View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18489_high_7 (Length: 555)

Name: NF18489_high_7
Description: NF18489
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18489_high_7
NF18489_high_7
[»] chr3 (248 HSPs)
chr3 (1-546)||(6500836-6501381)
chr3 (1-546)||(6490182-6490727)
chr3 (1-546)||(12249273-12249817)
chr3 (1-546)||(12237447-12237991)
chr3 (1-546)||(9993727-9994271)
chr3 (1-546)||(23635566-23636112)
chr3 (12-546)||(24706387-24706922)
chr3 (1-546)||(9981719-9982263)
chr3 (1-546)||(7804351-7804896)
chr3 (1-546)||(9535466-9536010)
chr3 (1-545)||(29461047-29461591)
chr3 (1-546)||(19887187-19887732)
chr3 (1-545)||(29471899-29472443)
chr3 (1-546)||(7794440-7794985)
chr3 (1-546)||(48337098-48337643)
chr3 (1-546)||(9391035-9391582)
chr3 (2-546)||(17909835-17910379)
chr3 (12-546)||(933495-934029)
chr3 (1-546)||(9380489-9381036)
chr3 (1-546)||(11216554-11217103)
chr3 (1-542)||(37885435-37885976)
chr3 (1-542)||(10626779-10627319)
chr3 (1-542)||(10655101-10655641)
chr3 (1-542)||(4174594-4175135)
chr3 (1-542)||(37866302-37866843)
chr3 (1-542)||(6180365-6180906)
chr3 (1-542)||(6220539-6221080)
chr3 (1-542)||(39672720-39673261)
chr3 (1-546)||(4404129-4404674)
chr3 (1-542)||(5536859-5537399)
chr3 (1-542)||(23767751-23768292)
chr3 (1-542)||(5865531-5866074)
chr3 (1-542)||(5876130-5876673)
chr3 (5-546)||(4456776-4457317)
chr3 (1-542)||(13383101-13383638)
chr3 (1-542)||(5510553-5511093)
chr3 (1-542)||(5520731-5521271)
chr3 (1-542)||(12286816-12287357)
chr3 (1-542)||(19788879-19789420)
chr3 (1-542)||(23757155-23757696)
chr3 (1-546)||(28168939-28169483)
chr3 (1-542)||(13372507-13373044)
chr3 (5-543)||(11163690-11164228)
chr3 (1-542)||(37759526-37760068)
chr3 (1-542)||(526371-526912)
chr3 (1-542)||(5547443-5547983)
chr3 (1-542)||(12296638-12297179)
chr3 (1-542)||(13557431-13557972)
chr3 (1-542)||(19778242-19778783)
chr3 (13-542)||(20720982-20721511)
chr3 (1-542)||(28314069-28314610)
chr3 (1-542)||(41683535-41684076)
chr3 (1-542)||(41694104-41694645)
chr3 (1-542)||(13393695-13394232)
chr3 (1-542)||(504005-504546)
chr3 (1-542)||(4743595-4744135)
chr3 (1-542)||(5579471-5580012)
chr3 (1-542)||(23647606-23648146)
chr3 (1-542)||(28324685-28325226)
chr3 (1-513)||(13121519-13122032)
chr3 (1-513)||(14465448-14465961)
chr3 (1-546)||(38314555-38315101)
chr3 (13-542)||(20673033-20673560)
chr3 (1-542)||(38194581-38195123)
chr3 (1-542)||(38205117-38205659)
chr3 (1-542)||(5627855-5628396)
chr3 (1-542)||(24383356-24383897)
chr3 (1-546)||(1783903-1784449)
chr3 (1-513)||(14476078-14476593)
chr3 (1-542)||(11272220-11272762)
chr3 (1-542)||(18483901-18484443)
chr3 (13-542)||(20683618-20684145)
chr3 (1-542)||(24659757-24660298)
chr3 (1-542)||(8774514-8775056)
chr3 (1-542)||(8785099-8785641)
chr3 (1-542)||(24670337-24670878)
chr3 (1-542)||(35187234-35187775)
chr3 (1-542)||(39382547-39383089)
chr3 (1-542)||(4754182-4754720)
chr3 (1-546)||(1794315-1794862)
chr3 (1-542)||(39371910-39372452)
chr3 (1-541)||(10098925-10099465)
chr3 (1-511)||(13261541-13262050)
chr3 (1-513)||(13131761-13132275)
chr3 (1-546)||(27883239-27883784)
chr3 (1-511)||(8995825-8996335)
chr3 (1-546)||(1063994-1064539)
chr3 (1-510)||(16076785-16077294)
chr3 (1-511)||(9006377-9006887)
chr3 (1-546)||(1053565-1054110)
chr3 (1-511)||(16671031-16671541)
chr3 (1-548)||(8739959-8740504)
chr3 (150-546)||(18851524-18851919)
chr3 (213-546)||(16391447-16391780)
chr3 (1-546)||(17281266-17281813)
chr3 (1-322)||(16385932-16386251)
chr3 (29-546)||(14581023-14581539)
chr3 (1-546)||(2246222-2246767)
chr3 (1-511)||(13199112-13199624)
chr3 (1-543)||(29933401-29933939)
chr3 (1-543)||(29982555-29983093)
chr3 (210-511)||(16665996-16666295)
chr3 (1-546)||(29906020-29906560)
chr3 (1-546)||(29947185-29947725)
chr3 (1-546)||(29996339-29996879)
chr3 (272-511)||(12567138-12567376)
chr3 (209-542)||(16476343-16476676)
chr3 (272-546)||(15216174-15216446)
chr3 (289-546)||(14321514-14321771)
chr3 (345-546)||(16348467-16348669)
chr3 (1-394)||(21735965-21736360)
chr3 (1-394)||(15662690-15663085)
chr3 (1-394)||(15651055-15651450)
chr3 (351-542)||(16493245-16493435)
chr3 (13-394)||(51989128-51989513)
chr3 (13-394)||(31113971-31114354)
chr3 (29-394)||(27172717-27173082)
chr3 (126-394)||(10529132-10529401)
chr3 (1-107)||(14321962-14322069)
chr3 (129-391)||(51340800-51341063)
chr3 (131-394)||(15833197-15833459)
chr3 (131-394)||(15850800-15851065)
chr3 (131-359)||(49990052-49990280)
chr3 (349-542)||(16487098-16487290)
chr3 (131-394)||(13148057-13148321)
chr3 (131-394)||(22151037-22151301)
chr3 (131-394)||(41045534-41045797)
chr3 (130-378)||(45861693-45861942)
chr3 (129-391)||(12752727-12752990)
chr3 (137-378)||(47405542-47405784)
chr3 (288-394)||(17021975-17022082)
chr3 (137-378)||(2560984-2561226)
chr3 (29-181)||(17017687-17017841)
chr3 (137-378)||(28581902-28582144)
chr3 (131-177)||(6253210-6253256)
chr3 (131-177)||(13410370-13410416)
chr3 (131-177)||(14077672-14077718)
chr3 (131-181)||(17006985-17007035)
chr3 (211-336)||(17961419-17961543)
chr3 (211-336)||(18006364-18006488)
chr3 (132-378)||(11909145-11909393)
chr3 (137-378)||(38177764-38178006)
chr3 (137-378)||(49553610-49553852)
chr3 (131-177)||(12396857-12396903)
chr3 (131-177)||(16794604-16794650)
chr3 (131-177)||(27374554-27374600)
chr3 (132-177)||(12968099-12968144)
chr3 (137-178)||(14955224-14955265)
chr3 (137-378)||(20645949-20646192)
chr3 (307-375)||(37412571-37412640)
chr3 (138-178)||(2784862-2784902)
chr3 (131-179)||(8729308-8729356)
chr3 (131-179)||(9081195-9081243)
chr3 (138-178)||(11223361-11223401)
chr3 (137-177)||(12389195-12389235)
chr3 (137-177)||(12726553-12726593)
chr3 (137-177)||(12963408-12963448)
chr3 (137-177)||(13948132-13948172)
chr3 (137-177)||(17239245-17239285)
chr3 (137-177)||(18121935-18121975)
chr3 (137-177)||(19249735-19249775)
chr3 (138-178)||(21636992-21637032)
chr3 (138-178)||(21640664-21640704)
chr3 (137-177)||(37467129-37467169)
chr3 (138-178)||(40850774-40850814)
chr3 (137-177)||(49643085-49643125)
chr3 (138-178)||(49666727-49666767)
chr3 (137-177)||(52920204-52920244)
chr3 (131-170)||(13653718-13653757)
chr3 (131-178)||(21317192-21317239)
chr3 (131-177)||(10851599-10851645)
chr3 (324-378)||(12726351-12726405)
chr3 (131-177)||(16879807-16879853)
chr3 (131-177)||(20418023-20418069)
chr3 (138-378)||(24775655-24775895)
chr3 (138-378)||(33583027-33583267)
chr3 (131-181)||(37412397-37412447)
chr3 (273-378)||(40799807-40799912)
chr3 (324-378)||(47207690-47207744)
chr3 (324-378)||(53056848-53056902)
chr3 (341-378)||(6090733-6090770)
chr3 (341-378)||(11868270-11868307)
chr3 (341-378)||(12388993-12389030)
chr3 (131-176)||(13699157-13699202)
chr3 (341-378)||(16032526-16032563)
chr3 (341-378)||(25398376-25398413)
chr3 (142-178)||(5213378-5213414)
chr3 (1-44)||(11206408-11206452)
chr3 (134-170)||(17697402-17697438)
chr3 (137-177)||(18143067-18143107)
chr3 (137-177)||(20627755-20627795)
chr3 (137-177)||(20724884-20724924)
chr3 (137-173)||(22804349-22804385)
chr3 (136-176)||(25398579-25398619)
chr3 (137-177)||(46350166-46350206)
chr3 (307-378)||(46796488-46796560)
chr3 (138-173)||(16812010-16812045)
chr3 (138-177)||(40799670-40799709)
chr3 (324-378)||(5213562-5213615)
chr3 (131-177)||(16882078-16882124)
chr3 (131-177)||(17762415-17762461)
chr3 (324-378)||(18121743-18121797)
chr3 (324-378)||(18142873-18142927)
chr3 (131-177)||(19063735-19063781)
chr3 (324-378)||(21605775-21605829)
chr3 (140-178)||(21605976-21606014)
chr3 (324-378)||(22140748-22140802)
chr3 (344-378)||(29855413-29855447)
chr3 (131-168)||(7832970-7833007)
chr3 (140-177)||(13823877-13823914)
chr3 (345-378)||(14955432-14955465)
chr3 (136-177)||(16199752-16199793)
chr3 (428-505)||(18006570-18006646)
chr3 (341-378)||(21636791-21636828)
chr3 (140-177)||(26417998-26418035)
chr3 (307-375)||(30054341-30054410)
chr3 (307-378)||(1728136-1728208)
chr3 (137-177)||(14393327-14393367)
chr3 (137-177)||(23538487-23538527)
chr3 (121-177)||(27851324-27851380)
chr3 (137-173)||(29951765-29951801)
chr3 (137-173)||(30000919-30000955)
chr3 (142-178)||(46796689-46796725)
chr3 (137-177)||(47207501-47207541)
chr3 (138-178)||(53057050-53057090)
chr3 (131-178)||(7921030-7921077)
chr3 (138-173)||(11868065-11868100)
chr3 (142-177)||(14969168-14969203)
chr3 (131-166)||(19198213-19198248)
chr3 (134-177)||(19658302-19658345)
chr3 (131-165)||(13954043-13954077)
chr3 (344-378)||(20627552-20627586)
chr3 (147-177)||(31303192-31303222)
chr3 (132-177)||(1464074-1464119)
chr3 (349-378)||(2785073-2785102)
chr3 (345-378)||(11223568-11223601)
chr3 (345-378)||(12968311-12968344)
chr3 (341-378)||(21640868-21640905)
chr3 (138-167)||(29855205-29855234)
chr3 (344-388)||(10851811-10851855)
chr3 (307-378)||(16658739-16658811)
chr3 (137-177)||(16658942-16658982)
chr3 (351-383)||(16880026-16880058)
chr3 (140-176)||(19889267-19889303)
chr3 (307-378)||(49642883-49642955)
chr3 (307-378)||(49666526-49666598)
chr3 (138-178)||(50300030-50300070)
chr3 (307-378)||(52920372-52920444)
[»] chr4 (164 HSPs)
chr4 (1-546)||(5022612-5023156)
chr4 (1-546)||(18077744-18078290)
chr4 (8-546)||(40454187-40454724)
chr4 (8-546)||(40470426-40470963)
chr4 (8-546)||(25657019-25657557)
chr4 (1-513)||(18752362-18752873)
chr4 (1-513)||(18762972-18763483)
chr4 (1-515)||(10909283-10909798)
chr4 (1-542)||(27814788-27815329)
chr4 (1-546)||(4987149-4987694)
chr4 (1-546)||(14835942-14836486)
chr4 (1-542)||(48371007-48371548)
chr4 (1-546)||(3370591-3371135)
chr4 (1-546)||(3390331-3390875)
chr4 (1-542)||(30936915-30937456)
chr4 (1-542)||(4948213-4948752)
chr4 (1-542)||(461033-461574)
chr4 (1-542)||(14843496-14844037)
chr4 (1-542)||(17928576-17929117)
chr4 (1-542)||(24027928-24028469)
chr4 (1-542)||(52703664-52704205)
chr4 (1-515)||(10695516-10696029)
chr4 (5-546)||(16317210-16317751)
chr4 (1-515)||(47151949-47152462)
chr4 (1-542)||(450452-450993)
chr4 (1-542)||(17917928-17918469)
chr4 (13-542)||(30926337-30926866)
chr4 (5-546)||(16304986-16305527)
chr4 (1-542)||(15560922-15561463)
chr4 (13-542)||(16266347-16266879)
chr4 (1-542)||(36018212-36018753)
chr4 (1-542)||(36028765-36029306)
chr4 (3-542)||(19944170-19944709)
chr4 (1-546)||(5873246-5873790)
chr4 (1-542)||(22006887-22007428)
chr4 (1-542)||(55745095-55745636)
chr4 (1-542)||(55755706-55756247)
chr4 (3-542)||(19954805-19955344)
chr4 (1-542)||(27656476-27657018)
chr4 (1-542)||(27667049-27667591)
chr4 (13-542)||(16255754-16256286)
chr4 (1-542)||(21996289-21996830)
chr4 (1-542)||(49518011-49518552)
chr4 (1-542)||(10751011-10751552)
chr4 (1-542)||(10964780-10965321)
chr4 (1-542)||(18130083-18130623)
chr4 (1-515)||(19581116-19581630)
chr4 (1-542)||(10740437-10740978)
chr4 (1-542)||(10954206-10954747)
chr4 (1-542)||(24640124-24640665)
chr4 (9-511)||(24713314-24713816)
chr4 (1-546)||(11535720-11536265)
chr4 (4-546)||(10300413-10300954)
chr4 (1-511)||(11514910-11515420)
chr4 (146-546)||(15207252-15207649)
chr4 (1-511)||(31266672-31267176)
chr4 (1-545)||(49001820-49002365)
chr4 (1-546)||(55651198-55651743)
chr4 (1-394)||(23508991-23509386)
chr4 (1-189)||(29041852-29042040)
chr4 (12-394)||(18774667-18775051)
chr4 (1-394)||(8997268-8997664)
chr4 (131-394)||(18007071-18007334)
chr4 (1-394)||(16819364-16819759)
chr4 (131-394)||(33378197-33378461)
chr4 (13-394)||(14778454-14778837)
chr4 (13-394)||(14710790-14711173)
chr4 (1-124)||(15207647-15207771)
chr4 (13-394)||(17993805-17994187)
chr4 (131-394)||(36210119-36210383)
chr4 (13-334)||(19241912-19242235)
chr4 (137-378)||(14604985-14605224)
chr4 (425-546)||(39526000-39526119)
chr4 (138-378)||(17247035-17247277)
chr4 (131-177)||(10249647-10249693)
chr4 (131-177)||(18773842-18773888)
chr4 (129-178)||(1672171-1672220)
chr4 (129-178)||(1674646-1674695)
chr4 (307-378)||(10692812-10692884)
chr4 (307-378)||(10906578-10906650)
chr4 (137-378)||(6641475-6641717)
chr4 (134-177)||(13027567-13027610)
chr4 (131-177)||(8685721-8685767)
chr4 (131-177)||(10661446-10661492)
chr4 (131-177)||(10875591-10875637)
chr4 (131-177)||(14154275-14154321)
chr4 (137-378)||(37435613-37435856)
chr4 (137-177)||(3395380-3395420)
chr4 (307-378)||(9751618-9751690)
chr4 (137-177)||(10072725-10072765)
chr4 (131-179)||(13890615-13890663)
chr4 (137-177)||(15014667-15014707)
chr4 (137-177)||(22675801-22675841)
chr4 (138-178)||(40860459-40860499)
chr4 (138-178)||(54679720-54679760)
chr4 (137-177)||(55380081-55380121)
chr4 (137-177)||(56034363-56034403)
chr4 (139-178)||(25651376-25651415)
chr4 (324-378)||(1672368-1672422)
chr4 (324-378)||(1674843-1674897)
chr4 (324-378)||(16853482-16853536)
chr4 (138-176)||(16939808-16939846)
chr4 (138-378)||(17398752-17398993)
chr4 (137-210)||(17540190-17540263)
chr4 (131-177)||(20571279-20571325)
chr4 (349-394)||(19244002-19244047)
chr4 (137-378)||(19884493-19884735)
chr4 (341-378)||(29121366-29121403)
chr4 (307-378)||(6517446-6517518)
chr4 (138-178)||(8105430-8105470)
chr4 (138-174)||(11900982-11901018)
chr4 (137-177)||(11915492-11915532)
chr4 (137-177)||(12600548-12600588)
chr4 (137-177)||(16632231-16632271)
chr4 (138-178)||(16853295-16853335)
chr4 (137-177)||(19621341-19621381)
chr4 (138-178)||(22190638-22190678)
chr4 (307-378)||(22190807-22190879)
chr4 (138-178)||(29121161-29121201)
chr4 (137-177)||(37985892-37985932)
chr4 (138-178)||(55731637-55731677)
chr4 (138-178)||(56533340-56533380)
chr4 (134-177)||(14357411-14357454)
chr4 (308-378)||(16939978-16940049)
chr4 (134-177)||(17526668-17526711)
chr4 (138-177)||(40845885-40845924)
chr4 (134-177)||(41115048-41115091)
chr4 (138-177)||(45833186-45833225)
chr4 (131-177)||(16324796-16324842)
chr4 (307-372)||(16848508-16848574)
chr4 (131-177)||(17057396-17057442)
chr4 (131-173)||(19889278-19889320)
chr4 (131-177)||(23087470-23087516)
chr4 (139-177)||(23750315-23750353)
chr4 (131-177)||(24619431-24619477)
chr4 (344-378)||(54679929-54679963)
chr4 (131-176)||(2651596-2651641)
chr4 (341-378)||(3105497-3105534)
chr4 (131-180)||(18473811-18473860)
chr4 (345-378)||(25651182-25651215)
chr4 (137-174)||(36470610-36470647)
chr4 (138-178)||(3105698-3105738)
chr4 (137-177)||(3483521-3483561)
chr4 (138-178)||(6517277-6517317)
chr4 (307-378)||(20977418-20977490)
chr4 (307-378)||(39419812-39419884)
chr4 (341-376)||(40860663-40860698)
chr4 (137-172)||(44397642-44397677)
chr4 (345-383)||(10661240-10661278)
chr4 (345-383)||(10875385-10875423)
chr4 (139-177)||(17788323-17788361)
chr4 (135-177)||(18394324-18394366)
chr4 (341-378)||(10072931-10072968)
chr4 (140-177)||(19912160-19912197)
chr4 (341-378)||(38513874-38513911)
chr4 (345-378)||(45833394-45833427)
chr4 (345-378)||(56533140-56533173)
chr4 (137-173)||(412792-412828)
chr4 (307-378)||(3395551-3395623)
chr4 (137-177)||(12811455-12811495)
chr4 (307-378)||(13576192-13576264)
chr4 (137-177)||(13576395-13576435)
chr4 (138-178)||(16848339-16848379)
chr4 (346-378)||(19911959-19911991)
[»] chr6 (189 HSPs)
chr6 (1-546)||(26044019-26044565)
chr6 (1-546)||(25787508-25788053)
chr6 (1-546)||(12827499-12828045)
chr6 (1-546)||(7375602-7376147)
chr6 (1-546)||(11147093-11147639)
chr6 (1-546)||(20029748-20030293)
chr6 (1-546)||(20062499-20063044)
chr6 (1-542)||(27372639-27373181)
chr6 (1-542)||(27462989-27463531)
chr6 (1-542)||(27505749-27506291)
chr6 (1-542)||(25985889-25986429)
chr6 (1-542)||(28251414-28251952)
chr6 (1-542)||(28356561-28357099)
chr6 (1-542)||(9122980-9123521)
chr6 (1-542)||(9112343-9112884)
chr6 (1-513)||(7751112-7751624)
chr6 (1-542)||(31542746-31543285)
chr6 (1-542)||(3671854-3672394)
chr6 (1-542)||(3661190-3661730)
chr6 (1-542)||(12854828-12855369)
chr6 (1-542)||(12865354-12865895)
chr6 (1-542)||(17984558-17985099)
chr6 (1-542)||(29384559-29385099)
chr6 (3-542)||(33199137-33199675)
chr6 (1-546)||(18925606-18926153)
chr6 (1-542)||(26035840-26036381)
chr6 (1-542)||(31982474-31983015)
chr6 (1-542)||(34807008-34807549)
chr6 (1-542)||(34817640-34818181)
chr6 (1-542)||(26025266-26025807)
chr6 (1-542)||(27341501-27342042)
chr6 (1-542)||(27402241-27402782)
chr6 (1-542)||(27412900-27413441)
chr6 (13-542)||(26864605-26865136)
chr6 (13-542)||(26875229-26875760)
chr6 (1-542)||(32961777-32962323)
chr6 (1-513)||(27474653-27475165)
chr6 (1-513)||(27504152-27504664)
chr6 (1-513)||(32972424-32972942)
chr6 (28-515)||(8653496-8653981)
chr6 (4-542)||(16930261-16930798)
chr6 (1-513)||(27384240-27384752)
chr6 (4-542)||(16959432-16959969)
chr6 (1-540)||(12716684-12717225)
chr6 (1-540)||(12727333-12727874)
chr6 (1-498)||(32300934-32301432)
chr6 (1-498)||(32311623-32312121)
chr6 (1-473)||(17982417-17982890)
chr6 (1-498)||(4630678-4631178)
chr6 (1-546)||(16123380-16123923)
chr6 (1-544)||(29765342-29765884)
chr6 (1-546)||(31572221-31572765)
chr6 (1-546)||(4292532-4293077)
chr6 (1-546)||(18826083-18826628)
chr6 (1-546)||(5844893-5845453)
chr6 (1-546)||(18834479-18835023)
chr6 (1-546)||(27166288-27166832)
chr6 (4-541)||(22308598-22309136)
chr6 (1-511)||(17745644-17746173)
chr6 (149-546)||(13913006-13913401)
chr6 (1-546)||(9933516-9934062)
chr6 (1-546)||(25518494-25519039)
chr6 (1-546)||(17741548-17742093)
chr6 (29-466)||(17064030-17064467)
chr6 (303-546)||(6158316-6158559)
chr6 (1-301)||(26022882-26023184)
chr6 (1-511)||(25735438-25735947)
chr6 (9-546)||(25686593-25687131)
chr6 (162-466)||(17042590-17042894)
chr6 (1-546)||(25679044-25679590)
chr6 (1-228)||(12353362-12353590)
chr6 (1-394)||(12953126-12953521)
chr6 (1-394)||(31931228-31931623)
chr6 (1-394)||(18555075-18555470)
chr6 (1-394)||(19289376-19289771)
chr6 (1-394)||(11205751-11206146)
chr6 (1-394)||(11235304-11235699)
chr6 (233-546)||(25675201-25675514)
chr6 (347-546)||(13928341-13928540)
chr6 (288-546)||(25722801-25723059)
chr6 (13-394)||(21127899-21128281)
chr6 (130-394)||(18498557-18498820)
chr6 (428-546)||(32761776-32761894)
chr6 (131-394)||(20635511-20635775)
chr6 (13-394)||(7586252-7586637)
chr6 (131-394)||(17608401-17608663)
chr6 (434-546)||(9468-9580)
chr6 (131-394)||(22386594-22386858)
chr6 (137-378)||(29917814-29918056)
chr6 (29-394)||(17047390-17047755)
chr6 (425-546)||(16123059-16123180)
chr6 (136-374)||(14051495-14051731)
chr6 (442-546)||(17577640-17577744)
chr6 (136-374)||(14070176-14070412)
chr6 (137-378)||(9717640-9717882)
chr6 (137-378)||(32544062-32544304)
chr6 (9-65)||(32757214-32757271)
chr6 (131-177)||(12347880-12347926)
chr6 (137-378)||(15954503-15954742)
chr6 (131-180)||(31127623-31127672)
chr6 (138-378)||(21618041-21618283)
chr6 (131-177)||(17927581-17927627)
chr6 (131-177)||(18172345-18172391)
chr6 (326-378)||(12348980-12349032)
chr6 (137-177)||(15531936-15531976)
chr6 (138-178)||(19066329-19066369)
chr6 (137-177)||(19623776-19623816)
chr6 (138-178)||(19833343-19833383)
chr6 (137-177)||(20731016-20731056)
chr6 (137-177)||(21624898-21624938)
chr6 (137-378)||(15301997-15302239)
chr6 (138-177)||(20113012-20113051)
chr6 (131-170)||(25592409-25592448)
chr6 (131-177)||(10704849-10704895)
chr6 (345-383)||(19625814-19625852)
chr6 (133-179)||(23230980-23231026)
chr6 (131-177)||(24719054-24719100)
chr6 (137-178)||(16335923-16335964)
chr6 (136-177)||(19470463-19470504)
chr6 (307-378)||(16877180-16877252)
chr6 (137-177)||(19688576-19688616)
chr6 (307-378)||(22076517-22076589)
chr6 (307-378)||(22802108-22802180)
chr6 (131-210)||(23296516-23296596)
chr6 (137-177)||(25593865-25593905)
chr6 (138-178)||(33352237-33352277)
chr6 (126-177)||(15478099-15478150)
chr6 (137-176)||(15987030-15987069)
chr6 (273-378)||(21235058-21235164)
chr6 (137-172)||(26943383-26943418)
chr6 (131-205)||(32335621-32335696)
chr6 (324-378)||(12423246-12423300)
chr6 (131-177)||(15551776-15551822)
chr6 (131-177)||(17445969-17446014)
chr6 (305-378)||(19482717-19482791)
chr6 (273-378)||(20488028-20488133)
chr6 (273-378)||(20730814-20730919)
chr6 (324-378)||(21625086-21625140)
chr6 (131-177)||(23006360-23006406)
chr6 (131-177)||(23781960-23782006)
chr6 (131-177)||(24728858-24728904)
chr6 (345-378)||(14100550-14100583)
chr6 (341-378)||(19066128-19066165)
chr6 (341-378)||(26943578-26943615)
chr6 (307-378)||(10640529-10640600)
chr6 (307-378)||(13435499-13435571)
chr6 (137-177)||(14100750-14100790)
chr6 (307-374)||(15531738-15531806)
chr6 (137-173)||(16265466-16265502)
chr6 (307-378)||(16336094-16336166)
chr6 (137-177)||(16915221-16915261)
chr6 (138-178)||(17381320-17381360)
chr6 (307-378)||(17381488-17381560)
chr6 (307-378)||(18435523-18435595)
chr6 (141-177)||(19625609-19625645)
chr6 (138-178)||(22076718-22076758)
chr6 (137-177)||(22801937-22801977)
chr6 (137-177)||(24116625-24116665)
chr6 (137-177)||(26972538-26972578)
chr6 (138-177)||(12423059-12423098)
chr6 (131-170)||(13144795-13144834)
chr6 (131-181)||(19452827-19452878)
chr6 (131-178)||(24398563-24398610)
chr6 (131-177)||(7811803-7811849)
chr6 (324-378)||(16265260-16265314)
chr6 (138-168)||(16876701-16876731)
chr6 (345-383)||(25592623-25592661)
chr6 (132-170)||(25930267-25930305)
chr6 (324-378)||(26589584-26589638)
chr6 (324-378)||(26972336-26972390)
chr6 (324-378)||(33352036-33352090)
chr6 (345-382)||(7812016-7812053)
chr6 (132-173)||(15541787-15541828)
chr6 (131-172)||(18027042-18027083)
chr6 (351-388)||(18172134-18172171)
chr6 (306-378)||(19623945-19624018)
chr6 (345-378)||(19833143-19833176)
chr6 (131-176)||(19875625-19875670)
chr6 (140-177)||(19951883-19951920)
chr6 (140-177)||(20890835-20890872)
chr6 (131-180)||(26185503-26185552)
chr6 (345-381)||(12348099-12348135)
chr6 (13-64)||(14070501-14070553)
chr6 (307-378)||(15987200-15987272)
chr6 (307-378)||(17316635-17316707)
chr6 (137-177)||(19085955-19085995)
chr6 (307-378)||(19086125-19086197)
chr6 (351-383)||(19875844-19875876)
chr6 (137-177)||(21234920-21234960)
[»] chr5 (202 HSPs)
chr5 (1-546)||(10754447-10754990)
chr5 (1-546)||(34782809-34783353)
chr5 (1-546)||(34771864-34772408)
chr5 (1-546)||(20797648-20798194)
chr5 (1-546)||(42394933-42395477)
chr5 (1-546)||(43043433-43043979)
chr5 (1-542)||(30069666-30070209)
chr5 (1-546)||(8521794-8522339)
chr5 (1-545)||(1108906-1109452)
chr5 (1-546)||(31448505-31449052)
chr5 (1-545)||(1121664-1122210)
chr5 (1-546)||(36084414-36084959)
chr5 (1-546)||(31418614-31419161)
chr5 (1-546)||(24925901-24926447)
chr5 (1-546)||(24983182-24983728)
chr5 (1-546)||(23406399-23406944)
chr5 (1-546)||(36228692-36229237)
chr5 (1-546)||(19477954-19478499)
chr5 (12-546)||(20551768-20552302)
chr5 (1-546)||(19463924-19464469)
chr5 (1-542)||(5290338-5290879)
chr5 (1-542)||(22559394-22559935)
chr5 (1-542)||(27622529-27623070)
chr5 (1-515)||(21702891-21703405)
chr5 (1-513)||(27603180-27603693)
chr5 (1-515)||(21705738-21706252)
chr5 (1-542)||(5300909-5301455)
chr5 (1-546)||(17446458-17447003)
chr5 (1-546)||(17457074-17457619)
chr5 (1-546)||(20562293-20562823)
chr5 (13-542)||(22146478-22147009)
chr5 (13-542)||(22157061-22157592)
chr5 (1-513)||(6130774-6131289)
chr5 (1-542)||(9335913-9336453)
chr5 (1-542)||(9346500-9347040)
chr5 (1-542)||(16003653-16004194)
chr5 (1-542)||(23306802-23307343)
chr5 (1-546)||(34062572-34063119)
chr5 (1-513)||(39352473-39352986)
chr5 (1-513)||(40401004-40401517)
chr5 (1-542)||(14557779-14558320)
chr5 (1-542)||(14568416-14568957)
chr5 (1-542)||(23296234-23296775)
chr5 (1-542)||(23707400-23707940)
chr5 (1-542)||(40390314-40390855)
chr5 (1-542)||(31843916-31844459)
chr5 (1-542)||(9377224-9377765)
chr5 (1-542)||(24816648-24817189)
chr5 (1-542)||(24827236-24827777)
chr5 (1-542)||(39490712-39491253)
chr5 (1-542)||(39501902-39502443)
chr5 (1-542)||(23362067-23362609)
chr5 (1-542)||(6975765-6976306)
chr5 (1-542)||(7031888-7032431)
chr5 (1-542)||(15993091-15993632)
chr5 (1-542)||(27203750-27204290)
chr5 (1-546)||(34051911-34052458)
chr5 (1-542)||(42042742-42043282)
chr5 (1-542)||(42053317-42053857)
chr5 (1-542)||(33951562-33952104)
chr5 (1-542)||(35226046-35226588)
chr5 (1-542)||(40513751-40514293)
chr5 (1-542)||(6986255-6986796)
chr5 (1-542)||(14030001-14030542)
chr5 (1-542)||(14040554-14041095)
chr5 (1-542)||(15693794-15694334)
chr5 (1-542)||(24567047-24567587)
chr5 (1-542)||(14446763-14447303)
chr5 (1-542)||(14457375-14457915)
chr5 (4-542)||(24807870-24808407)
chr5 (1-542)||(35215462-35216004)
chr5 (1-542)||(22676073-22676614)
chr5 (1-542)||(22685964-22686505)
chr5 (1-542)||(27460118-27460659)
chr5 (1-542)||(27470517-27471058)
chr5 (1-542)||(36582320-36582861)
chr5 (1-542)||(36592875-36593416)
chr5 (1-542)||(30227258-30227800)
chr5 (1-542)||(30237785-30238327)
chr5 (1-542)||(15739924-15740466)
chr5 (1-542)||(15769084-15769626)
chr5 (1-542)||(27041974-27042515)
chr5 (1-542)||(27052598-27053140)
chr5 (1-542)||(17607020-17607557)
chr5 (1-498)||(36687696-36688192)
chr5 (1-498)||(36698262-36698758)
chr5 (1-542)||(31348494-31349031)
chr5 (1-542)||(31359108-31359645)
chr5 (1-542)||(17617634-17618172)
chr5 (2-542)||(17718875-17719414)
chr5 (2-542)||(17729527-17730066)
chr5 (9-548)||(37406606-37407137)
chr5 (1-474)||(37729014-37729488)
chr5 (1-474)||(37740330-37740804)
chr5 (1-511)||(106107-106618)
chr5 (1-546)||(20624718-20625264)
chr5 (233-546)||(43621855-43622168)
chr5 (1-336)||(31833644-31833981)
chr5 (1-546)||(20416856-20417402)
chr5 (1-295)||(39364685-39364979)
chr5 (1-461)||(32753707-32754167)
chr5 (1-294)||(23696988-23697282)
chr5 (236-546)||(21414197-21414505)
chr5 (165-542)||(23372468-23372848)
chr5 (313-546)||(23392669-23392901)
chr5 (1-394)||(35543231-35543626)
chr5 (1-394)||(13522845-13523240)
chr5 (1-394)||(13533572-13533967)
chr5 (1-394)||(20168169-20168564)
chr5 (303-542)||(39362271-39362510)
chr5 (1-394)||(36095755-36096149)
chr5 (1-394)||(36097212-36097606)
chr5 (1-197)||(43621656-43621853)
chr5 (345-542)||(31815120-31815316)
chr5 (131-394)||(23478157-23478421)
chr5 (131-394)||(1915206-1915469)
chr5 (29-394)||(13404802-13405167)
chr5 (29-394)||(40228343-40228710)
chr5 (131-394)||(20215201-20215465)
chr5 (129-378)||(11208087-11208336)
chr5 (131-394)||(40032855-40033115)
chr5 (131-391)||(25111966-25112227)
chr5 (131-391)||(25171057-25171318)
chr5 (120-378)||(32160543-32160801)
chr5 (138-378)||(28464441-28464681)
chr5 (137-378)||(89524-89766)
chr5 (138-378)||(10848567-10848808)
chr5 (131-180)||(22586298-22586347)
chr5 (131-312)||(23488303-23488483)
chr5 (131-179)||(39799178-39799226)
chr5 (137-378)||(7745795-7746037)
chr5 (459-546)||(21520012-21520099)
chr5 (131-205)||(26120103-26120178)
chr5 (137-178)||(15516762-15516803)
chr5 (136-177)||(25097131-25097172)
chr5 (136-177)||(25155101-25155142)
chr5 (138-178)||(3245744-3245784)
chr5 (307-378)||(4886985-4887057)
chr5 (137-177)||(13736437-13736477)
chr5 (137-378)||(20550687-20550930)
chr5 (137-177)||(21100008-21100048)
chr5 (137-177)||(21199306-21199346)
chr5 (137-177)||(23413279-23413319)
chr5 (138-178)||(25930458-25930498)
chr5 (138-178)||(28139401-28139441)
chr5 (138-178)||(31145938-31145978)
chr5 (307-378)||(33933230-33933302)
chr5 (138-177)||(6499033-6499072)
chr5 (138-177)||(25740917-25740956)
chr5 (131-178)||(31589302-31589349)
chr5 (137-175)||(19536604-19536642)
chr5 (138-378)||(30742775-30743015)
chr5 (137-378)||(33022460-33022699)
chr5 (131-180)||(24019403-24019452)
chr5 (137-177)||(643006-643046)
chr5 (138-178)||(11993682-11993722)
chr5 (307-378)||(11993851-11993923)
chr5 (137-177)||(22000361-22000401)
chr5 (137-177)||(23880860-23880900)
chr5 (307-378)||(28139570-28139642)
chr5 (138-178)||(29138709-29138749)
chr5 (142-178)||(35932309-35932345)
chr5 (131-166)||(2156591-2156626)
chr5 (138-173)||(12353103-12353138)
chr5 (138-177)||(13545816-13545855)
chr5 (133-180)||(17263030-17263077)
chr5 (138-177)||(31488042-31488081)
chr5 (324-378)||(3245543-3245597)
chr5 (324-378)||(9088950-9089004)
chr5 (324-378)||(14086641-14086695)
chr5 (131-177)||(20567599-20567645)
chr5 (131-165)||(34638242-34638276)
chr5 (137-178)||(4886815-4886856)
chr5 (345-378)||(15516971-15517004)
chr5 (137-177)||(21072541-21072582)
chr5 (307-375)||(30115942-30116011)
chr5 (341-378)||(35932108-35932145)
chr5 (345-378)||(42243682-42243715)
chr5 (142-178)||(9088767-9088803)
chr5 (138-178)||(14086841-14086881)
chr5 (137-177)||(21203949-21203989)
chr5 (131-175)||(23589500-23589544)
chr5 (307-378)||(25096928-25096999)
chr5 (307-378)||(25154898-25154969)
chr5 (137-177)||(26784146-26784186)
chr5 (137-177)||(31117670-31117710)
chr5 (138-178)||(33933062-33933102)
chr5 (138-178)||(42243475-42243515)
chr5 (324-378)||(13545614-13545668)
chr5 (349-383)||(16607518-16607552)
chr5 (138-378)||(26758943-26759184)
chr5 (138-378)||(26765292-26765533)
chr5 (324-378)||(29138508-29138562)
chr5 (324-378)||(31117858-31117912)
chr5 (341-378)||(21099806-21099843)
chr5 (351-388)||(26119922-26119959)
chr5 (137-178)||(30116140-30116180)
chr5 (140-177)||(34637356-34637393)
chr5 (307-378)||(23413076-23413148)
chr5 (342-378)||(26784353-26784389)
chr5 (307-378)||(35986334-35986406)
chr5 (138-178)||(35986534-35986574)
[»] chr7 (189 HSPs)
chr7 (1-546)||(15888242-15888787)
chr7 (1-546)||(14745582-14746128)
chr7 (1-546)||(1367471-1368016)
chr7 (1-545)||(44280336-44280882)
chr7 (1-545)||(3165576-3166120)
chr7 (1-545)||(20490848-20491392)
chr7 (1-546)||(589054-589599)
chr7 (1-546)||(31116424-31116969)
chr7 (1-546)||(21769856-21770401)
chr7 (12-546)||(9170038-9170571)
chr7 (12-546)||(9159583-9160116)
chr7 (35-546)||(9170863-9171372)
chr7 (1-512)||(5685360-5685872)
chr7 (1-542)||(9433105-9433646)
chr7 (1-542)||(20989494-20990035)
chr7 (1-542)||(9443701-9444242)
chr7 (1-542)||(21002926-21003467)
chr7 (1-542)||(24930521-24931062)
chr7 (1-542)||(467499-468040)
chr7 (1-542)||(540926-541467)
chr7 (1-542)||(6867143-6867684)
chr7 (1-542)||(6877775-6878316)
chr7 (1-542)||(37344041-37344582)
chr7 (1-542)||(11095895-11096437)
chr7 (1-542)||(454717-455258)
chr7 (1-542)||(26699572-26700113)
chr7 (4-542)||(9085128-9085665)
chr7 (4-542)||(9094842-9095379)
chr7 (1-542)||(8617227-8617768)
chr7 (1-542)||(26653243-26653784)
chr7 (1-542)||(40042027-40042567)
chr7 (1-542)||(40052576-40053116)
chr7 (1-542)||(48710409-48710950)
chr7 (13-542)||(4222461-4222992)
chr7 (1-542)||(8627790-8628331)
chr7 (1-542)||(11005026-11005567)
chr7 (13-542)||(4211862-4212393)
chr7 (1-513)||(17950064-17950577)
chr7 (1-513)||(17960670-17961183)
chr7 (1-546)||(40054666-40055211)
chr7 (1-542)||(22088964-22089505)
chr7 (1-542)||(22099579-22100120)
chr7 (1-542)||(1987381-1987923)
chr7 (1-542)||(1998002-1998544)
chr7 (1-546)||(30049361-30049906)
chr7 (13-542)||(2705530-2706059)
chr7 (13-542)||(2716134-2716663)
chr7 (1-542)||(8001982-8002524)
chr7 (1-542)||(8012627-8013169)
chr7 (1-542)||(24734594-24735135)
chr7 (1-542)||(24744541-24745082)
chr7 (1-542)||(26390014-26390555)
chr7 (1-542)||(26400656-26401197)
chr7 (1-542)||(42865668-42866210)
chr7 (1-542)||(42876294-42876836)
chr7 (1-546)||(18441036-18441582)
chr7 (1-546)||(18418955-18419501)
chr7 (1-513)||(166736-167236)
chr7 (1-513)||(177328-177828)
chr7 (1-424)||(26294064-26294488)
chr7 (1-546)||(3476255-3476800)
chr7 (1-546)||(26209463-26210008)
chr7 (214-542)||(19985729-19986058)
chr7 (2-546)||(29589834-29590378)
chr7 (1-546)||(13682160-13682706)
chr7 (1-546)||(15216157-15216702)
chr7 (1-336)||(38403331-38403670)
chr7 (1-511)||(12734116-12734624)
chr7 (272-546)||(38593648-38593921)
chr7 (1-394)||(24882485-24882880)
chr7 (272-546)||(8933634-8933906)
chr7 (316-546)||(6044125-6044354)
chr7 (1-228)||(38593943-38594170)
chr7 (1-265)||(48382028-48382297)
chr7 (1-226)||(8933404-8933631)
chr7 (318-546)||(48382304-48382532)
chr7 (29-392)||(11087110-11087475)
chr7 (13-394)||(8998998-8999384)
chr7 (131-394)||(13174668-13174932)
chr7 (133-374)||(602553-602796)
chr7 (432-513)||(26290297-26290378)
chr7 (137-378)||(23280081-23280324)
chr7 (137-378)||(21283496-21283738)
chr7 (137-378)||(33691835-33692077)
chr7 (131-375)||(4412088-4412334)
chr7 (137-378)||(24787935-24788176)
chr7 (307-378)||(44467027-44467099)
chr7 (131-177)||(7488229-7488275)
chr7 (499-545)||(9261677-9261723)
chr7 (131-177)||(16308041-16308087)
chr7 (324-378)||(28409020-28409074)
chr7 (138-179)||(2265841-2265882)
chr7 (138-178)||(1292824-1292864)
chr7 (138-178)||(2266647-2266687)
chr7 (137-177)||(9098559-9098599)
chr7 (137-177)||(9099365-9099405)
chr7 (137-177)||(11319198-11319238)
chr7 (137-177)||(11792700-11792740)
chr7 (138-178)||(12174664-12174704)
chr7 (137-177)||(13260940-13260980)
chr7 (138-178)||(14425241-14425281)
chr7 (138-378)||(16112007-16112249)
chr7 (138-178)||(19339572-19339612)
chr7 (138-178)||(27871511-27871551)
chr7 (307-378)||(30944446-30944518)
chr7 (138-378)||(30945479-30945721)
chr7 (138-178)||(32265043-32265083)
chr7 (307-378)||(35952811-35952883)
chr7 (137-176)||(5001151-5001190)
chr7 (138-177)||(13472833-13472872)
chr7 (138-177)||(48237230-48237269)
chr7 (324-378)||(4821455-4821509)
chr7 (131-177)||(10254654-10254700)
chr7 (324-378)||(14426528-14426582)
chr7 (324-378)||(27871699-27871753)
chr7 (138-376)||(28622481-28622721)
chr7 (273-378)||(48237025-48237130)
chr7 (341-378)||(22578144-22578181)
chr7 (307-378)||(1292993-1293065)
chr7 (137-173)||(2499830-2499866)
chr7 (137-177)||(4494370-4494410)
chr7 (137-173)||(9069355-9069391)
chr7 (137-177)||(13683388-13683428)
chr7 (137-177)||(15467710-15467750)
chr7 (138-178)||(15704813-15704853)
chr7 (137-177)||(16314865-16314905)
chr7 (137-177)||(16316882-16316922)
chr7 (307-378)||(19711136-19711208)
chr7 (138-178)||(21381752-21381792)
chr7 (137-177)||(21692081-21692121)
chr7 (137-173)||(28408832-28408868)
chr7 (137-177)||(30025698-30025738)
chr7 (137-177)||(33605478-33605518)
chr7 (307-378)||(39284687-39284759)
chr7 (138-178)||(48063144-48063184)
chr7 (126-173)||(11015738-11015785)
chr7 (137-172)||(13034169-13034204)
chr7 (138-177)||(14426341-14426380)
chr7 (131-166)||(16105306-16105341)
chr7 (131-177)||(2501363-2501409)
chr7 (324-378)||(8182911-8182965)
chr7 (324-378)||(9069543-9069597)
chr7 (131-177)||(13172679-13172725)
chr7 (138-176)||(16556915-16556953)
chr7 (138-176)||(16608709-16608747)
chr7 (131-177)||(18056577-18056623)
chr7 (137-175)||(19237363-19237401)
chr7 (140-173)||(13018834-13018867)
chr7 (341-378)||(14193112-14193149)
chr7 (341-378)||(14425445-14425482)
chr7 (136-177)||(16310232-16310273)
chr7 (341-378)||(19237166-19237203)
chr7 (341-378)||(24794838-24794875)
chr7 (140-173)||(29935675-29935708)
chr7 (307-378)||(2265642-2265713)
chr7 (307-378)||(4494540-4494612)
chr7 (138-178)||(8182724-8182764)
chr7 (137-177)||(10883498-10883538)
chr7 (137-177)||(12367073-12367113)
chr7 (137-177)||(14187484-14187524)
chr7 (137-177)||(15088342-15088382)
chr7 (137-177)||(22579542-22579582)
chr7 (138-178)||(35953011-35953051)
chr7 (137-177)||(39284889-39284929)
chr7 (345-376)||(13894123-13894154)
chr7 (126-177)||(16412518-16412569)
chr7 (137-180)||(18361894-18361937)
chr7 (142-177)||(41842598-41842633)
chr7 (131-177)||(1878570-1878616)
chr7 (324-378)||(5000945-5000999)
chr7 (345-383)||(7488023-7488061)
chr7 (131-177)||(11572526-11572572)
chr7 (134-176)||(16411783-16411825)
chr7 (453-511)||(22494111-22494169)
chr7 (324-378)||(48806002-48806056)
chr7 (325-378)||(11319387-11319440)
chr7 (351-388)||(13172465-13172502)
chr7 (349-378)||(19339373-19339402)
chr7 (341-378)||(21692285-21692322)
chr7 (324-377)||(32264842-32264895)
chr7 (341-378)||(33605683-33605720)
chr7 (307-378)||(331608-331680)
chr7 (131-179)||(5035172-5035220)
chr7 (307-378)||(9709925-9709997)
chr7 (137-177)||(9710128-9710168)
chr7 (273-376)||(15467846-15467949)
chr7 (138-170)||(30944656-30944688)
chr7 (307-378)||(41842396-41842468)
chr7 (137-177)||(44466856-44466896)
[»] chr8 (157 HSPs)
chr8 (1-546)||(19224802-19225347)
chr8 (1-546)||(30314563-30315108)
chr8 (1-545)||(20161097-20161643)
chr8 (1-545)||(20195824-20196370)
chr8 (1-546)||(23469326-23469873)
chr8 (1-542)||(6318388-6318928)
chr8 (1-546)||(19428795-19429342)
chr8 (1-546)||(31214880-31215428)
chr8 (1-546)||(19418220-19418765)
chr8 (1-546)||(16746868-16747414)
chr8 (1-542)||(3220500-3221041)
chr8 (1-515)||(18158124-18158637)
chr8 (1-515)||(18153605-18154117)
chr8 (1-542)||(19139148-19139689)
chr8 (1-546)||(18769004-18769549)
chr8 (1-513)||(19128616-19129129)
chr8 (1-542)||(36292789-36293328)
chr8 (1-542)||(36303392-36303931)
chr8 (1-542)||(36077805-36078345)
chr8 (1-542)||(36088391-36088931)
chr8 (1-542)||(29076599-29077139)
chr8 (1-542)||(32088141-32088681)
chr8 (1-542)||(32077568-32078108)
chr8 (1-542)||(210025-210565)
chr8 (1-542)||(252277-252817)
chr8 (1-542)||(723648-724188)
chr8 (1-542)||(848839-849379)
chr8 (13-542)||(6150948-6151480)
chr8 (1-542)||(15791170-15791711)
chr8 (1-542)||(18449238-18449779)
chr8 (13-542)||(6160903-6161434)
chr8 (1-542)||(26111099-26111641)
chr8 (1-542)||(26120777-26121319)
chr8 (1-542)||(9341012-9341553)
chr8 (1-542)||(9368156-9368697)
chr8 (1-542)||(9856343-9856884)
chr8 (1-542)||(13688438-13688980)
chr8 (1-542)||(3348498-3349039)
chr8 (1-542)||(3359095-3359636)
chr8 (1-542)||(15780581-15781122)
chr8 (1-542)||(29086850-29087390)
chr8 (1-542)||(241692-242232)
chr8 (1-542)||(43248193-43248726)
chr8 (10-546)||(40213036-40213572)
chr8 (1-464)||(44480959-44481423)
chr8 (1-464)||(44491575-44492039)
chr8 (186-546)||(23457170-23457530)
chr8 (1-546)||(3843389-3843934)
chr8 (233-510)||(1750194-1750471)
chr8 (1-336)||(795047-795381)
chr8 (1-546)||(20259486-20260031)
chr8 (1-546)||(21046116-21046661)
chr8 (191-438)||(30325227-30325473)
chr8 (1-546)||(23370420-23370960)
chr8 (1-394)||(7018400-7018794)
chr8 (233-542)||(6576391-6576700)
chr8 (1-394)||(22135877-22136271)
chr8 (1-394)||(22167042-22167436)
chr8 (1-394)||(22211407-22211803)
chr8 (421-546)||(28691189-28691314)
chr8 (1-394)||(23271223-23271621)
chr8 (131-394)||(8031817-8032081)
chr8 (131-394)||(28903244-28903507)
chr8 (131-394)||(40003013-40003277)
chr8 (131-394)||(17519161-17519425)
chr8 (125-391)||(21540730-21540997)
chr8 (129-378)||(45568021-45568270)
chr8 (475-546)||(30325160-30325231)
chr8 (1-205)||(19460835-19461045)
chr8 (1-205)||(19558513-19558723)
chr8 (131-394)||(29379363-29379626)
chr8 (138-378)||(15425273-15425515)
chr8 (273-459)||(19461090-19461274)
chr8 (273-459)||(19558768-19558952)
chr8 (138-378)||(15336208-15336450)
chr8 (138-378)||(15516577-15516819)
chr8 (137-378)||(30421549-30421792)
chr8 (446-542)||(16436931-16437026)
chr8 (144-378)||(21932679-21932914)
chr8 (131-178)||(12193697-12193744)
chr8 (131-178)||(12438125-12438172)
chr8 (137-378)||(19943024-19943266)
chr8 (131-177)||(17917141-17917187)
chr8 (137-369)||(18121235-18121468)
chr8 (131-177)||(18557805-18557851)
chr8 (132-177)||(17267258-17267303)
chr8 (132-177)||(18321481-18321526)
chr8 (138-178)||(1744947-1744987)
chr8 (138-178)||(6407516-6407556)
chr8 (307-378)||(13430748-13430820)
chr8 (138-178)||(13430949-13430989)
chr8 (138-178)||(14990382-14990422)
chr8 (137-177)||(16188772-16188812)
chr8 (138-178)||(18151967-18152007)
chr8 (137-177)||(19956660-19956700)
chr8 (137-177)||(20255833-20255873)
chr8 (137-177)||(20382716-20382756)
chr8 (137-177)||(22461959-22461999)
chr8 (138-178)||(22673568-22673608)
chr8 (137-177)||(23263934-23263974)
chr8 (137-177)||(33082653-33082693)
chr8 (307-378)||(45538559-45538631)
chr8 (138-177)||(40845709-40845748)
chr8 (324-378)||(24551251-24551305)
chr8 (341-378)||(17797416-17797453)
chr8 (137-174)||(19707296-19707333)
chr8 (137-177)||(12758085-12758125)
chr8 (137-177)||(16681625-16681665)
chr8 (137-177)||(18679603-18679643)
chr8 (137-177)||(18685718-18685758)
chr8 (137-177)||(18731312-18731352)
chr8 (137-177)||(19156031-19156071)
chr8 (273-378)||(23185346-23185452)
chr8 (138-178)||(24551064-24551104)
chr8 (307-378)||(36105154-36105226)
chr8 (138-178)||(43639572-43639612)
chr8 (138-178)||(45292625-45292665)
chr8 (138-177)||(17701530-17701569)
chr8 (138-177)||(17797211-17797250)
chr8 (273-378)||(1237563-1237668)
chr8 (324-378)||(6407703-6407757)
chr8 (131-177)||(12541421-12541467)
chr8 (138-176)||(14989773-14989811)
chr8 (324-378)||(16207283-16207337)
chr8 (138-172)||(22662906-22662940)
chr8 (345-383)||(26833034-26833072)
chr8 (345-378)||(9320566-9320599)
chr8 (307-375)||(14989574-14989643)
chr8 (132-177)||(26832821-26832866)
chr8 (341-378)||(40845507-40845544)
chr8 (132-168)||(2810593-2810629)
chr8 (137-173)||(25163859-25163895)
chr8 (131-179)||(25850323-25850371)
chr8 (138-178)||(45538760-45538800)
chr8 (143-178)||(9320364-9320399)
chr8 (138-177)||(16207095-16207134)
chr8 (324-375)||(18151769-18151820)
chr8 (131-173)||(17687759-17687801)
chr8 (139-177)||(18772478-18772516)
chr8 (324-378)||(22673755-22673809)
chr8 (325-378)||(12757883-12757936)
chr8 (132-177)||(15598532-15598577)
chr8 (345-378)||(18685517-18685550)
chr8 (345-378)||(18722766-18722799)
chr8 (345-378)||(18731111-18731144)
chr8 (307-378)||(43639741-43639814)
chr8 (341-378)||(43644890-43644927)
chr8 (305-378)||(1745115-1745190)
chr8 (462-542)||(13596417-13596496)
chr8 (307-378)||(17525849-17525921)
chr8 (351-383)||(17687986-17688018)
chr8 (307-378)||(18321279-18321351)
chr8 (149-177)||(18718801-18718829)
chr8 (342-378)||(23263732-23263768)
chr8 (133-177)||(27739661-27739705)
chr8 (138-178)||(36104986-36105026)
chr8 (307-378)||(39693494-39693566)
[»] chr1 (171 HSPs)
chr1 (1-546)||(4250441-4250986)
chr1 (1-545)||(154166-154710)
chr1 (1-546)||(39193970-39194515)
chr1 (1-545)||(148091-148635)
chr1 (1-542)||(23580207-23580748)
chr1 (1-545)||(5973543-5974094)
chr1 (1-546)||(7689334-7689881)
chr1 (3-542)||(35012710-35013248)
chr1 (1-546)||(20441193-20441738)
chr1 (1-513)||(19187623-19188137)
chr1 (1-542)||(4167044-4167585)
chr1 (1-542)||(4177700-4178241)
chr1 (1-542)||(12730332-12730873)
chr1 (1-515)||(18381811-18382325)
chr1 (1-542)||(21894988-21895528)
chr1 (1-542)||(19178744-19179286)
chr1 (1-542)||(12740925-12741466)
chr1 (1-542)||(33084347-33084888)
chr1 (1-542)||(12897864-12898403)
chr1 (1-542)||(5639591-5640132)
chr1 (1-542)||(21877552-21878093)
chr1 (1-542)||(5650148-5650689)
chr1 (1-542)||(35648571-35649113)
chr1 (1-546)||(47195047-47195592)
chr1 (1-542)||(7507087-7507628)
chr1 (1-542)||(7517684-7518225)
chr1 (1-542)||(12623662-12624203)
chr1 (1-542)||(21863446-21863987)
chr1 (1-543)||(39586755-39587297)
chr1 (1-542)||(5833003-5833545)
chr1 (1-542)||(5843605-5844147)
chr1 (1-542)||(2538321-2538861)
chr1 (1-542)||(12614197-12614738)
chr1 (1-542)||(47607811-47608353)
chr1 (1-542)||(47618419-47618961)
chr1 (1-542)||(36236311-36236851)
chr1 (1-542)||(36246858-36247398)
chr1 (1-542)||(51629068-51629609)
chr1 (1-542)||(51656329-51656870)
chr1 (13-513)||(10997693-10998194)
chr1 (1-542)||(3171407-3171949)
chr1 (1-542)||(3182009-3182551)
chr1 (13-542)||(35404272-35404802)
chr1 (1-542)||(35637919-35638461)
chr1 (1-542)||(38094861-38095403)
chr1 (1-542)||(38105486-38106028)
chr1 (16-546)||(9050363-9050893)
chr1 (1-546)||(17957025-17957571)
chr1 (23-542)||(35401045-35401565)
chr1 (1-518)||(11194972-11195490)
chr1 (1-448)||(20195667-20196114)
chr1 (1-546)||(14388003-14388549)
chr1 (1-546)||(675230-675775)
chr1 (1-546)||(41132493-41133039)
chr1 (1-546)||(18310849-18311395)
chr1 (1-394)||(20798723-20799118)
chr1 (1-394)||(22610002-22610397)
chr1 (1-394)||(46180907-46181302)
chr1 (1-394)||(20883910-20884305)
chr1 (13-394)||(23926730-23927112)
chr1 (318-511)||(12946818-12947010)
chr1 (13-394)||(44200683-44201066)
chr1 (13-394)||(5929376-5929757)
chr1 (131-394)||(17370833-17371097)
chr1 (13-394)||(28473898-28474281)
chr1 (123-394)||(22655259-22655532)
chr1 (173-394)||(45070681-45070900)
chr1 (29-394)||(19037693-19038061)
chr1 (129-393)||(19170360-19170626)
chr1 (131-394)||(28379786-28380049)
chr1 (131-394)||(22019127-22019391)
chr1 (131-394)||(20251566-20251828)
chr1 (13-394)||(52350712-52351094)
chr1 (131-394)||(21543820-21544084)
chr1 (13-205)||(20867068-20867263)
chr1 (131-394)||(22642685-22642950)
chr1 (137-378)||(22464851-22465093)
chr1 (138-378)||(25448608-25448849)
chr1 (432-513)||(30291985-30292066)
chr1 (326-394)||(23064935-23065003)
chr1 (131-394)||(26548282-26548546)
chr1 (1-107)||(45070942-45071051)
chr1 (131-210)||(20909199-20909279)
chr1 (137-378)||(1900141-1900383)
chr1 (132-355)||(24028751-24028974)
chr1 (131-181)||(7745328-7745378)
chr1 (137-378)||(2266885-2267127)
chr1 (138-378)||(35039964-35040204)
chr1 (131-177)||(18130254-18130300)
chr1 (131-181)||(34255756-34255806)
chr1 (137-177)||(2834485-2834525)
chr1 (138-178)||(10250783-10250823)
chr1 (137-177)||(12624799-12624839)
chr1 (138-178)||(21135403-21135443)
chr1 (138-178)||(21205116-21205156)
chr1 (138-178)||(21984392-21984432)
chr1 (138-378)||(22427399-22427641)
chr1 (137-177)||(29215592-29215632)
chr1 (137-177)||(33256595-33256635)
chr1 (137-177)||(33276767-33276807)
chr1 (307-378)||(36134156-36134228)
chr1 (138-178)||(46088786-46088826)
chr1 (138-178)||(48570474-48570514)
chr1 (308-378)||(37642215-37642286)
chr1 (131-177)||(9346563-9346609)
chr1 (324-378)||(22153841-22153895)
chr1 (131-177)||(23054158-23054204)
chr1 (137-178)||(21702610-21702651)
chr1 (137-378)||(32785979-32786222)
chr1 (137-177)||(2268327-2268367)
chr1 (137-177)||(12284219-12284259)
chr1 (137-177)||(16235540-16235580)
chr1 (138-178)||(21121307-21121347)
chr1 (137-177)||(21192109-21192149)
chr1 (138-178)||(21214920-21214960)
chr1 (307-378)||(21702780-21702852)
chr1 (137-177)||(22201980-22202020)
chr1 (137-177)||(22600426-22600466)
chr1 (137-177)||(26702373-26702413)
chr1 (137-177)||(36133985-36134025)
chr1 (137-177)||(38282363-38282403)
chr1 (342-378)||(39201034-39201070)
chr1 (138-178)||(42284425-42284465)
chr1 (307-378)||(48570273-48570345)
chr1 (131-178)||(18517404-18517451)
chr1 (132-175)||(18614707-18614750)
chr1 (324-378)||(2268515-2268569)
chr1 (324-378)||(2327482-2327536)
chr1 (324-378)||(10250970-10251024)
chr1 (344-378)||(14263493-14263527)
chr1 (131-177)||(17018370-17018416)
chr1 (131-177)||(20110193-20110239)
chr1 (273-378)||(22600224-22600329)
chr1 (131-177)||(23935333-23935379)
chr1 (137-174)||(10757219-10757256)
chr1 (138-178)||(14263696-14263737)
chr1 (144-177)||(18896839-18896872)
chr1 (341-378)||(21191907-21191944)
chr1 (145-178)||(21206876-21206909)
chr1 (341-378)||(46088990-46089027)
chr1 (137-177)||(7309615-7309655)
chr1 (307-378)||(19215578-19215650)
chr1 (137-173)||(21028590-21028626)
chr1 (307-378)||(21135202-21135274)
chr1 (137-177)||(22153653-22153693)
chr1 (138-178)||(30571994-30572034)
chr1 (342-378)||(30572199-30572235)
chr1 (137-177)||(30892889-30892929)
chr1 (138-178)||(44824005-44824045)
chr1 (304-378)||(7745132-7745207)
chr1 (137-176)||(17025207-17025246)
chr1 (341-376)||(21121108-21121143)
chr1 (137-176)||(23036751-23036790)
chr1 (131-205)||(26280271-26280346)
chr1 (131-177)||(2819561-2819607)
chr1 (324-378)||(23024772-23024826)
chr1 (131-177)||(31359111-31359157)
chr1 (344-378)||(35401813-35401847)
chr1 (324-378)||(44821587-44821641)
chr1 (341-378)||(12613856-12613893)
chr1 (345-378)||(18896639-18896672)
chr1 (345-378)||(21204965-21204998)
chr1 (347-388)||(23054373-23054414)
chr1 (138-180)||(26703351-26703395)
chr1 (341-378)||(29215798-29215835)
chr1 (307-378)||(16235338-16235410)
chr1 (131-163)||(21684323-21684355)
chr1 (307-378)||(30893058-30893130)
chr1 (307-378)||(33256393-33256465)
chr1 (307-378)||(33276565-33276637)
chr1 (341-373)||(38282568-38282600)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-546)||(6758-7302)
[»] chr2 (154 HSPs)
chr2 (1-546)||(18768758-18769302)
chr2 (3-546)||(21172318-21172861)
chr2 (1-545)||(2561319-2561865)
chr2 (12-546)||(28721168-28721702)
chr2 (12-546)||(28731756-28732288)
chr2 (1-546)||(24414874-24415418)
chr2 (1-542)||(29244053-29244594)
chr2 (1-542)||(29254632-29255173)
chr2 (1-542)||(7005663-7006204)
chr2 (1-515)||(26866903-26867417)
chr2 (1-542)||(17857293-17857834)
chr2 (1-542)||(9897430-9897971)
chr2 (1-542)||(9908018-9908559)
chr2 (1-542)||(11388665-11389206)
chr2 (1-542)||(24327590-24328131)
chr2 (3-542)||(36251700-36252239)
chr2 (1-542)||(21650388-21650928)
chr2 (1-542)||(24338260-24338801)
chr2 (9-546)||(38585938-38586475)
chr2 (1-542)||(34477760-34478300)
chr2 (1-542)||(34790073-34790614)
chr2 (1-542)||(43354854-43355394)
chr2 (1-542)||(10277402-10277943)
chr2 (1-542)||(34804216-34804757)
chr2 (1-542)||(40222164-40222705)
chr2 (1-542)||(40251025-40251566)
chr2 (1-513)||(4220312-4220827)
chr2 (1-513)||(43093094-43093601)
chr2 (1-542)||(10266825-10267366)
chr2 (1-542)||(22914720-22915261)
chr2 (1-542)||(32217705-32218246)
chr2 (1-542)||(43345239-43345779)
chr2 (1-513)||(1099079-1099592)
chr2 (1-513)||(43082485-43082992)
chr2 (1-542)||(27221212-27221754)
chr2 (1-542)||(9773162-9773701)
chr2 (1-542)||(11395028-11395569)
chr2 (1-542)||(11405344-11405885)
chr2 (1-542)||(22960188-22960729)
chr2 (1-511)||(27978269-27978779)
chr2 (1-542)||(4209720-4210263)
chr2 (1-513)||(39169979-39170492)
chr2 (1-542)||(35252813-35253355)
chr2 (1-542)||(35263422-35263964)
chr2 (1-542)||(35274047-35274589)
chr2 (1-542)||(9762626-9763165)
chr2 (1-542)||(18392493-18393034)
chr2 (1-511)||(28064798-28065308)
chr2 (1-515)||(26879492-26880006)
chr2 (1-542)||(30488679-30489221)
chr2 (1-424)||(16768774-16769198)
chr2 (1-546)||(36784657-36785196)
chr2 (1-546)||(967356-967901)
chr2 (1-461)||(17969146-17969607)
chr2 (1-317)||(24427667-24427983)
chr2 (1-546)||(24274856-24275400)
chr2 (1-546)||(22774189-22774736)
chr2 (1-546)||(22763485-22764032)
chr2 (205-513)||(4099819-4100128)
chr2 (313-546)||(24425403-24425635)
chr2 (1-546)||(19497843-19498389)
chr2 (317-515)||(28374397-28374595)
chr2 (13-394)||(19356163-19356545)
chr2 (1-394)||(19313020-19313416)
chr2 (1-178)||(4099645-4099822)
chr2 (1-449)||(19299959-19300409)
chr2 (131-394)||(20646610-20646873)
chr2 (273-546)||(22779842-22780114)
chr2 (129-391)||(1083798-1084061)
chr2 (1-83)||(1041980-1042063)
chr2 (131-378)||(23392735-23392982)
chr2 (215-394)||(24814633-24814813)
chr2 (432-542)||(16777117-16777226)
chr2 (131-394)||(22755254-22755516)
chr2 (138-378)||(28711765-28712007)
chr2 (445-515)||(28379736-28379806)
chr2 (131-181)||(24801814-24801864)
chr2 (131-176)||(44880954-44880999)
chr2 (137-378)||(22317384-22317626)
chr2 (137-378)||(6574191-6574435)
chr2 (131-177)||(20567920-20567966)
chr2 (131-177)||(21845934-21845980)
chr2 (132-177)||(24575821-24575866)
chr2 (129-181)||(1089149-1089201)
chr2 (138-178)||(1587300-1587340)
chr2 (138-178)||(6392426-6392466)
chr2 (137-177)||(9015637-9015677)
chr2 (137-177)||(19114875-19114915)
chr2 (137-177)||(22455257-22455297)
chr2 (138-178)||(22785922-22785962)
chr2 (134-205)||(24157629-24157701)
chr2 (137-177)||(24850935-24850975)
chr2 (138-178)||(28551186-28551226)
chr2 (138-178)||(33074018-33074058)
chr2 (138-178)||(34322204-34322244)
chr2 (138-178)||(40331879-40331919)
chr2 (137-177)||(41121987-41122027)
chr2 (138-178)||(44840226-44840266)
chr2 (131-205)||(22383266-22383341)
chr2 (137-176)||(23184573-23184612)
chr2 (137-176)||(23595836-23595875)
chr2 (134-177)||(24843992-24844035)
chr2 (138-177)||(28701482-28701521)
chr2 (139-177)||(18702533-18702571)
chr2 (131-177)||(22271918-22271964)
chr2 (137-175)||(24376895-24376933)
chr2 (140-178)||(30557588-30557626)
chr2 (138-378)||(31800954-31801195)
chr2 (132-177)||(10010020-10010065)
chr2 (132-177)||(18431207-18431252)
chr2 (349-394)||(21025530-21025575)
chr2 (136-177)||(39037911-39037952)
chr2 (137-177)||(20152268-20152308)
chr2 (137-177)||(20569019-20569059)
chr2 (137-177)||(21537519-21537559)
chr2 (137-177)||(24779165-24779205)
chr2 (137-177)||(25189189-25189229)
chr2 (137-177)||(28140871-28140911)
chr2 (307-378)||(28550985-28551057)
chr2 (307-378)||(31328033-31328104)
chr2 (307-378)||(31334754-31334825)
chr2 (307-378)||(33074187-33074259)
chr2 (137-177)||(40782268-40782308)
chr2 (344-383)||(20568134-20568173)
chr2 (139-173)||(26619372-26619406)
chr2 (324-378)||(28701296-28701350)
chr2 (324-378)||(31968110-31968164)
chr2 (138-172)||(31968317-31968351)
chr2 (345-378)||(22802460-22802493)
chr2 (341-378)||(44840430-44840467)
chr2 (133-177)||(15670888-15670932)
chr2 (137-177)||(19540207-19540247)
chr2 (137-177)||(22257992-22258032)
chr2 (307-378)||(22776355-22776427)
chr2 (307-378)||(22781733-22781805)
chr2 (138-178)||(22802253-22802293)
chr2 (307-378)||(30557388-30557459)
chr2 (307-378)||(39037709-39037781)
chr2 (142-177)||(13964247-13964282)
chr2 (309-375)||(41121789-41121856)
chr2 (131-177)||(10898792-10898838)
chr2 (131-177)||(19320676-19320722)
chr2 (131-177)||(22683165-22683211)
chr2 (131-177)||(27939766-27939812)
chr2 (345-378)||(1587100-1587133)
chr2 (351-388)||(24440789-24440826)
chr2 (137-178)||(24440986-24441027)
chr2 (345-378)||(26619168-26619201)
chr2 (341-378)||(40332083-40332120)
chr2 (307-378)||(22188169-22188241)
chr2 (307-378)||(22785722-22785794)
chr2 (307-378)||(24377062-24377134)
chr2 (307-378)||(24575996-24576068)
chr2 (137-177)||(38781189-38781229)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-545)||(53997-54541)
scaffold0028 (1-512)||(14421-14934)
scaffold0028 (138-378)||(5674-5915)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (1-546)||(42393-42938)
scaffold0133 (1-542)||(30970-31511)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (1-546)||(2091-2636)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (1-546)||(32776-33320)
scaffold0047 (1-542)||(40330-40871)
scaffold0047 (137-173)||(9701-9737)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-515)||(10505-11019)
scaffold0068 (1-515)||(7658-8172)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-542)||(6719-7260)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-546)||(36607-37152)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (1-542)||(12195-12735)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (1-542)||(7799-8341)
scaffold0105 (1-542)||(36834-37376)
scaffold0105 (233-542)||(47468-47778)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (35-515)||(13511-13989)
[»] scaffold0747 (2 HSPs)
scaffold0747 (187-546)||(2824-3182)
scaffold0747 (1-83)||(2528-2610)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (1-546)||(11989-12535)
scaffold0407 (272-546)||(15820-16092)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-511)||(5133-5643)
scaffold0042 (368-511)||(12896-13038)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (67-546)||(51974-52457)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (1-546)||(175162-175707)
scaffold0017 (131-394)||(40369-40632)
scaffold0017 (350-546)||(180424-180619)
scaffold0017 (131-394)||(58915-59178)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-546)||(10161-10706)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (224-546)||(1-323)
[»] scaffold0084 (6 HSPs)
scaffold0084 (1-509)||(56691-57201)
scaffold0084 (130-357)||(464-691)
scaffold0084 (137-177)||(32282-32322)
scaffold0084 (137-177)||(49129-49169)
scaffold0084 (341-378)||(417-454)
scaffold0084 (307-378)||(32452-32524)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (214-546)||(6092-6423)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (26-546)||(19089-19638)
scaffold0099 (1-515)||(16828-17373)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-546)||(35375-35919)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (211-546)||(117148-117482)
scaffold0002 (131-394)||(475305-475569)
scaffold0002 (131-394)||(481825-482089)
scaffold0002 (131-394)||(156681-156945)
[»] scaffold0012 (6 HSPs)
scaffold0012 (1-463)||(140642-141105)
scaffold0012 (1-546)||(127484-128028)
scaffold0012 (131-394)||(7674-7937)
scaffold0012 (1-65)||(16443-16508)
scaffold0012 (138-178)||(215770-215810)
scaffold0012 (307-378)||(215569-215641)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (303-546)||(7935-8178)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-546)||(1831-2376)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-409)||(40339-40749)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (13-484)||(15577-16049)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (85-546)||(12698-13158)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-394)||(59316-59710)
scaffold0007 (137-385)||(142894-143143)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (13-394)||(1055-1437)
scaffold0752 (13-394)||(1670-2052)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (1-394)||(29310-29707)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (31-394)||(58170-58533)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-394)||(28820-29217)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (324-546)||(1533-1755)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-156)||(2601-2758)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (344-546)||(35031-35233)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (307-546)||(7375-7613)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (419-546)||(26995-27122)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-449)||(483-932)
scaffold0090 (1-449)||(4863-5312)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-394)||(555-950)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (13-394)||(60893-61276)
scaffold0005 (137-378)||(212154-212393)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-295)||(38120-38417)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (131-391)||(4909-5170)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (131-394)||(20432-20695)
[»] scaffold0414 (3 HSPs)
scaffold0414 (425-546)||(2550-2671)
scaffold0414 (138-178)||(7431-7471)
scaffold0414 (345-378)||(7228-7261)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (131-394)||(17861-18127)
scaffold0280 (138-378)||(2802-3043)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-297)||(9912-10210)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (131-394)||(61524-61788)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (131-394)||(990-1254)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (131-394)||(1183-1447)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (350-513)||(4405-4568)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (2-250)||(16349-16599)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (350-498)||(6130-6278)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (131-378)||(38157-38403)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (131-394)||(1727-1991)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (131-394)||(11553-11816)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (428-546)||(2306-2424)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (131-378)||(7076-7324)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (429-515)||(19122-19208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (129-390)||(16745-17007)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (131-378)||(3967-4215)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (215-394)||(6577-6757)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (466-546)||(53339-53418)
scaffold0083 (137-177)||(26249-26289)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (129-181)||(20410-20462)
scaffold0207 (131-249)||(10511-10629)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (137-373)||(84191-84429)
scaffold0009 (131-177)||(268572-268618)
[»] scaffold0314 (1 HSPs)
scaffold0314 (492-546)||(20646-20700)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (131-176)||(59349-59394)
scaffold0011 (304-378)||(165018-165093)
scaffold0011 (138-178)||(65678-65718)
scaffold0011 (138-178)||(144723-144763)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (131-336)||(1119-1324)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (132-378)||(1869-2117)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (307-378)||(25737-25809)
scaffold0056 (138-178)||(35077-35117)
scaffold0056 (324-378)||(34876-34930)
scaffold0056 (143-178)||(25938-25973)
scaffold0056 (131-177)||(36455-36501)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (324-394)||(9281-9352)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (138-378)||(1771-2012)
[»] scaffold0567 (2 HSPs)
scaffold0567 (131-177)||(9698-9744)
scaffold0567 (344-378)||(9911-9945)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (131-177)||(32060-32106)
scaffold0078 (344-383)||(31851-31890)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (131-177)||(29585-29631)
scaffold0035 (324-378)||(99277-99331)
scaffold0035 (138-178)||(99478-99518)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (132-177)||(1153-1198)
scaffold0772 (351-383)||(948-980)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (131-176)||(2451-2496)
scaffold0622 (131-179)||(3672-3720)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (425-546)||(15129-15249)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (137-178)||(1792-1833)
scaffold0040 (426-546)||(69860-69979)
scaffold0040 (131-178)||(4285-4332)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (137-177)||(272-312)
scaffold0771 (131-165)||(6131-6165)
[»] scaffold0607 (2 HSPs)
scaffold0607 (138-178)||(5804-5844)
scaffold0607 (324-376)||(5991-6043)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (137-177)||(2266-2306)
[»] scaffold0479 (2 HSPs)
scaffold0479 (137-177)||(9766-9806)
scaffold0479 (324-378)||(9954-10008)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (307-378)||(7348-7420)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (137-177)||(5964-6004)
[»] scaffold0352 (2 HSPs)
scaffold0352 (138-178)||(1093-1133)
scaffold0352 (345-378)||(893-926)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (137-177)||(14445-14485)
scaffold0337 (307-378)||(14615-14687)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (137-177)||(5426-5466)
scaffold0273 (345-378)||(5633-5666)
[»] scaffold0217 (4 HSPs)
scaffold0217 (138-178)||(22404-22444)
scaffold0217 (137-378)||(18828-19070)
scaffold0217 (324-378)||(9545-9599)
scaffold0217 (307-378)||(22203-22275)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (138-178)||(8953-8993)
scaffold0176 (307-378)||(9122-9194)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (137-177)||(14914-14954)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (138-178)||(5597-5637)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (137-177)||(1487-1527)
scaffold0065 (307-378)||(1657-1729)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (137-177)||(7723-7763)
scaffold0026 (137-177)||(59813-59853)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (138-178)||(211198-211238)
scaffold0004 (137-177)||(220035-220075)
scaffold0004 (307-378)||(211365-211437)
scaffold0004 (346-378)||(244356-244388)
scaffold0004 (137-177)||(244555-244595)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (137-177)||(90329-90369)
scaffold0003 (307-378)||(90127-90199)
scaffold0003 (126-177)||(1230-1281)
scaffold0003 (134-176)||(495-537)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (131-178)||(19863-19910)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (304-378)||(15694-15769)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (137-176)||(37199-37238)
scaffold0022 (137-176)||(135259-135298)
scaffold0022 (324-378)||(37387-37441)
scaffold0022 (324-378)||(135447-135501)
scaffold0022 (137-177)||(158906-158946)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (138-177)||(60601-60640)
scaffold0015 (341-378)||(60805-60842)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (29-83)||(806-860)
[»] scaffold1359 (3 HSPs)
scaffold1359 (324-378)||(727-781)
scaffold1359 (138-177)||(929-968)
scaffold1359 (341-378)||(1827-1864)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (356-394)||(6388-6426)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (345-383)||(379-417)
scaffold0498 (131-173)||(3582-3624)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (425-546)||(8-128)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (132-177)||(2067-2112)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (132-177)||(7617-7662)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (349-394)||(22050-22095)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (341-378)||(27501-27538)
scaffold0171 (137-177)||(27703-27743)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (307-378)||(3271-3343)
scaffold0471 (138-178)||(3103-3143)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (137-173)||(13368-13404)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (307-378)||(9923-9995)
scaffold0324 (137-172)||(9752-9787)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (307-378)||(17837-17909)
scaffold0249 (138-178)||(18038-18078)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (137-177)||(1457-1497)
scaffold0210 (341-378)||(1662-1699)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (307-378)||(21043-21115)
scaffold0116 (137-177)||(21245-21285)
scaffold0116 (137-178)||(2246-2287)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (138-178)||(87873-87913)
scaffold0045 (341-378)||(87672-87709)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (137-177)||(74378-74418)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (137-172)||(3021-3056)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (142-177)||(40441-40476)
scaffold0081 (341-378)||(40639-40676)
[»] scaffold0859 (2 HSPs)
scaffold0859 (307-373)||(2951-3016)
scaffold0859 (138-177)||(2781-2820)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (139-173)||(5807-5841)
scaffold0364 (351-383)||(10474-10506)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (324-378)||(15811-15865)
scaffold0247 (324-378)||(25471-25525)
scaffold0247 (137-178)||(16012-16052)
scaffold0247 (137-178)||(25672-25712)
[»] scaffold0227 (2 HSPs)
scaffold0227 (324-374)||(22661-22711)
scaffold0227 (138-174)||(22473-22509)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (144-178)||(16410-16444)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (324-378)||(36847-36901)
scaffold0120 (324-378)||(42104-42158)
scaffold0120 (137-173)||(37012-37048)
scaffold0120 (137-173)||(41957-41993)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (341-378)||(2763-2800)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (132-177)||(144698-144743)
