View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19851_high_3 (Length: 531)

Name: NF19851_high_3
Description: NF19851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19851_high_3
NF19851_high_3
[»] chr7 (164 HSPs)
chr7 (1-531)||(12704905-12705437)
chr7 (1-531)||(32445-32967)
chr7 (1-531)||(71011-71537)
chr7 (1-531)||(75120-75646)
chr7 (1-531)||(16113577-16114101)
chr7 (1-531)||(16116730-16117254)
chr7 (1-531)||(12718004-12718528)
chr7 (1-531)||(12722915-12723439)
chr7 (1-531)||(18278739-18279263)
chr7 (1-531)||(18282702-18283226)
chr7 (169-531)||(15083499-15083860)
chr7 (193-519)||(26291712-26292038)
chr7 (187-531)||(39721569-39721912)
chr7 (187-531)||(1859260-1859602)
chr7 (193-531)||(18424992-18425326)
chr7 (169-531)||(45170448-45170800)
chr7 (238-531)||(13918980-13919273)
chr7 (193-531)||(2530596-2530932)
chr7 (187-531)||(25927677-25928021)
chr7 (189-531)||(2832636-2832975)
chr7 (217-531)||(16907675-16907981)
chr7 (1-260)||(26291996-26292255)
chr7 (1-235)||(12714487-12714724)
chr7 (1-311)||(6017190-6017499)
chr7 (31-311)||(9409727-9410003)
chr7 (1-311)||(20117-20419)
chr7 (44-311)||(11232344-11232606)
chr7 (26-307)||(13569678-13569957)
chr7 (44-311)||(11239031-11239293)
chr7 (49-311)||(1347291-1347548)
chr7 (1-311)||(18531027-18531329)
chr7 (94-311)||(20703085-20703298)
chr7 (147-342)||(13148932-13149124)
chr7 (79-235)||(16907561-16907718)
chr7 (94-311)||(32767473-32767686)
chr7 (147-334)||(15728109-15728294)
chr7 (382-531)||(7519669-7519818)
chr7 (23-311)||(7535965-7536249)
chr7 (95-260)||(18425284-18425448)
chr7 (147-334)||(18556756-18556942)
chr7 (94-311)||(18175902-18176115)
chr7 (102-311)||(44786578-44786783)
chr7 (102-311)||(44793219-44793424)
chr7 (187-334)||(14216709-14216855)
chr7 (38-311)||(14958952-14959215)
chr7 (147-341)||(16724766-16724958)
chr7 (147-341)||(17701780-17701972)
chr7 (332-531)||(20487133-20487323)
chr7 (31-311)||(11262117-11262387)
chr7 (94-311)||(18164768-18164981)
chr7 (94-311)||(18182574-18182787)
chr7 (102-311)||(14655520-14655725)
chr7 (104-309)||(11365996-11366200)
chr7 (31-311)||(12692284-12692554)
chr7 (2-309)||(23519974-23520282)
chr7 (94-311)||(60772-60985)
chr7 (217-342)||(12714405-12714530)
chr7 (94-311)||(40523456-40523669)
chr7 (104-309)||(15162925-15163127)
chr7 (26-311)||(4318586-4318867)
chr7 (169-334)||(8917212-8917375)
chr7 (94-311)||(9511107-9511319)
chr7 (94-311)||(12703504-12703716)
chr7 (104-311)||(16407399-16407603)
chr7 (94-311)||(49051169-49051381)
chr7 (138-311)||(15021905-15022083)
chr7 (31-311)||(11554909-11555180)
chr7 (31-311)||(26419788-26420058)
chr7 (138-311)||(21458-21636)
chr7 (138-311)||(8202226-8202404)
chr7 (146-309)||(8705782-8705951)
chr7 (147-334)||(13461545-13461730)
chr7 (147-311)||(14330584-14330753)
chr7 (147-311)||(14337168-14337337)
chr7 (104-309)||(15156274-15156476)
chr7 (31-311)||(11548313-11548584)
chr7 (290-475)||(18301685-18301871)
chr7 (146-309)||(18553682-18553851)
chr7 (217-352)||(7519531-7519664)
chr7 (104-309)||(13690892-13691094)
chr7 (191-387)||(14932954-14933155)
chr7 (191-387)||(15356389-15356590)
chr7 (191-387)||(15360503-15360704)
chr7 (171-342)||(6800990-6801157)
chr7 (104-309)||(13684261-13684463)
chr7 (169-342)||(9593124-9593293)
chr7 (147-334)||(16457494-16457676)
chr7 (238-330)||(16275304-16275396)
chr7 (169-343)||(16583031-16583204)
chr7 (242-334)||(35151425-35151517)
chr7 (31-238)||(44408384-44408579)
chr7 (239-342)||(20579-20681)
chr7 (1-87)||(16907447-16907533)
chr7 (190-343)||(15605449-15605603)
chr7 (212-309)||(8712453-8712552)
chr7 (2-235)||(10869301-10869534)
chr7 (2-235)||(10875381-10875614)
chr7 (1-127)||(14148531-14148656)
chr7 (33-238)||(14953061-14953254)
chr7 (169-343)||(12317901-12318075)
chr7 (169-343)||(14152160-14152334)
chr7 (409-531)||(12714300-12714413)
chr7 (334-412)||(24274797-24274875)
chr7 (239-311)||(14953013-14953085)
chr7 (146-235)||(18585450-18585543)
chr7 (239-311)||(44408555-44408627)
chr7 (238-309)||(10869252-10869323)
chr7 (238-309)||(10875332-10875403)
chr7 (334-470)||(16585087-16585231)
chr7 (169-343)||(13635627-13635793)
chr7 (238-309)||(18585521-18585592)
chr7 (246-311)||(15380606-15380671)
chr7 (334-516)||(16579147-16579332)
chr7 (169-254)||(2530548-2530631)
chr7 (241-333)||(9751984-9752079)
chr7 (147-235)||(16275374-16275461)
chr7 (327-395)||(15605866-15605934)
chr7 (334-516)||(16586330-16586515)
chr7 (169-235)||(13918936-13919002)
chr7 (338-412)||(14257922-14257996)
chr7 (334-412)||(20585201-20585279)
chr7 (350-471)||(14257822-14257951)
chr7 (269-311)||(20871301-20871343)
chr7 (291-347)||(811467-811524)
chr7 (146-198)||(8719315-8719367)
chr7 (148-235)||(35151499-35151585)
chr7 (289-347)||(15144356-15144415)
chr7 (407-470)||(32300747-32300810)
chr7 (289-347)||(44013909-44013968)
chr7 (334-412)||(12466473-12466551)
chr7 (327-381)||(15082317-15082370)
chr7 (290-347)||(15755278-15755336)
chr7 (334-387)||(16461500-16461553)
chr7 (289-347)||(18005376-18005435)
chr7 (290-343)||(11996354-11996408)
chr7 (290-343)||(16402762-16402816)
chr7 (290-343)||(27848113-27848167)
chr7 (290-343)||(40443194-40443248)
chr7 (3-64)||(8706020-8706081)
chr7 (334-387)||(14183819-14183872)
chr7 (190-235)||(15580552-15580596)
chr7 (3-64)||(18553552-18553613)
chr7 (3-64)||(18585320-18585381)
chr7 (350-387)||(24274789-24274826)
chr7 (217-262)||(26292018-26292063)
chr7 (334-387)||(32300805-32300858)
chr7 (289-347)||(67470-67530)
chr7 (189-287)||(15580523-15580620)
chr7 (189-235)||(7519527-7519572)
chr7 (290-343)||(10588777-10588831)
chr7 (290-343)||(34200524-34200578)
chr7 (3-68)||(21702-21767)
chr7 (3-64)||(8202095-8202156)
chr7 (289-333)||(9703013-9703058)
chr7 (3-68)||(15022149-15022214)
chr7 (290-333)||(11858330-11858374)
chr7 (290-333)||(12186768-12186812)
chr7 (290-346)||(12322062-12322116)
chr7 (290-345)||(14429625-14429680)
chr7 (189-325)||(15605717-15605853)
chr7 (290-333)||(17138384-17138428)
chr7 (290-333)||(18155163-18155207)
chr7 (290-333)||(24054215-24054259)
chr7 (193-279)||(39268117-39268205)
[»] chr5 (136 HSPs)
chr5 (1-531)||(15237081-15237612)
chr5 (1-470)||(20295235-20295707)
chr5 (1-388)||(19472966-19473353)
chr5 (95-490)||(10752561-10752954)
chr5 (187-531)||(11230449-11230792)
chr5 (187-531)||(11220051-11220394)
chr5 (187-531)||(11224637-11224980)
chr5 (187-531)||(11228460-11228803)
chr5 (187-530)||(18355546-18355888)
chr5 (169-531)||(40724029-40724385)
chr5 (187-448)||(11226553-11226813)
chr5 (1-311)||(22325945-22326253)
chr5 (1-311)||(22352677-22352984)
chr5 (1-311)||(22343277-22343584)
chr5 (26-311)||(19774726-19775009)
chr5 (193-369)||(20911375-20911550)
chr5 (26-311)||(19768130-19768413)
chr5 (94-311)||(29471453-29471667)
chr5 (1-311)||(15441974-15442280)
chr5 (156-342)||(33409005-33409189)
chr5 (147-342)||(21885325-21885518)
chr5 (94-311)||(29478048-29478262)
chr5 (44-310)||(24020067-24020328)
chr5 (94-311)||(22139487-22139700)
chr5 (94-311)||(25406222-25406435)
chr5 (147-342)||(26172241-26172434)
chr5 (1-311)||(14359837-14360143)
chr5 (94-311)||(17283865-17284078)
chr5 (94-311)||(22132795-22133008)
chr5 (94-311)||(22587893-22588106)
chr5 (147-334)||(17730543-17730728)
chr5 (102-311)||(22062985-22063190)
chr5 (31-311)||(24554320-24554593)
chr5 (147-334)||(25229542-25229727)
chr5 (147-334)||(25293698-25293883)
chr5 (156-342)||(16673930-16674113)
chr5 (104-334)||(19991658-19991883)
chr5 (31-311)||(21295310-21295580)
chr5 (169-338)||(21340924-21341091)
chr5 (102-311)||(27516549-27516754)
chr5 (102-311)||(27523186-27523391)
chr5 (102-311)||(37543837-37544042)
chr5 (102-311)||(40706919-40707124)
chr5 (102-311)||(40713561-40713766)
chr5 (138-311)||(20775664-20775843)
chr5 (104-311)||(22328268-22328471)
chr5 (104-311)||(37286886-37287089)
chr5 (104-311)||(37293589-37293792)
chr5 (169-334)||(4036003-4036167)
chr5 (94-311)||(41098317-41098530)
chr5 (94-311)||(41769040-41769253)
chr5 (94-311)||(41775614-41775827)
chr5 (383-531)||(24767898-24768046)
chr5 (31-311)||(25534777-25535047)
chr5 (94-311)||(22264742-22264955)
chr5 (94-311)||(27663884-27664097)
chr5 (146-309)||(22410749-22410917)
chr5 (94-311)||(23249736-23249948)
chr5 (94-311)||(41294530-41294742)
chr5 (138-311)||(16354621-16354799)
chr5 (138-311)||(16361280-16361458)
chr5 (94-311)||(34294647-34294860)
chr5 (138-311)||(34564614-34564792)
chr5 (138-311)||(34571269-34571447)
chr5 (104-309)||(15001784-15001986)
chr5 (104-309)||(18038772-18038974)
chr5 (104-311)||(22341707-22341910)
chr5 (1-311)||(23337308-23337614)
chr5 (94-309)||(33725657-33725868)
chr5 (94-311)||(17707025-17707237)
chr5 (141-309)||(22258626-22258800)
chr5 (94-311)||(27608537-27608749)
chr5 (94-311)||(27670524-27670736)
chr5 (146-309)||(21667956-21668125)
chr5 (94-311)||(23583936-23584149)
chr5 (94-311)||(24472342-24472554)
chr5 (138-311)||(25106560-25106738)
chr5 (138-311)||(25165653-25165831)
chr5 (94-311)||(27615143-27615355)
chr5 (104-306)||(14995141-14995340)
chr5 (146-309)||(29316205-29316374)
chr5 (104-309)||(1692541-1692743)
chr5 (147-342)||(42805199-42805389)
chr5 (383-531)||(20911531-20911679)
chr5 (104-309)||(27687433-27687635)
chr5 (169-342)||(18773982-18774151)
chr5 (169-342)||(18783825-18783994)
chr5 (171-342)||(20232330-20232497)
chr5 (147-334)||(26742883-26743065)
chr5 (189-369)||(24767740-24767917)
chr5 (171-342)||(26666290-26666457)
chr5 (171-342)||(26937887-26938054)
chr5 (383-531)||(19473315-19473454)
chr5 (171-342)||(24533207-24533374)
chr5 (383-475)||(22108009-22108101)
chr5 (94-311)||(23609727-23609913)
chr5 (94-311)||(23841123-23841309)
chr5 (217-343)||(23535769-23535894)
chr5 (239-309)||(27680923-27680993)
chr5 (169-260)||(20911327-20911417)
chr5 (327-388)||(22107986-22108047)
chr5 (291-387)||(33896074-33896170)
chr5 (280-343)||(17410245-17410309)
chr5 (289-347)||(21565272-21565331)
chr5 (289-347)||(22959862-22959921)
chr5 (290-339)||(19661161-19661211)
chr5 (3-68)||(20775909-20775974)
chr5 (3-64)||(22258492-22258553)
chr5 (3-64)||(22410619-22410680)
chr5 (290-346)||(23201097-23201153)
chr5 (290-346)||(23511838-23511894)
chr5 (290-333)||(21873004-21873048)
chr5 (290-333)||(21877284-21877328)
chr5 (290-333)||(21887039-21887083)
chr5 (289-347)||(9077693-9077751)
chr5 (289-347)||(19668627-19668685)
chr5 (169-235)||(23535745-23535810)
chr5 (289-342)||(1096211-1096265)
chr5 (290-343)||(13025052-13025106)
chr5 (290-343)||(13095236-13095290)
chr5 (290-343)||(21293296-21293350)
chr5 (290-343)||(24493310-24493364)
chr5 (290-343)||(25421272-25421326)
chr5 (294-343)||(37723643-37723693)
chr5 (3-68)||(16354865-16354930)
chr5 (3-68)||(16361524-16361589)
chr5 (290-346)||(21366985-21367041)
chr5 (3-68)||(25106804-25106869)
chr5 (3-68)||(25165897-25165962)
chr5 (3-64)||(29316443-29316504)
chr5 (3-68)||(34564858-34564923)
chr5 (3-68)||(34571513-34571578)
chr5 (99-143)||(123416-123460)
chr5 (290-333)||(14078899-14078943)
chr5 (290-345)||(23458341-23458396)
chr5 (290-345)||(23462602-23462657)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (1-531)||(21406684-21407215)
chr1 (1-531)||(1010059-1010583)
chr1 (1-469)||(52638930-52639401)
chr1 (1-470)||(16375705-16376176)
chr1 (193-531)||(20229447-20229785)
chr1 (193-530)||(39244359-39244696)
chr1 (193-530)||(39247914-39248251)
chr1 (169-531)||(1925571-1925923)
chr1 (169-531)||(20924585-20924937)
chr1 (193-531)||(41388459-41388793)
chr1 (193-530)||(33796848-33797183)
chr1 (1-311)||(50887771-50888080)
chr1 (26-311)||(33386264-33386547)
chr1 (26-311)||(33392909-33393192)
chr1 (95-262)||(39244237-39244404)
chr1 (95-262)||(39247792-39247959)
chr1 (26-311)||(21807241-21807524)
chr1 (26-311)||(21835148-21835431)
chr1 (327-499)||(41781872-41782044)
chr1 (1-311)||(19104533-19104839)
chr1 (1-311)||(19111190-19111496)
chr1 (95-260)||(41388337-41388501)
chr1 (1-311)||(8304923-8305223)
chr1 (1-311)||(20525234-20525540)
chr1 (95-260)||(20229325-20229489)
chr1 (31-311)||(23763000-23763270)
chr1 (94-311)||(21828511-21828724)
chr1 (102-311)||(16345878-16346083)
chr1 (147-342)||(20137861-20138052)
chr1 (102-311)||(41348955-41349160)
chr1 (102-311)||(51328782-51328987)
chr1 (102-311)||(51335416-51335621)
chr1 (134-311)||(41356416-41356597)
chr1 (102-311)||(16352526-16352732)
chr1 (104-311)||(18600210-18600414)
chr1 (327-475)||(22131454-22131602)
chr1 (104-309)||(41478682-41478884)
chr1 (94-311)||(20216023-20216235)
chr1 (138-311)||(43078216-43078394)
chr1 (94-311)||(44844979-44845192)
chr1 (138-311)||(46157472-46157650)
chr1 (94-311)||(47659011-47659224)
chr1 (3-309)||(18626295-18626603)
chr1 (327-475)||(48602865-48603013)
chr1 (146-309)||(27898809-27898978)
chr1 (146-309)||(43063426-43063595)
chr1 (146-309)||(44755892-44756061)
chr1 (146-309)||(49334359-49334528)
chr1 (149-309)||(33384857-33385023)
chr1 (169-342)||(19211646-19211815)
chr1 (217-342)||(46975268-46975392)
chr1 (171-342)||(12646649-12646816)
chr1 (239-342)||(18882169-18882272)
chr1 (169-343)||(21172777-21172951)
chr1 (169-343)||(21312893-21313067)
chr1 (169-343)||(36819467-36819638)
chr1 (338-478)||(23967335-23967483)
chr1 (31-151)||(21437734-21437853)
chr1 (217-343)||(16080623-16080746)
chr1 (334-470)||(42911750-42911894)
chr1 (334-412)||(14238695-14238777)
chr1 (147-235)||(46975350-46975437)
chr1 (94-198)||(21844142-21844237)
chr1 (256-311)||(21844085-21844140)
chr1 (169-260)||(33797142-33797231)
chr1 (340-412)||(48519946-48520018)
chr1 (289-347)||(20248012-20248071)
chr1 (289-347)||(33680737-33680796)
chr1 (334-387)||(19675543-19675596)
chr1 (266-343)||(21161486-21161564)
chr1 (289-347)||(21753778-21753837)
chr1 (289-347)||(22922200-22922259)
chr1 (289-347)||(52928302-52928361)
chr1 (334-387)||(20241619-20241672)
chr1 (289-347)||(34509519-34509577)
chr1 (290-343)||(38801714-38801768)
chr1 (350-387)||(14238748-14238785)
chr1 (189-230)||(16080619-16080659)
chr1 (290-346)||(18182438-18182494)
chr1 (147-235)||(18882251-18882337)
chr1 (3-64)||(27898679-27898740)
chr1 (3-64)||(43063296-43063357)
chr1 (3-64)||(44756130-44756191)
chr1 (3-64)||(49334597-49334658)
chr1 (290-348)||(20847461-20847519)
chr1 (350-470)||(48519847-48519975)
chr1 (290-343)||(20134923-20134977)
chr1 (189-235)||(24783287-24783332)
chr1 (290-343)||(27251055-27251109)
chr1 (407-476)||(20241555-20241624)
chr1 (290-346)||(21788367-21788423)
chr1 (3-68)||(43078460-43078525)
chr1 (290-333)||(6151598-6151642)
chr1 (290-333)||(20091796-20091840)
chr1 (290-333)||(21022330-21022374)
chr1 (290-333)||(21709754-21709798)
chr1 (290-333)||(21714297-21714341)
chr1 (290-333)||(22469025-22469069)
chr1 (290-329)||(24783369-24783409)
chr1 (290-333)||(42865537-42865581)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-531)||(5347-5869)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-531)||(11758-12282)
[»] chr6 (173 HSPs)
chr6 (1-531)||(11566198-11566722)
chr6 (1-531)||(12619088-12619612)
chr6 (1-531)||(23394404-23394928)
chr6 (1-531)||(23989256-23989780)
chr6 (1-531)||(22862282-22862806)
chr6 (1-531)||(19869925-19870450)
chr6 (95-531)||(31478326-31478762)
chr6 (79-531)||(8243169-8243613)
chr6 (169-531)||(23414233-23414594)
chr6 (193-531)||(1643838-1644176)
chr6 (193-530)||(16623683-16624020)
chr6 (193-531)||(14471550-14471879)
chr6 (147-421)||(16759708-16759980)
chr6 (187-471)||(27556064-27556334)
chr6 (26-311)||(4167705-4167990)
chr6 (3-235)||(18917684-18917916)
chr6 (327-531)||(22074560-22074764)
chr6 (26-311)||(4208385-4208670)
chr6 (169-388)||(22948554-22948772)
chr6 (169-388)||(22952510-22952728)
chr6 (169-388)||(23870998-23871216)
chr6 (169-388)||(23874954-23875172)
chr6 (26-311)||(3708524-3708805)
chr6 (169-384)||(27416344-27416557)
chr6 (1-311)||(34832436-34832740)
chr6 (327-531)||(2076800-2077004)
chr6 (50-311)||(24291110-24291369)
chr6 (50-311)||(31317150-31317409)
chr6 (1-311)||(25928077-25928383)
chr6 (50-311)||(24315138-24315397)
chr6 (95-260)||(16623978-16624142)
chr6 (1-311)||(19808308-19808614)
chr6 (1-311)||(22758633-22758938)
chr6 (26-311)||(1545085-1545365)
chr6 (95-260)||(1644134-1644298)
chr6 (26-311)||(17037375-17037655)
chr6 (147-334)||(1587867-1588052)
chr6 (148-334)||(25135809-25135993)
chr6 (44-311)||(25110623-25110886)
chr6 (44-311)||(25117226-25117489)
chr6 (1-311)||(34369992-34370298)
chr6 (147-334)||(5616951-5617136)
chr6 (147-342)||(12496086-12496278)
chr6 (26-311)||(1538986-1539266)
chr6 (31-311)||(34298670-34298940)
chr6 (102-311)||(27430387-27430592)
chr6 (237-371)||(18917893-18918027)
chr6 (139-309)||(28314353-28314528)
chr6 (147-342)||(9482429-9482620)
chr6 (104-311)||(26130265-26130468)
chr6 (138-309)||(27185492-27185668)
chr6 (138-309)||(27207328-27207504)
chr6 (138-309)||(27241724-27241900)
chr6 (138-309)||(27263572-27263748)
chr6 (94-311)||(2870231-2870444)
chr6 (94-311)||(2876846-2877059)
chr6 (94-311)||(20060447-20060660)
chr6 (154-334)||(20803697-20803875)
chr6 (94-311)||(27328152-27328365)
chr6 (94-311)||(27388892-27389105)
chr6 (148-334)||(21702072-21702256)
chr6 (104-311)||(30694160-30694363)
chr6 (138-311)||(8228664-8228842)
chr6 (94-311)||(8796989-8797202)
chr6 (138-311)||(18930853-18931031)
chr6 (102-309)||(28287155-28287359)
chr6 (138-311)||(29587831-29588009)
chr6 (138-311)||(29593972-29594150)
chr6 (94-308)||(6980461-6980670)
chr6 (94-311)||(20649887-20650099)
chr6 (102-309)||(28258557-28258761)
chr6 (102-309)||(28265181-28265385)
chr6 (102-309)||(28337306-28337510)
chr6 (102-309)||(28343930-28344134)
chr6 (138-311)||(30638281-30638459)
chr6 (146-309)||(32565392-32565561)
chr6 (94-307)||(12762505-12762713)
chr6 (146-309)||(16552170-16552339)
chr6 (146-309)||(16576614-16576783)
chr6 (146-309)||(16618597-16618766)
chr6 (146-309)||(16628726-16628895)
chr6 (146-309)||(17017072-17017241)
chr6 (94-310)||(20801556-20801767)
chr6 (172-311)||(30597024-30597168)
chr6 (171-342)||(19662548-19662715)
chr6 (169-342)||(12706467-12706637)
chr6 (169-342)||(16740985-16741154)
chr6 (350-531)||(16759573-16759746)
chr6 (171-342)||(2685478-2685645)
chr6 (26-260)||(14098461-14098691)
chr6 (26-213)||(25595394-25595572)
chr6 (94-311)||(20176722-20176938)
chr6 (108-260)||(14471837-14471987)
chr6 (147-311)||(5834638-5834810)
chr6 (147-311)||(22159097-22159269)
chr6 (383-531)||(22948453-22948592)
chr6 (383-531)||(22952409-22952548)
chr6 (383-531)||(23870897-23871036)
chr6 (383-531)||(23874853-23874992)
chr6 (169-343)||(17803962-17804136)
chr6 (1-87)||(8243635-8243721)
chr6 (389-531)||(18918012-18918145)
chr6 (169-343)||(27325785-27325955)
chr6 (212-311)||(14098383-14098484)
chr6 (238-311)||(4233707-4233780)
chr6 (239-311)||(14053795-14053867)
chr6 (192-311)||(22430208-22430327)
chr6 (94-235)||(4233594-4233729)
chr6 (334-516)||(19774060-19774245)
chr6 (334-463)||(22805370-22805507)
chr6 (350-478)||(19656762-19656891)
chr6 (334-401)||(23538235-23538302)
chr6 (334-412)||(17105329-17105407)
chr6 (1-85)||(16371861-16371945)
chr6 (292-342)||(19298173-19298223)
chr6 (334-387)||(34963070-34963123)
chr6 (338-412)||(17742849-17742923)
chr6 (334-412)||(19656621-19656699)
chr6 (334-387)||(23992127-23992180)
chr6 (334-393)||(27126606-27126665)
chr6 (290-347)||(22081060-22081118)
chr6 (350-478)||(20182303-20182440)
chr6 (350-478)||(22153551-22153688)
chr6 (350-531)||(17742689-17742878)
chr6 (290-345)||(22831247-22831303)
chr6 (334-409)||(15705936-15706011)
chr6 (290-347)||(1561039-1561097)
chr6 (334-387)||(7825436-7825489)
chr6 (102-143)||(14059720-14059761)
chr6 (290-346)||(18906851-18906907)
chr6 (350-447)||(15705985-15706090)
chr6 (292-343)||(31155695-31155747)
chr6 (289-347)||(19651925-19651984)
chr6 (289-347)||(27333456-27333515)
chr6 (289-347)||(27394196-27394255)
chr6 (290-343)||(4738854-4738908)
chr6 (290-343)||(11185253-11185307)
chr6 (350-388)||(23538215-23538253)
chr6 (290-343)||(28496797-28496851)
chr6 (290-343)||(29809208-29809262)
chr6 (94-148)||(30597175-30597229)
chr6 (3-68)||(8228908-8228973)
chr6 (290-334)||(15894760-15894805)
chr6 (3-64)||(16552040-16552101)
chr6 (3-64)||(16576852-16576913)
chr6 (3-64)||(16618467-16618528)
chr6 (3-64)||(16628596-16628657)
chr6 (3-64)||(17016942-17017003)
chr6 (290-346)||(21830760-21830816)
chr6 (290-342)||(22780552-22780605)
chr6 (3-64)||(32565262-32565323)
chr6 (191-235)||(22430231-22430274)
chr6 (191-235)||(25767380-25767423)
chr6 (487-531)||(27556020-27556064)
chr6 (289-343)||(25629677-25629732)
chr6 (290-343)||(25603716-25603770)
chr6 (3-68)||(18931097-18931162)
chr6 (290-346)||(22408613-22408669)
chr6 (169-279)||(25767335-25767445)
chr6 (3-64)||(29587700-29587761)
chr6 (3-64)||(29593841-29593902)
chr6 (290-345)||(16523704-16523759)
chr6 (290-345)||(18692232-18692287)
chr6 (367-411)||(19656746-19656790)
chr6 (290-333)||(19872870-19872914)
chr6 (373-421)||(20182402-20182450)
chr6 (290-333)||(21740357-21740401)
chr6 (373-421)||(22153541-22153589)
chr6 (290-333)||(22335220-22335264)
chr6 (290-333)||(22431999-22432043)
chr6 (290-333)||(22438549-22438593)
chr6 (290-333)||(25642510-25642554)
chr6 (315-343)||(25767444-25767472)
[»] chr4 (158 HSPs)
chr4 (1-531)||(9555866-9556390)
chr4 (1-531)||(33741716-33742240)
chr4 (1-425)||(17809707-17810132)
chr4 (1-531)||(5757185-5757700)
chr4 (1-531)||(14757668-14758197)
chr4 (1-531)||(4561580-4562095)
chr4 (95-490)||(15224411-15224805)
chr4 (169-531)||(14954609-14954961)
chr4 (169-531)||(12487021-12487375)
chr4 (217-470)||(10712244-10712496)
chr4 (217-470)||(10926014-10926266)
chr4 (241-531)||(20157680-20157973)
chr4 (315-531)||(20160433-20160649)
chr4 (1-311)||(53433155-53433464)
chr4 (315-531)||(20163211-20163427)
chr4 (26-311)||(23081370-23081653)
chr4 (50-311)||(27709527-27709786)
chr4 (26-311)||(19942195-19942478)
chr4 (147-334)||(14708770-14708956)
chr4 (26-319)||(16956692-16956984)
chr4 (44-311)||(7901232-7901494)
chr4 (79-311)||(9272252-9272480)
chr4 (94-311)||(6873473-6873686)
chr4 (147-334)||(42997586-42997772)
chr4 (147-342)||(45937926-45938119)
chr4 (26-311)||(15322136-15322416)
chr4 (94-311)||(386426-386639)
chr4 (94-311)||(40477946-40478159)
chr4 (147-342)||(2014556-2014748)
chr4 (147-342)||(26243801-26243993)
chr4 (102-311)||(12474816-12475021)
chr4 (102-311)||(12481446-12481651)
chr4 (147-342)||(19757737-19757928)
chr4 (147-342)||(19781878-19782069)
chr4 (94-311)||(26285003-26285217)
chr4 (187-342)||(23139049-23139202)
chr4 (94-311)||(15383589-15383801)
chr4 (193-379)||(27533457-27533641)
chr4 (94-311)||(51493914-51494125)
chr4 (147-342)||(9530212-9530404)
chr4 (102-311)||(18024532-18024737)
chr4 (102-311)||(18070965-18071170)
chr4 (102-311)||(18295422-18295627)
chr4 (1-311)||(12521864-12522170)
chr4 (104-311)||(14268560-14268763)
chr4 (148-334)||(18602868-18603052)
chr4 (217-388)||(25689340-25689510)
chr4 (39-311)||(23838222-23838484)
chr4 (94-311)||(19780384-19780597)
chr4 (94-311)||(23953945-23954158)
chr4 (94-311)||(23960607-23960820)
chr4 (147-334)||(3412583-3412768)
chr4 (147-311)||(40453717-40453886)
chr4 (104-311)||(14298934-14299137)
chr4 (31-311)||(14678752-14679021)
chr4 (290-475)||(631289-631475)
chr4 (147-340)||(16243536-16243726)
chr4 (94-311)||(15148254-15148467)
chr4 (94-311)||(15361929-15362142)
chr4 (94-311)||(16231938-16232151)
chr4 (94-311)||(22194416-22194629)
chr4 (148-334)||(18609440-18609624)
chr4 (94-311)||(4771894-4772106)
chr4 (31-311)||(41385792-41386062)
chr4 (138-311)||(8384610-8384788)
chr4 (138-311)||(14073606-14073784)
chr4 (138-311)||(15256384-15256562)
chr4 (138-311)||(17090130-17090308)
chr4 (138-311)||(29041051-29041229)
chr4 (94-311)||(36884831-36885044)
chr4 (138-309)||(55795236-55795413)
chr4 (138-309)||(8391267-8391443)
chr4 (31-311)||(14684960-14685229)
chr4 (146-309)||(12349724-12349893)
chr4 (138-309)||(17962476-17962653)
chr4 (94-311)||(8048592-8048804)
chr4 (94-311)||(8055205-8055417)
chr4 (169-334)||(18236677-18236840)
chr4 (146-309)||(12300048-12300217)
chr4 (138-311)||(17808189-17808367)
chr4 (156-342)||(18222524-18222705)
chr4 (327-475)||(17048683-17048831)
chr4 (1-311)||(35170436-35170715)
chr4 (238-342)||(28569645-28569749)
chr4 (147-342)||(18228990-18229180)
chr4 (32-214)||(20682036-20682207)
chr4 (189-342)||(1951939-1952088)
chr4 (147-334)||(17152623-17152805)
chr4 (383-531)||(25689239-25689378)
chr4 (1-238)||(35613796-35614025)
chr4 (383-519)||(27533359-27533486)
chr4 (334-470)||(37018300-37018436)
chr4 (238-311)||(14305661-14305734)
chr4 (217-343)||(36134153-36134280)
chr4 (104-235)||(14305558-14305683)
chr4 (104-240)||(20115012-20115143)
chr4 (334-412)||(3484802-3484880)
chr4 (142-254)||(27533606-27533716)
chr4 (238-311)||(35613748-35613821)
chr4 (169-235)||(10712454-10712520)
chr4 (169-235)||(10926224-10926290)
chr4 (217-333)||(22634604-22634721)
chr4 (169-235)||(25689468-25689534)
chr4 (334-470)||(35812632-35812776)
chr4 (334-411)||(14548478-14548555)
chr4 (422-531)||(17807464-17807564)
chr4 (290-347)||(7798512-7798570)
chr4 (334-412)||(13592535-13592613)
chr4 (335-470)||(16997226-16997369)
chr4 (154-235)||(28569587-28569667)
chr4 (334-387)||(15042323-15042376)
chr4 (334-387)||(15112048-15112101)
chr4 (334-387)||(25090444-25090497)
chr4 (289-347)||(12773820-12773879)
chr4 (289-347)||(14038440-14038499)
chr4 (26-85)||(30235220-30235279)
chr4 (290-343)||(14053628-14053682)
chr4 (290-346)||(12569753-12569809)
chr4 (169-235)||(22634580-22634645)
chr4 (481-531)||(10712206-10712256)
chr4 (481-531)||(10925976-10926026)
chr4 (290-343)||(17046227-17046281)
chr4 (3-64)||(12299918-12299979)
chr4 (3-64)||(12349594-12349655)
chr4 (290-346)||(15093513-15093569)
chr4 (290-346)||(16488397-16488453)
chr4 (3-64)||(17962345-17962406)
chr4 (3-68)||(55795479-55795544)
chr4 (169-235)||(20157634-20157699)
chr4 (280-311)||(30235277-30235308)
chr4 (169-235)||(36134129-36134194)
chr4 (290-343)||(16240295-16240349)
chr4 (290-343)||(16377846-16377900)
chr4 (94-128)||(40471452-40471486)
chr4 (334-388)||(42874588-42874642)
chr4 (290-343)||(52873587-52873641)
chr4 (350-387)||(3484794-3484831)
chr4 (3-68)||(8384854-8384919)
chr4 (3-68)||(8391509-8391574)
chr4 (290-330)||(12610680-12610721)
chr4 (289-333)||(13569252-13569297)
chr4 (3-68)||(14073850-14073915)
chr4 (3-68)||(15256628-15256693)
chr4 (49-143)||(15353372-15353465)
chr4 (290-346)||(16348983-16349039)
chr4 (290-346)||(16357271-16357327)
chr4 (3-68)||(17089999-17090064)
chr4 (3-68)||(17808433-17808498)
chr4 (282-311)||(21339968-21339997)
chr4 (290-330)||(23803699-23803740)
chr4 (3-64)||(29040920-29040981)
chr4 (290-330)||(51464216-51464257)
chr4 (290-337)||(3096084-3096132)
chr4 (290-337)||(12902505-12902553)
chr4 (290-333)||(15122124-15122168)
chr4 (290-325)||(15705149-15705185)
chr4 (290-333)||(23843227-23843271)
chr4 (290-333)||(44675381-44675425)
[»] chr3 (222 HSPs)
chr3 (1-531)||(27409890-27410414)
chr3 (1-531)||(11069407-11069931)
chr3 (1-531)||(7109035-7109561)
chr3 (1-531)||(7112970-7113496)
chr3 (1-531)||(22321003-22321527)
chr3 (1-531)||(22336058-22336582)
chr3 (1-531)||(55022204-55022730)
chr3 (1-529)||(11165775-11166297)
chr3 (1-531)||(14498664-14499188)
chr3 (1-531)||(4107643-4108169)
chr3 (1-531)||(4111495-4112021)
chr3 (1-531)||(28949061-28949587)
chr3 (1-469)||(15616766-15617237)
chr3 (95-531)||(16750684-16751115)
chr3 (1-377)||(30065432-30065809)
chr3 (194-531)||(19774898-19775235)
chr3 (169-531)||(15964284-15964636)
chr3 (169-531)||(15968208-15968560)
chr3 (169-531)||(15972132-15972484)
chr3 (217-531)||(4589378-4589691)
chr3 (197-531)||(15464430-15464762)
chr3 (193-519)||(12339044-12339367)
chr3 (169-531)||(14664981-14665343)
chr3 (217-531)||(37440102-37440406)
chr3 (189-531)||(14668137-14668479)
chr3 (217-531)||(8489652-8489962)
chr3 (169-423)||(5222761-5223013)
chr3 (294-531)||(17317669-17317906)
chr3 (1-311)||(12891184-12891493)
chr3 (1-311)||(17253075-17253384)
chr3 (26-319)||(17710633-17710923)
chr3 (26-311)||(1145592-1145875)
chr3 (26-311)||(15343645-15343928)
chr3 (26-311)||(410791-411074)
chr3 (26-311)||(8721196-8721479)
chr3 (26-311)||(9073083-9073366)
chr3 (44-311)||(10236454-10236715)
chr3 (44-311)||(13316247-13316507)
chr3 (26-311)||(15350289-15350572)
chr3 (26-311)||(15404535-15404818)
chr3 (44-311)||(15825448-15825709)
chr3 (44-311)||(15992163-15992424)
chr3 (147-342)||(38814161-38814354)
chr3 (44-311)||(41092405-41092667)
chr3 (26-311)||(19808810-19809091)
chr3 (147-342)||(3833451-3833644)
chr3 (26-319)||(30777265-30777558)
chr3 (1-311)||(7985487-7985793)
chr3 (26-311)||(13320755-13321036)
chr3 (52-310)||(4710084-4710340)
chr3 (94-311)||(23704861-23705074)
chr3 (94-311)||(23723317-23723530)
chr3 (94-311)||(23741773-23741986)
chr3 (94-311)||(41201891-41202104)
chr3 (187-343)||(1598654-1598809)
chr3 (44-311)||(5150027-5150289)
chr3 (50-311)||(15366994-15367253)
chr3 (95-260)||(19775194-19775358)
chr3 (187-342)||(15942079-15942233)
chr3 (1-311)||(16332953-16333259)
chr3 (102-311)||(417798-418003)
chr3 (102-309)||(13250519-13250722)
chr3 (102-309)||(13257165-13257368)
chr3 (102-311)||(3690417-3690622)
chr3 (102-311)||(14673303-14673508)
chr3 (147-334)||(16696570-16696755)
chr3 (102-311)||(20057507-20057712)
chr3 (94-311)||(15727025-15727238)
chr3 (94-311)||(31422647-31422860)
chr3 (31-311)||(24187566-24187836)
chr3 (31-311)||(55148767-55149037)
chr3 (94-311)||(5106978-5107191)
chr3 (138-309)||(5426854-5427031)
chr3 (1-311)||(20722790-20723087)
chr3 (94-311)||(26794489-26794702)
chr3 (94-311)||(37615191-37615404)
chr3 (102-311)||(53380453-53380658)
chr3 (102-311)||(53387105-53387310)
chr3 (94-298)||(15692371-15692571)
chr3 (102-311)||(20064145-20064350)
chr3 (327-531)||(14670393-14670605)
chr3 (146-309)||(15584870-15585038)
chr3 (146-309)||(15591528-15591696)
chr3 (1-311)||(10325633-10325939)
chr3 (138-309)||(6608260-6608437)
chr3 (138-311)||(16633628-16633806)
chr3 (138-311)||(16640238-16640416)
chr3 (138-311)||(43160903-43161081)
chr3 (138-311)||(43167140-43167318)
chr3 (147-311)||(5221203-5221372)
chr3 (94-309)||(10003436-10003647)
chr3 (94-309)||(10010083-10010294)
chr3 (31-311)||(839035-839305)
chr3 (169-334)||(16809038-16809200)
chr3 (94-311)||(26889254-26889466)
chr3 (138-311)||(1333211-1333389)
chr3 (146-309)||(12482216-12482385)
chr3 (138-311)||(48423145-48423323)
chr3 (138-311)||(48429923-48430101)
chr3 (96-311)||(10153831-10154042)
chr3 (94-309)||(10904026-10904237)
chr3 (94-309)||(10910698-10910909)
chr3 (327-531)||(14681915-14682127)
chr3 (290-475)||(12852846-12853032)
chr3 (146-309)||(5201014-5201183)
chr3 (94-311)||(10846378-10846591)
chr3 (94-311)||(16758665-16758878)
chr3 (146-309)||(5420455-5420624)
chr3 (171-342)||(17241751-17241918)
chr3 (172-311)||(6598517-6598661)
chr3 (172-311)||(6605197-6605341)
chr3 (94-311)||(16624149-16624362)
chr3 (94-311)||(16747933-16748146)
chr3 (327-475)||(16795895-16796043)
chr3 (26-311)||(15397944-15398200)
chr3 (26-235)||(15360551-15360756)
chr3 (147-343)||(15482439-15482632)
chr3 (104-309)||(16489774-16489970)
chr3 (26-235)||(15337293-15337498)
chr3 (52-311)||(22643384-22643611)
chr3 (1-215)||(28351181-28351387)
chr3 (189-343)||(31097733-31097884)
chr3 (145-343)||(20461644-20461841)
chr3 (217-311)||(15360500-15360596)
chr3 (169-343)||(327332-327506)
chr3 (217-311)||(15337242-15337338)
chr3 (169-297)||(16798211-16798336)
chr3 (383-531)||(30065319-30065459)
chr3 (169-343)||(7793517-7793691)
chr3 (169-343)||(2897989-2898164)
chr3 (238-311)||(26789012-26789085)
chr3 (220-311)||(28368673-28368767)
chr3 (220-311)||(28376491-28376585)
chr3 (220-311)||(28384313-28384407)
chr3 (95-235)||(4589289-4589420)
chr3 (246-311)||(29695943-29696008)
chr3 (425-531)||(5220483-5220580)
chr3 (94-235)||(26788899-26789034)
chr3 (350-478)||(14440975-14441104)
chr3 (334-516)||(10543014-10543199)
chr3 (187-262)||(12339324-12339397)
chr3 (265-343)||(14572352-14572431)
chr3 (169-262)||(15464723-15464814)
chr3 (169-235)||(37440078-37440144)
chr3 (334-412)||(18700869-18700947)
chr3 (262-347)||(49668362-49668448)
chr3 (373-434)||(14067291-14067352)
chr3 (334-387)||(46821921-46821974)
chr3 (337-470)||(2842664-2842805)
chr3 (265-347)||(9512669-9512752)
chr3 (265-347)||(9520644-9520727)
chr3 (327-381)||(12120166-12120220)
chr3 (327-381)||(38962284-38962338)
chr3 (338-387)||(13543679-13543728)
chr3 (169-235)||(8489628-8489694)
chr3 (147-260)||(11300902-11301017)
chr3 (289-347)||(32307409-32307468)
chr3 (167-259)||(11854328-11854422)
chr3 (334-412)||(14441075-14441153)
chr3 (267-343)||(14577112-14577189)
chr3 (334-387)||(35353361-35353414)
chr3 (289-346)||(11557694-11557753)
chr3 (334-386)||(42353679-42353731)
chr3 (265-347)||(16103529-16103612)
chr3 (334-388)||(5214722-5214776)
chr3 (2-64)||(5420324-5420386)
chr3 (2-64)||(5426722-5426784)
chr3 (469-519)||(11301027-11301077)
chr3 (469-519)||(11854183-11854233)
chr3 (290-347)||(13210654-13210712)
chr3 (334-412)||(43890179-43890257)
chr3 (334-387)||(10562479-10562532)
chr3 (208-261)||(11854266-11854318)
chr3 (289-353)||(15467602-15467667)
chr3 (290-345)||(11849056-11849111)
chr3 (290-345)||(11862534-11862589)
chr3 (350-410)||(13520978-13521038)
chr3 (289-347)||(1645004-1645063)
chr3 (197-248)||(11300979-11301029)
chr3 (193-248)||(11854231-11854285)
chr3 (193-260)||(11854243-11854309)
chr3 (289-347)||(16097097-16097156)
chr3 (193-235)||(15464701-15464743)
chr3 (290-343)||(23083686-23083740)
chr3 (290-346)||(12172536-12172592)
chr3 (3-64)||(12482454-12482515)
chr3 (290-346)||(14878839-14878895)
chr3 (3-64)||(15584740-15584801)
chr3 (3-64)||(15591398-15591459)
chr3 (334-379)||(44269408-44269453)
chr3 (343-387)||(19884816-19884860)
chr3 (290-345)||(26196741-26196796)
chr3 (289-343)||(11425039-11425094)
chr3 (289-347)||(12174581-12174640)
chr3 (289-343)||(18438276-18438331)
chr3 (350-470)||(43890228-43890356)
chr3 (290-343)||(12398950-12399004)
chr3 (350-412)||(15565309-15565371)
chr3 (290-343)||(26683096-26683150)
chr3 (290-343)||(43840674-43840728)
chr3 (3-64)||(1333080-1333141)
chr3 (350-387)||(15565301-15565338)
chr3 (3-68)||(16633872-16633937)
chr3 (3-68)||(16640482-16640547)
chr3 (290-346)||(19726222-19726278)
chr3 (3-68)||(43161147-43161212)
chr3 (3-68)||(43167384-43167449)
chr3 (290-330)||(44494539-44494580)
chr3 (3-68)||(48423389-48423454)
chr3 (3-68)||(48430167-48430232)
chr3 (290-330)||(50242595-50242636)
chr3 (290-345)||(322333-322388)
chr3 (290-333)||(855889-855933)
chr3 (102-134)||(6598690-6598722)
chr3 (102-134)||(6605370-6605402)
chr3 (288-343)||(14972600-14972656)
chr3 (290-333)||(15878374-15878418)
chr3 (290-333)||(16369150-16369194)
chr3 (414-470)||(18700960-18701016)
chr3 (290-333)||(23053391-23053435)
chr3 (290-333)||(23077780-23077824)
chr3 (290-333)||(23408179-23408223)
[»] chr2 (120 HSPs)
chr2 (1-531)||(24628725-24629249)
chr2 (1-531)||(27601128-27601656)
chr2 (1-531)||(24648691-24649217)
chr2 (1-531)||(27379679-27380202)
chr2 (1-531)||(27383725-27384248)
chr2 (1-433)||(12901758-12902196)
chr2 (1-469)||(10101891-10102370)
chr2 (169-531)||(31344466-31344826)
chr2 (169-531)||(30345433-30345785)
chr2 (217-531)||(1282716-1283029)
chr2 (217-531)||(41531470-41531774)
chr2 (1-311)||(30970998-30971307)
chr2 (1-311)||(21147310-21147613)
chr2 (26-311)||(13970410-13970693)
chr2 (26-311)||(24714494-24714777)
chr2 (26-311)||(45057466-45057749)
chr2 (26-311)||(37318058-37318339)
chr2 (327-531)||(9784338-9784542)
chr2 (26-311)||(41604773-41605056)
chr2 (26-311)||(41610670-41610953)
chr2 (1-240)||(24872426-24872660)
chr2 (1-311)||(24640981-24641287)
chr2 (1-311)||(11677229-11677535)
chr2 (1-240)||(24880311-24880545)
chr2 (94-311)||(12828869-12829082)
chr2 (147-338)||(19928638-19928826)
chr2 (96-311)||(24914063-24914274)
chr2 (94-311)||(23170835-23171048)
chr2 (94-311)||(23582092-23582305)
chr2 (102-311)||(16928153-16928358)
chr2 (102-311)||(16996847-16997052)
chr2 (102-311)||(17003480-17003685)
chr2 (147-334)||(18855595-18855779)
chr2 (31-311)||(24502899-24503169)
chr2 (94-311)||(22321081-22321294)
chr2 (94-311)||(22327234-22327447)
chr2 (147-334)||(60602-60786)
chr2 (102-311)||(10873335-10873540)
chr2 (104-311)||(27599061-27599264)
chr2 (147-335)||(41666733-41666919)
chr2 (138-309)||(44381343-44381520)
chr2 (147-334)||(23186861-23187045)
chr2 (104-311)||(1842880-1843083)
chr2 (148-334)||(23598124-23598307)
chr2 (104-311)||(29233327-29233530)
chr2 (104-311)||(29346626-29346829)
chr2 (94-311)||(27617095-27617307)
chr2 (138-311)||(9340059-9340237)
chr2 (138-311)||(9488693-9488871)
chr2 (138-311)||(9607954-9608132)
chr2 (134-311)||(10865970-10866151)
chr2 (138-311)||(16922308-16922486)
chr2 (138-311)||(19490076-19490254)
chr2 (193-334)||(26124969-26125109)
chr2 (138-311)||(27215842-27216020)
chr2 (138-311)||(28432064-28432242)
chr2 (138-311)||(13306741-13306919)
chr2 (138-311)||(16985720-16985898)
chr2 (146-309)||(27369089-27369258)
chr2 (138-309)||(44388013-44388190)
chr2 (94-311)||(26877663-26877875)
chr2 (146-309)||(27375599-27375768)
chr2 (171-342)||(22461349-22461516)
chr2 (169-343)||(24735168-24735342)
chr2 (1-151)||(27196823-27196972)
chr2 (334-412)||(32215396-32215474)
chr2 (1-85)||(21139292-21139376)
chr2 (171-260)||(26125067-26125155)
chr2 (238-311)||(27195533-27195606)
chr2 (169-235)||(1282987-1283053)
chr2 (169-235)||(41531446-41531512)
chr2 (334-412)||(17306253-17306331)
chr2 (282-343)||(19691914-19691976)
chr2 (327-381)||(38967084-38967138)
chr2 (102-212)||(10866272-10866373)
chr2 (264-311)||(24872660-24872707)
chr2 (264-311)||(24880545-24880592)
chr2 (327-381)||(24367446-24367500)
chr2 (265-347)||(22134501-22134584)
chr2 (289-347)||(25175581-25175640)
chr2 (334-387)||(28653710-28653763)
chr2 (340-470)||(36838904-36839042)
chr2 (335-387)||(24514977-24515029)
chr2 (169-238)||(27195581-27195653)
chr2 (265-347)||(28405721-28405808)
chr2 (290-346)||(21327890-21327946)
chr2 (290-346)||(23020029-23020085)
chr2 (290-346)||(24673304-24673360)
chr2 (290-346)||(24679921-24679977)
chr2 (275-311)||(30657567-30657603)
chr2 (290-343)||(38442-38496)
chr2 (26-72)||(19646009-19646055)
chr2 (290-343)||(20322387-20322441)
chr2 (290-343)||(23072276-23072330)
chr2 (290-346)||(21318959-21319015)
chr2 (290-346)||(22799449-22799505)
chr2 (3-64)||(27369327-27369388)
chr2 (3-64)||(27375837-27375898)
chr2 (350-387)||(32215445-32215482)
chr2 (3-64)||(44381212-44381273)
chr2 (289-343)||(22336867-22336922)
chr2 (289-347)||(23657575-23657633)
chr2 (31-143)||(24174759-24174870)
chr2 (289-330)||(7679366-7679408)
chr2 (290-343)||(23654713-23654767)
chr2 (3-68)||(9340303-9340368)
chr2 (3-68)||(9488937-9489002)
chr2 (3-68)||(9608198-9608263)
chr2 (3-64)||(13306610-13306671)
chr2 (3-68)||(16922552-16922617)
chr2 (3-64)||(16985968-16986029)
chr2 (3-64)||(19489945-19490006)
chr2 (49-143)||(24655403-24655496)
chr2 (3-64)||(28431933-28431994)
chr2 (290-330)||(32215322-32215363)
chr2 (3-64)||(44387882-44387943)
chr2 (290-333)||(23031125-23031169)
chr2 (290-345)||(24716837-24716892)
chr2 (290-333)||(40622534-40622578)
chr2 (290-333)||(45678452-45678496)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (1-531)||(67547-68071)
scaffold0061 (94-310)||(59556-59768)
scaffold0061 (334-412)||(19613-19691)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (1-531)||(22111267-22111791)
chr8 (1-531)||(43251147-43251673)
chr8 (1-531)||(21972827-21973351)
chr8 (1-531)||(21976916-21977442)
chr8 (169-531)||(21828456-21828817)
chr8 (169-531)||(18863087-18863448)
chr8 (169-531)||(21410253-21410614)
chr8 (169-531)||(21804745-21805106)
chr8 (169-531)||(30940519-30940871)
chr8 (169-531)||(14398265-14398624)
chr8 (169-531)||(21386661-21387022)
chr8 (1-233)||(19278529-19278767)
chr8 (1-311)||(26935195-26935504)
chr8 (26-311)||(23845803-23846086)
chr8 (147-342)||(15531666-15531859)
chr8 (327-531)||(23913599-23913803)
chr8 (1-311)||(19905278-19905584)
chr8 (26-311)||(20023969-20024252)
chr8 (147-342)||(24445642-24445835)
chr8 (169-342)||(15538225-15538397)
chr8 (94-311)||(16883267-16883480)
chr8 (26-311)||(3216043-3216325)
chr8 (147-342)||(17828718-17828911)
chr8 (147-342)||(23847151-23847343)
chr8 (102-317)||(19111017-19111228)
chr8 (102-317)||(19117308-19117519)
chr8 (31-334)||(20527215-20527508)
chr8 (102-311)||(18865127-18865332)
chr8 (187-334)||(32598463-32598609)
chr8 (187-334)||(32604995-32605141)
chr8 (149-334)||(17055517-17055700)
chr8 (94-311)||(17669665-17669878)
chr8 (134-311)||(19496186-19496367)
chr8 (134-311)||(19498234-19498415)
chr8 (102-311)||(29122884-29123089)
chr8 (102-311)||(22047742-22047947)
chr8 (102-311)||(22115824-22116030)
chr8 (169-334)||(30308910-30309073)
chr8 (102-311)||(8354869-8355074)
chr8 (94-311)||(17676317-17676530)
chr8 (94-311)||(22083628-22083841)
chr8 (94-311)||(5534534-5534747)
chr8 (138-311)||(28454547-28454725)
chr8 (94-311)||(22124624-22124838)
chr8 (94-311)||(20013959-20014171)
chr8 (94-311)||(20020036-20020248)
chr8 (104-311)||(22123490-22123694)
chr8 (169-342)||(22044662-22044832)
chr8 (94-311)||(21915665-21915877)
chr8 (227-342)||(15440362-15440476)
chr8 (169-342)||(16231633-16231802)
chr8 (147-342)||(23833951-23834141)
chr8 (327-478)||(44385220-44385372)
chr8 (146-306)||(18065120-18065287)
chr8 (94-311)||(18854759-18854945)
chr8 (334-449)||(16413760-16413875)
chr8 (217-332)||(19278727-19278843)
chr8 (334-412)||(32121451-32121529)
chr8 (458-531)||(15923992-15924065)
chr8 (350-478)||(5760109-5760237)
chr8 (264-311)||(20705908-20705955)
chr8 (289-347)||(21673379-21673438)
chr8 (334-412)||(42819107-42819185)
chr8 (289-347)||(6520094-6520153)
chr8 (289-347)||(23761176-23761235)
chr8 (290-334)||(16184469-16184514)
chr8 (187-228)||(21383543-21383584)
chr8 (290-346)||(24755496-24755552)
chr8 (290-346)||(30643612-30643668)
chr8 (340-412)||(18833089-18833161)
chr8 (290-345)||(20466365-20466420)
chr8 (290-341)||(21389777-21389829)
chr8 (290-341)||(21779103-21779155)
chr8 (289-347)||(22874807-22874866)
chr8 (289-347)||(38855549-38855608)
chr8 (290-343)||(21249125-21249179)
chr8 (290-343)||(21254963-21255017)
chr8 (290-343)||(31971041-31971095)
chr8 (3-64)||(18065356-18065417)
chr8 (290-346)||(21162383-21162439)
chr8 (350-387)||(32121443-32121480)
chr8 (289-343)||(16092620-16092675)
chr8 (190-229)||(23913931-23913970)
chr8 (289-347)||(26355993-26356052)
chr8 (289-343)||(28649328-28649383)
chr8 (290-343)||(7372520-7372574)
chr8 (290-343)||(20535950-20536004)
chr8 (290-343)||(21919281-21919335)
chr8 (191-229)||(23913978-23914016)
chr8 (290-343)||(45131323-45131377)
chr8 (290-342)||(5866601-5866654)
chr8 (290-342)||(18818734-18818787)
chr8 (294-346)||(21169060-21169112)
chr8 (289-325)||(21673458-21673495)
chr8 (290-330)||(25484659-25484700)
chr8 (290-333)||(377022-377066)
chr8 (290-343)||(17140653-17140708)
chr8 (290-345)||(17927025-17927080)
chr8 (290-333)||(22873590-22873634)
chr8 (290-329)||(23777158-23777198)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (1-531)||(58965-59489)
scaffold0028 (44-311)||(13313-13574)
scaffold0028 (44-311)||(6788-7049)
scaffold0028 (44-311)||(22841-23102)
scaffold0028 (26-311)||(56828-57108)
scaffold0028 (49-311)||(41321-41578)
scaffold0028 (102-311)||(67307-67511)
scaffold0028 (265-347)||(132445-132528)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (1-531)||(65774-66293)
scaffold0029 (1-531)||(61858-62377)
scaffold0029 (95-530)||(79870-80305)
scaffold0029 (94-311)||(105981-106194)
scaffold0029 (94-311)||(126216-126428)
scaffold0029 (290-333)||(10479-10523)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-433)||(4121-4549)
[»] scaffold0109 (11 HSPs)
scaffold0109 (193-531)||(36431-36767)
scaffold0109 (54-311)||(26424-26677)
scaffold0109 (171-334)||(38977-39140)
scaffold0109 (171-334)||(11460-11623)
scaffold0109 (187-334)||(6746-6891)
scaffold0109 (26-262)||(43146-43377)
scaffold0109 (147-260)||(36361-36472)
scaffold0109 (212-310)||(43041-43143)
scaffold0109 (338-412)||(1063-1137)
scaffold0109 (212-262)||(43118-43171)
scaffold0109 (350-387)||(1108-1145)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (169-531)||(36528-36889)
scaffold0031 (169-343)||(53330-53504)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (169-499)||(189819-190148)
scaffold0012 (169-343)||(25127-25299)
scaffold0012 (298-347)||(5021-5071)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-308)||(1-310)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (193-530)||(208054-208390)
scaffold0016 (169-254)||(208006-208090)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (169-531)||(33102-33456)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (187-531)||(14547-14881)
scaffold0141 (102-311)||(37838-38044)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (169-531)||(20621-20986)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (238-531)||(1-295)
[»] scaffold0486 (2 HSPs)
scaffold0486 (238-531)||(9179-9473)
scaffold0486 (334-393)||(8201-8260)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (238-531)||(11299-11592)
scaffold0200 (187-235)||(11570-11618)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (256-490)||(73822-74056)
scaffold0013 (1-334)||(9098-9426)
scaffold0013 (189-343)||(2850-3001)
scaffold0013 (257-342)||(81468-81552)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (327-531)||(6465-6669)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (169-384)||(70804-71017)
scaffold0003 (102-311)||(56771-56976)
scaffold0003 (147-335)||(139496-139681)
scaffold0003 (169-343)||(100849-101018)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (44-311)||(12228-12489)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (26-311)||(73778-74061)
scaffold0009 (145-343)||(228507-228700)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (192-412)||(29259-29477)
scaffold0205 (350-387)||(29251-29288)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (26-311)||(19619-19901)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (26-311)||(77998-78277)
scaffold0004 (49-235)||(60832-61006)
scaffold0004 (290-333)||(69544-69588)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (169-369)||(6431-6629)
scaffold0299 (471-519)||(6371-6419)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (31-319)||(3717-4004)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (147-334)||(16799-16985)
scaffold0034 (334-387)||(116620-116673)
scaffold0034 (407-447)||(116585-116625)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (44-310)||(9637-9897)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (147-334)||(15121-15307)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (1-311)||(8875-9177)
scaffold0216 (294-346)||(17435-17487)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (94-311)||(7858-8071)
scaffold0044 (169-334)||(62045-62210)
scaffold0044 (94-311)||(72993-73206)
scaffold0044 (94-311)||(30324-30538)
scaffold0044 (169-343)||(12680-12852)
scaffold0044 (169-343)||(18964-19136)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (94-311)||(306895-307108)
scaffold0005 (290-333)||(281219-281263)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (147-342)||(9198-9390)
scaffold0193 (290-334)||(12963-13008)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (147-334)||(9688-9873)
scaffold0070 (289-343)||(4263-4316)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (147-343)||(77307-77500)
scaffold0043 (290-333)||(17986-18030)
[»] scaffold0052 (5 HSPs)
scaffold0052 (94-311)||(1149-1362)
scaffold0052 (138-311)||(10135-10313)
scaffold0052 (138-311)||(56557-56735)
scaffold0052 (3-68)||(10379-10444)
scaffold0052 (3-68)||(56801-56866)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (171-334)||(9121-9283)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (147-334)||(1661-1846)
scaffold0008 (289-347)||(15031-15090)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (31-311)||(241846-242116)
scaffold0010 (147-342)||(22995-23185)
scaffold0010 (289-347)||(129636-129695)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (26-311)||(15035-15316)
scaffold0096 (290-333)||(16672-16716)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (156-342)||(63632-63815)
scaffold0042 (290-346)||(35241-35297)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (94-311)||(9911-10124)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (383-531)||(10395-10543)
scaffold0166 (189-369)||(10237-10414)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (147-334)||(36093-36277)
[»] scaffold0111 (7 HSPs)
scaffold0111 (147-334)||(8285-8469)
scaffold0111 (193-334)||(15405-15544)
scaffold0111 (147-260)||(15502-15613)
scaffold0111 (334-412)||(20010-20088)
scaffold0111 (338-379)||(7093-7134)
scaffold0111 (338-379)||(14212-14253)
scaffold0111 (290-333)||(32196-32240)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-311)||(9957-10263)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (138-309)||(32460-32636)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (31-311)||(14587-14858)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (192-387)||(28799-28990)
[»] scaffold0546 (4 HSPs)
scaffold0546 (171-334)||(1684-1847)
scaffold0546 (187-334)||(6416-6561)
scaffold0546 (338-412)||(10664-10738)
scaffold0546 (350-387)||(10656-10693)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (147-326)||(6136-6313)
scaffold0130 (233-326)||(8219-8312)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (290-475)||(25131-25318)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (290-475)||(8126-8312)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (138-311)||(38480-38658)
scaffold0140 (3-68)||(38724-38789)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (102-311)||(76768-76974)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (94-310)||(138865-139077)
scaffold0017 (290-333)||(193300-193344)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (148-334)||(153-337)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (400-530)||(51300-51430)
[»] scaffold0242 (3 HSPs)
scaffold0242 (1-311)||(19364-19661)
scaffold0242 (1-262)||(25587-25835)
scaffold0242 (212-311)||(25511-25612)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (146-309)||(4228-4397)
scaffold0126 (3-64)||(4098-4159)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (138-311)||(25146-25324)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (169-328)||(18146-18303)
[»] scaffold0553 (2 HSPs)
scaffold0553 (146-309)||(8576-8745)
scaffold0553 (3-64)||(8814-8875)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (146-309)||(21991-22160)
scaffold0133 (3-64)||(22229-22290)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (354-475)||(8090-8211)
scaffold0601 (334-421)||(8037-8124)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (331-475)||(3115-3259)
scaffold0165 (331-475)||(7178-7322)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (147-342)||(16456-16646)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (334-478)||(241-385)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (189-343)||(9843-9993)
[»] scaffold0228 (2 HSPs)
scaffold0228 (145-343)||(18767-18962)
scaffold0228 (289-347)||(21826-21885)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (31-311)||(25024-25293)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (200-311)||(5-121)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (169-343)||(66582-66756)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (169-343)||(20174-20342)
scaffold0120 (289-347)||(33277-33336)
scaffold0120 (289-347)||(45669-45728)
scaffold0120 (289-347)||(17649-17708)
scaffold0120 (290-343)||(15899-15953)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (26-214)||(1-178)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-87)||(68081-68167)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (1-215)||(5819-6019)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (169-340)||(173072-173240)
scaffold0001 (290-333)||(204633-204677)
scaffold0001 (289-347)||(160415-160474)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (95-260)||(80871-81026)
scaffold0037 (289-347)||(23001-23060)
scaffold0037 (290-346)||(21845-21901)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (39-146)||(6560-6666)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (334-412)||(12705-12783)
scaffold0494 (350-387)||(12754-12791)
[»] scaffold0229 (2 HSPs)
scaffold0229 (217-311)||(11967-12060)
scaffold0229 (169-238)||(11943-12012)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (1-148)||(2752-2895)
scaffold0156 (279-311)||(2662-2694)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (334-412)||(18059-18137)
scaffold0023 (289-347)||(40425-40484)
scaffold0023 (289-347)||(100081-100140)
scaffold0023 (289-345)||(101271-101328)
scaffold0023 (350-387)||(18108-18145)
scaffold0023 (290-345)||(38802-38857)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (238-311)||(1141-1214)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (237-302)||(30725-30790)
scaffold0051 (169-235)||(30767-30833)
scaffold0051 (290-343)||(66276-66329)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (350-475)||(7141-7274)
scaffold0278 (337-420)||(7237-7317)
scaffold0278 (289-347)||(5375-5434)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (350-470)||(4329-4449)
scaffold0292 (334-412)||(4420-4498)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (334-470)||(13913-14057)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (245-311)||(14777-14843)
[»] scaffold0207 (7 HSPs)
scaffold0207 (337-412)||(15544-15619)
scaffold0207 (350-412)||(15689-15751)
scaffold0207 (350-412)||(15656-15718)
scaffold0207 (289-347)||(2974-3033)
scaffold0207 (350-412)||(15590-15652)
scaffold0207 (350-412)||(15623-15685)
scaffold0207 (350-402)||(15722-15774)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (334-412)||(629-707)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (334-412)||(19270-19348)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (265-347)||(31847-31930)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (334-412)||(63450-63528)
scaffold0032 (290-343)||(51321-51375)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (265-347)||(3397-3480)
scaffold0628 (289-347)||(7981-8040)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (289-347)||(1846-1905)
scaffold0621 (289-347)||(6263-6322)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (265-347)||(3423-3506)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (290-343)||(1005-1059)
scaffold1873 (169-287)||(1078-1195)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (338-412)||(832-906)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (334-387)||(10707-10760)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (169-224)||(1-56)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (289-346)||(195234-195293)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (289-343)||(16920-16975)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (289-347)||(18992-19051)
scaffold0102 (290-333)||(48769-48813)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (277-314)||(1-38)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (334-387)||(102305-102358)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (337-409)||(37-109)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (289-347)||(12492-12551)
scaffold0476 (290-346)||(5334-5390)
scaffold0476 (290-346)||(6529-6585)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (289-347)||(6337-6396)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (289-347)||(3650-3709)
scaffold0327 (193-279)||(99-187)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (289-347)||(29100-29159)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (289-343)||(24215-24270)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (290-348)||(1733-1791)
scaffold0046 (290-348)||(4288-4346)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (290-343)||(1333-1387)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (289-346)||(6550-6608)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (290-343)||(10751-10805)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (290-343)||(2727-2781)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (289-346)||(46123-46181)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (290-343)||(31808-31862)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (290-343)||(46735-46789)
scaffold0064 (290-333)||(65031-65075)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (290-346)||(7450-7506)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (290-346)||(38543-38600)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (290-346)||(5129-5185)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (290-333)||(14413-14457)
scaffold0081 (290-333)||(23429-23473)
scaffold0081 (290-333)||(38853-38897)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (289-343)||(10040-10095)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (289-347)||(17545-17603)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (290-343)||(1132-1186)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (290-339)||(5455-5505)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (290-343)||(8221-8275)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (290-343)||(1690-1744)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (289-346)||(10605-10663)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (290-343)||(16021-16075)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (290-343)||(15-69)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (290-343)||(15791-15845)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (290-343)||(174506-174560)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (290-343)||(168304-168358)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (294-346)||(2015-2067)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (290-346)||(2400-2456)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (290-346)||(6725-6781)
scaffold0412 (290-346)||(14036-14092)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (290-346)||(19609-19665)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (290-342)||(31901-31954)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (290-330)||(2585-2626)
scaffold0158 (290-330)||(6251-6292)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (334-387)||(56613-56666)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (290-333)||(1873-1917)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (290-333)||(5844-5888)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (290-333)||(10841-10885)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (290-333)||(3491-3535)
scaffold0149 (290-333)||(7922-7966)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (290-337)||(8854-8902)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (290-333)||(9286-9330)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (290-337)||(10063-10111)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 12704905 - 12705437
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12704905 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 12705004  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705005 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 12705104  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705105 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 12705204  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12705205 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 12705304  T
Q  399 catctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705305 catctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta 12705404  T
Q  499 agatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    | ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12705405 aaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 12705437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 32967 - 32445
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32967 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattgaaatgatga 32868  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32867 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 32768  T
Q  201 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 32668  T
Q  301 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32667 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatca 32568  T
Q  401 tctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  32567 tccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa 32477  T
Q  500 gatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
     ||  || || ||||||||| |||||||||||    
T  32476 aatattgctacgttgtttaaaatattgattat 32445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 71011 - 71537
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  71011 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 71110  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71111 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 71210  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71211 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 71310  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71311 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 71410  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  71411 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 71501  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  71502 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 71537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75646
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  75120 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 75219  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75220 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 75319  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75320 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 75419  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75420 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 75519  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  75520 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 75610  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  75611 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 75646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16114101 - 16113577
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16114101 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgtatgatgtctatatatatattatgaaatgat 16114002  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114001 gacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 16113902  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113901 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 16113802  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16113801 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 16113702  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  16113701 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 16113611  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16113610 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 16113577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16117254 - 16116730
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16117254 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgtatgatgtctatatatatattatgaaatgat 16117155  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117154 gacgtttagctccaagttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 16117055  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117054 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 16116955  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16116954 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 16116855  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  16116854 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 16116764  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16116763 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 16116730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12718528 - 12718004
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12718528 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 12718429  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12718428 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagttt 12718329  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718328 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 12718229  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12718228 acatgcatataagtgtctaagttacattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 12718129  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  12718128 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 12718038  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12718037 aaaatgttgctatgttgtttaacatgttgattat 12718004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12723439 - 12722915
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12723439 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 12723340  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723339 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgctgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 12723240  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723239 tgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 12723140  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12723139 acatgcatataagtgtctaagttccattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 12723040  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  12723039 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtattgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 12722949  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12722948 aaaatgttgctatgttgtttaacatgttgattat 12722915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 18279263 - 18278739
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  18279263 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 18279164  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279163 gacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 18279064  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279063 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 18278964  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18278963 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcaagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 18278864  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18278863 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 18278773  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18278772 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 18278739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 18283226 - 18282702
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  18283226 aattgatatattgatatctctatattgttgtgtgatttgactatgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 18283127  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283126 gacgtttaactccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 18283027  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283026 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 18282927  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18282926 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 18282827  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  18282826 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 18282736  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18282735 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 18282702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15083860 - 15083499
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15083860 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 15083763  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15083762 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 15083663  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15083662 tccatgagttgttaagttgtcgatgaaatatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat 15083563  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  15083562 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 15083499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 193 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 26292038 - 26291712
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292038 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 26291939  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26291938 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 26291839  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26291838 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatga 26291739  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaa 519  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  26291738 tgactaagatgttgctatgttgtttaa 26291712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 39721912 - 39721569
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39721912 ttcattgagctttgtcctcactacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgttctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 39721814  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39721813 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttaatgaattatcatccatgagttgttaagttg 39721714  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721713 tcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 39721614  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  39721613 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 39721569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Original strand, 1859260 - 1859602
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1859260 ttcattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 1859357  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1859358 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatctgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 1859457  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859458 tcgatgaattatcatctacgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattata 1859557  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  1859558 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 1859602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 18425326 - 18424992
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425326 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 18425227  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18425226 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgagttatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 18425127  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18425126 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat-- 18425029  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
      | ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18425028 --attattatgttgctatgttgtttaacatattgattat 18424992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 45170448 - 45170800
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45170448 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 45170545  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170546 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacaagcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 45170645  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  45170646 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- 45170742  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  45170743 ------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 45170800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 238 - 531
Target Start/End: Original strand, 13918980 - 13919273
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13918980 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatctgt 13919079  T
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13919080 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttg 13919179  T
Q  438 ttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  13919180 ttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 13919273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Original strand, 2530596 - 2530932
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530596 gagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 2530693  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  2530694 ggtaccacatgcatacaagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgaattgttaagttgttgatg 2530793  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2530794 aattatcatctaagagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacccatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattataagatat 2530893  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  2530894 tgattatgatgttgctatgttgtttaagatattgattat 2530932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Original strand, 25927677 - 25928021
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25927677 ttcattgagctt-gtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgatt-agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 25927774  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaag--t 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  25927775 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttt 25927874  T
Q  385 tgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaatta 484  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25927875 ttttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgacgtgaatta 25927974  T
Q  485 tatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||    
T  25927975 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattat 25928021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 189 - 531
Target Start/End: Original strand, 2832636 - 2832975
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  2832636 cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagccttgtcctccacacgat--aggagccttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa 2832731  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2832732 gattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgatttgttaagttgt 2832831  T
Q  388 cgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 487  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832832 tgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatat 2832931  T
Q  488 gatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  2832932 gatgttgactaagatgttgctatgttgtttaaaatattgattat 2832975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Original strand, 16907675 - 16907981
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907675 gagctttgtcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatataaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 16907774  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcga 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16907775 aagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcga 16907874  T
Q  416 gttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgt 515  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  16907875 gttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgt 16907965  T
Q  516 ttaacatattgattat 531  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16907966 ttaacatgttgattat 16907981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26292255 - 26291996
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292255 aattgatatattgatatctctctgttgttgtatgacttgactgtgctactggtgttatttaactaagtgcctgatgtctatatatatgatgaaatgatga 26292156  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26292155 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacgatgtcttgttgttaagagtcaatgcatagcatttcattgagctttg 26292056  T
Q  201 tcctcaccacg-attaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26292055 tcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 26291996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12714724 - 12714487
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12714724 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 12714625  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714624 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 12714525  T
Q  199 tgtcctcaccacg-attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12714524 tgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacg 12714487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 6017190 - 6017499
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6017190 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 6017289  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  6017290 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 6017379  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6017380 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 6017479  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6017480 tggtaccacatgcatataag 6017499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9410003 - 9409727
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgat 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9410003 tgtgacatgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcgtaatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgtt 9409906  T
Q  131 gatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  9409905 gatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcttcaccacgattattaggagctttgtc 9409815  T
Q  227 ctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9409814 ctccgcacgatttatttggagctttgtcctccgtacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9409727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 20117 - 20419
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20117 aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga 20211  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  20212 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta 20301  T
Q  200 gtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302 gtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 20401  T
Q  294 gtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20402 gtaccacatgcatataag 20419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 11232344 - 11232606
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  11232344 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgactgtatgta--atgaataagatgacatttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt 11232433  T
Q  143 acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttt 239  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232434 acgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttt 11232532  T
Q  240 a--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232533 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11232606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13569957 - 13569678
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13569957 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaatttttggat 13569858  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  13569857 gcatgtcgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgtatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 13569767  T
