View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18949_low_5 (Length: 503)

Name: NF18949_low_5
Description: NF18949
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18949_low_5
NF18949_low_5
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (33-500)||(4156-4640)
scaffold0676 (322-458)||(471-602)
[»] chr6 (154 HSPs)
chr6 (33-459)||(18906837-18907279)
chr6 (33-459)||(16523333-16523774)
chr6 (47-475)||(22408235-22408668)
chr6 (47-435)||(21766434-21766839)
chr6 (33-313)||(18692022-18692302)
chr6 (47-462)||(18180235-18180664)
chr6 (33-348)||(21740098-21740426)
chr6 (322-503)||(14472292-14472472)
chr6 (322-503)||(22862967-22863148)
chr6 (10-366)||(15894487-15894852)
chr6 (322-488)||(1644726-1644892)
chr6 (47-251)||(21830612-21830815)
chr6 (322-488)||(11566883-11567049)
chr6 (226-487)||(17804113-17804383)
chr6 (322-488)||(19870611-19870777)
chr6 (322-488)||(23395089-23395255)
chr6 (322-488)||(8243882-8244048)
chr6 (322-488)||(23989941-23990107)
chr6 (322-503)||(18955667-18955848)
chr6 (67-445)||(22074174-22074547)
chr6 (322-488)||(18917185-18917351)
chr6 (24-357)||(19862695-19863037)
chr6 (228-487)||(22429950-22430206)
chr6 (24-357)||(22334955-22335297)
chr6 (24-357)||(25642245-25642587)
chr6 (322-488)||(12618764-12618929)
chr6 (226-487)||(25767088-25767358)
chr6 (24-357)||(19872837-19873179)
chr6 (33-357)||(22431974-22432308)
chr6 (33-357)||(22438524-22438858)
chr6 (186-462)||(20907927-20908221)
chr6 (226-487)||(12706614-12706875)
chr6 (226-488)||(16741131-16741393)
chr6 (281-474)||(23414626-23414817)
chr6 (281-474)||(27556384-27556575)
chr6 (40-300)||(16965437-16965694)
chr6 (189-366)||(27553620-27553808)
chr6 (281-466)||(5616756-5616940)
chr6 (49-301)||(31164964-31165213)
chr6 (189-366)||(27567658-27567846)
chr6 (189-462)||(19790724-19791013)
chr6 (197-366)||(23657470-23657638)
chr6 (67-248)||(35245343-35245530)
chr6 (281-474)||(27416127-27416312)
chr6 (226-466)||(2685260-2685499)
chr6 (41-175)||(16960271-16960404)
chr6 (226-466)||(19662694-19662934)
chr6 (41-207)||(22831241-22831407)
chr6 (67-270)||(1561061-1561268)
chr6 (226-447)||(9482253-9482473)
chr6 (180-376)||(15041589-15041794)
chr6 (49-248)||(20638459-20638663)
chr6 (226-435)||(27325581-27325808)
chr6 (67-125)||(2077017-2077075)
chr6 (67-248)||(29060300-29060485)
chr6 (281-431)||(12496289-12496437)
chr6 (226-431)||(22592780-22592983)
chr6 (322-458)||(31477765-31477895)
chr6 (327-458)||(16624158-16624283)
chr6 (67-226)||(25611925-25612090)
chr6 (67-270)||(11185271-11185479)
chr6 (322-458)||(16760316-16760446)
chr6 (322-458)||(22949129-22949259)
chr6 (322-458)||(22953085-22953215)
chr6 (322-458)||(23871573-23871703)
chr6 (322-458)||(23875529-23875659)
chr6 (42-165)||(22080995-22081121)
chr6 (78-144)||(20908252-20908317)
chr6 (49-103)||(27325902-27325955)
chr6 (67-112)||(19773996-19774041)
chr6 (378-459)||(21834836-21834916)
chr6 (67-112)||(22780543-22780588)
chr6 (67-248)||(25629530-25629714)
chr6 (67-112)||(28496788-28496833)
chr6 (67-112)||(29809199-29809244)
chr6 (67-207)||(16920847-16920993)
chr6 (49-120)||(15041803-15041873)
chr6 (384-474)||(31478079-31478169)
chr6 (287-428)||(1587711-1587850)
chr6 (67-112)||(1595288-1595333)
chr6 (125-248)||(4738725-4738846)
chr6 (67-112)||(23992199-23992244)
chr6 (67-112)||(25603707-25603752)
chr6 (67-112)||(25644091-25644136)
chr6 (170-347)||(31155465-31155644)
chr6 (67-112)||(34963142-34963187)
chr6 (125-243)||(4186199-4186315)
chr6 (281-428)||(20803534-20803679)
chr6 (69-112)||(17288112-17288155)
chr6 (49-103)||(17803962-17804016)
chr6 (41-112)||(19303812-19303882)
chr6 (41-112)||(20593553-20593623)
chr6 (281-372)||(21702268-21702359)
chr6 (42-112)||(27333448-27333518)
chr6 (42-112)||(27394188-27394258)
chr6 (67-105)||(3852407-3852445)
chr6 (67-105)||(8227773-8227811)
chr6 (67-128)||(20557254-20557316)
chr6 (70-112)||(30677014-30677056)
chr6 (67-165)||(19651947-19652048)
chr6 (67-112)||(19848343-19848388)
chr6 (67-112)||(20361234-20361279)
chr6 (67-103)||(4738854-4738890)
chr6 (74-152)||(20076470-20076550)
chr6 (67-111)||(23019156-23019200)
chr6 (392-474)||(1644462-1644545)
chr6 (321-376)||(19848034-19848089)
chr6 (322-372)||(1644309-1644359)
chr6 (67-101)||(31155695-31155729)
chr6 (322-372)||(31478265-31478315)
chr6 (67-112)||(16448866-16448911)
chr6 (67-100)||(18926657-18926690)
chr6 (47-142)||(19791049-19791143)
chr6 (67-112)||(20108888-20108933)
chr6 (50-103)||(25135949-25136000)
chr6 (47-142)||(27553844-27553938)
chr6 (67-103)||(9100904-9100940)
chr6 (67-103)||(13019242-13019278)
chr6 (411-474)||(16760068-16760132)
chr6 (67-99)||(18456478-18456510)
chr6 (67-99)||(18461638-18461670)
chr6 (411-474)||(22948881-22948945)
chr6 (411-474)||(22952837-22952901)
chr6 (411-474)||(23871325-23871389)
chr6 (411-474)||(23875281-23875345)
chr6 (409-487)||(15894348-15894427)
chr6 (67-152)||(19668124-19668211)
chr6 (321-376)||(23992454-23992509)
chr6 (281-372)||(25135706-25135797)
chr6 (170-213)||(25603601-25603644)
chr6 (67-105)||(4643003-4643041)
chr6 (54-103)||(1588008-1588055)
chr6 (47-103)||(1644024-1644079)
chr6 (47-103)||(8243347-8243402)
chr6 (47-103)||(11566376-11566431)
chr6 (47-103)||(12619379-12619434)
chr6 (47-103)||(14471727-14471782)
chr6 (47-103)||(16623868-16623923)
chr6 (47-103)||(19870104-19870159)
chr6 (54-103)||(21702069-21702116)
chr6 (47-103)||(22862460-22862515)
chr6 (47-103)||(22948597-22948652)
chr6 (47-103)||(22952553-22952608)
chr6 (47-103)||(23394582-23394637)
chr6 (47-103)||(23414419-23414474)
chr6 (47-103)||(23871041-23871096)
chr6 (47-103)||(23874997-23875052)
chr6 (47-103)||(23989434-23989489)
chr6 (47-103)||(27556177-27556232)
chr6 (86-142)||(27567882-27567938)
chr6 (71-103)||(4186118-4186150)
chr6 (411-474)||(14472044-14472108)
chr6 (411-474)||(18956032-18956096)
chr6 (169-248)||(19773898-19773978)
[»] chr1 (122 HSPs)
chr1 (33-503)||(22449169-22449656)
chr1 (33-487)||(18182040-18182508)
chr1 (33-487)||(3472844-3473313)
chr1 (33-355)||(6151573-6151905)
chr1 (53-459)||(8761581-8761999)
chr1 (33-355)||(22831446-22831774)
chr1 (49-462)||(17678532-17678960)
chr1 (322-503)||(1010744-1010925)
chr1 (24-357)||(20091534-20091873)
chr1 (322-488)||(20228728-20228894)
chr1 (322-488)||(16375377-16375543)
chr1 (322-488)||(21407376-21407542)
chr1 (226-503)||(24783004-24783290)
chr1 (24-357)||(42865271-42865614)
chr1 (322-488)||(52639562-52639728)
chr1 (47-376)||(21788081-21788422)
chr1 (226-487)||(16080364-16080622)
chr1 (226-487)||(36819228-36819490)
chr1 (24-316)||(21714264-21714555)
chr1 (67-284)||(48603026-48603244)
chr1 (67-284)||(22131224-22131441)
chr1 (24-272)||(22468855-22469102)
chr1 (226-487)||(19211792-19212053)
chr1 (165-355)||(21022488-21022688)
chr1 (281-474)||(33797263-33797454)
chr1 (189-366)||(3705113-3705302)
chr1 (322-487)||(23819219-23819383)
chr1 (189-366)||(45310417-45310602)
chr1 (226-428)||(20138008-20138209)
chr1 (33-125)||(21022305-21022396)
chr1 (189-366)||(45489792-45489977)
chr1 (42-248)||(34509516-34509726)
chr1 (258-431)||(18882323-18882496)
chr1 (67-144)||(41781782-41781859)
chr1 (226-466)||(12646795-12647035)
chr1 (226-431)||(46975393-46975596)
chr1 (189-366)||(18394014-18394199)
chr1 (67-213)||(38801598-38801750)
chr1 (322-458)||(1925084-1925214)
chr1 (322-458)||(20924098-20924228)
chr1 (41-165)||(20248008-20248134)
chr1 (24-103)||(21709721-21709798)
chr1 (42-165)||(33680734-33680860)
chr1 (143-208)||(21022374-21022439)
chr1 (67-248)||(27250905-27251091)
chr1 (197-366)||(33050074-33050242)
chr1 (327-458)||(39244096-39244221)
chr1 (327-458)||(39247651-39247776)
chr1 (327-458)||(41388196-41388321)
chr1 (67-112)||(20134941-20134986)
chr1 (129-248)||(20847330-20847450)
chr1 (226-358)||(21313044-21313185)
chr1 (67-165)||(22922136-22922237)
chr1 (67-152)||(21753800-21753887)
chr1 (47-106)||(24783366-24783424)
chr1 (41-112)||(50210534-50210604)
chr1 (47-105)||(20847459-20847516)
chr1 (67-112)||(431498-431543)
chr1 (67-112)||(13213204-13213249)
chr1 (67-112)||(16361686-16361731)
chr1 (67-112)||(20916030-20916075)
chr1 (67-112)||(21840406-21840451)
chr1 (67-128)||(22123429-22123490)
chr1 (67-112)||(22532029-22532074)
chr1 (67-112)||(29776418-29776463)
chr1 (392-474)||(20229078-20229161)
chr1 (49-103)||(21172777-21172831)
chr1 (49-103)||(21312893-21312947)
chr1 (67-152)||(41050317-41050404)
chr1 (67-105)||(14295901-14295939)
chr1 (67-105)||(15860380-15860418)
chr1 (67-105)||(16275753-16275791)
chr1 (169-250)||(20916093-20916174)
chr1 (67-105)||(21341872-21341910)
chr1 (67-105)||(21346736-21346774)
chr1 (67-105)||(21477402-21477440)
chr1 (67-128)||(27161824-27161886)
chr1 (67-112)||(16368608-16368653)
chr1 (67-112)||(16758406-16758451)
chr1 (67-104)||(20454907-20454944)
chr1 (67-108)||(40388932-40388973)
chr1 (67-112)||(45575231-45575276)
chr1 (67-103)||(31612055-31612091)
chr1 (41-112)||(52928294-52928365)
chr1 (409-487)||(6151976-6152055)
chr1 (67-102)||(21161504-21161539)
chr1 (49-103)||(36819584-36819638)
chr1 (390-503)||(18393867-18393981)
chr1 (70-165)||(22237382-22237480)
chr1 (67-152)||(50622226-50622315)
chr1 (67-112)||(21896579-21896624)
chr1 (71-112)||(29297880-29297921)
chr1 (67-100)||(40129356-40129389)
chr1 (387-503)||(45310270-45310387)
chr1 (169-247)||(21161588-21161668)
chr1 (67-103)||(21706942-21706978)
chr1 (67-103)||(21711484-21711520)
chr1 (47-140)||(3705340-3705432)
chr1 (165-208)||(21022442-21022485)
chr1 (417-503)||(21022767-21022854)
chr1 (69-112)||(35261359-35261402)
chr1 (45-103)||(52639053-52639110)
chr1 (66-103)||(16080691-16080729)
chr1 (409-459)||(22831325-22831375)
chr1 (67-152)||(26064689-26064778)
chr1 (384-462)||(45489688-45489766)
chr1 (67-152)||(50614398-50614487)
chr1 (47-103)||(1010237-1010292)
chr1 (47-103)||(1925691-1925746)
chr1 (47-103)||(16375995-16376050)
chr1 (86-142)||(18394235-18394291)
chr1 (322-430)||(20229208-20229314)
chr1 (47-103)||(20924705-20924760)
chr1 (47-103)||(33797033-33797088)
chr1 (47-103)||(39244456-39244511)
chr1 (47-103)||(39248011-39248066)
chr1 (86-142)||(45490013-45490069)
chr1 (411-474)||(1925398-1925462)
chr1 (321-357)||(20135214-20135250)
chr1 (411-474)||(20924412-20924476)
chr1 (321-357)||(22468754-22468790)
chr1 (419-459)||(42865160-42865200)
[»] chr8 (124 HSPs)
chr8 (33-459)||(30643240-30643682)
chr8 (47-366)||(22010723-22011042)
chr8 (46-475)||(17926637-17927081)
chr8 (33-475)||(16410185-16410638)
chr8 (128-456)||(15611420-15611754)
chr8 (33-500)||(20465945-20466434)
chr8 (128-503)||(15602920-15603302)
chr8 (10-366)||(376973-377339)
chr8 (47-462)||(16861271-16861700)
chr8 (322-488)||(43251834-43252000)
chr8 (322-488)||(19278202-19278368)
chr8 (322-488)||(21972504-21972670)
chr8 (322-488)||(21976589-21976755)
chr8 (50-474)||(20856357-20856801)
chr8 (52-315)||(16184464-16184728)
chr8 (66-366)||(23776884-23777195)
chr8 (47-462)||(39094869-39095302)
chr8 (47-315)||(21168840-21169111)
chr8 (354-488)||(22111904-22112038)
chr8 (67-316)||(19898852-19899104)
chr8 (24-316)||(19982809-19983102)
chr8 (47-315)||(21162167-21162438)
chr8 (226-487)||(16231395-16231656)
chr8 (67-248)||(44385023-44385207)
chr8 (169-366)||(24755577-24755782)
chr8 (143-315)||(19259700-19259872)
chr8 (226-487)||(22044809-22045070)
chr8 (129-357)||(17354001-17354237)
chr8 (285-474)||(14398042-14398229)
chr8 (226-431)||(15531815-15532018)
chr8 (281-451)||(21383634-21383801)
chr8 (67-248)||(5866450-5866637)
chr8 (281-458)||(21387054-21387228)
chr8 (67-248)||(21249143-21249329)
chr8 (67-248)||(21254981-21255167)
chr8 (67-144)||(23913816-23913893)
chr8 (279-431)||(15538427-15538577)
chr8 (36-119)||(22873574-22873656)
chr8 (33-119)||(24755482-24755568)
chr8 (35-125)||(19259850-19259939)
chr8 (67-248)||(45131172-45131359)
chr8 (67-225)||(13597816-13597980)
chr8 (226-431)||(23846992-23847195)
chr8 (67-270)||(21490753-21490960)
chr8 (226-431)||(23834097-23834301)
chr8 (281-466)||(30308695-30308878)
chr8 (322-458)||(18862600-18862730)
chr8 (322-458)||(21827969-21828099)
chr8 (279-400)||(17828590-17828709)
chr8 (67-248)||(21389626-21389813)
chr8 (67-248)||(21396156-21396343)
chr8 (67-248)||(21778952-21779139)
chr8 (67-248)||(21790649-21790836)
chr8 (67-165)||(6520116-6520217)
chr8 (67-226)||(17140671-17140840)
chr8 (67-213)||(18818620-18818770)
chr8 (63-111)||(23406135-23406183)
chr8 (67-207)||(7372538-7372682)
chr8 (322-453)||(21410971-21411096)
chr8 (322-453)||(21805463-21805588)
chr8 (281-431)||(32605191-32605339)
chr8 (379-487)||(18619555-18619664)
chr8 (67-112)||(18879545-18879590)
chr8 (67-112)||(20535968-20536013)
chr8 (67-112)||(21919272-21919317)
chr8 (226-371)||(24445541-24445686)
chr8 (67-112)||(31971059-31971104)
chr8 (281-361)||(17055424-17055504)
chr8 (67-165)||(21673458-21673558)
chr8 (392-487)||(22028647-22028743)
chr8 (281-372)||(32598659-32598750)
chr8 (67-112)||(14409785-14409830)
chr8 (67-112)||(16413696-16413741)
chr8 (67-112)||(17612408-17612453)
chr8 (67-112)||(18678381-18678426)
chr8 (67-112)||(18717570-18717615)
chr8 (67-112)||(19896004-19896049)
chr8 (170-270)||(31971123-31971222)
chr8 (67-112)||(41597927-41597972)
chr8 (67-112)||(45291074-45291119)
chr8 (41-112)||(22626472-22626542)
chr8 (67-165)||(38855484-38855586)
chr8 (67-105)||(13508408-13508446)
chr8 (167-248)||(16199820-16199901)
chr8 (67-105)||(19937438-19937476)
chr8 (67-105)||(26223649-26223687)
chr8 (71-112)||(4083738-4083779)
chr8 (67-112)||(15203609-15203654)
chr8 (67-112)||(21673401-21673446)
chr8 (67-112)||(22874829-22874874)
chr8 (67-165)||(23761112-23761213)
chr8 (67-165)||(26355929-26356030)
chr8 (67-104)||(32121548-32121585)
chr8 (67-152)||(24352772-24352862)
chr8 (321-376)||(18678141-18678196)
chr8 (409-503)||(24755842-24755937)
chr8 (321-376)||(32121759-32121814)
chr8 (67-105)||(22965478-22965516)
chr8 (67-105)||(25484657-25484695)
chr8 (67-108)||(983733-983774)
chr8 (67-112)||(16092612-16092657)
chr8 (407-475)||(22010609-22010678)
chr8 (50-103)||(30309029-30309080)
chr8 (46-94)||(15603304-15603351)
chr8 (46-94)||(15611756-15611803)
chr8 (411-474)||(18862914-18862978)
chr8 (411-474)||(21828283-21828347)
chr8 (67-103)||(28649329-28649365)
chr8 (50-103)||(17055656-17055707)
chr8 (47-103)||(18863207-18863262)
chr8 (47-103)||(21386847-21386902)
chr8 (47-103)||(21410439-21410494)
chr8 (47-103)||(21804931-21804986)
chr8 (47-103)||(21828576-21828631)
chr8 (47-103)||(22111445-22111500)
chr8 (47-103)||(30940639-30940694)
chr8 (54-103)||(32598460-32598507)
chr8 (54-103)||(32604992-32605039)
chr8 (47-103)||(43251325-43251380)
chr8 (424-503)||(377414-377494)
chr8 (424-503)||(19259485-19259565)
chr8 (411-474)||(21410723-21410787)
chr8 (411-474)||(21805215-21805279)
chr8 (169-248)||(21919176-21919255)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (33-459)||(14815-15254)
[»] chr7 (153 HSPs)
chr7 (47-462)||(2759880-2760303)
chr7 (35-459)||(12321690-12322128)
chr7 (33-459)||(14429610-14430050)
chr7 (24-315)||(17138169-17138461)
chr7 (33-315)||(12186743-12187027)
chr7 (226-503)||(15580617-15580893)
chr7 (322-503)||(70669-70850)
chr7 (322-503)||(74778-74959)
chr7 (226-487)||(12318052-12318313)
chr7 (322-503)||(33128-33309)
chr7 (226-487)||(13635389-13635650)
chr7 (322-488)||(39722287-39722453)
chr7 (322-488)||(12714885-12715051)
chr7 (322-488)||(12718689-12718855)
chr7 (322-488)||(16114262-16114428)
chr7 (322-488)||(16117415-16117581)
chr7 (322-488)||(16907120-16907286)
chr7 (322-488)||(18283387-18283553)
chr7 (322-488)||(26292416-26292582)
chr7 (322-488)||(18279424-18279590)
chr7 (322-488)||(12704578-12704744)
chr7 (322-488)||(12723600-12723766)
chr7 (230-487)||(15605192-15605447)
chr7 (260-487)||(11312596-11312834)
chr7 (226-487)||(16583181-16583441)
chr7 (24-357)||(19649547-19649889)
chr7 (33-316)||(9702988-9703272)
chr7 (189-459)||(39267848-39268133)
chr7 (24-316)||(18154949-18155240)
chr7 (24-316)||(32216656-32216948)
chr7 (189-459)||(3271706-3271991)
chr7 (24-284)||(15211171-15211431)
chr7 (33-310)||(24054190-24054467)
chr7 (226-447)||(9593270-9593491)
chr7 (226-459)||(9751704-9751952)
chr7 (226-487)||(18978-19239)
chr7 (281-474)||(13918713-13918904)
chr7 (281-474)||(25927436-25927627)
chr7 (281-474)||(1859019-1859210)
chr7 (281-474)||(2530323-2530516)
chr7 (226-459)||(2832390-2832639)
chr7 (281-435)||(7519331-7519483)
chr7 (258-452)||(16457312-16457508)
chr7 (189-462)||(9446104-9446395)
chr7 (67-270)||(11996183-11996390)
chr7 (320-452)||(11987231-11987362)
chr7 (281-466)||(8917407-8917591)
chr7 (226-431)||(13149080-13149283)
chr7 (189-366)||(42203876-42204062)
chr7 (184-284)||(18301918-18302016)
chr7 (67-248)||(26211754-26211940)
chr7 (67-226)||(10588795-10588960)
chr7 (46-144)||(15580448-15580545)
chr7 (186-462)||(20569541-20569833)
chr7 (67-270)||(34200542-34200751)
chr7 (33-113)||(11858305-11858384)
chr7 (226-447)||(6801136-6801357)
chr7 (67-248)||(9508948-9509135)
chr7 (279-431)||(18556951-18557101)
chr7 (67-144)||(20487341-20487418)
chr7 (284-431)||(13461744-13461889)
chr7 (327-435)||(18425464-18425566)
chr7 (322-458)||(45169961-45170091)
chr7 (67-213)||(14258019-14258169)
chr7 (33-103)||(9752035-9752104)
chr7 (78-152)||(18301846-18301920)
chr7 (67-248)||(13032517-13032704)
chr7 (49-112)||(3564619-3564681)
chr7 (281-372)||(16275472-16275563)
chr7 (378-447)||(9644384-9644454)
chr7 (226-315)||(14932843-14932932)
chr7 (226-315)||(15356278-15356367)
chr7 (226-315)||(15360392-15360481)
chr7 (67-112)||(15755269-15755314)
chr7 (67-112)||(16402753-16402798)
chr7 (67-112)||(28505657-28505702)
chr7 (67-112)||(40443212-40443257)
chr7 (226-312)||(14152097-14152183)
chr7 (287-428)||(15728311-15728450)
chr7 (281-359)||(16724677-16724755)
chr7 (281-359)||(17701691-17701769)
chr7 (67-112)||(67493-67538)
chr7 (67-112)||(12256144-12256189)
chr7 (67-112)||(12698591-12698636)
chr7 (67-112)||(13869122-13869167)
chr7 (67-112)||(15144348-15144393)
chr7 (49-105)||(15605547-15605603)
chr7 (67-112)||(16213355-16213400)
chr7 (67-112)||(17062212-17062257)
chr7 (67-165)||(18005398-18005499)
chr7 (67-112)||(20110293-20110338)
chr7 (67-112)||(27848104-27848149)
chr7 (67-112)||(29329256-29329301)
chr7 (67-112)||(44116290-44116335)
chr7 (67-112)||(47831554-47831599)
chr7 (281-428)||(14216895-14217040)
chr7 (67-152)||(2282531-2282618)
chr7 (49-103)||(12317901-12317955)
chr7 (49-103)||(14933051-14933105)
chr7 (49-103)||(15356486-15356540)
chr7 (49-103)||(15360600-15360654)
chr7 (67-152)||(16056081-16056168)
chr7 (67-152)||(22072746-22072833)
chr7 (69-112)||(24274898-24274941)
chr7 (85-212)||(28505496-28505629)
chr7 (292-371)||(35151597-35151676)
chr7 (68-152)||(12901074-12901160)
chr7 (67-105)||(16495135-16495173)
chr7 (42-102)||(811467-811527)
chr7 (67-112)||(13647057-13647102)
chr7 (67-108)||(15082263-15082304)
chr7 (67-112)||(38898718-38898763)
chr7 (67-112)||(44013931-44013976)
chr7 (67-112)||(48273129-48273174)
chr7 (86-142)||(42203785-42203840)
chr7 (67-102)||(15605818-15605853)
chr7 (67-102)||(16220050-16220085)
chr7 (67-152)||(1868238-1868327)
chr7 (57-103)||(14152280-14152325)
chr7 (67-152)||(15008780-15008869)
chr7 (167-248)||(27848006-27848087)
chr7 (67-105)||(42376345-42376383)
chr7 (50-103)||(8917205-8917256)
chr7 (67-112)||(18456704-18456749)
chr7 (167-270)||(15755043-15755145)
chr7 (411-474)||(45170275-45170339)
chr7 (70-105)||(13831154-13831189)
chr7 (47-103)||(32623-32678)
chr7 (47-103)||(71304-71359)
chr7 (47-103)||(75413-75468)
chr7 (47-103)||(1859361-1859416)
chr7 (78-119)||(9446454-9446494)
chr7 (47-103)||(12705196-12705251)
chr7 (50-99)||(13461538-13461585)
chr7 (47-103)||(13919032-13919087)
chr7 (54-103)||(14216706-14216753)
chr7 (47-103)||(15083685-15083740)
chr7 (54-103)||(15728106-15728153)
chr7 (47-103)||(16113755-16113810)
chr7 (47-103)||(16116908-16116963)
chr7 (50-103)||(16457632-16457683)
chr7 (47-103)||(16907748-16907803)
chr7 (47-103)||(18282880-18282935)
chr7 (47-103)||(18425174-18425229)
chr7 (47-103)||(25927778-25927833)
chr7 (47-103)||(26291886-26291941)
chr7 (54-103)||(35151422-35151469)
chr7 (67-112)||(38227243-38227288)
chr7 (47-103)||(39721755-39721810)
chr7 (415-474)||(15083973-15084033)
chr7 (49-103)||(16583031-16583086)
chr7 (67-112)||(20220474-20220521)
chr7 (411-474)||(39722039-39722103)
[»] chr3 (191 HSPs)
chr3 (47-459)||(19725860-19726277)
chr3 (34-456)||(18383868-18384305)
chr3 (33-459)||(11862519-11862961)
chr3 (33-459)||(322318-322759)
chr3 (47-503)||(12496000-12496470)
chr3 (47-366)||(12172537-12172864)
chr3 (53-475)||(11298459-11298900)
chr3 (322-503)||(30065970-30066151)
chr3 (33-315)||(16369125-16369408)
chr3 (33-301)||(855864-856133)
chr3 (322-503)||(55022891-55023072)
chr3 (322-503)||(11070092-11070273)
chr3 (322-503)||(11165433-11165614)
chr3 (35-281)||(15067409-15067656)
chr3 (322-503)||(14499349-14499530)
chr3 (226-487)||(15482588-15482849)
chr3 (322-488)||(15617398-15617564)
chr3 (322-503)||(11854757-11854938)
chr3 (33-239)||(11849041-11849248)
chr3 (226-503)||(2897727-2898012)
chr3 (322-488)||(7109722-7109888)
chr3 (322-488)||(7113657-7113823)
chr3 (322-488)||(22336743-22336909)
chr3 (322-488)||(27409563-27409729)
chr3 (322-488)||(28949748-28949914)
chr3 (322-488)||(22321688-22321854)
chr3 (24-357)||(15878109-15878451)
chr3 (47-357)||(14878574-14878894)
chr3 (226-487)||(20461420-20461690)
chr3 (226-487)||(7793269-7793540)
chr3 (226-487)||(327084-327355)
chr3 (189-475)||(12037884-12038185)
chr3 (165-315)||(15051367-15051516)
chr3 (129-366)||(23053136-23053383)
chr3 (226-474)||(15850018-15850264)
chr3 (189-346)||(26196500-26196666)
chr3 (379-503)||(11300415-11300539)
chr3 (281-471)||(31097491-31097681)
chr3 (67-316)||(23408187-23408437)
chr3 (16-347)||(23077545-23077866)
chr3 (235-459)||(11851510-11851749)
chr3 (281-474)||(5223045-5223236)
chr3 (281-474)||(15464846-15465037)
chr3 (226-459)||(14665320-14665569)
chr3 (218-315)||(15060196-15060292)
chr3 (226-459)||(14668476-14668725)
chr3 (281-474)||(12339447-12339638)
chr3 (189-456)||(1982761-1983047)
chr3 (281-474)||(11300699-11300891)
chr3 (281-421)||(8489459-8489596)
chr3 (67-248)||(13210504-13210690)
chr3 (189-366)||(11557433-11557621)
chr3 (197-300)||(12852662-12852763)
chr3 (284-473)||(16797988-16798176)
chr3 (189-462)||(11595084-11595373)
chr3 (46-144)||(26196700-26196797)
chr3 (190-487)||(3402875-3403191)
chr3 (67-201)||(16796056-16796192)
chr3 (33-125)||(16909598-16909689)
chr3 (190-366)||(3389985-3390171)
chr3 (284-473)||(16808815-16809003)
chr3 (226-466)||(17241897-17242137)
chr3 (226-431)||(38814310-38814513)
chr3 (189-366)||(42325824-42326009)
chr3 (182-284)||(16796195-16796295)
chr3 (279-431)||(3833653-3833803)
chr3 (327-458)||(16750543-16750668)
chr3 (67-248)||(12398968-12399154)
chr3 (67-213)||(14682140-14682291)
chr3 (49-144)||(3403226-3403321)
chr3 (322-458)||(4111204-4111334)
chr3 (322-458)||(15964993-15965123)
chr3 (322-458)||(15968917-15969047)
chr3 (322-458)||(15972841-15972971)
chr3 (322-458)||(19775789-19775919)
chr3 (78-152)||(12852797-12852871)
chr3 (67-213)||(14670618-14670769)
chr3 (67-213)||(25476596-25476744)
chr3 (257-400)||(1598487-1598630)
chr3 (322-458)||(4107352-4107482)
chr3 (322-458)||(37439591-37439721)
chr3 (67-152)||(16097119-16097206)
chr3 (322-431)||(11854439-11854545)
chr3 (66-112)||(13442076-13442122)
chr3 (226-372)||(16696711-16696857)
chr3 (67-226)||(17487616-17487780)
chr3 (67-226)||(17499098-17499262)
chr3 (67-213)||(18438294-18438443)
chr3 (33-103)||(23053391-23053460)
chr3 (67-152)||(23083633-23083722)
chr3 (49-207)||(40213937-40214098)
chr3 (143-208)||(16909667-16909732)
chr3 (67-112)||(26683114-26683159)
chr3 (67-112)||(43840692-43840737)
chr3 (282-400)||(15941912-15942028)
chr3 (80-142)||(11557657-11557718)
chr3 (89-151)||(12038212-12038274)
chr3 (49-105)||(2898108-2898164)
chr3 (67-112)||(8499294-8499339)
chr3 (67-112)||(8898833-8898878)
chr3 (67-112)||(10556761-10556806)
chr3 (67-112)||(10901491-10901536)
chr3 (67-112)||(13543751-13543796)
chr3 (47-103)||(14665167-14665223)
chr3 (47-103)||(14668323-14668379)
chr3 (67-112)||(15412205-15412250)
chr3 (67-112)||(16283189-16283234)
chr3 (67-112)||(17447032-17447077)
chr3 (67-112)||(20698753-20698798)
chr3 (67-112)||(24153500-24153545)
chr3 (67-112)||(27165026-27165071)
chr3 (67-112)||(41123631-41123676)
chr3 (67-112)||(46821993-46822038)
chr3 (67-165)||(52523996-52524097)
chr3 (67-152)||(14972618-14972705)
chr3 (67-213)||(30029594-30029742)
chr3 (41-112)||(32307405-32307476)
chr3 (49-103)||(327452-327506)
chr3 (392-474)||(4589042-4589125)
chr3 (49-103)||(7793637-7793691)
chr3 (384-474)||(19775515-19775605)
chr3 (67-105)||(15076316-15076354)
chr3 (67-105)||(17736971-17737009)
chr3 (67-225)||(23274446-23274609)
chr3 (67-105)||(24341003-24341041)
chr3 (67-105)||(28194471-28194509)
chr3 (70-112)||(43550867-43550909)
chr3 (67-112)||(606648-606693)
chr3 (67-112)||(11425031-11425076)
chr3 (67-112)||(14234231-14234276)
chr3 (67-112)||(15467630-15467675)
chr3 (67-112)||(53301848-53301893)
chr3 (68-112)||(1644996-1645040)
chr3 (67-103)||(14572370-14572406)
chr3 (47-144)||(1983081-1983177)
chr3 (47-110)||(14872290-14872352)
chr3 (49-103)||(20461787-20461841)
chr3 (322-372)||(4589228-4589278)
chr3 (42-103)||(9512666-9512727)
chr3 (42-103)||(9520641-9520702)
chr3 (68-152)||(12174531-12174617)
chr3 (322-372)||(19775369-19775419)
chr3 (70-112)||(37251449-37251491)
chr3 (67-105)||(44494544-44494582)
chr3 (42-103)||(49668390-49668451)
chr3 (67-105)||(50242600-50242638)
chr3 (67-101)||(53071011-53071045)
chr3 (67-112)||(12120108-12120153)
chr3 (321-374)||(12511084-12511137)
chr3 (50-103)||(16809156-16809207)
chr3 (308-357)||(17525216-17525265)
chr3 (67-112)||(17661198-17661243)
chr3 (67-112)||(22110675-22110720)
chr3 (67-112)||(38962226-38962271)
chr3 (321-374)||(46822292-46822345)
chr3 (49-103)||(15482439-15482494)
chr3 (411-474)||(15964745-15964809)
chr3 (411-474)||(15968669-15968733)
chr3 (411-474)||(15972593-15972657)
chr3 (409-487)||(12172924-12173003)
chr3 (423-489)||(23052994-23053061)
chr3 (384-462)||(3389881-3389959)
chr3 (47-142)||(11595409-11595504)
chr3 (47-142)||(42325693-42325788)
chr3 (384-462)||(42326035-42326113)
chr3 (308-357)||(856150-856199)
chr3 (47-103)||(4589450-4589505)
chr3 (47-103)||(7109213-7109268)
chr3 (47-103)||(7113148-7113203)
chr3 (47-103)||(11069585-11069640)
chr3 (47-103)||(14498842-14498897)
chr3 (47-103)||(15616891-15616946)
chr3 (47-103)||(15964461-15964516)
chr3 (47-103)||(15968385-15968440)
chr3 (47-103)||(15972309-15972364)
chr3 (54-103)||(16696567-16696614)
chr3 (47-103)||(19775084-19775139)
chr3 (47-103)||(22321181-22321236)
chr3 (47-103)||(22336236-22336291)
chr3 (47-103)||(27410181-27410236)
chr3 (47-103)||(28949239-28949294)
chr3 (47-103)||(30065464-30065520)
chr3 (47-103)||(37440174-37440229)
chr3 (47-103)||(55022382-55022437)
chr3 (169-248)||(11424934-11425014)
chr3 (67-103)||(14577135-14577171)
chr3 (321-357)||(15051531-15051567)
chr3 (428-503)||(15051655-15051731)
chr3 (321-357)||(15060307-15060343)
chr3 (321-357)||(30029867-30029903)
chr3 (411-474)||(37439905-37439969)
[»] chr4 (140 HSPs)
chr4 (33-459)||(16488026-16488467)
chr4 (47-503)||(16348568-16349038)
chr4 (47-503)||(16356856-16357326)
chr4 (47-459)||(5338929-5339352)
chr4 (33-315)||(15121909-15122193)
chr4 (322-503)||(17810293-17810474)
chr4 (10-366)||(12569717-12570082)
chr4 (322-503)||(14757326-14757507)
chr4 (322-488)||(9556551-9556717)
chr4 (33-357)||(23843202-23843537)
chr4 (322-488)||(4561253-4561419)
chr4 (33-357)||(15093499-15093834)
chr4 (322-488)||(5756857-5757023)
chr4 (226-487)||(36133882-36134152)
chr4 (33-315)||(15125150-15125434)
chr4 (24-316)||(44675348-44675641)
chr4 (322-503)||(27534047-27534228)
chr4 (33-316)||(13569227-13569511)
chr4 (226-459)||(22634370-22634603)
chr4 (180-459)||(13812967-13813261)
chr4 (322-488)||(33742399-33742564)
chr4 (33-312)||(12423429-12423696)
chr4 (67-284)||(17048453-17048670)
chr4 (226-447)||(1951721-1951942)
chr4 (281-487)||(18222298-18222504)
chr4 (281-474)||(43256346-43256537)
chr4 (189-503)||(15353210-15353544)
chr4 (226-459)||(20157408-20157657)
chr4 (226-458)||(18228802-18229034)
chr4 (258-458)||(17152436-17152637)
chr4 (41-248)||(14053477-14053690)
chr4 (189-300)||(631105-631214)
chr4 (226-431)||(26243642-26243845)
chr4 (281-466)||(18236872-18237056)
chr4 (226-431)||(16243377-16243580)
chr4 (67-248)||(12902517-12902702)
chr4 (67-248)||(23374529-23374715)
chr4 (189-315)||(16351960-16352088)
chr4 (226-431)||(19757578-19757781)
chr4 (226-431)||(19782025-19782228)
chr4 (226-431)||(2014704-2014907)
chr4 (67-213)||(17046245-17046397)
chr4 (67-226)||(44052588-44052753)
chr4 (16-103)||(22634677-22634764)
chr4 (259-466)||(23139228-23139435)
chr4 (197-366)||(25555371-25555548)
chr4 (226-440)||(45938075-45938284)
chr4 (322-458)||(10712874-10713004)
chr4 (322-458)||(10926644-10926774)
chr4 (281-427)||(3412779-3412923)
chr4 (189-366)||(11250610-11250795)
chr4 (78-144)||(13813450-13813516)
chr4 (281-429)||(28569423-28569569)
chr4 (81-149)||(631243-631311)
chr4 (41-112)||(7798508-7798579)
chr4 (322-458)||(14954122-14954252)
chr4 (322-458)||(25689891-25690021)
chr4 (281-372)||(14708668-14708759)
chr4 (67-112)||(7893462-7893507)
chr4 (67-213)||(16240181-16240331)
chr4 (67-112)||(16377837-16377882)
chr4 (67-112)||(22636195-22636240)
chr4 (67-112)||(52873578-52873623)
chr4 (67-110)||(3096096-3096139)
chr4 (67-152)||(39706575-39706662)
chr4 (67-152)||(52243477-52243564)
chr4 (258-431)||(9530390-9530562)
chr4 (67-112)||(12773842-12773887)
chr4 (67-112)||(14038462-14038507)
chr4 (67-112)||(14280091-14280136)
chr4 (67-112)||(16270508-16270553)
chr4 (67-112)||(19618565-19618610)
chr4 (67-112)||(20149607-20149652)
chr4 (67-112)||(52312249-52312294)
chr4 (322-458)||(12487732-12487862)
chr4 (67-152)||(14132-14219)
chr4 (67-152)||(12288492-12288579)
chr4 (69-112)||(14928061-14928104)
chr4 (281-372)||(42997484-42997575)
chr4 (67-105)||(14971150-14971188)
chr4 (86-144)||(15353577-15353634)
chr4 (67-105)||(15367426-15367464)
chr4 (67-105)||(15369754-15369792)
chr4 (67-105)||(15373262-15373300)
chr4 (67-105)||(19242450-19242488)
chr4 (49-152)||(14157584-14157688)
chr4 (47-103)||(20157731-20157787)
chr4 (66-103)||(36134226-36134263)
chr4 (67-112)||(43198875-43198920)
chr4 (67-112)||(44102033-44102078)
chr4 (67-112)||(54799090-54799135)
chr4 (67-103)||(12613-12649)
chr4 (47-103)||(13818054-13818109)
chr4 (49-143)||(14164289-14164384)
chr4 (169-248)||(15551683-15551762)
chr4 (68-112)||(18215653-18215697)
chr4 (409-503)||(12570142-12570237)
chr4 (67-105)||(12610685-12610723)
chr4 (67-105)||(15705149-15705187)
chr4 (281-371)||(18602766-18602856)
chr4 (67-105)||(23803697-23803735)
chr4 (384-462)||(25555599-25555677)
chr4 (67-105)||(51464214-51464252)
chr4 (50-103)||(14708912-14708963)
chr4 (327-372)||(15224821-15224866)
chr4 (50-103)||(18236670-18236721)
chr4 (281-366)||(18609343-18609428)
chr4 (169-248)||(3096159-3096238)
chr4 (411-474)||(14954436-14954500)
chr4 (67-99)||(15375548-15375580)
chr4 (50-102)||(18603009-18603059)
chr4 (411-474)||(25689643-25689707)
chr4 (105-152)||(13813353-13813400)
chr4 (384-462)||(11250506-11250584)
chr4 (384-458)||(15224962-15225035)
chr4 (86-144)||(16352122-16352179)
chr4 (57-103)||(28569697-28569741)
chr4 (67-152)||(46640699-46640788)
chr4 (67-152)||(53082434-53082523)
chr4 (47-103)||(4561862-4561917)
chr4 (47-103)||(5757467-5757522)
chr4 (47-103)||(9556044-9556099)
chr4 (47-103)||(10712369-10712424)
chr4 (47-103)||(10926139-10926194)
chr4 (86-142)||(11250831-11250887)
chr4 (47-103)||(12487199-12487254)
chr4 (180-225)||(13813292-13813337)
chr4 (180-225)||(13813381-13813426)
chr4 (47-103)||(14757964-14758019)
chr4 (47-103)||(14954729-14954784)
chr4 (47-103)||(15224556-15224611)
chr4 (50-103)||(17152761-17152812)
chr4 (47-103)||(17809788-17809843)
chr4 (50-99)||(18609584-18609631)
chr4 (47-103)||(25689383-25689438)
chr4 (47-103)||(33741894-33741949)
chr4 (50-102)||(3412576-3412626)
chr4 (411-474)||(10712629-10712693)
chr4 (411-474)||(10926399-10926463)
chr4 (411-474)||(12487484-12487548)
[»] chr2 (112 HSPs)
chr2 (33-437)||(37524410-37524821)
chr2 (47-459)||(22811859-22812287)
chr2 (46-475)||(25963647-25964091)
chr2 (47-462)||(21318581-21319014)
chr2 (47-462)||(21327512-21327945)
chr2 (33-355)||(45678189-45678521)
chr2 (322-503)||(10101549-10101730)
chr2 (33-366)||(24673290-24673637)
chr2 (33-315)||(40622319-40622603)
chr2 (33-366)||(24679907-24680256)
chr2 (322-488)||(24649378-24649544)
chr2 (322-488)||(12901431-12901597)
chr2 (322-488)||(27379352-27379518)
chr2 (322-488)||(27383398-27383564)
chr2 (322-488)||(27601817-27601983)
chr2 (226-487)||(24735319-24735589)
chr2 (322-488)||(24628398-24628564)
chr2 (47-503)||(40428202-40428677)
chr2 (47-366)||(22799175-22799504)
chr2 (33-315)||(23019815-23020099)
chr2 (40-357)||(22741022-22741349)
chr2 (199-437)||(21916069-21916322)
chr2 (33-316)||(22758827-22759111)
chr2 (322-488)||(41530929-41531089)
chr2 (189-475)||(24716461-24716762)
chr2 (189-456)||(25961485-25961768)
chr2 (189-462)||(24174680-24174971)
chr2 (281-474)||(31344858-31345049)
chr2 (189-366)||(24869760-24869948)
chr2 (409-488)||(15477711-15477790)
chr2 (384-487)||(19688676-19688779)
chr2 (189-462)||(24655284-24655575)
chr2 (33-144)||(24716796-24716907)
chr2 (67-248)||(38292-38478)
chr2 (67-144)||(9784555-9784632)
chr2 (226-466)||(22461130-22461370)
chr2 (67-248)||(23072125-23072312)
chr2 (67-248)||(23103571-23103757)
chr2 (67-213)||(23654598-23654749)
chr2 (67-247)||(21900630-21900816)
chr2 (226-427)||(19928483-19928682)
chr2 (24-110)||(23031092-23031176)
chr2 (67-248)||(23060272-23060458)
chr2 (322-458)||(30344946-30345076)
chr2 (281-431)||(41666930-41667078)
chr2 (67-248)||(22336885-22337069)
chr2 (322-458)||(1283410-1283540)
chr2 (47-144)||(25961802-25961899)
chr2 (226-431)||(18855438-18855639)
chr2 (67-152)||(22413418-22413505)
chr2 (281-431)||(23187056-23187204)
chr2 (281-431)||(23598319-23598467)
chr2 (66-112)||(7679370-7679416)
chr2 (47-144)||(24655609-24655704)
chr2 (281-371)||(27263253-27263343)
chr2 (67-112)||(299110-299155)
chr2 (67-112)||(6725734-6725779)
chr2 (67-112)||(8946416-8946461)
chr2 (67-112)||(23076250-23076295)
chr2 (67-112)||(23130638-23130683)
chr2 (67-112)||(23133105-23133150)
chr2 (67-112)||(23712391-23712436)
chr2 (67-112)||(24643328-24643373)
chr2 (67-112)||(25616001-25616046)
chr2 (41-109)||(23657571-23657638)
chr2 (67-152)||(18787184-18787271)
chr2 (49-103)||(19691922-19691976)
chr2 (67-106)||(20322405-20322444)
chr2 (47-144)||(24174550-24174646)
chr2 (49-103)||(24735168-24735222)
chr2 (47-144)||(24869630-24869726)
chr2 (67-105)||(22105104-22105142)
chr2 (67-109)||(22731553-22731595)
chr2 (70-112)||(22738495-22738537)
chr2 (42-103)||(25175578-25175639)
chr2 (67-105)||(38967151-38967189)
chr2 (67-105)||(43137032-43137070)
chr2 (67-112)||(8056-8101)
chr2 (67-112)||(21177725-21177770)
chr2 (67-112)||(23040507-23040552)
chr2 (67-112)||(23713211-23713256)
chr2 (67-112)||(32215313-32215358)
chr2 (41-99)||(28405717-28405775)
chr2 (287-361)||(60803-60877)
chr2 (67-105)||(19671633-19671671)
chr2 (67-152)||(24688570-24688659)
chr2 (50-103)||(18855735-18855786)
chr2 (50-103)||(23186854-23186905)
chr2 (50-103)||(23598117-23598168)
chr2 (67-159)||(23791024-23791120)
chr2 (67-112)||(24367513-24367558)
chr2 (50-103)||(26124962-26125013)
chr2 (67-112)||(24697850-24697897)
chr2 (409-487)||(24673697-24673776)
chr2 (321-376)||(25616212-25616267)
chr2 (167-248)||(20308972-20309053)
chr2 (67-152)||(20520435-20520524)
chr2 (281-347)||(26125189-26125255)
chr2 (54-103)||(60599-60646)
chr2 (47-103)||(1282902-1282957)
chr2 (47-103)||(10102190-10102245)
chr2 (67-112)||(10822942-10822987)
chr2 (47-103)||(12902053-12902108)
chr2 (47-103)||(24629016-24629071)
chr2 (47-103)||(24648869-24648924)
chr2 (47-103)||(27601306-27601361)
chr2 (47-103)||(30345553-30345608)
chr2 (47-103)||(31344651-31344706)
chr2 (411-474)||(41531273-41531337)
chr2 (47-103)||(41531542-41531597)
chr2 (67-103)||(22134526-22134562)
chr2 (411-474)||(30345260-30345324)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (33-459)||(17059-17501)
[»] chr5 (134 HSPs)
chr5 (47-459)||(21366614-21367040)
chr5 (50-456)||(20805293-20805716)
chr5 (16-315)||(18770110-18770412)
chr5 (50-456)||(20766715-20767138)
chr5 (67-315)||(22032080-22032331)
chr5 (322-503)||(15236684-15236865)
chr5 (78-366)||(17919200-17919489)
chr5 (322-488)||(20295868-20296034)
chr5 (322-488)||(19472639-19472805)
chr5 (33-357)||(23201083-23201419)
chr5 (226-474)||(23535522-23535768)
chr5 (47-456)||(123256-123681)
chr5 (33-357)||(21872978-21873313)
chr5 (36-315)||(14078877-14079157)
chr5 (230-459)||(17410360-17410598)
chr5 (189-462)||(1858923-1859210)
chr5 (47-315)||(23511839-23512106)
chr5 (67-248)||(22107789-22107973)
chr5 (189-475)||(23451227-23451532)
chr5 (24-316)||(26703793-26704084)
chr5 (24-316)||(26973526-26973817)
chr5 (189-475)||(23458471-23458776)
chr5 (189-475)||(23462732-23463037)
chr5 (281-474)||(20911104-20911295)
chr5 (129-284)||(23571899-23572053)
chr5 (281-474)||(18355938-18356129)
chr5 (189-315)||(23439860-23439989)
chr5 (226-459)||(24767494-24767743)
chr5 (226-487)||(42805345-42805606)
chr5 (67-250)||(19661009-19661197)
chr5 (166-355)||(23501415-23501612)
chr5 (189-462)||(24221757-24222048)
chr5 (226-466)||(26742687-26742927)
chr5 (281-447)||(18774183-18774349)
chr5 (226-447)||(18783971-18784192)
chr5 (189-366)||(26680464-26680650)
chr5 (189-366)||(26952071-26952257)
chr5 (189-366)||(12028614-12028799)
chr5 (226-466)||(20232476-20232715)
chr5 (226-466)||(26666072-26666311)
chr5 (226-466)||(26937669-26937908)
chr5 (186-462)||(31342027-31342297)
chr5 (189-462)||(22757010-22757297)
chr5 (67-248)||(21808565-21808751)
chr5 (281-467)||(24532988-24533173)
chr5 (33-144)||(1859244-1859355)
chr5 (41-248)||(9077689-9077898)
chr5 (33-119)||(21887013-21887099)
chr5 (279-431)||(33409207-33409357)
chr5 (67-248)||(21293145-21293332)
chr5 (67-248)||(1096228-1096412)
chr5 (67-213)||(21729276-21729427)
chr5 (67-248)||(22074779-22074965)
chr5 (47-152)||(23439730-23439834)
chr5 (47-152)||(23451097-23451201)
chr5 (47-152)||(23458341-23458445)
chr5 (47-152)||(23462602-23462706)
chr5 (67-248)||(24493328-24493514)
chr5 (281-431)||(21340744-21340892)
chr5 (41-248)||(37723635-37723848)
chr5 (279-431)||(16674131-16674281)
chr5 (33-119)||(21877258-21877344)
chr5 (322-458)||(10753385-10753515)
chr5 (281-431)||(21885166-21885314)
chr5 (70-248)||(8287019-8287203)
chr5 (70-248)||(21997709-21997892)
chr5 (49-250)||(24528963-24529168)
chr5 (322-387)||(40723607-40723672)
chr5 (70-225)||(13025073-13025233)
chr5 (70-225)||(13095257-13095417)
chr5 (279-431)||(17718416-17718565)
chr5 (258-371)||(4036175-4036290)
chr5 (68-165)||(22959798-22959898)
chr5 (33-96)||(23571821-23571883)
chr5 (67-152)||(27989210-27989297)
chr5 (67-128)||(11581562-11581624)
chr5 (67-112)||(14047860-14047905)
chr5 (67-112)||(17517504-17517549)
chr5 (67-112)||(20918325-20918370)
chr5 (67-112)||(23064287-23064332)
chr5 (67-112)||(23390812-23390857)
chr5 (67-112)||(24066929-24066974)
chr5 (67-108)||(25421290-25421331)
chr5 (67-112)||(25431154-25431199)
chr5 (67-112)||(31060803-31060848)
chr5 (67-112)||(38619250-38619295)
chr5 (384-474)||(10753111-10753201)
chr5 (67-152)||(20027222-20027309)
chr5 (47-144)||(24221627-24221723)
chr5 (288-371)||(25229441-25229524)
chr5 (288-371)||(25293597-25293680)
chr5 (281-372)||(26172445-26172536)
chr5 (47-102)||(33896074-33896128)
chr5 (70-112)||(22411929-22411971)
chr5 (67-105)||(36314310-36314348)
chr5 (67-112)||(18319329-18319374)
chr5 (67-165)||(19668649-19668749)
chr5 (67-112)||(21329820-21329865)
chr5 (67-112)||(21565294-21565339)
chr5 (67-112)||(29329673-29329718)
chr5 (72-112)||(20902308-20902348)
chr5 (49-103)||(17410245-17410299)
chr5 (40-119)||(23501619-23501696)
chr5 (67-105)||(20807088-20807126)
chr5 (57-103)||(24767837-24767882)
chr5 (67-105)||(41095966-41096004)
chr5 (67-112)||(10776011-10776056)
chr5 (67-112)||(21502481-21502526)
chr5 (67-112)||(32027132-32027177)
chr5 (411-474)||(11220521-11220585)
chr5 (411-474)||(11226940-11227004)
chr5 (411-474)||(11228930-11228994)
chr5 (411-474)||(11230919-11230983)
chr5 (50-102)||(17730685-17730735)
chr5 (321-376)||(17517240-17517295)
chr5 (226-315)||(25534897-25534985)
chr5 (322-372)||(10752965-10753015)
chr5 (384-462)||(12028510-12028588)
chr5 (57-103)||(21885466-21885510)
chr5 (57-103)||(26172249-26172293)
chr5 (54-103)||(4036000-4036047)
chr5 (47-103)||(10752704-10752759)
chr5 (47-103)||(11226656-11226711)
chr5 (47-103)||(11230635-11230690)
chr5 (86-142)||(12028835-12028891)
chr5 (47-103)||(15237372-15237427)
chr5 (47-103)||(19473255-19473310)
chr5 (47-103)||(20295361-20295416)
chr5 (47-103)||(20911471-20911526)
chr5 (47-142)||(22756880-22756974)
chr5 (54-103)||(25229683-25229730)
chr5 (54-103)||(25293839-25293886)
chr5 (50-103)||(26743021-26743072)
chr5 (415-474)||(11225111-11225171)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (47-503)||(6319-6780)
scaffold0412 (47-103)||(14036-14091)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (33-472)||(2019-2470)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (33-459)||(123-561)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (42-503)||(1393-1861)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (47-456)||(42370-42787)
scaffold0124 (197-298)||(24949-25048)
scaffold0124 (82-152)||(25082-25152)
scaffold0124 (67-112)||(38599-38644)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (47-475)||(1541-1977)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (33-500)||(46633-47119)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (66-450)||(73725-74124)
scaffold0022 (67-152)||(44355-44442)
scaffold0022 (67-152)||(78076-78163)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (47-475)||(9254-9697)
scaffold0104 (47-475)||(1571-2015)
[»] scaffold0037 (5 HSPs)
scaffold0037 (47-315)||(21633-21900)
scaffold0037 (378-503)||(21472-21597)
scaffold0037 (42-165)||(22937-23063)
scaffold0037 (392-456)||(80642-80706)
scaffold0037 (322-372)||(80810-80860)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (149-459)||(1-328)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (33-462)||(621-1068)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (47-459)||(19240-19664)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (47-459)||(5335-5754)
scaffold0476 (47-459)||(6530-6949)
scaffold0476 (67-112)||(12514-12559)
[»] scaffold0311 (3 HSPs)
scaffold0311 (33-284)||(7269-7520)
scaffold0311 (308-355)||(7147-7194)
scaffold0311 (424-503)||(6981-7061)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (66-366)||(2589-2900)
scaffold0158 (66-366)||(6255-6566)
scaffold0158 (409-487)||(2960-3039)
scaffold0158 (409-487)||(6626-6705)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (128-459)||(1315-1661)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (322-503)||(3779-3960)
scaffold0525 (47-103)||(4406-4461)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (33-355)||(280950-281288)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (33-357)||(21861-22197)
scaffold0210 (33-357)||(29753-30089)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (53-437)||(33298-33694)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (67-315)||(18816-19073)
scaffold0080 (47-160)||(16740-16852)
scaffold0080 (262-459)||(18604-18821)
scaffold0080 (67-112)||(20128-20173)
scaffold0080 (73-213)||(39679-39823)
[»] scaffold0029 (9 HSPs)
scaffold0029 (322-488)||(61531-61697)
scaffold0029 (322-488)||(65447-65613)
scaffold0029 (322-503)||(80736-80914)
scaffold0029 (98-366)||(12550-12831)
scaffold0029 (33-103)||(10454-10523)
scaffold0029 (67-105)||(11101-11139)
scaffold0029 (384-462)||(80462-80539)
scaffold0029 (322-372)||(80316-80366)
scaffold0029 (47-103)||(66061-66116)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (322-503)||(12443-12624)
scaffold0349 (47-103)||(11936-11991)
[»] scaffold0372 (2 HSPs)
scaffold0372 (322-488)||(5020-5186)
scaffold0372 (47-103)||(5636-5691)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (24-357)||(16406-16749)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (33-366)||(34968-35311)
scaffold0042 (281-431)||(63835-63982)
scaffold0042 (258-431)||(75694-75866)
scaffold0042 (409-503)||(34813-34908)
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (226-487)||(66335-66605)
scaffold0036 (47-307)||(68616-68878)
scaffold0036 (49-103)||(66702-66756)
[»] scaffold0031 (7 HSPs)
scaffold0031 (226-487)||(53481-53751)
scaffold0031 (33-316)||(65906-66189)
scaffold0031 (322-458)||(36041-36171)
scaffold0031 (49-103)||(53330-53384)
scaffold0031 (67-248)||(128509-128697)
scaffold0031 (411-474)||(36355-36419)
scaffold0031 (47-103)||(36648-36703)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (322-488)||(58638-58804)
scaffold0028 (41-103)||(132441-132503)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (226-487)||(18552-18813)
scaffold0228 (67-112)||(21848-21893)
scaffold0228 (49-103)||(18907-18962)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (226-487)||(12829-13090)
scaffold0044 (226-487)||(19113-19374)
scaffold0044 (281-428)||(62241-62386)
scaffold0044 (49-103)||(12680-12735)
scaffold0044 (66-103)||(18981-19019)
scaffold0044 (54-103)||(62042-62089)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (67-315)||(1637-1889)
[»] scaffold0109 (8 HSPs)
scaffold0109 (322-488)||(35862-36027)
scaffold0109 (281-452)||(6925-7095)
scaffold0109 (281-372)||(11336-11427)
scaffold0109 (50-103)||(11579-11630)
scaffold0109 (281-361)||(38864-38944)
scaffold0109 (50-103)||(6739-6790)
scaffold0109 (47-103)||(36526-36581)
scaffold0109 (411-474)||(36209-36273)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (33-366)||(38528-38872)
scaffold0023 (79-248)||(119646-119820)
scaffold0023 (67-112)||(40417-40462)
scaffold0023 (67-165)||(100103-100204)
scaffold0023 (67-110)||(17997-18040)
scaffold0023 (67-112)||(44193-44238)
scaffold0023 (41-112)||(101265-101336)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (24-357)||(69511-69853)
scaffold0004 (406-487)||(10504-10585)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (24-366)||(5811-6163)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (47-503)||(19635-20110)
scaffold0017 (47-503)||(15113-15588)
scaffold0017 (33-284)||(193117-193369)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (67-315)||(7053-7303)
scaffold0114 (67-247)||(15641-15827)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (33-357)||(9021-9355)
scaffold0101 (67-112)||(1576-1621)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (33-354)||(32171-32491)
scaffold0111 (287-372)||(8486-8571)
scaffold0111 (287-372)||(15630-15715)
scaffold0111 (408-459)||(32554-32605)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (33-378)||(4841-5199)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (226-485)||(173217-173474)
scaffold0001 (189-462)||(422477-422767)
scaffold0001 (24-119)||(204600-204693)
scaffold0001 (47-144)||(422802-422898)
scaffold0001 (67-112)||(160437-160482)
scaffold0001 (67-112)||(500853-500898)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (36-301)||(3469-3735)
scaffold0149 (36-301)||(7900-8166)
scaffold0149 (419-459)||(3872-3912)
scaffold0149 (419-459)||(8303-8343)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (24-354)||(7878-8216)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (24-357)||(10580-10918)
scaffold0297 (24-357)||(15737-16078)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (36-315)||(18563-18844)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (46-366)||(23417-23747)
scaffold0081 (46-366)||(38841-39171)
scaffold0081 (46-366)||(14401-14732)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (24-357)||(17953-18295)
scaffold0043 (281-431)||(77148-77296)
scaffold0043 (49-103)||(77448-77500)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (189-503)||(43964-44293)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (226-488)||(2592-2853)
scaffold0013 (67-112)||(30076-30121)
scaffold0013 (49-103)||(2947-3001)
scaffold0013 (47-103)||(73856-73911)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (226-474)||(228306-228553)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (226-487)||(19937-20197)
scaffold0120 (67-112)||(15917-15962)
scaffold0120 (67-152)||(33227-33314)
scaffold0120 (67-152)||(45691-45778)
scaffold0120 (67-152)||(17600-17686)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (189-462)||(30689-30977)
scaffold0008 (281-431)||(1857-2005)
scaffold0008 (46-119)||(34148-34220)
scaffold0008 (50-103)||(1654-1705)
scaffold0008 (67-112)||(15023-15068)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (88-366)||(14135-14425)
scaffold0056 (41-250)||(17394-17607)
scaffold0056 (409-503)||(13980-14075)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (250-487)||(6228-6482)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (78-366)||(7319-7617)
[»] scaffold0327 (3 HSPs)
scaffold0327 (189-366)||(171-357)
scaffold0327 (67-144)||(37-114)
scaffold0327 (67-112)||(3642-3687)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (47-308)||(27238-27501)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (24-316)||(23562-23852)
[»] scaffold0003 (6 HSPs)
scaffold0003 (189-462)||(413996-414284)
scaffold0003 (281-462)||(71049-71221)
scaffold0003 (226-400)||(139637-139809)
scaffold0003 (47-144)||(414318-414415)
scaffold0003 (41-248)||(340122-340335)
scaffold0003 (49-103)||(100849-100901)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (67-316)||(36213-36463)
[»] scaffold0550 (3 HSPs)
scaffold0550 (189-435)||(7355-7615)
scaffold0550 (33-88)||(9599-9654)
scaffold0550 (47-144)||(7224-7321)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (24-316)||(1056-1348)
scaffold0261 (67-105)||(15443-15481)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (67-247)||(3276-3458)
scaffold0165 (67-247)||(7339-7522)
scaffold0165 (67-152)||(27993-28080)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (226-487)||(9585-9846)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (67-316)||(10252-10504)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (67-316)||(19739-19989)
scaffold0139 (67-152)||(38182-38271)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (40-316)||(178632-178907)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (326-487)||(13407-13568)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (23-207)||(48662-48847)
scaffold0102 (67-112)||(19014-19059)
scaffold0102 (227-316)||(48569-48657)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (258-487)||(3450-3681)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (47-223)||(2016-2193)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (80-220)||(195119-195258)
scaffold0015 (215-462)||(192262-192528)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (401-488)||(927-1014)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (226-474)||(6606-6852)
[»] scaffold0012 (7 HSPs)
scaffold0012 (226-473)||(24902-25150)
scaffold0012 (322-458)||(189332-189462)
scaffold0012 (57-103)||(25245-25290)
scaffold0012 (411-474)||(189646-189710)
scaffold0012 (67-111)||(225240-225284)
scaffold0012 (47-103)||(189939-189994)
scaffold0012 (67-95)||(5021-5049)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (281-474)||(30865-31056)
scaffold0051 (67-112)||(66294-66338)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (281-474)||(207771-207974)
scaffold0016 (67-112)||(1611-1656)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (189-366)||(2485-2673)
scaffold0439 (189-366)||(10345-10533)
scaffold0439 (47-144)||(10566-10662)
scaffold0439 (75-144)||(2706-2773)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (226-459)||(9991-10240)
scaffold0166 (57-103)||(10334-10379)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (320-457)||(18310-18446)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (281-474)||(20398-20589)
scaffold0293 (47-103)||(20741-20796)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (67-208)||(404-548)
scaffold0484 (180-284)||(542-644)
[»] scaffold0819 (2 HSPs)
scaffold0819 (33-125)||(1848-1939)
scaffold0819 (143-208)||(1917-1982)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (189-300)||(7942-8051)
scaffold0142 (78-152)||(8077-8151)
scaffold0142 (67-112)||(16516-16561)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (128-213)||(8359-8445)
scaffold0673 (33-93)||(8290-8350)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (67-248)||(10600-10787)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (70-248)||(11620-11803)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (226-431)||(9829-10032)
scaffold0070 (54-103)||(9685-9732)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (67-248)||(4471-4657)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (49-144)||(1005-1100)
scaffold1873 (226-312)||(1172-1258)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (311-459)||(2918-3073)
[»] scaffold0637 (2 HSPs)
scaffold0637 (189-462)||(8443-8732)
scaffold0637 (47-142)||(8312-8407)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (67-248)||(13254-13441)
[»] scaffold0410 (3 HSPs)
scaffold0410 (186-366)||(2048-2236)
scaffold0410 (384-462)||(11472-11550)
scaffold0410 (86-142)||(1960-2015)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (47-270)||(4291-4517)
scaffold0046 (47-248)||(1736-1941)
scaffold0046 (67-248)||(28172-28359)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (67-144)||(6375-6452)
[»] scaffold0546 (4 HSPs)
scaffold0546 (281-452)||(6212-6382)
scaffold0546 (281-372)||(1880-1971)
scaffold0546 (50-103)||(1677-1728)
scaffold0546 (50-103)||(6517-6568)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (67-248)||(31826-32012)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (67-248)||(168154-168340)
scaffold0011 (67-112)||(51673-51718)
[»] scaffold0184 (4 HSPs)
scaffold0184 (184-366)||(4275-4465)
scaffold0184 (67-105)||(1419-1457)
scaffold0184 (387-462)||(4170-4245)
scaffold0184 (86-142)||(4473-4529)
[»] scaffold0289 (2 HSPs)
scaffold0289 (189-272)||(2450-2532)
scaffold0289 (47-103)||(2335-2390)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (33-112)||(65022-65100)
scaffold0064 (67-248)||(46753-46940)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (67-248)||(1708-1897)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (67-207)||(16039-16186)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (282-431)||(18336-18483)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (226-431)||(9346-9549)
scaffold0193 (67-248)||(12972-13157)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (67-248)||(2576-2763)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (40-119)||(995-1073)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (226-466)||(23141-23381)
scaffold0010 (67-165)||(129658-129759)
scaffold0010 (67-112)||(117949-117994)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (374-487)||(1-115)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (67-213)||(5339-5491)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (67-247)||(31918-32105)
scaffold0171 (321-462)||(35456-35605)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (322-458)||(11456-11586)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (322-458)||(14042-14172)
scaffold0141 (71-112)||(37112-37153)
scaffold0141 (411-474)||(14356-14420)
scaffold0141 (47-103)||(14649-14704)
[»] scaffold0130 (4 HSPs)
scaffold0130 (67-248)||(27638-27821)
scaffold0130 (281-431)||(5977-6125)
scaffold0130 (58-103)||(6277-6321)
scaffold0130 (58-103)||(8276-8320)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (67-213)||(51339-51492)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (281-431)||(16640-16788)
scaffold0034 (67-152)||(32286-32373)
scaffold0034 (54-103)||(16941-16988)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (67-248)||(8239-8426)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (67-248)||(174524-174711)
scaffold0021 (67-112)||(121569-121614)
scaffold0021 (67-152)||(136665-136752)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (67-165)||(1306-1407)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (67-248)||(8704-8890)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (67-112)||(5148-5193)
[»] scaffold0292 (3 HSPs)
scaffold0292 (67-112)||(3230-3275)
scaffold0292 (67-112)||(10267-10312)
scaffold0292 (169-248)||(210-290)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (67-112)||(33-78)
scaffold0175 (67-248)||(33881-34068)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (67-112)||(38564-38609)
scaffold0145 (67-112)||(32279-32324)
scaffold0145 (67-112)||(32745-32790)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (41-112)||(1842-1913)
scaffold0621 (41-112)||(6259-6330)
scaffold0621 (67-114)||(8219-8266)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (226-357)||(29013-29153)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (41-112)||(4971-5041)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (281-372)||(9315-9406)
scaffold0585 (50-103)||(9114-9165)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (41-112)||(3463-3533)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (67-152)||(24165-24252)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (281-371)||(349-439)
scaffold1552 (50-102)||(146-196)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (70-112)||(6397-6439)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (70-112)||(12641-12683)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (67-112)||(1150-1195)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (67-112)||(6341-6386)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (67-165)||(6571-6672)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (67-112)||(8383-8428)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (67-112)||(10412-10457)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (67-112)||(11802-11847)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (287-372)||(15324-15409)
scaffold0371 (54-103)||(15118-15165)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (67-112)||(8881-8926)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (67-112)||(20428-20473)
scaffold0305 (47-142)||(4649-4743)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (67-112)||(5397-5442)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (67-112)||(16912-16957)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (47-103)||(29326-29382)
scaffold0205 (228-315)||(29479-29566)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (67-165)||(46059-46160)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (67-112)||(47043-47088)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (67-112)||(10075-10120)
scaffold0088 (129-213)||(20734-20819)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (67-112)||(52302-52347)
scaffold0075 (67-152)||(53830-53917)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (189-253)||(205235-205297)
scaffold0014 (86-142)||(205333-205389)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (67-112)||(161431-161476)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (67-248)||(4609-4794)
[»] scaffold0157 (3 HSPs)
scaffold0157 (322-458)||(32615-32745)
scaffold0157 (47-103)||(33223-33278)
scaffold0157 (411-474)||(32929-32993)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (67-114)||(76-123)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (343-458)||(439-548)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (69-248)||(1045-1234)
scaffold0106 (67-112)||(15530-15575)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (67-106)||(39006-39045)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (67-152)||(103912-103999)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (167-248)||(1225-1306)
scaffold0598 (67-103)||(1333-1369)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (67-120)||(2460-2514)
scaffold0247 (67-105)||(18350-18388)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (67-112)||(786-831)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (67-112)||(11197-11242)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (67-165)||(8340-8441)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (67-165)||(29036-29137)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (67-112)||(10058-10103)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (71-112)||(77659-77700)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (258-392)||(36263-36396)
scaffold0132 (50-103)||(36086-36137)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (67-110)||(304-347)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (41-103)||(31843-31905)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (42-103)||(3420-3481)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (67-112)||(12321-12366)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (69-152)||(16344-16429)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (67-112)||(2966-3011)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (67-112)||(25699-25744)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (169-248)||(1224-1303)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (67-103)||(3422-3458)
scaffold0628 (67-103)||(7982-8018)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (68-112)||(6360-6404)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (67-152)||(2427-2517)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (226-315)||(19484-19572)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (73-112)||(1730-1769)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (72-152)||(2079-2161)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (47-103)||(53-108)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (47-103)||(9366-9421)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (308-357)||(26838-26887)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (67-112)||(6551-6598)
scaffold0420 (67-112)||(14005-14052)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (67-112)||(56048-56095)


Alignment Details
Target: scaffold0676 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 33 - 500
Target Start/End: Original strand, 4156 - 4640
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  4156 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatacatgtggtaccaattcagggcatgaacccccaacattttagta 4255  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4256 ttaatatactttcagggcatgcacccccaacattattttgagcaaatgttccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtat 4355  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagac 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  4356 gctaatgcatggactcaatcatcttataacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagac 4455  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  4456 tcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataatcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcg 4554  T
Q  416 ataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaac 500  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||||    
T  4555 ataatatttcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataatcaacttagcatttcataatagtttcacagtttacagttaac 4640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 471 - 602
Alignment:
Q  322 actcatgcaactt-agttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataat 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    |||| || |||||||||||||||    
T  471 actcatgcaactttagttaaataacaatagcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataat 564  T
Q  421 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  565 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 154)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Original strand, 18906837 - 18907279
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18906837 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattttagt 18906935  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18906936 attaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgta 18907035  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtataga 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  18907036 tgctaatgcatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtataga 18907135  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  18907136 ctcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattc 18907234  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18907235 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 18907279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16523774 - 16523333
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  16523774 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattatagt 16523676  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16523675 attaatatactttcagggcataagccctcaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccccaacaaatgt 16523576  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatag 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  16523575 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatag 16523477  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca-------acagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||       ||  | | ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  16523476 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaactttatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcattc 16523378  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16523377 aataatatttcaggtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 16523333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22408668 - 22408235
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  22408668 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccctatcattttagtattaatatactttca 22408570  T
Q  147 gggcataaggccccaaca--ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22408569 gggcataagcccccaacagtttattttgagcaaatgctccatcgtggtgacgacaaagctccaggacatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgg 22408470  T
Q  245 actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataa 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22408469 actcaatcatc-taaaacatcttaatca---tctcatatacatccaataatttggagttcaacgtcctcttgtatagactcgtgcaacttggttaaataa 22408374  T
Q  345 caatcgcagcataatcagatcatatcaac-----agct---taatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaa 436  Q
    |||  |||| |||||||||||| | ||||     | ||   ||| | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||     
T  22408373 caaaagcagtataatcagatcacaacaactttataacttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagatcattcaagaatatttcaagtaatgcat 22408275  T
Q  437 tcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    | ||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22408274 ttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 22408235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 435
Target Start/End: Original strand, 21766434 - 21766839
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21766434 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttatacctattatatgcatgtggtgccaattcagggcatgagcccccaacattatagtattaatatactttca 21766532  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21766533 aggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaaactccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgggc 21766632  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatac--atccaataatttgga-gttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaactt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||    
T  21766633 tcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatatccaataatttggatgttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaactt 21766731  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  ||||||| | |||||         | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21766732 agttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttca 21766830  T
Q  427 agtaatgca 435  Q
    |||||||||    
T  21766831 agtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18692302 - 18692022
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  18692302 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattatagt 18692204  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18692203 attaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccccaacaaatgt 18692104  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatc 313  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18692103 atgctaatgcatgaactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatc 18692022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Original strand, 18180235 - 18180664
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |    
T  18180235 ttgactcgacaatgtgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttta 18180333  T
Q  147 gggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18180334 gggcataagcccccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 18180433  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| |    
T  18180434 ctcaatcatc-taaaacatcttaatcaacatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttgg 18180532  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||        | ||| | ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  18180533 ttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttaatcattcaataatatttcaagt 18180631  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  18180632 aatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 18180664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21740426 - 21740098
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata------ 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||           
T  21740426 aacatcattcatcattaactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattaatatt 21740328  T
Q  127 ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||   |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21740327 ttagtattaatataccttcagggcatgagcccccattgttattttgagctgatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaa 21740228  T
Q  227 atgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgt 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  21740227 atgtatgctaatgcatggactcaatc-tcctaaaacatcttaatcttcatctcatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgt 21740129  T
Q  318 atagactcatgcaacttagttaaataacaat 348  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21740128 atagactcgtgcaacatagttaaataacaat 21740098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 14472292 - 14472472
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472292 actcatgcaacttagttaa-taacaatagcagcataattagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 14472390  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472391 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 14472472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 22862967 - 22863148
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22862967 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaactttctaatcattcaataata 22863066  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22863067 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatacagcttcacaaataacagttaacatc 22863148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15894852 - 15894487
Alignment:
Q  10 acatcatcaacataagcatcttaaacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15894852 acatcttcaacata-gcatcttaaacatctttcatcatttgactcaacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 15894755  T
Q  109 gcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctc 205  Q
    ||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||| || || |||| ||||||    
T  15894754 gcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttattt-gagctaatgctccatcgtgttgtgtactaagctc 15894656  T
Q  206 catggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttca 305  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15894655 tagggcataagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatatccaataagttggagttca 15894557  T
Q  306 acatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||         |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15894556 acatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatca 15894487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 1644726 - 1644892
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644726 actcatgcaacttagtttaataacaatggcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 1644825  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644826 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 1644892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21830815 - 21830612
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||    
T  21830815 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgaacctccaacattatagtattaatatactttca 21830717  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21830716 gggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 21830617  T
Q  247 tcaat 251  Q
    |||||    
T  21830616 tcaat 21830612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 11566883 - 11567049
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566883 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 11566982  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566983 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 11567049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 17804113 - 17804383
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  17804113 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatct 17804210  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17804211 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 17804310  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  17804311 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 17804383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 19870611 - 19870777
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870611 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 19870710  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870711 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 19870777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 23395089 - 23395255
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395089 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 23395188  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395189 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 23395255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 8243882 - 8244048
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243882 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 8243981  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8243982 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagctccacaa 8244048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 23989941 - 23990107
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989941 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattaccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 23990040  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990041 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 23990107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18955848 - 18955667
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  18955848 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcggatcatatcaacaacttaatatcaattcattttcaataacttcttaatcattcaataata 18955749  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18955748 attcaagtaatgcaatcaatcaatcaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatc 18955667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 22074547 - 22074174
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacatt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||       ||||||      ||     
T  22074547 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt-------taaggc------atc 22074461  T
Q  167 attttgagca-aatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatc 265  Q
     |  |||| | || |||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22074460 gtggtgaggacaaagctcaatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgcactcaatcatct-aaaacatc 22074362  T
Q  266 ttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatc 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||| || ||||||    
T  22074361 ttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcatcatagttaaataataataacagcacaagcagatc 22074262  T
Q  366 atatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaat 445  Q
    | | ||||||| |||         |||||||||| ||||| |||| |  |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22074261 acaacaacagcataacttcatgattatcaattca-tttcagcaacattttgattattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaat 22074174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 18917351 - 18917185
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917351 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataattatatcatatcaacagcccaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 18917252  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917251 attcaagcaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 18917185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Original strand, 19862695 - 19863037
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19862695 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgactaa-gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 19862792  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19862793 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 19862892  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  19862893 caacttatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 19862990  T
Q  317 ----tata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19862991 atcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 19863037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 228 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22430206 - 22429950
Alignment:
Q  228 tgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |  || |||||||||||||   |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    ||||||    
T  22430206 tgtatgctaatgcatggactctatcacat--aatcatcttaatcatcaaatcacttatacatccaataatttgaagttcatcatcatattc---agactc 22430112  T
Q  326 atgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattc 425  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  22430111 atgcaacttagttaattaactatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgatcatttaataataattc 22430012  T
Q  426 aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22430011 aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataataacttcaca 22429950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22335297 - 22334955
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22335297 agcatcttaa-catcttttatctttgactcgattatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac 22335200  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22335199 gttatttgagtattaatatacttccagggcaaaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgcgtacaaagctccagggcatgagcccc 22335100  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  22335099 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcttaatcatcatctcttattcatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 22335002  T
Q  317 ------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
          ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22335001 atcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcata 22334955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25642587 - 25642245
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  25642587 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttataccacttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 25642490  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25642489 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 25642390  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgg-agttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  25642389 caacaaatgtatgctaatgcatggacttgatc-tctt-aaacatcttaatcatcatctcttatttatccaataatttggaagttcaacatcatcttgatc 25642292  T
Q  317 ------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
          ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25642291 atcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcata 25642245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12618929 - 12618764
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12618929 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttgataccaattcattt-caacaactccctgatcattcaataata 12618831  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618830 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacataataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 12618764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25767358 - 25767088
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||         ||    
T  25767358 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaaccatcaaatctcttatacatccaataatttggatttcatcatcatttcaaatatct 25767261  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25767260 tattcagactcatgcaacttagttaagtaacaatagcagcataatcagatcacaccaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 25767161  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25767160 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaattacattataatcacttagcatttcataatagtttcaca 25767088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Original strand, 19872837 - 19873179