scaffold0020 (345-383)||(144911-144949)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (138-178)||(11996-12036)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (138-178)||(7014-7054)
scaffold0439 (341-378)||(6812-6849)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (137-177)||(44193-44233)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (137-177)||(103369-103408)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (131-170)||(4061-4100)
[»] scaffold0161 (4 HSPs)
scaffold0161 (137-172)||(10386-10421)
scaffold0161 (137-172)||(15050-15085)
scaffold0161 (324-378)||(10180-10234)
scaffold0161 (324-378)||(14844-14898)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (131-178)||(31528-31575)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (324-378)||(5019-5073)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (131-177)||(5178-5224)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (131-177)||(7878-7924)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (324-378)||(78438-78492)
scaffold0043 (138-168)||(78650-78680)
[»] scaffold1747 (2 HSPs)
scaffold1747 (345-378)||(1323-1356)
scaffold1747 (137-177)||(1115-1155)
[»] scaffold1745 (2 HSPs)
scaffold1745 (345-378)||(55-88)
scaffold1745 (137-177)||(256-296)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (346-378)||(7710-7742)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 248)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 6501381 - 6500836
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501381 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagatattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 6501282  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501281 cgcttttgaacttgtatatttctctatatcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6501182  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501181 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 6501082  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501081 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 6500982  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500981 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 6500882  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6500881 atcttcagtttgaaaatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 6500836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 6490727 - 6490182
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490727 atacaatacaataaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagatattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 6490628  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490627 cgcttttgaacttgtatatttctctatatcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6490528  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490527 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 6490428  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490427 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 6490328  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490327 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 6490228  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6490227 atcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 6490182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12249817 - 12249273
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12249817 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaatttagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 12249718  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249717 cgctttttaacttgtatatctctatttgtcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12249618  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249617 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 12249518  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249517 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 12249419  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249418 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 12249319  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12249318 atcttcagtttgactatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 12249273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12237991 - 12237447
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12237991 atacaatacaataaagactatagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcattgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 12237892  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237891 cgctttttaacttgtatatctctatctgtcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12237792  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237791 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 12237692  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237691 atattctgcaggcatagctattgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 12237593  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237592 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 12237493  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12237492 atcttcagtttgactatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 12237447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9994271 - 9993727
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9994271 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 9994172  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatattt-ctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994171 cacttttgaacttgtatattttctatttttcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 9994072  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994071 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 9993972  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993971 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 9993873  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9993872 cgtaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttattagataagg-tgaaataagaaacagctactttg 9993774  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9993773 gatcttcagtttgagtaaatggattaaatgtagcttctggtgatgat 9993727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 23635566 - 23636112
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23635566 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 23635665  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23635666 gcgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 23635765  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635766 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 23635865  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635866 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 23635965  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23635966 cgaaggacaaatgctcagtactatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttta 23636065  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  23636066 gatcttcagtttgaatatacggattgaatgtagcttctggtgatgat 23636112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24706922 - 24706387
Alignment:
Q  12 taaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24706922 taaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaa 24706823  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24706822 cttgtgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggcgtgaaagagacgttgagagaattagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 24706723  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24706722 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 24706623  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24706622 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 24706523  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24706522 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttttgatcttcagtt 24706423  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24706422 tgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 24706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9982263 - 9981719
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9982263 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 9982164  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatattt-ctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982163 cacttttgaacttgtatattttctatttttcatcttcaagtcttcactctattatatagaagtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 9982064  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982063 gtcatttgaaatcctttgatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 9981964  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9981963 caaattctgcaggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 9981865  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9981864 cgtaggacagatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttattagataagg-tgaaataagaaacagctactttg 9981766  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9981765 gatcttcagtttgagtaaatggattaaatgtagcttctggtgatgat 9981719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7804896 - 7804351
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7804896 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 7804797  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  7804796 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 7804697  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804696 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 7804597  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804596 caaattctgcaggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 7804498  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804497 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 7804398  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7804397 gatcttcagtttgaatttatggattaaatgcagcttctggtgatgat 7804351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 9535466 - 9536010
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9535466 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 9535565  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9535566 gcgctttttaacttgtgtatctctatctccaat-ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 9535664  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535665 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 9535764  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535765 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 9535863  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9535864 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacaactactttg 9535963  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  9535964 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 9536010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 29461591 - 29461047
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29461591 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 29461492  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29461491 gcgctttttaacttgtgtatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacatctaaaga 29461392  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29461391 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggca 29461292  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461291 caaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 29461193  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29461192 cgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattctccgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttg 29461093  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29461092 gatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 29461047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19887732 - 19887187
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagact-ttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19887732 atacaatacgataaagactctagactcttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcaggaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 19887633  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19887632 gcgctttttaacttgtatatctctatctagaatcttcaagtcttcgctcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 19887533  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887532 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcgtttgcctgatttgggtgtactactttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 19887433  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19887432 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtgctttgtcaactctgttaa 19887334  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887333 cgaagtacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 19887234  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19887233 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 19887187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 29472443 - 29471899
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29472443 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 29472344  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29472343 gcgctttttaacttgtgtatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacatctaaaga 29472244  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29472243 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggca 29472144  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472143 caaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 29472045  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29472044 cgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattctctgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttg 29471945  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29471944 gatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 29471899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7794985 - 7794440
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7794985 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttg 7794886  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  7794885 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattttcacgtctaaaga 7794786  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794785 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 7794686  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794685 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 7794587  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||||| || | || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794586 cgaaggaaaaatacttagtgctatctaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 7794487  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7794486 gatcttcagtttgaatttatggattaaatgcagcttctggtgatgat 7794440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 48337098 - 48337643
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48337098 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 48337197  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  48337198 gcgctttttaacttgtgtatgtctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 48337297  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337298 gtcgtttagaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 48337397  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48337398 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaa 48337496  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48337497 cgaaggacaaatactcagtgctgtccaaatgaccgatgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 48337596  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  48337597 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 48337643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9391582 - 9391035
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9391582 atacaatgcaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 9391483  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9391482 gcgctttttaacttgtatatatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 9391383  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391382 gagtcgtt-gagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 9391284  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9391283 aacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtggtacatttgtactttctcaactctgtt 9391184  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9391183 aacgaaggacaaatactcagtgcgcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactt 9391084  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  9391083 tggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 9391035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17910379 - 17909835
Alignment:
Q  2 tacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  17910379 tacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttgg 17910280  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17910279 cgctttttaacttgtatatatctatcaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagag 17910180  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17910179 tcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatccttttcctgatttgggtgttgtccttttaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcat 17910080  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910079 aaattctgcaggcatagatgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 17909981  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17909980 gaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaagttgaaatgagaaacagctactttgg 17909881  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17909880 atcttcagtttgaatttacagattaaatgtagcttctggtgatgat 17909835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Original strand, 933495 - 934029
Alignment:
Q  12 taaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  933495 taaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaa 933594  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  933595 cttgtatatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcatgtctaaagagtcgtttgaaa 933694  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  933695 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgtctgatttggatgtagtcctttgaagaattagtttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 933794  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  933795 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 933893  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933894 tactcagagcacttcaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttcattcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 933993  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  933994 tgaatttacggattaaatgtagcttctggtggtgat 934029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9381036 - 9380489
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9381036 atacaatgcaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 9380937  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  9380936 gcgctttttaacttgtatatatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcatgtctaaa 9380837  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9380836 gagtcgtt-gagatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 9380738  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9380737 aacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactatgtt 9380638  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  9380637 aacgaaggacaaatactcagtgcgcttcaagtgactgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaatagctactt 9380538  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9380537 tggatcttcagtttgaatttacagattaaatgtagcttctggtgatgat 9380489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11217103 - 11216554
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11217103 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 11217004  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt----atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11217003 gcgctttttaacttgtatatatctctatctcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtcta 11216904  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216903 aagagtcgtt-gagatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 11216805  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216804 ggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 11216705  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    |||||||||||||| | ||||  |   | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  11216704 ttaacgaaggacaaatactcaatggacttcaaatgatcattgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaactac 11216605  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| |  | || |||| |||||||||||||||||    
T  11216604 tttggatcttcagtttgaatttgcggatcaaatatagcttctggtgatgat 11216554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 37885435 - 37885976
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37885435 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 37885534  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885535 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 37885634  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37885635 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 37885734  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37885735 aacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 37885834  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  37885835 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 37885934  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  37885935 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 37885976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10627319 - 10626779
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10627319 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 10627220  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627219 cgcttttgaacttgtatatctctatctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10627120  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10627119 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaataataatcttcaaattcattcccatcttgaaggcgc 10627020  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | | ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10627019 agaatctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaat 10626920  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
        ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  10626919 aggagacaagtgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagacagctactttga 10626820  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  10626819 atcttcagtttgatta-agggatcaaatgtagcttctggtga 10626779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10655641 - 10655101
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10655641 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 10655542  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10655541 cgcttttgaacttgtatatctctatctactatcttcaagtcttcaatcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcgaaagag 10655442  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10655441 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataatcttcaaattcattcccatcttgaaggcgc 10655342  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | | ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10655341 aaaatctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaat 10655242  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
        ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  10655241 aggagacaagtgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagacagctactttga 10655142  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  10655141 atcttcagtttgatta-agggatcaaatgtagcttctggtga 10655101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 4175135 - 4174594
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  4175135 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 4175036  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175035 cgctttttaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 4174936  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4174935 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 4174836  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4174835 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 4174736  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  4174735 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 4174636  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4174635 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4174594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 37866302 - 37866843
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37866302 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 37866401  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866402 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 37866501  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37866502 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcccgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 37866601  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37866602 aacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacactattaa 37866701  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  37866702 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 37866801  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  37866802 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 37866843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6180906 - 6180365
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6180906 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6180807  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    |||||||||| || | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180806 cgcttttgaatttatgtatctctatgtataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6180707  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6180706 tcgtttgaaatcctttgattatccaccaatgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 6180607  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6180606 aaattatgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6180507  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6180506 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 6180407  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6180406 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6180365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6221080 - 6220539
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6221080 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6220981  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    |||||||||| || | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6220980 cgcttttgaatttatgtatctctatgtataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6220881  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6220880 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 6220781  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6220780 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6220681  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6220680 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 6220581  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6220580 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6220539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 39673261 - 39672720
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39673261 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 39673162  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673161 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39673062  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||    
T  39673061 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgaacatac 39672962  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39672961 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 39672862  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  39672861 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 39672762  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  39672761 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 39672720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 4404129 - 4404674
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  4404129 atacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacatagtttt 4404228  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4404229 ggcgctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatataggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaag 4404328  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||| ||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4404329 agttgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaagga 4404427  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4404428 acat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 4404526  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4404527 acgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtttttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctacttt 4404626  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||    
T  4404627 ggatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctagtgatgat 4404674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5537399 - 5536859
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5537399 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5537300  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537299 cgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5537200  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  5537199 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 5537100  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5537099 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5537001  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  5537000 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 5536901  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  5536900 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5536859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 23767751 - 23768292
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23767751 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23767850  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767851 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23767950  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23767951 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 23768050  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23768051 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 23768150  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||  ||||||||||    
T  23768151 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaattagctactttg 23768250  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  23768251 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 23768292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5866074 - 5865531
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5866074 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5865975  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5865974 cgcttttgaacttatgtatctctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 5865875  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |     
T  5865874 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgt 5865775  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5865774 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 5865675  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  5865674 aacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactt 5865575  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5865574 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 5865531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5876673 - 5876130
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5876673 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5876574  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876573 cgcttttgaacttatgtatctctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 5876474  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |     
T  5876473 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgt 5876374  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5876373 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 5876274  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  5876273 aacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactt 5876174  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5876173 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 5876130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 546
Target Start/End: Original strand, 4456776 - 4457317
Alignment:
Q  5 aatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4456776 aatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 4456875  T
Q  103 cttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 202  Q
    ||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||     
T  4456876 ctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatataggcgtgaaagagacattgagatgaatagcacgtctaaagagtt 4456975  T
Q  203 gtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 302  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4456976 gtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaaggaacat 4457074  T
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4457075 -ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 4457173  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
    ||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4457174 aggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcatttttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggat 4457273  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||    
T  4457274 cttcagtttgaatttacagatcaaatgtagcttctggtgatgat 4457317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13383638 - 13383101
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  13383638 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 13383539  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383538 cgcttttgaacttatgtat--ctcttta--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 13383443  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  13383442 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 13383343  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13383342 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 13383243  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  13383242 cgaaagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 13383143  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  13383142 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 13383101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 5510553 - 5511093
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5510553 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5510652  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510653 cgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5510752  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  5510753 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 5510852  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5510853 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5510951  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  5510952 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 5511051  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  5511052 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5511093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 5520731 - 5521271
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5520731 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5520830  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520831 cgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5520930  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  5520931 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 5521030  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5521031 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5521129  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  5521130 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 5521229  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  5521230 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5521271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12287357 - 12286816
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12287357 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12287258  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287257 cgcttttgaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12287158  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12287157 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12287058  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12287057 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12286958  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  | |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12286957 cgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 12286858  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  12286857 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 12286816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 19788879 - 19789420
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19788879 atacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 19788978  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19788979 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcaacacgtctaaagag 19789078  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19789079 tcgtttgaaatcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 19789178  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19789179 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 19789278  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  19789279 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 19789378  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  19789379 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 19789420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 23757155 - 23757696
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23757155 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23757254  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757255 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23757354  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23757355 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 23757454  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23757455 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctattaa 23757554  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||  ||||||||||    
T  23757555 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaattagctactttg 23757654  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  23757655 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 23757696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 28168939 - 28169483
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  28168939 atacaatgcaataaaaactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagggttttg 28169038  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28169039 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 28169138  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28169139 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcatttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaa 28169237  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28169238 ca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 28169336  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    || ||||||| | ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28169337 cgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttg 28169436  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||||| |||  |   ||||| |||| ||||||||||||||    
T  28169437 aatcttcagtttaaattcactgattaattgtaccttctggtgatgat 28169483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13373044 - 13372507
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  13373044 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 13372945  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13372944 cgcttttgaacttatgtat--ctcttta--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 13372849  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  13372848 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 13372749  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13372748 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttattaa 13372649  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  13372648 cgaaagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 13372549  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  13372548 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 13372507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 11163690 - 11164228
Alignment:
Q  5 aatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |    
T  11163690 aataccataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttggcac 11163789  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||| ||||||||| | ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  11163790 tttttaacttgtatttctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaagagtcg 11163889  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    || ||  |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11163890 tt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaaaaa 11163988  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163989 ttctgtaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 11164088  T
Q  404 ggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatc 503  Q
    |||||| | ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  11164089 ggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatc 11164188  T
Q  504 ttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgat 543  Q
    |||||||||||| |  | || |||||||||||| ||||||    
T  11164189 ttcagtttgaatttgcggatcaaatgtagcttccggtgat 11164228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 37759526 - 37760068
Alignment:
Q  1 atacaataca-ataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37759526 atacaatacagaaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 37759625  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759626 gcgcttttgaacttatgtatttctatatgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 37759725  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
T  37759726 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgta 37759825  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37759826 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 37759925  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  37759926 atgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 37760025  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  37760026 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 37760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 526912 - 526371
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  526912 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 526813  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526812 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 526713  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  526712 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 526613  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  526612 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 526513  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  526512 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 526413  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  526412 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 526371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5547983 - 5547443
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  5547983 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacaaagttttgg 5547884  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547883 cgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5547784  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  5547783 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 5547684  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5547683 a-attctgtaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5547585  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  5547584 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 5547485  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  5547484 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5547443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12297179 - 12296638
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12297179 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12297080  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297079 cgcttttgaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12296980  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12296979 gcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12296880  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12296879 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12296780  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  | |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12296779 cgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 12296680  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  12296679 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 12296638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 13557431 - 13557972
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13557431 atacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 13557530  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557531 cgcttttgaacttatgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 13557630  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  13557631 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaactcattcccatcttgaacgtac 13557730  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13557731 aaattctgcatgcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 13557830  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  13557831 cgagagacaagtgctccgtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 13557930  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  13557931 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 13557972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 19778242 - 19778783
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19778242 atacaataaagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 19778341  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778342 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 19778441  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19778442 tcgtttgaaatcctttgattatccaacagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 19778541  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778542 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 19778641  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| |||||||||||    
T  19778642 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgggaatcagctactttg 19778741  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  19778742 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 19778783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 20720982 - 20721511
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20720982 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcgcttttaaact 20721081  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    ||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20721082 tgtgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 20721181  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  20721182 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcagg 20721281  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||      
T  20721282 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaaga 20721381  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  20721382 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagttt 20721481  T
Q  512 gaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || || | | || ||| ||||||||||||||    
T  20721482 gatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 20721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 28314610 - 28314069
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  28314610 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 28314511  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314510 cgcttttgaacttgtgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 28314411  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28314410 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 28314311  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28314310 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 28314211  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  28314210 tgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 28314111  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  28314110 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 28314069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 41683535 - 41684076
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  41683535 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 41683634  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683635 cgcttttaaacttatgtatatctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 41683734  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  41683735 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 41683834  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41683835 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 41683934  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  41683935 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 41684034  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  41684035 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 41684076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 41694104 - 41694645
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  41694104 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 41694203  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694204 cgcttttaaacttatgtatatctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 41694303  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  41694304 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 41694403  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41694404 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 41694503  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  41694504 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 41694603  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  41694604 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 41694645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13394232 - 13393695
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  13394232 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtactttttagaatcaaattgacagagttttgg 13394133  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394132 cgcttttgaacttatgtat--ctcttta--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 13394037  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  13394036 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 13393937  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13393936 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 13393837  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  13393836 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 13393737  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  13393736 aatcttcagtttgatta-aaggataaaacgtagcttctggtga 13393695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 504546 - 504005
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  504546 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 504447  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504446 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 504347  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  504346 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 504247  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  504246 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 504147  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  504146 tgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 504047  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  504046 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 504005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 4743595 - 4744135
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  4743595 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 4743694  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743695 cgcttttaaacttatgtatctctctctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 4743794  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  4743795 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 4743894  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4743895 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 4743993  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  4743994 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 4744093  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4744094 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4744135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5580012 - 5579471
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5580012 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5579913  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5579912 cgcttttaaacttgtgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5579813  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  5579812 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 5579713  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5579712 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5579613  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  5579612 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 5579513  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5579512 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 5579471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 23647606 - 23648146
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23647606 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23647705  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647706 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23647804  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23647805 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 23647904  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23647905 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 23648004  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  23648005 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 23648104  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  23648105 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 23648146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 28325226 - 28324685
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  28325226 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 28325127  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28325126 cgcttttgaacttgtgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtttaaagag 28325027  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28325026 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 28324927  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28324926 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 28324827  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  28324826 tgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 28324727  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  28324726 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 28324685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 13121519 - 13122032
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13121519 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 13121618  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13121619 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaggag 13121718  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  13121719 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaac 13121818  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13121819 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 13121918  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  13121919 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttg 13122018  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  13122019 aatcttcagtttga 13122032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 14465448 - 14465961
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14465448 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14465547  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14465548 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaggag 14465647  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14465648 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaac 14465747  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14465748 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 14465847  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  14465848 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttg 14465947  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  14465948 aatcttcagtttga 14465961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 38314555 - 38315101
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  38314555 atacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagtttt 38314654  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38314655 ggcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggagtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaag 38314754  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38314755 agtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaaacagcttcaaattcattcccatcttgaagga 38314853  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38314854 acat-ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 38314952  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  38314953 aacgaaggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactt 38315052  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||| || || | || || |||||||||||||||||||    
T  38315053 tgaatcttcagtttggatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 38315101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20673560 - 20673033
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20673560 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaactcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 20673461  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673460 tatgtatatctctata--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 20673363  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  20673362 ctttgattatccaccagtgatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcagg 20673263  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |    
T  20673262 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagt 20673163  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20673162 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagttt 20673063  T
Q  512 gaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || || | | || ||| ||||||||||||||    
T  20673062 gatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 20673033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 38194581 - 38195123
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38194581 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 38194680  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194681 cgcttttaaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 38194780  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  38194781 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 38194880  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38194881 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 38194980  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  38194981 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 38195080  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  38195081 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38195123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 38205117 - 38205659
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38205117 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 38205216  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205217 cgcttttaaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 38205316  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  38205317 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 38205416  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38205417 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 38205516  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  38205517 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 38205616  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  38205617 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38205659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5628396 - 5627855
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5628396 atacaatacagaaaagactctagacttagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5628297  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628296 cgcttttaaacttgtgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5628197  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  5628196 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 5628097  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5628096 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5627997  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  5627996 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 5627897  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5627896 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 5627855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24383897 - 24383356
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24383897 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24383798  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24383797 cgcttttaaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24383698  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24383697 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24383598  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24383597 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24383498  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  24383497 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 24383398  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24383397 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 24383356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1784449 - 1783903
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1784449 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgcagaatcaaattgacagagttttg 1784350  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1784349 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 1784250  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1784249 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaa 1784151  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgt-tgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1784150 cat-ttctgcaggcatggctgtgtttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 1784052  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  1784051 aacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactt 1783952  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||| |||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  1783951 tgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 1783903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 14476078 - 14476593
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14476078 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14476177  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagata--atcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  14476178 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatataatcagcacgtctaagg 14476277  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |     
T  14476278 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtga 14476377  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14476378 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagtgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 14476477  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  14476478 aatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactt 14476577  T
Q  498 tggatcttcagtttga 513  Q
    || |||||||||||||    
T  14476578 tgaatcttcagtttga 14476593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11272762 - 11272220