Q  221 tttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 307  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569766 tttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 13569678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 11239031 - 11239293
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  11239031 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgactgtatgta--atgaataagataacatttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt 11239120  T
Q  143 acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttt 239  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11239121 acgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccacacgtttt 11239219  T
Q  240 a--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239220 ataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11239293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1347548 - 1347291
Alignment:
Q  49 ctgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  1347548 ctgctgttatttaactaagtgcatgatgattgtatgta--atgaataagatgacatttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgat 1347459  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--gg 242  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1347458 gattacg-tgttttgttgttaagagttcatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttatagg 1347360  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347359 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1347291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18531329 - 18531027
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18531329 aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga 18531235  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  18531234 cgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta 18531145  T
Q  200 gtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531144 gttctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 18531045  T
Q  294 gtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18531044 gtaccacatgcatataag 18531027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20703085 - 20703298
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20703085 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 20703175  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20703176 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20703275  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20703276 gattggtaccacatgcatataag 20703298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13149124 - 13148932
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13149124 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 13149029  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149028 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 13148932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Original strand, 16907561 - 16907718
Alignment:
Q  79 tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatg 178  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16907561 tatatatattatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatg 16907660  T
Q  179 catagcatttcattgagctttgtcctcaccacg-attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16907661 catagcatttcattgagctttgtcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacg 16907718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32767686 - 32767473
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32767686 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 32767596  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32767595 agcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 32767496  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32767495 gattggtaccacatgcatataag 32767473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15728294 - 15728109
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15728294 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc 15728198  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15728197 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15728109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 382 - 531
Target Start/End: Original strand, 7519669 - 7519818
Alignment:
Q  382 agttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519669 agttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaa 7519768  T
Q  482 ttatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  7519769 ttatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 7519818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7536249 - 7535965
Alignment:
Q  23 tgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7536249 tgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattgg 7536152  T
Q  122 atgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---gg 217  Q
    |||| |  |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  7536151 atgcttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagttcatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattagg 7536062  T
Q  218 agctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7536061 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 7535965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18425448 - 18425284
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425448 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattatggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 18425349  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18425348 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 18425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18556942 - 18556756
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18556942 tgattaagatgttttgttgtttagcgtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 18556845  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18556844 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatt 18556756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18176115 - 18175902
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18176115 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 18176025  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18176024 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 18175925  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18175924 gattggtaccacatgcatataag 18175902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 44786578 - 44786783
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44786578 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 44786668  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44786669 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 44786768  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  44786769 ccacatgcatataag 44786783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 44793219 - 44793424
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44793219 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 44793309  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44793310 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 44793409  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  44793410 ccacatgcatataag 44793424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14216855 - 14216709
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14216855 ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 14216757  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14216756 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 14216709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14959215 - 14958952
Alignment:
Q  38 tgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatg 136  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14959215 tgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg 14959118  T
Q  137 ttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
     |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14959117 atgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacg 14959030  T
Q  236 ttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
     ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14959029 attattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14958952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 341
Target Start/End: Original strand, 16724766 - 16724958
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  16724766 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatacattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagccttgtcctccacaggttttcggagc 16724862  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 341  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724863 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 16724958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 341
Target Start/End: Original strand, 17701780 - 17701972
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  17701780 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatacattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagccttgtcctccacaggttttcggagc 17701876  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 341  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701877 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 17701972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 332 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20487323 - 20487133
Alignment:
Q  332 atttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctat 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20487323 atttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccat 20487224  T
Q  432 gtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||  |||||||||||    
T  20487223 gtgttgttaaagaagtacctatgaagatta---------tatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttatctatgatattgattat 20487133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11262387 - 11262117
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11262387 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 11262290  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11262289 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 11262202  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11262201 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 11262117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 18164768 - 18164981
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  18164768 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 18164858  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18164859 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 18164958  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18164959 gattggtaccacatgcatataag 18164981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18182787 - 18182574
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18182787 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttattcataagtgtccatgcatagcatctcattg 18182697  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18182696 agcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 18182597  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18182596 gattggtaccacatgcatataag 18182574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 14655520 - 14655725
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14655520 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 14655610  T
Q  202 cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655611 cctcaccacgattactaggagctttgtcctccgcacgttatataggagctttgtcctccgaacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 14655710  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||| ||||    
T  14655711 ccacatgcatttaag 14655725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11366200 - 11365996
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      || ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11366200 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt------ttgtgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 11366107  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366106 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 11366007  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  11366006 acatgcatata 11365996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12692554 - 12692284
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  12692554 tgtgacttgactatgctgctgctgttttttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtctagctccaaattattggatgcatat 12692457  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||         ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12692456 tgatatgatgattacgatgatt---------tgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagctttgtcct 12692369  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692368 ctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12692284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Original strand, 23519974 - 23520282
Alignment:
Q  2 attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt--gca-tgatgtctatatatatgatgaaa-tga 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||| |||  ||| || | | |||  |||| |||||| |||    
T  23519974 attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatactgctgctgttatttaactgagtatgcaatgttatatatgaatataatgaaaatga 23520073  T
Q  98 tgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagct 197  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||           ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23520074 tgacgtttagcttcaagttattgaatgcaca---------tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 23520164  T
Q  198 ttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    | ||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23520165 tagtcctcaccacgttttattaggatctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgat 23520264  T
Q  292 tggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23520265 tggtaccacatgcatata 23520282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 60772 - 60985
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  60772 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 60862  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  60863 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 60962  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  60963 gattggtaccacatgcatataag 60985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12714530 - 12714405
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714530 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 12714431  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12714430 aagttgcattgtcgcatttgtcgagt 12714405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 40523456 - 40523669
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||| ||||| ||||||    
T  40523456 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcagagcatatcattg 40523546  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40523547 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 40523646  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40523647 gattggtaccacatgcatataag 40523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 15162925 - 15163127
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15162925 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 15163016  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15163017 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15163116  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  15163117 acatgcatata 15163127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 4318586 - 4318867
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318586 tgttatgtgacttgactatgatgctactgttatttaactaagtgcataatgtctatatgt--gaagaataagatgacgtttagctccaaattattggatg 4318683  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagc 220  Q
    |||  |||||||         ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||    
T  4318684 catattgatatg---------atgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagc 4318773  T
Q  221 tttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318774 tttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4318867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8917375 - 8917212
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8917375 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagcttagtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 8917279  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917278 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 8917212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 9511107 - 9511319
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  9511107 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 9511196  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9511197 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 9511296  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9511297 gattggtaccacatgcatataag 9511319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 12703504 - 12703716
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12703504 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 12703593  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12703594 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 12703693  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12703694 gattggtaccacatgcatataag 12703716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 16407399 - 16407603
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16407399 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttattcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 16407490  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407491 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 16407590  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  16407591 acatgcatataag 16407603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49051381 - 49051169
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  49051381 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 49051292  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49051291 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 49051192  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  49051191 gattggtaccacatgcatataag 49051169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15022083 - 15021905
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15022083 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 15021984  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15021983 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15021905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 11554909 - 11555180
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  11554909 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattgttggatgcatat 11555006  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    |||||||  ||||||||||         |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11555007 tgatatgaagattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcagtagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 11555094  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555095 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11555180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26420058 - 26419788
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26420058 tgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 26419961  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || | |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26419960 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gcgtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 26419873  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    || |||| ||  |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26419872 ccacacgattattaggagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 26419788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21636 - 21458
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21636 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 21537  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 8202226 - 8202404
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8202226 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 8202325  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8202326 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8202404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8705951 - 8705782
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  8705951 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 8705852  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8705851 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 8705782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13461730 - 13461545
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| |||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13461730 tgattaaggtgatttgttgattagagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccttgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagc 13461634  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461633 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgttttgtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 13461545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14330753 - 14330584
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--g 241  Q
    |||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14330753 tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 14330654  T
Q  242 gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330653 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14330584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14337337 - 14337168
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--g 241  Q
    |||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14337337 tgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 14337238  T
Q  242 gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337237 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14337168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 15156274 - 15156476
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15156274 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 15156365  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||| || ||   | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156366 tcaccatgaataatagaagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15156465  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  15156466 acatgcatata 15156476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 11548313 - 11548584
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  11548313 tgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattgttggatgcatat 11548410  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    |||||||  ||||||||||         |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11548411 tgatatgaagattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcagtagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 11548498  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548499 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11548584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18301871 - 18301685
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18301871 attggtaccacatacatataagaggttttggttgcattgttgtatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt 18301772  T
Q  389 gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18301771 aatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacacgatgttcatga 18301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 18553682 - 18553851
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  18553682 atgattacgatgttttgttgttaagagtacatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 18553781  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18553782 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18553851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 217 - 352
Target Start/End: Original strand, 7519531 - 7519664
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519531 gagctttgtcctccgcacgat--aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 7519628  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgtt 352  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7519629 aagttgcattgtcgcatctgtcaagtcaaagtcgtt 7519664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13691094 - 13690892
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13691094 ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 13691003  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13691002 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 13690903  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  13690902 acatgcatata 13690892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 387
Target Start/End: Original strand, 14932954 - 14933155
Alignment:
Q  191 ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga-cg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  14932954 ttgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagag 14933050  T
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc-aaag-----tcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14933051 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaa 14933150  T
Q  383 gttgt 387  Q
    |||||    
T  14933151 gttgt 14933155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 387
Target Start/End: Original strand, 15356389 - 15356590
Alignment:
Q  191 ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga-cg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  15356389 ttgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagag 15356485  T
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc-aaag-----tcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15356486 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaa 15356585  T
Q  383 gttgt 387  Q
    |||||    
T  15356586 gttgt 15356590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 387
Target Start/End: Original strand, 15360503 - 15360704
Alignment:
Q  191 ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga-cg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  15360503 ttgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgagag 15360599  T
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc-aaag-----tcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15360600 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattttcgcatttgtcgagtctaaagatgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaa 15360699  T
Q  383 gttgt 387  Q
    |||||    
T  15360700 gttgt 15360704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6801157 - 6800990
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6801157 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacatgat--aggagctttgtcctccgcacgattaaagta 6801062  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6801061 tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatttaagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 6800990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13684463 - 13684261
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13684463 ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcacaagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 13684372  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13684371 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaaacatattaatacttatgatgacgattggtacc 13684272  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  13684271 acatgcatata 13684261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9593293 - 9593124
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||   ||||| ||||    
T  9593293 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctcccaacgattaaag 9593198  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9593197 tatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 9593124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 16457494 - 16457676
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  16457494 tgattaagatgttttgttgtta-gagcccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagc 16457588  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16457589 tttgacctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataattgtctaagttgcattgtcgcatt 16457676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 238 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16275396 - 16275304
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275396 ttaggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcg 16275304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16583204 - 16583031
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |   ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16583204 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctcaccacgatc--ggagctttgtcctccacacgattaaag 16583108  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16583107 tatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatgtaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 16583031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35151517 - 35151425
Alignment:
Q  242 gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151517 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 35151425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 238
Target Start/End: Original strand, 44408384 - 44408579
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44408384 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 44408481  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||         |||||||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  44408482 tgatat---------gatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccatga-taggagctttgtcct 44408569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Original strand, 20579 - 20681
Alignment:
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc 338  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579 taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgatgattggtaccaaatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc 20677  T
Q  339 gagt 342  Q
    ||||    
T  20678 gagt 20681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16907447 - 16907533
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907447 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat 16907533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 343
Target Start/End: Original strand, 15605449 - 15605603
Alignment:
Q  190 attgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  15605449 attgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatg 15605544  T
Q  287 acg-attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605545 acgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 15605603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8712552 - 8712453
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8712552 attaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 8712453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10869534 - 10869301
Alignment:
Q  2 attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat----atgatgaaa-tg 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||     |||| |||||||    || |||||| ||    
T  10869534 attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagtatgcaatgtttatatatgaatataatgaaaatg 10869435  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| |||||           ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10869434 atgacgttttgcttcaagttattgaatgcaca---------tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagc 10869344  T
Q  197 tttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    || ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  10869343 ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 10869301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10875614 - 10875381
Alignment:
Q  2 attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat----atgatgaaa-tg 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||     |||| |||||||    || |||||| ||    
T  10875614 attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagtatgcaatgtttatatatgaatataatgaaaatg 10875515  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| |||||           ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10875514 atgacgttttgcttcaagttattgaatgcaca---------tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagc 10875424  T
Q  197 tttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    || ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  10875423 ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 10875381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14148656 - 14148531
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||    
T  14148656 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctat--atatgatgaataagatg 14148559  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14148558 acgtttagctccaaattattggatgcat 14148531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14953254 - 14953061
Alignment:
Q  33 tgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatg 131  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14953254 tgacttgactatgctgcttctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 14953157  T
Q  132 atatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcc 230  Q
    ||||| |||||||||         |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14953156 atatgatgattacga---------tgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccatga-taggagctttgtcctcc 14953069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12318075 - 12317901
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||| | | || |||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  12318075 agagtccatgcattagcata-cattgagctttatcctcacaacgaattg-agttttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 12317980  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12317979 aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 12317901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 14152160 - 14152334
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||  ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  14152160 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccactatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 14152255  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14152256 aagtatattaatact-atgatgacaattggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgcattgtcgcatttgttgagtc 14152334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12714413 - 12714300
Alignment:
Q  409 ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgtt 508  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  12714413 ttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgct 12714323  T
Q  509 atgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  12714322 atgttgtttaagatattgattat 12714300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24274875 - 24274797
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24274875 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgaggaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 24274797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14953085 - 14953013
Alignment:
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14953085 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14953013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 235
Target Start/End: Original strand, 18585450 - 18585543
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  18585450 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacg 18585543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 44408555 - 44408627
Alignment:
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44408555 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 44408627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10869323 - 10869252
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869323 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 10869252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10875403 - 10875332
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875403 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 10875332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16585231 - 16585087
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  16585231 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct 16585132  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  16585131 acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16585087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 13635627 - 13635793
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  13635627 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaag 13635722  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||       | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635723 tatattaatac-tatgatgacgattg----tctaagtataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 13635793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Original strand, 18585521 - 18585592
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18585521 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 18585592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15380671 - 15380606
Alignment:
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380671 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15380606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16579332 - 16579147
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  16579332 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct 16579233  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    ||| | |||||||||  ||||| | || |||||||||| |||| ||||||    |  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  16579232 acccaggtgttgttatcgaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 16579147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Original strand, 2530548 - 2530631
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2530548 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctc 2530631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 333
Target Start/End: Original strand, 9751984 - 9752079
Alignment:
Q  241 ggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9751984 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 9752079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16275461 - 16275374
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16275461 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctctgcacg 16275374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 395
Target Start/End: Original strand, 15605866 - 15605934
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaat 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  15605866 gtcgcatttgtcgagtcaaattcgttgttgatgaattatcatccatgagtttttgagttgttgatgaat 15605934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Original strand, 16586330 - 16586515
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  16586330 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct 16586429  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    ||| | |||||||||  ||||| |  | |||||||||| |||| ||||||    |  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  16586430 acccaggtgttgttatcgaagtgctgatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 16586515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 13918936 - 13919002
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13918936 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg 13919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14257996 - 14257922
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  14257996 cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgaggaattgtcatccatgagttgt 14257922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20585279 - 20585201
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  20585279 ttgtcgagtcaaagtcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 20585201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14257951 - 14257822
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacctatgtgttgttaa 441  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14257951 gttgttgaggaattgtcatccatgagttgttaagttgttgacgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaa 14257852  T
Q  442 agaagtacctacgaagattatacgatgttt 471  Q
     ||||| | || |||||||||| |||||||    
T  14257851 tgaagtgcttatgaagattatatgatgttt 14257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 311
Target Start/End: Original strand, 20871301 - 20871343
Alignment:
Q  269 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20871301 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20871343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 347
Target Start/End: Original strand, 811467 - 811524
Alignment:
Q  291 ttggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  811467 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 811524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8719367 - 8719315
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8719367 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagctt 8719315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35151585 - 35151499
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35151585 gattaaggtgttttattgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattacgagctttgtcctccgcacg 35151499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 15144356 - 15144415
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15144356 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 15144415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32300810 - 32300747
Alignment:
Q  407 agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  32300810 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatacgatgtt 32300747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44013968 - 44013909
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44013968 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 44013909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 12466473 - 12466551
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||    
T  12466473 ttgtcgaatcaaagtcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgtggatgagttgtcatacatgagttgt 12466551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 15082317 - 15082370
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta 381  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15082317 gtcgcacttgtcgagtcaaagtcgttg-tgatgaattatcatccatgagttgtta 15082370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 15755278 - 15755336
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15755278 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 15755336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 16461500 - 16461553
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  16461500 ttgttgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 16461553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18005435 - 18005376
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  18005435 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcaagtcaaag 18005376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 11996354 - 11996408
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11996354 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 11996408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 16402762 - 16402816
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16402762 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 16402816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 27848113 - 27848167
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27848113 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 27848167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40443248 - 40443194
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40443248 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 40443194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8706081 - 8706020
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8706081 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 8706020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 14183819 - 14183872
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  14183819 ttgtcgagtcaaagtcgtttttgattagttgtcatccatgagttgttaagttgt 14183872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15580596 - 15580552
Alignment:
Q  190 attgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15580596 attgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg 15580552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 18553552 - 18553613
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18553552 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 18553613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 18585320 - 18585381
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18585320 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 18585381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24274826 - 24274789
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24274826 gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 24274789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26292063 - 26292018
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26292063 gagctttgtcctcaccacgttttaggagctttgtcctccgcacgat 26292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32300858 - 32300805
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  32300858 ttgttgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgt 32300805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 67530 - 67470
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgca-tttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  67530 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcattttgtcgagtcaaag 67470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15580620 - 15580523
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  15580620 cattgagctttgtcctcaccacgaat-tgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaata-ttatgat 15580525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 7519527 - 7519572
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7519527 cattgagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctccgcacg 7519572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10588831 - 10588777
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10588831 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 10588777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34200578 - 34200524
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  34200578 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatatttgcatttgtcgagtc 34200524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21767 - 21702
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21767 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 21702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 8202095 - 8202156
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8202095 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 8202156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9703058 - 9703013
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  9703058 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 9703013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15022214 - 15022149
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  15022214 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 15022149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11858374 - 11858330
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  11858374 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 11858330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12186812 - 12186768
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  12186812 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 12186768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 12322062 - 12322116
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12322062 attggtaccacatgcataagag-gtctaagtttcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 12322116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14429680 - 14429625
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14429680 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 14429625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 15605717 - 15605853
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgat 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  |||| ||  |||| |||||||||  || ||||   |||||||||||||||| |||||    
T  15605717 cattgagctttgttctcaccacgatttg-agttttgtcctcaccacgatt--ggag-tttgtcctcctcatgatgcttaaagtatattaatact-atgat 15605811  T
Q  286 gacgatt-ggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcat 325  Q
    || | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15605812 gaagttttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcat 15605853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 17138384 - 17138428
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  17138384 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 17138428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 18155163 - 18155207
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18155163 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 18155207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24054259 - 24054215
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  24054259 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 24054215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 39268117 - 39268205
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg-----aaagtatattaatact 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||||    
T  39268117 gagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctcaccacgattt--gagctttgtcctcaccacgatgccttaaaagtatattaatact 39268205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 15237081 - 15237612
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15237081 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 15237180  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237181 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 15237280  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237281 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15237380  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15237381 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttg-tgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 15237479  T
Q  399 catctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15237480 catctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatattgatta 15237579  T
Q  499 agatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
     |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15237580 tgatattgttatgttgtttaacatattggttat 15237612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20295707 - 20295235
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20295707 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 20295608  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295607 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 20295508  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295507 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcctcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 20295408  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20295407 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 20295308  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295307 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 20295235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 19472966 - 19473353
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472966 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 19473065  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473066 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 19473165  T
Q  201 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473166 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 19473265  T
Q  301 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||    
T  19473266 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 19473353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10752954 - 10752561
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10752954 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgg 10752855  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10752854 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaaatatattaatacttatgatgacgattgg 10752755  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10752754 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa 10752655  T
Q  395 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat 490  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752654 ttatcatc--tgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat 10752561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11230792 - 11230449
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11230792 ttcattgagctttgtcctgaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 11230694  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11230693 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 11230594  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230593 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 11230494  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  11230493 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 11230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11220394 - 11220051
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11220394 ttcattgagctttgtcctgaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 11220296  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11220295 acgattggtaccacatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 11220196  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220195 tcgatgaattatcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtagctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 11220096  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  11220095 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 11220051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11224980 - 11224637
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11224980 ttcattgagctttgtcctgaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 11224882  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11224881 acaattggtaccacatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgatttgttaagttg 11224782  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11224781 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 11224682  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  11224681 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 11224637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11228803 - 11228460
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11228803 ttcattgagctttgtcctgaccacaattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 11228705  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11228704 acgattggtaccacatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 11228605  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228604 tcgatgaattatcatctatgagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctaggaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 11228505  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  11228504 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 11228460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 187 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 18355888 - 18355546
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355888 ttcattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 18355790  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18355789 aagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcgaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 18355690  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18355689 ttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattata 18355590  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
    | | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  18355589 taaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 18355546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 40724029 - 40724385
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga 264  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40724029 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcttcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttagaagctttgtcctccgcacgatga 40724127  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaatta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40724128 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatctgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaatta 40724227  T
Q  365 tcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac 464  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724228 tcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac 40724327  T
Q  465 gatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40724328 ---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 40724385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 187 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11226813 - 11226553
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11226813 ttcattgagctttgtcctgaccacgattaagagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 11226715  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11226714 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaagatcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 11226615  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11226614 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagta 11226553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 22325945 - 22326253
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22325945 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgccgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatgatgaaatgatga 22326044  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  22326045 cgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 22326134  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326135 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaagagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 22326234  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22326235 ggtaccacatgcatataag 22326253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22352984 - 22352677
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| |||||||||||||    
T  22352984 aattaatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatattgt--attcatacgatgaaatgatga 22352887  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22352886 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttag 22352796  T
Q  201 tcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    || |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352795 tcttcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 22352696  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22352695 ggtaccacatgcatataag 22352677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22343584 - 22343277
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| |||||||||||||    
T  22343584 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctattgctgttatttaactaagtgcatattgt--attcatacgatgaaatgatga 22343487  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22343486 cgtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttag 22343396  T
Q  201 tcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22343395 tcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgatgatt 22343296  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22343295 ggtaccacatgcatataag 22343277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19775009 - 19774726
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19775009 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 19774910  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||    
T  19774909 gcatgatgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagc 19774819  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774818 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19774726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 369
Target Start/End: Original strand, 20911375 - 20911550
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911375 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 20911473  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911474 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc 20911550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19768413 - 19768130
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19768413 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 19768314  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||    
T  19768313 gcatgatgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctccgcacgattattaggagc 19768223  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768222 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19768130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 29471453 - 29471667
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29471453 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga--------attacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 29471544  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29471545 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 29471644  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29471645 gattggtaccacatgcatataag 29471667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 15441974 - 15442280
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  15441974 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 15442071  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||| |||  |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15442072 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacagtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 15442161  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442162 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 15442261  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15442262 ggtaccacatgcatataag 15442280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33409189 - 33409005
Alignment:
Q  156 tgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33409189 tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagttttgtcctc 33409093  T
Q  255 tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33409092 cgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctgagttgcattgtcgcatttgtcgagt 33409005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 21885325 - 21885518
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21885325 tgattaaggtggtttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 21885421  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21885422 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 21885518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 29478048 - 29478262
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29478048 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga--------attacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattg 29478139  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29478140 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 29478239  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29478240 gattggtaccacatgcatataag 29478262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24020328 - 24020067
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24020328 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtactt-tatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 24020230  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    ||||||||         ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  24020229 cgatgatt---------tgttcataagaatccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtactccgtacgattta 24020139  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 310  Q
      |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24020138 taggagctttgtcctccgcacgattaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 24020067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22139700 - 22139487
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22139700 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtctatgcatagcatatcattg 22139610  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22139609 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22139510  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22139509 gattggtaccacatgcatataag 22139487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25406435 - 25406222
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25406435 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 25406345  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25406344 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 25406245  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25406244 gattggtaccacatgcatataag 25406222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26172434 - 26172241
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26172434 tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgtattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 26172338  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26172337 tctgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 26172241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 14359837 - 14360143
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  14359837 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 14359934  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14359935 acgtttagctccaaactattggatgcatattgatatg---------atgattacggtggtttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 14360024  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttag---gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14360025 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattatgagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 14360124  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14360125 ggtaccacatgcatataag 14360143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17284078 - 17283865
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17284078 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgtatagcatatcattg 17283988  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17283987 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgatgac 17283888  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17283887 gattggtaccacatgcatataag 17283865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22133008 - 22132795
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22133008 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatattgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 22132918  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22132917 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22132818  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22132817 gattggtaccacatgcatataag 22132795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22588106 - 22587893
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22588106 atgatgaagtttatctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 22588016  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22588015 agcttagtcctcaccatgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22587916  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22587915 gattggtaccacatgcatataag 22587893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 17730543 - 17730728
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17730543 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc 17730639  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730640 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 17730728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 22062985 - 22063190
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22062985 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 22063075  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22063076 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 22063175  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  22063176 ccacatgcatataag 22063190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24554593 - 24554320
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24554593 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 24554496  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24554495 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagctttgtcct 24554408  T
Q  229 ccgcacg-----ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||     ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24554407 ccgcacgattatttttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24554320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 25229542 - 25229727
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25229542 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcactatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc 25229638  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229639 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 25229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 25293698 - 25293883
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25293698 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcactatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc 25293794  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293795 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 25293883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16674113 - 16673930
Alignment:
Q  156 tgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16674113 tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctctgcacgttt-aggagctttgtcctc 16674018  T
Q  255 tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674017 cgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatacatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 16673930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19991883 - 19991658
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19991883 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 19991793  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991792 tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 19991693  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  19991692 acatgcatataagagtctaag-agcattgtcgcatt 19991658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 21295310 - 21295580
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21295310 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 21295407  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21295408 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 21295495  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295496 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 169 - 338
Target Start/End: Original strand, 21340924 - 21341091
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21340924 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcac-ttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaag 21341020  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21341021 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattttcgcatttgtc 21341091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27516754 - 27516549
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27516754 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 27516664  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27516663 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggta 27516564  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  27516563 ccacatgcatataag 27516549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27523391 - 27523186
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27523391 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 27523301  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27523300 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggta 27523201  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  27523200 ccacatgcatataag 27523186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37544042 - 37543837
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37544042 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 37543952  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543951 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 37543852  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  37543851 ccacatgcatataag 37543837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40707124 - 40706919
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40707124 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 40707034  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707033 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 40706934  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  40706933 ccacatgcatataag 40706919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40713766 - 40713561
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40713766 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 40713676  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40713675 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 40713576  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  40713575 ccacatgcatataag 40713561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20775843 - 20775664
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  20775843 tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca 20775744  T
Q  234 cg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20775743 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20775664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 22328268 - 22328471
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22328268 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 22328358  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328359 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 22328458  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  22328459 acatgcatataag 22328471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 37286886 - 37287089
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37286886 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 37286976  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286977 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 37287076  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  37287077 acatgcatataag 37287089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 37293589 - 37293792
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37293589 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 37293679  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293680 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 37293779  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  37293780 acatgcatataag 37293792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4036167 - 4036003
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4036167 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaag 4036070  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036069 tatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 4036003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 41098317 - 41098530
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  41098317 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 41098407  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41098408 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 41098507  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41098508 gattggtaccacatgcatataag 41098530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41769253 - 41769040
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  41769253 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 41769163  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41769162 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 41769063  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41769062 gattggtaccacatgcatataag 41769040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41775827 - 41775614
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  41775827 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 41775737  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41775736 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 41775637  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41775636 gattggtaccacatgcatataag 41775614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 24767898 - 24768046
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767898 gttgttgatgaattatcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 24767997  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  24767998 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 24768046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25535047 - 25534777
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  25535047 tgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatat 25534950  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25534949 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 25534862  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25534861 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25534777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22264955 - 22264742
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22264955 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22264865  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22264864 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22264765  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22264764 gattggtaccacatgcatataag 22264742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27663884 - 27664097
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27663884 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27663974  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27663975 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtccttcgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27664074  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27664075 gattggtaccacatgcatataag 27664097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 22410749 - 22410917
