View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19658_high_17 (Length: 531)

Name: NF19658_high_17
Description: NF19658
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19658_high_17
NF19658_high_17
[»] chr3 (264 HSPs)
chr3 (11-515)||(6490016-6490520)
chr3 (11-515)||(6500670-6501174)
chr3 (11-515)||(9993561-9994063)
chr3 (11-515)||(9981553-9982055)
chr3 (11-515)||(12237290-12237784)
chr3 (11-515)||(12249116-12249610)
chr3 (11-515)||(23635774-23636293)
chr3 (11-513)||(9390872-9391371)
chr3 (11-515)||(24706206-24706725)
chr3 (11-515)||(19887006-19887524)
chr3 (11-515)||(933692-934210)
chr3 (105-513)||(11216483-11216890)
chr3 (105-515)||(29460975-29461383)
chr3 (12-515)||(6220370-6220873)
chr3 (105-514)||(48337307-48337714)
chr3 (11-512)||(4404340-4404854)
chr3 (11-512)||(4456983-4457497)
chr3 (104-515)||(17909763-17910172)
chr3 (105-515)||(29471827-29472235)
chr3 (143-514)||(7804318-7804687)
chr3 (11-513)||(9380309-9380825)
chr3 (127-514)||(7794391-7794776)
chr3 (11-515)||(9535673-9536174)
chr3 (11-515)||(4174424-4174928)
chr3 (12-515)||(6180196-6180699)
chr3 (11-515)||(13382932-13383435)
chr3 (11-515)||(13372338-13372841)
chr3 (11-515)||(23647812-23648315)
chr3 (11-515)||(23757362-23757865)
chr3 (11-515)||(37759734-37760237)
chr3 (11-515)||(39672551-39673054)
chr3 (12-515)||(19789086-19789588)
chr3 (11-515)||(503836-504339)
chr3 (11-515)||(5510760-5511262)
chr3 (11-515)||(12286647-12287150)
chr3 (11-515)||(12296469-12296972)
chr3 (11-515)||(13393526-13394029)
chr3 (11-515)||(20683449-20683952)
chr3 (11-515)||(41683742-41684245)
chr3 (11-515)||(41694311-41694814)
chr3 (12-515)||(19778449-19778951)
chr3 (127-510)||(16391398-16391780)
chr3 (11-515)||(5520938-5521440)
chr3 (11-515)||(5536690-5537192)
chr3 (11-515)||(13121726-13122229)
chr3 (11-515)||(13131969-13132472)
chr3 (11-515)||(13557638-13558141)
chr3 (11-515)||(14465655-14466158)
chr3 (11-515)||(20672864-20673367)
chr3 (11-515)||(20721177-20721680)
chr3 (11-515)||(23767958-23768461)
chr3 (11-515)||(37866509-37867014)
chr3 (11-515)||(24383186-24383690)
chr3 (11-515)||(5547274-5547776)
chr3 (11-515)||(14476287-14476790)
chr3 (11-515)||(10626610-10627112)
chr3 (11-515)||(4743802-4744305)
chr3 (105-512)||(18851453-18851859)
chr3 (11-515)||(4754388-4754890)
chr3 (11-515)||(5865364-5865865)
chr3 (11-515)||(10654950-10655434)
chr3 (11-490)||(16476367-16476845)
chr3 (19-512)||(1783731-1784239)
chr3 (11-515)||(24659964-24660485)
chr3 (11-515)||(526183-526705)
chr3 (11-515)||(5579284-5579805)
chr3 (11-515)||(5627668-5628189)
chr3 (11-515)||(24670544-24671065)
chr3 (180-512)||(11163896-11164228)
chr3 (11-515)||(10099132-10099636)
chr3 (19-512)||(1794143-1794651)
chr3 (11-515)||(35187441-35187962)
chr3 (143-512)||(28169149-28169516)
chr3 (11-515)||(28313883-28314403)
chr3 (11-515)||(28324499-28325019)
chr3 (11-515)||(37885642-37886128)
chr3 (146-512)||(38314766-38315131)
chr3 (11-515)||(5875946-5876464)
chr3 (11-515)||(18484108-18484629)
chr3 (14-512)||(27883451-27883960)
chr3 (11-515)||(38194788-38195310)
chr3 (11-515)||(38205324-38205846)
chr3 (212-511)||(13261541-13261839)
chr3 (128-512)||(1064206-1064586)
chr3 (11-515)||(11272033-11272555)
chr3 (11-515)||(39372117-39372639)
chr3 (127-510)||(16076999-16077378)
chr3 (105-512)||(1053777-1054180)
chr3 (126-515)||(8774721-8775111)
chr3 (126-515)||(8785306-8785696)
chr3 (163-513)||(16665947-16666295)
chr3 (127-512)||(8739913-8740294)
chr3 (161-512)||(8995774-8996123)
chr3 (128-512)||(17281219-17281600)
chr3 (128-512)||(14581205-14581585)
chr3 (144-515)||(39382754-39383126)
chr3 (127-512)||(9006294-9006675)
chr3 (11-372)||(16493245-16493604)
chr3 (167-512)||(16670986-16671329)
chr3 (106-434)||(14321444-14321771)
chr3 (212-451)||(12567138-12567376)
chr3 (162-451)||(15216159-15216446)
chr3 (127-512)||(13199028-13199411)
chr3 (105-512)||(29933328-29933726)
chr3 (105-512)||(29982482-29982880)
chr3 (161-512)||(2246435-2246783)
chr3 (127-378)||(16348418-16348669)
chr3 (11-404)||(16487067-16487458)
chr3 (127-512)||(29905972-29906347)
chr3 (127-512)||(29947137-29947512)
chr3 (127-512)||(29996291-29996666)
chr3 (329-512)||(21736178-21736360)
chr3 (329-512)||(15651055-15651237)
chr3 (329-512)||(15662690-15662872)
chr3 (329-511)||(27172900-27173082)
chr3 (401-515)||(16386138-16386251)
chr3 (329-487)||(10529243-10529401)
chr3 (11-178)||(13604662-13604828)
chr3 (329-483)||(51989128-51989282)
chr3 (329-511)||(31113971-31114152)
chr3 (329-487)||(41045640-41045797)
chr3 (329-487)||(15850905-15851065)
chr3 (23-155)||(19531697-19531828)
chr3 (11-155)||(11167913-11168056)
chr3 (329-487)||(15833302-15833459)
chr3 (379-512)||(17961419-17961551)
chr3 (379-512)||(18006364-18006496)
chr3 (332-487)||(51340907-51341063)
chr3 (329-435)||(17021975-17022082)
chr3 (329-487)||(22151142-22151301)
chr3 (345-487)||(45861693-45861835)
chr3 (11-89)||(16348270-16348348)
chr3 (329-487)||(13148162-13148321)
chr3 (364-487)||(49990157-49990280)
chr3 (11-118)||(7607977-7608083)
chr3 (345-450)||(2561121-2561226)
chr3 (11-89)||(12858430-12858507)
chr3 (11-89)||(16391249-16391327)
chr3 (18-138)||(7804205-7804330)
chr3 (11-98)||(39383206-39383293)
chr3 (345-487)||(47405542-47405684)
chr3 (11-89)||(7794242-7794319)
chr3 (345-399)||(12726351-12726405)
chr3 (345-450)||(24775655-24775760)
chr3 (11-89)||(29460865-29460943)
chr3 (11-89)||(29471717-29471795)
chr3 (345-450)||(40799807-40799912)
chr3 (345-399)||(47207690-47207744)
chr3 (11-89)||(48337747-48337824)
chr3 (345-399)||(53056848-53056902)
chr3 (332-487)||(12752727-12752883)
chr3 (14-155)||(14254051-14254190)
chr3 (27-155)||(16670813-16670941)
chr3 (128-295)||(18006570-18006734)
chr3 (11-98)||(8775172-8775260)
chr3 (11-98)||(8785757-8785845)
chr3 (17-89)||(11216380-11216451)
chr3 (105-202)||(21736486-21736597)
chr3 (345-397)||(25398376-25398428)
chr3 (108-156)||(39383132-39383180)
chr3 (345-416)||(46796488-46796560)
chr3 (108-155)||(8775099-8775146)
chr3 (108-155)||(8785684-8785731)
chr3 (105-195)||(15650835-15650923)
chr3 (11-94)||(27244791-27244874)
chr3 (345-399)||(5213562-5213615)
chr3 (345-399)||(6090716-6090770)
chr3 (345-399)||(11868253-11868307)
chr3 (105-202)||(15662470-15662565)
chr3 (345-399)||(18121743-18121797)
chr3 (345-399)||(18142873-18142927)
chr3 (345-399)||(21605775-21605829)
chr3 (345-399)||(22140748-22140802)
chr3 (345-399)||(29855393-29855447)
chr3 (345-382)||(12388993-12389030)
chr3 (73-138)||(14392847-14392911)
chr3 (73-138)||(15903453-15903517)
chr3 (345-382)||(16032526-16032563)
chr3 (128-295)||(17961625-17961789)
chr3 (345-398)||(21636791-21636844)
chr3 (348-416)||(30054341-30054410)
chr3 (348-416)||(37412571-37412640)
chr3 (73-154)||(47405292-47405373)
chr3 (345-416)||(1728136-1728208)
chr3 (105-141)||(16391359-16391395)
chr3 (112-195)||(23680171-23680251)
chr3 (112-195)||(24052408-24052488)
chr3 (11-87)||(40288653-40288729)
chr3 (345-419)||(11909145-11909220)
chr3 (345-396)||(49553610-49553661)
chr3 (105-155)||(2246804-2246854)
chr3 (105-155)||(9092112-9092162)
chr3 (11-89)||(17909654-17909731)
chr3 (19-89)||(18851352-18851421)
chr3 (345-399)||(20646138-20646192)
chr3 (103-156)||(21636550-21636601)
chr3 (345-450)||(28582039-28582144)
chr3 (345-450)||(33583163-33583267)
chr3 (345-399)||(38177764-38177818)
chr3 (19-140)||(38315153-38315281)
chr3 (73-138)||(11223801-11223865)
chr3 (345-378)||(14955432-14955465)
chr3 (105-138)||(17238825-17238858)
chr3 (73-138)||(19249254-19249318)
chr3 (73-138)||(37467556-37467620)
chr3 (105-154)||(38177544-38177593)
chr3 (73-138)||(52920659-52920723)
chr3 (345-416)||(2785031-2785102)
chr3 (105-153)||(8758245-8758293)
chr3 (345-416)||(16658739-16658811)
chr3 (105-161)||(16665873-16665929)
chr3 (162-202)||(31113806-31113846)
chr3 (345-416)||(49642883-49642955)
chr3 (345-416)||(49666526-49666598)
chr3 (345-416)||(52920372-52920444)
chr3 (78-137)||(1727872-1727930)
chr3 (103-138)||(9699950-9699985)
chr3 (103-138)||(10529567-10529602)
chr3 (103-138)||(13977956-13977991)
chr3 (103-138)||(15833627-15833662)
chr3 (103-138)||(15851173-15851208)
chr3 (127-189)||(16670930-16670990)
chr3 (345-487)||(20627552-20627694)
chr3 (103-138)||(24775388-24775423)
chr3 (73-132)||(31303649-31303707)
chr3 (103-138)||(37412860-37412895)
chr3 (103-138)||(40851197-40851232)
chr3 (103-138)||(49666286-49666321)
chr3 (27-89)||(8995606-8995667)
chr3 (27-89)||(9006158-9006219)
chr3 (127-248)||(9092151-9092270)
chr3 (345-399)||(9700157-9700211)
chr3 (345-399)||(11223548-11223601)
chr3 (104-138)||(12388729-12388763)
chr3 (104-138)||(13824286-13824320)
chr3 (103-156)||(14955679-14955730)
chr3 (73-138)||(16199653-16199716)
chr3 (105-155)||(17961779-17961828)
chr3 (104-154)||(40800081-40800131)
chr3 (104-156)||(2785317-2785367)
chr3 (73-138)||(6090986-6091050)
chr3 (345-378)||(12968311-12968344)
chr3 (73-138)||(14969567-14969632)
chr3 (345-382)||(21640868-21640905)
chr3 (73-138)||(25398115-25398180)
chr3 (11-64)||(33773486-33773539)
chr3 (105-141)||(8739874-8739910)
chr3 (103-155)||(8995701-8995753)
chr3 (102-138)||(12962970-12963006)
chr3 (345-416)||(13780705-13780777)
chr3 (11-59)||(14392329-14392377)
chr3 (11-59)||(15093998-15094046)
chr3 (340-372)||(16880026-16880058)
chr3 (106-138)||(28169504-28169536)
chr3 (78-138)||(28582361-28582420)
chr3 (105-141)||(29905933-29905969)
chr3 (105-141)||(29947098-29947134)
chr3 (105-141)||(29996252-29996288)
chr3 (105-141)||(31113738-31113774)
chr3 (345-416)||(31303352-31303424)
chr3 (103-135)||(33583502-33583534)
chr3 (103-135)||(33598122-33598154)
chr3 (106-138)||(46796266-46796298)
chr3 (80-136)||(53056576-53056631)
[»] chr4 (187 HSPs)
chr4 (11-515)||(5022819-5023315)
chr4 (12-515)||(18077563-18078082)
chr4 (11-515)||(40454006-40454524)
chr4 (11-515)||(25657219-25657738)
chr4 (11-515)||(40470262-40470763)
chr4 (11-515)||(18752147-18752666)
chr4 (11-515)||(18762757-18763276)
chr4 (11-515)||(27814619-27815122)
chr4 (11-515)||(48371214-48371717)
chr4 (11-515)||(10909491-10909995)
chr4 (127-512)||(4987359-4987743)
chr4 (11-515)||(52703871-52704374)
chr4 (11-515)||(24027759-24028262)
chr4 (9-515)||(4948418-4948923)
chr4 (11-515)||(461240-461743)
chr4 (127-512)||(14835893-14836276)
chr4 (11-515)||(14843327-14843830)
chr4 (11-515)||(15560753-15561256)
chr4 (11-515)||(17918135-17918638)
chr4 (11-515)||(36018419-36018922)
chr4 (11-515)||(17928783-17929286)
chr4 (11-515)||(19954636-19955139)
chr4 (11-515)||(22007094-22007597)
chr4 (11-512)||(10695726-10696226)
chr4 (11-515)||(16266545-16267048)
chr4 (11-515)||(21996496-21996999)
chr4 (11-515)||(30926168-30926671)
chr4 (11-515)||(30936746-30937249)
chr4 (12-515)||(450659-451161)
chr4 (105-512)||(47151846-47152252)
chr4 (113-510)||(3370803-3371198)
chr4 (11-515)||(16255952-16256455)
chr4 (128-512)||(15207204-15207585)
chr4 (106-512)||(16317416-16317821)
chr4 (11-515)||(10740265-10740771)
chr4 (11-515)||(10954034-10954540)
chr4 (127-510)||(3390543-3390924)
chr4 (106-512)||(16305192-16305596)
chr4 (127-512)||(19581327-19581711)
chr4 (11-515)||(19943984-19944504)
chr4 (11-515)||(36028972-36029492)
chr4 (11-515)||(18129915-18130416)
chr4 (11-515)||(49518218-49518738)
chr4 (126-515)||(10750956-10751345)
chr4 (126-515)||(10964725-10965114)
chr4 (127-512)||(11535932-11536313)
chr4 (128-512)||(24713518-24713898)
chr4 (126-514)||(55745040-55745428)
chr4 (126-514)||(55755651-55756039)
chr4 (129-512)||(5873456-5873837)
chr4 (161-512)||(10300621-10300970)
chr4 (112-510)||(31266574-31266968)
chr4 (128-512)||(11515122-11515501)
chr4 (144-515)||(24640330-24640702)
chr4 (144-515)||(27656683-27657055)
chr4 (144-515)||(27667256-27667628)
chr4 (105-512)||(55651411-55651813)
chr4 (105-512)||(49001749-49002151)
chr4 (11-206)||(20648309-20648501)
chr4 (329-512)||(23509204-23509386)
chr4 (106-512)||(18774448-18774849)
chr4 (329-512)||(8997268-8997450)
chr4 (329-511)||(18007071-18007252)
chr4 (329-512)||(16819364-16819546)
chr4 (329-487)||(33378302-33378461)
chr4 (329-487)||(14778454-14778611)
chr4 (11-155)||(17276433-17276577)
chr4 (11-155)||(25089166-25089309)
chr4 (329-487)||(17993805-17993962)
chr4 (11-156)||(28066621-28066765)
chr4 (127-298)||(39525952-39526119)
chr4 (9-157)||(53442310-53442459)
chr4 (329-487)||(14710790-14710947)
chr4 (11-155)||(10750822-10750968)
chr4 (11-155)||(10964591-10964737)
chr4 (329-487)||(36210119-36210278)
chr4 (105-203)||(17198189-17198286)
chr4 (12-118)||(8182533-8182639)
chr4 (105-202)||(16819143-16819237)
chr4 (345-416)||(10692812-10692884)
chr4 (345-416)||(10906578-10906650)
chr4 (345-416)||(14604985-14605057)
chr4 (105-202)||(8997032-8997143)
chr4 (345-416)||(9751618-9751690)
chr4 (105-202)||(19244174-19244266)
chr4 (11-98)||(55744874-55744962)
chr4 (11-98)||(55755485-55755573)
chr4 (11-98)||(24640782-24640869)
chr4 (11-98)||(27657135-27657222)
chr4 (11-98)||(27667708-27667795)
chr4 (345-399)||(1672368-1672422)
chr4 (345-399)||(1674843-1674897)
chr4 (11-89)||(14835745-14835822)
chr4 (11-89)||(16305630-16305707)
chr4 (345-399)||(16853482-16853536)
chr4 (345-416)||(6517446-6517518)
chr4 (345-416)||(17398752-17398824)
chr4 (345-488)||(19884592-19884735)
chr4 (345-416)||(22190807-22190879)
chr4 (108-156)||(24640708-24640756)
chr4 (108-156)||(27657061-27657109)
chr4 (108-156)||(27667634-27667682)
chr4 (6-89)||(4987814-4987896)
chr4 (113-156)||(8182651-8182694)
chr4 (11-118)||(15207055-15207160)
chr4 (345-404)||(29121344-29121403)
chr4 (19-89)||(17198088-17198157)
chr4 (19-89)||(19581782-19581851)
chr4 (19-89)||(25009303-25009372)
chr4 (73-154)||(13575943-13576023)
chr4 (11-88)||(16317856-16317932)
chr4 (329-394)||(19243982-19244047)
chr4 (345-416)||(3105497-3105569)
chr4 (105-202)||(18006838-18006946)
chr4 (345-416)||(20977418-20977490)
chr4 (345-416)||(37435613-37435685)
chr4 (345-416)||(39419812-39419884)
chr4 (103-138)||(20977662-20977697)
chr4 (347-398)||(40860647-40860698)
chr4 (108-155)||(55744988-55745035)
chr4 (108-155)||(55755599-55755646)
chr4 (351-416)||(16848508-16848574)
chr4 (389-483)||(19242142-19242235)
chr4 (345-399)||(25651182-25651235)
chr4 (103-137)||(39419587-39419621)
chr4 (103-137)||(40860907-40860941)
chr4 (345-379)||(54679929-54679963)
chr4 (345-382)||(6641680-6641717)
chr4 (105-142)||(14835854-14835891)
chr4 (73-138)||(16940210-16940274)
chr4 (104-141)||(24713902-24713939)
chr4 (73-154)||(54680130-54680210)
chr4 (11-83)||(3390990-3391061)
chr4 (345-416)||(3395551-3395623)
chr4 (105-141)||(4987746-4987782)
chr4 (345-416)||(13576192-13576264)
chr4 (105-141)||(19581714-19581750)
chr4 (102-138)||(29680385-29680421)
chr4 (73-156)||(37435320-37435400)
chr4 (345-416)||(38513839-38513911)
chr4 (103-138)||(3486351-3486386)
chr4 (103-138)||(3499491-3499526)
chr4 (348-450)||(8105566-8105667)
chr4 (103-138)||(9751391-9751426)
chr4 (103-138)||(10693084-10693119)
chr4 (103-138)||(10906850-10906885)
chr4 (103-138)||(14571257-14571292)
chr4 (103-138)||(15474994-15475029)
chr4 (345-415)||(16939978-16940049)
chr4 (103-138)||(17700639-17700674)
chr4 (345-399)||(22675598-22675653)
chr4 (105-160)||(23509568-23509623)
chr4 (103-138)||(27188509-27188544)
chr4 (124-155)||(55745021-55745052)
chr4 (124-155)||(55755632-55755663)
chr4 (345-399)||(10072914-10072968)
chr4 (105-155)||(10300991-10301041)
chr4 (27-89)||(10301076-10301137)
chr4 (340-378)||(10661240-10661278)
chr4 (340-378)||(10875385-10875423)
chr4 (345-379)||(17247243-17247277)
chr4 (345-399)||(19911959-19912013)
chr4 (161-195)||(23509519-23509553)
chr4 (103-137)||(38514105-38514139)
chr4 (345-399)||(45833373-45833427)
chr4 (104-138)||(56034807-56034841)
chr4 (11-64)||(9914103-9914156)
chr4 (73-154)||(10073155-10073235)
chr4 (345-398)||(12811253-12811306)
chr4 (73-138)||(16632687-16632751)
chr4 (73-138)||(19620891-19620955)
chr4 (345-398)||(19666352-19666405)
chr4 (11-64)||(43346103-43346156)
chr4 (73-138)||(45833643-45833708)
chr4 (105-138)||(55380508-55380541)
chr4 (345-378)||(56533140-56533173)
chr4 (78-138)||(3105256-3105315)
chr4 (11-59)||(3188078-3188126)
chr4 (14-118)||(5873882-5873984)
chr4 (105-141)||(11515505-11515541)
chr4 (105-141)||(11536316-11536352)
chr4 (102-138)||(14604734-14604770)
chr4 (345-416)||(19621139-19621211)
chr4 (345-416)||(23750483-23750555)
chr4 (126-154)||(25089133-25089161)
chr4 (105-141)||(39525913-39525949)
chr4 (345-397)||(55380271-55380323)
[»] chr5 (251 HSPs)
chr5 (11-515)||(10754281-10754783)
chr5 (11-515)||(34782646-34783146)
chr5 (11-515)||(34771701-34772201)
chr5 (11-515)||(20797467-20797986)
chr5 (11-515)||(42394769-42395269)
chr5 (11-515)||(43043641-43044160)
chr5 (105-515)||(8521723-8522131)
chr5 (104-515)||(24926110-24926519)
chr5 (105-515)||(36084343-36084751)
chr5 (105-515)||(1109116-1109524)
chr5 (105-515)||(20551697-20552105)
chr5 (105-515)||(36228621-36229029)
chr5 (11-515)||(1121874-1122392)
chr5 (127-515)||(30069876-30070262)
chr5 (11-515)||(27622736-27623239)
chr5 (130-512)||(19477908-19478289)
chr5 (106-515)||(23406329-23406736)
chr5 (127-515)||(24983391-24983777)
chr5 (130-512)||(19463878-19464259)
chr5 (127-512)||(17457285-17457668)
chr5 (11-515)||(40390145-40390648)
chr5 (11-515)||(40400807-40401310)
chr5 (105-512)||(21705948-21706355)
chr5 (11-515)||(14557986-14558490)
chr5 (11-515)||(14568623-14569127)
chr5 (11-515)||(5290545-5291048)
chr5 (11-515)||(7032095-7032600)
chr5 (11-515)||(9377431-9377934)
chr5 (11-515)||(22156892-22157395)
chr5 (11-515)||(23306633-23307136)
chr5 (11-515)||(24827443-24827946)
chr5 (11-515)||(27603387-27603890)
chr5 (127-515)||(31448456-31448844)
chr5 (11-515)||(39352276-39352779)
chr5 (127-512)||(17446669-17447052)
chr5 (11-515)||(22146309-22146812)
chr5 (11-515)||(23296065-23296568)
chr5 (11-515)||(24816855-24817358)
chr5 (11-515)||(31843747-31844250)
chr5 (11-515)||(6986085-6986589)
chr5 (11-515)||(6130577-6131080)
chr5 (11-515)||(9335744-9336246)
chr5 (11-515)||(9346331-9346833)
chr5 (127-515)||(31418565-31418953)
chr5 (106-512)||(34062503-34062907)
chr5 (9-515)||(42042571-42043075)
chr5 (105-490)||(43621855-43622249)
chr5 (11-515)||(15694001-15694503)
chr5 (11-515)||(24566878-24567380)
chr5 (11-515)||(24807701-24808203)
chr5 (11-515)||(42053148-42053650)
chr5 (11-515)||(14029831-14030335)
chr5 (11-515)||(14040384-14040888)
chr5 (11-515)||(23361898-23362402)
chr5 (11-515)||(15993298-15993801)
chr5 (11-515)||(16003860-16004363)
chr5 (11-512)||(21703101-21703600)
chr5 (11-515)||(27459949-27460452)
chr5 (11-515)||(27470348-27470851)
chr5 (11-515)||(30227467-30227969)
chr5 (11-515)||(30237994-30238496)
chr5 (106-512)||(34051842-34052246)
chr5 (127-515)||(20562244-20562615)
chr5 (11-515)||(39502109-39502611)
chr5 (11-515)||(35215293-35215797)
chr5 (108-515)||(36582527-36582934)
chr5 (108-515)||(36593082-36593489)
chr5 (11-515)||(6975595-6976099)
chr5 (11-515)||(27203598-27204084)
chr5 (108-515)||(23707327-23707733)
chr5 (11-515)||(22675886-22676407)
chr5 (11-515)||(27042181-27042702)
chr5 (11-420)||(39362102-39362510)
chr5 (11-515)||(23372299-23372805)
chr5 (163-515)||(22559376-22559728)
chr5 (11-515)||(27052805-27053327)
chr5 (11-515)||(5301116-5301607)
chr5 (126-515)||(22685909-22686298)
chr5 (11-515)||(35225860-35226381)
chr5 (11-515)||(40513958-40514480)
chr5 (11-515)||(39490919-39491404)
chr5 (126-515)||(15739869-15740259)
chr5 (126-515)||(15769029-15769419)
chr5 (112-512)||(106008-106405)
chr5 (127-512)||(37406559-37406935)
chr5 (126-515)||(17718820-17719210)
chr5 (126-515)||(17729472-17729862)
chr5 (127-512)||(20624670-20625051)
chr5 (128-515)||(36687602-36687987)
chr5 (128-515)||(36698168-36698553)
chr5 (161-487)||(21414197-21414521)
chr5 (144-515)||(14446968-14447340)
chr5 (144-515)||(14457580-14457952)
chr5 (144-515)||(33951769-33952141)
chr5 (11-378)||(31814951-31815316)
chr5 (127-410)||(23392620-23392901)
chr5 (163-515)||(17607002-17607352)
chr5 (163-515)||(17617616-17617966)
chr5 (163-515)||(31348476-31348826)
chr5 (163-515)||(31359090-31359440)
chr5 (105-512)||(20416786-20417188)
chr5 (249-515)||(37729220-37729488)
chr5 (249-515)||(37740536-37740804)
chr5 (105-512)||(32753919-32754341)
chr5 (105-512)||(20167950-20168351)
chr5 (329-512)||(13533785-13533967)
chr5 (329-511)||(36095755-36095936)
chr5 (329-511)||(36097212-36097393)
chr5 (329-512)||(13523058-13523240)
chr5 (384-515)||(31833641-31833772)
chr5 (329-512)||(35543231-35543413)
chr5 (428-515)||(39364685-39364772)
chr5 (329-487)||(40228553-40228710)
chr5 (329-487)||(23478262-23478421)
chr5 (329-487)||(1915311-1915469)
chr5 (345-487)||(11208087-11208229)
chr5 (329-487)||(13405010-13405167)
chr5 (329-487)||(20215201-20215360)
chr5 (19-264)||(21519840-21520099)
chr5 (346-487)||(40032869-40033009)
chr5 (36-155)||(22685802-22685921)
chr5 (11-143)||(15739684-15739815)
chr5 (11-143)||(15768844-15768975)
chr5 (11-142)||(23707176-23707306)
chr5 (19-153)||(21517507-21517639)
chr5 (332-487)||(25111966-25112122)
chr5 (332-487)||(25171057-25171213)
chr5 (11-88)||(31418417-31418493)
chr5 (11-89)||(31448308-31448385)
chr5 (11-118)||(23392471-23392577)
chr5 (345-487)||(32160659-32160801)
chr5 (11-89)||(8521613-8521691)
chr5 (11-89)||(30070333-30070411)
chr5 (345-416)||(4886985-4887057)
chr5 (345-416)||(33933230-33933302)
chr5 (11-98)||(14447420-14447507)
chr5 (11-98)||(14458032-14458119)
chr5 (11-98)||(17617467-17617554)
chr5 (11-98)||(31348327-31348414)
chr5 (11-98)||(31358941-31359028)
chr5 (11-98)||(33952221-33952308)
chr5 (11-89)||(1109556-1109634)
chr5 (11-89)||(17457740-17457817)
chr5 (11-89)||(19463727-19463804)
chr5 (11-89)||(19477757-19477834)
chr5 (345-399)||(20550876-20550930)
chr5 (11-89)||(20551587-20551664)
chr5 (11-89)||(23406218-23406295)
chr5 (429-514)||(23696988-23697074)
chr5 (11-89)||(34062392-34062469)
chr5 (11-89)||(36084233-36084310)
chr5 (11-178)||(37778653-37778835)
chr5 (11-89)||(43622282-43622359)
chr5 (105-166)||(13534143-13534204)
chr5 (11-156)||(22559250-22559388)
chr5 (345-416)||(7745795-7745867)
chr5 (345-416)||(10848736-10848808)
chr5 (345-416)||(11993851-11993923)
chr5 (108-156)||(14447346-14447394)
chr5 (108-156)||(14457958-14458006)
chr5 (108-156)||(17606966-17607014)
chr5 (17-89)||(20562101-20562172)
chr5 (345-416)||(28139570-28139642)
chr5 (108-156)||(33952147-33952195)
chr5 (105-160)||(13523422-13523477)
chr5 (108-155)||(15739834-15739881)
chr5 (108-155)||(15768994-15769041)
chr5 (11-98)||(17606854-17606940)
chr5 (11-98)||(17718672-17718759)
chr5 (108-155)||(17718785-17718832)
chr5 (11-98)||(17729324-17729411)
chr5 (108-155)||(17729437-17729484)
chr5 (105-160)||(35542977-35543032)
chr5 (345-399)||(9088950-9089004)
chr5 (345-399)||(14086641-14086695)
chr5 (11-89)||(17447124-17447201)
chr5 (11-89)||(24983849-24983926)
chr5 (345-399)||(33022645-33022699)
chr5 (11-89)||(34051731-34051808)
chr5 (106-160)||(36095520-36095573)
chr5 (106-160)||(36096977-36097030)
chr5 (11-89)||(36228511-36228588)
chr5 (11-89)||(36582935-36583013)
chr5 (11-89)||(36593490-36593568)
chr5 (104-141)||(17447055-17447092)
chr5 (104-141)||(17457671-17457708)
chr5 (11-88)||(24588501-24588578)
chr5 (11-88)||(24926552-24926628)
chr5 (73-138)||(30115713-30115778)
chr5 (348-416)||(30115942-30116011)
chr5 (345-398)||(35932108-35932161)
chr5 (345-416)||(15516933-15517004)
chr5 (345-416)||(25096928-25096999)
chr5 (345-416)||(25154898-25154969)
chr5 (105-141)||(30070265-30070301)
chr5 (103-138)||(23391481-23391516)
chr5 (11-98)||(36687452-36687539)
chr5 (11-98)||(36698018-36698105)
chr5 (345-399)||(13545614-13545668)
chr5 (11-89)||(21706387-21706464)
chr5 (73-135)||(28139825-28139886)
chr5 (345-399)||(29138508-29138562)
chr5 (345-399)||(30742962-30743015)
chr5 (345-399)||(31117858-31117912)
chr5 (103-137)||(35931881-35931915)
chr5 (103-137)||(35986093-35986127)
chr5 (345-399)||(42243662-42243715)
chr5 (105-138)||(642561-642594)
chr5 (104-141)||(24983780-24983817)
chr5 (161-202)||(35543064-35543105)
chr5 (102-138)||(89303-89339)
chr5 (345-416)||(89524-89596)
chr5 (105-141)||(20562205-20562241)
chr5 (345-416)||(23413076-23413148)
chr5 (345-416)||(26759113-26759184)
chr5 (345-416)||(26765462-26765533)
chr5 (345-416)||(35986334-35986406)
chr5 (103-138)||(5430119-5430154)
chr5 (106-141)||(19477867-19477902)
chr5 (103-138)||(21660454-21660489)
chr5 (106-141)||(23392582-23392617)
chr5 (348-399)||(25930261-25930312)
chr5 (103-138)||(28464216-28464251)
chr5 (106-141)||(37406521-37406556)
chr5 (345-399)||(3245543-3245597)
chr5 (104-138)||(4887257-4887291)
chr5 (80-138)||(14086382-14086439)
chr5 (340-374)||(16607518-16607552)
chr5 (104-138)||(25096661-25096695)
chr5 (104-138)||(25154631-25154665)
chr5 (103-137)||(25930047-25930081)
chr5 (345-399)||(26784335-26784389)
chr5 (160-246)||(37778568-37778653)
chr5 (345-414)||(41566536-41566606)
chr5 (161-202)||(13534093-13534134)
chr5 (112-141)||(19463843-19463872)
chr5 (103-136)||(19536153-19536186)
chr5 (105-138)||(20551129-20551162)
chr5 (105-138)||(21099558-21099591)
chr5 (345-382)||(21099806-21099843)
chr5 (345-398)||(21660194-21660247)
chr5 (105-138)||(23412843-23412876)
chr5 (345-382)||(28464441-28464478)
chr5 (73-138)||(29138231-29138295)
chr5 (345-416)||(9398836-9398908)
chr5 (345-416)||(19536403-19536475)
chr5 (105-141)||(20624631-20624667)
chr5 (345-416)||(21199105-21199177)
chr5 (345-397)||(21910539-21910591)
chr5 (340-372)||(26119927-26119959)
chr5 (78-138)||(33022899-33022958)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (11-515)||(2845-3346)
[»] chr6 (207 HSPs)
chr6 (11-515)||(26044228-26044712)
chr6 (11-499)||(28251243-28251730)
chr6 (11-515)||(25787716-25788234)
chr6 (11-515)||(12827707-12828226)
chr6 (105-514)||(20029677-20030084)
chr6 (105-514)||(20062428-20062835)
chr6 (105-514)||(7375531-7375938)
chr6 (11-515)||(9122811-9123314)
chr6 (11-512)||(7750914-7751414)
chr6 (127-515)||(11147044-11147431)
chr6 (11-515)||(9112174-9112677)
chr6 (11-515)||(12855035-12855538)
chr6 (11-515)||(31542577-31543080)
chr6 (11-515)||(17984388-17984892)
chr6 (11-515)||(3661397-3661899)
chr6 (11-515)||(3672061-3672563)
chr6 (11-515)||(12865561-12866064)
chr6 (126-515)||(25986096-25986483)
chr6 (11-515)||(34806839-34807342)
chr6 (36-512)||(13913067-13913538)
chr6 (11-515)||(33199342-33199844)
chr6 (11-515)||(34817471-34817974)
chr6 (11-515)||(26025473-26025976)
chr6 (11-515)||(26036047-26036550)
chr6 (11-515)||(32961608-32962111)
chr6 (11-515)||(27384447-27384950)
chr6 (11-515)||(27474860-27475363)
chr6 (11-515)||(27504359-27504862)
chr6 (11-515)||(16959636-16960138)
chr6 (11-515)||(26864802-26865305)
chr6 (11-515)||(26875426-26875929)
chr6 (11-515)||(27341708-27342211)
chr6 (11-515)||(27402448-27402951)
chr6 (11-515)||(27413107-27413610)
chr6 (11-515)||(32972227-32972730)
chr6 (12-515)||(29384766-29385267)
chr6 (127-512)||(18925556-18925941)
chr6 (151-499)||(28356529-28356877)
chr6 (163-515)||(27505956-27506309)
chr6 (9-515)||(27372846-27373315)
chr6 (9-515)||(27463196-27463665)
chr6 (127-512)||(8653678-8654063)
chr6 (11-515)||(31982288-31982808)
chr6 (105-512)||(18834409-18834812)
chr6 (11-515)||(17982199-17982683)
chr6 (11-515)||(16930465-16930950)
chr6 (11-515)||(4630887-4631403)
chr6 (127-512)||(18826035-18826416)
chr6 (104-512)||(5845102-5845524)
chr6 (127-512)||(29765553-29765934)
chr6 (36-512)||(31572432-31572920)
chr6 (127-512)||(4292744-4293125)
chr6 (128-515)||(32300842-32301225)
chr6 (128-515)||(32311531-32311914)
chr6 (167-420)||(6158316-6158569)
chr6 (145-512)||(16123350-16123715)
chr6 (127-510)||(27166240-27166619)
chr6 (144-515)||(12716645-12717017)
chr6 (144-515)||(12727294-12727666)
chr6 (127-512)||(9933468-9933849)
chr6 (128-512)||(17745562-17745960)
chr6 (112-512)||(17042639-17043036)
chr6 (128-512)||(22308808-22309189)
chr6 (257-512)||(17064212-17064467)
chr6 (128-512)||(25518708-25519086)
chr6 (14-376)||(13928341-13928699)
chr6 (161-512)||(17741532-17741880)
chr6 (161-508)||(25686577-25686923)
chr6 (11-289)||(9304-9580)
chr6 (161-508)||(25735385-25735732)
chr6 (105-495)||(25675196-25675601)
chr6 (105-508)||(25679259-25679677)
chr6 (161-435)||(25722785-25723059)
chr6 (130-295)||(32761730-32761894)
chr6 (105-512)||(19289156-19289558)
chr6 (11-203)||(10971206-10971395)
chr6 (329-512)||(12953126-12953308)
chr6 (329-512)||(18498638-18498820)
chr6 (329-512)||(31931441-31931623)
chr6 (329-511)||(11205965-11206146)
chr6 (329-512)||(18555288-18555470)
chr6 (329-486)||(7586252-7586408)
chr6 (329-508)||(11235521-11235699)
chr6 (14-298)||(16122894-16123180)
chr6 (329-487)||(17608401-17608558)
chr6 (127-281)||(17577591-17577744)
chr6 (329-487)||(21128124-21128281)
chr6 (329-487)||(20635616-20635775)
chr6 (329-487)||(17047597-17047755)
chr6 (18-162)||(25800717-25800860)
chr6 (11-155)||(18726628-18726771)
chr6 (329-487)||(22386699-22386858)
chr6 (105-202)||(18555596-18555691)
chr6 (422-515)||(26022882-26022975)
chr6 (11-118)||(10402764-10402870)
chr6 (349-487)||(14051495-14051633)
chr6 (105-195)||(18498953-18499041)
chr6 (345-468)||(29917933-29918056)
chr6 (11-118)||(11146895-11147001)
chr6 (11-89)||(12382380-12382457)
chr6 (11-89)||(27506346-27506423)
chr6 (12-89)||(25986553-25986630)
chr6 (9-118)||(30119908-30120016)
chr6 (11-118)||(32761578-32761684)
chr6 (345-468)||(15954619-15954742)
chr6 (11-98)||(1905310-1905397)
chr6 (11-98)||(11049028-11049115)
chr6 (349-487)||(14070176-14070314)
chr6 (11-98)||(28573147-28573234)
chr6 (11-89)||(7375421-7375498)
chr6 (345-450)||(9717777-9717882)
chr6 (345-450)||(32544199-32544304)
chr6 (73-138)||(34451514-34451579)
chr6 (345-416)||(16877180-16877252)
chr6 (9-89)||(18925406-18925485)
chr6 (345-416)||(22076517-22076589)
chr6 (345-416)||(22802108-22802180)
chr6 (108-155)||(1905271-1905318)
chr6 (11-98)||(12716478-12716565)
chr6 (11-98)||(12727127-12727214)
chr6 (345-450)||(21235058-21235164)
chr6 (11-98)||(22527816-22527903)
chr6 (11-98)||(32300675-32300762)
chr6 (11-98)||(32311364-32311451)
chr6 (11-89)||(10547417-10547494)
chr6 (345-399)||(12423246-12423300)
chr6 (340-378)||(19625814-19625852)
chr6 (345-450)||(20488028-20488133)
chr6 (345-399)||(20730814-20730868)
chr6 (345-399)||(21625086-21625140)
chr6 (27-89)||(22309264-22309326)
chr6 (345-398)||(19066128-19066181)
chr6 (345-397)||(12348980-12349032)
chr6 (105-202)||(12952889-12953000)
chr6 (345-416)||(13435499-13435571)
chr6 (349-416)||(15531738-15531806)
chr6 (345-416)||(16336094-16336166)
chr6 (345-416)||(17381488-17381560)
chr6 (345-416)||(18435523-18435595)
chr6 (127-202)||(31931749-31931821)
chr6 (105-157)||(31931808-31931860)
chr6 (105-160)||(11206327-11206382)
chr6 (105-160)||(11235880-11235935)
chr6 (345-404)||(14100550-14100608)
chr6 (11-118)||(17577443-17577548)
chr6 (103-138)||(19065902-19065937)
chr6 (112-155)||(25686497-25686540)
chr6 (112-155)||(30120027-30120070)
chr6 (11-89)||(8654134-8654211)
chr6 (345-399)||(16265260-16265314)
chr6 (11-89)||(20029567-20029644)
chr6 (11-89)||(20062318-20062395)
chr6 (103-194)||(20635912-20635997)
chr6 (345-379)||(21618249-21618283)
chr6 (73-135)||(24117086-24117147)
chr6 (113-155)||(25722722-25722764)
chr6 (113-155)||(25735322-25735364)
chr6 (345-399)||(26589584-26589638)
chr6 (345-399)||(26972336-26972390)
chr6 (105-174)||(30401373-30401440)
chr6 (345-399)||(33352036-33352090)
chr6 (73-138)||(16264996-16265060)
chr6 (345-417)||(19623945-19624018)
chr6 (73-138)||(19624217-19624281)
chr6 (345-382)||(26943578-26943615)
chr6 (105-141)||(9933429-9933465)
chr6 (105-141)||(11147005-11147041)
chr6 (106-138)||(14100334-14100366)
chr6 (345-416)||(15302167-15302239)
chr6 (345-416)||(17316635-17316707)
chr6 (345-416)||(19086125-19086197)
chr6 (102-138)||(19086388-19086424)
chr6 (126-157)||(1905252-1905283)
chr6 (103-138)||(16336392-16336427)
chr6 (103-138)||(17608198-17608233)
chr6 (103-138)||(19483008-19483043)
chr6 (103-138)||(19832877-19832912)
chr6 (103-138)||(26589862-26589897)
chr6 (104-138)||(13435787-13435821)
chr6 (104-138)||(15302424-15302458)
chr6 (14-88)||(16123192-16123265)
chr6 (345-418)||(19482717-19482791)
chr6 (112-154)||(21128450-21128492)
chr6 (340-378)||(25592623-25592661)
chr6 (104-138)||(26943817-26943851)
chr6 (11-64)||(3383581-3383634)
chr6 (341-378)||(7812016-7812053)
chr6 (105-138)||(10640297-10640330)
chr6 (345-378)||(10640529-10640562)
chr6 (161-202)||(11206272-11206313)
chr6 (11-64)||(13055934-13055987)
chr6 (105-138)||(13602427-13602460)
chr6 (345-378)||(19833143-19833176)
chr6 (103-156)||(22387024-22387076)
chr6 (105-138)||(23284819-23284852)
chr6 (345-398)||(24116814-24116867)
chr6 (73-138)||(33351775-33351839)
chr6 (11-59)||(9772588-9772636)
chr6 (11-59)||(11992548-11992596)
chr6 (342-378)||(12348099-12348135)
chr6 (345-416)||(13602139-13602211)
chr6 (106-138)||(16877452-16877484)
chr6 (340-372)||(18172139-18172171)
chr6 (340-372)||(19875844-19875876)
chr6 (103-135)||(20487777-20487809)
chr6 (345-416)||(23284531-23284603)
chr6 (105-141)||(25519090-25519126)
[»] chr1 (192 HSPs)
chr1 (11-515)||(4250277-4250778)
chr1 (11-515)||(35012915-35013416)
chr1 (105-514)||(39193899-39194306)
chr1 (106-512)||(20441123-20441528)
chr1 (105-515)||(154094-154502)
chr1 (105-515)||(5973757-5974166)
chr1 (105-515)||(148019-148427)
chr1 (127-515)||(7689284-7689672)
chr1 (21-515)||(4167251-4167744)
chr1 (11-512)||(18381615-18382114)
chr1 (11-515)||(5639422-5639925)
chr1 (11-515)||(21877759-21878262)
chr1 (108-515)||(23580134-23580541)
chr1 (11-515)||(5649979-5650482)
chr1 (11-515)||(12730539-12731042)
chr1 (11-515)||(12897695-12898198)
chr1 (11-515)||(12614028-12614531)
chr1 (11-515)||(12623493-12623996)
chr1 (11-515)||(12741132-12741635)
chr1 (11-515)||(21863653-21864156)
chr1 (11-515)||(19178951-19179455)
chr1 (11-515)||(33084554-33085056)
chr1 (11-515)||(10997496-10997999)
chr1 (105-512)||(39586965-39587371)
chr1 (11-515)||(2538528-2539030)
chr1 (11-515)||(3171614-3172118)
chr1 (11-515)||(3182216-3182720)
chr1 (11-515)||(21895194-21895714)
chr1 (11-515)||(36236141-36236644)
chr1 (11-515)||(36246688-36247191)
chr1 (11-515)||(38095068-38095572)
chr1 (11-515)||(38105693-38106197)
chr1 (127-512)||(47195257-47195641)
chr1 (11-515)||(4177907-4178393)
chr1 (11-515)||(51628881-51629402)
chr1 (126-515)||(7507294-7507683)
chr1 (126-515)||(7517891-7518280)
chr1 (11-515)||(19187830-19188315)
chr1 (11-515)||(51656141-51656663)
chr1 (11-515)||(5843812-5844333)
chr1 (126-515)||(5833210-5833600)
chr1 (127-512)||(11194897-11195277)
chr1 (126-515)||(47607756-47608146)
chr1 (126-515)||(47618364-47618754)
chr1 (127-512)||(9050314-9050698)
chr1 (145-512)||(17957236-17957601)
chr1 (144-515)||(35401008-35401380)
chr1 (144-515)||(35404235-35404607)
chr1 (144-515)||(35648534-35648906)
chr1 (161-512)||(14387987-14388336)
chr1 (144-515)||(35637882-35638254)
chr1 (161-512)||(675443-675791)
chr1 (161-512)||(41132477-41132825)
chr1 (161-510)||(18310833-18311180)
chr1 (275-512)||(20195667-20195903)
chr1 (129-405)||(12946818-12947091)
chr1 (105-512)||(46180686-46181089)
chr1 (108-291)||(30291884-30292066)
chr1 (329-512)||(20798936-20799118)
chr1 (329-512)||(20883910-20884092)
chr1 (329-512)||(23926930-23927112)
chr1 (329-512)||(45070681-45070863)
chr1 (329-512)||(22610002-22610184)
chr1 (329-487)||(5929600-5929757)
chr1 (105-487)||(28474124-28474499)
chr1 (11-155)||(7507688-7507832)
chr1 (11-155)||(7518285-7518429)
chr1 (329-487)||(17370938-17371097)
chr1 (329-487)||(19037903-19038061)
chr1 (329-487)||(28379892-28380049)
chr1 (329-487)||(52350712-52350869)
chr1 (330-487)||(19170360-19170518)
chr1 (329-483)||(44200912-44201066)
chr1 (329-487)||(20251671-20251828)
chr1 (329-487)||(22019232-22019391)
chr1 (329-487)||(22655373-22655532)
chr1 (11-88)||(7689133-7689210)
chr1 (348-487)||(21543925-21544064)
chr1 (329-487)||(22642791-22642950)
chr1 (329-397)||(23064935-23065003)
chr1 (345-488)||(25448608-25448751)
chr1 (345-416)||(1900311-1900383)
chr1 (345-416)||(36134156-36134228)
chr1 (11-98)||(5833661-5833748)
chr1 (11-98)||(19063506-19063593)
chr1 (345-487)||(22464851-22464993)
chr1 (73-136)||(30572421-30572484)
chr1 (11-98)||(35400841-35400928)
chr1 (11-98)||(35404068-35404155)
chr1 (11-98)||(35648367-35648454)
chr1 (345-415)||(37642215-37642286)
chr1 (11-98)||(47607608-47607695)
chr1 (11-98)||(47618216-47618303)
chr1 (11-89)||(147909-147987)
chr1 (11-89)||(5974198-5974276)
chr1 (11-89)||(20441012-20441089)
chr1 (345-399)||(22153841-22153895)
chr1 (345-399)||(35040150-35040204)
chr1 (73-138)||(21984825-21984890)
chr1 (345-416)||(21702780-21702852)
chr1 (345-416)||(22427399-22427471)
chr1 (329-487)||(26548282-26548441)
chr1 (11-94)||(46686576-46686660)
chr1 (345-416)||(48570273-48570345)
chr1 (108-155)||(5833588-5833635)
chr1 (103-195)||(19170140-19170227)
chr1 (105-160)||(20799299-20799354)
chr1 (345-487)||(32785979-32786121)
chr1 (11-98)||(35637715-35637802)
chr1 (105-160)||(45070445-45070499)
chr1 (19-118)||(47195684-47195781)
chr1 (108-155)||(47607721-47607768)
chr1 (108-155)||(47618329-47618376)
chr1 (11-89)||(153984-154062)
chr1 (345-399)||(2268515-2268569)
chr1 (345-399)||(2327482-2327536)
chr1 (76-138)||(12284693-12284754)
chr1 (345-399)||(22600224-22600278)
chr1 (19-89)||(24252951-24253020)
chr1 (11-89)||(26577053-26577130)
chr1 (11-89)||(39193789-39193866)
chr1 (19-89)||(39587403-39587472)
chr1 (105-154)||(23927268-23927317)
chr1 (74-138)||(2268781-2268845)
chr1 (345-416)||(19215578-19215650)
chr1 (103-154)||(21120879-21120928)
chr1 (345-416)||(21135202-21135274)
chr1 (345-416)||(30572163-30572235)
chr1 (345-381)||(39201034-39201070)
chr1 (345-416)||(46088955-46089027)
chr1 (103-138)||(2327216-2327251)
chr1 (345-419)||(7745132-7745207)
chr1 (345-399)||(14263493-14263548)
chr1 (103-157)||(19215820-19215872)
chr1 (105-152)||(20883672-20883719)
chr1 (347-398)||(21121108-21121159)
chr1 (103-138)||(23024998-23025033)
chr1 (103-138)||(42284856-42284891)
chr1 (105-159)||(675807-675861)
chr1 (345-399)||(2267073-2267127)
chr1 (11-127)||(13664934-13665051)
chr1 (345-399)||(23024772-23024826)
chr1 (11-89)||(23580055-23580133)
chr1 (11-89)||(30291805-30291883)
chr1 (345-399)||(44821587-44821641)
chr1 (74-135)||(7310060-7310121)
chr1 (161-202)||(20883743-20883784)
chr1 (345-382)||(21191907-21191944)
chr1 (73-138)||(22599943-22600008)
chr1 (73-138)||(30893316-30893380)
chr1 (345-416)||(16235338-16235410)
chr1 (14-118)||(21165240-21165342)
chr1 (105-141)||(22609783-22609819)
chr1 (345-416)||(26702171-26702243)
chr1 (345-416)||(29215763-29215835)
chr1 (345-416)||(33256393-33256465)
chr1 (345-416)||(33276565-33276637)
chr1 (78-138)||(46089233-46089293)
chr1 (14-89)||(9050169-9050243)
chr1 (106-141)||(9050276-9050311)
chr1 (103-138)||(21134975-21135010)
chr1 (107-138)||(21204726-21204757)
chr1 (345-399)||(35401792-35401847)
chr1 (103-138)||(37642478-37642513)
chr1 (103-138)||(44821352-44821387)
chr1 (345-399)||(10250970-10251024)
chr1 (345-450)||(10757354-10757459)
chr1 (14-88)||(17957686-17957759)
chr1 (106-152)||(18310763-18310809)
chr1 (73-138)||(21191642-21191705)
chr1 (368-433)||(24028751-24028816)
chr1 (105-139)||(26576986-26577020)
chr1 (345-398)||(1577852-1577905)
chr1 (11-64)||(5242105-5242158)
chr1 (105-138)||(12613588-12613621)
chr1 (345-382)||(12613856-12613893)
chr1 (36-89)||(12947168-12947220)
chr1 (105-138)||(17024774-17024807)
chr1 (345-378)||(18896639-18896672)
chr1 (345-378)||(21204965-21204998)
chr1 (345-398)||(22201778-22201831)
chr1 (345-450)||(23036569-23036676)
chr1 (11-64)||(23359063-23359116)
chr1 (104-153)||(29216005-29216054)
chr1 (348-416)||(34255561-34255630)
chr1 (73-138)||(35040404-35040468)
chr1 (350-399)||(38282551-38282600)
chr1 (348-399)||(2834673-2834725)
chr1 (340-376)||(23054373-23054409)
chr1 (11-59)||(36536792-36536840)
chr1 (345-416)||(42284594-42284666)
chr1 (161-189)||(45070514-45070542)
[»] chr7 (192 HSPs)
chr7 (11-515)||(14745419-14745920)
chr7 (11-515)||(20491056-20491557)
chr7 (105-515)||(1367679-1368087)
chr7 (11-515)||(31116243-31116762)
chr7 (127-515)||(15888193-15888579)
chr7 (11-509)||(19985562-19986058)
chr7 (105-514)||(21769785-21770192)
chr7 (105-515)||(9171035-9171443)
chr7 (11-515)||(20989701-20990204)
chr7 (105-515)||(44280546-44280954)
chr7 (11-515)||(21002757-21003260)
chr7 (11-515)||(9433312-9433815)
chr7 (105-515)||(9170234-9170642)
chr7 (11-515)||(9443908-9444411)
chr7 (127-515)||(589262-589648)
chr7 (105-515)||(3165784-3166192)
chr7 (105-515)||(9159779-9160187)
chr7 (11-515)||(6866974-6867477)
chr7 (11-515)||(6877606-6878109)
chr7 (11-515)||(24930352-24930855)
chr7 (11-515)||(37344248-37344752)
chr7 (11-515)||(454548-455051)
chr7 (11-515)||(467330-467833)
chr7 (11-515)||(8617434-8617937)
chr7 (11-515)||(48710240-48710743)
chr7 (11-515)||(2705361-2705864)
chr7 (11-515)||(8627997-8628500)
chr7 (11-515)||(11096103-11096606)
chr7 (11-515)||(26653074-26653577)
chr7 (11-515)||(26699403-26699906)
chr7 (11-515)||(2715965-2716468)
chr7 (11-515)||(4222658-4223161)
chr7 (11-515)||(9085332-9085834)
chr7 (11-515)||(9095046-9095548)
chr7 (11-515)||(17949867-17950370)
chr7 (11-515)||(4212059-4212562)
chr7 (11-515)||(22089171-22089674)
chr7 (11-515)||(22099786-22100289)
chr7 (11-515)||(40041858-40042360)
chr7 (11-515)||(40052407-40052909)
chr7 (11-515)||(17960473-17960976)
chr7 (11-515)||(166930-167433)
chr7 (11-515)||(177522-178025)
chr7 (11-515)||(5685567-5686053)
chr7 (11-514)||(8001812-8002316)
chr7 (11-514)||(8012457-8012961)
chr7 (11-515)||(11005233-11005753)
chr7 (143-515)||(541133-541505)
chr7 (128-512)||(18441249-18441629)
chr7 (19-512)||(30049571-30050078)
chr7 (121-512)||(40054612-40055001)
chr7 (126-515)||(26389959-26390348)
chr7 (126-515)||(24734801-24735190)
chr7 (126-515)||(24744748-24745137)
chr7 (126-515)||(26400601-26400990)
chr7 (128-512)||(18419168-18419548)
chr7 (105-512)||(26209393-26209795)
chr7 (11-515)||(1987588-1988127)
chr7 (11-515)||(1998209-1998748)
chr7 (105-512)||(13682374-13682776)
chr7 (106-451)||(38593578-38593921)
chr7 (161-512)||(3476239-3476587)
chr7 (11-515)||(42865875-42866414)
chr7 (11-515)||(42876501-42877040)
chr7 (105-512)||(29590046-29590448)
chr7 (105-451)||(8933634-8933976)
chr7 (105-407)||(6044055-6044354)
chr7 (105-512)||(15216370-15216772)
chr7 (105-512)||(12734011-12734413)
chr7 (11-291)||(26290100-26290378)
chr7 (11-246)||(23264341-23264573)
chr7 (299-515)||(26294064-26294281)
chr7 (161-405)||(48382304-48382548)
chr7 (329-512)||(24882485-24882667)
chr7 (11-221)||(9261512-9261720)
chr7 (387-512)||(38403331-38403455)
chr7 (329-487)||(8998998-8999155)
chr7 (331-487)||(11087110-11087265)
chr7 (11-141)||(26389810-26389940)
chr7 (11-141)||(26400452-26400582)
chr7 (105-201)||(19193262-19193356)
chr7 (11-118)||(589691-589798)
chr7 (11-118)||(15888027-15888133)
chr7 (143-270)||(22494043-22494169)
chr7 (329-487)||(13174668-13174827)
chr7 (345-416)||(44467027-44467099)
chr7 (349-490)||(602654-602796)
chr7 (11-118)||(24244200-24244307)
chr7 (11-89)||(10561220-10561298)
chr7 (345-487)||(23280081-23280224)
chr7 (345-416)||(30944446-30944518)
chr7 (345-416)||(30945479-30945551)
chr7 (11-98)||(541521-541608)
chr7 (11-98)||(22493940-22494027)
chr7 (11-98)||(23649266-23649353)
chr7 (11-98)||(24450682-24450769)
chr7 (11-98)||(45922150-45922237)
chr7 (11-89)||(1368120-1368197)
chr7 (11-89)||(3166224-3166302)
chr7 (345-399)||(4821455-4821509)
chr7 (11-89)||(9160220-9160297)
chr7 (11-89)||(9170675-9170752)
chr7 (11-89)||(9171476-9171553)
chr7 (345-450)||(16112007-16112112)
chr7 (11-89)||(21769675-21769752)
chr7 (345-399)||(27871699-27871753)
chr7 (345-450)||(33691835-33691940)
chr7 (345-450)||(48237025-48237130)
chr7 (345-416)||(21283496-21283568)
chr7 (101-152)||(3476164-3476215)
chr7 (345-399)||(8182911-8182965)
chr7 (345-399)||(9069543-9069597)
chr7 (11-89)||(20311912-20311990)
chr7 (345-399)||(24788122-24788176)
chr7 (345-399)||(28409020-28409074)
chr7 (11-89)||(44280986-44281064)
chr7 (458-512)||(48382243-48382297)
chr7 (73-154)||(9709676-9709756)
chr7 (345-382)||(14426545-14426582)
chr7 (345-382)||(22578144-22578181)
chr7 (345-398)||(24794838-24794891)
chr7 (106-155)||(25201426-25201475)
chr7 (103-156)||(48805745-48805797)
chr7 (345-416)||(1292993-1293065)
chr7 (345-416)||(2265642-2265713)
chr7 (345-416)||(4494540-4494612)
chr7 (73-137)||(21381296-21381359)
chr7 (105-202)||(24882248-24882359)
chr7 (347-450)||(28622481-28622584)
chr7 (345-416)||(35952811-35952883)
chr7 (103-138)||(14425672-14425707)
chr7 (11-118)||(25201316-25201421)
chr7 (11-98)||(24735234-24735323)
chr7 (11-98)||(24745181-24745270)
chr7 (345-399)||(48806002-48806056)
chr7 (348-416)||(4412088-4412157)
chr7 (345-382)||(14193112-14193149)
chr7 (73-138)||(14193325-14193390)
chr7 (345-382)||(14425445-14425482)
chr7 (73-138)||(14426765-14426829)
chr7 (105-138)||(19236886-19236919)
chr7 (345-382)||(19237166-19237203)
chr7 (345-398)||(19339373-19339426)
chr7 (345-398)||(21692269-21692322)
chr7 (104-137)||(24794631-24794664)
chr7 (73-138)||(27871945-27872010)
chr7 (346-399)||(32264842-32264895)
chr7 (345-416)||(331608-331680)
chr7 (345-416)||(9709925-9709997)
chr7 (347-450)||(15467846-15467949)
chr7 (345-416)||(19711136-19711208)
chr7 (78-138)||(30945237-30945296)
chr7 (345-397)||(33605668-33605720)
chr7 (345-416)||(39284687-39284759)
chr7 (345-416)||(41842396-41842468)
chr7 (103-138)||(8183179-8183214)
chr7 (103-138)||(9069814-9069849)
chr7 (347-378)||(13894123-13894154)
chr7 (103-138)||(19339147-19339182)
chr7 (14-89)||(38593471-38593545)
chr7 (103-156)||(4821707-4821758)
chr7 (19-89)||(6043951-6044020)
chr7 (340-378)||(7488023-7488061)
chr7 (104-138)||(13648949-13648983)
chr7 (345-399)||(16316680-16316734)
chr7 (104-138)||(28409289-28409323)
chr7 (104-138)||(30026142-30026176)
chr7 (14-88)||(40054489-40054562)
chr7 (105-155)||(48382569-48382619)
chr7 (11-64)||(1776797-1776850)
chr7 (104-137)||(2265423-2265456)
chr7 (345-398)||(2913731-2913784)
chr7 (103-156)||(4428944-4428996)
chr7 (73-154)||(13137767-13137847)
chr7 (105-138)||(13880842-13880875)
chr7 (105-138)||(15088757-15088790)
chr7 (105-138)||(24788361-24788394)
chr7 (103-136)||(32264614-32264647)
chr7 (73-138)||(48062672-48062737)
chr7 (11-59)||(923308-923356)
chr7 (106-138)||(4494725-4494757)
chr7 (345-416)||(12366871-12366943)
chr7 (345-416)||(13138018-13138090)
chr7 (340-372)||(13172470-13172502)
chr7 (345-416)||(13302773-13302845)
chr7 (102-138)||(13880355-13880391)
chr7 (78-138)||(15468167-15468226)
chr7 (105-141)||(18419552-18419588)
chr7 (345-416)||(21695364-21695436)
chr7 (104-155)||(22577896-22577945)
chr7 (345-416)||(29935481-29935553)
chr7 (349-416)||(48062947-48063015)
[»] chr8 (173 HSPs)
chr8 (11-490)||(1750194-1750673)
chr8 (11-515)||(19225010-19225529)
chr8 (11-515)||(30314382-30314900)
chr8 (105-514)||(19418429-19418836)
chr8 (105-514)||(19429004-19429413)
chr8 (11-515)||(23469145-23469665)
chr8 (105-515)||(20161025-20161433)
chr8 (105-515)||(20196034-20196442)
chr8 (11-515)||(6318238-6318721)
chr8 (11-515)||(23456989-23457508)
chr8 (11-515)||(19139355-19139858)
chr8 (11-515)||(31215091-31215626)
chr8 (11-515)||(3220707-3221211)
chr8 (12-515)||(26111307-26111809)
chr8 (12-515)||(26120985-26121487)
chr8 (11-515)||(209856-210358)
chr8 (11-515)||(252484-252986)
chr8 (11-515)||(723479-723981)
chr8 (11-515)||(848670-849172)
chr8 (11-515)||(15791001-15791504)
chr8 (127-512)||(16747080-16747463)
chr8 (105-512)||(18158334-18158740)
chr8 (11-512)||(18153815-18154329)
chr8 (11-515)||(36078010-36078514)
chr8 (11-515)||(36088596-36089100)
chr8 (11-515)||(241899-242401)
chr8 (11-515)||(15780412-15780915)
chr8 (127-512)||(18768955-18769339)
chr8 (11-515)||(29076806-29077308)
chr8 (11-515)||(29087057-29087559)
chr8 (11-515)||(9341219-9341723)
chr8 (11-515)||(9856174-9856677)
chr8 (11-515)||(18449445-18449948)
chr8 (11-515)||(32087972-32088474)
chr8 (11-515)||(6151145-6151649)
chr8 (11-515)||(6161100-6161603)
chr8 (11-515)||(32077399-32077901)
chr8 (11-515)||(43248401-43248895)
chr8 (11-515)||(19128823-19129308)
chr8 (124-515)||(36292994-36293385)
chr8 (124-515)||(36303597-36303988)
chr8 (11-515)||(9368363-9368867)
chr8 (126-515)||(3348443-3348832)
chr8 (126-515)||(3359040-3359429)
chr8 (105-512)||(3843602-3844004)
chr8 (11-515)||(44481166-44481681)
chr8 (11-515)||(44491782-44492297)
chr8 (145-512)||(40213006-40213371)
chr8 (285-515)||(30325227-30325456)
chr8 (163-502)||(6576373-6576712)
chr8 (144-515)||(13688401-13688773)
chr8 (105-512)||(20259416-20259818)
chr8 (105-512)||(21046046-21046448)
chr8 (11-302)||(28691189-28691476)
chr8 (112-512)||(23370633-23371039)
chr8 (11-248)||(30324996-30325231)
chr8 (11-277)||(16436764-16437026)
chr8 (329-512)||(7018400-7018582)
chr8 (329-512)||(22135877-22136059)
chr8 (329-512)||(22167042-22167224)
chr8 (329-512)||(22211407-22211589)
chr8 (11-197)||(795586-795771)
chr8 (368-515)||(795254-795401)
chr8 (329-511)||(23271223-23271405)
chr8 (329-487)||(28903349-28903507)
chr8 (329-487)||(8031923-8032081)
chr8 (105-489)||(19461051-19461445)
chr8 (105-489)||(19558729-19559123)
chr8 (329-487)||(40003118-40003277)
chr8 (11-155)||(3348307-3348455)
chr8 (11-155)||(3358904-3359052)
chr8 (11-138)||(6576258-6576384)
chr8 (345-509)||(15425273-15425437)
chr8 (329-487)||(17519161-17519320)
chr8 (345-490)||(15336208-15336353)
chr8 (345-490)||(15516577-15516722)
chr8 (105-202)||(22135657-22135752)
chr8 (332-487)||(21540841-21540997)
chr8 (329-468)||(29379486-29379626)
chr8 (345-487)||(45568021-45568163)
chr8 (11-89)||(16747534-16747611)
chr8 (144-261)||(13596380-13596496)
chr8 (345-416)||(13430748-13430820)
chr8 (345-416)||(45538559-45538631)
chr8 (11-98)||(13596213-13596300)
chr8 (11-98)||(13688234-13688321)
chr8 (105-160)||(22166806-22166861)
chr8 (105-195)||(22211186-22211274)
chr8 (108-173)||(13596326-13596390)
chr8 (345-487)||(23185346-23185489)
chr8 (345-416)||(36105154-36105226)
chr8 (345-487)||(21932772-21932914)
chr8 (105-160)||(23783757-23783812)
chr8 (19-118)||(26734709-26734806)
chr8 (345-450)||(1237563-1237668)
chr8 (345-399)||(6407703-6407757)
chr8 (345-399)||(16207283-16207337)
chr8 (345-399)||(17797399-17797453)
chr8 (11-89)||(19418869-19418946)
chr8 (11-89)||(20160915-20160993)
chr8 (11-89)||(20196474-20196552)
chr8 (105-155)||(23269688-23269738)
chr8 (348-416)||(14989574-14989643)
chr8 (16-89)||(19429446-19429518)
chr8 (103-156)||(43774098-43774150)
chr8 (345-416)||(19943194-19943266)
chr8 (163-202)||(7018236-7018275)
chr8 (348-399)||(18151769-18151820)
chr8 (11-94)||(23579577-23579660)
chr8 (345-399)||(9320546-9320599)
chr8 (11-89)||(18158772-18158849)
chr8 (104-138)||(21288625-21288659)
chr8 (345-399)||(22673755-22673809)
chr8 (345-399)||(24551251-24551305)
chr8 (340-378)||(26833034-26833072)
chr8 (345-399)||(30421549-30421603)
chr8 (103-156)||(36105440-36105491)
chr8 (103-156)||(40845258-40845309)
chr8 (345-399)||(40845507-40845561)
chr8 (105-154)||(7018198-7018246)
chr8 (73-138)||(17441663-17441727)
chr8 (354-450)||(18121235-18121331)
chr8 (11-84)||(23339397-23339470)
chr8 (345-416)||(43639741-43639814)
chr8 (102-138)||(18680046-18680082)
chr8 (105-141)||(18768916-18768952)
chr8 (105-141)||(23380769-23380805)
chr8 (161-201)||(23783702-23783742)
chr8 (106-138)||(24646585-24646617)
chr8 (345-416)||(39693494-39693566)
chr8 (103-138)||(1745382-1745417)
chr8 (11-58)||(15969130-15969177)
chr8 (103-138)||(18151550-18151585)
chr8 (73-132)||(20255408-20255466)
chr8 (103-138)||(22663377-22663412)
chr8 (11-118)||(23269579-23269684)
chr8 (103-138)||(24832941-24832976)
chr8 (11-66)||(36293425-36293480)
chr8 (11-66)||(36304028-36304083)
chr8 (345-399)||(602840-602894)
chr8 (113-155)||(2811052-2811094)
chr8 (105-155)||(3833174-3833224)
chr8 (77-138)||(19707750-19707809)
chr8 (27-89)||(22623069-22623130)
chr8 (103-137)||(24551536-24551570)
chr8 (104-138)||(29693562-29693596)
chr8 (345-414)||(43644857-43644927)
chr8 (105-138)||(18321045-18321078)
chr8 (345-378)||(18685517-18685550)
chr8 (345-378)||(18722766-18722799)
chr8 (345-378)||(18731111-18731144)
chr8 (73-138)||(19156429-19156493)
chr8 (105-138)||(19956222-19956255)
chr8 (73-138)||(20382236-20382300)
chr8 (345-398)||(21301000-21301053)
chr8 (161-202)||(22166876-22166917)
chr8 (345-398)||(24646316-24646369)
chr8 (11-64)||(31043308-31043361)
chr8 (106-154)||(40212955-40213004)
chr8 (106-138)||(602606-602638)
chr8 (105-141)||(3844259-3844295)
chr8 (106-138)||(15335931-15335963)
chr8 (106-138)||(15424996-15425028)
chr8 (106-138)||(15516300-15516332)
chr8 (102-138)||(17267718-17267754)
chr8 (340-372)||(17687986-17688018)
chr8 (73-156)||(17797652-17797731)
chr8 (345-416)||(21288362-21288434)
chr8 (106-138)||(22674024-22674056)
chr8 (345-381)||(23263732-23263768)
chr8 (345-416)||(25164029-25164101)
chr8 (73-136)||(43645081-43645142)
chr8 (73-137)||(45538295-45538358)
[»] chr2 (174 HSPs)
chr2 (11-512)||(18768577-18769092)
chr2 (105-515)||(28721097-28721505)
chr2 (127-515)||(21172269-21172655)
chr2 (17-515)||(28731581-28732091)
chr2 (11-515)||(7005494-7005997)
chr2 (11-512)||(24414694-24415208)
chr2 (11-515)||(29244260-29244763)
chr2 (11-515)||(9897261-9897764)
chr2 (11-515)||(9907849-9908352)
chr2 (11-515)||(29254839-29255342)
chr2 (11-515)||(43093294-43093798)
chr2 (11-515)||(10267032-10267535)
chr2 (11-515)||(10277609-10278112)
chr2 (11-515)||(24327421-24327924)
chr2 (11-515)||(40222371-40222874)
chr2 (11-515)||(40251232-40251735)
chr2 (129-515)||(2561529-2561913)
chr2 (11-515)||(43082685-43083189)
chr2 (11-515)||(17857124-17857627)
chr2 (11-515)||(21650219-21650721)
chr2 (11-515)||(22914551-22915054)
chr2 (11-515)||(43355061-43355563)
chr2 (11-515)||(11388495-11388999)
chr2 (11-515)||(9772993-9773496)
chr2 (11-515)||(22960019-22960522)
chr2 (11-515)||(24338091-24338594)
chr2 (11-515)||(34477967-34478469)
chr2 (11-515)||(34789904-34790407)
chr2 (11-515)||(34804047-34804550)
chr2 (11-515)||(9762457-9762960)
chr2 (11-515)||(43345446-43345948)
chr2 (11-515)||(32217912-32218415)
chr2 (11-515)||(30488510-30489014)
chr2 (11-515)||(4209929-4210432)
chr2 (11-515)||(4220521-4221024)
chr2 (127-512)||(26867114-26867498)
chr2 (11-515)||(39169775-39170285)
chr2 (14-512)||(27978058-27978568)
chr2 (14-512)||(28064587-28065097)
chr2 (11-515)||(36251548-36252034)
chr2 (108-515)||(1098978-1099385)
chr2 (108-515)||(4099822-4100229)
chr2 (11-515)||(11394841-11395362)
chr2 (11-515)||(11405157-11405678)
chr2 (127-512)||(38585890-38586273)
chr2 (127-512)||(26879703-26880087)
chr2 (11-515)||(27221419-27221941)
chr2 (11-515)||(35274254-35274776)
chr2 (144-514)||(18392456-18392826)
chr2 (128-512)||(967309-967688)
chr2 (144-515)||(35253020-35253392)
chr2 (144-515)||(35263629-35264001)
chr2 (112-512)||(36784594-36784983)
chr2 (127-410)||(24425354-24425635)
chr2 (127-512)||(24275069-24275448)
chr2 (131-406)||(28374320-28374595)
chr2 (127-512)||(22774402-22774784)
chr2 (105-512)||(17968973-17969394)
chr2 (105-512)||(19497773-19498176)
chr2 (11-291)||(16777117-16777395)
chr2 (127-512)||(22763698-22764080)
chr2 (299-515)||(16768981-16769198)
chr2 (127-481)||(22779811-22780162)
chr2 (11-234)||(20236714-20236935)
chr2 (11-221)||(20070568-20070776)
chr2 (274-511)||(19299959-19300194)
chr2 (274-511)||(19312966-19313201)
chr2 (329-511)||(20646610-20646791)
chr2 (406-512)||(24427667-24427773)
chr2 (329-512)||(19356363-19356545)
chr2 (332-487)||(1083905-1084061)
chr2 (131-278)||(28379659-28379806)
chr2 (329-487)||(24814633-24814792)
chr2 (11-118)||(21172120-21172226)
chr2 (105-202)||(19356672-19356767)
chr2 (27-155)||(6081589-6081717)
chr2 (329-450)||(22755395-22755516)
chr2 (11-89)||(24425206-24425283)
chr2 (11-98)||(38208213-38208301)
chr2 (11-98)||(18392288-18392375)
chr2 (11-98)||(35253472-35253559)
chr2 (11-98)||(35264081-35264168)
chr2 (11-89)||(26880158-26880235)
chr2 (345-450)||(28711765-28711870)
chr2 (11-89)||(30795238-30795315)
chr2 (345-450)||(31800954-31801059)
chr2 (126-179)||(38208116-38208169)
chr2 (345-487)||(6574191-6574334)
chr2 (345-416)||(28550985-28551057)
chr2 (345-416)||(31328033-31328104)
chr2 (345-416)||(31334754-31334825)
chr2 (345-416)||(33074187-33074259)
chr2 (108-156)||(35253398-35253446)
chr2 (108-156)||(35264007-35264055)
chr2 (14-141)||(38585761-38585887)
chr2 (105-160)||(19297423-19297477)
chr2 (11-118)||(28720987-28721093)
chr2 (11-89)||(1098899-1098977)
chr2 (11-89)||(4100230-4100308)
chr2 (11-89)||(26867569-26867646)
chr2 (345-399)||(28701296-28701350)
chr2 (345-399)||(31968110-31968164)
chr2 (103-160)||(23392494-23392550)
chr2 (102-154)||(24576284-24576334)
chr2 (73-138)||(40782718-40782783)
chr2 (105-202)||(20646377-20646485)
chr2 (345-416)||(22776355-22776427)
chr2 (345-416)||(22781733-22781805)
chr2 (345-416)||(30557388-30557459)
chr2 (345-416)||(39037709-39037781)
chr2 (340-379)||(20568134-20568173)
chr2 (345-487)||(23392735-23392877)
chr2 (106-141)||(26867501-26867536)
chr2 (106-141)||(26880090-26880125)
chr2 (106-141)||(28374278-28374313)
chr2 (108-155)||(38208174-38208221)
chr2 (348-414)||(41121789-41121856)
chr2 (19-89)||(20417324-20417393)
chr2 (105-155)||(20417425-20417475)
chr2 (345-399)||(22802440-22802493)
chr2 (11-89)||(28379507-28379584)
chr2 (73-138)||(39037444-39037507)
chr2 (329-374)||(21025530-21025575)
chr2 (73-138)||(30667238-30667302)
chr2 (104-141)||(38631181-38631218)
chr2 (345-382)||(44840430-44840467)
chr2 (345-416)||(1587100-1587171)
chr2 (144-195)||(19312838-19312887)
chr2 (345-416)||(22188169-22188241)
chr2 (102-138)||(23235256-23235292)
chr2 (105-141)||(24275451-24275487)
chr2 (345-416)||(24377062-24377134)
chr2 (345-416)||(24575996-24576068)
chr2 (345-416)||(40332048-40332120)
chr2 (103-138)||(6392868-6392903)
chr2 (105-160)||(19312784-19312838)
chr2 (364-450)||(20152112-20152198)
chr2 (103-138)||(22802706-22802741)
chr2 (102-137)||(30621437-30621472)
chr2 (102-137)||(30624058-30624093)
chr2 (103-138)||(33074474-33074509)
chr2 (124-155)||(38208157-38208188)
chr2 (345-450)||(38781326-38781432)
chr2 (103-138)||(44840654-44840689)
chr2 (161-259)||(6081470-6081568)
chr2 (345-399)||(14581494-14581548)
chr2 (103-137)||(14581685-14581719)
chr2 (127-173)||(20417464-20417509)
chr2 (345-399)||(21537315-21537369)
chr2 (104-138)||(23184147-23184181)
chr2 (104-138)||(23595404-23595438)
chr2 (104-138)||(25829352-25829386)
chr2 (80-138)||(28711507-28711564)
chr2 (103-137)||(34321738-34321772)
chr2 (105-138)||(10009569-10009602)
chr2 (348-416)||(10009820-10009889)
chr2 (345-398)||(13964045-13964098)
chr2 (105-138)||(22187920-22187953)
chr2 (348-416)||(22258162-22258231)
chr2 (345-398)||(23234987-23235040)
chr2 (345-398)||(25037326-25037379)
chr2 (345-398)||(25041433-25041486)
chr2 (345-378)||(26619168-26619201)
chr2 (345-398)||(30666969-30667022)
chr2 (105-141)||(967269-967305)
chr2 (345-416)||(19540377-19540449)
chr2 (106-138)||(19540648-19540680)
chr2 (112-160)||(22755691-22755738)
chr2 (345-416)||(23184371-23184443)
chr2 (345-416)||(23595634-23595706)
chr2 (340-372)||(24440794-24440826)
chr2 (78-138)||(28140427-28140487)
chr2 (345-416)||(34322003-34322075)
chr2 (103-135)||(45086984-45087016)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (11-515)||(53832-54333)
scaffold0028 (11-515)||(14629-15132)
scaffold0028 (345-399)||(5674-5728)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (129-511)||(6711-7092)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (11-515)||(6550-7053)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (127-515)||(42344-42730)
scaffold0133 (11-515)||(31177-31681)
scaffold0133 (11-118)||(42195-42301)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (105-514)||(2021-2427)
scaffold0391 (11-89)||(1911-1988)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (105-512)||(7555-7962)
scaffold0068 (11-512)||(10310-10809)
scaffold0068 (11-89)||(7446-7523)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (127-512)||(32727-33110)
scaffold0047 (11-515)||(40161-40664)
scaffold0047 (11-89)||(32579-32656)
scaffold0047 (105-142)||(32688-32725)
[»] scaffold0216 (3 HSPs)
scaffold0216 (127-499)||(1-372)
scaffold0216 (11-88)||(444-520)
scaffold0216 (105-141)||(375-411)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (11-515)||(12401-12904)
[»] scaffold0002 (8 HSPs)
scaffold0002 (128-512)||(117148-117530)
scaffold0002 (329-487)||(475305-475464)
scaffold0002 (329-487)||(481825-481984)
scaffold0002 (105-173)||(347448-347515)
scaffold0002 (329-487)||(156681-156840)
scaffold0002 (11-119)||(347320-347428)
scaffold0002 (105-141)||(117534-117570)
scaffold0002 (11-87)||(117604-117679)
[»] scaffold0267 (2 HSPs)
scaffold0267 (127-509)||(6043-6423)
scaffold0267 (11-92)||(5894-5974)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (12-420)||(7773-8178)
[»] scaffold0272 (6 HSPs)
scaffold0272 (127-512)||(13430-13814)
scaffold0272 (11-118)||(12977-13082)
scaffold0272 (11-89)||(13282-13359)
scaffold0272 (106-155)||(13087-13136)
scaffold0272 (127-202)||(13125-13199)
scaffold0272 (106-141)||(13392-13427)
[»] scaffold0072 (3 HSPs)
scaffold0072 (143-512)||(36574-36942)
scaffold0072 (11-89)||(36410-36487)
scaffold0072 (104-155)||(36518-36569)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (105-512)||(5345-5748)
scaffold0042 (127-355)||(12896-13121)
scaffold0042 (27-89)||(5783-5844)
scaffold0042 (27-89)||(13195-13256)
scaffold0042 (105-141)||(13124-13160)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (127-512)||(11941-12322)
scaffold0407 (161-451)||(15804-16092)
scaffold0407 (105-141)||(11902-11938)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (108-515)||(8006-8414)
scaffold0105 (108-515)||(36761-37169)
scaffold0105 (108-490)||(47395-47778)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (127-515)||(19287-19688)
scaffold0099 (104-512)||(16719-17152)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (128-515)||(51927-52316)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (11-257)||(53339-53584)
scaffold0083 (105-138)||(25798-25831)
[»] scaffold0497 (2 HSPs)
scaffold0497 (128-512)||(10114-10494)
scaffold0497 (105-141)||(10074-10110)
[»] scaffold0084 (7 HSPs)
scaffold0084 (127-512)||(56606-56988)
scaffold0084 (11-89)||(56455-56532)
scaffold0084 (345-416)||(32452-32524)
scaffold0084 (345-392)||(417-464)
scaffold0084 (366-419)||(464-518)
scaffold0084 (104-136)||(32728-32760)
scaffold0084 (105-141)||(56567-56603)
[»] scaffold0012 (7 HSPs)
scaffold0012 (102-512)||(127696-128101)
scaffold0012 (127-512)||(140854-141235)
scaffold0012 (329-511)||(7674-7856)
scaffold0012 (345-416)||(215569-215641)
scaffold0012 (105-160)||(7441-7495)
scaffold0012 (102-141)||(141238-141277)
scaffold0012 (11-59)||(64554-64602)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (127-512)||(35587-35967)
[»] scaffold0017 (7 HSPs)
scaffold0017 (127-512)||(175374-175755)
scaffold0017 (127-373)||(180424-180667)
scaffold0017 (329-511)||(40369-40551)
scaffold0017 (329-511)||(58915-59097)
scaffold0017 (105-160)||(40136-40190)
scaffold0017 (27-89)||(175830-175891)
scaffold0017 (143-202)||(58734-58790)
[»] scaffold0178 (2 HSPs)
scaffold0178 (11-304)||(26995-27288)
scaffold0178 (11-89)||(21708-21786)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (12-373)||(4206-4568)
[»] scaffold0481 (2 HSPs)
scaffold0481 (128-512)||(12651-13031)
scaffold0481 (105-141)||(12611-12647)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (314-512)||(40552-40749)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (239-512)||(15779-16049)
scaffold0410 (105-155)||(6959-7009)
[»] scaffold0739 (2 HSPs)
scaffold0739 (127-512)||(2044-2424)
scaffold0739 (105-141)||(2427-2463)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (127-416)||(7375-7661)
scaffold0201 (106-189)||(7061-7143)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (127-379)||(34982-35233)
scaffold0077 (11-89)||(34834-34911)
scaffold0077 (105-141)||(34943-34979)
[»] scaffold0477 (2 HSPs)
scaffold0477 (108-373)||(6018-6278)
scaffold0477 (11-98)||(5905-5992)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (11-246)||(19502-19734)
scaffold0334 (73-138)||(10048-10112)
[»] scaffold1477 (3 HSPs)
scaffold1477 (177-399)||(1533-1755)
scaffold1477 (106-155)||(1479-1528)
scaffold1477 (14-118)||(1372-1474)
[»] scaffold0163 (5 HSPs)
scaffold0163 (329-512)||(29524-29707)
scaffold0163 (17-118)||(36479-36579)
scaffold0163 (105-162)||(36583-36640)
scaffold0163 (105-157)||(29893-29945)
scaffold0163 (161-202)||(29833-29874)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (329-512)||(58351-58533)
scaffold0073 (105-202)||(58659-58754)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (11-221)||(407917-408125)
scaffold0001 (329-512)||(28820-29003)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (141-511)||(697-1062)
scaffold0090 (141-511)||(5077-5442)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (329-512)||(1255-1437)
scaffold0752 (105-512)||(1870-2288)
[»] scaffold0414 (5 HSPs)
scaffold0414 (127-298)||(2550-2720)
scaffold0414 (11-89)||(2791-2868)
scaffold0414 (105-141)||(2723-2759)
scaffold0414 (103-138)||(6978-7013)
scaffold0414 (345-378)||(7228-7261)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (11-124)||(23019-23131)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (329-512)||(768-950)
scaffold0547 (105-202)||(1077-1171)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (329-512)||(59316-59497)
scaffold0007 (105-202)||(59095-59190)
scaffold0007 (339-487)||(142994-143142)
[»] scaffold0314 (2 HSPs)
scaffold0314 (105-231)||(20575-20700)
scaffold0314 (11-89)||(20448-20526)
[»] scaffold0226 (4 HSPs)
scaffold0226 (131-294)||(19045-19208)
scaffold0226 (105-155)||(28396-28446)
scaffold0226 (105-141)||(19002-19038)
scaffold0226 (11-118)||(28286-28392)
[»] scaffold0655 (2 HSPs)
scaffold0655 (11-173)||(8586-8749)
scaffold0655 (332-508)||(4993-5170)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (11-173)||(81804-81967)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (11-157)||(6-151)
scaffold0772 (340-372)||(948-980)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (329-487)||(61119-61276)
scaffold0005 (345-416)||(212321-212393)
scaffold0005 (11-63)||(3902-3954)
scaffold0005 (103-138)||(246084-246119)
scaffold0005 (102-138)||(212608-212644)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (11-156)||(18388-18532)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (329-511)||(17861-18044)
scaffold0280 (345-416)||(2802-2874)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (329-487)||(20432-20590)
[»] scaffold1204 (3 HSPs)
scaffold1204 (128-295)||(2258-2424)
scaffold1204 (19-118)||(2117-2214)
scaffold1204 (105-141)||(2218-2254)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (11-138)||(9127-9253)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (11-148)||(17061-17197)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (73-202)||(9674-9801)
scaffold0544 (426-512)||(9912-9998)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (11-173)||(1-158)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (329-487)||(6577-6736)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (329-487)||(61629-61788)
scaffold0010 (11-98)||(224273-224360)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (127-298)||(8-176)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (329-487)||(1727-1886)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (345-487)||(7181-7324)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (428-512)||(38120-38204)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (329-487)||(990-1149)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (329-487)||(1183-1342)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (329-483)||(11662-11816)
scaffold0422 (103-138)||(11984-12019)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (127-298)||(15129-15297)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (345-487)||(38157-38298)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (127-297)||(69860-70027)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (345-487)||(3967-4110)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (333-487)||(16852-17007)
[»] scaffold0767 (2 HSPs)
scaffold0767 (11-118)||(5050-5155)
scaffold0767 (105-138)||(5013-5046)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (345-419)||(165018-165093)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (345-416)||(7348-7420)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (384-487)||(1116-1218)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (345-419)||(15694-15769)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (329-399)||(9281-9352)
scaffold0185 (162-201)||(9477-9516)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (345-450)||(1771-1876)
[»] scaffold0479 (2 HSPs)
scaffold0479 (345-399)||(9954-10008)
scaffold0479 (105-138)||(10208-10241)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (345-399)||(34876-34930)
scaffold0056 (345-416)||(25737-25809)
scaffold0056 (103-138)||(25496-25531)
scaffold0056 (103-138)||(34650-34685)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (105-394)||(22030-22312)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (345-416)||(3271-3343)
scaffold0471 (103-156)||(3557-3608)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (345-416)||(9923-9995)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (345-416)||(17837-17909)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (345-416)||(9122-9194)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (345-416)||(27501-27573)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (345-416)||(21043-21115)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (11-119)||(1-108)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (345-416)||(90127-90199)
[»] scaffold0774 (2 HSPs)
scaffold0774 (105-160)||(6151-6206)
scaffold0774 (329-367)||(6388-6426)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (340-379)||(31851-31890)
[»] scaffold1900 (1 HSPs)
scaffold1900 (11-89)||(1177-1255)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (350-416)||(2951-3016)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (340-378)||(379-417)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (345-399)||(15811-15865)
scaffold0247 (345-399)||(25471-25525)
scaffold0247 (73-138)||(23371-23435)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (349-399)||(22661-22711)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (345-399)||(36847-36901)
scaffold0120 (345-399)||(42104-42158)
scaffold0120 (106-138)||(36599-36631)
scaffold0120 (106-138)||(42374-42406)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (345-399)||(99277-99331)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (345-399)||(37387-37441)
scaffold0022 (345-399)||(135447-135501)
scaffold0022 (106-138)||(159324-159356)
[»] scaffold1359 (4 HSPs)
scaffold1359 (345-382)||(727-764)
scaffold1359 (103-138)||(1602-1637)
scaffold1359 (73-138)||(480-544)
scaffold1359 (345-382)||(1827-1864)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (347-399)||(5991-6043)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (345-397)||(2763-2815)
scaffold0473 (73-138)||(2519-2584)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (345-416)||(14615-14687)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (11-98)||(20301-20391)
[»] scaffold0217 (4 HSPs)
scaffold0217 (345-416)||(18998-19070)
scaffold0217 (345-416)||(22203-22275)
scaffold0217 (345-399)||(9545-9599)
scaffold0217 (78-156)||(21914-21989)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (345-416)||(1627-1699)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (345-416)||(211365-211437)
scaffold0004 (345-377)||(244356-244388)
scaffold0004 (344-398)||(377630-377684)
scaffold0004 (345-416)||(220205-220277)
scaffold0004 (106-138)||(377383-377415)
[»] scaffold2082 (1 HSPs)
scaffold2082 (11-86)||(1-76)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (345-419)||(1869-1944)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (103-138)||(952-987)
scaffold0016 (161-202)||(163483-163524)
scaffold0016 (105-160)||(163539-163594)
[»] scaffold2108 (2 HSPs)
scaffold2108 (105-155)||(2-52)
scaffold2108 (11-89)||(85-162)
[»] scaffold0861 (2 HSPs)
scaffold0861 (345-399)||(5019-5073)
scaffold0861 (73-138)||(4739-4803)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (103-137)||(5185-5219)
scaffold0069 (345-416)||(5397-5469)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (103-137)||(87433-87467)
scaffold0045 (345-397)||(87672-87724)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (345-399)||(78438-78492)
[»] scaffold1212 (1 HSPs)
scaffold1212 (11-64)||(17-70)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (73-138)||(18413-18477)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (105-138)||(15341-15374)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (345-382)||(60805-60842)
scaffold0015 (103-138)||(61042-61077)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (345-416)||(9873-9945)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (345-416)||(1657-1729)
scaffold0065 (102-154)||(1944-1994)
[»] scaffold0527 (3 HSPs)
scaffold0527 (103-138)||(107-142)
scaffold0527 (103-138)||(8170-8205)
scaffold0527 (11-64)||(4018-4071)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (103-138)||(8522-8557)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (345-450)||(7639-7742)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (103-138)||(35456-35491)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (73-136)||(103812-103875)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (350-416)||(84362-84429)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (104-138)||(9215-9249)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (345-399)||(6812-6866)
[»] scaffold0364 (3 HSPs)
scaffold0364 (73-138)||(6245-6308)
scaffold0364 (345-416)||(5974-6046)
scaffold0364 (340-372)||(10474-10506)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (104-138)||(5514-5548)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (345-399)||(10180-10234)
scaffold0161 (345-399)||(14844-14898)
scaffold0161 (106-154)||(9960-10008)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (103-137)||(11631-11665)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (104-138)||(8150-8184)
scaffold0026 (102-138)||(115774-115810)
scaffold0026 (106-138)||(151714-151746)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (340-378)||(144911-144949)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (345-378)||(1323-1356)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (345-378)||(55-88)
[»] scaffold1390 (1 HSPs)
scaffold1390 (11-64)||(1845-1898)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (11-64)||(4943-4996)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (345-398)||(13557-13610)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (345-378)||(893-926)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (345-378)||(5633-5666)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (345-382)||(40639-40676)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (471-512)||(16560-16601)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (73-138)||(43697-43761)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (11-64)||(34799-34852)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 264)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6490016 - 6490520
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6490016 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgc 6490115  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  6490116 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 6490215  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6490216 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 6490315  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490316 cagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 6490415  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6490416 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 6490515  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  6490516 gattt 6490520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6500670 - 6501174
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6500670 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgc 6500769  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  6500770 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatttt 6500869  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6500870 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 6500969  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500970 cagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 6501069  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6501070 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 6501169  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  6501170 gattt 6501174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9993561 - 9994063
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9993561 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgt 9993660  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  9993661 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttact 9993760  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9993761 caaactgaagatccaaagtagctgtttcttatttc-accttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 9993859  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993860 catttgtcctacgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 9993958  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9993959 cctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaag 9994058  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  9994059 gattt 9994063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9981553 - 9982055
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9981553 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgt 9981652  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  9981653 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttact 9981752  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9981753 caaactgaagatccaaagtagctgtttcttatttc-accttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 9981851  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9981852 catctgtcctacgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacatctatg 9981950  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9981951 cctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaag 9982050  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  9982051 gattt 9982055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12237290 - 12237784
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12237290 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagtttaaagtgc 12237388  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  12237389 ttctgaagtgatgacgtcatcagaag------gtcatcagaagcagaaggt---catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatag 12237479  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12237480 tcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctga 12237579  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12237580 gcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaatagctat 12237678  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12237679 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 12237778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12249116 - 12249610
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12249116 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagtttaaagtgc 12249214  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  12249215 ttctgaagtgatgacgtcatcagaag------gtcatcagaagcagaaggt---catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatag 12249305  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12249306 tcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctga 12249405  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249406 gcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 12249504  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12249505 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 12249604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23636293 - 23635774
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  23636293 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag-aaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 23636195  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  23636194 ttctgaagctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcagggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 23636096  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23636095 cattcaatccgtatattcaaactgaagatctaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 23635996  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635995 atttggatagtactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 23635896  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23635895 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggatta 23635796  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  23635795 ctggtgaatgatcaaaggattt 23635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Original strand, 9390872 - 9391371
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  9390872 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaata-aatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 9390969  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  9390970 tcctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaatt 9391068  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||| |    
T  9391069 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagcgcactgag 9391168  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9391169 tatttgtccttcgttaacagagttgagaaagtacaaatgtaccaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatg 9391268  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9391269 cctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 9391368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24706206 - 24706725
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  24706206 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 24706305  T
Q  111 ttctgaag-tga--------tgacg-------tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
    |||||||| |||        ||| |       |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24706306 ttctgaagctgaagtgcttctgaagcagaagctcattagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaaacgatatcatcaccagaagctac 24706404  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706405 atttaatccgtatattcaaactgaagatcaaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 24706504  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24706505 tttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaaga 24706604  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24706605 caagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 24706704  T
Q  495 tggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24706705 tggtgaatgatcaaaggattt 24706725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 19887006 - 19887524
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||     
T  19887006 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaa-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtga 19887104  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  19887105 ttctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagcta 19887203  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887204 catttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 19887303  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19887304 atttggatagcactgagtatttgtacttcgttaacagagttgacaaagcacaagtgtacaaccactaactccactactctg-ttttgtccacgctacaag 19887402  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  19887403 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagtagtacacccaaatcaggcaaacgatta 19887502  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  19887503 ctggtgaatgatcaaaggattt 19887524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 934210 - 933692
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  934210 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaa-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 934112  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  934111 ttctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaa-gattttcatcagaagcgatatcaccaccagaagcta 934013  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  934012 catttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 933913  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
     |||| |  |||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  933912 ttttgaagtgctctgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaag 933814  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  933813 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaaactaattcttcaaaggactacatccaaatcagacaaaggatta 933714  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  933713 ctggtgaatgatcaaaggattt 933692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 105 - 513
Target Start/End: Original strand, 11216483 - 11216890
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  11216483 aagttcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctatatttgatccg 11216581  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
     | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |   |    
T  11216582 caaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatgatcatttgaagtcc 11216681  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
      || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216682 attgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 11216781  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11216782 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 11216881  T
Q  505 tcaaaggat 513  Q
    |||||||||    
T  11216882 tcaaaggat 11216890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 29460975 - 29461383
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  29460975 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 29461073  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29461074 tatattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacggagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 29461173  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461174 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 29461272  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29461273 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 29461372  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  29461373 tcaaaggattt 29461383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Original strand, 6220370 - 6220873
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6220370 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6220468  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6220469 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6220567  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6220568 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6220667  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6220668 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 6220767  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6220768 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 6220867  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  6220868 ggattt 6220873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 48337714 - 48337307
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  48337714 aagtgcatcagaagtgatgacatcatcagaagcataagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 48337616  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48337615 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcatcggtcatttggacagc 48337516  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337515 actgagtatttgtccttcgttaacagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 48337417  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  48337416 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtgaatga 48337317  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  48337316 tcaaaggatt 48337307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4404854 - 4404340
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  4404854 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 4404757  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||                ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  4404756 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcactagaagctac 4404657  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4404656 atttgatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 4404557  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||| | | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4404556 tttggagaacactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 4404457  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4404456 caagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattac 4404358  T
Q  495 tggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4404357 tggtggatgatcaaagga 4404340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4457497 - 4456983
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||     
T  4457497 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgt 4457400  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||                ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4457399 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctac 4457300  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4457299 atttgatctgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 4457200  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||| | | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4457199 tttggagaacactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 4457100  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4457099 caagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 4457001  T
Q  495 tggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4457000 tggtggatgatcaaagga 4456983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 104 - 515
Target Start/End: Original strand, 17909763 - 17910172
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17909763 aaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatct 17909861  T
Q  204 atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909862 gtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaactttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 17909961  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909962 cactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaac 17910060  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  17910061 atctatgcctgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctaaaaggacaacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatg 17910160  T
Q  504 atcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||    
T  17910161 atcaaaggattt 17910172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 29471827 - 29472235
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  29471827 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 29471925  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29471926 tatattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacagagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 29472025  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472026 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 29472124  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29472125 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 29472224  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  29472225 tcaaaggattt 29472235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 143 - 514
Target Start/End: Original strand, 7804318 - 7804687
Alignment:
Q  143 gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcat 242  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7804318 gtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcat 7804416  T
Q  243 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7804417 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagt 7804516  T
Q  343 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7804517 acaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 7804615  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggatt 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7804616 aatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatt 7804687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Original strand, 9380309 - 9380825
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| | | |||||||    
T  9380309 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaata-aatttgaagcatctgaagaaaactgcttctgaagct-aaagtgc 9380406  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  9380407 tcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttttcatcagaaccgatatcatcaccagaagctac 9380506  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    |||| |||  || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9380507 atttaatctgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtca 9380606  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
     ||| |  || ||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9380607 cttgaagcgcactgagtatttgtccttcgttaacatagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 9380706  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9380707 caagacaacagccatgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 9380806  T
Q  495 tggtggatgatcaaaggat 513  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9380807 tggtggatgatcaaaggat 9380825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 127 - 514
Target Start/End: Original strand, 7794391 - 7794776
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  7794391 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcaaaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaa 7794489  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | || ||||||||||    
T  7794490 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttagatagcactaagtatttttccttcgtta 7794589  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7794590 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 7794688  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggatt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7794689 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatt 7794776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9536174 - 9535673
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  9536174 caaatgctagtcaagtaatttcaataagtcttggaagaacaatggaaaacaaag-gaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgc 9536076  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgt-catcagaagc-agaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    | ||||||   ||| || |||| ||||  |  | |||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  9536075 tcctgaagc--tgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaggattt-cattagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaa 9535979  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9535978 ttcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactg 9535879  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9535878 agtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagcta 9535780  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9535779 tgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaa 9535680  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  9535679 aggattt 9535673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 4174424 - 4174928
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  4174424 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 4174522  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa-gtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  4174523 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taa 4174621  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  4174622 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 4174721  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  4174722 gcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctgcgctacaagacaagacaacagcca 4174821  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4174822 tgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggataatcaa 4174921  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  4174922 aggattt 4174928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Original strand, 6180196 - 6180699
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6180196 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6180294  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6180295 ttctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6180393  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6180394 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6180493  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6180494 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 6180593  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  6180594 gcctgcataatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcattggtggataatcaaa 6180693  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  6180694 ggattt 6180699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 13382932 - 13383435
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  13382932 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 13383030  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  13383031 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 13383129  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  13383130 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 13383229  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13383230 cacttgtctttcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 13383329  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13383330 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 13383429  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  13383430 ggattt 13383435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 13372338 - 13372841
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  13372338 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 13372436  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  13372437 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 13372535  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  13372536 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 13372635  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13372636 cacttgtctttcgttaataaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 13372735  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13372736 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 13372835  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  13372836 ggattt 13372841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23648315 - 23647812
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  23648315 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 23648217  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  23648216 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 23648118  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  23648117 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 23648018  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23648017 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 23647918  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23647917 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 23647818  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  23647817 ggattt 23647812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23757865 - 23757362
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  23757865 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 23757767  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  23757766 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 23757668  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  23757667 caaactgaagattcaaagtagctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 23757568  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23757567 cacttgtctctcgttaatagatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 23757468  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23757467 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 23757368  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  23757367 ggattt 23757362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37760237 - 37759734
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  37760237 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 37760139  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  37760138 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 37760040  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  37760039 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 37759940  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37759939 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 37759840  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  37759839 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 37759740  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  37759739 ggattt 37759734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 39672551 - 39673054
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  39672551 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 39672649  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  39672650 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 39672748  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  39672749 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgag 39672848  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39672849 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 39672948  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39672949 gcctgcagaagttgtatgttcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 39673048  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  39673049 ggattt 39673054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19789588 - 19789086
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || |||||    
T  19789588 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgct 19789490  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||    
T  19789489 tctgaagtgatgatgtcatcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatc 19789391  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  19789390 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 19789291  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  19789290 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 19789191  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  19789190 cctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaag 19789091  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  19789090 gattt 19789086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 503836 - 504339
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  503836 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 503934  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  503935 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 504033  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  504034 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 504133  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  504134 ctcttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 504233  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  504234 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 504333  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  504334 ggattt 504339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5511262 - 5510760
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  5511262 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 5511164  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  5511163 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 5511065  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5511064 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5510965  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5510964 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 5510865  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5510864 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5510766  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5510765 ggattt 5510760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12286647 - 12287150
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  12286647 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 12286745  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  12286746 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 12286844  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||      
T  12286845 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaa 12286944  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12286945 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12287044  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12287045 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12287144  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12287145 ggattt 12287150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12296469 - 12296972
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  12296469 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 12296567  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  12296568 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 12296666  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||      
T  12296667 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaa 12296766  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12296767 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12296866  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12296867 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12296966  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12296967 ggattt 12296972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 13393526 - 13394029
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  13393526 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 13393624  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||| | || |    
T  13393625 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgttttatcctt-taat 13393723  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  13393724 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 13393823  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13393824 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 13393923  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13393924 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 13394023  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  13394024 ggattt 13394029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 20683449 - 20683952
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  20683449 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 20683547  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  20683548 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 20683646  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  20683647 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 20683746  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  20683747 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 20683846  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20683847 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 20683946  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  20683947 ggattt 20683952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41684245 - 41683742
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| ||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  41684245 caaaggctactcatgttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 41684147  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  41684146 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 41684048  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  41684047 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 41683948  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  41683947 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 41683848  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  41683847 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 41683748  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  41683747 ggattt 41683742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41694814 - 41694311
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| ||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  41694814 caaaggctactcatgttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 41694716  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  41694715 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 41694617  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  41694616 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 41694517  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  41694516 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 41694417  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  41694416 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 41694317  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  41694316 ggattt 41694311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19778951 - 19778449
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||| | | || |||||    
T  19778951 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgct 19778853  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||    
T  19778852 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatc 19778754  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  19778753 aaactgaagattcaaagtagctgattcccaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 19778654  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  19778653 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 19778554  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  19778553 cctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaag 19778454  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  19778453 gattt 19778449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 127 - 510
Target Start/End: Original strand, 16391398 - 16391780
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16391398 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 16391496  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||    
T  16391497 agtagctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttggataacactgagcatttgtccttcgtta 16391596  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16391597 acagagttgacaaagtacaagtatacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatgtgtac 16391696  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16391697 cctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgagtacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaag 16391780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5521440 - 5520938
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  5521440 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 5521342  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  5521341 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 5521243  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5521242 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5521143  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5521142 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 5521043  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5521042 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5520944  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5520943 ggattt 5520938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5536690 - 5537192
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  5536690 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 5536788  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  5536789 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 5536887  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5536888 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5536987  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5536988 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 5537087  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5537088 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5537186  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5537187 ggattt 5537192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13122229 - 13121726
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  13122229 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 13122131  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  13122130 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 13122032  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  13122031 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 13121932  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13121931 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 13121832  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13121831 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 13121732  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  13121731 ggattt 13121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13132472 - 13131969
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  13132472 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 13132374  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  13132373 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 13132275  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  13132274 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 13132175  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13132174 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 13132075  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13132074 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 13131975  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  13131974 ggattt 13131969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13558141 - 13557638
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  13558141 caaagactactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 13558043  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  13558042 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttaatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 13557944  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | | |    
T  13557943 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcacggag 13557844  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13557843 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 13557744  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    || |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13557743 gcatgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgagtttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 13557644  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  13557643 ggattt 13557638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14466158 - 14465655
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  14466158 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 14466060  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  14466059 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 14465961  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  14465960 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 14465861  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14465860 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 14465761  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14465760 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 14465661  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  14465660 ggattt 14465655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 20672864 - 20673367
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  20672864 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 20672962  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  20672963 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 20673061  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  20673062 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 20673161  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  20673162 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 20673261  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20673262 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggatcactggtggataatcaaa 20673361  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  20673362 ggattt 20673367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20721680 - 20721177
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  20721680 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 20721582  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  20721581 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taat 20721483  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  20721482 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 20721383  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  20721382 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 20721283  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20721282 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 20721183  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  20721182 ggattt 20721177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23768461 - 23767958
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||| ||| | | || ||||    
T  23768461 caaatgctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcatgaagctgaa-gtgc 23768363  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  23768362 ttctgaagtgatgacgtcgtcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 23768264  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  23768263 caaactgaagattcaaagtagctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 23768164  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23768163 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 23768064  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23768063 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 23767964  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  23767963 ggattt 23767958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37867014 - 37866509
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||    
T  37867014 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gt 37866916  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  37866915 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-ta 37866817  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  37866816 atcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactg 37866717  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
     ||| |||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  37866716 agcacttgtctctcgttaatagtgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcc 37866617  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37866616 atgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcgggcaaaggattactggtggataatca 37866517  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  37866516 aaggattt 37866509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24383186 - 24383690