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11272762 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 11272663  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272662 cgcttttgaacttatgtatatctatgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 11272563  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  11272562 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 11272463  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11272462 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 11272363  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  11272362 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 11272263  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  11272262 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 11272220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 18483901 - 18484443
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18483901 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 18484000  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18484001 cgcttttgaacttatatatctctatctaaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 18484100  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  18484101 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 18484200  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18484201 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 18484300  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  18484301 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 18484400  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  18484401 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 18484443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20684145 - 20683618
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20684145 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaactcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 20684046  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||| ||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684045 tatgtatatctctata--atcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtgaaagggacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 20683948  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  20683947 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcagg 20683848  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |    
T  20683847 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagt 20683748  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20683747 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagttt 20683648  T
Q  512 gaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || || | | || ||| ||||||||||||||    
T  20683647 gatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 20683618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24659757 - 24660298
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  24659757 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 24659856  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659857 tgcttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24659956  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24659957 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24660056  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24660057 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24660156  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  24660157 cgagagacaagagctcagagctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 24660256  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24660257 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 24660298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 8774514 - 8775056
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  8774514 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 8774613  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774614 cgcttttgaacttgtgtatatttctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 8774713  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  8774714 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 8774813  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8774814 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 8774913  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  8774914 atgagagacaagtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 8775013  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  8775014 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8775056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 8785099 - 8785641
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  8785099 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 8785198  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8785199 cgcttttgaacttgtgtatatttctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 8785298  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  8785299 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 8785398  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8785399 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 8785498  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  8785499 atgagagacaagtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 8785598  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  8785599 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8785641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24670337 - 24670878
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  24670337 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 24670436  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670437 tgcttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24670536  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24670537 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24670636  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24670637 aaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24670736  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  24670737 cgagagacaagagctcagagctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 24670836  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24670837 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 24670878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 35187234 - 35187775
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  35187234 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 35187333  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187334 cgcttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35187433  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  35187434 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 35187533  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35187534 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 35187633  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  35187634 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 35187733  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  35187734 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 35187775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 39382547 - 39383089
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39382547 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 39382646  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    |||||||| | || | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382647 cgcttttgtatttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39382746  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  39382747 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 39382846  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39382847 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 39382946  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  39382947 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 39383046  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  39383047 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 39383089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 4754182 - 4754720
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  4754182 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 4754281  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4754282 cgcttttaaacttatgtatctctctctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgag-taatcagcacgtctaaagag 4754380  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  4754381 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaa-aaataacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 4754479  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4754480 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 4754578  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  4754579 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 4754678  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4754679 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4754720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1794862 - 1794315
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaa-tttcta-agatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1794862 atacaatacaataaagactctagacttttaaatttctatagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 1794763  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1794762 ggcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaag 1794663  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1794662 agtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagga 1794564  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1794563 acat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 1794465  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | || ||   | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  1794464 taacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgatcgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacaactact 1794365  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| |||| |||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  1794364 ttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 1794315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 39371910 - 39372452
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39371910 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 39372009  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    |||||||| | || | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39372010 cgcttttgtatttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39372109  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  39372110 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 39372209  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39372210 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 39372309  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  39372310 atgagagacaagtgctcagtgttatctatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 39372409  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  39372410 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 39372452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 541
Target Start/End: Original strand, 10098925 - 10099465
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10098925 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 10099024  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| | | | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10099025 cgcttttgaacttatgtatctatgtctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10099124  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10099125 tcgtttgaaatcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10099224  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10099225 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10099323  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  | ||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  10099324 tgagaggcaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 10099423  T
Q  500 ga-tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtg 541  Q
     | | |||||||||| || | | || |||||||||||||||||    
T  10099424 aatttttcagtttgattaaaag-atcaaatgtagcttctggtg 10099465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13262050 - 13261541
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13262050 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacaaagttttg 13261951  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| | |   |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  13261950 acgctttttaacttgtatatctctatctacaatcaacaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattaacacgtctaaaga 13261851  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
     ||||| ||   ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13261850 ttcgtt-gagtccctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaa 13261752  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261751 ca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 13261653  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    || ||||||| | ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||     
T  13261652 cgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactacttta 13261553  T
Q  500 gatcttcagttt 511  Q
     |||||||||||    
T  13261552 aatcttcagttt 13261541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 13131761 - 13132275
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13131761 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 13131860  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttct-ctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    ||||| ||| ||   || ||||  || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13131861 cgcttctgaccta--atgtttcggctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaag 13131958  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  13131959 gagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtg 13132058  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13132059 aacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctat 13132158  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  13132159 taatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctact 13132258  T
Q  497 ttggatcttcagtttga 513  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13132259 ttgaatcttcagtttga 13132275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 27883239 - 27883784
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27883239 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagtttt 27883338  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |   ||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  27883339 ggcgctttt-aacttgtgttgatctctatctacaatcttcaagtctccactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgtttagcacgtctaa 27883437  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27883438 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaatcaatttcaaattcattcccatcttgaag 27883536  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27883537 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 27883635  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  27883636 taacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctgtcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 27883734  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  27883735 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 27883784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8996335 - 8995825
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  8996335 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 8996236  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  8996235 ggcgctttt-aacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgatatttttagcacgtctaa 8996137  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  8996136 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaag 8996038  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8996037 gaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 8995939  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||| ||||||||| | ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  8995938 taatgaaggacaaatactcagtgcttttaaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagcttct 8995840  T
Q  497 ttggatcttcagttt 511  Q
    ||| |||||||||||    
T  8995839 ttgaatcttcagttt 8995825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 1063994 - 1064539
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  ||||||||    
T  1063994 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggtagagtttt 1064093  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||    
T  1064094 ggcgctttt-aacttgtgtttatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagactttgagatttttagcacgtctaa 1064192  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1064193 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 1064291  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1064292 gaacat-ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 1064390  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | |  || ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  1064391 taacgaaggacaaatacctagtgctcttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 1064489  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  1064490 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 1064539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 16076785 - 16077294
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  16076785 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcaaagtttt 16076884  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  16076885 ggcgctttt-aacttgtattgatatctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagattttgagcacgtctaa 16076983  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16076984 agagtcgtt-gagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 16077082  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16077083 gaacat-tgctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 16077181  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  16077182 taacgaaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcattc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 16077280  T
Q  497 ttggatcttcagtt 510  Q
    ||| ||||||||||    
T  16077281 ttgaatcttcagtt 16077294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 9006887 - 9006377
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  9006887 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 9006788  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  9006787 ggcgctttt-aacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 9006689  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9006688 agattcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcgacttcaaattcattcccatcttgaag 9006590  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9006589 gaacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 9006491  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||| ||||||||| | ||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| || |||||||| ||    
T  9006490 taatgaaggacaaatactcagtgcttttaaaatgcccgttgatatctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgagattgaaacgaaaaacagcttct 9006392  T
Q  497 ttggatcttcagttt 511  Q
    ||| |||||||||||    
T  9006391 ttgaatcttcagttt 9006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 1053565 - 1054110
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1053565 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 1053664  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||| ||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  1053665 ggcactttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 1053763  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1053764 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 1053862  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1053863 gaacat-ttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 1053961  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  1053962 taacgaaggacaagtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 1054060  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  1054061 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 1054110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16671541 - 16671031
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  16671541 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 16671442  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  16671441 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgaaagagatgttgagatttttagcacgtctaa 16671343  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16671342 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaag 16671244  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16671243 gaaca-attctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaagagaaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 16671145  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  16671144 taacgaaggacaaatacccactgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcattcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 16671046  T
Q  497 ttggatcttcagttt 511  Q
    ||| |||||||||||    
T  16671045 ttgaatcttcagttt 16671031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8740504 - 8739959
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  8740504 atacaatgcaataaagactctagacttgggaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaa-gtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 8740406  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || || ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8740405 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtcacttgccaatcttcaagttttcactcctttatatagaagtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 8740307  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
     |||||||| |   |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  8740306 -gagtcgtt-gtgttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 8740209  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8740208 gagca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 8740110  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| || ||||| || ||    
T  8740109 taacgaaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttctttcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaacaactcct 8740011  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgatgt 548  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||||    
T  8740010 ttgaatcttcagtttaaatttaatgatcacttgtagcttctggtgatgatgt 8739959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 150 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18851919 - 18851524
Alignment:
Q  150 tttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgg 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18851919 tttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgg 18851821  T
Q  250 gcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaac 349  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18851820 gtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaac 18851722  T
Q  350 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18851721 agagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacatttactcagtgttttccaaatgaccgttgatacctcccttt 18851622  T
Q  450 caattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatat-atgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||||| ||||||||||||||    
T  18851621 caattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaatagctactttgaatcttcagattgaatattactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 18851524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 213 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16391780 - 16391447
Alignment:
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  16391780 ctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtactcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggtacacattctgcagg 16391681  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactg 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16391680 catagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatg 16391581  T
Q  413 ctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttg 512  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16391580 ctcagtgttatccaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacagctactttggatcttcagtttg 16391481  T
Q  513 aatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16391480 aatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 16391447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17281813 - 17281266
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  17281813 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgttttatagaatcaaatttggcagagtttt 17281714  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||  ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||| |||||    
T  17281713 ggcgctttt-aacttgtgttgatgcctcttgccaatcttcaagtcttcattcctttatatagaagtgtgaaagagacgttgagattttttagcatgtcta 17281615  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||    
T  17281614 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgccagatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattttcattttgaa 17281516  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17281515 ggaacat-ttctgcaggtatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 17281417  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttc-gttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||     
T  17281416 ataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcagttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctc 17281318  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  17281317 ctttgaatcgtcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 17281266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 16385932 - 16386251
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16385932 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 16386031  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386032 cgcttttaaacttatgtatctc-ctctgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 16386130  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16386131 tcgtatgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagattcaaattcattcccatcttgaaggaac 16386230  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgtt 322  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  16386231 at-ttctgcaggcatggctgtt 16386251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 546
Target Start/End: Original strand, 14581023 - 14581539
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctcttt 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| || ||| | ||||||||  |||||||| |||||||  || ||||| |    
T  14581023 gaatttctaagatatatcaaatcagtgaagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgtgcgctttt-aacttgtg-atgtctctct 14581120  T
Q  128 cttat-cttcaagtcttcact-cctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatcca 225  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14581121 cttgttcttcaagtcttcacttcctttatatggaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatcca 14581219  T
Q  226 ccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc 325  Q
    ||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  14581220 ccagtaatcttttgcctgatttggatgaagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaaattctgcaggtagagctgttgtc 14581319  T
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatcc 425  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| | | ||| ||| |      
T  14581320 ttgtcttgtagcgtggacaagaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaggacaagtacccagtgctttgt 14581419  T
Q  426 aaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatta 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||   || |    
T  14581420 aaatgaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaaaagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatca 14581518  T
Q  526 aatgtagcttctggtgatgat 546  Q
      |||||||||||||||||||    
T  14581519 cttgtagcttctggtgatgat 14581539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 2246222 - 2246767
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  2246222 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 2246321  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  2246322 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 2246420  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2246421 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 2246519  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2246520 ggaacat-ttatgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactct- 2246617  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   |  || ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||| || ||||| || |    
T  2246618 tcaatgaaggacaaacacctagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc-tcttagacgaggttaaaacgaaaaacaactcc 2246716  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  2246717 tttgaaactttagtttaaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgat 2246767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13199624 - 13199112
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  13199624 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcggtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 13199525  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  13199524 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcctgctaatcttcaagtcttcactcctttatacagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 13199426  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  13199425 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 13199327  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaa--cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13199326 ggatcat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 13199228  T
Q  394 tgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagct 493  Q
    | | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  13199227 t-tcaaagaaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctcccttttaattcatcgttc-tcttagacgaggttaaaacgaaaaacagct 13199130  T
Q  494 actttggatcttcagttt 511  Q
     ||||| | |||||||||    
T  13199129 cctttgaaacttcagttt 13199112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29933939 - 29933401
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  29933939 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 29933840  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    | ||||||| ||||||| | | | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||  |  ||||||||||    
T  29933839 gacgctttt-aacttgtgtttatatctctgtaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagactttgagattctttagcacgtcta 29933741  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaatt-agcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||  |  ||||||| |||||| |||||||    
T  29933740 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttga 29933642  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29933641 aggaacat-ttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 29933543  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||| |||||||| ||     
T  29933542 -tcaaagaaggacaagcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacaactc 29933451  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgat 543  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  29933450 ctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgat 29933401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29983093 - 29982555
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  29983093 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 29982994  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    | ||||||| ||||||| | | | ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||  |  ||||||||||    
T  29982993 gacgctttt-aacttgtgtttatatctctgtaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagactttgagattctttagcacgtcta 29982895  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaatt-agcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||  |  ||||||| |||||| |||||||    
T  29982894 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttga 29982796  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982795 aggaacat-ttctgcaggcagagctattgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 29982697  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||| |||||||| ||     
T  29982696 -tcaaagaaggacaagcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacaactc 29982605  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgat 543  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  29982604 ctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgat 29982555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 210 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16666295 - 16665996
Alignment:
Q  210 atcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgc 309  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  16666295 atcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaaca-attctgc 16666197  T
Q  310 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16666196 aggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 16666097  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     | | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  16666096 gtacccagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagt 16665998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29906560 - 29906020
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  29906560 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 29906461  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtct 194  Q
    | ||||||| ||||||| |  || ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  |||||||||    
T  29906460 gacgctttt-aacttgtgttgatatctctataa-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttagcacgtct 29906363  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||    
T  29906362 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttga 29906264  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29906263 aggaaaat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct 29906165  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   ||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||| |||||||||||     
T  29906164 -tcaaagaaggacaagcactccgtgctttacaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacagctc 29906073  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29906072 ctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgatgat 29906020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29947725 - 29947185
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  29947725 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 29947626  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtct 194  Q
    | ||||||| ||||||| |  || ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  |||||||||    
T  29947625 gacgctttt-aacttgtgttgatatctctataa-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttagcacgtct 29947528  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||    
T  29947527 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttga 29947429  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29947428 aggaaaat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct 29947330  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   ||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||| |||||||||||     
T  29947329 -tcaaagaaggacaagcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacagctc 29947238  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29947237 ctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgatgat 29947185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29996879 - 29996339
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  29996879 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 29996780  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtct 194  Q
    | ||||||| ||||||| |  || ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  |||||||||    
T  29996779 gacgctttt-aacttgtgttgatatctctataa-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttagcacgtct 29996682  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||    
T  29996681 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttga 29996583  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29996582 aggaaaat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct 29996484  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   ||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||| |||||||||||     
T  29996483 -tcaaagaaggacaagcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacagctc 29996392  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29996391 ctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgatgat 29996339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 272 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12567376 - 12567138
Alignment:
Q  272 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12567376 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 12567278  T
Q  372 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12567277 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagac 12567178  T
Q  472 aaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12567177 gaggttgaaacgagaaacaactactttaaatcttcagttt 12567138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 209 - 542
Target Start/End: Original strand, 16476343 - 16476676
Alignment:
Q  209 aatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctg 308  Q
    |||||| |||| |||||||||   |||| |||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||||||    
T  16476343 aatcctgtgattatccaccaaggatcctgtgcctgtttggggtgtagtcctttgaaggataagcttcaaattcattcccatggtgagtgtacaaattctg 16476442  T
Q  309 caggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaa-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 407  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  16476443 caggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagac 16476542  T
Q  408 aactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 507  Q
    || ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  16476543 aagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttca 16476642  T
Q  508 gtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  16476643 gtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 16476676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 15216446 - 15216174
Alignment:
Q  272 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15216446 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 15216348  T
Q  372 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  15216347 tacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaggtacccagtgctcttcaaatgatcgttgatacctcactttcaattcttcgttc-tcttagac 15216249  T
Q  472 aaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  15216248 gaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcgtcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 15216174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 289 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14321771 - 14321514
Alignment:
Q  289 tcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14321771 tcttgaaggaacat-ttctgcaggaagagttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 14321673  T
Q  389 aactctgttaacgaaggacaactgctcagagct-atccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaa 487  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  14321672 aactctgataacaaaggacaagtactcagtgttcttcaaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagatgaggttgaaacgacaa 14321573  T
Q  488 acagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |   ||||| |||||||||||||||||||    
T  14321572 acagctactttgaatcttcagtttaaattcactgattaattgtagcttctggtgatgat 14321514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 345 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16348669 - 16348467
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctc 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16348669 aaaacaaagtagtggaggtagtggttgcacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaagacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctc 16348570  T
Q  445 cctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaac-agctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgat 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||    
T  16348569 cctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgat 16348470  T
Q  544 gat 546  Q
    |||    
T  16348469 gat 16348467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 21735965 - 21736360
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  21735965 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 21736064  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||| |  || ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  21736065 gggcgctttt-aacttgtgttgatatctctat-tgatcttcaagtcttcactcctttaaatagtggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtct 21736162  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||     
T  21736163 aaagtgtcgtt-gagttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgt 21736261  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     || ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21736262 gggaaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 21736360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15663085 - 15662690
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||  |||| |||||||||    
T  15663085 atacaatgcaatacagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctgtttagaatcaaatttggcagagtttt 15662986  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15662985 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggcgactagagagacgttgagatttttagcacgtcta 15662887  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || |||||    
T  15662886 aagggtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaa 15662788  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    || | | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15662787 gg-aaaaattctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15662690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15651450 - 15651055
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||  |||| |||||||||    
T  15651450 atacaatgcaatacagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctgtttagaatcaaatttggcagagtttt 15651351  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||| ||||| ||||||| |  || ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||  || | | | |||||| |||||||  | ||||||||||    
T  15651350 ggcactttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatataatggcgagtagagagacattgagatttttagcacgtcta 15651252  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| || |||||    
T  15651251 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctattttgaa 15651153  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    || | | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651152 gg-aaaaattctgtaggcagagctgttgtcttttcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15651055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 542
Target Start/End: Original strand, 16493245 - 16493435
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  16493245 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttc 16493344  T
Q  451 aattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  16493345 aattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 16493435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51989513 - 51989128
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |    
T  51989513 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-a 51989415  T
Q  110 acttgtatatttctcttt-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||     
T  51989414 acttgttgtattgtctttgctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttg 51989315  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
      || |||| |||||   ||||||  || ||| ||||||||||  || ||||| | |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||    
T  51989314 agaaacctt-gatcaaataccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttc 51989217  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51989216 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaaacagattcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 51989128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31114354 - 31113971
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||  |||| || ||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  31114354 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattaacacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgggcgctttt-aa 31114256  T
Q  111 cttgt-atatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||| ||| | |||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||   | | |||||||||||||||||||     
T  31114255 cttgttataatgtctctc-ctgatcttcaagtcttcactcctttttatagaggtgtgtagagaaacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt- 31114158  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
    || | ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||    
T  31114157 gagaacctttgatcattcaacattaatcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaaaccattcctaacttgaaggaacat-ttc 31114059  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114058 tgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 31113971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 394
Target Start/End: Original strand, 27172717 - 27173082
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgt-atatttctctt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||     
T  27172717 gaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgtgatatgtctcta 27172815  T
Q  127 tcttatcttcaagtcttcact-cctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatc 223  Q
     |  ||||||||||||||||| ||||||||||| || | | | ||||||||||||||  ||  ||||   || |||||||||   || ||||||||| |     
T  27172816 cca-atcttcaagtcttcacttcctttatataggggagagtagagagacgttgagattttcttgcac---tatagagtcgttgagaaacctttgatcttt 27172911  T
Q  224 caccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 323  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||| |||||||     
T  27172912 caccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcctatcttgaaagaaca-aatctgcaggcagagctgtta 27173010  T
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagag-tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |  ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27173011 tcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactct 27173082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 394
Target Start/End: Original strand, 10529132 - 10529401
Alignment:
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||| ||   || |||| |||||      
T  10529132 ttctgatcttcaagtcttcactcctttatacagagatgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcattgagaaacctt-gatcaaa 10529230  T
Q  224 caccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 323  Q
     ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||     
T  10529231 taccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttt 10529329  T
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10529330 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 10529401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14322069 - 14321962
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14322069 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagagcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 14321970  T
Q  100 gcgctttt 107  Q
    ||||||||    
T  14321969 gcgctttt 14321962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 391
Target Start/End: Original strand, 51340800 - 51341063
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||    
T  51340800 ttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagattcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcac 51340897  T
Q  227 caatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-c 325  Q
    ||||  || ||||||||||||||  || || || ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| |||||| |||| ||||||| | |    
T  51340898 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcgggcagagctgtttttc 51340996  T
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 391  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51340997 ttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 51341063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 15833197 - 15833459
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||| | |  |||||||  |||||    
T  15833197 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaatagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgacacc--ttgatcaatcacca 15833294  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  15833295 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctat--tgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 15833391  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15833392 gtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 15833459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 15850800 - 15851065
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagc-acgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  | | | ||||| | ||||||||| ||| | |  |||||||  |||||    
T  15850800 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcattgagatctttaaccacgtcaatagagtcgttgtgacacc--ttgatcaatcacca 15850897  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||| || | |||    
T  15850898 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctggaggcagagctatttttctt 15850996  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtgg-ttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15850997 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtttgtacactttgtactttgtcaactct 15851065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 359
Target Start/End: Original strand, 49990052 - 49990280
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||  |||||    
T  49990052 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ctttgatcaatcacca 49990149  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  49990150 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagctgtttttctt 49990248  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtgg 359  Q
    ||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  49990249 gtcttgtagcgtagacataagcagagtagtgg 49990280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 349 - 542
Target Start/End: Original strand, 16487098 - 16487290
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 448  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||  |||||  |||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16487098 cagagtagtggaggtactggttgaacacttgtagtgtgtcaactctattgacgagagacaagagctcagtggtatccatatatccgttgatacctccctt 16487197  T
Q  449 tcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  16487198 tcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 16487290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 13148057 - 13148321
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  13148057 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 13148154  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| || ||||    
T  13148155 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggtagagctgtttttctt 13148253  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||  || |||  |  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13148254 gtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13148321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 22151037 - 22151301
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||  || ||    
T  22151037 atcttcaagttttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ctttgatcaaacagca 22151134  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  22151135 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 22151233  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| || |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22151234 gtcttgtagcgtagacacaagcagaatcgtggaggtagtggttgtacgctttgtactttgtcaactct 22151301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 41045534 - 41045797
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| ||| |||| |||   || |||| |||||   |||    
T  41045534 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaaagagttgttgagaaacctt-gatcaat-acc 41045631  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt 327  Q
    |||  |  ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  41045632 aattattttttgcatgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatctt 41045730  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41045731 gtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 41045797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45861942 - 45861693
Alignment:
Q  130 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaa-agagtcgttt-gaaatcctttgatcatccac 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| || |||||||||  ||||||  |||||||  |||    
T  45861942 tatctttaagtcttgactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaatagagtcgttcagaaatc--ttgatcaatcac 45861845  T
Q  227 caatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtct 326  Q
    ||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |    
T  45861844 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttt 45861746  T
Q  327 t-gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    | ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45861745 ttgtcttgtagcgtagacataaacatagtagtggaggtagtggtcgtacactt 45861693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12752990 - 12752727
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||   | |||||||| | | ||||||| |||||  | |||||||  |||    
T  12752990 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagattcattgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcac 12752893  T
Q  227 caatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtc 325  Q
    ||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||  |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||| || ||    
T  12752892 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaatgatcacgttcaaagccattcctattctgaaggaacat-ttttgcaggcagagctgtttttc 12752794  T
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaac 391  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12752793 ttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagatagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 12752727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47405784 - 47405542
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  47405784 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagacgttgtgaattgtcagcatatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 47405687  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  47405686 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 47405588  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47405587 gtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 47405542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 394
Target Start/End: Original strand, 17021975 - 17022082
Alignment:
Q  288 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtacttt 385  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17021975 atcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtacttt 17022073  T
Q  386 gtcaactct 394  Q
    |||||||||    
T  17022074 gtcaactct 17022082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 2560984 - 2561226
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || ||| |  ||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  2560984 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 2561081  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||  || |  |||||||||||||||||  |||||| ||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||    
T  2561082 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggtagagctgtttttcttgtctt 2561180  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561181 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2561226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 181
Target Start/End: Original strand, 17017687 - 17017841
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctct- 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||||||||  ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||    || |||     
T  17017687 gaatttctaagatatatcaaatgagcacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtcttgtctc 17017785  T
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17017786 ttatgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagat 17017841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 28581902 - 28582144
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  28581902 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 28581999  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||| | |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||| ||    
T  28582000 cttttgcctgctatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtttt 28582098  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582099 gtaccagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 28582144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 6253210 - 6253256
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6253210 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 6253256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13410416 - 13410370
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13410416 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13410370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14077718 - 14077672
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14077718 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 14077672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Original strand, 17006985 - 17007035
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17006985 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagat 17007035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Original strand, 17961419 - 17961543
Alignment:
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||  | ||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||    
T  17961419 tcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaaca-aatctgca 17961517  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtag 336  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  17961518 ggcagagctgttttcttgtcttgtag 17961543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Original strand, 18006364 - 18006488
Alignment:
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||  | ||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||    
T  18006364 tcctttgatcatccaccagtgatctgttgcctgatttggatgcagtcctttgcataatcaacttcaaattcattgctatcttgaaggaaca-aatctgca 18006462  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtag 336  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  18006463 ggcagagctgttttcttgtcttgtag 18006488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11909393 - 11909145
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||| || | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||    
T  11909393 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcaccaa 11909296  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttggg-cgtagtcctttgaagaat-tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtct 326  Q
    |  || ||||||| |||||||  || ||||| ||||| ||  |  ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  11909295 tgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 11909197  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11909196 tgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacactt 11909145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38178006 - 38177764
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  38178006 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 38177909  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||| ||||| |||   | ||||| ||||| || |  |||||||  |||| |||  |||||| ||||  | |||||||| || || || |||||||||    
T  38177908 cttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattctcattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagttgtttttcttgtctt 38177810  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177809 gtagcagagtcaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 38177764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49553852 - 49553610
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||| ||| || ||  |||||||||||  |  |||||||||  |||||||  |    
T  49553852 aagtcttcactcctttatataggggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcaacacatcaaaatagagtcgtttg--acgctttgatcaatcaccaatgat 49553755  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||| ||||  | ||||| || || || || || ||||||    
T  49553754 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcagacaaagttgtttttcctgtctt 49553656  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49553655 gtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 49553610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 12396857 - 12396903
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12396857 atcttcaagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagagacgttg 12396903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16794650 - 16794604
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16794650 atcttcaagtcttcactcctttatgtagaggtgtgaaagagacgttg 16794604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 27374554 - 27374600
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374554 atcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 27374600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 12968099 - 12968144
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12968099 tcttcatgtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12968144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 14955224 - 14955265
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955224 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 14955265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 20645949 - 20646192
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtcta---aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || |   ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||      
T  20645949 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaataagagtcatttgaa--gctttgatcaatcaccaatga 20646046  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtct 331  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||   || ||| |||| |  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  20646047 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacat-tgttgcaggcagaactgttattcttgtct 20646145  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646146 tgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 20646192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Original strand, 37412571 - 37412640
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37412571 tgcaggcatagctgttttacttgtcttgtagtgaagacagaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 37412640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 2784862 - 2784902
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2784862 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 2784902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8729356 - 8729308
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8729356 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacattgag 8729308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9081243 - 9081195
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9081243 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacattgag 9081195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 11223361 - 11223401
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11223361 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 11223401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12389235 - 12389195
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12389235 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12389195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12726593 - 12726553
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726593 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12726553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12963448 - 12963408
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12963448 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12963408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 13948132 - 13948172
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13948132 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13948172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17239285 - 17239245
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17239285 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 17239245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18121975 - 18121935
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121975 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18121935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19249775 - 19249735
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19249775 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21637032 - 21636992
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21637032 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 21640664 - 21640704
