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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19851_low_3 (Length: 531)
Name: NF19851_low_3
Description: NF19851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19851_low_3 |
 |  |
|
| [»] chr7 (164 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (136 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (100 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0372 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0349 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (173 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (158 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (222 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (120 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0061 (3 HSPs) |
 |  |
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| [»] chr8 (100 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0028 (8 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0029 (6 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0525 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (11 HSPs) |
 |  |
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| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0012 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0676 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0157 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0293 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1852 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0486 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0200 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0013 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0575 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0003 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0431 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0205 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0089 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0299 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0744 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0572 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0371 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0216 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0070 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0043 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0052 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0585 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0096 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0042 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0155 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0166 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0111 (7 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0259 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0144 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0233 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0019 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0546 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0130 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0142 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0140 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0017 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1552 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0074 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0242 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0126 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0055 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0284 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0553 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0133 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0601 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0235 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0484 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0405 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0228 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0256 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0231 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0036 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0780 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0697 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0494 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0229 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0156 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0656 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0051 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0278 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0292 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0452 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0358 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0207 (7 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0203 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0621 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0324 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1873 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0301 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0415 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0015 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0217 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0102 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0146 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0040 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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|
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 |  |  |
|
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|
| [»] scaffold0598 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0556 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0161 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0113 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0064 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0311 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0145 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0093 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0081 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0056 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1655 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0718 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0639 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0490 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0439 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0351 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0114 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1276 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0615 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0412 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0280 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0171 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0073 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0819 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0671 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0297 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0149 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0121 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0101 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0088 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 12704905 - 12705437
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12704905 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
12705004 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12705005 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
12705104 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12705105 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
12705204 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12705205 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
12705304 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta |
498 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12705305 |
catctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta |
12705404 |
T |
 |
| Q |
499 |
agatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12705405 |
aaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
12705437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 32967 - 32445
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32967 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattgaaatgatga |
32868 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32867 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
32768 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32767 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
32668 |
T |
 |
| Q |
301 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatca |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32667 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatca |
32568 |
T |
 |
| Q |
401 |
tctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32567 |
tccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa |
32477 |
T |
 |
| Q |
500 |
gatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32476 |
aatattgctacgttgtttaaaatattgattat |
32445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 71011 - 71537
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
71011 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg |
71110 |
T |
 |
| Q |
97 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71111 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
71210 |
T |
 |
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71211 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
71310 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71311 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt |
71410 |
T |
 |
| Q |
397 |
atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga |
495 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71411 |
atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga |
71501 |
T |
 |
| Q |
496 |
ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
71502 |
ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
71537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75646
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
75120 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg |
75219 |
T |
 |
| Q |
97 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
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296 |
Q |
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T |
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396 |
Q |
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T |
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495 |
Q |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #5
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Target Start/End: Complemental strand, 16114101 - 16113577
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398 |
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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16117254 - 16116730
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Target: chr7; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 12718528 - 12718004
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398 |
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aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 1 - 531
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Q |
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 |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
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 |
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catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
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Q |
| |
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T |
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aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 15083860 - 15083499
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Target: chr7; HSP #14
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Target: chr7; HSP #15
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T |
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Target: chr7; HSP #17
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tatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Target: chr7; HSP #22
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1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26292255 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtatgacttgactgtgctactggtgttatttaactaagtgcctgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
26292156 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26292155 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacgatgtcttgttgttaagagtcaatgcatagcatttcattgagctttg |
26292056 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacg-attaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26292055 |
tcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
26291996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12714724 - 12714487
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12714724 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
12714625 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12714624 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
12714525 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12714524 |
tgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacg |
12714487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 6017190 - 6017499
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6017190 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
6017289 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6017290 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
6017379 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6017380 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
6017479 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6017480 |
tggtaccacatgcatataag |
6017499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9410003 - 9409727
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgat |
130 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9410003 |
tgtgacatgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcgtaatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgtt |
9409906 |
T |
 |
| Q |
131 |
gatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtc |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9409905 |
gatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcttcaccacgattattaggagctttgtc |
9409815 |
T |
 |
| Q |
227 |
ctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9409814 |
ctccgcacgatttatttggagctttgtcctccgtacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
9409727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 20117 - 20419
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20117 |
aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga |
20211 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20212 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta |
20301 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20302 |
gtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
20401 |
T |
 |
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20402 |
gtaccacatgcatataag |
20419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 11232344 - 11232606
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11232344 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgactgtatgta--atgaataagatgacatttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt |
11232433 |
T |
 |
| Q |
143 |
acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11232434 |
acgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttt |
11232532 |
T |
 |
| Q |
240 |
a--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11232533 |
ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
11232606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13569957 - 13569678
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13569957 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaatttttggat |
13569858 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13569857 |
gcatgtcgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgtatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
13569767 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13569766 |
tttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata |
13569678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 11239031 - 11239293
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11239031 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgactgtatgta--atgaataagataacatttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt |
11239120 |
T |
 |
| Q |
143 |
acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttt |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11239121 |
acgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccacacgtttt |
11239219 |
T |
 |
| Q |
240 |
a--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239220 |
ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
11239293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1347548 - 1347291
Alignment:
| Q |
49 |
ctgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1347548 |
ctgctgttatttaactaagtgcatgatgattgtatgta--atgaataagatgacatttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgat |
1347459 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--gg |
242 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1347458 |
gattacg-tgttttgttgttaagagttcatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg |
1347360 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1347359 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
1347291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18531329 - 18531027
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18531329 |
aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga |
18531235 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18531234 |
cgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta |
18531145 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18531144 |
gttctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
18531045 |
T |
 |
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18531044 |
gtaccacatgcatataag |
18531027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20703085 - 20703298
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20703085 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
20703175 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20703176 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20703275 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20703276 |
gattggtaccacatgcatataag |
20703298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13149124 - 13148932
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13149124 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
13149029 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13149028 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
13148932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Original strand, 16907561 - 16907718
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| Q |
79 |
tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatg |
178 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16907561 |
tatatatattatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatg |
16907660 |
T |
 |
| Q |
179 |
catagcatttcattgagctttgtcctcaccacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16907661 |
catagcatttcattgagctttgtcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacg |
16907718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32767686 - 32767473
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
32767686 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
32767596 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32767595 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
32767496 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32767495 |
gattggtaccacatgcatataag |
32767473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15728294 - 15728109
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15728294 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc |
15728198 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15728197 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
15728109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 382 - 531
Target Start/End: Original strand, 7519669 - 7519818
Alignment:
| Q |
382 |
agttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaa |
481 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7519669 |
agttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaa |
7519768 |
T |
 |
| Q |
482 |
ttatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7519769 |
ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
7519818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7536249 - 7535965
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7536249 |
tgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattgg |
7536152 |
T |
 |
| Q |
122 |
atgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---gg |
217 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7536151 |
atgcttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagttcatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattagg |
7536062 |
T |
 |
| Q |
218 |
agctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7536061 |
agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag |
7535965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18425448 - 18425284
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18425448 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattatggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
18425349 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18425348 |
gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
18425284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18556942 - 18556756
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18556942 |
tgattaagatgttttgttgtttagcgtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
18556845 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18556844 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatt |
18556756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18176115 - 18175902
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18176115 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg |
18176025 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18176024 |
agcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
18175925 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18175924 |
gattggtaccacatgcatataag |
18175902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 44786578 - 44786783
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
44786578 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
44786668 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44786669 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
44786768 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
44786769 |
ccacatgcatataag |
44786783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 44793219 - 44793424
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
44793219 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
44793309 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44793310 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
44793409 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
44793410 |
ccacatgcatataag |
44793424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14216855 - 14216709
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216855 |
ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
14216757 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14216756 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
14216709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14959215 - 14958952
Alignment:
| Q |
38 |
tgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatg |
136 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14959215 |
tgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg |
14959118 |
T |
 |
| Q |
137 |
ttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14959117 |
atgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacg |
14959030 |
T |
 |
| Q |
236 |
ttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14959029 |
attattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14958952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 341
Target Start/End: Original strand, 16724766 - 16724958
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
16724766 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatacattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagccttgtcctccacaggttttcggagc |
16724862 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
341 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16724863 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
16724958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 341
Target Start/End: Original strand, 17701780 - 17701972
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
17701780 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatacattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagccttgtcctccacaggttttcggagc |
17701876 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
341 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17701877 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
17701972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 332 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20487323 - 20487133
Alignment:
| Q |
332 |
atttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctat |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20487323 |
atttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccat |
20487224 |
T |
 |
| Q |
432 |
gtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
20487223 |
gtgttgttaaagaagtacctatgaagatta---------tatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttatctatgatattgattat |
20487133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11262387 - 11262117
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11262387 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
11262290 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11262289 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
11262202 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11262201 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag |
11262117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 18164768 - 18164981
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18164768 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
18164858 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18164859 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
18164958 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18164959 |
gattggtaccacatgcatataag |
18164981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18182787 - 18182574
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18182787 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttattcataagtgtccatgcatagcatctcattg |
18182697 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18182696 |
agcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
18182597 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18182596 |
gattggtaccacatgcatataag |
18182574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 14655520 - 14655725
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
14655520 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
14655610 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14655611 |
cctcaccacgattactaggagctttgtcctccgcacgttatataggagctttgtcctccgaacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
14655710 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
14655711 |
ccacatgcatttaag |
14655725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11366200 - 11365996
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11366200 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt------ttgtgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
11366107 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11366106 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
11366007 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
11366006 |
acatgcatata |
11365996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12692554 - 12692284
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12692554 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttttttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtctagctccaaattattggatgcatat |
12692457 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12692456 |
tgatatgatgattacgatgatt---------tgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagctttgtcct |
12692369 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12692368 |
ctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
12692284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Original strand, 23519974 - 23520282
Alignment:
| Q |
2 |
attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt--gca-tgatgtctatatatatgatgaaa-tga |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||| || | | ||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
23519974 |
attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatactgctgctgttatttaactgagtatgcaatgttatatatgaatataatgaaaatga |
23520073 |
T |
 |
| Q |
98 |
tgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagct |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23520074 |
tgacgtttagcttcaagttattgaatgcaca---------tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct |
23520164 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23520165 |
tagtcctcaccacgttttattaggatctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgat |
23520264 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23520265 |
tggtaccacatgcatata |
23520282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 60772 - 60985
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
60772 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
60862 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60863 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
60962 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60963 |
gattggtaccacatgcatataag |
60985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12714530 - 12714405
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12714530 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
12714431 |
T |
 |
| Q |
317 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12714430 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
12714405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 40523456 - 40523669
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
40523456 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcagagcatatcattg |
40523546 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40523547 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
40523646 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40523647 |
gattggtaccacatgcatataag |
40523669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 15162925 - 15163127
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15162925 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
15163016 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15163017 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
15163116 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15163117 |
acatgcatata |
15163127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 4318586 - 4318867
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4318586 |
tgttatgtgacttgactatgatgctactgttatttaactaagtgcataatgtctatatgt--gaagaataagatgacgtttagctccaaattattggatg |
4318683 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagc |
220 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4318684 |
catattgatatg---------atgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagc |
4318773 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4318774 |
tttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
4318867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8917375 - 8917212
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
8917375 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagcttagtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
8917279 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8917278 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
8917212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 9511107 - 9511319
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9511107 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
9511196 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9511197 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
9511296 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9511297 |
gattggtaccacatgcatataag |
9511319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
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94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12703504 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
12703593 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12703594 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
12703693 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12703694 |
gattggtaccacatgcatataag |
12703716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 16407399 - 16407603
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| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16407399 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttattcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
16407490 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16407491 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
16407590 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
16407591 |
acatgcatataag |
16407603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49051381 - 49051169
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
49051381 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
49051292 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49051291 |
agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
49051192 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49051191 |
gattggtaccacatgcatataag |
49051169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15022083 - 15021905
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15022083 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
15021984 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15021983 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15021905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 11554909 - 11555180
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11554909 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattgttggatgcatat |
11555006 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11555007 |
tgatatgaagattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcagtagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
11555094 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11555095 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
11555180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26420058 - 26419788
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26420058 |
tgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
26419961 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26419960 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gcgtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
26419873 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26419872 |
ccacacgattattaggagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
26419788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21636 - 21458
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21636 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
21537 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21536 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
21458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 8202226 - 8202404
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8202226 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
8202325 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8202326 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
8202404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8705951 - 8705782
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8705951 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
8705852 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8705851 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
8705782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13461730 - 13461545
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
13461730 |
tgattaaggtgatttgttgattagagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccttgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagc |
13461634 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13461633 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgttttgtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
13461545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14330753 - 14330584
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--g |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14330753 |
tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag |
14330654 |
T |
 |
| Q |
242 |
gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14330653 |
gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14330584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14337337 - 14337168
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--g |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14337337 |
tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag |
14337238 |
T |
 |
| Q |
242 |
gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14337237 |
gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14337168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 15156274 - 15156476
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15156274 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
15156365 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15156366 |
tcaccatgaataatagaagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
15156465 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15156466 |
acatgcatata |
15156476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 11548313 - 11548584
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11548313 |
tgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattgttggatgcatat |
11548410 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11548411 |
tgatatgaagattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcagtagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
11548498 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11548499 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
11548584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18301871 - 18301685
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18301871 |
attggtaccacatacatataagaggttttggttgcattgttgtatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt |
18301772 |
T |
 |
| Q |
389 |
gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
18301771 |
aatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacacgatgttcatga |
18301685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 18553682 - 18553851
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18553682 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtacatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
18553781 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18553782 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
18553851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 217 - 352
Target Start/End: Original strand, 7519531 - 7519664
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7519531 |
gagctttgtcctccgcacgat--aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
7519628 |
T |
 |
| Q |
317 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgtt |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7519629 |
aagttgcattgtcgcatctgtcaagtcaaagtcgtt |
7519664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13691094 - 13690892
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13691094 |
ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
13691003 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13691002 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
13690903 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
13690902 |
acatgcatata |
13690892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 387
Target Start/End: Original strand, 14932954 - 14933155
Alignment:
| Q |
191 |
ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga-cg |
289 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
14932954 |
ttgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagag |
14933050 |
T |
 |
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc-aaag-----tcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14933051 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaa |
14933150 |
T |
 |
| Q |
383 |
gttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
14933151 |
gttgt |
14933155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 387
Target Start/End: Original strand, 15356389 - 15356590
Alignment:
| Q |
191 |
ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga-cg |
289 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
15356389 |
ttgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagag |
15356485 |
T |
 |
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc-aaag-----tcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15356486 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaa |
15356585 |
T |
 |
| Q |
383 |
gttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
15356586 |
gttgt |
15356590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 387
Target Start/End: Original strand, 15360503 - 15360704
Alignment:
| Q |
191 |
ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga-cg |
289 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
15360503 |
ttgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagag |
15360599 |
T |
 |
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc-aaag-----tcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaa |
382 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15360600 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaa |
15360699 |
T |
 |
| Q |
383 |
gttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
15360700 |
gttgt |
15360704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6801157 - 6800990
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
6801157 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacatgat--aggagctttgtcctccgcacgattaaagta |
6801062 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6801061 |
tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatttaagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
6800990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13684463 - 13684261
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13684463 |
ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcacaagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
13684372 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13684371 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaaacatattaatacttatgatgacgattggtacc |
13684272 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
13684271 |
acatgcatata |
13684261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9593293 - 9593124
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
9593293 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctcccaacgattaaag |
9593198 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9593197 |
tatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
9593124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 16457494 - 16457676
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
16457494 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagcccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagc |
16457588 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16457589 |
tttgacctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataattgtctaagttgcattgtcgcatt |
16457676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 238 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16275396 - 16275304
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16275396 |
ttaggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcg |
16275304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16583204 - 16583031
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16583204 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctcaccacgatc--ggagctttgtcctccacacgattaaag |
16583108 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16583107 |
tatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatgtaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
16583031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35151517 - 35151425
Alignment:
| Q |
242 |
gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35151517 |
gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
35151425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 44408384 - 44408579
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44408384 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
44408481 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44408482 |
tgatat---------gatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccatga-taggagctttgtcct |
44408569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Original strand, 20579 - 20681
Alignment:
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20579 |
taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgatgattggtaccaaatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc |
20677 |
T |
 |
| Q |
339 |
gagt |
342 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20678 |
gagt |
20681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16907447 - 16907533
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16907447 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat |
16907533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 343
Target Start/End: Original strand, 15605449 - 15605603
Alignment:
| Q |
190 |
attgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15605449 |
attgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatg |
15605544 |
T |
 |
| Q |
287 |
acg-attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15605545 |
acgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
15605603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8712552 - 8712453
Alignment:
| Q |
212 |
attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8712552 |
attaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
8712453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10869534 - 10869301
Alignment:
| Q |
2 |
attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat----atgatgaaa-tg |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
10869534 |
attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagtatgcaatgtttatatatgaatataatgaaaatg |
10869435 |
T |
 |
| Q |
97 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10869434 |
atgacgttttgcttcaagttattgaatgcaca---------tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagc |
10869344 |
T |
 |
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10869343 |
ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg |
10869301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10875614 - 10875381
Alignment:
| Q |
2 |
attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat----atgatgaaa-tg |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
10875614 |
attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagtatgcaatgtttatatatgaatataatgaaaatg |
10875515 |
T |
 |
| Q |
97 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10875514 |
atgacgttttgcttcaagttattgaatgcaca---------tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagc |
10875424 |
T |
 |
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10875423 |
ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg |
10875381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14148656 - 14148531
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
14148656 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctat--atatgatgaataagatg |
14148559 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcat |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14148558 |
acgtttagctccaaattattggatgcat |
14148531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14953254 - 14953061
Alignment:
| Q |
33 |
tgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatg |
131 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14953254 |
tgacttgactatgctgcttctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg |
14953157 |
T |
 |
| Q |
132 |
atatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcc |
230 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14953156 |
atatgatgattacga---------tgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccatga-taggagctttgtcctcc |
14953069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12318075 - 12317901
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | || ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
12318075 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttatcctcacaacgaattg-agttttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
12317980 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12317979 |
aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
12317901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 14152160 - 14152334
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
14152160 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccactatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
14152255 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14152256 |
aagtatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgcattgtcgcatttgttgagtc |
14152334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12714413 - 12714300
Alignment:
| Q |
409 |
ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgtt |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |
|
|
| T |
12714413 |
ttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgct |
12714323 |
T |
 |
| Q |
509 |
atgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12714322 |
atgttgtttaagatattgattat |
12714300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24274875 - 24274797
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24274875 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgaggaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt |
24274797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14953085 - 14953013
Alignment:
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14953085 |
taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14953013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 235
Target Start/End: Original strand, 18585450 - 18585543
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18585450 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg |
18585543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 44408555 - 44408627
Alignment:
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44408555 |
taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
44408627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10869323 - 10869252
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10869323 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
10869252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10875403 - 10875332
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10875403 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
10875332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16585231 - 16585087
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16585231 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct |
16585132 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16585131 |
acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
16585087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 13635627 - 13635793
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13635627 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaag |
13635722 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13635723 |
tatattaatac-tatgatgacgattg----tctaagtataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
13635793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Original strand, 18585521 - 18585592
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18585521 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata |
18585592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15380671 - 15380606
Alignment:
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15380671 |
tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15380606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16579332 - 16579147
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16579332 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct |
16579233 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
516 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16579232 |
acccaggtgttgttatcgaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt |
16579147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Original strand, 2530548 - 2530631
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2530548 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctc |
2530631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 333
Target Start/End: Original strand, 9751984 - 9752079
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| Q |
241 |
ggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9751984 |
ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
9752079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
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Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16275461 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctctgcacg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 395
Target Start/End: Original strand, 15605866 - 15605934
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| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaat |
395 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
15605866 |
gtcgcatttgtcgagtcaaattcgttgttgatgaattatcatccatgagtttttgagttgttgatgaat |
15605934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16586330 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct |
16586429 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
516 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| ||||| | | |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16586430 |
acccaggtgttgttatcgaagtgctgatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt |
16586515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13918936 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #120
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Target Start/End: Complemental strand, 14257996 - 14257922
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cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14257996 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgaggaattgtcatccatgagttgt |
14257922 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20585279 - 20585201
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20585279 |
ttgtcgagtcaaagtcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
20585201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14257951 - 14257822
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350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacctatgtgttgttaa |
441 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14257951 |
gttgttgaggaattgtcatccatgagttgttaagttgttgacgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaa |
14257852 |
T |
 |
| Q |
442 |
agaagtacctacgaagattatacgatgttt |
471 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14257851 |
tgaagtgcttatgaagattatatgatgttt |
14257822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 311
Target Start/End: Original strand, 20871301 - 20871343
Alignment:
| Q |
269 |
atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20871301 |
atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
20871343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 347
Target Start/End: Original strand, 811467 - 811524
Alignment:
| Q |
291 |
ttggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
811467 |
ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
811524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8719367 - 8719315
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8719367 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagctt |
8719315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35151585 - 35151499
Alignment:
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35151585 |
gattaaggtgttttattgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattacgagctttgtcctccgcacg |
35151499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 15144356 - 15144415
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15144356 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
15144415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32300810 - 32300747
Alignment:
| Q |
407 |
agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32300810 |
agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtt |
32300747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44013968 - 44013909
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44013968 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
44013909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 12466473 - 12466551
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
12466473 |
ttgtcgaatcaaagtcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgtggatgagttgtcatacatgagttgt |
12466551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 15082317 - 15082370
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta |
381 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15082317 |
gtcgcacttgtcgagtcaaagtcgttg-tgatgaattatcatccatgagttgtta |
15082370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 15755278 - 15755336
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15755278 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
15755336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 16461500 - 16461553
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16461500 |
ttgttgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
16461553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18005435 - 18005376
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18005435 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcaagtcaaag |
18005376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 11996354 - 11996408
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
11996354 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
11996408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 16402762 - 16402816
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
16402762 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
16402816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 27848113 - 27848167
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27848113 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
27848167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40443248 - 40443194
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
40443248 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
40443194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8706081 - 8706020
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8706081 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
8706020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 14183819 - 14183872
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14183819 |
ttgtcgagtcaaagtcgtttttgattagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
14183872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15580596 - 15580552
Alignment:
| Q |
190 |
attgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15580596 |
attgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg |
15580552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 18553552 - 18553613
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18553552 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
18553613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 18585320 - 18585381
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18585320 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
18585381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24274826 - 24274789
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24274826 |
gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
24274789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26292063 - 26292018
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26292063 |
gagctttgtcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacgat |
26292018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32300858 - 32300805
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32300858 |
ttgttgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgt |
32300805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 67530 - 67470
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgca-tttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
67530 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcattttgtcgagtcaaag |
67470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15580620 - 15580523
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgat |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15580620 |
cattgagctttgtcctcaccacgaat-tgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaata-ttatgat |
15580525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 7519527 - 7519572
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7519527 |
cattgagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctccgcacg |
7519572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10588831 - 10588777
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
10588831 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
10588777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34200578 - 34200524
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
34200578 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatatttgcatttgtcgagtc |
34200524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21767 - 21702
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21767 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
21702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 8202095 - 8202156
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8202095 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
8202156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9703058 - 9703013
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9703058 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
9703013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15022214 - 15022149
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15022214 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
15022149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11858374 - 11858330
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11858374 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
11858330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12186812 - 12186768
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12186812 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
12186768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 12322062 - 12322116
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12322062 |
attggtaccacatgcataagag-gtctaagtttcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
12322116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14429680 - 14429625
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14429680 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
14429625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 15605717 - 15605853
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgat |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| || |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15605717 |
cattgagctttgttctcaccacgatttg-agttttgtcctcaccacgatt--ggag-tttgtcctcctcatgatgcttaaagtatattaatact-atgat |
15605811 |
T |
 |
| Q |
286 |
gacgatt-ggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcat |
325 |
Q |
| |
|
|| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15605812 |
gaagttttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat |
15605853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 17138384 - 17138428
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17138384 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
17138428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 18155163 - 18155207
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18155163 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
18155207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24054259 - 24054215
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24054259 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
24054215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 39268117 - 39268205
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg-----aaagtatattaatact |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39268117 |
gagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctcaccacgattt--gagctttgtcctcaccacgatgccttaaaagtatattaatact |
39268205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 15237081 - 15237612
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15237081 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
15237180 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15237181 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
15237280 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15237281 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
15237380 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15237381 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttg-tgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
15237479 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta |
498 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
15237480 |
catctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattgatta |
15237579 |
T |
 |
| Q |
499 |
agatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15237580 |
tgatattgttatgttgtttaacatattggttat |
15237612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20295707 - 20295235
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20295707 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
20295608 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20295607 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
20295508 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20295507 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcctcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
20295408 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20295407 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
20295308 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20295307 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
20295235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 19472966 - 19473353
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19472966 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
19473065 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19473066 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
19473165 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19473166 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
19473265 |
T |
 |
| Q |
301 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19473266 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc |
19473353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10752954 - 10752561
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10752954 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgg |
10752855 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10752854 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaaatatattaatacttatgatgacgattgg |
10752755 |
T |
 |
| Q |
295 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10752754 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa |
10752655 |
T |
 |
| Q |
395 |
ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat |
490 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10752654 |
ttatcatc--tgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat |
10752561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11230792 - 11230449
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11230792 |
ttcattgagctttgtcctgaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
11230694 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11230693 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg |
11230594 |
T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11230593 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
11230494 |
T |
 |
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11230493 |
tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
11230449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11220394 - 11220051
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11220394 |
ttcattgagctttgtcctgaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
11220296 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11220295 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg |
11220196 |
T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
486 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11220195 |
tcgatgaattatcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
11220096 |
T |
 |
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11220095 |
tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
11220051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11224980 - 11224637
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
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| T |
11224980 |
ttcattgagctttgtcctgaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
11224882 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
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| T |
11224881 |
acaattggtaccacatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgatttgttaagttg |
11224782 |
T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
486 |
Q |
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| T |
11224781 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
11224682 |
T |
 |