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta-- 240  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22410749 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata 22410848  T
Q  241 ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410849 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22410917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23249948 - 23249736
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23249948 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23249859  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23249858 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23249759  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23249758 gattggtaccacatgcatataag 23249736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 41294530 - 41294742
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||          ||| |   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41294530 atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatg----------tttttccataagagtccatgcatagcatctcattg 41294619  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41294620 agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgac 41294719  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41294720 gattggtaccacatgcatataag 41294742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16354799 - 16354621
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16354799 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 16354700  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354699 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16354621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16361458 - 16361280
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16361458 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 16361359  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361358 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16361280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 34294647 - 34294860
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  34294647 atgatgaagtttagctccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 34294737  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34294738 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 34294837  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34294838 gattggtaccacatgcatataag 34294860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34564792 - 34564614
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34564792 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 34564693  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34564692 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 34564614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34571447 - 34571269
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34571447 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 34571348  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571347 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 34571269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 15001784 - 15001986
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15001784 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 15001875  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001876 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagcttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15001975  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  15001976 acatgcatata 15001986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 18038772 - 18038974
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18038772 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 18038863  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttttag--gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038864 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttatatgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 18038963  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  18038964 acatgcatata 18038974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 22341707 - 22341910
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  22341707 ttagctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgcccatgcatagcatctcattgagcatagtcc 22341797  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341798 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 22341897  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  22341898 acatgcatataag 22341910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 23337308 - 23337614
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   || ||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  23337308 aattgatataatgatatcatcctattgttgtgttacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 23337405  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  23337406 acgtttggctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacagtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctc 23337495  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23337496 agtcctcaccgcgattattaggagctttgtactccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgttt 23337595  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23337596 ggtaccacatgcatataag 23337614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33725868 - 33725657
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  33725868 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg 33725778  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33725777 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 33725678  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33725677 gattggtaccacatgcatata 33725657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 17707025 - 17707237
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  17707025 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17707114  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17707115 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 17707214  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  17707215 gattggtaccacttgcatataag 17707237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Original strand, 22258626 - 22258800
Alignment:
Q  141 ttacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||     
T  22258626 ttacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacga 22258725  T
Q  237 tt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258726 ttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22258800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27608749 - 27608537
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27608749 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27608660  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27608659 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27608560  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27608559 gattggtaccacatgcatataag 27608537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27670524 - 27670736
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27670524 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27670613  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27670614 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27670713  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27670714 gattggtaccacatgcatataag 27670736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 21667956 - 21668125
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  21667956 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 21668055  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21668056 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21668125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23584149 - 23583936
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23584149 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23584059  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23584058 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccacacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23583959  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23583958 gattggtaccacatgcatataag 23583936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 24472342 - 24472554
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  24472342 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 24472432  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttttag--gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24472433 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctt-gtcctccgcacgttttataagagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 24472531  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24472532 gattggtaccacatgcatataag 24472554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25106738 - 25106560
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25106738 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 25106639  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25106638 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25106560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25165831 - 25165653
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25165831 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 25165732  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25165731 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25165653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27615355 - 27615143
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27615355 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27615266  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27615265 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27615166  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27615165 gattggtaccacatgcatataag 27615143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Original strand, 14995141 - 14995340
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14995141 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 14995232  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995233 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggaccttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14995332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29316374 - 29316205
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  29316374 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacaattatt 29316275  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316274 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 29316205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 1692541 - 1692743
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1692541 ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatcttattgagcttagtcc 1692632  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692633 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 1692732  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  1692733 acatgcatata 1692743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42805389 - 42805199
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  42805389 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagc 42805295  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805294 tttgtcctccacacgattaaagtatattaataca-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 42805199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 20911531 - 20911679
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20911531 gttgttgatgaattatcatctattagttgacgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaaa 20911630  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||| ||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||    
T  20911631 tatataatgttgactaagatatcgctatgttgtttaagatattgattat 20911679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 27687433 - 27687635
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27687433 ttagctccaatttaatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 27687524  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687525 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcatccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 27687624  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  27687625 acatgcatata 27687635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18774151 - 18773982
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  18774151 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtccttcacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 18774056  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774055 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 18773982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18783994 - 18783825
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  18783994 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 18783899  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783898 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 18783825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20232497 - 20232330
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  20232497 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta 20232402  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232401 tattaatact-atgatgacgattggtatcacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 20232330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 26742883 - 26743065
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  26742883 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagc 26742977  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26742978 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 26743065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 24767740 - 24767917
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  24767740 cattgatctttgtcctcaccacgatc-ggagccttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa 24767835  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767836 gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgatgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc 24767917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 26666290 - 26666457
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  26666290 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttatcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta 26666385  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666386 tattaatact-atgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 26666457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 26937887 - 26938054
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  26937887 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttatcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta 26937982  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26937983 tattaatact-atgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 26938054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 19473315 - 19473454
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  19473315 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaat 19473405  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19473406 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 19473454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 24533207 - 24533374
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||    
T  24533207 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgttt-ggagctttgtcctccatacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaaata 24533302  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24533303 tattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatttgtcgagt 24533374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 383 - 475
Target Start/End: Original strand, 22108009 - 22108101
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22108009 gttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22108101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23609913 - 23609727
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23609913 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23609823  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    ||||| ||||||||||||| ||                      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609822 agcttagtcctcaccacgaata----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 23609745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23841309 - 23841123
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23841309 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23841219  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    ||||| ||||||||||||| ||                      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841218 agcttagtcctcaccacgaata----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 23841141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 23535769 - 23535894
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgt 314  Q
    |||||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  23535769 gagctttgtcctcaccacgatt--ggagcttcgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatcacgattgataccacatgcatataagggtgt 23535865  T
Q  315 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535866 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 23535894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Original strand, 27680923 - 27680993
Alignment:
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680923 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27680993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Original strand, 20911327 - 20911417
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20911327 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 20911417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 388
Target Start/End: Original strand, 22107986 - 22108047
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22107986 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtc 22108047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 387
Target Start/End: Original strand, 33896074 - 33896170
Alignment:
Q  291 ttggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||    
T  33896074 ttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatt-gttgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaaattgt 33896170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17410309 - 17410245
Alignment:
Q  280 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410309 tatgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 17410245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21565331 - 21565272
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21565331 gattggtaccacaagcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 21565272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 22959862 - 22959921
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  22959862 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcacagtcgcatttctcgagtcaaag 22959921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 19661161 - 19661211
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcg 339  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19661161 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcg 19661211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20775974 - 20775909
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||    
T  20775974 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactgagt 20775909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 22258492 - 22258553
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22258492 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgttgttatttaact 22258553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 22410619 - 22410680
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22410619 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 22410680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23201153 - 23201097
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23201153 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 23201097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23511894 - 23511838
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23511894 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 23511838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21873048 - 21873004
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21873048 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 21873004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21877328 - 21877284
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21877328 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 21877284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21887083 - 21887039
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21887083 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 21887039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9077751 - 9077693
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  9077751 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcaca-ttgtcgagtcaaag 9077693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19668685 - 19668627
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19668685 gattggtacca-atgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 19668627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 23535745 - 23535810
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  23535745 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-ggagcttcgtcctccccacg 23535810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1096265 - 1096211
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1096265 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagt 1096211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13025106 - 13025052
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13025106 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttggatagttgcatttgtcgagtc 13025052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13095290 - 13095236
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13095290 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttggatagttgcatttgtcgagtc 13095236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 21293296 - 21293350
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  21293296 attggtaccacatgcatataagaggtctaagtagcatagttgcatttgtcgagtc 21293350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24493364 - 24493310
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24493364 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 24493310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25421326 - 25421272
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  25421326 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 25421272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37723693 - 37723643
Alignment:
Q  294 gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37723693 gtaccacatgcatataagatgtctaagctgcatattcgcatttgtcgagtc 37723643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16354930 - 16354865
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  16354930 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 16354865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16361589 - 16361524
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  16361589 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 16361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21366985 - 21367041
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21366985 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21367041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25106869 - 25106804
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  25106869 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 25106804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25165962 - 25165897
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  25165962 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 25165897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29316504 - 29316443
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||| || ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29316504 ttgatatattgatatatccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 29316443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 34564923 - 34564858
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  34564923 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 34564858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 34571578 - 34571513
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  34571578 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 34571513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 123416 - 123460
Alignment:
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  123416 gacgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14078943 - 14078899
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14078943 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 14078899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23458396 - 23458341
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23458396 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 23458341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23462657 - 23462602
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23462657 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 23462602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21407215 - 21406684
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21407215 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 21407116  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407115 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 21407016  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407015 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 21406917  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21406916 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagttaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 21406817  T
Q  399 catctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta 498  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21406816 catctatgagctgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgacta 21406717  T
Q  499 agatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  21406716 agaggttgctatgttgtttaacatgttgattat 21406684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1010583 - 1010059
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1010583 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 1010484  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010483 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 1010384  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010383 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 1010284  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1010283 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 1010184  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  1010183 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 1010093  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  1010092 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 1010059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 52639401 - 52638930
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  52639401 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 52639302  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639301 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 52639202  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639201 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 52639102  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52639101 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 52639002  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 469  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639001 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 52638930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Original strand, 16375705 - 16376176
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16375705 aattgatatattgatatctctatattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatattatgaaatgatga 16375804  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagc-atttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16375805 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagctatttcattgagcttt 16375904  T
Q  200 gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375905 gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 16376004  T
Q  300 catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16376005 catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatc 16376104  T
Q  400 atctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376105 atccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 16376176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Original strand, 20229447 - 20229785
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20229447 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatatcaatacttatgatgacgatt 20229546  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20229547 ggtaccacatgcatataaatgtttaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 20229646  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20229647 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccgcctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatga 20229746  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20229747 tgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 20229785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Original strand, 39244359 - 39244696
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244359 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgat 39244457  T
Q  292 tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39244458 tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgat 39244557  T
Q  392 gaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatg 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244558 gaattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatg 39244657  T
Q  492 ttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  39244658 ctgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 39244696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Original strand, 39247914 - 39248251
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247914 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgat 39248012  T
Q  292 tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39248013 tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgat 39248112  T
Q  392 gaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatg 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248113 gaattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatg 39248212  T
Q  492 ttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  39248213 ctgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 39248251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 1925571 - 1925923
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1925571 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 1925668  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1925669 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 1925768  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  1925769 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- 1925865  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  1925866 ------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 1925923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 20924585 - 20924937
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20924585 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 20924682  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20924683 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 20924782  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20924783 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- 20924879  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  20924880 ------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 20924937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Original strand, 41388459 - 41388793
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388459 gagctttgtcatccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 41388558  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41388559 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 41388658  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||      
T  41388659 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatggtgtgaattatatgat-- 41388756  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
      | ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41388757 --attattatgttgctatgttgtttaacatattgattat 41388793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 33797183 - 33796848
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33797183 gagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagatt 33797086  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  33797085 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcaattgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgata 33796986  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  33796985 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacccatgtgttattaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagt 33796886  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  33796885 tgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 33796848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 50887771 - 50888080
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  50887771 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 50887870  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  50887871 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 50887960  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50887961 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 50888060  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50888061 tggtaccacatgcatataag 50888080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 33386264 - 33386547
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33386264 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 33386363  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  33386364 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 33386454  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386455 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 33386547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 33392909 - 33393192
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33392909 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 33393008  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  33393009 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 33393099  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393100 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 33393192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 262
Target Start/End: Original strand, 39244237 - 39244404
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244237 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39244336  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39244337 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgat 39244404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 262
Target Start/End: Original strand, 39247792 - 39247959
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247792 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 39247891  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39247892 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgat 39247959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 21807241 - 21807524
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21807241 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggat 21807340  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  21807341 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 21807431  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807432 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21807524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21835431 - 21835148
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21835431 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggat 21835332  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  21835331 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 21835241  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835240 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21835148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 327 - 499
Target Start/End: Original strand, 41781872 - 41782044
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41781872 gtcgcatttgtcgagtcaaagctgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttcta 41781971  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781972 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 41782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19104839 - 19104533
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||||    
T  19104839 aattgatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatacata--atgaataagatg 19104742  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19104741 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 19104652  T
Q  199 tgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104651 agtcctcaccacggttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 19104552  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19104551 ggtaccacatgcatataag 19104533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19111496 - 19111190
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    ||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||||    
T  19111496 aattgatataacgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatacata--atgaataagatg 19111399  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19111398 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 19111309  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111308 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 19111209  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19111208 ggtaccacatgcatataag 19111190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 41388337 - 41388501
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388337 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 41388436  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41388437 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcatccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 41388501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8305223 - 8304923
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  || ||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8305223 aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactgtgct---gctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga 8305132  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  8305131 cgtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta 8305042  T
Q  200 gtcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305041 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 8304942  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8304941 ggtaccacatgcatataag 8304923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 20525234 - 20525540
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  20525234 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 20525331  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20525332 aagtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattattgtgttttgttgttaatagtccatgcattagcatt-cattgagctt 20525421  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525422 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 20525521  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20525522 ggtaccacatgcatataag 20525540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 20229325 - 20229489
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20229325 tgatgacatttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcttagcatttcattga 20229424  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20229425 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 20229489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23763270 - 23763000
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23763270 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 23763173  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23763172 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 23763085  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23763084 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23763000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21828724 - 21828511
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         | |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21828724 atgatgaattttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gcgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattg 21828634  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21828633 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 21828534  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21828533 gattggtaccacatgcatataag 21828511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 16345878 - 16346083
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16345878 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 16345968  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16345969 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 16346068  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  16346069 ccacatgcatataag 16346083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20138052 - 20137861
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20138052 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttg-cctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagc 20137958  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137957 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 20137861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 41348955 - 41349160
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41348955 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 41349045  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349046 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 41349145  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  41349146 ccacatgcatataag 41349160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 51328782 - 51328987
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51328782 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 51328872  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328873 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 51328972  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  51328973 ccacatgcatataag 51328987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 51335416 - 51335621
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  51335416 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 51335506  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335507 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 51335606  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  51335607 ccacatgcatataag 51335621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Original strand, 41356416 - 41356597
Alignment:
Q  134 atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  41356416 atgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc 41356514  T
Q  231 gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41356515 gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41356597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 16352526 - 16352732
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16352526 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 16352616  T
Q  202 cctcaccacga----ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 295  Q
    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352617 cctcaccacgaaaattaaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 16352716  T
Q  296 accacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  16352717 accacatgcatataag 16352732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 18600210 - 18600414
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18600210 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 18600301  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600302 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 18600401  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  18600402 acatgcatataag 18600414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Original strand, 22131454 - 22131602
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22131454 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagctgtcatcta 22131553  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22131554 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 22131602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 41478682 - 41478884
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41478682 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 41478773  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41478774 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 41478873  T
Q  299 acatgcatata 309  Q
    |||||||||||    
T  41478874 acatgcatata 41478884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20216023 - 20216235
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20216023 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20216112  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20216113 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20216212  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20216213 gattggtaccacatgcatataag 20216235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43078394 - 43078216
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  43078394 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 43078295  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078294 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 43078216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 44844979 - 44845192
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||| |||||||||| ||||||    
T  44844979 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccgtgcatagcatatcattg 44845069  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44845070 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttacaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 44845169  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44845170 gattggtaccacatgcatataag 44845192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 46157472 - 46157650
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  46157472 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 46157571  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46157572 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 46157650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47659224 - 47659011
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  47659224 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg 47659134  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47659133 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 47659034  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  47659033 gattggtaccacatgcatataag 47659011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 18626295 - 18626603
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat----atgatgaaa-tga 97  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||     |||| |||||||    || |||||| |||    
T  18626295 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagtatgcaatgtttatatatgaatataatgaaaatga 18626394  T
Q  98 tgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagct 197  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||||           |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18626395 tgacgttttgcttcaagttattgaatgcaca---------tgattatgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagct 18626485  T
Q  198 ttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18626486 tagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcatgattaaagtatatttatacttatgatgacgat 18626585  T
Q  292 tggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18626586 tggtaccacatgcatata 18626603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 48603013 - 48602865
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48603013 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagctgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtcttcta 48602914  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48602913 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 48602865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 27898809 - 27898978
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27898809 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 27898908  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898909 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27898978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 43063426 - 43063595
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  43063426 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 43063525  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43063526 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 43063595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 44756061 - 44755892
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  44756061 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 44755962  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44755961 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 44755892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49334528 - 49334359
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  49334528 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 49334429  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49334428 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 49334359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 149 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33385023 - 33384857
Alignment:
Q  149 attacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  33385023 attacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 33384924  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33384923 agctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33384857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19211815 - 19211646
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19211815 agagtccatgcattagcatt-cattgagctatgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 19211720  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19211719 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 19211646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46975392 - 46975268
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975392 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattcatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 46975294  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  46975293 aagttgcattgtcgcatttgtcgagt 46975268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12646816 - 12646649
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  12646816 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttttcctccacacgattaaagta 12646721  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12646720 tattaatact-atgatgacgattggaaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 12646649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18882272 - 18882169
Alignment:
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18882272 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtgtattaatacttttgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc 18882173  T
Q  339 gagt 342  Q
    ||||    
T  18882172 gagt 18882169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21172951 - 21172777
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  21172951 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 21172856  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172855 aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 21172777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21313067 - 21312893
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  21313067 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 21312972  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21312971 aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 21312893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 36819467 - 36819638
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  36819467 agagtccatgcattagcata-cattgaactttgtcctcaccacaatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaag 36819562  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819563 tatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 36819638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23967483 - 23967335
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacct 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||         |||||||||||||| |    
T  23967483 cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgctgaattgtcatccatgagttgttaagtagttgagttgtcttctacat 23967384  T
Q  430 atgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23967383 atgtgttgttaatgaagtacttatgaagattatacgatgtttatgatgt 23967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21437853 - 21437734
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21437853 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaaatgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 21437756  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgatt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  21437755 tgatatgatgattacgatgatt 21437734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 16080623 - 16080746
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata--agtgt 314  Q
    |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16080623 gagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctcc-cacgat-aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgt 16080717  T
Q  315 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16080718 ctaagttgcattgttgcatttgtcgagtc 16080746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42911894 - 42911750
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  42911894 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttct 42911795  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    | | | |||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  42911794 atccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 42911750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 14238695 - 14238777
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattat----catccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14238695 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatatatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 14238777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46975437 - 46975350
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975437 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 46975350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21844237 - 21844142
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21844237 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat---------tacggcgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 21844147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21844140 - 21844085
Alignment:
Q  256 gcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844140 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21844085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33797231 - 33797142
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  33797231 agagtccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctccgcacg 33797142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 48520018 - 48519946
Alignment:
Q  340 agtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  48520018 agtcaaagttgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 48519946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20248071 - 20248012
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20248071 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 20248012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33680796 - 33680737
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33680796 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 33680737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19675596 - 19675543
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  19675596 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 19675543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21161564 - 21161486
Alignment:
Q  266 agtatattaatacttatgatgacgatt-ggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21161564 agtatattaatact-attatgatgatttggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc 21161486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21753837 - 21753778
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21753837 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtggagtcaaag 21753778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 22922200 - 22922259
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22922200 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgaatcaaag 22922259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 52928302 - 52928361
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52928302 gattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 52928361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20241672 - 20241619
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  20241672 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcgtccatgagttgttaagttgt 20241619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34509577 - 34509519
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34509577 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcaca-ttgtcgagtcaaag 34509519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 38801714 - 38801768
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38801714 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 38801768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 14238748 - 14238785
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14238748 gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 14238785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Original strand, 16080619 - 16080659
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16080619 cattgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctcc 16080659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 18182438 - 18182494
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18182438 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgttgca-ttgtcgagtcaaa 18182494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18882337 - 18882251
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18882337 tgattaagatgttttgttatta-gagtccatgcattagcatt-cattgagtcttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacg 18882251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 27898679 - 27898740
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27898679 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 27898740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 43063296 - 43063357
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43063296 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 43063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 44756191 - 44756130
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44756191 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 44756130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 49334658 - 49334597
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49334658 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 49334597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 348
Target Start/End: Original strand, 20847461 - 20847519
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20847461 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgta-ttgtcgagtcaaagt 20847519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48519975 - 48519847
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaa 441  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  48519975 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaggttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaa 48519876  T
Q  442 agaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
     ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  48519875 tgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 48519847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20134977 - 20134923
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  20134977 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 20134923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 24783287 - 24783332
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24783287 cattgagctttgttctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg 24783332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 27251055 - 27251109
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27251055 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 27251109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20241624 - 20241555
Alignment:
Q  407 agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgat 476  Q
    |||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||| | || || ||||||| ||||||||||||    
T  20241624 agttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaggattatatgatgtttatgat 20241555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21788367 - 21788423
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  21788367 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtctca-tagtcgagtcaaa 21788423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43078525 - 43078460
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  43078525 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 43078460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6151642 - 6151598
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  6151642 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 6151598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 20091796 - 20091840
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  20091796 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 20091840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21022374 - 21022330
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21022374 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 21022330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21709798 - 21709754
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21709798 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 21709754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21714341 - 21714297
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21714341 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 21714297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 22469025 - 22469069
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22469025 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 22469069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 329
Target Start/End: Original strand, 24783369 - 24783409
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24783369 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtc 24783409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 42865537 - 42865581
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  42865537 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 42865581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 5347 - 5869
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5347 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaaatgatga 5446  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5447 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 5546  T
Q  201 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 5646  T
Q  301 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5647 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatca 5746  T
Q  401 tctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  5747 tccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa 5837  T
Q  500 gatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
     ||  || |||||||||| |||| ||||||||    
T  5838 aatattgctatgttgtttgacatgttgattat 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12282 - 11758
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12282 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 12183  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12182 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 12083  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12082 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 11983  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 11883  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  11882 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 11792  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11791 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11566722 - 11566198
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  11566722 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 11566623  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566622 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 11566523  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566522 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 11566423  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11566422 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 11566323  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  11566322 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 11566232  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11566231 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 11566198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 12619088 - 12619612
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  12619088 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 12619187  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619188 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 12619287  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619288 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 12619387  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12619388 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 12619487  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  12619488 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 12619578  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12619579 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 12619612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23394928 - 23394404
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  23394928 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 23394829  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394828 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 23394729  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394728 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 23394629  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23394628 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 23394529  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  23394528 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 23394438  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23394437 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 23394404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23989780 - 23989256
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  23989780 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 23989681  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989680 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtggtttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 23989581  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989580 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 23989481  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23989480 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 23989381  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  23989380 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctgcgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 23989290  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23989289 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 23989256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22862806 - 22862282
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga--tgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  22862806 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgatactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgat 22862707  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22862706 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgagttt 22862607  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862606 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 22862507  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22862506 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 22862407  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22862406 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 22862316  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22862315 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 22862282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19870450 - 19869925
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  19870450 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagagcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 19870351  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870350 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattatggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 19870251  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870250 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 19870151  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19870150 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattat 19870051  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttct-acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 496  Q
    |||| ||||| |||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  19870050 catccatgagtttgtcgagttatgttataacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgac 19869960  T
Q  497 taagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19869959 taaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 19869925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 531
Target Start/End: Original strand, 31478326 - 31478762
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478326 tgatgacgtttagcttcaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 31478425  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478426 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtccttcgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 31478525  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31478526 taccaaatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa 31478625  T
Q  395 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31478626 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacatacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgatg 31478725  T
Q  495 actaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  31478726 actaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 31478762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8243613 - 8243169
Alignment:
Q  79 tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatg 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8243613 tatatatattatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatg 8243514  T
Q  179 catagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8243513 catagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgtttcaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatac 8243414  T
Q  279 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8243413 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttg 8243314  T
Q  379 ttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||    
T  8243313 ttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagat---------tttacgatg 8243223  T
Q  478 tgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  8243222 tgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 8243169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23414594 - 23414233
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23414594 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 23414497  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414496 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 23414397  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23414396 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat 23414297  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  23414296 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 23414233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1644176 - 1643838
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644176 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgatt 1644077  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1644076 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 1643977  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1643976 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttccacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatga 1643877  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1643876 tgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 1643838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 16624020 - 16623683
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624020 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgatt 16623921  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16623920 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 16623821  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16623820 aattatcatctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaaaaagtacctacgaaaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgc 16623721  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  16623720 tgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 16623683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14471879 - 14471550
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471879 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 14471780  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14471779 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaactatcatctatgagttgttaagttgtcgatg 14471680  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| |    
T  14471679 aattatcatccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatat 14471589  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14471588 tgactaagatgatgctatgttgtttaacatattgattat 14471550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 147 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16759980 - 16759708
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16759980 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagct 16759882  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  16759881 ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgtgtc-aa 16759783  T
Q  347 gtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  16759782 gtcgttgttgatgaattatcatccattagctgttaagttgtcgatgaattatcatccattagttgttaagttgtc 16759708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 187 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27556334 - 27556064
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27556334 ttcattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacatgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 27556236  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||    
T  27556235 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaat-------------ttgttaagttg 27556149  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttt 471  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27556148 atgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttt 27556064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4167990 - 4167705
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167990 tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 4167891  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggag 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  4167890 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 4167800  T
Q  220 ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167799 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4167705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 18917684 - 18917916
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacg 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18917684 ttgatatattgatatatctcttttgttgtgtgacttgactgtgctatggctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgaggaaatgatgacg 18917783  T
Q  103 tttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18917784 tttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagctttgt 18917882  T
Q  202 cctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18917883 cctcaccatgtttaggagctttgtcctccgcacg 18917916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Original strand, 22074560 - 22074764
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074560 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttatcttcta 22074659  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  22074660 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattg 22074759  T
Q  527 attat 531  Q
    |||||    
T  22074760 attat 22074764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4208670 - 4208385
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4208670 tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattagat 4208571  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggag 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  4208570 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 4208480  T