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19872837 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 19872934  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19872935 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 19873034  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||   |||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||       
T  19873035 caaattatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttgaaggtttaacatcatcttgatc 19873132  T
Q  317 ----tata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19873133 atcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 19873179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Original strand, 22431974 - 22432308
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  22431974 aacatctttcatcattgacttgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttga 22432072  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  22432073 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccagagcatgagcccccaacaaatg 22432172  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg-------tata- 320  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||       ||||     
T  22432173 tatgcaaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatacaataatttggaggttcaacatcatcttgatcatcttatac 22432270  T
Q  321 -gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22432271 cgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 22432308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Original strand, 22438524 - 22438858
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  22438524 aacatctttcatcattgacttgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttga 22438622  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  22438623 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccagagcatgagcccccaacaaatg 22438722  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg-------tata- 320  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||       ||||     
T  22438723 tatgcaaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatacaataatttggaggttcaacatcatcttgatcatcttatac 22438820  T
Q  321 -gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22438821 cgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 22438858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20908221 - 20907927
Alignment:
Q  186 tcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atat 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| | |||| ||||    
T  20908221 tcatagtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactctatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatat 20908122  T
Q  284 acatccaataatttggagttcaacatcatct---------tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||    
T  20908121 acatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaaca 20908022  T
Q  375 gcttaat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
     | ||||        | ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  20908021 tcataatttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 20907927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 12706614 - 12706875
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  12706614 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 12706711  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12706712 ctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcattttcagcaatttcttgatcattcaaaaataa 12706809  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||  |||||| |||||||  | |||||||||    
T  12706810 ttcaagtaaatgcaatcaatccataattcattttatattcacttaacatttcataaaagcttcaca 12706875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 226 - 488
Target Start/End: Original strand, 16741131 - 16741393
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  16741131 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 16741228  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16741229 cacatgcaacttagtttaataacaattgtagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcactgtcaacaatttcttgatcattcaataataa 16741326  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||||||    
T  16741327 ttcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcataaaagcttcacaa 16741393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 23414626 - 23414817
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  23414626 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 23414723  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  23414724 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 23414817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 27556384 - 27556575
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  27556384 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 27556481  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27556482 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 27556575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16965694 - 16965437
Alignment:
Q  40 ttcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-attagtattaata 138  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||    
T  16965694 ttcatcattgactcgactatgagacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccaacgtaataagtattaata 16965596  T
Q  139 tactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaat 238  Q
    ||| |||||||||  || ||| | | ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||| || |||||    
T  16965595 tac-ttcagggcaagagccccaatcgttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagagcataagcccccatcatatgaatactaat 16965497  T
Q  239 acatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga 300  Q
     ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  16965496 gcatggactcgatc-tctt-aaacatctcaattatcatcttatatttgtccaataatttgga 16965437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27553808 - 27553620
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  27553808 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 27553709  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27553708 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaagaacaacagcagcataatcagatca 27553620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5616940 - 5616756
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||||    
T  5616940 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaa 5616843  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    || ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  5616842 taacaaatcattctcagcaacttcttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcactta 5616756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31165213 - 31164964
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatactttcag 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||| |||||    
T  31165213 gactcgacaatgcgacta-tgcaacctagacatctcatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgctataagtattaatatac-ttcag 31165116  T
Q  148 ggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
    ||||| || ||||| |  || || |||| || |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31165115 ggcatgagcccccatcgcta-ttcgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaac-aatgtatgctaatgcatggact 31165018  T
Q  248 caatcatctt-aaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag 301  Q
    | ||| |||| |||||||||   | ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31165017 cgatc-tcttaaaaacatctcgttaatcatctcttatatatccagtaatttggag 31164964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27567846 - 27567658
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  27567846 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 27567747  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||||||| |||||| ||||||         ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27567746 tccaataacttggagctcaacaacatgttattcatcatgtatagactcatacaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 27567658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19791013 - 19790724
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  19791013 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatgaactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 19790916  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca---- 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||        ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||        
T  19790915 tccagtaatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacatcattat 19790816  T
Q  375 ----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
         | ||| | |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  19790815 aatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 19790724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23657638 - 23657470
Alignment:
Q  197 acaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaac-atcttaatcatcgtctc-atatacatccaataa 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  23657638 acaaagctccagggcatgagcccccaac-aaggtatgctaatgcatggactcaatcaacctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataa 23657540  T
Q  295 tttggagttcaacatcatct-tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||| |||||| ||||| |  ||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23657539 tttggagctcaacaacatctattcat---ctcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 23657470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 35245343 - 35245530
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35245343 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccccca 35245442  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  35245443 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagactc 35245530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27416312 - 27416127
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||       |||||||    
T  27416312 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacatattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca-atca-------agcttaa 27416221  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27416220 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcattaatatttagagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 27416127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2685499 - 2685260
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||    
T  2685499 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcaga 2685402  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| || | |||||    
T  2685401 ctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcgacaataa 2685305  T
Q  423 ttcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  2685304 ttcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 2685260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16960404 - 16960271
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-attagtattaatat 139  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||    
T  16960404 tcatcattgactcgactatgagacta-tgcagcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccaacgtaataagtattaatat 16960306  T
Q  140 actttcagggcataaggccccaacattattttgagc 175  Q
    || |||||||||| || ||||| | |||||||||||    
T  16960305 ac-ttcagggcatgagcccccatcgttattttgagc 16960271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 19662694 - 19662934
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaa-catcatcttgtat-ag 321  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||    
T  19662694 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcattcatcaacttatttcag 19662791  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  19662792 actcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaata 19662888  T
Q  422 attcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  19662889 attcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 19662934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 22831241 - 22831407
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatattagtattaata 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| | ||||||||||    
T  22831241 tcatcattgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccc---catttgagtattaata 22831336  T
Q  139 tactttcagggcat-aaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcca 207  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |  | ||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22831337 tacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttagctaatgctccaacgtcgtgagtacaaagctcca 22831407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Original strand, 1561061 - 1561268
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  1561061 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 1561160  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaa 260  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||| || | | |||||||    
T  1561161 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggattcga-cctcttaaa 1561258  T
Q  261 acatcttaat 270  Q
    ||| ||||||    
T  1561259 acaacttaat 1561268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9482473 - 9482253
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |  | ||    
T  9482473 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttgaagttcatcatcagcttattcatac 9482376  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  9482375 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataagcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 9482278  T
Q  424 tcaagt-aatgcaatcaatcaataa 447  Q
    |||||| || |||||||||| ||||    
T  9482277 tcaagtaaaggcaatcaatctataa 9482253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15041794 - 15041589
Alignment:
Q  180 gctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc 279  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||| |||||||  |||    
T  15041794 gctccatcgtgttgagtactaagctctagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgttc-tcttaaaa-atctcaatcatcaactc 15041697  T
Q  280 atatacat-ccaataatttgga-gttcaacatcatcttg---------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcata 368  Q
     | || || ||||||||||||| ||||||||||||||||         || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| |    
T  15041696 ttttatataccaataatttggaggttcaacatcatcttgttcatcttataaagactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcaca 15041597  T
Q  369 tcaacagc 376  Q
     |||||||    
T  15041596 acaacagc 15041589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20638663 - 20638459
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||     
T  20638663 gactcgacaatgcaacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttc 20638565  T
Q  145 cagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacat 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    |||||||| |||    
T  20638564 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcgtcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 20638465  T
Q  243 ggactc 248  Q
    ||||||    
T  20638464 ggactc 20638459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27325808 - 27325581
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  27325808 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcattaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcatttcaattatct 27325711  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttc-aacaacttcc 405  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||        | |||||||||||||||||| ||||||  |     
T  27325710 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcatatcacatcaacagtataacttcataatatcaattcattttcaaacaacaact 27325611  T
Q  406 tgatcattcaataataattcaagtaatgca 435  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27325610 tgatcattccataatatttcaagtaatgca 27325581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 125
Target Start/End: Original strand, 2077017 - 2077075
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2077017 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacat 2077075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 29060300 - 29060485
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt-agtattaatatactttcagggcat-aaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||     
T  29060300 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccat 29060399  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  29060400 cgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 29060485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 12496289 - 12496437
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-a 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||      
T  12496289 tatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcagatca---caacaggttct 12496385  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  12496386 ataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaatatttcaagtaa 12496437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22592983 - 22592780
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  22592983 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatcaaataatttggagttcatcatcagcttattcatag 22592886  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||   |||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22592885 acatgcaacttagttaaataacatttgtagcataatcaaatca---caacaggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 22592789  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  22592788 ttcaagtaa 22592780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31477895 - 31477765
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  31477895 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 31477802  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  31477801 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 31477765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 458
Target Start/End: Original strand, 16624158 - 16624283
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16624158 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--aacttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataatacttca 16624251  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16624252 agtaatgcatttaatcattaattcacaatata 16624283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25612090 - 25611925
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  25612090 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatatacggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 25611991  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
     |  ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25611990 tcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 25611925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Original strand, 11185271 - 11185479
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  11185271 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccccca 11185370  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaa 259  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| | | ||||||    
T  11185371 tcgctaattttgagctaatgctccaacgcggtgagtacaaaaatccagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactcga-cctcttaa 11185468  T
Q  260 aacatcttaat 270  Q
    |||| ||||||    
T  11185469 aacaacttaat 11185479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 16760316 - 16760446
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  16760316 actcgtgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 16760409  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16760410 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 16760446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 22949129 - 22949259
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  22949129 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 22949222  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  22949223 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 22949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 22953085 - 22953215
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  22953085 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 22953178  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  22953179 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 22953215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 23871573 - 23871703
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  23871573 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 23871666  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  23871667 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 23871703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 23875529 - 23875659
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  23875529 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 23875622  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  23875623 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 23875659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22081121 - 22080995
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaata 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | |||||||||||||    
T  22081121 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccctcaacgtaattagtattaata 22081023  T
Q  139 tactttcagggcat-aaggccccaacat 165  Q
    |||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  22081022 tacttctagggcatcaagcccccaacat 22080995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20908317 - 20908252
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  20908317 acctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 20908252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27325955 - 27325902
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325955 gactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 27325902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19774041 - 19773996
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774041 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 19773996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21834916 - 21834836
Alignment:
Q  378 taatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  21834916 taatatcaattcattt-caacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatacatttaatcattaaatcacattataa 21834836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22780588 - 22780543
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780588 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 22780543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25629714 - 25629530
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  25629714 atgcaatttagacctcctatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatc 25629615  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
      || ||||||| || |||||||| || ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  25629614 gcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 25629530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28496833 - 28496788
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496833 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 28496788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29809244 - 29809199
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29809244 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 29809199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16920993 - 16920847
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  16920993 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagaccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 16920894  T
Q  162 acatta-ttttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcca 207  Q
        || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16920893 ttgctatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 16920847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15041873 - 15041803
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccca 120  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15041873 gactcgacaatgcgacta-tgcaacctagacatctcatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccca 15041803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31478169 - 31478079
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  31478169 caattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 31478079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1587850 - 1587711
Alignment:
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | |||| |||    
T  1587850 tccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaa 1587753  T
Q  387 ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
     ||||| |||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1587752 atcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaag 1587711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 1595288 - 1595333
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1595288 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 1595333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4738846 - 4738725
Alignment:
Q  125 tattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggca-tgagcccccaa 223  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |   | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||||    
T  4738846 tattagtattaatatattgtcagg-cataagcccccatcg--agtttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaa 4738750  T
Q  224 caaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  4738749 caaatgtatgctaatgcatggactc 4738725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 23992199 - 23992244
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23992199 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 23992244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25603752 - 25603707
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25603752 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcat 25603707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 25644091 - 25644136
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25644091 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 25644136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31155644 - 31155465
Alignment:
Q  170 ttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggca-tgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatctta 268  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  31155644 ttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcga-catctt-aaacatctta 31155547  T
Q  269 atcatcgtctcatatacatccaataatttgga----gttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaa 347  Q
    | || | ||  | |||  ||||||||||||||      ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155546 aacaacttcgtaaata-gtccaataatttggaacatcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 34963142 - 34963187
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34963142 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 34963187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Original strand, 4186199 - 4186315
Alignment:
Q  125 tattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggca-tgagcccccaa 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |   | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||||    
T  4186199 tattagtattaatatactgtcagg-cataagcccccatcg--agtttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaa 4186295  T
Q  224 caaatgtatgctaatacatg 243  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4186296 caaatgtatgctaatgcatg 4186315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20803679 - 20803534
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||    
T  20803679 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcagcttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaa 20803582  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20803581 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaag 20803534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17288155 - 17288112
Alignment:
Q  69 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17288155 gcaacttagacctcttatatacatgtggtaccaatacagggcat 17288112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 17803962 - 17804016
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17803962 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 17804016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19303882 - 19303812
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19303882 tcatctttgactcgacaatatgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcat 19303812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 20593553 - 20593623
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20593553 tcatctttgactcaacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaaaccagggcat 20593623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 21702268 - 21702359
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  21702268 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttaattaaataacaattgcagcaaaatcaaatcacatcaa 21702359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27333518 - 27333448
Alignment:
Q  42 catcattgactcgac-aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27333518 catctttgactcgacgaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatccagggcat 27333448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27394258 - 27394188
Alignment:
Q  42 catcattgactcgac-aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27394258 catctttgactcgacgaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatccagggcat 27394188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3852445 - 3852407
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852445 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 3852407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8227811 - 8227773
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8227811 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 8227773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20557316 - 20557254
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  20557316 atgcaacttagacctcttatatgcatatggtaccaatccagggcatcaagcccccaacatatt 20557254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30677056 - 30677014
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30677056 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 30677014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 19651947 - 19652048
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacata-ttagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  19651947 atgcaacttaaatctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtagtaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 19652046  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  19652047 at 19652048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19848388 - 19848343
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19848388 atgcaacttagacctctcatatgcatgtggtaccaatacggggcat 19848343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20361279 - 20361234
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20361279 atgcaatttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcat 20361234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4738890 - 4738854
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738890 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 4738854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 152
Target Start/End: Original strand, 20076470 - 20076550
Alignment:
Q  74 ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20076470 ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatcgagggcatcaagcccccatcgctattagtattaatatacttccagggcat 20076550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 111
Target Start/End: Original strand, 23019156 - 23019200
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23019156 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatccagggca 23019200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 474
Target Start/End: Original strand, 1644462 - 1644545
Alignment:
Q  392 tttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1644462 tttcaacaacatcttgatcattcaaaaatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 1644545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19848089 - 19848034
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  19848089 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 19848034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Original strand, 1644309 - 1644359
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  1644309 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 1644359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31155729 - 31155695
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155729 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 31155695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31478315 - 31478265
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  31478315 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 31478265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16448911 - 16448866
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16448911 atgcaacttagacctcctatatgcatatggtaccaatccagggcat 16448866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Original strand, 18926657 - 18926690
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926657 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 18926690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19791143 - 19791049
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  19791143 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 19791049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20108888 - 20108933
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20108888 atgcaacttaaacctcttaaatgcatgtggtaccaatccagggcat 20108933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25136000 - 25135949
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25136000 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 25135949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27553938 - 27553844
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27553938 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-caaggcatgagcccccaacatcatagtattaatatact 27553844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9100940 - 9100904
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9100940 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 9100904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Original strand, 13019242 - 13019278
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13019242 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 13019278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 16760068 - 16760132
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16760068 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 16760132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 99
Target Start/End: Original strand, 18456478 - 18456510
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456478 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 18456510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 99
Target Start/End: Original strand, 18461638 - 18461670
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461638 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 18461670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 22948881 - 22948945
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22948881 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 22948945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 22952837 - 22952901
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22952837 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 22952901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 23871325 - 23871389
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23871325 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 23871389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 23875281 - 23875345
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23875281 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 23875345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15894427 - 15894348
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  | |||||||||    
T  15894427 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcaca 15894348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 19668124 - 19668211
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatat-tagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19668124 atgcaacttaaacctcttatatggatgtggtaccaatctagggcatcaagccctcaacgtataaagtattaatatacttccagggcat 19668211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 23992454 - 23992509
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  23992454 gactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 23992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25135797 - 25135706
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  25135797 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaactcaattaaataacatttgcagcattatcaaatcacatcaa 25135706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25603644 - 25603601
Alignment:
Q  170 ttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25603644 ttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagctccagggcat 25603601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4643041 - 4643003
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4643041 atgcaatttagacctcttatatgcatgtcgtaccaatac 4643003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1588055 - 1588008
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1588055 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1588008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 1644024 - 1644079
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1644024 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1644079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 8243347 - 8243402
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8243347 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 8243402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 11566376 - 11566431
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11566376 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 11566431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12619434 - 12619379
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12619434 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 12619379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 14471727 - 14471782
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14471727 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14471782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 16623868 - 16623923
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16623868 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16623923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 19870104 - 19870159
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19870104 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 19870159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 21702069 - 21702116
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21702069 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 21702116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 22862460 - 22862515
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22862460 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 22862515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 22948597 - 22948652
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22948597 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 22948652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 22952553 - 22952608
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22952553 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 22952608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 23394582 - 23394637
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23394582 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23394637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 23414419 - 23414474
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23414419 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23414474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 23871041 - 23871096
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23871041 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23871096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 23874997 - 23875052
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23874997 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23875052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 23989434 - 23989489
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23989434 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23989489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 27556177 - 27556232
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27556177 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 27556232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27567938 - 27567882
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagc-cccaaacatattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  27567938 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagctccccaacatcatagtattaatatact 27567882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4186150 - 4186118
Alignment:
Q  71 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4186150 aacttagacctcttatatacatgtggtaccaat 4186118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 14472044 - 14472108
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  14472044 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 14472108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18956096 - 18956032
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  18956096 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 18956032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19773978 - 19773898
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  19773978 tttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 19773898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 122)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 33 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22449656 - 22449169
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  22449656 aacatcattcatcattgactcgacattgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggaatgagcccccaacattttagta 22449557  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22449556 ttaatatactttcagggcataagcccctaacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtat 22449457  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagac 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||    
T  22449456 gctaatgcatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcagcatcatcttaatcatcttgtatagac 22449357  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattca 415  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||        | |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  22449356 tcatgcaacttagttaaataatagtagcagcataatcagatcacaacaagagcataatttcataatatcaatac-ttttcaacaacatcttgatcattca 22449258  T
Q  416 ataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  22449257 ataatatttcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcacagattgcagttaacatc 22449169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18182508 - 18182040
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  18182508 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcaacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacatggcatgagccccaa-cattttagt 18182411  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18182410 attaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccttcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgta 18182311  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtataga 322  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  18182310 tgctaatgcatggacttgatc-tctt-aaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtataga 18182213  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||        | ||||||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  18182212 ctcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattta-tttcaacaacatcttgatcattc 18182114  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||    
T  18182113 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattgaatcacattataaacaacttagcatctcataacagcttcaca 18182040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3473313 - 3472844
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  3473313 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaaactaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacattatagt 3473215  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3473214 attaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagcaaaagctccatcgtggtgaggacaaagctccagggtatgagcccccaacaaatgt 3473115  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatag 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  3473114 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcaacttaatcatcttgtatag 3473016  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca------tatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| |||  | ||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  3473015 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaagagtattaacttcataatatcaaatca-cttcaacaacatcttgatcattca 3472917  T
Q  416 ataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    | |||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  3472916 acaatatttcaagtaattcatttaatcattaaatcacatttcaaacaacttagcatttcataacagcttcaca 3472844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 355
Target Start/End: Original strand, 6151573 - 6151905
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    |||    
T  6151573 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcaaggcatgagcccccaacattatttta 6151671  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6151672 gtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 6151771  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtata 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||    
T  6151772 tatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtata 6151870  T
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6151871 gactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagca 6151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8761999 - 8761581
Alignment:
Q  53 cgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8761999 cgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagaccccaacagtttagtattaatatactttcagggcat 8761901  T
Q  153 aaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt-atgctaatacatggactcaa 250  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  8761900 aagcccccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgagcccccaacatatgttatgctaatgcatggactcaa 8761801  T
Q  251 tcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctca-tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaa 347  Q
    |||||||||  ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8761800 tcatcttaatcaacatcttaataaacatctcaatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcatcatagttaaataacaa 8761701  T
Q  348 tcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatc 438  Q
    |  ||||| || ||||||| | ||||| | |||         |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  8761700 taacagcacaagcagatcacaacaacaacataacttcataattatcaattca-tttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaatgcaatt 8761602  T
Q  439 aatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  8761601 aatcaataaatcacatcataa 8761581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22831774 - 22831446
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22831774 aacatcattcatcattgactcgactatgcaacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattttagta 22831676  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22831675 ttaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtat 22831576  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttca--------acatcatcttgtatagact 324  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  22831575 gctaatgcatggactcaatc-tcctaaaacatcttaatattcatctcatatatatccaataatttggagttcacatcatcttaatcatcttgtatagact 22831477  T
Q  325 catgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22831476 catgcaacatagttaaataacaatagcagca 22831446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17678960 - 17678532
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  17678960 gactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagagcatgatcccccaacagtttagtattaatatacttttagg 17678862  T
Q  149 gcataaggccccaaca--ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17678861 gcataagcccccaacaatttattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatggac 17678762  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||    
T  17678761 tcaatcatc-taaaacatcttaatcaacatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataacgactcatgcaacttggt 17678663  T
Q  338 taaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagta 430  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||        | ||| | ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  17678662 taaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttaatcattcaataatatttcaagta 17678564  T
Q  431 atgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||    
T  17678563 atgcatttaatcattaaataacattacaaaca 17678532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 1010744 - 1010925
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1010744 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 1010843  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010844 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 1010925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20091873 - 20091534
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20091873 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac 20091776  T
Q  124 atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaa 223  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20091775 attttagtattaatatactttcaaggcatgagcccccaacattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaa 20091676  T
Q  224 caaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg------ 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||  || |||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||          
T  20091675 caaatgtatgctaatgcatggactcga-cttctt-aaacatcaaaaacatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcatc 20091578  T
Q  317 ---tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
       ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20091577 ttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcata 20091534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 20228894 - 20228728
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228894 actcatgcaacttagtttaataacaatggcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 20228795  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228794 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 20228728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 16375543 - 16375377
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375543 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16375444  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375443 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 16375377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 21407376 - 21407542
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407376 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 21407475  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407476 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 21407542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24783290 - 24783004
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||            
T  24783290 aatgtatgctaatgcatgaactcaatcatct--aaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggatttcatcatcatcttaatcatct 24783193  T
Q  317 tat--agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24783192 tattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatgaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcttgatcattc 24783093  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||    
T  24783092 aataataattcaagtaatgcaattaattaataaatcacattataatcacttagcatttcataacagcttcacaattttcagttaacatc 24783004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42865614 - 42865271
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  42865614 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 42865517  T
Q  124 a-tatt--agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
    | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |  || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42865516 actatttgagtattaatatacttccagggcataagcctccatcgctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccc 42865417  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  42865416 caacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 42865318  T
Q  317 ------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
          ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  42865317 atcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacata 42865271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 52639562 - 52639728
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639562 actcatgtaacttagttaaataacaataacagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 52639661  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639662 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 52639728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21788422 - 21788081
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactt 143  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || | |||||||||||||||    
T  21788422 ttgactcgactatgagacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatactt 21788324  T
Q  144 tcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatg 243  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21788323 ccagggcataagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtactaagctccagggtatgagcccccaacatatgtatgctaatgcata 21788224  T
Q  244 gactcaatcatcttaaaa-catcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaac 332  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||         ||||||| ||| ||||||||||||    
T  21788223 gactcgatc-tcttaaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatcttattcatcttatattgactcatgcaac 21788125  T
Q  333 ttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  21788124 ttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagc 21788081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16080622 - 16080364
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatc--gtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||||    
T  16080622 aatgtatgctaatgcatggaccctatcaac--aaaacatcttaatcatcaagtcacttatacatccaataatttggagttcatcatcatattc---agac 16080528  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16080527 tcatgcaacttagttaattaaaaatagcagcataatcagatcacatcaataacttattatcaattcattttcaacaacttcttgatcatccaataataat 16080428  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||    
T  16080427 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataaaagcttcaca 16080364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 36819490 - 36819228
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  36819490 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcattaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 36819393  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatc-aattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36819392 tcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaccagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatcattcaataataa 36819293  T
Q  423 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||||||    
T  36819292 ttcaagaaatgcaatcaataaataaatcacaatataatcacttaacatttcataaaagcttcaca 36819228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 21714264 - 21714555
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  21714264 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 21714361  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714362 gctatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctattt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 21714460  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21714461 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcacaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 21714555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 284
Target Start/End: Original strand, 48603026 - 48603244
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaaca--tatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  48603026 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaaaggttattgagtattaatatacttccagggcataagcctccatc 48603125  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
      || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  48603126 gctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tctt-aaaca 48603223  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatata 284  Q
    || |||||||| |||| ||||    
T  48603224 tcataatcatcatctcttata 48603244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22131441 - 22131224
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  22131441 atgcaacttagacctcttatattcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacgttattgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcg 22131342  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacat 264  Q
     || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  22131341 ctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacat 22131244  T
Q  265 cttaatcatcgtctcatata 284  Q
    | |||||||| |||| ||||    
T  22131243 cataatcatcatctcttata 22131224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22469102 - 22468855
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  22469102 agcatcttaa-catctttcttcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 22469005  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22469004 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgggtactaagctccagggcatgagcccc 22468905  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatca 272  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22468904 caacaaatatatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcttaatca 22468855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 19211792 - 19212053
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |   |||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  19211792 aatgaatgctaatgcatggactctatcaacg--aaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 19211889  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19211890 ctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 19211987  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||  | |||||||||    
T  19211988 ttcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcataaaagcttcaca 19212053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 21022488 - 21022688
Alignment:
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacat 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21022488 ttattttgagctaatgctccatcgtggtgaggacaaagctctagggcatgag-ccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacat 21022585  T
Q  265 ctt-aatcatcgtctc--atatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgca 352  Q
    ||| ||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21022586 cttaaattatcatctcatatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagca 21022685  T
Q  353 gca 355  Q
    |||    
T  21022686 gca 21022688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 33797263 - 33797454
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  33797263 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 33797360  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  33797361 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgattaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 33797454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3705302 - 3705113
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||||||    
T  3705302 tggtgaggagaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatataca 3705203  T
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatct----------tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3705202 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcaatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 3705113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 322 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23819383 - 23819219
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  23819383 actcatgcaacttcgtttaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattttcagcaatttcttgatcattcaataata 23819286  T
Q  422 attcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||| |||  | |||||||||    
T  23819285 attcaagtaaagacaatcaatccataaatcactttatattcacttaacatctcataaaagcttcaca 23819219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45310602 - 45310417
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  45310602 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctagtgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 45310505  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45310504 tccaataatttggagttcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacgacagcagcataatcagatca 45310417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 20138008 - 20138209
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  20138008 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 20138105  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  20138106 ctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgaacattcaacaataa 20138203  T
Q  423 ttcaag 428  Q
    ||||||    
T  20138204 ttcaag 20138209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 125
Target Start/End: Original strand, 21022305 - 21022396
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  21022305 aacatcattcatcatggactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgaggccccaacat 21022396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45489977 - 45489792
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  45489977 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 45489880  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||| |||||||||| ||||||        ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  45489879 tccattaatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataatagcagcagcataatcagatca 45489792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 248
Target Start/End: Original strand, 34509516 - 34509726
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaat 137  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |   || | |||||||||    
T  34509516 catctttgactcgacaatgtgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaat 34509614  T
Q  138 atactttcagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgct 235  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| |  || ||||||| || |||||||| || ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    |||||    
T  34509615 atacttccagggcatcaaggacccatcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgct 34509713  T
Q  236 aatacatggactc 248  Q
    ||| |||||||||    
T  34509714 aatgcatggactc 34509726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 431
Target Start/End: Original strand, 18882323 - 18882496
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |  | |   ||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  18882323 aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttagagttcatcatcagcttattcataaaaatgcaacttagttaaataacattttcagca 18882422  T
Q  356 taatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    |||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18882423 taatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattatcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 18882496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41781859 - 41781782
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  41781859 atgcaaattagacctcttatatgtatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 41781782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 12646795 - 12647035
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaa-catcatcttgtat-ag 321  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||    
T  12646795 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcattcatcaacttatttcag 12646892  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  12646893 attcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaata 12646989  T
Q  422 attcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  12646990 attcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 12647035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 46975393 - 46975596
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  46975393 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatag 46975490  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     | |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  46975491 acgtgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 46975587  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  46975588 ttcaagtaa 46975596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18394199 - 18394014
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca-tcttaatcatcgtctca-tataca 286  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||    
T  18394199 tggtgaggacaaagttccagagcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggacttaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 18394102  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18394101 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 18394014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38801750 - 38801598
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  38801750 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 38801651  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  | ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  38801650 tcgctaattttgagttaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcat 38801598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1925214 - 1925084
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  1925214 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 1925121  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  1925120 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 1925084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20924228 - 20924098
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  20924228 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 20924135  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  20924134 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 20924098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 165
Target Start/End: Original strand, 20248008 - 20248134
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaat 137  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || |||||||||    
T  20248008 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaat 20248106  T
Q  138 atactttcagggcataaggccccaacat 165  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  20248107 atacttccagggcatcaagccccaacat 20248134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 103
Target Start/End: Original strand, 21709721 - 21709798
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21709721 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 21709798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Original strand, 33680734 - 33680860
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaata 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| | || ||||||||||    
T  33680734 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaacgtaataagtattaata 33680832  T
Q  139 tactttcagggcat-aaggccccaacat 165  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  33680833 tacttccagggcatcaagcccccaacat 33680860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 21022374 - 21022439
Alignment:
Q  143 ttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccat 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21022374 ttcagggcatgaggccccaacattattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccat 21022439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27251091 - 27250905
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||    
T  27251091 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctaggacatcaagccccca 27250992  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |  |||| |||||||| |||||||||    
T  27250991 tcgctaatttgagctaaagctccaatgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccctatcaatgaatgctaatgcatggactc 27250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33050242 - 33050074
Alignment:
Q  197 acaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataat 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||     ||||    |||| |||| |||||||||||    
T  33050242 acaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatacatggactcaatcaatctaaaac-----aatc----tctcaatatgcatccaataat 33050154  T
Q  296 ttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||||| ||||||         ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33050153 ttggagctcaacaacatcttattcatcatgtataaactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 33050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 39244221 - 39244096
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||  |||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  39244221 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--aacttaataagaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttca 39244128  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  39244127 agtaatgcatttaatcattaattcacagtata 39244096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 39247776 - 39247651
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||  |||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  39247776 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--aacttaataagaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttca 39247683  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  39247682 agtaatgcatttaatcattaattcacagtata 39247651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 41388321 - 41388196
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||  |||||||||  |||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  41388321 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcgtatca--agcttaataaaaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttca 41388228  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  41388227 agtaatgcatttaatcattaattcacagtata 41388196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20134941 - 20134986
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20134941 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 20134986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20847450 - 20847330
Alignment:
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaa-cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |    
T  20847450 agtattaatatacttccagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-a 20847352  T
Q  227 atgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  20847351 atgaatgctaatgcatggactc 20847330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Original strand, 21313044 - 21313185
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatc---------atct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||    
T  21313044 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatct 21313141  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataa 358  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21313142 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa 21313185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22922237 - 22922136
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22922237 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 22922138  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  22922137 at 22922136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 21753800 - 21753887
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc-aaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  21753800 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaacccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 21753887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24783424 - 24783366
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 106  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783424 ttgactcgaccatgagacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 24783366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50210604 - 50210534
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50210604 tcatctttgactcgacaatgtgacta-tgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 50210534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20847516 - 20847459
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847516 ttgactcgacaatacgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 20847459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 431498 - 431543
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  431498 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 431543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13213249 - 13213204
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13213249 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 13213204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 16361686 - 16361731
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16361686 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 16361731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20916030 - 20916075
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20916030 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 20916075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 21840406 - 21840451
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21840406 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 21840451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22123490 - 22123429
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||    
T  22123490 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcacaagcccccaacgtatt 22123429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 22532029 - 22532074
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22532029 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 22532074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 29776418 - 29776463
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29776418 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 29776463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20229161 - 20229078
Alignment:
Q  392 tttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  20229161 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 20229078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 21172777 - 21172831
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172777 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 21172831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 21312893 - 21312947
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21312893 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 21312947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41050404 - 41050317
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41050404 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 41050317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14295939 - 14295901
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295939 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 14295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15860418 - 15860380
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860418 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15860380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16275791 - 16275753
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275791 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 16275753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 20916093 - 20916174
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaa 250  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  20916093 tttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactcaa 20916174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 21341872 - 21341910
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341872 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 21341910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 21346736 - 21346774
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346736 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 21346774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 21477402 - 21477440
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477402 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 21477440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27161886 - 27161824
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  27161886 atgcaacttagatctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaacatatt 27161824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16368653 - 16368608
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16368653 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 16368608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 16758406 - 16758451
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16758406 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 16758451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20454944 - 20454907
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454944 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaata 20454907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Original strand, 40388932 - 40388973
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40388932 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagg 40388973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 45575276 - 45575231
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45575276 atgcaacttagacctattatatgcatgtggtaccaatacggggcat 45575231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Original strand, 31612055 - 31612091
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612055 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 31612091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52928365 - 52928294
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  52928365 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaatctagggcat 52928294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Original strand, 6151976 - 6152055
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||    
T  6151976 tcattcactaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataaacagcttaacatttcataacagcttcaca 6152055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 102
Target Start/End: Original strand, 21161504 - 21161539
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21161504 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 21161539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36819638 - 36819584
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36819638 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 36819584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18393981 - 18393867
Alignment:
Q  390 attttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||  | |||||||||     
T  18393981 attttcaacaacttcaaggttattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacag 18393882  T
Q  489 ataacagttaacatc 503  Q
    ||  |||||||||||    
T  18393881 atctcagttaacatc 18393867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 22237382 - 22237480
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacata-ttagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaacat 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||  ||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  22237382 caacttagacctcttatatgaatgtggtacaaatccagggcatcaagccctcaacgtagtaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaacat 22237480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 50622315 - 50622226
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50622315 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 50622226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21896624 - 21896579
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21896624 atgcaacttaaacctcttatgtgcatgtggtaccaatccagggcat 21896579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Original strand, 29297880 - 29297921
Alignment:
Q  71 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29297880 aacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 29297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Original strand, 40129356 - 40129389