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11224681 |
tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
11224637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11228803 - 11228460
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11228803 |
ttcattgagctttgtcctgaccacaattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
11228705 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
11228704 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg |
11228605 |
T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
486 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11228604 |
tcgatgaattatcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctaggaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
11228505 |
T |
 |
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11228504 |
tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
11228460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 187 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 18355888 - 18355546
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18355888 |
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18355790 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18355789 |
aagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcgaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg |
18355690 |
T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
486 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
18355689 |
ttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattata |
18355590 |
T |
 |
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18355589 |
taaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta |
18355546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 40724029 - 40724385
Alignment:
| Q |
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264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40724029 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcttcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttagaagctttgtcctccgcacgatga |
40724127 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaatta |
364 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40724128 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatctgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaatta |
40724227 |
T |
 |
| Q |
365 |
tcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac |
464 |
Q |
| |
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|
| T |
40724228 |
tcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac |
40724327 |
T |
 |
| Q |
465 |
gatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40724328 |
---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat |
40724385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 187 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11226813 - 11226553
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11226813 |
ttcattgagctttgtcctgaccacgattaagagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
11226715 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11226714 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaagatcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg |
11226615 |
T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11226614 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagta |
11226553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 22325945 - 22326253
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgccgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatgatgaaatgatga |
22326044 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22326045 |
cgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
22326134 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22326135 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaagagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
22326234 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22326235 |
ggtaccacatgcatataag |
22326253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22352984 - 22352677
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22352984 |
aattaatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatattgt--attcatacgatgaaatgatga |
22352887 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22352886 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttag |
22352796 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352795 |
tcttcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
22352696 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352695 |
ggtaccacatgcatataag |
22352677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22343584 - 22343277
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22343584 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctattgctgttatttaactaagtgcatattgt--attcatacgatgaaatgatga |
22343487 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22343486 |
cgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttag |
22343396 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22343395 |
tcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgatgatt |
22343296 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22343295 |
ggtaccacatgcatataag |
22343277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19775009 - 19774726
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
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T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19774909 |
gcatgatgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagc |
19774819 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19774818 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19774726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 369
Target Start/End: Original strand, 20911375 - 20911550
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20911375 |
gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
20911473 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20911474 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc |
20911550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19768413 - 19768130
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19768413 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
19768314 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19768313 |
gcatgatgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctccgcacgattattaggagc |
19768223 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19768222 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19768130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 29471453 - 29471667
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29471453 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga--------attacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
29471544 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
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|
| T |
29471545 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
29471644 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29471645 |
gattggtaccacatgcatataag |
29471667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 15441974 - 15442280
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
15441974 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
15442071 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15442072 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacagtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
15442161 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15442162 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
15442261 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15442262 |
ggtaccacatgcatataag |
15442280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33409189 - 33409005
Alignment:
| Q |
156 |
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254 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33409189 |
tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagttttgtcctc |
33409093 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33409092 |
cgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctgagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
33409005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 21885325 - 21885518
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21885325 |
tgattaaggtggtttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
21885421 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21885422 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
21885518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 29478048 - 29478262
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
29478048 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga--------attacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattg |
29478139 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29478140 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
29478239 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29478240 |
gattggtaccacatgcatataag |
29478262 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24020328 - 24020067
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24020328 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtactt-tatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
24020230 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24020229 |
cgatgatt---------tgttcataagaatccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtactccgtacgattta |
24020139 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24020138 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa |
24020067 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22139700 - 22139487
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22139700 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtctatgcatagcatatcattg |
22139610 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22139609 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22139510 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22139509 |
gattggtaccacatgcatataag |
22139487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25406435 - 25406222
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25406435 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
25406345 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25406344 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
25406245 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25406244 |
gattggtaccacatgcatataag |
25406222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26172434 - 26172241
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26172434 |
tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgtattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
26172338 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26172337 |
tctgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
26172241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 14359837 - 14360143
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
14359837 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
14359934 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14359935 |
acgtttagctccaaactattggatgcatattgatatg---------atgattacggtggtttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
14360024 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttag---gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14360025 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattatgagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
14360124 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14360125 |
ggtaccacatgcatataag |
14360143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17284078 - 17283865
Alignment:
| Q |
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atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
17284078 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgtatagcatatcattg |
17283988 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17283987 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgatgac |
17283888 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17283887 |
gattggtaccacatgcatataag |
17283865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22133008 - 22132795
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22133008 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatattgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
22132918 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22132917 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22132818 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22132817 |
gattggtaccacatgcatataag |
22132795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22588106 - 22587893
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22588106 |
atgatgaagtttatctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
22588016 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22588015 |
agcttagtcctcaccatgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22587916 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22587915 |
gattggtaccacatgcatataag |
22587893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 17730543 - 17730728
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147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17730543 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc |
17730639 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17730640 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
17730728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 22062985 - 22063190
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102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
22062985 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
22063075 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22063076 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
22063175 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
22063176 |
ccacatgcatataag |
22063190 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24554593 - 24554320
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| Q |
31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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24554496 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24554495 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagctttgtcct |
24554408 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacg-----ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24554407 |
ccgcacgattatttttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 25229542 - 25229727
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| Q |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25229639 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 25293698 - 25293883
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| Q |
147 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25293698 |
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25293794 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25293795 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16674113 - 16673930
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| Q |
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254 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16674113 |
tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctctgcacgttt-aggagctttgtcctc |
16674018 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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cgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatacatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19991883 - 19991658
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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19991793 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19991792 |
tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
19991693 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19991692 |
acatgcatataagagtctaag-agcattgtcgcatt |
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T |
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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 21295310 - 21295580
Alignment:
| Q |
31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21295310 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
21295407 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21295408 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
21295495 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21295496 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
21295580 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 169 - 338
Target Start/End: Original strand, 21340924 - 21341091
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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21341020 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc |
338 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21341021 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattttcgcatttgtc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27516754 - 27516549
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
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27516664 |
T |
 |
| Q |
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cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27516663 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggta |
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T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
27516563 |
ccacatgcatataag |
27516549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27523391 - 27523186
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| Q |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
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gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
27523301 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27523300 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggta |
27523201 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
27523200 |
ccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37544042 - 37543837
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| Q |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
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gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
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T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37543951 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
37543852 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
37543851 |
ccacatgcatataag |
37543837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
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| Q |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40707033 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
40706934 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
40706933 |
ccacatgcatataag |
40706919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
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40713766 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
40713676 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40713675 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
40713576 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
40713575 |
ccacatgcatataag |
40713561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
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138 |
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233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca |
20775744 |
T |
 |
| Q |
234 |
cg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20775743 |
cgaatattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
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22328268 |
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T |
 |
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204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22328359 |
tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
22328458 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
22328459 |
acatgcatataag |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
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Target Start/End: Original strand, 37286886 - 37287089
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| |
|
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|
|
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37286886 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
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 |
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204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37286977 |
tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
37287076 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
37287077 |
acatgcatataag |
37287089 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37293589 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
37293679 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37293680 |
tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
37293779 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
37293780 |
acatgcatataag |
37293792 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
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| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
4036167 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaag |
4036070 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4036069 |
tatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
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41098407 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41098408 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
41098507 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41098508 |
gattggtaccacatgcatataag |
41098530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41769253 - 41769040
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41769253 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41769162 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
41769063 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41769062 |
gattggtaccacatgcatataag |
41769040 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41775827 - 41775614
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41775827 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41775736 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
41775637 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41775636 |
gattggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 24767898 - 24768046
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482 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24767898 |
gttgttgatgaattatcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
24767997 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24767998 |
tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
24768046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25535047 - 25534777
Alignment:
| Q |
31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25535047 |
tgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatat |
25534950 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25534949 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
25534862 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25534861 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
25534777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22264955 - 22264742
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22264955 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22264864 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22264765 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22264764 |
gattggtaccacatgcatataag |
22264742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27663884 - 27664097
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27663884 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
27663974 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27663975 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtccttcgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27664074 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27664075 |
gattggtaccacatgcatataag |
27664097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 22410749 - 22410917
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| Q |
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240 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22410749 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata |
22410848 |
T |
 |
| Q |
241 |
ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22410849 |
ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
22410917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23249948 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
23249859 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23249858 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23249759 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23249758 |
gattggtaccacatgcatataag |
23249736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 41294530 - 41294742
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41294530 |
atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatg----------tttttccataagagtccatgcatagcatctcattg |
41294619 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41294620 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgac |
41294719 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41294720 |
gattggtaccacatgcatataag |
41294742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16354799 - 16354621
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138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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16354799 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
16354700 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16354699 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
16354621 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
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| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16361458 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
16361359 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16361358 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
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94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34294647 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
34294737 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
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| T |
34294738 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
34294837 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34294838 |
gattggtaccacatgcatataag |
34294860 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 34564792 - 34564614
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234 |
Q |
| |
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||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
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tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
34564693 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34564692 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
34564614 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34571447 - 34571269
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| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34571447 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
34571348 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34571347 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
34571269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
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Target Start/End: Original strand, 15001784 - 15001986
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| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15001784 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
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T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15001876 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagcttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
15001975 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15001976 |
acatgcatata |
15001986 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 18038772 - 18038974
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| Q |
104 |
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18038772 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
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T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttag--gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18038864 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttatatgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
18038963 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18038964 |
acatgcatata |
18038974 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 22341707 - 22341910
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| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||| |
|
|
| T |
22341707 |
ttagctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgcccatgcatagcatctcattgagcatagtcc |
22341797 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22341798 |
tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
22341897 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
22341898 |
acatgcatataag |
22341910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 23337308 - 23337614
Alignment:
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1 |
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23337308 |
aattgatataatgatatcatcctattgttgtgttacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
23337405 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23337406 |
acgtttggctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacagtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctc |
23337495 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23337496 |
agtcctcaccgcgattattaggagctttgtactccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgttt |
23337595 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23337596 |
ggtaccacatgcatataag |
23337614 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33725868 - 33725657
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33725868 |
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33725778 |
T |
 |
| Q |
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288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
33725678 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33725677 |
gattggtaccacatgcatata |
33725657 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 17707025 - 17707237
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17707025 |
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17707114 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17707115 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
17707214 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17707215 |
gattggtaccacttgcatataag |
17707237 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Original strand, 22258626 - 22258800
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| Q |
141 |
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236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22258626 |
ttacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacga |
22258725 |
T |
 |
| Q |
237 |
tt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22258726 |
ttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
22258800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27608749 - 27608537
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27608659 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27608560 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27608559 |
gattggtaccacatgcatataag |
27608537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27670524 - 27670736
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27670524 |
atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
27670613 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27670614 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27670713 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27670714 |
gattggtaccacatgcatataag |
27670736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 21667956 - 21668125
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
21667956 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
21668055 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21668056 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23584149 - 23583936
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23584149 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
23584059 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23584058 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23583959 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23583958 |
gattggtaccacatgcatataag |
23583936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 24472342 - 24472554
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24472342 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
24472432 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttttag--gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24472433 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctt-gtcctccgcacgttttataagagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
24472531 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24472532 |
gattggtaccacatgcatataag |
24472554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25106738 - 25106560
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| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25106738 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
25106639 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25106638 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
25106560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25165831 - 25165653
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25165831 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
25165732 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25165731 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
25165653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27615355 - 27615143
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27615355 |
atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
27615266 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27615265 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27615166 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27615165 |
gattggtaccacatgcatataag |
27615143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Original strand, 14995141 - 14995340
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14995141 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
14995232 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14995233 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggaccttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
14995332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29316374 - 29316205
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
29316374 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacaattatt |
29316275 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29316274 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
29316205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 1692541 - 1692743
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
1692541 |
ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatcttattgagcttagtcc |
1692632 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1692633 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
1692732 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
1692733 |
acatgcatata |
1692743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42805389 - 42805199
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
42805389 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagc |
42805295 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42805294 |
tttgtcctccacacgattaaagtatattaataca-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
42805199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 20911531 - 20911679
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20911531 |
gttgttgatgaattatcatctattagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaaa |
20911630 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20911631 |
tatataatgttgactaagatatcgctatgttgtttaagatattgattat |
20911679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 27687433 - 27687635
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27687433 |
ttagctccaatttaatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
27687524 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27687525 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcatccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
27687624 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
27687625 |
acatgcatata |
27687635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18774151 - 18773982
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
18774151 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtccttcacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
18774056 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18774055 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
18773982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18783994 - 18783825
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
18783994 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
18783899 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18783898 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
18783825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20232497 - 20232330
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
20232497 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta |
20232402 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20232401 |
tattaatact-atgatgacgattggtatcacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
20232330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 26742883 - 26743065
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
26742883 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagc |
26742977 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26742978 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
26743065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 24767740 - 24767917
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24767740 |
cattgatctttgtcctcaccacgatc-ggagccttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa |
24767835 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc |
369 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24767836 |
gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgatgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc |
24767917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 26666290 - 26666457
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
26666290 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttatcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta |
26666385 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26666386 |
tattaatact-atgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
26666457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 26937887 - 26938054
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
26937887 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttatcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta |
26937982 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26937983 |
tattaatact-atgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
26938054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 19473315 - 19473454
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19473315 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaat |
19473405 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19473406 |
tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
19473454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 24533207 - 24533374
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| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
24533207 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgttt-ggagctttgtcctccatacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaaata |
24533302 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24533303 |
tattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatttgtcgagt |
24533374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 383 - 475
Target Start/End: Original strand, 22108009 - 22108101
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22108009 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
22108101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23609913 - 23609727
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23609913 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
23609823 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23609822 |
agcttagtcctcaccacgaata----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
23609745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23841309 - 23841123
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23841309 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
23841219 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23841218 |
agcttagtcctcaccacgaata----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
23841141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 23535769 - 23535894
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgt |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23535769 |
gagctttgtcctcaccacgatt--ggagcttcgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatcacgattgataccacatgcatataagggtgt |
23535865 |
T |
 |
| Q |
315 |
ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23535866 |
ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
23535894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Original strand, 27680923 - 27680993
Alignment:
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27680923 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27680993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Original strand, 20911327 - 20911417
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20911327 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
20911417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 388
Target Start/End: Original strand, 22107986 - 22108047
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22107986 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtc |
22108047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 387
Target Start/End: Original strand, 33896074 - 33896170
Alignment:
| Q |
291 |
ttggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
33896074 |
ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatt-gttgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaaattgt |
33896170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17410309 - 17410245
Alignment:
| Q |
280 |
tatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17410309 |
tatgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
17410245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21565331 - 21565272
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21565331 |
gattggtaccacaagcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
21565272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 22959862 - 22959921
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22959862 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcacagtcgcatttctcgagtcaaag |
22959921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 19661161 - 19661211
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcg |
339 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19661161 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcg |
19661211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20775974 - 20775909
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20775974 |
ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactgagt |
20775909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 22258492 - 22258553
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22258492 |
ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgttgttatttaact |
22258553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 22410619 - 22410680
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22410619 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
22410680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23201153 - 23201097
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
23201153 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
23201097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23511894 - 23511838
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
23511894 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
23511838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21873048 - 21873004
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21873048 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
21873004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21877328 - 21877284
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21877328 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
21877284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21887083 - 21887039
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21887083 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
21887039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9077751 - 9077693
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
9077751 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcaca-ttgtcgagtcaaag |
9077693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19668685 - 19668627
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19668685 |
gattggtacca-atgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
19668627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 23535745 - 23535810
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
23535745 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-ggagcttcgtcctccccacg |
23535810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1096265 - 1096211
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
1096265 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagt |
1096211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13025106 - 13025052
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
13025106 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttggatagttgcatttgtcgagtc |
13025052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13095290 - 13095236
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
13095290 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttggatagttgcatttgtcgagtc |
13095236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 21293296 - 21293350
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
21293296 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagtagcatagttgcatttgtcgagtc |
21293350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24493364 - 24493310
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
24493364 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
24493310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25421326 - 25421272
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25421326 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
25421272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37723693 - 37723643
Alignment:
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37723693 |
gtaccacatgcatataagatgtctaagctgcatattcgcatttgtcgagtc |
37723643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16354930 - 16354865
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16354930 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
16354865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16361589 - 16361524
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16361589 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
16361524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21366985 - 21367041
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21366985 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
21367041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25106869 - 25106804
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25106869 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
25106804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25165962 - 25165897
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25165962 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
25165897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29316504 - 29316443
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29316504 |
ttgatatattgatatatccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
29316443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 34564923 - 34564858
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34564923 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
34564858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 34571578 - 34571513
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34571578 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
34571513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 123416 - 123460
Alignment:
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
123416 |
gacgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta |
123460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14078943 - 14078899
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14078943 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
14078899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23458396 - 23458341
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23458396 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
23458341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23462657 - 23462602
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23462657 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
23462602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21407215 - 21406684
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21407215 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
21407116 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21407115 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
21407016 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21407015 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
21406917 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21406916 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagttaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
21406817 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta |
498 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21406816 |
catctatgagctgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta |
21406717 |
T |
 |
| Q |
499 |
agatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21406716 |
agaggttgctatgttgtttaacatgttgattat |
21406684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1010583 - 1010059
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1010583 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
1010484 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1010483 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
1010384 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1010383 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
1010284 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1010283 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
1010184 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1010183 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
1010093 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1010092 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
1010059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 52639401 - 52638930
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52639401 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
52639302 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52639301 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
52639202 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52639201 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
52639102 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52639101 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
52639002 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt |
469 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52639001 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt |
52638930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Original strand, 16375705 - 16376176
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16375705 |
aattgatatattgatatctctatattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatattatgaaatgatga |
16375804 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagc-atttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16375805 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagctatttcattgagcttt |
16375904 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16375905 |
gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca |
16376004 |
T |
 |
| Q |
300 |
catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16376005 |
catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatc |
16376104 |
T |
 |
| Q |
400 |
atctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16376105 |
atccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
16376176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Original strand, 20229447 - 20229785
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20229447 |
gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatatcaatacttatgatgacgatt |
20229546 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20229547 |
ggtaccacatgcatataaatgtttaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg |
20229646 |
T |
 |
| Q |
393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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20229746 |
T |
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493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
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tgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat |
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Target: chr1; HSP #6
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T |
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292 |
tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgat |
391 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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gaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatg |
491 |
Q |
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| T |
39244558 |
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39244657 |
T |
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492 |
ttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
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Target: chr1; HSP #7
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T |
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tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgat |
391 |
Q |
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tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgat |
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T |
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gaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatg |
491 |
Q |
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T |
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ttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
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T |
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367 |
Q |
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| T |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
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T |
 |
| Q |
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tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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267 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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20924879 |
T |
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gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
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Target: chr1; HSP #10
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T |
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392 |
Q |
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T |
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| Q |
393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
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| T |
41388659 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatggtgtgaattatatgat-- |
41388756 |
T |
 |
| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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| || ||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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--attattatgttgctatgttgtttaacatattgattat |
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Target: chr1; HSP #11
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T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg |
392 |
Q |
| |
|
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|
|
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ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcaattgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgata |
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T |
 |
| Q |
393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
|
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33796985 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacccatgtgttattaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagt |
33796886 |
T |
 |
| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |
|
|
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tgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Q |
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50887960 |
T |
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Q |
| |
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gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
50888060 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
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Q |
| |
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50888061 |
tggtaccacatgcatataag |
50888080 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
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gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
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Q |
| |
|
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|
|
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 |
| Q |
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tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 33392909 - 33393192
Alignment:
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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T |
 |
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124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33393009 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
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T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33393100 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
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Target Start/End: Original strand, 39244237 - 39244404
Alignment:
| Q |
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| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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39244237 |
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39244336 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 262
Target Start/End: Original strand, 39247792 - 39247959
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
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T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 21807241 - 21807524
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123 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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| T |
21807241 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggat |
21807340 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21807341 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
21807431 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21807432 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
21807524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21835431 - 21835148
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21835431 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggat |
21835332 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21835331 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
21835241 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21835240 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
21835148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 327 - 499
Target Start/End: Original strand, 41781872 - 41782044
Alignment:
| Q |
327 |
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426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41781872 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagctgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttcta |
41781971 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41781972 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
41782044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19104839 - 19104533
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
19104839 |
aattgatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatacata--atgaataagatg |
19104742 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19104741 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
19104652 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19104651 |
agtcctcaccacggttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
19104552 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19104551 |
ggtaccacatgcatataag |
19104533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19111496 - 19111190
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| |
|
|
| T |
19111496 |
aattgatataacgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatacata--atgaataagatg |
19111399 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19111398 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
19111309 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19111308 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
19111209 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19111208 |
ggtaccacatgcatataag |
19111190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 41388337 - 41388501
Alignment:
| Q |
95 |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41388337 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
41388436 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41388437 |
gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcatccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
41388501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8305223 - 8304923
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8305223 |
aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactgtgct---gctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga |
8305132 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8305131 |
cgtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta |
8305042 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8305041 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
8304942 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8304941 |
ggtaccacatgcatataag |
8304923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 20525234 - 20525540
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
20525234 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
20525331 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20525332 |
aagtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattattgtgttttgttgttaatagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
20525421 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20525422 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
20525521 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20525522 |
ggtaccacatgcatataag |
20525540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 20229325 - 20229489
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| Q |
95 |
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194 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20229325 |
tgatgacatttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcttagcatttcattga |
20229424 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20229425 |
gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
20229489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23763270 - 23763000
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23763270 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
23763173 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23763172 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
23763085 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23763084 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
23763000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21828724 - 21828511
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21828724 |
atgatgaattttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gcgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattg |
21828634 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21828633 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
21828534 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21828533 |
gattggtaccacatgcatataag |
21828511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 16345878 - 16346083
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
16345878 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
16345968 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16345969 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
16346068 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
16346069 |
ccacatgcatataag |
16346083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20138052 - 20137861
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| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
20138052 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttg-cctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagc |
20137958 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20137957 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
20137861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 41348955 - 41349160
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
41348955 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
41349045 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41349046 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
41349145 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
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||||||||||||||| |
|
|
| T |
41349146 |
ccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 51328782 - 51328987
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Q |
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||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
51328973 |
ccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 51335416 - 51335621
Alignment:
| Q |
102 |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
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T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
51335606 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
51335607 |
ccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 41356416 - 41356597
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230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc |
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T |
 |
| Q |
231 |
gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41356515 |
gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
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Target: chr1; HSP #34
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
16352526 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
16352616 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga----ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16352617 |
cctcaccacgaaaattaaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
16352716 |
T |
 |
| Q |
296 |
accacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
16352717 |
accacatgcatataag |
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T |
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Target: chr1; HSP #35
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
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18600210 |
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T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18600302 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
18600401 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
18600402 |
acatgcatataag |
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T |
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Target: chr1; HSP #36
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426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
22131454 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagctgtcatcta |
22131553 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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22131554 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
22131602 |
T |
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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
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Target Start/End: Original strand, 41478682 - 41478884
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203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41478682 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
41478773 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41478774 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
41478873 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
41478874 |
acatgcatata |
41478884 |
T |
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Target: chr1; HSP #38
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20216023 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
20216112 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20216113 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20216212 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20216213 |
gattggtaccacatgcatataag |
20216235 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
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| Q |