Q  220 ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208479 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4208385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22948772 - 22948554
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22948772 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 22948675  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22948674 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 22948575  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    || | |||||||  |||||||    
T  22948574 tctatgagttgtcgagttgtc 22948554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22952728 - 22952510
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22952728 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 22952631  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22952630 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 22952531  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    || | |||||||  |||||||    
T  22952530 tctatgagttgtcgagttgtc 22952510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23871216 - 23870998
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23871216 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 23871119  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23871118 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 23871019  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    || | |||||||  |||||||    
T  23871018 tctatgagttgtcgagttgtc 23870998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 169 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23875172 - 23874954
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23875172 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 23875075  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23875074 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 23874975  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    || | |||||||  |||||||    
T  23874974 tctatgagttgtcgagttgtc 23874954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 3708524 - 3708805
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3708524 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtatatgtgtatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgc 3708623  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt 222  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  3708624 atattgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 3708714  T
Q  223 tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708715 tgtcctccgcacgatttatcggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 3708805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Original strand, 27416344 - 27416557
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  27416344 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagttttgtcctccgcacgattaaag 27416440  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27416441 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatctgtcgagtcgaagtcgttgttgatgaattatca 27416540  T
Q  368 tccaagagttgttaagt 384  Q
    || | ||||||||||||    
T  27416541 tctatgagttgttaagt 27416557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34832740 - 34832436
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  34832740 aattgatatattgatatca-tctgtt--tatgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatggaatgatga 34832646  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  34832645 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcattagcatttcattaagctta 34832555  T
Q  200 gtcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34832554 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacaatt 34832455  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34832454 ggtaccacatgcatataag 34832436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2077004 - 2076800
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2077004 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttcta 2076905  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||    
T  2076904 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattgcatgatgtttatgatgtgaattttatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattg 2076805  T
Q  527 attat 531  Q
    |||||    
T  2076804 attat 2076800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 24291110 - 24291369
Alignment:
Q  50 tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24291110 tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat 24291209  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
    |         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  24291210 g---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 24291300  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24291301 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24291369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 31317150 - 31317409
Alignment:
Q  50 tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31317150 tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat 31317249  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
    |         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  31317250 g---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 31317340  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31317341 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 31317409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25928383 - 25928077
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  25928383 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 25928286  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25928285 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 25928196  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928195 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 25928096  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25928095 ggtaccacatgcatataag 25928077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 24315138 - 24315397
Alignment:
Q  50 tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24315138 tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat 24315237  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
    |         |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  24315238 g---------ttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 24315328  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24315329 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24315397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16624142 - 16623978
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624142 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16624043  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16624042 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 16623978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19808614 - 19808308
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  19808614 aattgatataatgatatcatcctattgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 19808517  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19808516 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 19808427  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808426 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 19808327  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19808326 ggtaccacatgcatataag 19808308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22758938 - 22758633
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | ||||    
T  22758938 aattgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gaggaataagatg 22758841  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758840 acgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 22758751  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758750 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt-aaagtatattaatacttatgatgacgatt 22758652  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22758651 ggtaccacatgcatataag 22758633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1545085 - 1545365
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545085 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg 1545182  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct 221  Q
    ||||        |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  1545183 catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagct 1545273  T
Q  222 ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545274 ttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1545365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1644298 - 1644134
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644298 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 1644199  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1644198 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 1644134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 17037375 - 17037655
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaat-gatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17037375 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatgtat--gatgaaaaagatgacgtttagctccaaattattggatg 17037472  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagct 221  Q
    ||   |||||||         |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||    
T  17037473 cacattgatatg---------atgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagct 17037563  T
Q  222 ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17037564 ttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17037655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 1587867 - 1588052
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1587867 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc 1587963  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587964 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 1588052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 25135809 - 25135993
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25135809 gattaaggtgttttgttgttaag--tccatgcattaacatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgatttaggagct 25135905  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135906 ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 25135993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25110886 - 25110623
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25110886 tgctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgatta 25110787  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    |||||         |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  25110786 cgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta 25110696  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25110695 taggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 25110623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25117489 - 25117226
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25117489 tgctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatgatta 25117390  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    |||||         |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  25117389 cgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta 25117299  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25117298 taggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 25117226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 34369992 - 34370298
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | ||||    
T  34369992 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gaagaataagatg 34370089  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34370090 acgtttagcttcaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 34370179  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34370180 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaagtatattaatacttatgatgacgatt 34370279  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    | |||||||||||||||||    
T  34370280 gttaccacatgcatataag 34370298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 5616951 - 5617136
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5616951 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagc 5617047  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5617048 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgccttgtcgcatt 5617136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12496278 - 12496086
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12496278 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cactgagctttgtcctcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 12496183  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496182 tttgtccttcgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 12496086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1538986 - 1539266
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||   || | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1538986 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgataatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg 1539083  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct 221  Q
    ||||        |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  1539084 catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccaggcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagct 1539174  T
Q  222 ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1539175 ttgtcctccgcacgtttattaggagttttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1539266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 34298670 - 34298940
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34298670 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 34298767  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34298768 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 34298855  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298856 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 34298940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 27430387 - 27430592
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27430387 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 27430477  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430478 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 27430577  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  27430578 ccacatgcatataag 27430592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 371
Target Start/End: Original strand, 18917893 - 18918027
Alignment:
Q  237 tttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttg 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917893 tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttg 18917992  T
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatcca 371  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18917993 ttgagtcaaagtcgttggtgatgaattatcatcca 18918027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28314528 - 28314353
Alignment:
Q  139 gattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  28314528 gattacgatgaatacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 28314429  T
Q  236 tttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314428 ttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 28314353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 9482429 - 9482620
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9482429 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttctcctccgcacgttt-aggagc 9482524  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9482525 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-agtgtctaagtttcattgtcgcatttgtcgagt 9482620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26130468 - 26130265
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26130468 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 26130378  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130377 tcaccacgaatattaggagctttgtcccccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 26130278  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  26130277 acatgcatataag 26130265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27185668 - 27185492
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27185668 tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 27185569  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185568 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27185492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27207504 - 27207328
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27207504 tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 27207405  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27207404 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27207328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 27241724 - 27241900
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27241724 tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 27241823  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27241824 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27241900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 27263572 - 27263748
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27263572 tgattacgatgaatacgatgttttgttgttgagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 27263671  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263672 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27263748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 2870231 - 2870444
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  2870231 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 2870321  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2870322 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 2870421  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2870422 gattggtaccacatgcatataag 2870444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 2876846 - 2877059
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  2876846 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 2876936  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2876937 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 2877036  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2877037 gattggtaccacatgcatataag 2877059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20060660 - 20060447
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20060660 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20060570  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20060569 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20060470  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20060469 gattggtaccacatgcatataag 20060447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 334
Target Start/End: Original strand, 20803697 - 20803875
Alignment:
Q  154 ggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcc 252  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20803697 ggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctctacacgttttaggagctttgtcc 20803793  T
Q  253 tctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20803794 tccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgttgcatt 20803875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27328152 - 27328365
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27328152 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 27328242  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27328243 agcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27328342  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27328343 gattggtaccacatgcatataag 27328365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 27388892 - 27389105
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27388892 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 27388982  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27388983 agcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27389082  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27389083 gattggtaccacatgcatataag 27389105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21702256 - 21702072
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||||    
T  21702256 gattaaggtgttttgttgtta-gaatccatgcattagcatt-cattgagctttgtccttaccatgataag-agatttgtcctccacacgttttaggagct 21702160  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702159 ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 21702072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30694363 - 30694160
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||         |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  30694363 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagaatctcattgagcttagtcc 30694273  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694272 tcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 30694173  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  30694172 acatgcatataag 30694160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8228842 - 8228664
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8228842 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 8228743  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8228742 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8228664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8797202 - 8796989
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  8797202 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8797112  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8797111 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 8797012  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8797011 gattggtaccacatgcatataag 8796989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18931031 - 18930853
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  18931031 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 18930932  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18930931 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18930853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28287359 - 28287155
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  28287359 gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt 28287268  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28287267 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 28287168  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  28287167 ccacatgcatata 28287155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29587831 - 29588009
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29587831 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 29587930  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29587931 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 29588009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29593972 - 29594150
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29593972 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 29594071  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29594072 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 29594150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6980670 - 6980461
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  6980670 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 6980581  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6980580 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 6980481  T
Q  289 gattggtaccacatgcatat 308  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6980480 gattggtaccacatgcatat 6980461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20649887 - 20650099
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20649887 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20649976  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20649977 agcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20650076  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20650077 gattggtaccacatgcatataag 20650099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28258557 - 28258761
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  28258557 gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt 28258648  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258649 cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 28258748  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  28258749 ccacatgcatata 28258761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28265181 - 28265385
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  28265181 gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt 28265272  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265273 cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 28265372  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  28265373 ccacatgcatata 28265385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28337306 - 28337510
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  28337306 gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt 28337397  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337398 cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 28337497  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  28337498 ccacatgcatata 28337510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 28343930 - 28344134
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  28343930 gtttagctccaaattattggacgcat-------tgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcattacatatcattgagcttagt 28344021  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28344022 cttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 28344121  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  28344122 ccacatgcatata 28344134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 30638281 - 30638459
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  30638281 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 30638380  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30638381 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 30638459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 32565392 - 32565561
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  32565392 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 32565491  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32565492 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 32565561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12762713 - 12762505
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12762713 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 12762623  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttt-taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 289  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12762622 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgtttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 12762523  T
Q  290 attggtaccacatgcata 307  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12762522 attggtaccacatgcata 12762505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 16552170 - 16552339
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16552170 atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 16552269  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16552270 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16552339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16576783 - 16576614
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16576783 atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 16576684  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16576683 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16576614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 16618597 - 16618766
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16618597 atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 16618696  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618697 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 16628726 - 16628895
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16628726 atgattacaatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 16628825  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628826 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 16628895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 17017072 - 17017241
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  17017072 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 17017171  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017172 aggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 17017241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20801767 - 20801556
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          |||||||  |||||||   || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20801767 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgaagttttgtccatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20801678  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20801677 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20801578  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20801577 gattggtaccacatgcatataa 20801556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30597168 - 30597024
Alignment:
Q  172 gtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaa 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  30597168 gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaa 30597069  T
Q  267 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597068 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 30597024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19662715 - 19662548
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  19662715 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta 19662620  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662619 tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 19662548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12706637 - 12706467
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  12706637 agagtccatgcattagcata-cattgagctctgtcctcgccacgatcag-agctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 12706542  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12706541 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgttgagt 12706467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16741154 - 16740985
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16741154 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 16741059  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16741058 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcacttgtcgagt 16740985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 350 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16759746 - 16759573
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta 448  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16759746 gttgtcgatgaattatcatccattagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagta 16759647  T
Q  449 cctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16759646 cctacgaagattatacg---------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 16759573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 2685478 - 2685645
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  2685478 agtccatgcattagcatt-cattgacctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta 2685573  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2685574 tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 2685645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14098691 - 14098461
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098691 tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtttatgtat--gaggaacatgatgacgtttagctccaaattattggatg 14098594  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct 221  Q
    ||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||    
T  14098593 catg--------ttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaagagct 14098503  T
Q  222 ttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||| |||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  14098502 ttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 14098461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 25595394 - 25595572
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25595394 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgcctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 25595493  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgat 213  Q
    ||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25595494 atgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgat 25595572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20176938 - 20176722
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||        ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20176938 atgatgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgttt--------ttgttgttaagagtccatgcatagcatctcattg 20176847  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatactt-atgatg 286  Q
    ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  20176846 agcttagtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattataggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatg 20176747  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20176746 acgattggtaccacatgcatataag 20176722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14471987 - 14471837
Alignment:
Q  108 ctccaaattattggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctca 206  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14471987 ctccaaattattggatgtataagtgatatgttgattacgatgattacg-tgttt-gttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagctttgtcctca 14471890  T
Q  207 ccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14471889 ccacgtttaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 14471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Original strand, 5834638 - 5834810
Alignment:
Q  147 tgattacggtgtttt-gtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg--tttta 240  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  || ||    
T  5834638 tgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagtatctcattgagcttagtcctcaccatgatttttaggagctttgtcctccgcacgaattata 5834737  T
Q  241 ggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatactt-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834738 ggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatataag 5834810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Original strand, 22159097 - 22159269
Alignment:
Q  147 tgattacggtgtttt-gtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacg--tttta 240  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22159097 tgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcatagaatctcattgagcttagtcctcaccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattata 22159196  T
Q  241 ggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatactt-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159197 ggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22159269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22948592 - 22948453
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||    
T  22948592 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat 22948502  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22948501 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 22948453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22952548 - 22952409
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||    
T  22952548 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat 22952458  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22952457 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 22952409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23871036 - 23870897
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||    
T  23871036 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat 23870946  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23870945 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 23870897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23874992 - 23874853
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||    
T  23874992 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat 23874902  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23874901 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 23874853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17804136 - 17803962
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||        
T  17804136 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctat 17804041  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804040 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 17803962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8243721 - 8243635
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243721 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat 8243635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 531
Target Start/End: Original strand, 18918012 - 18918145
Alignment:
Q  389 gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatg 488  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  18918012 gatgaattatcatccatgggtgatcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatg 18918102  T
Q  489 atgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18918103 atgttgactaagatgttgctatgttgtttaacatgttgattat 18918145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 27325785 - 27325955
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |   |||||||||| |||  |||||| ||||    
T  27325785 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatc--ggagctttgttctccacacgattaaag 27325880  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27325881 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtc 27325955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14098484 - 14098383
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098484 attaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctcctcacgattaaagtatatttatacttctgatgacgattggtaccacatgcatata 14098385  T
Q  310 ag 311  Q
    ||    
T  14098384 ag 14098383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 4233707 - 4233780
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233707 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4233780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 14053795 - 14053867
Alignment:
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053795 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14053867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 311
Target Start/End: Original strand, 22430208 - 22430327
Alignment:
Q  192 tgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  22430208 tgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgac 22430304  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22430305 gattggtaccacatgcatataag 22430327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Original strand, 4233594 - 4233729
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  4233594 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 4233684  T
Q  194 agctttgtcctcaccac---gattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  4233685 agcttagtcctcaccacaaatattaggagctttgtcctccgcacg 4233729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Original strand, 19774060 - 19774245
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  19774060 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgacttgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagttgtcttct 19774159  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| ||||||    |  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19774160 acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 19774245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22805507 - 22805370
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  22805507 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttgtcttct 22805408  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattata 463  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  22805407 acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattata 22805370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Original strand, 19656762 - 19656891
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcga--tgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagt 447  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||  || | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19656762 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgctaagttgttgagttgtcttct-atccatgagttgttgagttgtcttctatctatgtgttgttaatgaagt 19656860  T
Q  448 acctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||    
T  19656861 gcttatgaagattatacgatgtttatgatgt 19656891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23538302 - 23538235
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcat 401  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23538302 ttgtctagtcaaattcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgttgatgaattatcat 23538235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17105407 - 17105329
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  17105407 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgtcgatgagttggcatccatgagttgt 17105329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16371945 - 16371861
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 85  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371945 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat 16371861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19298223 - 19298173
Alignment:
Q  292 tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19298223 tggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 19298173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34963123 - 34963070
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34963123 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 34963070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17742923 - 17742849
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  17742923 cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgacatccatgagttgt 17742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 19656621 - 19656699
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  19656621 ttgtcgagtcaaagtcgttgtcgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgatgatgaattctcatccatgagttgt 19656699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23992180 - 23992127
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23992180 ttgtcgattcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 23992127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 393
Target Start/End: Original strand, 27126606 - 27126665
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27126606 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatga 27126665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 22081060 - 22081118
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22081060 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 22081118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20182440 - 20182303
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg---------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgtta 440  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20182440 gttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtcgatgaattgtcatacatgagttgttaaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaa 20182341  T
Q  441 aagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    | ||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  20182340 atgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt 20182303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Original strand, 22153551 - 22153688
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg---------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgtta 440  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22153551 gttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtcgatgaattgtcatacatgagttgttaaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgtaa 22153650  T
Q  441 aagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    | ||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  22153651 atgaagtgcttatgaagagtatacactgtttatgatgt 22153688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17742878 - 17742689
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacctatgtgttgttaa 441  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||         ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  17742878 gttgttgatgaattgacatccatgagttgtaaagttgttgatgaattgtcctccatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccacgtgttgttaa 17742779  T
Q  442 agaagtacctacgaagattatacgatgt--ttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
     ||||| | || |||||||||| |||||  |||||||||   |||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  17742778 tgaagtgcttatgaagattatatgatgttattatgatgttgtttata--atgttgattatgatgttgttatgttgtttatgatattgattat 17742689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22831303 - 22831247
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22831303 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaa 22831247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 409
Target Start/End: Original strand, 15705936 - 15706011
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagt 409  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  15705936 ttgtcaagtcaaattcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt 15706011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1561097 - 1561039
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1561097 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 1561039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7825489 - 7825436
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  7825489 ttgtcgaatcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccacgagttgttaagttgt 7825436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Original strand, 14059720 - 14059761
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14059720 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 14059761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18906907 - 18906851
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18906907 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 18906851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 447
Target Start/End: Original strand, 15705985 - 15706090
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaa 441  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||        |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15705985 gttgttgatgagttgtcatccatgagtggttaagttgttgatgagttgtcatctatgagtcgttaagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaa 15706084  T
Q  442 agaagt 447  Q
     |||||    
T  15706085 tgaagt 15706090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 343
Target Start/End: Original strand, 31155695 - 31155747
Alignment:
Q  292 tggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31155695 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc 31155747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19651984 - 19651925
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19651984 gattggtaccacatgcatataagagatttaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 19651925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 27333456 - 27333515
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27333456 gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcattcgtcgagtcaaag 27333515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 27394196 - 27394255
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27394196 gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcattcgtcgagtcaaag 27394255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 4738854 - 4738908
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4738854 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatctgtcgagtc 4738908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11185307 - 11185253
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11185307 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtc 11185253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23538253 - 23538215
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23538253 gttgttgatgaattatcattcaagagttgttaagttgtc 23538215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 28496797 - 28496851
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28496797 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 28496851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 29809208 - 29809262
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29809208 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 29809262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30597229 - 30597175
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 148  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30597229 atgatgaagttaagctccaaattattggatgcatgtcgataagttgattacgatg 30597175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8228973 - 8228908
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  8228973 ttgatatattgatatctccttgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 8228908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Original strand, 15894760 - 15894805
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15894760 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 15894805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 16552040 - 16552101
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16552040 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 16552101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16576913 - 16576852
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16576913 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 16576852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 16618467 - 16618528
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16618467 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 16618528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 16628596 - 16628657
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16628596 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 16628657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 17016942 - 17017003
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17016942 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 17017003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21830760 - 21830816
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21830760 attggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21830816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 22780552 - 22780605
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22780552 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagt 22780605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 32565262 - 32565323
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32565262 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 32565323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 22430231 - 22430274
Alignment:
Q  191 ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22430231 ttgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg 22430274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 25767380 - 25767423
Alignment:
Q  191 ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25767380 ttgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg 25767423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27556064 - 27556020
Alignment:
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  27556064 tgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 27556020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 25629677 - 25629732
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25629677 gattggtaccacatgcatataggaggtctaaattgcatagtcgcatttgtcgagtc 25629732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 25603716 - 25603770
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  25603716 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgtcgagtc 25603770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18931162 - 18931097
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  18931162 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 18931097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 22408613 - 22408669
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22408613 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 22408669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 279
Target Start/End: Original strand, 25767335 - 25767445
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  25767335 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcatcaccaagatt-tgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 25767430  T
Q  265 aagtatattaatact 279  Q
    |||||||||||||||    
T  25767431 aagtatattaatact 25767445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 29587700 - 29587761
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29587700 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 29587761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 29593841 - 29593902
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29593841 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 29593902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 16523704 - 16523759
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16523704 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 16523759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 18692232 - 18692287
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18692232 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 18692287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Original strand, 19656746 - 19656790
Alignment:
Q  367 atccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttg 411  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19656746 atccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttg 19656790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19872914 - 19872870
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19872914 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 19872870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20182450 - 20182402
Alignment:
Q  373 gagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 421  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  20182450 gagttgttaagttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtc 20182402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 21740357 - 21740401
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21740357 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 21740401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 421
Target Start/End: Original strand, 22153541 - 22153589
Alignment:
Q  373 gagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 421  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  22153541 gagttgttaagttgttgatgaattgtcatccacgagttgttgagttgtc 22153589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 22335220 - 22335264
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22335220 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 22335264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22432043 - 22431999
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22432043 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 22431999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22438593 - 22438549
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22438593 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 22438549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 25642510 - 25642554
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagt-gtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  25642510 attggtaccacatgcatataagtggtataagttgcatagtcgcat 25642554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Original strand, 25767444 - 25767472
Alignment:
Q  315 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767444 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 25767472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 158)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9556390 - 9555866
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  9556390 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 9556291  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556290 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 9556191  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556190 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 9556091  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9556090 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 9555991  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  9555990 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 9555900  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  9555899 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 9555866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33742240 - 33741716
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  33742240 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 33742141  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742140 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 33742041  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742040 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 33741941  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33741940 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 33741841  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  33741840 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 33741750  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  33741749 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 33741716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17810132 - 17809707
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810132 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 17810033  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810032 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 17809933  T
Q  201 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809932 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 17809833  T
Q  301 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809832 atgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatca 17809733  T
Q  401 tctatgag-ttgtcgagttgtcttct 425  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||    
T  17809732 tccatgagtttgtcgagttgtgttct 17809707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 5757185 - 5757700
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  5757185 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtatatatatatattatgaaatgat 5757284  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757285 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgat---------tacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 5757375  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757376 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 5757475  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5757476 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 5757575  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  5757576 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 5757666  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  5757667 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 5757700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 14757668 - 14758197
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga--tgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  14757668 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgat 14757767  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14757768 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagctt 14757867  T
Q  199 tgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
     |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757868 agtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattg 14757967  T
Q  294 gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14757968 gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatga 14758067  T
Q  394 attatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  14758068 attatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgt 14758158  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14758159 tgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 14758197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 4561580 - 4562095
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  4561580 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 4561679  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561680 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgat---------tacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 4561770  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561771 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 4561870  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4561871 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgtcgatgaattat 4561970  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  4561971 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaggattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 4562061  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  4562062 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 4562095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15224805 - 15224411
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224805 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 15224706  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224705 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 15224607  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15224606 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgctgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa 15224507  T
Q  395 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224506 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat 15224411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 14954609 - 14954961
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14954609 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 14954706  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954707 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 14954806  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  14954807 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctataagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- 14954903  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14954904 ------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 14954961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12487375 - 12487021
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12487375 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaag 12487277  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12487276 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 12487177  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacga 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12487176 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac-- 12487079  T
Q  467 tgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
           |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12487078 -------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 12487021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 217 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10712496 - 10712244
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712496 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 10712398  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712397 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 10712298  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10712297 ttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 10712244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 217 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10926266 - 10926014
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926266 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 10926168  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926167 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 10926068  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10926067 ttgtcttttacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtt 10926014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 241 - 531
Target Start/End: Original strand, 20157680 - 20157973
Alignment:
Q  241 ggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttg 336  Q
    ||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  20157680 ggagctttgtcctccccacgatgctgaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttacattgtcgcatttg 20157778  T
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgtt 436  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20157779 tcgagtcaaactcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgtt 20157878  T
Q  437 gttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  20157879 gttaaataagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactgagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 20157973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 315 - 531
Target Start/End: Original strand, 20160433 - 20160649
Alignment:
Q  315 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcg 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20160433 ctaagttacattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgaattgtcg 20160532  T
Q  415 agttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttg 514  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20160533 agttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttg 20160632  T
Q  515 tttaacatattgattat 531  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20160633 tttaagatattgattat 20160649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 53433464 - 53433155
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  53433464 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 53433365  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  53433364 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 53433275  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53433274 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 53433175  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53433174 tggtaccacatgcatataag 53433155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 315 - 531
Target Start/End: Original strand, 20163211 - 20163427
Alignment:
Q  315 ctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcg 414  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20163211 ctaagttacattgtcgcgtttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcg 20163310  T
Q  415 agttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttg 514  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  20163311 ggttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgtttctatgttg 20163410  T
Q  515 tttaacatattgattat 531  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20163411 tttaagatattgattat 20163427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23081653 - 23081370
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23081653 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 23081554  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  23081553 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 23081463  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081462 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23081370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27709786 - 27709527
Alignment:
Q  50 tgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27709786 tgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgat 27709687  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
    |         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  27709686 g---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 27709596  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709595 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 27709527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 19942195 - 19942478
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19942195 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 19942294  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||    
T  19942295 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattatgagc 19942385  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942386 tttgtcctctgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19942478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 14708770 - 14708956
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708770 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 14708867  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708868 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 14708956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Original strand, 16956692 - 16956984
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16956692 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 16956791  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  16956792 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttatgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 16956882  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtcta 317  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16956883 tttgtcctccgcacgattattaggagttttttcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtcta 16956982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 7901232 - 7901494
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  7901232 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt 7901321  T
Q  143 acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt- 238  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||     
T  7901322 atgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgttctctgcacgttta 7901420  T
Q  239 -taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901421 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 7901494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Original strand, 9272252 - 9272480
Alignment:
Q  79 tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||         ||||  ||||||||||||    
T  9272252 tatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatt---------tgttcataagagtccatg 9272342  T
Q  179 catagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatatt 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9272343 catagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatt 9272442  T
Q  274 aatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9272443 aatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag 9272480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 6873473 - 6873686
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6873473 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 6873563  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6873564 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 6873663  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6873664 gattggtaccacatgcatataag 6873686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 42997586 - 42997772
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42997586 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 42997683  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42997684 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtatcacgtgcatataagtgtctaagtcgcattgtcgcatt 42997772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45938119 - 45937926
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45938119 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 45938023  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45938022 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagt 45937926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15322136 - 15322416
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15322136 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg 15322233  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct 221  Q
    ||||        |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||    
T  15322234 catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttattgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattacgagct 15322324  T
Q  222 ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15322325 ttgtcctccgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15322416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 386426 - 386639
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  386426 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 386516  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  386517 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 386616  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  386617 gattggtaccacatgcatataag 386639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40478159 - 40477946
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40478159 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 40478069  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40478068 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 40477969  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40477968 gattggtaccacatgcatataag 40477946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2014748 - 2014556
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2014748 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 2014653  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2014652 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatcgtcgcatttgtcgagt 2014556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 26243801 - 26243993
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26243801 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgtttaag-agc 26243896  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243897 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 26243993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12475021 - 12474816
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12475021 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 12474931  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474930 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 12474831  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  12474830 ccacatgcatataag 12474816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12481651 - 12481446
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12481651 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 12481561  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481560 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 12481461  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  12481460 ccacatgcatataag 12481446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 19757737 - 19757928
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19757737 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatt-ggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 19757832  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757833 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 19757928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19782069 - 19781878
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19782069 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatt-ggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 19781974  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781973 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 19781878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 26285003 - 26285217
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26285003 atgatgaagtctagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga--------attacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 26285094  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26285095 agcttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgag 26285194  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26285195 gattggtaccacatgcatataag 26285217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23139202 - 23139049
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139202 ttcattgagctttgtcatcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 23139105  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139104 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 23139049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 15383589 - 15383801
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||          ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15383589 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg----------tgttttgttgttatgtgtccatgcatagcatatcattg 15383678  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15383679 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 15383778  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15383779 gattggtaccacatgcatataag 15383801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27533641 - 27533457
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27533641 gagctttgtcctccgcacaat-aggagctttgtcctccgcatgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgatt 27533544  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27533543 ggtaccacatgcatatgagtgtctaagttgcattttcgcattcgtcgagtcaaagtcgttgtcgatgaattatcatccatgagttgt 27533457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 51493914 - 51494125
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51493914 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcat--tgatatgtttattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 51494002  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51494003 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 51494102  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51494103 gattggtaccacatgcatataag 51494125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9530404 - 9530212
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  9530404 tgattaagatgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggatc 9530309  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9530308 tttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagt 9530212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 18024532 - 18024737