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  24383186 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 24383284  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  24383285 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 24383383  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  24383384 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 24383483  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  24383484 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 24383583  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24383584 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 24383683  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  24383684 aggattt 24383690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5547274 - 5547776
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  5547274 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 5547372  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  5547373 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 5547471  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5547472 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5547571  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5547572 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 5547671  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    |||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5547672 gcctacagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5547770  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5547771 ggattt 5547776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14476790 - 14476287
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  14476790 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 14476692  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  14476691 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 14476593  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  14476592 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 14476493  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  14476492 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacactacaagacaaaacaacagccat 14476393  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14476392 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 14476293  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  14476292 ggattt 14476287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 10626610 - 10627112
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  10626610 caaaagcttgtcaagcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 10626707  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat--catcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  10626708 ctctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaataccttcaccagaagctacatttgatccct-ta 10626805  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  10626806 atcaaactgaagattcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactg 10626905  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  10626906 agcacttgtctcctattaacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagcct 10627005  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10627006 tgcctgcagattctgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagattattattcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 10627105  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  10627106 aggattt 10627112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4744305 - 4743802
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  4744305 caaaggctacttaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 4744207  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  4744206 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taa 4744108  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  4744107 tcaaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 4744008  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  4744007 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 4743908  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4743907 tgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 4743809  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  4743808 aggattt 4743802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 18851453 - 18851859
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||      
T  18851453 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaaataa-gattttcatcaaaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcag 18851551  T
Q  205 ta-tactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    || || |||| |||||||  |||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18851552 taatattcaatctgaagattcaaagtagctatttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaaa 18851651  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18851652 cactgagtaaatgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 18851751  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18851752 agctatgcctgcaaaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctttaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatg 18851850  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  18851851 atcaaagga 18851859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4754890 - 4754388
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  4754890 caaaggctacttaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 4754792  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  4754791 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taa 4754693  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  4754692 tcaaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 4754593  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  4754592 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 4754493  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4754492 tgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaag-ttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 4754395  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  4754394 aggattt 4754388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5865364 - 5865865
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  5865364 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 5865462  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  5865463 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaacgtcatcagaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-ta 5865557  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  5865558 atcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactg 5865657  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
     ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5865658 agctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcc 5865757  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  5865758 atgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatca 5865857  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  5865858 aaggattt 5865865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 10654950 - 10655434
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  10654950 caaaagcttgtcaagcaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 10655047  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||                 ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  10655048 ctctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaa-----------------atatcttcaccagaagctacatttgatccct-taat 10655129  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |    
T  10655130 caaactgaagattcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgag 10655229  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  10655230 cacttgtctcctattaacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttg 10655329  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10655330 cctgcagattttgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagattattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 10655429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16476845 - 16476367
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16476845 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16476747  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  16476746 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 16476648  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  16476647 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 16476548  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16476547 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttcttgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 16476448  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    ||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  16476447 gcctgcagaatttgtacactcaccatgggaatgaatttgaagcttatccttcaaaggactacaccccaaacaggcacagga 16476367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 512
Target Start/End: Original strand, 1783731 - 1784239
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  | ||||||||||||    
T  1783731 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaat-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgga-gtgcttctgaag 1783828  T
Q  119 tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||                ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1783829 tgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatc 1783928  T
Q  203 catatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 302  Q
    | || | | |||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  1783929 cgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggaga 1784028  T
Q  303 gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagaca 401  Q
       ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1784029 aaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaa 1784128  T
Q  402 -acagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtgg 500  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1784129 cacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtga 1784227  T
Q  501 atgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||    
T  1784228 atgatcaaagga 1784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24660485 - 24659964
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  24660485 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 24660387  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  24660386 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 24660287  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24660286 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 24660188  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24660187 tatatggatagctctgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 24660088  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24660087 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 24659988  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  24659987 cactggtggataatcaaaggattt 24659964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 526183 - 526705
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  526183 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 526281  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa-gtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                  ||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  526282 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagc 526381  T
Q  192 tacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526382 tacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 526480  T
Q  292 tcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctac 390  Q
      || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  526481 atatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctac 526580  T
Q  391 aagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526581 aagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 526680  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  526681 tcactggtggataatcaaaggattt 526705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5579284 - 5579805
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  5579284 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 5579382  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  5579383 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 5579482  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5579483 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgga 5579581  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5579582 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 5579681  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5579682 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 5579781  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  5579782 cactggtggataatcaaaggattt 5579805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5627668 - 5628189
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  5627668 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 5627766  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  5627767 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 5627866  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5627867 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgga 5627965  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5627966 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 5628065  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5628066 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 5628165  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  5628166 cactggtggataatcaaaggattt 5628189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24671065 - 24670544
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  24671065 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 24670967  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  24670966 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 24670867  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24670866 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 24670768  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24670767 tatatggatagctctgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 24670668  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24670667 agacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 24670568  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  24670567 cactggtggataatcaaaggattt 24670544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 180 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11164228 - 11163896
Alignment:
Q  180 atcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaaggg 279  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  | | ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11164228 atcaccggaagctacatttgatccgcaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaaggg 11164129  T
Q  280 aggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    ||||||||||||||||||| |  || ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11164128 aggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctt 11164029  T
Q  380 gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11164028 gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctacagaatttttgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaat 11163929  T
Q  480 caggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11163928 taggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 11163896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10099636 - 10099132
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  10099636 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 10099538  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctata-tcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||  | ||     
T  10099537 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagatttcatcagaagcaaaagttggcaccagaagctacatttgatcttt-taa 10099439  T
Q  210 tcaaactgaagaac-caaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  10099438 tcaaactgaaaaattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactg 10099339  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
     ||| ||| |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  10099338 agcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcc 10099239  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  10099238 atgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattca 10099140  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  10099139 aaggattt 10099132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 512
Target Start/End: Original strand, 1794143 - 1794651
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  | ||||||||||||    
T  1794143 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaat-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgga-gtgcttctgaag 1794240  T
Q  119 tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||                ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1794241 tgatgacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaaacaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatc 1794340  T
Q  203 catatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 302  Q
    | || | | |||||| |||  |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  1794341 cgtaaatttaaactggagattcaaagtagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacgatcatttggaga 1794440  T
Q  303 gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagaca 401  Q
       ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1794441 aaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaa 1794540  T
Q  402 a-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtgg 500  Q
    | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1794541 aacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtga 1794639  T
Q  501 atgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||    
T  1794640 atgatcaaagga 1794651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35187962 - 35187441
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  35187962 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 35187864  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  35187863 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 35187764  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35187763 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 35187665  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35187664 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 35187565  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35187564 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 35187465  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  35187464 cactggtggataatcaaaggattt 35187441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 143 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28169516 - 28169149
Alignment:
Q  143 gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcat 242  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||| || |||  |  | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  28169516 gtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaaggtacaattaatcagtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt 28169418  T
Q  243 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagt 342  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| | | ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  28169417 ttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaatagagttgacaaagt 28169318  T
Q  343 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28169317 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatg 28169219  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  28169218 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaatgattactggtggatgatcaaagga 28169149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 28313883 - 28314403
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  28313883 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 28313981  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  28313982 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcta 28314081  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  28314082 catttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggat 28314180  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtccacgctacaa 392  Q
    || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28314181 atatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaa 28314280  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28314281 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 28314380  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28314381 actggtggataatcaaaggattt 28314403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 28324499 - 28325019
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  28324499 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 28324597  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  28324598 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcta 28324697  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  28324698 catttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggat 28324796  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtccacgctacaa 392  Q
    || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28324797 atatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaa 28324896  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28324897 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 28324996  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28324997 actggtggataatcaaaggattt 28325019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37886128 - 37885642
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  37886128 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 37886030  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  37886029 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca----------------aaagtttt-catcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 37885948  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  37885947 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 37885848  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37885847 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 37885748  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37885747 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 37885648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 146 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38315131 - 38314766
Alignment:
Q  146 atcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttc 245  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  38315131 atcagaagcaaggtttt-catcagaagttaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatccaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttc 38315033  T
Q  246 aaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtaca 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38315032 aaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtaca 38314933  T
Q  346 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38314932 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 38314834  T
Q  445 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38314833 tttgaagctgtttcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 38314766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5875946 - 5876464
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  5875946 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 5876044  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagtttt-------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |             ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  5876045 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatatcttcaccagaagctact 5876144  T
Q  196 tttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 295  Q
    |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5876145 tttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatat 5876243  T
Q  296 ttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaaga 394  Q
     |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5876244 atggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaga 5876343  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5876344 caaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcac 5876443  T
Q  495 tggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  5876444 tggtggataatcaaaggattt 5876464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18484629 - 18484108
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  18484629 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 18484531  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  18484530 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcta 18484431  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  18484430 catttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggat 18484332  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18484331 atatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaa 18484232  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18484231 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 18484132  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  18484131 cactggtggataatcaaaggattt 18484108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27883960 - 27883451
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||||||    
T  27883960 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 27883863  T
Q  114 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca------------aagtt---tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacattt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||            |||     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  27883862 tgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagaccatcagaagcaagatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaatt 27883763  T
Q  199 gatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    ||||  || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27883762 gatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttg 27883664  T
Q  299 gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
     | ||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27883663 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 27883564  T
Q  399 acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27883563 acaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaaattgattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggt 27883465  T
Q  499 ggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||    
T  27883464 ggatgatcaaagga 27883451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38195310 - 38194788
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  38195310 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 38195212  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  38195211 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 38195112  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  38195111 acatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 38195013  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38195012 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 38194913  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194912 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 38194813  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  38194812 tcactggtggataatcaaaggattt 38194788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38205846 - 38205324
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  38205846 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 38205748  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  38205747 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 38205648  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  38205647 acatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 38205549  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38205548 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 38205449  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205448 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 38205349  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  38205348 tcactggtggataatcaaaggattt 38205324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 212 - 511
Target Start/End: Original strand, 13261541 - 13261839
Alignment:
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |     
T  13261541 aaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagt 13261640  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 411  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261641 acttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgc 13261740  T
Q  412 ctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13261741 ctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaagg 13261839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1064586 - 1064206
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  1064586 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 1064489  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||  | | |||||||||||||     
T  1064488 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaagagcactaggtatttgtccttcgttat 1064390  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  1064389 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaa-atgttcc 1064291  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1064290 ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 1064206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 11272033 - 11272555
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  11272033 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 11272131  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  11272132 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 11272231  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11272232 acatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 11272330  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  11272331 tatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctaca 11272430  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272431 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 11272530  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  11272531 tcactggtggataatcaaaggattt 11272555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39372639 - 39372117
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  39372639 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 39372541  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  39372540 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 39372441  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  39372440 acatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 39372342  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || | |||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39372341 tatatagataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 39372242  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39372241 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 39372142  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  39372141 tcactggtggataatcaaaggattt 39372117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 127 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16077378 - 16076999
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | |  |||||||||  |||    
T  16077378 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaaatgatcagtaaattttaactgaagattcaa 16077281  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| | | |||||||||||||    
T  16077280 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgtta 16077182  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |    
T  16077181 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagca-atgttc 16077083  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16077082 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 16076999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1054180 - 1053777
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||      
T  1054180 aagtgcctctgaagtaatgacatcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttct-at-agaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcag 1054083  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  1054082 taaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcatttgaagagc 1053984  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||  | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1053983 actaggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 1053884  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  1053883 gctctgcctgtagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaagattactggtggatga 1053785  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  1053784 tcaaagga 1053777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8775111 - 8774721
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  8775111 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaatcaaactgaagattca 8775013  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || | ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  8775012 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcatt 8774913  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||    
T  8774912 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt 8774813  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  8774812 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 8774721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8785696 - 8785306
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  8785696 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaatcaaactgaagattca 8785598  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || | ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  8785597 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcatt 8785498  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||    
T  8785497 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgt 8785398  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  8785397 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 8785306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 163 - 513
Target Start/End: Original strand, 16665947 - 16666295
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||    
T  16665947 tcatcagaagctatatcatcaccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaaga 16666045  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16666046 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 16666145  T
Q  363 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 462  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  16666146 tccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattcttca 16666244  T
Q  463 aaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggat 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16666245 aaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggat 16666295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 8739913 - 8740294
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  8739913 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagattt--catcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaa 8740010  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || || ||||| || |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| | | |||||||||||||    
T  8740011 aggagttgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaaagaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgtta 8740109  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |    
T  8740110 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgctc 8740208  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8740209 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 8740294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 8995774 - 8996123
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||| |  |  | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||     
T  8995774 tttcatcagaagctatatcatcaccataagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaagaagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga- 8995872  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8995873 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttaaaagcactgagtatttgtccttcattatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 8995972  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  8995973 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagtcgattctt 8996071  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8996072 caaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 8996123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Original strand, 17281219 - 17281600
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||| ||  ||||    
T  17281219 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaa 17281316  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaac-gaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    | |||||||| || |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  17281317 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaactgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtta 17281415  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  17281416 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctatacctgcagaa-atgttc 17281514  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17281515 cttcaaaatgaaaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatctggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 17281600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14581585 - 14581205
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  14581585 catcagaagcagaa-gtcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 14581489  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | |||| ||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | | ||||||||| ||      
T  14581488 ggagctttttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcatttacaaagcactgggtacttgtccttcatttt 14581390  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||    
T  14581389 cagcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaatttgttcc 14581290  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14581289 ttcaagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggacttcatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 14581205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39383126 - 39382754
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  39383126 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 39383028  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  39383027 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 39382928  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  39382927 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 39382828  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  39382827 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 39382754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 9006294 - 9006675
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |  |  | | ||||||||||  |||    
T  9006294 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcacaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaa 9006391  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||| ||| | | ||||||||| |||    
T  9006392 agaagctgtttttcgtttcaatctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacgggcattttaaaagcactgagtatttgtccttcatta 9006490  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  9006491 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 9006589  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9006590 cttcaagatgggaatgaatttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 9006675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16493604 - 16493245
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16493604 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16493506  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  16493505 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 16493407  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  16493406 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 16493307  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16493306 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactc 16493245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 167 - 512
Target Start/End: Original strand, 16670986 - 16671329
Alignment:
Q  167 cagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacga 266  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||| ||    
T  16670986 cagaagctatatcatcaccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaatga 16671084  T
Q  267 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctcca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16671085 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcagtgggtatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 16671184  T
Q  367 ctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagg 466  Q
    ||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16671185 ctacttttctcttgtccacactacaagacaagacaacagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattcttcaaagg 16671283  T
Q  467 actacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16671284 acttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 16671329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 434
Target Start/End: Original strand, 14321444 - 14321771
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  |    
T  14321444 agtgcttctgaagtaatgacgttatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagt 14321542  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggat-agc 304  Q
      | | ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  14321543 gaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttgtcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttgaagaac 14321642  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14321643 actgagtacttgtcctttgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 14321742  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaaga 434  Q
     || | ||||||||| |||| |||||||||    
T  14321743 actcttcctgcagaa-atgttccttcaaga 14321771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 451
Target Start/End: Original strand, 12567138 - 12567376
Alignment:
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |     
T  12567138 aaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagt 12567237  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 411  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567238 acttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgc 12567337  T
Q  412 ctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 451  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12567338 ctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 12567376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 162 - 451
Target Start/End: Original strand, 15216159 - 15216446
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaag 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||| ||  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |    
T  15216159 ttcatcagaagctctatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-g 15216257  T
Q  262 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactac 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15216258 aacgaagaattgaaagtgaggtatcaacgatcatttgaagagcactgggtacctgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 15216357  T
Q  362 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 451  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15216358 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 15216446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 13199028 - 13199411
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |  |||||||||   ||    
T  13199028 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattttaaactgaagtttca 13199125  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||| |||||||| || ||| |||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||    
T  13199126 aaggagctgtttttcgttttaacctcgtctaaga-gaacgatgaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcttt 13199224  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatg 423  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13199225 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atg 13199322  T
Q  424 tgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
      |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13199323 atccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 13199411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 29933328 - 29933726
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||       
T  29933328 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatataatcaccagaagctacatttgattag 29933425  T
Q  205 tatactc-aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    | || |  |||||||||   ||||| || |||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29933426 tttattttaaactgaagtttcaaaggagttgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaag 29933518  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | | | |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  29933519 cacggagtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaat 29933617  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggat 502  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  29933618 agctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggat 29933716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 29982482 - 29982880
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||       
T  29982482 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatataatcaccagaagctacatttgattag 29982579  T
Q  205 tatactc-aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    | || |  |||||||||   ||||| || |||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29982580 tttattttaaactgaagtttcaaaggagttgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaag 29982672  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | | | |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  29982673 cacggagtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaat 29982771  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggat 502  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  29982772 agctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggat 29982870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2246783 - 2246435
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| | ||||| |||   ||||| || ||||| || ||| |||||  |||||||     
T  2246783 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactaaagtttcaaaggagttgtttttcgttttaacctcgtctaaga- 2246685  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||  |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2246684 gaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactaggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaactacta 2246586  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  2246585 cctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctt 2246487  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2246486 cataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 2246435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 127 - 378
Target Start/End: Original strand, 16348418 - 16348669
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| ||||    
T  16348418 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 16348516  T
Q  227 agtagct-gtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||    
T  16348517 agtagcttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtctttcgtt 16348616  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16348617 aacagagttgacaaaatacaagtgtgcaaccactacctccactactttgtttt 16348669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16487458 - 16487067
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  16487458 caaaggctactcaagttatttcattaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 16487360  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  16487359 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcaaaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-t 16487265  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  16487264 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataccact 16487165  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
    | ||  |||||  |||| || |||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||   |||||||||||||    
T  16487164 gagctcttgtctctcgtcaatagagttgacacactacaagtgttcaaccagtacctccactactctgctttctgtctacgctcacagacaagacaaca 16487067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 29905972 - 29906347
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || |  |||||||||   ||    
T  29905972 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29906069  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| | | |   ||||||||| ||    
T  29906070 aaggagctgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgtaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29906162  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  29906163 ga-agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atttt 29906260  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29906261 ccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29906347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 29947137 - 29947512
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || |  |||||||||   ||    
T  29947137 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29947234  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| | | |   ||||||||| ||    
T  29947235 aaggagctgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29947327  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  29947328 ga-agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atttt 29947425  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29947426 ccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29947512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 29996291 - 29996666
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || |  |||||||||   ||    
T  29996291 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttca 29996388  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| | | |   ||||||||| ||    
T  29996389 aaggagctgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttcttt 29996481  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  29996482 ga-agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atttt 29996579  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29996580 ccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29996666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21736360 - 21736178
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  21736360 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttccc 21736262  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  21736261 acaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaagga 21736178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 15651055 - 15651237
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||    
T  15651055 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaattttt-cct 15651153  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15651154 tcaaaataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 15651237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 15662690 - 15662872
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||    
T  15662690 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaattttt-cct 15662788  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15662789 tcaaaataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 15662872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27173082 - 27172900
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-ctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |     
T  27173082 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatt-tgttct 27172984  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| | |||||||||    
T  27172983 ttcaagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtgaaagatcaaagg 27172900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16386251 - 16386138
Alignment:
Q  401 aacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtgg 500  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16386251 aacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaatctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgg 16386153  T
Q  501 atgatcaaaggattt 515  Q
    || ||||||||||||    
T  16386152 ataatcaaaggattt 16386138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10529401 - 10529243
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  10529401 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 10529303  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  10529302 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 10529243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13604828 - 13604662
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaaga-attccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||  ||    
T  13604828 caaaggctattcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag-aaaaagagattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaac-tg 13604731  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat 178  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13604730 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatat 13604662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Original strand, 51989128 - 51989282
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  51989128 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaatctgtttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 51989226  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 483  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  51989227 ttcaagataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcagg 51989282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 31113971 - 31114152
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  31113971 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 31114069  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||| | ||||||  ||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||    
T  31114070 tcaagttaggaatggttttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattaatgttgaatgatcaaagg 31114152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 41045797 - 41045640
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  41045797 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 41045699  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  41045698 tcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcatgcaaa 41045640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15851065 - 15850905
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaa-ccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||||     
T  15851065 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctccagaa-atgtt 15850967  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  15850966 ccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 15850905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19531828 - 19531697
Alignment:
Q  23 aagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgat 122  Q
    |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||| |||||| |||    
T  19531828 aagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgctcctgaagagat 19531730  T
Q  123 gacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19531729 gacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 19531697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11168056 - 11167913
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaaga-aaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  |||  ||| |||| | | || |||    
T  11168056 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatctgaagctaaagtgcttctgaagctgaa-gtg 11167959  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11167958 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagca 11167913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15833459 - 15833302
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  15833459 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 15833361  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||  || |||||  |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  15833360 cttca--ataggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 15833302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 379 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17961551 - 17961419
Alignment:
Q  379 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 478  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||    
T  17961551 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatt-tgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaa 17961453  T
Q  479 tcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  17961452 tcaggcaacagatcactggtggatgatcaaagga 17961419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 379 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18006496 - 18006364
Alignment:
Q  379 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 478  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||    
T  18006496 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatt-tgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaa 18006398  T
Q  479 tcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  18006397 tcaggcaacagatcactggtggatgatcaaagga 18006364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 51341063 - 51340907
Alignment:
Q  332 gttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  51341063 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaa-atgttcctt 51340965  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||  || |||||| |||||||  | || ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  51340964 cagaataggaatggatttgaacgtgatccttcatagtacaacaaccaaatcaggcaaa 51340907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17022082 - 17021975
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  17022082 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttc 17021984  T
Q  427 cttcaagat 435  Q
    |||||||||    
T  17021983 cttcaagat 17021975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22151301 - 22151142
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  22151301 agagttgacaaagtacaaagcgtacaaccactacctccacgattctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 22151203  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  22151202 tttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaa 22151142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 45861693 - 45861835
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || ||||||     
T  45861693 aagtgtacgaccactacctccactactatgtttatgtctacgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatgg 45861791  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  45861792 atttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 45861835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 16348270 - 16348348
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  16348270 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 16348348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13148321 - 13148162
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| ||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||| |    
T  13148321 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaat-tgttc 13148223  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13148222 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 13148162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 49990280 - 49990157
Alignment:
Q  364 ccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 462  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |||||    
T  49990280 ccactactctgcttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttca 49990182  T
Q  463 aaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||    
T  49990181 taggacaacatccaaatcaggcaaa 49990157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 7607977 - 7608083
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  7607977 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 7608075  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  7608076 ttctgaag 7608083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2561226 - 2561121
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||| ||||||  ||||||||||    
T  2561226 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgca-acgatgttccttcacaatgggaatga 2561128  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  2561127 atttgaa 2561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 12858430 - 12858507
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12858430 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaaaaacaatggaaag-aaaaagaattctaagcatctgaataaaac 12858507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 16391249 - 16391327
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  16391249 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 16391327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 7804205 - 7804330
Alignment:
Q  18 tagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct------ 111  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||| | |  |||||||          
T  7804205 tagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttgaagtgctcctgca 7804303  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7804304 tctgaagtgatgacgtcatcagaagca 7804330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 39383293 - 39383206
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  39383293 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 39383206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 47405542 - 47405684
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  || ||||||     
T  47405542 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaataggaatgc 47405640  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  47405641 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 47405684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 7794242 - 7794319
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  7794242 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 7794319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 12726351 - 12726405
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  12726351 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 12726405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 24775655 - 24775760
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  24775655 aagtgtacaaccactacatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagtaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgc 24775753  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  24775754 atttgaa 24775760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 29460865 - 29460943
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  29460865 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 29460943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 29471717 - 29471795
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  29471717 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 29471795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40799912 - 40799807
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  40799912 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgc 40799814  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  40799813 atttgaa 40799807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47207744 - 47207690
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  47207744 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaaga 47207690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48337824 - 48337747
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  48337824 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 48337747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 53056848 - 53056902
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  53056848 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 53056902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Original strand, 12752727 - 12752883
Alignment:
Q  332 gttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  12752727 gttgacaaagtacaaagtgtacgaccactatctccacaactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aaaatgttcctt 12752825  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||  || ||||||  ||||||  | ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12752826 cagaataggaatggctttgaacgtgatcattcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 12752883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 14254051 - 14254190
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||   ||||||||||||||||| ||   ||| | | ||||||||||    
T  14254051 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatctgaagcatctgaagaaaactgcgtttgaagct-aaagtgcttc 14254148  T
Q  114 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  14254149 tgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagca 14254190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Original strand, 16670813 - 16670941
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttca-aagtgcttctgaagtgatgac 125  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | | ||||||||||||||| |||||    
T  16670813 aatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaag-gaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaagtaatgac 16670911  T
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  16670912 gtcatcagaagcagaagttcatcaaaagca 16670941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18006734 - 18006570
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaa-ctgaagaaccaa 226  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| | | | | ||| || ||||  |||    
T  18006734 catccgaagcagaa-gtcatcagaagcaa--tatttcgtcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaagattcaa 18006638  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 295  Q
    || ||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  18006637 aggagctgtttctcgtttcaatctcgtct-agaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 18006570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8775260 - 8775172
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaatttt-aacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8775260 caaaggctactcaagttatttttaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 8775172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8785845 - 8785757
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaatttt-aacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8785845 caaaggctactcaagttatttttaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 8785757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 11216380 - 11216451
Alignment:
Q  17 ctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11216380 ctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 11216451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21736597 - 21736486
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21736597 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaag 21736498  T
Q  191 ctacatttgatc 202  Q
    ||||| ||||||    
T  21736497 ctacagttgatc 21736486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Original strand, 25398376 - 25398428
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25398376 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaa 25398428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39383180 - 39383132
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39383180 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 39383132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 46796488 - 46796560
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46796488 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 46796560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8775146 - 8775099
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775146 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 8775099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8785731 - 8785684
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8785731 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 8785684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 15650835 - 15650923
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15650835 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatgagaagcaa--gatttcgtcagaagctatatcatcaccagaagctaca 15650923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Original strand, 27244791 - 27244874
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctc 94  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  27244791 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctc 27244874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5213615 - 5213562
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  5213615 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctatgctacaagacaaga 5213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6090770 - 6090716
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  6090770 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctgcaagacaaga 6090716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11868307 - 11868253
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  11868307 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaaaacaaga 11868253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 15662470 - 15662565
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  15662470 aagtgcctccgaagtaatgatgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagttacagttgatc 15662565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 18121743 - 18121797
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  18121743 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctctgctacaagacaaga 18121797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 18142873 - 18142927
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  18142873 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctctgctacaagacaaga 18142927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 21605775 - 21605829
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  21605775 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 21605829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22140802 - 22140748
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22140802 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22140748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 29855447 - 29855393
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  29855447 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctctgctacaagacaaga 29855393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 12388993 - 12389030
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12388993 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 12389030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 14392847 - 14392911
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14392847 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagtt-aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14392911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15903517 - 15903453
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15903517 aagcatctgaagagaagtgctccttaagt-caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15903453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16032563 - 16032526
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032563 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 16032526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17961789 - 17961625
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaa-ctgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| | | | | ||| || | ||  |||    
T  17961789 catcagaagcagaa-gtcatcagaagcaa--tatttcgtcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaggattcaa 17961693  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 295  Q
    || || |||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  17961692 aggagttgtttcacgtttcaatctcatct-agaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 17961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 21636791 - 21636844
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21636791 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 21636844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 30054341 - 30054410
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  30054341 tgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 30054410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37412640 - 37412571
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37412640 tgtacaaccactatctccactactctgtttctgtcttcactacaagacaagtaaaacagctatgcctgca 37412571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 47405292 - 47405373
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  47405292 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagc 47405373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 1728136 - 1728208
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1728136 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 1728208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 16391359 - 16391395
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16391359 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 16391395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Original strand, 23680171 - 23680251
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23680171 tctgaagtgatgacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccaaaagctaca 23680251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Original strand, 24052408 - 24052488
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24052408 tctgaagtgatgacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccaaaagctaca 24052488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40288729 - 40288653
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaa 87  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||    
T  40288729 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaa 40288653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 11909145 - 11909220
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  11909145 aagtgtacgaccactacctccactactttgtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 11909220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 396
Target Start/End: Original strand, 49553610 - 49553661
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagaca 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  49553610 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagaca 49553661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2246854 - 2246804
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2246854 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 2246804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Original strand, 9092112 - 9092162
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9092112 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 9092162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 17909654 - 17909731
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  17909654 caaatgctagtcaagtaatttgaataggtcttggaagaacaaaggaaagc-aaaggaattcatagcatctaaagaaaac 17909731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 18851352 - 18851421
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  18851352 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctaaagaaaac 18851421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20646192 - 20646138
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  20646192 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 20646138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Original strand, 21636550 - 21636601
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21636550 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 21636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28582144 - 28582039
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||| ||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  28582144 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctggtacaaaacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgg 28582046  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  28582045 atttgaa 28582039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33583267 - 33583163
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  33583267 aagtgtacaaccactacctccaatactct-attttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgc 33583170  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  33583169 atttgaa 33583163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 38177764 - 38177818
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||    
T  38177764 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgactctgctacaagacaaga 38177818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38315281 - 38315153
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttct---- 114  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||  |||| | | |||||||||||        
T  38315281 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatttgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttcttgtg 38315184  T
Q  115 -----gaagtgatgacgtcatcagaagcaga 140  Q
         ||||||||||||||||||||||||||    
T  38315183 cctctgaagtgatgacgtcatcagaagcaga 38315153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11223865 - 11223801
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11223865 aagcatctgaagagaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 11223801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14955465 - 14955432
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955465 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 14955432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 17238825 - 17238858
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17238825 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 17238858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 19249254 - 19249318
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19249254 aagcatctgaagaaaagtggttctgaagttcaaa-tgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19249318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37467620 - 37467556
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37467620 aagcatctgaagataagtgctcctgaagt-caaagagctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 37467556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Original strand, 38177544 - 38177593
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38177544 aagtgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagc 38177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 52920723 - 52920659
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52920723 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagta-aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 52920659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2785102 - 2785031
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2785102 aagtgtacaaccactacctccactactctg-atttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 2785031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Original strand, 8758245 - 8758293
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaag 153  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8758245 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaag 8758293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 16658739 - 16658811
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16658739 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 16658811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Original strand, 16665873 - 16665929
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagttt 161  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  16665873 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt 16665929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 202
Target Start/End: Original strand, 31113806 - 31113846
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31113806 ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 31113846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 49642883 - 49642955
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  49642883 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 49642955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 49666526 - 49666598
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  49666526 aagtgtacaaccactatctccactactctgattctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 49666598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 52920444 - 52920372
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||   | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52920444 aagtatacaaccactacctctactaccctgtttttgtctctgatacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 52920372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 1727872 - 1727930
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||  |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1727872 tctgaagaaaagtgctcctgaaga-caaagtgcttctaaagtgatgacgtcatcagaagc 1727930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 9699950 - 9699985
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9699950 caaagtgcttctgaagtgttgacgtcatcagaagca 9699985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10529602 - 10529567
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529602 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10529567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13977991 - 13977956
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13977991 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 13977956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15833662 - 15833627
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15833662 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15833627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15851208 - 15851173
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15851208 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15851173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Original strand, 16670930 - 16670990
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaa 189  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16670930 tcatcaaaagcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagctatatcatcaccagaa 16670990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 20627552 - 20627694
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| ||| | |||| || |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  20627552 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttatctctgctacaagataagaaaaacaactctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgc 20627650  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  20627651 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 20627694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 24775388 - 24775423
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24775388 caaagtgcttctgaagtgatgatgtcatcagaagca 24775423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31303707 - 31303649
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatca 132  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31303707 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatca 31303649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37412895 - 37412860
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37412895 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 37412860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40851232 - 40851197
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40851232 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 40851197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 49666286 - 49666321
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49666286 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 49666321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 8995606 - 8995667
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  8995606 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaagaatcctaagcatctgaagaaaac 8995667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 9006158 - 9006219
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9006158 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaagaatcctaagcatctgaagaaaac 9006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Original strand, 9092151 - 9092270
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  9092151 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagattt--catcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaa 9092248  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaac 248  Q
    || || ||||| || |||||||    
T  9092249 aggagttgtttttcgtttcaac 9092270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 9700157 - 9700211
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9700157 aagtgtataaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9700211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11223601 - 11223548
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  11223601 aagtgtacaaccactatctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 11223548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 12388729 - 12388763
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12388729 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 12388763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13824320 - 13824286
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13824320 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 13824286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14955730 - 14955679
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14955730 caaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 14955679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 16199653 - 16199716
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16199653 aagcatctgaagaaaagtgctcctgaagtc--aagtgctcctgaactgatgacgtcatcagaagca 16199716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17961828 - 17961779
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17961828 aagtgcctctgaaatgatgacgtcatcagaagcag-aaggcatcagaagca 17961779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40800131 - 40800081
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  40800131 aaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagc 40800081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2785367 - 2785317
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  2785367 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatctgaagc--aaggtcatcagaagcaa 2785317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6091050 - 6090986
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  6091050 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagtt-aaagtgctcatgaagttatgacgtcatcagaagca 6090986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12968344 - 12968311
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12968344 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 12968311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14969632 - 14969567
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14969632 aagcatctgaagagaatcgctccttaagacaaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcataagca 14969567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21640905 - 21640868
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21640905 aagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtc 21640868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 25398115 - 25398180
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25398115 aagcatttgaagagaagcgctcctgaagatacaagtgctcctgaagtgacgacgtcatcagaagca 25398180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 33773486 - 33773539
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33773486 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 33773539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 8739874 - 8739910
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8739874 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 8739910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 8995701 - 8995753
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8995701 caaagtgcctttgaagaaatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagca 8995753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Original strand, 12962970 - 12963006
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12962970 tcaaagtgctcttgaagtgatgacgtcatcagaagca 12963006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 13780705 - 13780777
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13780705 aagtgtacaaccactatctccacgactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgca 13780777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 14392377 - 14392329
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  14392377 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 14392329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 15093998 - 15094046
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  15093998 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 15094046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16880058 - 16880026
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16880058 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 16880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28169536 - 28169504
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28169536 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagca 28169504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28582420 - 28582361
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28582420 tctgaagagaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 28582361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 29905933 - 29905969
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29905933 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 29905969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 29947098 - 29947134
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29947098 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 29947134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 29996252 - 29996288
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29996252 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 29996288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 31113738 - 31113774
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31113738 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 31113774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31303424 - 31303352
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31303424 aagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 31303352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33583534 - 33583502
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33583534 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 33583502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33598154 - 33598122
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33598154 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 33598122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 46796266 - 46796298
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46796266 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 46796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Original strand, 53056576 - 53056631
Alignment:
Q  80 tgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53056576 tgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaag 53056631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 187)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5023315 - 5022819
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5023315 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgc 5023217  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  5023216 ttctgaagtgatgacgtcatcagaag------gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 5023123  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5023122 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 5023023  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023022 cagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 5022924  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5022923 cctgcagaatatgtgcctttaagatgggaatgaatttggagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 5022824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Original strand, 18077563 - 18078082
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||||    
T  18077563 aaaggctagtcaagtaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgct 18077662  T
Q  112 tctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
    |||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18077663 tctgaagctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctac 18077761  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    |||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077762 atttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 18077861  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18077862 tttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaaga 18077961  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18077962 caagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 18078061  T
Q  495 tggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18078062 tggtgaatgatcaaaggattt 18078082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40454006 - 40454524
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  40454006 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 40454104  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  40454105 ttctgaagctgaagtgcatctggagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagtaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 40454203  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40454204 catttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtc 40454303  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40454304 atttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaag 40454402  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40454403 acaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatta 40454502  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  40454503 ctggtgaatgatcaaaggattt 40454524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25657738 - 25657219
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  25657738 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 25657640  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  25657639 ttctgaagctgaagtgcatctggagtgatgacgtcatcagaagcagaaggttatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 25657541  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25657540 catttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggtc 25657441  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaaca-gagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25657440 atttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacaagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttt-gtccacgctacaa 25657342  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25657341 gacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 25657242  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  25657241 actggtgaatgatcaaaggattt 25657219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40470262 - 40470763
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  40470262 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 40470360  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgt-catcagaagc-agaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||   ||| || |||| | ||  |  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||  || |    
T  40470361 ttctgaagc--tgaagtgcatctggagtgatgacgtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaa 40470457  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40470458 ttcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactg 40470557  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470558 agcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 40470656  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40470657 tgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaa 40470756  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  40470757 aggattt 40470763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 18752147 - 18752666
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgagg---------- 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |              
T  18752147 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagtattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagaaaactgctc 18752245  T
Q  101 ------ttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatct 192  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||| ||||||||| ||    
T  18752246 ctgaagttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaatatcttcaccagaaact 18752345  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
     |||||||||  | || |||| |||||||   |||||||| | |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752346 gcatttgatctct-taatcaatctgaagatttaaagtagccgattctccattcagccttatctaagtagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 18752444  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    |||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18752445 catttgaattgctctaagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaa 18752543  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18752544 gacaaggcaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 18752643  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  18752644 actggtgaatgatcaatggattt 18752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 18762757 - 18763276
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgagg---------- 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |              
T  18762757 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagtattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagaaaactgctc 18762855  T
Q  101 ------ttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatct 192  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||| ||||||||| ||    
T  18762856 ctgaagttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaatatcttcaccagaaact 18762955  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
     |||||||||  | || |||| |||||||   |||||||| | |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762956 gcatttgatctct-taatcaatctgaagatttaaagtagccgattctccattcagccttatctaagtataacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 18763054  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18763055 catttgaatagctctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaa 18763153  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18763154 gacaaggcaacagttatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 18763253  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  18763254 actggtgaatgatcaatggattt 18763276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 27814619 - 27815122
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  27814619 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 27814717  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  27814718 ttctgaagtgatgacgtcatcagaaacagaaggtcatcagaagcaaagattttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 27814816  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| |    
T  27814817 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtataaacggatatatggatagcactgag 27814916  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27814917 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttatgtctacgctacaagacaagacaacagccat 27815016  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27815017 gcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 27815116  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27815117 ggattt 27815122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48371717 - 48371214
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  48371717 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 48371619  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  48371618 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcattagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 48371520  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  48371519 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggggggtatcaacggatatatggatagcactgag 48371420  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48371419 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 48371320  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48371319 gcctgcataatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 48371220  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  48371219 ggattt 48371214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10909995 - 10909491
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaa--gcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||  ||  ||||||||||||||  |   |||| | | || ||    
T  10909995 caaaggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattttaaaagcatctgaagaaaaatgtgtctgaagctgaa-gt 10909898  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |  || |    
T  10909897 gcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaa 10909799  T
Q  209 ct-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
     | |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10909798 attcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccct 10909699  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909698 gagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 10909599  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10909598 atgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatca 10909499  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  10909498 aaggattt 10909491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4987743 - 4987359
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||  |||    
T  4987743 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttg-atcaggagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagattcaa 4987645  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | | |||||||||||||    
T  4987644 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgtta 4987545  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4987544 agagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 4987445  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4987444 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 4987359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52704374 - 52703871
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  52704374 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 52704276  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  52704275 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 52704177  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  52704176 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 52704077  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  52704076 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 52703977  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  52703976 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 52703877  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  52703876 ggattt 52703871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24027759 - 24028262
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||| | | |  ||||||    
T  24027759 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctccttaagct-gaagtgc 24027857  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  24027858 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 24027956  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24027957 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24028056  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  24028057 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccat 24028156  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24028157 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggattatcaaa 24028256  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24028257 ggattt 24028262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4948923 - 4948418
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||    
T  4948923 atcaaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gt 4948825  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||    
T  4948824 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcaaaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-ta 4948726  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  4948725 atcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactg 4948626  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
     ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  4948625 agcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcc 4948526  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4948525 atgcctgcagaatatgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaatgaccacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatca 4948426  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  4948425 aaggattt 4948418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 461743 - 461240
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  461743 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 461645  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  461644 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 461546  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  461545 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 461446  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  461445 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 461346  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  461345 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 461246  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  461245 ggattt 461240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 14835893 - 14836276
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| ||||    
T  14835893 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 14835991  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  14835992 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 14836091  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14836092 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 14836190  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14836191 cttcaagatgggaatgaatttaaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 14836276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 14843327 - 14843830
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  14843327 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 14843425  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  14843426 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 14843524  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  14843525 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 14843624  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14843625 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 14843724  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14843725 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 14843824  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  14843825 ggattt 14843830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 15560753 - 15561256
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  15560753 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 15560851  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  15560852 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 15560950  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  15560951 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 15561050  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15561051 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 15561150  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15561151 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 15561250  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  15561251 ggattt 15561256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17918638 - 17918135
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  17918638 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaaggtgaa-gtgc 17918540  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  17918539 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 17918441  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  17918440 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 17918341  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  17918340 cacttgtctctcgttaatagagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 17918241  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17918240 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17918141  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  17918140 ggattt 17918135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36018922 - 36018419
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  36018922 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 36018824  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  | || |    
T  36018823 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttt-taat 36018725  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  36018724 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 36018625  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  36018624 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 36018525  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  36018524 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 36018425  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  36018424 ggattt 36018419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17929286 - 17928783
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  17929286 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaaggtgaa-gtgc 17929188  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  17929187 ttctgaagtaatgacgtcatcaaaagcggaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 17929089  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  17929088 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 17928989  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  17928988 cacttgtctctcgttaatagagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 17928889  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17928888 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17928789  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  17928788 ggattt 17928783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 19954636 - 19955139
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19954636 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19954734  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  19954735 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 19954833  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||| |    
T  19954834 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgag 19954933  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  19954934 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactcttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 19955033  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  19955034 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaaccaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 19955133  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  19955134 ggattt 19955139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22007597 - 22007094
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  22007597 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 22007499  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22007498 ttctgaagtaatgacgtcatcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22007400  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  22007399 caaactgaagattcaaagtagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 22007300  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22007299 cacttgtctctcgttaatagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 22007200  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22007199 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22007100  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22007099 ggattt 22007094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10696226 - 10695726
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaa--gcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||  ||  ||||||||||||||  |   |||| | | || ||    
T  10696226 caaaggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattttaaaagcatctgaagaaaaatgtgtctgaagctgaa-gt 10696129  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |  || |    
T  10696128 gcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaa 10696030  T
Q  209 ct-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
     | |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10696029 attcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccct 10695930  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  10695929 gagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagcc 10695830  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10695829 atgcctgcagaat-tgttccttcgagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatca 10695731  T
Q  508 aagga 512  Q
    |||||    
T  10695730 aagga 10695726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16267048 - 16266545
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16267048 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16266950  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  16266949 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 16266851  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  16266850 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 16266751  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16266750 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 16266651  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16266650 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 16266551  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  16266550 ggattt 16266545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21996999 - 21996496
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  21996999 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 21996901  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  21996900 ttctgaagtaatgacgtcatcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 21996802  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  21996801 caaactgaagattcaaagtagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 21996702  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21996701 cacttgtctctcgttaatagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 21996602  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21996601 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 21996502  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  21996501 ggattt 21996496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 30926168 - 30926671
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  30926168 caaaggctattcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 30926266  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  30926267 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 30926365  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  30926366 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 30926465  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30926466 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 30926565  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30926566 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttaaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 30926665  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  30926666 ggattt 30926671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 30936746 - 30937249
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||||| | | || ||||    
T  30936746 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaaaaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 30936844  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  30936845 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 30936943  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  30936944 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 30937043  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30937044 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 30937143  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30937144 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 30937243  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  30937244 ggattt 30937249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 451161 - 450659
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||  |||||||| | | || |||||    
T  451161 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaattgctcctgaagctgaa-gtgct 451063  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||    
T  451062 tctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatc 450964  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  450963 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 450864  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    | || ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  450863 acttatctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 450764  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  450763 cctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 450664  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  450663 gattt 450659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 47151846 - 47152252
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||        
T  47151846 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa-gattttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaatag 47151944  T
Q  205 tatact-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    || | | |||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47151945 taaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagag 47152044  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47152045 ccctgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaac 47152144  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47152145 aaccatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatg 47152243  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  47152244 atcaaagga 47152252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3371198 - 3370803
Alignment:
Q  113 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || | | || | |    
T  3371198 ctgaagtgatgacgtcgtcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcggaatcatcaccagaagctacaattaattcgt-tattta 3371101  T
Q  213 aactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgca 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | |    
T  3371100 aactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagta 3371001  T