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234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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43078394 |
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T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43078294 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 44844979 - 44845192
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | |||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44844979 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccgtgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44845070 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttacaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
44845169 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44845170 |
gattggtaccacatgcatataag |
44845192 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 46157472 - 46157650
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| Q |
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tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46157472 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
46157571 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46157572 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47659224 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg |
47659134 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47659133 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
47659034 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47659033 |
gattggtaccacatgcatataag |
47659011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 18626295 - 18626603
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3 |
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97 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
18626295 |
ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagtatgcaatgtttatatatgaatataatgaaaatga |
18626394 |
T |
 |
| Q |
98 |
tgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagct |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18626395 |
tgacgttttgcttcaagttattgaatgcaca---------tgattatgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct |
18626485 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18626486 |
tagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcatgattaaagtatatttatacttatgatgacgat |
18626585 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18626586 |
tggtaccacatgcatata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 48603013 - 48602865
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327 |
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426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48603013 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagctgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtcttcta |
48602914 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48602913 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 27898809 - 27898978
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
27898809 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
27898908 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27898909 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27898978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 43063426 - 43063595
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
43063426 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
43063525 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43063526 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
43063595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 44756061 - 44755892
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
44756061 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
44755962 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44755961 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
44755892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49334528 - 49334359
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
49334528 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
49334429 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49334428 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
49334359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 149 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33385023 - 33384857
Alignment:
| Q |
149 |
attacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
33385023 |
attacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg |
33384924 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33384923 |
agctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
33384857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19211815 - 19211646
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
19211815 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctatgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
19211720 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19211719 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
19211646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46975392 - 46975268
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46975392 |
gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattcatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
46975294 |
T |
 |
| Q |
317 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46975293 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
46975268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12646816 - 12646649
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
12646816 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttttcctccacacgattaaagta |
12646721 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12646720 |
tattaatact-atgatgacgattggaaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
12646649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18882272 - 18882169
Alignment:
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18882272 |
taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtgtattaatacttttgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc |
18882173 |
T |
 |
| Q |
339 |
gagt |
342 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18882172 |
gagt |
18882169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21172951 - 21172777
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
21172951 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
21172856 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21172855 |
aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
21172777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21313067 - 21312893
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
21313067 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
21312972 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21312971 |
aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
21312893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 36819467 - 36819638
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
36819467 |
agagtccatgcattagcata-cattgaactttgtcctcaccacaatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaag |
36819562 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36819563 |
tatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
36819638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23967483 - 23967335
Alignment:
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacct |
429 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
23967483 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgctgaattgtcatccatgagttgttaagtagttgagttgtcttctacat |
23967384 |
T |
 |
| Q |
430 |
atgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23967383 |
atgtgttgttaatgaagtacttatgaagattatacgatgtttatgatgt |
23967335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21437853 - 21437734
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21437853 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaaatgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
21437756 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgatt |
151 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21437755 |
tgatatgatgattacgatgatt |
21437734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 16080623 - 16080746
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata--agtgt |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16080623 |
gagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctcc-cacgat-aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgt |
16080717 |
T |
 |
| Q |
315 |
ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16080718 |
ctaagttgcattgttgcatttgtcgagtc |
16080746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42911894 - 42911750
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42911894 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttct |
42911795 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
| | | |||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42911794 |
atccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
42911750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 14238695 - 14238777
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattat----catccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14238695 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatatatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt |
14238777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46975437 - 46975350
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46975437 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
46975350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21844237 - 21844142
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21844237 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat---------tacggcgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
21844147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21844140 - 21844085
Alignment:
| Q |
256 |
gcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844140 |
gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
21844085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33797231 - 33797142
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33797231 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctccgcacg |
33797142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 48520018 - 48519946
Alignment:
| Q |
340 |
agtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48520018 |
agtcaaagttgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt |
48519946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20248071 - 20248012
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20248071 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
20248012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33680796 - 33680737
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33680796 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
33680737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19675596 - 19675543
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19675596 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
19675543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21161564 - 21161486
Alignment:
| Q |
266 |
agtatattaatacttatgatgacgatt-ggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21161564 |
agtatattaatact-attatgatgatttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc |
21161486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21753837 - 21753778
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21753837 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtggagtcaaag |
21753778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 22922200 - 22922259
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22922200 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgaatcaaag |
22922259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 52928302 - 52928361
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52928302 |
gattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
52928361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20241672 - 20241619
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20241672 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcgtccatgagttgttaagttgt |
20241619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34509577 - 34509519
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
34509577 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcaca-ttgtcgagtcaaag |
34509519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 38801714 - 38801768
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
38801714 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
38801768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 14238748 - 14238785
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14238748 |
gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
14238785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Original strand, 16080619 - 16080659
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16080619 |
cattgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctcc |
16080659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 18182438 - 18182494
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18182438 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgttgca-ttgtcgagtcaaa |
18182494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18882337 - 18882251
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18882337 |
tgattaagatgttttgttatta-gagtccatgcattagcatt-cattgagtcttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacg |
18882251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 27898679 - 27898740
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27898679 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
27898740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 43063296 - 43063357
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43063296 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
43063357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 44756191 - 44756130
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44756191 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
44756130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 49334658 - 49334597
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49334658 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
49334597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 348
Target Start/End: Original strand, 20847461 - 20847519
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagt |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20847461 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgta-ttgtcgagtcaaagt |
20847519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48519975 - 48519847
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaa |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
48519975 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaggttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaa |
48519876 |
T |
 |
| Q |
442 |
agaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48519875 |
tgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
48519847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20134977 - 20134923
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
20134977 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
20134923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 24783287 - 24783332
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24783287 |
cattgagctttgttctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg |
24783332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 27251055 - 27251109
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
27251055 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
27251109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20241624 - 20241555
Alignment:
| Q |
407 |
agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgat |
476 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||| | || || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20241624 |
agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaggattatatgatgtttatgat |
20241555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21788367 - 21788423
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
21788367 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtctca-tagtcgagtcaaa |
21788423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43078525 - 43078460
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43078525 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
43078460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6151642 - 6151598
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6151642 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
6151598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 20091796 - 20091840
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20091796 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
20091840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21022374 - 21022330
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21022374 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
21022330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21709798 - 21709754
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21709798 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
21709754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21714341 - 21714297
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21714341 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
21714297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 22469025 - 22469069
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22469025 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
22469069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 329
Target Start/End: Original strand, 24783369 - 24783409
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtc |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24783369 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtc |
24783409 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 42865537 - 42865581
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42865537 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
42865581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0372 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:
Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 5347 - 5869
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5347 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaaatgatga |
5446 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5447 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
5546 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5547 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
5646 |
T |
 |
| Q |
301 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatca |
400 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5647 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatca |
5746 |
T |
 |
| Q |
401 |
tctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5747 |
tccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa |
5837 |
T |
 |
| Q |
500 |
gatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
5838 |
aatattgctatgttgtttgacatgttgattat |
5869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0349 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:
Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12282 - 11758
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12282 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
12183 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12182 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
12083 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12082 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
11983 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11982 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
11883 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11882 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
11792 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11791 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
11758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11566722 - 11566198
Alignment:
| Q |
1 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11566722 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
11566623 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11566622 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
11566523 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11566522 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
11566423 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11566422 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
11566323 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11566322 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
11566232 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11566231 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
11566198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 12619088 - 12619612
Alignment:
| Q |
1 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12619088 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
12619187 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12619188 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
12619287 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12619288 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
12619387 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12619388 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
12619487 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12619488 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
12619578 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12619579 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
12619612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23394928 - 23394404
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23394928 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
23394829 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23394828 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
23394729 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23394728 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
23394629 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23394628 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
23394529 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23394528 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
23394438 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23394437 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
23394404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23989780 - 23989256
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23989780 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
23989681 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23989680 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtggtttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
23989581 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23989580 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
23989481 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23989480 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
23989381 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23989380 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctgcgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
23989290 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23989289 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
23989256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22862806 - 22862282
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga--tgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22862806 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgatactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgat |
22862707 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
22862706 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgagttt |
22862607 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22862606 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
22862507 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
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T |
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399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
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catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
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T |
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498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19870450 - 19869925
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T |
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298 |
Q |
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T |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
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19870150 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattat |
19870051 |
T |
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496 |
Q |
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T |
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497 |
taagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 531
Target Start/End: Original strand, 31478326 - 31478762
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T |
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taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa |
394 |
Q |
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taccaaatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa |
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T |
 |
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ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttg |
494 |
Q |
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T |
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actaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8243613 - 8243169
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8243414 |
T |
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Q |
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T |
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ttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatg |
477 |
Q |
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T |
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tgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23414594 - 23414233
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Q |
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T |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
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Q |
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| T |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
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T |
 |
| Q |
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tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
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| T |
23414396 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat |
23414297 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
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gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
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Target: chr6; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 1644176 - 1643838
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 |
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392 |
Q |
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T |
 |
| Q |
393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
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| T |
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aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatga |
1643877 |
T |
 |
| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
| |
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tgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 16624020 - 16623683
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|
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T |
 |
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392 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
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aattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaaaaagtacctacgaaaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgc |
16623721 |
T |
 |
| Q |
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tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
| |
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tgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14471879 - 14471550
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|
|
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T |
 |
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ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg |
392 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
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aattatcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatat |
14471589 |
T |
 |
| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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|
|
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14471588 |
tgactaagatgatgctatgttgtttaacatattgattat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 147 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16759980 - 16759708
Alignment:
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T |
 |
| Q |
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ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
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 |
| Q |
347 |
gtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 187 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27556334 - 27556064
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 |
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tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttt |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4167990 - 4167705
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Q |
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| T |
4167990 |
tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
4167891 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggag |
219 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4167890 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag |
4167800 |
T |
 |
| Q |
220 |
ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4167799 |
ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
4167705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 18917684 - 18917916
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18917684 |
ttgatatattgatatatctcttttgttgtgtgacttgactgtgctatggctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgaggaaatgatgacg |
18917783 |
T |
 |
| Q |
103 |
tttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18917784 |
tttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagctttgt |
18917882 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
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|||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18917883 |
cctcaccatgtttaggagctttgtcctccgcacg |
18917916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Original strand, 22074560 - 22074764
Alignment:
| Q |
327 |
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426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22074560 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttatcttcta |
22074659 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg |
526 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22074660 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattg |
22074759 |
T |
 |
| Q |
527 |
attat |
531 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
22074760 |
attat |
22074764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4208670 - 4208385
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
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| T |
4208670 |
tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattagat |
4208571 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggag |
219 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4208570 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag |
4208480 |
T |
 |
| Q |
220 |
ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4208479 |
ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
4208385 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22948772 - 22948554
Alignment:
| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
22948772 |
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22948675 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22948674 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
22948575 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22948574 |
tctatgagttgtcgagttgtc |
22948554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22952728 - 22952510
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| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
22952728 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
22952631 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22952630 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
22952531 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22952530 |
tctatgagttgtcgagttgtc |
22952510 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23871216 - 23870998
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
23871216 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
23871119 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23871118 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
23871019 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23871018 |
tctatgagttgtcgagttgtc |
23870998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23875172 - 23874954
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
23875172 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
23875075 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23875074 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
23874975 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23874974 |
tctatgagttgtcgagttgtc |
23874954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 3708524 - 3708805
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3708524 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtatatgtgtatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgc |
3708623 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt |
222 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3708624 |
atattgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt |
3708714 |
T |
 |
| Q |
223 |
tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3708715 |
tgtcctccgcacgatttatcggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
3708805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Original strand, 27416344 - 27416557
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
27416344 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagttttgtcctccgcacgattaaag |
27416440 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27416441 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatctgtcgagtcgaagtcgttgttgatgaattatca |
27416540 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagt |
384 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |
|
|
| T |
27416541 |
tctatgagttgttaagt |
27416557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34832740 - 34832436
Alignment:
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1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
34832740 |
aattgatatattgatatca-tctgtt--tatgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatggaatgatga |
34832646 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34832645 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcattagcatttcattaagctta |
34832555 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34832554 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacaatt |
34832455 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34832454 |
ggtaccacatgcatataag |
34832436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2077004 - 2076800
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2077004 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttcta |
2076905 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg |
526 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
2076904 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgcatgatgtttatgatgtgaattttatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattg |
2076805 |
T |
 |
| Q |
527 |
attat |
531 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
2076804 |
attat |
2076800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 24291110 - 24291369
Alignment:
| Q |
50 |
tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24291110 |
tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat |
24291209 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
24291210 |
g---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg |
24291300 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24291301 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
24291369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 31317150 - 31317409
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50 |
tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31317150 |
tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat |
31317249 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
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|
| T |
31317250 |
g---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg |
31317340 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31317341 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
31317409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25928383 - 25928077
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
25928383 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
25928286 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25928285 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
25928196 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25928195 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
25928096 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25928095 |
ggtaccacatgcatataag |
25928077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 24315138 - 24315397
Alignment:
| Q |
50 |
tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24315138 |
tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat |
24315237 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
24315238 |
g---------ttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg |
24315328 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24315329 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
24315397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16624142 - 16623978
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16624142 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
16624043 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16624042 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
16623978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19808614 - 19808308
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
19808614 |
aattgatataatgatatcatcctattgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
19808517 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19808516 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
19808427 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19808426 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
19808327 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19808326 |
ggtaccacatgcatataag |
19808308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22758938 - 22758633
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||| |
|
|
| T |
22758938 |
aattgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gaggaataagatg |
22758841 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22758840 |
acgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
22758751 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22758750 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt-aaagtatattaatacttatgatgacgatt |
22758652 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22758651 |
ggtaccacatgcatataag |
22758633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1545085 - 1545365
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1545085 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg |
1545182 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1545183 |
catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagct |
1545273 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1545274 |
ttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
1545365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1644298 - 1644134
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1644298 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
1644199 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1644198 |
gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
1644134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 17037375 - 17037655
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaat-gatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17037375 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatgtat--gatgaaaaagatgacgtttagctccaaattattggatg |
17037472 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagct |
221 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
17037473 |
cacattgatatg---------atgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagct |
17037563 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17037564 |
ttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
17037655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 1587867 - 1588052
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1587867 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc |
1587963 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1587964 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
1588052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 25135809 - 25135993
Alignment:
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25135809 |
gattaaggtgttttgttgttaag--tccatgcattaacatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgatttaggagct |
25135905 |
T |
 |
| Q |
247 |
ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25135906 |
ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
25135993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25110886 - 25110623
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
25110886 |
tgctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgatta |
25110787 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25110786 |
cgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta |
25110696 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25110695 |
taggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag |
25110623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25117489 - 25117226
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
25117489 |
tgctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgatta |
25117390 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25117389 |
cgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta |
25117299 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25117298 |
taggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag |
25117226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 34369992 - 34370298
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||| |
|
|
| T |
34369992 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gaagaataagatg |
34370089 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34370090 |
acgtttagcttcaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
34370179 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34370180 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaagtatattaatacttatgatgacgatt |
34370279 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34370280 |
gttaccacatgcatataag |
34370298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 5616951 - 5617136
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5616951 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc |
5617047 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5617048 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgccttgtcgcatt |
5617136 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12496278 - 12496086
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12496278 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cactgagctttgtcctcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
12496183 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12496182 |
tttgtccttcgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
12496086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1538986 - 1539266
Alignment:
| Q |
26 |
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124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1538986 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgataatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg |
1539083 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1539084 |
catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccaggcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagct |
1539174 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1539175 |
ttgtcctccgcacgtttattaggagttttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
1539266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 34298670 - 34298940
Alignment:
| Q |
31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34298670 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
34298767 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34298768 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
34298855 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34298856 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
34298940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 27430387 - 27430592
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
27430387 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
27430477 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27430478 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
27430577 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
27430578 |
ccacatgcatataag |
27430592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 371
Target Start/End: Original strand, 18917893 - 18918027
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| Q |
237 |
tttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttg |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18917893 |
tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttg |
18917992 |
T |
 |
| Q |
337 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatcca |
371 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18917993 |
ttgagtcaaagtcgttggtgatgaattatcatcca |
18918027 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28314528 - 28314353
Alignment:
| Q |
139 |
gattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28314528 |
gattacgatgaatacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg |
28314429 |
T |
 |
| Q |
236 |
tttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28314428 |
ttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
28314353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 9482429 - 9482620
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9482429 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttctcctccgcacgttt-aggagc |
9482524 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9482525 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-agtgtctaagtttcattgtcgcatttgtcgagt |
9482620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26130468 - 26130265
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26130468 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
26130378 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26130377 |
tcaccacgaatattaggagctttgtcccccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
26130278 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
26130277 |
acatgcatataag |
26130265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27185668 - 27185492
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27185668 |
tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac |
27185569 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27185568 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27185492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27207504 - 27207328
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27207504 |
tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac |
27207405 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27207404 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27207328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 27241724 - 27241900
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27241724 |
tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac |
27241823 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27241824 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27241900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 27263572 - 27263748
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27263572 |
tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac |
27263671 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27263672 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27263748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 2870231 - 2870444
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2870231 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg |
2870321 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2870322 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
2870421 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2870422 |
gattggtaccacatgcatataag |
2870444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2876846 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg |
2876936 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2876937 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
2877036 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2877037 |
gattggtaccacatgcatataag |
2877059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20060660 - 20060447
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20060660 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
20060570 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
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| T |
20060569 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20060470 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20060469 |
gattggtaccacatgcatataag |
20060447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 334
Target Start/End: Original strand, 20803697 - 20803875
Alignment:
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154 |
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252 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20803697 |
ggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctctacacgttttaggagctttgtcc |
20803793 |
T |
 |
| Q |
253 |
tctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20803794 |
tccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgttgcatt |
20803875 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27328152 - 27328365
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
27328152 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg |
27328242 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27328243 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27328342 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27328343 |
gattggtaccacatgcatataag |
27328365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27388892 - 27389105
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27388892 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg |
27388982 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27388983 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27389082 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27389083 |
gattggtaccacatgcatataag |
27389105 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21702256 - 21702072
Alignment:
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21702256 |
gattaaggtgttttgttgtta-gaatccatgcattagcatt-cattgagctttgtccttaccatgataag-agatttgtcctccacacgttttaggagct |
21702160 |
T |
 |
| Q |
247 |
ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21702159 |
ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
21702072 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30694363 - 30694160
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30694363 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagaatctcattgagcttagtcc |
30694273 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30694272 |
tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
30694173 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
30694172 |
acatgcatataag |
30694160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8228842 - 8228664
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8228842 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
8228743 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8228742 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
8228664 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8797202 - 8796989
Alignment:
| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8797202 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
8797112 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8797111 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
8797012 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8797011 |
gattggtaccacatgcatataag |
8796989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18931031 - 18930853
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18931031 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
18930932 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18930931 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
18930853 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28287359 - 28287155
Alignment:
| Q |
102 |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
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28287359 |
gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt |
28287268 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28287267 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
28287168 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
28287167 |
ccacatgcatata |
28287155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29587831 - 29588009
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29587831 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
29587930 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29587931 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
29588009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29593972 - 29594150
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29593972 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
29594071 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29594072 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
29594150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6980670 - 6980461
Alignment:
| Q |
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atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6980670 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
6980581 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6980580 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
6980481 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatat |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6980480 |
gattggtaccacatgcatat |
6980461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20649887 - 20650099
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20649887 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
20649976 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20649977 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20650076 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20650077 |
gattggtaccacatgcatataag |
20650099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28258557 - 28258761
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28258557 |
gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt |
28258648 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28258649 |
cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
28258748 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
28258749 |
ccacatgcatata |
28258761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28265181 - 28265385
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102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28265181 |
gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt |
28265272 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28265273 |
cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
28265372 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
28265373 |
ccacatgcatata |
28265385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28337306 - 28337510
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28337306 |
gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt |
28337397 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28337398 |
cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
28337497 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
28337498 |
ccacatgcatata |
28337510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28343930 - 28344134
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28343930 |
gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt |
28344021 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28344022 |
cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
28344121 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
28344122 |
ccacatgcatata |
28344134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 30638281 - 30638459
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30638281 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
30638380 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30638381 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
30638459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 32565392 - 32565561
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
32565392 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
32565491 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32565492 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
32565561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12762713 - 12762505
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12762713 |
atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
12762623 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt-taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg |
289 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12762622 |
agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgtttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg |
12762523 |
T |
 |
| Q |
290 |
attggtaccacatgcata |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12762522 |
attggtaccacatgcata |
12762505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 16552170 - 16552339
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16552170 |
atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
16552269 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16552270 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
16552339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16576783 - 16576614
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16576783 |
atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
16576684 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16576683 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
16576614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 16618597 - 16618766
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16618597 |
atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
16618696 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16618697 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
16618766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 16628726 - 16628895
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
16628726 |
atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
16628825 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16628826 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
16628895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 17017072 - 17017241
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
17017072 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
17017171 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17017172 |
aggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
17017241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20801767 - 20801556
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20801767 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgaagttttgtccatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
20801678 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20801677 |
agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20801578 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20801577 |
gattggtaccacatgcatataa |
20801556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30597168 - 30597024
Alignment:
| Q |
172 |
gtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
30597168 |
gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaa |
30597069 |
T |
 |
| Q |
267 |
gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30597068 |
gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
30597024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19662715 - 19662548
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
19662715 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta |
19662620 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19662619 |
tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
19662548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12706637 - 12706467
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12706637 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctctgtcctcgccacgatcag-agctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
12706542 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12706541 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgttgagt |
12706467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16741154 - 16740985
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16741154 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
16741059 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16741058 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcacttgtcgagt |
16740985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 350 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16759746 - 16759573
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta |
448 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16759746 |
gttgtcgatgaattatcatccattagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagta |
16759647 |
T |
 |
| Q |
449 |
cctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16759646 |
cctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
16759573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 2685478 - 2685645
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2685478 |
agtccatgcattagcatt-cattgacctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta |
2685573 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2685574 |
tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
2685645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14098691 - 14098461
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14098691 |
tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtttatgtat--gaggaacatgatgacgtttagctccaaattattggatg |
14098594 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct |
221 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
14098593 |
catg--------ttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaagagct |
14098503 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14098502 |
ttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg |
14098461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 25595394 - 25595572
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25595394 |
tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgcctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
25595493 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgat |
213 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25595494 |
atgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgat |
25595572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20176938 - 20176722
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20176938 |
atgatgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgttt--------ttgttgttaagagtccatgcatagcatctcattg |
20176847 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatactt-atgatg |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20176846 |
agcttagtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatg |
20176747 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20176746 |
acgattggtaccacatgcatataag |
20176722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14471987 - 14471837
Alignment:
| Q |
108 |
ctccaaattattggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctca |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14471987 |
ctccaaattattggatgtataagtgatatgttgattacgatgattacg-tgttt-gttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctca |
14471890 |
T |
 |
| Q |
207 |
ccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14471889 |
ccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
14471837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Original strand, 5834638 - 5834810
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgtttt-gtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg--tttta |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
5834638 |
tgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagtatctcattgagcttagtcctcaccatgatttttaggagctttgtcctccgcacgaattata |
5834737 |
T |
 |
| Q |
241 |
ggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatactt-atgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5834738 |
ggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
5834810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Original strand, 22159097 - 22159269
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgtttt-gtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg--tttta |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
22159097 |
tgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagaatctcattgagcttagtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattata |
22159196 |
T |
 |
| Q |
241 |
ggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatactt-atgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22159197 |
ggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
22159269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22948592 - 22948453
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
22948592 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat |
22948502 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22948501 |
tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
22948453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22952548 - 22952409
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
22952548 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat |
22952458 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22952457 |
tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
22952409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23871036 - 23870897
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
23871036 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat |
23870946 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23870945 |
tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
23870897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23874992 - 23874853
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
23874992 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat |
23874902 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23874901 |
tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
23874853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17804136 - 17803962
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17804136 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctat |
17804041 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17804040 |
aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
17803962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8243721 - 8243635
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8243721 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat |
8243635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 531
Target Start/End: Original strand, 18918012 - 18918145
Alignment:
| Q |
389 |
gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatg |
488 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18918012 |
gatgaattatcatccatgggtgatcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatg |
18918102 |
T |
 |
| Q |
489 |
atgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18918103 |
atgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattat |
18918145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 27325785 - 27325955
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
27325785 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatc--ggagctttgttctccacacgattaaag |
27325880 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27325881 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtc |
27325955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14098484 - 14098383
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| Q |
212 |
attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14098484 |
attaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctcctcacgattaaagtatatttatacttctgatgacgattggtaccacatgcatata |
14098385 |
T |
 |
| Q |
310 |
ag |
311 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14098384 |
ag |
14098383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 4233707 - 4233780
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4233707 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
4233780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #106
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Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 14053795 - 14053867
Alignment:
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14053795 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 311
Target Start/End: Original strand, 22430208 - 22430327
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| Q |