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640664 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21640704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 37467129 - 37467169
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37467129 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 37467169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 40850774 - 40850814
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40850774 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 40850814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49643125 - 49643085
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49643125 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 49643085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49666767 - 49666727
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49666767 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 49666727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 52920204 - 52920244
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52920204 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 52920244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Original strand, 13653718 - 13653757
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13653718 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 13653757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 21317192 - 21317239
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21317192 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgttga 21317239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 10851599 - 10851645
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10851599 atcttcaagtcttcactcctttatattgaggtgtgaaagagatgttg 10851645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12726405 - 12726351
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726405 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12726351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 16879807 - 16879853
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16879807 atcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttg 16879853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 20418023 - 20418069
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20418023 atcttcaagtctacactcctttatatagacgtgtgaaagagacgttg 20418069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24775895 - 24775655
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  |||||||  |     
T  24775895 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga-atttccagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatt 24775798  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 333  Q
    |||||||| || | |   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24775797 ctttgcctaatat-gttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttacttgtcttg 24775700  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24775699 tagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacactt 24775655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 33583027 - 33583267
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  |||||||  ||    
T  33583027 agtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga-atttccaggacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatc 33583124  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||   | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  33583125 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacat-tgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttg 33583223  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33583224 tagcagagac-aaaatagagtattggaggtagtggttgtacactt 33583267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Original strand, 37412397 - 37412447
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37412397 atcttcaggtcttcactcctttatatagtggtgtgaaaaagacgttgagat 37412447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 40799807 - 40799912
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40799807 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 40799905  T
Q  372 tacactt 378  Q
    |||||||    
T  40799906 tacactt 40799912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 47207690 - 47207744
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207690 tcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53056902 - 53056848
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53056902 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 53056848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 6090733 - 6090770
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090733 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6090770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 11868270 - 11868307
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11868270 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11868307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12389030 - 12388993
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12389030 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12388993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 176
Target Start/End: Original strand, 13699157 - 13699202
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13699157 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgtt 13699202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 16032526 - 16032563
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032526 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16032563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25398413 - 25398376
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398413 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25398376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 178
Target Start/End: Original strand, 5213378 - 5213414
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213378 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 5213414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11206452 - 11206408
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagac-tttgaatttctaagatgta 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11206452 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgta 11206408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 170
Target Start/End: Original strand, 17697402 - 17697438
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697402 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 17697438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18143107 - 18143067
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18143107 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttg 18143067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20627795 - 20627755
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20627795 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 20627755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 20724884 - 20724924
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20724884 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 20724924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22804385 - 22804349
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22804385 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 22804349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25398619 - 25398579
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398619 caagacttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 25398579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46350206 - 46350166
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46350206 aagtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 46350166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46796560 - 46796488
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46796560 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 46796488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 173
Target Start/End: Original strand, 16812010 - 16812045
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16812010 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 16812045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 40799670 - 40799709
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40799670 agtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttg 40799709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 5213562 - 5213615
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213562 tcttgtcttgtagcatagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 16882078 - 16882124
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16882078 atctttaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttg 16882124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17762461 - 17762415
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17762461 atcttcaagtcttcattccttcatatagaggtatgaaagagacgttg 17762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18121797 - 18121743
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121797 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18142927 - 18142873
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142927 tcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18142873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19063781 - 19063735
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19063781 atcttcaagtcttcattccttcatatagaggtatgaaagagacgttg 19063735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21605829 - 21605775
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21605829 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21605775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21606014 - 21605976
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21606014 tcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttga 21605976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 22140748 - 22140802
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22140748 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 22140802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 29855413 - 29855447
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855413 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29855447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7833007 - 7832970
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7833007 atcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaa 7832970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 13823877 - 13823914
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823877 tcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13823914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 14955432 - 14955465
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955432 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14955465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16199793 - 16199752
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16199793 caagtgttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 16199752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 428 - 505
Target Start/End: Original strand, 18006570 - 18006646
Alignment:
Q  428 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatctt 505  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18006570 atgaccgttgatatcttccttgcaattcttcgttcttc-tagacgagattgaaacgagaaacagctcctttgaatctt 18006646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21636828 - 21636791
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21636828 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21636791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26418035 - 26417998
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26418035 tcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 26417998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30054410 - 30054341
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30054410 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtaca 30054341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1728208 - 1728136
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1728208 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 1728136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14393367 - 14393327
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14393367 aagttttcactcctttatatagaggtgtgtaagagacgttg 14393327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23538527 - 23538487
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23538527 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagaaacgttg 23538487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Original strand, 27851324 - 27851380
Alignment:
Q  121 tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27851324 tctctttttaatcttcaagtcttcattcctttatatagatgtatgaaagatacgttg 27851380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29951801 - 29951765
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29951801 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagac 29951765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30000955 - 30000919
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30000955 aagtcttcactcctttatatagaggtgtggaagagac 30000919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46796725 - 46796689
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46796725 ttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttga 46796689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 47207501 - 47207541
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47207501 aagtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagacgttg 47207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53057090 - 53057050
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  53057090 agtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagatacgttga 53057050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7921077 - 7921030
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7921077 atcttcaagtcttcaatcctttatatagaggttgaaaagagacgttga 7921030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 173
Target Start/End: Original strand, 11868065 - 11868100
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11868065 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagac 11868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 177
Target Start/End: Original strand, 14969168 - 14969203
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14969168 ttcactcctttatatagaggtgtcaaagagacgttg 14969203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19198248 - 19198213
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19198248 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtga 19198213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19658345 - 19658302
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19658345 ttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagatgttg 19658302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 165
Target Start/End: Original strand, 13954043 - 13954077
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13954043 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg 13954077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20627586 - 20627552
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20627586 aaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 20627552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 177
Target Start/End: Original strand, 31303192 - 31303222
Alignment:
Q  147 tcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31303192 tcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 31303222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 1464074 - 1464119
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1464074 tcttcaagtcttcatttctttatatggaggtatgaaagagacgttg 1464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 378
Target Start/End: Original strand, 2785073 - 2785102
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785073 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 11223568 - 11223601
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11223568 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 11223601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 12968311 - 12968344
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12968311 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12968344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 21640868 - 21640905
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21640868 gacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacactt 21640905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 167
Target Start/End: Original strand, 29855205 - 29855234
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855205 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaa 29855234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Original strand, 10851811 - 10851855
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  10851811 aaaaacagagtagtggagatggtggttgtacaattgtactatgtc 10851855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16658811 - 16658739
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16658811 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 16658739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16658982 - 16658942
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16658982 aagttttcagtcctttatatagaagtgtgaaagagacgttg 16658942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 383
Target Start/End: Original strand, 16880026 - 16880058
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16880026 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 16880058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19889303 - 19889267
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19889303 tcttcaatccattatatagaggtgtgaaagagacgtt 19889267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49642955 - 49642883
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49642955 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 49642883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49666598 - 49666526
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49666598 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacactt 49666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 50300030 - 50300070
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  50300030 agtcttcactcctttatatagatgtgtaaaagagatgttga 50300070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 52920372 - 52920444
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  52920372 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatactt 52920444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 5022612 - 5023156
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5022612 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaattagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 5022711  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022712 cgcttttgaacttgtatatatctatctattatcttcaagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5022811  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5022812 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagctccaaattcattcccatcttaaaggcac 5022911  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022912 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 5023010  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023011 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 5023110  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5023111 atcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 5023156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18078290 - 18077744
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18078290 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 18078191  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18078190 gcgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 18078091  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078090 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 18077991  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077990 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 18077891  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077890 cgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 18077791  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  18077790 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 18077744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40454724 - 40454187
Alignment:
Q  8 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40454724 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 40454625  T
Q  108 gaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
     ||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454624 taacttgtgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 40454525  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40454524 aaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatct 40454425  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454424 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 40454326  T
Q  408 aactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 507  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454325 aaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 40454226  T
Q  508 gtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  40454225 gtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 40454187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40470963 - 40470426
Alignment:
Q  8 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40470963 acaataaagtctctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 40470864  T
Q  108 gaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
     ||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470863 taacttgtgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 40470764  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40470763 aaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatct 40470664  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470663 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 40470565  T
Q  408 aactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 507  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470564 aaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 40470465  T
Q  508 gtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  40470464 gtttgaatttacagattaaatgtagcttctggtgatgat 40470426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 546
Target Start/End: Original strand, 25657019 - 25657557
Alignment:
Q  8 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25657019 acaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 25657118  T
Q  108 gaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
     ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657119 taacttatgtatatctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 25657218  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25657219 aaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattct 25657318  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc-tgttaacgaagga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25657319 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactcttgttaacgaagga 25657417  T
Q  407 caactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttc 506  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657418 caaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctctctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttc 25657517  T
Q  507 agtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  25657518 agtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 25657557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18752873 - 18752362
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18752873 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 18752774  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752773 cgcttttgaacttgtatgtttctctctcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 18752674  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752673 tcgtttgaaatccattgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 18752574  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752573 aaattctgcaggcatagctgttgccttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 18752475  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||      
T  18752474 gaaggacaaatgcttagagcaattcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttctacttagataaggctgaatggagaatcggctactttaa 18752375  T
Q  501 atcttcagtttga 513  Q
    |||||||| ||||    
T  18752374 atcttcagattga 18752362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18763483 - 18762972
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18763483 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 18763384  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763383 cgcttttgaacttgtatgtttctctctcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 18763284  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763283 tcgtttgaaatccattgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 18763184  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763183 aaattctgcaggcataactgttgccttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 18763085  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||      
T  18763084 gaaggacaaatgctcagagctattcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttatacttagataaggctgaatggagaatcggctactttaa 18762985  T
Q  501 atcttcagtttga 513  Q
    |||||||| ||||    
T  18762984 atcttcagattga 18762972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 10909283 - 10909798
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10909283 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 10909382  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10909383 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 10909482  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909483 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 10909582  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909583 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 10909682  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  10909683 cgaaggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttg 10909782  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  10909783 aatcttcagtttgaat 10909798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27815329 - 27814788
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27815329 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27815230  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815229 cgcttttgaacttgtatatctctatgtcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27815130  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27815129 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 27815030  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27815029 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacataaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27814930  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  27814929 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgtttatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 27814830  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  27814829 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 27814788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 4987149 - 4987694
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4987149 atacattacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 4987248  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4987249 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 4987348  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987349 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 4987447  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4987448 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctcttaa 4987547  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4987548 cgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 4987647  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  4987648 aatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctggtgatgat 4987694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14836486 - 14835942
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14836486 atacaatacaataaagactataaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 14836387  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14836386 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 14836287  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14836286 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggca 14836188  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836187 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 14836089  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14836088 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattattcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 14835989  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  14835988 gatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 14835942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 48371007 - 48371548
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48371007 atacaatacaataaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 48371106  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48371107 cgcttttgaacttatatatttctatcttcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 48371206  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48371207 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 48371306  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48371307 aaattatgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 48371406  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  48371407 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacccccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 48371506  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  48371507 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 48371548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 3370591 - 3371135
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  3370591 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 3370690  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  3370691 gcgtttttgaacttgtatatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 3370790  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3370791 gtcgtt-gagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 3370889  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3370890 caaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 3370989  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3370990 cgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 3371089  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3371090 gatcttcagtttaaata-acgaattaattgtagcttctggtgatgat 3371135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 3390331 - 3390875
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  3390331 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 3390430  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  3390431 gcgtttttgaacttgtatatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 3390530  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390531 gtcgtt-gagtttctttgatcacccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 3390629  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390630 taaattctgcatgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 3390729  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3390730 cgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttcttagacgaggttgaaataagaaacagctactttg 3390829  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  3390830 gatcttcagtttaaata-acgaattaattatagcttctggtgatgat 3390875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30937456 - 30936915
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30937456 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 30937357  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937356 cgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 30937257  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  30937256 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 30937157  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30937156 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 30937057  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  30937056 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 30936957  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  30936956 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 30936915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 4948213 - 4948752
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4948213 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 4948312  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948313 cgcttttgaacttatgtatttctgtatc--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 4948410  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  4948411 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtggtcatttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 4948510  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4948511 atattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 4948610  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  4948611 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 4948710  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4948711 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4948752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 461033 - 461574
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  461033 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaattgacagagttttgg 461132  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461133 cgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 461232  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  461233 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 461332  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  461333 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 461432  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  461433 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 461532  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  461533 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 461574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14844037 - 14843496
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14844037 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14843938  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14843937 cgcttttgaacttatgtatatctctatttaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14843838  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14843837 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 14843738  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14843737 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 14843638  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  14843637 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 14843538  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  14843537 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 14843496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 17928576 - 17929117
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17928576 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17928675  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928676 cgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17928775  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17928776 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17928875  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17928876 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaa 17928975  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  17928976 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 17929075  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  17929076 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 17929117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24028469 - 24027928
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24028469 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24028370  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028369 cgcttttgaacttatgtatatctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24028270  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24028269 tcgtttgaaatcctttgataatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24028170  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24028169 aaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24028070  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24028069 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 24027970  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24027969 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 24027928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 52703664 - 52704205
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  52703664 atacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaattgacagagttttgg 52703763  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703764 cgcttttgaacttatgtatttctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 52703863  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  52703864 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 52703963  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52703964 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 52704063  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  52704064 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 52704163  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  52704164 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 52704205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 10695516 - 10696029
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10695516 atacaatacaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 10695615  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| | |    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10695616 gcgctttttaacttgtatgtctctatctacattcttcaaatcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 10695715  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10695716 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctcgaaggaa 10695814  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695815 ca-attctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 10695913  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  10695914 cgaaggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttg 10696013  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  10696014 aatcttcagtttgaat 10696029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 546
Target Start/End: Original strand, 16317210 - 16317751
Alignment:
Q  5 aatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16317210 aatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcatattgacagagttttggcgc 16317309  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||| ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16317310 tttttaacttgtgtatatctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg 16317409  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    || ||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16317410 tt-gatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat- 16317507  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16317508 ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacga 16317607  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
    ||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  16317608 aggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaat 16317707  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  16317708 cttcagtttaaatttatggatcaattgtagcttctggtgatgat 16317751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47152462 - 47151949
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47152462 atacaatacaataaagactctaaacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 47152363  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47152362 gcgctttttaacttgtatgtctctatctgcattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 47152263  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47152262 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaa 47152164  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152163 ca-attctgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 47152065  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  47152064 cgaaggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactttg 47151965  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  47151964 aatcttcagtttgaat 47151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 450452 - 450993
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  450452 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 450551  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450552 cgcttttgaacttatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 450651  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  450652 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 450751  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  450752 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 450851  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  || || ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  450852 cgagagataagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 450951  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  450952 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 450993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 17917928 - 17918469
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17917928 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17918027  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| | | | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918028 cgcttttgaacttgtgtatctttatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17918127  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17918128 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17918227  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17918228 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaa 17918327  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  17918328 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 17918427  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  17918428 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 17918469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30926866 - 30926337
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30926866 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 30926767  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30926766 tatgtatctctctatttaatcttcaagtcttcactcatttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 30926667  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  30926666 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagctttaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcagg 30926567  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |    
T  30926566 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 30926467  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30926466 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagttt 30926367  T
Q  512 gaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || || | | || ||| ||||||||||||||    
T  30926366 gatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 30926337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 546
Target Start/End: Original strand, 16304986 - 16305527
Alignment:
Q  5 aatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16304986 aatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 16305085  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||| ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16305086 tttttaacttgtgtatatctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg 16305185  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    || ||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  16305186 tt-gatttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggaacat- 16305283  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16305284 ttctgcaggcatggttgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatactttgtcaactctgttaacga 16305383  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
    ||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  16305384 aggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaat 16305483  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  16305484 cttcagtttaaatttatggatcaattgtagcttctggtgatgat 16305527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15561463 - 15560922
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15561463 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 15561364  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561363 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 15561264  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  15561263 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 15561164  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15561163 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 15561064  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  15561063 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 15560964  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  15560963 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 15560922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 16266347 - 16266879
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16266347 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 16266446  T
Q  113 tgtatattt-ctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 209  Q
    | | ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266447 tatgtattttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 16266546  T
Q  210 atcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgc 309  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  16266547 atcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgc 16266646  T
Q  310 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 408  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  16266647 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 16266746  T
Q  409 actgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcag 508  Q
    | ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16266747 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcag 16266846  T
Q  509 tttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  16266847 tttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 16266879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36018212 - 36018753
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  36018212 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 36018311  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018312 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36018411  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36018412 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 36018511  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36018512 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36018611  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  36018612 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 36018711  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36018712 aatcttcagtttgattaaaag-atcaaatgtagcttctggtga 36018753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36028765 - 36029306
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  36028765 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 36028864  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028865 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36028964  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36028965 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 36029064  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36029065 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36029164  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  36029165 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 36029264  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36029265 aatcttcagtttgattaaaag-atcaaatgtagcttctggtga 36029306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19944709 - 19944170
Alignment:
Q  3 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19944709 acaatacagtaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 19944610  T
Q  103 cttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 202  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944609 cttttgaacttatgtatctctctctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 19944510  T
Q  203 gtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 302  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  19944509 atttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtacaa 19944410  T
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19944409 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttatagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacg 19944310  T
Q  402 aaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 501  Q
    |  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||| ||||||||||| |    
T  19944309 agagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccctttcaattcttcgttcttcttggaaaagactgaattgagaatcagctactttgaa 19944210  T
Q  502 tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  19944209 tcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 19944170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 5873246 - 5873790
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  5873246 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagggttttg 5873345  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5873346 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 5873445  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5873446 gtcgtt-gagttccttggatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaatttcattcccatcttgaaggaa 5873544  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5873545 cat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatgttaa 5873643  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5873644 tgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactactttg 5873743  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     |||||||| || ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  5873744 aatcttcagcttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 5873790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 22006887 - 22007428
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22006887 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttataagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttgg 22006986  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006987 cgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22007086  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22007087 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 22007186  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22007187 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaa 22007286  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| |||||||||||    
T  22007287 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgcgaatcagctactttg 22007386  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22007387 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22007428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 55745636 - 55745095
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55745636 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 55745537  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745536 cgcttttaaacttatgtatttctctgtcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 55745437  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  55745436 tcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 55745337  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55745336 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 55745237  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  55745236 tgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 55745137  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  55745136 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 55745095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 55756247 - 55755706
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55756247 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 55756148  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55756147 cgcttttaaacttatgtatttctctgtcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 55756048  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  55756047 tcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 55755948  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55755947 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 55755848  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  55755847 tgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 55755748  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  55755747 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 55755706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19955344 - 19954805
Alignment:
Q  3 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19955344 acaatacagtaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 19955245  T
Q  103 cttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 202  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955244 cttttgaacttatgtatctctctctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 19955145  T
Q  203 gtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||     
T  19955144 gtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgaacgtacaa 19955045  T
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19955044 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacg 19954945  T
Q  402 aaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 501  Q
    |  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||| ||||||||||| |    
T  19954944 agagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccctttcaattcttcgttcttcttggaaaagactgaattgagaatcagctactttgaa 19954845  T
Q  502 tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  19954844 tcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 19954805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27656476 - 27657018
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27656476 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27656575  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656576 cgcttttgaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27656675  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  27656676 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 27656775  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27656776 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 27656875  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  27656876 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 27656975  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27656976 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27657018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27667049 - 27667591
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27667049 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27667148  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667149 cgcttttgaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggggtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27667248  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  27667249 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 27667348  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27667349 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 27667448  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  27667449 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 27667548  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27667549 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27667591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 16255754 - 16256286
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16255754 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 16255853  T
Q  113 tgtatattt-ctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 209  Q
    | | ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16255854 tatgtattttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtttaaagagtcgtttgaa 16255953  T
Q  210 atcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgc 309  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||    
T  16255954 atcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaagttctgc 16256053  T
Q  310 aggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaca 408  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  16256054 aggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagaca 16256153  T
Q  409 actgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcag 508  Q
    | ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16256154 agtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcag 16256253  T
Q  509 tttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  16256254 tttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 16256286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 21996289 - 21996830
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21996289 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttataagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttgg 21996388  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996389 cgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 21996488  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21996489 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 21996588  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21996589 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaa 21996688  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| |||||||||||    
T  21996689 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgcgaatcagctactttg 21996788  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  21996789 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 21996830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 49518011 - 49518552
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49518011 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 49518110  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49518111 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 49518210  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  49518211 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 49518310  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49518311 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 49518410  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  49518411 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 49518510  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  49518511 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 49518552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10751552 - 10751011
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  10751552 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 10751453  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751452 cgcttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10751353  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10751352 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10751253  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10751252 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10751153  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  10751152 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 10751053  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  10751052 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 10751011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10965321 - 10964780
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  10965321 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 10965222  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965221 cgcttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10965122  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10965121 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10965022  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10965021 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10964922  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  10964921 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 10964822  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  10964821 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 10964780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18130623 - 18130083
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18130623 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 18130524  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130523 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 18130424  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  18130423 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 18130324  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18130323 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 18130224  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  18130223 cgagagacaagagctcagtgctatccatat-atccttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 18130125  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  18130124 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 18130083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 19581116 - 19581630
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  19581116 atacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatataccaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgatagagtttt 19581215  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  19581216 ggcgcttttaaatttgtat--ttctctatcttcattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaa 19581313  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19581314 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 19581412  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19581413 gaacat-ttctgcaggcatggctgttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 19581511  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    |||| |||||||| | ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||    
T  19581512 taacaaaggacaagtactcagtgttttccaaatgatcgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactact 19581611  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaat 515  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19581612 ttgaatcttcagtttgaat 19581630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10740978 - 10740437
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  10740978 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgaccgagttttgg 10740879  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10740878 cgcttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10740779  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10740778 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10740679  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10740678 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10740579  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  10740578 cgagagacaagagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 10740479  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  10740478 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 10740437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 10954747 - 10954206
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  10954747 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgaccgagttttgg 10954648  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10954647 cgcttttaaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10954548  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10954547 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10954448  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10954447 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10954348  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  10954347 cgagagacaagagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 10954248  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  10954247 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 10954206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24640124 - 24640665