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129356 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacc 40129389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 45310387 - 45310270
Alignment:
Q  387 ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttca 485  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||  | |||||||    
T  45310387 ttcattttcaacaacttcaaggttattcaagaataaatcaagcaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttca 45310288  T
Q  486 caaataacagttaacatc 503  Q
    || ||  |||||||||||    
T  45310287 cagatctcagttaacatc 45310270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 247
Target Start/End: Original strand, 21161588 - 21161668
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctcca-tcatggtgagtacaaagctccatggca-tgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21161588 tttgagctaaagctccaatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggact 21161668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Original strand, 21706942 - 21706978
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21706942 atgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaat 21706978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Original strand, 21711484 - 21711520
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21711484 atgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaat 21711520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3705432 - 3705340
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatata 140  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  3705432 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaac-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatata 3705340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 208
Target Start/End: Original strand, 21022442 - 21022485
Alignment:
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccat 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21022442 ttattttgagctaatgctccatcgtggtgaggacaaagctccat 21022485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 503
Target Start/End: Original strand, 21022767 - 21022854
Alignment:
Q  417 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| || ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21022767 taatatttcaagtaatgcaattaatcattaattcacattataatcagcttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaacatc 21022854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 35261402 - 35261359
Alignment:
Q  69 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35261402 gcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 35261359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 103
Target Start/End: Original strand, 52639053 - 52639110
Alignment:
Q  45 cattgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52639053 cattgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 52639110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16080729 - 16080691
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16080729 aatgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 16080691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22831375 - 22831325
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22831375 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 22831325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 26064689 - 26064778
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26064689 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtgttaagtattaatatacttccagggcat 26064778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 45489766 - 45489688
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  45489766 caattcattttcaacaacatcaagtttattcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 45489688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 50614487 - 50614398
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50614487 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccagtccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 50614398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 1010237 - 1010292
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1010237 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1010292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1925746 - 1925691
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1925746 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1925691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16376050 - 16375995
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16376050 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16375995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18394291 - 18394235
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  18394291 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 18394235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20229314 - 20229208
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |  || | |||| ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |    
T  20229314 actcttgcaacttagttaaataacaattccagcataatcaaatcacatta--agttaaataacaaatcattctcaaaagtttcttgatcattcaacaaca 20229217  T
Q  422 attcaagta 430  Q
    |||||||||    
T  20229216 attcaagta 20229208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20924760 - 20924705
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20924760 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 20924705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 33797033 - 33797088
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaat-gcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33797033 ttgactcgacaattgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 33797088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39244511 - 39244456
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39244511 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 39244456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39248066 - 39248011
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39248066 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 39248011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45490069 - 45490013
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  45490069 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 45490013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1925462 - 1925398
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1925462 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 1925398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 20135214 - 20135250
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20135214 gactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcata 20135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20924476 - 20924412
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  20924476 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 20924412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22468790 - 22468754
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22468790 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 22468754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 42865200 - 42865160
Alignment:
Q  419 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42865200 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 42865160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 124)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 30643682 - 30643240
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  30643682 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacagtttagt 30643584  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30643583 attaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagttccagggcatgagcccccaacaaatgta 30643484  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatca---------tcttgtataga 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||    
T  30643483 tgctaatgcatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgaataga 30643384  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||         | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  30643383 ctcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattc 30643285  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  30643284 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcatattataa 30643240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22011042 - 22010723
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  22011042 ttgactcaacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagcattatagtattaatatactttca 22010944  T
Q  147 gggcataaggccccaaca--ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22010943 gggcataagcccccaacagtttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccctaacaaatgtatgctaatgcatgg 22010844  T
Q  245 actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataa 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22010843 actcaatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttggttaaataa 22010745  T
Q  345 caatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  22010744 caaaagcagcataatcagatca 22010723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17927081 - 17926637
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttc 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||    
T  17927081 attgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcctccagcattatagtattaatatactttc 17926983  T
Q  146 agggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17926982 agggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatactaatgcatgga 17926883  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||    
T  17926882 ctcaatcatc-taaaacatcttaatcataatctcgtatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 17926784  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt--------aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||||| | ||||||| |        |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  17926783 ttaaataacaatagtagcataggcagatcaaaacaacagcataatttcacaatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaag 17926685  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  17926684 taatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 17926637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16410638 - 16410185
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattga-ctcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  16410638 aacatctttcatcatttaactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgaatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagt 16410540  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16410539 attaatatactttcagggcataagcccccaacagttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgt 16410440  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatac--atccaataatttgga-gttcaacatcatcttgtatagactcat 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||    
T  16410439 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaccatcttaatcatcatctcatatacatatccaataatttggatattcaacatcatcttataatgactcat 16410341  T
Q  328 gcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataa 419  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        | ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16410340 gcaacttagtgaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataataccaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataa 16410242  T
Q  420 taattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  16410241 tatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 16410185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 128 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15611754 - 15611420
Alignment:
Q  128 tagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15611754 tagtattaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaa 15611655  T
Q  228 tgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcat 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611654 tgtatgctaatgcatggactcaatcatc-taagacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcat 15611556  T
Q  328 gcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataa 419  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  15611555 gcaacttggttaaataacaaaaccagcataatcagatcacatcaacagcaaaatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataa 15611457  T
Q  420 taattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15611456 tatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 15611420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20466434 - 20465945
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    ||     
T  20466434 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcctccaacattattttt 20466336  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20466335 gtattaatatactttcagggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 20466236  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaataatttggagttcaacatcatct-----------tg 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           |     
T  20466235 tatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaataatcatctcttatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttata 20466137  T
Q  317 tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| | |||||         | ||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  20466136 tatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttga 20466038  T
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaac 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||| ||  ||||||||    
T  20466037 tcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttagcatttcataacagcttcacagattgcagttaac 20465945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 128 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15603302 - 15602920
Alignment:
Q  128 tagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15603302 tagtattaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtagaaatctccagggcatgagcccccaacaaa 15603203  T
Q  228 tgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcat 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603202 tgtatgctaatgcatggactcaatcatc-taagacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcat 15603104  T
Q  328 gcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataa 419  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||        | ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  15603103 gcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacatcaacagcaaaatttcataatatcgattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataa 15603005  T
Q  420 taattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagca-tttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||| | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  15603004 tatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacagacaacttagcagtttcaa-acagcttcacagatttcagttaacatc 15602920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 366
Target Start/End: Original strand, 376973 - 377339
Alignment:
Q  10 acatcatcaacataagcatcttaaacatcatt-catcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  376973 acatcttcaacataagcatcttaaacatcatagcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagg 377071  T
Q  109 gcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccat 208  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||     
T  377072 gcatgagcccccaacattttagtattaatatactttcaaggcatgagcccccaacattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccag 377171  T
Q  209 ggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaataatttggagttcaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  377172 ggcatgagcccccaacaaatgtatgcaaatggatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatatccaataatttggagttcaa 377270  T
Q  307 c---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |         ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  377271 catcatcttaatcatcttgtatatactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatca 377339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16861700 - 16861271
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16861700 ttgactcgacaatgtgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 16861602  T
Q  147 gggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  16861601 gggcataagcccccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgtgcccccaacatatgtatgttaatgcatgga 16861502  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||  |    
T  16861501 ctcaatca-cctaaaacatcttaatcaacatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaactcgg 16861403  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||        | ||| | ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  16861402 ttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatatttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttaatcattcaataatatttcaagt 16861304  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||| | | ||||| |||||||||||| |||||    
T  16861303 aatgtatttaatcattaaatcacattacaaaca 16861271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 43251834 - 43252000
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43251834 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 43251933  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251934 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 43252000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19278368 - 19278202
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278368 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 19278269  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278268 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 19278202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21972670 - 21972504
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972670 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 21972571  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972570 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 21972504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21976755 - 21976589
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976755 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 21976656  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976655 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 21976589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20856801 - 20856357
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatatta-gtattaatatactttcagg 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  20856801 actcgacaatgagacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatgagcccccaacagtttaagtattaatatactttcagg 20856703  T
Q  149 gcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20856702 gcataagcccccaacaattattttgagctaaagctccatcgttgtgaggacaagactccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggact 20856603  T
Q  248 caatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttag 336  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||         ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20856602 caatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 20856503  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatc--------aacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |        |||  | ||| | |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||    
T  20856502 ttaaataacaa-agcagcataatcagatcacaacaatattataacttcataacaacaattcattttcaacaacatctaggttattcaagaataattcaag 20856404  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttca 474  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  20856403 taatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttagcaattca 20856357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 16184464 - 16184728
Alignment:
Q  52 tcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagg 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   || | ||||||||||| ||| ||||    
T  16184464 tcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttatttgagtattaatattcttccagg 16184562  T
Q  149 gcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16184563 gcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcataagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactc 16184662  T
Q  249 aatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16184663 gatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggagttcaacatcatctt 16184728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23777195 - 23776884
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  23777195 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcattattgagtattaatatacttccaaggcataagcccccatc 23777096  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
      || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  23777095 gctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaaca 23776997  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcag 353  Q
    ||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||         ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23776996 tctcaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcag 23776897  T
Q  354 cataatcagatca 366  Q
    ||||  |||||||    
T  23776896 cataggcagatca 23776884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 39095302 - 39094869
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttc 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  39095302 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttc 39095205  T
Q  146 agggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  39095204 agggcataagcccccaacaattatttgagcaaatgcttcatcgtggtgaggactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcataga 39095105  T
Q  246 ctcaatca-tcttaaaacatcttaatcatcgtctca-tatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactt 334  Q
    |||||||| ||| |||  |||| ||||| | || || ||| || |||||||||||||| ||||||         ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  39095104 ctcaatcaatctaaaataatctcaatcaacatcccaatatgcagccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcttataatgactcatgcaactt 39095005  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||         | ||||| |||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| |||    
T  39095004 agttaaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacaattcattttcaacaacatcaaggttattcaagaataaatca 39094905  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||    
T  39094904 agtaatgcatttaatcattaaattacattacaaaca 39094869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21169111 - 21168840
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||     
T  21169111 ttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatacatggcatgagcccccatcgttattgagtattaatatacttc 21169013  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21169012 cagggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgg 21168913  T
Q  245 --actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168912 aaactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatctt 21168840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 354 - 488
Target Start/End: Original strand, 22111904 - 22112038
Alignment:
Q  354 cataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 453  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111904 cataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 22112003  T
Q  454 ttataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22112004 ttataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 22112038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 19898852 - 19899104
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  19898852 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgcgcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatc 19898951  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  19898952 gttaatttgagcgaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaaca 19899050  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19899051 tcttaatcatcatctcttaggtatccaataatttggaggttcaacatcgtcttg 19899104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 19982809 - 19983102
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |    
T  19982809 agcatcttaa-catctttcatcaatgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttataggcatgtggtaccaattcagggcctgagcccccatc 19982906  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  19982907 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagctagtgctccatcgtgttgactactaagctccagggcatgagcccc 19983006  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19983007 caacatatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatcttttatgtatctaataatttggaggttcaacatcgtcttg 19983102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21162438 - 21162167
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-attag-tattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| | |||||||||||||     
T  21162438 ttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttattgggtattaatatacttc 21162340  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    || |||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21162339 caaggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgg 21162240  T
Q  245 --actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21162239 aaactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttaagtatccaataatttggaggttcaacatcatctt 21162167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16231656 - 16231395
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  16231656 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 16231559  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16231558 ctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaaattcttgatcattcaataataa 16231461  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||| |||||||  | |||||||||    
T  16231460 ttcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagcttcaca 16231395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44385207 - 44385023
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| | | | |    
T  44385207 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattaagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcctcaatc 44385108  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44385107 gttaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgaatgctaatgcatggactc 44385023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 169 - 366
Target Start/End: Original strand, 24755577 - 24755782
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatctta 268  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24755577 tttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcataagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatctta 24755675  T
Q  269 atcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataat 359  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  24755676 atcatcatctcttatgtatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataag 24755775  T
Q  360 cagatca 366  Q
    |||||||    
T  24755776 cagatca 24755782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19259872 - 19259700
Alignment:
Q  143 ttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19259872 ttcagggcatgagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgaggaaaaagttctagggcatgagcccccaacaaatgtatgctactgcat 19259773  T
Q  243 ggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19259772 ggactcaatc-tattaaaacatcttaattatcatctcatatatatccaataatttggaggtacaacatcatctt 19259700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 22044809 - 22045070
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||   | |||    
T  22044809 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcgtcaacttaattcaga 22044906  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22044907 ctcatgcaacttagtttgataacaattgcagcacaatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattccataataa 22045004  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||| |||  | |||||||||    
T  22045005 ttcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatctcataaaagcttcaca 22045070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17354237 - 17354001
Alignment:
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaat 228  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17354237 agtattaatatacttccaaggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatgagcccctaacaaat 17354138  T
Q  229 gtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg---------ta 318  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||    
T  17354137 gtatgctaatgcatggactcgat-ttctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcatcttata 17354040  T
Q  319 tagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17354039 tcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 17354001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14398229 - 14398042
Alignment:
Q  285 catccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatc 384  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||  | ||||||||| |    
T  14398229 catccaataatttcgagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcgcat--aaagcttaataac 14398132  T
Q  385 aattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  14398131 aattca-tttcaacaacaacttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 14398042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 15531815 - 15532018
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |     
T  15531815 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacatag 15531912  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  15531913 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 15532009  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  15532010 ttcaagtaa 15532018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 451
Target Start/End: Original strand, 21383634 - 21383801
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||  |||||||    
T  21383634 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--agcttaa 21383731  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatca 451  Q
    || ||||||| |||||||||| || | ||||||||||| || ||| || |||||| | ||||| |||||||    
T  21383732 taacaattca-tttcaacaacatcttaatcattcaatactatttcgagcaatgcatttaatcattaaatca 21383801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5866637 - 5866450
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  5866637 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 5866538  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  5866537 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 5866450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 458
Target Start/End: Original strand, 21387054 - 21387228
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  21387054 tatacatccaataatttgaagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 21387151  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    || ||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| || ||| |  |||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  21387152 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcgatactatttcgaacaatgcatttaatcattaaatcacagtata 21387228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 21249143 - 21249329
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  21249143 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccccca 21249242  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  21249243 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 21249329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 21254981 - 21255167
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  21254981 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccccca 21255080  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  21255081 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 21255167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 23913816 - 23913893
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  23913816 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 23913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Original strand, 15538427 - 15538577
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-gct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||| | |    
T  15538427 catatacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtt 15538523  T
Q  378 taatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15538524 taataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataactcaagtaa 15538577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22873656 - 22873574
Alignment:
Q  36 atcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22873656 atcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccc 22873574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 24755482 - 24755568
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24755482 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcttgagcccc 24755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19259939 - 19259850
Alignment:
Q  35 catcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19259939 catcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcacgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacat 19259850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45131359 - 45131172
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  45131359 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatagagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 45131260  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  45131259 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 45131172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13597980 - 13597816
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcataaggcccca- 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||     
T  13597980 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcatcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccag 13597881  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaaca 225  Q
     |  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13597880 tcgctaatttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaca 13597816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23847195 - 23846992
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  23847195 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa 23847098  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  23847097 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacagatttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 23847001  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  23847000 ttcaagtaa 23846992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Original strand, 21490753 - 21490960
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |   || | ||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||    
T  21490753 atgcaacttagaccttttatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccacaa 21490852  T
Q  163 -cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaa 260  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || | |||||||| ||||||||| | | |||||||    
T  21490853 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aacgaatgctaatgcatggactcga-cctcttaaa 21490950  T
Q  261 acatcttaat 270  Q
    ||||||||||    
T  21490951 acatcttaat 21490960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 23834097 - 23834301
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  23834097 aatgaatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 23834194  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  23834195 ctcatgcaacatagtttaataacaattgcatcatagtcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaatttcttggtcattcaacaataa 23834292  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  23834293 ttcaagtaa 23834301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30308878 - 30308695
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  ||||     ||||    
T  30308878 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaaattagtttaataacaattgcaacataatcaaatcccatca--gatttaa 30308781  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    || ||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  30308780 taacaaatcattcacaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaatacaatcaatccataattcacttcataatcactta 30308695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18862730 - 18862600
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  18862730 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 18862637  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  18862636 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 18862600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 21828099 - 21827969
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  21828099 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 21828006  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  21828005 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 21827969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17828709 - 17828590
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||  |||||    
T  17828709 catatacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacatagacatgcaacttagttaattaacatttgcagcataatcaaatcacatca--agctt 17828612  T
Q  379 aatatcaattcattttcaacaa 400  Q
    |||| ||| ||||| |||||||    
T  17828611 aataacaaatcattctcaacaa 17828590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21389813 - 21389626
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| | |||    
T  21389813 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgcca 21389714  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  21389713 tcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 21389626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21396343 - 21396156
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca-tgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| | |||    
T  21396343 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtgccaatacagggcattaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgcca 21396244  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  21396243 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcataaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 21396156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21779139 - 21778952
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| | |||    
T  21779139 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgcca 21779040  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  21779039 tcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 21778952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21790836 - 21790649
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca-tgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| | |||    
T  21790836 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtgccaatacagggcattaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgcca 21790737  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  21790736 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcataaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 21790649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 6520116 - 6520217
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6520116 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatactttcagggcatcaagcccccaac 6520215  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  6520216 at 6520217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 17140671 - 17140840
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctctt-atatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt---agtattaatatactttcagggcat-aaggccc 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |  ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  17140671 atgcaacttagacctctttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 17140770  T
Q  160 caacatta--ttttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
    || |  ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17140771 catcgctaatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 17140840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18818770 - 18818620
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  18818770 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 18818671  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  ||  |||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||    
T  18818670 tcgcta-attgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 18818620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 111
Target Start/End: Original strand, 23406135 - 23406183
Alignment:
Q  63 acaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406135 acaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca 23406183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 207
Target Start/End: Original strand, 7372538 - 7372682
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |    | | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  7372538 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaatcccccatcgctgtttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 7372637  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcca 207  Q
     || || ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  7372638 tcaata-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctcca 7372682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 453
Target Start/End: Original strand, 21410971 - 21411096
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  21410971 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 21411064  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 453  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  21411065 tttcaaataatgcatttaatcattaattcaca 21411096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 453
Target Start/End: Original strand, 21805463 - 21805588
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  21805463 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 21805556  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 453  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  21805557 tttcaaataatgcatttaatcattaattcaca 21805588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 32605191 - 32605339
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||  || | ||    
T  32605191 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcacaatcaaatcacatca--agttaaa 32605288  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  32605289 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagtaa 32605339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 487
Target Start/End: Original strand, 18619555 - 18619664
Alignment:
Q  379 aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaata 477  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||| |||  |    
T  18619555 aatntcaattcattttcagcaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaagacaatcaatccataaatcactttatattcacttaacatctcataa 18619654  T
Q  478 tagcttcaca 487  Q
     |||||||||    
T  18619655 aagcttcaca 18619664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18879590 - 18879545
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879590 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 18879545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20535968 - 20536013
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20535968 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 20536013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21919317 - 21919272
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919317 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 21919272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24445686 - 24445541
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatca--tcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  |||||||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |     
T  24445686 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaatttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacatag 24445589  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
     |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||    
T  24445588 acatgcaacttagttaaataacatttacagcataatcaaatcacatca 24445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 31971059 - 31971104
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971059 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 31971104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17055504 - 17055424
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatca 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17055504 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca 17055424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 21673458 - 21673558
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  21673458 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagccccaaca 21673557  T
Q  165 t 165  Q
    |    
T  21673558 t 21673558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 487
Target Start/End: Original strand, 22028647 - 22028743
Alignment:
Q  392 tttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||| |||||||  | |||||||||    
T  22028647 tttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagcttcaca 22028743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 32598659 - 32598750
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  32598659 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcacaatcaaatcacatcaa 32598750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14409830 - 14409785
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409830 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 14409785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16413741 - 16413696
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413741 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 16413696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17612453 - 17612408
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17612453 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 17612408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18678426 - 18678381
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18678426 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 18678381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18717615 - 18717570
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18717615 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 18717570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 19896004 - 19896049
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19896004 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 19896049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 270
Target Start/End: Original strand, 31971123 - 31971222
Alignment:
Q  170 ttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatctta 268  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  31971123 ttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacaactta 31971220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 41597927 - 41597972
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41597927 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 41597972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 45291119 - 45291074
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45291119 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 45291074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 22626472 - 22626542
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22626472 tcatctttgactcgacaatgtgacta-tgcaacatagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcat 22626542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38855586 - 38855484
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacata--ttagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  ||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  38855586 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatccagggcatcaagccctcaacgtaattaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaa 38855487  T
Q  163 cat 165  Q
    |||    
T  38855486 cat 38855484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13508446 - 13508408
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13508446 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 13508408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16199901 - 16199820
Alignment:
Q  167 attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16199901 attttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 16199820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19937476 - 19937438
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937476 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 19937438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 26223649 - 26223687
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26223649 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 26223687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Original strand, 4083738 - 4083779
Alignment:
Q  71 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4083738 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 4083779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15203654 - 15203609
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15203654 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 15203609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 21673401 - 21673446
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21673401 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 21673446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 22874829 - 22874874
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22874829 atgcaacatagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 22874874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23761213 - 23761112
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| |||  | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  23761213 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctatggcatcaagccctaaatgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 23761114  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  23761113 at 23761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26356030 - 26355929
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  26356030 atgcaacttaaacctcttgtatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 26355931  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  26355930 at 26355929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 104
Target Start/End: Original strand, 32121548 - 32121585
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121548 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaata 32121585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 24352772 - 24352862
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  24352772 atgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtatttaagtattaatatacttccagggcat 24352862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18678196 - 18678141
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  18678196 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 18678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 503
Target Start/End: Original strand, 24755842 - 24755937
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  24755842 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatc 24755937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 32121759 - 32121814
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  32121759 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 32121814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 22965478 - 22965516
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22965478 atgcaacttagacctcttgtatgcatgtggtaccaatac 22965516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25484695 - 25484657
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25484695 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 25484657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 983774 - 983733
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  983774 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagg 983733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16092657 - 16092612
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092657 atgcaacttagacatgttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 16092612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 407 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22010678 - 22010609
Alignment:
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22010678 gatcattcaagaatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 22010609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30309080 - 30309029
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30309080 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 30309029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15603351 - 15603304
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgt 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  15603351 attgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgt 15603304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15611803 - 15611756
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgt 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  15611803 attgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgt 15611756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18862978 - 18862914
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18862978 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 18862914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21828347 - 21828283
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21828347 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 21828283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28649365 - 28649329
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28649365 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaat 28649329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17055707 - 17055656
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  17055707 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagac-tcctgtatgcatgtggtaccaat 17055656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18863262 - 18863207
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18863262 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 18863207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 21386847 - 21386902
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21386847 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 21386902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 21410439 - 21410494
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21410439 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 21410494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 21804931 - 21804986
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21804931 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 21804986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21828631 - 21828576
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21828631 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 21828576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 22111445 - 22111500
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22111445 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 22111500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30940694 - 30940639
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30940694 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 30940639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 32598460 - 32598507
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32598460 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 32598507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 32604992 - 32605039
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32604992 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 32605039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 43251325 - 43251380
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43251325 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 43251380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 503
Target Start/End: Original strand, 377414 - 377494
Alignment:
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  377414 tcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattatgatcagcttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatc 377494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19259565 - 19259485
Alignment:
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  19259565 tcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaacatc 19259485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 21410723 - 21410787
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  21410723 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 21410787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 21805215 - 21805279
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  21805215 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 21805279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21919255 - 21919176
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  21919255 tttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccgcaac-aatgaatgctaatgcatggactc 21919176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Original strand, 14815 - 15254
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagta 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  14815 aacatcattcatcatcgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacaatttagta 14914  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14915 ttaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccaggg--tgagcccccaacaaatgtat 15012  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagac 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| ||    
T  15013 gctaatgcatggactcaatcatcttaaaatatcttaatcatcatctcatatacacccaataagttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatacac 15112  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatc-------aacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |       |||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  15113 tcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcacaacacagcataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaa 15211  T
Q  417 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15212 taatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 15254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 153)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Original strand, 2759880 - 2760303
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  2759880 ttgactcgacaatgcaacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagtattaatatactttca 2759978  T
Q  147 gggcataaggccccaaca--ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2759979 gggcataagcccccaacagtttattttaagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgg 2760078  T
Q  245 actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataa 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760079 actcaatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataa 2760177  T
Q  345 caatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaa 436  Q
    | |  ||||||||||||||||| | |||||         | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  2760178 cgaaagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataatatcaattcattttcaacaacatcatgatcattcaataatatctcaagtaatgcat 2760277  T
Q  437 tcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||    
T  2760278 ttaatcattaaatcacattacaaaca 2760303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12322128 - 12321690
Alignment:
Q  35 catcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtat 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  12322128 catcattcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgaaacttagacctcttat--gcatgtggtaccaattcaggggatgagcccccaacattttagtat 12322032  T
Q  134 taatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatg 233  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12322031 aaatatacgttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatg 12321932  T
Q  234 ctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagact 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||    
T  12321931 ctaatgcatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagtttaacatcttcttaatcatcttgtatagact 12321832  T
Q  325 catgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaa 416  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |    
T  12321831 catgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcca 12321733  T
Q  417 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12321732 taatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 12321690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Original strand, 14429610 - 14430050
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  14429610 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattatagt 14429708  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  14429709 attaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccccaac-aatgt 14429807  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatag 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  14429808 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatag 14429906  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||       | | ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  14429907 actcatgcaacttagttaaataacaatagccgcataatcagatcacaacaacagtatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcattc 14430005  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14430006 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 14430050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17138461 - 17138169
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17138461 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaac 17138364  T
Q  124 ata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17138363 attattttagtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccc 17138264  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17138263 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 17138169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Original strand, 12186743 - 12187027
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||    |||    
T  12186743 aacatcattcatcactgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatttagggcatgagcctccaacattatttta 12186841  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12186842 gtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctctagggcatgagcccccaacaaatg 12186941  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12186942 tatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 12187027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 226 - 503
Target Start/End: Original strand, 15580617 - 15580893
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg-tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagact 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  15580617 aatgtatgctaatgcatggactcaatcatct--aaacatcttaatcatcaatctctcatacatccaataatttggagttcatcatcatcttattcagact 15580714  T
Q  325 catgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15580715 catgcaacttagttaaataacgatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttttttatcattcaataataatt 15580814  T
Q  425 caagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||||    
T  15580815 caagtaatgcaatcaattaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttttcagttaacatc 15580893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 70850 - 70669
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  70850 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaattattcaataata 70751  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70750 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 70669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 74959 - 74778
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  74959 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaattattcaataata 74860  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74859 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 74778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 12318052 - 12318313
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||    
T  12318052 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaatagtttggagttcatcatcatcttattcagac 12318149  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12318150 tcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcttaatcattcaataataat 12318249  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  12318250 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacatttcataatagcttcaca 12318313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 33128 - 33309
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33128 actcatgcaactgagttaaataacaataacagcataatcggaacatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 33227  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33228 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 33309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13635650 - 13635389
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||| | |   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  13635650 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaattaacaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 13635553  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13635552 tcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataat 13635453  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13635452 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 13635389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 39722287 - 39722453
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722287 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaactcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 39722386  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722387 attcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 39722453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 12714885 - 12715051
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714885 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12714984  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714985 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 12715051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 12718689 - 12718855
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718689 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12718788  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718789 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 12718855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 16114262 - 16114428
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114262 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16114361  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114362 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 16114428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 16117415 - 16117581
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117415 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16117514  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117515 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 16117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 16907286 - 16907120
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907286 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16907187  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907186 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 16907120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 18283387 - 18283553
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283387 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 18283486  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283487 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 18283553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 26292416 - 26292582
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26292416 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttccttatcattcaataata 26292515  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292516 attcaattaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 26292582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 18279424 - 18279590
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279424 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacaacttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 18279523  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279524 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 18279590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12704744 - 12704578
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704744 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcagcagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12704645  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704644 attcaagtaatgcattcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 12704578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 12723600 - 12723766
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723600 actcatgtaacttagttaaataacaatatcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaatttattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12723699  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723700 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 12723766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 230 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15605447 - 15605192
Alignment:
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcat 327  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||||||||    
T  15605447 tatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcatattc---agactcat 15605353  T
Q  328 gcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa-ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15605352 gcattttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatcattcaataataattca 15605253  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  15605252 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacatttcataatagcttcaca 15605192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 260 - 487
Target Start/End: Original strand, 11312596 - 11312834
Alignment:
Q  260 aacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------cttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaat 348  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11312596 aacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaat 11312695  T
Q  349 cgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaa 448  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312696 agcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaa 11312795  T
Q  449 tcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  11312796 tcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 11312834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 16583181 - 16583441
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcat--atacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |   |||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  16583181 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacaaatcactaatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 16583278  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  16583279 tcatgcaacgtagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttctcgatcattcaacaataat 16583378  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16583379 tcaagtaatgcaatcaatc-ataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 16583441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19649889 - 19649547
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19649889 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatccatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 19649792  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19649791 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 19649692  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  19649691 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaatatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 19649594  T
Q  317 ----tata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19649593 atcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 19649547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 316
Target Start/End: Original strand, 9702988 - 9703272
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  9702988 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccatcgctatttga 9703085  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9703086 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 9703185  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9703186 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatattaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttgaacatcatcttg 9703272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 39268133 - 39267848
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39268133 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactctatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 39268035  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcat---------cttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagat--------catatca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||   |    
T  39268034 caataatttggagttcaacatcatcttgatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccacaacattaaa 39267935  T
Q  372 acagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||  | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  39267934 acttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaatactatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 39267848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18155240 - 18154949
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  18155240 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 18155143  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18155142 gctatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctattt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 18155044  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18155043 caacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatctcaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacttcatcttg 18154949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32216948 - 32216656
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  32216948 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctctt-tatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 32216852  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32216851 gctatttgagtattaaaatattttcaaggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttaagtactaagctccagggcatgagcccc 32216752  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32216751 caacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtaaccaataatttggaggttcaacatcatcttg 32216656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 459
Target Start/End: Original strand, 3271706 - 3271991
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3271706 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaattatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 3271804  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  3271805 caataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcata 3271904  T
Q  380 a---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |         |||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3271905 acttcataattatcaattca-tttctacaacatcttgattattcaataat-attcaagtaatgcaattaatcagtaaatcacatcataa 3271991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Original strand, 15211171 - 15211431
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15211171 agcatcttaa-catctttcatcattgactcaactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggcaccaatacagggcatgagcccccaac 15211268  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | | ||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15211269 gttatttgaatattaatatacttccagggcatgagcccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccc 15211368  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatata 284  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15211369 caacttatgtatgctaatgcatggactctaac-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttata 15211431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 24054190 - 24054467
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  24054190 aacatcatacatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttga 24054288  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |  ||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24054289 gtattaatatacttccagggcatgagcccccatctctattt-gagctaaagctccatcgcgttgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 24054387  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatc 310  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24054388 tatgctaatgcatggactcgatca-ctt-aaacatcacaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatc 24054467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 9593270 - 9593491
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  9593270 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 9593367  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9593368 ctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataa 9593465  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataa 447  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9593466 ttcaagtaaatgcaatcaatccataa 9593491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9751952 - 9751704
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------- 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  9751952 aatgtatgctaatgcatgaactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatatcttatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatct 9751855  T
Q  316 -gtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctg 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  9751854 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagtataattcataatatcaattca-ttccaacaacatcttg 9751756  T
Q  408 atcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  9751755 atcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 9751704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 19239 - 18978
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  19239 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcagttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 19142  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  19141 ctcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcattcaataataa 19044  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||| |||  | |||||||||    
T  19043 ttcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcaca 18978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13918904 - 13918713
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  13918904 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 13918807  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  13918806 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttca 13918713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25927627 - 25927436
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | |||||    
T  25927627 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--aacttaa 25927530  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  25927529 taaaaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 25927436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1859210 - 1859019
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||||||    
T  1859210 tatacatccaataattcggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacaaca--agcttaa 1859113  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  1859112 taacaattc-ttttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttca 1859019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2530516 - 2530323
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcat-atcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||    
T  2530516 tatacatccaataatttggagttcgtcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcataatca--agctta 2530419  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  2530418 ataacaattcattttcagcaatttcttgatcattccataattttttgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 2530323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2832639 - 2832390
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||            
T  2832639 aatgtatgctaatgtatagactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttataaatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatct 2832542  T
Q  317 --tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaac-----agct---taatatcaattcattttcaacaacttcct 406  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     | ||   ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  2832541 tatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcccatcaacaatataactttataatatcaattca-tttcaacaacatctt 2832443  T