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  18024532 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatatcattgagcttagt 18024622  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024623 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 18024722  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  18024723 ccacatgcatataag 18024737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18071170 - 18070965
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18071170 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 18071080  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071079 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 18070980  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  18070979 ccacatgcatataag 18070965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18295627 - 18295422
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18295627 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 18295537  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295536 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 18295437  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  18295436 ccacatgcatataag 18295422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12522170 - 12521864
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||| ||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  12522170 aattgatataatgatatcatcctgttgttatgttacttgactatgatgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 12522073  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  12522072 acgtttggctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctc 12521983  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12521982 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 12521883  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12521882 ggtaccacatgcatataag 12521864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 14268560 - 14268763
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14268560 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 14268650  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268651 tcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14268750  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  14268751 acatgcatataag 14268763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 18602868 - 18603052
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18602868 gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagatttgtcctccacacgttttaggagct 18602964  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18602965 ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18603052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 217 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25689510 - 25689340
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689510 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 25689412  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||    
T  25689411 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 25689340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23838484 - 23838222
Alignment:
Q  39 gactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgt 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  23838484 gactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatga 23838387  T
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgt 236  Q
    ||||||||| |         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  23838386 tgattacgacg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgaacttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacga 23838299  T
Q  237 t--ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838298 tatttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23838222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 19780384 - 19780597
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19780384 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 19780474  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19780475 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 19780574  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19780575 gattggtaccacatgcatataag 19780597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23954158 - 23953945
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23954158 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23954068  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23954067 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23953968  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23953967 gattggtaccacatgcatataag 23953945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23960820 - 23960607
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  23960820 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 23960730  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23960729 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23960630  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23960629 gattggtaccacatgcatataag 23960607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3412768 - 3412583
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3412768 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacatgttttaggagc 3412672  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3412671 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtagcacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 3412583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40453886 - 40453717
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--g 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40453886 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 40453787  T
Q  242 gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40453786 gagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 40453717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 14298934 - 14299137
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14298934 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 14299024  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299025 tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14299124  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  14299125 acatgcatataag 14299137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14679021 - 14678752
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14679021 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 14678924  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         ||||||  |  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14678923 tgatatgatgattacgatg---------ttttgtgat--agagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 14678837  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14678836 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14678752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 631289 - 631475
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagt-gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  631289 attggtaccacatgcatataagaagttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt 631388  T
Q  389 gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  631389 aatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 631475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 340
Target Start/End: Original strand, 16243536 - 16243726
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16243536 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagcttagtcctccgcacgttt-aggagc 16243631  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcga 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16243632 tttgtcctctgcacgatgaaattatattaatacttacgatgacgattggtaccacatgcatataaatgtctaagttgcattgtcgcatttatcga 16243726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15148467 - 15148254
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15148467 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 15148377  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15148376 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 15148277  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15148276 gattggtaccacatgcatataag 15148254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15362142 - 15361929
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15362142 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 15362052  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15362051 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 15361952  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15361951 gattggtaccacatgcatataag 15361929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16231938 - 16232151
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16231938 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 16232028  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16232029 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 16232128  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16232129 gattggtaccacatgcatataag 16232151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22194629 - 22194416
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22194629 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22194539  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22194538 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22194439  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22194438 gattggtaccacatgcatataag 22194416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 18609440 - 18609624
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18609440 gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtccttaccatgataag-agctttgtcctccacacgttttaggagct 18609536  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609537 ttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttagtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18609624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4772106 - 4771894
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  4772106 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 4772017  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4772016 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 4771917  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4771916 gattggtaccacatgcatataag 4771894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 41385792 - 41386062
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  41385792 tgtgacttgactatgttgctgcggttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 41385889  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  41385890 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtctt 41385977  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385978 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41386062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8384788 - 8384610
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8384788 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 8384689  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8384688 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8384610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14073784 - 14073606
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  14073784 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 14073685  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073684 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14073606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15256562 - 15256384
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15256562 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 15256463  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15256462 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 17090130 - 17090308
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17090130 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 17090229  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17090230 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17090308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 29041051 - 29041229
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29041051 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 29041150  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29041151 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 29041229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 36884831 - 36885044
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  36884831 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 36884921  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36884922 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagcgttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 36885021  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36885022 gattggtaccacatgcatataag 36885044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 55795413 - 55795236
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  55795413 tgattacgaggattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca 55795314  T
Q  234 cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55795313 cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 55795236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8391443 - 8391267
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8391443 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 8391344  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391343 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 8391267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14685229 - 14684960
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14685229 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 14685132  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    | ||||| |||||||||||         ||||||  |  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14685131 taatatgatgattacgatg---------ttttgtgat--agagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 14685045  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14685044 ccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatttgtaccacatgcatataag 14684960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 12349724 - 12349893
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  12349724 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 12349823  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349824 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12349893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 17962476 - 17962653
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  17962476 tgattacgatgattaagatgttttgttgttaagaatccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca 17962575  T
Q  234 cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17962576 cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 17962653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 8048592 - 8048804
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  8048592 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8048681  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8048682 agcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 8048781  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8048782 gattggtaccacatgcatataag 8048804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 8055205 - 8055417
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  8055205 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 8055294  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8055295 agcttagtcctcaccacgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 8055394  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8055395 gattggtaccacatgcatataag 8055417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18236840 - 18236677
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18236840 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggatctttgtcctccgcacgattaaag 18236744  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18236743 tatattaataattatgacgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18236677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 12300048 - 12300217
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  12300048 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 12300147  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300148 aggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12300217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17808367 - 17808189
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17808367 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 17808268  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17808267 gttttataggagctttgtcctccgcacgattgaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17808189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Original strand, 18222524 - 18222705
Alignment:
Q  156 tgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  18222524 tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctc 18222618  T
Q  255 tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18222619 cgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgttgagt 18222705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Original strand, 17048683 - 17048831
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||    
T  17048683 gtcgcatttgtcgattcaaagtcgttgttgatgaattatcatccacgagttgttaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattata 17048782  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17048783 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35170715 - 35170436
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||| | |||||||   |||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  35170715 aattgatacaatgatatcatcctgttgttgtgtcacttgcctatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 35170618  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35170617 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattgagctt 35170527  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
     ||||||||||||||||                      ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35170526 agtcctcaccacgatta----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 35170449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 238 - 342
Target Start/End: Original strand, 28569645 - 28569749
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28569645 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatttgt 28569744  T
Q  338 cgagt 342  Q
    |||||    
T  28569745 cgagt 28569749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 18228990 - 18229180
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||  |  ||||||    
T  18228990 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacaat--aggagc 18229084  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18229085 tttgtcttccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgacaattggtaccatatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 18229180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20682207 - 20682036
Alignment:
Q  32 gtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatg 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20682207 gtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 20682110  T
Q  132 atatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt 214  Q
    ||||||||||         ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20682109 atatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatt 20682036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 342
Target Start/End: Original strand, 1951939 - 1952088
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1951939 cattgagctttgtcctgaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgac 1952034  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1952035 gattggtaccacatgcatattagtgtccaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 1952088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 17152623 - 17152805
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  17152623 tgattaagatgttttgttttta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtgctccacacgat--aggagc 17152717  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152718 tttgttctccacacgattaaagtatattaatact-acgatgacgattggtactacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 17152805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25689378 - 25689239
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||    
T  25689378 gttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtaaat 25689288  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  25689287 tatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 25689239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35614025 - 35613796
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||     
T  35614025 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgatgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagata 35613928  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||         |||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  35613927 acgttg-gctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacga---------tgttttgttgataagagtccatgtattagca-ttcattgagctt 35613839  T
Q  199 tgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt 238  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  35613838 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 35613796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 383 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27533486 - 27533359
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  27533486 gttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgcgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaat 27533396  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa 519  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  27533395 tatatgatgttgactaaaatgttgctatgttgtttaa 27533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37018436 - 37018300
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| | | ||    
T  37018436 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccataagttgttgagttgtcttctatccacgt 37018337  T
Q  434 gttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    |||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  37018336 gttgttcatgaagtacttatgaagattatatgatgtt 37018300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 14305661 - 14305734
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305661 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14305734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 36134153 - 36134280
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-t 312  Q
    |||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36134153 gagctttgtcctcaccacgattt--gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagag 36134249  T
Q  313 gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36134250 gtctaagttgcattgtcacatttgtcgagtc 36134280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 14305558 - 14305683
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14305558 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 14305648  T
Q  204 tcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    || |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  14305649 tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacg 14305683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20115143 - 20115012
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20115143 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 20115052  T
Q  204 tcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    ||||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20115051 tcaccacgaataataggagttttgtcctccgcacgtttta 20115012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3484880 - 3484802
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3484880 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagctgttaagttgttgttgaattatcatccatgagttgt 3484802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27533716 - 27533606
Alignment:
Q  142 tacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||    
T  27533716 tacgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcac--aata 27533620  T
Q  241 ggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||||||||    
T  27533619 ggagctttgtcctc 27533606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35613821 - 35613748
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35613821 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 35613748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10712520 - 10712454
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712520 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 10712454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10926290 - 10926224
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926290 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 10926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Original strand, 22634604 - 22634721
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga---aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-t 312  Q
    |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22634604 gagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagag 22634700  T
Q  313 gtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22634701 gtctaagttgcattgtcgcat 22634721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25689534 - 25689468
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689534 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 25689468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Original strand, 35812632 - 35812776
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||    
T  35812632 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagtcgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgaattgttaagttgttgagttgtcttct 35812731  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    | | |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  35812732 atccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 35812776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14548555 - 14548478
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14548555 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccttgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttg 14548478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17807564 - 17807464
Alignment:
Q  422 ttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaaca 521  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||    
T  17807564 ttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagat---------tttacgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctaagttgtttaaca 17807474  T
Q  522 tattgattat 531  Q
    | ||||||||    
T  17807473 tgttgattat 17807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7798570 - 7798512
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7798570 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 7798512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 13592535 - 13592613
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  13592535 ttgttgagtcaaagtcgttgttgatgagtcgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 13592613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16997369 - 16997226
Alignment:
Q  335 tgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatga--------gttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||        ||||| |||||||||||||    
T  16997369 tgtcgagtcaaagtcgttgttaatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgacatccatgagttgttaggttgttgagttgtcttcta 16997270  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
     | | |||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  16997269 tccacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 16997226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Original strand, 28569587 - 28569667
Alignment:
Q  154 ggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28569587 ggtgttttgttgttaa-attccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg 28569667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 15042323 - 15042376
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  15042323 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 15042376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15112101 - 15112048
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  15112101 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 15112048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25090497 - 25090444
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  25090497 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 25090444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12773879 - 12773820
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12773879 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 12773820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14038499 - 14038440
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14038499 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 14038440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 30235220 - 30235279
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 85  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30235220 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat 30235279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 14053628 - 14053682
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14053628 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc 14053682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12569809 - 12569753
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12569809 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 12569753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 22634580 - 22634645
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22634580 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg 22634645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 10712256 - 10712206
Alignment:
Q  481 attatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  10712256 attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 10712206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 10926026 - 10925976
Alignment:
Q  481 attatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  10926026 attatacgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 10925976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17046281 - 17046227
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17046281 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 17046227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 12299918 - 12299979
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12299918 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 12299979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 12349594 - 12349655
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12349594 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 12349655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15093569 - 15093513
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15093569 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgtattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 15093513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 16488397 - 16488453
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16488397 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgttgca-ttgtcgagtcaaa 16488453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 17962345 - 17962406
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  17962345 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaact 17962406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 55795544 - 55795479
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||    
T  55795544 ttgatatattgatatctctttgctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactgagt 55795479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 20157634 - 20157699
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20157634 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctgaccacgatt-ggagctttgtcctccccacg 20157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 311
Target Start/End: Original strand, 30235277 - 30235308
Alignment:
Q  280 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235277 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 30235308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 36134129 - 36134194
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36134129 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctccccacg 36134194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 16240295 - 16240349
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16240295 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 16240349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 16377846 - 16377900
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16377846 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 16377900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40471486 - 40471452
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatg 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40471486 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatg 40471452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42874642 - 42874588
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||    
T  42874642 ttgtcgaatcaaagtcgttgttgatgagttgtcattcatgagttgttgagttgtc 42874588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 52873587 - 52873641
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  52873587 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 52873641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3484831 - 3484794
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3484831 gttgttgttgaattatcatccatgagttgttaagttgt 3484794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8384919 - 8384854
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  8384919 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 8384854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8391574 - 8391509
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  8391574 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 8391509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12610721 - 12610680
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12610721 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 12610680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13569297 - 13569252
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13569297 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 13569252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14073915 - 14073850
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  14073915 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 14073850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15256693 - 15256628
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  15256693 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 15256628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 15353372 - 15353465
Alignment:
Q  49 ctgctgttatttaactaagt-gcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15353372 ctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacat--gatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 15353465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 16348983 - 16349039
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16348983 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 16349039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 16357271 - 16357327
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16357271 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 16357327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 17089999 - 17090064
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  17089999 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgttgttatttaactaagt 17090064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17808498 - 17808433
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  17808498 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 17808433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 311
Target Start/End: Original strand, 21339968 - 21339997
Alignment:
Q  282 tgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339968 tgatgacgattggtaccacatgcatataag 21339997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 23803699 - 23803740
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23803699 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 23803740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 29040920 - 29040981
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29040920 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 29040981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 51464216 - 51464257
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51464216 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 51464257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3096132 - 3096084
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  3096132 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt 3096084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12902553 - 12902505
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  12902553 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt 12902505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 15122124 - 15122168
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15122124 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 15122168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15705185 - 15705149
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcat 325  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15705185 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 15705149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23843271 - 23843227
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23843271 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 23843227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44675425 - 44675381
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  44675425 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 44675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 222)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 27409890 - 27410414
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27409890 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 27409989  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409990 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 27410089  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410090 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 27410189  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27410190 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 27410289  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27410290 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 27410380  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  27410381 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 27410414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11069931 - 11069407
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  11069931 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 11069832  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069831 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 11069732  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11069731 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacctatgatgacgattggtacc 11069632  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11069631 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 11069532  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  11069531 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 11069441  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11069440 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 11069407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7109561 - 7109035
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga----tgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||    
T  7109561 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatatattttgaaatg 7109462  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109461 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 7109362  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109361 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 7109262  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7109261 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 7109162  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  7109161 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 7109071  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  7109070 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 7109035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7113496 - 7112970
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga----tgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||    
T  7113496 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatatattttgaaatg 7113397  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113396 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 7113297  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113296 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 7113197  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7113196 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 7113097  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  7113096 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 7113006  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  7113005 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 7112970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22321527 - 22321003
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22321527 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgaattgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 22321428  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321427 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 22321328  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321327 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttgggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtacc 22321228  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321227 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 22321128  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22321127 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 22321037  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22321036 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 22321003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22336582 - 22336058
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22336582 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgaattgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 22336483  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336482 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 22336383  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336382 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttgggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtacc 22336283  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22336282 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 22336183  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22336182 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 22336092  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22336091 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 22336058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 55022730 - 55022204
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  55022730 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 55022631  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022630 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 55022531  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022530 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 55022431  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55022430 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 55022331  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||    
T  55022330 atcatccatgagtttgtcgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 55022240  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  55022239 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 55022204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 529
Target Start/End: Original strand, 11165775 - 11166297
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  11165775 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 11165874  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165875 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 11165974  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165975 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcatccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 11166074  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11166075 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgattcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 11166174  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  11166175 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacaaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 11166265  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgatt 529  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  11166266 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgatt 11166297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14499188 - 14498664
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14499188 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgattggactgtgctactgctattatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 14499089  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14499088 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattatgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 14498989  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498988 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacattttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 14498889  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14498888 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 14498789  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  14498788 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 14498698  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14498697 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 14498664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 4107643 - 4108169
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  4107643 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 4107742  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107743 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 4107842  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107843 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 4107942  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4107943 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatatgttgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 4108042  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4108043 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4108133  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || || ||||||||| ||| |||||||    
T  4108134 ctaaaatattgctacgttgtttaagataatgattat 4108169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 4111495 - 4112021
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  4111495 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 4111594  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111595 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 4111694  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111695 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 4111794  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4111795 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatatgttgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 4111894  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  4111895 atcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 4111985  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || || ||||||||| ||| |||||||    
T  4111986 ctaaaatattgctacgttgtttaagataatgattat 4112021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 28949587 - 28949061
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  28949587 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 28949488  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949487 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 28949388  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949387 tttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgaaaaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 28949288  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28949287 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 28949188  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  28949187 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 28949097  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    | || ||  || |||||||||||| || ||||||||    
T  28949096 ccaaaattttgctatgttgtttaagatgttgattat 28949061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15617237 - 15616766
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  15617237 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatattatgaaatgat 15617138  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617137 gacatttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 15617038  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617037 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacggtttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15616938  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15616937 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 15616838  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 469  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616837 catccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 15616766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 531
Target Start/End: Original strand, 16750684 - 16751115
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750684 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 16750783  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750784 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 16750882  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16750883 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcacatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcaatgaa 16750982  T
Q  395 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttg 494  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  16750983 ttatcatctatgagttgttaagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgttcatgatgtgaattatatgat---- 16751078  T
Q  495 actaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    | ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16751079 attattatgttgctatgttgtttaacatattgattat 16751115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30065809 - 30065432
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065809 aattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgttgttatttaaataagtacatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 30065710  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065709 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 30065610  T
Q  201 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065609 tcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac 30065510  T
Q  301 atgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagtt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30065509 atgcatataaagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgtcgatgaattatcatccatgagtt 30065432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 194 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19775235 - 19774898
Alignment:
Q  194 agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775235 agctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 19775136  T
Q  294 gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19775135 gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatga 19775036  T
Q  394 attatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19775035 attatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgat 19774936  T
Q  494 gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19774935 gactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 19774898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15964636 - 15964284
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15964636 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 15964539  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964538 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 15964439  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15964438 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg-- 15964341  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
           ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  15964340 -------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 15964284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15968560 - 15968208
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15968560 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 15968463  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968462 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 15968363  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15968362 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg-- 15968265  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
           ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  15968264 -------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 15968208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15972484 - 15972132
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15972484 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 15972387  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972386 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 15972287  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15972286 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg-- 15972189  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
           ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  15972188 -------atgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 15972132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Original strand, 4589378 - 4589691
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589378 gagctttgtcctccccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 4589476  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589477 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagttgttgttgatgaattatcatctatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 4589576  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  4589577 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaaggttatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttcactaagatgttgctatgttgtt 4589676  T
Q  517 taacatattgattat 531  Q
    ||| ||| |||||||    
T  4589677 taagataatgattat 4589691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 197 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15464762 - 15464430
Alignment:
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464762 tttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 15464665  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15464664 ccacatgcatataagtttctaagttgcattgtcacatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaatt 15464565  T
Q  397 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 496  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464564 atcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgac 15464465  T
Q  497 taagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||| ||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  15464464 taaaatattgctatgttgtttaagatattgattat 15464430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 193 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12339367 - 12339044
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339367 gagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-agcagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgatt 12339270  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12339269 ggtaccacatgcatataagtgtctatgttgcatagtcgcatttctcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatg 12339170  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12339169 aattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacc-atgtgttgttaaagaagtacctatgaagattttacgatgtttatgatgtgaattatataatgt 12339071  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaa 519  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  12339070 tgactaagatgtttctatgttgtttaa 12339044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14665343 - 14664981
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  || ||||        
T  14665343 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agttttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccatgatgctat 14665248  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaatt 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665247 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaatt 14665149  T
Q  364 atcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattata 463  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14665148 atcattcatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattata 14665049  T
Q  464 cgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  14665048 cgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 14664981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Original strand, 37440102 - 37440406
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440102 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 37440200  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440201 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 37440300  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37440301 ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt 37440391  T
Q  517 taacatattgattat 531  Q
    ||| |||||||||||    
T  37440392 taagatattgattat 37440406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 189 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14668479 - 14668137
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga---aagtatattaatacttatgat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||  ||  ||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||||| ||||    
T  14668479 cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agttttgtcctcaccacaatt--ggagctttgtcctccccacgatgctataagtatattaatactt-tgat 14668384  T
Q  286 gacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14668383 gacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagt 14668284  T
Q  385 tgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaatta 484  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668283 tgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttatcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaatta 14668184  T
Q  485 tatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  14668183 tatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 14668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Original strand, 8489652 - 8489962
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8489652 gagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataagtgtct 8489750  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8489751 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattttcatccatgagttgttaagtt---gatgaattatcatctatgagttgtcgag 8489847  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| | | ||||||||    
T  8489848 ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgttatgatgttgtt 8489947  T
Q  517 taacatattgattat 531  Q
    ||| |||||||||||    
T  8489948 taagatattgattat 8489962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 169 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 5223013 - 5222761
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5223013 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagctttgtcctccgcacgatgaaag 5222917  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5222916 tatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaaattgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgataaattatca 5222817  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtctt 423  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5222816 tccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagtagtctt 5222761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 294 - 531
Target Start/End: Original strand, 17317669 - 17317906
Alignment:
Q  294 gtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  17317669 gtaccacatgcatataagtgtctaagttccattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgaattgttaagtcgtcgatga 17317768  T
Q  394 attatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317769 attatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatatgttgttaaagaagtaccaacgaatattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt 17317868  T
Q  494 gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  17317869 gacaaagatgttgctatgttgtttaacatattggttat 17317906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12891493 - 12891184
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12891493 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 12891394  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  12891393 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 12891304  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891303 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 12891204  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12891203 tggtaccacatgcatataag 12891184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17253075 - 17253384
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17253075 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 17253174  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  17253175 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 17253264  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17253265 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 17253364  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17253365 tggtaccacatgcatataag 17253384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Original strand, 17710633 - 17710923
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17710633 tgttatgtgacctgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaatgatgacatttagctccaaattattggatgc 17710732  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt 222  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||         ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  17710733 atgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcatatgagtccatgcatagcattccattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 17710823  T
Q  223 tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaag 319  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17710824 tgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaag 17710923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1145592 - 1145875
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1145592 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 1145691  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  1145692 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 1145782  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1145783 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1145875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15343645 - 15343928
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15343645 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 15343744  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  15343745 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 15343835  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343836 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctctgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15343928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 410791 - 411074
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  410791 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaagttgttggat 410890  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  410891 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 410981  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  410982 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 411074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 8721196 - 8721479
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8721196 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 8721295  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  8721296 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 8721386  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721387 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8721479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 9073083 - 9073366
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9073083 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 9073182  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  9073183 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 9073273  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073274 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9073366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 10236454 - 10236715
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10236454 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatggtgt--atttatatgatgaactgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 10236551  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||    
T  10236552 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctgcgcacgattta 10236642  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10236643 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10236715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 13316247 - 13316507
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13316247 tgctgctgctgttatttgactaagtgcatg--gtatatttatacgatgaa-tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 13316343  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    |||||         |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13316344 cgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttta 13316434  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316435 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13316507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15350289 - 15350572
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15350289 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 15350388  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  15350389 gcatgttgatatgttgattacgatg---------tttttttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 15350479  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15350480 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15350572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15404535 - 15404818
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15404535 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaatttttggat 15404634  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  15404635 gcatgtcgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 15404725  T
Q  221 tttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15404726 tttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgaatataag 15404818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15825709 - 15825448
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15825709 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 15825612  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  15825611 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 15825521  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15825520 taggagctttgtcctccacatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15825448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 15992163 - 15992424
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15992163 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaactgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 15992260  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  15992261 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 15992351  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992352 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15992424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38814354 - 38814161
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38814354 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 38814258  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814257 tttgtcctccgcatgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 38814161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 41092405 - 41092667
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  41092405 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgattgtgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt 41092494  T
Q  143 acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt- 238  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||     
T  41092495 acgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacgttta 41092593  T
Q  239 -taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41092594 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41092667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19809091 - 19808810
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  19809091 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttattgaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgataaagtttagctccaaattattgaatgc 19808992  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt 222  Q
    ||| |||||||| ||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  19808991 atgttgatatgtcgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 19808901  T
Q  223 tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808900 tgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatgcttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19808810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3833644 - 3833451
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3833644 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 3833548  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3833547 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 3833451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Original strand, 30777265 - 30777558
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30777265 tgttatgtgacttgattatgcttctgctgttatttaaccaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaagttgttggat 30777364  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||        |||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||    
T  30777365 gcatgttgatatgttga--------attacgatgttttgttcatgagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgtttattagaagc 30777456  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtcta 317  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30777457 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtcta 30777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7985793 - 7985487
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  7985793 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 7985696  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||         ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7985695 acgtttagctccaaattattgggtgcatgttgatatg---------atgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 7985606  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7985605 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttttgatgacgatt 7985506  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7985505 ggtaccacatgcatataag 7985487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13321036 - 13320755
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321036 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 13320939  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct 221  Q
    ||| ||||||||||||         ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  13320938 atgttgatatgttgat---------tacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct 13320849  T
Q  222 ttgtcctccgc---acgttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||   || | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320848 ttgtcctccgcacaacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13320755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4710340 - 4710084
Alignment:
Q  52 ctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatga 149  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4710340 ctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatg- 4710242  T
Q  150 ttacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggag 244  Q
            |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  4710241 --------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagctttgtcctctgcacgattattaggag 4710150  T
Q  245 ctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 310  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4710149 ttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 4710084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 23704861 - 23705074
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23704861 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 23704951  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23704952 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23705051  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23705052 gattggtaccacatgcatataag 23705074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 23723317 - 23723530
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23723317 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 23723407  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23723408 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23723507  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23723508 gattggtaccacatgcatataag 23723530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 23741773 - 23741986
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23741773 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 23741863  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23741864 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23741963  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23741964 gattggtaccacatgcatataag 23741986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 41201891 - 41202104
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41201891 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 41201981  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41201982 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 41202081  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41202082 gattggtaccacatgcatataag 41202104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 1598654 - 1598809
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598654 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctcctcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 1598752  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598753 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtagagtc 1598809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Original strand, 5150027 - 5150289
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatt 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  5150027 tgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgatt 5150116  T
Q  143 acgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt- 238  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     
T  5150117 acgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttta 5150215  T
Q  239 -taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5150216 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 5150289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 15366994 - 15367253
Alignment:
Q  50 tgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15366994 tgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgtaggatgcatgttgatatgttgattacgat 15367093  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
              |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15367094 t---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattagg 15367184  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15367185 agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattagtaccacatgcatataag 15367253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19775358 - 19775194
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775358 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 19775259  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  19775258 gctttgtcctcaccacgtttagaagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 19775194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Original strand, 15942079 - 15942233
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15942079 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgata 15942177  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15942178 aagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagt 15942233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16333259 - 16332953
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||    
T  16333259 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gataaataagatg 16333162  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16333161 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 16333072  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333071 agtcctcaccacgattatcaggagttttgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 16332972  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16332971 ggtaccacatgcatataag 16332953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 418003 - 417798
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  418003 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 417913  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417912 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 417813  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  417812 ccacatgcatataag 417798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13250722 - 13250519