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  24640124 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaattgacagagttttgg 24640223  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24640224 cgcttttgaacttatgtatgtctctgtaa-atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24640322  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  24640323 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 24640422  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24640423 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 24640522  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  24640523 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 24640622  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  24640623 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 24640665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Original strand, 24713314 - 24713816
Alignment:
Q  9 caataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24713314 caataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagttttggcgcttt 24713413  T
Q  107 tgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgt 204  Q
    | ||||||| |   ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24713414 t-aacttgtgttgatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgt 24713512  T
Q  205 ttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 304  Q
    | ||  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  24713513 t-gagttcctttgatcatctaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-t 24713610  T
Q  305 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaag 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24713611 tctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtg-acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaag 24713709  T
Q  405 gacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatct 504  Q
    ||||| | ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  24713710 gacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacaagaaacaactactttgaatct 24713809  T
Q  505 tcagttt 511  Q
    |||||||    
T  24713810 tcagttt 24713816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 11535720 - 11536265
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  11535720 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 11535819  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  11535820 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 11535918  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11535919 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 11536017  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11536018 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 11536116  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  11536117 taacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 11536215  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  11536216 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 11536265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 546
Target Start/End: Original strand, 10300413 - 10300954
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggc 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  10300413 caatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggc 10300512  T
Q  102 gcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  10300513 gctttt-aacttgtgttgatgtctctccca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaaga 10300610  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10300611 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaa 10300709  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10300710 cat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataa 10300808  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| |||||    
T  10300809 cgaaggacaaatactcaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattctttgttcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttg 10300907  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  10300908 aatcttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 10300954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 11514910 - 11515420
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  11514910 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 11515009  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  11515010 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcattaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 11515108  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  11515109 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaag 11515207  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  11515208 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgttaactctga 11515306  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  11515307 taacgaaggacaagtactcagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 11515405  T
Q  497 ttggatcttcagttt 511  Q
    ||| |||||||||||    
T  11515406 ttgaatcttcagttt 11515420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 146 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 15207649 - 15207252
Alignment:
Q  146 ctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgat 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15207649 ctcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgat 15207551  T
Q  246 ttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaa 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15207550 ttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtggacaa 15207452  T
Q  346 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcc 445  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15207451 aa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgctttccaaatgaccgttgatacctcc 15207353  T
Q  446 ctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||   |||||||||| |||||||||||||    
T  15207352 ctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaaacttcagtttatatttactgattaaatgtaacttctggtgatga 15207253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31267176 - 31266672
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31267176 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtccagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 31267077  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  31267076 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcact-------atagaggtgtgaaagagacgttgagattttttagcacgtcta 31266985  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31266984 aagagtcgtt-gagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaatcaacttcaaattcattcccatcttgaa 31266886  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31266885 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 31266787  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| |    
T  31266786 ttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcctttacaattcttcgttctt-ttagacgaggttgaaacgaaaaacagcttc 31266688  T
Q  496 tttggatcttcagttt 511  Q
    |||| || ||||||||    
T  31266687 tttgaatattcagttt 31266672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 49002365 - 49001820
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt--gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  49002365 atacaatgcaataaagactctagactttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagttt 49002266  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  49002265 tggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtctttactcctttatatagagatgagtagagagacgttgagatttttagcacgtct 49002167  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49002166 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttga 49002068  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49002067 aggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 49001969  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   | ||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || ||||||||     
T  49001968 -tcaatgaaggacaagcacccaatgcttttcaaatgactgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctc 49001871  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||| | ||||||||| ||| |    || || ||||||||||||||||||    
T  49001870 ctttgaaacttcagtttaaattttctgatcaactgtagcttctggtgatga 49001820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 55651198 - 55651743
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||||    
T  55651198 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttaaagaaacaaatttggcagagtttt 55651297  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || || |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  55651298 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtcacttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 55651396  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||    
T  55651397 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgactgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaa 55651495  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55651496 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 55651593  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  55651594 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 55651692  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||| ||||||||||||||    
T  55651693 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaattgtaacttctggtgatgat 55651743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 23508991 - 23509386
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  23508991 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 23509090  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    | |||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||     
T  23509091 ttgcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttccg-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcc 23509188  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23509189 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttga 23509287  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509288 aggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23509386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29042040 - 29041852
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29042040 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29041941  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagca 189  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29041940 cgcttttgaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagca 29041852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18775051 - 18774667
Alignment:
Q  12 taaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||| | ||||||| |    
T  18775051 taaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttggacgctttt-a 18774953  T
Q  110 acttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||    || |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||     
T  18774952 acttgttgtaatgtctcttactaatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgtt- 18774854  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
    ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||     
T  18774853 gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-atta 18774755  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |   || || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18774754 tgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggagatagtggttgtacaattgtattttgtcaactct 18774667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8997664 - 8997268
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||    
T  8997664 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttgtgagaatcaaatttggcagagttt 8997565  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--att-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtc 193  Q
    || ||||||| ||||||| |  ||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||  | ||||||||    
T  8997564 tgacgctttt-aacttgtgttgattgtctctacca-atcttcaagtcttcacttctttatatagatgtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtc 8997467  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| | ||| || | |||||||||||||||  |||||    
T  8997466 caaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttg 8997368  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
    |||| |||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8997367 aaggaacac-ttctgcaggcagaactgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 8997269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18007334 - 18007071
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  18007334 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatccacca 18007236  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 328  Q
     || || ||||||| ||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  18007235 gtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcaggcagagctgttttcttg 18007137  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007136 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18007071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16819759 - 16819364
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| || |||||    
T  16819759 atacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcaaagttt 16819660  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgt-at-atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag-cacgtc 193  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||   | |  ||||||    
T  16819659 tggcgctttt-aacttgtgatgatgtctctg-cagatcttcaagtcttcactccttt-tatagaggtgtgtagagagacgttgagacctttaaacacgtc 16819563  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16819562 caaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttg 16819464  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
      || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819463 tgggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 16819365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 33378197 - 33378461
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||| || | ||||||||| |||||  |||||||||  |||||    
T  33378197 atctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttgtgaaa--ctttgatcaatcacca 33378294  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||| | |||    
T  33378295 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggtagaactgtttttctt 33378393  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33378394 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 33378461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14778837 - 14778454
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||| | ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |    
T  14778837 aaagactctagtcttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgcatgaaacaaatttggcagagtttgggcgcttttta 14778738  T
Q  110 acttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||  |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||     
T  14778737 acttgtcgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtc-aaagagtcgttg 14778640  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
      || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||    
T  14778639 agaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttc 14778542  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14778541 tgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 14778454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14711173 - 14710790
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |    
T  14711173 aaagactctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaacaaatttggcagagtttaggcgcttttta 14711074  T
Q  110 acttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||  |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||     
T  14711073 acttgtcgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtc-aaagagtcgttg 14710976  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
      || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||    
T  14710975 agaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttc 14710878  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |  ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14710877 tataggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 14710790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15207771 - 15207647
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15207771 atacaatgcaataaagactctagactagtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 15207672  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctc 124  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  15207671 gcgctttttaacttgtatatctctc 15207647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17994187 - 17993805
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |    
T  17994187 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-a 17994089  T
Q  110 acttgtatatttctctttctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||  | || ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |  | | ||||||| |||||||| ||     
T  17994088 acttgttgaattgtctctaataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgttgagagacgttgagttctttaagcacgtc-aaagagtcattg 17993990  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
      || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||    
T  17993989 agaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacat-ttc 17993893  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17993892 tgcaggcagagctattatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 17993805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36210383 - 36210119
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  36210383 atctttaagttttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcatgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaa 36210285  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  36210284 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtttatcttg 36210186  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36210185 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 36210119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 334
Target Start/End: Original strand, 19241912 - 19242235
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||| || ||| | |||||||| | ||||||| ||    
T  19241912 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttggacgctttt-aa 19242010  T
Q  111 cttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    |||||    || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | | |||||||||||||||||||     
T  19242011 cttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt- 19242108  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
    || | |||||||||||  ||||||  || ||| ||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||    
T  19242109 gagaacctttgatcatttaccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttc 19242207  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 334  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19242208 tgcaggcagagctgttatcttgtcttgt 19242235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14605224 - 14604985
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  14605224 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 14605127  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | ||| |||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| ||||    |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14605126 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacat----tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 14605031  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14605030 gtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14604985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 39526119 - 39526000
Alignment:
Q  425 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatt 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||   ||     
T  39526119 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaa-gaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatc 39526022  T
Q  525 aaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  39526021 acttgtagcttctggtgatgat 39526000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 17247035 - 17247277
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||    
T  17247035 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgatc 17247132  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
     |||||||||| |||   | ||||||||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||  |||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  17247133 ttttgcctgatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatctt-tgctggcagagctgtttttcttgccttg 17247231  T
Q  334 tagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17247232 tagtagagacaaaaaacagagtagtggaggcagtggttgtacactt 17247277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 10249647 - 10249693
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249647 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10249693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 18773842 - 18773888
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18773842 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18773888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 1672171 - 1672220
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1672171 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttga 1672220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 1674646 - 1674695
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1674646 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttga 1674695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 10692812 - 10692884
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692812 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 10906578 - 10906650
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906578 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10906650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 6641475 - 6641717
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtc--taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   |||||| ||   |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  6641475 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaaaagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 6641572  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| |   |||||| ||||  | |||||||||| |||||  ||||||| |    
T  6641573 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgt-tgcaggcatatctgttattcttgtcct 6641671  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
     |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641672 atagcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6641717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Original strand, 13027567 - 13027610
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13027567 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13027610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8685767 - 8685721
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8685767 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 8685721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10661492 - 10661446
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10661492 atcttcaagccttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10661446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10875637 - 10875591
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10875637 atcttcaagccttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10875591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14154321 - 14154275
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14154321 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaatagacgttg 14154275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37435856 - 37435613
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt--tgagataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |   ||||| ||| ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||||      
T  37435856 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttatgaatttgccagcatgtcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatga 37435759  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 331  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  37435758 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagt-tgcaggcagagctgtttttcttgtct 37435660  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    | |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37435659 tatagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 37435613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 3395380 - 3395420
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395380 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 3395420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9751690 - 9751618
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9751690 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 9751618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 10072725 - 10072765
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072725 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10072765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 13890615 - 13890663
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13890615 atctacaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttgag 13890663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15014707 - 15014667
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15014707 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 15014667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22675841 - 22675801
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22675841 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22675801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 40860459 - 40860499
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40860459 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 40860499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 54679720 - 54679760
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679720 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 54679760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 55380081 - 55380121
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55380081 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 55380121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 56034363 - 56034403
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56034363 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 56034403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25651415 - 25651376
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651415 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 25651376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 1672368 - 1672422
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672368 tcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1672422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 1674843 - 1674897
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674843 tcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1674897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 16853482 - 16853536
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16853482 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16853536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Original strand, 16939808 - 16939846
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16939808 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 16939846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17398993 - 17398752
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||||  ||    
T  17398993 agtcttcactcctttatatagaggtgtggaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 17398896  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttg 333  Q
     |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||   ||||   ||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  17398895 atttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaataaacattgt-tgcaggcagagctgttatccttgtcttg 17398797  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17398796 tagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 17398752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Original strand, 17540190 - 17540263
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtc-taaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17540190 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacatcaaaaagagtcgtttgaaa 17540263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20571325 - 20571279
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20571325 atcttcaagtctacactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttg 20571279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Original strand, 19244002 - 19244047
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19244002 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 19244047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 19884493 - 19884735
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||| | |  ||   ||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| |    
T  19884493 aagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatttccagcgcattcaaaatagagtcgtttgaagt--tttgatcaatcaccaat-g 19884589  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 331  Q
      ||||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||  |||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  19884590 atctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtct 19884688  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19884689 tgtagcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacactt 19884735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 29121366 - 29121403
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29121366 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29121403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 6517446 - 6517518
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6517446 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 6517518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 8105430 - 8105470
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8105430 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 8105470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 11900982 - 11901018
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11900982 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 11901018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 11915492 - 11915532
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11915492 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 11915532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 12600548 - 12600588
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12600548 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 12600588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 16632231 - 16632271
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632231 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 16632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 16853295 - 16853335
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16853295 agtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga 16853335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19621381 - 19621341
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19621381 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttg 19621341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 22190638 - 22190678
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22190638 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaatagacgttga 22190678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 22190807 - 22190879
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22190807 tgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 22190879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 29121161 - 29121201
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29121161 agtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttga 29121201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37985932 - 37985892
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37985932 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 37985892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 55731637 - 55731677
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55731637 agtcttcactcctttatatcgaggtgtgaaagagacgttga 55731677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 56533380 - 56533340
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56533380 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaaacgttga 56533340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14357454 - 14357411
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14357454 ttcaagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagaggttg 14357411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 16939978 - 16940049
Alignment:
Q  308 gcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16939978 gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagggacaaaaacatagcagtggagatagtggttgtacactt 16940049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17526711 - 17526668
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17526711 ttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 17526668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 40845885 - 40845924
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40845885 agtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 40845924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41115091 - 41115048
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41115091 ttcaagtcttcactcctttatatataggtgtgagagagacgttg 41115048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 45833186 - 45833225
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45833186 agtcttcactcctttatatagaggtctgaaagagacgttg 45833225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16324842 - 16324796
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16324842 atcttcaagtcttcactcttttatacagaggtatgaaagagacgttg 16324796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 372
Target Start/End: Original strand, 16848508 - 16848574
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 372  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16848508 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaggagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17057442 - 17057396
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17057442 atcttcaagtcttcactccattatatagaggtgtgagatagacgttg 17057396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19889320 - 19889278
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19889320 atcttcaatttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 19889278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 23087470 - 23087516
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23087470 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatcaaagagacgttg 23087516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Original strand, 23750315 - 23750353
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23750315 gtcttcactcgtttatatagaggtgtgaaagagacgttg 23750353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 24619431 - 24619477
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24619431 atcttcaagtcttcattcatttatatagaggtatgaaagagacgttg 24619477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 54679929 - 54679963
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679929 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 54679963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 176
Target Start/End: Original strand, 2651596 - 2651641
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  2651596 atcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagatacgtt 2651641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3105534 - 3105497
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3105534 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 3105497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Original strand, 18473811 - 18473860
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18473811 atcttcaagtatttactcttttatatagaggtgtgaaaaagacgttgaga 18473860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25651215 - 25651182
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651215 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25651182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 174
Target Start/End: Original strand, 36470610 - 36470647
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36470610 aagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacg 36470647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3105738 - 3105698
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3105738 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaaaagacgttga 3105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 3483521 - 3483561
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3483521 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaatagacgttg 3483561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 6517277 - 6517317
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6517277 agtcttcacttctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 6517317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 20977418 - 20977490
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20977418 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 20977490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39419884 - 39419812
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39419884 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacactt 39419812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 376
Target Start/End: Original strand, 40860663 - 40860698
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40860663 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 40860698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Original strand, 44397642 - 44397677
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44397642 aagtcttcactccattatatagaggtgtgaaagaga 44397677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10661278 - 10661240
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10661278 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 10661240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10875423 - 10875385
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10875423 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 10875385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17788361 - 17788323
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17788361 gtcttcactcctttatatagaggttggaaagagacgttg 17788323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 177
Target Start/End: Original strand, 18394324 - 18394366
Alignment:
Q  135 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18394324 tcaagtcttcattcctttatatagaagtatgaaagagacgttg 18394366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 10072931 - 10072968
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10072931 gacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacactt 10072968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19912197 - 19912160
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19912197 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaataaacgttg 19912160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 38513874 - 38513911
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38513874 gacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacactt 38513911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 45833394 - 45833427
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45833394 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 45833427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56533173 - 56533140
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56533173 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 56533140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 412792 - 412828
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  412792 aagtcttcatttctttatatagaggtgtgaaagagac 412828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 3395551 - 3395623
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3395551 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 3395623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12811495 - 12811455
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12811495 aagtattcactcctttataaagaagtgtgaaagagacgttg 12811455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13576264 - 13576192
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  13576264 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacactt 13576192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13576435 - 13576395
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13576435 aagtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagatgttg 13576395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 16848339 - 16848379
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16848339 agtcttcactgttttatatagagatgtgaaagagacgttga 16848379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19911991 - 19911959
Alignment:
Q  346 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911991 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 19911959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 473; Significance: 0; HSPs: 189)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 26044019 - 26044565
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26044019 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 26044118  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044119 cgcttttgaacttgtatatctctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 26044218  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044219 agtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 26044318  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044319 acaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaag-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 26044417  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044418 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 26044517  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26044518 ggatcttcagtttgaatatagggattaaatgtagcttctggtgatgat 26044565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 25787508 - 25788053
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25787508 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 25787607  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25787608 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 25787707  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787708 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 25787807  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787808 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 25787906  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787907 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 25788006  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25788007 gatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 25788053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 12827499 - 12828045
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12827499 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 12827598  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12827599 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 12827698  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12827699 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcg 12827798  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827799 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 12827898  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827899 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 12827998  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  12827999 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 12828045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7376147 - 7375602
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7376147 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 7376048  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7376047 gcgctttttaacttgtgtatatctttctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 7375948  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375947 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 7375848  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375847 caaattctgctggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 7375749  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7375748 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 7375649  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  7375648 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 7375602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11147639 - 11147093
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11147639 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 11147540  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||| | |||  || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11147539 gcgctttttaacttatgtatcactatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 11147440  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147439 gtcatttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 11147340  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147339 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 11147240  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147239 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 11147140  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  11147139 gatcttcagtttgaatttacggattatatgtagcttctggtgttgat 11147093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20030293 - 20029748
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20030293 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20030194  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20030193 gcgctttttaacttgtacatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 20030094  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030093 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 20029994  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029993 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 20029895  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20029894 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 20029795  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  20029794 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 20029748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20063044 - 20062499
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  20063044 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttg 20062945  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  20062944 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgagatgatttgcacgtctaaaga 20062845  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062844 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 20062745  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062744 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 20062646  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20062645 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 20062546  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||    
T  20062545 gatcttcagtttgattttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 20062499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27372639 - 27373181
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27372639 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27372738  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372739 cgcttttgaacttgtatatctctatcttctatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27372838  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372839 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 27372938  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac--aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27372939 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctacta 27373038  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  27373039 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaatcagctacttt 27373138  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  27373139 ggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatatagcttctggtga 27373181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27462989 - 27463531
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27462989 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27463088  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463089 cgcttttgaacttgtatatctctatcttctatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27463188  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463189 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 27463288  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac--aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27463289 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctacta 27463388  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  27463389 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaatcagctacttt 27463488  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  27463489 ggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatatagcttctggtga 27463531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27505749 - 27506291
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27505749 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27505848  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505849 cgcttttgaacttgtatatctctatcttctatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27505948  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505949 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 27506048  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac--aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27506049 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctacta 27506148  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  27506149 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaatcagctacttt 27506248  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  27506249 ggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatatagcttctggtga 27506291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 25985889 - 25986429
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25985889 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 25985988  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25985989 cgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaagag 25986088  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25986089 tcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaatttattcccatcttgaaggcac 25986188  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25986189 aaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 25986288  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||    
T  25986289 gaaggacaaatgctcagtgctattcatatgaccgttggtacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagaccgaattgagaaccagctactttgg 25986388  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||||||||||| ||||    
T  25986389 atcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttcttgtga 25986429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 28251952 - 28251414
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28251952 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 28251853  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28251852 cgcttttgaacttgtatatctctgtctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagag 28251753  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251752 tcgtttgaattccttaaatcat-caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 28251654  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251653 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 28251555  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||      
T  28251554 gaaggacaaatgttcagagctctccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggctgaatggagaaccagctactttaa 28251455  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||| ||||||||||||    
T  28251454 atcttcagtttgatta-aaggatcaaatgcagcttctggtga 28251414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 28357099 - 28356561
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28357099 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 28357000  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28356999 cgcttttgaacttgtatatctctgtctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagag 28356900  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356899 tcgtttgaattccttaaatcat-caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 28356801  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356800 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 28356702  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||      
T  28356701 gaaggacaaatgttcagagctctccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggctgaatggagaaccagctactttaa 28356602  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||| || | | || ||||| ||||||||||||    
T  28356601 atcttcagtttgatta-aaggatcaaatgcagcttctggtga 28356561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9123521 - 9122980
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9123521 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 9123422  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123421 cgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9123322  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9123321 tcttttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 9123222  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9123221 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9123122  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||     
T  9123121 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttta 9123022  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9123021 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9122980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9112884 - 9112343
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9112884 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 9112785  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9112784 cgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9112685  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9112684 tcttttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 9112585  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9112584 aaattttgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9112485  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||     
T  9112484 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttta 9112385  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9112384 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9112343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7751624 - 7751112
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7751624 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 7751525  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7751524 cgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7751425  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7751424 tcgtttgaattcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaattcattcccatcttgaaggcgc 7751325  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  7751324 acattctgcaggcaaggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaa 7751225  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  7751224 gagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaaacagctactttga 7751125  T
Q  501 atcttcagtttga 513  Q
    |||||||||||||    
T  7751124 atcttcagtttga 7751112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31543285 - 31542746
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31543285 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 31543186  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| |  || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543185 cgcttttgaacttatgcatgtctct--cttgtcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 31543088  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  31543087 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 31542988  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31542987 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 31542888  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  31542887 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 31542788  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  31542787 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 31542746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 3671854 - 3672394
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3671854 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 3671953  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671954 cgcttttgaacttatgtatttctatatttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3672053  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  3672054 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 3672153  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3672154 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 3672252  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  3672253 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 3672352  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  3672353 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 3672394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 3661190 - 3661730
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3661190 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 3661289  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3661290 cgcttttgaacttatgtatttctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3661389  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  3661390 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 3661489  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3661490 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 3661588  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  3661589 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 3661688  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  3661689 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 3661730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 12854828 - 12855369
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12854828 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12854927  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854928 cgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12855027  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12855028 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12855127  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12855128 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12855227  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12855228 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 12855327  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12855328 aatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12855369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 12865354 - 12865895
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12865354 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12865453  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865454 cgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12865553  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12865554 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12865653  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12865654 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12865753  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12865754 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 12865853  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12865854 aatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12865895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17985099 - 17984558
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17985099 atacaatacagaaaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17985000  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984999 cgcttttgaacttatgtatttctcacttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17984900  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17984899 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17984800  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17984799 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17984700  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  17984699 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 17984600  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  17984599 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 17984558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 29384559 - 29385099
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29384559 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29384658  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384659 cgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 29384758  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  29384759 tcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 29384858  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29384859 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 29384957  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  29384958 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 29385057  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  29385058 aatcttcagtttgatta-aagaatcaaatgtagcttctggtga 29385099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 542
Target Start/End: Original strand, 33199137 - 33199675
Alignment:
Q  3 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33199137 acaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 33199236  T
Q  103 cttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 202  Q
    ||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33199237 cttttgaacttatgtatctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 33199336  T
Q  203 gtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  33199337 gtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcctatcttgaatgtacaa 33199436  T
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33199437 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacg 33199536  T
Q  402 aaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 501  Q
    |  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  33199537 agagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcaatttttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctac-ttgaa 33199635  T
Q  502 tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  33199636 tcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 33199675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18926153 - 18925606
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18926153 atacaatacgatacagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtggaatcaaattgacagagttttg 18926054  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18926053 gcgctttttaacttgtatatatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 18925954  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18925953 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 18925855  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
     |||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18925854 aacat-ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 18925756  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  18925755 taacgaaggacaagtactaagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacaactact 18925656  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| |||| |||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  18925655 ttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 18925606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 26035840 - 26036381
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26035840 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26035939  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035940 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26036039  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26036040 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 26036139  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26036140 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26036239  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  26036240 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagattgaattgagaatcagcaactttg 26036339  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  26036340 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 26036381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31983015 - 31982474
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31983015 atacaatacaaaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 31982916  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31982915 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 31982816  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  31982815 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 31982716  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31982715 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 31982616  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  31982615 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 31982516  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  31982515 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 31982474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34807549 - 34807008