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  2832442 gatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 2832390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7519483 - 7519331
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  7519483 tatacatccaataatttggagttcatcatcaatttaattcagactcatccaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agctta 7519386  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgca 435  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7519385 ataacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 7519331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 258 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16457508 - 16457312
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagc 354  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||    ||| ||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  16457508 aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttccttgtcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagc 16457409  T
Q  355 ataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcac 452  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  16457408 ataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcac 16457312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 9446395 - 9446104
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtct-catataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||  |||| ||    
T  9446395 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccgacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctaaatatgca 9446296  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagct 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||| |     
T  9446295 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacatca 9446196  T
Q  378 taat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||        | ||||||| |||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  9446195 taatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 9446104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11996390 - 11996183
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  11996390 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 11996291  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaa 260  Q
     |  || ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  11996290 tcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagagcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactcaa-cctcttaaa 11996193  T
Q  261 acatcttaat 270  Q
    ||||||||||    
T  11996192 acatcttaat 11996183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 320 - 452
Target Start/End: Original strand, 11987231 - 11987362
Alignment:
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataa 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  11987231 agactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattttcaacagtttcttgatcattcaataa 11987328  T
Q  420 taattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcac 452  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  11987329 taaatcaagtaaatgcaatcaatccataattcac 11987362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 8917407 - 8917591
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||   | ||||    
T  8917407 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--ggtttaa 8917504  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    || ||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  8917505 taacaaatcattcacaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcacttcataatcactta 8917591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 13149080 - 13149283
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||    
T  13149080 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatac 13149177  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13149178 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 13149275  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  13149276 tcaagtaa 13149283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 42203876 - 42204062
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  || ||||||| | |||| |||| ||    
T  42203876 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaa-gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaattttaatcaacatctcaatatgca 42203974  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  42203975 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaacaacaacagcagcataatcagatca 42204062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 18301918 - 18302016
Alignment:
Q  184 catcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatat 283  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  18301918 catcgtggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactctatcatct--aaacatcttaatcatcatctcatat 18302015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 26211754 - 26211940
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat-aagg-cccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  26211754 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggccccca 26211853  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  26211854 tcgctaatctgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 26211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 10588795 - 10588960
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  10588795 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacatggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 10588894  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  10588895 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 10588960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 144
Target Start/End: Original strand, 15580448 - 15580545
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||    
T  15580448 attgactcgacaatgagacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtagcattacagggcatgagcccccatcatcataatattaatatacttt 15580545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20569833 - 20569541
Alignment:
Q  186 tcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atat 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| ||||    
T  20569833 tcatggtgaggacaaagctccaaggcatgagcccccaacaaa--tatgctaatgcatgaactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatat 20569736  T
Q  284 acatccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca- 374  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| | || ||     
T  20569735 gcatcccataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcatatcacaacagcat 20569636  T
Q  375 -------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
            | ||| | |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  20569635 tataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 20569541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Original strand, 34200542 - 34200751
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt---agtattaatatactttcagggcat-aaggcccc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |  ||||   ||||||||||||||| || ||||| ||  || |    
T  34200542 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccaaggcatcaaaccctc 34200641  T
Q  161 aaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatctta 258  Q
    | || | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | | |||||    
T  34200642 atcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactcga-cctctta 34200739  T
Q  259 aaacatcttaat 270  Q
    ||||| ||||||    
T  34200740 aaacaacttaat 34200751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 113
Target Start/End: Original strand, 11858305 - 11858384
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatg 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11858305 aacatctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatg 11858384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 6801136 - 6801357
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaa-catcatcttgtat-ag 321  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||    
T  6801136 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcattcatcaacttatttcag 6801233  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||    
T  6801234 acccatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcatgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaata 6801330  T
Q  422 attcaagtaa-tgcaatcaatcaataa 447  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  6801331 attcaagtaagggcaatcaatccataa 6801357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 9508948 - 9509135
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  9508948 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcatgcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaaccccca 9509047  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  |||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  9509048 tcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 9509135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Original strand, 18556951 - 18557101
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   | |     
T  18556951 catatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatacatagtcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggttc 18557048  T
Q  379 aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    |||| ||| ||||| |||| |  ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  18557049 aatagcaaatcattctcaatagtttcttgatcatttaacaataattcaagtaa 18557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 20487341 - 20487418
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  20487341 atgcaacttagacctcttatatgcatatggtatcaattcagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 20487418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 431
Target Start/End: Original strand, 13461744 - 13461889
Alignment:
Q  284 acatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatat 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||   | ||||||     
T  13461744 acatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaaattagtttaattacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataa 13461841  T
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||| |||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13461842 caaatcattcacaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 13461889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Original strand, 18425464 - 18425566
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  18425464 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttca 18425557  T
Q  427 agtaatgca 435  Q
    |||||||||    
T  18425558 agtaatgca 18425566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 45170091 - 45169961
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  45170091 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 45169998  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  45169997 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 45169961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 14258019 - 14258169
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-ata--ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | |||  | ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  14258019 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgataattgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 14258118  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
        | ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  14258119 tcgcaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat 14258169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9752104 - 9752035
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9752104 aacatcattcatcattgactcaactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 9752035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 152
Target Start/End: Original strand, 18301846 - 18301920
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18301846 acctcttatatgtatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttttagggcat 18301920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 13032517 - 13032704
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  13032517 atgcaacttagacctcttatatgcatgtgttaccaatacaaggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 13032616  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
        |||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  13032617 ttgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 13032704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3564681 - 3564619
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564681 gactcgacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 3564619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 16275472 - 16275563
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16275472 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 16275563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 447
Target Start/End: Original strand, 9644384 - 9644454
Alignment:
Q  378 taatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataa 447  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9644384 taataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataa 9644454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14932932 - 14932843
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14932932 aatgtatgctaatgcatgaactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 14932843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15356367 - 15356278
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356367 aatgtatgctaatgcatgaactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 15356278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15360481 - 15360392
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360481 aatgtatgctaatgcatgaactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 15360392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15755314 - 15755269
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755314 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 15755269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16402798 - 16402753
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16402798 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 16402753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28505702 - 28505657
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505702 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 28505657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 40443212 - 40443257
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443212 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 40443257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14152183 - 14152097
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14152183 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcat 14152097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Original strand, 15728311 - 15728450
Alignment:
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaa 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | |||| |||    
T  15728311 tccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaa 15728408  T
Q  387 ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
     ||||| |||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15728409 atcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaag 15728450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16724755 - 16724677
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataat 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16724755 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataat 16724677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17701769 - 17701691
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataat 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17701769 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataat 17701691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 67493 - 67538
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  67493 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 67538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12256189 - 12256144
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12256189 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 12256144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 12698591 - 12698636
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12698591 atgcaacttagacctcttataagcatgtggtaccaatacagggcat 12698636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 13869122 - 13869167
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869122 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 13869167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15144393 - 15144348
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15144393 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 15144348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15605603 - 15605547
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605603 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15605547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 16213355 - 16213400
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16213355 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 16213400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17062257 - 17062212
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17062257 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 17062212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 18005398 - 18005499
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18005398 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 18005497  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  18005498 at 18005499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20110293 - 20110338
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20110293 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 20110338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27848149 - 27848104
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27848149 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 27848104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29329301 - 29329256
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29329301 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 29329256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 44116290 - 44116335
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44116290 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 44116335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 47831554 - 47831599
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47831554 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 47831599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Original strand, 14216895 - 14217040
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||    
T  14216895 tatacttccaataatttagagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagttcaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaa 14216992  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14216993 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaag 14217040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2282618 - 2282531
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  2282618 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 2282531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 12317901 - 12317955
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12317901 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 12317955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14933105 - 14933051
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14933105 gactcgacaaatgcga-aaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14933051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15356540 - 15356486
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356540 gactcgacaaatgcga-aaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 15356486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15360654 - 15360600
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360654 gactcgacaaatgcga-aaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 15360600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 16056081 - 16056168
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16056081 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 16056168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 22072746 - 22072833
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22072746 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggaatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 22072833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Original strand, 24274898 - 24274941
Alignment:
Q  69 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24274898 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 24274941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28505629 - 28505496
Alignment:
Q  85 atatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac-attattttgagcaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  | ||||||||| ||    
T  28505629 atatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaa 28505530  T
Q  179 tgctccatcatggtgagtacaaagctccatggca 212  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28505529 tgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggca 28505496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 35151597 - 35151676
Alignment:
Q  292 taatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  35151597 taatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 35151676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 12901074 - 12901160
Alignment:
Q  68 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  12901074 tgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcgagccctcaacgtattaagtattaatatacttccaaggcat 12901160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 16495135 - 16495173
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495135 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 16495173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 811527 - 811467
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811527 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 811467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 13647057 - 13647102
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13647057 atgcaacttagacctattatatgcatgtggtaccaatacggggcat 13647102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15082304 - 15082263
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15082304 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagg 15082263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38898763 - 38898718
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898763 atgcaacttagacttcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 38898718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 44013931 - 44013976
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44013931 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 44013976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 48273129 - 48273174
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48273129 atgcaacttagacctcttatgtgcatgtggtaccaatccagggcat 48273174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Original strand, 42203785 - 42203840
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  42203785 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatact 42203840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15605853 - 15605818
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605853 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 15605818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16220085 - 16220050
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16220085 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 16220050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1868327 - 1868238
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1868327 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatctagggcattaagccctcaacatattaagtattaatatacttccagggcat 1868238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14152325 - 14152280
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14152325 aatgcgacaa-tgcaacttagaccttttatatgcatgtggtaccaat 14152280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15008869 - 15008780
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15008869 atgcaacttagatctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 15008780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27848087 - 27848006
Alignment:
Q  167 attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  27848087 attttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagcttcagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 27848006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42376383 - 42376345
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42376383 atgcaacttagaccttttatatgcatgtggtaccaatac 42376345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 8917205 - 8917256
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8917205 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 8917256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18456749 - 18456704
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18456749 atgcaacttagatcttttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 18456704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15755145 - 15755043
Alignment:
Q  167 attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatc 265  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||| || | | |||||||||| |    
T  15755145 attttgaggtaatgcaccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggattcga-cctcttaaaacaac 15755048  T
Q  266 ttaat 270  Q
    |||||    
T  15755047 ttaat 15755043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 45170339 - 45170275
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45170339 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 45170275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 105
Target Start/End: Original strand, 13831154 - 13831189
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13831154 caacttagacctcttatatgcatgtgttaccaatac 13831189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 32623 - 32678
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32623 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 32678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 71359 - 71304
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  71359 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 71304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 75468 - 75413
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  75468 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 75413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1859416 - 1859361
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1859416 ttgactcgacagatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1859361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9446494 - 9446454
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9446494 acctcttttatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccc 9446454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12705251 - 12705196
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12705251 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 12705196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Original strand, 13461538 - 13461585
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13461538 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtac 13461585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13919087 - 13919032
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13919087 ttgactcgacagatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 13919032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 14216706 - 14216753
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14216706 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14216753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 15083685 - 15083740
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15083685 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15083740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 15728106 - 15728153
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15728106 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15728153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 16113755 - 16113810
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16113755 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16113810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 16116908 - 16116963
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16116908 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16116963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16457683 - 16457632
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16457683 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacaa-ttatatgcatgtggtaccaat 16457632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16907803 - 16907748
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16907803 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16907748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 18282880 - 18282935
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18282880 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 18282935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 18425174 - 18425229
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18425174 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 18425229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25927833 - 25927778
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25927833 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 25927778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 26291886 - 26291941
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26291886 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 26291941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 35151422 - 35151469
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35151422 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 35151469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 38227243 - 38227288
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  38227243 atgcaacttagacctcttatatgcattttttaccaatccagggcat 38227288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 39721755 - 39721810
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39721755 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 39721810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 474
Target Start/End: Original strand, 15083973 - 15084033
Alignment:
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15083973 aataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 15084033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 16583031 - 16583086
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16583031 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacactcttacatgcatgtggtaccaat 16583086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20220521 - 20220474
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20220521 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcat 20220474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 39722039 - 39722103
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  39722039 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 39722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 191)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 19726277 - 19725860
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  19726277 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagtattaatatactttca 19726179  T
Q  147 gggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19726178 gggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaacccgcaacaaatgtatgctaatgcatgga 19726079  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataac 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19726078 ctcaatcatct-aaaacatcttaatcaacatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac 19725980  T
Q  346 aatcgcagcataatcagatcatatcaacag-------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatc 438  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19725979 aatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgactcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgtaatt 19725881  T
Q  439 aatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  19725880 aatcattaaatcacattataa 19725860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 34 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18384305 - 18383868
Alignment:
Q  34 acatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagta 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  18384305 acatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggaaccaatacagggcatgagcccccagcattatagta 18384207  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18384206 ttaatatactttcagggcataaacccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccccaacaaatgta 18384107  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtataga 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  18384106 tgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtataga 18384008  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattca 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||        | | ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  18384007 ctcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcattca 18383909  T
Q  416 ataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18383908 ataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatta 18383868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Original strand, 11862519 - 11862961
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||  ||||    
T  11862519 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagccctcatcattatagt 11862617  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11862618 attaatatactttcagggcataagcccccaacagttattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgt 11862717  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatag 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||         ||||||||||| ||    
T  11862718 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagcacaacatcatcttaatcatcttgtaaag 11862816  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatc------atat--caacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcatt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||   |||  | ||||||||||||| |||||||||| || || |||||    
T  11862817 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcaccaaaatattataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttggtcatt 11862915  T
Q  414 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  11862916 caataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataa 11862961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Original strand, 322318 - 322759
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||    
T  322318 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcccccagcattatagt 322416  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  322417 attaatatactttcacggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcataagcccccaacaaatgt 322516  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatag 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  322517 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatgtcatatgcatccaataatttggagttcaacatcatcataatcatcttgtatag 322615  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca-------acagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||       ||  | | ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  322616 actcatgcaacttagttaaataacaatagcggcataatcagatcacaacaatattatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcattc 322714  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  322715 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 322759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Original strand, 12496000 - 12496470
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |    
T  12496000 ttgactcgacaatgcggcaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattatagtattaatatactttta 12496098  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12496099 gggtataac-ccccaacattattttgagaaaatgctccatcatggtgagtaaaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 12496197  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagt 337  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||||||    
T  12496198 tcaatcatc-taaataatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagt 12496296  T
Q  338 taaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||         |||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  12496297 taaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattca-tttctacaacatcttgatcattcaataatatttcaag 12496395  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  12496396 taatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa-acagcttcacagatttcagttaacatc 12496470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 47 - 366
Target Start/End: Original strand, 12172537 - 12172864
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12172537 ttgactcgacaatgcgagaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattttaatattaatatactttca 12172635  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12172636 gggcataagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctacagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 12172735  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttag 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12172736 tcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcataatcatcttatatagactcatgcaacttag 12172834  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12172835 ttaaataacaatagcagcataatcagatca 12172864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 53 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 11298900 - 11298459
Alignment:
Q  53 cgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  11298900 cgacaatgcaacaa-tgcgacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagcccccaacattatagtattattatactttcagggcat 11298802  T
Q  153 aaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaat 251  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11298801 aagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgaacccccaacagatgtatgctaatgcatggactcaat 11298702  T
Q  252 catcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatac--atccaataatttgga-gttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagtta 339  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||  |||||||||||||||||||    
T  11298701 catc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatatccaataatttggatgttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagtta 11298603  T
Q  340 aataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||         | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  11298602 aataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaa 11298504  T
Q  432 tgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  11298503 tgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 11298459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 30065970 - 30066151
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30065970 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 30066069  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066070 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 30066151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Original strand, 16369125 - 16369408
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatatt--ag 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   ||||  ||    
T  16369125 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatgcagggcatgagccttaacattattttag 16369223  T
Q  131 tattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16369224 tattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagctcccaacaaatgt 16369323  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16369324 atgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 16369408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 301
Target Start/End: Original strand, 855864 - 856133
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||    
T  855864 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttta 855962  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  855963 gtattaatatactttcaaggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcctccaacaaatg 856062  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag 301  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  856063 tatgttaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggag 856133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 55022891 - 55023072
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55022891 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagtataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 55022990  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022991 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 55023072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 11070092 - 11070273
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11070092 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaagaata 11070191  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070192 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcgatatagcttcacaaataacagttaacatc 11070273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11165614 - 11165433
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11165614 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 11165515  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11165514 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttggcatttcaatatagtttcacaaataacagttaacatc 11165433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 281
Target Start/End: Original strand, 15067409 - 15067656
Alignment:
Q  35 catcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||    
T  15067409 catcattcatcattgactcgactatgcggcta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagt 15067507  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15067508 attaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgta 15067607  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcat 281  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15067608 tgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcat 15067656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 14499349 - 14499530
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14499349 actcatgcaacttagttaaataacaataaccgcataatcagatcttatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 14499448  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14499449 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacaattagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 14499530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 15482588 - 15482849
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatc--gtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| |||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  15482588 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacaccttaatcaacaagtcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 15482685  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15482686 tcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgagcattcaataataat 15482785  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  15482786 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 15482849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 15617398 - 15617564
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15617398 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaagttcctgatcattcaataata 15617497  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617498 attcaagtaatgtaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 15617564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 11854757 - 11854938
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11854757 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacaacttaacatcaattcattttcaataacttcttgatcattcaataata 11854856  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11854857 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatc 11854938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Original strand, 11849041 - 11849248
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  11849041 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagt 11849139  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11849140 attaatatactttcagggcataagcccccaacagttattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgt 11849239  T
Q  231 atgctaata 239  Q
    |||||||||    
T  11849240 atgctaata 11849248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2898012 - 2897727
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||           
T  2898012 aatgtatgctaatgcatggactctatcatt---aaacatcttaatcttcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttgattatct 2897916  T
Q  317 tat--agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2897915 tattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaatttattttcatcaacttcttgatcattc 2897816  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2897815 aataataattccagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttaacagttaacatc 2897727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 7109722 - 7109888
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109722 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 7109821  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109822 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 7109888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 7113657 - 7113823
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113657 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 7113756  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113757 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 7113823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 22336743 - 22336909
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336743 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 22336842  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336843 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 22336909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27409729 - 27409563
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409729 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27409630  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409629 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 27409563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 28949748 - 28949914
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949748 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 28949847  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949848 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 28949914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 22321688 - 22321854
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321688 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaatagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 22321787  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321788 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 22321854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15878451 - 15878109
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  15878451 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 15878354  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15878353 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 15878254  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  15878253 caacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 15878156  T
Q  317 ----tata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15878155 atcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 15878109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14878894 - 14878574
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||     
T  14878894 ttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacttcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcctccaacgttattgagtattaatatacttc 14878796  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  14878795 cagggcataagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaatctccagggcatgagccccctacatatgtatgctaatgcatgg 14878696  T
Q  245 actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag-ttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactt 334  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||         ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14878695 actcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggagattcaacatcatcttattcatcttatattgactcatgcaactt 14878597  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  14878596 agttaaataacaatagcagcata 14878574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20461690 - 20461420
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||         ||    
T  20461690 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcgtaatcatcaaatctcttatacatccaataatttgaagttcatcatcattttaattatct 20461593  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20461592 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 20461493  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20461492 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 20461420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 7793540 - 7793269
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  7793540 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttcatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatct 7793443  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataat-cagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcatt 413  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7793442 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataattcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 7793343  T
Q  414 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7793342 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaacaaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 7793269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 327355 - 327084
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatca---------tct 314  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||         |||    
T  327355 aatgtatgctcatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcaatttaattatct 327258  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataa-tcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcatt 413  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  327257 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataactaagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaatttcttgatcatt 327158  T
Q  414 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  327157 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 327084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12038185 - 12037884
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12038185 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactctatcatat-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 12038087  T
Q  289 caataatttggagttcaacatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    |||||||||||||||||||||||         |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||         
T  12038086 caataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatataaactcatgcaacttagttaaataacaa-agcagcataatcagatcacaacaacattata 12037988  T
Q  375 ---gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcat 470  Q
        | ||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||    
T  12037987 atttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacat 12037889  T
Q  471 ttcaa 475  Q
    |||||    
T  12037888 ttcaa 12037884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 165 - 315
Target Start/End: Original strand, 15051367 - 15051516
Alignment:
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacat 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15051367 ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaggccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacat 15051465  T
Q  265 cttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15051466 cttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaagatcatctt 15051516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23053383 - 23053136
Alignment:
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaat 228  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||    || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  23053383 agtattaatatatttccagggcataagcccccatttctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaaggcatgatcccccaacatat 23053284  T
Q  229 gtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgt 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |    
T  23053283 gtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatacatccaataatttggagttcaacattatcttaatcatcttat 23053185  T
Q  318 atagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23053184 atagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataagcagatca 23053136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 226 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15850264 - 15850018
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  || |    
T  15850264 aatgtatgctaatgcatggactctatcaaca-aaaacatcttaatcatcatatcacttatacatccaataatttggagttcttcatcaacttattcagtc 15850166  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15850165 tcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcagatcatatca--agtttaataacaattcattttc-acaatttcttgatcattcaacaataat 15850069  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttca 474  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15850068 tcaagttatgcaatcaatccatatatcacaatataatcatttagcatttca 15850018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26196666 - 26196500
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26196666 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 26196567  T
Q  289 caataatttggagttcaacatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagttaaataaca 346  Q
    |||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196566 caataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 379 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11300539 - 11300415
Alignment:
Q  379 aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatat 478  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300539 aatatcaattcattttcaataacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatat 11300440  T
Q  479 agcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  11300439 agctttacaattaacagttaacatc 11300415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 281 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31097681 - 31097491
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31097681 tatacatccaataatttggagttcttcatcaacttattcagactcatgcaacatagttaattaacaattgcagcataatcagatcacatcaatagcttaa 31097582  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatt 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  31097581 taacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtagtggaatcaatcaatatatcacaacataatcacttagcatt 31097491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 23408187 - 23408437
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  23408187 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgagcccccatc 23408286  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
      ||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||    
T  23408287 gctattt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatc-tctt-aaaca 23408383  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23408384 tcaaaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 23408437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23077866 - 23077545
Alignment:
Q  16 tcaacataagcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |              
T  23077866 tcaacataagcatcataaacatctttcatcattgactcaactatgcgacaa-tgcaacttagacctctcatatgcatgtggtaccaattcg--------- 23077777  T
Q  116 ccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatga 215  Q
             | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  23077776 ---------tttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctagtttgagataatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga 23077686  T
Q  216 gcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaa-catcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatca--- 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  23077685 gcccccaacatatgtatgctaatgaatggactcgatc-tcttaaaaacatctcaatcatcatctcttatatatccactaatttggagttcaacatcatct 23077587  T
Q  312 ------tcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaa 347  Q
          |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23077586 taatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaa 23077545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 459
Target Start/End: Original strand, 11851510 - 11851749
Alignment:
Q  235 taatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||    
T  11851510 taatgcatggactcaatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactc 11851608  T
Q  326 atgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaat 417  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| | |||||         | ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  11851609 atgcaacttagttaaataacgatagtagcataattagatcacaacaacattataacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgttcattcaat 11851707  T
Q  418 aataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  11851708 aatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataa 11851749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 5223045 - 5223236
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  5223045 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatacaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 5223142  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  5223143 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 5223236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 15464846 - 15465037
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  15464846 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 15464943  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  15464944 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttca 15465037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Original strand, 14665320 - 14665569
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||            
T  14665320 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaatatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatct 14665417  T
Q  317 --tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-----ctt---aatatcaattcattttcaacaacttcct 406  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||     |||   |||||||||||| |||||||||| || |    
T  14665418 tatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataatcagatcacatcaacagtataactttaaaatatcaattca-tttcaacaacatctt 14665516  T
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  14665517 gatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 14665569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 315
Target Start/End: Original strand, 15060196 - 15060292
Alignment:
Q  218 ccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060196 ccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 15060292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Original strand, 14668476 - 14668725
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||            
T  14668476 aatgtatgttaatgcatggactctatcaac--aaaacattttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatct 14668573  T
Q  317 --tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-----ct---taatatcaattcattttcaacaacttcct 406  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     ||   ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  14668574 tatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatcaattca-tttcaacaacatctt 14668672  T
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||    
T  14668673 gatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcatattataa 14668725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 12339447 - 12339638
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||  || ||||    
T  12339447 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattctcatca--agtttaa 12339544  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12339545 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 12339638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1983047 - 1982761
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  1983047 tggtgaggacatagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 1982948  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--- 374  Q
     | |||||||||||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||       
T  1982947 cctaataatttggagctcaacaacatctttttcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacacta 1982848  T
Q  375 -----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
          | ||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  1982847 taacttcataacaacaattcattttcaacaacatataggtcattcaaaaatagttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 1982761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 11300891 - 11300699
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| | |||    
T  11300891 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcagactcatgcaacttagttaaataacaattgtagcataatcaaatcacat-aac-gttta 11300794  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  11300793 ataacaattcattt-caacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcaaattacaaacaacttagcagttca 11300699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8489596 - 8489459
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  8489596 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 8489499  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8489498 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataata 8489459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13210690 - 13210504
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |   || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13210690 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccccca 13210591  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13210590 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 13210504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11557621 - 11557433
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  11557621 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 11557522  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||| ||         ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11557521 tccaataatttggagctcagcaacatcttattcatcatgtataaactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 11557433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12852763 - 12852662
Alignment:
Q  197 acaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatt 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12852763 acaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcattgactctatcatct--aaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatt 12852666  T
Q  297 tgga 300  Q
    ||||    
T  12852665 tgga 12852662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16798176 - 16797988
Alignment:
Q  284 acatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatat 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  | |||||||     
T  16798176 acatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacatagtttaataacaagtgcaacataatcaaatcacatca--aacttaataa 16798079  T
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttc 473  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  16798078 caaatcattttcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttc 16797988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11595373 - 11595084
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  11595373 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 11595276  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca---- 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | || ||        
T  11595275 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattat 11595176  T
Q  375 ----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
         | ||| | |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  11595175 aatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 11595084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26196797 - 26196700
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  26196797 attgactcgacaatgagacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataaagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 26196700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3403191 - 3402875
Alignment:
Q  190 ggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacat 287  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| |||    
T  3403191 ggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaa-gtatgttaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcat 3403093  T
Q  288 ccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    ||| |||||||||| ||||||         ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||   |    
T  3403092 ccactaatttggagctcaacaacatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcattat 3402993  T
Q  379 aat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagca 469  Q
    |||        | |||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  3402992 aatttcatgacaacaattcattttcaacaacatcaaggttattcaagaataaatcaaggaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaaca 3402893  T
Q  470 tttcaatatagcttcaca 487  Q
     ||||  |||||||||||    
T  3402892 attcataatagcttcaca 3402875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 201
Target Start/End: Original strand, 16796056 - 16796192
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  16796056 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatttagggcatgagcccccaacgttattgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcg 16796155  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaa 201  Q
     || ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16796156 ctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaa 16796192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 125
Target Start/End: Original strand, 16909598 - 16909689
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16909598 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcaagtggtaccaattcagggcatgagcccccaacat 16909689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3390171 - 3389985
Alignment:
Q  190 ggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacat 287  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| |||    
T  3390171 ggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaa-gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcat 3390073  T
Q  288 ccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||| ||| |||||| ||||||         ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3390072 ccactaaattggagctcaacaacatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatca 3389985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 284 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16809003 - 16808815
Alignment:
Q  284 acatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatat 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||  ||||| ||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||||||     
T  16809003 acatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaatatagtttaataacaagtgcaacataatcaaatcacatca--agcttaataa 16808906  T
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttc 473  Q
    ||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  16808905 caaatcatttgcaacaatttcttgaccattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttc 16808815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 17241897 - 17242137
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaa-catcatcttgtat-ag 321  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||    
T  17241897 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcattcatcaacttatttcag 17241994  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  17241995 actcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaata 17242091  T
Q  422 attcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  17242092 attcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 17242137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 38814310 - 38814513
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  38814310 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattgatag 38814407  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  38814408 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 38814504  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  38814505 ttcaagtaa 38814513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 42325824 - 42326009
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  42325824 tggtgaggacaaagctccagggtatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 42325921  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  42325922 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaaaaacagcagcagcataatcagatca 42326009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 284
Target Start/End: Original strand, 16796195 - 16796295
Alignment:
Q  182 tccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcat 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |    
T  16796195 tccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctctt 16796292  T
Q  282 ata 284  Q
    |||    
T  16796293 ata 16796295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Original strand, 3833653 - 3833803
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-gct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   ||||| | |    
T  3833653 catatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtt 3833749  T
Q  378 taatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3833750 taataacaagtcattctcaacaattgcttgatcattcaacaataattcaagtaa 3833803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16750668 - 16750543
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16750668 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttca 16750575  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16750574 agtaatgcatttaatcattaattcacagtata 16750543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 12398968 - 12399154
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaa---acatattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |     || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  12398968 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 12399067  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12399068 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagtgctccagggcatcaagccaccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 12399154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 14682140 - 14682291
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  14682140 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 14682239  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  14682240 tcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccaaggcat 14682291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3403321 - 3403226
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||    
T  3403321 gactcgacaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacatcataatattgatatacttt 3403226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 4111334 - 4111204
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  4111334 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 4111241  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4111240 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 4111204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 15964993 - 15965123
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  15964993 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 15965086  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15965087 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15965123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 15968917 - 15969047
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  15968917 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 15969010  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15969011 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15969047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 15972841 - 15972971
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  15972841 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 15972934  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15972935 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15972971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 19775789 - 19775919
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  19775789 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 19775882  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  19775883 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 19775919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12852871 - 12852797
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  12852871 acctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagccctcaacatcatagtattaatatacttttagggcat 12852797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 14670618 - 14670769
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  14670618 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatgcttccagggcatcaagccccca 14670717  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  || ||||||| || |||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  14670718 tcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgactacaaagctccaaggcat 14670769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25476744 - 25476596
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccc-caaacatatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||    |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |    
T  25476744 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcatcgctattgagtattaatatacttacagggcatcaacccccatc 25476645  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
    | || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  25476644 acta-tttgagctaaagctccatcttgttgagtacaaagctccagggcat 25476596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1598630 - 1598487
Alignment:
Q  257 taaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagc 354  Q
    |||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1598630 taaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacatagacatgcaacttagttaaataac-attgcagc 1598532  T
Q  355 ataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaa 400  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  1598531 ataatcaaatcacatca--agcttaaataacaaatcattttcaacaa 1598487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 4107482 - 4107352
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  4107482 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 4107389  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4107388 tttcaactaatgcatttaatcattaattcacagtata 4107352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 37439721 - 37439591
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  37439721 actcatgcaacttagtttaacaacaattgtagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 37439628  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  37439627 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 37439591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 16097119 - 16097206
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatg-agccccaaacata-ttagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  16097119 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatgaagccctcaacgtagtaagtattaatatacttccagggcat 16097206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 431
Target Start/End: Original strand, 11854439 - 11854545
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  11854439 actcatgcaacttagttaaataacaattgcggcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattca-tttcaacaacatcttaatctttcaataata 11854535  T
Q  422 attcaagtaa 431  Q
     ||| |||||    
T  11854536 tttcgagtaa 11854545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 112
Target Start/End: Original strand, 13442076 - 13442122
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442076 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 13442122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 372
Target Start/End: Original strand, 16696711 - 16696857
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  16696711 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataa 16696808  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  16696809 tcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataaacaaatcacatcaa 16696857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 17487616 - 17487780
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  17487616 atgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 17487715  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
     |  ||  |||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17487716 tcgcta-attgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 17487780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 17499098 - 17499262
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  17499098 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 17499197  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
     |  ||  |||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17499198 tcgcta-attgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 17499262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 18438294 - 18438443
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt-agtattaatatactttcagggcat-aaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||      
T  18438294 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctattgagtattaatatacttccagggcatcaagccccctt 18438393  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
    || || ||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  18438394 cacta-tttgagctaaaactccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat 18438443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23053460 - 23053391
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23053460 aacatctttcatcatcgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 23053391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23083722 - 23083633
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23083722 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat 23083633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40214098 - 40213937
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaa----catattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |     || | |||||||||||||||     
T  40214098 gactcgacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccacatcgctatttgagtattaatatacttc 40214000  T
Q  145 cagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  40213999 cagggcatcaagcccccatcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctcca 40213937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 16909667 - 16909732
Alignment:
Q  143 ttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccat 208  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16909667 ttcagggcatgagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggttagtacaaagctccat 16909732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 26683114 - 26683159
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26683114 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 26683159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 43840692 - 43840737
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840692 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 43840737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15942028 - 15941912
Alignment:
Q  282 atacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||   |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||  |  |||||    
T  15942028 atacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacttagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--aatttaat 15941931  T
Q  382 atcaattcattttcaacaa 400  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  15941930 aacaaatcattttcaacaa 15941912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11557718 - 11557657