192 |
tgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22430208 |
tgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgac |
22430304 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22430305 |
gattggtaccacatgcatataag |
22430327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Original strand, 4233594 - 4233729
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4233594 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg |
4233684 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccac---gattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4233685 |
agcttagtcctcaccacaaatattaggagctttgtcctccgcacg |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19774060 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgacttgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttct |
19774159 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
516 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19774160 |
acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt |
19774245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22805507 - 22805370
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22805507 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct |
22805408 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattata |
463 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
22805407 |
acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata |
22805370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Original strand, 19656762 - 19656891
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcga--tgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagt |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || || | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19656762 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgctaagttgttgagttgtcttct-atccatgagttgttgagttgtcttctatctatgtgttgttaatgaagt |
19656860 |
T |
 |
| Q |
448 |
acctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19656861 |
gcttatgaagattatacgatgtttatgatgt |
19656891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23538302 - 23538235
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcat |
401 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23538302 |
ttgtctagtcaaattcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgttgatgaattatcat |
23538235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17105407 - 17105329
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17105407 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgtcgatgagttggcatccatgagttgt |
17105329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16371945 - 16371861
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat |
85 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16371945 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat |
16371861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19298223 - 19298173
Alignment:
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19298223 |
tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
19298173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34963123 - 34963070
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34963123 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
34963070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17742923 - 17742849
Alignment:
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17742923 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgacatccatgagttgt |
17742849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 19656621 - 19656699
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19656621 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgtcgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgatgatgaattctcatccatgagttgt |
19656699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23992180 - 23992127
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23992180 |
ttgtcgattcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
23992127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 393
Target Start/End: Original strand, 27126606 - 27126665
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga |
393 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27126606 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatga |
27126665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 22081060 - 22081118
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22081060 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
22081118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20182440 - 20182303
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg---------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgtta |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
20182440 |
gttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtcgatgaattgtcatacatgagttgttaaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaa |
20182341 |
T |
 |
| Q |
441 |
aagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
| ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20182340 |
atgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt |
20182303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Original strand, 22153551 - 22153688
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg---------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgtta |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
22153551 |
gttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtcgatgaattgtcatacatgagttgttaaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaa |
22153650 |
T |
 |
| Q |
441 |
aagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
| ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22153651 |
atgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt |
22153688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17742878 - 17742689
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacctatgtgttgttaa |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
17742878 |
gttgttgatgaattgacatccatgagttgtaaagttgttgatgaattgtcctccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaa |
17742779 |
T |
 |
| Q |
442 |
agaagtacctacgaagattatacgatgt--ttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17742778 |
tgaagtgcttatgaagattatatgatgttattatgatgttgtttata--atgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattat |
17742689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22831303 - 22831247
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22831303 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaa |
22831247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 409
Target Start/End: Original strand, 15705936 - 15706011
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagt |
409 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
15705936 |
ttgtcaagtcaaattcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt |
15706011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1561097 - 1561039
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1561097 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
1561039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7825489 - 7825436
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7825489 |
ttgtcgaatcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccacgagttgttaagttgt |
7825436 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Original strand, 14059720 - 14059761
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14059720 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
14059761 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18906907 - 18906851
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18906907 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
18906851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #131
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Target Start/End: Original strand, 15705985 - 15706090
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaa |
441 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15705985 |
gttgttgatgagttgtcatccatgagtggttaagttgttgatgagttgtcatctatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaa |
15706084 |
T |
 |
| Q |
442 |
agaagt |
447 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
15706085 |
tgaagt |
15706090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 343
Target Start/End: Original strand, 31155695 - 31155747
Alignment:
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31155695 |
tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc |
31155747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19651984 - 19651925
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19651984 |
gattggtaccacatgcatataagagatttaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
19651925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 27333456 - 27333515
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27333456 |
gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcattcgtcgagtcaaag |
27333515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 27394196 - 27394255
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27394196 |
gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcattcgtcgagtcaaag |
27394255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 4738854 - 4738908
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4738854 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatctgtcgagtc |
4738908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11185307 - 11185253
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11185307 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtc |
11185253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23538253 - 23538215
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23538253 |
gttgttgatgaattatcattcaagagttgttaagttgtc |
23538215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 28496797 - 28496851
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
28496797 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
28496851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 29809208 - 29809262
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
29809208 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
29809262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30597229 - 30597175
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg |
148 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30597229 |
atgatgaagttaagctccaaattattggatgcatgtcgataagttgattacgatg |
30597175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8228973 - 8228908
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8228973 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
8228908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 15894760 - 15894805
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15894760 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt |
15894805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 16552040 - 16552101
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16552040 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
16552101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16576913 - 16576852
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16576913 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
16576852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 16618467 - 16618528
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16618467 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
16618528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 16628596 - 16628657
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16628596 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
16628657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 17016942 - 17017003
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17016942 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
17017003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21830760 - 21830816
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21830760 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
21830816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 22780552 - 22780605
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
22780552 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagt |
22780605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 32565262 - 32565323
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32565262 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
32565323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 22430231 - 22430274
Alignment:
| Q |
191 |
ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22430231 |
ttgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg |
22430274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 25767380 - 25767423
Alignment:
| Q |
191 |
ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25767380 |
ttgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg |
25767423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27556064 - 27556020
Alignment:
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27556064 |
tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
27556020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 25629677 - 25629732
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25629677 |
gattggtaccacatgcatataggaggtctaaattgcatagtcgcatttgtcgagtc |
25629732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 25603716 - 25603770
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
25603716 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgtcgagtc |
25603770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18931162 - 18931097
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18931162 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
18931097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 22408613 - 22408669
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22408613 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
22408669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 279
Target Start/End: Original strand, 25767335 - 25767445
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
25767335 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcatcaccaagatt-tgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
25767430 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatact |
279 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
25767431 |
aagtatattaatact |
25767445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 29587700 - 29587761
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29587700 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
29587761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 29593841 - 29593902
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29593841 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
29593902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 16523704 - 16523759
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16523704 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
16523759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 18692232 - 18692287
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18692232 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
18692287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Original strand, 19656746 - 19656790
Alignment:
| Q |
367 |
atccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttg |
411 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
19656746 |
atccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttg |
19656790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19872914 - 19872870
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19872914 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
19872870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20182450 - 20182402
Alignment:
| Q |
373 |
gagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc |
421 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20182450 |
gagttgttaagttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtc |
20182402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 21740357 - 21740401
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21740357 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
21740401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 421
Target Start/End: Original strand, 22153541 - 22153589
Alignment:
| Q |
373 |
gagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc |
421 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22153541 |
gagttgttaagttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtc |
22153589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 22335220 - 22335264
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22335220 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
22335264 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22432043 - 22431999
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22432043 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
22431999 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22438593 - 22438549
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22438593 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
22438549 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 25642510 - 25642554
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagt-gtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25642510 |
attggtaccacatgcatataagtggtataagttgcatagtcgcat |
25642554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Original strand, 25767444 - 25767472
Alignment:
| Q |
315 |
ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25767444 |
ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
25767472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 158)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9556390 - 9555866
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9556390 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
9556291 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9556290 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
9556191 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9556190 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
9556091 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9556090 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
9555991 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9555990 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
9555900 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9555899 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
9555866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33742240 - 33741716
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33742240 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
33742141 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33742140 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
33742041 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33742040 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
33741941 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33741940 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
33741841 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33741840 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
33741750 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33741749 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
33741716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17810132 - 17809707
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17810132 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
17810033 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17810032 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
17809933 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17809932 |
tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
17809833 |
T |
 |
| Q |
301 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatca |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17809832 |
atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatca |
17809733 |
T |
 |
| Q |
401 |
tctatgag-ttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17809732 |
tccatgagtttgtcgagttgtgttct |
17809707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 5757185 - 5757700
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5757185 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtatatatatatattatgaaatgat |
5757284 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5757285 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgat---------tacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
5757375 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5757376 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
5757475 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5757476 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
5757575 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5757576 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
5757666 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5757667 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
5757700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 14757668 - 14758197
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga--tgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14757668 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgat |
14757767 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14757768 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagctt |
14757867 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14757868 |
agtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
14757967 |
T |
 |
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14757968 |
gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatga |
14758067 |
T |
 |
| Q |
394 |
attatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14758068 |
attatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgt |
14758158 |
T |
 |
| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14758159 |
tgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
14758197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 4561580 - 4562095
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4561580 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
4561679 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4561680 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgat---------tacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
4561770 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4561771 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
4561870 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4561871 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgtcgatgaattat |
4561970 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4561971 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaggattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
4562061 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4562062 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
4562095 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15224805 - 15224411
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
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| T |
15224805 |
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15224706 |
T |
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195 |
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294 |
Q |
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| T |
15224705 |
gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
15224607 |
T |
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| Q |
295 |
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394 |
Q |
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15224606 |
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15224507 |
T |
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395 |
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490 |
Q |
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| T |
15224506 |
ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 14954609 - 14954961
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14954706 |
T |
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367 |
Q |
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| T |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
14954806 |
T |
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| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
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| T |
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tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- |
14954903 |
T |
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| Q |
468 |
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531 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12487375 - 12487021
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267 |
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T |
 |
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268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
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T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacga |
466 |
Q |
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| T |
12487176 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac-- |
12487079 |
T |
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| Q |
467 |
tgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 217 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10712496 - 10712244
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| Q |
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Q |
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T |
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aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag |
416 |
Q |
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| T |
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T |
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417 |
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470 |
Q |
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10712297 |
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T |
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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 217 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10926266 - 10926014
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316 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag |
416 |
Q |
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| T |
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10926068 |
T |
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ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 241 - 531
Target Start/End: Original strand, 20157680 - 20157973
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| Q |
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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436 |
Q |
| |
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| T |
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20157878 |
T |
 |
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gttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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Target: chr4; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 20160433 - 20160649
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Q |
| |
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20160433 |
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20160532 |
T |
 |
| Q |
415 |
agttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttg |
514 |
Q |
| |
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|
| T |
20160533 |
agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttg |
20160632 |
T |
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| Q |
515 |
tttaacatattgattat |
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Q |
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|
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20160633 |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 53433464 - 53433155
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Q |
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|
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aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
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T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
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| T |
53433364 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
53433275 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
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| T |
53433274 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
53433175 |
T |
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| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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| T |
53433174 |
tggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 315 - 531
Target Start/End: Original strand, 20163211 - 20163427
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414 |
Q |
| |
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|
|
| T |
20163211 |
ctaagttacattgtcgcgtttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcg |
20163310 |
T |
 |
| Q |
415 |
agttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttg |
514 |
Q |
| |
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|
| T |
20163311 |
ggttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgtttctatgttg |
20163410 |
T |
 |
| Q |
515 |
tttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| |
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|
| T |
20163411 |
tttaagatattgattat |
20163427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23081653 - 23081370
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
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| T |
23081653 |
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T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
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| T |
23081553 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
23081463 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
23081462 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
23081370 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27709786 - 27709527
Alignment:
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50 |
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147 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
27709686 |
g---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg |
27709596 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27709595 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 19942195 - 19942478
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| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
19942195 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
19942294 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |
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| T |
19942295 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattatgagc |
19942385 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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| T |
19942386 |
tttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19942478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 14708770 - 14708956
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| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14708770 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
14708867 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14708868 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
14708956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Original strand, 16956692 - 16956984
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16956692 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
16956791 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16956792 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttatgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
16956882 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtcta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16956883 |
tttgtcctccgcacgattattaggagttttttcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtcta |
16956982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 7901232 - 7901494
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7901232 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt |
7901321 |
T |
 |
| Q |
143 |
acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt- |
238 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
7901322 |
atgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgttctctgcacgttta |
7901420 |
T |
 |
| Q |
239 |
-taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7901421 |
ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
7901494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Original strand, 9272252 - 9272480
Alignment:
| Q |
79 |
tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatg |
178 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9272252 |
tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatt---------tgttcataagagtccatg |
9272342 |
T |
 |
| Q |
179 |
catagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatatt |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9272343 |
catagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatt |
9272442 |
T |
 |
| Q |
274 |
aatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9272443 |
aatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag |
9272480 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 6873473 - 6873686
Alignment:
| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6873473 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
6873563 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6873564 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
6873663 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6873664 |
gattggtaccacatgcatataag |
6873686 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 42997586 - 42997772
Alignment:
| Q |
147 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42997586 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
42997683 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42997684 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtatcacgtgcatataagtgtctaagtcgcattgtcgcatt |
42997772 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45938119 - 45937926
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45938119 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
45938023 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45938022 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagt |
45937926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15322136 - 15322416
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15322136 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg |
15322233 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
15322234 |
catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttattgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattacgagct |
15322324 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15322325 |
ttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15322416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 386426 - 386639
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
386426 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
386516 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
386517 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
386616 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
386617 |
gattggtaccacatgcatataag |
386639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40478159 - 40477946
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40478159 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
40478069 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40478068 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
40477969 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40477968 |
gattggtaccacatgcatataag |
40477946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2014748 - 2014556
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2014748 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
2014653 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2014652 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatcgtcgcatttgtcgagt |
2014556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 26243801 - 26243993
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
26243801 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgtttaag-agc |
26243896 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26243897 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
26243993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12475021 - 12474816
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
12475021 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
12474931 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12474930 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
12474831 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
12474830 |
ccacatgcatataag |
12474816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12481651 - 12481446
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
12481651 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
12481561 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12481560 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
12481461 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
12481460 |
ccacatgcatataag |
12481446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 19757737 - 19757928
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| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19757737 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatt-ggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
19757832 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19757833 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
19757928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19782069 - 19781878
Alignment:
| Q |
147 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19782069 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatt-ggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
19781974 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19781973 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
19781878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 26285003 - 26285217
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26285003 |
atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga--------attacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
26285094 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26285095 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgag |
26285194 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26285195 |
gattggtaccacatgcatataag |
26285217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23139202 - 23139049
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23139202 |
ttcattgagctttgtcatcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
23139105 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23139104 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
23139049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 15383589 - 15383801
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15383589 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg----------tgttttgttgttatgtgtccatgcatagcatatcattg |
15383678 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15383679 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
15383778 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15383779 |
gattggtaccacatgcatataag |
15383801 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27533641 - 27533457
Alignment:
| Q |
193 |
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292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27533641 |
gagctttgtcctccgcacaat-aggagctttgtcctccgcatgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgatt |
27533544 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27533543 |
ggtaccacatgcatatgagtgtctaagttgcattttcgcattcgtcgagtcaaagtcgttgtcgatgaattatcatccatgagttgt |
27533457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 51493914 - 51494125
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51493914 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcat--tgatatgtttattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
51494002 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51494003 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
51494102 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51494103 |
gattggtaccacatgcatataag |
51494125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9530404 - 9530212
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
9530404 |
tgattaagatgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggatc |
9530309 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9530308 |
tttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagt |
9530212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 18024532 - 18024737
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
18024532 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatatcattgagcttagt |
18024622 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18024623 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
18024722 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
18024723 |
ccacatgcatataag |
18024737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18071170 - 18070965
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
18071170 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
18071080 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18071079 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
18070980 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
18070979 |
ccacatgcatataag |
18070965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18295627 - 18295422
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
18295627 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
18295537 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18295536 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
18295437 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
18295436 |
ccacatgcatataag |
18295422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12522170 - 12521864
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
12522170 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttatgttacttgactatgatgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
12522073 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12522072 |
acgtttggctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctc |
12521983 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12521982 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
12521883 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12521882 |
ggtaccacatgcatataag |
12521864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 14268560 - 14268763
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14268560 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
14268650 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14268651 |
tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
14268750 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
14268751 |
acatgcatataag |
14268763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 18602868 - 18603052
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| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18602868 |
gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagatttgtcctccacacgttttaggagct |
18602964 |
T |
 |
| Q |
247 |
ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18602965 |
ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
18603052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25689510 - 25689340
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| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25689510 |
gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
25689412 |
T |
 |
| Q |
317 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25689411 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc |
25689340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23838484 - 23838222
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39 |
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137 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23838484 |
gactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatga |
23838387 |
T |
 |
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgt |
236 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23838386 |
tgattacgacg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgaacttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacga |
23838299 |
T |
 |
| Q |
237 |
t--ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23838298 |
tatttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
23838222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 19780384 - 19780597
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19780384 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
19780474 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19780475 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
19780574 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19780575 |
gattggtaccacatgcatataag |
19780597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23954158 - 23953945
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23954158 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
23954068 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23954067 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23953968 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23953967 |
gattggtaccacatgcatataag |
23953945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23960820 - 23960607
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23960820 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
23960730 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23960729 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23960630 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23960629 |
gattggtaccacatgcatataag |
23960607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3412768 - 3412583
Alignment:
| Q |
147 |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
3412768 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacatgttttaggagc |
3412672 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3412671 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtagcacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
3412583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40453886 - 40453717
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| Q |
147 |
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241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40453886 |
tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttatag |
40453787 |
T |
 |
| Q |
242 |
gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40453786 |
gagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
40453717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 14298934 - 14299137
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14298934 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
14299024 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299025 |
tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
14299124 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
14299125 |
acatgcatataag |
14299137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14679021 - 14678752
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14679021 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
14678924 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14678923 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgtgat--agagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
14678837 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14678836 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14678752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 631289 - 631475
Alignment:
| Q |
290 |
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388 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
631289 |
attggtaccacatgcatataagaagttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt |
631388 |
T |
 |
| Q |
389 |
gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
631389 |
aatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
631475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 340
Target Start/End: Original strand, 16243536 - 16243726
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16243536 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagcttagtcctccgcacgttt-aggagc |
16243631 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcga |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16243632 |
tttgtcctctgcacgatgaaattatattaatacttacgatgacgattggtaccacatgcatataaatgtctaagttgcattgtcgcatttatcga |
16243726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15148467 - 15148254
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15148467 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
15148377 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15148376 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
15148277 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15148276 |
gattggtaccacatgcatataag |
15148254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15362142 - 15361929
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15362142 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
15362052 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15362051 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
15361952 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15361951 |
gattggtaccacatgcatataag |
15361929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16231938 - 16232151
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16231938 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
16232028 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232029 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
16232128 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232129 |
gattggtaccacatgcatataag |
16232151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22194629 - 22194416
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22194629 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
22194539 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22194538 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22194439 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22194438 |
gattggtaccacatgcatataag |
22194416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 18609440 - 18609624
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| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18609440 |
gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtccttaccatgataag-agctttgtcctccacacgttttaggagct |
18609536 |
T |
 |
| Q |
247 |
ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18609537 |
ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttagtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
18609624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4772106 - 4771894
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4772106 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
4772017 |
T |
 |
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194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4772016 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
4771917 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4771916 |
gattggtaccacatgcatataag |
4771894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 41385792 - 41386062
Alignment:
| Q |
31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41385792 |
tgtgacttgactatgttgctgcggttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
41385889 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
41385890 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtctt |
41385977 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41385978 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
41386062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8384788 - 8384610
Alignment:
| Q |
138 |
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234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8384788 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
8384689 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8384688 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
8384610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14073784 - 14073606
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14073784 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
14073685 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14073684 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14073606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15256562 - 15256384
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15256562 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
15256463 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15256462 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15256384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 17090130 - 17090308
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17090130 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
17090229 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17090230 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
17090308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29041051 - 29041229
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29041051 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
29041150 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29041151 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
29041229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 36884831 - 36885044
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36884831 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
36884921 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36884922 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagcgttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
36885021 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36885022 |
gattggtaccacatgcatataag |
36885044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 55795413 - 55795236
Alignment:
| Q |
138 |
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233 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55795413 |
tgattacgaggattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca |
55795314 |
T |
 |
| Q |
234 |
cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55795313 |
cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
55795236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8391443 - 8391267
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8391443 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
8391344 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8391343 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
8391267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14685229 - 14684960
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14685229 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
14685132 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14685131 |
taatatgatgattacgatg---------ttttgtgat--agagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
14685045 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||| ||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14685044 |
ccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatttgtaccacatgcatataag |
14684960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 12349724 - 12349893
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| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
12349724 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
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T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349824 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
12349893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 17962476 - 17962653
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17962476 |
tgattacgatgattaagatgttttgttgttaagaatccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca |
17962575 |
T |
 |
| Q |
234 |
cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17962576 |
cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
17962653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 8048592 - 8048804
Alignment:
| Q |
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atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8048592 |
atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8048682 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
8048781 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8048782 |
gattggtaccacatgcatataag |
8048804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 8055205 - 8055417
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8055205 |
atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8055295 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
8055394 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8055395 |
gattggtaccacatgcatataag |
8055417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18236840 - 18236677
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |
|
|
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18236744 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tatattaataattatgacgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 12300048 - 12300217
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atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
12300048 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
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T |
 |
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aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12300148 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
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| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17808367 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
17808268 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17808267 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattgaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
17808189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Original strand, 18222524 - 18222705
Alignment:
| Q |
156 |
tgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18222524 |
tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctc |
18222618 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18222619 |
cgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgttgagt |
18222705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Original strand, 17048683 - 17048831
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
17048683 |
gtcgcatttgtcgattcaaagtcgttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattata |
17048782 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17048783 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
17048831 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35170715 - 35170436
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||| |||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
35170715 |
aattgatacaatgatatcatcctgttgttgtgtcacttgcctatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
35170618 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35170617 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattgagctt |
35170527 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35170526 |
agtcctcaccacgatta----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
35170449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 238 - 342
Target Start/End: Original strand, 28569645 - 28569749
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28569645 |
ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatttgt |
28569744 |
T |
 |
| Q |
338 |
cgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
28569745 |
cgagt |
28569749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 18228990 - 18229180
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
18228990 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacaat--aggagc |
18229084 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18229085 |
tttgtcttccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacaattggtaccatatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
18229180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20682207 - 20682036
Alignment:
| Q |
32 |
gtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatg |
131 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20682207 |
gtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg |
20682110 |
T |
 |
| Q |
132 |
atatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20682109 |
atatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatt |
20682036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 342
Target Start/End: Original strand, 1951939 - 1952088
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1951939 |
cattgagctttgtcctgaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgac |
1952034 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1952035 |
gattggtaccacatgcatattagtgtccaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
1952088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 17152623 - 17152805
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
17152623 |
tgattaagatgttttgttttta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtgctccacacgat--aggagc |
17152717 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17152718 |
tttgttctccacacgattaaagtatattaatact-acgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
17152805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25689378 - 25689239
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
25689378 |
gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat |
25689288 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25689287 |
tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
25689239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35614025 - 35613796
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
35614025 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgatgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagata |
35613928 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35613927 |
acgttg-gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacga---------tgttttgttgataagagtccatgtattagca-ttcattgagctt |
35613839 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35613838 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt |
35613796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 383 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27533486 - 27533359
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27533486 |
gttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgcgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaat |
27533396 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
27533395 |
tatatgatgttgactaaaatgttgctatgttgtttaa |
27533359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37018436 - 37018300
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| | | || |
|
|
| T |
37018436 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccataagttgttgagttgtcttctatccacgt |
37018337 |
T |
 |
| Q |
434 |
gttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37018336 |
gttgttcatgaagtacttatgaagattatatgatgtt |
37018300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 14305661 - 14305734
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14305661 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14305734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 36134153 - 36134280
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-t |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36134153 |
gagctttgtcctcaccacgattt--gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagag |
36134249 |
T |
 |
| Q |
313 |
gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36134250 |
gtctaagttgcattgtcacatttgtcgagtc |
36134280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 14305558 - 14305683
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14305558 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
14305648 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14305649 |
tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg |
14305683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20115143 - 20115012
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| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20115143 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
20115052 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20115051 |
tcaccacgaataataggagttttgtcctccgcacgtttta |
20115012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3484880 - 3484802
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3484880 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagctgttaagttgttgttgaattatcatccatgagttgt |
3484802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27533716 - 27533606
Alignment:
| Q |
142 |
tacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27533716 |
tacgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcac--aata |
27533620 |
T |
 |
| Q |
241 |
ggagctttgtcctc |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
27533619 |
ggagctttgtcctc |
27533606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35613821 - 35613748
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35613821 |
ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
35613748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10712520 - 10712454
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10712520 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
10712454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10926290 - 10926224
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10926290 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
10926224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 22634604 - 22634721
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga---aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-t |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22634604 |
gagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagag |
22634700 |
T |
 |
| Q |
313 |
gtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22634701 |
gtctaagttgcattgtcgcat |
22634721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25689534 - 25689468
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25689534 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
25689468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Original strand, 35812632 - 35812776
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35812632 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagtcgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgaattgttaagttgttgagttgtcttct |
35812731 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35812732 |
atccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
35812776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14548555 - 14548478
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttg |
411 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14548555 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccttgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttg |
14548478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17807564 - 17807464
Alignment:
| Q |
422 |
ttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaaca |
521 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |
|
|
| T |
17807564 |
ttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctaagttgtttaaca |
17807474 |
T |
 |
| Q |
522 |
tattgattat |
531 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
17807473 |
tgttgattat |
17807464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7798570 - 7798512
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7798570 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
7798512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 13592535 - 13592613
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13592535 |
ttgttgagtcaaagtcgttgttgatgagtcgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
13592613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16997369 - 16997226
Alignment:
| Q |
335 |
tgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatga--------gttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16997369 |
tgtcgagtcaaagtcgttgttaatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgacatccatgagttgttaggttgttgagttgtcttcta |
16997270 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
| | |||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16997269 |
tccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
16997226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Original strand, 28569587 - 28569667
Alignment:
| Q |
154 |
ggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28569587 |
ggtgttttgttgttaa-attccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg |
28569667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 15042323 - 15042376
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15042323 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
15042376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15112101 - 15112048
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15112101 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
15112048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25090497 - 25090444
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25090497 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
25090444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12773879 - 12773820
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12773879 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
12773820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14038499 - 14038440
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14038499 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
14038440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 30235220 - 30235279
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat |
85 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30235220 |
tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat |
30235279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 14053628 - 14053682
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14053628 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc |
14053682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12569809 - 12569753
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12569809 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