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34807549 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 34807450  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    || |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807449 cgtttttgaacttatgtatctctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 34807350  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  34807349 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 34807250  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34807249 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 34807150  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  34807149 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 34807050  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  34807049 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 34807008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34818181 - 34817640
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34818181 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 34818082  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    || |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818081 cgtttttgaacttatgtatctctatattcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 34817982  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  34817981 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 34817882  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34817881 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagatagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 34817782  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  34817781 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 34817682  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  34817681 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 34817640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 26025266 - 26025807
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26025266 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26025365  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025366 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26025465  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26025466 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 26025565  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26025566 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26025665  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  26025666 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 26025765  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  26025766 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 26025807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27341501 - 27342042
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27341501 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27341600  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341601 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27341700  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27341701 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27341800  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27341801 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27341900  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  27341901 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 27342000  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27342001 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27342042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27402241 - 27402782
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27402241 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27402340  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402341 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27402440  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27402441 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27402540  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27402541 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27402640  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  27402641 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 27402740  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27402741 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27402782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27412900 - 27413441
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27412900 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27412999  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413000 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27413099  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27413100 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27413199  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27413200 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27413299  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  27413300 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 27413399  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27413400 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27413441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 26864605 - 26865136
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26864605 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagactcaaattgacagagttttggcgcttttaaact 26864704  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864705 tatgtatctctatctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 26864804  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||    
T  26864805 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgca 26864904  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  26864905 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26865004  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26865005 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 26865104  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  26865105 ttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26865136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 26875229 - 26875760
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26875229 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagactcaaattgacagagttttggcgcttttaaact 26875328  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875329 tatgtatctctatctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 26875428  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||    
T  26875429 tcctttgaatatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaaatctgca 26875528  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  26875529 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 26875628  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26875629 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 26875728  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  26875729 ttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26875760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 32962323 - 32961777
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  32962323 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttga 32962224  T
Q  101 cgcttttgaactt--gtatattt--ctctttctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    |||||||||||||  |||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962223 cgcttttgaacttctgtatatctatctcttttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 32962124  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32962123 aagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgag 32962024  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962023 tgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 32961924  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||||||    
T  32961923 attaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttcataagactgaattgagaatcagcta 32961824  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||| ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  32961823 ctttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 32961777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 27474653 - 27475165
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27474653 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27474752  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27474753 cgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagattatcagcacgtctaaagag 27474852  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27474853 tcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgc 27474952  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  27474953 acattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaa 27475052  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||||     
T  27475053 gagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagagccagctactttga 27475152  T
Q  501 atcttcagtttga 513  Q
    |||||||||||||    
T  27475153 atcttcagtttga 27475165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 27504152 - 27504664
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27504152 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27504251  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27504252 cgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagattatcagcacgtctaaagag 27504351  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27504352 tcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgc 27504451  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  27504452 acattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaa 27504551  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||||     
T  27504552 gagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagagccagctactttga 27504651  T
Q  501 atcttcagtttga 513  Q
    |||||||||||||    
T  27504652 atcttcagtttga 27504664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32972942 - 32972424
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  32972942 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttga 32972843  T
Q  101 cgcttttgaactt--gtatattt--ctctttctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    |||||||||||||  |||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32972842 cgcttttgaacttctgtatatctatctcttttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 32972743  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32972742 aagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgag 32972643  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32972642 tgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagagagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 32972543  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||| ||||||    
T  32972542 attaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttcataagactgaattgagaatcagcta 32972443  T
Q  495 ctttggatcttcagtttga 513  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  32972442 ctttgaatcttcagtttga 32972424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 28 - 515
Target Start/End: Original strand, 8653496 - 8653981
Alignment:
Q  28 tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctcttt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| |    
T  8653496 tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgcagaatcaaattgacatagttttggcgctttttaacttatatctccctctct 8653595  T
Q  128 cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8653596 tcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagttgattagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccacc 8653694  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt 327  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  8653695 aataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattagcttcaaattcattcccgttttgaaggaacat-ttctacaggcatagcttttgtctt 8653793  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaa 427  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  8653794 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtattcagtgctcttcaa 8653893  T
Q  428 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8653894 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagtcgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 8653981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 542
Target Start/End: Original strand, 16930261 - 16930798
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16930261 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 16930360  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930361 ttttaaacttatgtatatctatataaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 16930460  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  16930461 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 16930559  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16930560 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacga 16930659  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
      |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||    
T  16930660 gagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaat 16930759  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  16930760 cttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 16930798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 27384240 - 27384752
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27384240 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatttatcaaatcagtgcagaaattctgtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 27384339  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27384340 cgcttttgaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttgagattatcagcacgtctaaagag 27384439  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27384440 tcgtttgaaatcctttaatcatccaccagtgatcctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagagttagcttcaaaatcattcccatcttgaaggcgc 27384539  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  27384540 acattctgcaggcaaggctgttgttttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaa 27384639  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||||     
T  27384640 gagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccctttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagagccagctactttga 27384739  T
Q  501 atcttcagtttga 513  Q
    |||||||||||||    
T  27384740 atcttcagtttga 27384752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 542
Target Start/End: Original strand, 16959432 - 16959969
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16959432 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 16959531  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959532 ttttaaacttatgtatatctatataaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 16959631  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  16959632 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 16959730  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16959731 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttgtactttgtcaactctattaacga 16959830  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
      |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||    
T  16959831 gagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaat 16959930  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  16959931 cttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 16959969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12717225 - 12716684
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12717225 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12717126  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctct-ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717125 cgcttttaaacttgtgtatctctatcttcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 12717026  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggc 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   |     
T  12717025 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgt 12716926  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12716925 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 12716826  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  12716825 aaagagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactt 12716726  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggt 540  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||    
T  12716725 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggt 12716684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12727874 - 12727333
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12727874 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12727775  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctct-ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727774 cgcttttaaacttgtgtatctctatcttcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 12727675  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggc 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   |     
T  12727674 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgt 12727575  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12727574 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 12727475  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  12727474 aaagagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactt 12727375  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggt 540  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||    
T  12727374 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggt 12727333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32301432 - 32300934
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32301432 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 32301333  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301332 cgcttttgaacttatgtatgtctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 32301233  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  32301232 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 32301133  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32301132 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 32301033  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  32301032 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 32300934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32312121 - 32311623
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32312121 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 32312022  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312021 cgcttttgaacttatgtatgtctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 32311922  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  32311921 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 32311822  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32311821 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 32311722  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  32311721 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 32311623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17982890 - 17982417
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17982890 atacaatacagaaaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17982791  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982790 cgcttttgaacttatgtatttctcacttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17982691  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17982690 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctctgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17982591  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17982590 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17982491  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataa 473  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17982490 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataa 17982417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 4630678 - 4631178
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  4630678 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacaaagttttgg 4630777  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630778 cgcttttgaacttatgtatgtctctgtatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 4630877  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |     
T  4630878 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgt 4630977  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4630978 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 4631077  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  4631078 aatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactt 4631177  T
Q  498 t 498  Q
    |    
T  4631178 t 4631178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16123923 - 16123380
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16123923 atacaatgtaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcaaaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 16123824  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| |||||  |||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16123823 gcgctttttaactt--atatctctatgtacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 16123726  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  16123725 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatactttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattacaatcttgaaggaa 16123627  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgtta 398  Q
    ||| || || |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16123626 cat-ttatgaaggcatggatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgtta 16123528  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16123527 aagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttaaaaagagaaacagctacttt 16123428  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | |||| |||||| |||  |   ||||| |||||||||||||||||||    
T  16123427 gaatctccagtttaaattaactgattaattgtagcttctggtgatgat 16123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 544
Target Start/End: Original strand, 29765342 - 29765884
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  29765342 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtactttgtagaatcaaatttggcagagtttt 29765441  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29765442 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagtacgtctaa 29765540  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
     |||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  29765541 -gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 29765638  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29765639 gaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtctgatagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 29765737  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| || ||||||||  |    
T  29765738 taacgaaggacaagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttc-tagacgatgttgaaacgaaaaacagctctt 29765836  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatg 544  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  29765837 ttgaatcttcagtttaaatttactaatcacttgtagcttctggtgatg 29765884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 31572221 - 31572765
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31572221 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaa-gtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 31572319  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  31572320 ggcgctttt-aacttgtattgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 31572418  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||      
T  31572419 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgata 31572517  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  31572518 gaacat-ttctgcaggcatggtcgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtagtttgtcaactctga 31572616  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  31572617 taacgaaggacaaatactcagtgcttttcaaaagaccgttgatacctccctttcaattcttcattc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 31572715  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||| | ||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||||||    
T  31572716 ttgaatcgttagtttaaatttactgatcaaatgtagcttctggtgatgat 31572765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 4292532 - 4293077
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4292532 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagtttt 4292631  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  4292632 ggcgcttttga-cttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 4292730  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    |||||||||  |  |||||||||||||||| | || || |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4292731 agagtcgtta-agttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaag 4292829  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4292830 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 4292928  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    | | ||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||    
T  4292929 tgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagatgaggttgaaacgaaaaatagctcct 4293027  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || || || ||||||||||||||||    
T  4293028 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgat 4293077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18826628 - 18826083
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  18826628 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggtgctttgtagaattaaatttggcagagtttt 18826529  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||| ||||| ||||||| |  || ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  18826528 ggcactttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 18826430  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||   |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  18826429 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 18826331  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18826330 gaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 18826232  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    |||||||||| || | | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  18826231 taacgaaggataagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 18826133  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  18826132 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 18826083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 5844893 - 5845453
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5844893 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctatgatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtt-tttgtagaatcaaattgacagagttttg 5844991  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| |  || | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5844992 gcgctttttattttttttatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 5845091  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5845092 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaatcggcttcaaattcattcccatcttgaatgaa 5845190  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5845191 cat-tcctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataa 5845289  T
Q  400 cgaaggacaactgctca-----------------gagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaat 482  Q
    |||||||||| | ||||                 | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||     
T  5845290 cgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctcagacgaggttgaaac 5845389  T
Q  483 gagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  5845390 gagaaacagctactttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 5845453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18835023 - 18834479
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||| |    
T  18835023 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtg-agaaattcaaggtgctttgtagaatcaaatttggcagagttgt 18834925  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || ||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  18834924 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtcttttgccaatcttcaagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 18834826  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||   |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  18834825 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggaaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 18834727  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18834726 gaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 18834628  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  18834627 taacgaaggacaagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttc-tagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 18834529  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  18834528 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 18834479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 27166832 - 27166288
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  27166832 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaataaaatttgacagagtttt 27166733  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  27166732 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttatcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaaagagacgttgagatgtttagcacgtctaa 27166634  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  27166633 -gagtcgtt-gagtttctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaag 27166536  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27166535 gaaca-attctgcaggcagagccgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagtgtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 27166437  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||| ||||||||| | | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| || ||||| || ||    
T  27166436 taatgaaggacaagtacacagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttc-tagacgatgttgaaacgaaaaacaactcct 27166338  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  27166337 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 27166288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 541
Target Start/End: Original strand, 22308598 - 22309136
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  22308598 caatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagttttggt 22308697  T
Q  102 gcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||||||  |||||  |  || ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  22308698 gctttttgacttgcgttaatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaaga 22308797  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22308798 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctttgaggaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaa 22308896  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
     || |||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22308897 tat-ttctacaggtagagctgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataa 22308995  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||| |||| | | ||| ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  22308996 cgaagaacaattacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacatccctttcaattcttcgttc-tcttagacaaggttgaaacgaaaaacagctcctttg 22309094  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtg 541  Q
     ||| ||||||| ||| ||   ||||  ||||||||||||||    
T  22309095 aatcgtcagtttaaatttactgattacttgtagcttctggtg 22309136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17746173 - 17745644
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtg-tgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17746173 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaggatgctttgtagaatcaaatttgacagagttt 17746074  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    |||| ||||| ||||||| |   ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17746073 tggcactttt-aacttgtgttaatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgtttagcacgtcta 17745975  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17745974 aagagtcgtt-gagttcctttgattattcaccagtaatgattttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaa 17745876  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17745875 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttctactttgtcaactctg 17745777  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatga-----------------ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttg 478  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  17745776 ataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggacgaggttg 17745677  T
Q  479 aaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17745676 aaatgagaaacagctactttgaatcttcagttt 17745644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 149 - 546
Target Start/End: Original strand, 13913006 - 13913401
Alignment:
Q  149 ctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttg 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13913006 ctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagttgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttg 13913104  T
Q  249 ggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaa 348  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13913105 ggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaa 13913203  T
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13913204 caaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 13913303  T
Q  449 tcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  13913304 tcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctccagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 13913401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9934062 - 9933516
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  9934062 atacaatgcaataaagactctagacttacgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 9933963  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  9933962 ggcgctttt-aacttgtgttaatgtctcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagatgttgagatttttagcacgtcta 9933864  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||| |||| ||||||||    
T  9933863 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgattttggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaa 9933765  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9933764 ggaacat-ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttgtagcatagacagaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 9933666  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     ||| |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| |    
T  9933665 ataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcc 9933567  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  9933566 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 9933516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 25518494 - 25519039
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  |||| |||||||||    
T  25518494 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttataagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttt 25518593  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttct----tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25518594 ggcgctttt-aacttgtatatctctctctgtattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtct 25518692  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| || || || ||||| || | |||||||||||||||  ||||||    
T  25518693 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgttgtgctatgaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttga 25518791  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518792 aggaacat-ttctggaggcagagctgttgtcttgtcttgtaacgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 25518890  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   | ||| ||| | || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||     
T  25518891 -tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcagatgaccgttgata-ctcctttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttaaaacgagaaacagctc 25518987  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  25518988 ctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 25519039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17742093 - 17741548
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  17742093 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 17741994  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17741993 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 17741895  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || | ||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  17741894 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatacaccagtaatcttatgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 17741796  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17741795 ggaacat-ttctgcaggcagagatgttgtattgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 17741698  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    |||  |||||||||   | ||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  17741697 ttagagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgattgttgatacctccctttcaattcttcattc-tcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 17741599  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  17741598 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 17741548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 466
Target Start/End: Original strand, 17064030 - 17064467
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctcttt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| || ||| | ||||||||  |||||||| |||||||  || ||||| |    
T  17064030 gaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgtgcgctttttaacttgtg-atgtctctct 17064128  T
Q  128 cttatcttcaagtcttcact-cctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccac 226  Q
    |  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17064129 ca-atctccaagtcttcacttcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccac 17064227  T
Q  227 caatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtct 326  Q
    || || || ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17064228 cagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcagagctgttgtct 17064327  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatcca 426  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||| | | ||| ||| | ||    
T  17064328 tgtcttgtagcgtggacaagaacatagtagtggaggtagttgttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaagacaagtacccagtgctttgca 17064427  T
Q  427 aatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttct 466  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17064428 aaagaccgttgatacctcccttgcaattcttcgttcttct 17064467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 303 - 546
Target Start/End: Original strand, 6158316 - 6158559
Alignment:
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158316 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 6158415  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
     |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6158416 gggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgttacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacaactactttggat 6158515  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6158516 cttcagtttaaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 6158559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26023184 - 26022882
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26023184 atacaataccataaagactctagcctttggatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgaaagagttttgg 26023085  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    |||||||||||| ||| || ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26023084 cgcttttgaactggtaaatctctccatctttgatcttcaagtcttcactcctttataaagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcaagtttaaag 26022985  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  26022984 agtcgtttgaaatcctttgattattcaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggattaggtttaaattcattcccattttgaaggc 26022885  T
Q  299 aca 301  Q
    |||    
T  26022884 aca 26022882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 25735947 - 25735438
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  25735947 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaattgacagagtttag 25735848  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag-cacgtctaa 196  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  | |||||||||    
T  25735847 gcgctttt-aacttgtatgtggtctcttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttggcacgtctaa 25735749  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||    
T  25735748 agagtcgtt-gagttcctt-gatcatctaccagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaag 25735651  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25735650 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-t 25735553  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     || |||||||||   | ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||| |    
T  25735552 caatgaaggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacacgagaaacagcttc 25735454  T
Q  496 tttggatcttcagttt 511  Q
    |||| | |||||||||    
T  25735453 tttgaaacttcagttt 25735438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25687131 - 25686593
Alignment:
Q  9 caataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttt 106  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25687131 caataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatttgacagagtttaggcgcttt 25687032  T
Q  107 tgaacttgtatatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataa-tcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    | ||||||||| || ||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  25687031 t-aacttgtatgttgtctcttgtcaatcttcaagtctatactcctttatatagaggtgagcagagagacgttgagattccttagcacgtctaaagagtcg 25686933  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    || ||  ||||| |||||||||||| || || ||| | ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||||     
T  25686932 tt-gagttcctt-gatcatccaccagtaatctttttcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat- 25686836  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  25686835 ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaa 25686737  T
Q  404 ggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
    ||||||   | ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |     
T  25686736 ggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttctt-ttagacgaggttgaaacgagaaacagcttcattgaaa 25686638  T
Q  503 cttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||    
T  25686637 cttcagtttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatgat 25686593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 162 - 466
Target Start/End: Original strand, 17042590 - 17042894
Alignment:
Q  162 tgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtccttt 261  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  17042590 tgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaaagagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtccttt 17042689  T
Q  262 gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggag 361  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  17042690 gaagtattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaaattctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggag 17042789  T
Q  362 gtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| | | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17042790 gtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaacgaaagacaagtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgcaattcttcgtt 17042889  T
Q  462 cttct 466  Q
    |||||    
T  17042890 cttct 17042894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 25679044 - 25679590
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  25679044 atacaatgcaattaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaattgacagagtttag 25679143  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag-cacgtctaa 196  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  | |||||||||    
T  25679144 gcgctttt-aacttgtatgtggtctcttgtcaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattctttggcacgtctaa 25679242  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||    
T  25679243 agagtcgtt-gagttcctt-gatcatctactagtaatcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaag 25679340  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25679341 gaacat-ttctgcaggaagagctgatgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-t 25679438  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||| || |    
T  25679439 caatgaaggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctacctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacacgagaaacaacttc 25679537  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatat--atgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| || ||  |   || ||||||||||||||||||||||    
T  25679538 tttgaaacttcagtttaaaaatgaactgatcaaatgtagcttctggtgatgat 25679590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12353362 - 12353590
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  12353362 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttg 12353461  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12353462 gcgcttttgaacttatatgtctctcacttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaggagacgttgagataattagcacgtctaaaga 12353561  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12353562 gtcgtttgaaatcctttgatcattcacca 12353590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12953521 - 12953126
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  12953521 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 12953422  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct- 194  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||     
T  12953421 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcatcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctt 12953324  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  12953323 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 12953225  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12953224 aggaaca-attctacaggcagagctgttatcttgtattgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 12953126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 31931228 - 31931623
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  31931228 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttt 31931327  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  31931328 tggcgctttt-aacttgtgttcatgtctctttag-atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtagagagacgttgagatctttagcacgtct 31931425  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | |||||    
T  31931426 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctaacttga 31931524  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31931525 aggaaca-attctgcaggcagagttgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 31931623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 18555075 - 18555470
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||  |||||||    
T  18555075 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggtagagttt 18555174  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||| |  || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  18555175 gggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctgtca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacatct 18555272  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||| | ||  | ||||||||||||||| ||||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  18555273 aaagagtcgtt-gagttccttagatcatccacgagtaaacttttgcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 18555371  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18555372 gggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18555470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19289771 - 19289376
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  19289771 atacaatgcaataaaagactctggacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttt 19289672  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgt-atatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     | ||||||| ||||||| |||   |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  19289671 ggacgctttt-aacttgtgataacgtctcta-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtct 19289574  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||||||    
T  19289573 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggatgtagtcctatgaaggatcgacttcaaattcattcctatcttga 19289475  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289474 aggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19289376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 11205751 - 11206146
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  11205751 atacaatgcaatcaaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcaatacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttt 11205850  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| || ||||  || | |||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  11205851 gggcgctttt-aatttgttgtagtgtctctacca-atcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtggagagagacgttgagatcttaagcacgtct 11205948  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||   | || || |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||    
T  11205949 aaagagtcgtt-gagaacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttga 11206047  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206048 aggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtgttgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 11206146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 11235304 - 11235699
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  11235304 atacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttt 11235403  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| || ||||  || | |||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  11235404 gggcgctttt-aatttgttgtagtgtctctacca-atcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtggagagagacgttgagatcttaagcacatct 11235501  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| || | || |||||||||||||  || || ||||||||||||||   | ||||| |||| ||| |  ||||||| |||||| |||||||    
T  11235502 aaagagtcgtt-gagaaccattgatcatccacctgtaatcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttga 11235600  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11235601 aggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtaatttgtcaactct 11235699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 546
Target Start/End: Original strand, 25675201 - 25675514
Alignment:
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 332  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25675201 tcctttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtctt 25675299  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatga 431  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | |||||||    
T  25675300 gtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttcaaatga 25675398  T
Q  432 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatat--atgaattaaatg 529  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||  |   || |||||    
T  25675399 ccgttgataccttcctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacacgagaaacaacttctttgaaacttcagtttaaaaatgaactgatcaaatg 25675497  T
Q  530 tagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||    
T  25675498 tagcttctggtgatgat 25675514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 347 - 546
Target Start/End: Original strand, 13928341 - 13928540
Alignment:
Q  347 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13928341 aacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 13928440  T
Q  447 tttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||   || || |||||||||| ||||||||    
T  13928441 tttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactactttgaatctccagtttaaatttactgatcaattgtagcttctagtgatgat 13928540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 288 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25723059 - 25722801
Alignment:
Q  288 atcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgt 387  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25723059 atcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacatttgtactttgt 25722961  T
Q  388 caactctgttaacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgaga 486  Q
    ||||||| | || ||||||||| | | ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||    
T  25722960 caactct-tcaatgaaggacaagtacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacaggaga 25722863  T
Q  487 aacagctactttggatcttcagtttgaatata---tgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| || |||   || || ||||||||||||||||||||||    
T  25722862 aacagcttctttgcaacttcagtttaaaaataaactg-atcaaatgtagcttctggtgatgat 25722801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 21127899 - 21128281
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaac 111  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||  |||||| ||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| |||    
T  21127899 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacatagaaattcaaagtgcttggtgaaacaaatttggcagagtttaggcgctttttaac 21127998  T
Q  112 ttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttga 208  Q
    ||||  |||| |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| || | |||||||||       
T  21127999 ttgttgtattgtctcta-ctgatcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatctttaagcacttcaatagagtcgttgcg 21128097  T
Q  209 aatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctg 308  Q
    || |||| |||||  |||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||||||    ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21128098 aaacctt-gatcaatcaccaattatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatcgcattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctg 21128195  T
Q  309 caggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21128196 caggcagagatgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 21128281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Original strand, 18498557 - 18498820
Alignment:
Q  130 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  18498557 tatcatcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcatt-gagttcctttgatcatccacca 18498655  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 328  Q
     || || |||| |||||||||| |||||||| | ||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  18498656 gtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcttatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttattttg 18498754  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498755 tcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 428 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32761894 - 32761776
Alignment:
Q  428 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  32761894 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttacggattaaa 32761795  T
Q  528 tgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32761794 tgtagcttctggtgatgat 32761776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 20635511 - 20635775
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | |||||| || ||||| |  |||||||  |||||    
T  20635511 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtctttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 20635608  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| | |||    
T  20635609 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-tgctgcaggcagagctgtttttctt 20635707  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20635708 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20635775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7586637 - 7586252
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt--gta-gaatcag-tttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||    
T  7586637 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt 7586538  T
Q  108 gaacttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcg 203  Q
     |||||||  |||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||    
T  7586537 -aacttgttgtattgtctctat-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcg 7586440  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    ||   || |||| |||||   ||||||  ||  |||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||||     
T  7586439 ttgagaaacctt-gatcaat-accaatgatctgttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat- 7586343  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7586342 ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 7586252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17608663 - 17608401
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  17608663 atctttaagtcttcactcctttgtatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 17608566  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  17608565 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 17608467  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17608466 gtcttgtagcgtagacaaaa-caaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 17608401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 434 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9580 - 9468
Alignment:
Q  434 gttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagc 533  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9580 gttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaacgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagc 9481  T
Q  534 ttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||    
T  9480 ttctggtgatgat 9468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 22386594 - 22386858
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  22386594 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcatgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 22386691  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  || |||| ||||   |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| | |||    
T  22386692 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttaaaatccattaatatcttgaaggaacat-tactgcaggcagagctgtttttctt 22386790  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22386791 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttggtactttgtcaactct 22386858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 29917814 - 29918056
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  29917814 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 29917911  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
      |||||||||| ||| | | ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||  |||| | |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  29917912 tttttgcctgatatggtcattgtcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 29918010  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918011 gtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29918056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 394
Target Start/End: Original strand, 17047390 - 17047755
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaacttgt-atatttctct 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| || ||| | ||||||||  |||||||| ||||||| || | |||||    
T  17047390 gaatttctaagatatatcaaatcaaaacagaaattcaaagtgctttttcagaaacaattttggcagagtttgtgcgctttt-aacttgtgatctgtctct 17047488  T
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcact-cctttatatagag-gtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcat 222  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||||  ||  ||||   || |||||||||   || ||||||||| |    
T  17047489 at-ttatcttcaagtcttcacttcctttatatagagagagt-agagagacgttgagattttcttgcac---tatagagtcgttgagaaacctttgatctt 17047583  T
Q  223 ccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt 322  Q
     ||||| ||  | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  17047584 tcaccattaaacttttgcctgatttggatgtagtcctttaaagaattaacttaaaattcattcctatcttgaaggaaca-aatctgcaggcagagctgtt 17047682  T
Q  323 gtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagag-tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     ||||||| ||||| | ||||| |  ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17047683 atcttgtcctgtagcgaggacacactcagagttcgtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactct 17047755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 425 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16123180 - 16123059
Alignment:
Q  425 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatt 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||   |||    
T  16123180 caaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttaaaacgagaaacagctactttgaatctccagtttaaatttactgatt 16123081  T
Q  525 aaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16123080 aattgtagcttctggtgatgat 16123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14051731 - 14051495
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||| |||  |    | |||||||  |||||||  |    
T  14051731 caagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacgtc-aaagagttgttgtag---ccttgatcaatcaccaatgat 14051636  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  |  ||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14051635 cttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtctt 14051537  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 374  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14051536 gtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtac 14051495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 442 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17577744 - 17577640
Alignment:
Q  442 ctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtg 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || | || || ||||||||||||||    
T  17577744 ctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtg 17577645  T
Q  542 atgat 546  Q
    |||||    
T  17577644 atgat 17577640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14070412 - 14070176
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||  |    | |||||||  |||||||  |    
T  14070412 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacgtc-aaagagtcgttgta---gccttgatcaatcaccaatgat 14070317  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  |  ||||||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  14070316 cttttgtctgatttggatgatgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttgtctt 14070218  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 374  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14070217 gtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtac 14070176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 9717640 - 9717882
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  9717640 aagtcttcactcctttatacaaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 9717737  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   |  |||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9717738 cttttgcctgatatggttattctcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 9717836  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717837 gtatcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9717882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 32544062 - 32544304
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  32544062 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 32544159  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | ||| |||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  32544160 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 32544258  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32544259 gtagcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32544304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 32757214 - 32757271
Alignment:
Q  9 caataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32757214 caataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 32757271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 12347880 - 12347926
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12347880 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12347926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 15954503 - 15954742
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||||       
T  15954503 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgaa 15954600  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||| ||||| |     | ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  15954601 cttttgtctgatgtta---ttgtcctatgaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 15954696  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15954697 gtagaagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15954742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31127672 - 31127623