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13250722 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 13250632  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250631 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 13250532  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  13250531 ccacatgcatata 13250519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13257368 - 13257165
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13257368 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 13257278  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257277 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 13257178  T
Q  297 ccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||    
T  13257177 ccacatgcatata 13257165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3690622 - 3690417
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3690622 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 3690532  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690531 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 3690432  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  3690431 ccacatgcatataag 3690417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 14673303 - 14673508
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  14673303 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacatagcatatcattgagcttagt 14673393  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673394 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 14673493  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  14673494 ccacatgcatataag 14673508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16696755 - 16696570
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16696755 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgacctttgtcctcaccatgtttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 16696659  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16696658 tttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16696570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 20057507 - 20057712
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20057507 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 20057597  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057598 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 20057697  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  20057698 ccacatgcatataag 20057712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 15727025 - 15727238
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15727025 atgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 15727115  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15727116 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgac 15727215  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15727216 gattggtaccacatgcatataag 15727238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 31422647 - 31422860
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  31422647 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 31422737  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31422738 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 31422837  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31422838 gattggtaccacatgcatataag 31422860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24187836 - 24187566
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24187836 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 24187739  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24187738 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 24187651  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24187650 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcaagtttaaagtatattaacacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24187566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55149037 - 55148767
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  55149037 tgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 55148940  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  55148939 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 55148852  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55148851 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataag 55148767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 5106978 - 5107191
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  5106978 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 5107068  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5107069 agcttagtcctcacaacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 5107168  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5107169 gattggtaccacatgcatataag 5107191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 5426854 - 5427031
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  5426854 tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca 5426953  T
Q  234 cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5426954 cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5427031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20723087 - 20722790
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  20723087 aattgatatattgatatca-tctgttattgtg--acctgactatgctgctgttgttatttaaataagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 20722993  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20722992 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctt 20722904  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20722903 agtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccacacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 20722805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 26794489 - 26794702
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||    
T  26794489 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatttgtgtccatgcatagcatatcattg 26794579  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26794580 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 26794679  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26794680 gattggtaccacatgcatataag 26794702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37615404 - 37615191
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  37615404 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 37615314  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37615313 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 37615214  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37615213 gattggtaccacatgcatataag 37615191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 53380453 - 53380658
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  53380453 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 53380543  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380544 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 53380643  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  53380644 ccacatgcatataag 53380658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 53387105 - 53387310
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  53387105 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 53387195  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387196 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 53387295  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  53387296 ccacatgcatataag 53387310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 298
Target Start/End: Original strand, 15692371 - 15692571
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15692371 atgatgaagtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgat---------tacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 15692461  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15692462 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 15692561  T
Q  289 gattggtacc 298  Q
    ||||||||||    
T  15692562 gattggtacc 15692571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 20064145 - 20064350
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20064145 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 20064235  T
Q  202 cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064236 cctcaccacgaatatgaggagctttgtcctctgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 20064335  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  20064336 ccacatgcatataag 20064350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14670605 - 14670393
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt------ 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||||          
T  14670605 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgttgagttgttgagtt 14670506  T
Q  421 --cttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgttta 518  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14670505 gtcttcaacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgttta 14670406  T
Q  519 acatattgattat 531  Q
      |||||||||||    
T  14670405 tgatattgattat 14670393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 15584870 - 15585038
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta-- 240  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||      
T  15584870 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata 15584969  T
Q  241 ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584970 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15585038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 15591528 - 15591696
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta-- 240  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||      
T  15591528 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttata 15591627  T
Q  241 ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15591628 ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15591696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10325939 - 10325633
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat-atgatgaaatgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  10325939 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaa-gatg 10325841  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||          |||||||  || |||| ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  10325840 acgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgatgattacgatt---------ttttgttgata-gagttcatgcattagcatt-cattgagttt 10325752  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325751 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccacacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 10325652  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10325651 ggtaccacatgcatataag 10325633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6608437 - 6608260
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga----ttaggagctttgtcctccgca 233  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  6608437 tgattacgatgaatacgatgttttgttataaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaatattaggagctttgtcctccgca 6608338  T
Q  234 cgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608337 cgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 6608260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16633806 - 16633628
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16633806 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 16633707  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633706 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16633628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16640416 - 16640238
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16640416 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 16640317  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16640316 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16640238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43161081 - 43160903
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  43161081 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 43160982  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43160981 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 43160903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43167318 - 43167140
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  43167318 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 43167219  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43167218 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 43167140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5221372 - 5221203
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--g 241  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |    
T  5221372 tgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttatag 5221273  T
Q  242 gagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221272 gagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 5221203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10003647 - 10003436
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  10003647 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg 10003557  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10003556 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 10003457  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10003456 gattggtaccacatgcatata 10003436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10010294 - 10010083
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  10010294 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg 10010204  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10010203 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 10010104  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10010103 gattggtaccacatgcatata 10010083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 839305 - 839035
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  839305 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaa-tgcataatgtctatatata--atgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacat 839209  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  839208 tgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcact-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagttttgtcct 839120  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  839119 ccgtacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 839035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Original strand, 16809038 - 16809200
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16809038 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 16809134  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16809135 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16809200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26889466 - 26889254
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  26889466 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 26889377  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26889376 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgac 26889277  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26889276 gattggtaccacatgcatataag 26889254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 1333211 - 1333389
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1333211 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 1333310  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1333311 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1333389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12482385 - 12482216
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  12482385 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 12482286  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12482285 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12482216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48423323 - 48423145
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48423323 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 48423224  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48423223 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 48423145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48430101 - 48429923
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  48430101 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacggaaattaggagctttgtcctccgcac 48430002  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48430001 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 48429923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 311
Target Start/End: Original strand, 10153831 - 10154042
Alignment:
Q  96 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgag 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  10153831 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgag 10153921  T
Q  196 ctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacga 290  Q
    ||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10153922 cttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 10154021  T
Q  291 ttggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10154022 ttggtaccacatgcatataag 10154042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10904237 - 10904026
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  10904237 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg 10904147  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10904146 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgac 10904047  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10904046 gattggtaccacatgcatata 10904026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10910909 - 10910698
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  10910909 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcataacattg 10910819  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10910818 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgac 10910719  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10910718 gattggtaccacatgcatata 10910698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14682127 - 14681915
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||         |||||    
T  14682127 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattgtcatgcatgagttgttaagttgttgacaagttgtcatccatgagttgttaagttgttgagtt 14682028  T
Q  419 gtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgttta 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  14682027 gtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtcta 14681928  T
Q  519 acatattgattat 531  Q
      |||||||||||    
T  14681927 tgatattgattat 14681915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 12852846 - 12853032
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12852846 attggtaccacatgcatataagaggttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagttattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt 12852945  T
Q  389 gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
     |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12852946 aatgaattatcatctttgagtttcttagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 12853032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5201183 - 5201014
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  5201183 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 5201084  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5201083 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgtttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5201014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 10846378 - 10846591
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  10846378 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatctcattg 10846468  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10846469 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgac 10846568  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10846569 gattggtaccacatgcatataag 10846591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16758665 - 16758878
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||         |||||||  || | || |||||||||||| ||||||    
T  16758665 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttg---------ttttgttcatacgtgttcatgcatagcatatcattg 16758755  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16758756 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 16758855  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16758856 gattggtaccacatgcatataag 16758878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 5420455 - 5420624
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  5420455 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatatcatatcattgagcttagtcctcaccacattttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 5420554  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5420555 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5420624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17241918 - 17241751
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  17241918 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagta 17241823  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17241822 tattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 17241751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6598661 - 6598517
Alignment:
Q  172 gtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaa 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||    
T  6598661 gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaa 6598562  T
Q  267 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598561 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6598517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6605341 - 6605197
Alignment:
Q  172 gtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaa 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||    
T  6605341 gtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccacacgattaaa 6605242  T
Q  267 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605241 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6605197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16624149 - 16624362
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||    
T  16624149 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatgtgtgtccatgcatagcatatcattg 16624239  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16624240 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 16624339  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  16624340 gattggtaccacatgcatgtaag 16624362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16747933 - 16748146
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16747933 atgatgaagtttagctctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctg---------ttttgttcatacgtgtccatgcatagcatatcattg 16748023  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    || || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16748024 agtttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 16748123  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16748124 gattggtaccacatgcatataag 16748146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 327 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16796043 - 16795895
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16796043 gtcgcatttgtctagtcgaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttattaatgaattatcatctatgagttgctgagttgtattcta 16795944  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16795943 ctcatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 16795895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15397944 - 15398200
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15397944 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 15398043  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagcttt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||            
T  15398044 gcatgtcgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgttta-------- 15398126  T
Q  224 gtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
                  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15398127 --------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag 15398200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15360756 - 15360551
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcat--gatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15360756 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 15360657  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagc 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||         |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||   ||||||||    
T  15360656 gcatgtcgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacgatttttaggagc 15360566  T
Q  221 tttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  15360565 tttgtcctccgcacg 15360551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15482632 - 15482439
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||| ||  |||||    
T  15482632 tgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agttttgtcctcaccacgatt--ggagc 15482538  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482537 tttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 15482439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 16489774 - 16489970
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||  |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||     |||    
T  16489774 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------tttttgtcataagtgtccatgcatagcatctcatttag-----tcc 16489859  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16489860 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 16489959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15337498 - 15337293
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcat--gatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||   || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15337498 tgttatgtgacttgattatgctactgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacatttagctccaaattgttggat 15337399  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagc 220  Q
    |||||  ||||||||||||||||         |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||   |||||||     
T  15337398 gcatgtcgatatgttgattacga---------tgttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagctttgtcctccgcacgatttttaggagt 15337308  T
Q  221 tttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  15337307 tttgtcctccgcacg 15337293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 311
Target Start/End: Original strand, 22643384 - 22643611
Alignment:
Q  52 ctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgatt 151  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  22643384 ctgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaaatgatgaagtt-agctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg--- 22643479  T
Q  152 acggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtc 251  Q
          |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||                      ||||||||||||||    
T  22643480 ------ttttgttcatacgagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgatta----------------------ttaggagctttgtc 22643551  T
Q  252 ctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22643552 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcgtataag 22643611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 28351181 - 28351387
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  28351181 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgccgttatttagctaagtgcataatgtctatatatatgatgaataagatg 28351280  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||         |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28351281 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatat---------gatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagctt 28351370  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta 215  Q
     ||||||||||||||||    
T  28351371 agtcctcaccacgatta 28351387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 31097733 - 31097884
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  31097733 cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagtcttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa 31097828  T
Q  289 gattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097829 gattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 31097884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 20461644 - 20461841
Alignment:
Q  145 gatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttagga 243  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||| ||  |||    
T  20461644 gatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcgccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--gga 20461738  T
Q  244 gctttgtcctctgcacgatg---aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcg 339  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20461739 gctttgtcctccccacgatgcgtaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcg 20461837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15360596 - 15360500
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360596 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15360500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 327332 - 327506
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||  |||||||        
T  327332 agagtccatgcatgagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccatgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctat 327427  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327428 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 327506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15337338 - 15337242
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15337338 gagctttgtcctccgcacgatttttaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15337242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 297
Target Start/End: Original strand, 16798211 - 16798336
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16798211 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 16798307  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtac 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16798308 tatattaatac-tatgatgacgattggtac 16798336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 30065459 - 30065319
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagtt-gtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaa 481  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  30065459 gttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagtggtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacg---------atgtgaa 30065369  T
Q  482 ttatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  30065368 ttatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 30065319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 7793517 - 7793691
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  7793517 agagtccatgcattagcata-cattgaactttgtcctcagcacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 7793612  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793613 aagtatattaatact-atgataacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 7793691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 2897989 - 2898164
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  2897989 agagtccatgcattagcata-cattgatctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 2898084  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898085 aagtatattaatact-atgatgaagtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 2898164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 26789012 - 26789085
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789012 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 26789085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 28368673 - 28368767
Alignment:
Q  220 ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368673 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28368767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 28376491 - 28376585
Alignment:
Q  220 ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376491 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28376585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 28384313 - 28384407
Alignment:
Q  220 ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384313 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28384407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 4589289 - 4589420
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||        |||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||    
T  4589289 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgat--------tgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattg 4589378  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589379 agctttgtcctccccacgattaggagctttgtcctccgcacg 4589420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 311
Target Start/End: Original strand, 29695943 - 29696008
Alignment:
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695943 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 29696008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 5220580 - 5220483
Alignment:
Q  425 tacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatat 524  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  5220580 tacctaagtgttgttaaagaagtacctatgaagattata---------tgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatat 5220490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Original strand, 26788899 - 26789034
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||         |||||||||  || | ||||||||||||||| | ||||    
T  26788899 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacga---------tgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatattattg 26788989  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26788990 agcttagttctcaccacgtatattaggagctttgtcctccgcacg 26789034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14441104 - 14440975
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc-atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta 448  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||   |  || ||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||     
T  14441104 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatttgtcttctatccatgagttgttgagttgtcttctatccatgtgttgttaataaagtg 14441005  T
Q  449 cctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  14441004 cttatgaagattatacgatgtttatgatgt 14440975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 516
Target Start/End: Original strand, 10543014 - 10543199
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatcta--------tgagttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |        | | |||| ||||||||||||    
T  10543014 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccacgattcgttaaattgttgagttgtcttct 10543113  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| ||||||    |  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  10543114 acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatg-ttatga----agctatatgatgttgattatgatgttgttatgttgtt 10543199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12339397 - 12339324
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  12339397 ttcattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctccgcacgat 12339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14572431 - 14572352
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14572431 aagtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc 14572352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15464814 - 15464723
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  15464814 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagttttgtcctccgcacg--ataggagctttgtcctccgcacgat 15464723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 37440078 - 37440144
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440078 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 37440144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 18700869 - 18700947
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  18700869 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 18700947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Original strand, 49668362 - 49668448
Alignment:
Q  262 tgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49668362 tgaaagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 49668448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 434
Target Start/End: Original strand, 14067291 - 14067352
Alignment:
Q  373 gagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtg 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14067291 gagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagttgtcgagttgtgttctacccatgtg 14067352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 46821974 - 46821921
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46821974 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 46821921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 470
Target Start/End: Original strand, 2842664 - 2842805
Alignment:
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacc 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||||||||||| |    
T  2842664 tcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgtaaagttgttgagttgtcttctatc 2842763  T
Q  429 tatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
     | |||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  2842764 cacgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 2842805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9512752 - 9512669
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512752 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 9512669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9520727 - 9520644
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9520727 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 9520644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 12120166 - 12120220
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12120166 gtcgcatttgttgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtta 12120220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 38962284 - 38962338
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38962284 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcattcatgagttgtta 38962338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13543728 - 13543679
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13543728 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 13543679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 8489628 - 8489694
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8489628 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacg 8489694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Original strand, 11300902 - 11301017
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttttagg 242  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  11300902 tgattaaggtgtcttgttgataagagtccatgcattagcatt-cactgagcttagtcctcaccacgattattaggagttttgtcctccgcacg-attagg 11300999  T
Q  243 agctttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||||||| |||||    
T  11301000 agctttgtcctccgcacg 11301017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32307468 - 32307409
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32307468 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 32307409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11854422 - 11854328
Alignment:
Q  167 taagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcac 259  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11854422 taagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgacgattagcagctttatcctccgcacg-tttaggagctttgtcctccgcac 11854328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14441153 - 14441075
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  14441153 ttgtcgagtcaaagtcgttgtcgatgagttgttatccatgagctgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 14441075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 343
Target Start/End: Original strand, 14577112 - 14577189
Alignment:
Q  267 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  14577112 gtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagacgtctaagatgcataatcgcatttgtcgagtc 14577189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35353414 - 35353361
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  35353414 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 35353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 11557694 - 11557753
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11557694 gattggtaccacatgcatataagagtcttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 11557753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 386
Target Start/End: Original strand, 42353679 - 42353731
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  42353679 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttg 42353731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16103612 - 16103529
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16103612 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagatgtatgagtcccatagtcgcatttgtcgagtcaaag 16103529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5214776 - 5214722
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  5214776 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttattaagttgtc 5214722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 5420324 - 5420386
Alignment:
Q  2 attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5420324 attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactttgctgctgctgttatttaact 5420386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 5426722 - 5426784
Alignment:
Q  2 attgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5426722 attgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 5426784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 519
Target Start/End: Original strand, 11301027 - 11301077
Alignment:
Q  469 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  11301027 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgctgtttaa 11301077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11854233 - 11854183
Alignment:
Q  469 tttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11854233 tttatgatgagaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaa 11854183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 13210654 - 13210712
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13210654 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 13210712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 43890179 - 43890257
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  43890179 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatggattgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgt 43890257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10562532 - 10562479
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  10562532 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttattaagttgt 10562479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11854318 - 11854266
Alignment:
Q  208 cacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacga 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11854318 cacgtttaggagctttgtcctccgcacg-tttaggagctttgtcctccgcacga 11854266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15467667 - 15467602
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttg 353  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15467667 gattggtaccacatacatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcgaagttgttg 15467602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11849111 - 11849056
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11849111 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 11849056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11862589 - 11862534
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11862589 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 11862534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 13520978 - 13521038
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagtt 410  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  13520978 gttgttgatgaattttcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtt 13521038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 1645004 - 1645063
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1645004 gattggtaccacatgcatataagaggtcgaagttgcacagtcgcatttgtcgagtcaaag 1645063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 248
Target Start/End: Original strand, 11300979 - 11301029
Alignment:
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagcttt 248  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11300979 tttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacg-tttaggagcttt 11301029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11854285 - 11854231
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagcttt 248  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11854285 gagctttgtcctccgcacgactaggagctttgtcctccgcacg-tttaggagcttt 11854231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11854309 - 11854243
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  11854309 gagctttgtcctccgcacgtttaggagctttgtcctccgcacg-actaggagctttgtcctccgcacg 11854243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16097156 - 16097097
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16097156 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagttaaag 16097097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15464743 - 15464701
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464743 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacg 15464701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 23083686 - 23083740
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23083686 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 23083740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12172592 - 12172536
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12172592 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattctcgca-ttgtcgagtcaaa 12172536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12482515 - 12482454
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12482515 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 12482454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 14878839 - 14878895
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14878839 attggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 14878895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 15584740 - 15584801
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15584740 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 15584801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 15591398 - 15591459
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15591398 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 15591459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44269453 - 44269408
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  44269453 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 44269408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 387
Target Start/End: Original strand, 19884816 - 19884860
Alignment:
Q  343 caaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  19884816 caaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 19884860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 26196741 - 26196796
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26196741 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtctca-ttgtcgagtcaa 26196796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 11425039 - 11425094
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11425039 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 11425094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 12174581 - 12174640
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  12174581 gattggtaccacatgcatataagaggtataagatgcacagtcgcatttgtcgagtcaaag 12174640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18438331 - 18438276
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18438331 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 18438276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Original strand, 43890228 - 43890356
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagt--------tgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaa 441  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||        ||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43890228 gttgttgacgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagtcgttaatttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttta 43890327  T
Q  442 agaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
     ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  43890328 tgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 43890356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12399004 - 12398950
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  12399004 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 12398950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15565371 - 15565309
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  15565371 gttgttgatgaattgtcatccgtgagttgttaggttgttgatgaattgtcatccacgagttgt 15565309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26683150 - 26683096
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  26683150 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 26683096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43840728 - 43840674
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  43840728 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 43840674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 1333080 - 1333141
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1333080 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 1333141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15565338 - 15565301
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15565338 gttgttgatgaattgtcatccacgagttgttaagttgt 15565301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16633937 - 16633872
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  16633937 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 16633872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16640547 - 16640482
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  16640547 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 16640482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 19726222 - 19726278
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19726222 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 19726278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43161212 - 43161147
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  43161212 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 43161147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 43167449 - 43167384
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  43167449 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 43167384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44494580 - 44494539
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44494580 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 44494539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48423454 - 48423389
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  48423454 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 48423389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48430232 - 48430167
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  48430232 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 48430167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50242636 - 50242595
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50242636 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 50242595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 322388 - 322333
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  322388 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 322333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 855933 - 855889
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  855933 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 855889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6598722 - 6598690
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6598722 gtttagctccaaattattggatgcatgttgata 6598690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6605402 - 6605370
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6605402 gtttagctccaaattattggatgcatgttgata 6605370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14972656 - 14972600
Alignment:
Q  288 cgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  14972656 cgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgttgagtc 14972600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 15878374 - 15878418
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15878374 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 15878418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16369194 - 16369150
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16369194 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 16369150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 470
Target Start/End: Original strand, 18700960 - 18701016
Alignment:
Q  414 gagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||    
T  18700960 gagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgctcatgaagattatatgatgtt 18701016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 23053391 - 23053435
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23053391 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 23053435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 23077780 - 23077824
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  23077780 attggtaccacatgcatatgagaggtctaagttgcattgtcgcat 23077824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23408223 - 23408179
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23408223 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 23408179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 24628725 - 24629249
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  24628725 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 24628824  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628825 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 24628924  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628925 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 24629024  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24629025 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 24629124  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  24629125 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 24629215  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  24629216 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 24629249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27601656 - 27601128
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg------atgaaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  27601656 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatattatgaaa 27601557  T
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601556 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 27601457  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601456 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 27601357  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27601356 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa 27601257  T
Q  395 ttatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt 493  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  27601256 ttatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgtt 27601166  T
Q  494 gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  27601165 gactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 27601128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24649217 - 24648691
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  24649217 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 24649118  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649117 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 24649018  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649017 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 24648918  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24648917 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 24648818  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||    
T  24648817 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 24648727  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24648726 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttggttat 24648691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 27379679 - 27380202
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27379679 aattgatatattgatatctctct-ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 27379777  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379778 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 27379877  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27379878 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtacc 27379977  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27379978 acatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 27380077  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27380078 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 27380168  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  27380169 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 27380202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 27383725 - 27384248
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27383725 aattgatatattgatatctctct-ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 27383823  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383824 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 27383923  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27383924 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtacc 27384023  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27384024 acatgcatataagtgtataagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 27384123  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  27384124 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 27384214  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  27384215 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 27384248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Original strand, 12901758 - 12902196
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg------atgaaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  12901758 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatattatgaaa 12901857  T
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901858 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 12901957  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901958 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 12902057  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12902058 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaa 12902157  T
Q  395 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902158 ttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 12902196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Original strand, 10101891 - 10102370
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg------------ 88  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  10101891 aattgatatattgatatctct--gttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatatatatatt 10101988  T
Q  89 atgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcattt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10101989 atgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcattt 10102088  T
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10102089 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgac 10102188  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10102189 gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtc 10102288  T
Q  389 gatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 469  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102289 gatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgtcgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgt 10102370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31344826 - 31344466
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  31344826 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattagaagctttgtcctccgcacgatt-agaagctttgtcctccgcacgattaaag 31344729  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344728 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 31344629  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31344628 tccatgagttgttaagttgt-gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat 31344530  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  31344529 gtttatgatgtgaactatataaagttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 31344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 30345433 - 30345785
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30345433 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 30345530  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30345531 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 30345630  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30345631 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- 30345727  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  30345728 ------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 30345785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1283029 - 1282716
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283029 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 1282931  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1282930 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctataagttgtcgag 1282831  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1282830 ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtt 1282731  T
Q  517 taacatattgattat 531  Q
    ||| |||||||||||    
T  1282730 taagatattgattat 1282716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 217 - 531
Target Start/End: Original strand, 41531470 - 41531774
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 316  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531470 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtct 41531568  T
Q  317 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531569 aagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgag 41531668  T
Q  417 ttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtt 516  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||    
T  41531669 ttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaaaagattgctatgttgtt 41531759  T
Q  517 taacatattgattat 531  Q
    |||||| ||||||||    
T  41531760 taacatgttgattat 41531774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 30970998 - 30971307
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30970998 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 30971097  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  30971098 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 30971187  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971188 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 30971287  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30971288 tggtaccacatgcatataag 30971307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 21147310 - 21147613
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  21147310 aattgatatattgatatcttcctgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 21147407  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21147408 acgtttagctccaaattattggatgcttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 21147497  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 295  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21147498 agtcctcaccacgattattagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 21147597  T
Q  296 accacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  21147598 accacatgcatataag 21147613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 13970410 - 13970693
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13970410 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 13970509  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  13970510 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 13970600  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970601 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13970693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24714777 - 24714494
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24714777 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 24714678  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  24714677 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 24714587  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714586 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24714494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 45057466 - 45057749
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45057466 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 45057565  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  45057566 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 45057656  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45057657 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 45057749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37318339 - 37318058
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37318339 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaaacgatgacgtttagctccaaattattggatgc 37318240  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt 222  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||         |||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  37318239 atgttgatatgttgattacggtgatt---------tgtgcatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 37318149  T
Q  223 tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37318148 tgtcctccgcatgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatataag 37318058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9784542 - 9784338
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9784542 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttttcttcta 9784443  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||  ||||||    
T  9784442 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagtttatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgccatgttgtctatgatattg 9784343  T
Q  527 attat 531  Q
    |||||    
T  9784342 attat 9784338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 41604773 - 41605056
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41604773 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaactgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 41604872  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  41604873 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 41604963  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41604964 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41605056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 41610670 - 41610953
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41610670 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 41610769  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  41610770 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcataacatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 41610860  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41610861 tttgtcctccgcacgattattagaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41610953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24872426 - 24872660
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24872426 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 24872525  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  24872526 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatga---------tttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 24872615  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872616 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24872660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 24640981 - 24641287
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  24640981 aattgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacctgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 24641078  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  24641079 acgtttagctccaaattattggatgtttattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtgcatgcattagcatt-cattgagctt 24641168  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641169 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgttctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 24641268  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24641269 ggtaccacatgcatataag 24641287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11677535 - 11677229
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  11677535 aattgatatattgacatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 11677438  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11677437 acgtttagctccaaattattggatgcacattgatatgatggttacaatgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 11677348  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677347 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 11677248  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11677247 ggtaccacatgcatataag 11677229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24880311 - 24880545
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24880311 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 24880410  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  24880411 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacaatga---------tttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 24880500  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880501 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttta 24880545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12829082 - 12828869
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12829082 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 12828992  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12828991 agcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatactaatacttatgatgac 12828892  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12828891 gattggtaccacatgcatataag 12828869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 338
Target Start/End: Original strand, 19928638 - 19928826
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19928638 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 19928733  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtc 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19928734 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtctcatttgtc 19928826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 311
Target Start/End: Original strand, 24914063 - 24914274
Alignment:
Q  96 gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgag 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24914063 gatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgag 24914153  T
Q  196 ctttgtcctcaccacgat---taggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacga 290  Q
    ||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24914154 cttagtcctcaccacgatgattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacga 24914253  T
Q  291 ttggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24914254 ttggtaccacatgcatataag 24914274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23171048 - 23170835
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23171048 atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgtccataagagtccatgcatagcatctcattg 23170958  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23170957 agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23170858  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23170857 gattggtaccacatgcatataag 23170835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23582305 - 23582092
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23582305 atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgtccataagagtccatgcatagcatctcattg 23582215  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23582214 agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 23582115  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23582114 gattggtaccacatgcatataag 23582092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16928358 - 16928153
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16928358 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 16928268  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928267 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 16928168  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  16928167 ccacatgcatataag 16928153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16997052 - 16996847
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16997052 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 16996962  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996961 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 16996862  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  16996861 ccacatgcatataag 16996847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17003685 - 17003480
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17003685 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 17003595  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003594 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 17003495  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  17003494 ccacatgcatataag 17003480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 18855595 - 18855779
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18855595 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 18855690  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855691 tttgtcttccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18855779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24503169 - 24502899
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24503169 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 24503072  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||  |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24503071 tgatataatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgat-aggagctttgtcct 24502984  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24502983 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataag 24502899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 22321081 - 22321294
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22321081 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22321171  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22321172 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22321271  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22321272 gattggtaccacatgcatataag 22321294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 22327234 - 22327447
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22327234 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22327324  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22327325 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22327424  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22327425 gattggtaccacatgcatataag 22327447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 60786 - 60602
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  60786 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggaa-tttgtcctccacacgttttaggagc 60691  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60690 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 60602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10873540 - 10873335
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10873540 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 10873450  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873449 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 10873350  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  10873349 ccacatgcatataag 10873335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27599264 - 27599061
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27599264 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 27599174  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599173 tcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 27599074  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  27599073 acatgcatataag 27599061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41666919 - 41666733
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41666919 tgattaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagttttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 41666823  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcattt 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  41666822 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataggaatctaagttgcattgtcgaattt 41666733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 44381343 - 44381520
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  44381343 tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca 44381442  T
Q  234 cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    || ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381443 cgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 44381520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23187045 - 23186861
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  23187045 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttg-aggagc 23186950  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23186949 tttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23186861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1843083 - 1842880
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1843083 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 1842993  T