Q  313 gttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 412  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3371000 tttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcc 3370901  T
Q  413 tgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3370900 tgcaaaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaag 3370803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16256455 - 16255952
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16256455 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16256357  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  16256356 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 16256258  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  16256257 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 16256158  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16256157 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 16256058  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16256057 gcctgcagaacttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 16255958  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  16255957 ggattt 16255952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Original strand, 15207204 - 15207585
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||  || |   |||||||||   ||||    
T  15207204 catcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttaatcagtaaatataaactgaagtttcaaa 15207302  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||    
T  15207303 gtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgagtacttgtccttcgttaa 15207402  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  15207403 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaat-tgttcc 15207500  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15207501 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 15207585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 106 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16317821 - 16317416
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16317821 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcaga-tgggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccat 16317723  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagct 305  Q
    | | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |     
T  16317722 aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaca 16317623  T
Q  306 ctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaaca 404  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16317622 ctaagtatttgtccttcgttaacagagttgacgaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaaca 16317523  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16317522 gccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatga 16317424  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  16317423 tcaaagga 16317416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 10740265 - 10740771
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaaga---attccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaag 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||| | | |||     
T  10740265 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaac 10740363  T
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  10740364 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-t 10740462  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||    
T  10740463 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcact 10740562  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10740563 gagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 10740662  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||    
T  10740663 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatc 10740762  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  10740763 aaaggattt 10740771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 10954034 - 10954540
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaaga---attccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaag 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||| | | |||     
T  10954034 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaac 10954132  T
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  10954133 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-t 10954231  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||    
T  10954232 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcact 10954331  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10954332 gagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 10954431  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||    
T  10954432 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatc 10954531  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  10954532 aaaggattt 10954540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 127 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3390924 - 3390543
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||| | || || | | || | |||||||||| ||||    
T  3390924 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcggaatcatcaccagaagctataattaattcgt-tatttaaactgaagatccaa 3390827  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | | |||||||||||||    
T  3390826 agtagctgtttcttatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgtta 3390727  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  3390726 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcatgcagaatttatgc 3390627  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3390626 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaag 3390543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 106 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16305596 - 16305192
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |  |  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16305596 agtgcttctgaagtgataacgtcatcagaagtagaagctcatcagaagcaga--tggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccat 16305499  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagct 305  Q
    | | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |     
T  16305498 aaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaca 16305399  T
Q  306 ctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaaca 404  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16305398 ctaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtataagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaaca 16305299  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
     | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16305298 accatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatga 16305200  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  16305199 tcaaagga 16305192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19581711 - 19581327
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat-atactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||  | | | ||||||||||||  ||    
T  19581711 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 19581613  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| | | |||||||| |||    
T  19581612 aagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacgatcatttggaaaacactgagtacttgtcctttgtt 19581513  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||     
T  19581512 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaacagccatgcctgcagaa-atgtt 19581414  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19581413 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtggatgatcaaagga 19581327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 19943984 - 19944504
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19943984 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19944082  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  19944083 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcta 19944182  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    | |||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  19944183 cgtttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggat 19944281  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  19944282 atatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctataa 19944381  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19944382 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 19944481  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  19944482 actggtggataatcaaaggattt 19944504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36029492 - 36028972
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  36029492 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 36029394  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  36029393 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcta 36029294  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||  | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36029293 catttgatcttt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggat 36029195  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36029194 atatggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaa 36029095  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36029094 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 36028995  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  36028994 actggtggataatcaaaggattt 36028972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 18129915 - 18130416
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  18129915 caaaggctactcaagttatttcattaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 18130013  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  18130014 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcaaaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-t 18130108  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||    
T  18130109 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaaggat-atatggatagcact 18130207  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18130208 gagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 18130307  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  18130308 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 18130407  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  18130408 aaaggattt 18130416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49518738 - 49518218
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  49518738 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 49518640  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  49518639 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 49518540  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  49518539 catttgatcctt-tagtcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggat 49518441  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49518440 atatggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaa 49518341  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49518340 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 49518241  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  49518240 actggtggataatcaaaggattt 49518218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 10750956 - 10751345
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  10750956 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 10751054  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  10751055 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 10751154  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  10751155 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 10751254  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  10751255 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 10751345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 10964725 - 10965114
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  10964725 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 10964823  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  10964824 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 10964923  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  10964924 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 10965023  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  10965024 acactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 10965114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11536313 - 11535932
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  11536313 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 11536216  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  11536215 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtta 11536117  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  11536116 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 11536018  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11536017 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 11535932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24713898 - 24713518
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||  || | | ||||||||||  ||||    
T  24713898 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaa 24713801  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    |||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||     
T  24713800 gtagttgtttcttgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttat 24713701  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  24713700 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt-cacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 24713603  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24713602 ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatcaaagga 24713518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 514
Target Start/End: Original strand, 55745040 - 55745428
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  55745040 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 55745138  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  55745139 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatt 55745238  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  55745239 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 55745338  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggatt 514  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  55745339 acactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatt 55745428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 514
Target Start/End: Original strand, 55755651 - 55756039
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  55755651 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 55755749  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  55755750 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatt 55755849  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  55755850 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 55755949  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggatt 514  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  55755950 acactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatt 55756039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 129 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5873837 - 5873456
Alignment:
Q  129 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaag 228  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| || |||  || | | || |||||||  |||||    
T  5873837 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcaaaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaagctgaagattcaaag 5873739  T
Q  229 tagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaac 328  Q
    ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||| |||||    
T  5873738 tagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcattaac 5873639  T
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  5873638 atagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcct 5873540  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5873539 tcaagatgggaatgaaattgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatccaagga 5873456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10300970 - 10300621
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||    
T  10300970 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaa 10300872  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10300871 gaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgagtatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 10300772  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10300771 cctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattctt 10300673  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10300672 caaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 10300621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 112 - 510
Target Start/End: Original strand, 31266574 - 31266968
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||  || | |     
T  31266574 tctgaagtaatgacatcatcagaagtagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccaaaagttacaagtgatcagtaaattt 31266671  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  31266672 aaactgaatattcaaagaagctgtttttcgtttcaacctcgtctaa-aagaacgaagaattgtaaaggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagt 31266770  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31266771 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgc 31266870  T
Q  412 ctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31266871 ctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 31266968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11515501 - 11515122
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  11515501 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagta-atttaaactgaagattcaaa 11515405  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||     
T  11515404 ggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtacttgtccttcgttat 11515306  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  11515305 cagagttaacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 11515207  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11515206 ttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 11515122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24640702 - 24640330
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  24640702 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 24640604  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  24640603 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 24640504  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  24640503 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 24640404  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24640403 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 24640330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27657055 - 27656683
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  27657055 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 27656957  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  27656956 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 27656857  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  27656856 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 27656757  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  27656756 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 27656683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27667628 - 27667256
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  27667628 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 27667530  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  27667529 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 27667430  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  27667429 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 27667330  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  27667329 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 27667256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 55651813 - 55651411
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||      
T  55651813 aagtgcctctgaagtaacgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagttacaattgatcag 55651716  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  55651715 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgttcatttgaaaagc 55651617  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55651616 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 55651518  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  55651517 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaatttgatccttcataggactacacccaaatcagtcaaaagattactggtggatga 55651419  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  55651418 tcaaagga 55651411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 49001749 - 49002151
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||  |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||      
T  49001749 aagtgcctctgaagtaatgacgtcgtcagaagcagaagtccatcagaagtaagattt--catcagaagctatttcatcaccagaagctacagttgatcag 49001846  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
     | | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  49001847 aaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttgaaaagc 49001945  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
      || |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49001946 attgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 49002044  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  49002045 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatga 49002143  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  49002144 tcaaagga 49002151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 20648309 - 20648501
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  20648309 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 20648406  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20648407 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccata 20648501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23509386 - 23509204
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  23509386 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 23509288  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23509287 tcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 23509204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 512
Target Start/End: Original strand, 18774448 - 18774849
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||       
T  18774448 agtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaattt--catcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatctga 18774544  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    | | |||| |||||    ||||  |||||| |||  |  | |||||  ||||||| || | ||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | |||    
T  18774545 agattcaatctgaaatctcaaaagagctgtctctttaagttaacctcgtctaaga-gagcaaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagc 18774643  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18774644 actgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaaatacaattgtacaaccactatctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataaca 18774742  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18774743 gctctgcctgcataat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatga 18774841  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  18774842 tcaaagga 18774849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 8997268 - 8997450
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||| |||    
T  8997268 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagttctgcctgcagaa-gtgttcct 8997366  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||  ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8997367 tcaagacaggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 8997450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 18007071 - 18007252
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  18007071 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgca-aaaatgttcct 18007169  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18007170 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 18007252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 16819364 - 16819546
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  16819364 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccc 16819462  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16819463 acaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaagga 16819546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 33378461 - 33378302
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||| |    
T  33378461 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcagaa-atgttc 33378363  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  33378362 cttcaagataggaatggatttgaacgtgattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 33378302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 14778454 - 14778611
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  14778454 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 14778552  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  14778553 tcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 14778611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17276577 - 17276433
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  17276577 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 17276479  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17276478 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 17276433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25089309 - 25089166
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  25089309 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 25089211  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25089210 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 25089166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 17993805 - 17993962
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||    
T  17993805 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgtccct 17993903  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17993904 tcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 17993962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28066765 - 28066621
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||| | | | ||| |||    
T  28066765 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctaaagct-aaactgc 28066667  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28066666 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 28066621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Original strand, 39525952 - 39526119
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  39525952 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 39526049  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39526050 aggagctgtttttc-tttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 39526119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 53442459 - 53442310
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaa 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  53442459 atcaaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaa 53442361  T
Q  107 gtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 157  Q
     |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53442360 ctgctcctgaagagatgacgtcatcggaagcagaaagtcatcagaagcaaa 53442310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 14710790 - 14710947
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||| |||    
T  14710790 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctatagaa-atgttcct 14710888  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  14710889 tcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 14710947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 10750822 - 10750968
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaaga---attccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaag 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||| | | |||     
T  10750822 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaac 10750920  T
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750921 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 10750968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 10964591 - 10964737
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaaga---attccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaag 107  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||| | | |||     
T  10964591 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaac 10964689  T
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10964690 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 10964737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 36210119 - 36210278
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  36210119 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataa-atgttc 36210217  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36210218 cttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 36210278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 17198189 - 17198286
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17198189 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatcc 17198286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 8182533 - 8182639
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||||    
T  8182533 aaaggctagtcaagtaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgct 8182632  T
Q  112 tctgaag 118  Q
    |||||||    
T  8182633 tctgaag 8182639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 16819143 - 16819237
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16819143 aagtgcctctgaagaaatgacgtcatcagaagcagaa-gtcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 16819237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10692884 - 10692812
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10692884 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 10692812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10906650 - 10906578
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10906650 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 10906578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 14604985 - 14605057
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14604985 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 14605057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 8997032 - 8997143
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8997032 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaag 8997131  T
Q  191 ctacatttgatc 202  Q
    ||||| ||||||    
T  8997132 ctacagttgatc 8997143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 9751618 - 9751690
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9751618 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 9751690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19244266 - 19244174
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19244266 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaac----ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 19244174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 55744874 - 55744962
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag-aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  55744874 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 55744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 55755485 - 55755573
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag-aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  55755485 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 55755573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24640869 - 24640782
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24640869 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 24640782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27657222 - 27657135
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  27657222 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 27657135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27667795 - 27667708
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  27667795 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 27667708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1672422 - 1672368
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1672422 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1672368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1674897 - 1674843
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1674897 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1674843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 14835745 - 14835822
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14835745 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgtagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 14835822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16305707 - 16305630
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16305707 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcgtggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctgaagaaaac 16305630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16853536 - 16853482
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16853536 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16853482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6517518 - 6517446
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6517518 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 6517446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 17398752 - 17398824
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17398752 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 17398824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19884735 - 19884592
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  |||| ||||     
T  19884735 aagtgtacaaccactatctccactaatctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatggaaatgc 19884637  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaag 488  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| |||||||||||    
T  19884636 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaag 19884592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22190879 - 22190807
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  22190879 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 22190807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24640756 - 24640708
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24640756 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 24640708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27657109 - 27657061
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657109 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 27657061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27667682 - 27667634
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667682 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 27667634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 4987896 - 4987814
Alignment:
Q  6 agtatcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  4987896 agtaccaaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaactcgaagcatctgaagaaaac 4987814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 156
Target Start/End: Original strand, 8182651 - 8182694
Alignment:
Q  113 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8182651 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 8182694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 15207055 - 15207160
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  15207055 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 15207152  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  15207153 ttctgaag 15207160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29121403 - 29121344
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||    
T  29121403 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgttacaagacaagaaaaca 29121344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 17198088 - 17198157
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17198088 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctgaagaaaac 17198157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19581851 - 19581782
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19581851 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 19581782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25009372 - 25009303
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25009372 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaatgaattcgaagcatctgaagaaaac 25009303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 13575943 - 13576023
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  13575943 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagc 13576023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 16317932 - 16317856
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  16317932 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcgtggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctgaaaaaaa 16317856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19244047 - 19243982
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||    
T  19244047 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 19243982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 3105497 - 3105569
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  3105497 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaaggcaaggataacagctctgcctgca 3105569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 18006838 - 18006946
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18006838 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aaactcatcagaagcaaagttcatcagaagcaacttcatcagaagctatatcatcaccagaagct 18006936  T
Q  193 acatttgatc 202  Q
    ||| ||||||    
T  18006937 acagttgatc 18006946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20977490 - 20977418
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20977490 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 20977418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 37435613 - 37435685
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  37435613 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctataagacaagaaaaacagctctgcctgca 37435685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 39419812 - 39419884
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  39419812 aagtgtacaaccactacttccattactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 39419884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20977697 - 20977662
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20977697 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 20977662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40860698 - 40860647
Alignment:
Q  347 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  40860698 gtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 40860647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 55744988 - 55745035
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55744988 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaacgtcatcagaagca 55745035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 55755599 - 55755646
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55755599 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaacgtcatcagaagca 55755646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16848574 - 16848508
Alignment:
Q  351 acaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16848574 acaaccactacctccactactctgtttttgtctctcctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16848508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242142
Alignment:
Q  389 acaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 483  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19242235 acaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcattcataggacaacatccaaatcagg 19242142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 25651182 - 25651235
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  25651182 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 25651235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 39419587 - 39419621
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39419587 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 39419621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40860941 - 40860907
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40860941 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 40860907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54679963 - 54679929
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679963 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 54679929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6641717 - 6641680
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6641717 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttatgtc 6641680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 142
Target Start/End: Original strand, 14835854 - 14835891
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaa 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14835854 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaa 14835891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16940274 - 16940210
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16940274 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtt-aaagtgctcttgaagtgatgacgtaatcagaagca 16940210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24713939 - 24713902
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24713939 aaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 24713902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54680210 - 54680130
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  54680210 aagcgtctgaagaaaattgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagc 54680130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3391061 - 3390990
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaa 83  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  3391061 caaaggcaaatcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatctgaa 3390990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3395623 - 3395551
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3395623 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 3395551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4987782 - 4987746
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987782 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 4987746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 13576192 - 13576264
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13576192 aagtgtaaaaccactacatccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 13576264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19581750 - 19581714
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19581750 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 19581714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Original strand, 29680385 - 29680421
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29680385 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 29680421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 37435320 - 37435400
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  37435320 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagta-atagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 37435400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 38513911 - 38513839
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  38513911 aagtgtacaaccactactttcactactctgtttttgtctctgctacaagacgagaaaaacagctctgcctgca 38513839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3486386 - 3486351
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3486386 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 3486351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 3499491 - 3499526
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3499491 caaagtgcttctgaagtgatgatgtcatcagaagca 3499526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8105667 - 8105566
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||    
T  8105667 tgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcatt 8105570  T
Q  447 tgaa 450  Q
    ||||    
T  8105569 tgaa 8105566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 9751391 - 9751426
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9751391 caaagtgcttatgaagtgatgacgtcatcagaagca 9751426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10693119 - 10693084
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10693119 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10693084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10906885 - 10906850
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10906885 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10906850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14571292 - 14571257
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14571292 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14571257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 15474994 - 15475029
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15474994 caaagtgcttatgaagtgatgacgtcatcagaagca 15475029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16940049 - 16939978
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgc 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||   |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16940049 aagtgtacaaccactatctccactgctatgtttttgtccctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgc 16939978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 17700639 - 17700674
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17700639 caaagtgcttctaaagtgatgacgtcatcagaagca 17700674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 22675598 - 22675653
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||    
T  22675598 aagtgtacaaccactacctccactactcagttttttgtctctgctacaagacaaga 22675653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23509623 - 23509568
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23509623 aagtgcctctgaagtagtgacgtcatcagaagcagaagttcatcaaaagcaaagtt 23509568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 27188509 - 27188544
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27188509 caaagtgcttctgaagtgttgacgtcatcagaagca 27188544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 155
Target Start/End: Original strand, 55745021 - 55745052
Alignment:
Q  124 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745021 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 55745052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 155
Target Start/End: Original strand, 55755632 - 55755663
Alignment:
Q  124 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55755632 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 55755663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10072968 - 10072914
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||    
T  10072968 aagtgtacaaccactatctccactactatgtttttgtctctgctataagacaaga 10072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10301041 - 10300991
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10301041 aagtgcctctgaagcaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 10300991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10301137 - 10301076
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  10301137 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaagaatacaaagcatctgaagaaaac 10301076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Original strand, 10661240 - 10661278
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10661240 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 10661278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Original strand, 10875385 - 10875423
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10875385 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 10875423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17247277 - 17247243
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17247277 aagtgtacaaccactgcctccactactctgttttt 17247243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 19911959 - 19912013
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |   ||||||||||||||    
T  19911959 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgcctctgctacaagacaaga 19912013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23509553 - 23509519
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23509553 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 23509519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38514139 - 38514105
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38514139 caaagtgcttctgaagtgatgatgtcatcagaagc 38514105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 45833427 - 45833373
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||    
T  45833427 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttggtctctgctacaaaacaaga 45833373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 56034841 - 56034807
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56034841 aaagtgcttctgaagtgatgacgtaatcagaagca 56034807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 9914103 - 9914156
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9914103 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 9914156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10073235 - 10073155
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  10073235 aagcgtctgaagaaaagtgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgatgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagc 10073155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 12811253 - 12811306
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  12811253 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 12811306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16632751 - 16632687
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16632751 aagcatctgaagagaagtgctcctaaagt-caaagtgcttctgaagtgatgacaccatcagaagca 16632687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 19620891 - 19620955
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| |   |||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19620891 aagcatctgaagagacgtgctcctgaagt-caaagtgatcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19620955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19666405 - 19666352
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  19666405 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 19666352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 43346103 - 43346156
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43346103 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 43346156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 45833708 - 45833643
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45833708 aagcatctgaaaagaagcgctcctgaagacaaaagtgctcttgaagtgatgacgtcatcagaagca 45833643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 55380541 - 55380508
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55380541 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 55380508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 56533140 - 56533173
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56533140 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 56533173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 3105256 - 3105315
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3105256 tctgaagaaaactgctcctgaaga-caaggtgctcctgaagtgatgacgtcatcaaaagca 3105315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 3188078 - 3188126
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  3188078 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 3188126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5873984 - 5873882
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||||||    
T  5873984 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 5873887  T
Q  114 tgaag 118  Q
    |||||    
T  5873886 tgaag 5873882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11515541 - 11515505
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11515541 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 11515505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11536352 - 11536316
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11536352 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 11536316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Original strand, 14604734 - 14604770
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14604734 tcaaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagca 14604770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 19621139 - 19621211
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19621139 aagtgtacaaccactatctccactattcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 19621211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23750555 - 23750483
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23750555 aagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 23750483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25089161 - 25089133
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25089161 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 25089133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 39525913 - 39525949
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39525913 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 39525949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 55380323 - 55380271
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||    
T  55380323 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaa 55380271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 251)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 10754281 - 10754783
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10754281 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgc 10754380  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  10754381 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 10754480  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10754481 caaactgaagatccaaagtagctgtttcttatttcaaccttatct-agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 10754579  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754580 catttgtcctacgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 10754678  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  10754679 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaat 10754778  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  10754779 gattt 10754783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 34782646 - 34783146
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  34782646 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 34782743  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  34782744 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 34782842  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34782843 caaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgag 34782942  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34782943 catttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 34783041  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34783042 tctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 34783141  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  34783142 gattt 34783146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 34771701 - 34772201
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  34771701 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 34771798  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  34771799 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 34771897  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34771898 caaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgag 34771997  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34771998 catttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 34772096  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34772097 tctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 34772196  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  34772197 gattt 34772201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 20797467 - 20797986
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  20797467 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag-aaaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 20797565  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  20797566 ttctgaagctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa-gattttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 20797664  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797665 catttaatccatatattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 20797764  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20797765 atttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctgcaag 20797864  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20797865 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 20797964  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  20797965 ctggtgaatgatcaaaggattt 20797986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 42394769 - 42395269
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  42394769 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagtgc 42394867  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  42394868 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 42394966  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  42394967 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcgctgag 42395066  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42395067 catttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-tctg-ttttgtccacactacaagacaagacaacagctatg 42395164  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  42395165 cctgcagaatttgtgccttcaagatggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaag 42395264  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  42395265 gattt 42395269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43044160 - 43043641
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||| | | |||||||    
T  43044160 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaa-gaattctaagcatctgaagaaaactacgtctgaagcttaaagtgc 43044062  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  43044061 ttctgaagctgaagtgcttctgaaatgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagcta 43043963  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| || | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043962 catttaattcgtatattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 43043863  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43043862 atttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtccacgctacaag 43043763  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43043762 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggatta 43043663  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43043662 ctggtggatgatcaaaggattt 43043641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 8521723 - 8522131
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8521723 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaagtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatcca 8521821  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8521822 tatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagc 8521921  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     |||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521922 gctgatcatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 8522020  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  8522021 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtgaatga 8522120  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    ||||| |||||    
T  8522121 tcaaatgattt 8522131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 104 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24926519 - 24926110
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24926519 aaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatcc 24926421  T
Q  204 atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24926420 gtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaaaggaggtatcaacggtcatttggatag 24926321  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926320 cactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaac 24926222  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24926221 acctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatg 24926122  T
Q  504 atcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||    
T  24926121 atcaaaggattt 24926110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 36084343 - 36084751
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  36084343 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttaatccg 36084441  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084442 taaattcaaactgaatatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 36084541  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36084542 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacatgacaagacaaca 36084640  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36084641 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 36084740  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  36084741 tcaaaggattt 36084751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1109524 - 1109116
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1109524 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 1109426  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1109425 tatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 1109326  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109325 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 1109227  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1109226 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 1109127  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  1109126 tcaaaggattt 1109116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 20551697 - 20552105
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  20551697 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaag-agaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 20551795  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20551796 taaattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 20551895  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20551896 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtccacgctacaagacaagacaaca 20551994  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20551995 gctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 20552094  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    ||||| |||||    
T  20552095 tcaaatgattt 20552105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 36228621 - 36229029
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  36228621 aagtgcatctgaagtgatgacgccatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccg 36228719  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36228720 taaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgtaagggaggtatcaacggtcatttggataac 36228819  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36228820 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgccacaagacaagacaaca 36228918  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36228919 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 36229018  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  36229019 tcaaaggattt 36229029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1122392 - 1121874
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| | | ||         
T  1122392 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaaccgcgtctgaagctaaagtgct 1122293  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
               ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  1122292 tctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctac 1122194  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1122193 atttaatccatatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaatgtatcaacggtca 1122094  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1122093 tttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaaga 1121995  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1121994 caagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 1121895  T
Q  495 tggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  1121894 tggtgaatgatcaaaggattt 1121874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30070262 - 30069876
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30070262 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcttcaccagaagctacatttgatccat-taatcaaactgaagatccaa 30070165  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||     
T  30070164 agtagctggttctcaattcagtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgttg 30070065  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30070064 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 30069965  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30069964 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcataggattactggtggatgatcaaaggattt 30069876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27623239 - 27622736
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  27623239 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 27623141  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  27623140 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 27623042  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27623041 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27622942  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27622941 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 27622842  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27622841 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 27622742  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27622741 ggattt 27622736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 130 - 512
Target Start/End: Original strand, 19477908 - 19478289
Alignment:
Q  130 tcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagt 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| |||||||    
T  19477908 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19478006  T
Q  230 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    
T  19478007 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 19478106  T
Q  330 gagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19478107 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 19478206  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19478207 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 19478289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 106 - 515
Target Start/End: Original strand, 23406329 - 23406736
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| || || ||||| | |    
T  23406329 agtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgtaatcatcaccagaagcttcaattgattcgt 23406427  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagct 305  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23406428 aaattcaaactgaagatccaaagtagctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagca 23406527  T
Q  306 ctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacag 405  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23406528 ctgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaatacaacag 23406626  T
Q  406 ctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgat 505  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23406627 ctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgat 23406726  T
Q  506 caaaggattt 515  Q
    ||||||||||    
T  23406727 caaaggattt 23406736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24983777 - 24983391
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||| ||||    
T  24983777 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 24983679  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||    
T  24983678 agtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcatta 24983579  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24983578 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgc 24983480  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24983479 cttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 24983391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 130 - 512
Target Start/End: Original strand, 19463878 - 19464259
Alignment:
Q  130 tcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagt 229  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| |||||||    
T  19463878 tcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19463976  T
Q  230 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    
T  19463977 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 19464076  T
Q  330 gagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19464077 aagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 19464176  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19464177 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 19464259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17457668 - 17457285
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  17457668 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaa 17457570  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | | |||||||||||||    
T  17457569 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtta 17457470  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  17457469 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtatacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 17457371  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17457370 cttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 17457285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40390145 - 40390648
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  40390145 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 40390243  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  40390244 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 40390342  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  40390343 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaatttagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 40390442  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40390443 caattgtctctcgtaaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40390542  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40390543 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40390642  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40390643 ggattt 40390648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40400807 - 40401310
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  40400807 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 40400905  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  40400906 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 40401004  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  40401005 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 40401104  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  40401105 cacttgtctctcgtaaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcat 40401204  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40401205 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40401304  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40401305 ggattt 40401310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21706355 - 21705948
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||      
T  21706355 aagtgcctctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcag 21706257  T
Q  205 t-atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    | | | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     
T  21706256 taaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaa 21706157  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21706156 cactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 21706057  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21706056 agctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatg 21705957  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  21705956 atcaaagga 21705948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14558490 - 14557986
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  14558490 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 14558392  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  14558391 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 14558293  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  14558292 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 14558193  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  14558192 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 14558093  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  14558092 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 14557993  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  14557992 aggattt 14557986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14569127 - 14568623
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  14569127 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 14569029  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  14569028 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 14568930  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  14568929 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 14568830  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  14568829 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 14568730  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  14568729 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 14568630  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  14568629 aggattt 14568623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5291048 - 5290545
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||| | | || |||     
T  5291048 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttagaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtga 5290950  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  5290949 ttctgaagtgatcacgtcattagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 5290851  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5290850 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5290751  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5290750 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 5290651  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5290650 gcctgcagaagttgtacgttcaagatggtaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 5290551  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5290550 ggattt 5290545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7032600 - 7032095
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  7032600 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 7032502  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  7032501 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 7032403  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  7032402 caaattgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgagagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 7032303  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt---gtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||     
T  7032302 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcc 7032203  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  7032202 atgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatca 7032103  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  7032102 aaggattt 7032095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9377934 - 9377431
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  9377934 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 9377836  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  9377835 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 9377737  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9377736 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9377637  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9377636 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9377537  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9377536 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9377437  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9377436 ggattt 9377431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 22156892 - 22157395
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  22156892 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 22156990  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22156991 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22157089  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  22157090 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 22157189  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22157190 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 22157289  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22157290 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22157389  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22157390 ggattt 22157395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 23306633 - 23307136
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  23306633 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 23306731  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  23306732 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 23306830  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  23306831 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 23306930  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23306931 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 23307030  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23307031 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 23307130  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  23307131 ggattt 23307136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24827946 - 24827443
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  24827946 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 24827848  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  24827847 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 24827749  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24827748 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24827649  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24827648 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 24827549  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24827548 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24827449  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24827448 ggattt 24827443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27603890 - 27603387
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  27603890 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 27603792  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||| | || |    
T  27603791 ttctgaagtaatgtcgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccataagctacgtttgatcctt-taat 27603693  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27603692 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27603593  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27603592 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 27603493  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27603492 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 27603393  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27603392 ggattt 27603387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 31448456 - 31448844
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  31448456 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 31448554  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  31448555 agtagctatttatcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttggtta 31448654  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31448655 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtg 31448754  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31448755 ccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggattt 31448844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 39352276 - 39352779
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  39352276 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 39352374  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  39352375 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 39352473  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  39352474 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 39352573  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  39352574 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 39352673  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39352674 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 39352773  T
Q  510 ggattt 515  Q
    | ||||    
T  39352774 gaattt 39352779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17447052 - 17446669
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  17447052 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaa 17446954  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | | |||||||||||||    
T  17446953 agtagctgtttctcatttcaacctcgtataagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgtta 17446854  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  17446853 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttc 17446755  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446754 cttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 17446669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 22146309 - 22146812
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||| | | || ||||    
T  22146309 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgcttctgaagctgaa-gtgc 22146407  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22146408 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22146506  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  22146507 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 22146606  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22146607 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 22146706  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22146707 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22146806  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22146807 ggattt 22146812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 23296065 - 23296568
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  23296065 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 23296163  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  23296164 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 23296262  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  23296263 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 23296362  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23296363 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 23296462  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23296463 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 23296562  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  23296563 ggattt 23296568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24817358 - 24816855
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || |  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  24817358 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaatagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 24817260  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  24817259 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 24817161  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24817160 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24817061  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24817060 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 24816961  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24816960 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24816861  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24816860 ggattt 24816855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 31843747 - 31844250
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  31843747 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 31843845  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  31843846 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 31843944  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  31843945 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 31844044  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31844045 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 31844144  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  31844145 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 31844244  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  31844245 ggattt 31844250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6986085 - 6986589
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  6986085 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 6986183  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  6986184 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 6986282  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  6986283 tcaaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 6986382  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6986383 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 6986482  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  6986483 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 6986582  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  6986583 aggattt 6986589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6130577 - 6131080
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6130577 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6130675  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  6130676 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 6130774  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6130775 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6130874  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6130875 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 6130974  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6130975 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 6131074  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  6131075 ggattt 6131080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9335744 - 9336246
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  9335744 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 9335842  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  9335843 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 9335941  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9335942 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9336041  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9336042 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9336141  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9336142 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9336240  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9336241 ggattt 9336246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9346331 - 9346833
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  9346331 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 9346429  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  9346430 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 9346528  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9346529 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9346628  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9346629 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9346728  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9346729 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9346827  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9346828 ggattt 9346833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 31418565 - 31418953
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||| |||| ||||    
T  31418565 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtatattcaaactaaagatccaa 31418663  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  31418664 agtagctgtttctcaattcaatattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcattgagcatttgtccttcgtta 31418763  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  31418764 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttatg 31418863  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31418864 ccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggattt 31418953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 106 - 512
Target Start/End: Original strand, 34062503 - 34062907
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  34062503 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgt 34062600  T
Q  206 atact-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    | | | |||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  34062601 aaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaac 34062700  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34062701 actgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 34062800  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34062801 gccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatga 34062899  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  34062900 tcaaagga 34062907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 515
Target Start/End: Original strand, 42042571 - 42043075
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |    
T  42042571 atcaaaggctactcaagtcatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaact 42042669  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  42042670 gctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-ttta 42042768  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||     
T  42042769 atcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcacta 42042868  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
     ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  42042869 agctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcc 42042968  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  42042969 atgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatca 42043067  T
Q  508 aaggattt 515  Q
    ||||||||    
T  42043068 aaggattt 42043075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 105 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 43622249 - 43621855
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt---------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||         ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  43622249 aagtgcatctgaagtgataacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 43622150  T
Q  196 tttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 295  Q
    ||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622149 ttttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcagcactatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 43622050  T
Q  296 tt-ggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    || ||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43622049 tttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaaga 43621951  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621950 caagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 43621855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15694503 - 15694001
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  15694503 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 15694405  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  15694404 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 15694306  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  15694305 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 15694206  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15694205 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 15694106  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15694105 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 15694007  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  15694006 ggattt 15694001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24566878 - 24567380
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  24566878 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 24566976  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  24566977 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 24567075  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24567076 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24567175  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24567176 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 24567275  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24567276 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24567374  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24567375 ggattt 24567380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24807701 - 24808203
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  24807701 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 24807799  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  24807800 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 24807898  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24807899 caaactcaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24807998  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24807999 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 24808098  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24808099 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24808197  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24808198 ggattt 24808203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 42053148 - 42053650
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  42053148 caaaggctactcaagtcatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 42053246  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  42053247 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 42053345  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  42053346 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 42053445  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  42053446 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 42053545  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  42053546 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 42053644  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  42053645 ggattt 42053650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 14029831 - 14030335
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  14029831 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 14029929  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  14029930 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 14030028  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  14030029 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 14030128  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  14030129 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 14030228  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  14030229 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 14030328  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  14030329 aggattt 14030335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 14040384 - 14040888
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  14040384 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 14040482  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  14040483 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 14040581  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  14040582 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 14040681  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  14040682 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 14040781  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  14040782 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 14040881  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  14040882 aggattt 14040888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 23361898 - 23362402
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  23361898 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 23361996  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  23361997 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 23362095  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||| |    
T  23362096 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgag 23362195  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23362196 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 23362295  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  23362296 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 23362395  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  23362396 aggattt 23362402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15993801 - 15993298
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  15993801 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 15993703  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  15993702 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 15993604  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  15993603 caaactgaagattcaaagtaactgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 15993504  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15993503 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaatctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 15993404  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15993403 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 15993304  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  15993303 ggattt 15993298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16004363 - 16003860
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16004363 caaaggttactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16004265  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  16004264 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 16004166  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  16004165 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 16004066  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16004065 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 16003966  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16003965 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 16003866  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  16003865 ggattt 16003860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21703600 - 21703101
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  21703600 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaga-aatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 21703503  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgt-catcagaagc-agaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||   ||| || | || ||||  |  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||  || |    
T  21703502 ttctgaagc--tgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaa 21703406  T
Q  209 ct-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
     | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||    
T  21703405 attcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacact 21703306  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
      | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703305 aagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 21703206  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21703205 atgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatca 21703106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 27459949 - 27460452
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  27459949 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 27460047  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  27460048 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taat 27460146  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27460147 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27460246  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27460247 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27460346  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27460347 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27460446  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27460447 ggattt 27460452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 27470348 - 27470851
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  27470348 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 27470446  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  27470447 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taat 27470545  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27470546 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27470645  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27470646 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27470745  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27470746 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27470845  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27470846 ggattt 27470851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30227969 - 30227467
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  30227969 caaaggctactcaagtcatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 30227871  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  30227870 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 30227772  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  30227771 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 30227672  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30227671 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 30227572  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30227571 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 30227473  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  30227472 ggattt 30227467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30238496 - 30237994
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  30238496 caaaggctactcaagtcatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 30238398  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  30238397 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 30238299  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  30238298 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 30238199  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30238198 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 30238099  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30238098 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 30238000  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  30237999 ggattt 30237994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 106 - 512
Target Start/End: Original strand, 34051842 - 34052246
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  34051842 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgt 34051939  T
Q  206 atact-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    | | | |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  34051940 aaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaac 34052039  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34052040 actgagtacttgtccttcattaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctatttttgtctacgctacaagacaagacaaca 34052139  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34052140 gccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatga 34052238  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  34052239 tcaaagga 34052246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 20562244 - 20562615
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||| ||||    
T  20562244 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaa 20562342  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||    
T  20562343 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgtta 20562442  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||               |||    
T  20562443 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagcta---------------tgc 20562526  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  20562527 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgattt 20562615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39502611 - 39502109
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  39502611 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 39502513  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  39502512 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagt----catcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-t 39502418  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  39502417 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 39502318  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39502317 gagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 39502218  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  39502217 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 39502118  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  39502117 aaaggattt 39502109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 35215293 - 35215797
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  35215293 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 35215391  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  35215392 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 35215490  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    || ||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| |    
T  35215491 catactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgag 35215590  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  35215591 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 35215690  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  35215691 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 35215790  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  35215791 aggattt 35215797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36582934 - 36582527
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  36582934 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-t 36582836  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||    
T  36582835 aatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcact 36582736  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    |  || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36582735 gaccacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 36582636  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  36582635 catgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 36582536  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  36582535 aaaggattt 36582527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36593489 - 36593082
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  36593489 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-t 36593391  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||    
T  36593390 aatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcact 36593291  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    |  || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36593290 gaccacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 36593191  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  36593190 catgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 36593091  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  36593090 aaaggattt 36593082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6975595 - 6976099
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |     |       
T  6975595 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagagatgacgt 6975694  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    | || ||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  6975695 catcagaagc-agaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 6975792  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  6975793 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 6975892  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6975893 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 6975992  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  6975993 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 6976092  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  6976093 aggattt 6976099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 27203598 - 27204084
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  27203598 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 27203696  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  27203697 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca----------------aaagtttt-catcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 27203778  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27203779 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27203878  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27203879 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27203978  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27203979 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27204078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Original strand, 23707327 - 23707733
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  23707327 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-t 23707425  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  23707426 aatcaaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 23707525  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23707526 gagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 23707625  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  23707626 catgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 23707724  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  23707725 aaaggattt 23707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 22675886 - 22676407
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  22675886 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 22675984  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  22675985 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 22676084  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22676085 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 22676183  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| |||  |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22676184 tatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 22676283  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22676284 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 22676383  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  22676384 cactggtggataatcaaaggattt 22676407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27042702 - 27042181
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  27042702 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 27042604  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  27042603 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 27042504  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27042503 acatttgatcctt-tagtcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacgga 27042405  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27042404 tatatggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctaca 27042305  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27042304 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 27042205  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  27042204 cactggtggataatcaaaggattt 27042181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 420
Target Start/End: Original strand, 39362102 - 39362510
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | |||||||    
T  39362102 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaagtgc 39362200  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  39362201 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatccct-taat 39362299  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  39362300 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 39362399  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  39362400 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 39362499  T
Q  410 gcctgcagaat 420  Q
    |||||||||||    
T  39362500 gcctgcagaat 39362510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 23372299 - 23372805
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  23372299 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 23372397  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  23372398 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 23372496  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||| |    
T  23372497 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgag 23372596  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaa-ccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  23372597 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagaaaaaacaacagcca 23372696  T
Q  409 tgcctgcagaa-tatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
    |||||  | || | ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  23372697 tgcctcaaaaattttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaaggactacccccaaatcaggcaaaggaacactggtggataatc 23372796  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  23372797 aaaggattt 23372805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 163 - 515
Target Start/End: Original strand, 22559376 - 22559728
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  22559376 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatcaaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaaga 22559474  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22559475 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggttagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 22559574  T
Q  363 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22559575 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttc 22559674  T
Q  462 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22559675 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggattt 22559728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27053327 - 27052805
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  27053327 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 27053229  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  27053228 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 27053129  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27053128 acatttgatcctt-tagtcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcattcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacgga 27053030  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgt-acaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctac 390  Q
     || |||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27053029 tatatggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgttacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctac 27052930  T
Q  391 aagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052929 aagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 27052830  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  27052829 tcactggtggataatcaaaggattt 27052805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5301607 - 5301116
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  5301607 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 5301509  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  5301508 ttctgaagtgatgacgtcatcagaag-----------------caaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 5301427  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5301426 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5301327  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgct-----acaagacaagacaaca 404  Q
    || ||||   ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     ||||||||||||||||    
T  5301326 cacttgtttctcgttaatagagctgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaagacaaca 5301227  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    || ||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5301226 gccatgccagcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatga 5301127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 22685909 - 22686298
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  22685909 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 22686007  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||  |  |||||  |||||    
T  22686008 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgtt 22686107  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22686108 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 22686207  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22686208 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 22686298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 35225860 - 35226381
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  35225860 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 35225958  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  35225959 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 35226058  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  35226059 catttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggat 35226157  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35226158 atatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaa 35226257  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35226258 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 35226357  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  35226358 cactggtggataatcaaaggattt 35226381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40514480 - 40513958
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  40514480 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 40514382  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  40514381 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 40514282  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40514281 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 40514183  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40514182 tatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 40514083  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40514082 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 40513983  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  40513982 tcactggtggataatcaaaggattt 40513958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39491404 - 39490919