Alignment:
Q  80 ctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  11557718 ctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatact 11557657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12038274 - 12038212
Alignment:
Q  89 gcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggca 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12038274 gcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttttagggca 12038212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2898164 - 2898108
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898164 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 2898108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 8499294 - 8499339
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499294 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 8499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 8898833 - 8898878
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8898833 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 8898878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 10556761 - 10556806
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10556761 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 10556806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10901536 - 10901491
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10901536 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 10901491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 13543751 - 13543796
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13543751 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 13543796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 14665167 - 14665223
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665167 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 14668323 - 14668379
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668323 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14668379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 15412205 - 15412250
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412205 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 15412250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16283234 - 16283189
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16283234 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 16283189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17447077 - 17447032
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17447077 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 17447032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20698798 - 20698753
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20698798 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatacagggcat 20698753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24153545 - 24153500
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24153545 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatgcagggcat 24153500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 27165026 - 27165071
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165026 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 27165071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 41123631 - 41123676
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123631 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 41123676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 46821993 - 46822038
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46821993 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 46822038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52524097 - 52523996
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  52524097 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 52523998  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  52523997 at 52523996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 14972618 - 14972705
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga--gccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |   |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14972618 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatcgagggcatcaagcccccatccctataagtattaatatacttccagggcat 14972705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 30029594 - 30029742
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| || |||||||| |||||     
T  30029594 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatggggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttcca-ggcataagcccccat 30029692  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
    |  ||  |||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  30029693 cgcta-attgagctaaagctccaacatgttgagtacaaagctccagggcat 30029742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 32307405 - 32307476
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32307405 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcat 32307476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 327506 - 327452
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327506 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 327452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4589125 - 4589042
Alignment:
Q  392 tttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  4589125 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 4589042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7793691 - 7793637
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793691 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 7793637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 474
Target Start/End: Original strand, 19775515 - 19775605
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  19775515 caattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 19775605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15076354 - 15076316
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15076354 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15076316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 17736971 - 17737009
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17736971 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 17737009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 23274446 - 23274609
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgag-ccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||| | |   || | ||||||| ||||||  |||||||| | ||||| |    
T  23274446 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggagcatcaaacccctatcgctatttgagtattattatactc-cagggcatcaagccccta 23274544  T
Q  163 -cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaaca 225  Q
     |  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23274545 tcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaca 23274609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24341041 - 24341003
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341041 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 24341003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 28194471 - 28194509
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194471 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 28194509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43550909 - 43550867
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550909 caacttagacctattatatgcatgtggtaccaatacagggcat 43550867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 606693 - 606648
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  606693 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 606648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11425076 - 11425031
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11425076 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcat 11425031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 14234231 - 14234276
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14234231 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 14234276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 15467630 - 15467675
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15467630 atgcaacttagacctcttatatgtatgtggtaccaatccagggcat 15467675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 53301893 - 53301848
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53301893 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 53301848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1645040 - 1644996
Alignment:
Q  68 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1645040 tgcaacttcgacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 1644996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Original strand, 14572370 - 14572406
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572370 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 14572406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1983177 - 1983081
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1983177 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgaggccccaacatcatagtattaatatacttt 1983081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14872352 - 14872290
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 110  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14872352 ttgactcgactatgccacaa-tgcaacttggacttcttatatgaatgtggtaccaatacagggc 14872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20461841 - 20461787
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20461841 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 20461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4589278 - 4589228
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  4589278 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 4589228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 9512666 - 9512727
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9512666 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 9512727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 9520641 - 9520702
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9520641 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 9520702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12174617 - 12174531
Alignment:
Q  68 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12174617 tgcatcttatacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 12174531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Original strand, 19775369 - 19775419
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  19775369 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 19775419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 37251491 - 37251449
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37251491 caacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 37251449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 44494544 - 44494582
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44494544 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 44494582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 49668451 - 49668390
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49668451 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 49668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 50242600 - 50242638
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50242600 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 50242638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 53071045 - 53071011
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071045 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacca 53071011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12120153 - 12120108
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12120153 atgcaacttagaccttctatatgcatgtggtaccaatacagagcat 12120108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 12511084 - 12511137
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||    
T  12511084 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaaca 12511137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16809207 - 16809156
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16809207 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16809156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17525265 - 17525216
Alignment:
Q  308 atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17525265 atcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcata 17525216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17661243 - 17661198
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17661243 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaacaatccagggcat 17661198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22110720 - 22110675
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22110720 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcat 22110675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38962271 - 38962226
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38962271 atgcaacttagaccttctatatgcatgtggtaccaatccagggcat 38962226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 46822292 - 46822345
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||    
T  46822292 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaaca 46822345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 15482439 - 15482494
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15482439 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 15482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 15964745 - 15964809
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15964745 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 15964809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 15968669 - 15968733
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15968669 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 15968733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 15972593 - 15972657
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15972593 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 15972657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Original strand, 12172924 - 12173003
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||||||    
T  12172924 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcaca 12173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23053061 - 23052994
Alignment:
Q  423 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaa 489  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||    
T  23053061 ttcaagtaatgcaattaataattaaatcacattataaacaacttaaaatttcataatagcttcacaaa 23052994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3389959 - 3389881
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |  ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  3389959 caattcattttcaacaacatcaaggtttttcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 3389881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11595504 - 11595409
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  11595504 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 11595409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 42325693 - 42325788
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  42325693 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 42325788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Original strand, 42326035 - 42326113
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  42326035 caattcattttcaacaacatcaagtttattcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 42326113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Original strand, 856150 - 856199
Alignment:
Q  308 atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  856150 atcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacata 856199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4589505 - 4589450
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4589505 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 4589450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 7109213 - 7109268
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7109213 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 7109268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 7113148 - 7113203
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7113148 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 7113203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 11069585 - 11069640
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11069585 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 11069640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 14498842 - 14498897
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14498842 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14498897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 15616891 - 15616946
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15616891 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15616946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 15964461 - 15964516
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15964461 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15964516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 15968385 - 15968440
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15968385 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15968440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 15972309 - 15972364
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15972309 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15972364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 16696567 - 16696614
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16696567 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16696614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 19775084 - 19775139
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19775084 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 19775139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 22321181 - 22321236
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22321181 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 22321236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 22336236 - 22336291
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22336236 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 22336291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 27410236 - 27410181
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27410236 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 27410181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 28949239 - 28949294
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28949239 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 28949294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 30065464 - 30065520
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  30065464 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacactttatatgcatgtggtaccaat 30065520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 37440229 - 37440174
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37440229 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 37440174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 55022382 - 55022437
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  55022382 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 55022437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11425014 - 11424934
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  11425014 tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 11424934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14577171 - 14577135
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14577171 atgcatcttagacgtcttatatgcatgtggtaccaat 14577135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 15051531 - 15051567
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15051531 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 15051567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 428 - 503
Target Start/End: Original strand, 15051655 - 15051731
Alignment:
Q  428 gtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  15051655 gtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacaaattgcagttaacatc 15051731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 15060307 - 15060343
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15060307 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 15060343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 357
Target Start/End: Original strand, 30029867 - 30029903
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30029867 gactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcata 30029903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 37439969 - 37439905
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  37439969 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 37439905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 140)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16488467 - 16488026
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  16488467 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcaacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggaatgagcccccaacattttagt 16488369  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16488368 attaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgag-ccccaacgaatgta 16488270  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtataga 322  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  16488269 tgctaatgcatgtactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtataga 16488170  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||        | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16488169 ctcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaattc-ttttcaacaacatcttgatcattc 16488071  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16488070 aataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataa 16488026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16349038 - 16348568
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  16349038 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagcattatagtattaatatactttca 16348940  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16348939 gggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 16348840  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||||||    
T  16348839 tcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttagagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagt 16348741  T
Q  338 taaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| || ||||    
T  16348740 taaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattca-tttccacaacatcttgataattcaataatattttaagt 16348642  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| || || | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  16348641 aatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagtttaa-aaagcttcacagatttcagttaacatc 16348568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16357326 - 16356856
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||| |    
T  16357326 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagcattacagtattaatatactttta 16357228  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16357227 gggcataagcctccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 16357128  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||||||    
T  16357127 tcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagt 16357029  T
Q  338 taaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  16357028 taaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattca-tttccacaacatcttgatcattcaataatatttcaagt 16356930  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacatta-taaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  16356929 aatgcatttaatcattaaatcacattacaaaaaacttagcagttcaa-acagcttcacagatttcagttaacatc 16356856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 5339352 - 5338929
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  5339352 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaaccttttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 5339254  T
Q  147 gggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5339253 gggcataagcccccaacaattatttagagctaaagctccatcgtggtgatgacaaggctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 5339154  T
Q  246 ctcaatcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaat 342  Q
    ||| ||||||||||  ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5339153 ctcgatcatcttaatcaacattttaatcaacatctcaatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcatcatagttaaat 5339054  T
Q  343 aacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatg 433  Q
    ||||||  ||||| || ||||||| | ||||||| |||         |||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5339053 aacaataacagcacaagcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattca-tttcaacaaaatcttgattattcaataatatctcaagtaatg 5338955  T
Q  434 caatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5338954 caattaatcaataaatcacatcataa 5338929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15122193 - 15121909
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   || |||    
T  15122193 aacatcattcatcattgacttgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttatttta 15122095  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15122094 gtattaatatactttcagggcatgagcccccattgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 15121995  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15121994 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 15121909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 17810293 - 17810474
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810293 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 17810392  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810393 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttaacatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 17810474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 366
Target Start/End: Original strand, 12569717 - 12570082
Alignment:
Q  10 acatcatcaacataagcatcttaaacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12569717 acatcttcaacata-gcatcttaaacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 12569814  T
Q  109 gcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctc 205  Q
    ||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  12569815 gcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttattt-gagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctc 12569913  T
Q  206 catggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttca 305  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12569914 cagggtataagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatatccaataatttggagttca 12570012  T
Q  306 ac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||         |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12570013 acatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatca 12570082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14757507 - 14757326
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14757507 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacaacttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 14757408  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757407 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 14757326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 9556551 - 9556717
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9556551 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaatacta 9556650  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556651 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 9556717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Original strand, 23843202 - 23843537
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  23843202 aacatctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttga 23843300  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23843301 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagccaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 23843400  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||         |||||||| |||    
T  23843401 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcattttgatcatcttatat 23843499  T
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23843500 cgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcata 23843537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 4561419 - 4561253
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4561419 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaatttattttcaacaacttcctaatcattcaataata 4561320  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561319 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 4561253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Original strand, 15093499 - 15093834
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-a 129  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||| |    
T  15093499 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tacaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccctcatcgttattga 15093597  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |  || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15093598 gtattaatatacttccagggcataagccaccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 15093697  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||    
T  15093698 tatgctaatgcatggactcgatc-tctaaaaacatcttaatcatcatctcttatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttgtat 15093796  T
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15093797 tgactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcata 15093834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5757023 - 5756857
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757023 actcatgtaacttagttaaataacaataacagcataatcagattatatcaacaacttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 5756924  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5756923 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 5756857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 36134152 - 36133882
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  36134152 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacattcaataatttggagttcatcatcattttaattatct 36134055  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36134054 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatccattcatcttcaacaacttcctgatcattc 36133955  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  36133954 aataataactcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 36133882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15125434 - 15125150
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  15125434 aacatcattcatcattgactcgactattcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttga 15125336  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15125335 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggaatgagcccccaacatatg 15125236  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15125235 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcgacatcatctt 15125150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 44675348 - 44675641
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |    
T  44675348 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagcccccatc 44675445  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44675446 gctatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccc 44675545  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  44675546 caacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccagtaatttggaggttcaacatcgtcttg 44675641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 27534047 - 27534228
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||     
T  27534047 actcatgcaacttagtttaataacaataacagcataatcggatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaataacttcttaatcattcaataatg 27534146  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27534147 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataacaacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatc 27534228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 316
Target Start/End: Original strand, 13569227 - 13569511
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  13569227 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccatcgctatttga 13569324  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13569325 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 13569424  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13569425 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatattaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttgaacatcatcttg 13569511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22634603 - 22634370
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  22634603 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 22634506  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22634505 gcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataat 22634406  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  22634405 tcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 22634370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13813261 - 13812967
Alignment:
Q  180 gctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc 279  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13813261 gctcaatcgtggtgaggacaaagcttcagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactctatcatct-aaaacatcttaatcatcatctc 13813163  T
Q  280 atatacatccaataatttggagttcaacatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagat------ 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          
T  13813162 atatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccac 13813063  T
Q  365 --catatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
      |||   |||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  13813062 aacattaaaacttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 13812967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 33742399 - 33742564
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33742399 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttgataccaattcattt-caacaactccctgatcattcaataata 33742497  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742498 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacataataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 33742564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 312
Target Start/End: Original strand, 12423429 - 12423696
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||    
T  12423429 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatttggtaccaattcaggacatgagcccccaacatcatagta 12423527  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagca-aatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||| |||||||   |              |||| | || |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12423528 ttaatatacttttagggcatcgtgg-------------tgaggacaaagctcaatcgtggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgta 12423614  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatca-tcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat 312  Q
    || |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12423615 tgttaacgcatggactcaatcaatctaaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat 12423696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17048670 - 17048453
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |     
T  17048670 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttattgagtattaatatacttccagggcatatgcccccatcg 17048571  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacat 264  Q
     || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  17048570 ctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacat 17048473  T
Q  265 cttaatcatcgtctcatata 284  Q
    | |||||||| |||| ||||    
T  17048472 cataatcatcatctcttata 17048453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1951942 - 1951721
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  1951942 aatgtatgctaatgcatgaactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 1951845  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1951844 ctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataa 1951747  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataa 447  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1951746 ttcaagtaaatgcaatcaatccataa 1951721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18222504 - 18222298
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  18222504 tatacatccaataatttggagttcatcatgaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gctta 18222407  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatat 478  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||| |||  |     
T  18222406 ataacaattcattttcaacaattccttgatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaa 18222307  T
Q  479 agcttcaca 487  Q
    |||||||||    
T  18222306 agcttcaca 18222298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 43256537 - 43256346
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  43256537 tatatatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgtagcataatcaaatcacatca--agcttaa 43256440  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  43256439 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 43256346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15353544 - 15353210
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  15353544 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 15353445  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagct 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||| |     
T  15353444 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacagcaacatca 15353345  T
Q  378 taat--------atcaattcattttcaacaacttc-ctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttag 467  Q
    ||||        | ||||||| |||||||||| ||   ||| |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||     
T  15353344 taatttcataacaacaattca-tttcaacaacatcaaggattattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaa 15353246  T
Q  468 catttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    || ||||  | ||||||||||||  |||||||||||    
T  15353245 caattcataacagcttcacaaattccagttaacatc 15353210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20157657 - 20157408
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||            
T  20157657 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcgtcttaatcaact 20157560  T
Q  317 --tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaac-----agct---taatatcaattcattttcaacaacttcct 406  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     | ||   ||||||||||||| |||||||||| ||      
T  20157559 tatatagactcatgcaaattagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacggtataactttataatatcaattca-tttcaacaacatcta 20157461  T
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  20157460 gatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 20157408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18229034 - 18228802
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  18229034 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatagatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 18228937  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||    
T  18228936 ctcatgcaacttagttaaataaaaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttcataacaattcatttccaacaattccttgatcattcaataataa 18228839  T
Q  423 ttcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||    
T  18228838 ttcaagtaaagacaatcaatccataattcactttata 18228802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 17152637 - 17152436
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagc 354  Q
    ||||||||||||||| | | |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17152637 aaaacatcttaatcaacttatcacttataaatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagc 17152538  T
Q  355 ataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcaca 453  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||     
T  17152537 ataatcaaatcacatca--agcttaataacaattca-tttcaacaattccttgatcattcaataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcact 17152441  T
Q  454 ttata 458  Q
    |||||    
T  17152440 ttata 17152436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14053690 - 14053477
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtatta 135  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || |||||||||    
T  14053690 tcatcatcgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctattttagtatta 14053592  T
Q  136 atatactttcagggcat-aaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtat 232  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||    
T  14053591 atatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaat 14053493  T
Q  233 gctaatacatggactc 248  Q
    |||||| |||||||||    
T  14053492 gctaatgcatggactc 14053477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 631214 - 631105
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  631214 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactctatcatct--aaacatcttaattatcatctcatatatatc 631117  T
Q  289 caataatttgga 300  Q
    ||||||||||||    
T  631116 caataatttgga 631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26243845 - 26243642
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  26243845 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa 26243748  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  26243747 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 26243650  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  26243649 tcaagtaa 26243642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 18236872 - 18237056
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | ||||    
T  18236872 tatacatccaataatttggaattcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaa 18236969  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    || ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  18236970 taacaaatcattctcaacaatttcttaatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcactta 18237056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16243580 - 16243377
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||    
T  16243580 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatac 16243483  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16243482 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 16243385  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  16243384 tcaagtaa 16243377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 12902517 - 12902702
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||     
T  12902517 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccccttcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccat 12902616  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12902617 cgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 12902702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23374715 - 23374529
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |   || | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  23374715 atgcaacttagacctcttatataaatgtggtaccaatacggggcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccaa 23374616  T
Q  163 -cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23374615 tcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 23374529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16352088 - 16351960
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  16352088 tggtgaggacaaagctccaaggcatgagcccccaacagaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 16351989  T
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16351988 tccaataatttggagctcaacaacatctt 16351960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19757781 - 19757578
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  19757781 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa 19757684  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19757683 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 19757587  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  19757586 ttcaagtaa 19757578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 19782025 - 19782228
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  19782025 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa 19782122  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19782123 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataa 19782219  T
Q  423 ttcaagtaa 431  Q
    |||||||||    
T  19782220 ttcaagtaa 19782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 2014704 - 2014907
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||    
T  2014704 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatac 2014801  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   | |||||| ||| |||||  |||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  2014802 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattcgcaacaatttcttgatcattccacaataat 2014899  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  2014900 tcaagtaa 2014907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 17046245 - 17046397
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17046245 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccccca 17046344  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  17046345 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtgcaaagctccagggcat 17046397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 44052588 - 44052753
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | | |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  44052588 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaggacatcaagcccccatcgatatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 44052687  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaa 226  Q
     |  |||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  44052688 tcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaa 44052753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22634764 - 22634677
Alignment:
Q  16 tcaacataagcatctta-aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634764 tcaacataaacatctcataacatcattcatcattgacttgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 22634677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 466
Target Start/End: Original strand, 23139228 - 23139435
Alignment:
Q  259 aaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcat 356  Q
    |||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23139228 aaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcat 23139327  T
Q  357 aatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagta-atgcaatcaatcaataaatcacatt 455  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||| |||| |     
T  23139328 aatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataattcaagtatgggcaatcaatccataattcacttc 23139424  T
Q  456 ataaacactta 466  Q
    |||| ||||||    
T  23139425 ataatcactta 23139435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 25555371 - 25555548
Alignment:
Q  197 acaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataa 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| |||||| |||    
T  25555371 acaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggattcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccagtaa 25555468  T
Q  295 tttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25555469 tttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 25555548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 440
Target Start/End: Original strand, 45938075 - 45938284
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatat-acatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagact 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |      
T  45938075 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacattacatccaataatttggagttcatcatcagcttatacataga 45938172  T
Q  325 catgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataatt 424  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||| |    
T  45938173 catgcatcttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataa-t 45938268  T
Q  425 caagtaatgcaatcaa 440  Q
    ||||||| ||||||||    
T  45938269 caagtaaggcaatcaa 45938284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 10712874 - 10713004
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  10712874 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 10712967  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10712968 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10713004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 10926644 - 10926774
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  10926644 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 10926737  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10926738 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10926774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Original strand, 3412779 - 3412923
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||    
T  3412779 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcaaatcacatca--ggttaaa 3412876  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaa 427  Q
    || ||| ||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3412877 taacaaatcattctcaataatttcttgatcattcaacaataattcaa 3412923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11250795 - 11250610
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca-tcttaatcatcgtctca-tataca 286  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||    
T  11250795 tggtgaggacaaaactccagggcatgatcccccaacaa--gtatgctaatgcatggagtcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 11250698  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  11250697 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatca 11250610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13813516 - 13813450
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  13813516 acctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 13813450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28569569 - 28569423
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||   | ||    
T  28569569 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaac--ttaaa 28569472  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28569471 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagt 28569423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 631311 - 631243
Alignment:
Q  81 tcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcaggg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  631311 tcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttttaggg 631243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 7798508 - 7798579
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798508 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 7798579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14954252 - 14954122
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  14954252 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 14954159  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  14954158 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacaatata 14954122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 25689891 - 25690021
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  25689891 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 25689984  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  25689985 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 25690021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14708759 - 14708668
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  14708759 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 14708668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 7893462 - 7893507
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893462 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 7893507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16240331 - 16240181
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  16240331 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcaagctcccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 16240232  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  || | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16240231 tcgcta-tctgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccagggcat 16240181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16377882 - 16377837
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377882 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 16377837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 22636195 - 22636240
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636195 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 22636240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52873623 - 52873578
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873623 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 52873578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 110
Target Start/End: Original strand, 3096096 - 3096139
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096096 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 3096139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 39706662 - 39706575
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  39706662 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 39706575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 52243564 - 52243477
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  52243564 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 52243477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 431
Target Start/End: Original strand, 9530390 - 9530562
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  | |   ||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  9530390 aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagtttgttcataaaaatgcaacttagttaaatgacatttgcagca 9530489  T
Q  356 taatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  9530490 taatcaaatcacatca--agcttaataataaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataattcgagtaa 9530562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 12773842 - 12773887
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12773842 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 12773887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 14038462 - 14038507
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14038462 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 14038507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 14280091 - 14280136
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14280091 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 14280136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16270553 - 16270508
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16270553 atgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagggcat 16270508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19618610 - 19618565
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19618610 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 19618565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20149607 - 20149652
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20149607 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 20149652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 52312249 - 52312294
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52312249 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 52312294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 12487732 - 12487862
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  12487732 actcatgcaacttagtttaacaacaattacagcataatcaattcatgtcaa--gcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 12487825  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  12487826 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 12487862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14219 - 14132
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14219 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 14132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12288579 - 12288492
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12288579 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 12288492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14928104 - 14928061
Alignment:
Q  69 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14928104 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 14928061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42997575 - 42997484
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  42997575 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa 42997484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14971188 - 14971150
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14971188 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 14971150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15353634 - 15353577
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  15353634 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 15353577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 15367426 - 15367464
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367426 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15367464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 15369754 - 15369792
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369754 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15369792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 15373262 - 15373300
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373262 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 19242450 - 19242488
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242450 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 19242488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 14157584 - 14157688
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||  |    
T  14157584 gactcgacaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatacatgtggtatcaatccggggcatcaagcccccaacgtaataagtattaatatacttcta 14157682  T
Q  147 gggcat 152  Q
    ||||||    
T  14157683 gggcat 14157688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20157787 - 20157731
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20157787 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgtaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 20157731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36134263 - 36134226
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134263 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 36134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43198920 - 43198875
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43198920 atgcaacttagacctcatatatgcatgtggtaccaatccagggcat 43198875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 44102033 - 44102078
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44102033 atgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 44102078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54799135 - 54799090
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54799135 atgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatgcagggcat 54799090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12649 - 12613
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13818109 - 13818054
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13818109 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaccaaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 13818054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 14164289 - 14164384
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactt 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  14164289 gactcgacaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatacatgtggtatcaatccggggcatcaagcccccaacgtaataagtattaatatactt 14164384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Original strand, 15551683 - 15551762
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  15551683 tttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 15551762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18215697 - 18215653
Alignment:
Q  68 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18215697 tgcaaattagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 18215653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 503
Target Start/End: Original strand, 12570142 - 12570237
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  12570142 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatc 12570237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 12610685 - 12610723
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12610685 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 12610723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 15705149 - 15705187
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15705149 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 15705187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18602856 - 18602766
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |  | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  18602856 tatacttccaataatttggagttcatcgtcaacttattcatactcatgaaacttagtttagtaacaattgcagcataatcaaatcacatca 18602766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23803735 - 23803697
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23803735 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 23803697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Original strand, 25555599 - 25555677
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  25555599 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 25555677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 51464252 - 51464214
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51464252 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatac 51464214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14708963 - 14708912
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14708963 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14708912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Original strand, 15224821 - 15224866
Alignment:
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15224821 tgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 15224866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 18236670 - 18236721
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18236670 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 18236721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18609428 - 18609343
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |  | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  18609428 tatacttccaataatttggagttcatcgtcaacttattcatactcatgaaacttagtttagtaacaattgcagcataatcaaatca 18609343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Original strand, 3096159 - 3096238
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3096159 tttgagctaatgcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 3096238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14954500 - 14954436
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14954500 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 14954436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 99
Target Start/End: Original strand, 15375548 - 15375580
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15375548 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 15375580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18603059 - 18603009
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18603059 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaa 18603009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 25689643 - 25689707
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25689643 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 25689707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13813400 - 13813353
Alignment:
Q  105 cagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  13813400 cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttttagggcat 13813353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11250584 - 11250506
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  11250584 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcatgtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 11250506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 458
Target Start/End: Original strand, 15224962 - 15225035
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||    
T  15224962 caattcatttt-aacaacatcttggtcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcatattata 15225035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16352179 - 16352122
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  16352179 tatgcatgtggtagcaat-cagggcatgagctcccaacatcatagtattaatatacttt 16352122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28569741 - 28569697
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28569741 aatgcgacaa-tgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 28569697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 46640788 - 46640699
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46640788 atgcaacttagacctcttaatcatgcatatggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttacagggcat 46640699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 53082523 - 53082434
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53082523 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagagcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 53082434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4561917 - 4561862
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4561917 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 4561862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 5757522 - 5757467
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5757522 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 5757467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 9556044 - 9556099
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9556044 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 9556099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 10712369 - 10712424
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10712369 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 10712424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 10926139 - 10926194
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10926139 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 10926194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11250887 - 11250831
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  11250887 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 11250831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 12487199 - 12487254
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12487199 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 12487254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13813337 - 13813292
Alignment:
Q  180 gctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaaca 225  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13813337 gctcaatcgtggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaaca 13813292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13813426 - 13813381
Alignment:
Q  180 gctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaaca 225  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13813426 gctcaatcgtggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaaca 13813381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14758019 - 14757964
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14758019 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14757964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14954784 - 14954729
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14954784 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14954729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 15224556 - 15224611
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15224556 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15224611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17152812 - 17152761
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17152812 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtagtaccaat 17152761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 17809788 - 17809843
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17809788 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 17809843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18609631 - 18609584
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18609631 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtac 18609584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 25689383 - 25689438
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25689383 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 25689438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 33741894 - 33741949
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33741894 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 33741949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Original strand, 3412576 - 3412626
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  3412576 actcgacaatgcgac-aatgcaacttaga-cacttatatgcatgtgctaccaa 3412626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 10712629 - 10712693
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10712629 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 10712693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 10926399 - 10926463
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10926399 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 10926463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 12487484 - 12487548
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12487484 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattaaaaacaacttagcagttca 12487548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 112)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 437
Target Start/End: Original strand, 37524410 - 37524821
Alignment:
Q  33 aacatcattcatc-attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  37524410 aacatctttcatccattgactcgacaatgcaacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacattatagt 37524508  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37524509 attaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgt 37524608  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgca 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37524609 atgctaatgcatggactcaatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgca 37524707  T
Q  331 acttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||         | ||| | ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  37524708 acttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacatcaacattgtaacttcataacaacaattca-tttcaataacatcttgatcattcaataatat 37524806  T
Q  423 ttcaagtaatgcaat 437  Q
    |||||||||||||||    
T  37524807 ttcaagtaatgcaat 37524821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22812287 - 22811859
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |    
T  22812287 ttgactcgacaatgcgacca-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattatagtattaatatactttaa 22812189  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22812188 gggcataagcccccaacaatattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 22812089  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  22812088 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggcgttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagt 22811989  T
Q  338 taaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||         | | ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||    
T  22811988 taaataacaatagcagcataatcaaatcacaacaacattataacttcatcatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatacttcaggt 22811890  T
Q  430 aatgcaa-tcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  22811889 aatgcaatttaatcattaaatcacattataa 22811859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 46 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25964091 - 25963647
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttc 145  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  25964091 attgacccgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccagcattatagtattaatatactttc 25963993  T
Q  146 agggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25963992 agggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgga 25963893  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||    
T  25963892 ctcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 25963794  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  25963793 ttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaag 25963695  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  25963694 taatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 25963647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 21319014 - 21318581
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  21319014 ttgactcgacaatgcgacaa-tccaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcataagcccccaacagtttagtattaatatactttca 21318916  T
Q  147 gggcataaggccccaacattatttt-gagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21318915 gggcttaagcccccaacgttatttttgagcaaatgctccatcgcggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 21318816  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatctta-atcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactta 335  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||     
T  21318815 ctcattcatcttaaaacatcttagatcatcatcttatatacatccaataatttggagttcaacaacatctcattcatcttgtatagactcatgcaacttg 21318716  T
Q  336 gttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||| |||         |||||||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||    
T  21318715 gttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataattatcaattca-tttctacaacatcttgattattcaacaatatctca 21318617  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21318616 agtaatgcaattaatcaataaatcacatcataaaca 21318581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 21327945 - 21327512
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||    
T  21327945 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaactgtttagtattaacatactttca 21327847  T
Q  147 gggcataaggccccaacattatttt-gagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21327846 gggcttaagcccccaacgttatttttgagcaaatgctccatcgcggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 21327747  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatctta-atcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactta 335  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||     
T  21327746 ctcattcatcttaaaacatcttagatcatcatcttatatacatccaataatttggagttcaacaacatcttattcatcttgtatagactcatgcaacttg 21327647  T
Q  336 gttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||| |||         |||||||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||    
T  21327646 gttaaataacaaaagcagcataatcagatcacagcagcagcataacttcataattatcaattca-tttctacaacatcttgattattcaacaatatctca 21327548  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21327547 agtaatgcaattaatcaataaatcacatcataaaca 21327512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45678521 - 45678189
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |   || |||    
T  45678521 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcatggcatgagcccccatctttatttta 45678423  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45678422 gtattaatatactttcagtgcattagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 45678323  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtata 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||         ||||||||||||     
T  45678322 tatgctaatgcatggactcaatc-tcctaaaacatcttaatcatcatctcatatatttccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatg 45678224  T
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45678223 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagca 45678189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10101730 - 10101549
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101730 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 10101631  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101630 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 10101549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Original strand, 24673290 - 24673637
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||    
T  24673290 aacatcattcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttt 24673388  T
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattatttt-gagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24673389 agtattaatatactttcagggcatgagctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaa 24673488  T
Q  228 tgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttg 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  24673489 tgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttg 24673587  T
Q  317 tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  24673588 tacagactcatgcaacatggttaaataacaatagcagcacaagcagatca 24673637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40622603 - 40622319
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||    
T  40622603 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttta 40622505  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40622504 gtattaatatactttcagggcatgagcccacatcgttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctcaagggcatgagcccacaacaaatg 40622405  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40622404 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 40622319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Original strand, 24679907 - 24680256
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||    
T  24679907 aacatcattcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttt 24680005  T
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattatttt-gagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24680006 agtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttatttttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaa 24680105  T
Q  228 tgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc----atatacatccaataatttggagttcaac---------atcatct 314  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||         |||||||    
T  24680106 tgtatgctaatgcattgactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatatatccaataatttgaagttcaacaccatcttaatcatct 24680204  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  24680205 tgtacagactcaagcaacatggttaaataacaatagcagcacaagcagatca 24680256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 24649378 - 24649544
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24649378 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 24649477  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649478 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 24649544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12901597 - 12901431
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12901597 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcggatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 12901498  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901497 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27379518 - 27379352
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379518 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27379419  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379418 attaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 27379352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27383564 - 27383398
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383564 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27383465  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383464 attaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 27383398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 27601817 - 27601983
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601817 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27601916  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601917 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 27601983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 24735319 - 24735589
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatca---------tct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||         |||    
T  24735319 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcactttaattatct 24735416  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24735417 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 24735516  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24735517 aataataattcaagtaatgcgatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 24735589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 24628564 - 24628398