Q  204 tcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1842992 tcgccacgaatattaggagctttgtcctccgcacattttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 1842893  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  1842892 acatgcatataag 1842880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23598307 - 23598124
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23598307 gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttg-aggagct 23598212  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23598211 ttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 23598124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29233530 - 29233327
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29233530 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 29233440  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233439 tcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtacc 29233340  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  29233339 acatgcatataag 29233327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29346829 - 29346626
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29346829 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagtcc 29346739  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346738 tcaccgcgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtacc 29346639  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  29346638 acatgcatataag 29346626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27617307 - 27617095
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  27617307 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 27617218  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27617217 agcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 27617118  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27617117 gattggtaccacatgcatataag 27617095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9340237 - 9340059
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9340237 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 9340138  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340137 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9340059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9488871 - 9488693
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9488871 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 9488772  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488771 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9608132 - 9607954
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9608132 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 9608033  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608032 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9607954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10866151 - 10865970
Alignment:
Q  134 atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10866151 atgttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctcc 10866053  T
Q  231 gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10866052 gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10865970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16922486 - 16922308
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16922486 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 16922387  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16922386 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16922308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 19490076 - 19490254
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19490076 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 19490175  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19490176 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19490254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26125109 - 26124969
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26125109 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgacgaaagtatattaatacttgtgatgacgatt 26125011  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125010 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 26124969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27216020 - 27215842
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27216020 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 27215921  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215920 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 27215842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 28432064 - 28432242
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28432064 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 28432163  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28432164 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28432242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Original strand, 13306741 - 13306919
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  13306741 tgattacgatgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 13306840  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306841 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13306919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16985898 - 16985720
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16985898 tgattacgatgattatgatgttctgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 16985799  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16985798 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16985720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27369258 - 27369089
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27369258 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 27369159  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27369158 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27369089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 44388013 - 44388190
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  44388013 tgattacgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcataacatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgca 44388112  T
Q  234 cgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    || ||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44388113 cgattattaggagctttatcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 44388190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 26877663 - 26877875
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  26877663 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 26877752  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    || || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26877753 agtttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 26877852  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26877853 gattggtaccacatgcatataag 26877875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27375768 - 27375599
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27375768 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctaaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 27375669  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27375668 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27375599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 22461349 - 22461516
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22461349 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgatat--gagctttgtcctccacacgattaaagta 22461444  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22461445 tattaaaact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 22461516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24735342 - 24735168
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  24735342 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 24735247  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735246 aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 24735168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27196972 - 27196823
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||    
T  27196972 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctat--atatgatgaataagatg 27196875  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgatt 151  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  27196874 acatttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacggtgatt 27196823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 32215396 - 32215474
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32215396 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 32215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 21139292 - 21139376
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 85  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21139292 aattgatatattgatatcttcctgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatatctatatat 21139376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26125155 - 26125067
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26125155 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 26125067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27195606 - 27195533
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27195606 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacaagcatataag 27195533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1283053 - 1282987
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283053 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 1282987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 41531446 - 41531512
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531446 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 41531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17306331 - 17306253
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  17306331 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 17306253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 343
Target Start/End: Original strand, 19691914 - 19691976
Alignment:
Q  282 tgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691914 tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 19691976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 38967138 - 38967084
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38967138 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtta 38967084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10866373 - 10866272
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10866373 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 10866283  T
Q  202 cctcaccacga 212  Q
    |||||||||||    
T  10866282 cctcaccacga 10866272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 24872660 - 24872707
Alignment:
Q  264 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872660 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24872707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 24880545 - 24880592
Alignment:
Q  264 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880545 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24880592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24367500 - 24367446
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgtta 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24367500 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcattcatgagttgtta 24367446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 22134501 - 22134584
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22134501 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagagatttaagttgcatagtcgcatttgtcaagtcaaag 22134584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25175640 - 25175581
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175640 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 25175581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 28653710 - 28653763
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  28653710 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 28653763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36839042 - 36838904
Alignment:
Q  340 agtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttctacctat 431  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||        |||||| ||||||||||||| | |     
T  36839042 agtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcattcatgagttgttaagttgttgagttgtcttctatccac 36838943  T
Q  432 gtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    |||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  36838942 gtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 36838904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24515029 - 24514977
Alignment:
Q  335 tgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  24515029 tgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 24514977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27195653 - 27195581
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgttt 238  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27195653 agagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 27195581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28405808 - 28405721
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattg----gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28405808 aagtatattaatacttattacgttgattggtacgtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 28405721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21327890 - 21327946
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21327890 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21327946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 23020029 - 23020085
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23020029 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 23020085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24673360 - 24673304
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24673360 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 24673304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24679977 - 24679921
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24679977 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 24679921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 311
Target Start/End: Original strand, 30657567 - 30657603
Alignment:
Q  275 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30657567 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 30657603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 38442 - 38496
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38442 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 38496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 19646009 - 19646055
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcat 72  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19646009 tgttatgtgacttgactgtactactgctgttatttaactaagtgcat 19646055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20322441 - 20322387
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20322441 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 20322387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 23072276 - 23072330
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23072276 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 23072330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21318959 - 21319015
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21318959 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttggattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21319015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 22799449 - 22799505
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22799449 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 22799505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27369388 - 27369327
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27369388 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 27369327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27375898 - 27375837
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27375898 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 27375837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 32215445 - 32215482
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32215445 gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 32215482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 44381212 - 44381273
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  44381212 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaact 44381273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22336922 - 22336867
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  22336922 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 22336867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23657633 - 23657575
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  23657633 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacattt-tcgagtcaaag 23657575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24174870 - 24174759
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt-gcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatg 128  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||     
T  24174870 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacat--gatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcata 24174774  T
Q  129 atgatatgttgatta 143  Q
     ||| ||||||||||    
T  24174773 ttgagatgttgatta 24174759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7679408 - 7679366
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7679408 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcg 7679366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 23654713 - 23654767
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  23654713 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 23654767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9340368 - 9340303
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  9340368 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 9340303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9489002 - 9488937
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  9489002 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 9488937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9608263 - 9608198
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  9608263 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 9608198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 13306610 - 13306671
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13306610 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 13306671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16922617 - 16922552
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  16922617 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 16922552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16986029 - 16985968
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16986029 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 16985968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 19489945 - 19490006
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19489945 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 19490006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 24655403 - 24655496
Alignment:
Q  49 ctgctgttatttaactaagt-gcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24655403 ctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacat--gatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatta 24655496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 28431933 - 28431994
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28431933 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaact 28431994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 32215322 - 32215363
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32215322 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 32215363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 44387882 - 44387943
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||||||||||    
T  44387882 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgttgctgttatttaact 44387943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23031169 - 23031125
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23031169 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 23031125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 24716837 - 24716892
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24716837 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 24716892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 40622534 - 40622578
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  40622534 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 40622578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 45678452 - 45678496
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  45678452 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 45678496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 67547 - 68071
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  67547 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 67646  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67647 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 67746  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67747 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 67846  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  67847 acatgcatataagtgtctaagtttcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 67946  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  67947 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 68037  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  68038 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 68071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Original strand, 59556 - 59768
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  59556 atgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcattg 59646  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  59647 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 59746  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  59747 gattggtaccacatgcatataa 59768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 19613 - 19691
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  19613 ttgtcgagttaaagtcgttgttaatgagttgtcatccatgagttgctaatttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 19691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22111791 - 22111267
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22111791 aattgatatattgatatctctttattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 22111692  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111691 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 22111592  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111591 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 22111492  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22111491 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 22111392  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  22111391 catccatgagtttgtcgagttatgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgact 22111301  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22111300 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 22111267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 43251673 - 43251147
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  43251673 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 43251574  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251573 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 43251474  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251473 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 43251374  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43251373 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 43251274  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||    
T  43251273 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattgtac---------gatgtgaattatatgatgttga 43251183  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  43251182 ctaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 43251147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 21972827 - 21973351
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21972827 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 21972926  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972927 gatgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 21973026  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973027 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtttattaatacttatgatgacgattggtacc 21973126  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21973127 acatgcatataagtgtctaagttgcattatcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 21973226  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||     
T  21973227 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgacc 21973317  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21973318 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgtttat 21973351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 21976916 - 21977442
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg----atgaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  21976916 aattgatatattgatatctctctattgctgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaaatg 21977015  T
Q  97 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21977016 atgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagt 21977115  T
Q  197 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977116 tttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 21977215  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21977216 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattatcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 21977315  T
Q  397 atcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttga 495  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  21977316 atcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttgaagaagtacctatgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttga 21977406  T
Q  496 ctaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    | || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  21977407 ccaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 21977442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 21828456 - 21828817
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21828456 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 21828553  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828554 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 21828653  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21828654 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat 21828753  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  21828754 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 21828817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 18863087 - 18863448
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18863087 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 18863184  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863185 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 18863284  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18863285 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat 18863384  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18863385 gtttacgatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 18863448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21410614 - 21410253
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21410614 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 21410517  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21410516 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 21410417  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  21410416 tccatgagttgttaagttgtcgatgatttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgat 21410317  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  21410316 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 21410253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21805106 - 21804745
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21805106 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 21805009  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21805008 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 21804909  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  21804908 tccatgagttgttaagttgtcgatgatttatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgacgattatatgat 21804809  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  21804808 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 21804745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 30940519 - 30940871
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30940519 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 30940616  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940617 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 30940716  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30940717 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac--- 30940813  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  30940814 ------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 30940871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 14398265 - 14398624
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14398265 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaacaagattaggagctttgtcctccacacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 14398362  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398363 tatattaatacatatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaaattgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 14398462  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14398463 tccatgaattgttaagttgttgatgaattatcatc--tgagttgtcgagttgttttctacccatgtgttgttaaagaagtacatatgaagattatacgat 14398560  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  14398561 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 14398624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21387022 - 21386661
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21387022 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgccatccgcacgttt-aggaactttgtcctccgcacaatgaaag 21386925  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386924 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 21386825  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21386824 tccatgagttgttaagttgttgataaattatcatctttgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacttataaagattatacgat 21386725  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| | | ||||||||||| |||||||||||    
T  21386724 gtttatgatgtgaattatatgatactgattataatgttatgatgttgtttaagatattgattat 21386661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19278529 - 19278767
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga------tgaaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||    
T  19278529 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatatattgaaa 19278628  T
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278629 tgatgacgtttagctccaaattattgaatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 19278728  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278729 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgca 19278767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 26935195 - 26935504
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26935195 aattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaaatgatga 26935294  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  26935295 cgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 26935384  T
Q  200 gtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26935385 gtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgat 26935484  T
Q  292 tggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26935485 tggtaccacatgcatataag 26935504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 23845803 - 23846086
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23845803 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 23845902  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  23845903 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 23845993  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23845994 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23846086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15531859 - 15531666
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15531859 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 15531763  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15531762 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 15531666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23913803 - 23913599
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23913803 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttaatttgtcttcta 23913704  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||    
T  23913703 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattacatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattg 23913604  T
Q  527 attat 531  Q
    |||||    
T  23913603 attat 23913599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19905584 - 19905278
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  19905584 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 19905487  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19905486 acgtttagctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 19905397  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19905396 agtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 19905297  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19905296 ggtaccacatgcatataag 19905278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 20023969 - 20024252
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20023969 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaagttgttggat 20024068  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||     
T  20024069 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagt 20024159  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20024160 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacattcatataag 20024252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 24445642 - 24445835
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24445642 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 24445738  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445739 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataactgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 24445835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15538397 - 15538225
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15538397 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacaattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaag 15538300  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538299 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 15538225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 16883267 - 16883480
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16883267 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 16883357  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16883358 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 16883457  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16883458 gattggtaccacatgcatataag 16883480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3216325 - 3216043
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216325 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 3216228  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagc 220  Q
    ||| |||||||||||         |||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||    
T  3216227 atgttgatatgttga---------ttacagtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagc 3216138  T
Q  221 tttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacg-atgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216137 tttgtcctccgcacgacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 3216043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 17828718 - 17828911
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17828718 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattaacatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 17828814  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828815 tttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 17828911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 23847151 - 23847343
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23847151 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 23847246  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23847247 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 23847343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19111228 - 19111017
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19111228 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 19111138  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111137 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 19111038  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtcta 317  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  19111037 ccacatgcatataagagtcta 19111017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19117519 - 19117308
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19117519 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 19117429  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19117428 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 19117329  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtcta 317  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  19117328 ccacatgcatataagagtcta 19117308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20527508 - 20527215
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20527508 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 20527411  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20527410 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 20527323  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcat 325  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  20527322 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcat 20527224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18865332 - 18865127
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18865332 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 18865242  T
Q  202 cctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18865241 cctcaccacgtttattaggagctttgtccttcgcacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 18865142  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||| |||||    
T  18865141 ccacatgcacataag 18865127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32598609 - 32598463
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32598609 ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 32598511  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32598510 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 32598463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32605141 - 32604995
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32605141 ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 32605043  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32605042 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 32604995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 17055517 - 17055700
Alignment:
Q  149 attacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctt 247  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17055517 attaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctt 17055613  T
Q  248 tgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  17055614 tgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatacaggagtctaagttgcattgtcgcatt 17055700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 17669665 - 17669878
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  17669665 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17669755  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17669756 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 17669855  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17669856 gattggtaccacatgcatataag 17669878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19496367 - 19496186
Alignment:
Q  134 atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19496367 atgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc 19496269  T
Q  231 gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496268 gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19496186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19498415 - 19498234
Alignment:
Q  134 atgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctcc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19498415 atgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctcc 19498317  T
Q  231 gcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498316 gcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19498234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29123089 - 29122884
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  29123089 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattaca---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagt 29122999  T
Q  202 cctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29122998 cctcaccacatttattaggagctttgtcctccgcacgttttatagtagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 29122899  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  29122898 ccacatgcatataag 29122884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22047947 - 22047742
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22047947 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 22047857  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047856 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 22047757  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  22047756 ccacatgcatataag 22047742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 22115824 - 22116030
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22115824 gtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgtccataagagtccatgcatagcatctcattgagcttggt 22115915  T
Q  202 cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115916 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 22116015  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  22116016 ccacatgcatataag 22116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Original strand, 30308910 - 30309073
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30308910 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgttt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 30309006  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30309007 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 30309073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 8354869 - 8355074
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         || ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8354869 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttctgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagcttagt 8354959  T
Q  202 cctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8354960 cctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggca 8355059  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  8355060 ccacatgcatataag 8355074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 17676317 - 17676530
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  17676317 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 17676407  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17676408 agcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 17676507  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17676508 gattggtaccacatgcatataag 17676530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22083841 - 22083628
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22083841 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 22083751  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22083750 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 22083651  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22083650 gattggtaccacatgcatataag 22083628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 5534534 - 5534747
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||          |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  5534534 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgata---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 5534624  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5534625 aacttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 5534724  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5534725 gattggtaccacatgcatataag 5534747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28454725 - 28454547
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28454725 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 28454626  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454625 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28454547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 22124624 - 22124838
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22124624 atgatgaagtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgtccataagagtccatgcatagcatctcattg 22124715  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22124716 agcttagtcctcaccacgattattaggagatttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgac 22124815  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  22124816 gattggtaccacgtgcatataag 22124838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20013959 - 20014171
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20013959 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20014048  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20014049 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20014148  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20014149 gattggtaccacatgcatataag 20014171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 20020036 - 20020248
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20020036 atgatgaagtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 20020125  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20020126 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 20020225  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20020226 gattggtaccacatgcatataag 20020248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 22123490 - 22123694
Alignment:
Q  104 ttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||        |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  22123490 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttt--------ttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattgagctcagtcc 22123581  T
Q  204 tcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123582 tcaccacgaataataggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 22123681  T
Q  299 acatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||    
T  22123682 acatgcatataag 22123694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22044832 - 22044662
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22044832 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcgtcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 22044737  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044736 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 22044662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 21915665 - 21915877
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          ||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||  |||||    
T  21915665 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt----------gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcataccattg 21915754  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21915755 agcttagtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 21915854  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21915855 gattggtaccacatgcatataag 21915877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15440476 - 15440362
Alignment:
Q  227 ctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15440476 ctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt 15440378  T
Q  327 gtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||    
T  15440377 gtcgcatttgtcgagt 15440362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 342
Target Start/End: Original strand, 16231633 - 16231802
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16231633 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 16231728  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231729 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 16231802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23834141 - 23833951
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  23834141 tgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttttcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagc 23834047  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23834046 tttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 23833951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 327 - 478
Target Start/End: Original strand, 44385220 - 44385372
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44385220 gtcgcatttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaattatcattcatgagttgttaagttgttaatgaattatcatctatgtgttgttgagttgtcttcta 44385319  T
Q  427 cctatgtgttgttaaa-gaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    || ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44385320 cccatgtgttattaaagggagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt 44385372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18065287 - 18065120
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgttt-ttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt-- 238  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||      
T  18065287 atgattacgatgttttggttattaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattat 18065188  T
Q  239 taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 306  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18065187 taggagatttgtcctccgcacgattaaagtatatttatatttatgatgacgattggtaccacatgcat 18065120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18854945 - 18854759
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18854945 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 18854855  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    ||||| |||||||||||| |||                      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854854 agcttagtcctcaccacgttta----------------------ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 18854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 449
Target Start/End: Original strand, 16413760 - 16413875
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  16413760 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatacatgagttattaagttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcttctatccatgt 16413859  T
Q  434 gttgttaaagaagtac 449  Q
    || ||||| |||||||    
T  16413860 gtagttaatgaagtac 16413875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Original strand, 19278727 - 19278843
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgca-cgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac-atgcatataagtgt 314  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19278727 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcaacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaatgcatataaatgt 19278825  T
Q  315 ctaagttgcattgtcgca 332  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19278826 ctaagttgcattgtcgca 19278843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 32121529 - 32121451
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32121529 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgaggaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 32121451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 458 - 531
Target Start/End: Original strand, 15923992 - 15924065
Alignment:
Q  458 attatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15923992 attatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgaccaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 15924065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5760237 - 5760109
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc-atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagta 448  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||   ||  || ||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| |||||     
T  5760237 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgagttatcttctatccatgagttgtt-agttgtcttctatccatgtgttgttaatgaagtg 5760139  T
Q  449 cctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  5760138 cttatgaagattatacgatgtttatgatgt 5760109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 20705908 - 20705955
Alignment:
Q  264 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20705908 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20705955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21673438 - 21673379
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21673438 gattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag 21673379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 42819107 - 42819185
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  42819107 ttgtcgagtccaagttgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 42819185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6520153 - 6520094
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6520153 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgtatttgtcgagtcaaag 6520094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 23761176 - 23761235
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23761176 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 23761235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16184514 - 16184469
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16184514 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcattgtcgcatt 16184469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21383584 - 21383543
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21383584 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagttttgtcct 21383543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24755552 - 24755496
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24755552 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 24755496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 30643612 - 30643668
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30643612 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 30643668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18833161 - 18833089
Alignment:
Q  340 agtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18833161 agtcaaagttgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgacgagttgtcatccatgagttgt 18833089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 20466365 - 20466420
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20466365 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 20466420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 341
Target Start/End: Original strand, 21389777 - 21389829
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 341  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21389777 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgag 21389829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 341
Target Start/End: Original strand, 21779103 - 21779155
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 341  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21779103 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgag 21779155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22874866 - 22874807
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22874866 gattggtaccacatgcatataagaggtctatgttgcatagtctcatttgtcgagtcaaag 22874807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 38855549 - 38855608
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38855549 gattagtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtggagtcaaag 38855608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21249179 - 21249125
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21249179 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 21249125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21255017 - 21254963
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21255017 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 21254963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31971095 - 31971041
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31971095 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 31971041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18065417 - 18065356
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18065417 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 18065356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21162383 - 21162439
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21162383 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 21162439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32121480 - 32121443
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32121480 gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 32121443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 16092620 - 16092675
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16092620 gattggtaccacatgcatataacatgtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 16092675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23913970 - 23913931
Alignment:
Q  190 attgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23913970 attgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctc 23913931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 26355993 - 26356052
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26355993 gattggtaccacatgcatacaagaggtttaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 26356052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 28649328 - 28649383
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  28649328 gattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcataattgcatttgttgagtc 28649383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7372574 - 7372520
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  7372574 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 7372520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20536004 - 20535950
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  20536004 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 20535950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 21919281 - 21919335
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  21919281 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 21919335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23914016 - 23913978
Alignment:
Q  191 ttgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23914016 ttgagctttgtcctcaccacgattttgagctttgtcctc 23913978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 45131323 - 45131377
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  45131323 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcattcgtcgagtc 45131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 5866601 - 5866654
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  5866601 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttatcgagt 5866654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 18818734 - 18818787
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  18818734 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagt 18818787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 21169060 - 21169112
Alignment:
Q  294 gtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21169060 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 21169112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21673495 - 21673458
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21673495 gattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcat 21673458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 25484659 - 25484700
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25484659 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagtcg 25484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 377066 - 377022
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  377066 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 377022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17140708 - 17140653
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagt--gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17140708 attggtaccacatgcatataaagaggtctaagttgcatcgttgcatttgtcgagtc 17140653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 17927025 - 17927080
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17927025 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaa 17927080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 22873590 - 22873634
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22873590 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 22873634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 329
Target Start/End: Original strand, 23777158 - 23777198
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23777158 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtc 23777198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 58965 - 59489
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatg--atgaaatgat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  58965 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaaatgat 59064  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  59065 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcttttcattgagctt 59164  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  59165 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtatc 59264  T
Q  299 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattat 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  59265 acatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattat 59364  T
Q  399 catctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgact 497  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||     
T  59365 catccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgatgattatac---------gatgtgaattatatgatgttgacc 59455  T
Q  498 aagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    || ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  59456 aaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 59489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13574 - 13313
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13574 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 13477  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  13476 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 13386  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13385 taggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7049 - 6788
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7049 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 6952  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  6951 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 6861  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6860 taggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23102 - 22841
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23102 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 23005  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  23004 cggtgatt---------tgtccataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 22914  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22913 taggagccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 57108 - 56828
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  57108 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--acgaataagatgacgtttaactccaaattattggatg 57011  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagct 221  Q
    ||||        |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  57010 catg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagct 56920  T
Q  222 ttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56919 ttgtcctccgcatgtttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 56828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41578 - 41321
Alignment:
Q  49 ctgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||| |||    
T  41578 ctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgta--acgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatg--------ttgattaggat 41489  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--tagg 242  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  41488 gattacg-tgttttgttgtttagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcatgtttattagg 41390  T
Q  243 agctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389 agctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 67511 - 67307
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         ||||||  | | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  67511 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgtcat-atgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 67422  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67421 cctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 67322  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  67321 ccacatgcatataag 67307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 132528 - 132445
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  132528 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 132445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 65774 - 66293
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65774 aattgatatattgatatctctctgttgctgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaaatgatga 65873  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  65874 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttt 65971  T
Q  200 gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65972 gtcctcaccacaattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagcattgtctcccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 66070  T
Q  300 catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  66071 catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgtttatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatc 66170  T
Q  400 atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  66171 atccatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa 66261  T
Q  500 gatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  66262 gatgttgctatgttgtttaacatgttgattat 66293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 61858 - 62377
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61858 aattgatatattgatatctctcttttgttgtgttacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaaatgatga 61957  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  61958 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttt 62055  T
Q  200 gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62056 gtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcatgatt-aggagcattgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtacca 62154  T
Q  300 catgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatc 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62155 catgcataaaagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgattcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatc 62254  T
Q  400 atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
    ||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  62255 atacatgagtcgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtagctacgaagattatac---------gatgtgaattatatgatgttgactaa 62345  T
Q  500 gatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  62346 gatgttgctatgttgtttaacatgttgattat 62377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 80305 - 79870
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  80305 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgataatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattga 80206  T
Q  195 gctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80205 gctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 80107  T
Q  295 taccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  80106 taccacatgcatataagtgtctaaattgcattgtcgcatatgtcaagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccataagttgttaagttgtcgatgaa 80007  T
Q  395 ttatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgtt 493  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  80006 ttatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacctatgtgttattaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatggtgtt 79907  T
Q  494 gactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  79906 gactaagatgttgctatgtcgtttaacatgttgatta 79870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 105981 - 106194
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  105981 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattg 106071  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106072 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 106171  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  106172 gattggaactacatgcatataag 106194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 126216 - 126428
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  126216 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagaccatgcatagcatctcattg 126306  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg--attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 289  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  126307 agcttagtccttaccacattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 126406  T
Q  290 attggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  126407 attggtaccgcatgcatataag 126428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10523 - 10479
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  10523 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 10479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 433
Target Start/End: Original strand, 4121 - 4549
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4121 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgaagtctataaatatgatgaaatgatga 4220  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4221 cgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcatagcatatcattgagcttag 4312  T
Q  201 tcctcaccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4313 tcctcaccacgattttttaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 4412  T
Q  297 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4413 ccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaatt 4512  T
Q  397 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4513 atcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 11)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 193 - 531
Target Start/End: Original strand, 36431 - 36767
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36431 gagctttgtcctccgcacgat-aggagctttgtcctctgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 36528  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36529 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatg 36628  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36629 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatga 36728  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36729 tgactaagatgttgctatgttgtttaacatattgattat 36767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26677 - 26424
Alignment:
Q  54 gttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgatta 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| || ||||| ||    
T  26677 gttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgaatatgatgacta 26588  T
Q  153 cggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt---aggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctt 247  Q
    || |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26587 cgatgttttgttcataagattccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgatttttaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctt 26488  T
Q  248 tgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26487 tgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgataacgattggtaccacatgcatataag 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Original strand, 38977 - 39140
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  38977 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccacacgattaaagta 39075  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39076 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcactatcgcatt 39140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Original strand, 11460 - 11623
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  11460 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgttttaggagttttatcctccgcaggattaaagta 11558  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11559 tattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 11623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6891 - 6746
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6891 ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgtttcag-agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 6794  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6793 acgattggtaccacatgcatataagtgtccaagttgcattgtcgcatt 6746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43377 - 43146
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43377 tgttatgtgacttgactatgctgctactgttatttaactaagtgcaatatgtctatacat--gatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggaagc 43280  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagc 220  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||          |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||    
T  43279 atgttgatatgttgatcacggtga----------ttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagc 43191  T
Q  221 tttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  43190 tttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgat 43146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Original strand, 36361 - 36472
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  36361 tgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgtttaggagctttgtcctccgcacg--ataggagc 36457  T
Q  246 tttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||||||||||    
T  36458 tttgtcctctgcacg 36472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43143 - 43041
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatg-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43143 attaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgaacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 43044  T
Q  308 taa 310  Q
    |||    
T  43043 taa 43041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Original strand, 1063 - 1137
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  1063 cgagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattaccatccatgagttgt 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43171 - 43118
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacg---ttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  43171 attaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgat 43118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1145
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1108 gttgttgatgaattaccatccatgagttgttaagttgt 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 36528 - 36889
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36528 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 36625  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36626 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 36725  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36726 tccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgat 36825  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||    
T  36826 gtttatgatatgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattgattat 36889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53504 - 53330
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  53504 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 53409  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408 aagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 53330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 169 - 499
Target Start/End: Original strand, 189819 - 190148
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  189819 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaag 189916  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  189917 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattataa 190016  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgat 467  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  190017 tccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcttcccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgat 190116  T
Q  468 gtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  190117 atttatgatgtgaattatataaagttgactaa 190148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 25127 - 25299
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25127 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgttctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctcagcacgattaaag 25223  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25224 tatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcattgtcgcatttgtctagtc 25299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 347
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5071
Alignment:
Q  298 cacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5021 cacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgttgagtcaaag 5071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 1
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatga--tgaaatgat 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  310 aattaatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgat 211  T
Q  99 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 gacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatttcattgagctt 111  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 11  T