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  39491404 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 39491306  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||                   |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  39491305 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcag-------------------aagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 39491226  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  39491225 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 39491126  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  39491125 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 39491026  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  39491025 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 39490926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 15739869 - 15740259
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  15739869 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattca 15739967  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  || ||    
T  15739968 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 15740067  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  15740068 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 15740167  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  15740168 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggattt 15740259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 15769029 - 15769419
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  15769029 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattca 15769127  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  || ||    
T  15769128 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 15769227  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  15769228 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 15769327  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  15769328 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggattt 15769419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 112 - 512
Target Start/End: Original strand, 106008 - 106405
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | |     
T  106008 tctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagagcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaattt 106105  T
Q  212 -aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
     ||||||||||  ||||  |||||||| || |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |    
T  106106 taaactgaagattcaaatgagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactggg 106204  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
     | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  106205 tacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagctctg 106304  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  106305 cctgtagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 106403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 37406559 - 37406935
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||  || | | ||||||||||  |||    
T  37406559 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaacatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 37406657  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | | ||| | | |||||||||||||    
T  37406658 agtagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca-------aacactgagtacttgtccttcgtta 37406750  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  37406751 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaat-tgttc 37406849  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37406850 cttcaagatgagaattaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 37406935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 17718820 - 17719210
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  17718820 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctt-tagtcaaactgaagattca 17718918  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || ||    
T  17718919 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatt 17719018  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  17719019 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 17719118  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17719119 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 17719210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 17729472 - 17729862
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  17729472 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctt-tagtcaaactgaagattca 17729570  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || ||    
T  17729571 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcatt 17729670  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  17729671 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 17729770  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17729771 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 17729862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 20624670 - 20625051
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  || | | ||||||| ||  |||    
T  20624670 tcatcagaagcagaagttcatcagaagcacaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaa 20624767  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | | |||||||||||||    
T  20624768 aggagcagtttttcgtttcaacctcatctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaggcactgggtacttgtccttcgtta 20624866  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  20624867 tcagagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaacagctatgcctgcagaa-atgttc 20624965  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20624966 cttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 20625051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 515
Target Start/End: Original strand, 36687602 - 36687987
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| | ||||||| | || ||||||||||||   |||    
T  36687602 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaacttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaa 36687698  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || ||||    
T  36687699 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 36687798  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  36687799 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 36687898  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36687899 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 36687987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 515
Target Start/End: Original strand, 36698168 - 36698553
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| | ||||||| | || ||||||||||||   |||    
T  36698168 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaacttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaa 36698264  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || ||||    
T  36698265 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 36698364  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  36698365 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 36698464  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36698465 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 36698553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 161 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21414521 - 21414197
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||  || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||     
T  21414521 tttcatcagaacctatatcatcaccagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga- 21414423  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21414422 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 21414323  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  21414322 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcctt 21414224  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21414223 caaaggactacacccaaatcaggcaaa 21414197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14447340 - 14446968
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  14447340 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tgtaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 14447242  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  14447241 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagta 14447142  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  14447141 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 14447042  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  14447041 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggattt 14446968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14457952 - 14457580
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  14457952 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tgtaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 14457854  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  14457853 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagta 14457754  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  14457753 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 14457654  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  14457653 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggattt 14457580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33952141 - 33951769
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  33952141 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 33952043  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  33952042 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 33951943  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  33951942 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcccgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 33951843  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  33951842 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 33951769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 31814951 - 31815316
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  31814951 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 31815049  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  31815050 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 31815148  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  31815149 caaactgaagattcaaagtagttgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 31815248  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31815249 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 31815316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 127 - 410
Target Start/End: Original strand, 23392620 - 23392901
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||  | || ||||| | || | |||||||||||| ||||    
T  23392620 tcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgtaatcatcaccagaagtttcaattgattcgtaaattcaaactgaagatccaa 23392718  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  23392719 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaaaggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 23392818  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392819 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 23392901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 515
Target Start/End: Original strand, 17607002 - 17607352
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  17607002 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 17607098  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17607099 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 17607198  T
Q  363 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  17607199 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttc 17607298  T
Q  462 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17607299 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 17607352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 515
Target Start/End: Original strand, 17617616 - 17617966
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  17617616 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 17617712  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17617713 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 17617812  T
Q  363 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  17617813 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttc 17617912  T
Q  462 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17617913 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 17617966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 515
Target Start/End: Original strand, 31348476 - 31348826
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  31348476 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 31348572  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31348573 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 31348672  T
Q  363 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  31348673 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttc 31348772  T
Q  462 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  31348773 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 31348826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 515
Target Start/End: Original strand, 31359090 - 31359440
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  31359090 tcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 31359186  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31359187 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 31359286  T
Q  363 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  31359287 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttc 31359386  T
Q  462 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  31359387 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 31359440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 20416786 - 20417188
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  20416786 aagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 20416883  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||  ||  |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20416884 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttctaatatcgtctaagaa-aacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagc 20416982  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20416983 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 20417081  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  20417082 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagagaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatctaaatcaggcaaaagattattggtggatga 20417180  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  20417181 tcaaagga 20417188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 249 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37729488 - 37729220
Alignment:
Q  249 cttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagt 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  37729488 cttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagt 37729389  T
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatt 446  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||    
T  37729388 gtacaaccactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatt 37729289  T
Q  447 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  37729288 tgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 37729220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 249 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37740804 - 37740536
Alignment:
Q  249 cttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagt 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  37740804 cttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagt 37740705  T
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatt 446  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||    
T  37740704 gtacaaccactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatt 37740605  T
Q  447 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  37740604 tgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 37740536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32754341 - 32753919
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32754341 aagtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagtccatcagaagcaacatttcatcagaagctgtatcatcaccagaag 32754242  T
Q  191 ctacatttgatcc--atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttct--catttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatc 286  Q
    ||||| ||||||   ||||  |  ||||||||   ||||| |||||||| |  | ||| | |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32754241 ctacagttgatcagaatattttataactgaagtttcaaaggagctgtttttttcgttttatcctcgtctgagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatc 32754143  T
Q  287 aacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacg 386  Q
    |||||||||||| | |||  ||     | ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32754142 aacggtcatttgaaaagcattggatgctcgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacg 32754044  T
Q  387 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 486  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  32754043 ctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggaaa 32753945  T
Q  487 aggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    | || || |||| |||||||||||||    
T  32753944 aagattaatggtagatgatcaaagga 32753919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 20167950 - 20168351
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||      
T  20167950 aagtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaa-gtcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatcatcaccagaagttatagttgttcag 20168045  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     | | |||| |||||    ||||  |||||| |||  |  | |||||  ||||||| || ||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | ||    
T  20168046 aagattcaatctgaaatctcaaaagagctgtctcttgaagttaacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaag 20168144  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  20168145 cactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataac 20168243  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    |||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20168244 agctctgcctgcagaat-tgttccctcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatg 20168342  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  20168343 atcaaagga 20168351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13533967 - 13533785
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  13533967 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 13533869  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13533868 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 13533785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 36095755 - 36095936
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||    
T  36095755 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaat-tgttcct 36095853  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36095854 tcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 36095936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 36097212 - 36097393
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||    
T  36097212 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaat-tgttcct 36097310  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36097311 tcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 36097393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13523240 - 13523058
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  13523240 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 13523142  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13523141 tcaagataggaatgaatttgaagttgatctttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 13523058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 384 - 515
Target Start/End: Original strand, 31833641 - 31833772
Alignment:
Q  384 acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 483  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833641 acgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcagg 31833740  T
Q  484 caaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  31833741 caaaggatcactggtggataatcaaaggattt 31833772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 35543231 - 35543413
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  35543231 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcgacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 35543329  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  35543330 tcaagatatgaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattacttgtggatgatcaaagga 35543413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 428 - 515
Target Start/End: Original strand, 39364685 - 39364772
Alignment:
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39364685 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggattt 39364772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 40228710 - 40228553
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  40228710 agagctgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 40228612  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  40228611 tcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 40228553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23478421 - 23478262
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| |    
T  23478421 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaa-atgttc 23478323  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23478322 cttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacaaccaaatcaggcaaa 23478262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1915469 - 1915311
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  1915469 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacaactctgcctgcagaa-atgttcc 1915371  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1915370 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 1915311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 11208087 - 11208229
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||     
T  11208087 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaaaataagaatgg 11208185  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  11208186 atttgaacttaattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 11208229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13405167 - 13405010
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  13405167 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 13405069  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||  |||||| |||||||  | || |||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  13405068 tcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcattggacaacatccaaatcaggcaaa 13405010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 20215201 - 20215360
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  20215201 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttc 20215299  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20215300 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 20215360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 21519840 - 21520099
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  | ||||||||||||    
T  21519840 agtcaagtaatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaat-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgga-gtgcttctgaag 21519937  T
Q  119 tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||                ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21519938 tgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatc 21520037  T
Q  203 catatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaac 264  Q
    | || | | |||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  21520038 cgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaac 21520099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 487
Target Start/End: Original strand, 40032869 - 40033009
Alignment:
Q  346 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaat 445  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||    
T  40032869 agtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcttgcagaa-atgttccttcaagataggaatggat 40032967  T
Q  446 ttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  40032968 ttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 40033009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Original strand, 22685802 - 22685921
Alignment:
Q  36 aggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcaga 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22685802 aggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgctcctgaagagatgacgtcatcaga 22685900  T
Q  135 agcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22685901 agcagaaagtcatcagaagca 22685921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 15739684 - 15739815
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  15739684 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 15739782  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaag 143  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15739783 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaag 15739815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 15768844 - 15768975
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  15768844 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 15768942  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaag 143  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15768943 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaag 15768975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 23707176 - 23707306
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  23707176 caaaggctactcaagtcatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 23707274  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaa 142  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23707275 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaa 23707306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 21517507 - 21517639
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  | ||||||||||||    
T  21517507 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaat-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgga-gtgcttctgaag 21517604  T
Q  119 tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21517605 tgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaag 21517639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Original strand, 25111966 - 25112122
Alignment:
Q  332 gttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25111966 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcctt 25112064  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||  || |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  25112065 cataataggaatggatttgaatgtgatccttcataagacaacaaccaaatcaggcaaa 25112122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Original strand, 25171057 - 25171213
Alignment:
Q  332 gttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25171057 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcctt 25171155  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||  || |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  25171156 cataataggaatggatttgaatgtgatccttcataagacaacaaccaaatcaggcaaa 25171213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 31418417 - 31418493
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31418417 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaagaattctaagcatctgaagaaaa 31418493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 31448308 - 31448385
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31448308 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaaaaatggaaagc-aaaagaattctaagcatctgaagaaaac 31448385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 23392471 - 23392577
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  23392471 caaaggcaaatcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaaagtgc 23392569  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  23392570 ttctgaag 23392577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32160801 - 32160659
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| || | |  || ||||||     
T  32160801 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcccttagaataggaatgg 32160703  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  32160702 atttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 32160659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 8521613 - 8521691
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  8521613 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 8521691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30070411 - 30070333
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30070411 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttagaagaacaatgaaaagcaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 30070333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 4887057 - 4886985
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  4887057 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 4886985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33933302 - 33933230
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33933302 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 33933230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14447507 - 14447420
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14447507 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 14447420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14458119 - 14458032
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14458119 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 14458032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 17617467 - 17617554
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17617467 caaaagctactcaagttattttgataggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 17617554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 31348327 - 31348414
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31348327 caaaagctactcaagttattttgataggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 31348414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 31358941 - 31359028
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31358941 caaaagctactcaagttattttgataggtcctggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 31359028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33952308 - 33952221
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  33952308 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 33952221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1109634 - 1109556
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1109634 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 1109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17457817 - 17457740
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17457817 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 17457740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 19463727 - 19463804
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  19463727 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattctatgcatctgaagaaaac 19463804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 19477757 - 19477834
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  19477757 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattctatgcatctgaagaaaac 19477834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20550930 - 20550876
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  20550930 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 20550876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20551587 - 20551664
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20551587 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 20551664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 23406218 - 23406295
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23406218 caaaggcaaatcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 23406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 514
Target Start/End: Original strand, 23696988 - 23697074
Alignment:
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaa-ggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggatt 514  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23696988 tcaagatgggaaggaatttgaaggtttttctttaaaaggactccacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatt 23697074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 34062392 - 34062469
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34062392 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 34062469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 36084233 - 36084310
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36084233 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcgtagcatctgaagaaaac 36084310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37778835 - 37778653
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttc------- 103  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||           
T  37778835 caaaggctactcaagttattttgataagtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 37778736  T
Q  104 ---------aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat 178  Q
             ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  37778735 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc-aatattttcatcagaagcaatat 37778653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 43622359 - 43622282
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  43622359 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 43622282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13534204 - 13534143
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcat 166  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13534204 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcttcat 13534143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 22559250 - 22559388
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-----ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||     ||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  22559250 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacattggaaagaaaaaaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaag----- 22559344  T
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22559345 -------ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaa 22559388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 7745795 - 7745867
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7745795 aagtgtacaaccactacctccactactcggtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7745867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10848808 - 10848736
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10848808 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 10848736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11993923 - 11993851
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11993923 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctatgcctgca 11993851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14447394 - 14447346
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14447394 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 14447346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14458006 - 14457958
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458006 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 14457958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Original strand, 17606966 - 17607014
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17606966 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 17607014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 20562101 - 20562172
Alignment:
Q  17 ctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20562101 ctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 20562172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28139642 - 28139570
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  28139642 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 28139570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33952195 - 33952147
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33952195 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 33952147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13523477 - 13523422
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13523477 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 13523422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 15739834 - 15739881
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15739834 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 15739881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 15768994 - 15769041
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768994 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 15769041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 17606854 - 17606940
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17606854 caaaagctactcaagttattttgataggtcctggaagaacaatggaaag-aaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 17606940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 17718672 - 17718759
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17718672 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 17718759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 17718785 - 17718832
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718785 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 17718832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 17729324 - 17729411
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17729324 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 17729411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 17729437 - 17729484
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17729437 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 17729484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 35542977 - 35543032
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35542977 aagtgcctctgaagttatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 35543032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9089004 - 9088950
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9089004 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 14086641 - 14086695
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14086641 aagtgtacaaccgctacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 14086695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17447201 - 17447124
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17447201 caaaagctcgtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 17447124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24983926 - 24983849
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24983926 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 24983849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33022699 - 33022645
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  33022699 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 33022645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 34051731 - 34051808
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34051731 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagag-taaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 34051808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Original strand, 36095520 - 36095573
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36095520 agtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa-gtcatcagaagcaaagtt 36095573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Original strand, 36096977 - 36097030
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36096977 agtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa-gtcatcagaagcaaagtt 36097030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 36228511 - 36228588
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  36228511 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagc-aaaggaattcgaagcatctgtagaaaac 36228588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36583013 - 36582935
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  36583013 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 36582935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36593568 - 36593490
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  36593568 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 36593490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17447092 - 17447055
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17447092 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 17447055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17457708 - 17457671
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457708 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 17457671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24588578 - 24588501
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||    
T  24588578 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaa 24588501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24926628 - 24926552
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  24926628 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaa 24926552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 30115713 - 30115778
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  30115713 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtttgaagtgctcctgaagtgatgacgtcattagaagca 30115778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 30115942 - 30116011
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30115942 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 30116011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 35932108 - 35932161
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  35932108 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 35932161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15517004 - 15516933
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15517004 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 15516933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 25096928 - 25096999
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25096928 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaagaataacagctatgcctgca 25096999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 25154898 - 25154969
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25154898 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaagaataacagctatgcctgca 25154969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30070301 - 30070265
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30070301 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 30070265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 23391481 - 23391516
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23391481 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 23391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 36687452 - 36687539
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36687452 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatgaaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 36687539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 36698018 - 36698105
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36698018 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatgaaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 36698105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 13545614 - 13545668
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  13545614 aagtgtacaaccaccacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 13545668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21706464 - 21706387
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  21706464 caaaagctagtcaagtaatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaaga-aatttgaagcatctgaagaaaac 21706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28139886 - 28139825
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28139886 aagcatctgaagaaaactgctcctgaagat-aaactgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 28139825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 29138508 - 29138562
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  29138508 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaaga 29138562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30743015 - 30742962
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  30743015 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 30742962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31117912 - 31117858
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  31117912 aagtgtacatccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 31117858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 35931881 - 35931915
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35931881 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 35931915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 35986093 - 35986127
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35986093 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 35986127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 42243715 - 42243662
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  42243715 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 42243662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 642561 - 642594
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  642561 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 642594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24983817 - 24983780
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983817 aaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 24983780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Original strand, 35543064 - 35543105
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35543064 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 35543105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Original strand, 89303 - 89339
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  89303 tcaaagtgctactgaagtgatgacgtcatcagaagca 89339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 89524 - 89596
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  89524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 89596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 20562205 - 20562241
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562205 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 20562241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 23413076 - 23413148
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  23413076 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaaaataacagctatgcctgca 23413148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #215
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26759184 - 26759113
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  26759184 aagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 26759113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #216
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26765533 - 26765462
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  26765533 aagtgtacaaccactgcctccactactctg-ttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 26765462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #217
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 35986334 - 35986406
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  35986334 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 35986406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5430154 - 5430119
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5430154 caaagtgcttctgaagtggtgacgtcatcagaagca 5430119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Original strand, 19477867 - 19477902
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19477867 agtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 19477902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21660489 - 21660454
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21660489 caaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagca 21660454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Original strand, 23392582 - 23392617
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392582 agtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 23392617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 399
Target Start/End: Original strand, 25930261 - 25930312
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25930261 tgtacaaccactatctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 25930312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 28464216 - 28464251
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28464216 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 28464251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Original strand, 37406521 - 37406556
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37406521 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 37406556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 3245543 - 3245597
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  3245543 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctactacaagacaaga 3245597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4887291 - 4887257
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4887291 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 4887257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 14086382 - 14086439
Alignment:
Q  80 tgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14086382 tgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtgatgatgtcatcagaagca 14086439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16607552 - 16607518
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16607552 agtacaagtgtacaaccactatctccactactctg 16607518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 25096661 - 25096695
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25096661 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 25096695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 25154631 - 25154665
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25154631 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 25154665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 25930047 - 25930081
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25930047 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcaccagaagc 25930081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26784389 - 26784335
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||    
T  26784389 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtgtctgctacaagacaaga 26784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37778653 - 37778568
Alignment:
Q  160 ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttca 246  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||    
T  37778653 ttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattca 37778568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 414
Target Start/End: Original strand, 41566536 - 41566606
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctg 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  41566536 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctg 41566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13534134 - 13534093
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13534134 tttcatcataagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 13534093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 19463843 - 19463872
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19463843 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 19463872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 136
Target Start/End: Original strand, 19536153 - 19536186
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19536153 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaag 19536186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20551162 - 20551129
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20551162 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 20551129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 21099558 - 21099591
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21099558 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 21099591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 21099806 - 21099843
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21099806 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtc 21099843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21660247 - 21660194
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  21660247 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 21660194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #242
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 23412843 - 23412876
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23412843 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 23412876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #243
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 28464441 - 28464478
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28464441 aagtgtacaaccactatctctactactctgtttttgtc 28464478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #244
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 29138231 - 29138295
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29138231 aagcgtctgaagaaaactgttcctgaaga-caaagtgctcctgtagtgatgacgtcatcagaagca 29138295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #245
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 9398836 - 9398908
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9398836 aagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 9398908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #246
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 19536403 - 19536475
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19536403 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 19536475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #247
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 20624631 - 20624667
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20624631 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 20624667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #248
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 21199105 - 21199177
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   |||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  21199105 aagtgtacaatcactacctccactactcagtttgtgtctctgctactggacaaggataacagctatgcctgca 21199177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #249
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21910591 - 21910539
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||    
T  21910591 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaa 21910539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #250
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 26119927 - 26119959
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26119927 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 26119959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #251
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33022958 - 33022899
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33022958 tctgaaaaaaactgctcctgaaga-caaagtgcttttgaagtggtgacgtcatcagaagca 33022899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3346 - 2845
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  3346 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctaaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 3249  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |    
T  3248 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaggtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattaatccatatatt 3149  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3148 caaactgaaggtccaaagtagctgtttctcatttcaacctaatctaagaagaacgaagaagtgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctcttag 3049  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3048 catttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccaatacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 2950  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2949 cctgcagaatttgtgccctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 2850  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  2849 gattt 2845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 207)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26044712 - 26044228
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26044712 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgc 26044613  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                   |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  26044612 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcag-------------------aagctatatcatcaccagaagctacatttaatccctatatt 26044532  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26044531 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgag 26044432  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044431 cagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ctttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 26044333  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26044332 cctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaatgatcaaag 26044233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 499
Target Start/End: Original strand, 28251243 - 28251730
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28251243 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaatagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcagagtgc 28251341  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || |||||||||| | ||    
T  28251342 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatcctt-ta 28251440  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28251441 atcaaactgaagatttaaagtagctggttctccattcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctg 28251540  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
      || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251541 aacatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 28251639  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28251640 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 28251730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25788234 - 25787716
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  25788234 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaag-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 25788136  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  25788135 ttctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 25788037  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788036 catttaatccgtatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 25787937  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25787936 atttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaag 25787838  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25787837 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 25787738  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25787737 ctggtgaatgatcaaaggattt 25787716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12828226 - 12827707
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  12828226 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaag-gaatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 12828128  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||| |||    
T  12828127 ttctgaagctgaagtgcctctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcataagcgtaatcatcaccagaagcta 12828029  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12828028 catttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 12827929  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827928 atttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 12827829  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12827828 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 12827729  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  12827728 ctggtgaatgatcaaaggattt 12827707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 20029677 - 20030084
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  20029677 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 20029775  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029776 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 20029875  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029876 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 20029974  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20029975 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 20030074  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  20030075 tcaaaggatt 20030084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 20062428 - 20062835
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  20062428 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 20062526  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062527 taaaatcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 20062626  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062627 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 20062725  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20062726 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 20062825  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  20062826 tcaaaggatt 20062835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 7375531 - 7375938
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  7375531 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcattagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 7375629  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375630 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 7375729  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375730 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 7375828  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7375829 gctatgccagcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 7375928  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  7375929 tcaaaggatt 7375938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9122811 - 9123314
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9122811 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9122909  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9122910 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9123008  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||| |    
T  9123009 caaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgag 9123108  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9123109 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 9123208  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9123209 gcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 9123308  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9123309 ggattt 9123314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 7750914 - 7751414
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  7750914 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattctaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgc 7751012  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||  |  |||| ||||||||| || |||||||||| |  |    
T  7751013 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggtttt-catcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaa 7751111  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  7751112 -tcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactg 7751210  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  7751211 agcacttgtctctctttactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagcct 7751310  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  7751311 tgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgattaa 7751410  T
Q  509 agga 512  Q
    ||||    
T  7751411 agga 7751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 11147044 - 11147431
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||||| | |||| || | |||||||||||| ||||    
T  11147044 tcatcagatgcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcaacaccagaagctacatataatccgtaaattcaaactgaagatccaa 11147142  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  11147143 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 11147242  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11147243 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 11147342  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11147343 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 11147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9112174 - 9112677
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9112174 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9112272  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9112273 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9112371  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||| |    
T  9112372 caaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgag 9112471  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9112472 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 9112571  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9112572 gcctgcaaaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 9112671  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9112672 ggattt 9112677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12855538 - 12855035
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12855538 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12855440  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12855439 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12855341  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12855340 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12855241  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12855240 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12855141  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12855140 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12855041  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12855040 ggattt 12855035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 31542577 - 31543080
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  31542577 caaagactactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 31542675  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  31542676 ttctgaagtaatgaagtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaacagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 31542774  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  31542775 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 31542874  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31542875 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 31542974  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31542975 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 31543074  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  31543075 ggattt 31543080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 17984388 - 17984892
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  17984388 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 17984486  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  17984487 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 17984585  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  17984586 tcaaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 17984685  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  17984686 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 17984785  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  17984786 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 17984885  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  17984886 aggattt 17984892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3661899 - 3661397
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  3661899 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 3661801  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  3661800 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 3661702  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  3661701 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 3661602  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3661601 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 3661502  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  3661501 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 3661403  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  3661402 ggattt 3661397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3672563 - 3672061
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  3672563 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 3672465  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  3672464 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 3672366  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  3672365 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 3672266  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3672265 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 3672166  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  3672165 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 3672067  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  3672066 ggattt 3672061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12866064 - 12865561
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12866064 caaagactactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12865966  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12865965 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12865867  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12865866 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12865767  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12865766 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12865667  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12865666 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12865567  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12865566 ggattt 12865561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25986483 - 25986096
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||    
T  25986483 gtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaatatcttcacaagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagatcca 25986386  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  25986385 aagtagctggttctcaattcggtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatatgaatagcactgagcatttgtccttcgtt 25986286  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25986285 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 25986186  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25986185 ccttcaagatgggaataaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 25986096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 34806839 - 34807342
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  34806839 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 34806937  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  34806938 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 34807036  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  34807037 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 34807136  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  34807137 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccat 34807236  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  34807237 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 34807336  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  34807337 ggattt 34807342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 36 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13913538 - 13913067
Alignment:
Q  36 aggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13913538 aggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-agagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaa 13913441  T
Q  136 gcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgt 235  Q
    ||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||| |||  ||||||||||||    
T  13913440 gcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactggagattcaaagtagctgt 13913343  T
Q  236 ttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttg 335  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  13913342 ttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgataacagagttg 13913243  T
Q  336 actaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagat 435  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13913242 acaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagat 13913144  T
Q  436 gggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13913143 gggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 13913067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33199844 - 33199342
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  33199844 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 33199746  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  33199745 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 33199647  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| |    
T  33199646 caaactgaagattcaa-gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgag 33199548  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  33199547 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 33199448  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  33199447 gcctgcagaatttgtacattcaagataggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 33199348  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  33199347 ggattt 33199342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 34817471 - 34817974
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  34817471 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 34817569  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  34817570 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 34817668  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  34817669 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 34817768  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  34817769 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccat 34817868  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  34817869 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 34817968  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  34817969 ggattt 34817974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26025976 - 26025473
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  26025976 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 26025878  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  26025877 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taat 26025779  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  26025778 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 26025679  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26025678 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 26025579  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26025578 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 26025479  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  26025478 ggattt 26025473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26036550 - 26036047
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  26036550 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaataatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 26036452  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  26036451 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taat 26036353  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  26036352 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcaatcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 26036253  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26036252 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 26036153  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26036152 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 26036053  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  26036052 ggattt 26036047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 32961608 - 32962111
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  32961608 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 32961706  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  32961707 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 32961805  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  32961806 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 32961905  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32961906 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccat 32962005  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32962006 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 32962105  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  32962106 ggattt 32962111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27384950 - 27384447
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27384950 caaagtctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattccaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgc 27384852  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||  |  |||| ||||||||| || |||||||||| |  |    
T  27384851 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggtttt-catcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaa 27384753  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||| |||    
T  27384752 -tcaaactgaagattcaaagtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactg 27384654  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||      
T  27384653 agcacttgtctctctttactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagcct 27384554  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27384553 tgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaa 27384454  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  27384453 aggattt 27384447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27475363 - 27474860
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27475363 caaagtctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattccaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgc 27475265  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||  |  |||| ||||||||| || |||||||||| |  |    
T  27475264 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggtttt-catcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaa 27475166  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||| |||    
T  27475165 -tcaaactgaagattcaaagtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactg 27475067  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||      
T  27475066 agcacttgtctctctttactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagcct 27474967  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27474966 tgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaa 27474867  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  27474866 aggattt 27474860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27504862 - 27504359
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27504862 caaagtctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaattccaagcatctgaagaaaatcgctcctgaagttcagagtgc 27504764  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||  ||||||||| || |||||||||| |  |    
T  27504763 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaggatcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaatattttcaccagaagctgcatttgatccctcaa 27504665  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||| |||    
T  27504664 -tcaaactgaagattcaaagtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactg 27504566  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||      
T  27504565 agcacttgtctctctttactagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagcct 27504466  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27504465 tgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgattttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaa 27504366  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  27504365 aggattt 27504359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16960138 - 16959636
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16960138 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16960040  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  16960039 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 16959941  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  16959940 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 16959841  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16959840 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtgcaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 16959741  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16959740 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 16959642  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  16959641 ggattt 16959636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26865305 - 26864802
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  26865305 caaaggttactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 26865207  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  26865206 tcctgaagagatgacgtcatcagaagtagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 26865108  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  26865107 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 26865008  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26865007 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 26864908  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  26864907 gcctgcagattttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaa 26864808  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  26864807 ggattt 26864802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26875929 - 26875426
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  26875929 caaaggctactcaagttatttcaataggtctttgaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 26875831  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  26875830 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 26875732  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  26875731 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 26875632  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26875631 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 26875532  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  26875531 gcctgcagattttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaa 26875432  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  26875431 ggattt 26875426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27342211 - 27341708
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  27342211 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 27342113  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  27342112 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-tagt 27342014  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27342013 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27341914  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27341913 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27341814  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27341813 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27341714  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27341713 ggattt 27341708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27402951 - 27402448
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  27402951 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 27402853  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  27402852 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-tagt 27402754  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27402753 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27402654  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27402653 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27402554  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27402553 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27402454  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27402453 ggattt 27402448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27413610 - 27413107
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  27413610 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 27413512  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  27413511 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-tagt 27413413  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  27413412 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 27413313  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27413312 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 27413213  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27413212 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 27413113  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  27413112 ggattt 27413107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 32972227 - 32972730
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  32972227 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 32972325  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||| | || |    
T  32972326 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccaaaagctacgtttgatcctt-taat 32972424  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  32972425 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 32972524  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32972525 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccat 32972624  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32972625 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 32972724  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  32972725 ggattt 32972730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29385267 - 29384766
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||||    
T  29385267 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgct 29385169  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | | || ||    
T  29385168 cctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaaacaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgattctt-taatc 29385070  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  29385069 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 29384970  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
      |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  29384969 tcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 29384870  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  29384869 cctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaag 29384771  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  29384770 gattt 29384766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 18925556 - 18925941
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||| |||  |||    
T  18925556 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 18925655  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||  | | |||||||||||||    
T  18925656 agtagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacacttagtacttgtccttcgtta 18925755  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||     
T  18925756 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgtt 18925854  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18925855 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 18925941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 151 - 499
Target Start/End: Original strand, 28356529 - 28356877
Alignment:
Q  151 aagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaac 248  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||   |||||||||| |||||  |||| |    
T  28356529 aagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatcctt-taatcaaactgaagatttaaagtagctggttctccattcagc 28356627  T
Q  249 cttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28356628 cttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaacatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagt 28356727  T
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttg 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356728 gtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttg 28356826  T
Q  449 aagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtg 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28356827 aagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 28356877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 163 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27506309 - 27505956
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27506309 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctt-taatcaaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27506211  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27506210 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27506111  T
Q  363 tccactactctgttttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27506110 tccactactctgtttttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattctt 27506011  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27506010 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggattt 27505956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27373315 - 27372846
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  27373315 atcaaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagc-aaaagaattccaagcatctgaagaaaac------------------t 27373235  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||                   ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||    
T  27373234 gcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagca-------------------atatcttcaccagaagctatatttgatcc-ttta 27373155  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||    
T  27373154 atcaaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactg 27373055  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--tttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
     ||| |||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27373054 agcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagc 27372955  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27372954 catgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatc 27372855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27463665 - 27463196
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  27463665 atcaaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagc-aaaagaattccaagcatctgaagaaaac------------------t 27463585  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||                   ||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||    
T  27463584 gcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagca-------------------atatcttcaccagaagctatatttgatcc-ttta 27463505  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||    
T  27463504 atcaaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactg 27463405  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg--tttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
     ||| |||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27463404 agcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagc 27463305  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27463304 catgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatc 27463205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8654063 - 8653678
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc-tatatcatcaccagaatctacatttgatccat-atactcaaactgaagaacc 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||  |||||||||||  | | | ||||||||||||  |    
T  8654063 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattc 8653965  T
Q  225 aaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||   | |||||||||||    
T  8653964 aaagtagctgtttctcatttcaacctcgactaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgaatacttgtccttcgt 8653865  T
Q  325 taacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8653864 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaaagctatgcctgtagaa-atgt 8653766  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8653765 tccttcaaaacgggaatgaatttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaagga 8653678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 31982288 - 31982808
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  31982288 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 31982386  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  31982387 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta 31982486  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  31982487 catttgatcctt-tagtcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggat 31982585  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31982586 atatggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaa 31982685  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31982686 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 31982785  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  31982786 actggtggataatcaaaggattt 31982808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 18834409 - 18834812
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||      
T  18834409 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcag 18834506  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  18834507 taaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaac 18834605  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18834606 actgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 18834705  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18834706 gctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttttcccaaatcaggcaaaagattactggtggatga 18834804  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  18834805 tcaaagga 18834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 17982199 - 17982683
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  17982199 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 17982297  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  17982298 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 17982396  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||                    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  17982397 tcaaactgaagattcaaagt--------------------ttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 17982476  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  17982477 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 17982576  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  17982577 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcagaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 17982676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16930950 - 16930465
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16930950 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16930852  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||                |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  16930851 ttctgaagagatgacgtcatcagaagca----------------aaagtttt-catcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 16930770  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  16930769 caaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 16930670  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16930669 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 16930570  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16930569 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 16930471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4631403 - 4630887
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttc------- 103  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||           
T  4631403 caaaagctactcaagttattttgataggtcctggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 4631304  T
Q  104 ---------aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
             ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||      
T  4631303 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct-- 4631206  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4631205 atttgatcc-tttaatcaaactgaaga--gaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggata 4631109  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaag 393  Q
    | |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4631108 tatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaag 4631009  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4631008 acaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatca 4630909  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  4630908 ctggtggataatcaaaggattt 4630887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 18826035 - 18826416
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  18826035 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 18826132  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| | | || ||||||||||    
T  18826133 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttatccttcgtta 18826231  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  18826232 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttc 18826330  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18826331 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactttacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 18826416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 104 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5845524 - 5845102
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||     
T  5845524 aaagtgattctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgatca 5845427  T
Q  204 atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     || | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5845426 gtaaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctgagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagag 5845327  T
Q  304 ctctgt-----------------gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacg 386  Q
    | | ||                 | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5845326 cacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacg 5845227  T
Q  387 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5845226 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagga-atgttcattcaagatgggaatgaatttgaagccgattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaa 5845128  T
Q  487 aggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  5845127 aggattactggtggatgatcaaagga 5845102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29765934 - 29765553
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||   || | | ||||||||||  |||    
T  29765934 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagctataccatcaccagaagctacaagtgattagtaaatttaaactgaagattcaa 29765837  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |  |||||||| || ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| | | |||||||||||||    
T  29765836 aagagctgtttttcgtttcaacatcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttgtccttcgtta 29765738  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  29765737 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctatcagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttc 29765639  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29765638 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29765553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31572920 - 31572432
Alignment:
Q  36 aggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||| |   |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31572920 aggtcttggaagaacaatggagagcaaaagaaatccaaagcatctgaagaaaactgtgtctgaagct-aaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaa 31572822  T
Q  136 gcagaaagtcatcagaagca-aagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaag 220  Q
    | ||||  |||||||||||| |||||              ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||| | |    
T  31572821 gtagaagttcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatcagtaaatttaaactaacg 31572722  T
Q  221 aaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtcct 320  Q
    |  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| | | |||||||    
T  31572721 attcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttgaaaagcactgagtatttgtcct 31572623  T
Q  321 tcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 420  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||     
T  31572622 tcgttatcagagttgacaaactacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacgaccatgcctgcagaa- 31572524  T
Q  421 atgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31572523 atgttctatcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 31572432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4293125 - 4292744
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  || | | ||||||||||  |||    
T  4293125 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcaca--ttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 4293028  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||| ||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||   | ||||||||| | |    
T  4293027 aggagctatttttcgtttcaacctcatctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttca 4292929  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  4292928 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaggacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 4292830  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4292829 cttcaagatgggaatgaatttgaagctgatccttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaagga 4292744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 515
Target Start/End: Original strand, 32300842 - 32301225
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||   |||    
T  32300842 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaa 32300936  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || ||||    
T  32300937 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 32301036  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  32301037 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 32301136  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  32301137 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 32301225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 515
Target Start/End: Original strand, 32311531 - 32311914
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||   |||    
T  32311531 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctt-taatcaaactgaagag--aaa 32311625  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    || |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||  || ||||    
T  32311626 gttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaa 32311725  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  32311726 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 32311825  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  32311826 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 32311914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 167 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6158569 - 6158316
Alignment:
Q  167 cagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacga 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6158569 cagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatttaaactgaagatccaaagtagttgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacga 6158470  T
Q  267 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctcca 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158469 agaattgaaagggaggtaacaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccctcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 6158370  T
Q  367 ctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158369 ctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 6158316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 145 - 512
Target Start/End: Original strand, 16123350 - 16123715
Alignment:
Q  145 catcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcattt 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  |  | | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  16123350 catcagaagcaaagttt--catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagttaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctctttt 16123447  T
Q  245 caaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaa-gta 343  Q
     |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16123448 taacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagta 16123547  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||||||| | |||||    
T  16123548 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatccatgccttcataa-atgttccttcaagattgtaatga 16123646  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16123647 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaagtattactggtggatgatcaaagga 16123715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 127 - 510
Target Start/End: Original strand, 27166240 - 27166619
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  27166240 tcatcagaagcagaagactatcagaagcaaggttt--catcagaagttatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 27166337  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || || ||||| || ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |||    
T  27166338 aggagttgtttttcgtttcaacatcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgtgtacttgtccttcatta 27166436  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  27166437 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactacactgttcttgtccacgctacaagacaagacaacggctctgcctgcagaat-tgttc 27166535  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27166536 cttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 27166619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 12716645 - 12717017
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  12716645 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatttttaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 12716743  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  12716744 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctctttaatagagttgacaaagta 12716843  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  12716844 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 12716943  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  12716944 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 12717017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 12727294 - 12727666
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  12727294 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatttttaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 12727392  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  12727393 tcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctctttaatagagttgacaaagta 12727492  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  12727493 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 12727592  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  12727593 gaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 12727666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 9933468 - 9933849
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||||||   |||    
T  9933468 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagtttcaa 9933565  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  9933566 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 9933664  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |    
T  9933665 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttctgtctatgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttc 9933763  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9933764 cttcaagataggaaggaatttgaagttgatccttcataggactacaccaaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 9933849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Original strand, 17745562 - 17745960
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||  |  | | ||||||||||  ||||    
T  17745562 catcagaagcagaagaccatcagaagcaa--tatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgttcagttaatttaaactgaagattcaaa 17745659  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg-----------------tcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||| | ||| ||| |    
T  17745660 gtagctgtttctcatttcaacctcgtccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcacggtcatttgaagagcactgag 17745759  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
     | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17745760 tacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtagaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctg 17745859  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| || |||||||    
T  17745860 cctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaatcattactggtgaataatcaaag 17745958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 112 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17043036 - 17042639
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |    ||    
T  17043036 tctgaagttgtgacgtcatcagaagctagaagacatcagaagcaagatat--catcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgatcagttgtttc 17042939  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||| ||||   |||| |||||||| ||  |||  |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| |     
T  17042938 aaactaaagatttaaaggagctgtttttcggttcgtcctcgtcta-gaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggt 17042840  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 411  Q
    | ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17042839 acttgtctttcgttttcagcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgc 17042740  T
Q  412 ctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17042739 ctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaatacttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 17042640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22309189 - 22308808
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatc-accagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  | |||  || | | ||||||| ||  |||    
T  22309189 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagttatatcatccaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaa 22309092  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||| | | |||| ||||||||    
T  22309091 aggagctgtttttcgtttcaaccttgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgttcttcgtta 22308993  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |    
T  22308992 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagctctacctgtagaa-atattc 22308894  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22308893 cttcaagatgggaatgaatttgaaattgattcctcaaaggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaagga 22308808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 257 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17064467 - 17064212
Alignment:
Q  257 agaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaacc 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| | | ||||| ||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  17064467 agaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggtacttgtctttcattttcagcgttgacaaagtacaagtgtacaaca 17064368  T
Q  357 actacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 456  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17064367 actacctccactactatgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaat 17064268  T
Q  457 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17064267 acttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 17064212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25519086 - 25518708
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  25519086 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 25518989  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | ||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || | ||| ||| |   ||||||||| || |    
T  25518988 ggagctgtttctcgttttaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaaaggag-tatcaacggtcatctgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga 25518891  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||    
T  25518890 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgttacaagacaagacaacagctctgcctccagaa-atgttcc 25518793  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25518792 ttcaagacaggaatgaatttgaagttgatccttcatagcacaacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 25518708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13928699 - 13928341
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||   ||||||||||||||||| ||   ||| | | ||||||||||    
T  13928699 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatctgaagcatctgaagaaaactgcgtttgaagct-aaagtgcttc 13928602  T
Q  114 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||  || | | ||    
T  13928601 tgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt--catcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgatcagtaaatttaa 13928504  T
Q  214 actgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcag 313  Q
    |||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |     
T  13928503 actggagattcaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtac 13928404  T
Q  314 ttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13928403 ttgtccttcgataacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtt 13928341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 17741532 - 17741880
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||     
T  17741532 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaaga- 17741630  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |   |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17741631 gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacaatcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctaa-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 17741729  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  17741730 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaatacaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctt 17741828  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  17741829 cataggactacacccaaatcaagcataagattactggtgtatgatcaaagga 17741880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 161 - 508
Target Start/End: Original strand, 25686577 - 25686923
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |  |||||||||   ||| | ||||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  25686577 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttcaatgaagctgtttctcgtttcaacctcgtctaa-a 25686675  T
Q  260 agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata-gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25686676 agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 25686774  T
Q  359 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 458  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  25686775 tacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 25686873  T
Q  459 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  25686874 ttcataggacaacatccaaatcaagaaaaagattactggtggatgatcaa 25686923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 9304 - 9580
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  9304 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagtgc 9402  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  9403 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 9501  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaac 289  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9502 caaactgaagatccaaagtagttgtttctcgtttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaac 9580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 161 - 508
Target Start/End: Original strand, 25735385 - 25735732
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc--aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaag 258  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||  | || |   |||||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  25735385 tttcatcagaagttgtatcatcagcagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagtttcaaagaagctgtttctcgtgtcaacctcgtctaag 25735484  T
Q  259 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata-gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaacca 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25735485 a-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaacca 25735582  T
Q  358 ctacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  25735583 ctacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatc 25735681  T
Q  458 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25735682 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatcaa 25735732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 25675601 - 25675196
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagt--------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaa 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||               |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25675601 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttcatcagaagatctatcatcaccagaa 25675502  T
Q  190 tctacatttgatccat--atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatca 287  Q
     ||||||||||||  |  ||  | |||||||||   ||||| || |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25675501 gctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttcaaagaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaaggaaggtatca 25675403  T
Q  288 acggtcatttg-gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacg 386  Q
    |||||||||||  | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25675402 acggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacg 25675304  T
Q  387 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  25675303 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 25675205  T
Q  487 aggactact 495  Q
    |||| ||||    
T  25675204 aggattact 25675196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 25679677 - 25679259
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagt--------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaa 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||               |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25679677 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcagaagtctatcagaagcaacatttcatcagaagatctatcatcaccagaa 25679578  T
Q  190 tctacatttgatccat--atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatca 287  Q
     ||||||||||||  |  ||  | |||||||||   ||||| || |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25679577 gctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttcaaagaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaaggtaggtatca 25679479  T