12569753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 22634580 - 22634645
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22634580 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg |
22634645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 10712256 - 10712206
Alignment:
| Q |
481 |
attatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10712256 |
attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
10712206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 10926026 - 10925976
Alignment:
| Q |
481 |
attatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10926026 |
attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
10925976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17046281 - 17046227
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
17046281 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
17046227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 12299918 - 12299979
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12299918 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
12299979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 12349594 - 12349655
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349594 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
12349655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15093569 - 15093513
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15093569 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgtattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
15093513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 16488397 - 16488453
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16488397 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgttgca-ttgtcgagtcaaa |
16488453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 17962345 - 17962406
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17962345 |
ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaact |
17962406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 55795544 - 55795479
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
55795544 |
ttgatatattgatatctctttgctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactgagt |
55795479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 20157634 - 20157699
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20157634 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctgaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg |
20157699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 311
Target Start/End: Original strand, 30235277 - 30235308
Alignment:
| Q |
280 |
tatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30235277 |
tatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
30235308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 36134129 - 36134194
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
36134129 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctccccacg |
36134194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 16240295 - 16240349
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
16240295 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
16240349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 16377846 - 16377900
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
16377846 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
16377900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40471486 - 40471452
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatg |
128 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40471486 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatg |
40471452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42874642 - 42874588
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42874642 |
ttgtcgaatcaaagtcgttgttgatgagttgtcattcatgagttgttgagttgtc |
42874588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 52873587 - 52873641
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
52873587 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
52873641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3484831 - 3484794
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3484831 |
gttgttgttgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
3484794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8384919 - 8384854
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8384919 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
8384854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8391574 - 8391509
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8391574 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
8391509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12610721 - 12610680
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12610721 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
12610680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13569297 - 13569252
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13569297 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
13569252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14073915 - 14073850
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14073915 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
14073850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15256693 - 15256628
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15256693 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
15256628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 15353372 - 15353465
Alignment:
| Q |
49 |
ctgctgttatttaactaagt-gcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
15353372 |
ctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacat--gatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta |
15353465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 16348983 - 16349039
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16348983 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
16349039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 16357271 - 16357327
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16357271 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
16357327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 17089999 - 17090064
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17089999 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgttgttatttaactaagt |
17090064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17808498 - 17808433
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17808498 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
17808433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 311
Target Start/End: Original strand, 21339968 - 21339997
Alignment:
| Q |
282 |
tgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21339968 |
tgatgacgattggtaccacatgcatataag |
21339997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 23803699 - 23803740
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23803699 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
23803740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 29040920 - 29040981
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29040920 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
29040981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 51464216 - 51464257
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51464216 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
51464257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3096132 - 3096084
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
3096132 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt |
3096084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12902553 - 12902505
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
12902553 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt |
12902505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 15122124 - 15122168
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15122124 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
15122168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15705185 - 15705149
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcat |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15705185 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat |
15705149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23843271 - 23843227
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23843271 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
23843227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44675425 - 44675381
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44675425 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
44675381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 222)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 27409890 - 27410414
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27409890 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
27409989 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27409990 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
27410089 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
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T |
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299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
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T |
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497 |
Q |
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T |
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aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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Target: chr3; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 11069931 - 11069407
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198 |
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298 |
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T |
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398 |
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T |
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aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7109561 - 7109035
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T |
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| |
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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7113496 - 7112970
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T |
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Q |
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T |
 |
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ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
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 |
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ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
| |
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Q |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
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|
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 |
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497 |
Q |
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T |
 |
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aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 403; E-Value: 0
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Target Start/End: Complemental strand, 22336582 - 22336058
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| |
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| T |
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 |
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298 |
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T |
 |
| Q |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
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|
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 |
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aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
| |
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| |
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 |
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197 |
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 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
| |
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 |
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atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga |
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T |
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496 |
ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 397; E-Value: 0
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Target Start/End: Original strand, 11165775 - 11166297
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| |
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 |
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199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
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| |
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acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
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Q |
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Target: chr3; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 14499188 - 14498664
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298 |
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Target: chr3; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 4107643 - 4108169
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Target: chr3; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 4111495 - 4112021
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396 |
Q |
| |
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|
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 |
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| |
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|
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 |
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ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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| |
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| || || || |||||||||||| || |||||||| |
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|
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Target: chr3; HSP #13
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| |
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Q |
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 |
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Q |
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 |
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ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttg |
494 |
Q |
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16750983 |
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 |
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495 |
actaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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| |
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| || ||| || |||||||||||||||||||||||| |
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| |
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tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac |
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| |
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 |
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377 |
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| |
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Target: chr3; HSP #16
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gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga |
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| |
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Q |
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aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
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T |
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atcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattata |
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Target: chr3; HSP #24
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Q |
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T |
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Q |
| |
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taacatattgattat |
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tatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Target: chr3; HSP #26
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ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
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ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgttatgatgttgtt |
8489947 |
T |
 |
| Q |
517 |
taacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8489948 |
taagatattgattat |
8489962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 169 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5223013 - 5222761
Alignment:
| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5223013 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagctttgtcctccgcacgatgaaag |
5222917 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5222916 |
tatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaaattgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgataaattatca |
5222817 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtctt |
423 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5222816 |
tccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagtagtctt |
5222761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 294 - 531
Target Start/End: Original strand, 17317669 - 17317906
Alignment:
| Q |
294 |
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393 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17317669 |
gtaccacatgcatataagtgtctaagttccattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgaattgttaagtcgtcgatga |
17317768 |
T |
 |
| Q |
394 |
attatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt |
493 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17317769 |
attatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtaccaacgaatattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt |
17317868 |
T |
 |
| Q |
494 |
gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17317869 |
gacaaagatgttgctatgttgtttaacatattggttat |
17317906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12891493 - 12891184
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12891493 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
12891394 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12891393 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
12891304 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12891303 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
12891204 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12891203 |
tggtaccacatgcatataag |
12891184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17253075 - 17253384
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17253075 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
17253174 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17253175 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
17253264 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17253265 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
17253364 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17253365 |
tggtaccacatgcatataag |
17253384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Original strand, 17710633 - 17710923
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17710633 |
tgttatgtgacctgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaatgatgacatttagctccaaattattggatgc |
17710732 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17710733 |
atgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcatatgagtccatgcatagcattccattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt |
17710823 |
T |
 |
| Q |
223 |
tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaag |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17710824 |
tgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaag |
17710923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1145592 - 1145875
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1145592 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
1145691 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1145692 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
1145782 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1145783 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
1145875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15343645 - 15343928
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15343645 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
15343744 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15343745 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
15343835 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15343836 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctctgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15343928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 410791 - 411074
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
410791 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaagttgttggat |
410890 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
410891 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
410981 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
410982 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
411074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 8721196 - 8721479
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8721196 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
8721295 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8721296 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
8721386 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8721387 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
8721479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 9073083 - 9073366
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9073083 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
9073182 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9073183 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
9073273 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9073274 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
9073366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 10236454 - 10236715
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10236454 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatggtgt--atttatatgatgaactgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
10236551 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
10236552 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctgcgcacgattta |
10236642 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10236643 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
10236715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 13316247 - 13316507
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13316247 |
tgctgctgctgttatttgactaagtgcatg--gtatatttatacgatgaa-tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
13316343 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13316344 |
cgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta |
13316434 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13316435 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
13316507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15350289 - 15350572
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15350289 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
15350388 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15350389 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------tttttttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
15350479 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15350480 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15350572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15404535 - 15404818
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15404535 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaatttttggat |
15404634 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15404635 |
gcatgtcgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
15404725 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15404726 |
tttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgaatataag |
15404818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15825709 - 15825448
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15825709 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
15825612 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15825611 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
15825521 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15825520 |
taggagctttgtcctccacatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15825448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 15992163 - 15992424
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15992163 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaactgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
15992260 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15992261 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
15992351 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15992352 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15992424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38814354 - 38814161
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38814354 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
38814258 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38814257 |
tttgtcctccgcatgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
38814161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 41092405 - 41092667
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41092405 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgattgtgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt |
41092494 |
T |
 |
| Q |
143 |
acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt- |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41092495 |
acgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgttta |
41092593 |
T |
 |
| Q |
239 |
-taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41092594 |
ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
41092667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19809091 - 19808810
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19809091 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttattgaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgataaagtttagctccaaattattgaatgc |
19808992 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19808991 |
atgttgatatgtcgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt |
19808901 |
T |
 |
| Q |
223 |
tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19808900 |
tgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatgcttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19808810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3833644 - 3833451
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3833644 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
3833548 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3833547 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
3833451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Original strand, 30777265 - 30777558
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
30777265 |
tgttatgtgacttgattatgcttctgctgttatttaaccaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaagttgttggat |
30777364 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
30777365 |
gcatgttgatatgttga--------attacgatgttttgttcatgagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgtttattagaagc |
30777456 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtcta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30777457 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtcta |
30777556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7985793 - 7985487
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
7985793 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
7985696 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7985695 |
acgtttagctccaaattattgggtgcatgttgatatg---------atgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
7985606 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7985605 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttttgatgacgatt |
7985506 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7985505 |
ggtaccacatgcatataag |
7985487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13321036 - 13320755
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13321036 |
tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
13320939 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct |
221 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13320938 |
atgttgatatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct |
13320849 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgc---acgttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13320848 |
ttgtcctccgcacaacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
13320755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4710340 - 4710084
Alignment:
| Q |
52 |
ctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatga |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4710340 |
ctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatg- |
4710242 |
T |
 |
| Q |
150 |
ttacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggag |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
4710241 |
--------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagctttgtcctctgcacgattattaggag |
4710150 |
T |
 |
| Q |
245 |
ctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4710149 |
ttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa |
4710084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 23704861 - 23705074
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23704861 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
23704951 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23704952 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23705051 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23705052 |
gattggtaccacatgcatataag |
23705074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 23723317 - 23723530
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23723317 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
23723407 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23723408 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23723507 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23723508 |
gattggtaccacatgcatataag |
23723530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
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Target Start/End: Original strand, 23741773 - 23741986
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23741773 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
23741863 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23741864 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23741963 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23741964 |
gattggtaccacatgcatataag |
23741986 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 41201891 - 41202104
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41201891 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
41201981 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41201982 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
41202081 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41202082 |
gattggtaccacatgcatataag |
41202104 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 1598654 - 1598809
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| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1598654 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcctcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
1598752 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1598753 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtagagtc |
1598809 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 5150027 - 5150289
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| Q |
44 |
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142 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5150027 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt |
5150116 |
T |
 |
| Q |
143 |
acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt- |
238 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5150117 |
acgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttta |
5150215 |
T |
 |
| Q |
239 |
-taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5150216 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
5150289 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 15366994 - 15367253
Alignment:
| Q |
50 |
tgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15366994 |
tgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgtaggatgcatgttgatatgttgattacgat |
15367093 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
15367094 |
t---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg |
15367184 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15367185 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattagtaccacatgcatataag |
15367253 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19775358 - 19775194
Alignment:
| Q |
95 |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19775358 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
19775259 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19775258 |
gctttgtcctcaccacgtttagaagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
19775194 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 15942079 - 15942233
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15942079 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgata |
15942177 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15942178 |
aagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagt |
15942233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16333259 - 16332953
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| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||| |
|
|
| T |
16333259 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gataaataagatg |
16333162 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16333161 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
16333072 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16333071 |
agtcctcaccacgattatcaggagttttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
16332972 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16332971 |
ggtaccacatgcatataag |
16332953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 418003 - 417798
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| Q |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
418003 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
417913 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
417912 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
417813 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
417812 |
ccacatgcatataag |
417798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13250722 - 13250519
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
13250722 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
13250632 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13250631 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
13250532 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
13250531 |
ccacatgcatata |
13250519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13257368 - 13257165
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
13257368 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
13257278 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13257277 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
13257178 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
13257177 |
ccacatgcatata |
13257165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3690622 - 3690417
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
3690622 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
3690532 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3690531 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
3690432 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
3690431 |
ccacatgcatataag |
3690417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 14673303 - 14673508
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
14673303 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatatcattgagcttagt |
14673393 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14673394 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
14673493 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
14673494 |
ccacatgcatataag |
14673508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16696755 - 16696570
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| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16696755 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgacctttgtcctcaccatgtttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
16696659 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16696658 |
tttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
16696570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 20057507 - 20057712
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20057507 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
20057597 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20057598 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
20057697 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
20057698 |
ccacatgcatataag |
20057712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 15727025 - 15727238
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15727025 |
atgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
15727115 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15727116 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgac |
15727215 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15727216 |
gattggtaccacatgcatataag |
15727238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 31422647 - 31422860
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31422647 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
31422737 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31422738 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
31422837 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31422838 |
gattggtaccacatgcatataag |
31422860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24187836 - 24187566
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24187836 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
24187739 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24187738 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
24187651 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24187650 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcaagtttaaagtatattaacacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
24187566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55149037 - 55148767
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55149037 |
tgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
55148940 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
55148939 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
55148852 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
55148851 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataag |
55148767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 5106978 - 5107191
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5106978 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
5107068 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5107069 |
agcttagtcctcacaacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
5107168 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5107169 |
gattggtaccacatgcatataag |
5107191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 5426854 - 5427031
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5426854 |
tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca |
5426953 |
T |
 |
| Q |
234 |
cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5426954 |
cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
5427031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20723087 - 20722790
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
20723087 |
aattgatatattgatatca-tctgttattgtg--acctgactatgctgctgttgttatttaaataagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
20722993 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20722992 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
20722904 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20722903 |
agtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
20722805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 26794489 - 26794702
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26794489 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatttgtgtccatgcatagcatatcattg |
26794579 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26794580 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
26794679 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26794680 |
gattggtaccacatgcatataag |
26794702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37615404 - 37615191
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37615404 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
37615314 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37615313 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
37615214 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37615213 |
gattggtaccacatgcatataag |
37615191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 53380453 - 53380658
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
53380453 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt |
53380543 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53380544 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
53380643 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
53380644 |
ccacatgcatataag |
53380658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 53387105 - 53387310
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
53387105 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt |
53387195 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53387196 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
53387295 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
53387296 |
ccacatgcatataag |
53387310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 298
Target Start/End: Original strand, 15692371 - 15692571
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15692371 |
atgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgat---------tacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
15692461 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15692462 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
15692561 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
15692562 |
gattggtacc |
15692571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 20064145 - 20064350
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20064145 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
20064235 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20064236 |
cctcaccacgaatatgaggagctttgtcctctgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
20064335 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
20064336 |
ccacatgcatataag |
20064350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14670605 - 14670393
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt------ |
420 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14670605 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgttgagttgttgagtt |
14670506 |
T |
 |
| Q |
421 |
--cttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgttta |
518 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
14670505 |
gtcttcaacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgttta |
14670406 |
T |
 |
| Q |
519 |
acatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14670405 |
tgatattgattat |
14670393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 15584870 - 15585038
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta-- |
240 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15584870 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata |
15584969 |
T |
 |
| Q |
241 |
ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15584970 |
ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
15585038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 15591528 - 15591696
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta-- |
240 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15591528 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata |
15591627 |
T |
 |
| Q |
241 |
ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15591628 |
ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
15591696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10325939 - 10325633
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat-atgatgaaatgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
10325939 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaa-gatg |
10325841 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
10325840 |
acgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgatgattacgatt---------ttttgttgata-gagttcatgcattagcatt-cattgagttt |
10325752 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10325751 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccacacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
10325652 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10325651 |
ggtaccacatgcatataag |
10325633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6608437 - 6608260
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga----ttaggagctttgtcctccgca |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6608437 |
tgattacgatgaatacgatgttttgttataaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaatattaggagctttgtcctccgca |
6608338 |
T |
 |
| Q |
234 |
cgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6608337 |
cgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
6608260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16633806 - 16633628
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16633806 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
16633707 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16633706 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
16633628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16640416 - 16640238
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16640416 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
16640317 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16640316 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
16640238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43161081 - 43160903
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43161081 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
43160982 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43160981 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
43160903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43167318 - 43167140
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43167318 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
43167219 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43167218 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
43167140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5221372 - 5221203
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--g |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5221372 |
tgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttatag |
5221273 |
T |
 |
| Q |
242 |
gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5221272 |
gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
5221203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10003647 - 10003436
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10003647 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg |
10003557 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10003556 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
10003457 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10003456 |
gattggtaccacatgcatata |
10003436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10010294 - 10010083
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10010294 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg |
10010204 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10010203 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
10010104 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10010103 |
gattggtaccacatgcatata |
10010083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 839305 - 839035
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
839305 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaa-tgcataatgtctatatata--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacat |
839209 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
839208 |
tgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcact-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagttttgtcct |
839120 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||| ||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
839119 |
ccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag |
839035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Original strand, 16809038 - 16809200
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
16809038 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
16809134 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16809135 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
16809200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26889466 - 26889254
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26889466 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26889376 |
agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
26889277 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26889276 |
gattggtaccacatgcatataag |
26889254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 1333211 - 1333389
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1333211 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
1333310 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1333311 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
1333389 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
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Target Start/End: Complemental strand, 12482385 - 12482216
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| Q |
146 |
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239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
12482385 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
12482286 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12482285 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
12482216 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48423323 - 48423145
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| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48423323 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
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T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48423223 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48430101 - 48429923
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48430101 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacggaaattaggagctttgtcctccgcac |
48430002 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48430001 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
48429923 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 311
Target Start/End: Original strand, 10153831 - 10154042
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| Q |
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195 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10153831 |
gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgag |
10153921 |
T |
 |
| Q |
196 |
ctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacga |
290 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga |
10154021 |
T |
 |
| Q |
291 |
ttggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10154022 |
ttggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10904237 - 10904026
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10904237 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10904146 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgac |
10904047 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10904046 |
gattggtaccacatgcatata |
10904026 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10910909 - 10910698
Alignment:
| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10910909 |
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10910819 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10910818 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgac |
10910719 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10910718 |
gattggtaccacatgcatata |
10910698 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14682127 - 14681915
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327 |
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418 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14682127 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattgtcatgcatgagttgttaagttgttgacaagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagtt |
14682028 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgttta |
518 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |
|
|
| T |
14682027 |
gtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtcta |
14681928 |
T |
 |
| Q |
519 |
acatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
14681927 |
tgatattgattat |
14681915 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 12852846 - 12853032
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| Q |
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388 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12852846 |
attggtaccacatgcatataagaggttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagttattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt |
12852945 |
T |
 |
| Q |
389 |
gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12852946 |
aatgaattatcatctttgagtttcttagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
12853032 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5201183 - 5201014
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
5201183 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
5201084 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5201083 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgtttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
5201014 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 10846378 - 10846591
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10846378 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10846469 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgac |
10846568 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10846569 |
gattggtaccacatgcatataag |
10846591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16758665 - 16758878
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||| || | || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16758665 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttg---------ttttgttcatacgtgttcatgcatagcatatcattg |
16758755 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16758756 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
16758855 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16758856 |
gattggtaccacatgcatataag |
16758878 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 5420455 - 5420624
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| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
5420455 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatatcatatcattgagcttagtcctcaccacattttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
5420554 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5420555 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
5420624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
17241918 |
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T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17241822 |
tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
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| Q |
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gtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
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gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaa |
6598562 |
T |
 |
| Q |
267 |
gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6598561 |
gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
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gtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaa |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
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gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaa |
6605242 |
T |
 |
| Q |
267 |
gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6605241 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
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Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16624149 - 16624362
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193 |
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| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
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atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
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194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16624240 |
agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
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T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16624340 |
gattggtaccacatgcatgtaag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16747933 - 16748146
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16747933 |
atgatgaagtttagctctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctg---------ttttgttcatacgtgtccatgcatagcatatcattg |
16748023 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16748024 |
agtttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
16748123 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16748124 |
gattggtaccacatgcatataag |
16748146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16796043 - 16795895
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
16796043 |
gtcgcatttgtctagtcgaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttattaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattcta |
16795944 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16795943 |
ctcatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
16795895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15397944 - 15398200
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15397944 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
15398043 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagcttt |
223 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15398044 |
gcatgtcgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgttta-------- |
15398126 |
T |
 |
| Q |
224 |
gtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15398127 |
--------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag |
15398200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15360756 - 15360551
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcat--gatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15360756 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
15360657 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
15360656 |
gcatgtcgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacgatttttaggagc |
15360566 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
15360565 |
tttgtcctccgcacg |
15360551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15482632 - 15482439
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
15482632 |
tgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agttttgtcctcaccacgatt--ggagc |
15482538 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15482537 |
tttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
15482439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 16489774 - 16489970
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
16489774 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------tttttgtcataagtgtccatgcatagcatctcatttag-----tcc |
16489859 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16489860 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
16489959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15337498 - 15337293
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcat--gatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15337498 |
tgttatgtgacttgattatgctactgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacatttagctccaaattgttggat |
15337399 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
15337398 |
gcatgtcgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacgatttttaggagt |
15337308 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
15337307 |
tttgtcctccgcacg |
15337293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 311
Target Start/End: Original strand, 22643384 - 22643611
Alignment:
| Q |
52 |
ctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgatt |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22643384 |
ctgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg--- |
22643479 |
T |
 |
| Q |
152 |
acggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtc |
251 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22643480 |
------ttttgttcatacgagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgatta----------------------ttaggagctttgtc |
22643551 |
T |
 |
| Q |
252 |
ctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22643552 |
ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcgtataag |
22643611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 28351181 - 28351387
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
28351181 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgccgttatttagctaagtgcataatgtctatatatatgatgaataagatg |
28351280 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28351281 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatat---------gatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagctt |
28351370 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
28351371 |
agtcctcaccacgatta |
28351387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 31097733 - 31097884
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31097733 |
cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagtcttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa |
31097828 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31097829 |
gattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
31097884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 20461644 - 20461841
Alignment:
| Q |
145 |
gatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttagga |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
20461644 |
gatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcgccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--gga |
20461738 |
T |
 |
| Q |
244 |
gctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcg |
339 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20461739 |
gctttgtcctccccacgatgcgtaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcg |
20461837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15360596 - 15360500
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15360596 |
gagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15360500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 327332 - 327506
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
327332 |
agagtccatgcatgagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccatgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctat |
327427 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
327428 |
aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
327506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15337338 - 15337242
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15337338 |
gagctttgtcctccgcacgatttttaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15337242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 297
Target Start/End: Original strand, 16798211 - 16798336
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
16798211 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
16798307 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtac |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16798308 |
tatattaatac-tatgatgacgattggtac |
16798336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
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| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaa |
481 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30065459 |
gttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagtggtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaa |
30065369 |
T |
 |
| Q |
482 |
ttatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30065368 |
ttatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
30065319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 7793517 - 7793691
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
7793517 |
agagtccatgcattagcata-cattgaactttgtcctcagcacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
7793612 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7793613 |
aagtatattaatact-atgataacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
7793691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 2897989 - 2898164
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
2897989 |
agagtccatgcattagcata-cattgatctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
2898084 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2898085 |
aagtatattaatact-atgatgaagtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
2898164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 26789012 - 26789085
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26789012 |
ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
26789085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 28368673 - 28368767
Alignment:
| Q |
220 |
ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28368673 |
ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
28368767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 28376491 - 28376585
Alignment:
| Q |
220 |
ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28376491 |
ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
28376585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 28384313 - 28384407
Alignment:
| Q |
220 |
ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28384313 |
ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
28384407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 4589289 - 4589420
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
4589289 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgat--------tgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattg |
4589378 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4589379 |
agctttgtcctccccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
4589420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 311
Target Start/End: Original strand, 29695943 - 29696008
Alignment:
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29695943 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
29696008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5220580 - 5220483
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| Q |
425 |
tacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatat |
524 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5220580 |
tacctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagattata---------tgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatat |
5220490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Original strand, 26788899 - 26789034
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
26788899 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatattattg |
26788989 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26788990 |
agcttagttctcaccacgtatattaggagctttgtcctccgcacg |
26789034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14441104 - 14440975
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc-atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14441104 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatttgtcttctatccatgagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtg |
14441005 |
T |
 |
| Q |
449 |
cctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14441004 |
cttatgaagattatacgatgtttatgatgt |
14440975 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Original strand, 10543014 - 10543199
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatcta--------tgagttgtcgagttgtcttct |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| | | | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10543014 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccacgattcgttaaattgttgagttgtcttct |
10543113 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
516 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10543114 |
acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt |
10543199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12339397 - 12339324
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12339397 |
ttcattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctccgcacgat |
12339324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14572431 - 14572352
Alignment:
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14572431 |
aagtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc |
14572352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15464814 - 15464723
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15464814 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagttttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctccgcacgat |
15464723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 37440078 - 37440144
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37440078 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
37440144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 18700869 - 18700947
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18700869 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
18700947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Original strand, 49668362 - 49668448
Alignment:
| Q |
262 |
tgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49668362 |
tgaaagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
49668448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 434
Target Start/End: Original strand, 14067291 - 14067352
Alignment:
| Q |
373 |
gagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtg |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
14067291 |
gagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtg |
14067352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 46821974 - 46821921
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46821974 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
46821921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 470
Target Start/End: Original strand, 2842664 - 2842805
Alignment:
| Q |
337 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacc |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
2842664 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgtaaagttgttgagttgtcttctatc |
2842763 |
T |
 |
| Q |
429 |
tatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2842764 |
cacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
2842805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9512752 - 9512669
Alignment:
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9512752 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
9512669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9520727 - 9520644
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| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9520727 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
9520644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 12120166 - 12120220
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12120166 |
gtcgcatttgttgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtta |
12120220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 38962284 - 38962338
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| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
38962284 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcattcatgagttgtta |
38962338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13543728 - 13543679
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| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13543728 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
13543679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 8489628 - 8489694
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8489628 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacg |
8489694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Original strand, 11300902 - 11301017
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttttagg |
242 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11300902 |
tgattaaggtgtcttgttgataagagtccatgcattagcatt-cactgagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacg-attagg |
11300999 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11301000 |
agctttgtcctccgcacg |
11301017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32307468 - 32307409
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32307468 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
32307409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11854422 - 11854328
Alignment:
| Q |
167 |
taagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcac |
259 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11854422 |
taagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgacgattagcagctttatcctccgcacg-tttaggagctttgtcctccgcac |
11854328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14441153 - 14441075
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14441153 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgtcgatgagttgttatccatgagctgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt |
14441075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 343
Target Start/End: Original strand, 14577112 - 14577189
Alignment:
| Q |
267 |
gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14577112 |
gtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagacgtctaagatgcataatcgcatttgtcgagtc |
14577189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35353414 - 35353361
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35353414 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
35353361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 11557694 - 11557753
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11557694 |
gattggtaccacatgcatataagagtcttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
11557753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 386
Target Start/End: Original strand, 42353679 - 42353731
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42353679 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttg |
42353731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16103612 - 16103529
Alignment:
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16103612 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagatgtatgagtcccatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
16103529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5214776 - 5214722
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5214776 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttattaagttgtc |
5214722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 5420324 - 5420386
Alignment:
| Q |
2 |
attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5420324 |
attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactttgctgctgctgttatttaact |
5420386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 5426722 - 5426784
Alignment:
| Q |
2 |
attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5426722 |
attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
5426784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 519
Target Start/End: Original strand, 11301027 - 11301077
Alignment:
| Q |
469 |
tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
11301027 |
tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgctgtttaa |
11301077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11854233 - 11854183
Alignment:
| Q |
469 |
tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa |
519 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11854233 |
tttatgatgagaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaa |
11854183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 13210654 - 13210712
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13210654 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
13210712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 43890179 - 43890257
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43890179 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatggattgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgt |
43890257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10562532 - 10562479
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10562532 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttattaagttgt |
10562479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11854318 - 11854266
Alignment:
| Q |
208 |
cacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacga |
261 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11854318 |
cacgtttaggagctttgtcctccgcacg-tttaggagctttgtcctccgcacga |
11854266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15467667 - 15467602
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttg |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
15467667 |
gattggtaccacatacatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcgaagttgttg |
15467602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11849111 - 11849056
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11849111 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
11849056 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11862589 - 11862534
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11862589 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
11862534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 13520978 - 13521038
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtt |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |
|
|
| T |
13520978 |
gttgttgatgaattttcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtt |
13521038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 1645004 - 1645063
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1645004 |
gattggtaccacatgcatataagaggtcgaagttgcacagtcgcatttgtcgagtcaaag |
1645063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 248
Target Start/End: Original strand, 11300979 - 11301029
Alignment:
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagcttt |
248 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11300979 |
tttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacg-tttaggagcttt |
11301029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11854285 - 11854231
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagcttt |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11854285 |
gagctttgtcctccgcacgactaggagctttgtcctccgcacg-tttaggagcttt |
11854231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11854309 - 11854243
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11854309 |
gagctttgtcctccgcacgtttaggagctttgtcctccgcacg-actaggagctttgtcctccgcacg |
11854243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16097156 - 16097097
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16097156 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagttaaag |
16097097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15464743 - 15464701
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15464743 |
gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacg |
15464701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 23083686 - 23083740
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
23083686 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
23083740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12172592 - 12172536
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12172592 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattctcgca-ttgtcgagtcaaa |
12172536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12482515 - 12482454
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12482515 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
12482454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 14878839 - 14878895
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
14878839 |
attggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
14878895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 15584740 - 15584801
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15584740 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
15584801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 15591398 - 15591459
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15591398 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
15591459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44269453 - 44269408
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44269453 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
44269408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 387
Target Start/End: Original strand, 19884816 - 19884860
Alignment:
| Q |
343 |
caaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19884816 |
caaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
19884860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 26196741 - 26196796
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26196741 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtctca-ttgtcgagtcaa |
26196796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 11425039 - 11425094
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
11425039 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
11425094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 12174581 - 12174640
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12174581 |
gattggtaccacatgcatataagaggtataagatgcacagtcgcatttgtcgagtcaaag |
12174640 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18438331 - 18438276
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18438331 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
18438276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Original strand, 43890228 - 43890356
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagt--------tgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaa |
441 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
43890228 |
gttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagtcgttaatttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttta |
43890327 |
T |
 |
| Q |
442 |
agaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43890328 |
tgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
43890356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12399004 - 12398950
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
12399004 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
12398950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15565371 - 15565309
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
15565371 |
gttgttgatgaattgtcatccgtgagttgttaggttgttgatgaattgtcatccacgagttgt |
15565309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26683150 - 26683096
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
26683150 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
26683096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43840728 - 43840674
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
43840728 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
43840674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 1333080 - 1333141
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1333080 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
1333141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15565338 - 15565301
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15565338 |
gttgttgatgaattgtcatccacgagttgttaagttgt |
15565301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16633937 - 16633872
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16633937 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
16633872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16640547 - 16640482
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16640547 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
16640482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 19726222 - 19726278
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19726222 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
19726278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43161212 - 43161147
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43161212 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
43161147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43167449 - 43167384
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43167449 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
43167384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44494580 - 44494539
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
44494580 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
44494539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48423454 - 48423389
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48423454 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
48423389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48430232 - 48430167
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48430232 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
48430167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50242636 - 50242595
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50242636 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
50242595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 322388 - 322333
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
322388 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
322333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 855933 - 855889
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
855933 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
855889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6598722 - 6598690
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgata |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6598722 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgata |
6598690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6605402 - 6605370
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgata |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6605402 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgata |
6605370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14972656 - 14972600
Alignment:
| Q |
288 |
cgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14972656 |
cgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgttgagtc |
14972600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 15878374 - 15878418
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15878374 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
15878418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16369194 - 16369150
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16369194 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
16369150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 470
Target Start/End: Original strand, 18700960 - 18701016
Alignment:
| Q |
414 |
gagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18700960 |
gagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgctcatgaagattatatgatgtt |
18701016 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 23053391 - 23053435
Alignment:
| Q |
290 |
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333 |
Q |
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|
|
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23053391 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 23077780 - 23077824
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
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|
|
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23077780 |
attggtaccacatgcatatgagaggtctaagttgcattgtcgcat |
23077824 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23408223 - 23408179
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
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|
|
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23408223 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
23408179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 24628725 - 24629249
Alignment:
| Q |
1 |
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98 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24628725 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
24628824 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24628825 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
24628924 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24628925 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
24629024 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24629025 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
24629124 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24629125 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
24629215 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24629216 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
24629249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27601656 - 27601128
Alignment:
| Q |
1 |
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94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27601656 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatattatgaaa |
27601557 |
T |
 |
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27601556 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
27601457 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
294 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27601456 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
27601357 |
T |
 |
| Q |
295 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa |
394 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27601356 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa |
27601257 |
T |
 |
| Q |
395 |
ttatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt |
493 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27601256 |
ttatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgtt |
27601166 |
T |
 |
| Q |
494 |
gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27601165 |
gactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
27601128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24649217 - 24648691
Alignment:
| Q |
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96 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24649217 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg |
24649118 |
T |
 |
| Q |
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atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24649117 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
24649018 |
T |
 |
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24649017 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
24648918 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24648917 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt |
24648818 |
T |
 |
| Q |
397 |
atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga |
495 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24648817 |
atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga |
24648727 |
T |
 |
| Q |
496 |
ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24648726 |
ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttggttat |
24648691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 27379679 - 27380202
Alignment:
| Q |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27379679 |
aattgatatattgatatctctct-ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
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T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27379778 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
27379877 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27379878 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtacc |
27379977 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27379978 |
acatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
27380077 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27380078 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
27380168 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27380169 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
27380202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 27383725 - 27384248
Alignment:
| Q |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27383824 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
27383923 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27383924 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtacc |
27384023 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27384024 |
acatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
27384123 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27384124 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
27384214 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27384215 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
27384248 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Original strand, 12901758 - 12902196
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg------atgaaa |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12901758 |
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T |
 |
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12901858 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
12901957 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
294 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12901958 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
12902057 |
T |
 |
| Q |
295 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa |
394 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12902058 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa |
12902157 |
T |
 |
| Q |
395 |
ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12902158 |
ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
12902196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Original strand, 10101891 - 10102370
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg------------ |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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89 |
atgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcattt |
188 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10101989 |
atgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcattt |
10102088 |
T |
 |
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
10102089 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac |
10102188 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
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| T |
10102189 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtc |
10102288 |
T |
 |
| Q |
389 |
gatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt |
469 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
10102289 |
gatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgtcgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt |
10102370 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31344826 - 31344466
Alignment:
| Q |
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267 |
Q |
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|
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31344826 |
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31344729 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
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| T |
31344728 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
31344629 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
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| T |
31344628 |
tccatgagttgttaagttgt-gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat |
31344530 |
T |
 |
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468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
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gtttatgatgtgaactatataaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 30345433 - 30345785
Alignment:
| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
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30345433 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
30345530 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
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| T |
30345531 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
30345630 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
30345631 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- |
30345727 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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| T |
30345728 |
------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
30345785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1283029 - 1282716
Alignment:
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217 |
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316 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
1282931 |
T |
 |
| Q |
317 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag |
416 |
Q |
| |
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|
| T |
1282930 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctataagttgtcgag |
1282831 |
T |
 |
| Q |
417 |
ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
516 |
Q |
| |
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| T |
1282830 |
ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt |
1282731 |
T |
 |
| Q |
517 |
taacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| |
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1282730 |
taagatattgattat |
1282716 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Original strand, 41531470 - 41531774
Alignment:
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316 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41531470 |
gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct |
41531568 |
T |
 |
| Q |
317 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag |
416 |
Q |
| |
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|
| T |
41531569 |
aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag |
41531668 |
T |
 |
| Q |
417 |
ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt |
516 |
Q |
| |
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|
| T |
41531669 |
ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaagattgctatgttgtt |
41531759 |
T |
 |
| Q |
517 |
taacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |
|
|
| T |
41531760 |
taacatgttgattat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 30970998 - 30971307
Alignment:
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Q |
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|
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aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
30971097 |
T |
 |
| Q |
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cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30971098 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
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T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
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| T |
30971188 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
30971287 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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|
| T |
30971288 |
tggtaccacatgcatataag |
30971307 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 21147310 - 21147613
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21147310 |
aattgatatattgatatcttcctgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
21147407 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21147408 |
acgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
21147497 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
295 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21147498 |
agtcctcaccacgattattagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
21147597 |
T |
 |
| Q |
296 |
accacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21147598 |
accacatgcatataag |
21147613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 13970410 - 13970693
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13970510 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
13970600 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13970601 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
13970693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24714777 - 24714494
Alignment:
| Q |
26 |
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Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24714777 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
24714678 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24714677 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
24714587 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24714586 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
24714494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 45057466 - 45057749
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45057466 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
45057565 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45057566 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
45057656 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45057657 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag |
45057749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37318339 - 37318058
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37318339 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaacgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
37318240 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37318239 |
atgttgatatgttgattacggtgatt---------tgtgcatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt |
37318149 |
T |
 |
| Q |
223 |
tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37318148 |
tgtcctccgcatgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatataag |
37318058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9784542 - 9784338
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
9784542 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttttcttcta |
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T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg |
526 |
Q |
| |
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| T |
9784442 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagtttatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgccatgttgtctatgatattg |
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T |
 |
| Q |
527 |
attat |
531 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
9784342 |
attat |
9784338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 41604773 - 41605056
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41604773 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaactgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
41604872 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41604873 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
41604963 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41604964 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
41605056 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 41610670 - 41610953
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41610670 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
41610769 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41610770 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
41610860 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41610861 |
tttgtcctccgcacgattattagaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
41610953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24872426 - 24872660
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24872426 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
24872525 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24872526 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatga---------tttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
24872615 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24872616 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta |
24872660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 24640981 - 24641287
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
24640981 |
aattgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacctgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
24641078 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24641079 |
acgtttagctccaaattattggatgtttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtgcatgcattagcatt-cattgagctt |
24641168 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24641169 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgttctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
24641268 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24641269 |
ggtaccacatgcatataag |
24641287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11677535 - 11677229
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
11677535 |
aattgatatattgacatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
11677438 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11677437 |
acgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatggttacaatgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
11677348 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11677347 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
11677248 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11677247 |
ggtaccacatgcatataag |
11677229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24880311 - 24880545
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24880311 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
24880410 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24880411 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatga---------tttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
24880500 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24880501 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta |
24880545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12829082 - 12828869
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12829082 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
12828992 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12828991 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatactaatacttatgatgac |
12828892 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12828891 |
gattggtaccacatgcatataag |
12828869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 338
Target Start/End: Original strand, 19928638 - 19928826
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19928638 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
19928733 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc |
338 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19928734 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtctcatttgtc |
19928826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 311
Target Start/End: Original strand, 24914063 - 24914274
Alignment:
| Q |
96 |
gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgag |
195 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24914063 |
gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgag |
24914153 |
T |
 |
| Q |
196 |
ctttgtcctcaccacgat---taggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacga |
290 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24914154 |
cttagtcctcaccacgatgattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga |
24914253 |
T |
 |
| Q |
291 |
ttggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24914254 |
ttggtaccacatgcatataag |
24914274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23171048 - 23170835
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23171048 |
atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgtccataagagtccatgcatagcatctcattg |
23170958 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23170957 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23170858 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23170857 |
gattggtaccacatgcatataag |
23170835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23582305 - 23582092
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23582305 |
atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgtccataagagtccatgcatagcatctcattg |
23582215 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23582214 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
23582115 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23582114 |
gattggtaccacatgcatataag |
23582092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16928358 - 16928153
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
16928358 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
16928268 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16928267 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
16928168 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
16928167 |
ccacatgcatataag |
16928153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16997052 - 16996847
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
16997052 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
16996962 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996961 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
16996862 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996861 |
ccacatgcatataag |
16996847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17003685 - 17003480
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
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| T |
17003685 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
17003595 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
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|
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| T |
17003594 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
17003495 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
17003494 |
ccacatgcatataag |
17003480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 18855595 - 18855779
Alignment:
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245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18855595 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
18855690 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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18855779 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24503169 - 24502899
Alignment:
| Q |
31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24503169 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
24503072 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24503071 |
tgatataatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagctttgtcct |
24502984 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24502983 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataag |
24502899 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 22321081 - 22321294
Alignment:
| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
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22321081 |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22321172 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22321271 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22321272 |
gattggtaccacatgcatataag |
22321294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 22327234 - 22327447
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| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22327234 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
22327324 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22327325 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22327424 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22327425 |
gattggtaccacatgcatataag |
22327447 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 60786 - 60602
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| Q |
147 |
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245 |
Q |
| |
|
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| T |
60786 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggaa-tttgtcctccacacgttttaggagc |
60691 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
60690 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
60602 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10873540 - 10873335
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gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10873540 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
10873450 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10873449 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
10873350 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
10873349 |
ccacatgcatataag |
10873335 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27599264 - 27599061
Alignment:
| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27599264 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
27599174 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27599173 |
tcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
27599074 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
27599073 |
acatgcatataag |
27599061 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41666919 - 41666733
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| Q |
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245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41666919 |
tgattaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
41666823 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcattt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41666822 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataggaatctaagttgcattgtcgaattt |
41666733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 44381343 - 44381520
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44381343 |
tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca |
44381442 |
T |
 |
| Q |
234 |
cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44381443 |
cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
44381520 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23187045 - 23186861
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| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
23187045 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttg-aggagc |
23186950 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23186949 |
tttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
23186861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1843083 - 1842880
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| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1843083 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
1842993 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1842992 |
tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
1842893 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
1842892 |
acatgcatataag |
1842880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23598307 - 23598124
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| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
23598307 |
gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttg-aggagct |
23598212 |
T |
 |
| Q |
247 |
ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23598211 |
ttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
23598124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29233530 - 29233327
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ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29233530 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
29233440 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29233439 |
tcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtacc |
29233340 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
29233339 |
acatgcatataag |
29233327 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29346829 - 29346626
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| Q |
104 |
ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29346829 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc |
29346739 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29346738 |
tcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtacc |
29346639 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
29346638 |
acatgcatataag |
29346626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27617307 - 27617095
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atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27617307 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
27617218 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27617217 |
agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
27617118 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27617117 |
gattggtaccacatgcatataag |
27617095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9340237 - 9340059
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9340237 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
9340138 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9340137 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
9340059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9488871 - 9488693
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9488871 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
9488772 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9488771 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
9488693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9608132 - 9607954
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9608132 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
9608033 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9608032 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
9607954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10866151 - 10865970
Alignment:
| Q |
134 |
atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10866151 |
atgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctcc |
10866053 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10866052 |
gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
10865970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16922486 - 16922308
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16922486 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
16922387 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16922386 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
16922308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 19490076 - 19490254
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19490076 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
19490175 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19490176 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19490254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26125109 - 26124969
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26125109 |
gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgacgaaagtatattaatacttgtgatgacgatt |
26125011 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26125010 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
26124969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27216020 - 27215842
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27216020 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
27215921 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27215920 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
27215842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 28432064 - 28432242
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28432064 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
28432163 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28432164 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
28432242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 13306741 - 13306919
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13306741 |
tgattacgatgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
13306840 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13306841 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
13306919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16985898 - 16985720
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16985898 |
tgattacgatgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
16985799 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16985798 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
16985720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27369258 - 27369089
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
27369258 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
27369159 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27369158 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27369089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 44388013 - 44388190
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44388013 |
tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca |
44388112 |
T |
 |
| Q |
234 |
cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44388113 |
cgattattaggagctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
44388190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 26877663 - 26877875
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26877663 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
26877752 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26877753 |
agtttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
26877852 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26877853 |
gattggtaccacatgcatataag |
26877875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27375768 - 27375599
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
27375768 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctaaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
27375669 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27375668 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
27375599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 22461349 - 22461516
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
22461349 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgatat--gagctttgtcctccacacgattaaagta |
22461444 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22461445 |
tattaaaact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
22461516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24735342 - 24735168
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
24735342 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
24735247 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24735246 |
aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
24735168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27196972 - 27196823
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
27196972 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctat--atatgatgaataagatg |
27196875 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgatt |
151 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
27196874 |
acatttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacggtgatt |
27196823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 32215396 - 32215474
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32215396 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt |
32215474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 21139292 - 21139376
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat |
85 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
21139292 |
aattgatatattgatatcttcctgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatatctatatat |
21139376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26125155 - 26125067
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26125155 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
26125067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27195606 - 27195533
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27195606 |
ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacaagcatataag |
27195533 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1283053 - 1282987
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1283053 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
1282987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 41531446 - 41531512
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41531446 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
41531512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17306331 - 17306253
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17306331 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
17306253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 343
Target Start/End: Original strand, 19691914 - 19691976
Alignment:
| Q |
282 |
tgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19691914 |
tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
19691976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38967138 - 38967084
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38967138 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtta |
38967084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10866373 - 10866272
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
10866373 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
10866283 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
10866282 |
cctcaccacga |
10866272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 24872660 - 24872707
Alignment:
| Q |
264 |
aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24872660 |
aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
24872707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 24880545 - 24880592
Alignment:
| Q |
264 |
aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24880545 |
aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
24880592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24367500 - 24367446
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
24367500 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcattcatgagttgtta |
24367446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 22134501 - 22134584
Alignment:
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22134501 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagagatttaagttgcatagtcgcatttgtcaagtcaaag |
22134584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25175640 - 25175581
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175640 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
25175581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 28653710 - 28653763
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28653710 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
28653763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36839042 - 36838904
Alignment:
| Q |
340 |
agtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacctat |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||| | | |
|
|
| T |
36839042 |
agtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccac |
36838943 |
T |
 |
| Q |
432 |
gtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36838942 |
gtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
36838904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24515029 - 24514977
Alignment:
| Q |
335 |
tgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24515029 |
tgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
24514977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27195653 - 27195581
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27195653 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt |
27195581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28405808 - 28405721
Alignment:
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattg----gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28405808 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtacgtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
28405721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21327890 - 21327946
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21327890 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
21327946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 23020029 - 23020085
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23020029 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
23020085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24673360 - 24673304
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24673360 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
24673304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24679977 - 24679921
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24679977 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
24679921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 311
Target Start/End: Original strand, 30657567 - 30657603
Alignment:
| Q |
275 |
atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30657567 |
atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
30657603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 38442 - 38496
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
38442 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
38496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 19646009 - 19646055
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcat |
72 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19646009 |
tgttatgtgacttgactgtactactgctgttatttaactaagtgcat |
19646055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20322441 - 20322387
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
20322441 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
20322387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 23072276 - 23072330
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
23072276 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
23072330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21318959 - 21319015
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21318959 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttggattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
21319015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 22799449 - 22799505
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22799449 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
22799505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27369388 - 27369327
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27369388 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
27369327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27375898 - 27375837
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27375898 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
27375837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 32215445 - 32215482
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32215445 |
gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
32215482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 44381212 - 44381273
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44381212 |
ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaact |
44381273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22336922 - 22336867
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22336922 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
22336867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23657633 - 23657575
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23657633 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacattt-tcgagtcaaag |
23657575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24174870 - 24174759
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt-gcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatg |
128 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24174870 |
tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacat--gatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcata |
24174774 |
T |
 |
| Q |
129 |
atgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
24174773 |
ttgagatgttgatta |
24174759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7679408 - 7679366
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7679408 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcg |
7679366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 23654713 - 23654767
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
23654713 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
23654767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9340368 - 9340303
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9340368 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
9340303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9489002 - 9488937
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9489002 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
9488937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9608263 - 9608198
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9608263 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
9608198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 13306610 - 13306671
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13306610 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
13306671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16922617 - 16922552
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16922617 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
16922552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16986029 - 16985968
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16986029 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
16985968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 19489945 - 19490006
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19489945 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
19490006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 24655403 - 24655496
Alignment:
| Q |
49 |
ctgctgttatttaactaagt-gcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
24655403 |
ctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacat--gatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta |
24655496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 28431933 - 28431994
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28431933 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
28431994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 32215322 - 32215363
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32215322 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
32215363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 44387882 - 44387943
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44387882 |
ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgttgctgttatttaact |
44387943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23031169 - 23031125
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23031169 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
23031125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 24716837 - 24716892
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24716837 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
24716892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 40622534 - 40622578
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40622534 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
40622578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 45678452 - 45678496
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
45678452 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
45678496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:
Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 67547 - 68071
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
67547 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
67646 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67647 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
67746 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67747 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
67846 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67847 |
acatgcatataagtgtctaagtttcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
67946 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67947 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
68037 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
68038 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
68071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Original strand, 59556 - 59768
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
59556 |
atgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcattg |
59646 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
59647 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
59746 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
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59747 |
gattggtaccacatgcatataa |
59768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 19613 - 19691
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412 |
Q |
| |
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19613 |
ttgtcgagttaaagtcgttgttaatgagttgtcatccatgagttgctaatttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
19691 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22111791 - 22111267
Alignment:
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T |
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gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
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| T |
22111691 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
22111592 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
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| T |
22111591 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
22111492 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
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| T |
22111491 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
22111392 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
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| T |
22111391 |
catccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact |
22111301 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
22111300 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
22111267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 43251673 - 43251147
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
43251673 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg |
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T |
 |
| Q |
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atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43251573 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
43251474 |
T |
 |
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
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|
| T |
43251473 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
43251374 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43251373 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt |
43251274 |
T |
 |
| Q |
397 |
atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga |
495 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43251273 |
atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga |
43251183 |
T |
 |
| Q |
496 |
ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43251182 |
ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
43251147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 21972827 - 21973351
Alignment:
| Q |
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98 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21972827 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
21972926 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21972927 |
gatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
21973026 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21973027 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtttattaatacttatgatgacgattggtacc |
21973126 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21973127 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattatcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
21973226 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21973227 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgacc |
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T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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aaaatattgctatgttgtttaacatgttgtttat |
21973351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 21976916 - 21977442