Q  299 acatgcatat 308  Q
    ||||||||||    
T  10 acatgcatat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 193 - 530
Target Start/End: Original strand, 208054 - 208390
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208054 gagctttatcctccgcacgattaagagctttgtcctccgcgcgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 208152  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  208153 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatg 208252  T
Q  393 aattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  208253 aattatcatctatgagttgtcgacttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatatttatgatgtgaattatataaagt 208352  T
Q  493 tgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  208353 tgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgatta 208390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Original strand, 208006 - 208090
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  208006 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatttggagctttatcctccgcacg-attaagagctttgtcctc 208090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 33102 - 33456
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33102 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgataaaag 33200  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33201 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatatgtcgagtcaaggtcgttgttgatgaattatca 33300  T
Q  368 tccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacga 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33301 tccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtgttctacccatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatac-- 33398  T
Q  467 tgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
           |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  33399 -------gatgtgaattatatgatgttgactaaaatattgctatgttgtttaacatgttgattat 33456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 187 - 531
Target Start/End: Original strand, 14547 - 14881
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14547 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 14645  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14646 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttg 14745  T
Q  387 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattata 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||         |||| |||||||||||||    
T  14746 tcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagat---------tttacgatgtgaattata 14836  T
Q  487 tgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14837 tgatgttgactaaattattgctatgttgtttaacatgttgattat 14881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38044 - 37838
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38044 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 37954  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcc-tccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 295  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37953 cctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 37854  T
Q  296 accacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  37853 accacatgcatataag 37838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 169 - 531
Target Start/End: Original strand, 20621 - 20986
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20621 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcatcaccatgattaggagctttgtcctccacacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 20718  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20719 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagttgttgttgatgaattatca 20818  T
Q  368 tccaagagttgttaag--ttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgtt--aaagaagtacctacgaagattata 463  Q
    |||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20819 tccatgagttgttaagtttttttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaaaagaagtacctatgaagattata 20918  T
Q  464 cgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||    
T  20919 tgatgtttatgacgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtatatgatattgattat 20986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 238 - 531
Target Start/End: Original strand, 1 - 295
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt 100  T
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgag-ttgtcgagttgtcttctacctatgtgtt 436  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  101 cgagtcaaggtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattatcatccatgagtttgtcgagttgtcttctacccatgtgtt 200  T
Q  437 gttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  201 gttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttacgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctgtgttgtttaagatattgattat 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 238 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 9473 - 9179
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgt 9374  T
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  9373 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatccaagaattgtcgagctgtcttatacctaagtgttg 9274  T
Q  438 ttaaagaagtacctacgaag-attatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  9273 ttaaagaagtacctatgaagaattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 9179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8260 - 8201
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatga 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8260 ttgtcgagtctaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatga 8201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 238 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11592 - 11299
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttg 336  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11592 ttaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttg 11493  T
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgtt 436  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  11492 ttgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctacgagttgtcgagttgtcttctacccatgtctt 11393  T
Q  437 gttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||    
T  11392 gttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatattgctatg-tgtttaagatattgattat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11618 - 11570
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11618 ttcattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacg 11570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 256 - 490
Target Start/End: Original strand, 73822 - 74056
Alignment:
Q  256 gcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgtt 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73822 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgtt 73921  T
Q  356 gatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacga 455  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  73922 gatgaattatcatccatgagttgttcagttgttgatgaattatcatctaagagttgtcgagttgtcttctacctaagtgttgttaaagaagtacctatga 74021  T
Q  456 agattatacgatgtttatgatgtgaattatatgat 490  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  74022 agattatacgatgtttaagatgtgaattatatgat 74056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9426 - 9098
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | | ||||    
T  9426 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgcataagatg 9329  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9328 acgtttagatccaaattattagatgcttattgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctt 9240  T
Q  199 tgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9239 agtcctcaccacgattaataggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 9140  T
Q  293 ggtaccacatgcatat-aagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  9139 ggtaccacatgcatataaagagtctaag-agcattgtcgcatt 9098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 2850 - 3001
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2850 cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaata-ttatgatgac 2945  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2946 gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Original strand, 81468 - 81552
Alignment:
Q  257 cacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81468 cacgattaaagtatattaatact-atgatgaagattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 81552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 327 - 531
Target Start/End: Original strand, 6465 - 6669
Alignment:
Q  327 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttcta 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6465 gtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattatcatctatgagttgttgagttgtcttcta 6564  T
Q  427 cctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||    
T  6565 cccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatatgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtctatgatattg 6664  T
Q  527 attat 531  Q
    |||||    
T  6665 attat 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 71017 - 70804
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  71017 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgat--aggagttttgtcctccgcacgattaaag 70921  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  70920 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtctaagtcgttgttgatgaattatca 70821  T
Q  368 tccaagagttgttaagt 384  Q
    || | ||||||||||||    
T  70820 tctatgagttgttaagt 70804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56976 - 56771
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  56976 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 56886  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56885 cctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 56786  T
Q  297 ccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||    
T  56785 ccacatgcatataag 56771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 139681 - 139496
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  139681 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgttt-ggagctttgtcctccgcacgttt-aggtgc 139586  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcattt 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139585 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcattt 139496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 101018 - 100849
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  101018 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatc-ggagctttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaag 100923  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  100922 tatattaatact-attatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtc 100849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12489 - 12228
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12489 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 12392  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  12391 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 12301  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 74061 - 73778
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatg--atgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 123  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  74061 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggat 73962  T
Q  124 gcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  73961 gcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagc 73871  T
Q  221 tttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73870 tttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 73778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 228507 - 228700
Alignment:
Q  145 gatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttagga 243  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |   |||    
T  228507 gatgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctatgtcctcaccacgatttg-agctttg-cctcaccacgatc--gga 228600  T
Q  244 gctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  228601 gctttgtcctctacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 228699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 192 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29477 - 29259
Alignment:
Q  192 tgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29477 tgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatact-atgatgaagat 29381  T
Q  292 tggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcga 390  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  29380 tggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattattatccatgagttgttaagttgttga 29281  T
Q  391 tgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  29280 tgaattatcatccatgagttgt 29259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29288 - 29251
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29288 gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 29251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 19619 - 19901
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 124  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19619 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatg 19716  T
Q  125 catgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagct 221  Q
    ||||        |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  19717 catg--------ttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct 19808  T
Q  222 ttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    || ||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19809 ttatcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 78277 - 77998
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78277 tgttatgtgacttgattatgctgctgttgttatttaactaagtgcatattgt--attcatacgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 78180  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctt 222  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  78179 atgttgatatgttgattacggtgatt---------tgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 78089  T
Q  223 tgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78088 tgtcctccgcacgatttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 77998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 60832 - 61006
Alignment:
Q  49 ctgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||         |||    
T  60832 ctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatat---------gat 60920  T
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  60921 gattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccatga-taggagctttgtcctccgcacg 61006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 69588 - 69544
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  69588 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 69544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 169 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6629 - 6431
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6629 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgat-aggagctttgtcctccgcacgatt-aggagctttgtcctccgcacgattaaag 6533  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6532 tatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatca 6433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 471 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 6419 - 6371
Alignment:
Q  471 tatgatgtgaattatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaa 519  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6419 tatgatgtgaattatataatgctgactaagatgttgctatgttgtttaa 6371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 319
Target Start/End: Original strand, 3717 - 4004
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctat--atatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatg 128  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3717 tgtgacttgattatgctgctgctgttgtttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatg 3816  T
Q  129 atgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgt 225  Q
     |||||||||||||||||||         |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||    
T  3817 ttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagagtccatgcatagcatttcattgagcttagtcctcaccacatttattaggagctttgt 3907  T
Q  226 cctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat-aagtgtctaag 319  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3908 cctccgcacgattattaggagctttgtcctccgtacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaag 4004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 16799 - 16985
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16799 tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagttttgtcctccgcacgttttaggagc 16896  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116620
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  116673 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgt 116620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 407 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 116625 - 116585
Alignment:
Q  407 agttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagt 447  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  116625 agttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagt 116585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9637
Alignment:
Q  44 tgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgatta 143  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9897 tgctgctgctgttatttaacttagtgcatagtgt--atttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatta 9800  T
Q  144 cgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta 240  Q
    || |||||         ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  9799 cggtgatt---------tgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 9709  T
Q  241 --ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 310  Q
      |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9708 taggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 9637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15307 - 15121
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 15210  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15209 tttgtcctccgcacgattaaagtatgttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 8875 - 9177
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8875 aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgaccgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatga 8969  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  8970 cgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctta 9059  T
Q  200 gtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattg 293  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9060 gtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 9159  T
Q  294 gtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9160 gtaccacatgcatataag 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 17435 - 17487
Alignment:
Q  294 gtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17435 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattatcgca-ttgtcgagtcaaa 17487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8071 - 7858
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8071 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 7981  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7980 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 7881  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7880 gattggtaccacatgcatataag 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 169 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 62210 - 62045
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  62210 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaag 62112  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62111 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 62045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 72993 - 73206
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  72993 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 73083  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  73084 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 73183  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  73184 gattggtaccacatgcatataag 73206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30538 - 30324
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaa-ttattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcatt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| |||||    
T  30538 atgatgaagtttagctccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcatt 30448  T
Q  193 gagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatga 287  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30447 gagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatga 30348  T
Q  288 cgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30347 cgattggtaccacatgcatataag 30324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12852 - 12680
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  |||| |||||||||  |||||| ||||    
T  12852 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagttttgtcctccccacgattaaag 12757  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756 tatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 12680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19136 - 18964
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19136 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgattaaag 19041  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19040 tatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcgtttgtcgagtc 18964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 307108 - 306895
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  307108 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacg---------gtgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattg 307018  T
Q  194 agctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  307017 agcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 306918  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  306917 gattggtaccacatgcatataag 306895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 281219 - 281263
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  281219 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 281263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9390 - 9198
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9390 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 9295  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9294 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 9198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13008 - 12963
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13008 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcatagttgcatt 12963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9688
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9873 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 9777  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9776 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 9688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4316 - 4263
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4316 gattggtaccacatgcataagag-gtctaagttgcatagtcgcatatgtcgagtc 4263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 343
Target Start/End: Original strand, 77307 - 77500
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  77307 tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 77403  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  77404 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgttgca-ttgtcgagtc 77500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18030 - 17986
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18030 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 17986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 5)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 1149 - 1362
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1149 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatg---------ttttgttcataagtgtccatgcatagcatctcattg 1239  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1240 agcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 1339  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1340 gattggtaccacatgcatataag 1362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10313 - 10135
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10313 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 10214  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10213 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56735 - 56557
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  56735 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagttttgtcctccgcac 56636  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56635 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 56557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10444 - 10379
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  10444 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 56866 - 56801
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  56866 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 56801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9283 - 9121
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9283 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagta 9186  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9185 ttttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatt 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1661
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1846 tgattaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 1750  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1749 cttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagagtctaagttgcattgtcgcatt 1661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 15031 - 15090
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15031 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 15090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 242116 - 241846
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  242116 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatat 242019  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  242018 tgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccatgat-aggagctttgtcct 241931  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241930 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 241846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23185 - 22995
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  23185 tgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgatc-ggagctttgtcctccacacggt--aggagc 23091  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23090 tttgtcctccacacgattaaagtatattaattct-atgatgacgattggcaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 22995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 129695 - 129636
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  129695 gattggtaccacattcatataagaggtctaagttgcatagtttcatttgtcgagtcaaag 129636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 15035 - 15316
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15035 tgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactatgtgcataatgtctatatat--gatgaaatgatgatgtttagctccaaattattggatgc 15132  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt----aggagc 220  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||         ||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  15133 atattgatatgttgattatggtgatt---------tgttcataagagttcatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagc 15222  T
Q  221 tttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223 tttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 16672 - 16716
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16672 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 63815 - 63632
Alignment:
Q  156 tgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctc 254  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  63815 tgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacattt-aggagctttttcctc 63720  T
Q  255 tgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63719 cgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 63632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 35241 - 35297
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35241 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 35297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 311
Target Start/End: Original strand, 9911 - 10124
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  9911 atgatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatg---------ttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattg 10001  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10002 agcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 10101  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10102 gattggtaccacatgcatataag 10124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10543
Alignment:
Q  383 gttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395 gttgttgatgaattatcatctgtgagttgtcgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgtttatgatgtgaat 10494  T
Q  483 tatatgatgttgactaagatgatgttatgttgtttaacatattgattat 531  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  10495 tatatgatgttgactaagatgttgctatgttgtttaagatattgattat 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 10237 - 10414
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  10237 cattgatctttgtcctcaccacgatc-ggagccttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgaa 10332  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10333 gattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgatgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatc 10414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36277 - 36093
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36277 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatacattagcatt-cattgagctttgtcctcgccatg-ttaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 36182  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36181 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 7)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8469 - 8285
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8469 tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagc 8373  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8372 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatataa-agtctaagttgcattgtcgcatt 8285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15544 - 15405
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15544 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt-aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 15446  T
Q  293 ggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15445 gatagcacatgcatataa-agtctaagttgcattgtcgcatt 15405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15613 - 15502
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15613 tgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagc 15517  T
Q  246 tttgtcctctgcacg 260  Q
    ||||||||| |||||    
T  15516 tttgtcctccgcacg 15502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 20010 - 20088
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  20010 ttgtcgagtgaaagtcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 20088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7134 - 7093
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7134 cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 7093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14253 - 14212
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  14253 cgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32240 - 32196
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32240 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 32196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10263 - 9957
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | ||||    
T  10263 aattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctcttatttaactaagtgcataaggtctatatat--gatgaataagatg 10166  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||         ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10165 acgtttatctccaaattattggatgcatattgatatg---------atgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagctt 10076  T
Q  199 tgtcctcaccacgattag---gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 292  Q
     ||| |||| |||||||    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10075 agtcttcacgacgattattacgagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 9976  T
Q  293 ggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9975 ggtaccacatgcatataag 9957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 309
Target Start/End: Original strand, 32460 - 32636
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  32460 tgattacgatgaatacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcac 32559  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32560 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 32636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 14587 - 14858
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  14587 tgtgacttgactatggtgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacat 14684  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    |||||||         |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  14685 tgatatg---------atgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtccttaccacgat-aggagctttgtcat 14773  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14774 ccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28990 - 28799
Alignment:
Q  192 tgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgat 291  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28990 tgagctttctcctccgcatgattaggagctttgtcctc---acgatt-aggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatact-atgatgaagat 28896  T
Q  292 tggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28895 tggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcaatgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 28799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1847 - 1684
Alignment:
Q  171 agtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagta 269  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  1847 agtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccacacgttttaggagttttatcctccgcaggattaaagta 1749  T
Q  270 tattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1748 tattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6561
Alignment:
Q  187 ttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6416 ttcattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccacacgtttcag-agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatg 6513  T
Q  287 acgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6514 acgattggtaccacatgcatataagtgtccaagttgcattgtcgcatt 6561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10738 - 10664
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  10738 cgagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgaattaccatccatgagttgt 10664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10693 - 10656
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10693 gttgttgatgaattaccatccatgagttgttaagttgt 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 326
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6313
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  6136 tgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctctacaagttttaggagc 6232  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt 326  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6233 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 8219 - 8312
Alignment:
Q  233 acgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt 326  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219 acgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatt 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 25131 - 25318
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagt--gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25131 attggtaccacatgcatataagtaggttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 25230  T
Q  388 cgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
      ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25231 taatgaattatcatctacgagttgctgagttgtattctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 25318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 8126 - 8312
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtc 388  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8126 attggtaccacatgcatataagaggttttggttgcattgttgcatttgtcgagtcaaagtcattgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtt 8225  T
Q  389 gatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
     |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8226 aatgaattatcatctttgagttgctaagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38658 - 38480
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  38658 tgattacgatgattatgatgttttgttcatatgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcac 38559  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38558 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 38480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 38789 - 38724
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagt 68  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  38789 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagt 38724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 311
Target Start/End: Original strand, 76768 - 76974
Alignment:
Q  102 gtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  76768 gtttagctccaaattattggatgcatg--------ttgattacgatgattacg-tgttctgttcataagtgtccatgcatagcatatcattgagcttagt 76858  T
Q  202 cctcaccacga---ttaggagctttgtcc-tccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 295  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76859 cctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggt 76958  T
Q  296 accacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  76959 accacatgcatataag 76974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 139077 - 138865
Alignment:
Q  94 atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattg 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||         |||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  139077 atgatgaagtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttg---------ttttgttcctatgtgtccatgcatagcatatcattg 138987  T
Q  194 agctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcacgtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  138986 agctttgtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgac 138887  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  138886 gattggtaccacatgcatataa 138865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 193300 - 193344
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  193300 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 193344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 337 - 153
Alignment:
Q  148 gattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagct 246  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  337 gattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-agtagctttgtcctccacacgttttaggagct 241  T
Q  247 ttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 334  Q
    ||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  240 ttgtcctccactcgattaaagtatattaatatttatgatgacgtttggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatt 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 400 - 530
Target Start/End: Original strand, 51300 - 51430
Alignment:
Q  400 atctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgttgactaa 499  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51300 atctatgagtcgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgtgaattatatgatgctgactaa 51399  T
Q  500 gatgatgttatgttgtttaacatattgatta 530  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  51400 gatgttgctatgttgtttaacatgttgatta 51430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19661 - 19364
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  19661 aattgatatattgatatca-tctgttattgtg--acttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 19567  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctt 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||         |||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19566 atgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattgagctt 19478  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggta 296  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19477 agtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgattattaggagcattgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggta 19379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25835 - 25587
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  25835 aattgatatattgatatca-tctgttattgtg--acttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatg 25741  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctt 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||         |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25740 atgtttagctccaaattattggatgcattttgatatgatgattacga---------tgttttgttgat-agagtccatgcattagca-ttcattgagctt 25652  T
Q  199 tgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg--ttttaggagctttgtcctctgcacgat 262  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  25651 agtcctcaccatga-taggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 25587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25612 - 25511
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25612 attaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 25513  T
Q  310 ag 311  Q
    ||    
T  25512 ag 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 4228 - 4397
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  4228 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 4327  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4328 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 4397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 4098 - 4159
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4098 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 4159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25324 - 25146
Alignment:
Q  138 tgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacga---ttaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25324 tgattacgatgattatgatgttttgttcatctgtgtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcac 25225  T
Q  235 gtttta--ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25224 gttttataggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18303 - 18146
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18303 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatgat-aggagctttgtcctccgcacgttt-agtagctttttcctccgcacgatgaaag 18207  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18206 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataactgtctaagttgcattgt 18146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8745 - 8576
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  8745 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 8646  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8645 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacctcatgcatata 8576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8875 - 8814
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8875 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 8814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22160 - 21991
Alignment:
Q  146 atgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcatagcatttcattgagctttgtcctcaccacg----attaggagctttgtcctccgcacgttt--t 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  22160 atgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcatagcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattatt 22061  T
Q  240 aggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22060 aggagctttgtcctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22290 - 22229
Alignment:
Q  3 ttgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaact 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22290 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaact 22229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 354 - 475
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8211
Alignment:
Q  354 ttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtacctac 453  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8090 ttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtcgatgaattgtcatctatgagttgttgagttgtcttctacccatgtgttgttaaagaagtacctat 8189  T
Q  454 gaagattatacgatgtttatga 475  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  8190 gaagattatacgatgttcatga 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 8037 - 8124
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  8037 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagtttttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgtc 8124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 331 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 3259 - 3115
Alignment:
Q  331 catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctaccta 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  3259 catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgtgttgctaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctaccca 3160  T
Q  431 tgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3159 tgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 331 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7322 - 7178
Alignment:
Q  331 catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctaccta 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  7322 catttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgtgttgctaagttgttaacgaattatcatctatgagttgctgagttgtattctaccca 7223  T
Q  431 tgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7222 tgtgttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16646 - 16456
Alignment:
Q  147 tgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagc 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  16646 tgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccatg-ttcggagctttgtcctccacacgat--aggagc 16552  T
Q  246 tttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||| |||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16551 tttttcctccacacgattacagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcatcgtcgcatttgtcgagt 16456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 334 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 241
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgt 433  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||    
T  385 ttgtcaagtcaatgtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgtcaagttgttaatgaattatcatctatgagttgctgagttttattctacccatgt 286  T
Q  434 gttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtttatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  285 gttgttaaagaagtacctatgaagattatacgatgttcatgatgt 241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 9843 - 9993
Alignment:
Q  189 cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 288  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9843 cattgaactttgtcctcaccaagatc-ggagatttgtcctccacacgat--aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatact-atgatgac 9938  T
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9939 gattggtaccacatgcatataagtgtctgagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 9993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 18767 - 18962
Alignment:
Q  145 gatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttagga 243  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||  |||| ||  |||    
T  18767 gatgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccatgatttg-agcttagtcatcaccacgatt--gga 18861  T
Q  244 gctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag--tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 341  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862 gctttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgag 18960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21885 - 21826
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21885 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcaagtgaaag 21826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Original strand, 25024 - 25293
Alignment:
Q  31 tgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatga 129  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  25024 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaacta-gtgtataatgtctatgtat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacat 25120  T
Q  130 tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcct 228  Q
    ||||||| ||||||| |||         |||||||  || |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25121 tgatatgatgattacaatg---------ttttgttgata-gagtccatgcattagcgtt-cattgagcttagtcctcaccatgat-agaagctttgtcct 25208  T
Q  229 ccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    || |||| ||  |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25209 ccacacgattattaggagatttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgaagacgattggtaccacatgcatataag 25293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 311
Target Start/End: Original strand, 5 - 121
Alignment:
Q  200 gtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgttt--taggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 294  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattgg 104  T
Q  295 taccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||    
T  105 taccacatgcatataag 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 66582 - 66756
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatga--- 264  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||        
T  66582 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctat 66677  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66678 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 66756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 20174 - 20342
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |   ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  20174 agagtccatgcattagcata-cattaagctttgtcctcaccacgatttg-agctttgtcctcaccacgatc--ggagctttgtcctca-cacgattaaag 20268  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20269 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataga-gtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 20342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 33277 - 33336
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33277 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag 33336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45728 - 45669
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45728 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag 45669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 17649 - 17708
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17649 gattggtaccacatgcatagaagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag 17708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15953 - 15899
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  15953 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 15899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 178 - 1
Alignment:
Q  26 tgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 125  Q
    |||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178 tgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcatattg--tttttatatgatgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatgc 81  T
Q  126 atgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt 214  Q
    ||| ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  80 atgttgatatgt---------tgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 68167 - 68081
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68167 aattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatat 68081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5819 - 6019
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaaatgatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  5819 aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgaccgtgctgctgttgttgtttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaaatgatga 5913  T
Q  101 cgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgca-tagcatttcattgagcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  5914 cgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgt---------tgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagctta 6003  T
Q  200 gtcctcaccacgatta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  6004 gtcctcaccacgatta 6019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 173240 - 173072
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaag 267  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||| |   |||||||||||||   |||||| ||||    
T  173240 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatttg-agctatgtcctcaccacgatc--ggagctttgtcctgcacacgattaaag 173145  T
Q  268 tatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata-agtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcga 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  173144 tatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataaagagtgtctaagttgcattgtcacatttgtcga 173072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 204677 - 204633
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  204677 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcactgtcgcat 204633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 160474 - 160415
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  160474 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcattagtcaagtcaaag 160415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 80871 - 81026
Alignment:
Q  95 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatgattacggtgttttgtttttaagagtccatgcat-agcatttcattg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||        |||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||    
T  80871 tgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgat--------tgttttgttgata-gagtccatgcattagcatt-cattg 80960  T
Q  194 agctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacg 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  80961 agctttgtcctcaccatgattaggagctttgtcctccgcacg-attaggagctttgtcctccgcacg 81026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 23001 - 23060
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23001 gattggtaccacatgcatataagagatctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 23060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21845 - 21901
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21845 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 21901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6666 - 6560
Alignment:
Q  39 gactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgt 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  6666 gactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatga 6569  T
Q  138 tgattacga 146  Q
    |||||||||    
T  6568 tgattacga 6560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 12705 - 12783
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  12705 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgttgatgtattatcatccatgagttgt 12783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 12754 - 12791
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12754 gttgttgatgtattatcatccatgagttgttaagttgt 12791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Original strand, 11967 - 12060
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11967 gagctttgtcctcaccacgatt-aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Original strand, 11943 - 12012
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt 238  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11943 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttt 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2895 - 2752
Alignment:
Q  1 aattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacctgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat-atgatgaaatgatg 99  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  2895 aattgatatattgatatca-tccgttgttgtg--acttgactgtgcttctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatatgatgattaa--gatg 2801  T
Q  100 acgtttagctccaaattattggatgcatgatgatatgttgattacgatg 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  2800 acgtttggctccaaattattggatgcatatcgatatgatgattacgatg 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2694 - 2662
Alignment:
Q  279 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 2662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 18059 - 18137
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18059 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccttgagttgttaagttgttgatgaattatcatccatgagttgt 18137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 40425 - 40484
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40425 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgtatttgtcgagtcaaag 40484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 100140 - 100081
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  100140 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcacatttgtcgagtcaaag 100081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 101328 - 101271
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  101328 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagctgcatagtcgcatttgtcgagtcaa 101271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 387
Target Start/End: Original strand, 18108 - 18145
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18108 gttgttgatgaattatcatccatgagttgttaagttgt 18145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 38802 - 38857
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  38802 attggtaccacatgcatataagaggtctaggttgcattgtcaca-ttgtcgagtcaa 38857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 1141
Alignment:
Q  238 ttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1214 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30725
Alignment:
Q  237 tttaggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790 tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30833 - 30767
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30833 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacatttaggagctttgtcctccgcacg 30767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 66329 - 66276
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  66329 attggtaccacatgcatataagagactaagttgcatagttgcatttgttgagtc 66276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7274 - 7141
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtc--------gagttgtcttctacctatgtgttgttaa 441  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||         ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  7274 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgtcaagttgttgatgaattgtcatctatgagttgttaagttgttgagttgtctgctacccctgtgttgttaa 7175  T
Q  442 agaagtacctacgaagattatacgatgtttatga 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7174 agaagtacctatgaagattatacgatgttcatga 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7317 - 7237
Alignment:
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7317 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccatga---gttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgtcaagttgt 7237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5434 - 5375
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  5434 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtctcattcgtcgagtcaaag 5375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4449 - 4329
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgtcgagttgtcttctacctatgtgttgttaaagaagtac 449  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  4449 gttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgtcttctacccatgtgttgttaatgaagtgc 4350  T
Q  450 ctacgaagattatacgatgtt 470  Q
     || |||||||||| ||||||    
T  4349 ttatgaagattatatgatgtt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4498 - 4420
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  4498 ttgtcgagtcaaaatcattgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 4420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 470
Target Start/End: Original strand, 13913 - 14057
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatg--------agttgtcgagttgtcttct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||        |||||| ||||| ||||||    
T  13913 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagtcgttaagttgttgagttatcttct 14012  T
Q  426 acctatgtgttgttaaagaagtacctacgaagattatacgatgtt 470  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  14013 acccatgtgttgttaatgaagtgcttatgaagattatatgatgtt 14057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14843 - 14777
Alignment:
Q  245 ctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 311  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14843 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 7)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 412
Target Start/End: Original strand, 15544 - 15619
Alignment:
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15544 tcgagttaaagtcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 15619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Original strand, 15689 - 15751
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  15689 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgaattgtcatccgtgagttgt 15751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Original strand, 15656 - 15718
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15656 gttgttgatgaattgtgatccatgagttgtttagttgttgatgaattgtcatccatgagttgt 15718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 2974 - 3033
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2974 gattgctaccacatgcatataagaggtataagttgcatagccgcatttgtcgagtcaaag 3033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Original strand, 15590 - 15652
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||| || || |||||||||    
T  15590 gttgttgatgaattgtcatccatgagttgtttagttgttcatgaattgtcgtccatgagttgt 15652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Original strand, 15623 - 15685
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  15623 gttgttcatgaattgtcgtccatgagttgttaagttgttgatgaattgtgatccatgagttgt 15685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 402
Target Start/End: Original strand, 15722 - 15774
Alignment:
Q  350 gttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatc 402  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15722 gttgttgatgaattgtcatccgtgagttgttaggttgttgatgaattgtcatc 15774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 629 - 707
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  629 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttctcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 19270 - 19348
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  19270 ttgtcgagtcaaaatcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagttgt 19348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31930 - 31847
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31930 aagtatattaatacttattacgttgattggtatcacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 31847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 412
Target Start/End: Original strand, 63450 - 63528
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||||||||    
T  63450 ttgtcgagtcaaattcgttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttcttgatgaattgtcaaccatgagttgt 63528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 51375 - 51321
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51375 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 51321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 3397 - 3480
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3397 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcatagtcgcatttttcgagtcaaag 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 7981 - 8040
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7981 gattggtaccacatgcatataagaggtctgagttgcatagtcgcatttttcgagtcaaag 8040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1905 - 1846
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1905 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6322 - 6263
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6322 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 6263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3506 - 3423
Alignment:
Q  265 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3506 aagtatattaatacttattacgttaattggtaccacatgcatataagaggtttaagttgcatagtcgcatttgtcgagtcaaag 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1059 - 1005
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1059 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1195 - 1078
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg---a 264  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  |||||||   |    
T  1195 agagtccatgcattagcata-cattgagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctcaccacgatt--ggagctttgtcctccccacgatgctta 1100  T
Q  265 aagtatattaatacttatgatga 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  1099 aagtatattaatac-tatgatga 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 412
Target Start/End: Original strand, 832 - 906
Alignment:
Q  338 cgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagttgt 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||    
T  832 cgagtcaaagtctttgttgatgaattgtcatccatgagttgttaagttattgaggaattgtcatccatgagttgt 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10760 - 10707
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  10760 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 10707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 56 - 1
Alignment:
Q  169 agagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttg 224  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56 agagtccatgcattagcatt-cattgagctttgtcctcaccacgattaggagctttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 195234 - 195293
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtctaag--ttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  195234 gattggtaccacatgcatataagagtcttagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 195293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 16920 - 16975
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16920 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcatttgtcgagtc 16975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19051 - 18992
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19051 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 18992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 48769 - 48813
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  48769 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 48813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38 - 1
Alignment:
Q  277 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataagtgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 102305 - 102358
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  102305 ttgtcaagtcaaagtcgttgttgatgagttgtcatccatgagttgttaagttgt 102358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 109 - 37
Alignment:
Q  337 tcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgtcgatgaattatcatctatgagt 409  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  109 tcgagtcaatgtcgttgttcatgagttgtcatccatgagttgttaagttgttgatgagttgtcatccatgagt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12551 - 12492
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  12551 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcataggtgcatttgtcgagtcaaag 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5390 - 5334
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5390 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 5334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6585 - 6529
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6585 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 6529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6396 - 6337
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6396 gattggtagcacatgcatataagaggtctaagttgcacagtcgcatttgtcgagtcaaag 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 3650 - 3709
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3650 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtcaaag 3709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 187 - 99
Alignment:
Q  193 gagctttgtcctcaccacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctctgcacgatg-----aaagtatattaatact 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||||    
T  187 gagctttgtcctcaccacgatt-tgagctttgtcctcaccacgattt--gagctttgtcctcaccacgatgccttaaaagtatattaatact 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 29100 - 29159
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29100 gattggtaccacatggatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaag 29159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Original strand, 24215 - 24270
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24215 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 24270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1791 - 1733
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1791 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgca-ttgtcgagtcaaagt 1733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4288
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaagt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4346 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgca-ttgtcgagtcaaagt 4288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 1333 - 1387
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1333 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 1387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6608 - 6550
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  6608 gattggtaccacatgcatataagaggtctcagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 6550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 10751 - 10805
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10751 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 10805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2781
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2727 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 2781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 46123 - 46181
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46123 gattggtaccacatgcatataagaggtataagttgcatagttgcatttgtcgagtcaaa 46181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31862 - 31808
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagt-gtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31862 attggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 31808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46789 - 46735
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46789 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 46735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 65031 - 65075
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  65031 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 65075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 7450 - 7506
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7450 attggttccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38600 - 38543
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  38600 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtcaaa 38543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 5129 - 5185
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5129 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tcgtcgagtcaaa 5185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14457 - 14413
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14457 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 14413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23473 - 23429
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23473 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 23429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38897 - 38853
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38897 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10095 - 10040
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  10095 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtttcatttgtcgagtc 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 17545 - 17603
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  17545 gattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcaca-ttgtcgagtcaaag 17603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1186 - 1132
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  1186 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgtcgagtc 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Original strand, 5455 - 5505
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  5455 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcg 5505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8275 - 8221
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  8275 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttacatttgtcgagtc 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1744 - 1690
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  1744 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatatgtcgagtc 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 10605 - 10663
Alignment:
Q  289 gattggtaccacatgcatataagtgtcta-agttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10605 gattggtaccacatgcataaagaggtctagatttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 10663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16075 - 16021
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  16075 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttatcgagtc 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 69 - 15
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  69 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 15791 - 15845
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15791 attggtaccacattcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgtcgagtc 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 174560 - 174506
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  174560 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatattcgcatttttcgagtc 174506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 168304 - 168358
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  168304 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagtc 168358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 2015
Alignment:
Q  294 gtaccacatgcatataagtg-tctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2067 gtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgca-tagtcgagtcaaa 2015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 2400 - 2456
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2400 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgtgttgtcgca-ttgtcgagtcaaa 2456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6781
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6725 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 6781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 14036 - 14092
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14036 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 14092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 19609 - 19665
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtcaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19609 attggtaccacatgcatataagaggtttaggttgcattgtcgca-ttgtcgagtcaaa 19665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31954 - 31901
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  31954 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgttgagt 31901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2626 - 2585
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2626 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcg 2585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6251
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6292 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcg 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 56666 - 56613
Alignment:
Q  334 ttgtcgagtcaaagtcgttgttgatgaattatcatccaagagttgttaagttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  56666 ttgtcgagtcaaagtcgttgtcgataagttattatccatgagttgtcaagttgt 56613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1917 - 1873
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  1917 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5888 - 5844
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  5888 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgttgcat 5844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 10841 - 10885
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  10841 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 10885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3491
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  3535 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7966 - 7922
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  7966 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 7922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 8854 - 8902
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  8854 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt 8902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 333
Target Start/End: Original strand, 9286 - 9330
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  9286 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagtcgcat 9330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10111 - 10063
Alignment:
Q  290 attggtaccacatgcatataag-tgtctaagttgcattgtcgcatttgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  10111 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcatagttgcatttgt 10063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University