Q  288 acggtcatttg-gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacg 386  Q
    |||||||||||  | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25679478 acggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacg 25679380  T
Q  387 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 486  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  25679379 ctacaagacaagacatcagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 25679281  T
Q  487 aggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||| |||| || |||||||||    
T  25679280 aggattactagtagatgatcaa 25679259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 161 - 435
Target Start/End: Original strand, 25722785 - 25723059
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc--aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaag 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || |   |||||||||   ||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  25722785 tttcatcagaagctgtatcatcaccagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagttgcaaagaagctgtttctcctgtcaacctcgtctaag 25722884  T
Q  259 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata-gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaacca 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| | | ||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  25722885 a-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtacttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaacta 25722982  T
Q  358 ctacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25722983 ctacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagat 25723059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 32761730 - 32761894
Alignment:
Q  130 tcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagt 229  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||    
T  32761730 tcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 32761828  T
Q  230 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32761829 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 32761894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 19289156 - 19289558
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  19289156 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaaaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 19289252  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     | | |||| |||||    ||||  |||||| |||  |  | |||||   |||||| || ||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||| | ||    
T  19289253 aagattcaatctgaaatctcaaaagagctgtctcttgaagttaacctcgcctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaag 19289351  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  19289352 cactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataac 19289450  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  19289451 agctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagtcgatccttcataggactacatccaaatcagacaaaagattactggtggatg 19289549  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  19289550 atcaaagga 19289558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 10971206 - 10971395
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  10971206 caaaggccagtcaagtaatttcaacaggtcttgatagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 10971303  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10971304 ttctgaagtgatgacgtcattagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc 10971395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 12953126 - 12953308
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  12953126 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaatacaagataacagctctgcctgtagaat-tgttcct 12953224  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12953225 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 12953308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18498820 - 18498638
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  18498820 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 18498722  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||  |||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  18498721 tcaagataagaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcagacaaaagattactggtggatgatcaaagga 18498638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31931623 - 31931441
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||| |||    
T  31931623 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacaactctgcctgcagaat-tgttcct 31931525  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  31931524 tcaagttaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatgatcaaagga 31931441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11206146 - 11205965
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  11206146 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctatgctacaacacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 11206048  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| || || | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11206047 tcaagataggaatggatttgaacttgatttttcatagtacaatatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 11205965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18555470 - 18555288
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  18555470 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccc 18555372  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||    
T  18555371 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggcaaaagtttactcgtggatgatctaagga 18555288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 329 - 486
Target Start/End: Original strand, 7586252 - 7586408
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  7586252 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 7586350  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 486  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  7586351 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 7586408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 11235699 - 11235521
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  11235699 agagttgacaaattacaagtgtacaaccactacctccactattctacttttgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 11235601  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | ||| |||| ||||| | | |||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  11235600 tcaagataggaatggatttgaacttgatttttcataggacaatatccaaatcaggcaaaagattacaggtggatgatcaa 11235521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Original strand, 16122894 - 16123180
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  ||  |||| | | ||||||||||    
T  16122894 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaag-gaatccaaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagct-aaagtgcttc 16122991  T
Q  114 tgaagtga-tgacgtcatcagaagc-----agaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||||| | |||| |||||||||||     ||||   |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  ||     
T  16122992 tgaagtaaatgacatcatcagaagctcatcagaagcccatcagaagcaaagttt--catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaa 16123089  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    | | |||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16123090 atttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgttttaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttg 16123180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 17608401 - 17608558
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  17608401 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttg-ttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 17608498  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17608499 ttcaagataggaatgaatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 17608558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 281
Target Start/End: Original strand, 17577591 - 17577744
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||| |||  |||    
T  17577591 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 17577689  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggag 281  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577690 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggag 17577744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21128281 - 21128124
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||    
T  21128281 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacatctctgcctgcagaa-atgttcct 21128183  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||| |||||| |||||||    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  21128182 tcaagataggaatggatttgaatgcgattcttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 21128124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20635775 - 20635616
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||| |    
T  20635775 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagca-atgttc 20635677  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20635676 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 20635616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17047755 - 17047597
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-ctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||    
T  17047755 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatt-tgttcc 17047657  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17047656 ttcaagataggaatgaattttaagttaattctttaaaggactacatccaaatcaggcaaa 17047597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25800860 - 25800717
Alignment:
Q  18 tagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaa-gcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctga 116  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||    
T  25800860 tagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaat-gaattcgaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctga 25800763  T
Q  117 agtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25800762 agtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt 25800717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18726771 - 18726628
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||    
T  18726771 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-gaagtgc 18726673  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18726672 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagca 18726628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22386858 - 22386699
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||| |    
T  22386858 agagttgacaaagtaccaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagta-atgttc 22386760  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||||   |||| |||| ||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22386759 cttcaagatattaatggattttaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 22386699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18555691 - 18555596
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18555691 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaa--atttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 18555596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Original strand, 26022882 - 26022975
Alignment:
Q  422 tgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26022882 tgtgccttcaaaatgggaatgaatttaaacctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaataatcaaaggattt 26022975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 10402764 - 10402870
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  10402764 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaagaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 10402862  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  10402863 ttctgaag 10402870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 487
Target Start/End: Original strand, 14051495 - 14051633
Alignment:
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaattt 447  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |  ||||| ||||    
T  14051495 gtacagccacttcctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgtttcttcaaattcagaatggattt 14051593  T
Q  448 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  14051594 gaaattaattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 14051633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18499041 - 18498953
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18499041 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaa--atttcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 18498953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29918056 - 29917933
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| | ||||  |||||||||     
T  29918056 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttcattcacaatgggaatgc 29917958  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggac 468  Q
    |||||||  | |||||||| |||||    
T  29917957 atttgaaattgattcttcataggac 29917933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 11146895 - 11147001
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  11146895 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagc-aaaagaattctaagcatttgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 11146993  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  11146994 ttctgaag 11147001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12382457 - 12382380
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12382457 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattctaagcatctgaagaaaac 12382380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27506423 - 27506346
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27506423 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaac 27506346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25986630 - 25986553
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25986630 aaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 25986553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Original strand, 30119908 - 30120016
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||| | | |||||    
T  30119908 atcaaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcgtagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagt 30120006  T
Q  109 gcttctgaag 118  Q
    ||||||||||    
T  30120007 gcttctgaag 30120016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 32761578 - 32761684
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  32761578 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtctttgaagaacaatggaaagcaaag-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 32761676  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  32761677 ttctgaag 32761684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15954742 - 15954619
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  15954742 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-atgatgttccttcacaatgggaatgc 15954644  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggac 468  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||    
T  15954643 atttgaaattaatccttcataggac 15954619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1905397 - 1905310
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  1905397 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 1905310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11049115 - 11049028
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  11049115 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 11049028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 487
Target Start/End: Original strand, 14070176 - 14070314
Alignment:
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaattt 447  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |  ||||| ||||    
T  14070176 gtacagccacttcctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgtttcttcaaattcagaatggattt 14070274  T
Q  448 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||  |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||    
T  14070275 gaaattaattcttcataggacatcatccaaatcagacaaa 14070314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 28573234 - 28573147
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  28573234 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 28573147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 7375421 - 7375498
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  7375421 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 7375498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9717882 - 9717777
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  9717882 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgatacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgg 9717784  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  9717783 atttgaa 9717777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32544304 - 32544199
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  32544304 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgg 32544206  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  32544205 atttgaa 32544199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 34451514 - 34451579
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34451514 aagcatctgaagagaagcgctcctgaagacaaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 34451579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16877252 - 16877180
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16877252 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgcctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16877180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 18925406 - 18925485
Alignment:
Q  9 atcaaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18925406 atcaaaagctagtcaaataatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 18925485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 22076517 - 22076589
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22076517 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22076589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22802180 - 22802108
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22802180 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22802108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1905318 - 1905271
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1905318 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 1905271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 12716478 - 12716565
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  12716478 caaaggctactcaagttttttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 12716565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 12727127 - 12727214
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  12727127 caaaggctactcaagttttttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 12727214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21235164 - 21235058
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||    
T  21235164 aagtgtacaaccactacctccactactctgatatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgc-gaagatgttccttcacaatgggaatg 21235066  T
Q  443 aatttgaa 450  Q
     |||||||    
T  21235065 catttgaa 21235058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 22527816 - 22527903
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22527816 caaaagctattcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 22527903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 32300675 - 32300762
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  32300675 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 32300762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 32311364 - 32311451
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  32311364 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 32311451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 10547417 - 10547494
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10547417 caaaggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 10547494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12423300 - 12423246
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  12423300 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctccgctataagacaaga 12423246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19625852 - 19625814
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625852 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 19625814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 20488028 - 20488133
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  20488028 aagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtatctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgc 20488126  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  20488127 atttgaa 20488133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 20730814 - 20730868
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  20730814 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctcagctacaagacaaga 20730868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21625140 - 21625086
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21625140 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtccgtgctacaagacaaga 21625086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22309326 - 22309264
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22309326 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaaggaattcaaagcatctgaagaaaac 22309264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 19066128 - 19066181
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19066128 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 19066181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12349032 - 12348980
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  12349032 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtccctactacaagacaa 12348980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 12952889 - 12953000
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12952889 aagtgcctctgaagtgattacatcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaag 12952988  T
Q  191 ctacatttgatc 202  Q
    ||||| ||||||    
T  12952989 ctacagttgatc 12953000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13435571 - 13435499
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13435571 aagtgtacaaccactacctccactactctatatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 13435499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 416
Target Start/End: Original strand, 15531738 - 15531806
Alignment:
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15531738 gtacaaccactacctccactactctgtctttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 15531806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16336166 - 16336094
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16336166 aagtgtacaaccactatctacactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16336094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17381560 - 17381488
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17381560 aagtgtacaatcactacctccactattctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 17381488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18435595 - 18435523
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18435595 aagtgtacaaccactacctccagtacactgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 18435523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31931821 - 31931749
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31931821 tcatcagaagca-aaattcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 31931749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31931860 - 31931808
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 157  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31931860 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaa 31931808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11206382 - 11206327
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11206382 aagtgcctctgaagtaatgacgttatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 11206327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11235935 - 11235880
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  11235935 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcataagcaaagtt 11235880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 14100550 - 14100608
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||    
T  14100550 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaca 14100608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 17577443 - 17577548
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  17577443 caaaggctagtcaagtaatttcaatttgtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattagaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 17577540  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  17577541 ttctgaag 17577548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 19065902 - 19065937
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19065902 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19065937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 155
Target Start/End: Original strand, 25686497 - 25686540
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25686497 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 25686540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 155
Target Start/End: Original strand, 30120027 - 30120070
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30120027 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagca 30120070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 8654211 - 8654134
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| |||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8654211 caaaggcaagtcaattaaattcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 8654134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 16265260 - 16265314
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  16265260 aagtgtgcaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaaga 16265314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20029567 - 20029644
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20029567 caaatgctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaataatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 20029644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20062318 - 20062395
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20062318 caaatgctaatcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 20062395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20635997 - 20635912
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  20635997 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaa----gttcatcagaagctatgt-atcaccagaagctac 20635912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21618283 - 21618249
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618283 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 21618249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24117147 - 24117086
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24117147 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 24117086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Original strand, 25722722 - 25722764
Alignment:
Q  113 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25722722 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 25722764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Original strand, 25735322 - 25735364
Alignment:
Q  113 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25735322 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 25735364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26589638 - 26589584
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  26589638 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagacaaga 26589584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 26972336 - 26972390
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||    
T  26972336 aagtgtacaaccactacctccactactcagtatttgtctctgctacaagacaaga 26972390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 30401373 - 30401440
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagct 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  30401373 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcgaa--atttcatcagaagct 30401440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 33352036 - 33352090
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  33352036 aagtgtacaatcactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 33352090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 16264996 - 16265060
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16264996 aagcatctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggcgacgtcatcagaagca 16265060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19624018 - 19623945
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcag 417  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  19624018 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctttgctacaagacaagaataacagctctgcctgcag 19623945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19624281 - 19624217
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19624281 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctaaagtgatgacgtcatcagaagca 19624217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26943615 - 26943578
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26943615 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtc 26943578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 9933429 - 9933465
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9933429 aagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 9933465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 11147005 - 11147041
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11147005 aagtgcttctgaagtgatgatgtcatcagaagcagaa 11147041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 14100334 - 14100366
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100334 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14100366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15302239 - 15302167
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15302239 aagtgtacaaccactatctccactactcagttagtgtctctgctacaagacaaggataacagctatgcctgca 15302167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 17316635 - 17316707
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17316635 aagtgtacaaccactatctgcactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 17316707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19086197 - 19086125
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19086197 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 19086125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19086424 - 19086388
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19086424 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19086388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1905283 - 1905252
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1905283 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 1905252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16336427 - 16336392
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16336427 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 16336392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 17608198 - 17608233
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17608198 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 17608233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19483043 - 19483008
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19483043 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcattagaagca 19483008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 19832877 - 19832912
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19832877 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19832912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26589897 - 26589862
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26589897 caaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagca 26589862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13435821 - 13435787
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13435821 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 13435787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15302458 - 15302424
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15302458 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15302424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 16123192 - 16123265
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  16123192 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaa 16123265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19482791 - 19482717
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcaga 418  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  19482791 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctactaaaagacaagaataacagctctgcctgcaga 19482717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21128492 - 21128450
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21128492 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaaagctcatcagaagc 21128450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25592661 - 25592623
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25592661 agtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 25592623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26943851 - 26943817
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26943851 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 26943817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3383634 - 3383581
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3383634 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 3383581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7812053 - 7812016
Alignment:
Q  341 gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7812053 gtacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 7812016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 10640297 - 10640330
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10640297 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10640330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 10640529 - 10640562
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10640529 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttt 10640562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11206313 - 11206272
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11206313 tttcatcagaaactatatcatcaccagaagctacagttgatc 11206272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13055987 - 13055934
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13055987 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 13055934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13602460 - 13602427
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13602460 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 13602427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 19833143 - 19833176
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19833143 aagtgtacaagcactacctccactactctgtttt 19833176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22387076 - 22387024
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22387076 caaagtgcctttgaagtgatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaa 22387024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23284852 - 23284819
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23284852 aagtgcttctgaagtgatgatgtcatcagaagca 23284819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24116867 - 24116814
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  24116867 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 24116814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 33351775 - 33351839
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  33351775 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcttgaagtgatgatgtcatcagaagca 33351839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 9772588 - 9772636
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9772588 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 9772636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 11992548 - 11992596
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  11992548 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 11992596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12348135 - 12348099
Alignment:
Q  342 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12348135 tacaattgtacaaccactatctccactactctgtttt 12348099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13602211 - 13602139
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13602211 aagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 13602139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16877484 - 16877452
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16877484 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagca 16877452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 18172139 - 18172171
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18172139 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 18172171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19875876 - 19875844
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19875876 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 19875844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 135
Target Start/End: Original strand, 20487777 - 20487809
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20487777 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 20487809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23284603 - 23284531
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23284603 aagtgtataaccattatctccactactcagtttgtgtctccgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 23284531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25519126 - 25519090
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25519126 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 25519090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 192)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 4250277 - 4250778
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  4250277 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcatctgaagct-gaagtgc 4250375  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  4250376 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 4250474  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4250475 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgag 4250574  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250575 catttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 4250673  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4250674 cctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaag 4250773  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  4250774 gattt 4250778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35013416 - 35012915
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  35013416 caaaggctagtcaagaaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaac-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 35013319  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  35013318 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 35013220  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  35013219 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 35013120  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35013119 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatg 35013020  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35013019 cctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 35012920  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  35012919 gattt 35012915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 39193899 - 39194306
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  39193899 aagtgcatcttaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccg 39193997  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39193998 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggttatttggatagc 39194097  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194098 actgagtatctgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 39194196  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39194197 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 39194296  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  39194297 tcaaaggatt 39194306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 106 - 512
Target Start/End: Original strand, 20441123 - 20441528
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  20441123 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgt 20441221  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagct 305  Q
    | | || || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20441222 aaattctaattaaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacatcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagca 20441321  T
Q  306 ctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacag 405  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20441322 ctgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaa 20441421  T
Q  406 ctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgat 505  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20441422 ctatgcctacagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgat 20441521  T
Q  506 caaagga 512  Q
    |||||||    
T  20441522 caaagga 20441528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 154094 - 154502
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  154094 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 154192  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  154193 tatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 154292  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  154293 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtataaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 154391  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  154392 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 154491  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  154492 tcaaaggattt 154502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5974166 - 5973757
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5974166 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 5974068  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt-ggatag 303  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |     
T  5974067 tatattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcattttggacaa 5973968  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5973967 cgctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactgcctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaac 5973869  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5973868 agctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatg 5973769  T
Q  504 atcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||    
T  5973768 atcaaaggattt 5973757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 148019 - 148427
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  148019 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 148117  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  148118 tatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaagtatcaacggtcatttggacagc 148217  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  148218 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 148316  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  148317 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatga 148416  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  148417 tcaaaggattt 148427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 7689284 - 7689672
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| || | |||||||||||| ||||    
T  7689284 tcatcagaagcagaaggtcaacagaagctaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 7689383  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg-cagttgtccttcgtt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  7689384 agtagctgtttctcatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagttatttgtccttcgtt 7689483  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7689484 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtg 7689582  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7689583 ccttcaagatgtgaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 7689672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4167744 - 4167251
Alignment:
Q  21 tcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtg 120  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||    
T  4167744 tcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgcttctgaagtg 4167646  T
Q  121 atgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaag 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||    
T  4167645 atgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatcaaactgaag 4167547  T
Q  221 aaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtcct 320  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||      
T  4167546 attcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctc 4167447  T
Q  321 tcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  4167446 tcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaa 4167347  T
Q  420 tatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4167346 tttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggattt 4167251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 18381615 - 18382114
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||   | ||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  18381615 caaagcctagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagaccaaaggaattttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 18381713  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |  || | |    
T  18381714 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaat 18381812  T
Q  211 -caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||     
T  18381813 tcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttggagagccctga 18381912  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18381913 gtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccat 18382012  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18382013 gcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaa 18382111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5639422 - 5639925
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  5639422 caaaagctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 5639520  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  5639521 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 5639619  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5639620 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5639719  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  5639720 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccat 5639819  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5639820 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5639919  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5639920 ggattt 5639925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21878262 - 21877759
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  21878262 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 21878164  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  21878163 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 21878065  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||| |    
T  21878064 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatagatagcactgag 21877965  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21877964 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 21877865  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21877864 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 21877765  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  21877764 ggattt 21877759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Original strand, 23580134 - 23580541
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |    
T  23580134 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-t 23580232  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  23580233 aatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 23580332  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23580333 gagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagc 23580432  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580433 catgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatc 23580532  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  23580533 aaaggattt 23580541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 5649979 - 5650482
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  5649979 caaaagctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 5650077  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  5650078 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 5650176  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5650177 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5650276  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  5650277 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccat 5650376  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5650377 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 5650476  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  5650477 ggattt 5650482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12731042 - 12730539
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12731042 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12730944  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12730943 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12730845  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12730844 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12730745  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12730744 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12730645  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12730644 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12730545  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12730544 ggattt 12730539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12897695 - 12898198
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12897695 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12897793  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12897794 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12897892  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12897893 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12897992  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12897993 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12898092  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12898093 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12898192  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12898193 ggattt 12898198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12614028 - 12614531
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12614028 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12614126  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12614127 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12614225  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12614226 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12614325  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12614326 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12614425  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12614426 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12614525  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12614526 ggattt 12614531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 12623493 - 12623996
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12623493 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12623591  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12623592 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12623690  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| |    
T  12623691 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatatcactgag 12623790  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12623791 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12623890  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12623891 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12623990  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12623991 ggattt 12623996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12741635 - 12741132
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12741635 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12741537  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12741536 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12741438  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12741437 caaattgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12741338  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12741337 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 12741238  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12741237 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 12741138  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12741137 ggattt 12741132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21864156 - 21863653
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  21864156 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 21864058  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  21864057 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 21863959  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  21863958 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 21863859  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21863858 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtttacgctacaagacaaaacaacagccat 21863759  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21863758 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 21863659  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  21863658 ggattt 21863653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19179455 - 19178951
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19179455 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagcacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19179357  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  19179356 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 19179258  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||      
T  19179257 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggagttatcaacggatatattggatagcactaa 19179158  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19179157 gcacttgtctctcgttaatatagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagcca 19179058  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19179057 tgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtggataatcaa 19178958  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  19178957 aggattt 19178951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33085056 - 33084554
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  33085056 caaagactactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag-aaaaagaaatttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 33084959  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||   | || |    
T  33084958 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgattttt-taat 33084860  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  33084859 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 33084760  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||    
T  33084759 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctattttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccat 33084660  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  33084659 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 33084560  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  33084559 ggattt 33084554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 10997496 - 10997999
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  10997496 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 10997594  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  10997595 ttctgaagagatgacgtcattagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 10997693  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  10997694 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 10997793  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  10997794 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 10997893  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  10997894 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 10997993  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  10997994 ggattt 10997999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39587371 - 39586965
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||    
T  39587371 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcggaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaattatcaccagaagctacaattgatcca 39587273  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    ||   | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |    
T  39587272 taagtttaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaac 39587173  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaac 403  Q
     ||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39587172 actaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaac 39587073  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39587072 agccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatg 39586974  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  39586973 atcaaagga 39586965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2539030 - 2538528
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  2539030 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 2538932  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  2538931 tcttgaagagatgatgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 2538833  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  2538832 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 2538733  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  2538732 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 2538633  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||  | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  2538632 gcctgcag-ttttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 2538534  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  2538533 ggattt 2538528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3172118 - 3171614
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  3172118 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 3172020  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  3172019 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 3171921  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| |    
T  3171920 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgag 3171821  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3171820 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 3171721  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  3171720 gcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaa 3171621  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  3171620 aggattt 3171614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3182720 - 3182216
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  3182720 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 3182622  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  3182621 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 3182523  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| |    
T  3182522 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgag 3182423  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3182422 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 3182323  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  3182322 gcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaa 3182223  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  3182222 aggattt 3182216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21895714 - 21895194
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||         
T  21895714 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaagtgct 21895615  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
               ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  21895614 cctgaagctgaagtgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctac 21895515  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
     |||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21895514 gtttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggata 21895416  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaag 393  Q
    | |||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21895415 tatggatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaag 21895316  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21895315 acaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatca 21895216  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  21895215 ctggtggataatcaaaggattt 21895194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 36236141 - 36236644
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  36236141 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 36236239  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||| | ||     
T  36236240 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcc-tttaa 36236338  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||      
T  36236339 tcaaactgaagattcaaagttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaa 36236438  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  36236439 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 36236538  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  36236539 tgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 36236637  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  36236638 aggattt 36236644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 36246688 - 36247191
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  36246688 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 36246786  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||| | ||     
T  36246787 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcc-tttaa 36246885  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||      
T  36246886 tcaaactgaagattcaaagttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaa 36246985  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  36246986 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 36247085  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  36247086 tgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 36247184  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  36247185 aggattt 36247191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38095572 - 38095068
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  38095572 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 38095474  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  38095473 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 38095375  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    | |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| |    
T  38095374 ccaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgag 38095275  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    ||  ||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  38095274 cacctgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 38095175  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  38095174 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 38095075  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  38095074 aggattt 38095068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38106197 - 38105693
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  38106197 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 38106099  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  38106098 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcc-tttaat 38106000  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    | |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| |    
T  38105999 ccaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgag 38105900  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    ||  ||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  38105899 cacctgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 38105800  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  38105799 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 38105700  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  38105699 aggattt 38105693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47195641 - 47195257
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||| |||  |||    
T  47195641 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactggagattcaa 47195543  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |   ||  | | |||||||||||||    
T  47195542 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 47195443  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||     
T  47195442 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgtt 47195344  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  47195343 ccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcgaaggattactggtggatgatcaaagga 47195257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4178393 - 4177907
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| |   || ||||    
T  4178393 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagcggaa-gtgc 4178295  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  4178294 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca----------------aaagtttt-catcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 4178213  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  4178212 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 4178113  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4178112 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 4178013  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4178012 gcctgcaaaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 4177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 51628881 - 51629402
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  51628881 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 51628979  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  51628980 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 51629079  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  51629080 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 51629178  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  51629179 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 51629278  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51629279 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 51629378  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  51629379 cactggtggataatcaaaggattt 51629402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7507683 - 7507294
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||  ||    
T  7507683 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccat-taatcaaactgaagattca 7507585  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  7507584 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 7507485  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  7507484 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 7507385  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7507384 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 7507294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7518280 - 7517891
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||  ||    
T  7518280 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccat-taatcaaactgaagattca 7518182  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  7518181 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 7518082  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  7518081 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 7517982  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7517981 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 7517891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19188315 - 19187830
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19188315 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19188217  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                   |||| ||||| |||| |||| |||| |||||||| | || |    
T  19188216 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcag-------------------aagcaatatcttcactagaagctacgtttgatcctt-taat 19188137  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||     
T  19188136 caaactgaagattcaaagtagttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactga 19188037  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19188036 gcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagcca 19187937  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19187936 tgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaa 19187837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 51656141 - 51656663
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |    
T  51656141 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaact 51656239  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatc 191  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  51656240 gctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagc 51656339  T
Q  192 tacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    ||| |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51656340 tacttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgg 51656438  T
Q  292 tcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctac 390  Q
      || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51656439 atatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctac 51656538  T
Q  391 aagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51656539 aagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 51656638  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  51656639 tcactggtggataatcaaaggattt 51656663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5844333 - 5843812
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggtt-------- 102  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | |            
T  5844333 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctaaactgct 5844234  T
Q  103 --------caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
             ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  5844233 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctac 5844134  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5844133 atttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggata 5844035  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaag 393  Q
    | |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5844034 tatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaag 5843935  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5843934 acaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 5843835  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5843834 actggtggataatcaaaggattt 5843812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5833600 - 5833210
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  5833600 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattca 5833502  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  5833501 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcatt 5833402  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  5833401 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 5833302  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5833301 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 5833210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 11194897 - 11195277
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||  |||| | ||||||||||  |||    
T  11194897 tcatcagaagcagaataccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcac-agaagctgcaattgatcagtatatttaaactgaagattcaa 11194993  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||| |||||||    
T  11194994 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtctttcgtta 11195092  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  11195093 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttc 11195191  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11195192 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacactcaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagga 11195277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 47607756 - 47608146
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  47607756 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattca 47607854  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| || | |||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  47607855 aagttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcttt 47607954  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  47607955 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 47608054  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47608055 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 47608146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 47618364 - 47618754
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  47618364 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattca 47618462  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| || | |||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || ||    
T  47618463 aagttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcttt 47618562  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  47618563 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 47618662  T
Q  425 gc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |   ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47618663 acaactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 47618754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 9050314 - 9050698
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  || | | ||  || |||  |||    
T  9050314 tcatcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaatttggagattcaa 9050412  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| | | ||||| ||| |||    
T  9050413 agtagctggttctcatttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcattcttta 9050512  T
Q  327 acagagttgactaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9050513 acaaagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgtt 9050611  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9050612 ccttcaagatggtaatgaatttgaagctattttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaagga 9050698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 145 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17957601 - 17957236
Alignment:
Q  145 catcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcattt 244  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  |  | | |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  17957601 catcagaagcaaagttt--catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcattt 17957504  T
Q  245 caaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaa-gta 343  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||| ||| ||||||| || || |||    
T  17957503 caacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtatttgtccttctttatcagagtttacaaaagta 17957404  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17957403 caagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacactacaagacaagaaaacaaccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatga 17957305  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  17957304 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccatatcaggcaaagaattactggtggaagatcaaagga 17957236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 35401008 - 35401380
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  35401008 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35401106  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  35401107 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35401206  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  35401207 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35401306  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35401307 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 35401380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 35404235 - 35404607
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  35404235 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35404333  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  35404334 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35404433  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  35404434 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35404533  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35404534 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 35404607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 35648534 - 35648906
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  35648534 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35648632  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  35648633 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35648732  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  35648733 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35648832  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35648833 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 35648906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 14387987 - 14388336
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||  |||||  ||||| ||    
T  14387987 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttctaacctcgtctaa-aa 14388085  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14388086 gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 14388185  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  14388186 cctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctt 14388284  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14388285 cataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 14388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 35637882 - 35638254
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |  |||||| |||| |||||| |    
T  35637882 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaaaattcaaagttgctgattctcaat 35637980  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  35637981 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacagatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35638080  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  35638081 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35638180  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35638181 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 35638254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 675791 - 675443
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |   ||| | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||     
T  675791 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgaacagaatatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagag 675692  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  675691 ga-cgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactcggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 675594  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  675593 cctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttgatcctt 675495  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  675494 cataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 675443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 41132477 - 41132825
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||||||   ||||  |||||||| || ||| || ||  ||||||||    
T  41132477 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaatgagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa 41132576  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41132577 -aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgggtgtttgtccttctttga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 41132674  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  41132675 cctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ctgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttgatcctt 41132773  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41132774 cataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 41132825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 161 - 510
Target Start/End: Original strand, 18310833 - 18311180
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | ||  |||||   ||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||    
T  18310833 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaatttgaagtttcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaa-aa 18310931  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18310932 gaacgaaggattgaaaggaagatatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 18311031  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  18311032 cctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctt 18311130  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  18311131 cataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtgaatgatcaaag 18311180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 275 - 512
Target Start/End: Original strand, 20195667 - 20195903
Alignment:
Q  275 aagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195667 aagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactaggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 20195766  T
Q  375 tttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacc 474  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  20195767 ttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccatcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggacttcacc 20195865  T
Q  475 caaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20195866 caaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 20195903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 129 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12947091 - 12946818
Alignment:
Q  129 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaag 228  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |  |  | | ||||||||||  |||||    
T  12947091 atcagaagcagaagatcatcagaagcacgattt--catcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaag 12946994  T
Q  229 tagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaac 328  Q
     |||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | || |||||||||| |    
T  12946993 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtatttatccttcgttatc 12946895  T
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacag 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12946894 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 12946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 46180686 - 46181089
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  46180686 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 46180783  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc-atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     | | |||| ||| |    ||||  || |||||||  |  | |||||  ||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  ||||| ||||||| | ||    
T  46180784 aagattcaatctggaatctcaaaagagttgtttctttaagttaacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaaag 46180882  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| |   |||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||  |||    
T  46180883 cactgggtgcttgtccctcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcttcgctacaagacaagttaac 46180981  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  46180982 agctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatg 46181080  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  46181081 atcaaagga 46181089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 291
Target Start/End: Original strand, 30291884 - 30292066
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | |    
T  30291884 tgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-ttt 30291982  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30291983 aatcaaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 30292066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20799118 - 20798936
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  20799118 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 20799020  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20799019 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcctctataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 20798936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 20883910 - 20884092
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | | |||    
T  20883910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattagctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgccagcagaat-tcttcct 20884008  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20884009 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaacagattactggtggatgatcaaagga 20884092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23927112 - 23926930
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||    
T  23927112 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctacagaa-atgttcct 23927014  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||| | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23927013 tcaagataggaatggatttgaacgtgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaagga 23926930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 45070681 - 45070863
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  45070681 agagttgacaaattacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 45070779  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  45070780 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattagtggtgaatgatcaaagga 45070863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 22610002 - 22610184
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22610002 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 22610100  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | || ||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  22610101 tcaagataggaatgaatttgaatttgatcctttataggactacactcaaatcaggcaaaagattactgatggatgatcaaagga 22610184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5929757 - 5929600
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||    
T  5929757 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagacaccagctctgcctgcagaa-atgttcct 5929659  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  5929658 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 5929600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28474499 - 28474124
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||      
T  28474499 aagtgcatctaaagtaatgacgtcatcagaagcagaac-tcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatcag 28474404  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc--atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 302  Q
     | | |||| ||||||   |||| | ||||||| |   |||| |||||  ||||||| || ||||  | | ||||| ||||  ||||| ||||||| | |    
T  28474403 aagattcaatctgaagtttcaaa-tggctgtttattggattt-aacctcgtctaaga-gagcgaaagactcaaaggaaggtgccaacgttcatttgaaaa 28474307  T
Q  303 gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa 402  Q
    || ||| |   |||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| ||    
T  28474306 gcactgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataa 28474208  T
Q  403 cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  28474207 cagctctgcctgcagaa-atgttcctttaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 28474124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7507832 - 7507688
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  7507832 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 7507734  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507733 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 7507688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7518429 - 7518285
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  7518429 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 7518331  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7518330 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 7518285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17371097 - 17370938
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||| |    
T  17371097 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaa-atgttc 17370999  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17370998 cttcatgataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 17370938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 19038061 - 19037903
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  19038061 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctgcgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 19037963  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  19037962 ttcaagataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcaggcaaa 19037903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28380049 - 28379892
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  28380049 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccagtacctccacgactctaattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 28379951  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||| |||||  |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  28379950 tcaagataggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 28379892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 52350712 - 52350869
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||    
T  52350712 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgtccct 52350810  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| | |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  52350811 tcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 52350869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 330 - 487
Target Start/End: Original strand, 19170360 - 19170518
Alignment:
Q  330 gagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |     
T  19170360 gagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcg 19170458  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  19170459 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaagcaaa 19170518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 44201066 - 44200912
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  44201066 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacaactttgcctgcagaa-atgttcc 44200968  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 483  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  44200967 ttcaagataggaatggatttgaacttgatctttcataggacaacatccaaatcagg 44200912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20251828 - 20251671
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  20251828 agagttgacaaagtgcaagggtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctatgctacaaaacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 20251730  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20251729 tcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 20251671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22019391 - 22019232
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| |    
T  22019391 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaa-atgttc 22019293  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  22019292 cttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 22019232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22655532 - 22655373
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| |    
T  22655532 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttc 22655434  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22655433 cttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacatccaaatcaggcaaa 22655373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 7689133 - 7689210
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7689133 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaataatggagagcaaaaagaattctaagcatctgaagaaaa 7689210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21544064 - 21543925
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatt 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |||    
T  21544064 tgtacgaccactacctccactactttgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaa-atgttccttcaagttaggaatggatt 21543966  T
Q  447 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||  | |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  21543965 tgaacatgattctttataggacaacatccaaatcaggcaaa 21543925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22642950 - 22642791
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||| |    
T  22642950 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacggtacaagacaagataaacagttctgcctgcagaa-atgttc 22642852  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||  ||||| ||| |||||| |||||||    
T  22642851 cttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcttaggacaacatccaaataaggcaaa 22642791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23065003 - 23064935
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23065003 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaa 23064935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 488
Target Start/End: Original strand, 25448608 - 25448751
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  25448608 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgc 25448706  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaag 488  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  25448707 atttgaaattgatccttcataggacaacaaccatatcaggcaaag 25448751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1900383 - 1900311
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1900383 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1900311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36134228 - 36134156
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36134228 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36134156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5833748 - 5833661
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  5833748 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 5833661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 19063506 - 19063593
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19063506 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 19063593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 22464851 - 22464993
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  |||||||||     
T  22464851 aagtgtacatccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgc 22464949  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  22464950 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 22464993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30572484 - 30572421
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30572484 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtttaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaag 30572421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 35400841 - 35400928
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35400841 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 35400928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 35404068 - 35404155
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35404068 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 35404155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 35648367 - 35648454
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35648367 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 35648454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 37642286 - 37642215
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37642286 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgc 37642215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 47607608 - 47607695
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  47607608 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 47607695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 47618216 - 47618303
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  47618216 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 47618303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 147909 - 147987
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  147909 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 147987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5974276 - 5974198
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  5974276 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 5974198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20441012 - 20441089
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20441012 caaaggctagtcaagtaacttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 20441089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22153895 - 22153841
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22153895 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35040204 - 35040150
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  35040204 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 35040150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21984890 - 21984825
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984890 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtttgaattgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 21984825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21702852 - 21702780
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21702852 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 21702780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 22427399 - 22427471
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22427399 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 22427471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 26548282 - 26548441
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| || |||| |    
T  26548282 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgacactgcctctgtctacgctacaagacaggataaacagctctgtctgcataa-atgttc 26548380  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  26548381 tttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacagcatccaaatcaggcaaa 26548441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Original strand, 46686576 - 46686660
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag-aattccaagcatctgaagaaaaccgctc 94  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  46686576 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctc 46686660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 48570273 - 48570345
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  48570273 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaggacaagaaaaacagctatgcctgca 48570345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5833635 - 5833588
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5833635 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 5833588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Original strand, 19170140 - 19170227
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19170140 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaaagttcatcagaagcaa----gttcatcagaagctttat-atcaccagaagctaca 19170227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20799354 - 20799299
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20799354 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagtaaagtt 20799299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 32785979 - 32786121
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||| |||| || |||| ||||||  |||||||||     
T  32785979 aagtgtacaaccactatctccactactatgtttttgtctccgctaaaagacaagaaaaacagctctgcttgca-aagatgttccttcacaatgggaatgc 32786077  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  32786078 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 32786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 35637715 - 35637802
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  35637715 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctga 35637802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 45070445 - 45070499
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45070445 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcag-aagacatcagaagcaaagtt 45070499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47195781 - 47195684
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||||    
T  47195781 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgaag 47195684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 47607721 - 47607768
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47607721 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 47607768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 47618329 - 47618376
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47618329 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 47618376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 153984 - 154062
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  153984 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 154062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2268569 - 2268515
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2268569 aagtgtacaaccactacctcgactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 2268515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 2327482 - 2327536
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  2327482 aagtgtacaaccactacctccactactctggttttgtctctgctacaagacaaga 2327536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12284754 - 12284693
Alignment:
Q  76 catctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284754 catctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 12284693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 22600224 - 22600278
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22600224 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22600278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24253020 - 24252951
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24253020 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 24252951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26577130 - 26577053
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  26577130 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaac-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 26577053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 39193789 - 39193866
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  39193789 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaaaggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 39193866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 39587472 - 39587403
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39587472 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 39587403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23927317 - 23927268
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23927317 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagc 23927268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2268845 - 2268781
Alignment:
Q  74 agcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2268845 agcatctgaagagaagcgctcctgaagacaaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 2268781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19215650 - 19215578
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19215650 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 19215578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 154
Target Start/End: Original strand, 21120879 - 21120928
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  21120879 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaattcatcagaagc 21120928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 21135202 - 21135274
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21135202 aagtgtacaaccactaaatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 21135274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 30572235 - 30572163
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30572235 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtttctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 30572163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 39201034 - 39201070
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39201034 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 39201070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 46089027 - 46088955
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  46089027 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctactagacaaggataacagctctgcctgca 46088955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 2327216 - 2327251
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2327216 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 2327251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 7745132 - 7745207
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  7745132 aagtgtacaaccactacctccactactctgctattgccttcgctacatgacaagaaaaacagctttgcctgcagaa 7745207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 14263493 - 14263548
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  14263493 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaaga 14263548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19215872 - 19215820
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  19215872 caaagtgcttctgaagtgatgtcgtcatcagaagc--aaattcatcagaagcaaa 19215820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 152
Target Start/End: Original strand, 20883672 - 20883719
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaa 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20883672 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaa 20883719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 21121108 - 21121159
Alignment:
Q  347 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21121108 gtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 21121159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23025033 - 23024998
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23025033 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 23024998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42284891 - 42284856
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42284891 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 42284856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 675861 - 675807
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagt 159  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  675861 aagtgcctctgaagaaatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagt 675807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2267127 - 2267073
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||    
T  2267127 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctactacaagacaaga 2267073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Original strand, 13664934 - 13665051
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa-agaattccaagcatctgaag-aaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | |  ||||    
T  13664934 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaaattctgagcatctgaagaaaaactgctcctgaagct-gaagt 13665032  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgt 127  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  13665033 gcttctgaaatgatgacgt 13665051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23024826 - 23024772
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  23024826 aagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 23024772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 23580055 - 23580133
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  23580055 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgggaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 23580133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 30291805 - 30291883
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||||    
T  30291805 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatatgaagaaaac 30291883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 44821587 - 44821641
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  44821587 aagtgtacaactactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 44821641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 7310121 - 7310060
Alignment:
Q  74 agcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7310121 agcatctgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 7310060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Original strand, 20883743 - 20883784
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20883743 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 20883784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 21191907 - 21191944
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21191907 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtc 21191944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 22599943 - 22600008
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22599943 aagcatctgaagagaagcgctcctgaagacaaaagtgctcctgaagtgatgacatcatcagaagca 22600008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30893380 - 30893316
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30893380 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtactcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 30893316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 16235338 - 16235410
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16235338 aagtgtacaacaactacctccactactccttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 16235410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21165342 - 21165240
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||||||    
T  21165342 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 21165245  T
Q  114 tgaag 118  Q
    |||||    
T  21165244 tgaag 21165240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 22609783 - 22609819
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22609783 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 22609819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 26702171 - 26702243
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26702171 aagtgtacaaccactacctccactacttagtatgtgtctctgctacaagacaagaataacagctatgcctgca 26702243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29215835 - 29215763
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  29215835 aagtgtacaatcactagctccactactctgtttttgtctctgctacaaggcaagaaaaacagctctgcctgca 29215763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 33256393 - 33256465
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33256393 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 33256465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 33276565 - 33276637
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33276565 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 33276637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46089293 - 46089233
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46089293 tctgaagaaaactgctcatgaagtctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 46089233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 9050169 - 9050243
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  9050169 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaac 9050243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Original strand, 9050276 - 9050311
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9050276 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 9050311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 21134975 - 21135010
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21134975 caaagtgcttctgaaatgatgacgtcatcagaagca 21135010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 138
Target Start/End: Original strand, 21204726 - 21204757
Alignment:
Q  107 gtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21204726 gtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 21204757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35401847 - 35401792
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  35401847 aagtgtacaaccactacctccactactatgttttttgtctctgctacaagacaaga 35401792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37642513 - 37642478
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37642513 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcattagaagca 37642478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 44821352 - 44821387
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44821352 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 44821387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10251024 - 10250970
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  10251024 aagtgtacaaccattatctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 10250970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 10757459 - 10757354
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||| ||||||   | |||||||    
T  10757459 aagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcat-tgttccttcatacttggaatga 10757361  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  10757360 atttgaa 10757354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 17957759 - 17957686
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  17957759 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaa 17957686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 152
Target Start/End: Original strand, 18310763 - 18310809
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaa 152  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18310763 agtgcctctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaa 18310809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 21191642 - 21191705
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21191642 aagcatctgaagaaaagtgctcctgaagtc--aagtcctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 21191705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Original strand, 24028751 - 24028816
Alignment:
Q  368 tactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaag 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  24028751 tactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcaag 24028816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26577020 - 26576986
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcag 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26577020 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcag 26576986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1577905 - 1577852
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  1577905 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 1577852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5242158 - 5242105
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5242158 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 5242105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 12613588 - 12613621
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12613588 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 12613621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 12613856 - 12613893
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12613856 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttgtgtc 12613893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12947220 - 12947168
Alignment:
Q  36 aggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  12947220 aggtcttggaagaacaatggagagc-aaaagaatccaaagcatctgaagaaaac 12947168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 17024774 - 17024807
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17024774 aagtgcttctgaagtgataacgtcatcagaagca 17024807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 18896639 - 18896672
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18896639 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 18896672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 21204965 - 21204998
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21204965 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 21204998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 22201778 - 22201831
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  22201778 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 22201831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 23036569 - 23036676
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg--tttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||    
T  23036569 aagtgtacaaccactacctcctctactttgtttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-atgatgttccttcacaatgggaat 23036667  T
Q  442 gaatttgaa 450  Q
    | |||||||    
T  23036668 ggatttgaa 23036676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 23359063 - 23359116
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23359063 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 23359116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29216054 - 29216005
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaag 153  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29216054 aaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaag 29216005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 34255561 - 34255630
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34255561 tgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 34255630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35040468 - 35040404
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  35040468 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcatgaagtggtgacgtcatcagaagca 35040404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38282600 - 38282551
Alignment:
Q  350 tacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  38282600 tacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagataaga 38282551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2834725 - 2834673
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  2834725 tgtacaaccactgcctccactactctgttctttgtctctgctacaagacaaga 2834673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23054409 - 23054373
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23054409 agtacaattgtacaaccactaccttcactactctgtt 23054373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 36536792 - 36536840