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127672 atctccaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 31127623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 21618041 - 21618283
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  |||||||  ||    
T  21618041 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatc 21618138  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagct-gttgtcttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||   | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||   ||||| |||| |  |||||||| ||||  || | ||||||||    
T  21618139 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacat-tgttgcaggcagagctatttttattgtcttg 21618237  T
Q  334 tagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618238 tagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21618283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 17927581 - 17927627
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17927581 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtttgaaagagacgttg 17927627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18172391 - 18172345
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18172391 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttg 18172345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Original strand, 12348980 - 12349032
Alignment:
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12348980 ttgtcttgtagtagggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12349032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15531976 - 15531936
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15531976 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 15531936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19066369 - 19066329
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19066369 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 19066329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19623776 - 19623816
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19623776 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19623816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19833383 - 19833343
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19833383 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 19833343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20731056 - 20731016
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20731056 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20731016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 21624898 - 21624938
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21624898 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21624938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 15301997 - 15302239
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  | ||||||||||||  |||||||||  |||||||  |    
T  15301997 aagtattcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 15302094  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | ||||||| || |||   | ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||   || ||| |||| |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15302095 cttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatgaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacat-tgttgcaggcatagctgttatccttgtctt 15302193  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15302194 gtagcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 15302239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20113051 - 20113012
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20113051 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20113012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Original strand, 25592409 - 25592448
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25592409 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 25592448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10704895 - 10704849
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10704895 atcttcaagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 10704849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Original strand, 19625814 - 19625852
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625814 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 19625852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 179
Target Start/End: Original strand, 23230980 - 23231026
Alignment:
Q  133 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23230980 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgttgag 23231026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24719100 - 24719054
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24719100 atcttcaagtcttcactcctttatattgaggtttgaaagagacgttg 24719054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 16335923 - 16335964
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16335923 aagtcttcactcctttatatagaggtgcgaaagagacgttga 16335964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Original strand, 19470463 - 19470504
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470463 caagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19470504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 16877180 - 16877252
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877180 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19688576 - 19688616
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688576 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19688616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22076589 - 22076517
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22076589 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 22076517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 22802108 - 22802180
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802108 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 23296516 - 23296596
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-gataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  23296516 atcttcaagtctttaatccattatatagtggtgtgagagagacgttgatgattttcagcacatcaaaagagtcgtttgaaa 23296596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 25593865 - 25593905
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25593865 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 25593905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33352277 - 33352237
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33352277 agtcttcactccttcatatagaggtgtgaaagagacgttga 33352237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15478150 - 15478099
Alignment:
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15478150 ttctaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagatgttg 15478099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Original strand, 15987030 - 15987069
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15987030 aagtcttcactccttaatatagaggtgtgaaagagacgtt 15987069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 21235058 - 21235164
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggtt 370  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21235058 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttc-gcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggtt 21235156  T
Q  371 gtacactt 378  Q
    ||||||||    
T  21235157 gtacactt 21235164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Original strand, 26943383 - 26943418
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26943383 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 26943418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Original strand, 32335621 - 32335696
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||| || |||||||||||    
T  32335621 atcttcaagtcttcactcacttatatagaggtgtgagagagacgttgtagatttccagcacatcaaaagagtcgtt 32335696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 12423246 - 12423300
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12423246 tcttgtcttatagcggagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 12423300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 15551776 - 15551822
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15551776 atctttaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 15551822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17446014 - 17445969
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17446014 atcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaa-agacgttg 17445969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Original strand, 19482717 - 19482791
Alignment:
Q  305 tctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19482717 tctgcaggcagagctgttattcttgtcttttagtagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19482791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20488133 - 20488028
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20488133 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 20488035  T
Q  372 tacactt 378  Q
    || ||||    
T  20488034 taaactt 20488028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20730919 - 20730814
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||| |||| || || ||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20730919 ttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctt-tgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttg 20730821  T
Q  372 tacactt 378  Q
    |||||||    
T  20730820 tacactt 20730814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 21625086 - 21625140
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21625086 tcttgtcttgtagcacggacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 21625140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23006406 - 23006360
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23006406 atcttaaagtcttcactcatttatatagaggtgtgagagagacgttg 23006360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 23781960 - 23782006
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23781960 atcttaaagtcttcactcatttatatagaggtgtgagagagacgttg 23782006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24728904 - 24728858
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  24728904 atcttcaagtcttcactcctttatattgaagcgtgaaagagacgttg 24728858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14100583 - 14100550
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100583 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14100550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19066165 - 19066128
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19066165 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 19066128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 26943578 - 26943615
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26943578 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 26943615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10640600 - 10640529
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10640600 tgcaggcatagctgttattcttgtcatgtagtagagacaaaa-catagtagtggaggtagtggttgtacactt 10640529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 13435499 - 13435571
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435499 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13435571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14100790 - 14100750
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14100790 aagtctttactcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 14100750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15531806 - 15531738
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 374  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15531806 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtac 15531738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16265502 - 16265466
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16265502 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagac 16265466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 16336094 - 16336166
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16336094 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacactt 16336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 16915221 - 16915261
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16915221 aagtcttcactcctttacatagaggtgtgaaagagatgttg 16915261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 17381320 - 17381360
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17381320 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagaggcgttga 17381360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 17381488 - 17381560
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17381488 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacactt 17381560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 18435523 - 18435595
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18435523 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactt 18435595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 177
Target Start/End: Original strand, 19625609 - 19625645
Alignment:
Q  141 cttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19625609 cttcactcctttatgtagaggtgtgaaagagacgttg 19625645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22076758 - 22076718
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22076758 agtcttcactcctctatatagagatgtgaaagagacgttga 22076718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 22801937 - 22801977
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22801937 aagtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagacgttg 22801977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 24116625 - 24116665
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24116625 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgcgagagacgttg 24116665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26972578 - 26972538
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26972578 aagtcttcactcctttatatagacgtgtcaaagagacgttg 26972538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 12423059 - 12423098
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12423059 agtcgtcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12423098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Original strand, 13144795 - 13144834
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13144795 atcttcaggtattcactcctttatatagaggtgtgaaaga 13144834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19452878 - 19452827
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19452878 atcttcaagtcttcacccctttatatagagatgtgtagagagacgttgagat 19452827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 24398563 - 24398610
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  24398563 atcttcaagtattcactcctttatatagtggtgtgagagatacgttga 24398610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 7811803 - 7811849
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7811803 atcttcaagtgctcactcatttatataaaggtgtgaaagagacgttg 7811849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16265314 - 16265260
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16265314 tcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacactt 16265260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Original strand, 16876701 - 16876731
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876701 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 16876731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Original strand, 25592623 - 25592661
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25592623 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtact 25592661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 170
Target Start/End: Original strand, 25930267 - 25930305
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25930267 tcttcaggtcttcactcctttatgtagaggtgtgaaaga 25930305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 26589584 - 26589638
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26589584 tcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 26589638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26972390 - 26972336
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972390 tcttgtcttgtagcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 26972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33352090 - 33352036
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33352090 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacactt 33352036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 7812016 - 7812053
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7812016 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattgtac 7812053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 173
Target Start/End: Original strand, 15541787 - 15541828
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15541787 tcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaaaagac 15541828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18027083 - 18027042
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18027083 atcttcaagtcttcattcctttatacagaggtatgaaagaga 18027042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18172171 - 18172134
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18172171 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 18172134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 19623945 - 19624018
Alignment:
Q  306 ctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19623945 ctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19624018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19833176 - 19833143
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19833176 aaaacagagtagtggaggtagtgcttgtacactt 19833143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 176
Target Start/End: Original strand, 19875625 - 19875670
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  19875625 atcttcaagtattcactcctttatatagaggtatgggagagacgtt 19875670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19951920 - 19951883
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19951920 tcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 19951883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 20890835 - 20890872
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20890835 tcttcactcctttaaaaagaggtgtgaaagagacgttg 20890872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Original strand, 26185503 - 26185552
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26185503 atcttaaagtcttgaatcctttatatagaggtatgaaaaagacgttgaga 26185552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 12348099 - 12348135
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12348099 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattgta 12348135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14070553 - 14070501
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattc 64  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14070553 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatgagtacagaaattc 14070501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 15987200 - 15987272
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||   |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15987200 tgcaggcatagctgttatccttgtcctgtagtagagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacactt 15987272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17316707 - 17316635
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17316707 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacactt 17316635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19085955 - 19085995
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19085955 aagtcttcagtcctttatataaaggtgtgaaatagacgttg 19085995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 19086125 - 19086197
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19086125 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 19086197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 383
Target Start/End: Original strand, 19875844 - 19875876
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19875844 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 19875876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 21234920 - 21234960
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21234920 aagtcttcactcctttatataagtgtgtgaaagagacgttg 21234960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 202)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 10754990 - 10754447
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10754990 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcataaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 10754891  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754890 agctttttaacttgtatatctctatatctcatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10754791  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754790 tcgtttgaaatcatttaatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 10754691  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754690 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 10754592  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10754591 gtaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttc-tagataaggttgaaataagaaacagctactttgg 10754493  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10754492 atcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 10754447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34783353 - 34782809
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34783353 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttgg 34783254  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783253 cgctttttaacttgtgtatgtctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 34783154  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783153 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 34783054  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783053 aaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 34782955  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34782954 gaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttgg 34782855  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34782854 atcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 34782809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34772408 - 34771864
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34772408 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttgg 34772309  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34772308 cgctttttaacttgtgtatgtctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcatcacgtctaaagag 34772209  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772208 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 34772109  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772108 aaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 34772010  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34772009 gaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttgg 34771910  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34771909 atcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 34771864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20798194 - 20797648
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20798194 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20798095  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20798094 gcgcttttgaacttgtgtatctctatatgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 20797995  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797994 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 20797895  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797894 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgcagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 20797795  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20797794 cgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttg 20797695  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20797694 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 20797648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 42395477 - 42394933
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42395477 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 42395378  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42395377 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 42395278  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42395277 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaaggca 42395178  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395177 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaacaga-tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 42395080  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42395079 cgaaggacaaatgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttg 42394980  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42394979 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 42394933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 43043433 - 43043979
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43043433 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 43043532  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43043533 gcgcttttgaacttgtatgtctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 43043632  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043633 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 43043732  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043733 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 43043832  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43043833 cgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacaactactttg 43043932  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43043933 gatcttcagtttgaatatacgaattaaatgtagcttctggtgatgat 43043979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 30069666 - 30070209
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttct-aagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30069666 atacaatacaataaagactctagactttgaatttcttaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttg 30069765  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069766 gcgctttttaacttgtatatctctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 30069865  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069866 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctatgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 30069965  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30069966 cacaaattctgcaggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtc 30070065  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  30070066 aacgaaggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagactgaattgagaaccagctactt 30070165  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  30070166 tggatcttcagtttgatta-atggatcaaatgtagcttctggtga 30070209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8522339 - 8521794
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8522339 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 8522240  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8522239 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 8522140  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522139 gtcgtttgaaatcatttgatcattcactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 8522040  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8522039 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataa 8521941  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8521940 cgaaggacaaatgatcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttg 8521841  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8521840 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 8521794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 1108906 - 1109452
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1108906 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttg 1109005  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1109006 gcgctttttaacttgtgtatatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 1109105  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1109106 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaagg 1109205  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109206 cacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 1109304  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1109305 aacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactt 1109404  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1109405 tggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 1109452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31449052 - 31448505
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31449052 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgagagagttttgg 31448953  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctta---tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31448952 cgcttttgaacttgtatat--ctctatcttacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 31448855  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448854 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaagg 31448755  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448754 cacaaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 31448655  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  31448654 taaccaaggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgataaatagctact 31448555  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31448554 ttggatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 31448505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 1121664 - 1122210
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1121664 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttg 1121763  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1121764 gcgctttttaacttgtgtatatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 1121863  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1121864 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaagg 1121963  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121964 cacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 1122062  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1122063 aacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatacattcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactt 1122162  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1122163 tggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 1122210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 36084959 - 36084414
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36084959 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 36084860  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||| |||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36084859 gcgatttttaacttgtgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 36084760  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084759 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 36084660  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084659 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcatgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 36084561  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084560 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 36084461  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  36084460 gatattcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 36084414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31419161 - 31418614
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31419161 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctctgtagaatcaatttgacagagttttgg 31419062  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctta---tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31419061 cgcttttgaacttgtatat--ctctatcttacaatcttcaagtcttcactcctctatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 31418964  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31418963 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaagg 31418864  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31418863 cataaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 31418764  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  31418763 taacgaaggacaaatgctcaatgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatattgaattgagaaacagctact 31418664  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31418663 ttggatctttagtttgaatatacagattaaatgtagcttctggtgatgat 31418614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 24925901 - 24926447
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24925901 atacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 24926000  T
Q  100 gcgcttttg-aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24926001 gcgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaag 24926100  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24926101 agtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggc 24926200  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926201 acaaattctgcaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 24926299  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926300 acgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccttttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 24926399  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24926400 ggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 24926447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 24983182 - 24983728
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24983182 atacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 24983281  T
Q  100 gcgcttttg-aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24983282 gcgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaag 24983381  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24983382 agtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggc 24983481  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983482 acaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 24983580  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983581 atgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttaaataaggttgaaatgagaaacagctacttt 24983680  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24983681 ggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 24983728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23406944 - 23406399
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23406944 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagttcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 23406845  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
     ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23406844 acgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 23406745  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406744 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 23406645  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406644 caaattctgcaggcatagctgttgtattgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 23406546  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406545 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaatagctactttg 23406446  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||    
T  23406445 gatcttcagtttgaatttacgaatcaattgaagcttctggtgatgat 23406399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 36229237 - 36228692
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36229237 atacaatacgttaaaaactctagacttttgaatttccaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 36229138  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
     ||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36229137 acgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 36229038  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229037 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 36228938  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36228937 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtggcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 36228839  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36228838 cgaaggacaaatactcagtgttatccaaatgaccgttgatacctcccttacaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttg 36228739  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  36228738 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 36228692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19478499 - 19477954
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  19478499 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttatagaatcaaattgacagagttttg 19478400  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19478399 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 19478300  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478299 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 19478201  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478200 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 19478101  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19478100 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 19478001  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| ||||    
T  19478000 gatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgttgat 19477954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20552302 - 20551768
Alignment:
Q  12 taaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||    
T  20552302 taaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacgctttttaa 20552203  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  20552202 cttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcaagtctaaagagttgtttgaaa 20552103  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20552102 tcatttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaaatctgca 20552003  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20552002 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 20551904  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20551903 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatctttagtt 20551804  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  20551803 tgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 20551768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19464469 - 19463924
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  19464469 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttg 19464370  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19464369 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 19464270  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464269 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 19464171  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19464170 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaa 19464071  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19464070 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 19463971  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| ||||    
T  19463970 gatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgttgat 19463924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 5290338 - 5290879
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5290338 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 5290437  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290438 cgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5290537  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  5290538 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattaccatcttgaacgtac 5290637  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5290638 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5290737  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  5290738 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 5290837  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5290838 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 5290879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22559935 - 22559394
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22559935 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 22559836  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22559835 cgcttttgaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22559736  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22559735 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 22559636  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22559635 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22559536  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||     
T  22559535 cgagagacaagtgctcagtgctaaccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttta 22559436  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22559435 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22559394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27622529 - 27623070
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27622529 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27622628  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622629 cgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27622728  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27622729 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 27622828  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27622829 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27622928  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  27622929 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 27623028  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  27623029 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 27623070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 21702891 - 21703405
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21702891 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 21702990  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21702991 gcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 21703090  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703091 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 21703189  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703190 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 21703289  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | || || | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21703290 cgaaggacaaatacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacagctactttg 21703389  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  21703390 aatcttcagtttgaat 21703405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 27603180 - 27603693
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27603180 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27603279  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603280 cgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27603379  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27603380 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 27603479  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27603480 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctattaa 27603579  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  27603580 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttgaataagactgaattgagaatcagctactttg 27603679  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  27603680 aatcttcagtttga 27603693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 21705738 - 21706252
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  21705738 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaattgacagagttttg 21705837  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21705838 gcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 21705937  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705938 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 21706036  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21706037 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 21706136  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21706137 cgaaggacaaatactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacaactactttg 21706236  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  21706237 aatcttcagtttgaat 21706252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 5300909 - 5301455
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5300909 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 5301008  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301009 cgcttttgaacttgtatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5301108  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5301109 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 5301208  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt-----agtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||     || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5301209 aacttctgctggcatggctgttgtcttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctct 5301308  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     |||||||   |||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||    
T  5301309 attaacgagaaacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagcta 5301408  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||| ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5301409 ctttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 5301455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 17446458 - 17447003
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17446458 atacaatacaataaagactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 17446557  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  17446558 ggcgctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaag 17446657  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17446658 agtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaagga 17446756  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446757 acat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 17446855  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17446856 acgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcatttttcttatacgaggttgaaatgagaaacagctacttt 17446955  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  17446956 ggatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctggtgatgat 17447003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 17457074 - 17457619
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17457074 atacaatacaataaatactctagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 17457173  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  17457174 ggcgctttttaacttgtatctctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaag 17457273  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17457274 agtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaagga 17457372  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457373 acat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 17457471  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17457472 acgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtttttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctacttt 17457571  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  17457572 ggatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctggtgatgat 17457619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20562823 - 20562293
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20562823 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20562724  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  20562723 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcaagtctaaaga 20562624  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  20562623 gttgtttgaaatcatttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa---- 20562528  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
               ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562527 -----------ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 20562440  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562439 cgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 20562340  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  20562339 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 20562293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22147009 - 22146478
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22147009 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 22146910  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146909 tatgtatttctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 22146810  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  22146809 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22146710  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  22146709 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22146610  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22146609 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 22146510  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22146509 ttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22146478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22157592 - 22157061
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22157592 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 22157493  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157492 tatgtatttctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 22157393  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  22157392 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 22157293  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  22157292 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 22157193  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22157192 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 22157093  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22157092 ttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22157061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6131289 - 6130774
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6131289 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6131190  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131189 cgcttttgaacttatgtatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 6131090  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |     
T  6131089 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgt 6130990  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6130989 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 6130890  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  6130889 aatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactt 6130790  T
Q  498 tggatcttcagtttga 513  Q
    || ||||| |||||||    
T  6130789 tgaatctttagtttga 6130774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9336453 - 9335913
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9336453 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9336354  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336353 cgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9336254  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9336253 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9336154  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9336153 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9336055  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  9336054 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 9335955  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  9335954 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 9335913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9347040 - 9346500
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9347040 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9346941  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346940 cgcttttgaacttatgtatttctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9346841  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9346840 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9346741  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9346740 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9346642  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  9346641 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 9346542  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  9346541 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 9346500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 16003653 - 16004194
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16003653 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 16003752  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003753 cgcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 16003852  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  16003853 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 16003952  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16003953 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 16004052  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  16004053 cgagagacaagtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 16004152  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  16004153 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 16004194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23307343 - 23306802
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23307343 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23307244  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307243 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23307144  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23307143 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 23307044  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23307043 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 23306944  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  23306943 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 23306844  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  23306843 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 23306802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34063119 - 34062572
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  34063119 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaataagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 34063020  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  34063019 gcgctttttaacttgtatatgactctatctttattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaa 34062920  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34062919 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccaacttgaagg 34062821  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34062820 aacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 34062722  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||    
T  34062721 aacgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtacttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactt 34062622  T
Q  498 tggatcttcagtttgaa-tatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||| | || | || || |||||||||||||||||||    
T  34062621 tgaatcttcagtttgaattttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 34062572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 39352986 - 39352473
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39352986 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 39352887  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | |||  || | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352886 cgcttttgaacttatgtatccctttctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39352787  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39352786 tcgtttgaaattctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 39352687  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39352686 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 39352587  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  39352586 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 39352487  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  39352486 aatcttcagtttga 39352473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 40401517 - 40401004
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40401517 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40401418  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401417 cgcttttgaacttatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40401318  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40401317 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 40401218  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40401217 aaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattta 40401118  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  40401117 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 40401018  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  40401017 aatcttcagtttga 40401004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 14557779 - 14558320
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14557779 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14557878  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557879 cgcttttaaacttatgtatctctgtctcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14557978  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14557979 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 14558078  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14558079 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 14558178  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  14558179 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 14558278  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  14558279 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 14558320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 14568416 - 14568957
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14568416 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14568515  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568516 cgcttttaaacttatgtatctctgtctcaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14568615  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14568616 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 14568715  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14568716 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 14568815  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  14568816 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 14568915  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  14568916 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 14568957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23296775 - 23296234
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23296775 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23296676  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296675 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23296576  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23296575 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcatttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 23296476  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23296475 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 23296376  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  23296375 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 23296276  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  23296275 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 23296234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23707940 - 23707400
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23707940 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23707841  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707840 cgcttttgaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23707741  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  23707740 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 23707641  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23707640 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 23707542  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  23707541 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 23707442  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  23707441 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 23707400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 40390855 - 40390314
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40390855 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40390756  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390755 cgcttttgaacttatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40390656  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40390655 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 40390556  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40390555 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattta 40390456  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| |||||||||||    
T  40390455 cgagagacaattgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactaaattgagaatcagctactttg 40390356  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  40390355 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 40390314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31844459 - 31843916
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31844459 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 31844360  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844359 cgcttttgaacttatgtatatctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 31844260  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |     
T  31844259 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgt 31844160  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31844159 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 31844060  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||| |||||||||    
T  31844059 aacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataggactgaattgagaatcagctactt 31843960  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  31843959 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 31843916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 9377224 - 9377765
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  9377224 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 9377323  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377324 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9377423  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9377424 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9377523  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9377524 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9377623  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  9377624 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 9377723  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  9377724 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 9377765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24816648 - 24817189
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  24816648 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 24816747  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816748 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24816847  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24816848 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24816947  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24816948 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24817047  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24817048 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 24817147  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  24817148 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 24817189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24827236 - 24827777
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  24827236 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 24827335  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827336 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24827435  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24827436 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24827535  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24827536 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24827635  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24827636 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 24827735  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  24827736 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 24827777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 39490712 - 39491253
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39490712 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 39490811  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490812 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39490911  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  39490912 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 39491011  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39491012 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 39491111  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  39491112 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 39491211  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  39491212 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 39491253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 39501902 - 39502443