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628564 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatattaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 24628465  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628464 attcaagcaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 24628398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Original strand, 40428202 - 40428677
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttc 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40428202 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttc 40428299  T
Q  146 agggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40428300 agggcataagccctcaacaattatttgagcaaatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 40428399  T
Q  246 ctcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactt 334  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||         |||||||  |  ||||||||||||||    
T  40428400 ctcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcttacaatgactcatgcaactt 40428499  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatc--------aacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||||| | |        |||  | ||||| |||||||||||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||    
T  40428500 agttcaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaatattataacttcataataacaattcattttcaacaacatcaaggttatttaagaataaatca 40428599  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  40428600 agtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatc 40428677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22799504 - 22799175
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||     
T  22799504 ttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatgagcccctatcgttattgagtattaatatacttc 22799406  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22799405 cagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgg 22799306  T
Q  245 actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag-ttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactt 334  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||         ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22799305 actcggtc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggagattcaacatcatcttattcatcttatattgactcatgcaactt 22799207  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22799206 agttaaataacaatagcagcataggcagatca 22799175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23020099 - 23019815
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-a 129  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  23020099 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttattga 23020001  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||| | ||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23020000 gtattaatatacatccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaattcaccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 23019901  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23019900 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatatccaataatttggaggttcgacatcatctt 23019815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22741349 - 22741022
Alignment:
Q  40 ttcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaa 136  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||    
T  22741349 ttcatcattgactcgactattcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaa 22741251  T
Q  137 tatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgcta 236  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22741250 tatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgcta 22741151  T
Q  237 atacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgg-agttcaacatcatcttg---------tatagactca 326  Q
    || ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||         ||| ||||||    
T  22741150 atgcatggactcgatc-tctt-aaacatcttaatcatcatctcttatttatccaataatttggaagttcaacatcatcttgatcatcttatatcgactca 22741053  T
Q  327 tgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22741052 tgcaactaggttaaataacaatagcagcata 22741022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21916322 - 21916069
Alignment:
Q  199 aaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttg 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21916322 aaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttg 21916224  T
Q  299 gagttcaacatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaat 381  Q
    |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| | ||| ||        | ||||    
T  21916223 gagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaacataatcagatcacaacaaaagcataaattcataat 21916124  T
Q  382 atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaat 437  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21916123 atcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaat 21916069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22759111 - 22758827
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | |   || | |    
T  22759111 aacatctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatgtgcatgtggtaccaattcaaggcatgagcccccatcgttatttga 22759013  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22759012 gtatttatatacttccagggcataggcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatgagcccccaacaaatg 22758913  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22758912 tatgctaatgcatggactcgatc-tctt-atacatcttaatcatcatctcttatttatccaataatttggatgttcaacatcatcttg 22758827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 41531089 - 41530929
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  41531089 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 41530996  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41530995 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 41530929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24716762 - 24716461
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24716762 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgttaatgcatggactcaatcat-ttaacccatcttaatcatcatctcatatacatc 24716664  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||         
T  24716663 caataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattata 24716564  T
Q  375 --gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatt 471  Q
       | ||| | ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  24716563 cttcataacaacaattca-tttcaacaacatcataatcattcaataatatgtctagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagt 24716465  T
Q  472 tcaa 475  Q
    ||||    
T  24716464 tcaa 24716461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 25961768 - 25961485
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacat 287  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| | |||| ||||  ||    
T  25961768 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcattgactcaatcaatctaaaacatcttaatca-catctcaatatgaat 25961670  T
Q  288 ccaataatttggagttcaacatcatct--------tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||        | ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||         
T  25961669 ccaataatttggagctcaacaacatcttattcatctttaatgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaacattata 25961570  T
Q  375 ---gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
        | ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  25961569 acttcataacaacaattcattttcaacaacatctagatcattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 25961485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Original strand, 24174680 - 24174971
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  24174680 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 24174779  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagct 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| |     
T  24174780 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatca 24174879  T
Q  378 taat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||        | ||||||| |||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  24174880 taatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 24174971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 31344858 - 31345049
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  31344858 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataataattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 31344955  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  31344956 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcatgaaatcacattacaaacaacttagcagttca 31345049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 24869760 - 24869948
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatca-tcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  24869760 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccctaacaaaagtatgctaatccatggactcaatcactctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 24869859  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24869860 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatca 24869948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 488
Target Start/End: Original strand, 15477711 - 15477790
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15477711 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 15477790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 19688779 - 19688676
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagctt 483  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  19688779 caattcatcttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctt 19688680  T
Q  484 caca 487  Q
    ||||    
T  19688679 caca 19688676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24655575 - 24655284
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  24655575 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 24655476  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagct 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| | ||||| |     
T  24655475 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacatca 24655376  T
Q  378 taat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||        | ||||||| |||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  24655375 taatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 24655284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24716907 - 24716796
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  24716907 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatcatagt 24716809  T
Q  132 attaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||    
T  24716808 attaatatacttt 24716796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38478 - 38292
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  38478 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 38379  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  38378 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 38292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 9784555 - 9784632
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  9784555 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 9784632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22461370 - 22461130
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaa-catcatcttgtat-ag 321  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||    
T  22461370 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcattcatcaacttatttcag 22461273  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  22461272 actcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaata 22461176  T
Q  422 attcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  22461175 attcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 22461130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23072312 - 23072125
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  23072312 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 23072213  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23072212 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctctagagcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 23072125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23103757 - 23103571
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23103757 atgcagcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtagtaatatactttcagggcatcaagccccca 23103658  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  23103657 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagccccaac-aatgagtgctaatgcatggactc 23103571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23654749 - 23654598
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  23654749 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 23654650  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23654649 tcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcat 23654598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21900816 - 21900630
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21900816 atgcaacttagacctcttaaatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagccccca 21900717  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
     |  ||  |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| ||||||||    
T  21900716 tcgctaaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggact 21900630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19928682 - 19928483
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  | |     
T  19928682 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagattattcataa 19928585  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19928584 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 19928487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 23031092 - 23031176
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23031092 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggc 23031176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 23060272 - 23060458
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  23060272 atgcaacttacacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 23060371  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  23060372 tcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 23060458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 30345076 - 30344946
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  30345076 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 30344983  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  30344982 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 30344946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 41666930 - 41667078
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  || | ||    
T  41666930 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaa 41667027  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  41667028 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagtaa 41667078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 22336885 - 22337069
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  22336885 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctattgagtattaatatacttccagggcatcaagccccatc 22336984  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
       | ||||||| || |||||||  || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  22336985 -gcaatttgagctaaagctccattgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 22337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 1283410 - 1283540
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  1283410 actcatgcaacttagattaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 1283503  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  1283504 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 1283540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25961899 - 25961802
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  25961899 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 25961802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18855639 - 18855438
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  | |     
T  18855639 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagtttattcataa 18855542  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||||    
T  18855541 -catgcaacttagttaaacaacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataat 18855446  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  18855445 tcaagtaa 18855438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22413505 - 22413418
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22413505 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 22413418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 23187056 - 23187204
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||   | | ||    
T  23187056 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatggaacttggtttaataacaattgcagcataatcaaatcatatca--ggttaaa 23187153  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||  || ||||| |||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23187154 taaaaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 23187204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 23598319 - 23598467
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||   | | ||    
T  23598319 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatggaacttggtttaataacaattgcagcataatcaaatcatatca--ggttaaa 23598416  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||  || ||||| |||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23598417 taaaaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 23598467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 112
Target Start/End: Original strand, 7679370 - 7679416
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7679370 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 7679416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24655704 - 24655609
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24655704 ttgactcgacaatgcaacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 24655609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 371
Target Start/End: Original strand, 27263253 - 27263343
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27263253 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 27263343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 299155 - 299110
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  299155 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 299110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 6725734 - 6725779
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6725734 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 6725779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 8946416 - 8946461
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946416 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 8946461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 23076250 - 23076295
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076250 atgcaacttacacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 23076295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 23130638 - 23130683
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23130638 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 23130683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 23133105 - 23133150
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23133105 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 23133150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23712436 - 23712391
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23712436 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 23712391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24643373 - 24643328
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24643373 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 24643328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 25616001 - 25616046
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25616001 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 25616046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Original strand, 23657571 - 23657638
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaggg 109  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23657571 tcatctttgactcgaaaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaggg 23657638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18787271 - 18787184
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18787271 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 18787184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19691976 - 19691922
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691976 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 19691922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 106
Target Start/End: Original strand, 20322405 - 20322444
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20322405 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 20322444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 24174550 - 24174646
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24174550 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacattatagtattaatatacttt 24174646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 24735168 - 24735222
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735168 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 24735222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 24869630 - 24869726
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24869630 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 24869726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 22105104 - 22105142
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105104 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 22105142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22731595 - 22731553
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaggg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731595 atgcaactaagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaggg 22731553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22738537 - 22738495
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22738537 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 22738495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 25175578 - 25175639
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175578 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 25175639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 38967151 - 38967189
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967151 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 38967189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 43137032 - 43137070
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137032 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 43137070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8101 - 8056
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8101 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 8056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21177770 - 21177725
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21177770 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 21177725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23040552 - 23040507
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23040552 atgcaacttagacctcttatatgcatatgttaccaatacagggcat 23040507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23713256 - 23713211
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23713256 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 23713211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32215358 - 32215313
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32215358 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 32215313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 28405717 - 28405775
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 99  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405717 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtac 28405775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Original strand, 60803 - 60877
Alignment:
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatca 361  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  60803 tccaataatttggagttcatcaacaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatca 60877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 19671633 - 19671671
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19671633 atgcaacttagacctcttttatgcatgtggtaccaatac 19671671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24688659 - 24688570
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggca-tgagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24688659 atgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcattaagccttcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 24688570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18855786 - 18855735
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18855786 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 18855735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 23186854 - 23186905
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23186854 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23186905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 23598117 - 23598168
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23598117 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 23598168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 159
Target Start/End: Original strand, 23791024 - 23791120
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcataaggccc 159  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23791024 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttgcagggcataaagccc 23791120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 24367513 - 24367558
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24367513 atgcaacttagaccttctatatgcatgtggtaccaatccagggcat 24367558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 26124962 - 26125013
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26124962 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 26125013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24697897 - 24697850
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24697897 atgcaacttagacctcttattcatgcatgtggtaccaatccagggcat 24697850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Original strand, 24673697 - 24673776
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||||    
T  24673697 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacagtataatcagcttaacatttcataatagcttcaca 24673776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 25616212 - 25616267
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  25616212 gactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 25616267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 20308972 - 20309053
Alignment:
Q  167 attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  20308972 attttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 20309053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20520524 - 20520435
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  20520524 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtgttaagtattaatatacttccagggcat 20520435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Original strand, 26125189 - 26125255
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||    
T  26125189 tatacttccaataatttggagatcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaa 26125255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 60599 - 60646
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  60599 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 60646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 1282902 - 1282957
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1282902 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1282957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10102245 - 10102190
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10102245 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 10102190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10822987 - 10822942
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10822987 atgcaacttaaacctcttctatgcatgtggtaccaatccagagcat 10822942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12902108 - 12902053
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12902108 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 12902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24629071 - 24629016
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24629071 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 24629016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 24648869 - 24648924
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24648869 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 24648924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 27601306 - 27601361
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27601306 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 27601361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30345608 - 30345553
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30345608 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 30345553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 31344651 - 31344706
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31344651 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 31344706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 41531337 - 41531273
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41531337 attcaataatatttngagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 41531273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 41531597 - 41531542
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41531597 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 41531542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22134562 - 22134526
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22134562 atgcaacttaaatctcttatatgcatgtggtaccaat 22134526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30345324 - 30345260
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  30345324 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 30345260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17501 - 17059
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  17501 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgataa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatacagggcatgagcccccaacaatttagt 17403  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  17402 attaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtatgaagctccagggcattag-ccccaacaattgta 17304  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtataga 322  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  17303 tgctaatgcatggactcgatcatcttataacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtataga 17204  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  17203 ctcatggaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcataacttcataatatcaattcatttccaacaacatcttgaacattc 17104  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17103 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 17059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 134)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21367040 - 21366614
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21367040 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagtattaatatactttca 21366942  T
Q  147 gggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21366941 gggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgga 21366842  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366841 ctcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttag 21366743  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||        | | ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21366742 ttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagt 21366644  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21366643 aatgcaattaatcattaaatcacattataa 21366614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 456
Target Start/End: Original strand, 20805293 - 20805716
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcaggg 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  20805293 actcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagccctcagcattatagtattaatatactttcaggg 20805391  T
Q  150 cataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20805392 cataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcaagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactc 20805491  T
Q  249 aatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatac--atccaataatttgga-gttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||    
T  20805492 aatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatatccaataatttggatgttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 20805590  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||         | |||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||    
T  20805591 ttaaataacaatagcagcataggcagatcacaagaacaaaataatttcataatatcaattca--ttcaacaacatctagatcattcaataacatttcaag 20805688  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  20805689 taatgcatttaatcattaaatcacatta 20805716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18770412 - 18770110
Alignment:
Q  16 tcaacataagcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgag 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18770412 tcaacataagcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcaacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgag 18770315  T
Q  116 ccccaaacata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggca 212  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18770314 cccccaacattattttagtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggca 18770215  T
Q  213 tgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttgga-gttcaacat 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18770214 tgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcagtc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatctatatatccaataatttggaggttcaacat 18770116  T
Q  310 catctt 315  Q
    ||||||    
T  18770115 catctt 18770110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 456
Target Start/End: Original strand, 20766715 - 20767138
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcaggg 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20766715 actcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccagcattatagtattaatataatttcaggg 20766813  T
Q  150 cataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20766814 cataagccctcaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctatagggcatgaacccccaacatatgtatgctaatgcatggactc 20766913  T
Q  249 aatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatac--atccaataatttgga-gttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||    
T  20766914 aatcat-ttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatatccaataatttggatgttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 20767012  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||| | |||||         | |||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||    
T  20767013 ttaaataacaatagcagcataggcaaatcacaacaacaacataagttcataatatcaattca--ttcaacaacatctagatcattcaataacatttcaag 20767110  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  20767111 taatgcatttaatcattaaatcacatta 20767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 67 - 315
Target Start/End: Original strand, 22032080 - 22032331
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22032080 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcatgagcccccatc 22032179  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22032180 gttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagccctcaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaaca 22032278  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22032279 tcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 22032331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15236865 - 15236684
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15236865 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaagaata 15236766  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236765 attcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 15236684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17919489 - 17919200
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |    
T  17919489 acctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttcagggcataagcccccaacatttatttgagtta 17919391  T
Q  178 atgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgt 276  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |    
T  17919390 atgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcatgagcccccaacatatgaatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacat 17919291  T
Q  277 ctc-atatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17919290 ctcaatatgcatccaataatttggagctcaacaacatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 17919200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Original strand, 20295868 - 20296034
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295868 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 20295967  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295968 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 20296034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19472805 - 19472639
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472805 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 19472706  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472705 atttaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 19472639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Original strand, 23201083 - 23201419
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatt 128  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || |     
T  23201083 aacatctttcatcatttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttattta 23201181  T
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaat 228  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23201182 agtattaatatacttccagtgcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacatat 23201281  T
Q  229 gtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg---------ta 318  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||    
T  23201282 gtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcataatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatcttgttcatcttata 23201380  T
Q  319 tagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23201381 tcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 23201419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 226 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23535768 - 23535522
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |   |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  23535768 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacaaatcacttatacatccaataaattggagttcatcatcaacttattcagac 23535671  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23535670 tcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattca-tttcaacaatttcttgatcattcaataataat 23535572  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttca 474  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23535571 taaagtaatgcaatctatcaataaatcac-gtataatcacttagcatttca 23535522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 123681 - 123256
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  123681 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaatagtttagtattaatatacttt 123584  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||    
T  123583 cagggcataagcccccaacatttatttgagcaaatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcatgagcccccaacatatcattgctaatgcatgg 123484  T
Q  245 actcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaacatc------atcttgtatagactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||      ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  123483 actcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaacgtcttatttatcttataatgactcatgcaacttag 123384  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||   ||||        | |||||||||||||||||| ||    | |||||| |||||||||||    
T  123383 ttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcatcacaacaattcattttcaacaacatcaaagttattcaagaataattcaag 123284  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    ||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  123283 taatgcatttaatctttaaatcacatta 123256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Original strand, 21872978 - 21873313
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-a 129  Q
    |||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  21872978 aacatctttcatcatacgactcgaatatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttattga 21873076  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||    || ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21873077 gtattaatatacttccagggcataagcccccattgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 21873176  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaaca---------tcatcttgtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||         ||||||| |||    
T  21873177 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatgttaatgatcatctcatatgtatccaataatttggagggtcaacatcatcttattcatcttatat 21873275  T
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21873276 tgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 21873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 14078877 - 14079157
Alignment:
Q  36 atcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | | |    | ||||    
T  14078877 atcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcggggcatgagccctcatcgttagttgagta 14078975  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  14078976 ttaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcatgagcccccaacacatgtat 14079075  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14079076 gctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataattggaggttcaacatcatctt 14079157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 459
Target Start/End: Original strand, 17410360 - 17410598
Alignment:
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------cttgta 318  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||| |     
T  17410360 tatgctaatgcatggactccatcaac--aaaacatcttaatcataaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatcttatt 17410457  T
Q  319 tagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaata 418  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  17410458 cagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacttaatatcaattcatcttcgacaacttcttgatcattcaata 17410557  T
Q  419 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410558 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 17410598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1859210 - 1858923
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1859210 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcaact-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 1859112  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||         
T  1859111 caataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattata 1859012  T
Q  375 --gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
       | ||| | ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  1859011 cttcataacaacaattca-tttcaacaacatcataatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 1858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Original strand, 23511839 - 23512106
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atatt-agtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||     
T  23511839 ttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttattgaatattaatatacttc 23511937  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||| ||||     
T  23511938 cagggcataagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagggcataag---ccaacatatgtatgctaatgcatga 23512034  T
Q  245 actcaatcatctta-aaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
     ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23512035 gctcgatc-tcttataaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatctt 23512106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22107973 - 22107789
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  22107973 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatc 22107874  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
      || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22107873 gctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgttaatgcatagactc 22107789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 475
Target Start/End: Original strand, 23451227 - 23451532
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctc-atatac 285  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  23451227 tggtgaggacaaagctctagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatcttaatcaacatcttaatcaacatctcaatatac 23451326  T
Q  286 atccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-- 374  Q
    |||||||||||||||||||||||         ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||      
T  23451327 atccaataatttggagttcaacattatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacatt 23451426  T
Q  375 -----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagc 468  Q
          | ||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| |||| |||||||    
T  23451427 atacttcataacatcaattc-ttttcaacaacatcataatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcactttacaaacaacttagc 23451525  T
Q  469 atttcaa 475  Q
    | |||||    
T  23451526 agttcaa 23451532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 26703793 - 26704084
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaactta-gacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaa 122  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |     
T  26703793 agcatcttaa-catctttcatcattggctcgactatgcgacta-tgcaacttaagacctcttatatgcttgtggtaccaatttagggcatgagcccccat 26703890  T
Q  123 c---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagccc 219  Q
    |   || | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26703891 cgctatttgagtattaatatacctccagggcataagcccccatcgctatt--gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagccc 26703988  T
Q  220 ccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26703989 ccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatc-tctt-aaacatcacaatcatcatctcttatttatccaataatttagaggttcaacatcatcttg 26704084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 26973526 - 26973817
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaactta-gacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaa 122  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |     
T  26973526 agcatcttaa-catctttcatcattggctcgactatgcgacta-tgcaacttaagacctcttatatgcttgtggtaccaatttagggcatgagcccccat 26973623  T
Q  123 c---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagccc 219  Q
    |   || | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26973624 cgctatttgagtattaatatacctccagggcataagcccccatcgctatt--gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagccc 26973721  T
Q  220 ccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26973722 ccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatc-tctt-aaacatcacaatcatcatctcttatttatccaataatttagaggttcaacatcatcttg 26973817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 475
Target Start/End: Original strand, 23458471 - 23458776
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctc-atatac 285  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  23458471 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatcttaatcaacatcttagtcaacatctcaatatac 23458570  T
Q  286 atccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-- 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||      
T  23458571 atccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagaagcataatcagatcacaacaacact 23458670  T
Q  375 -----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagc 468  Q
          | ||| | |||||| ||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  23458671 atacttcataacagcaattc-ttttcaacagcatcataatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagc 23458769  T
Q  469 atttcaa 475  Q
    | |||||    
T  23458770 agttcaa 23458776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 475
Target Start/End: Original strand, 23462732 - 23463037
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctc-atatac 285  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  23462732 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatcttaatcaacatcttagtcaacatctcaatatac 23462831  T
Q  286 atccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca-- 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||      
T  23462832 atccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagaagcataatcagatcacaacaacact 23462931  T
Q  375 -----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagc 468  Q
          | ||| | |||||| ||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  23462932 atacttcataacagcaattc-ttttcaacagcatcataatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagc 23463030  T
Q  469 atttcaa 475  Q
    | |||||    
T  23463031 agttcaa 23463037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20911295 - 20911104
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  20911295 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 20911198  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  20911197 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 20911104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 284
Target Start/End: Original strand, 23571899 - 23572053
Alignment:
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23571899 agtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttaagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagccccaaacaaat 23571998  T
Q  229 gtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatata 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  23571999 gtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacattttaatcatcatgtcatata 23572053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 18355938 - 18356129
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||  || ||||    
T  18355938 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--agtttaa 18356035  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  18356036 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 18356129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Original strand, 23439860 - 23439989
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctc-atatac 285  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  23439860 tggtgaggacaaagctctagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatcttaatcaacatcttaatcaacatctcaatatac 23439959  T
Q  286 atccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23439960 atccaataatttggagttcaacattatctt 23439989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24767743 - 24767494
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||            
T  24767743 aatgtatgctaatgcatggattctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatct 24767646  T
Q  317 --tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-----ctt---aatatcaattcattttcaacaacttcct 406  Q
      |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     |||   ||||||||||||||| ||||||| || |    
T  24767645 tatatagatttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatcaattcattt-caacaacatctt 24767547  T
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  24767546 gatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 24767494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 42805345 - 42805606
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  42805345 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 42805442  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  42805443 ctcatgcaacttggttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcatttaataataa 42805540  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||| |||  | |||||||||    
T  42805541 ttcaagtaaataaaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcaca 42805606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19661197 - 19661009
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  19661197 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 19661098  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaa 250  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  19661097 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccatggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactcaa 19661009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23501612 - 23501415
Alignment:
Q  166 tattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatc 265  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  23501612 tattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatc 23501515  T
Q  266 ttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgg-agttcaacatcatcttg---------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
     ||| |||| |||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||         ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23501514 ataaacatcatctcgtatttatccaatattttggaagttcaacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagca 23501415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Original strand, 24221757 - 24222048
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  24221757 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgttaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 24221856  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagct 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| |     
T  24221857 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacctagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatca 24221956  T
Q  378 taat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||        | ||||||| |||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  24221957 taatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 24222048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26742927 - 26742687
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-gtataga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  |||    
T  26742927 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttagttcaga 26742830  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26742829 ctcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggcttaataacaactcattctcaacaattccttgatcattcaataataa 26742732  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||| ||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||||||    
T  26742731 ttcgagtaaatacaatcaaaccataattcactttataatcactta 26742687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 447
Target Start/End: Original strand, 18774183 - 18774349
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  18774183 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gctta 18774280  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataa 447  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18774281 ataacaaatcattttcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataa 18774349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 18783971 - 18784192
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||| |||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  18783971 aatgtatgctaatgcatggactctatcaacg--aaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 18784068  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  18784069 ctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattttcaacaatttctttatcattcaacaataa 18784166  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataa 447  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18784167 ttcaagtaaatacaatcaatccataa 18784192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 26680464 - 26680650
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |  ||| |||| ||    
T  26680464 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgataatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacaactcaatatgca 26680561  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26680562 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatca 26680650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 26952071 - 26952257
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |  ||| |||| ||    
T  26952071 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgataatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacaactcaatatgca 26952168  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26952169 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatca 26952257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12028799 - 12028614
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  12028799 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 12028702  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12028701 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 12028614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 20232476 - 20232715
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||    
T  20232476 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcaga 20232573  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||| |||| |||||    
T  20232574 cttatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcattctcaacaa-ttattgatcaatcaacaataa 20232670  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  20232671 ttcaagtaaaggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 20232715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26666311 - 26666072
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||    
T  26666311 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcaga 26666214  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  26666213 ctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaataa 26666117  T
Q  423 ttcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  26666116 ttcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 26666072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26937908 - 26937669
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||    
T  26937908 aatgaatgctaatgcatggacttaaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcaga 26937811  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  26937810 ctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaataa 26937714  T
Q  423 ttcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  26937713 ttcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcactta 26937669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 462
Target Start/End: Original strand, 31342027 - 31342297
Alignment:
Q  186 tcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca-tata 284  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||||||||   ||||| |||     
T  31342027 tcatggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcgatcaatctaaacaatcttaatcaatatctcaatatg 31342124  T
Q  285 catccaataatttggagttcaacatcatctt---------gtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   |||||     
T  31342125 catccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatca---caaca- 31342220  T
Q  376 cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
              |||||||||||||||| ||  | | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  31342221 ----------attcattttcaacaacatcaagtttattcaaggataattcaagtaatgcaattaatcgttaaatcacattacaaaca 31342297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Original strand, 22757010 - 22757297
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacat 287  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||| | |||| |||| |||    
T  22757010 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatca-ctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcat 22757106  T
Q  288 ccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    |||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| | || ||         
T  22757107 ccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgtaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacagcattata 22757206  T
Q  375 ---gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
        | ||| | |||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  22757207 atttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttattcaataataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 22757297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21808751 - 21808565
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  21808751 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaaccccca 21808652  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  21808651 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac-aatgaaggctaatgcatggactc 21808565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24533173 - 24532988
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||  |||  ||||||    
T  24533173 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcaacataatcaaatcacgtca--agctta 24533076  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttag 467  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| | |||| |||||||    
T  24533075 ataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaacaataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttag 24532988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1859355 - 1859244
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  1859355 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgacta-tgcaaccaaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatcatagt 1859257  T
Q  132 attaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||    
T  1859256 attaatatacttt 1859244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Original strand, 9077689 - 9077898
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtattaata 138  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  ||| ||||||||||    
T  9077689 tcatctttgactcgacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctataagtattaata 9077787  T
Q  139 tactttcagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgcta 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    ||||||    
T  9077788 tacttccagggcatcaagcccccatcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgcta 9077886  T
Q  237 atacatggactc 248  Q
    || |||||||||    
T  9077887 atgcatggactc 9077898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 21887013 - 21887099
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21887013 aacatctttcatcatacgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 21887099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Original strand, 33409207 - 33409357
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| ||    
T  33409207 catatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatagacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtt 33409303  T
Q  379 -aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
     |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33409304 taataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 33409357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21293332 - 21293145
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgag--ccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  21293332 atgctacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 21293233  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  21293232 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaattcatggactc 21293145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 1096228 - 1096412
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  1096228 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctattaagtattaatatactttcagggcatcaagccccatc 1096327  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
      || ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  1096328 gcta-tttgagctaaagctccatcatgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 1096412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21729427 - 21729276
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  21729427 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaaccccca 21729328  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21729327 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccaaggcat 21729276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 22074779 - 22074965
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  22074779 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtagcaatacagggcatcaagcccccatcactatctgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 22074878  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  22074879 tcgctaatttgagctaatactcaaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 22074965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 23439730 - 23439834
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  23439730 ttgactcgacaatgctacaa-tgcaacctaaacctcatatatgcatgtggtaccaattctgggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 23439828  T
Q  147 gggcat 152  Q
     |||||    
T  23439829 aggcat 23439834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 23451097 - 23451201
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  23451097 ttgactcgacaatgctacaa-tgcaacctaaacctcatatatgcatgtggtaccaattctgggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 23451195  T
Q  147 gggcat 152  Q
     |||||    
T  23451196 aggcat 23451201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 23458341 - 23458445
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  23458341 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcatggcaggagcccccaacagtttaatattaatatactttca 23458439  T
Q  147 gggcat 152  Q
     |||||    
T  23458440 aggcat 23458445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 23462602 - 23462706
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  23462602 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcatggcaggagcccccaacagtttaatattaatatactttca 23462700  T
Q  147 gggcat 152  Q
     |||||    
T  23462701 aggcat 23462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 24493328 - 24493514
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  24493328 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 24493427  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  24493428 tcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 24493514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21340892 - 21340744
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  21340892 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agctta 21340795  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  21340794 ataacaaatcattctaaacaa-ttcttgatcaattaacaataattcgagtaa 21340744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Original strand, 37723635 - 37723848
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaaca-tatt--agtatta 135  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | |  ||||  |||||||    
T  37723635 tcatcatcgactcgacaaatgcga-atatgcagcttagacatcttatatgcatgtggtactaatacagggcatcaagcccccatcgctattcgagtatta 37723733  T
Q  136 atatactttcagggcat-aaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtat 232  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||    
T  37723734 atatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-tatgaat 37723832  T
Q  233 gctaatacatggactc 248  Q
    |||||| |||||||||    
T  37723833 gctaatgcatggactc 37723848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Original strand, 16674131 - 16674281
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| ||    
T  16674131 catatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcttaaacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggtt 16674227  T
Q  379 -aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
     |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16674228 taataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 16674281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 21877258 - 21877344
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    |||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877258 aacatctttcatcatacgactcgattatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 21877344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Original strand, 10753385 - 10753515
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  10753385 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 10753478  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10753479 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10753515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21885314 - 21885166
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  || | ||    
T  21885314 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaa 21885217  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21885216 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagtaa 21885166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8287203 - 8287019
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |     
T  8287203 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcctccatcg 8287104  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     || ||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  8287103 ctaatttgagctaaagctccaacgtggtgggtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 8287019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21997892 - 21997709
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |     
T  21997892 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacatggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcg 21997793  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     || |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  21997792 cta-tttgagctcaagctccatcatgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 21997709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 24528963 - 24529168
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||     
T  24528963 gactcgacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttc 24529061  T
Q  145 cagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacat 242  Q
    |||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| |  | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||    
T  24529062 cagggcataaagcccccatcgcta-tttgagctaaagctccatcgtattaagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 24529160  T
Q  243 ggactcaa 250  Q
    ||||||||    
T  24529161 ggactcaa 24529168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 40723672 - 40723607
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaat 387  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40723672 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcggatcatatcaacaacttaatatcaat 40723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Original strand, 13025073 - 13025233
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||    
T  13025073 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagctctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatca 13025172  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaaca 225  Q
     || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13025173 cta-tttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaca 13025233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Original strand, 13095257 - 13095417
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |     
T  13095257 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagccctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcg 13095356  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaaca 225  Q
     || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13095357 cta-tttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaca 13095417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17718565 - 17718416
Alignment:
Q  279 catatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||   | |     
T  17718565 catatacatccaataatttggagttcttcatcagcttattcataa-catgcaacttagttaaataacatttgccgcataatcaaatcacatcat--gttc 17718469  T
Q  379 aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    |||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17718468 aataacagatcattctcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaa 17718416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 371
Target Start/End: Original strand, 4036175 - 4036290
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4036175 aaaacatcttaatcaacttatcacttatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagca 4036274  T
Q  356 taatcagatcatatca 371  Q
    |||||| |||| ||||    
T  4036275 taatcaaatcacatca 4036290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22959898 - 22959798
Alignment:
Q  68 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  22959898 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaaca 22959799  T
Q  165 t 165  Q
    |    
T  22959798 t 22959798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 23571821 - 23571883
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtgg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23571821 aacatcattcatcattgactcgactatgcaacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtgg 23571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27989297 - 27989210
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27989297 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccttaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 27989210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11581624 - 11581562
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  11581624 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccaacatatt 11581562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 14047860 - 14047905
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14047860 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 14047905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17517549 - 17517504
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17517549 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 17517504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20918370 - 20918325
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20918370 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 20918325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 23064287 - 23064332
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23064287 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 23064332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23390857 - 23390812
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23390857 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccattacagggcat 23390812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 24066929 - 24066974
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24066929 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 24066974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Original strand, 25421290 - 25421331
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421290 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagg 25421331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 25431154 - 25431199
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25431154 atgcaacttagacctcttacatgcatgtggtaccaatacagggcat 25431199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 31060803 - 31060848
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31060803 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 31060848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 38619250 - 38619295
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619250 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 38619295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 474
Target Start/End: Original strand, 10753111 - 10753201
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10753111 caattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 10753201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20027309 - 20027222
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  20027309 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 20027222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 24221627 - 24221723
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24221627 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 24221723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25229524 - 25229441
Alignment:
Q  288 ccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25229524 ccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 25229441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25293680 - 25293597
Alignment:
Q  288 ccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25293680 ccaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 25293597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 26172445 - 26172536
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  26172445 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttaatcataatcattcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 26172536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33896128 - 33896074
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33896128 ttgactcaacaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 33896074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Original strand, 22411929 - 22411971
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22411929 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 22411971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 36314310 - 36314348
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314310 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 36314348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18319374 - 18319329
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18319374 atgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaatccagggcat 18319329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 19668649 - 19668749
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  19668649 atgcaacttagacctcttatatgcat-tggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 19668747  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  19668748 at 19668749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21329865 - 21329820
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21329865 atgcaacttagacctgttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 21329820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 21565294 - 21565339
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21565294 atgcaacttagacctcttatatgcttgtggtaccaatccagggcat 21565339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 29329673 - 29329718
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29329673 atgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaatccagggcat 29329718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20902348 - 20902308
Alignment:
Q  72 acttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20902348 acttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 20902308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 17410245 - 17410299
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17410245 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaat 17410299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23501696 - 23501619
Alignment:
Q  40 ttcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  23501696 ttcatcattgactcaactatgcgacta-tgcaacttaaaactcttatatgcatgtggtacc-attcatggcatgagcccc 23501619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20807126 - 20807088
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20807126 atgcaacttagacctcttatatgcatgtagtaccaatac 20807088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24767882 - 24767837
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24767882 aatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 24767837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41096004 - 41095966
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41096004 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaatac 41095966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10776056 - 10776011
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10776056 atgcaacttagaccttctatatgcatgtggtaccaatccagggcat 10776011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21502526 - 21502481
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21502526 atgcaacttagaccttttagatgcatgtggtaccaatccagggcat 21502481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 32027132 - 32027177
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32027132 atgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 32027177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 11220521 - 11220585