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  36536792 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 36536840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42284666 - 42284594
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  42284666 aagtgtacaaccactacctccactattatgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 42284594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 45070514 - 45070542
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45070514 tttcatcagaagctatatcatcaccagaa 45070542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 192)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 14745419 - 14745920
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  14745419 caaaggctagtcaagtaatttcaacttgtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 14745516  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| || |    
T  14745517 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagctatatcatcaccagatgctacatttaattcatttatt 14745615  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  14745616 caaactgaagatccaaagtagatgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgag 14745715  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745716 catttgtccttcgttaacagagttgacaaaatacaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 14745815  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14745816 cctgcagaatttgtgccctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 14745915  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  14745916 gattt 14745920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20491557 - 20491056
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  20491557 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagtgc 20491459  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  20491458 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 20491360  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |    
T  20491359 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacaacgctgag 20491260  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491259 catttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 20491161  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20491160 cctgcaaaatttgtgccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaag 20491061  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  20491060 gattt 20491056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1368087 - 1367679
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  1368087 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 1367989  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367988 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 1367889  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367888 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 1367790  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1367789 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 1367690  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  1367689 tcaaaggattt 1367679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 31116243 - 31116762
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  31116243 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaatga-ttctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 31116341  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
     |||||||                 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  31116342 gtctgaagctgaaatgcttttgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 31116440  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116441 catttaatccgtaaattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 31116540  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||  | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116541 atttggatagcactaagtatttgtccttcgttagcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 31116640  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31116641 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggatta 31116740  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  31116741 ctggtgaatgatcaaaggattt 31116762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 15888193 - 15888579
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  15888193 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaa 15888291  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  15888292 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgtta 15888391  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15888392 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaatttgtgc 15888490  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15888491 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 15888579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 19985562 - 19986058
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19985562 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcttgatagaacaatgaaaggcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19985659  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||| |  || |    
T  19985660 ttctgaagagatgacgtgatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaatatcttcacccgaagctacatttaatcaagttatt 19985758  T
Q  211 caaa-ctgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19985759 caaaacttaagatccaaagtagttgtttcttaattcaatcttatctaagaggaacgaagaaatgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactga 19985858  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19985859 acatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactat 19985958  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19985959 gcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 19986058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 21769785 - 21770192
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |     
T  21769785 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatacg 21769883  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21769884 taaattcaaactggagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 21769983  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21769984 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 21770082  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21770083 actatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 21770182  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  21770183 tcaaaggatt 21770192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9171443 - 9171035
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  9171443 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccg 9171345  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171344 taaattcaaactgaaaattcaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 9171245  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  9171244 actgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaagacaaca 9171146  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9171145 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 9171046  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  9171045 tcaaaggattt 9171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20990204 - 20989701
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  20990204 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 20990106  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  20990105 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 20990007  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  20990006 caaactgaagattcaaagtagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 20989907  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20989906 catttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 20989807  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20989806 gcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 20989707  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  20989706 ggattt 20989701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44280954 - 44280546
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  44280954 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 44280856  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44280855 tatattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 44280756  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280755 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 44280657  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44280656 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 44280557  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  44280556 tcaaaggattt 44280546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 21002757 - 21003260
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  21002757 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 21002855  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  21002856 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 21002954  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  21002955 caaactgaagattcaaagtagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 21003054  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21003055 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 21003154  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21003155 gcctgcagaatttctaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaat 21003254  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  21003255 ggattt 21003260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9433815 - 9433312
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9433815 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9433717  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9433716 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaaacaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9433618  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9433617 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9433518  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9433517 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 9433418  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9433417 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 9433318  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9433317 ggattt 9433312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9170642 - 9170234
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  9170642 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccg 9170544  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170543 taaattcaaactgaaaattcaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 9170444  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
      || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  9170443 antgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaanacaaca 9170345  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  9170344 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttnaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaangattactggtgaatga 9170245  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  9170244 tcaaaggattt 9170234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9444411 - 9443908
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9444411 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatatgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9444313  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9444312 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9444214  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9444213 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9444114  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9444113 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtgttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 9444014  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9444013 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 9443914  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9443913 ggattt 9443908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 589648 - 589262
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||| ||||    
T  589648 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 589550  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  589549 agtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 589450  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  589449 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctaggcctgcagaatttgtgc 589351  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  589350 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggatcactggtgattgatcaaaggattt 589262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3166192 - 3165784
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  3166192 aagtgcatttgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 3166094  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3166093 tatattcaaactaaagatccaaagtagttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 3165994  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165993 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 3165895  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3165894 ggtatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 3165795  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  3165794 tcaaaggattt 3165784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9160187 - 9159779
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  9160187 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccg 9160089  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160088 taaattcaaactgaaaattcaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 9159989  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
      || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  9159988 attgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaaaacaaca 9159890  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  9159889 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttaaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtgaatga 9159790  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  9159789 tcaaaggattt 9159779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6866974 - 6867477
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6866974 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgggcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6867072  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6867073 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6867171  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6867172 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6867271  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6867272 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 6867371  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6867372 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 6867471  T
Q  510 ggattt 515  Q
    | ||||    
T  6867472 gaattt 6867477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6877606 - 6878109
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6877606 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgggcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6877704  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6877705 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6877803  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6877804 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6877903  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6877904 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 6878003  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6878004 gcctgcagaatttgtacattcaagttgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 6878103  T
Q  510 ggattt 515  Q
    | ||||    
T  6878104 gaattt 6878109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24930352 - 24930855
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  24930352 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 24930450  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  24930451 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 24930549  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24930550 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24930649  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  24930650 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcat 24930749  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24930750 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24930849  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24930850 ggattt 24930855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37344752 - 37344248
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | || |||    
T  37344752 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtg 37344654  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  37344653 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taa 37344555  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  37344554 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 37344455  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| ||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  37344454 gcacttgcctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 37344355  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37344354 tgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaagactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaa 37344255  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  37344254 aggattt 37344248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 454548 - 455051
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  454548 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 454646  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  454647 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 454745  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  454746 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 454845  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  454846 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 454945  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  454946 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 455045  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  455046 ggattt 455051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 467330 - 467833
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||| | | || ||||    
T  467330 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 467428  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  467429 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 467527  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  467528 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 467627  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  467628 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 467727  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  467728 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 467827  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  467828 ggattt 467833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8617937 - 8617434
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  8617937 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 8617839  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  8617838 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 8617740  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  8617739 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 8617640  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  8617639 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 8617540  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  8617539 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 8617440  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  8617439 ggattt 8617434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 48710240 - 48710743
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  48710240 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 48710338  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  48710339 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 48710437  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  48710438 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 48710537  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  48710538 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 48710637  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  48710638 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 48710737  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  48710738 ggattt 48710743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 2705361 - 2705864
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  2705361 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 2705459  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  2705460 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 2705558  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  2705559 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 2705658  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  2705659 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccat 2705758  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  2705759 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 2705858  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  2705859 ggattt 2705864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8628500 - 8627997
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  8628500 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 8628402  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  8628401 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 8628303  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  8628302 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 8628203  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  8628202 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 8628103  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  8628102 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 8628003  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  8628002 ggattt 8627997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11096606 - 11096103
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  11096606 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 11096508  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||   ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  11096507 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaataatttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 11096409  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  11096408 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 11096309  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  11096308 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 11096209  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  11096208 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 11096109  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  11096108 ggattt 11096103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 26653074 - 26653577
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  26653074 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 26653172  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  26653173 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 26653271  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  26653272 caaacggaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 26653371  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26653372 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 26653471  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26653472 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 26653571  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  26653572 ggattt 26653577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 26699403 - 26699906
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  26699403 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 26699501  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  26699502 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 26699600  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  26699601 caaacggaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 26699700  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26699701 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 26699800  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26699801 gcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 26699900  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  26699901 ggattt 26699906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 2715965 - 2716468
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  2715965 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 2716063  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  2716064 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 2716162  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  2716163 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 2716262  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  2716263 cacttgtctctcgttaatagagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 2716362  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  2716363 gcctgcagaatttgtacactcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 2716462  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  2716463 ggattt 2716468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4223161 - 4222658
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  4223161 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 4223063  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  4223062 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 4222964  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  4222963 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 4222864  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4222863 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 4222764  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4222763 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 4222664  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  4222663 ggattt 4222658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9085834 - 9085332
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  9085834 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 9085736  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  9085735 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 9085637  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9085636 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9085537  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9085536 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9085437  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9085436 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9085338  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9085337 ggattt 9085332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9095548 - 9095046
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  9095548 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 9095450  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  9095449 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 9095351  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9095350 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9095251  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9095250 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9095151  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9095150 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9095052  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9095051 ggattt 9095046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 17949867 - 17950370
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  17949867 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 17949965  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  17949966 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 17950064  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  17950065 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 17950164  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  17950165 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 17950264  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17950265 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17950364  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  17950365 ggattt 17950370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4212562 - 4212059
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  4212562 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 4212464  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  4212463 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 4212365  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  4212364 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 4212265  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4212264 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 4212165  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4212164 gcctgcagaatttgtacactcaagatggaaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 4212065  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  4212064 ggattt 4212059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22089674 - 22089171
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  22089674 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 22089576  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22089575 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22089477  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||| |    
T  22089476 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgag 22089377  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||  ||    
T  22089376 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacagtcat 22089277  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22089276 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22089177  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22089176 ggattt 22089171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22100289 - 22099786
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  22100289 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 22100191  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22100190 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22100092  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||| |    
T  22100091 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgag 22099992  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| | ||    
T  22099991 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacaaccat 22099892  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22099891 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22099792  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22099791 ggattt 22099786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40041858 - 40042360
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  40041858 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 40041956  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  40041957 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 40042055  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  40042056 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 40042155  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40042156 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40042255  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40042256 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40042354  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40042355 ggattt 40042360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40052407 - 40052909
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  40052407 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 40052505  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  40052506 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 40052604  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  40052605 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 40052704  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40052705 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40052804  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40052805 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40052903  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40052904 ggattt 40052909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 17960473 - 17960976
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  17960473 caaaggctactcaagttatttcaatagatcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 17960571  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  17960572 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatccgaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 17960670  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  17960671 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 17960770  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||    
T  17960771 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccat 17960870  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17960871 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17960970  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  17960971 ggattt 17960976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 167433 - 166930
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||  |||    
T  167433 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaac-tgc 167335  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  167334 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 167236  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  167235 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 167136  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  167135 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 167036  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  167035 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 166936  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  166935 ggattt 166930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 178025 - 177522
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||  |||    
T  178025 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaac-tgc 177927  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  177926 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcattatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taat 177828  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  177827 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 177728  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  177727 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 177628  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  177627 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 177528  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  177527 ggattt 177522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5686053 - 5685567
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  5686053 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 5685955  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                 ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||      
T  5685954 ttctgaagtgatgacgtcatcagaag-----------------caaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taaa 5685873  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  5685872 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 5685773  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5685772 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 5685673  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5685672 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 5685573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 514
Target Start/End: Original strand, 8001812 - 8002316
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaaga-aaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  |||| |||||||| | | ||| ||    
T  8001812 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagctaaactgctcctgaagct-aaactg 8001910  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  8001911 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 8002009  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    || |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||     
T  8002010 tccaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactga 8002109  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  8002110 gcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 8002209  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  8002210 tgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatca 8002309  T
Q  508 aaggatt 514  Q
    |||||||    
T  8002310 aaggatt 8002316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 514
Target Start/End: Original strand, 8012457 - 8012961
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaaga-aaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  |||| |||||||| | | ||| ||    
T  8012457 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagctaaactgctcctgaagct-aaactg 8012555  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  8012556 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taa 8012654  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    || |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||     
T  8012655 tccaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactga 8012754  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  8012755 gcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 8012854  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  8012855 tgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatca 8012954  T
Q  508 aaggatt 514  Q
    |||||||    
T  8012955 aaggatt 8012961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11005753 - 11005233
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  11005753 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 11005655  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca--aagt---------------ttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||               |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  11005654 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcta 11005555  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  11005554 catttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggat 11005456  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaa 392  Q
    || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11005455 atatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaa 11005356  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11005355 gacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatc 11005256  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  11005255 actggtggataatcaaaggattt 11005233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 143 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 541505 - 541133
Alignment:
Q  143 gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcat 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  541505 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaa 541407  T
Q  243 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagt 342  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  541406 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagt 541307  T
Q  343 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  541306 acaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaat 541207  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  541206 gaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggattt 541133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18441629 - 18441249
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  18441629 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 18441532  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | || ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||     
T  18441531 ggagttgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttat 18441433  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  18441432 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 18441334  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18441333 ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 18441249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 30050078 - 30049571
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  | ||||||||||||    
T  30050078 agtcaagtaatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaat-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgga-gtgcttctgaag 30049981  T
Q  119 tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||                ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30049980 tgatgaggtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcataagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatc 30049881  T
Q  203 catatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 302  Q
    | || | | |||||| |||  |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |    
T  30049880 cgtaaatttaaactggagattcaaattagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacagtcatttggaga 30049781  T
Q  303 gctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-aca 401  Q
       ||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30049780 aaactaagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaa 30049681  T
Q  402 acagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtgga 501  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30049680 acagccatgcctgcagaa-atgttcattcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaa 30049582  T
Q  502 tgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||    
T  30049581 tgatcaaagga 30049571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 121 - 512
Target Start/End: Original strand, 40054612 - 40055001
Alignment:
Q  121 atgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaag 220  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  || | | |||||| ||    
T  40054612 atgacgtcatcataagcagaagcccatcagaagcaaggttt--catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactggag 40054709  T
Q  221 aaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtcct 320  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||    
T  40054710 attcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcct 40054809  T
Q  321 tcgttaacagagttgactaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  40054810 tctttaacagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcataa 40054909  T
Q  420 tatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40054910 -atgttccttcaagataggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 40055001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 26389959 - 26390348
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  26389959 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 26390057  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  26390058 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 26390157  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  26390158 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 26390257  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  26390258 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 26390348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24735190 - 24734801
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  24735190 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 24735092  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  || ||    
T  24735091 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 24734992  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  24734991 attagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 24734892  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24734891 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 24734801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24745137 - 24744748
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  24745137 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 24745039  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  || ||    
T  24745038 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcatt 24744939  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  24744938 attagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 24744839  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24744838 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 24744748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 26400601 - 26400990
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  26400601 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaaactgaagattca 26400699  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  26400700 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 26400799  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  26400800 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 26400899  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  26400900 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 26400990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18419548 - 18419168
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  18419548 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 18419451  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | || ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||     
T  18419450 ggagttgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttat 18419352  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  18419351 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctcttcctgcagaa-atgttcc 18419253  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18419252 ttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 18419168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 26209393 - 26209795
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  26209393 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 26209490  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26209491 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagc 26209589  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26209590 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaaca 26209688  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26209689 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatga 26209787  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  26209788 tcaaagga 26209795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1988127 - 1987588
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||         
T  1988127 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 1988028  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat------------ca-- 180  Q
               | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||            ||      
T  1988027 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcatcagaagcaat 1987928  T
Q  181 ----tcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaa 276  Q
        ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1987927 attttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaa 1987829  T
Q  277 gggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987828 gggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 1987729  T
Q  377 tt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacc 474  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1987728 ttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacc 1987629  T
Q  475 caaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1987628 caaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggattt 1987588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1998748 - 1998209
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||         
T  1998748 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 1998649  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat------------ca-- 180  Q
               | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||            ||      
T  1998648 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcatcagaagcaat 1998549  T
Q  181 ----tcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaa 276  Q
        ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1998548 attttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaa 1998450  T
Q  277 gggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998449 gggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 1998350  T
Q  377 tt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacc 474  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1998349 ttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacc 1998250  T
Q  475 caaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1998249 caaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggattt 1998209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13682776 - 13682374
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  13682776 aagtgcctctgaagtgatgacgtcattagaagcagaagttcatcagaagcaaaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 13682679  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | |    
T  13682678 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaatc 13682580  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   |||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13682579 actgggtgcttgtccttctctga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaaca 13682481  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13682480 gctattcctgcagaa-atgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttaatccttcacaagactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatga 13682382  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  13682381 tcaaagga 13682374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 451
Target Start/End: Original strand, 38593578 - 38593921
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  |    
T  38593578 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagt 38593676  T
Q  206 atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagct 305  Q
    | | | | | || |||  ||||||||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  38593677 aaatttatattggagattcaaagtagctggttcttgtttcaacctcgtctaataagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagca 38593776  T
Q  306 ctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacag 405  Q
    ||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38593777 ctgagtacttgtccttctttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagataacag 38593876  T
Q  406 ctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 451  Q
      |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38593877 tcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 38593921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 3476239 - 3476587
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||   ||||| |||||||| |||||  |  ||  ||||| ||    
T  3476239 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcattatattctcgtctaa-aa 3476337  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3476338 gaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 3476436  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 460  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  3476437 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatcctt 3476535  T
Q  461 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3476536 cacaggactacacccaaatcaggcaaaggattaatggtggatgatcaaagga 3476587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42866414 - 42865875
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||         
T  42866414 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 42866315  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat------------ca-- 180  Q
               | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||            ||      
T  42866314 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcatcagaagcaat 42866215  T
Q  181 ----tcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaa 276  Q
        ||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42866214 attttcaccagaagctacatttgattctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaa 42866116  T
Q  277 gggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42866115 gggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 42866016  T
Q  377 tt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacc 474  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42866015 ttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacc 42865916  T
Q  475 caaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  42865915 caaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggattt 42865875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42877040 - 42876501
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||         
T  42877040 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 42876941  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatat------------ca-- 180  Q
               | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||            ||      
T  42876940 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcatcagaagcaat 42876841  T
Q  181 ----tcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaa 276  Q
        ||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42876840 attttcaccagaagctacatttgattctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaa 42876742  T
Q  277 gggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876741 gggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 42876642  T
Q  377 tt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacc 474  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42876641 ttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacc 42876542  T
Q  475 caaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  42876541 caaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggattt 42876501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29590448 - 29590046
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  29590448 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 29590351  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
     | | | |||||||||   ||||| || ||||| || ||| || ||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||    
T  29590350 gacatttaaactgaagtttcaaaggagttgtttttcgttttaatctcgtctaa-aagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagc 29590252  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29590251 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 29590153  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29590152 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcatatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatga 29590054  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  29590053 tcaaagga 29590046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8933976 - 8933634
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  8933976 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 8933879  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||    || | |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8933878 taaatttaaactgaagttttaatggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagc 8933780  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8933779 actgggtgcttgtccttctttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 8933680  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 451  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8933679 gctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaag 8933634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 105 - 407
Target Start/End: Original strand, 6044055 - 6044354
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||      
T  6044055 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcacaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcag 6044152  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  6044153 taaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaggc 6044251  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6044252 actgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 6044351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15216772 - 15216370
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  15216772 aagtgcctctgaagtgatgacgtcattagaagcagaagtccatcagaagcgaaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 15216675  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||| ||| || ||| || ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  15216674 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctatttttcgttttaatctcgtttaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggccatttgagaagc 15216576  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15216575 actgggtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaaca 15216477  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  15216476 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatctgtcataggactacacccaaatcaggcaatagattactggtgaatga 15216378  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  15216377 tcaaagga 15216370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 12734011 - 12734413
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||     
T  12734011 aagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagtc---catcagaagctatatcatcaccataagctatagttgatca 12734107  T
Q  204 atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12734108 gtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaag 12734206  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| |   |||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12734207 cactgggtgcttgtccttctctga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacgctataagacaagacaac 12734305  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    | || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  12734306 aactctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaataaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaagagattactggtggatg 12734404  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  12734405 atcaaagga 12734413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 291
Target Start/End: Original strand, 26290100 - 26290378
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  26290100 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 26290198  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | || |    
T  26290199 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcc-tttaat 26290297  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26290298 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 26290378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 23264341 - 23264573
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  23264341 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaac-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 23264438  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  23264439 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 23264537  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttca 246  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  23264538 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattca 23264573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 515
Target Start/End: Original strand, 26294064 - 26294281
Alignment:
Q  299 gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaa 397  Q
    |||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26294064 gatagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaa 26294163  T
Q  398 gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactgg 497  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26294164 aacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgg 26294263  T
Q  498 tggatgatcaaaggattt 515  Q
    || || ||||||||||||    
T  26294264 tgtataatcaaaggattt 26294281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 161 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 48382548 - 48382304
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  || | | |||||||||   ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||     
T  48382548 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgctcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga- 48382450  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  48382449 gaacgaagaattaaaagggatgtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccgcta 48382350  T
Q  361 cctccactactctgt-ttttgtccacgctacaagacaagacaacag 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48382349 cctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaagacaacag 48382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 24882485 - 24882667
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  24882485 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttcct 24882583  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24882584 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 24882667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 9261512 - 9261720
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  9261512 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagtgc 9261610  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  9261611 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 9261709  T
Q  211 caaactgaaga 221  Q
    |||||||||||    
T  9261710 caaactgaaga 9261720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 387 - 512
Target Start/End: Original strand, 38403331 - 38403455
Alignment:
Q  387 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38403331 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 38403429  T
Q  487 aggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  38403430 aagattactggtggatgatcaaagga 38403455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 8998998 - 8999155
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  8998998 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 8999096  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  8999097 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 8999155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 487
Target Start/End: Original strand, 11087110 - 11087265
Alignment:
Q  331 agttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttc 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||     
T  11087110 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacactacaagacaagataacagctctgcctgcataa-atgttccttt 11087208  T
Q  431 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  11087209 aagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 11087265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 26389810 - 26389940
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  26389810 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 26389908  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26389909 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaa 26389940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 26400452 - 26400582
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  26400452 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 26400550  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26400551 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaa 26400582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19193356 - 19193262
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19193356 aagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagc--agaatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgat 19193262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 589798 - 589691
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  589798 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 589699  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  589698 ttctgaag 589691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 15888027 - 15888133
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||| | | |||||||    
T  15888027 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaaaaatggaaagc-aaaagaattctaagcatctgaaggaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 15888125  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  15888126 ttctgaag 15888133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 270
Target Start/End: Original strand, 22494043 - 22494169
Alignment:
Q  143 gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcat 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || | ||||| ||||  ||||||||||| ||||||     
T  22494043 gtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaattaaactaaagattcaaagtagctgattctcaa 22494141  T
Q  243 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaa 270  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22494142 ttcagtcttatccaagaagaacgaagaa 22494169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 13174668 - 13174827
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | || || |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||      
T  13174668 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtctctacactacaagacaagaaaaacagctttgcatgcagaa-atgtta 13174766  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  13174767 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 13174827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44467099 - 44467027
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44467099 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 44467027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 602796 - 602654
Alignment:
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatt 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||  |  ||||| |||    
T  602796 gtacaaccacttcctccactactctgttctttgtctacgctacaggacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccctcaaattcagaatggatt 602698  T
Q  447 tgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    ||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  602697 tgaaatcaattcttcataggactatatccaaatcaggcaaagga 602654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 24244200 - 24244307
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | | |||||    
T  24244200 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttatagtgc 24244299  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  24244300 ttctgaag 24244307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10561298 - 10561220
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  10561298 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 10561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 23280081 - 23280224
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||    
T  23280081 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatg 23280179  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  23280180 catttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 23280224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 30944446 - 30944518
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30944446 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 30944518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 30945479 - 30945551
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30945479 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 30945551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 541608 - 541521
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  541608 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 541521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 22493940 - 22494027
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22493940 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 22494027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23649353 - 23649266
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  23649353 caaaggctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 23649266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24450769 - 24450682
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24450769 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 24450682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 45922150 - 45922237
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  45922150 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 45922237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1368197 - 1368120
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1368197 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 1368120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3166302 - 3166224
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  3166302 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 3166224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4821509 - 4821455
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4821509 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 4821455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9160297 - 9160220
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9160297 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 9160220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9170752 - 9170675
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9170752 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 9170675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9171553 - 9171476
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9171553 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 9171476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 16112007 - 16112112
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  16112007 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcataatgggaatgc 16112105  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  16112106 atttgaa 16112112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 21769675 - 21769752
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21769675 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 21769752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27871753 - 27871699
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  27871753 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 27871699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 33691835 - 33691940
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  33691835 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgg 33691933  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  33691934 atttgaa 33691940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 48237025 - 48237130
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  || ||||||     
T  48237025 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaataggaatgc 48237123  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  48237124 atttgaa 48237130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 21283496 - 21283568
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21283496 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 21283568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Original strand, 3476164 - 3476215
Alignment:
Q  101 ttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaa 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3476164 ttcaaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaa 3476215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8182965 - 8182911
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  8182965 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 8182911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9069597 - 9069543
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  9069597 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgctacaagacaaga 9069543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20311912 - 20311990
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  20311912 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 20311990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24788176 - 24788122
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  24788176 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 24788122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28409074 - 28409020
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  28409074 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 28409020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44281064 - 44280986
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  44281064 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttaagcatctgaagaaaac 44280986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 48382297 - 48382243
Alignment:
Q  458 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  48382297 cttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaagga 48382243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 9709676 - 9709756
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  9709676 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagc 9709756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14426582 - 14426545
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426582 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 14426545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 22578144 - 22578181
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578144 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 22578181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 24794838 - 24794891
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24794838 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 24794891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 25201426 - 25201475
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25201426 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagca 25201475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Original strand, 48805745 - 48805797
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  48805745 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaa 48805797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1293065 - 1292993
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1293065 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1292993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 2265642 - 2265713
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2265642 aagtgtacaaccactacctccactgctctg-ttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 2265713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 4494612 - 4494540
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  4494612 aagtgtacaaccgctacctccactactctctttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 4494540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 21381296 - 21381359
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381296 aagcgtctgaagaaaagtgctcctaaagt-caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 21381359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 24882248 - 24882359
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24882248 aagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagttcatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaag 24882347  T
Q  191 ctacatttgatc 202  Q
    ||||| ||||||    
T  24882348 ctacagttgatc 24882359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 450
Target Start/End: Original strand, 28622481 - 28622584
Alignment:
Q  347 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaat 445  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| ||    
T  28622481 gtgtacaaccactacctctacttctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcat 28622579  T
Q  446 ttgaa 450  Q
    |||||    
T  28622580 ttgaa 28622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 35952811 - 35952883
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  35952811 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctctactacaagacaagaataacagctctgcctgca 35952883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14425707 - 14425672
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425707 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14425672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 25201316 - 25201421
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  25201316 caaaagctagtcaaataatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 25201413  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  25201414 ttctgaag 25201421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24735323 - 24735234
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24735323 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 24735234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24745270 - 24745181
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24745270 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 24745181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 48806002 - 48806056
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  48806002 aagtgtacaaccactacttccactactctgattttgtctctgctacaagacaaga 48806056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 4412088 - 4412157
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4412088 tgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctactacaagacaaggaaaacagctctgcctgca 4412157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14193149 - 14193112
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14193149 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtc 14193112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14193390 - 14193325
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14193390 aagcgtctgaagagaagcgctcctgaagacaaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 14193325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14425482 - 14425445
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14425482 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 14425445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14426829 - 14426765
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14426829 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 14426765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 19236886 - 19236919
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19236886 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19236919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 19237166 - 19237203
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19237166 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtc 19237203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 19339373 - 19339426
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  19339373 aagtgtacaaccactacctccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 19339426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21692322 - 21692269
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  21692322 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 21692269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 137
Target Start/End: Original strand, 24794631 - 24794664
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794631 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 24794664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27872010 - 27871945
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27872010 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtgtgaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagca 27871945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 399
Target Start/End: Original strand, 32264842 - 32264895
Alignment:
Q  346 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  32264842 agtgtacaaccagtacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 32264895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 331680 - 331608
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  331680 aagtgtacaaccactacctccactacacagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 331608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 9709925 - 9709997
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9709925 aagtgtaaaaccactacatccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 9709997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15467949 - 15467846
Alignment:
Q  347 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaat 445  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||| | ||||||| | |||||| |  |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  15467949 gtgtacaaccattacctccactactctgaatttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttacctgca-acgatgttccttcaaaatgggaatggat 15467851  T
Q  446 ttgaa 450  Q
    |||||    
T  15467850 ttgaa 15467846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 19711136 - 19711208
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19711136 aagtgtacaaccactatttccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 19711208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 30945237 - 30945296
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30945237 tctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 30945296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33605720 - 33605668
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  33605720 aagtgtacaaccactaccttcactactatgtttttgtctctgctacaagacaa 33605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 39284687 - 39284759
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  39284687 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctactacaggacaaagataacagctatgcctgca 39284759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 41842396 - 41842468
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  41842396 aagtgtacaaccactacctgcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 41842468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8183214 - 8183179
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8183214 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 8183179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9069849 - 9069814
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9069849 caaagtgcttctgaagtggtgacgtcatcagaagca 9069814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 378
Target Start/End: Original strand, 13894123 - 13894154
Alignment:
Q  347 gtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894123 gtgtacaaccactacctccactactctgtttt 13894154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 19339147 - 19339182
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19339147 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcctcagaagca 19339182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 38593471 - 38593545
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  38593471 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaac 38593545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4821758 - 4821707
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4821758 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcaaaagc--aaggtcatcagaagcaa 4821707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 6043951 - 6044020
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  6043951 agtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaac 6044020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Original strand, 7488023 - 7488061
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7488023 agtacaactgtacaaccactatctccactactctgtttt 7488061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13648983 - 13648949
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13648983 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 13648949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 16316680 - 16316734
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  16316680 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 16316734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28409323 - 28409289
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28409323 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 28409289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30026176 - 30026142
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30026176 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 30026142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 40054489 - 40054562
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  40054489 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaa 40054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48382619 - 48382569
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  48382619 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcaaaagttcatcagaagca 48382569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1776850 - 1776797
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1776850 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 1776797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 137
Target Start/End: Original strand, 2265423 - 2265456
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2265423 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc 2265456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 2913731 - 2913784
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  2913731 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 2913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Original strand, 4428944 - 4428996
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  4428944 caaaatgcttctgaagtgatgacatcatcagaagca-aagttcatcagaagcaa 4428996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 13137767 - 13137847
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||| |||||||    
T  13137767 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcttcaaaagctgaagatcaccagaagc 13137847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13880875 - 13880842
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13880875 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 13880842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15088790 - 15088757
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15088790 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15088757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24788394 - 24788361
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24788394 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 24788361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 136
Target Start/End: Original strand, 32264614 - 32264647
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32264614 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaag 32264647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 48062672 - 48062737
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  48062672 aagcgtctgaagaaaattgctcctgaagtgtgaagtgctcctgaagtgatgacgccatcagaagca 48062737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 923356 - 923308
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  923356 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 923308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4494757 - 4494725
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4494757 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 4494725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 12366871 - 12366943
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12366871 aagtatacaaccactacctccactaatcagtctgtgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 12366943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 13138018 - 13138090
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13138018 aagtgtacaaccactatctccattactcagtttatgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 13138090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 13172470 - 13172502
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13172470 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 13172502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13302845 - 13302773
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13302845 aagtgtacaaccactatcaccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 13302773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13880391 - 13880355
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13880391 tcaaagtgctcctgaagtgatgacatcatcagaagca 13880355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15468226 - 15468167
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| |||| ||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15468226 tctgaagaaaactgctcttgaaga-caaagtgctcttgaagtgatgacgtcatcagaagca 15468167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18419588 - 18419552
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18419588 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 18419552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21695436 - 21695364
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21695436 aagtgtacaaccagtacctcaactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 21695364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Original strand, 22577896 - 22577945
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  22577896 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcattagaagc--aaggtcatcagaagca 22577945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 29935481 - 29935553
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  29935481 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 29935553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 416
Target Start/End: Original strand, 48062947 - 48063015
Alignment:
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48062947 gtacaaccactatctccattactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 48063015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1750673 - 1750194
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1750673 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaatagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcagagtgc 1750575  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcta--tatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || ||||||||   | ||    
T  1750574 ttctgaagtgatgaagtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatatct-ta 1750476  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     || |||||||||   |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750475 atctaactgaagatttaaagtagctggttctcaactcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 1750376  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1750375 agcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagcta 1750276  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750275 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 1750194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19225529 - 19225010
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttca------ 104  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |          
T  19225529 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttatagtgt 19225430  T
Q  105 -----------aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  19225429 ttctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagcta 19225331  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225330 catttaatccatatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 19225231  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19225230 atttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaag 19225132  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19225131 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggacaacacccaaatcaggcaaaggatta 19225032  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  19225031 ctggtgaatgatcaaaggattt 19225010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 30314382 - 30314900
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||         
T  30314382 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaagtgct 30314481  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
               ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  30314482 tctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcaacagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctac 30314580  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30314581 atttaatccatatattcaaactgaagattcaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtca 30314680  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30314681 tttggatagcgcttagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaaga 30314779  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30314780 caagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattac 30314879  T
Q  495 tggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  30314880 tggtgaatgatcaaaggattt 30314900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19418836 - 19418429
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  19418836 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 19418738  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418737 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 19418638  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
      || | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19418637 attgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaaca 19418539  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19418538 gccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 19418439  T
Q  505 tcaaaggatt 514  Q
    ||||||||||    
T  19418438 tcaaaggatt 19418429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19429413 - 19429004
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  19429413 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccg 19429315  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19429314 taaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 19429215  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
      || | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19429214 attgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaac 19429115  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19429114 agccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatg 19429015  T
Q  504 atcaaaggatt 514  Q
    |||||||||||    
T  19429014 atcaaaggatt 19429004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 23469145 - 23469665
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| |   |||| | | |||||||    
T  23469145 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatttgaagaaaactgtgtctgaagcttaaagtgc 23469243  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa-----------------agtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||                 | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23469244 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttgt-catcagaagcgatatcatcaccagaagcta 23469342  T
Q  194 catttgatccatatact-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23469343 catttaatccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggt 23469442  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    |||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469443 catttggatagcactgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaa 23469542  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23469543 gacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagt 23469642  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23469643 actggtgaatgatcaaaggattt 23469665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 20161025 - 20161433
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20161025 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 20161123  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20161124 tatattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 20161223  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161224 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 20161322  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20161323 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 20161422  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  20161423 tcaaaggattt 20161433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20196442 - 20196034
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20196442 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatcca 20196344  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20196343 tatattcaaactaaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagc 20196244  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196243 gctgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 20196145  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20196144 gctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 20196045  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  20196044 tcaaaggattt 20196034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6318238 - 6318721
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  6318238 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcttggaagaacaatgaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttgaa-gtgc 6318335  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  6318336 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca------------------aggttttcatcagaagctatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 6318416  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  6318417 caatctgaagattcaaagtagctggttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtaccaacggtcatatggatagcactgag 6318516  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318517 catttgtccctcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 6318616  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6318617 cctgcataatttgtgtcctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggagtacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 6318716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 23456989 - 23457508
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| |   |||| | | |||||||    
T  23456989 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatttgaagaaaactgtgtctgaagcttaaagtgc 23457087  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa-----------------agtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||                 | ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  23457088 ttctgaagtgatgacgttatcagaagcagaagctcatcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttgt-catcataagcgatatcatcaccagaagcta 23457186  T
Q  194 catttgatccatatact-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23457187 catttaatccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggt 23457286  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    |||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23457287 catttggatagcactgagtatttttccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaa 23457385  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23457386 gacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagt 23457485  T
Q  493 actggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23457486 actggtgaatgatcaaaggattt 23457508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19139858 - 19139355
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19139858 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19139760  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  19139759 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 19139661  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  19139660 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 19139561  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19139560 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 19139461  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19139460 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 19139361  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  19139360 ggattt 19139355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31215626 - 31215091
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttca------ 104  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | | |          
T  31215626 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaagaattccaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttatagtgc 31215528  T
Q  105 -----------aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca----------------aagtttttcatcagaagctata 177  Q
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||                ||| |||||||||||||| |||    
T  31215527 ttctgaagctgaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgata 31215428  T
Q  178 tcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaag 277  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215427 tcatcaccagaagctacatttaatccataaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcttttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaag 31215328  T
Q  278 ggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 377  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215327 ggaggtatcaactgtcattt-gatagcactgagcatttgtccttcattaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 31215229  T
Q  378 ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaa 477  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215228 ttgtccacgctataagacaagacaacagctatgcctgcataatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaa 31215129  T
Q  478 atcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  31215128 atcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaagattt 31215091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3221211 - 3220707
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaa-gtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || |||    
T  3221211 caaaggctactcaaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtg 3221113  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  3221112 cttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taa 3221014  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||     
T  3221013 tcaaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaagtatcaacggatatatggatagcactga 3220914  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  3220913 gcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaagacaacagcca 3220814  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3220813 tgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 3220714  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  3220713 aggattt 3220707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26111809 - 26111307
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| | | || |||||    
T  26111809 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattataagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgct 26111711  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||    
T  26111710 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taatc 26111612  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  26111611 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 26111512  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  26111511 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacaacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatg 26111412  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  26111411 cctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 26111312  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  26111311 gattt 26111307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26121487 - 26120985
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || |||||    
T  26121487 aaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgct 26121389  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||    
T  26121388 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatc 26121290  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||    
T  26121289 aaactgaagattcaaagtagttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 26121190  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  26121189 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatg 26121090  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  26121089 cctgcagaatttgtacgttcaagatgggaataaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaag 26120990  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  26120989 gattt 26120985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 209856 - 210358
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  209856 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 209954  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  209955 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 210053  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  210054 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 210153  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  210154 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 210253  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  210254 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 210352  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  210353 ggattt 210358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 252986 - 252484
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  252986 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 252888  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  252887 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 252789  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  252788 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 252689  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  252688 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 252589  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  252588 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 252490  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  252489 ggattt 252484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 723479 - 723981
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  723479 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 723577  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  723578 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 723676  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  723677 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 723776  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  723777 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 723876  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  723877 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 723975  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  723976 ggattt 723981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 848670 - 849172
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  848670 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 848768  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  848769 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 848867  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  848868 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 848967  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  848968 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 849067  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  849068 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 849166  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  849167 ggattt 849172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 15791001 - 15791504
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  15791001 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 15791099  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  15791100 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 15791198  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||   ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  15791199 caaactgaagattcaaagtagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgag 15791298  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15791299 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 15791398  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15791399 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 15791498  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  15791499 ggattt 15791504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16747463 - 16747080
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| ||||    
T  16747463 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagtgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 16747365  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  16747364 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 16747265  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16747264 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgc 16747166  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16747165 cttcaagatggaaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 16747080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18158740 - 18158334
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||      
T  18158740 aagtgctcatgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaag-aaaggtttttatcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcag 18158642  T
Q  205 t-atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    | | | ||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18158641 taaaattcaaactgaagattcaaagtagatgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagag 18158542  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
      ||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18158541 aactgagtacttgtccttcgttaacggagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccactctacaagacaagacaac 18158442  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18158441 agctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatg 18158343  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  18158342 atcaaagga 18158334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18154329 - 18153815
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  18154329 caaaggcaagtcaagtaatttcaaaaggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatttaaa-catctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 18154233  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaa-----------------gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||    
T  18154232 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcataagcagaaggtcatcagaagcaaggttttttatcagaagcaaaatcatcaccagaagtta 18154133  T
Q  194 catttgatccat-atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    |||||||||  | | | ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154132 catttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 18154033  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    |||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154032 catttggagagcactgagtacttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 18153933  T
Q  393 gacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggact 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18153932 gacaagacaacagctatgcctgca-aat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 18153835  T
Q  493 actggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18153834 actggtggatgatcaaagga 18153815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36078514 - 36078010
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  36078514 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 36078416  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  36078415 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 36078317  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  36078316 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 36078217  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  36078216 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 36078117  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  36078116 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaa 36078017  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  36078016 aggattt 36078010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36089100 - 36088596
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  36089100 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 36089002  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  36089001 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 36088903  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  36088902 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 36088803  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  36088802 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 36088703  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  36088702 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaa 36088603  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  36088602 aggattt 36088596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 242401 - 241899
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  242401 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 242303  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  242302 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 242204  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||| |    
T  242203 caaactgaagattcaatgtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgag 242104  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  242103 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 242004  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  242003 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 241905  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  241904 ggattt 241899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 15780412 - 15780915
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  15780412 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 15780510  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  15780511 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 15780609  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    || ||||||||  ||||||||||   ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  15780610 catactgaagattcaaagtagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgag 15780709  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
     | |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15780710 tacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 15780809  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15780810 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 15780909  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  15780910 ggattt 15780915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 18768955 - 18769339
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||  |||    
T  18768955 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactgaagattcaa 18769053  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||| |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| | | |||||||||||||    
T  18769054 agtagttgtttaacatttcaacctcgtcttagaagaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtatttgtccttcgtta 18769153  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18769154 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagataagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 18769253  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18769254 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 18769339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29077308 - 29076806
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  29077308 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 29077210  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  29077209 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 29077111  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  29077110 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 29077011  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29077010 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 29076911  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  29076910 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 29076812  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  29076811 ggattt 29076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29087559 - 29087057
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  29087559 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 29087461  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  29087460 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 29087362  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  29087361 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 29087262  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29087261 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 29087162  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  29087161 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 29087063  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  29087062 ggattt 29087057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9341723 - 9341219
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  9341723 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 9341625  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  9341624 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaaatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 9341526  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  9341525 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 9341426  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9341425 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 9341326  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  9341325 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 9341226  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  9341225 aggattt 9341219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9856174 - 9856677
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||||| | | || ||||    
T  9856174 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaataaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9856272  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9856273 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9856371  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9856372 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggagatatcaacggatatatggatagcactgag 9856471  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9856472 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9856571  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9856572 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9856671  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9856672 ggattt 9856677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18449948 - 18449445
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  18449948 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatgcaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 18449850  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  18449849 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 18449751  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  18449750 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcctattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 18449651  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18449650 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 18449551  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  18449550 gcctgcagaatttgtacactcaaaatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 18449451  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  18449450 ggattt 18449445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 32087972 - 32088474