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aattgatatattgatatctctctattgctgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg |
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T |
 |
| Q |
97 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc |
196 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21977016 |
atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagt |
21977115 |
T |
 |
| Q |
197 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21977116 |
tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
21977215 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21977216 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattatcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt |
21977315 |
T |
 |
| Q |
397 |
atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga |
495 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21977316 |
atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga |
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T |
 |
| Q |
496 |
ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
| || || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21977407 |
ccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
21977442 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 21828456 - 21828817
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21828554 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
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T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat |
21828753 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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|
|
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gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 18863087 - 18863448
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| Q |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18863185 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
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T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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| T |
18863285 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat |
18863384 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18863385 |
gtttacgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
18863448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21410614 - 21410253
Alignment:
| Q |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
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21410517 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
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|
| T |
21410516 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
21410417 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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| T |
21410416 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgatttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgat |
21410317 |
T |
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| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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|
| T |
21410316 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
21410253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21805106 - 21804745
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
21805106 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
21805009 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21805008 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
21804909 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
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21804908 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgatttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgat |
21804809 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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21804808 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
21804745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 30940519 - 30940871
Alignment:
| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
30940519 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
30940616 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30940617 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
30940716 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30940717 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- |
30940813 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30940814 |
------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
30940871 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 14398265 - 14398624
Alignment:
| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
14398265 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaacaagattaggagctttgtcctccacacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
14398362 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14398363 |
tatattaatacatatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaaattgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
14398462 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
14398463 |
tccatgaattgttaagttgttgatgaattatcatc--tgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacatatgaagattatacgat |
14398560 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14398561 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
14398624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21387022 - 21386661
Alignment:
| Q |
169 |
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
21387022 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgccatccgcacgttt-aggaactttgtcctccgcacaatgaaag |
21386925 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21386924 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
21386825 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21386824 |
tccatgagttgttaagttgttgataaattatcatctttgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacttataaagattatacgat |
21386725 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21386724 |
gtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgttatgatgttgtttaagatattgattat |
21386661 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19278529 - 19278767
Alignment:
| Q |
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94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19278529 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatatattgaaa |
19278628 |
T |
 |
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19278629 |
tgatgacgtttagctccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
19278728 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgca |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19278729 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgca |
19278767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 26935195 - 26935504
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26935195 |
aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga |
26935294 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26935295 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
26935384 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26935385 |
gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat |
26935484 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26935485 |
tggtaccacatgcatataag |
26935504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 23845803 - 23846086
Alignment:
| Q |
26 |
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123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23845803 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
23845902 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23845903 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
23845993 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23845994 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
23846086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15531859 - 15531666
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15531859 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
15531763 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15531762 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
15531666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23913803 - 23913599
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
23913803 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttaatttgtcttcta |
23913704 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg |
526 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
23913703 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattg |
23913604 |
T |
 |
| Q |
527 |
attat |
531 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
23913603 |
attat |
23913599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19905584 - 19905278
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| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
19905584 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
19905487 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19905486 |
acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
19905397 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19905396 |
agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
19905297 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19905296 |
ggtaccacatgcatataag |
19905278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 20023969 - 20024252
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| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
20023969 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaagttgttggat |
20024068 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20024069 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagt |
20024159 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20024160 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacattcatataag |
20024252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 147 - 342
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147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24445642 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
24445738 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24445739 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataactgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
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agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15538397 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacaattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaag |
15538300 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15538299 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16883267 - 16883480
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16883267 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
16883357 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16883358 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
16883457 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16883458 |
gattggtaccacatgcatataag |
16883480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3216325 - 3216043
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3216325 |
tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
3216228 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3216227 |
atgttgatatgttga---------ttacagtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagc |
3216138 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3216137 |
tttgtcctccgcacgacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
3216043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 17828718 - 17828911
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17828718 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
17828814 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17828815 |
tttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
17828911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 23847151 - 23847343
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23847151 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
23847246 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23847247 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
23847343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19111228 - 19111017
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
19111228 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
19111138 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19111137 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
19111038 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtcta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19111037 |
ccacatgcatataagagtcta |
19111017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19117519 - 19117308
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
19117519 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
19117429 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19117428 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
19117329 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtcta |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19117328 |
ccacatgcatataagagtcta |
19117308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20527508 - 20527215
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20527508 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
20527411 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20527410 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
20527323 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcat |
325 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
20527322 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcat |
20527224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18865332 - 18865127
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
18865332 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
18865242 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18865241 |
cctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
18865142 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18865141 |
ccacatgcacataag |
18865127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32598609 - 32598463
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32598609 |
ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
32598511 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32598510 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
32598463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32605141 - 32604995
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32605141 |
ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
32605043 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32605042 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
32604995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 17055517 - 17055700
Alignment:
| Q |
149 |
attacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctt |
247 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17055517 |
attaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctt |
17055613 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17055614 |
tgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatacaggagtctaagttgcattgtcgcatt |
17055700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 17669665 - 17669878
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17669665 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
17669755 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17669756 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
17669855 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17669856 |
gattggtaccacatgcatataag |
17669878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19496367 - 19496186
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| Q |
134 |
atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19496367 |
atgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc |
19496269 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19496268 |
gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19496186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19498415 - 19498234
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| Q |
134 |
atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19498415 |
atgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc |
19498317 |
T |
 |
| Q |
231 |
gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19498316 |
gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19498234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29123089 - 29122884
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
29123089 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattaca---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
29122999 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29122998 |
cctcaccacatttattaggagctttgtcctccgcacgttttatagtagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
29122899 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
29122898 |
ccacatgcatataag |
29122884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22047947 - 22047742
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| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
22047947 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
22047857 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22047856 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
22047757 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
22047756 |
ccacatgcatataag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 22115824 - 22116030
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201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
22115824 |
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22115915 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22115916 |
cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
22116015 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
22116016 |
ccacatgcatataag |
22116030 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
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Target Start/End: Original strand, 30308910 - 30309073
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
30308910 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
30309006 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30309007 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
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T |
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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
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| Q |
102 |
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201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
8354869 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt |
8354959 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8354960 |
cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggca |
8355059 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
8355060 |
ccacatgcatataag |
8355074 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 17676317 - 17676530
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
194 |
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288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17676408 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
17676507 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17676508 |
gattggtaccacatgcatataag |
17676530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22083841 - 22083628
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22083841 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22083750 |
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22083651 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22083650 |
gattggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 5534534 - 5534747
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5534534 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgata---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
5534624 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5534625 |
aacttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
5534724 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5534725 |
gattggtaccacatgcatataag |
5534747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28454725 - 28454547
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| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28454725 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
28454626 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28454625 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
28454547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 22124624 - 22124838
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| Q |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22124624 |
atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgtccataagagtccatgcatagcatctcattg |
22124715 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22124716 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagatttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgac |
22124815 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22124816 |
gattggtaccacgtgcatataag |
22124838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20013959 - 20014171
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20013959 |
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20014049 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20014148 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20014149 |
gattggtaccacatgcatataag |
20014171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20020036 - 20020248
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20020036 |
atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
20020125 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20020126 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
20020225 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20020226 |
gattggtaccacatgcatataag |
20020248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 22123490 - 22123694
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ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22123490 |
ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagctcagtcc |
22123581 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22123582 |
tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
22123681 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
22123682 |
acatgcatataag |
22123694 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
22044832 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcgtcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
22044737 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22044736 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
22044662 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
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Target Start/End: Original strand, 21915665 - 21915877
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193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21915755 |
agcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
21915854 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21915855 |
gattggtaccacatgcatataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
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326 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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327 |
gtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
15440377 |
gtcgcatttgtcgagt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Original strand, 16231633 - 16231802
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267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
16231633 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
16231728 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16231729 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
16231802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23834141 - 23833951
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
23834141 |
tgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttttcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagc |
23834047 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23834046 |
tttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
23833951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 327 - 478
Target Start/End: Original strand, 44385220 - 44385372
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44385220 |
gtcgcatttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaattatcattcatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctatgtgttgttgagttgtcttcta |
44385319 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaa-gaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44385320 |
cccatgtgttattaaagggagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt |
44385372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18065287 - 18065120
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgttt-ttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt-- |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18065287 |
atgattacgatgttttggttattaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattat |
18065188 |
T |
 |
| Q |
239 |
taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat |
306 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18065187 |
taggagatttgtcctccgcacgattaaagtatatttatatttatgatgacgattggtaccacatgcat |
18065120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18854945 - 18854759
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18854945 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
18854855 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18854854 |
agcttagtcctcaccacgttta----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
18854777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 449
Target Start/End: Original strand, 16413760 - 16413875
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
16413760 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatacatgagttattaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcttctatccatgt |
16413859 |
T |
 |
| Q |
434 |
gttgttaaagaagtac |
449 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16413860 |
gtagttaatgaagtac |
16413875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Original strand, 19278727 - 19278843
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgca-cgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac-atgcatataagtgt |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
19278727 |
gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcaacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaatgcatataaatgt |
19278825 |
T |
 |
| Q |
315 |
ctaagttgcattgtcgca |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19278826 |
ctaagttgcattgtcgca |
19278843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32121529 - 32121451
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32121529 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgaggaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt |
32121451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 458 - 531
Target Start/End: Original strand, 15923992 - 15924065
Alignment:
| Q |
458 |
attatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15923992 |
attatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat |
15924065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5760237 - 5760109
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc-atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5760237 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttatcttctatccatgagttgtt-agttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtg |
5760139 |
T |
 |
| Q |
449 |
cctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5760138 |
cttatgaagattatacgatgtttatgatgt |
5760109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 20705908 - 20705955
Alignment:
| Q |
264 |
aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20705908 |
aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
20705955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21673438 - 21673379
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21673438 |
gattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag |
21673379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 42819107 - 42819185
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42819107 |
ttgtcgagtccaagttgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
42819185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6520153 - 6520094
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6520153 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgtatttgtcgagtcaaag |
6520094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 23761176 - 23761235
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23761176 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
23761235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16184514 - 16184469
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16184514 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcattgtcgcatt |
16184469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21383584 - 21383543
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21383584 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagttttgtcct |
21383543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24755552 - 24755496
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24755552 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
24755496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 30643612 - 30643668
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30643612 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
30643668 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18833161 - 18833089
Alignment:
| Q |
340 |
agtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18833161 |
agtcaaagttgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgt |
18833089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 20466365 - 20466420
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20466365 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
20466420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 341
Target Start/End: Original strand, 21389777 - 21389829
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
341 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21389777 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgag |
21389829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 341
Target Start/End: Original strand, 21779103 - 21779155
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
341 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21779103 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgag |
21779155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22874866 - 22874807
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22874866 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgcatagtctcatttgtcgagtcaaag |
22874807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 38855549 - 38855608
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38855549 |
gattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtggagtcaaag |
38855608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21249179 - 21249125
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
21249179 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
21249125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21255017 - 21254963
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
21255017 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
21254963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31971095 - 31971041
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
31971095 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
31971041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18065417 - 18065356
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18065417 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
18065356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21162383 - 21162439
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21162383 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
21162439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32121480 - 32121443
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32121480 |
gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
32121443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 16092620 - 16092675
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
16092620 |
gattggtaccacatgcatataacatgtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
16092675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23913970 - 23913931
Alignment:
| Q |
190 |
attgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctc |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23913970 |
attgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctc |
23913931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 26355993 - 26356052
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26355993 |
gattggtaccacatgcatacaagaggtttaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
26356052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 28649328 - 28649383
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
28649328 |
gattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcataattgcatttgttgagtc |
28649383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7372574 - 7372520
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
7372574 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
7372520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20536004 - 20535950
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
20536004 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
20535950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 21919281 - 21919335
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
21919281 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
21919335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23914016 - 23913978
Alignment:
| Q |
191 |
ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctc |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23914016 |
ttgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctc |
23913978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 45131323 - 45131377
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
45131323 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcattcgtcgagtc |
45131377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 5866601 - 5866654
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||| |
|
|
| T |
5866601 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttatcgagt |
5866654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 18818734 - 18818787
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
18818734 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagt |
18818787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 21169060 - 21169112
Alignment:
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21169060 |
gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
21169112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21673495 - 21673458
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcat |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21673495 |
gattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat |
21673458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 25484659 - 25484700
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25484659 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg |
25484700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 377066 - 377022
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
377066 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
377022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17140708 - 17140653
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagt--gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
17140708 |
attggtaccacatgcatataaagaggtctaagttgcatcgttgcatttgtcgagtc |
17140653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 17927025 - 17927080
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17927025 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa |
17927080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 22873590 - 22873634
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22873590 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
22873634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 329
Target Start/End: Original strand, 23777158 - 23777198
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtc |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23777158 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtc |
23777198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 58965 - 59489
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
58965 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat |
59064 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
59065 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcttttcattgagctt |
59164 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
59165 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtatc |
59264 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
59265 |
acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat |
59364 |
T |
 |
| Q |
399 |
catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact |
497 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
59365 |
catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgatgattatac---------gatgtgaattatatgatgttgacc |
59455 |
T |
 |
| Q |
498 |
aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
59456 |
aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
59489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13574 - 13313
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13574 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
13477 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13476 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
13386 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13385 |
taggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
13313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7049 - 6788
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7049 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
6952 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6951 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
6861 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6860 |
taggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
6788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23102 - 22841
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23102 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
23005 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23004 |
cggtgatt---------tgtccataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
22914 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22913 |
taggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
22841 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 57108 - 56828
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
57108 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--acgaataagatgacgtttaactccaaattattggatg |
57011 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
57010 |
catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagct |
56920 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56919 |
ttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
56828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41578 - 41321
Alignment:
| Q |
49 |
ctgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
41578 |
ctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--acgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatg--------ttgattaggat |
41489 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg |
242 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
41488 |
gattacg-tgttttgttgtttagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgtttattagg |
41390 |
T |
 |
| Q |
243 |
agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41389 |
agctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
41321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 67511 - 67307
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
67511 |
gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgtcat-atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
67422 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67421 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
67322 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
67321 |
ccacatgcatataag |
67307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 132528 - 132445
Alignment:
| Q |
265 |
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347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132528 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
132445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:
Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 65774 - 66293
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
65774 |
aattgatatattgatatctctctgttgctgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaaatgatga |
65873 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
65874 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttt |
65971 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
65972 |
gtcctcaccacaattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagcattgtctcccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca |
66070 |
T |
 |
| Q |
300 |
catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc |
399 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
66071 |
catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgtttatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatc |
66170 |
T |
 |
| Q |
400 |
atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
66171 |
atccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa |
66261 |
T |
 |
| Q |
500 |
gatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
66262 |
gatgttgctatgttgtttaacatgttgattat |
66293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 61858 - 62377
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61858 |
aattgatatattgatatctctcttttgttgtgttacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaaatgatga |
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T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
61958 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttt |
62055 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca |
299 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
62056 |
gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcatgatt-aggagcattgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtacca |
62154 |
T |
 |
| Q |
300 |
catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc |
399 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
62155 |
catgcataaaagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgattcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatc |
62254 |
T |
 |
| Q |
400 |
atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
62255 |
atacatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa |
62345 |
T |
 |
| Q |
500 |
gatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
62346 |
gatgttgctatgttgtttaacatgttgattat |
62377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 79870
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80305 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga |
80206 |
T |
 |
| Q |
195 |
gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80205 |
gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
80107 |
T |
 |
| Q |
295 |
taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80106 |
taccacatgcatataagtgtctaaattgcattgtcgcatatgtcaagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccataagttgttaagttgtcgatgaa |
80007 |
T |
 |
| Q |
395 |
ttatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt |
493 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
80006 |
ttatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacctatgtgttattaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatggtgtt |
79907 |
T |
 |
| Q |
494 |
gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
79906 |
gactaagatgttgctatgtcgtttaacatgttgatta |
79870 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 105981 - 106194
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
105981 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg |
106071 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106072 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
106171 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
106172 |
gattggaactacatgcatataag |
106194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 126216 - 126428
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
126216 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagaccatgcatagcatctcattg |
126306 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg--attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg |
289 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126307 |
agcttagtccttaccacattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg |
126406 |
T |
 |
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
126407 |
attggtaccgcatgcatataag |
126428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10523 - 10479
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10523 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
10479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0525 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:
Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Original strand, 4121 - 4549
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4121 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgaagtctataaatatgatgaaatgatga |
4220 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
4221 |
cgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttag |
4312 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4313 |
tcctcaccacgattttttaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
4412 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4413 |
ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt |
4512 |
T |
 |
| Q |
397 |
atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4513 |
atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
4549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 11)
Name: scaffold0109
Description:
Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Original strand, 36431 - 36767
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36431 |
gagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctctgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
36528 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36529 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg |
36628 |
T |
 |
| Q |
393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36629 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatga |
36728 |
T |
 |
| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36729 |
tgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat |
36767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26677 - 26424
Alignment:
| Q |
54 |
gttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgatta |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |
|
|
| T |
26677 |
gttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgaatatgatgacta |
26588 |
T |
 |
| Q |
153 |
cggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt---aggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctt |
247 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26587 |
cgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgatttttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctt |
26488 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26487 |
tgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgataacgattggtaccacatgcatataag |
26424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Original strand, 38977 - 39140
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
38977 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccacacgattaaagta |
39075 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
39076 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcactatcgcatt |
39140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Original strand, 11460 - 11623
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| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
11460 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgttttaggagttttatcctccgcaggattaaagta |
11558 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11559 |
tattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
11623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6891 - 6746
Alignment:
| Q |
187 |
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286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6891 |
ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgtttcag-agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
6794 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6793 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtccaagttgcattgtcgcatt |
6746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43377 - 43146
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
43377 |
tgttatgtgacttgactatgctgctactgttatttaactaagtgcaatatgtctatacat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggaagc |
43280 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43279 |
atgttgatatgttgatcacggtga----------ttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagc |
43191 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43190 |
tttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgat |
43146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Original strand, 36361 - 36472
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36361 |
tgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg--ataggagc |
36457 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
36458 |
tttgtcctctgcacg |
36472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43143 - 43041
Alignment:
| Q |
212 |
attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43143 |
attaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgaacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata |
43044 |
T |
 |
| Q |
308 |
taa |
310 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
43043 |
taa |
43041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Original strand, 1063 - 1137
Alignment:
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
1063 |
cgagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattaccatccatgagttgt |
1137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43171 - 43118
Alignment:
| Q |
212 |
attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43171 |
attaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgat |
43118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1145
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1108 |
gttgttgatgaattaccatccatgagttgttaagttgt |
1145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 36528 - 36889
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
36528 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
36625 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36626 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
36725 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
36726 |
tccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgat |
36825 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
36826 |
gtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattat |
36889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53504 - 53330
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
53504 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
53409 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53408 |
aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
53330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 499
Target Start/End: Original strand, 189819 - 190148
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
189819 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaag |
189916 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
189917 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattataa |
190016 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat |
467 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
190017 |
tccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcttcccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat |
190116 |
T |
 |
| Q |
468 |
gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
190117 |
atttatgatgtgaattatataaagttgactaa |
190148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 25127 - 25299
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
25127 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgttctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctcagcacgattaaag |
25223 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25224 |
tatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcattgtcgcatttgtctagtc |
25299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 347
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5071
Alignment:
| Q |
298 |
cacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5021 |
cacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgttgagtcaaag |
5071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0676 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:
Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 1
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga--tgaaatgat |
98 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
310 |
aattaatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgat |
211 |
T |
 |
| Q |
99 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
210 |
gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt |
111 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc |
11 |
T |
 |
| Q |
299 |
acatgcatat |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
10 |
acatgcatat |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Original strand, 208054 - 208390
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
208054 |
gagctttatcctccgcacgattaagagctttgtcctccgcgcgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
208152 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
208153 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatg |
208252 |
T |
 |
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393 |
aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt |
492 |
Q |
| |
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| T |
208253 |
aattatcatctatgagttgtcgacttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagt |
208352 |
T |
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| Q |
493 |
tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
| |
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||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |
|
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| T |
208353 |
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T |
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T |
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Target: scaffold0157; HSP #1
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Q |
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T |
 |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca |
33300 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacga |
466 |
Q |
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| T |
33301 |
tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac-- |
33398 |
T |
 |
| Q |
467 |
tgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
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-------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat |
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T |
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Target: scaffold0141 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 14547 - 14881
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Q |
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T |
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386 |
Q |
| |
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|
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| T |
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acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg |
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T |
 |
| Q |
387 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata |
486 |
Q |
| |
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| T |
14746 |
tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagat---------tttacgatgtgaattata |
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T |
 |
| Q |
487 |
tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
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|
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Target: scaffold0141; HSP #2
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Q |
| |
|
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|
|
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gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
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T |
 |
| Q |
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cctcaccacga---ttaggagctttgtcc-tccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
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Q |
| |
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|
|
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cctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
37854 |
T |
 |
| Q |
296 |
accacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
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37853 |
accacatgcatataag |
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T |
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Target: scaffold0293; HSP #1
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Q |
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| T |
20621 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcatcaccatgattaggagctttgtcctccacacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
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T |
 |
| Q |
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tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
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| T |
20719 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagttgttgttgatgaattatca |
20818 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaag--ttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgtt--aaagaagtacctacgaagattata |
463 |
Q |
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| T |
20819 |
tccatgagttgttaagtttttttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaaaagaagtacctatgaagattata |
20918 |
T |
 |
| Q |
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cgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |
|
|
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20919 |
tgatgtttatgacgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtatatgatattgattat |
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T |
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Target: scaffold1852 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:
Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 238 - 531
Target Start/End: Original strand, 1 - 295
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Q |
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|
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T |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
101 |
cgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgtt |
200 |
T |
 |
| Q |
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gttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
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Q |
| |
|
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|
|
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gttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctgtgttgtttaagatattgattat |
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Target: scaffold0486; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9473 |
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9374 |
T |
 |
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttg |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
9373 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccaagaattgtcgagctgtcttatacctaagtgttg |
9274 |
T |
 |
| Q |
438 |
ttaaagaagtacctacgaag-attatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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ttaaagaagtacctatgaagaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
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Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 8260 - 8201
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334 |
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393 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
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8260 |
ttgtcgagtctaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatga |
8201 |
T |
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Target: scaffold0200 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
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Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
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336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttg |
11493 |
T |
 |
| Q |
337 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgtt |
436 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
11492 |
ttgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtctt |
11393 |
T |
 |
| Q |
437 |
gttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11392 |
gttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatattgctatg-tgtttaagatattgattat |
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T |
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Q |
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|
|
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11570 |
T |
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Target: scaffold0013; HSP #1
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355 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73822 |
gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgtt |
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T |
 |
| Q |
356 |
gatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacga |
455 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
73922 |
gatgaattatcatccatgagttgttcagttgttgatgaattatcatctaagagttgtcgagttgtcttctacctaagtgttgttaaagaagtacctatga |
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T |
 |
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456 |
agattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat |
490 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
74022 |
agattatacgatgtttaagatgtgaattatatgat |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgcataagatg |
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T |
 |
| Q |
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acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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acgtttagatccaaattattagatgcttattgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
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T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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agtcctcaccacgattaataggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
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T |
 |
| Q |
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ggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
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Target: scaffold0013; HSP #3
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|
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|
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cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaata-ttatgatgac |
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T |
 |
| Q |
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gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2946 |
gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013; HSP #4
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342 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
81468 |
cacgattaaagtatattaatact-atgatgaagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
81552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0575 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:
Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Original strand, 6465 - 6669
Alignment:
| Q |
327 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6465 |
gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttcta |
6564 |
T |
 |
| Q |
427 |
cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg |
526 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
6565 |
cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattg |
6664 |
T |
 |
| Q |
527 |
attat |
531 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
6665 |
attat |
6669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 71017 - 70804
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
71017 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagttttgtcctccgcacgattaaag |
70921 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70920 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtctaagtcgttgttgatgaattatca |
70821 |
T |
 |
| Q |
368 |
tccaagagttgttaagt |
384 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| |
|
|
| T |
70820 |
tctatgagttgttaagt |
70804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56976 - 56771
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
56976 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
56886 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56885 |
cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
56786 |
T |
 |
| Q |
297 |
ccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
56785 |
ccacatgcatataag |
56771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 139681 - 139496
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
139681 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgttt-ggagctttgtcctccgcacgttt-aggtgc |
139586 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcattt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
139585 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcattt |
139496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 101018 - 100849
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
101018 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag |
100923 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
100922 |
tatattaatact-attatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtc |
100849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0431 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:
Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12489 - 12228
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12489 |
tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
12392 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12391 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
12301 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12300 |
taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
12228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 74061 - 73778
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat |
123 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
74061 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat |
73962 |
T |
 |
| Q |
124 |
gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc |
220 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
73961 |
gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc |
73871 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73870 |
tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
73778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 228507 - 228700
Alignment:
| Q |
145 |
gatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttagga |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| | ||| |
|
|
| T |
228507 |
gatgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctatgtcctcaccacgatttg-agctttg-cctcaccacgatc--gga |
228600 |
T |
 |
| Q |
244 |
gctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
228601 |
gctttgtcctctacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
228699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0205 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:
Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 192 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29477 - 29259
Alignment:
| Q |
192 |
tgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
29477 |
tgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgaagat |
29381 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcga |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29380 |
tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattattatccatgagttgttaagttgttga |
29281 |
T |
 |
| Q |
391 |
tgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29280 |
tgaattatcatccatgagttgt |
29259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29288 - 29251
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29288 |
gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
29251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0089 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:
Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 19619 - 19901
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19619 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg |
19716 |
T |
 |
| Q |
125 |
catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagct |
221 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19717 |
catg--------ttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct |
19808 |
T |
 |
| Q |
222 |
ttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19809 |
ttatcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
19901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 78277 - 77998
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78277 |
tgttatgtgacttgattatgctgctgttgttatttaactaagtgcatattgt--attcatacgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
78180 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
78179 |
atgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt |
78089 |
T |
 |
| Q |
223 |
tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78088 |
tgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
77998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 60832 - 61006
Alignment:
| Q |
49 |
ctgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
60832 |
ctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatat---------gat |
60920 |
T |
 |