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11220521 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 11220585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 11226940 - 11227004
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11226940 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 11227004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 11228930 - 11228994
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11228930 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 11228994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Original strand, 11230919 - 11230983
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11230919 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 11230983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17730735 - 17730685
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17730735 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaa 17730685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17517295 - 17517240
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  17517295 gactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 17517240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Original strand, 25534897 - 25534985
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca-tatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |  |||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25534897 aatgaatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcgtaatcatcatatcaatatgcatccaataatttggagttaaacgtcatctt 25534985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Original strand, 10752965 - 10753015
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  10752965 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataattaaatcacatcaa 10753015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12028588 - 12028510
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  12028588 caattcattttcaacaacatcaagtttattcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 12028510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21885510 - 21885466
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21885510 aatgcgacaa-tgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 21885466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Original strand, 26172249 - 26172293
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26172249 aatgcgacaa-tgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 26172293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 4036000 - 4036047
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4036000 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 4036047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 10752704 - 10752759
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10752704 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 10752759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 11226656 - 11226711
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11226656 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 11226711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 11230635 - 11230690
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11230635 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 11230690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12028891 - 12028835
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  12028891 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 12028835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15237427 - 15237372
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15237427 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15237372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19473310 - 19473255
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19473310 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 19473255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 20295361 - 20295416
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20295361 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 20295416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20911526 - 20911471
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20911526 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 20911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 22756880 - 22756974
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccc-caaacatattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||    
T  22756880 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagccctcaacaatcatagtattaatatact 22756974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25229730 - 25229683
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25229730 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 25229683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25293886 - 25293839
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25293886 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 25293839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26743072 - 26743021
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  26743072 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtatcaat 26743021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 474
Target Start/End: Original strand, 11225111 - 11225171
Alignment:
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11225111 aataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 11225171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6780 - 6319
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||| |    
T  6780 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccggcattatagtattaatatactttta 6682  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6681 gggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctctagggcataagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 6582  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataaca 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  6581 tcaatcatc-taaaacatcttaatcattatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttataatgactcatgcaacatagttaaataaca 6483  T
Q  347 atcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatc 438  Q
    || ||||||||   |||||| | ||| ||        | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |     
T  6482 atagcagcataggaagatcacaacaatagcataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcattt 6384  T
Q  439 aatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  6383 aatcattaaatcacattacaaacaagttagcagttcaa-acagcttcacatatttcagttaacatc 6319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14091 - 14036
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14091 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 14036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2470 - 2019
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||    
T  2470 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaaca-caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc---cttat-agt 2376  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2375 attaatatactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgta 2276  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtataga 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||| ||    
T  2275 tgctaatgcatggactcaatcatc-taatacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttttattga 2177  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||         | |||||||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  2176 ctcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatcca-tttcaacaacatcttgatcattc 2078  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcattt 472  Q
    ||| | | ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  2077 aatgaaatttcaagtaatgcatttaatcattaaattacattacaaacaacttagcattt 2019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 459
Target Start/End: Original strand, 123 - 561
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||    
T  123 aacatctttcatcatttgactcgacaatgc-acaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgcggtaccaattcagggcatgagcccctagcattatagt 220  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  221 attaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgt 320  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatag 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  321 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatca---tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatag 416  T
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcatt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||        | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  417 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataatatcaattc-ttttcaacgacatcttgatcatt 515  T
Q  414 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  516 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataa 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1861 - 1393
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  1861 catcattgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcatatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagtattaatatac 1763  T
Q  142 tttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaataca 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1762 tttcagggcataagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgta 1663  T
Q  242 tggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaa 341  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1662 tggactcaatcaatctaaaacatcttaatcatcatctcacataaatccaataatttggagttcaatatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaa 1563  T
Q  342 taacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatg 433  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| | |||||         | ||| | ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1562 taaccaaagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataacaacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatg 1464  T
Q  434 caatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||| | ||  ||| ||||||||||| || |||| || ||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  1463 caattattcgttaagtcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatc 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 47 - 456
Target Start/End: Original strand, 42370 - 42787
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  42370 ttgactcgataatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatagtattaatatactttca 42468  T
Q  147 gggcataaggccccaaca--ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42469 gggcataagcccccaacagtttattttgagcaaatactccatcgtggtgagtacaaacctccagggcatgatcccccaacaaatgtatgctaatgcatgg 42568  T
Q  245 actcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaactta 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42569 actcaatcatc-taaaacatcttaatca---tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaactta 42664  T
Q  336 gttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||       | ||||||||||||||||    |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  42665 gttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattaacttcataatatcaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttcaagt 42760  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  42761 aatgcatttaatcattaaatcacatta 42787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25048 - 24949
Alignment:
Q  197 acaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatt 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25048 acaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcaaggactctatcatct--aaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatt 24951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25152 - 25082
Alignment:
Q  82 cttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25152 cttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagccccaaacatcatagtattaatatacttttagggcat 25082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38644 - 38599
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38644 atgcaacgtagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 38599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 47 - 475
Target Start/End: Original strand, 1541 - 1977
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  1541 ttgactcgaaaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtatcaattcatggcatgagcgcccaacattatagtattaatatactttca 1639  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1640 gggcataagcccccaacaattatttgagcaaatgctccatcatggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 1739  T
Q  247 tcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataac 345  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1740 tcaatcaatctaaaaacatcctaatcatcatctcatatacatctaataatttggagttcaacatcatcttgtatagcctcatgcaacttagttaaataac 1839  T
Q  346 aatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaat 437  Q
    ||  |||||||||||||| || | |||||         | |||   ||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1840 aaaggcagcataatcagaccacaacaacattataagttcataaccacaattca-tttcaataacatcgttatcattcaataatatttcaagtaatgcatt 1938  T
Q  438 caatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  1939 taatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 47119 - 46633
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  47119 aacatctttcatcatttgactcgacaatgaaacaa-tgcgacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcataagcccccaacattttagt 47021  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47020 attaatatactttcagggcataagccctcaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccctaacaaatgta 46921  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt-------gtata- 320  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||     
T  46920 tgctaatgcatggactcaatc-tcataaaacatcttaatcatcatctcatatatatatccaataatttggatgttcaacatcatcttattcgtcttataa 46822  T
Q  321 -gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatca 411  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | ||| ||        | ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  46821 tgactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaattca-tttccacaacatcttgatca 46723  T
Q  412 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaac 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||| ||  ||||||||    
T  46722 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttagcatttcataacagcttcacagattgcagttaac 46633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 66 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 74124 - 73725
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaaca- 164  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  74124 aatgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccagcattattgtattaatatacttttagggcataagcccccaacaa 74025  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  74024 ttattttgagcaaatgctccatcgtggttagtacaaagctccagggcataagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacat 73926  T
Q  265 cttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  73925 cttaatcatcatctcatatacatccaataatttggatttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagca 73826  T
Q  356 taatcagatcatatcaaca-------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaa 448  Q
    ||||||||||| | |||||        | | ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  73825 taatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaa 73727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 44355 - 44442
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44355 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagctctcaacgtattaagtattaatatacttacagggcat 44442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 78076 - 78163
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  78076 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagctctcaacgtattaagtattaatatacttacagggcat 78163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 475
Target Start/End: Original strand, 9254 - 9697
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||| |    
T  9254 ttgactcgacaatacgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatatggtaccaattcagggcatgagcccccagcattatagtattactatactttta 9352  T
Q  147 gggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9353 gggcataagcccccaacaattagtttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcataga 9452  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||    
T  9453 ctcaatcatc-taaactatcttaatcaacatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 9551  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt 429  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  9552 ttaaataacaataacaacataatcagatcacatcaacagcataactcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagt 9650  T
Q  430 aatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9651 aatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 475
Target Start/End: Original strand, 1571 - 2015
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||| |    
T  1571 ttgactcgacaatacgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatatggtaccaattcagggcatgagcccccagcattatagtattactatactttta 1669  T
Q  147 gggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1670 gggcataagcccccaacaattagtttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcataga 1769  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttag 336  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||    
T  1770 ctcaatcatc-taaactatcttaatcaacatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttag 1868  T
Q  337 ttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  1869 ttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaag 1967  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaa 475  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  1968 taatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcaa 2015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 5)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21900 - 21633
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21900 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattttagtattaatatactttca 21802  T
Q  147 gggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21801 aggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgga 21702  T
Q  246 ctcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701 ctcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 21633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21597 - 21472
Alignment:
Q  378 taatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaat 476  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||      
T  21597 taatatcaattcattt-caacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatacaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcata 21499  T
Q  477 atagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
      ||||||||||||  |||||||||||    
T  21498 gcagcttcacaaatttcagttaacatc 21472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23063 - 22937
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaata 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||    
T  23063 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagatctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaata 22965  T
Q  139 tactttcagggcat-aaggccccaacat 165  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  22964 tacttccagggcatcaagcccccaacat 22937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 80706 - 80642
Alignment:
Q  392 tttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 456  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  80706 tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagcaatgcatttaatcattaaatcacatta 80642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 80860 - 80810
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  80860 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataattaaatcacatcaa 80810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 149 - 459
Target Start/End: Original strand, 1 - 328
Alignment:
Q  149 gcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1 gcataagccccctacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 100  T
Q  249 aatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagtta 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  101 aatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagtta 200  T
Q  340 aataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||         | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  201 aataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacataacttcataatatcaattcattttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaa 300  T
Q  432 tgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  301 tgcaattagtcattaaatcacattataa 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 33 - 462
Target Start/End: Original strand, 621 - 1068
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattga-ctcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||    
T  621 aacatctttcatcatttaactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatttagggcatgagcccccaacattatagt 719  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  720 attaatatactttcagggcataa-cccccaacaattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgt 818  T
Q  231 atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatac--atccaataatttgga-gttcaacatcatctt-------gtata 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||    
T  819 atgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatacacatatccaataatttggatgttcaacatcatcttattcatcttata 917  T
Q  321 --gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatc 410  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        | ||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  918 atgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattca-tttcaacaacatcttgatc 1016  T
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  1017 attcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 19664 - 19240
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19664 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 19566  T
Q  147 gggcataaggccccaac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg-tatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  19565 gggcataagcccccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctctagggcatgagcccccaacatatgttatgctaatgcatgg 19466  T
Q  245 actcaatcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaa 341  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19465 actcaatcatcttaatcaacatcttaataaacatctcaatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatccatcatagttaaa 19366  T
Q  342 taacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaat 432  Q
    |||||||  ||||| || || |||| | ||||||| |||         |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||    
T  19365 taacaataacagcacaagcaaatcacaacaacagcataacttcataattatcaattca-tttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaat 19267  T
Q  433 gcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19266 gcaattaatcaataaatcacatcataa 19240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Original strand, 5335 - 5754
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  5335 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 5433  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5434 gggcataagcccccaacaattatttgagcaaatgctccatcgtggtgaggacaaggctacagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 5533  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaacatcatct----------tgtatagactcatgcaactta 335  Q
    |||||          ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  5534 tcaat----------catcttaatcaacatctcaatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaactcatcatgtatagactcatgcaactta 5623  T
Q  336 gttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||       | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  5624 gttaaataacagtagcagcataatcagatcacaacaacagcatagttcataatatcaattcattttcaacaacatcttgatcattcaataatatctcaag 5723  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  5724 taatgcaattattcatttaatcacattataa 5754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 459
Target Start/End: Original strand, 6530 - 6949
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6530 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttca 6628  T
Q  147 gggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggac 246  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6629 gggcataagcccccaacaattatttgagcaaatgctccatcgtggtgaggacaaggctacagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggac 6728  T
Q  247 tcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaacatcatct----------tgtatagactcatgcaactta 335  Q
    |||||          ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  6729 tcaat----------catcttaatcaacatctcaatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaactcatcatgtatagactcatgcaactta 6818  T
Q  336 gttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||       | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  6819 gttaaataacagtagcagcataatcagatcacaacaacagcatagttcataatatcaattcattttcaacaacatcttgatcattcaataatatctcaag 6918  T
Q  429 taatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  6919 taatgcaattattcatttaatcacattataa 6949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 12514 - 12559
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12514 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 12559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7520 - 7269
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagt 131  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7520 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggaaccaatacagggcatgagcccccaacattttagt 7422  T
Q  132 attaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgta 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7421 attaataaactttcagggcataagcccccaacattattttgagcaaatgctccatcgtggtgattacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgta 7322  T
Q  232 tgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatata 284  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7321 tgctaatgcatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatata 7269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7194 - 7147
Alignment:
Q  308 atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  7194 atcatcttgtatagactcatgcgacatagttaaataacaatagcagca 7147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7061 - 6981
Alignment:
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  7061 tcaagtaatgcaattaatcattaaatctcattataatcagcttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatc 6981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 66 - 366
Target Start/End: Original strand, 2589 - 2900
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  2589 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcatgagcccccat 2688  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaac 262  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2689 cattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcaagggcatgagcccccaacaaatgtatggtaatgcatggactcaatca-cttaaaac 2787  T
Q  263 atcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcag 353  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2788 atcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcag 2887  T
Q  354 cataatcagatca 366  Q
    || || |||||||    
T  2888 cacaagcagatca 2900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 66 - 366
Target Start/End: Original strand, 6255 - 6566
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    || ||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  6255 aatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttttgtattaatatactttcagggcatgagcccccat 6354  T
Q  163 cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaac 262  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||    
T  6355 cattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatggtaatgcatggactcaatc-ccttaaaac 6453  T
Q  263 atcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcag 353  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6454 atcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcag 6553  T
Q  354 cataatcagatca 366  Q
    || || |||||||    
T  6554 cacaagcagatca 6566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Original strand, 2960 - 3039
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||||||    
T  2960 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcaca 3039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Original strand, 6626 - 6705
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca-cttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||||||    
T  6626 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcaca 6705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 459
Target Start/End: Original strand, 1315 - 1661
Alignment:
Q  128 tagtattaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1315 tagtattaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagaaaatgctctatcgtggtgagtacaaagctccagggcataagcccccaacaa 1414  T
Q  227 atgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgt 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  1415 atgtatgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcacctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgt 1513  T
Q  318 atagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca-------acagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||       ||  | | ||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  1514 atagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaactttatacttcatcatatcaattca-tttcatcaacatcttgatc 1612  T
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1613 attcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 1661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3960 - 3779
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3960 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 3861  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3860 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 3779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 4461 - 4406
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4461 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 4406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 281288 - 280950
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||    
T  281288 aacatcattcatcattgactcgaccatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattatttta 281190  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  281189 gtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 281090  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtct-------catatacatccaataatttggagttcaac---------atcatc 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |        ||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  281089 tatgctaatgcatggactcaat--tcttaaaacatcttaatcatcatatatatatatatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatc 280992  T
Q  314 ttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  280991 ttgtatagactcatgcgacatagttaaataacaatagcagca 280950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22197 - 21861
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    |||    
T  22197 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcgtatatgcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacattatttta 22099  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22098 gtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 21999  T
Q  230 t-atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgta 318  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||         |||||||| ||    
T  21998 taatgctaatgcatgggctcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttata 21900  T
Q  319 tagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21899 tcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 21861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30089 - 29753
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---tta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    |||    
T  30089 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcgtatatgcatgtggtatcaattcagggcatgagcccccaacattatttta 29991  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29990 gtattaatatactttcagggcatgagcccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 29891  T
Q  230 t-atgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgta 318  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||         |||||||| ||    
T  29890 taatgctaatgcatgggctcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttata 29792  T
Q  319 tagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29791 tcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 29753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 437
Target Start/End: Original strand, 33298 - 33694
Alignment:
Q  53 cgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33298 cgacaatgcgacaa-tgcaacctaaacctcttatatgcatgtggtacgaattcagggcatgagcccccgacagtttagtattaatatacattcagggcat 33396  T
Q  153 aaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgt-atgctaatacatggactcaa 250  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  33397 aagcccccaacaattattttgagctaaagctccatcgtggtgaggacaaggctccagggcatgagcccgcaacatatgttatgctaatgcatggactcaa 33496  T
Q  251 tcatcttaa--aacatcttaatcatcgtctca-tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaa 347  Q
    |||||||||  ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  33497 tcatcttaatcaacatcttaaaaaacatctcaatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatccatcatagttaaataacaa 33596  T
Q  348 tcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa---------tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaat 437  Q
    |  ||||| || ||||||| | ||||||| |||         |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  33597 taacagcacaagcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattca-tttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaatgcaat 33694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 67 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19073 - 18816
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  19073 atgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacatattttagtattaatatactttcagggcataagaccccatcg 18974  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacat 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18973 ttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacat 18875  T
Q  265 cttaatcatcgtctc--------atatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||| ||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18874 cttaatcatcatctcatatatatatatatatccaataatttggagttcaacatcatctt 18816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16852 - 16740
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  16852 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaaccttttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaactgtttagtattaatatactttca 16754  T
Q  147 gggcataaggcccc 160  Q
    ||||||||| ||||    
T  16753 gggcataagccccc 16740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18821 - 18604
Alignment:
Q  262 catcttaatcatcgtctcatatacat--ccaataatttggagttcaacatcatcttg-----------tatagactcatgcaacttagttaaataacaat 348  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821 catcttaatcattatctcatatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatatagactcatgcaacttagttaaataacaat 18722  T
Q  349 cgcagcataatcagatcatatcaacag--------cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaa 440  Q
     ||||||||  ||||||| | ||||||        | |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18721 agcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaattcgttt-caacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatggaattaa 18623  T
Q  441 tcaataaatcacattataa 459  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18622 tcattaaatcacattataa 18604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20173 - 20128
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20173 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 20128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 213
Target Start/End: Original strand, 39679 - 39823
Alignment:
Q  73 cttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaacatta 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |  ||    
T  39679 cttagacctcttatatgcatgtagtaccaatagagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagctcccatcgcta 39778  T
Q  168 ttttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  39779 -tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat 39823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 9)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 61697 - 61531
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61697 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 61598  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61597 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 61531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 65613 - 65447
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65613 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcttgatcattcaataata 65514  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65513 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 65447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 80736 - 80914
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  80736 actcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt-caacatcttcctgatcattcaataata 80832  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  80833 attcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataaacacttagcatttcaatacagcttcacaaataacagttaacatc 80914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 366
Target Start/End: Original strand, 12550 - 12831
Alignment:
Q  98 accaatacagggcatgagccccaaacat-att--agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtga 194  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| ||| || |||| ||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12550 accaattcagggcatgagcccccaacattatttgagtattagtatacttccagagcgtaagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtggtga 12649  T
Q  195 gtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaat 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||     
T  12650 gtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcatatatatatccaac 12748  T
Q  293 aatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
     ||||||| || |||         |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||    
T  12749 gatttggaatttaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatca 12831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Original strand, 10454 - 10523
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10454 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 11101 - 11139
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11101 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 11139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Original strand, 80462 - 80539
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  80462 caattcatttt-aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 80539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 372
Target Start/End: Original strand, 80316 - 80366
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  80316 actcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 80366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 66116 - 66061
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  66116 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 66061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 503
Target Start/End: Original strand, 12443 - 12624
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  12443 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcccaatcatttaataata 12542  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12543 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 12624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 11936 - 11991
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11936 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 11991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 5020
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5186 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagctcatatcaacaacttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 5087  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5086 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 5020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 5691 - 5636
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5691 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 5636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16749 - 16406
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  16749 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 16652  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  16651 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgatcccc 16552  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag-ttcaaca---------tc 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||| |||  |||||||||||| ||| |||||||         ||    
T  16551 caacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacgtcataatcatcatctcttatgtatccaataatttagagattcaacatcatattgttc 16453  T
Q  311 atcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16452 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 16406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35311 - 34968
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatt 128  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     || |     
T  35311 aacatctttcatcatttgactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatgagcccccattgttatttg 35213  T
Q  129 agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  35212 agtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttattt-gagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcataagcccccaacatat 35114  T
Q  229 gtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatc---------ttgtat 319  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||         || |||    
T  35113 gtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcattttatat 35015  T
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  35014 agactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatca 34968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 63835 - 63982
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt-a 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||   |||||| || |    
T  63835 tatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa-catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatca---caacaggttta 63930  T
Q  380 atatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  63931 ataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 63982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 431
Target Start/End: Original strand, 75694 - 75866
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagca 355  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  75694 aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa-catgcaacttagttaaataacattttcagca 75792  T
Q  356 taatcagatcatatcaacagctt-aatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    |||||| ||||   |||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  75793 taatcaaatca---caacaggtttaataacaattcattctcaacaatttcttgaccattcaacaataattcaagtaa 75866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34908 - 34813
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  34908 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacaattcataacagcttcacagattgcagttaacatc 34813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 66605 - 66335
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  66605 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatct 66508  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  66507 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 66408  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  66407 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 66335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 307
Target Start/End: Original strand, 68616 - 68878
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  68616 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatacttt 68713  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  68714 cagggcataagcccccaacatttatttgagcaaatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcatgagcccccaacatatgaatgctaatgcatgg 68813  T
Q  245 actcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaac 307  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  68814 actcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaac 68878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 66756 - 66702
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66756 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 66702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 7)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 53481 - 53751
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat---------ct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  53481 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcattttaattatct 53578  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattc 414  Q
    | |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  53579 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 53678  T
Q  415 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  53679 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcaca 53751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 66189 - 65906
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaaca-tatt--a 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||  |    
T  66189 aacatctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttttatgcatgtggtaccatttcagggcatgagcccccatcactatttga 66091  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  66090 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctattt-gagctaaagctccatcgtgttgagttcaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 65992  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65991 tatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 65906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 36171 - 36041
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  36171 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 36078  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  36077 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 36041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 53330 - 53384
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53330 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 53384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 128509 - 128697
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatat--gcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaa---acatattagtattaatatactttcagggcat-aaggccc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |     || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  128509 atgcaacttagacctcttatatatgcatgcggtaccaatacagggcatcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttcaagggcatcaagcccc 128608  T
Q  160 caacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    || |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  128609 catcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 128697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36419 - 36355
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36419 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 36355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36703 - 36648
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36703 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 36648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 58804 - 58638
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58804 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 58705  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58704 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 58638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 103
Target Start/End: Original strand, 132441 - 132503
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132441 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 132503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18813 - 18552
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  18813 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacaccttaatcatcaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 18716  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  18715 tcatgcaacttaggtaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaataacaattcattttcaataatttcttgatcattcaaaaataat 18616  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||    
T  18615 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataaaagcttcaca 18552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 21848 - 21893
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21848 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 21893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18962 - 18907
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18962 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 18907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 12829 - 13090
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  12829 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 12926  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12927 tcatgcaacttagttaattaacaataggagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaatttcttgatcattcaataataat 13026  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  13027 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctccaca 13090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Original strand, 19113 - 19374
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  19113 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 19210  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19211 tcatgcaacttagttaattaacaataggagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaatttcttgatcattcaataataat 19310  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19311 taaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctccaca 19374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Original strand, 62241 - 62386
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||    
T  62241 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaa 62338  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaag 428  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  62339 taacaactcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaag 62386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 12680 - 12735
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12680 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 12735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Original strand, 18981 - 19019
Alignment:
Q  66 aatgcaacttagac-ctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18981 aatgcaacttagacactcttatatgcatgtggtaccaat 19019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 62042 - 62089
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  62042 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 62089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 315
Target Start/End: Original strand, 1637 - 1889
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  1637 atgcaacttagaccccttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcatgagctcccatc 1736  T
Q  164 attatttt-gagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaac 262  Q
     ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1737 gttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaac 1835  T
Q  263 atcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1836 atcttaatcatcatctcatatatatccaatattttggaggttcaacatcatctt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 322 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 36027 - 35862
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36027 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataattagatcatatcaacagcttaatatcaattaattt-caacaacttcctgatcattcaataata 35929  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35928 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 35862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 452
Target Start/End: Original strand, 6925 - 7095
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||||    
T  6925 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatgctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaa 7022  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcac 452  Q
    || ||| |||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  7023 taacaaatcattcacagcaacttcttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcac 7095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11427 - 11336
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  11427 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcattatcaaatcacatcaa 11336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11630 - 11579
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11630 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 11579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38944 - 38864
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatca 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  38944 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcattatca 38864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 6739 - 6790
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  6739 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttggaca-cttatatgcatgtggtaccaat 6790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36581 - 36526
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36581 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 36526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36273 - 36209
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  36273 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 36209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38872 - 38528
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-a 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  38872 aacatccttcatcacttgactcgacaatgtgacaa-tgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacattattga 38774  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||    || ||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38773 gtattaatatacttctagggcataagcccccattgctaatttgagctaatgctcaatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatg 38674  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||         |||||||| |||    
T  38673 tatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttataaatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttatat 38575  T
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  38574 tgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatca 38528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Original strand, 119646 - 119820
Alignment:
Q  79 cctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgag--ccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggccccaacattattttga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  || |||||    
T  119646 cctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttga 119745  T
Q  174 gcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  119746 gctaatgctccaacgtggtgagtacagagctccagggcatcaagccctcaac-aatgaatgctaatgcatggactc 119820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 40462 - 40417
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40462 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 40417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 100103 - 100204
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  100103 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaggccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 100202  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  100203 at 100204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18040 - 17997
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18040 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggc 17997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 44193 - 44238
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44193 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 44238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 101265 - 101336
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  101265 tcatccttgactcgacaaatgcgacta-tgcagcttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 101336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Original strand, 69511 - 69853
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  69511 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 69608  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  69609 gctatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 69708  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  69709 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 69806  T
Q  317 ----tata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  69807 atcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 69853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 406 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10585 - 10504
Alignment:
Q  406 tgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10585 tgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagtatttcataatagcttcaca 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 366
Target Start/End: Original strand, 5811 - 6163
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  5811 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcaacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcaggacataagcccccaac 5908  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  || ||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5909 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagctcccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccc 6008  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaac---------atc 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||         |||    
T  6009 caacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 6107  T
Q  311 atcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  6108 atcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatca 6163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20110 - 19635
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttc 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  20110 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatt-agggcatgagcccccaacaatttagtattaatatactttt 20013  T
Q  146 agggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20012 agggcataagcccccaacaattatttgagcaaattctccatcgtggtgaggactaagctccatggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 19913  T
Q  246 ctcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactt 334  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||         ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19912 ctcaatcgatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcttataatgactcatgcaactt 19813  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||         | ||||| || ||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||  |     
T  19812 agttaaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacacttcattttcaacaacatcaaggttattcaagaataaaccc 19713  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  19712 agtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaactgcttagcaattcataacagcttcacagatctcagttaacatc 19635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15588 - 15113
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttc 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  15588 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaatt-agggcatgagcccccaacaatttagtattaatatactttt 15491  T
Q  146 agggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgga 245  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15490 agggcataagcccccaacaattatttgagcaaattctccatcgtggtgaggactaagctccatggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatgga 15391  T
Q  246 ctcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaactt 334  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||         ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15390 ctcaatcgatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcttataatgactcatgcaactt 15291  T
Q  335 agttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattca 426  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||| | |||||         | ||||| || ||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||  |     
T  15290 agttaaataacaaaagcatcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacacttcattttcaacaacatcaaggttattcaagaataaaccc 15191  T
Q  427 agtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  15190 agtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaactgcttagcaattcataacagcttcacagatctcagttaacatc 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 193369 - 193117
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att--a 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  193369 aacatctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatgagcccccaacattatttga 193271  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  193270 gtattaatatacttccagggcatgagcccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacatatg 193171  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatata 284  Q
    ||||||||| ||||||||| | | | ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  193170 tatgctaatgcatggactctaac-tgttaaagcatcttaatcatcatctcttata 193117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 315
Target Start/End: Original strand, 7053 - 7303
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacata---ttagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  7053 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggcaccaattcagggtatgagcccccaacattattttagtattaatatactttcagggcatgagcccccatc 7152  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
     |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7153 gttattt-gagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaacccaaaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatc-tcttaaaaca 7250  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7251 tcttaatcatcatctcatatatatccaataatttggaggttcaacatcatctt 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15827 - 15641
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  15827 atgcaacttagacctcttatatgaatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 15728  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  15727 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgttaatgcatggact 15641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9355 - 9021
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat--att-a 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |  ||| |    
T  9355 aacatcatgcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttaattga 9257  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9256 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatg 9157  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg---------tat 319  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||    
T  9156 tatgctaatgcatggactcgat-ttctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcatcttatat 9059  T
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9058 cgactcatgcaacttggttaaataataatagcagcata 9021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1621 - 1576
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1621 atgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaattcagggcat 1576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 32171 - 32491
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atatta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | |    
T  32171 aacatcaatcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttga 32269  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||   || ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32270 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttg---actaagcttcagggcatgagcccccaacatatg 32366  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttgtatagactcatg 328  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||    
T  32367 tatgataatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggttcgacatcatcttatatcaactcatg 32465  T
Q  329 caacttagttaaataacaatcgcagc 354  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  32466 caacatagttaattaacaatagcagc 32491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 8486 - 8571
Alignment:
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  8486 tccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatcaa 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 15630 - 15715
Alignment:
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  15630 tccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatcaa 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 459
Target Start/End: Original strand, 32554 - 32605
Alignment:
Q  408 atcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32554 atcattcattcataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 32605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5199 - 4841
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcatt-gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-a 129  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |    
T  5199 aacatctttcatcatttgactcgacgatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggtatgagcccccatcattattga 5101  T
Q  130 gtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||     
T  5100 gtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcatgttgagtactaagctttagggcataagcccccaacatatc 5001  T
Q  230 tatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--atatacatccaataatttgga-gttcaac---------atcatcttgt 317  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||         |||||||| |    
T  5000 tatgctattgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttat 4902  T
Q  318 atagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  4901 attgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagctt 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 226 - 485
Target Start/End: Original strand, 173217 - 173474
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  173217 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 173314  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  173315 tcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttctttatcattcaataataat 173412  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  173413 tcaagtaatgcaatcaatcaatatatcacaatataatcacttagcatttcataatagcttca 173474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 422767 - 422477
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatca-tcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacat 287  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  422767 tggtgaggacaaagctccagggcataagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaaccatcttaatcatcatctcatttacat 422668  T
Q  288 ccaataatttggagttcaacatcatct---------tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | ||||| | |    
T  422667 ccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataattagatcacaacaacatcat 422568  T
Q  379 aat--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||        | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||    
T  422567 aatttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagatcattcaagaataattcaagtaatgcatttagtcgttaaatcacattacaaaca 422477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 204600 - 204693
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  204600 agcatcttaa-catctttcattattgactcgactatgcgacag-tgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 204693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 422898 - 422802
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  422898 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatctggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 422802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 160437 - 160482
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  160437 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 160482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 500853 - 500898
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  500853 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacggggcat 500898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 3469 - 3735
Alignment:
Q  36 atcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||    
T  3469 atcattcatcattgactcgaccatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagta 3567  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  3568 taaatatacttccagggcataagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccctaacatatgtat 3667  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag 301  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  3668 actaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatatccagtaatttggag 3735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Original strand, 7900 - 8166
Alignment:
Q  36 atcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||    
T  7900 atcattcatcattgactcgaccatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagta 7998  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  7999 taaatatacttccagggcataagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccctaacatatgtat 8098  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag 301  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  8099 actaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatatatccagtaatttggag 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 459
Target Start/End: Original strand, 3872 - 3912
Alignment:
Q  419 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3872 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 3912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 459
Target Start/End: Original strand, 8303 - 8343
Alignment:
Q  419 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8303 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataa 8343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8216 - 7878
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |    
T  8216 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccattt-agggcatgagcccccatc 8120  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8119 gctatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccc 8020  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgg-agttcaacatcatcttg--- 316  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  8019 caacaaatgtatgttaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaagttcaacatcatcttgatc 7922  T
Q  317 ------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagc 354  Q
          ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7921 atctcatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagc 7878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10918 - 10580
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  10918 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 10821  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10820 gttatttgagtattaatatacttccagggcataagccccca---ttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatgagcccc 10724  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||       
T  10723 caacaaatgtatcctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaat-atttggaggttcaacatcatcttgatc 10627  T
Q  317 ------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
          ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  10626 atcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacata 10580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16078 - 15737
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  16078 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcctatatgcatgtggtaccaattcagggcataagcccccatc 15981  T
Q  124 at-att-agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagccccc 221  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15980 gttattgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagttaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatgagcccgc 15881  T
Q  222 aacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg---- 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  15880 aacaaatgtatgctaatgcatggacttgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatca 15783  T
Q  317 -----tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
         ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15782 tcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 15737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18844 - 18563
Alignment:
Q  36 atcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |   || | ||||    
T  18844 atcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtgttaccatttcagggcatgagcccccatcgttatttgagta 18746  T
Q  133 ttaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtat 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  18745 ttaatatacttccagggcataagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcatgagcccccaacatatgtat 18646  T
Q  233 gctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatctt 315  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18645 gctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcttcatctcttatgtatccaataatttggaggttcaacatcttctt 18563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 366
Target Start/End: Original strand, 23417 - 23747
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactt 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||    
T  23417 attgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttattgagtattaatatactt 23515  T
Q  144 tcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatg 243  Q
     ||||| ||||| ||||| |  || |||||| ||| ||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23516 ccagggaataagcccccatcgataatttgagaaaaagctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatg 23615  T
Q  244 gactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagt-tcaacatcatcttg---------tatagactcatgcaact 333  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||          ||| ||||||| |||||    
T  23616 gactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggctcaacatcatcttaatcatcttatattgactcatacaact 23714  T
Q  334 tagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  23715 tggttaaataacaatagcagcataggcagatca 23747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 366
Target Start/End: Original strand, 38841 - 39171
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactt 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||    
T  38841 attgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttattgagtattaatatactt 38939  T
Q  144 tcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatg 243  Q
     ||||| ||||| ||||  |  || ||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38940 ccagggtataagcccccttcgctaatttgagctaatgctgcatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatg 39039  T
Q  244 gactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagt-tcaacatcatcttg---------tatagactcatgcaact 333  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||          ||| ||||||| |||||    
T  39040 gactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttatgtatccaataatttggaggctcaacatcatcttaatcatcttatattgactcatacaact 39138  T
Q  334 tagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  39139 tggttaaataacaatagcagcataggcagatca 39171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 366
Target Start/End: Original strand, 14401 - 14732
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactt 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||    
T  14401 attgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttattgagtattaatatactt 14499  T
Q  144 tcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatg 243  Q
     ||||| ||||| ||||  |  || ||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14500 ccagggaataagcccccttcgctaatttgagctaatgctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatgagcccccaacatatgtatgctaatgcatg 14599  T
Q  244 gactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaa----------catcatcttgtatagactcatgcaac 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||  ||| ||||||||||| ||||||           |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14600 gactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatcccttatgtatcaaataatttggaggttcaaacatcatcttaatcatcttatattgactcatacaac 14698  T
Q  333 ttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    || ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  14699 ttggttaaataacaatagcagcataggcagatca 14732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 357
Target Start/End: Original strand, 17953 - 18295
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  17953 agcatcttaa-catcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 18050  T
Q  124 at--att-agtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
    |   ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || | ||||| |||||||| || |||||||||    
T  18051 aataattgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttcagtactaagctccagggtatgagcccc 18150  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg--- 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  18151 caacaaatgtatgctaatgcatggactcga-cttctt-aaacatcataatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatc 18248  T
Q  317 ------tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
          ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18249 atcttatatcgactcatgcaacatagttaattaacaatagcagcata 18295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 77296 - 77148
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  || | ||    
T  77296 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaa 77199  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  77198 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagtaa 77148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 77500 - 77448
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  77500 gactcgacaatgcaacaa-tgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 77448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 503
Target Start/End: Original strand, 43964 - 44293
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43964 tggtgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatc-taaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 44062  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag---- 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||        
T  44063 caataatttagagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcata 44162  T
Q  376 ----cttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcat 470  Q
        | ||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||     
T  44163 atttcataatatcaattca-tttccacaacatcttgataattcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcag 44261  T
Q  471 ttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    || || | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  44262 tttaa-aaagcttcacagatttcagttaacatc 44293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2853 - 2592
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  2853 aatgtatgctaatgcatgtactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 2756  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  2755 tcatgcaacttagttaattaacaattgcagcataatcagatcacatcaacagcttaataacaattca-tttcaacaatttcttgatcattcaataacaat 2657  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  2656 tcaagtaatccaatcaatcaatatatcacaatataatcacttagcagttcataaaagcttcacaa 2592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 30076 - 30121
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30076 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 30121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3001 - 2947
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3001 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 2947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 73911 - 73856
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  73911 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 73856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 228553 - 228306
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||    
T  228553 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacaccttaatcatcaaatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagac 228456  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  228455 tcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcagatcacatca--agcttaataacaattcattttcaactatttcttgatcattcaataataat 228358  T
Q  424 tcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttca 474  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  228357 tcaagtaaatgcaatcaatcaataaatcactatataatcacttagcatttca 228306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20197 - 19937
