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccatcaaaataggaatgga 38255  T
Q  443 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  38256 tttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcagg 38294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Original strand, 17078 - 17191
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  17078 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtc 17177  T
Q  131 atcagaagcagaag 144  Q
    ||||||||||||||    
T  17178 atcagaagcagaag 17191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 165018 - 165099
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  165018 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttc 165099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 372
Target Start/End: Original strand, 6162 - 6278
Alignment:
Q  256 agaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaagtgtacaacc 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || | ||||||  | |||||||  || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6162 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacc 6261  T
Q  356 actacctccactactct 372  Q
    |||||||||||||||||    
T  6262 actacctccactactct 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Original strand, 6006 - 6103
Alignment:
Q  98 ctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaag--taaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagcta 193  Q
    ||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||   ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  6006 ctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 6103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 81821 - 81947
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaa---ggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  81821 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacg 81920  T
Q  129 tcatcagaagcagaagaccatcagaag 155  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  81921 tcatcagaagcagaaggtcatcagaag 81947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 163700 - 163601
Alignment:
Q  22 aagtcaatcaatttcaataggtcttggaa-gaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcta--aagtgcttctga 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  163700 aagttaatcaatttcaataggtcttggaaagaacaatagagagcaaaggaatttaaagcatctgaagaaaactacgtctgaagctatgaagtgcttctga 163601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 163554 - 163481
Alignment:
Q  130 catcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcag 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  163554 catcagaagca-aagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 163481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 163580 - 163530
Alignment:
Q  121 taatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagtaaggtttcatcagaag 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  163580 taatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaaag-ttcatcagaag 163530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 763 - 690
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  763 aagtgtacaatcactatctgcactactctgttttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 344 - 481
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4106
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatga 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||     
T  3967 aagtgtacgaccactacctccacttctctgtttttcgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaaaagttccttcaagataggaatgg 4066  T
Q  442 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 481  Q
    |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  4067 atttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcagg 4106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2108 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2108
Description:

Target: scaffold2108; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 72
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  145 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaggaattcatagcatctgaagaaaactgtgtctgaagct 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15775
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  15694 aagtgtacgaccactatctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttc 15775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16583 - 16518
Alignment:
Q  481 gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  16583 gattactggtggatgatcaaaggaactcaacgactcttttgacgtgctaaaaatctcaacgtctct 16518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 134 - 22
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  134 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 35  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  34 atcagaagcagaa 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Original strand, 948 - 980
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  948 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 18405 - 18517
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |  ||||||||    
T  18405 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtc 18504  T
Q  131 atcagaagcagaa 143  Q
    |||||||||||||    
T  18505 atcagaagcagaa 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9516 - 9281
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt-ttcgtttcaaccttgtctagaag 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||| |||  | |||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||  ||||  |     
T  9516 ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgattagtagattctacctgaagtttcaaa-tagctgtttattggattcaacctcatctaagaa 9418  T
Q  261 aacgaagaattgaaatgga-ggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagaattgacaaagtacaa-gtgtacaaccact 358  Q
    | ||||  | | ||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| || || |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9417 agcgaaagact-aaatggaaggtgccaacgttcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttcattg--agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccact 9321  T
Q  359 acctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9320 acctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaaga 9281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 9698 - 9654
Alignment:
Q  28 atcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9698 atcaattt-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 9654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3343 - 3256
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  3343 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttctttcaa 3256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 481
Target Start/End: Original strand, 1114 - 1214
Alignment:
Q  381 ctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcag 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  1114 ctacgctacaagacaagataacagctctgtctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcag 1213  T
Q  481 g 481  Q
    |    
T  1214 g 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10008 - 9954
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10008 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 34876 - 34930
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34876 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 34930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 25737 - 25842
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||  |||||  |||||| | |    
T  25737 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaagcagctctgcctgcatcaatgtttattcaaattgggaacgca 25836  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  25837 tttgaa 25842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 1771 - 1876
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| |    
T  1771 aagtgtacaaccactaccttcactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 1870  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  1871 tttgaa 1876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 1869 - 1950
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  1869 aagtgtacgaccactacctccactactttgtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttc 1950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 17837 - 17909
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  17837 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 17909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9122
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  9194 aagtgtacaaccactatctccactactgtgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 27501 - 27573
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  27501 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgca 27573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 27236 - 27301
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  27236 gaagcatctgaagagaagtgcttctgaaggcaaagtgctcctgaagtgatgacatcatcagaagca 27301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 15811 - 15865
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15811 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 15865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 25471 - 25525
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25471 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 25525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22711 - 22661
Alignment:
Q  348 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22711 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 36847 - 36901
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36847 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 36901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42158 - 42104
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42158 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 42104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 21043 - 21097
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21043 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 21097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 99277 - 99331
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  99277 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 99331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37441 - 37387
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  37441 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 37387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 135501 - 135447
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  135501 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 135447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 211437 - 211334
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  211437 aagtatacaactactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttca--atgggaatgca 211340  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  211339 tttgaa 211334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 397
Target Start/End: Original strand, 377630 - 377684
Alignment:
Q  343 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  377630 caagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 377684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 376
Target Start/End: Original strand, 244356 - 244388
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244356 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 244388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 220556 - 220492
Alignment:
Q  75 gaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    ||||| ||||||||||| |||  |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  220556 gaagcgtctgaagaaaagtgctcctgaag-tcaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagca 220492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 90127 - 90181
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  90127 aagtgtacaacccctacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 90181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Original strand, 89812 - 89845
Alignment:
Q  40 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatc 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  89812 aggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatc 89845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14687 - 14606
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  14687 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttc 14606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19070 - 18965
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||   |||||| |||   ||||||||| |    
T  19070 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgctacaagaaaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcgcaatgggaatgga 18971  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  18970 tttgaa 18965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 22203 - 22275
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22203 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9599 - 9532
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||    
T  9599 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgc 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1699 - 1618
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  1699 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctagaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttc 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 5991
Alignment:
Q  346 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6043 gtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 2763 - 2815
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2763 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaa 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 2519 - 2584
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaag-ctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2519 aagcgtctgaagaaaactgcttctgaagtctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 2584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7348
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  7420 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 4
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaa-tccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  91 atttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgcttctga 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 378
Target Start/End: Original strand, 31851 - 31890
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31851 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Original strand, 78438 - 78533
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaa 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||    
T  78438 aagtgtacaaccactacctacactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaa 78533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 727 - 765
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 1827 - 1880
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  1827 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctttgcaacaagacaag 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 1578 - 1637
Alignment:
Q  81 tctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1578 tctgaagaaaactgctacagaagacaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 140
Target Start/End: Original strand, 480 - 544
Alignment:
Q  76 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagca 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  480 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Original strand, 379 - 417
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7742 - 7639
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||| |    
T  7742 aagtgtacaaccactacctccactactcag--tttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 7645  T
Q  443 tttgaa 448  Q
    ||||||    
T  7644 tttgaa 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 60842 - 60761
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| | | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  60842 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctcttctacaagacatgaaaaacagctctgcctgcaacaatgttc 60761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9945 - 9873
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  9945 aagtgtacaaccactacctgcactactctgtttttatctctgctacaaaacaaggaaaacagctctgcctgca 9873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 6812 - 6884
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  6812 aagtgtacaaccactacctccagtactctatttttgtctctgctacaacacaagaaaaacagctctgcatgca 6884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1657
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  1729 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Original strand, 87672 - 87724
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 396  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  87672 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagacaa 87724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2918
Alignment:
Q  349 tacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatgaatttgaa 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||   ||| || ||||  ||||||||| |||||||    
T  3016 tacaaccactacctccactactctatttttgtccctgctacaagacaa-aaaacagctctgcctgcaacgatgctccttcacaatgggaatgcatttgaa 2918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 10180 - 10247
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | |||||||||||    
T  10180 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgc 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 14844 - 14911
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | |||||||||||    
T  14844 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgc 14911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 84429 - 84362
Alignment:
Q  349 tacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  84429 tacaaccactacctccactactcagtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 84362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 409
Target Start/End: Original strand, 893 - 958
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctg 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  893 aagtgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctg 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9995 - 9909
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttctttca 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||    
T  9995 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtcgctgctacaagacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttcattca 9909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13610 - 13557
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  13610 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 5019 - 5091
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcttgca 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||   ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  5019 aagtgtacaaccactacctccattaccatgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacaactctgcttgca 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 5397 - 5469
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgca 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  5397 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagaaaaggataacagctctgcctgca 5469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 103611 - 103543
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac-gctacaagacaag-acaacagctctgc 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  103611 aagtgtgcaaccactacctccactactttgtttttttcttctgctacaagacaagaaaaacagctctgc 103543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 18693 - 18760
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgc 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||| || |||||||||||    
T  18693 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctggtacaagacaaggataacagctctgc 18760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6046 - 5992
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 398  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||    
T  6046 aagtgtacaaccactacctctactactctatttgtgtctctgctacaggacaaga 5992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10506
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10474 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23128 - 23054
Alignment:
Q  18 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaatccgaagcatctgaagaaaac 92  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||  |||| | |||||||||||||||||    
T  23128 aggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaagaaatagaattccaagcatctgaagaaaac 23054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40676 - 40638
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40676 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttatgtct 40638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 144949 - 144911
Alignment:
Q  339 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144949 agtacaattgtacatccactacctccactactctgtttt 144911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1900 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1900
Description:

Target: scaffold1900; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 1194 - 1255
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatggagag-caaaggaatccgaagcatctgaagaaaac 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  1194 atttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1356 - 1323
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1356 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Original strand, 55 - 88
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1310
Alignment:
Q  388 acaagacaagacaa-cagctctgcttgcagaaatgttctttcaagatgggaatg 440  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1363 acaagacaagaaaaacagctctgcatgcagaaatgttccttcaagataggaatg 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12248 - 12195
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||  |||||||||||||    
T  12248 aagtgtacaaccactatctccactactcagattgtgtctctgctacaagacaag 12195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 397
Target Start/End: Original strand, 5762 - 5815
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 397  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  5762 aagtgtacaactactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 5815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5666 - 5633
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5666 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttt 5633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11664 - 11631
Alignment:
Q  106 aaagtgcttctgaggtaatgacgtcatcagaagc 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11664 aaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagc 11631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 60055 - 59974
Alignment:
Q  344 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagctctgcttgcagaaatgttc 424  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  60055 aagtgtacaaccactatctcttctactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttc 59974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2082 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2082
Description:

Target: scaffold2082; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 31
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  59 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 31  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1390 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1390
Description:

Target: scaffold1390; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 1862 - 1890
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1862 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 1890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1212 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1212
Description:

Target: scaffold1212; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 53 - 25
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 4960 - 4988
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4960 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 4035 - 4063
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 4063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 20318 - 20346
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20318 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 20346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31 - 3
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Original strand, 34816 - 34844
Alignment:
Q  32 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34816 atttcaataggtcttggaagaacaatgga 34844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University