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
60921 |
gattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccatga-taggagctttgtcctccgcacg |
61006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 69588 - 69544
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
69588 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
69544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0299 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:
Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 169 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6629 - 6431
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
6629 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag |
6533 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
367 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6532 |
tatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca |
6433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 471 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 6419 - 6371
Alignment:
| Q |
471 |
tatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
6419 |
tatgatgtgaattatataatgctgactaagatgttgctatgttgtttaa |
6371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0744 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:
Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 319
Target Start/End: Original strand, 3717 - 4004
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatg |
128 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3717 |
tgtgacttgattatgctgctgctgttgtttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatg |
3816 |
T |
 |
| Q |
129 |
atgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgt |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3817 |
ttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacatttattaggagctttgt |
3907 |
T |
 |
| Q |
226 |
cctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaag |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3908 |
cctccgcacgattattaggagctttgtcctccgtacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaag |
4004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 16799 - 16985
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16799 |
tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagttttgtcctccgcacgttttaggagc |
16896 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16897 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
16985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116620
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
116673 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgt |
116620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 407 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 116625 - 116585
Alignment:
| Q |
407 |
agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagt |
447 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
116625 |
agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagt |
116585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:
Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9637
Alignment:
| Q |
44 |
tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta |
143 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9897 |
tgctgctgctgttatttaacttagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta |
9800 |
T |
 |
| Q |
144 |
cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta |
240 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9799 |
cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta |
9709 |
T |
 |
| Q |
241 |
--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9708 |
taggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa |
9637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0371 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:
Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15307 - 15121
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15307 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
15210 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15209 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatgttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
15121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0216 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:
Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 8875 - 9177
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8875 |
aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgaccgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga |
8969 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8970 |
cgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta |
9059 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9060 |
gtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg |
9159 |
T |
 |
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9160 |
gtaccacatgcatataag |
9177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 17435 - 17487
Alignment:
| Q |
294 |
gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17435 |
gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattatcgca-ttgtcgagtcaaa |
17487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8071 - 7858
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8071 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
7981 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7980 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
7881 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7880 |
gattggtaccacatgcatataag |
7858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 62210 - 62045
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
62210 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaag |
62112 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
62111 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
62045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 72993 - 73206
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
72993 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
73083 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73084 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
73183 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
73184 |
gattggtaccacatgcatataag |
73206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30538 - 30324
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaa-ttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcatt |
192 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30538 |
atgatgaagtttagctccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt |
30448 |
T |
 |
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga |
287 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30447 |
gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga |
30348 |
T |
 |
| Q |
288 |
cgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30347 |
cgattggtaccacatgcatataag |
30324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12852 - 12680
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12852 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagttttgtcctccccacgattaaag |
12757 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12756 |
tatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
12680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19136 - 18964
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
19136 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaag |
19041 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19040 |
tatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcgtttgtcgagtc |
18964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 307108 - 306895
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
307108 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg |
307018 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
307017 |
agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
306918 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
306917 |
gattggtaccacatgcatataag |
306895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 281219 - 281263
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
281219 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
281263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9390 - 9198
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9390 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
9295 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9294 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
9198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13008 - 12963
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
13008 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagttgcatt |
12963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:
Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9688
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9873 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
9777 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9776 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
9688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4316 - 4263
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4316 |
gattggtaccacatgcataagag-gtctaagttgcatagtcgcatatgtcgagtc |
4263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0043 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:
Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 343
Target Start/End: Original strand, 77307 - 77500
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
77307 |
tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
77403 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
77404 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgttgca-ttgtcgagtc |
77500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18030 - 17986
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18030 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
17986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 5)
Name: scaffold0052
Description:
Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 1149 - 1362
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1149 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg |
1239 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1240 |
agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
1339 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1340 |
gattggtaccacatgcatataag |
1362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10313 - 10135
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10313 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
10214 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10213 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
10135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56735 - 56557
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
56735 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagttttgtcctccgcac |
56636 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56635 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
56557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10444 - 10379
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10444 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
10379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 56866 - 56801
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
56866 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
56801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0585 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:
Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9283 - 9121
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9283 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagta |
9186 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9185 |
ttttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatt |
9121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1661
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1846 |
tgattaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
1750 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1749 |
cttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatt |
1661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 15031 - 15090
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15031 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
15090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 242116 - 241846
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
242116 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat |
242019 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
242018 |
tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct |
241931 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
241930 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
241846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23185 - 22995
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
23185 |
tgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacggt--aggagc |
23091 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23090 |
tttgtcctccacacgattaaagtatattaattct-atgatgacgattggcaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
22995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 129695 - 129636
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
129695 |
gattggtaccacattcatataagaggtctaagttgcatagtttcatttgtcgagtcaaag |
129636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0096 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:
Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15035 - 15316
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15035 |
tgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactatgtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgc |
15132 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt----aggagc |
220 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15133 |
atattgatatgttgattatggtgatt---------tgttcataagagttcatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagc |
15222 |
T |
 |
| Q |
221 |
tttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15223 |
tttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
15316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 16672 - 16716
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16672 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
16716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:
Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 63815 - 63632
Alignment:
| Q |
156 |
tgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc |
254 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
63815 |
tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacattt-aggagctttttcctc |
63720 |
T |
 |
| Q |
255 |
tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63719 |
cgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
63632 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 35241 - 35297
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35241 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
35297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0155 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:
Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 9911 - 10124
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9911 |
atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg |
10001 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10002 |
agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
10101 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10102 |
gattggtaccacatgcatataag |
10124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:
Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10543
Alignment:
| Q |
383 |
gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
482 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10395 |
gttgttgatgaattatcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaat |
10494 |
T |
 |
| Q |
483 |
tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat |
531 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10495 |
tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat |
10543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 10237 - 10414
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10237 |
cattgatctttgtcctcaccacgatc-ggagccttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa |
10332 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc |
369 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10333 |
gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgatgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc |
10414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36277 - 36093
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36277 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatacattagcatt-cattgagctttgtcctcgccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
36182 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36181 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
36093 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 7)
Name: scaffold0111
Description:
Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8469 - 8285
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8469 |
tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc |
8373 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8372 |
tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatataa-agtctaagttgcattgtcgcatt |
8285 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15544 - 15405
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15544 |
gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
15446 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15445 |
gatagcacatgcatataa-agtctaagttgcattgtcgcatt |
15405 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15613 - 15502
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15613 |
tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagc |
15517 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15516 |
tttgtcctccgcacg |
15502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 20010 - 20088
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20010 |
ttgtcgagtgaaagtcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
20088 |
T |
 |
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Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7134 - 7093
Alignment:
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7134 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
7093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14253 - 14212
Alignment:
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14253 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
14212 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32240 - 32196
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32240 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
32196 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0259 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:
Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10263 - 9957
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
10263 |
aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctcttatttaactaagtgcataaggtctatatat--gatgaataagatg |
10166 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10165 |
acgtttatctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
10076 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattag---gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
292 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10075 |
agtcttcacgacgattattacgagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt |
9976 |
T |
 |
| Q |
293 |
ggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9975 |
ggtaccacatgcatataag |
9957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0144 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:
Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 32460 - 32636
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32460 |
tgattacgatgaatacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcac |
32559 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32560 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
32636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0233 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:
Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 14587 - 14858
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14587 |
tgtgacttgactatggtgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacat |
14684 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
14685 |
tgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtccttaccacgat-aggagctttgtcat |
14773 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14774 |
ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28990 - 28799
Alignment:
| Q |
192 |
tgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat |
291 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
28990 |
tgagctttctcctccgcatgattaggagctttgtcctc---acgatt-aggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatact-atgatgaagat |
28896 |
T |
 |
| Q |
292 |
tggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28895 |
tggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcaatgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
28799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0546
Description:
Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1847 - 1684
Alignment:
| Q |
171 |
agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
1847 |
agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgttttaggagttttatcctccgcaggattaaagta |
1749 |
T |
 |
| Q |
270 |
tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1748 |
tattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
1684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6561
Alignment:
| Q |
187 |
ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6416 |
ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgtttcag-agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg |
6513 |
T |
 |
| Q |
287 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6514 |
acgattggtaccacatgcatataagtgtccaagttgcattgtcgcatt |
6561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10738 - 10664
Alignment:
| Q |
338 |
cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
10738 |
cgagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattaccatccatgagttgt |
10664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0546; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10693 - 10656
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10693 |
gttgttgatgaattaccatccatgagttgttaagttgt |
10656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 326
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6313
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
6136 |
tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctctacaagttttaggagc |
6232 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6233 |
tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt |
6313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 8219 - 8312
Alignment:
| Q |
233 |
acgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8219 |
acgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt |
8312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 25131 - 25318
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagt--gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25131 |
attggtaccacatgcatataagtaggttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
25230 |
T |
 |
| Q |
388 |
cgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25231 |
taatgaattatcatctacgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
25318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0142 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:
Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 8126 - 8312
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc |
388 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8126 |
attggtaccacatgcatataagaggttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt |
8225 |
T |
 |
| Q |
389 |
gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8226 |
aatgaattatcatctttgagttgctaagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
8312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38658 - 38480
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38658 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac |
38559 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38558 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
38480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 38789 - 38724
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt |
68 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38789 |
ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt |
38724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 76768 - 76974
Alignment:
| Q |
102 |
gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
76768 |
gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt |
76858 |
T |
 |
| Q |
202 |
cctcaccacga---ttaggagctttgtcc-tccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76859 |
cctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt |
76958 |
T |
 |
| Q |
296 |
accacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
76959 |
accacatgcatataag |
76974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 139077 - 138865
Alignment:
| Q |
94 |
atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
139077 |
atgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcattg |
138987 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138986 |
agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac |
138887 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138886 |
gattggtaccacatgcatataa |
138865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 193300 - 193344
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
193300 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
193344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1552 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:
Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 337 - 153
Alignment:
| Q |
148 |
gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct |
246 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
337 |
gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-agtagctttgtcctccacacgttttaggagct |
241 |
T |
 |
| Q |
247 |
ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
240 |
ttgtcctccactcgattaaagtatattaatatttatgatgacgtttggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt |
153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 400 - 530
Target Start/End: Original strand, 51300 - 51430
Alignment:
| Q |
400 |
atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa |
499 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51300 |
atctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaa |
51399 |
T |
 |
| Q |
500 |
gatgatgttatgttgtttaacatattgatta |
530 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51400 |
gatgttgctatgttgtttaacatgttgatta |
51430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:
Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19661 - 19364
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
19661 |
aattgatatattgatatca-tctgttattgtg--acttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
19567 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19566 |
atgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctt |
19478 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19477 |
agtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgattattaggagcattgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggta |
19379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25835 - 25587
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
25835 |
aattgatatattgatatca-tctgttattgtg--acttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg |
25741 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctt |
198 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25740 |
atgtttagctccaaattattggatgcattttgatatgatgattacga---------tgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagctt |
25652 |
T |
 |
| Q |
199 |
tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgat |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25651 |
agtcctcaccatga-taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgat |
25587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25612 - 25511
Alignment:
| Q |
212 |
attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25612 |
attaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata |
25513 |
T |
 |
| Q |
310 |
ag |
311 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
25512 |
ag |
25511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0126 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:
Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 4228 - 4397
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
4228 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
4327 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4328 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
4397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 4098 - 4159
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4098 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
4159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0055 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:
Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25324 - 25146
Alignment:
| Q |
138 |
tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25324 |
tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac |
25225 |
T |
 |
| Q |
235 |
gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25224 |
gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
25146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0284 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:
Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18303 - 18146
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| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18303 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-agtagctttttcctccgcacgatgaaag |
18207 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18206 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataactgtctaagttgcattgt |
18146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0553 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0553
Description:
Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8745 - 8576
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8745 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
8646 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8645 |
aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacctcatgcatata |
8576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0553; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8875 - 8814
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8875 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
8814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0133 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:
Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22160 - 21991
Alignment:
| Q |
146 |
atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
22160 |
atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt |
22061 |
T |
 |
| Q |
240 |
aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22060 |
aggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata |
21991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22290 - 22229
Alignment:
| Q |
3 |
ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22290 |
ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact |
22229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0601 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:
Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 354 - 475
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8211
Alignment:
| Q |
354 |
ttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctac |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8090 |
ttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattgtcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctat |
8189 |
T |
 |
| Q |
454 |
gaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8190 |
gaagattatacgatgttcatga |
8211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 8037 - 8124
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc |
421 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8037 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagtttttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtc |
8124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 331 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 3259 - 3115
Alignment:
| Q |
331 |
catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctaccta |
430 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
3259 |
catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgtgttgctaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctaccca |
3160 |
T |
 |
| Q |
431 |
tgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3159 |
tgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
3115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 331 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7322 - 7178
Alignment:
| Q |
331 |
catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctaccta |
430 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
7322 |
catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgtgttgctaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctaccca |
7223 |
T |
 |
| Q |
431 |
tgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7222 |
tgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
7178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0235 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:
Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16646 - 16456
Alignment:
| Q |
147 |
tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc |
245 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
16646 |
tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagc |
16552 |
T |
 |
| Q |
246 |
tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16551 |
tttttcctccacacgattacagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatcgtcgcatttgtcgagt |
16456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0484 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:
Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 334 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 241
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt |
433 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
385 |
ttgtcaagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttttattctacccatgt |
286 |
T |
 |
| Q |
434 |
gttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt |
478 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
285 |
gttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt |
241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0405 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:
Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 9843 - 9993
Alignment:
| Q |
189 |
cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac |
288 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9843 |
cattgaactttgtcctcaccaagatc-ggagatttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgac |
9938 |
T |
 |
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9939 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctgagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
9993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0228 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:
Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 18767 - 18962
Alignment:
| Q |
145 |
gatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttagga |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| || |||| || ||| |
|
|
| T |
18767 |
gatgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccatgatttg-agcttagtcatcaccacgatt--gga |
18861 |
T |
 |
| Q |
244 |
gctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
341 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18862 |
gctttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag |
18960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21885 - 21826
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21885 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcaagtgaaag |
21826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0256 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:
Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 25024 - 25293
Alignment:
| Q |
31 |
tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga |
129 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25024 |
tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaacta-gtgtataatgtctatgtat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacat |
25120 |
T |
 |
| Q |
130 |
tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct |
228 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
25121 |
tgatatgatgattacaatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcgtt-cattgagcttagtcctcaccatgat-agaagctttgtcct |
25208 |
T |
 |
| Q |
229 |
ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25209 |
ccacacgattattaggagatttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgaagacgattggtaccacatgcatataag |
25293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0231 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:
Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 311
Target Start/End: Original strand, 5 - 121
Alignment:
| Q |
200 |
gtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5 |
gtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg |
104 |
T |
 |
| Q |
295 |
taccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
105 |
taccacatgcatataag |
121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0036 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:
Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 66582 - 66756
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
66582 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctat |
66677 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
66678 |
aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
66756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 20174 - 20342
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20174 |
agagtccatgcattagcata-cattaagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatc--ggagctttgtcctca-cacgattaaag |
20268 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20269 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataga-gtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
20342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 33277 - 33336
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33277 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag |
33336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45728 - 45669
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45728 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag |
45669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 17649 - 17708
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17649 |
gattggtaccacatgcatagaagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag |
17708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15953 - 15899
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15953 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
15899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0780 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:
Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 178 - 1
Alignment:
| Q |
26 |
tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
125 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
178 |
tgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcatattg--tttttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc |
81 |
T |
 |
| Q |
126 |
atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt |
214 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
80 |
atgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatt |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 68167 - 68081
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
68167 |
aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat |
68081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0560 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:
Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5819 - 6019
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5819 |
aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgaccgtgctgctgttgttgtttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaaatgatga |
5913 |
T |
 |
| Q |
101 |
cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5914 |
cgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgt---------tgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta |
6003 |
T |
 |
| Q |
200 |
gtcctcaccacgatta |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
6004 |
gtcctcaccacgatta |
6019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 173240 - 173072
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag |
267 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
173240 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctatgtcctcaccacgatc--ggagctttgtcctgcacacgattaaag |
173145 |
T |
 |
| Q |
268 |
tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcga |
340 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
173144 |
tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcacatttgtcga |
173072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 204677 - 204633
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
204677 |
attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcactgtcgcat |
204633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 160474 - 160415
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
160474 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcattagtcaagtcaaag |
160415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 80871 - 81026
Alignment:
| Q |
95 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattg |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
80871 |
tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgat--------tgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattg |
80960 |
T |
 |
| Q |
194 |
agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
80961 |
agctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg |
81026 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 23001 - 23060
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23001 |
gattggtaccacatgcatataagagatctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
23060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21845 - 21901
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21845 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
21901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0697 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:
Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6666 - 6560
Alignment:
| Q |
39 |
gactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgt |
137 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6666 |
gactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatga |
6569 |
T |
 |
| Q |
138 |
tgattacga |
146 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6568 |
tgattacga |
6560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:
Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 12705 - 12783
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12705 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgtattatcatccatgagttgt |
12783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 12754 - 12791
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12754 |
gttgttgatgtattatcatccatgagttgttaagttgt |
12791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0229 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0229
Description:
Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Original strand, 11967 - 12060
Alignment:
| Q |
217 |
gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11967 |
gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
12060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Original strand, 11943 - 12012
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11943 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt |
12012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0156 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:
Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2895 - 2752
Alignment:
| Q |
1 |
aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat-atgatgaaatgatg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
2895 |
aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactgtgcttctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatatgatgattaa--gatg |
2801 |
T |
 |
| Q |
100 |
acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg |
148 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2800 |
acgtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatg |
2752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2694 - 2662
Alignment:
| Q |
279 |
ttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2694 |
ttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
2662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 18059 - 18137
Alignment:
| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18059 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccttgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt |
18137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 40425 - 40484
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40425 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgtatttgtcgagtcaaag |
40484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 100140 - 100081
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
100140 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag |
100081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 101328 - 101271
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101328 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagctgcatagtcgcatttgtcgagtcaa |
101271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 18108 - 18145
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18108 |
gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt |
18145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 38802 - 38857
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
38802 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcattgtcaca-ttgtcgagtcaa |
38857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0656 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:
Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 1141
Alignment:
| Q |
238 |
ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1214 |
ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
1141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:
Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30725
Alignment:
| Q |
237 |
tttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30790 |
tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat |
30725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30833 - 30767
Alignment:
| Q |
169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30833 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacatttaggagctttgtcctccgcacg |
30767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 66329 - 66276
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
66329 |
attggtaccacatgcatataagagactaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
66276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0278 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:
Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7274 - 7141
Alignment:
| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacctatgtgttgttaa |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7274 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgtcaagttgttgatgaattgtcatctatgagttgttaagttgttgagttgtctgctacccctgtgttgttaa |
7175 |
T |
 |
| Q |
442 |
agaagtacctacgaagattatacgatgtttatga |
475 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7174 |
agaagtacctatgaagattatacgatgttcatga |
7141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7317 - 7237
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337 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt |
420 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7317 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatga---gttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgtcaagttgt |
7237 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0278; HSP #3
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Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5434 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtctcattcgtcgagtcaaag |
5375 |
T |
 |
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Target: scaffold0292 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
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350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtac |
449 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
4449 |
gttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgc |
4350 |
T |
 |
| Q |
450 |
ctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4349 |
ttatgaagattatatgatgtt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0292; HSP #2
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4498 |
ttgtcgagtcaaaatcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
4420 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0452 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
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Target: scaffold0452; HSP #1
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425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13913 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttatcttct |
14012 |
T |
 |
| Q |
426 |
acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt |
470 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14013 |
acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt |
14057 |
T |
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Target: scaffold0358 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
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Target: scaffold0358; HSP #1
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245 |
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311 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14843 |
ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag |
14777 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 7)
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Target: scaffold0207; HSP #1
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337 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15544 |
tcgagttaaagtcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt |
15619 |
T |
 |
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Target: scaffold0207; HSP #2
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| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
15689 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccgtgagttgt |
15751 |
T |
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Target: scaffold0207; HSP #3
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| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15656 |
gttgttgatgaattgtgatccatgagttgtttagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt |
15718 |
T |
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2974 |
gattgctaccacatgcatataagaggtataagttgcatagccgcatttgtcgagtcaaag |
3033 |
T |
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| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
15590 |
gttgttgatgaattgtcatccatgagttgtttagttgttcatgaattgtcgtccatgagttgt |
15652 |
T |
 |
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Target: scaffold0207; HSP #6
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350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15623 |
gttgttcatgaattgtcgtccatgagttgttaagttgttgatgaattgtgatccatgagttgt |
15685 |
T |
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| Q |
350 |
gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatc |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15722 |
gttgttgatgaattgtcatccgtgagttgttaggttgttgatgaattgtcatc |
15774 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1662 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:
Target: scaffold1662; HSP #1
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ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
629 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttctcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
707 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0203; HSP #1
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334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19270 |
ttgtcgagtcaaaatcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt |
19348 |
T |
 |
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Target: scaffold0150 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
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Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
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| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31930 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
31847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
63450 |
ttgtcgagtcaaattcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttcttgatgaattgtcaaccatgagttgt |
63528 |
T |
 |
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Target: scaffold0032; HSP #2
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
51375 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
51321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
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Description:
Target: scaffold0628; HSP #1
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265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3397 |
aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcatagtcgcatttttcgagtcaaag |
3480 |
T |
 |
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7981 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcatagtcgcatttttcgagtcaaag |
8040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0621
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Target: scaffold0621; HSP #1
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1905 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
1846 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6322 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
6263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0324 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:
Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
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265 |
aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3506 |
aagtatattaatacttattacgttaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag |
3423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1873 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:
Target: scaffold1873; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1059 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
1005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1873; HSP #2
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169 |
agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
1195 |
agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta |
1100 |
T |
 |
| Q |
265 |
aagtatattaatacttatgatga |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1099 |
aagtatattaatac-tatgatga |
1078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
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338 |
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412 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
832 |
cgagtcaaagtctttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttattgaggaattgtcatccatgagttgt |
906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0301 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
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Target: scaffold0301; HSP #1
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10760 |
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10707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0415; HSP #1
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224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56 |
agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttg |
1 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0015 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
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Target: scaffold0015; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 195234 - 195293
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
195234 |
gattggtaccacatgcatataagagtcttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
195293 |
T |
 |
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16920 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc |
16975 |
T |
 |
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Target: scaffold0102 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
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Target: scaffold0102; HSP #1
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19051 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
18992 |
T |
 |
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Target: scaffold0102; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 48769 - 48813
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48769 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
48813 |
T |
 |
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Target: scaffold0146 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0146; HSP #1
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| Q |
277 |
acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgt |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38 |
acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgt |
1 |
T |
 |
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Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0040; HSP #1
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| Q |
334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
102305 |
ttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt |
102358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1633 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
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Target: scaffold1633; HSP #1
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| Q |
337 |
tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagt |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
109 |
tcgagtcaatgtcgttgttcatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt |
37 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
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Description:
Target: scaffold0476; HSP #1
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Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12551 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcataggtgcatttgtcgagtcaaag |
12492 |
T |
 |
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Target: scaffold0476; HSP #2
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Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5390 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
5334 |
T |
 |
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Target: scaffold0476; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6585 - 6529
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6585 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
6529 |
T |
 |
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Target: scaffold0333 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:
Target: scaffold0333; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 6396 - 6337
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6396 |
gattggtagcacatgcatataagaggtctaagttgcacagtcgcatttgtcgagtcaaag |
6337 |
T |
 |
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Target: scaffold0327 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
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Description:
Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Target Start/End: Original strand, 3650 - 3709
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3650 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtcaaag |
3709 |
T |
 |
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Target: scaffold0327; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 187 - 99
Alignment:
| Q |
193 |
gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg-----aaagtatattaatact |
279 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
187 |
gagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctcaccacgattt--gagctttgtcctcaccacgatgccttaaaagtatattaatact |
99 |
T |
 |
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Target: scaffold0211 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:
Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Target Start/End: Original strand, 29100 - 29159
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29100 |
gattggtaccacatggatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag |
29159 |
T |
 |
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Target: scaffold0100 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Target Start/End: Original strand, 24215 - 24270
Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
24215 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
24270 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
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Description:
Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
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Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagt |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1791 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgca-ttgtcgagtcaaagt |
1733 |
T |
 |
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Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4288
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagt |
348 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4346 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgca-ttgtcgagtcaaagt |
4288 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0598 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:
Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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Target Start/End: Original strand, 1333 - 1387
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
1333 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
1387 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0556 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0556; HSP #1
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| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6608 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctcagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa |
6550 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
10751 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
10805 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0161 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0161; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
2727 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
2781 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
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Alignment:
| Q |
289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46123 |
gattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa |
46181 |
T |
 |
Back To:
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Description:
Target: scaffold0113; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagt-gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
31862 |
attggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
31808 |
T |
 |
Back To:
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Description:
Target: scaffold0064; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
46789 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
46735 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
65031 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
65075 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0311 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
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Target: scaffold0311; HSP #1
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| Q |
290 |
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346 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7450 |
attggttccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
7506 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38600 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtcaaa |
38543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0093 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0093; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
5129 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tcgtcgagtcaaa |
5185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:
Target: scaffold0081; HSP #1
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14457 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
14413 |
T |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23473 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
23429 |
T |
 |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38897 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat |
38853 |
T |
 |
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289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
10095 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtttcatttgtcgagtc |
10040 |
T |
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Target: scaffold0056; HSP #1
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289 |
gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag |
347 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
17545 |
gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcaca-ttgtcgagtcaaag |
17603 |
T |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
1186 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgtcgagtc |
1132 |
T |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcg |
339 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5455 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcg |
5505 |
T |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8275 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttacatttgtcgagtc |
8221 |
T |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
1744 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgtcgagtc |
1690 |
T |
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289 |
gattggtaccacatgcatataagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10605 |
gattggtaccacatgcataaagaggtctagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
10663 |
T |
 |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
16075 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttatcgagtc |
16021 |
T |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
69 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
15 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
15791 |
attggtaccacattcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc |
15845 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
174560 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatattcgcatttttcgagtc |
174506 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc |
343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
168304 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc |
168358 |
T |
 |
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294 |
gtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
2067 |
gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa |
2015 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2400 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgtgttgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
2456 |
T |
 |
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Target: scaffold0412; HSP #1
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| Q |
290 |
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346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6725 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
6781 |
T |
 |
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290 |
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346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14036 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
14092 |
T |
 |
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| Q |
290 |
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346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19609 |
attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa |
19665 |
T |
 |
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
31954 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagt |
31901 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2626 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcg |
2585 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6292 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcg |
6251 |
T |
 |
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334 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
56666 |
ttgtcgagtcaaagtcgttgtcgataagttattatccatgagttgtcaagttgt |
56613 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1917 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
1873 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5888 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgttgcat |
5844 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10841 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
10885 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3535 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
3491 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7966 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
7922 |
T |
 |
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| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
8854 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt |
8902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
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| T |
9286 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat |
9330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:
Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10111 - 10063
Alignment:
| Q |
290 |
attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt |
337 |
Q |
| |
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| T |
10111 |
attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt |
10063 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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