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||     
T  20197 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcagat 20100  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20099 tcatgcaacttagtttaataacaattgcaacataatcagatcacatca--agcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataat 20002  T
Q  424 tcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||||||    
T  20001 tcaagtaaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacgtttcataaaagcttcaca 19937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 15917 - 15962
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15917 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 15962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33314 - 33227
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| | |  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33314 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccccatcggtataagtattaatatacttccagggcat 33227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 45691 - 45778
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| | |  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45691 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcatcaagcccccatcggtataagtattaatatacttccagggcat 45778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17686 - 17600
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17686 atgcaacttagacctcttctatgcatgtggtaccaatccagggaatcaagccccatcgctataagtattaatatacttccagggcat 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 30977 - 30689
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30977 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 30878  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||         
T  30877 caataatttggagttcaacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcggatcacaacaacattata 30778  T
Q  375 --gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
       | ||| | ||||||| ||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  30777 cttcataacaacaattca-tttcaactacatctttatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 30689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 1857 - 2005
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||  || | ||    
T  1857 tatacttccaataatttggagctcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaatcacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaa 1954  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  1955 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagtaa 2005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34220 - 34148
Alignment:
Q  46 attgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34220 attgactcgacaatgcgacaa-tgcaacctaaatctctcatatgcatgtggtaccaattcaggacatgagcccc 34148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 1654 - 1705
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1654 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 1705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15068 - 15023
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15068 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcat 15023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14425 - 14135
Alignment:
Q  88 tgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctcc 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  14425 tgcatatggtaccaatacagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcgttattt-gagctaatgctcc 14327  T
Q  185 atcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc--ata 282  Q
    ||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  14326 atcgtgttgagtactaagctccagggcataagcccccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaacatcttaatcatcatctcttata 14228  T
Q  283 tacatccaataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    || ||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14227 tatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatca 14135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17607 - 17394
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaa 136  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |   || | ||||||||    
T  17607 tcatctttgactcgacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaa 17509  T
Q  137 tatactttcagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgc 234  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||||| || |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    ||||    
T  17508 tatacttccagggcatcaagcccccatcgcta-tttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaacctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgc 17410  T
Q  235 taatacatggactcaa 250  Q
    |||| |||||||||||    
T  17409 taatgcatggactcaa 17394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14075 - 13980
Alignment:
Q  409 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatc 503  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  14075 tcattcattaacatttcaagtaattcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagatttcagttaacatc 13980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 250 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6482 - 6228
Alignment:
Q  250 atcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggagttcaacatca---------tcttgtatagactcatgcaacttagttaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6482 atcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaa 6383  T
Q  341 ataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaat 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||         | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6382 ataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaattca-tttcaacaacttcttgatcattcaataatatttcaagtaat 6284  T
Q  433 gcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  6283 gcaattaataattaaatcacaatataaacaacttaacatttcataatagcttcaca 6228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7617 - 7319
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  7617 acctcttatatgcatgtggtaccaatt-agggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttcagggcataagcccccaacatttatttgagcaa 7519  T
Q  178 atgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgt 276  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |    
T  7518 atgctccatcgtggtgaggactaagcttcagggcatgagcccccaacatattaatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacat 7419  T
Q  277 ctc-atatacatccaataatttggagttcaacatcatctt-------gtata--gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||        ||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  7418 ctcaatatgcatccaataattttgagctcaacaacatcttattaatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatca 7319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 171 - 357
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  171 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactctttcatcttaaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 270  T
Q  289 caataatttggagttcaac---------atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    |||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  271 caataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatca 357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 37 - 114
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  37 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccctaacaatttagtattaatatacttt 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3687 - 3642
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3687 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 3642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27501 - 27238
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  27501 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggtatgagcccccaagtgtttagtattaatatacttt 27404  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatgg 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  27403 cagggcataagcccccaacatttatttgagcaaatgctccatcgtggtgaggactaagctccagggcatgagcccccaacatatgaatgctaatgcatgg 27304  T
Q  245 actcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaaca 308  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27303 actcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaaca 27238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23852
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | |    
T  23562 agcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgagacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcggggcatgagctcccatc 23659  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||  |||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660 gctatttgagtattaatatacctccagggcataagcccccatcactatt--gagctaaagctctatcgtgttgagtacaaagctccatggcatgagcccc 23757  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23758 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcacaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 23852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 6)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 414284 - 413996
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  414284 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactctatcatct-aaaacattttaatcatcatctcatatacatc 414186  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatct---------tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca----- 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||         
T  414185 caataatttggagttcaacatcatcttaatcatcatgtatagacgcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaacattata 414086  T
Q  375 ---gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
        | ||| | ||||||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  414085 atttcataacaacaattc-gtttcaacaacatctagatcattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 413996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 462
Target Start/End: Original strand, 71049 - 71221
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||       |||||||    
T  71049 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacatattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca-atca-------agcttaa 71140  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||| | |||||  ||||||||||| |||||    
T  71141 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttaaaataatgcatttaatcataaaatcacattacaaaca 71221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 400
Target Start/End: Original strand, 139637 - 139809
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  | |     
T  139637 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagtttattcataa 139734  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaa 400  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  139735 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaacaacaaatcattctcaacaa 139809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 414415 - 414318
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  414415 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctcttatatgcatgtggtgccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 414318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 340335 - 340122
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaac----ttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtatt 134  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |  ||||||||||    
T  340335 tcatctttgactcgacaatgtgac-tatgcaacttaattagacctcttatatgcatgtggtaccaatcgagggcatcaagcccccatcgctattagtatt 340237  T
Q  135 aatatactttcagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtat 232  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| |   ||||| ||| || |||||||| || ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    ||    
T  340236 aatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaatttt-agctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaat 340138  T
Q  233 gctaatacatggactc 248  Q
    |||||| |||||||||    
T  340137 gctaatgcatggactc 340122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 103
Target Start/End: Original strand, 100849 - 100901
Alignment:
Q  49 gactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  100849 gactcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 100901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 36213 - 36463
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  36213 atgcaagttagacctcttatatgcatgtggtactaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgagcccccatc 36312  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
      ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  36313 gctattt-gagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaa-cctctt-aaaca 36409  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    ||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36410 tcacaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 36463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 7355 - 7615
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7355 tggtgaggacaaagctctagggcatgagcccccaacaaa-gtatgctaatgcatggactctatcatct-aaaacatcttaatcatcatctcatatacatc 7452  T
Q  289 caataatttggagttcaacatcatct---------tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  7453 caataatttggagttcaacatcatcttaatcatcatgtatagactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacagcaacatcata 7552  T
Q  380 at--------atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgca 435  Q
    ||        | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7553 atttcataacaacaattca-tttcaacaacatctagatcattcaagaataattcaagtaatgca 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 9654 - 9599
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatat 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9654 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatat 9599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 7224 - 7321
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  7224 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatataaacctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagccctcaacatcatagtattaatatacttt 7321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 1056 - 1348
Alignment:
Q  24 agcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac 123  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  1056 agcatcttaa-catctttcgtcattgactcgactatgtgacta-tgcaacttagacctcttttatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatc 1153  T
Q  124 ---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
       || | |||||||||||||||  |||||||| | ||||| |  || ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1154 gttatttgagtattaatatacttctagggcatatgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagaacatgagcccc 1253  T
Q  221 caacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1254 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgat-atcttaaaa-atcaaaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 15443 - 15481
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 15481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 247
Target Start/End: Original strand, 3276 - 3458
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat-att-agtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  3276 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacgttattgagtattaatatacttccagggcataagcccccatcg 3375  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
     || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3376 ctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggact 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 247
Target Start/End: Original strand, 7339 - 7522
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaaca--tatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  7339 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaaaggttattgagtattaatatacttccagggcataagcccccatc 7438  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
      || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7439 gctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggact 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28080 - 27993
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  28080 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 27993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 226 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9846 - 9585
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  9846 aatgtatgctaattcatggactttatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttatttagac 9749  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattt-tcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9748 tcatgcaacatagttaattaacaattgcagcgtaatcagatcacatca--agcttaataacaattcatttaataacaatttcttgatcattcaataataa 9651  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||    
T  9650 ttcaagtaaatgcgatcaatcaataaatcacattataatcacttaaaatttcataaaagcttcaca 9585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 10252 - 10504
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  10252 atgcgacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcataagcccccatc 10351  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  10352 gttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctcaagggcatgagcacccaacatatgtatgctaatgcatggactcgatc-tcttaaaaca 10450  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    |||||||| || |||| ||   |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  10451 tcttaatcgtcatctcttaggtatccaagaatttggaggttcaacatcgtcttg 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Original strand, 19739 - 19989
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  19739 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgagcccccatc 19838  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaaca 263  Q
      ||  |||||| || |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  19839 gcta-attgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaaactccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaaca 19935  T
Q  264 tcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    || |||||||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19936 tcataatcattatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 19989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 38182 - 38271
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38182 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccagtccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 38271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 316
Target Start/End: Original strand, 178632 - 178907
Alignment:
Q  40 ttcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac---atattagtattaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |  | ||| ||||    
T  178632 ttcatcattgactcgactatgcgagta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccatcgctaattgagtgttaa 178730  T
Q  137 tatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgcta 236  Q
    |||||   ||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  178731 tataccgccagggcataagcccccatcgctatt--gagctaaagctccatcatgttaagtacaaagctccagggtatgagcccccaacaaatgtatgcta 178828  T
Q  237 atacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttgga-gttcaacatcatcttg 316  Q
    || ||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  178829 atgcatggactcgatc-tctt-aaacatcacaatcatcatctcttatttatccaataatttggaggttcaacatcatcttg 178907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 326 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 13568 - 13407
Alignment:
Q  326 atgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattc 425  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13568 atgcaactcagttaattaacaataacagaataatcagatcacatcaacaacttaatatcaatcgatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatta 13469  T
Q  426 aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  13468 aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctacaca 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48847 - 48662
Alignment:
Q  23 aagcatcttaaacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaa 122  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48847 aagcatcttaa-catctttcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaa 48750  T
Q  123 c---atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcca 207  Q
    |   || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  48749 cgttatttgagtattaatatacttccagggcatgagcccccatctttattttgagctaaagctccattgtggtgagtacaaagctcca 48662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 19014 - 19059
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19014 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagagcat 19059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48657 - 48569
Alignment:
Q  227 atgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatccaataatttggag-ttcaacatcatcttg 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48657 atgtatgctaatgcatggactcga-cttcttaaa-catcgtaaacatcatctcttattcatccaataatttggagattcaacatcatcttg 48569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3450
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagc 354  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  3681 aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagt 3582  T
Q  355 ataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcaca 453  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  3581 ataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataacaattcaagtaaatgcaatcaatccataattcact 3484  T
Q  454 ttataaacacttagcatttcaatatagcttcaca 487  Q
     ||||  |||||| |||||||  | |||||||||    
T  3483 ctatattcacttaacatttcataaaagcttcaca 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 2016 - 2193
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atatt-agtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||     
T  2016 ttgactcgactatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacaaatacagggcatgagcccccaactttattgagtattaatatacttc 2114  T
Q  145 cagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaa 223  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| || || |||||||||    
T  2115 cagggcataagcccccatctttaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtagtaagctccagggtataagcccccaa 2193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 195258 - 195119
Alignment:
Q  80 ctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  195258 ctcttatatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacagtttagtattaatatactttcagggcataagcccccaacatttatttgagcaaat 195160  T
Q  180 gctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccc 220  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  195159 gctccatcgtggtgaggattaagctccagggcatgagcccc 195119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 192528 - 192262
Alignment:
Q  215 agcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atatacatccaataatttggagttcaaca---- 308  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||        
T  192528 agcccccaacatatgaatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaataatcttaatcaacatctcaatatgcatccaataatttggagctcaacaacat 192429  T
Q  309 -----tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca--------gcttaatatcaattcattttc 395  Q
         ||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| | |||||         | | ||| ||||||||||||    
T  192428 cttattcatcttataatgactcacacaacttagttaaataacaaaggcagcatattcaaatcacaacaacattataacttcattataacaattcattttc 192329  T
Q  396 aacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||| ||  | | |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  192328 aacaacatcaaggtaattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 192262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 1014 - 927
Alignment:
Q  401 cttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014 cttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaa 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 474
Target Start/End: Original strand, 6606 - 6852
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  | ||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |  | ||    
T  6606 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--agaacatcttaatcaacttttcaattatacatccaataatttggagttcatcatgaacttattcatac 6703  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |    
T  6704 tcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatctcatca--agcttaataacaattca-tttcaacaacatcttgatcattctataatatt 6800  T
Q  424 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  6801 tcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 6852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 7)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24902
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||    
T  25150 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacttaattcaga 25053  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcc--tgatcattcaataat 420  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  25052 ctcatgcaactcagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaacacattttcaataa-ttcctttgatcattcaataat 24956  T
Q  421 aattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttc 473  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  24955 aattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttc 24902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 189462 - 189332
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  189462 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 189369  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  189368 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 189332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25245
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25290 aatgcgacaa-tgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaat 25245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 189710 - 189646
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  189710 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 189646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 111
Target Start/End: Original strand, 225240 - 225284
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggca 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  225240 atgcaacttaaacctcttatatgcatatggtaccaatccagggca 225284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 189994 - 189939
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  189994 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 189939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 5049 - 5021
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5049 atgcaacttagacctcttatatgcatgtg 5021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Original strand, 30865 - 31056
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||  |||||||    
T  30865 tatacatccaataatttggagttcgtcatcaacttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattacagcataatcaaatctcatca--agcttaa 30962  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  30963 taacaattca-tttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 31056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 66294 - 66338
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66294 atgcaacttagtc-tcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 66338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 207974 - 207771
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag----- 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||         
T  207974 tatacattcaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcatatcatatcaacagtataa 207875  T
Q  376 ---cttaatatcaattcattttc-aacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcat 470  Q
       | |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||     
T  207874 cttcataatatcaattcattttcaaacaacaacttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcag 207775  T
Q  471 ttca 474  Q
    ||||    
T  207774 ttca 207771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 1611 - 1656
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1611 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccattacagggcat 1656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2673 - 2485
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  2673 tggtgaggacaaagctccaaggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 2574  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2573 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaatttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 2485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10533 - 10345
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  10533 tggtgaggacaaagctccaaggcatgagcccccaacaaaagtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 10434  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca---------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10433 tccaataatttggagctcaacaacatcttattcatcatgtatagactcatgcaatttagttaaataacagcagcagcataatcagatca 10345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10662 - 10566
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10662 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctagacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 10566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2706
Alignment:
Q  75 tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  2773 tagacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacatcatagtattaatatacttt 2706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 10240 - 9991
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcatcttg------- 316  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||            
T  10240 aatgtatgctaatgcatggattctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatct 10143  T
Q  317 --tatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacag-----ctt---aatatcaattcattttcaacaacttcct 406  Q
      |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     |||   ||||||||||||||| ||||||| || |    
T  10142 tatatagatttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatcaattcattt-caacaacatctt 10044  T
Q  407 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  10043 gatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 9991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10379 - 10334
Alignment:
Q  57 aatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10379 aatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtatcaat 10334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 320 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18446 - 18310
Alignment:
Q  320 agactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataa 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18446 agactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcattcaataa 18349  T
Q  420 taattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattat 457  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  18348 taattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttat 18310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20589 - 20398
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  20589 tatacattcaataatttggagttcatcatcaacttattcatattcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaa 20492  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    || ||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||| |||  |||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  20491 taacaattca-tttcatcaacatcttgattattcaataatatttcgtgtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca 20398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20796 - 20741
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20796 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 20741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 208
Target Start/End: Original strand, 404 - 548
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc--aaacatatt-agtattaatatactttcagggcataaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  404 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaaaggttattgagtattaatatacttccagggcataagcctccatc 503  T
Q  164 attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccat 208  Q
      || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  504 gctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccat 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 284
Target Start/End: Original strand, 542 - 644
Alignment:
Q  180 gctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctc 279  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  542 gctccattgtggtgagtacaaagctccagggcctgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatc-tctt-aaacatcataatcatcatctc 639  T
Q  280 atata 284  Q
     ||||    
T  640 ttata 644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 125
Target Start/End: Original strand, 1848 - 1939
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1848 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccccaacat 1939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 1917 - 1982
Alignment:
Q  143 ttcagggcataaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccat 208  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1917 ttcagggcatgagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccat 1982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 7942
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctcatatacatc 288  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8051 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacgaatgtatgctaatgtagggactctatcatct--aaacatcttaatcatcatctcatatacatc 7954  T
Q  289 caataatttgga 300  Q
    ||||||||||||    
T  7953 caataatttgga 7942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 8077
Alignment:
Q  78 acctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  8151 acctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcattagcccccaacatcatagtattaatatacttttagggcat 8077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16561
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16516 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtacctatccagggcat 16561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Original strand, 8359 - 8445
Alignment:
Q  128 tagtattaatatactttcagggcataaggccccaaca-ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8359 tagtattaatatactttcagggcataagcccccaacaattattttgagcaaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat 8445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Original strand, 8290 - 8350
Alignment:
Q  33 aacatcattcatca-ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatg 93  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8290 aacatctttcatcaattgactcgacaatgcgac-aatgcaacctaaacctcttatatgcatg 8350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10787 - 10600
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  10787 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 10688  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  10687 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 10600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11803 - 11620
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |     
T  11803 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcg 11704  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  11703 ctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 11620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 9829 - 10032
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||    
T  9829 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatac 9926  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  9927 acatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 10024  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  10025 tcaagtaa 10032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 9685 - 9732
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9685 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 9732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 4471 - 4657
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  4471 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 4570  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  4571 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccctaac-aatgaatgctaatgcatggactc 4657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1100
Alignment:
Q  49 gactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  1005 gactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccccatcatcatagtattaatatacttt 1100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 1172 - 1258
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcg--tctcatatacatccaataatttggagttcaacatcat 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1172 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcaaatctcttatacatccaataatttggagttcatcatcat 1258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 459
Target Start/End: Original strand, 2918 - 3073
Alignment:
Q  311 atcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaac-----agct---taatatcaattcattttcaacaact 402  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     | ||   ||||||||||| | ||||||||||     
T  2918 atcttatatagacttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaatataactttataatatcaatt-aatttcaacaaca 3016  T
Q  403 tcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 459  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  3017 tcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataa 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 462
Target Start/End: Original strand, 8443 - 8732
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaat-catcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atataca 286  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| |||  |||||||||| | |||| |||| ||    
T  8443 tggtgaggaaaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatgaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatatgca 8540  T
Q  287 tccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaaca---- 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | || ||        
T  8541 tccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattat 8640  T
Q  375 ----gcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
         | ||| | |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  8641 aatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 8312 - 8407
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaact-tagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  8312 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 8407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 13254 - 13441
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  13254 atgcaacttagacctcttatatgcatatggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 13353  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13354 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 13441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 2048 - 2236
Alignment:
Q  186 tcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-atat 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||| |||  |||||||||| | |||| ||||    
T  2048 tcatggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactaaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaatat 2145  T
Q  284 acatccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
     |||||||||||||||||||||| |        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  2146 gcatccaataatttggagttcaagaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcaaatca 2236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Original strand, 11472 - 11550
Alignment:
Q  384 caattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  11472 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaaca 11550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Original strand, 1960 - 2015
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1960 tatgcatgtggtaccaat-caaggcattagcccccaacattatagtattaatatact 2015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Original strand, 4291 - 4517
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atatt--agtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| | |||||  ||||||| ||||||    
T  4291 ttgactcgacaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataaggggcatcaagccccaatcgatatttgagtattattatact 4389  T
Q  143 ttcagggcataaggccccaa-cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatac 240  Q
    |  | ||||| | ||||||| |  || ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |    
T  4390 tcaaaggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgaggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgc 4488  T
Q  241 atggactcaatcatcttaaaacatcttaat 270  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  4489 atggactcga-cctctaaaaacatcttaat 4517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 248
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1941
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |   || | ||||||| ||||||    
T  1736 ttgactcgacaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatggggcatcaagccccaatcgctatttgagtattattatact 1834  T
Q  143 ttcagggcataaggccccaa-cattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatac 240  Q
    |  ||||||| | ||||||| |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |    
T  1835 tctagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgc 1933  T
Q  241 atggactc 248  Q
    || |||||    
T  1934 atagactc 1941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 28172 - 28359
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggc-ataaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  28172 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtactaatacatggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggctttaagccccca 28271  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
       ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  28272 ttgttaatttgagctaaacctccaacatggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 28359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6452 - 6375
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaacatattagtattaatatacttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  6452 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccctcaacatcatagtattaatatacttt 6375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6382 - 6212
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||||    
T  6382 tatacatccaataatttggagttcatcatcaacttattcatgctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaa 6285  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcac 452  Q
    || ||| |||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  6284 taacaaatcattcacagcaacttcttgatcattcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcac 6212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 1880 - 1971
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  1880 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcattatcaaatcacatcaa 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 1677 - 1728
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1677 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 1728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6568 - 6517
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  6568 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttggaca-cttatatgcatgtggtaccaat 6517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 31826 - 32012
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgag--ccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  31826 atgcaacttagacttcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 31925  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  31926 tcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 32012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 168340 - 168154
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||    
T  168340 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaaaatacttccagggcatcaagccccca 168241  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  168240 tcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 168154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 51673 - 51718
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51673 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtagcaatacagggcat 51718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4465 - 4275
Alignment:
Q  184 catcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatc-atcttaaaacatcttaatcatcgtctc-at 281  Q
    |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | |||| ||    
T  4465 catcgtggtgaggacaaagcttcagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatcaatctaaaacaatcttaatcaacatctcaat 4368  T
Q  282 atacatccaataatttggagttcaaca--------tcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatca 366  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  4367 atgcatccaataatttggagctcaacaacatctattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatca 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1457 - 1419
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 1419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4245 - 4170
Alignment:
Q  387 ttcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  4245 ttcattttcaacaacttcaaggttattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 4170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4529 - 4473
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  4529 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 4473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Original strand, 2450 - 2532
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatca 272  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2450 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatcgtc-taaaacatcttaatca 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 2335 - 2390
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2335 ttgactcgacaatgcgacaa-tgcaaccaaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 65100 - 65022
Alignment:
Q  33 aacatcattcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  65100 aacatcattcatcattgactcgactatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcat 65022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 46753 - 46940
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  46753 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccccca 46852  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  46853 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggggagtacaaagctctagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 46940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 1708 - 1897
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  1708 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccccca 1807  T
Q  162 ac---attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |   | | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1808 tcgctaattttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 1897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 207
Target Start/End: Original strand, 16039 - 16186
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  16039 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 16138  T
Q  162 acatta--ttttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctcca 207  Q
     |  ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16139 tcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 16186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 431
Target Start/End: Original strand, 18336 - 18483
Alignment:
Q  282 atacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||   | |||||    
T  18336 atacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataaacaaatcacatca--ggtttaat 18433  T
Q  382 atcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    | ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18434 aacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 18483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 431
Target Start/End: Original strand, 9346 - 9549
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagac 323  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || |  ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | |     
T  9346 aatgaatgctaatgcatggactctaacaac--aaaacatcttaatcaacttatcacatatacatccaataatttggagttcatcatcagcttattcataa 9443  T
Q  324 tcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataat 423  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||| ||   | |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9444 acatgcaacttagttaaataacatttgcagtataattaaatcataacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaataataat 9541  T
Q  424 tcaagtaa 431  Q
    ||||||||    
T  9542 tcaagtaa 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 12972 - 13157
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  12972 atgcaacttagacatcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 13071  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  ||  |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    |||||||| |||||||||    
T  13072 tcgcta-attgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2763 - 2576
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2763 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaagacatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 2664  T
Q  162 acatt-attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     | || ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  2663 tcgttaattttgagctaatgctccaacgttgtgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1073 - 995
Alignment:
Q  40 ttcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagcccc 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1073 ttcatcattgactcgactatgcgatta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatgagcccc 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 466
Target Start/End: Original strand, 23141 - 23381
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtat-aga 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   | |||    
T  23141 aatgaatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacaccttaatcaacttatcacttatacatccaataatttggagttcatcatcaacgtaattcaga 23238  T
Q  323 ctcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataa 422  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  23239 ctcatgaaacatagtttaataataattgcagcttaatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaatttcttggtcattcaacaataa 23336  T
Q  423 ttcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacactta 466  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||    
T  23337 ttcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcactta 23381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 129658 - 129759
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacata-ttagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  129658 atgcaacttagacctcttatatgaatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtagtaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 129757  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  129758 at 129759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 117994 - 117949
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  117994 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 117949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 487
Target Start/End: Original strand, 1 - 115
Alignment:
Q  374 agcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcattt 472  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  1 agcttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacattt 100  T
Q  473 caatatagcttcaca 487  Q
    ||  | |||||||||    
T  101 cataaaagcttcaca 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5491 - 5339
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  5491 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggtatcaagccccca 5392  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  5391 tcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcat 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 247
Target Start/End: Original strand, 31918 - 32105
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  31918 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 32017  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggact 247  Q
     |  | ||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| ||||||||    
T  32018 tcgctaattttgagctaatgccccaatgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggact 32105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35456
Alignment:
Q  321 gactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatca--------attcattttcaacaacttcctgatcat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||   |||| |||        |||||||||||||||| ||  | | ||    
T  35605 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 35506  T
Q  413 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaaca 462  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  35505 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaca 35456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11586 - 11456
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  11586 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 11493  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  11492 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 11456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14172 - 14042
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  14172 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatca--agcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataata 14079  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  14078 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 14042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Original strand, 37112 - 37153
Alignment:
Q  71 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37112 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 37153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14420 - 14356
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14420 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttca 14356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14704 - 14649
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14704 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 14649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 27638 - 27821
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac-atattagtattaatatactttcagggcataaggccccaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |     
T  27638 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagcccccatcgctataagtattaatatacttccagggcatcaagccccatcg 27737  T
Q  165 ttattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     || ||||||| || |||||||| || | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  27738 cta-tttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 27821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6125 - 5977
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||    
T  6125 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaa 6028  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6027 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaataattcaagtaa 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6321 - 6277
Alignment:
Q  58 atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6321 atgcgacaaatgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 6277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8320 - 8276
Alignment:
Q  58 atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8320 atgcgacaaatgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 8276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 51339 - 51492
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga--gccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||    ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  51339 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagttcccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 51438  T
Q  162 acatta--ttttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
     |  ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  51439 tcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcat 51492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16788 - 16640
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   | ||    
T  16788 tatacttccaataatttggagttcagcatcaacttattcataatcatgcgacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcatatcaac--ttaaa 16691  T
Q  381 tatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaa 431  Q
    || ||| ||||| |||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16690 taacaaatcattctcaatagtttcttgatcattcaacaacaattcaagtaa 16640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 32286 - 32373
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  32286 atgcaacatagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 32373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16988 - 16941
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16988 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 16941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 8239 - 8426
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |   || ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  8239 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcatcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagtcccca 8338  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | || |||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  8339 tcgctaatgttgagctaatgctccaatgtggtgagtacaaagatccagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 8426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 174524 - 174711
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  174524 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacaaggcatcaagccaccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 174623  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  174624 tcgctaattttgagcaaattctccaatgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 174711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 121569 - 121614
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121569 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 121614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 136752 - 136665
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  136752 atgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaggccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 136665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1407 - 1306
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  1407 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 1308  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  1307 at 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8890 - 8704
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |   || | |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  8890 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccccca 8791  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     || ||  |||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  8790 tcacta-attgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 8704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5193 - 5148
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5193 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 5148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3275
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3230 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 3275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 10267 - 10312
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Original strand, 210 - 290
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  210 tttgagctaaagctccatcgtgttgagtgcaaagctccagggcatcaagcccccaacaaagaaatgctaatgcatggactc 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 33 - 78
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 78  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 33881 - 34068
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||| | |   || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  33881 atgcaacttagacctcttatatgcatatggtacgaatacagggcatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 33980  T
Q  162 ac-attattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||| | || |||||  |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  33981 tcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagttgcagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatagactc 34068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 38564 - 38609
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38564 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 38609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 32279 - 32324
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32279 atgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagggcat 32324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 32745 - 32790
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32745 atgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagggcat 32790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 1842 - 1913
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1842 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Original strand, 6259 - 6330
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6259 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Original strand, 8219 - 8266
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  8219 atgcaacttaaacctcttatatgcttgtggtaccaatgcatggcatga 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 357
Target Start/End: Original strand, 29013 - 29153
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaac---------atcatct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||| |         ||||||     
T  29013 aatgtatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcttaatcatcatatcacttatacatccaataatttggaattcatcatcaacttaatcatca 29110  T
Q  315 tgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  29111 tgtatagactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcata 29153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5041 - 4971
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5041 tcatctttgactcaacaatgtgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 4971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9406
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9315 tatacttccaataatttggaattcatcatcaacttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 9406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 9114 - 9165
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9114 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagac-tcttatatgcatgtggtaccaat 9165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3533 - 3463
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3533 tcatctttgactcgacaatgcgatta-tgcaacttagacctcttatatgaatgtggtaccaatccagggcat 3463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24252 - 24165
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatta-gtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24252 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaatgtattatgtattaatatacttccagggcat 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 371
Target Start/End: Original strand, 349 - 439
Alignment:
Q  281 tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatca 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  349 tatacttccaataatttggagttcatcatcaacttattcataatcatgcaacttaattaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Original strand, 146 - 196
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  146 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaa 196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 6397
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6439 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12683 - 12641
Alignment:
Q  70 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683 caacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 12641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 1150 - 1195
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1150 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 6341 - 6386
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6341 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 6571 - 6672
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  6571 atgcaactgagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 6670  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  6671 at 6672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8428 - 8383
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8428 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 8383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10457
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10412 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 10457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11847
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11802 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 11847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15409
Alignment:
Q  287 tccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaa 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15324 tccaataatttggagttcatcatcaacttattcataattatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 15409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Original strand, 15118 - 15165
Alignment:
Q  54 gacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15118 gacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 15165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 8881 - 8926
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8881 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 8926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 20428 - 20473
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20428 atgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaatacagggcat 20473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 4649 - 4743
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  4649 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaatctaaacctctt-tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 4743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 5397 - 5442
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5397 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16957 - 16912
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16957 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 16912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 29326 - 29382
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29326 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 29382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 315
Target Start/End: Original strand, 29479 - 29566
Alignment:
Q  228 tgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca--tatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29479 tgtatgctaatgcatagactctatcaac--aaaacatcttaatcatcatattacttatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 29566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46160 - 46059
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacata-ttagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  46160 atgcaacttatacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagcccttaacatagtaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 46061  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  46060 at 46059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 47088 - 47043
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47088 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 47043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 10075 - 10120
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10075 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatatagggcat 10120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Original strand, 20734 - 20819
Alignment:
Q  129 agtattaatatactttcagggcat-aaggccccaacattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  20734 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccaaggcat 20819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52347 - 52302
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52347 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 52302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 53917 - 53830
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  53917 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaattcagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 53830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 205297 - 205235
Alignment:
Q  189 tggtgagtacaaagctccatggcatgagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactcaatca 253  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  205297 tggtgaggacaaagctccagggcatgagcccccaacaa--gtatgctaatgcatggactcaatca 205235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 205389 - 205333
Alignment:
Q  86 tatgcatgtggtaccaatacagggcatgagccccaaac-atattagtattaatatact 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  205389 tatgcatgtggtaccaat-cagggcatgagcccccaacaatcatagtattaatatact 205333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 161476 - 161431
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  161476 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 161431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 4609 - 4794
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaaca-tatt--agtattaatatactttcagggcat-aaggcccca 161  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  4609 atgcaacttagacctcttataagaatgtggtaccaatacagggcatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagccccca 4708  T
Q  162 acattattttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
     |  ||  |||| | || |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  4709 tcgcta-attgacctaaagctccaacgtggtgagtacaaaactccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 4794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 32745 - 32615
Alignment:
Q  322 actcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 421  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||| ||||    |||| || ||||||||||||||||    
T  32745 actcatgcaacttagtttaacaacaattacagcataatcaattcatgtcaa--gcttaataacaatttattt----caacatcttgatcattcaataata 32652  T
Q  422 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 458  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  32651 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 32615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33278 - 33223
Alignment:
Q  47 ttgactcgaca-atgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33278 ttgactcgacatatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 33223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 32993 - 32929
Alignment:
Q  411 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaac-acttagcatttca 474  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  32993 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattaaaaacaacttagcagttca 32929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 123 - 76
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcatga 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  123 atgcaacttagacctcttatatacatgtggtactaatacagggcatga 76  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 458
Target Start/End: Original strand, 439 - 548
Alignment:
Q  343 aacaatcgcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatc 442  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  439 aacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattt----caacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatc 532  T
Q  443 aataaatcacattata 458  Q
    | ||| ||||| ||||    
T  533 attaattcacagtata 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Original strand, 1045 - 1234
Alignment:
Q  69 gcaacttagacctctta----tatgcatgtggtaccaatacagggcatga-gccccaaac---atattagtattaatatactttcagggcat-aaggccc 159  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |   || | ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||    
T  1045 gcaacttagacctcttaattatatgcatgtggtaccaatacggggcatcaagccccgaccgctatttgagttttaatatacttccaggacatcaagcccc 1144  T
Q  160 caacatta-ttttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcatg-agcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    || |  || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  1145 catcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatgaagcccccaac-tatgaatgctaatgcatggactc 1234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15575 - 15530
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15575 atgcaacttagacttgttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 15530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39045 - 39006
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaataca 39006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 103999 - 103912
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt-agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  103999 atgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtattaagtattaatatacttccagggcat 103912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 1225
Alignment:
Q  167 attttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1306 attttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1369 - 1333
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1369 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2460
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagcccca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  2514 atgcaacttagacctcttatatgcatgttgtaccaatacagagcatcgagcccca 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18388 - 18350
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatac 18350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 786 - 831
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  786 atgcaacttagaactcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 11197 - 11242
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11197 atgcaacgtagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagagcat 11242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8441 - 8340
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  8441 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 8342  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  8341 at 8340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29137 - 29036
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacata-ttagtattaatatactttcagggcat-aaggccccaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||  ||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  29137 atgcaacttagacctcttatatccatgtggtaccaatctagggcatcaagccctcaacgtagtaagtattaatatacttccagggcatcaagcccccaac 29038  T
Q  164 at 165  Q
    ||    
T  29037 at 29036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 10058 - 10103
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10058 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 10103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 77700 - 77659
Alignment:
Q  71 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  77700 aacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 77659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 392
Target Start/End: Original strand, 36263 - 36396
Alignment:
Q  258 aaaacatcttaatcatcgtctca-tatacatccaataatttggagttcaacatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcat 356  Q
    ||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || |  | |  ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  36263 aaaacatcttaatcaacttatcactttacatccaataatttggagttcatcatcagtttattcataaacatgcaacttaattaaataacatttgcagcat 36362  T
Q  357 aatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcatt 392  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||| ||| |||||    
T  36363 aatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcatt 36396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 36086 - 36137
Alignment:
Q  50 actcgacaatgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36086 actcgacaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 36137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 110
Target Start/End: Original strand, 304 - 347
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  304 atgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatccagggc 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 103
Target Start/End: Original strand, 31843 - 31905
Alignment:
Q  41 tcatcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31843 tcatctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttagacctcttatatgcatgtgataccaat 31905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3481
Alignment:
Q  42 catcattgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3420 catctttgactcgacaaatgcgacta-tgcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaat 3481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 12321 - 12366
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12321 atgcaacttaatcctcttatatgcatgtggtaccaatccagggcat 12366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16429 - 16344
Alignment:
Q  69 gcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16429 gcaacttaaacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 16344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3011 - 2966
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3011 atgcaacttatacctcttatatgcatgtggtagcaatccagggcat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 25699 - 25744
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25699 atgcaacctagacctcttatatgcatgtggtaccaatctagggcat 25744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1303 - 1224
Alignment:
Q  169 tttgagcaaatgctccatcatggtgagtacaaagctccatggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatacatggactc 248  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1303 tttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac-aatgaatgctaatgcatggactc 1224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3422
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3458 atgcaactcagacctcttatatgcatgtggtaccaat 3422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8018 - 7982
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8018 atgcaactcagacctcttatatgcatgtggtaccaat 7982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 6360 - 6404
Alignment:
Q  68 tgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  6360 tgcaacttagacctcttatatgcatgtgctaccaatccacggcat 6404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2517
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacatatt--agtattaatatactttcagggcat 152  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  2427 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcatcaagccctcaacgtatttaagtattaatatacttccagggcat 2517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 315
Target Start/End: Original strand, 19484 - 19572
Alignment:
Q  226 aatgtatgctaatacatggactcaatcatcttaaaacatcttaatcatcgtctca-tatacatccaataatttggagttcaacatcatctt 315  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |  |||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19484 aatgaatgctaatgcatggactctatcaac--aaaacatcgtaatcatcatatcaatatgcatccaataatttggagctaaacatcatctt 19572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 112
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1769
Alignment:
Q  73 cttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1730 cttagacctcttatatgcatgtggtaccaatccaaggcat 1769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2161 - 2079
Alignment:
Q  72 acttagacctcttatatgcatgtggtaccaatacagggcat-gagccccaaacat-attagtattaatatactttcagggcat 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  2161 acttaaacctcttatatgcatgtggtacaaatccagggcatcaagccctcaacgtaataagtattaatatacttccagggcat 2079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 108 - 53
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  108 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 9366 - 9421
Alignment:
Q  47 ttgactcgacaa-tgcgacaaatgcaacttagacctcttatatgcatgtggtaccaat 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9366 ttgactcgacaaatgcgacaa-tgcaacttagaca-cttatatgcatgtggtaccaat 9421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Original strand, 26838 - 26887
Alignment:
Q  308 atcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatcgcagcata 357  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26838 atcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcata 26887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6551
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6598 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcat 6551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14052 - 14005
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14052 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 56095 - 56048
Alignment:
Q  67 atgcaacttagacctcttat--atgcatgtggtaccaatacagggcat 112  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  56095 atgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatccagggcat 56048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University