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  32087972 caaaggctacttaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 32088070  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  32088071 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 32088169  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  32088170 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 32088269  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32088270 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 32088369  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32088370 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 32088468  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  32088469 ggattt 32088474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6151649 - 6151145
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6151649 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatttgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6151551  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6151550 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6151452  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  6151451 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactga 6151352  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6151351 gcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 6151252  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  6151251 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 6151152  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  6151151 aggattt 6151145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6161603 - 6161100
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6161603 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6161505  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6161504 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6161406  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6161405 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6161306  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | ||    
T  6161305 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaaacaaaacaacaaccat 6161206  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6161205 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 6161106  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  6161105 ggattt 6161100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 32077399 - 32077901
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  32077399 caaaggctacttaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 32077497  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  32077498 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 32077596  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  32077597 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 32077696  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32077697 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 32077796  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  32077797 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaa 32077895  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  32077896 ggattt 32077901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43248895 - 43248401
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  43248895 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 43248797  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  43248796 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 43248698  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  43248697 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 43248598  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  43248597 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaacca---------ctactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 43248507  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  43248506 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 43248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19129308 - 19128823
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  19129308 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 19129210  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||                  | |||||||| | || |    
T  19129209 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcta------------------cgtttgatcctt-taat 19129129  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  19129128 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattctgtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 19129029  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19129028 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 19128929  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  19128928 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtggataatcaaa 19128829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 124 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36293385 - 36292994
Alignment:
Q  124 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||      
T  36293385 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagatt 36293287  T
Q  224 caaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcg 323  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||    
T  36293286 caaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcg 36293187  T
Q  324 ttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatat 422  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  36293186 ttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattt 36293087  T
Q  423 gtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36293086 gtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 36292994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 124 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36303988 - 36303597
Alignment:
Q  124 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||      
T  36303988 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagatt 36303890  T
Q  224 caaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcg 323  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||    
T  36303889 caaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcg 36303790  T
Q  324 ttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatat 422  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  36303789 ttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattt 36303690  T
Q  423 gtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36303689 gtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 36303597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9368867 - 9368363
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |     |       
T  9368867 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagagatgacgt 9368768  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    | || ||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  9368767 catcagaagc-agaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 9368670  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  9368669 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 9368570  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9368569 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 9368470  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  9368469 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 9368370  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  9368369 aggattt 9368363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 3348443 - 3348832
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||| |||||||  ||    
T  3348443 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaatctgaagattca 3348541  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  3348542 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 3348641  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  3348642 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 3348741  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  3348742 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 3348832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Original strand, 3359040 - 3359429
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||| |||||||  ||    
T  3359040 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taatcaatctgaagattca 3359138  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||  |||||  |||||    
T  3359139 aagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgtt 3359238  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  3359239 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 3359338  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  3359339 acactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 3359429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3844004 - 3843602
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  3844004 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 3843907  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3843906 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagc 3843808  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3843807 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 3843709  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3843708 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatga 3843610  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  3843609 tcaaagga 3843602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44481681 - 44481166
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttc------- 103  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||           
T  44481681 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 44481582  T
Q  104 ---------aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
             ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||     
T  44481581 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaa 44481482  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44481481 atttgatcc-tttaatcaaactgaaga--gaaagttgctgattctcaattcagtcttatc---aaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggata 44481388  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaag 393  Q
    | |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44481387 tatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaag 44481288  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44481287 acaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatca 44481188  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  44481187 ctggtggataatcaaaggattt 44481166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44492297 - 44491782
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttc------- 103  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||           
T  44492297 caaaagctactcaagttattttgataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctcaactgct 44492198  T
Q  104 ---------aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
             ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||     
T  44492197 cctgaagctaaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaa 44492098  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44492097 atttgatcc-tttaatcaaactgaaga--gaaagttgctgattctcaattcagtcttatc---aaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggata 44492004  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaag 393  Q
    | |||| ||| || |||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44492003 tatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaag 44491904  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44491903 acaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatca 44491804  T
Q  494 ctggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  44491803 ctggtggataatcaaaggattt 44491782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 145 - 512
Target Start/End: Original strand, 40213006 - 40213371
Alignment:
Q  145 catcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcattt 244  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  |  | | |||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  40213006 catcagaagcaaggttt--catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgtttctcgttt 40213103  T
Q  245 caaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaa-gta 343  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  40213104 caacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggccgtttgaagagcactgcgtacttgtccttctttaacagagttgacaaaagta 40213203  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40213204 caagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatga 40213302  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40213303 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaagga 40213371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 285 - 515
Target Start/End: Original strand, 30325227 - 30325456
Alignment:
Q  285 tcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcca 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30325227 tcaacggtcatttggatagcgcttagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtcct 30325325  T
Q  385 cgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325326 cgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 30325425  T
Q  485 aaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30325426 aaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 30325456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 163 - 502
Target Start/End: Original strand, 6576373 - 6576712
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 262  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||   ||||| ||||  |||||| |||||||    
T  6576373 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagtagctaactctcaattcagtcttatccaagaaga 6576471  T
Q  263 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6576472 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 6576571  T
Q  363 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6576572 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttc 6576671  T
Q  462 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6576672 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggat 6576712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Original strand, 13688401 - 13688773
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  13688401 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 13688499  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  13688500 tcagtcttatcaaagaaggacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 13688599  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  13688600 caagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 13688699  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  13688700 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 13688773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 20259416 - 20259818
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||       
T  20259416 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgattag 20259513  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20259514 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagc 20259612  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  20259613 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaaca 20259711  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20259712 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaattcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatga 20259810  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  20259811 tcaaagga 20259818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 21046046 - 21046448
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||       
T  21046046 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgattag 21046143  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21046144 taaatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagc 21046242  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| |   ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21046243 actgggtgcttgtccttcattga-agagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaaca 21046341  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  21046342 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaattcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatga 21046440  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  21046441 tcaaagga 21046448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28691476 - 28691189
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | || ||||    
T  28691476 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaaa-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctgaa-gtgc 28691379  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  28691378 atctgaagtgatgacatcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaaggt--catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaatt 28691281  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 302  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28691280 caaactgaagatctaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata 28691189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23371039 - 23370633
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23371039 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagt 23370940  T
Q  198 tgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 297  Q
    |||||  || | | ||||||||    ||||| |||||||| || ||| | ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23370939 tgatcagtaaatttaaactgaaatttcaaaggagctgtttttcgttttatcctcatctgagaa-aacgaagaattaaaagggaggtaccaacggtcattt 23370841  T
Q  298 ggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    | | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  23370840 gaaaagcactgggtgcttgtccttctttga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt-----ctacaagacaa 23370747  T
Q  398 gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactgg 497  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||  ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  23370746 gacaacacctctgcctacagaa-atgttcctttaagataggaatgaattcaaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggaaaaagattactgg 23370648  T
Q  498 tggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||    
T  23370647 tggatgatcaaagga 23370633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 30324996 - 30325231
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  30324996 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagtgc 30325094  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  30325095 atctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtaatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatatt 30325193  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaac 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30325194 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaac 30325231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 16436764 - 16437026
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  16436764 caaaagcttgtcaagcaatttcaataggtcttggaagaacaataaaaagcaaaa-gaattccaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 16436861  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  | |    
T  16436862 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatccct-caat 16436959  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaag 277  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16436960 caaactgaagattcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaag 16437026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 7018400 - 7018582
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  7018400 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttcct 7018498  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  7018499 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 7018582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 22135877 - 22136059
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22135877 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 22135975  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22135976 tcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 22136059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 22167042 - 22167224
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22167042 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagataagataacagctttgcctgcagaat-tgttcct 22167140  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22167141 tcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 22167224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 22211407 - 22211589
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  22211407 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagccctgcctgcagaat-tgttcct 22211505  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22211506 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 22211589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 795771 - 795586
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  795771 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 795673  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatt 197  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  795672 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatt 795586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 368 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 795401 - 795254
Alignment:
Q  368 tactctgtttttg-tccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagg 466  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  795401 tactctgttttcggtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaagg 795303  T
Q  467 actacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  795302 actacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 23271223 - 23271405
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||    
T  23271223 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgcctgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 23271321  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  23271322 ttcaagataggaatggatttgaatttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaagg 23271405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28903507 - 28903349
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  28903507 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactagctccactactctg-ttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 28903410  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  28903409 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 28903349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 8032081 - 8031923
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||| ||    
T  8032081 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaa-atgttcc 8031983  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  8031982 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 8031923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19461445 - 19461051
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19461445 aagtgcctctgaagtaatgacatcatcagaagccaaaactcatcagaagcaaagttcatcagaagcaacttcattagaagctatatcatcaccagaagct 19461346  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgt-ttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    ||| ||||||   | | |||| ||||||   ||||  |||||| || | | || |||||  |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  |||||     
T  19461345 acagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaag-agagcgaaggattaaaagggaggtgccaacgt 19461247  T
Q  292 tcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctaca 391  Q
    ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| |    
T  19461246 tcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctata 19461148  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagg 489  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||  | || ||||| ||||| ||| || |||||| ||||||    
T  19461147 agacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaatataggaatagatttgaacttgatccttcataggacaacatcccaatcagacaaagg 19461051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19559123 - 19558729
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19559123 aagtgcctctgaagtaatgacatcatcagaagccaaaactcatcagaagcaaagttcatcagaagcaacttcattagaagctatatcatcaccagaagct 19559024  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgt-ttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    ||| ||||||   | | |||| ||||||   ||||  |||||| || | | || |||||  |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  |||||     
T  19559023 acagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaag-agagcgaaggattaaaagggaggtgccaacgt 19558925  T
Q  292 tcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctaca 391  Q
    ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| |    
T  19558924 tcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctata 19558826  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagg 489  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||  | || ||||| ||||| ||| || |||||| ||||||    
T  19558825 agacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaatataggaatagatttgaacttgatccttcataggacaacatcccaatcagacaaagg 19558729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 40003277 - 40003118
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  40003277 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgactgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 40003179  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  40003178 cttcaagataggaatggatttgaacgtaattcttcttaggacaacatccaaatcagacaaa 40003118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 3348307 - 3348455
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-----ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||     |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||    
T  3348307 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aa 3348405  T
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3348406 actgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 3348455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 3358904 - 3359052
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-----ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa 105  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||     |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||    
T  3358904 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aa 3359002  T
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359003 actgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 3359052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 6576258 - 6576384
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |  ||||||    
T  6576258 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagct-gaagtgc 6576356  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576357 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 6576384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 345 - 509
Target Start/End: Original strand, 15425273 - 15425437
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  15425273 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgc 15425371  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  15425372 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaggatcattggtgaatgatcaaa 15425437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 17519161 - 17519320
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |    
T  17519161 agagttaacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaa-atgttc 17519259  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  17519260 cttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 17519320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 490
Target Start/End: Original strand, 15336208 - 15336353
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  15336208 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgc 15336306  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||    
T  15336307 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaagga 15336353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 490
Target Start/End: Original strand, 15516577 - 15516722
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  15516577 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgc 15516675  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||    
T  15516676 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaagga 15516722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 22135657 - 22135752
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22135657 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaa--gatttcatcagaagctatatcatcaccagaagttacagttgatc 22135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21540997 - 21540841
Alignment:
Q  332 gttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  21540997 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttcctt 21540899  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  21540898 cagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 21540841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29379626 - 29379486
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||| |    
T  29379626 agagttgacaaagtagaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcagaa-atgttc 29379528  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggac 468  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||||    
T  29379527 cttcaggataggaatggatttgaacataatccttcataggac 29379486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 45568021 - 45568163
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| || |||  || ||||||     
T  45568021 aagtgtacgaccactaccttcactactctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccctcagaataggaatgg 45568119  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  45568120 atttgaatgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 45568163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16747611 - 16747534
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16747611 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatctgaagaaaac 16747534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Original strand, 13596380 - 13596496
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  13596380 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcc-tttaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 13596478  T
Q  244 tcaaccttatctaagaag 261  Q
    |||  |||||| ||||||    
T  13596479 tcagtcttatcaaagaag 13596496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 13430748 - 13430820
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13430748 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 13430820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 45538559 - 45538631
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  45538559 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 45538631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 13596213 - 13596300
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  13596213 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 13596300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 13688234 - 13688321
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  13688234 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 13688321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 22166806 - 22166861
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22166806 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 22166861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 22211186 - 22211274
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22211186 aagtgcctctgaaatgatgacgtcatcagaagtagaagttcatcagaagcaa--gaattcatcagaagctatatcatcaccagaagctaca 22211274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 13596326 - 13596390
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc 173  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13596326 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc-aatattttcatcagaagc 13596390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 23185346 - 23185489
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag--acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  | ||||||| | |||||| || |||| ||||||  |||||||||    
T  23185346 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctcttcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatg 23185444  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  23185445 catttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 23185489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36105226 - 36105154
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36105226 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36105154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21932914 - 21932772
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  21932914 aagtgtacaaccactacctccactactcagtgtttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgg 21932816  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  21932815 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 21932772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23783812 - 23783757
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23783812 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtt 23783757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 26734709 - 26734806
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||||    
T  26734709 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgaag 26734806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1237668 - 1237563
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  1237668 aagtgtacaaccactacctccactactctgttgttgtctctgctacaagagaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgc 1237570  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  1237569 atttgaa 1237563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6407757 - 6407703
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6407757 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 6407703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16207337 - 16207283
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16207337 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16207283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17797453 - 17797399
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  17797453 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctataagacaaga 17797399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19418946 - 19418869
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  19418946 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttagaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 19418869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20160915 - 20160993
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  20160915 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttaagcatctgaagaaaac 20160993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20196552 - 20196474
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  20196552 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttaagcatctgaagaaaac 20196474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Original strand, 23269688 - 23269738
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23269688 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcggaagca 23269738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 14989574 - 14989643
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14989574 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 14989643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19429518 - 19429446
Alignment:
Q  16 gctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  19429518 gctagtcaagtaatttcaataggtcttagaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 19429446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43774150 - 43774098
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  43774150 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaa 43774098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19943266 - 19943194
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19943266 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttggtctctcctacaagacaagaaaaccagctctgcctgca 19943194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 7018236 - 7018275
Alignment:
Q  163 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7018236 tcatcagaagctatatcatcaccagaatctacagttgatc 7018275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 399
Target Start/End: Original strand, 18151769 - 18151820
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18151769 tgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 18151820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Original strand, 23579577 - 23579660
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctc 94  Q
    |||||| || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  23579577 caaaggttactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctc 23579660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9320599 - 9320546
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  9320599 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 9320546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18158849 - 18158772
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  18158849 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggactttaaagcatctgaagaaaac 18158772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21288659 - 21288625
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288659 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 21288625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22673809 - 22673755
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  22673809 aagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaaga 22673755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24551305 - 24551251
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||    
T  24551305 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctactacaagacaaga 24551251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26833072 - 26833034
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26833072 agtataagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 26833034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 30421549 - 30421603
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  30421549 aagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgcaacaagacaaga 30421603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36105491 - 36105440
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36105491 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 36105440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Original strand, 40845258 - 40845309
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  40845258 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 40845309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 40845507 - 40845561
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  40845507 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagagaaga 40845561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Original strand, 7018198 - 7018246
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7018198 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcag-aagtcatcagaagc 7018246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 17441663 - 17441727
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17441663 aagcgtctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 17441727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 18121235 - 18121331
Alignment:
Q  354 accactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  18121235 accactacctcaactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaa 18121331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23339470 - 23339397
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaag 84  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||    
T  23339470 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaag 23339397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43639814 - 43639741
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43639814 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 43639741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18680082 - 18680046
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18680082 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 18680046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 18768916 - 18768952
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768916 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 18768952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23380805 - 23380769
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23380805 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 23380769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23783742 - 23783702
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23783742 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 23783702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24646617 - 24646585
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24646617 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 24646585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39693566 - 39693494
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39693566 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 39693494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1745417 - 1745382
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1745417 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 1745382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 15969130 - 15969177
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaa 58  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15969130 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaa 15969177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 18151550 - 18151585
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18151550 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 18151585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 132
Target Start/End: Original strand, 20255408 - 20255466
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatca 132  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20255408 aagcgtctgaagagaactgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatca 20255466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22663412 - 22663377
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22663412 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 22663377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 23269579 - 23269684
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  23269579 caaaggcaagtcaataaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 23269676  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  23269677 ttctgaag 23269684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 24832941 - 24832976
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24832941 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 24832976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 36293480 - 36293425
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag 66  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36293480 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaag 36293425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 36304083 - 36304028
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag 66  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36304083 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaag 36304028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 602840 - 602894
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  602840 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 602894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2811094 - 2811052
Alignment:
Q  113 ctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2811094 ctgaagtgatgacgtcatcagaagctgaagctcatcagaagca 2811052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3833224 - 3833174
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  3833224 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagca 3833174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19707809 - 19707750
Alignment:
Q  77 atctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707809 atctgaagaaaagtgctcctgaagtt--aagtgctcctgaagtgatgacatcatcagaagca 19707750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 22623069 - 22623130
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22623069 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaagaatccaaagcatctgaagaaaac 22623130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24551570 - 24551536
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24551570 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc 24551536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29693596 - 29693562
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29693596 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 29693562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 43644927 - 43644857
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagaca-agacaacagctatgcctg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  43644927 aagtgtacaaccactacctccactactcggtttgtgtctctgctacaggacagagataacaactatgcctg 43644857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 18321045 - 18321078
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18321045 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 18321078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 18685517 - 18685550
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18685517 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18685550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 18722766 - 18722799
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18722766 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18722799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 18731111 - 18731144
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18731111 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18731144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19156493 - 19156429
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19156493 aagcgtctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacatcatcagaagca 19156429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 19956222 - 19956255
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19956222 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19956255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 20382236 - 20382300
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20382236 aagcgtctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcaaaagca 20382300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21301053 - 21301000
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  21301053 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 21301000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Original strand, 22166876 - 22166917
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22166876 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagttacagttgatc 22166917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24646369 - 24646316
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  24646369 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 24646316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 31043308 - 31043361
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31043308 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 31043361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Original strand, 40212955 - 40213004
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtga-tgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40212955 agtgcttctgaagtaaatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagc 40213004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 602606 - 602638
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  602606 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 602638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3844295 - 3844259
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3844295 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 3844259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 15335931 - 15335963
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15335931 agtgcttctgaaatgatgacgtcatcagaagca 15335963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 15424996 - 15425028
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15424996 agtgcttctgaaatgatgacgtcatcagaagca 15425028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 15516300 - 15516332
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15516300 agtgcttctgaaatgatgacgtcatcagaagca 15516332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17267754 - 17267718
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17267754 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgttattagaagca 17267718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17688018 - 17687986
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17688018 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 17687986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17797731 - 17797652
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  17797731 aagcatctgaa-aaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaaatggtgacgtcatcagaagc--aaattcatcagaagcaa 17797652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21288434 - 21288362
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21288434 aagtgtacaaccactacttccactactttgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 21288362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22674056 - 22674024
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22674056 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 22674024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 23263732 - 23263768
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23263732 aagtgtacaaccactacctccactaccatgtttttgt 23263768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25164101 - 25164029
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  25164101 aagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtgtctctgctacaagacaagaataacagttatgcctgca 25164029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43645142 - 43645081
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43645142 aagcatctgaagaatagcgctcctgaagttta--gtgctcctgaagtgatgacgtcatcggaag 43645081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 45538295 - 45538358
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | | |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45538295 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaagat-aaagcgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagc 45538358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 174)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 18768577 - 18769092
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  18768577 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcaaag-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 18768675  T
Q  111 ttctgaag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatcta 193  Q
    ||||||||                 |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18768676 ttctgaagctgaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagcta 18768774  T
Q  194 catttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 293  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768775 catttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtc 18768874  T
Q  294 atttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag 393  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18768875 atttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaag 18768973  T
Q  394 acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggacta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18768974 acaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 18769073  T
Q  494 ctggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18769074 ctggtggatgatcaaagga 18769092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 105 - 515
Target Start/End: Original strand, 28721097 - 28721505
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  28721097 aagtgcatctggagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccg 28721195  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721196 taaattcaaactcaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 28721295  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721296 actgagtatctgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 28721394  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28721395 gctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatga 28721494  T
Q  505 tcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||    
T  28721495 tcaaaggattt 28721505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 21172269 - 21172655
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||| ||||    
T  21172269 tcatcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 21172367  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  21172368 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 21172467  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21172468 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagaatttgtgc 21172566  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  21172567 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggattt 21172655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 515
Target Start/End: Original strand, 28731581 - 28732091
Alignment:
Q  17 ctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctga 116  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||    
T  28731581 ctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacagtggaaagcaaag-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctga 28731679  T
Q  117 ag-----------------tgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttg 199  Q
    ||                 |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  28731680 agctgaagtgcatctggagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacattta 28731778  T
Q  200 atccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgg 299  Q
    |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28731779 atccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacatcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgg 28731878  T
Q  300 atagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28731879 atagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgt--aaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaga 28731975  T
Q  400 caacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtg 499  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28731976 caacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattcctcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtg 28732075  T
Q  500 gatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||||||||    
T  28732076 aatgatcaaaggattt 28732091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 7005494 - 7005997
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  7005494 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 7005592  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  7005593 ttctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 7005691  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  7005692 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcaatcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 7005791  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  7005792 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 7005891  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7005892 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 7005991  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  7005992 ggattt 7005997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 24414694 - 24415208
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaa----- 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||         
T  24414694 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaaagtgct 24414792  T
Q  106 -----------agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctac 194  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24414793 tctgaagctgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctac 24414891  T
Q  195 atttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    | |||||   || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24414892 aattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatca 24414991  T
Q  295 tttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24414992 tttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaaga 24415090  T
Q  395 caagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactac 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  24415091 caagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattac 24415190  T
Q  495 tggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  24415191 tggtgaatgatcaaagga 24415208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29244763 - 29244260
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  29244763 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 29244665  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  29244664 ttctgaagtgatgacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 29244566  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  29244565 caaactgaagattcaaagtaactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 29244466  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29244465 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 29244366  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29244365 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 29244266  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  29244265 ggattt 29244260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9897261 - 9897764
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9897261 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9897359  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9897360 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9897458  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9897459 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9897558  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9897559 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9897658  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9897659 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9897758  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9897759 ggattt 9897764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9907849 - 9908352
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9907849 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9907947  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9907948 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9908046  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9908047 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9908146  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9908147 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9908246  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9908247 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 9908346  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9908347 ggattt 9908352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29255342 - 29254839
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||| | | || ||||    
T  29255342 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctaaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 29255244  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  29255243 ttctgaagtgatgacatcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 29255145  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  29255144 caaactgaagattcaaagtaactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 29255045  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29255044 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 29254945  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29254944 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaa 29254845  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  29254844 ggattt 29254839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43093798 - 43093294
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  43093798 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 43093700  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| | || |    
T  43093699 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctt-taat 43093601  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||     
T  43093600 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactga 43093501  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  43093500 gcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtca 43093401  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43093400 tgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 43093301  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  43093300 aggattt 43093294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10267535 - 10267032
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  10267535 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 10267437  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  10267436 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 10267338  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  10267337 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 10267238  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  10267237 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 10267138  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  10267137 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 10267038  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  10267037 ggattt 10267032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10278112 - 10277609
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  10278112 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 10278014  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  10278013 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 10277915  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  10277914 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 10277815  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  10277814 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 10277715  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  10277714 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 10277615  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  10277614 ggattt 10277609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24327421 - 24327924
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||  ||||||| | | || ||||    
T  24327421 caaaagctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactactcctgaagctgaa-gtgc 24327519  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  24327520 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 24327618  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  24327619 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 24327718  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  24327719 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcat 24327818  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24327819 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 24327918  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24327919 ggattt 24327924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40222874 - 40222371
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  40222874 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 40222776  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  40222775 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 40222677  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  40222676 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 40222577  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40222576 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40222477  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40222476 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40222377  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40222376 ggattt 40222371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40251735 - 40251232
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  40251735 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 40251637  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  40251636 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 40251538  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  40251537 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 40251438  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40251437 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40251338  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40251337 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40251238  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40251237 ggattt 40251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 129 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2561913 - 2561529
Alignment:
Q  129 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2561913 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaag 2561815  T
Q  229 tagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaac 328  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2561814 tagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcacttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaac 2561715  T
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2561714 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcct 2561616  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2561615 tcaaagtgggaatgaatttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattt 2561529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43083189 - 43082685
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  43083189 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 43083091  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| | || |    
T  43083090 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcggaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctt-taat 43082992  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttggatagctctgt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||     
T  43082991 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactga 43082892  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| || ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43082891 gcacttatctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagcca 43082792  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43082791 tgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 43082692  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  43082691 aggattt 43082685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 17857124 - 17857627
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||| |||||| |||||||| | | || ||||    
T  17857124 caaaagctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattttgagcatctgaggaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 17857222  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  17857223 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 17857321  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  17857322 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 17857421  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  17857422 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 17857521  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17857522 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 17857621  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  17857622 ggattt 17857627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 21650219 - 21650721
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  21650219 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 21650317  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  21650318 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 21650416  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  21650417 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 21650516  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21650517 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 21650616  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21650617 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 21650715  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  21650716 ggattt 21650721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 22914551 - 22915054
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  22914551 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 22914649  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22914650 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22914748  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  22914749 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 22914848  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  22914849 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccat 22914948  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22914949 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22915048  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22915049 ggattt 22915054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43355563 - 43355061
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  43355563 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 43355465  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  43355464 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 43355366  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  43355365 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 43355266  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  43355265 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 43355166  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  43355165 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 43355067  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  43355066 ggattt 43355061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 11388495 - 11388999
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  11388495 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 11388593  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  11388594 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcaaaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 11388692  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  11388693 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 11388792  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  11388793 gcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 11388892  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  11388893 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 11388992  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  11388993 aggattt 11388999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9772993 - 9773496
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9772993 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9773091  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9773092 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9773190  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9773191 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9773290  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9773291 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9773390  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  9773391 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaa 9773490  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9773491 ggattt 9773496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 22960019 - 22960522
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  22960019 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 22960117  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  22960118 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 22960216  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  22960217 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 22960316  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  22960317 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccat 22960416  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22960417 gcctgcagaatttgtacactcaagatgagaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 22960516  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  22960517 ggattt 22960522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 24338091 - 24338594
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  24338091 caaaagctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 24338189  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  24338190 ttctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 24338288  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  || |    
T  24338289 caaactgatgattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcattgag 24338388  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24338389 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 24338488  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  24338489 gcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaa 24338588  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  24338589 ggattt 24338594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34478469 - 34477967
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  34478469 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 34478371  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  34478370 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 34478272  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  34478271 caaactgaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 34478172  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  34478171 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 34478072  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  34478071 gcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 34477973  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  34477972 ggattt 34477967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 34789904 - 34790407
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  34789904 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 34790002  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  34790003 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 34790101  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  34790102 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 34790201  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||    
T  34790202 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccat 34790301  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  34790302 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 34790401  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  34790402 ggattt 34790407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 34804047 - 34804550
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  34804047 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 34804145  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  34804146 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 34804244  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  34804245 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaag 34804344  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||    
T  34804345 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccat 34804444  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  34804445 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 34804544  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  34804545 ggattt 34804550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 9762457 - 9762960
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  9762457 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 9762555  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  9762556 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 9762654  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  9762655 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 9762754  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9762755 cacttgtctctctttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 9762854  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  9762855 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaa 9762954  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  9762955 ggattt 9762960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43345948 - 43345446
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  43345948 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 43345850  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  43345849 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 43345751  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| ||| |    
T  43345750 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatggatatatggatagcactgag 43345651  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    |  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  43345650 ctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 43345551  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  43345550 gcctgcagaat-tgtacactcaagatggaaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 43345452  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  43345451 ggattt 43345446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32218415 - 32217912
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  32218415 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 32218317  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  ||||||| || || |    
T  32218316 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctatgtttgatc-atttaat 32218218  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  32218217 caaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 32218118  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32218117 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 32218018  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32218017 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 32217918  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  32217917 ggattt 32217912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 30488510 - 30489014
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  30488510 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 30488608  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  30488609 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctt-taat 30488707  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||| ||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  30488708 caaactaaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 30488807  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30488808 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 30488907  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |   |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  30488908 gcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaacgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 30489007  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  30489008 aggattt 30489014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4210432 - 4209929
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  4210432 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 4210334  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  4210333 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttattagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 4210235  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  4210234 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 4210135  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4210134 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 4210035  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  4210034 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgatcactggtggataatcaaa 4209935  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  4209934 ggattt 4209929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4221024 - 4220521
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  4221024 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 4220926  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | || |    
T  4220925 tcctgaagagatgacgtcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagttacgtttgatcctt-taat 4220827  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  4220826 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 4220727  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4220726 cacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 4220627  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4220626 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 4220527  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  4220526 ggattt 4220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26867498 - 26867114
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat-atactcaaactgaagaacca 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||  | | | ||||||||||||  ||    
T  26867498 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattca 26867400  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||    
T  26867399 aagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagcattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgtt 26867300  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26867299 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgtt 26867201  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  26867200 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattgttggtggatgatcaaagga 26867114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 39169775 - 39170285
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-------ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttc 103  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||       |||  |||||||||||||||| |||||||| | |     
T  39169775 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct- 39169873  T
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  39169874 aaactgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcaacttttgatcc 39169973  T
Q  204 atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  39169974 tt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatag 39170072  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaa 402  Q
    | ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  39170073 cactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaa 39170172  T
Q  403 cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggat 502  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39170173 cagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggat 39170272  T
Q  503 gatcaaaggattt 515  Q
     ||||||||||||    
T  39170273 aatcaaaggattt 39170285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 512
Target Start/End: Original strand, 27978058 - 27978568
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||| || ||  |||| ||| ||||||||||    
T  27978058 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaatactgcgtctgaagtt-aaagtgcttc 27978155  T
Q  114 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca------------aagtt---tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacattt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||            |||     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |    
T  27978156 tgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagcccatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagt 27978255  T
Q  199 gatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    | || ||  | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978256 gttcaattaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 27978355  T
Q  299 gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
     | ||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27978356 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 27978455  T
Q  399 acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27978456 acaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 27978554  T
Q  499 ggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||    
T  27978555 ggatgatcaaagga 27978568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 512
Target Start/End: Original strand, 28064587 - 28065097
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||| || ||  |||| ||| ||||||||||    
T  28064587 aggcaagtcaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccgaagcatctgaagaatactgcgtctgaagtt-aaagtgcttc 28064684  T
Q  114 tgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca------------aagtt---tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacattt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||            |||     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |    
T  28064685 tgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagcccatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagt 28064784  T
Q  199 gatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    | || ||  | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28064785 gttcaattaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 28064884  T
Q  299 gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
     | ||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28064885 aagagcactgagtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 28064984  T
Q  399 acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28064985 acaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt 28065083  T
Q  499 ggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||    
T  28065084 ggatgatcaaagga 28065097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 36251548 - 36252034
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  36251548 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 36251646  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  36251647 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca----------------aaagtttt-catcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 36251728  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  36251729 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 36251828  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  36251829 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 36251928  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  36251929 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 36252028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Original strand, 1098978 - 1099385
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | |    
T  1098978 tgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-t 1099076  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  1099077 aatcaaactaaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 1099176  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1099177 gagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 1099276  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  1099277 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 1099376  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  1099377 aaaggattt 1099385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4100229 - 4099822
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | |    
T  4100229 tgcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-t 4100131  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  4100130 aatcaaactaaagattcaaagtagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcact 4100031  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4100030 gagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 4099931  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatc 506  Q
     ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  4099930 catgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatc 4099831  T
Q  507 aaaggattt 515  Q
    |||||||||    
T  4099830 aaaggattt 4099822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 11394841 - 11395362
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  11394841 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 11394939  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagca-----------------gaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11394940 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcaaaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 11395039  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11395040 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 11395138  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11395139 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 11395238  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11395239 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 11395338  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  11395339 cactggtggataatcaaaggattt 11395362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 11405157 - 11405678
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||    
T  11405157 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactg 11405255  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagca-----------------gaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11405256 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcaaaaagtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagct 11405355  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11405356 acttttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgga 11405454  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11405455 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 11405554  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggac 491  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11405555 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 11405654  T
Q  492 tactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  11405655 cactggtggataatcaaaggattt 11405678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 38585890 - 38586273
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||  || | | |||||| |||  |||    
T  38585890 tcatcagaagaagaagcccatcagaagcaaggtttt--atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgtagattcaa 38585987  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||| |||    
T  38585988 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcttta 38586087  T
Q  327 acagagttgactaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  38586088 acatagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaaaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgtt 38586186  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38586187 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 38586273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26880087 - 26879703
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccat-atactcaaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||  | | | |||| |||||||  ||    
T  26880087 tcatcagaagcagaagatcatcataagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaacctgaagattca 26879989  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    || |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | || |||||| ||    
T  26879988 aattagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttatccttcatt 26879889  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26879888 aacaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgtt 26879790  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  26879789 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattgctggtgaatgatcaaagga 26879703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27221941 - 27221419
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  27221941 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 27221843  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  27221842 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 27221743  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27221742 acatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 27221644  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||||| ||| ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27221643 tatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 27221544  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27221543 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 27221444  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  27221443 tcactggtggataatcaaaggattt 27221419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35274776 - 35274254
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  35274776 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 35274678  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt------------------tcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  35274677 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaatattttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagct 35274578  T
Q  193 acatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggt 292  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  35274577 acatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacgga 35274479  T
Q  293 catttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctaca 391  Q
     || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35274478 tatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctaca 35274379  T
Q  392 agacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35274378 agacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 35274279  T
Q  491 ctactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
      |||||||||| ||||||||||||    
T  35274278 tcactggtggataatcaaaggattt 35274254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 144 - 514
Target Start/End: Original strand, 18392456 - 18392826
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  18392456 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 18392554  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  18392555 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 18392654  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  18392655 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatg 18392754  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggatt 514  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18392755 aatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatt 18392826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Original strand, 967309 - 967688
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||||||   ||||    
T  967309 catcagaagcagaaatccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaa 967406  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || |    
T  967407 ggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga 967505  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  967506 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttcc 967603  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  967604 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 967688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35253392 - 35253020
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  35253392 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35253294  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  35253293 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35253194  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  35253193 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35253094  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35253093 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 35253020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35264001 - 35263629
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatt 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||| |||| |||||| |    
T  35264001 tcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-taatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaat 35263903  T
Q  244 tcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagta 343  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| ||| |||||  || |||| ||||||||| |||||    
T  35263902 tcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagta 35263803  T
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||    
T  35263802 caagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaat 35263703  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35263702 gaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattt 35263629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 112 - 512
Target Start/End: Original strand, 36784594 - 36784983
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  || | |    
T  36784594 tctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcagaagac---catcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatt 36784690  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||      
T  36784691 taaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcatctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcattgga 36784789  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
     | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |    
T  36784790 tacttgtccttcgctatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-------g 36784882  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36784883 cctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccctcaaatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 36784981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 127 - 410
Target Start/End: Original strand, 24425354 - 24425635
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| ||||    
T  24425354 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 24425452  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  24425453 agtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 24425552  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24425553 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatg 24425635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24275448 - 24275069
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | | |||||||||   |||    
T  24275448 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagta-atttaaactgaagtttcaa 24275352  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  24275351 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 24275253  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  24275252 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 24275155  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | || | ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24275154 cttcaagataggaatgaatttgaatttgatccgtcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 24275069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 131 - 406
Target Start/End: Original strand, 28374320 - 28374595
Alignment:
Q  131 cagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact-caaactgaagaaccaaagt 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |  || | | |||||||||||  ||||||    
T  28374320 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagtttt-catcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagt 28374418  T
Q  230 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaaca 329  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||    
T  28374419 agctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcagttggagagcactgagtacttgtccttcgttaaca 28374518  T
Q  330 gagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28374519 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 28374595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22774784 - 22774402
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |  ||| |||||   ||    
T  22774784 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttg--tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttca 22774687  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata-gctctgtgcagttgtccttcgt 324  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||| |   ||||||||| |    
T  22774686 aaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcat 22774588  T
Q  325 taacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22774587 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgt 22774490  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22774489 tccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 22774402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 17968973 - 17969394
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||               |||||||||||||| | ||||||||||||     
T  17968973 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcatcagaagcaaagtccatcagaagcaagatttcatcagaagctgtgtcatcaccagaag 17969072  T
Q  191 ctacatttgatccatatactcaa--actgaagaaccaaagtagctgtttct-catttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatca 287  Q
    ||||| |||||| | ||| |  |  |||||||   ||||| |||||||| | | ||| | |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17969073 ctacagttgatcaaaatattttataactgaagtttcaaaggagctgttttttcgttttatcctcgtctgagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatca 17969171  T
Q  288 acggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgc 387  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |   | ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  17969172 acggtcatttgaaaagcactgggtgctcgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacatccactactctatttttgtctacgc 17969270  T
Q  388 tacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17969271 tacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggcaaa 17969369  T
Q  488 ggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     || || ||||||||||||||||||    
T  17969370 agattaatggtggatgatcaaagga 17969394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 19497773 - 19498176
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||      
T  19497773 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctatagttgatcag 19497870  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaa-gggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    |||| | |||||||||   ||||| |||||||| || ||| || |   |||||||| ||||||| | | ||| |||||||  ||||| ||||||| | ||    
T  19497871 tatatttaaactgaagtttcaaaggagctgtttttcgttttaatcccgtctaagaa-aacgaaggactaaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaag 19497969  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  19497970 cactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctactctacaagacaagacaac 19498068  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19498069 agctctgcctgcagaa-atgttcctttaagataggaatgaatttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatg 19498167  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  19498168 atcaaagga 19498176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16777395 - 16777117
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  16777395 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaaa-tgc 16777297  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  16777296 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 16777198  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 291  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16777197 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacgg 16777117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22764080 - 22763698
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |  |||||||||   ||    
T  22764080 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttt--tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttca 22763983  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata-gctctgtgcagttgtccttcgt 324  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||| |   ||||||||| |    
T  22763982 aaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcat 22763884  T
Q  325 taacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  22763883 tga-agagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaccagctctacctgcagaa-atgt 22763786  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||||||| |||||| |||||||  | || | ||| ||||  ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  22763785 tccttcaagataggaatggatttgaacttgatccgtcataggagaacatccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 22763698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16769198 - 16768981
Alignment:
Q  299 gatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaa 397  Q
    |||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16769198 gatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaa 16769099  T
Q  398 gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactgg 497  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16769098 gacaacagtcatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggaccacacccaaatcaggcaaagtattactgg 16768999  T
Q  498 tggatgatcaaaggattt 515  Q
    || || ||||||||||||    
T  16768998 tgaataatcaaaggattt 16768981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22780162 - 22779811
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc-aaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |  ||| |||||   ||    
T  22780162 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttg--tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttca 22780065  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggata-gctctgtgcagttgtccttcgt 324  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||| |   ||||||||| |    
T  22780064 aaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcat 22779966  T
Q  325 taacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgt 424  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22779965 tga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgt 22779868  T
Q  425 gccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatca 481  Q
     |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22779867 tccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatca 22779811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20236935 - 20236714
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  20236935 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 20236837  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  20236836 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 20236738  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctg 234  Q
    |||||||||||  |||||||||||    
T  20236737 caaactgaagattcaaagtagctg 20236714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 20070568 - 20070776
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  20070568 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 20070666  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  20070667 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 20070765  T
Q  211 caaactgaaga 221  Q
    |||||||||||    
T  20070766 caaactgaaga 20070776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 274 - 511
Target Start/End: Original strand, 19299959 - 19300194
Alignment:
Q  274 aaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 373  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19299959 aaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacaactct 19300057  T
Q  374 gtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacac 473  Q
    |  | |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||     
T  19300058 gagtgtgtctacgctaccagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagtttatccttcataggactacat 19300156  T
Q  474 ccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19300157 ccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 19300194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 274 - 511
Target Start/End: Original strand, 19312966 - 19313201
Alignment:
Q  274 aaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 373  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| | ||| |||||   ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19312966 aaagggatgtttcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacaactct 19313064  T
Q  374 gtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacac 473  Q
    |  | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| | || ||||| |||||||||     
T  19313065 gagtgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatagaaatgaatttgaagttgatccttcataggactacat 19313163  T
Q  474 ccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19313164 ccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 19313201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 20646610 - 20646791
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  20646610 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgca-aaaatgttcct 20646708  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20646709 tcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg 20646791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 512
Target Start/End: Original strand, 24427667 - 24427773
Alignment:
Q  406 ctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgat 505  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  24427667 ctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaaggattactggtgaatgat 24427766  T
Q  506 caaagga 512  Q
    |||||||    
T  24427767 caaagga 24427773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19356545 - 19356363
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  19356545 agagttggcaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtctcctcgttacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttcct 19356447  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19356446 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactgatggatgatcaaagga 19356363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1084061 - 1083905
Alignment:
Q  332 gttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  1084061 gttgacaaagtacaaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcctt 1083963  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1083962 cagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 1083905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Original strand, 28379659 - 28379806
Alignment:
Q  131 cagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact-caaactgaagaaccaaagt 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |  || | | |||||||||||  ||||||    
T  28379659 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagtttt-catcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagt 28379757  T
Q  230 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagg 278  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28379758 agctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagg 28379806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 24814633 - 24814792
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  24814633 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 24814731  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  24814732 cttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 24814792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 21172120 - 21172226
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  21172120 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagcgaaa-gaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 21172218  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  21172219 ttctgaag 21172226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19356767 - 19356672
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19356767 aagtgcctttgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 19356672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6081717 - 6081589
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttca-aagtgcttctgaagtgatgac 125  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | | ||||||||||||||| |||||    
T  6081717 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaag-gaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagctaagaagtgcttctgaagtaatgac 6081619  T
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6081618 gtcatcagaagcagaagttcatcagaagca 6081589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22755516 - 22755395
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaag-tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||| |    
T  22755516 agagttgacaaagtacaaggtgtacgaccactacttccactactctg-ttttgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaa-atgttc 22755419  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaa 450  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  22755418 cttcaagataggaatggatttgaa 22755395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 24425206 - 24425283
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24425206 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 24425283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38208301 - 38208213
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag-aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  38208301 caaaggctattcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 38208213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 18392288 - 18392375
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  18392288 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 18392375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35253559 - 35253472
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35253559 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 35253472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35264168 - 35264081
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35264168 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 35264081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26880235 - 26880158
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26880235 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 26880158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 28711765 - 28711870
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  28711765 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctaaaagacaagaaaaacagctctgcctgca-atgatgttccttcacaatgggaatgg 28711863  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  28711864 atttgaa 28711870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30795315 - 30795238
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  30795315 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 30795238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 31800954 - 31801059
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  31800954 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgc 31801052  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  31801053 atttgaa 31801059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38208169 - 38208116
Alignment:
Q  126 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  38208169 gtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatc 38208116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 6574191 - 6574334
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  |||||||||    
T  6574191 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatg 6574289  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  6574290 catttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 6574334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 28550985 - 28551057
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  28550985 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 28551057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 31328033 - 31328104
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31328033 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 31328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 31334754 - 31334825
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31334754 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 31334825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33074259 - 33074187
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33074259 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 33074187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35253446 - 35253398
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35253446 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 35253398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35264055 - 35264007
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264055 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 35264007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 38585761 - 38585887
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||  ||  |||| | | ||||||||||    
T  38585761 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccgaagcatctgaagaaaattgcgtctgaagct-aaagtgcttc 38585858  T
Q  114 tgaagt-gatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38585859 tgaagtaaatgacgtcatcagaagcagaa 38585887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 19297423 - 19297477
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19297423 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcag-aagtcatcagaagcaaagtt 19297477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 28720987 - 28721093
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  28720987 caaaagctagtaaagtaatttcaataggtcttggaagaacagtggaaagc-aaaggaatactaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 28721085  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  28721086 ttctgaag 28721093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 1098899 - 1098977
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  1098899 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 1098977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 4100308 - 4100230
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  4100308 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 4100230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26867646 - 26867569
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26867646 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaacggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 26867569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 28701296 - 28701350
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28701296 aagtgtacaaccattacctccactactttgtttttgtccctgctacaagacaaga 28701350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 31968110 - 31968164
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  31968110 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 31968164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 23392494 - 23392550
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23392494 caaagtgcctctaaagtgatgacgtcatcagaagca-aaattcatcagaagcaaagtt 23392550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24576334 - 24576284
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  24576334 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagc 24576284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40782783 - 40782718
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40782783 aagcatctgaagagaagtgctcctgaaagtcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 40782718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 20646377 - 20646485
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaatct 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20646377 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aaactcatcagaagcaaagttcatcagaagcaacttcatcagaagctatatcatcaccagaagct 20646475  T
Q  193 acatttgatc 202  Q
    ||| ||||||    
T  20646476 acagttgatc 20646485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 22776355 - 22776427
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22776355 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22776427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 22781733 - 22781805
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22781733 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 30557388 - 30557459
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30557388 aagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 30557459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 39037709 - 39037781
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  39037709 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacatgacaaggataacagctatgcctgca 39037781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20568173 - 20568134
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568173 agtacaattgtacaaccactacctccactactctgttttt 20568134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 23392735 - 23392877
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || | ||||     
T  23392735 aagtgtacaaccactacttccattactctaagtttgtctctgctacaagacaatgataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaatagaaatgg 23392833  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23392834 atttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 23392877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26867536 - 26867501
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867536 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 26867501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26880125 - 26880090
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26880125 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 26880090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Original strand, 28374278 - 28374313
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28374278 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 28374313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38208221 - 38208174
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38208221 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaacgtcatcagaagca 38208174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 414
Target Start/End: Original strand, 41121789 - 41121856
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  41121789 tgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaggacaagaataacagctatgcctg 41121856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 20417324 - 20417393
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20417324 agtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 20417393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Original strand, 20417425 - 20417475
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20417425 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcaggagcagaagctcatcagaagca 20417475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22802493 - 22802440
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  22802493 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 22802440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 28379507 - 28379584
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  28379507 caaaggctagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagc-aaaggaactcgaagcatctgaagaaaac 28379584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 39037444 - 39037507
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39037444 aagcatctgaagagaagtgctactgaagtt--aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 39037507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 374
Target Start/End: Original strand, 21025530 - 21025575
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21025530 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacttcctccacgactctg 21025575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30667302 - 30667238
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30667302 aagcatctgaagagaagtgctcccgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 30667238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 38631218 - 38631181
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38631218 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 38631181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44840467 - 44840430
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44840467 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 44840430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 1587100 - 1587171
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1587100 aagtgtacaaccactatctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1587171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 195
Target Start/End: Original strand, 19312838 - 19312887
Alignment:
Q  144 tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctaca 195  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19312838 tcatcagaagcaaaattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 19312887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 22188169 - 22188241
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22188169 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22188241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23235292 - 23235256
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23235292 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 23235256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24275487 - 24275451
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275487 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 24275451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24377134 - 24377062
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  24377134 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 24377062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24576068 - 24575996
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  24576068 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 24575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40332120 - 40332048
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagaca-agacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  40332120 aagtgtacaaccactaactccattactctgtttttgtctctgctacaagacacggataacagctctgcctgca 40332048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6392903 - 6392868
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6392903 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 6392868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 19312784 - 19312838
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19312784 aagtgcctctgaagtaatgacatcatcagaagcag-aagtcatcataagcaaagtt 19312838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Original strand, 20152112 - 20152198
Alignment:
Q  364 ccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 450  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  20152112 ccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 20152198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22802741 - 22802706
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22802741 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 22802706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30621472 - 30621437
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30621472 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc 30621437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30624093 - 30624058
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30624093 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc 30624058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33074509 - 33074474
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33074509 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 33074474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38208188 - 38208157
Alignment:
Q  124 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38208188 acgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 38208157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38781432 - 38781326
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactct-gtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||    
T  38781432 aagtgtacaaccactacatccactactctattttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgtcccttcacaatgggaatg 38781334  T
Q  443 aatttgaa 450  Q
     |||||||    
T  38781333 gatttgaa 38781326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44840689 - 44840654
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44840689 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 44840654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6081568 - 6081470
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaaga 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  || | | ||||||| ||  ||||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  6081568 tttcaccagaagctatatcatcaccagaagctataagtgatcggtaaatttaaactgacgatacaaaggagctgtttttcgtttcaaccttgtctaaga 6081470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14581548 - 14581494
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  14581548 aagtgtacaaccactatctccacttctctgattttgtctctgctacaagacaaga 14581494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14581719 - 14581685
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14581719 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc 14581685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 173
Target Start/End: Original strand, 20417464 - 20417509
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20417464 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagc 20417509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 21537315 - 21537369
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  21537315 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctttgctacaagacaaga 21537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 23184147 - 23184181
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23184147 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 23184181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 23595404 - 23595438
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23595404 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 23595438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25829386 - 25829352
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25829386 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 25829352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 28711507 - 28711564
Alignment:
Q  80 tgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28711507 tgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 28711564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 34321738 - 34321772
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34321738 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc 34321772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 10009569 - 10009602
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10009569 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10009602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 10009820 - 10009889
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10009820 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 10009889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 13964045 - 13964098
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  13964045 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13964098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 22187920 - 22187953
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22187920 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 22187953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22258231 - 22258162
Alignment:
Q  348 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22258231 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 22258162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23235040 - 23234987
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  23235040 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 23234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 25037326 - 25037379
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  25037326 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 25037379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Original strand, 25041433 - 25041486
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  25041433 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 25041486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 26619168 - 26619201
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26619168 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 26619201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30667022 - 30666969
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  30667022 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 30666969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 967269 - 967305
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  967269 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 967305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19540449 - 19540377
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  19540449 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaaggcaagaataacagctctgcctgca 19540377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19540680 - 19540648
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19540680 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 19540648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22755738 - 22755691
Alignment:
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22755738 tctgaagtaatgacgtcatcagaagcag-aacccatcagaagcaaagtt 22755691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 23184371 - 23184443
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23184371 aagtgtagaaccactacctcctctactcagtttgtgtctctgctacaggacaagattaacagctatgcctgca 23184443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 23595634 - 23595706
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23595634 aagtgtagaaccactacctcctctactcagtttgtgtctctgctacaggacaagattaacagctatgcctgca 23595706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 24440794 - 24440826
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24440794 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 24440826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 28140427 - 28140487
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28140427 tctgaagagaagtgctcctgaagtcaaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcaaaagca 28140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 34322003 - 34322075
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  34322003 aagtgtacaaccactatcttcactactctatttttgtttctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 34322075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 135
Target Start/End: Original strand, 45086984 - 45087016
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaa 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45086984 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaa 45087016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54333
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||||    
T  53832 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagtgc 53930  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  53931 atctgaagtgatgacatcatcagaagcagaaggaaatcagaagc-aagattttcatcaaaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatact 54029  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  54030 caaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgag 54129  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 410  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54130 catttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatg 54228  T
Q  411 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaag 510  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  54229 cctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaag 54328  T
Q  511 gattt 515  Q
    |||||    
T  54329 gattt 54333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15132 - 14629
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  15132 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 15034  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||| | ||      
T  15033 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctt-taaa 14935  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  14934 caaacggaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 14835  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14834 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgctttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 14735  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14734 gcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 14635  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  14634 ggattt 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 5674 - 5728
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  5674 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 129 - 511
Target Start/End: Original strand, 6711 - 7092
Alignment:
Q  129 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaag 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||     
T  6711 atcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaac 6809  T
Q  229 tagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaac 328  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  6810 tagctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactaagcatttgtccttcgttaac 6909  T
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 7009  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7010 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattctttaaaggactacacccaaaccaggcaaaggattactggtggatgatcaaagg 7092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 6550 - 7053
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  6550 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattatgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 6648  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  6649 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 6747  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  6748 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 6847  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6848 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 6947  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6948 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 7047  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  7048 ggattt 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Original strand, 42344 - 42730
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||| ||||    
T  42344 tcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaa 42442  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  42443 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 42542  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42543 acagagttgacaacgtacaagtgtacaacgactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaagacaagacatcagctatgcctgcagaatttgtgc 42641  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  42642 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggattt 42730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31681 - 31177
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaa-ttccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtg 109  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||| | | ||| ||    
T  31681 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaagaaattctgagcatctgaagtaaactgctcctgaagct-aaactg 31583  T
Q  110 cttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatac 209  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||     
T  31582 ctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctt-taa 31484  T
Q  210 tcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||     
T  31483 tcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactga 31384  T
Q  310 gcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagcta 408  Q
    ||  |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  31383 gctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagcca 31284  T
Q  409 tgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31283 tgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaa 31184  T
Q  509 aggattt 515  Q
    |||||||    
T  31183 aggattt 31177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 42195 - 42301
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  42195 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgc 42293  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    | ||||||    
T  42294 tcctgaag 42301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 2021 - 2427
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca-aagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcc 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2021 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcagaagct---catcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatcc 2117  T
Q  204 atatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     || | ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2118 gtaaattcaaactgaagataaaaagtagatgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 2217  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2218 cactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaaatacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaac 2316  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2317 agctatgcttgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacaccaaaatcaggcaaaggattactggtgaatg 2416  T
Q  504 atcaaaggatt 514  Q
    |||||||||||    
T  2417 atcaaaggatt 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 1911 - 1988
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1911 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Original strand, 7555 - 7962
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||      
T  7555 aagtgcctctaaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcag 7653  T
Q  205 t-atactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
    | | | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     
T  7654 taaaattcaaactgaagattcaaagtagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaa 7753  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 403  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7754 cactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac 7853  T
Q  404 agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatg 503  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7854 agctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatg 7953  T
Q  504 atcaaagga 512  Q
    |||||||||    
T  7954 atcaaagga 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 10310 - 10809
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  10310 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaga-aatttgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 10407  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgt-catcagaagc-agaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||   ||| || | || ||||  |  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||  || |    
T  10408 ttctgaagc--tgaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaa 10504  T
Q  209 ct-caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
     | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||    
T  10505 attcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacact 10604  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 407  Q
      | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10605 aagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 10704  T
Q  408 atgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatca 507  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10705 atgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatca 10804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 7446 - 7523
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  7446 caaaagctagtcaagtaatttcaatagatcttggaagaacaatggagagcaaaga-aatttgaagcatctgaagaaaac 7523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 32727 - 33110
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| ||||    
T  32727 tcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaa 32825  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  32826 agtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 32925  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32926 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 33024  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33025 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 33110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Original strand, 40161 - 40664
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  40161 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 40259  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  40260 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 40358  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  40359 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 40458  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40459 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccat 40558  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40559 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaa 40658  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  40659 ggattt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 32579 - 32656
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32579 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgtagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 32656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 142
Target Start/End: Original strand, 32688 - 32725
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaa 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32688 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaa 32725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 127 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 1
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||  |||    
T  372 tcatcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttt-atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgattcgtatattcaaactgaagattcaa 274  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  273 agtagctgtttctcatttcaacctagtctaagaaaaatgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgtta 174  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  173 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgc 74  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtg 499  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  73 cttcaagatgggaataaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 520 - 444
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaa 88  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  520 caaaagctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaa 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 375
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  411 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12904 - 12401
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||||    
T  12904 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gtgc 12806  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  12805 ttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctt-taat 12707  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtg 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |    
T  12706 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgag 12607  T
Q  311 cagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctat 409  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  12606 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctactctacaagacaaaacaacagccat 12507  T
Q  410 gcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  12506 gcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaa 12407  T
Q  510 ggattt 515  Q
    ||||||    
T  12406 ggattt 12401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 8)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 117530 - 117148
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  117530 catcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 117432  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||    
T  117431 gtagctggttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttaa 117332  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  117331 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccgctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaat-tgttcc 117233  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  117232 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 117148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 475305 - 475464
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  475305 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttc 475403  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  475404 cttcaagataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 475464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 481825 - 481984
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  481825 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttc 481923  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  481924 cttcaagataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 481984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 347448 - 347515
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  347448 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagc 347515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 156681 - 156840
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| ||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||| |    
T  156681 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaat-tgttc 156779  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  156780 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 156840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Original strand, 347320 - 347428
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| | | | |||||    
T  347320 caaatgctattcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaaaaaaactgcgtctgaagcttatagtgc 347419  T
Q  111 ttctgaagt 119  Q
    |||||||||    
T  347420 ttctgaagt 347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 117570 - 117534
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117570 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 117534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 117679 - 117604
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaa 87  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||| ||| |||| | ||| |||||||||||    
T  117679 caaatgctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagc-aaaggaatccaaagaatctgaagaaa 117604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 127 - 509
Target Start/End: Original strand, 6043 - 6423
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||   || | || ||||||||| ||||    
T  6043 tcataagaagcagaaggtcttcagaagcaaggtttt-catcagaagcgtaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattc-aactgaagatccaa 6140  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  6141 agtagctgtttctcatttcaacataatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatgaaaagcactgagtatttgtccttcgtta 6240  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6241 acagaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgc 6340  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaa 509  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6341 cttaaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Original strand, 5894 - 5974
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgc 92  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5894 caaaggttagtcaagtaatttaaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaaccgc 5974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 420
Target Start/End: Original strand, 7773 - 8178
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgct 111  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| | ||||||||||||||  ||  |||| | | | ||||||    
T  7773 aaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgaagagcaaag-gaattcgatgcatctgaagaaaattgcatctgaagct-agagtgct 7870  T
Q  112 tctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||   || | ||    
T  7871 tctgaagtgatgacgtcgtcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagatacaattgatttgtaaattc 7969  T
Q  212 aaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgc 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  7970 aaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggttagctctgagt 8069  T
Q  312 agttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8070 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 8169  T
Q  412 ctgcagaat 420  Q
    |||||||||    
T  8170 ctgcagaat 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 6)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13814
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact-caaactgaagaacca 225  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||   || | | |||||||||||  ||    
T  13430 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaagtttt-catcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgattagtaaaattcaaactgaagattca 13528  T
Q  226 aagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||| ||| | | ||||||||||||    
T  13529 aagtagttgtttctcatttcaacctcatctaaggaaaacgaagaatcgaaagggaggtatcaacggtcatttcagaagcactgagtatttgtccttcgtt 13628  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     
T  13629 aatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataat-tatt 13727  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13728 ccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 13814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 12977 - 13082
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  12977 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 13074  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  13075 ttctgaag 13082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 13282 - 13359
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13282 caaaggcaagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaac 13359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 13087 - 13136
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13087 agtgcttatgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagca 13136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Original strand, 13125 - 13199
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||    
T  13125 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaaagtttt-catcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatc 13199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 141
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13427
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392 agtgcttttgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 13427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 143 - 512
Target Start/End: Original strand, 36574 - 36942
Alignment:
Q  143 gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcat 242  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||| |||  ||||||||||||||  |||    
T  36574 gtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacat 36672  T
Q  243 ttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |   ||  | | ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  36673 ttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttaacaaagt 36772  T
Q  343 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36773 acaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaat 36871  T
Q  442 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36872 gaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 36942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 36410 - 36487
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  36410 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattagaagcatctgaagaaaac 36487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Original strand, 36518 - 36569
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  36518 aaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcaaaagca 36569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5748 - 5345
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||      
T  5748 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcag 5651  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
    || | | ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||    
T  5650 taaaattaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaagc 5552  T
Q  305 tctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaaca 404  Q
     ||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5551 actgggtaattgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 5452  T
Q  405 gctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatga 504  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5451 gctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatga 5353  T
Q  505 tcaaagga 512  Q
    ||||||||    
T  5352 tcaaagga 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13121 - 12896
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  13121 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaaattaaactgaagattcaa 13024  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  13023 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaagcactgggtaattgtccttcgtta 12925  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaac 355  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12924 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaac 12896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5844 - 5783
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5844 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctgaagaaaac 5783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13256 - 13195
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13256 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctgaagaaaac 13195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13160 - 13124
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13160 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 13124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 11941 - 12322
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  |||    
T  11941 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 12038  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||||||||||    
T  12039 aggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgtta 12137  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  12138 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaat-tgttc 12236  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12237 cttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 12322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 451
Target Start/End: Original strand, 15804 - 16092
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  || | | ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||      
T  15804 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgattttcgtttcaacctcatctaagg- 15902  T
Q  261 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccacta 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||   | ||||| |||  ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15903 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcaatggatacttgtcattcaatataaaagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 16002  T
Q  361 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 451  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16003 cctacactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 16092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 11902 - 11938
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11902 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 11938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 8006
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  8414 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-t 8316  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  8315 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacact 8216  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||| ||| |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8215 gagcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 8116  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgat 505  Q
     ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  8115 catgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataat 8016  T
Q  506 caaaggattt 515  Q
    ||||||||||    
T  8015 caaaggattt 8006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 108 - 515
Target Start/End: Original strand, 36761 - 37169
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  36761 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctt-t 36859  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  36860 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacact 36959  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||| ||| |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36960 gagcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 37059  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgat 505  Q
     ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  37060 catgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataat 37159  T
Q  506 caaaggattt 515  Q
    ||||||||||    
T  37160 caaaggattt 37169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 108 - 490
Target Start/End: Original strand, 47395 - 47778
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  47395 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcc-ttt 47493  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  47494 aatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacact 47593  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagc 406  Q
    | ||| ||| |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47594 gagcacttgcctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagc 47693  T
Q  407 tatgcctgcagaatatgtgc-cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 490  Q
     ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47694 catgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagga 47778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 127 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19688 - 19287
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaag-tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact-caaactg-aagaac 223  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||| |||| |    
T  19688 tcatcagaagcagaagtctcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgtaagatc 19590  T
Q  224 caaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaa-cgaagaatt-gaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtcctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||    
T  19589 caaagtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaaacgaagaattagaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtcctt 19490  T
Q  322 cgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt--ccacgctacaagacaagacaacagc-tatgcct----g 414  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||         
T  19489 cattaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgttccaacgctacaagacaagacaacaccttatgcctcgaca 19390  T
Q  415 cagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagct-aattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19389 ccgaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaaattcctcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaagga 19290  T
Q  513 ttt 515  Q
    |||    
T  19289 ttt 19287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 512
Target Start/End: Original strand, 16719 - 17152
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag-cagaaagtc-atcagaagcaaagtttttcatcagaag-ctatatcatcacc-agaa-tctacattt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16719 aaagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagacagaagctctatcagaagcaaggtttt-catcagaagtcgatatcatcacccagaagtctacattt 16817  T
Q  199 gatccatatact-caaactgaagaaccaaagtagct-gtttctcatttcaacctt-atctaagaagaacgaagaattgaaag-ggaggta-tcaa-cggt 292  Q
     |||| || | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  16818 aatccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagcttgtttctcatttcaacctttatctaagaagaacgaagaattgaaaaaggaggtaatcaaacggt 16917  T
Q  293 catttgga-tagctctgtgcagttgtccttcgtt--aacagagttgactaagtacaagt-gtacaacc-actacctccactactctgtttttgtcc-acg 386  Q
    |||||||| |||| ||| | | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16918 catttggaatagcactgagtatttgtccttcgttttaacagagttgacaaagtacaagtagtacaacccactacctccactactctgtttttgtccaacg 17017  T
Q  387 ctacaagacaagacaacagctatgcct-gca---gaatatgtgccttc-aagatgggaatgaa--tttgaagctaattcttcaaagga-ctacacccaaa 478  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |   |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  17018 ctacaagacaagacaacacctatgcctcgtacacgaatttgtgccttcaaagatgggaatgaaattttgaagttaattcctcaaaggacctacacccaaa 17117  T
Q  479 tcaggcaaaggact-actggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17118 tcaggcaaaggattaactggtgaatgatcaaagga 17152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 128 - 515
Target Start/End: Original strand, 51927 - 52316
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||  | |||  || | | ||||||||||  ||||    
T  51927 catcagaagcagaagtccatcagaagcaaggttt--catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaactaatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 52024  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||| ||||    
T  52025 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaa 52124  T
Q  328 cagagttgactaa-gtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccac----gctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatat 422  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||    
T  52125 cagagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacctacgctgcaagacaagataacagctctgcctgcataa-at 52223  T
Q  423 gtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaaggattt 515  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  52224 gttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgatgaatgatcaaaggattt 52316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 53584 - 53339
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  53584 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggttctggaagaacaatgaaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcaaagtgt 53485  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  53484 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttact 53385  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaa 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  53384 caaactgaagatccaaagtagctgtttcttatttc-accttatctaa 53339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 25798 - 25831
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25798 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 25831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Original strand, 10114 - 10494
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||  || | | ||||||||||  ||||    
T  10114 catcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaaactatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaa 10211  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaa 327  Q
    | |||||||| |  | |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| | | |||||||||||||     
T  10212 ggagctgttttttgtctcaacctcgtataaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttat 10310  T
Q  328 cagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  10311 cagagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcc 10409  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10410 tttaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 10494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 10074 - 10110
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10074 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 10110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 7)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Original strand, 56606 - 56988
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  || | | | ||||| ||  |||    
T  56606 tcatcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccataagctacaagtgatcagtaaatttacactgacgattcaa 56703  T
Q  227 agtagctg-tttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtt 325  Q
    || ||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | | | || |||||||||    
T  56704 aggagctggtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcacggggaaattttccttcgtt 56802  T
Q  326 aacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtg 425  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  56803 atcagatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgtt 56901  T
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  56902 ccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 56988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 56455 - 56532
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  56455 caaaggctactcaagtgatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcaaagcatctgaagaaaac 56532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32524 - 32452
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 32452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Original strand, 417 - 464
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaa 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  417 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtcttcgctacaa 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 419
Target Start/End: Original strand, 464 - 518
Alignment:
Q  366 actactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  464 actactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32760 - 32728
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32760 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaag 32728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 56567 - 56603
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56567 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 56603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 7)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 102 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 128101 - 127696
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgat 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  128101 tcaaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgat 128004  T
Q  202 ccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggat 301  Q
    |  || |   |||||||||   ||||| || ||| | || |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |     
T  128003 cagtaaatctaaactgaagtttcaaaggaggtgtctttcgtttcaaccttgtctaaga-gaacgaataattaaaagggaggtatcaacggtcatttaaaa 127905  T
Q  302 agctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaca 401  Q
    ||| ||| |   ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  127904 agcactgggtgcttgtccttcattga-agatttgactaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaca 127806  T
Q  402 acagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtgga 501  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  127805 acagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaacgattactggtgga 127707  T
Q  502 tgatcaaagga 512  Q
    |||||||||||    
T  127706 tgatcaaagga 127696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 141235 - 140854
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  || |   |||||||||   |||    
T  141235 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcactagaaactacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaa 141138  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || || ||| | || |||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  141137 aggagttgtctttcctttccatcttgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacagtcatttaaaaagcactgggtgtttgtccttcattg 141039  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  141038 aaa-agtttacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 140941  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  140940 cttcaagatgggaatgagtttgaagttgatccttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 140854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 7674 - 7856
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |     
T  7674 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgagtgtgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaa-atgttca 7772  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||||  |||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  7773 ttcaagatatgaatgaatttgaacttgatgcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaagg 7856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 215569 - 215641
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  215569 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttcgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 215641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 7441 - 7495
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7441 aagtgcctctgaagtaatgacatcatcagaagca-aaactcatcagaagcaaagtt 7495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 141277 - 141238
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  141277 tcaaagtgcctgtgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 64554 - 64602
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaag 59  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  64554 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaag 64602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 35967 - 35587
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||    |||    
T  35967 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaaatttcaa 35870  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| |||||  | |||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   ||||||||| ||     
T  35869 aggagctgtttttcattatatcctcgtctaaga-gaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttg 35771  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  35770 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 35673  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  35672 cttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaagga 35587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 7)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 175755 - 175374
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||  || | | ||||||||||  |||    
T  175755 tcatcagaagcagaagagcatcagaaggacattttt--atcagaagctgtatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 175658  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||| ||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||   | ||||||||| | |    
T  175657 aggagctatttttcgtttcaacctagtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttca 175559  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  175558 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaggacaagacaacagctttgtttgcagaa-atgttc 175460  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  175459 cttcaagatgggaatgaatttgaagctgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 175374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 180667 - 180424
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  || | | ||||||||||  |||    
T  180667 tcatcagaagcagaagagcatcagaagcacattttt--atcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaa 180570  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||| ||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||   | ||||||||| | |    
T  180569 aggagctatttttcgtttcaacctagtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttca 180471  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 373  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180470 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 180424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 40369 - 40551
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  40369 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaa-atgttcc 40467  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  40468 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaagg 40551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 58915 - 59097
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| || |||   | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  58915 agagttgacaaagtacaattgtacaatcactacctccacgaatctgcttgtgtttgcactacgagacaagtataacagctctgcctgcagaa-atgttcc 59013  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  59014 ttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaagg 59097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 40136 - 40190
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40136 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcag-aactcatcagaagcaaagtt 40190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 175891 - 175830
Alignment:
Q  27 aattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  175891 aatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaagaatccaaagcatctgaagaaaac 175830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 58734 - 58790
Alignment:
Q  143 gtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  58734 gtcattagaagcaaagtt---catcagaagctatatcgtcaccagaagctacagttgatc 58790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27288 - 26995
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaa--gaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | |  ||||    
T  27288 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-gaagt 27190  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27189 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcaaaagc-aaggttttcatcagaagtgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatata 27091  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 304  Q
     ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27090 ttcaaactaaagatccaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagc 26995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21786 - 21708
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21786 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 21708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 4206 - 4568
Alignment:
Q  12 aaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattcc-aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4206 aaaggctagtaaagtaatttcaacaagtcctggaagaacaatggaaag-aaaaagaaatcctaagcgtctgaagaaaaacgctcctgaagttcagagtgc 4304  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc--tatatcatcaccagaatctacatttgatccatata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || |||||||||| |  |    
T  4305 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagatcattagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccct-ca 4403  T
Q  209 ctcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctg 308  Q
     ||||||||||||  |||||||| ||  ||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||| |||    
T  4404 atcaaactgaagattcaaagtagatgaatctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaatcgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactg 4503  T
Q  309 tgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 373  Q
     ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4504 agcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 512
Target Start/End: Original strand, 12651 - 13031
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactca-aactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |   ||||||||   |||    
T  12651 catcagaagcagaaatccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattttgaactgaagtttcaa 12748  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || ||| || ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |   |||||| || ||     
T  12749 aggagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctctttg 12847  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| |    
T  12848 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcatg-aaaaaatgttc 12945  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12946 cttcaagataggaatgaatttgaagttgatacttcaaaggactacaaccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 13031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 12611 - 12647
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12611 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 314 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40749 - 40552
Alignment:
Q  314 ttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcct 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40749 ttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcct 40650  T
Q  414 gcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  40649 gcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 40552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 239 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16049 - 15779
Alignment:
Q  239 tcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgact 338  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| || | |||||||||     
T  16049 tcatttcaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgaca 15952  T
Q  339 aagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatggg 438  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  ||    
T  15951 aggtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaagg 15853  T
Q  439 aatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15852 aatgaattagaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagga 15779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7009 - 6959
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  7009 aagtgcctctgaagtgatgacgtcaacagaagcagaagttcatcagaagca 6959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2044
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||   |||    
T  2424 tcatcagaagcagaagtccatcagaagca--gtatttcctcataagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 2327  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||||| || ||| |||||  ||| |||| |||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |    | |||||| ||     
T  2326 aggagctgtttttcgttttaacctcgtctgagaa-aacgtaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctttccttctttg 2228  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  2227 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttc 2130  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  2129 cttcaagataggaatgaatttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaattaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaagga 2044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2463 - 2427
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2463 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7661 - 7375
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |   |||||||||   |||    
T  7661 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaa 7564  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    || |||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |   ||||||||| |||    
T  7563 aggagctgtctttcgtttcaaccttgtctaaga-gaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcttta 7465  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 416  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7464 tcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgca 7375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7143 - 7061
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaa 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7143 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaaaaccatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaa 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 379
Target Start/End: Original strand, 34982 - 35233
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||| |||  |||    
T  34982 tcatcagaagcagatggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaa 35080  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgtta 326  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |   ||  | | |||||||||||||    
T  35081 agtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgtta 35180  T
Q  327 acagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35181 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 35233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 34834 - 34911
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||    |||||||||||||||||    
T  34834 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaaaaaaaagcatctgaagaaaac 34911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 34943 - 34979
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34943 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 34979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 373
Target Start/End: Original strand, 6018 - 6278
Alignment:
Q  108 tgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatat 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||||| | |    
T  6018 tgctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagcta--tttgatcctt-t 6114  T
Q  208 actcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctct 307  Q
    | ||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||    
T  6115 aatcaaactgaagag--aaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcact 6212  T
Q  308 gtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 373  Q
     |||| |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6213 ctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 5905 - 5992
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  5905 caaaagctactcaagttattttgataggtcctggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 5992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 19502 - 19734
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | || ||||    
T  19502 caaaggctagtcaagaaatttcaataggtcttggaagaacaatgaaaagcaaac-gaattccaagcatctgaagaaaactactcctgaagctgaa-gtgc 19599  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  19600 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 19698  T
Q  211 caaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttca 246  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  19699 caaactgaagattcaaagtagctgattctcaattca 19734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10112 - 10048
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10112 aagcatctgaagagaaatgcttctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 399
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1755
Alignment:
Q  177 atcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaa 276  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||  || | | ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1533 atcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctatttctcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattaaaa 1632  T
Q  277 gggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 376  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | ||| | | ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1633 gggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcattattagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 1732  T
Q  377 tttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  1733 tttgtctacgctacaagacaaga 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 1479 - 1528
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  1479 agtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcataagctcatcagaagca 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1474
Alignment:
Q  14 aggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttc 113  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | ||||||||||    
T  1372 aggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaataatggagagcaaag-gaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttc 1469  T
Q  114 tgaag 118  Q
    |||||    
T  1470 tgaag 1474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 5)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29707 - 29524
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  29707 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 29609  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaa-aggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29608 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcaataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 36479 - 36579
Alignment:
Q  17 ctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctga 116  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||    
T  36479 ctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcgtagcatctgaagaaaactgcgtctgaagcttaaagtgcttctga 36577  T
Q  117 ag 118  Q
    ||    
T  36578 ag 36579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 36583 - 36640
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttt 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36583 aagtgcatctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagcaaggtttt 36640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29945 - 29893
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29945 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaa 29893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29874 - 29833
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29874 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 29833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 58533 - 58351
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  58533 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 58435  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  58434 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 58351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 58754 - 58659
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  58754 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaagttcatcaaaagcaa--gatttcatcagatgctatatcatcaccagaagctacagttgatc 58659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 407917 - 408125
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||| | | |  ||||||    
T  407917 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctaaagct-gaagtgc 408015  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |    
T  408016 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcc-tttaat 408114  T
Q  211 caaactgaaga 221  Q
    |||||||||||    
T  408115 caaactgaaga 408125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 28820 - 29003
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccacta-cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcc 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  28820 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatcctctacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 28918  T
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28919 tttaagattggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 1062 - 697
Alignment:
Q  141 aagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc 240  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   | | |||| ||| | |  ||||  |||||| |||     
T  1062 aagtcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctctt 966  T
Q  241 -atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgacta 339  Q
     | || |||||  ||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||   ||||||||| || | ||||||||| |    
T  965 gaatttaacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaa 868  T
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatggga 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  867 agtacaagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagatagga 769  T
Q  440 atgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  768 atgattttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagg 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5442 - 5077
Alignment:
Q  141 aagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctc 240  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   | | |||| ||| | |  ||||  |||||| |||     
T  5442 aagtcatcagaagcaaagtt---catcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctctt 5346  T
Q  241 -atttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgacta 339  Q
     | || |||||  ||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||   ||||||||| || | ||||||||| |    
T  5345 gaatttaacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaa 5248  T
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatggga 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  5247 agtacaagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagatagga 5149  T
Q  440 atgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    |||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5148 atgattttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaagg 5077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1437 - 1255
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  1437 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 1339  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1338 tcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaagga 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2288 - 1870
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt--------------tttcatcagaagctatatcatcaccagaat 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2288 aagtgcttctgaagtaatgacatcatcagaagcag-aagtcatcagaagcaaagttcatcagaagcaaaatttcatcagaagctatatcatcaccagaag 2190  T
Q  191 ctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaagtagctgt-ttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaac 289  Q
    ||||| ||||||   ||| |||| |||||    ||||  || ||| | || |  | || ||  |||||| ||||||||| ||  ||||||||||  ||||    
T  2189 ctacagttgatcagaatattcaatctgaaatctcaaaagagttgtctcctgaagttaatctcgtctaag-agaacgaaggatcaaaagggaggtgccaac 2091  T
Q  290 ggtcatttggatagctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgcta 389  Q
    | ||||||| | ||| ||| |    |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||    
T  2090 gttcatttgaaaagcactgggtgcctgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgcta 1992  T
Q  390 caagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagg 489  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||||||| |    
T  1991 caagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaag 1893  T
Q  490 actactggtggatgatcaaagga 512  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  1892 attactggtagatgatcaaagga 1870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2720 - 2550
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   || | |||||||||||| ||||    
T  2720 tcatcagaagcagaagctcatcaggtgcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttttaaattcaaactgaagatccaa 2622  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2621 agtagttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 2550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2791
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  2868 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaactcgaagcatctgaagaaaac 2791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2759 - 2723
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2759 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 6978 - 7013
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6978 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 7228 - 7261
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7228 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 7261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23131 - 23019
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23131 caaaggctagtcaagtaatttcaacaggtcctggaagaacaatggaaag-aaatagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaagttcagagtgc 23033  T
Q  111 ttctgaagtgatga 124  Q
    ||||||||||||||    
T  23032 ttctgaagtgatga 23019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 950 - 768
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  950 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccc 852  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
     |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  851 acaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaagga 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1077
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1171 aagtgcctctgaagaaatgacgtcatcagaagcagaa-gtcatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 1077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 59316 - 59497
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  59316 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagaat-tgt-cct 59413  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  59414 tcaagataggaatgaatttgaagttcatccttcataggactacacctaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 59497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Original strand, 59095 - 59190
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  59095 aagtgcctctgaagttatgacgtcatcagaagcagaagttcatcaggagcaa--catttcatcagaagctataccatcaccagaagctacagttgatc 59190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 143142 - 142994
Alignment:
Q  339 aagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaag-acaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | || | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||    
T  143142 aagtacaagtgtacaaccactacctccactacttagtttttgtctatgctacaagaaaaaaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgg 143044  T
Q  438 gaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||| |||||||  | || ||||| ||||| | | ||| ||||||||||    
T  143043 gaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaa 142994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 20575 - 20700
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20575 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatcca 20673  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtag 231  Q
    | || |||||||||||| |||||||||    
T  20674 tgtattcaaactgaagatccaaagtag 20700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 20448 - 20526
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  20448 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaataatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaac 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 294
Target Start/End: Original strand, 19045 - 19208
Alignment:
Q  131 cagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatact-caaactgaagaaccaaagt 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |  || | | |||||||||||  ||||||    
T  19045 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagt 19143  T
Q  230 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 294  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19144 agctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 19208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Original strand, 28396 - 28446
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  28396 aagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagctcaccagaagca 28446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 19002 - 19038
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19002 aagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaa 19038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 28286 - 28392
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||   | ||  ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  28286 caaaggcaagtcaattaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagcaaaggaattttaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgc 28384  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  28385 ttctgaag 28392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 8586 - 8749
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||| |  |||| |    
T  8586 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagc-caaact 8684  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc 173  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8685 gctcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagc 8749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 5170 - 4993
Alignment:
Q  332 gttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgcctt 429  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  5170 gttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcgtgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcctt 5072  T
Q  430 caagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaa 508  Q
    |||||| |||||| |||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  5071 caagataggaatggatttgaacatgattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagaccattggtgattgatcaa 4993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 81804 - 81967
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaag--aattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagt 108  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | || ||    
T  81804 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagctgaa-gt 81902  T
Q  109 gcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  81903 gcttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagc 81967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 6
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  151 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 53  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 157  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaa 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 948 - 980
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  948 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 61276 - 61119
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 428  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  61276 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcct 61178  T
Q  429 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||  |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  61177 tcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 61119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 212393 - 212321
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  212393 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 3954 - 3902
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  3954 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatgtagagcaaa 3902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 246084 - 246119
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  246084 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 246119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 212644 - 212608
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  212644 tcaaagtgctcctgaagtaatgacgtcatcagaagca 212608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 18388 - 18532
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||    
T  18388 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-aaactgc 18486  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18487 tcctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 18532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 511
Target Start/End: Original strand, 17861 - 18044
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  17861 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttc 17959  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagg 511  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  17960 cttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcaatggtgaatgatcaaagg 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 2802 - 2874
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2802 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 2874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 20432 - 20590
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| |    
T  20432 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaa-atgt-c 20529  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20530 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 20590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Original strand, 2258 - 2424
Alignment:
Q  128 catcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaaa 227  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| |||  || | | |||||||||   ||||    
T  2258 catcagaagtagaagcccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcaaaatcatcactagaagttacatttaatcagtaaatttaaactgaagtttcaaa 2356  T
Q  228 gtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357 gtagccgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 2424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 2117 - 2214
Alignment:
Q  19 agtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaag 118  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||||    
T  2117 agtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaatccaaagcatctgaagaaaactgcgtctgaagct-aaagtgcttctgaag 2214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 2218 - 2254
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2218 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaa 2254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 9127 - 9253
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||    
T  9127 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctaagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-gaagtgc 9225  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Original strand, 17061 - 17197
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||    
T  17061 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-gaagtgc 17159  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatc 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17160 ttctgaagagatgacgtcatcagaagcagaaggtcatc 17197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Original strand, 9674 - 9801
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaag 172  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||    
T  9674 aagcatctgaagaaaactgcgtctgaagtttcaagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagcagaagttcatcagaagcaaa--atttcatccgaag 9771  T
Q  173 ctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9772 ctatatcatcaccagaagctacagttgatc 9801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 512
Target Start/End: Original strand, 9912 - 9998
Alignment:
Q  426 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9912 ccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactgcatctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 9998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 1
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||       |||||    
T  158 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatagaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga-------agtgc 66  T
Q  111 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaag---tcatcagaagcaaagtttttcatcagaagc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  65 ttctgaagtgatgacgtcatcagaagca-aaagttttcatcagaagcaaaagttttcatcagaagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6736
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  6577 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttc 6675  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  6676 cttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 6736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 61788 - 61629
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |||| |    
T  61788 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctaca-aaaatgttc 61690  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  61689 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 61629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 224273 - 224360
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  224273 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 224360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 8
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||   |||    
T  176 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaa--tatttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 79  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    || |||||||| || ||  | |||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  78 aggagctgtttttcgttatatcctcgtctaag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttg 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 1727 - 1886
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||  | || |||| |    
T  1727 agagttgacaaagtacgaagtttacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcct-aaaaaaatgttc 1825  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  1826 cttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 1886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 7324 - 7181
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  7324 aagtgtacgaccactacctccacttctctgttttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-aagttccttcaagataggaatg 7226  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  7225 gatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 7181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 512
Target Start/End: Original strand, 38120 - 38204
Alignment:
Q  428 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38120 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 38204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 990 - 1149
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| |    
T  990 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttc 1088  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1089 cttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Original strand, 1183 - 1342
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| |    
T  1183 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttc 1281  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1282 cttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11816 - 11662
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgc 426  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||  |    
T  11816 agagttgacaaagtacaaagtgtaaaaccactacctccactactctg-ttttgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaat-tgatc 11719  T
Q  427 cttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 483  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  11718 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaactaccaaatcagg 11662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12019 - 11984
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12019 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 11984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15297 - 15129
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||   |||    
T  15297 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctgtatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactgaagtttcaa 15200  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 298  Q
    || |||||||| |||||| |||||  | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15199 aggagctgtttttcattttaacctcgtttaag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttg 15129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 38157 - 38298
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| || |||| || ||||||     
T  38157 aagtgtacgaccactacctccactactctg-ttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccatcaaaataggaatgg 38254  T
Q  444 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  38255 atttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 38298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 70027 - 69860
Alignment:
Q  127 tcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatccatatactcaaactgaagaaccaa 226  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||   |||    
T  70027 tcatcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt--catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaa 69930  T
Q  227 agtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 297  Q
    || |||||||| || ||  |||||  ||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  69929 aggagctgtttttcgttataacctcgtctgag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcattt 69860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 487
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4110
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatg 442  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  3967 aagtgtacgaccactacctccacttctctgtttttcgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaa-aagttccttcaagataggaatg 4065  T
Q  443 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
     |||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  4066 gatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaa 4110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17007 - 16852
Alignment:
Q  333 ttgactaagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttc 430  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  17007 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttccttc 16909  T
Q  431 aagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 487  Q
    |  || |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  16908 agaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaagcaaa 16852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5155 - 5050
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||||||    
T  5155 caaaggctagtcaagtaatttcaataggtcttggaagaacaatggagagc-aaaggaattcgaagcatctgaagaaaactgcatctgaagct-aaagtgc 5058  T
Q  111 ttctgaag 118  Q
    ||||||||    
T  5057 ttctgaag 5050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5046 - 5013
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5046 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 5013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 165018 - 165093
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  165018 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 165093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7348
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7420 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 487
Target Start/End: Original strand, 1116 - 1218
Alignment:
Q  384 acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1116 acgctacaagacaagataacagctctgtctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 1214  T
Q  484 caaa 487  Q
    ||||    
T  1215 caaa 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15769
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  15694 aagtgtacgaccactatctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 15769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9352 - 9281
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  9352 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaaga 9281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9516 - 9477
Alignment:
Q  162 ttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9516 ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgat 9477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Original strand, 1771 - 1876
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  1771 aagtgtacaaccactaccttcactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgc 1869  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  1870 atttgaa 1876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10008 - 9954
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  10008 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10241 - 10208
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10241 aagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 10208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 34876 - 34930
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  34876 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 34930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 25737 - 25809
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25737 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctactacaagacaagaaaagcagctctgcctgca 25809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 25496 - 25531
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25496 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 25531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 34650 - 34685
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34650 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22312 - 22030
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatcca 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  22312 aagtgcctctgaagtaatgacgtcatcagaagca-aagttcatcagaagcaac----ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcag 22218  T
Q  205 tatactcaaactgaagaaccaaagtagctgtttctca-tttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatag 303  Q
     | | ||||  |||||   |||| | ||||||| |   ||| |||||  ||||||| || ||||  | | ||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  22217 aagattcaatttgaagtttcaaa-tggctgtttattggttttaacctcgtctaaga-gagcgaaagactcaaaggaaggtgtcaacgttcatttgaaaag 22120  T
Q  304 ctctgtgcagttgtccttcgttaacagagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaaga 394  Q
    | ||| |   |||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||    
T  22119 cactgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 22030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3343 - 3271
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  3343 aagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3557
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  3608 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 3557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9995 - 9923
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9995 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtcgctgctacaagacaaggataacagctatgcctgca 9923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 17837 - 17909
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17837 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 17909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9122
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9194 aagtgtacaaccactatctccactactgtgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 27501 - 27573
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  27501 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgca 27573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 21043 - 21115
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21043 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 108 - 1
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgc 110  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||    
T  108 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaatgtaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctgaagct-gaagtgc 10  T
Q  111 ttctgaagt 119  Q
    |||||||||    
T  9 ttctgaagt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 90127 - 90199
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  90127 aagtgtacaacccctacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 90199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6206
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  6151 aagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagcataagttcatcagaagcaaagtt 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 6388 - 6426
Alignment:
Q  329 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccac 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6388 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 6426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 379
Target Start/End: Original strand, 31851 - 31890
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31851 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1900 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1900
Description:

Target: scaffold1900; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1255
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  1177 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaac 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2951
Alignment:
Q  350 tacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  3016 tacaaccactacctccactactctatttttgtccctgctacaagacaa-aaaacagctctgcctgca 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Original strand, 379 - 417
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 15811 - 15865
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15811 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 15865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 25471 - 25525
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25471 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 25525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 23371 - 23435
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23371 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaag-acaaagtgctcctgaagtgataacgtcatcaaaagca 23435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22711 - 22661
Alignment:
Q  349 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22711 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 36847 - 36901
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  36847 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 36901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 42158 - 42104
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  42158 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 42104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 36599 - 36631
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36599 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 36631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42406 - 42374
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42406 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 42374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 99277 - 99331
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  99277 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 99331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37441 - 37387
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  37441 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 37387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 135501 - 135447
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  135501 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 135447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 159356 - 159324
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  159356 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 159324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 727 - 764
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Original strand, 1602 - 1637
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1602 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 480 - 544
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  480 aagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga-caaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagca 544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 1827 - 1864
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1827 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 1864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 5991
Alignment:
Q  347 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6043 gtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Original strand, 2763 - 2815
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  2763 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaa 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 2519 - 2584
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2519 aagcgtctgaagaaaactgcttctgaagtctgaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 2584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14687 - 14615
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14687 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 20301 - 20391
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaa---gaattccaagcatctgaagaaaaccgctcctga 98  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  20301 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaaaaagaaattctgagcatctgaagaaaactgctcctga 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19070 - 18998
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  19070 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgctacaagaaaagaaaaacagctctgcctgca 18998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 22203 - 22275
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22203 aagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 22275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9599 - 9545
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  9599 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctactacaagacaaga 9545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 156
Target Start/End: Original strand, 21914 - 21989
Alignment:
Q  78 tctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaa 156  Q
    ||||||||| || |||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21914 tctgaagaatactgctcctgaaga-caaagtgcacctgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagcaa 21989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1699 - 1627
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1699 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctagaagacaagaaaaacagctctgcctgca 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 211437 - 211365
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  211437 aagtatacaactactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 211365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 377
Target Start/End: Original strand, 244356 - 244388
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244356 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 244388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 398
Target Start/End: Original strand, 377630 - 377684
Alignment:
Q  344 caagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  377630 caagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 377684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 220277 - 220205
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |   |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  220277 aagtgtataaccactacctccactactcagtttgtgcctctgctaaaagacaaggataacagctatgcctgca 220205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 377383 - 377415
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  377383 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 377415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2082 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2082
Description:

Target: scaffold2082; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 76 - 1
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaa 86  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  76 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaagaaattctgagcatctgaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 1869 - 1944
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  1869 aagtgtacgaccactacctccactactttgtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 952
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  987 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 163524 - 163483
Alignment:
Q  161 tttcatcagaagctatatcatcaccagaatctacatttgatc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  163524 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatc 163483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 163594 - 163539
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagtt 160  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  163594 aagtgcctctgaaataatgacgtcatcagaagcagaagtccatcagaagcaaagtt 163539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2108 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold2108
Description:

Target: scaffold2108; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52 - 2
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagca 155  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52 aagtgcatctgaagagatgacgtcatcagaagcagaagctcatcagaagca 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2108; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 162 - 85
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaaagaattccaagcatctgaagaaaac 89  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  162 caaatgctattcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagc-aaaggaattcatagcatctgaagaaaac 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 5019 - 5073
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5019 aagtgtacaaccactacctccattaccatgtttttgtccctgctacaagacaaga 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 4739 - 4803
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4739 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcctgaagtgatgatgtcatcagaagca 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 5185 - 5219
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 5219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 5397 - 5469
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   ||||||||| || || ||||||| ||||||||    
T  5397 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagaaaaggataacagctctgcctgca 5469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 87433 - 87467
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87433 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 87467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Original strand, 87672 - 87724
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  87672 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagacaa 87724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 78438 - 78492
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  78438 aagtgtacaaccactacctacactactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 78492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1212 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1212
Description:

Target: scaffold1212; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 70 - 17
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  70 caaaggctagtcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 18413 - 18477
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18413 aagcatctgaagagaagtgctcctgaagt-caaagtgctcatgaagtgatgacgtcatcagaagca 18477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15374 - 15341
Alignment:
Q  105 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15374 aagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 60842 - 60805
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  60842 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 60805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 61077 - 61042
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  61077 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 61042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9945 - 9873
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  9945 aagtgtacaaccactacctgcactactctgtttttatctctgctacaaaacaaggaaaacagctctgcctgca 9873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1657
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  1729 aagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1944
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1994 tcaaagtgctcatgaagtgatgacgtcatcagaagc--aaggtcatcagaagc 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 142 - 107
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  142 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8205 - 8170
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8205 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 8170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 4018 - 4071
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4018 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 4071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8557 - 8522
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8557 caaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 8522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7742 - 7639
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||     
T  7742 aagtgtacaaccactacctccactactcag--tttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgg 7646  T
Q  444 atttgaa 450  Q
    |||||||    
T  7645 atttgaa 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35491 - 35456
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35491 caaagtgcctctgaagtgatgacgtcatcagaagca 35456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 103875 - 103812
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaag 136  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |   |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  103875 aagcatctgaagagaagcgctcctgaagacaaaagtgctactaaagtgatgacgtcatcagaag 103812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 84429 - 84362
Alignment:
Q  350 tacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  84429 tacaaccactacctccactactcagtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 84362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 9215 - 9249
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9215 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 9249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 6812 - 6866
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||| ||||||    
T  6812 aagtgtacaaccactacctccagtactctatttttgtctctgctacaacacaaga 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6308 - 6245
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6308 aagcatctgaagaaaagtgctcctgaagtc--aagtgttcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6046 - 5974
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||   |||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  6046 aagtgtacaaccactacctctactactctatttgtgtctctgctacaggacaagaataacatctatgcctgca 5974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10506
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactc 372  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10474 agtacaattgtacaaccactacctccactactc 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Original strand, 5514 - 5548
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5514 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 5548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 10180 - 10234
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  10180 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaagacaaga 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 14844 - 14898
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  14844 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaagacaaga 14898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10008
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagcagaaagtcatcagaagc 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  9960 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaaactgaaaatcaccagaagc 10008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11665 - 11631
Alignment:
Q  103 caaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagc 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11665 caaagtgcttctgaagtaatgacgtcatcagaagc 11631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8184 - 8150
Alignment:
Q  104 aaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8184 aaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 115810 - 115774
Alignment:
Q  102 tcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  115810 tcaaagtgctcctgaagtgatgacgtcatcaaaagca 115774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 138
Target Start/End: Original strand, 151714 - 151746
Alignment:
Q  106 agtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  151714 agtgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagca 151746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 144949 - 144911
Alignment:
Q  340 agtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144949 agtacaattgtacatccactacctccactactctgtttt 144911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1356 - 1323
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1356 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 55 - 88
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1390 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1390
Description:

Target: scaffold1390; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 1845 - 1898
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1845 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 1898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 4943 - 4996
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4943 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaaggaaaa 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13610 - 13557
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  13610 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 893 - 926
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  893 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttt 926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5666 - 5633
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5666 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttt 5633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40676 - 40639
Alignment:
Q  345 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40676 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttatgtc 40639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16601 - 16560
Alignment:
Q  471 cacccaaatcaggcaaaggactactggtggatgatcaaagga 512  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16601 cacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 16560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 43697 - 43761
Alignment:
Q  73 aagcatctgaagaaaaccgctcctgaggttcaaagtgcttctgaagtgatgacgtcatcagaagca 138  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43697 aagcatctgaagaaaagaggttctgaagttcaa-gtgctcttgaagtgatgacgtcatcagaagca 43761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 34799 - 34852
Alignment:
Q  11 caaaggctagtcaagtaattttaacaggtcctggaagaacaatggaaagcaaaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34799 caaaggctactcaagttatttcaataggtcttggaagaacaatggaaagaaaaa 34852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University