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39501902 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 39502001  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39502002 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39502101  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  39502102 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 39502201  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39502202 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 39502301  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  39502302 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 39502401  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  39502402 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 39502443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23362609 - 23362067
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23362609 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23362510  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362509 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23362410  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcc-tttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
T  23362409 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaa 23362310  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23362309 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 23362210  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  23362209 atgagagacaagtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctacttt 23362110  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  23362109 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 23362067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6976306 - 6975765
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6976306 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6976207  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976206 cgcttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6976107  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  6976106 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 6976007  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6976006 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6975907  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6975906 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 6975807  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  6975806 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 6975765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 7031888 - 7032431
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7031888 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 7031987  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031988 cgcttttgaacttatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7032087  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7032088 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 7032187  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggac---aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7032188 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 7032287  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  7032288 aacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctctcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactt 7032387  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||| ||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  7032388 tgaatcttcaatttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 7032431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 15993091 - 15993632
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15993091 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 15993190  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15993191 cgcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagagccgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 15993290  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  15993291 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 15993390  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15993391 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagattagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 15993490  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || ||| |||||||    
T  15993491 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgaaaatcagttactttg 15993590  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  15993591 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 15993632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27204290 - 27203750
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27204290 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27204191  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27204190 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcaacacgtctaaagag 27204092  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27204091 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27203992  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27203991 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27203892  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  27203891 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 27203792  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  27203791 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 27203750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34052458 - 34051911
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  34052458 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaataagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 34052359  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctta--tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  34052358 gcgctttttaacttgtatatgactctatctttattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaatagcacgtctaaa 34052259  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34052258 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccaacttgaagg 34052160  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34052159 aacat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 34052061  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  34052060 aatgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtacttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactt 34051961  T
Q  498 tggatcttcagtttgaa-tatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||| | || | || || |||||||||||||||||||    
T  34051960 tgaatcttcagtttgaattttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 34051911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 42043282 - 42042742
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42043282 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 42043183  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043182 cgctttttaacttatgtatttttctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 42043083  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  42043082 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 42042983  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42042982 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 42042884  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  42042883 cgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 42042784  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  42042783 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 42042742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 42053857 - 42053317
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42053857 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 42053758  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053757 cgctttttaacttatgtatttttctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 42053658  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  42053657 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 42053558  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42053557 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 42053459  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  42053458 cgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 42053359  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  42053358 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 42053317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 33951562 - 33952104
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  33951562 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 33951661  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951662 cgcttttgaacttatgtatttctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 33951761  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  33951762 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 33951861  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33951862 caaattctgcgggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 33951961  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  33951962 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 33952061  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  33952062 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 33952104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35226588 - 35226046
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35226588 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 35226489  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226488 cgcttttgaacttatgtatatctcttttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35226389  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35226388 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35226289  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35226288 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35226189  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35226188 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35226089  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35226088 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35226046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 40513751 - 40514293
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40513751 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40513850  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513851 cgcttttgaacttatgtatctctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40513950  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  40513951 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 40514050  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40514051 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 40514150  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  40514151 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 40514250  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  40514251 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 40514293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6986796 - 6986255
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6986796 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6986697  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6986696 cgcttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6986597  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  6986596 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 6986497  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6986496 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6986397  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||     
T  6986396 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttta 6986297  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  6986296 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 6986255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14030542 - 14030001
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14030542 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14030443  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030442 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14030343  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14030342 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 14030243  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14030242 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 14030143  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  14030142 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 14030043  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  14030042 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 14030001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14041095 - 14040554
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14041095 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14040996  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040995 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14040896  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14040895 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 14040796  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14040795 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 14040696  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  14040695 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 14040596  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  14040595 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 14040554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 15693794 - 15694334
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  15693794 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 15693893  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693894 cgcttttaaacttatgtatctctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 15693993  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  15693994 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 15694093  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15694094 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 15694192  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  15694193 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 15694292  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  15694293 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 15694334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24567587 - 24567047
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  24567587 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 24567488  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567487 cgcttttaaacttatgtatctctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24567388  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  24567387 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 24567288  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24567287 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24567189  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  24567188 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 24567089  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  24567088 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 24567047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 14446763 - 14447303
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14446763 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14446862  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446863 cgcttttaaacttgtgtat--ctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14446960  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  14446961 tcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 14447060  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14447061 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 14447160  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  14447161 aagagagacaagtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccctttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 14447260  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  14447261 gaatcttcagtttgattaca-ggatcaaatgtagcttctggtga 14447303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 14457375 - 14457915
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14457375 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 14457474  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457475 cgcttttaaacttgtgtat--ctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 14457572  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  14457573 tcgtttgaaatcctttaattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 14457672  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14457673 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 14457772  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  14457773 aagagagacaagtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccctttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 14457872  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  14457873 gaatcttcagtttgattaca-ggatcaaatgtagcttctggtga 14457915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24808407 - 24807870
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24808407 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 24808308  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808307 ttttaaacttatgtatatctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 24808208  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  24808207 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 24808109  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24808108 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacga 24808009  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
      |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24808008 gagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaat 24807909  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||| ||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  24807908 cttgagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 24807870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35216004 - 35215462
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35216004 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 35215905  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215904 cgcttttgaacttatgtatatctcttttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35215805  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35215804 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35215705  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35215704 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35215605  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35215604 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35215505  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||| ||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35215504 gaatcttcagtatgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35215462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22676614 - 22676073
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22676614 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 22676515  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676514 cgcttttgaacttatgtatctctatcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22676415  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22676414 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 22676315  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22676314 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22676215  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  | |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  22676214 cgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 22676115  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22676114 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 22676073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22686505 - 22685964
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22686505 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 22686406  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686405 cgcttttgaacttatgtatctctatcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22686306  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22686305 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 22686206  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22686205 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22686106  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  | |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  22686105 cgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 22686006  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22686005 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 22685964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27460659 - 27460118
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27460659 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27460560  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460559 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27460460  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27460459 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27460360  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27460359 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27460260  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  27460259 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 27460160  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  27460159 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 27460118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27471058 - 27470517
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27471058 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27470959  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27470958 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27470859  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27470858 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27470759  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27470758 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27470659  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  27470658 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 27470559  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  27470558 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 27470517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36582320 - 36582861
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36582320 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaggttgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36582419  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582420 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36582519  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36582520 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaac 36582619  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36582620 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36582719  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| || |||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  36582720 tgagagacaagtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttg 36582819  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36582820 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36582861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36592875 - 36593416
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36592875 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaggttgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36592974  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592975 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36593074  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36593075 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaac 36593174  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36593175 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36593274  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| || |||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  36593275 tgagagacaagtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttg 36593374  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36593375 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36593416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 30227258 - 30227800
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30227258 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 30227357  T
Q  101 cgcttttg--aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    |||||||   ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227358 cgctttttttaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 30227457  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |     
T  30227458 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgt 30227557  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30227558 aca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 30227656  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||    
T  30227657 aacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactt 30227756  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  30227757 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 30227800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 30237785 - 30238327
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30237785 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 30237884  T
Q  101 cgcttttg--aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    |||||||   ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237885 cgctttttttaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 30237984  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |     
T  30237985 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgt 30238084  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30238085 aca-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 30238183  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||    
T  30238184 aacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactt 30238283  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  30238284 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 30238327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15740466 - 15739924
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15740466 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 15740367  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740366 cgcttttgaacttatgtatctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 15740267  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  15740266 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 15740167  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15740166 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 15740067  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  15740066 atgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 15739967  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  15739966 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 15739924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15769626 - 15769084
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15769626 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 15769527  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769526 cgcttttgaacttatgtatctctatcttgaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 15769427  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  15769426 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 15769327  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15769326 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 15769227  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  15769226 atgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 15769127  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  15769126 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 15769084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27041974 - 27042515
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  27041974 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttcg 27042073  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27042074 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27042173  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27042174 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27042273  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27042274 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 27042373  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  27042374 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 27042473  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27042474 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27042515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27052598 - 27053140
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27052598 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27052697  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052698 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27052797  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  27052798 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 27052897  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgt-acacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  27052898 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggtggtagtggttgtaacacttgtactttgtcaactctatta 27052997  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  27052998 atgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagaatgaattgagaatcagcaacttt 27053097  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27053098 gaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27053140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17607557 - 17607020
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17607557 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17607458  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607457 cgcttttgaacttgtgtat--ctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17607360  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17607359 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17607260  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17607259 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17607160  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||     
T  17607159 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt- 17607061  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
      |||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  17607060 -ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17607020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36688192 - 36687696
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36688192 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36688093  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688092 cgcttttgaactt--atttttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36687995  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36687994 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 36687895  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36687894 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36687795  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  36687794 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 36687696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36698758 - 36698262
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36698758 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36698659  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698658 cgcttttgaactt--atttttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36698561  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36698560 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 36698461  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36698460 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36698361  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  36698360 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 36698262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31349031 - 31348494
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31349031 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttgg 31348932  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31348931 cgcttttgaacttatatatatctat--ctaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 31348834  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  31348833 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 31348734  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31348733 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 31348634  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||     
T  31348633 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt- 31348535  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
      |||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  31348534 -ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 31348494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31359645 - 31359108
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31359645 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaattaaattgacagagttttgg 31359546  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359545 cgcttttgaacttatatatatctat--ctaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 31359448  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  31359447 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 31359348  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31359347 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 31359248  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||     
T  31359247 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt- 31359149  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
      |||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  31359148 -ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 31359108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17618172 - 17617634
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17618172 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17618073  T
Q  101 -cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
     ||||||||||||||| |||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618072 tcgcttttgaacttgtgtat--ctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 17617975  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | |    
T  17617974 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgta 17617875  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17617874 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 17617775  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  17617774 atgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 17617675  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
       |||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  17617674 --ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17617634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17719414 - 17718875
Alignment:
Q  2 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 101  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17719414 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 17719315  T
Q  102 gcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 201  Q
    |||||||||||| | |||  |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719314 gcttttgaacttatgtat--ctctataaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 17719217  T
Q  202 cgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcac 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||    
T  17719216 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtac 17719117  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17719116 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17719017  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  17719016 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 17718917  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  17718916 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17718875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17730066 - 17729527
Alignment:
Q  2 tacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 101  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17730066 tacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 17729967  T
Q  102 gcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 201  Q
    |||||||||||| | |||  |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17729966 gcttttgaacttatgtat--ctctataaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 17729869  T
Q  202 cgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcac 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | ||    
T  17729868 cgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtac 17729769  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17729768 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17729669  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  17729668 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 17729569  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || |||| |||||||||||||    
T  17729568 aatcttcagtttgacta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17729527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 37407137 - 37406606
Alignment:
Q  9 caataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37407137 caataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 37407038  T
Q  108 gaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
     ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |    
T  37407037 taacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgaataacacgtctaaagagtcgtt-g 37406939  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    |  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  37406938 agttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattaattctcatcttgaaggaaca-attct 37406840  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggac 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37406839 gcaggcataactgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggac 37406740  T
Q  408 aactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 507  Q
    || | ||||| | |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  37406739 aagtactcagtgtt-------tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactttgaatcttca 37406647  T
Q  508 gtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgatgt 548  Q
    |||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||||    
T  37406646 gtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgatgt 37406606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Original strand, 37729014 - 37729488
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  37729014 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 37729113  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37729114 cgcttttgaacttatgtacttctctatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-gatcagcacgtctaaagag 37729212  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  37729213 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 37729312  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37729313 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 37729412  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataag 474  Q
    | ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37729413 atgagagacaagtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataag 37729488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Original strand, 37740330 - 37740804
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  37740330 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 37740429  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37740430 cgcttttgaacttatgtacttctctatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-gatcagcacgtctaaagag 37740528  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  37740529 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 37740628  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37740629 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 37740728  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataag 474  Q
    | ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37740729 atgagagacaagtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataag 37740804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 106618 - 106107
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  106618 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 106519  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    ||||||||  ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  106518 ggcgctttc-aacttgtgttaatgtctcttaccaatcttcaagtctccactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagattttttagcacgtcta 106420  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  106419 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaa 106321  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106320 ggaacat-ttctacaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 106222  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| || ||||||||      
T  106221 ataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcattc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctca 106123  T
Q  496 tttggatcttcagttt 511  Q
    |||| |||||||||||    
T  106122 tttgaatcttcagttt 106107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20625264 - 20624718
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  20625264 atacaatgcaataaagactatagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 20625165  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  20625164 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagattttttagcacgtcta 20625066  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  20625065 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaa 20624967  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20624966 ggaacat-ttctgcaggcatagctgttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactctg 20624868  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     ||||||||||||| | | ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||| ||| |    
T  20624867 ataacgaaggacaagtacccagtgcctttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcattc-tcttagatgaggttgaaacgaaaaactgctcc 20624769  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| ||| ||||||| ||| ||   ||||  |||||||||||||||||||    
T  20624768 tttgaatcgtcagtttaaatttactgattacttgtagcttctggtgatgat 20624718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 233 - 546
Target Start/End: Original strand, 43621855 - 43622168
Alignment:
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621855 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 43621954  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatcc-aaatga 431  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  43621955 gtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaaatga 43622053  T
Q  432 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgta 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||    
T  43622054 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagatagtgctgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgta 43622153  T
Q  532 gcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||    
T  43622154 gcttctggtgatgat 43622168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31833981 - 31833644
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  31833981 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttga 31833882  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833881 cgcttttgaacttatgtatatctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 31833782  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |     
T  31833781 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgt 31833682  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 336  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31833681 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtag 31833644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20417402 - 20416856
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||  |||| |||||||||    
T  20417402 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaatatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctatttagaatcaaatttggcagagtttt 20417303  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20417302 ggcgctttttaacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtagtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 20417203  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||| ||||| || | |||||||||||||||  |||||||    
T  20417202 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttagatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctctcttgaa 20417104  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20417103 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 20417006  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |  ||  || || |||||||| |    
T  20417005 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgtt-ttcttagacgatattagaacgaaaaacagctcc 20416907  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  20416906 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 20416856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39364979 - 39364685
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39364979 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 39364880  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | |||  || | |   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39364879 cgcttttgaacttatgtatccctttctacaatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39364780  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39364779 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaa 39364685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 461
Target Start/End: Original strand, 32753707 - 32754167
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  32753707 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgttttatagaatcaaatttggcagagtttt 32753806  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||| ||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  32753807 ggcactttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatctt-aagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 32753904  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32753905 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatctaccattaatctttttcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaa 32754003  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32754004 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 32754101  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 461  Q
    | || ||||||| |     ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32754102 tcaatgaaggacgagcatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 32754167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23697282 - 23696988
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23697282 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 23697183  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23697182 cgcttttgaacttatgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgaaataatcagcacgtctaaagag 23697083  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcc-tttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  23697082 tcgttttgaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtggagtccttttaaagaaaaaccttcaaattccttcccatcttga 23696988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 236 - 546
Target Start/End: Original strand, 21414197 - 21414505
Alignment:
Q  236 tttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgta 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21414197 tttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgta 21414295  T
Q  336 gtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgt 435  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||| ||||||    
T  21414296 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaacgaccgt 21414395  T
Q  436 tgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatata-tgaattaaatgtagct 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||  || |||||||    
T  21414396 tgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgaa-caattgtagct 21414493  T
Q  535 tctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||    
T  21414494 tctggtgatgat 21414505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 165 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23372848 - 23372468
Alignment:
Q  165 gaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtccttt-ga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23372848 gaaagagacgttgagataatcagcccgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgttcctttgcctgatttgggggtagtccttttga 23372749  T
Q  264 agaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata-ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggag 361  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| | || |  |||||| |||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23372748 agaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgaacaaaatttttgaggcatggctgttgttttttcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggag 23372649  T
Q  362 gtagtgg-ttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgt 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372648 gtagtgggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccctttcaattcttcgt 23372549  T
Q  461 tcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||| | ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  23372548 tcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 23372468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 313 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23392901 - 23392669
Alignment:
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23392901 catagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaata 23392803  T
Q  413 ctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttg 512  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392802 ctcagtgctatccaaatgacctttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttg 23392703  T
Q  513 aatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| || |||| || || | ||||||||||||||    
T  23392702 aatttacgaatcaattgaaacttctggtgatgat 23392669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35543626 - 35543231
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| |||| |||    
T  35543626 atacaatgcaataaaagactatagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagatttt 35543527  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  35543526 tggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttt-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtct 35543429  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||  |||||||    
T  35543428 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccacaagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcatatcttga 35543330  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35543329 aggaaca-attctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtcgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 35543231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 13522845 - 13523240
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  13522845 atacaatgcaataaaagactccagacttgagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 13522944  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgt-atatttctcttt-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||| |||||  ||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  13522945 aggcgctttt-aacttgtgatattg-tctatgcagatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtct 13523042  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||    
T  13523043 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaagatcaacttcaaattcattcctatcttga 13523141  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13523142 aggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13523240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 13533572 - 13533967
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  13533572 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 13533671  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgt-atatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||| ||| | |||||  |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||| |||  | |||||||||    
T  13533672 gggcgctttt-aacttgtgataatgtctctg-cagatcttcaagtcttcacttccttatatagtggtgtgtagagagacgttgcgatcttaagcacgtct 13533769  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  13533770 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 13533868  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13533869 aggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13533967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20168564 - 20168169
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  20168564 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttt 20168465  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgt-atatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| | |||||  || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  20168464 tggagctttt-aacttgtgataatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcatttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtct 20168367  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  20168366 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 20168268  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20168267 gggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 20168169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 303 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 39362510 - 39362271
Alignment:
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39362510 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacg 39362411  T
Q  402 aaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 501  Q
    |  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |    
T  39362410 agagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaa 39362311  T
Q  502 tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  39362310 tcttcagtttgatta-agggatcaaacgtagcttctggtga 39362271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36096149 - 36095755
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  36096149 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgattttgagaaacaaatttggcagagttt 36096050  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     | ||||||  | ||||||   || |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  36096049 ggacgcttta-accttgtagtaatgtctctg-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtct 36095952  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36095951 aaagattcgtt-gaga-cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttga 36095854  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36095853 aggaaca-attttgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36095755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36097606 - 36097212
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  36097606 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgattttgagaaacaaatttggcagagttt 36097507  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     | ||||||  | ||||||   || |||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  36097506 ggacgcttta-accttgtagtaatgtctctg-ctgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtct 36097409  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36097408 aaagattcgtt-gaga-cctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttga 36097311  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36097310 aggaaca-attttgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36097212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43621656 - 43621853
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43621656 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 43621755  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  43621756 gcgctttttaacttgtgtatttctatctacaatcttcaagtcttcaatcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaa 43621853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 345 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31815316 - 31815120
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  31815316 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctc 31815217  T
Q  445 cctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  31815216 cctttcaattcttcgttcttctttgataggactgaattgagaatcaactactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 31815120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 23478157 - 23478421
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  23478157 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 23478254  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || |||||  |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||    
T  23478255 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctacaggcatagctgtttttctt 23478353  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23478354 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 23478421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 1915206 - 1915469
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  1915206 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgatagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaa 1915304  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgt 329  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  1915305 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagttgttatcttgt 1915403  T
Q  330 cttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1915404 cttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 1915469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 394
Target Start/End: Original strand, 13404802 - 13405167
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgta-tatt-tctc 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  13404802 gaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttgtattgtctc 13404900  T
Q  125 tttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatc 223  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||   || |||| |||||      
T  13404901 ta-cagatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatcttttagcacgtc-aaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaa 13404997  T
Q  224 caccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 323  Q
     ||||||  || ||||||||||||||  || ||||  ||||| || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||     
T  13404998 taccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtta 13405096  T
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13405097 tcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 13405167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 394
Target Start/End: Original strand, 40228343 - 40228710
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctctt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||    || |||     
T  40228343 gaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtgtgaaacaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgttgtcttgtctc 40228441  T
Q  127 t-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatc 223  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||      
T  40228442 tactgatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaa 40228540  T
Q  224 caccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 323  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||     
T  40228541 taccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtta 40228639  T
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40228640 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctct 40228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20215465 - 20215201
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| | |||||| ||||| |  | ||||| |   |||||    
T  20215465 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtcaatagagtc-tttgagaaaccttgattaaataccaa 20215367  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  20215366 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttg 20215268  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20215267 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20215201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 129 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11208336 - 11208087
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||  ||||    
T  11208336 ttatcttcacgtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagaactttaagcacgtcaatagagtcgttctgaagcctt-gatcaatcacc 11208238  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ct 326  Q
    |||  |  ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||||| |||||  || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||    
T  11208237 aatgattttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 11208139  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11208138 tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 11208087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40033115 - 40032855
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   ||||    
T  40033115 atcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgtaaagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaatacca 40033017  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 328  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  40033016 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaagcagagctgttatcttg 40032918  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  40032917 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac---tactttgtcaactct 40032855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25112227 - 25111966
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||   | |||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  25112227 atcttcaagtcttcactcctttataaagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 25112130  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  25112129 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 25112031  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 391  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25112030 gtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25111966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25171318 - 25171057
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||   | |||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  25171318 atcttcaagtcttcactcctttataaagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 25171221  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  25171220 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 25171122  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 391  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25171121 gtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25171057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 378
Target Start/End: Original strand, 32160543 - 32160801
Alignment:
Q  120 ttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttg 217  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   | |||||||| | ||||||||| ||||| |  |||    
T  32160543 ttctcttctttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgcgatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaac--ttg 32160640  T
Q  218 atcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatag 317  Q
    ||||  |||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  | | || |||| ||||||||||| ||    
T  32160641 atcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaacat-ttctgcaggcagag 32160739  T
Q  318 ctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||| || |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32160740 ctgtttttcttatcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 32160801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28464681 - 28464441
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgt--ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    ||||||||||||| || | |||||| |  |||||||  |||    
T  28464681 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgtcagcacattcaaaaagagtcgtttg-aagcttttgataaatcaccaatgatcc 28464584  T
Q  236 tttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgt 334  Q
    |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||   |||||| |||| |  |||||||| ||||| || ||||||||| |    
T  28464583 tttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacat-tgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttat 28464485  T
Q  335 agtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28464484 agtagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacactt 28464441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 89766 - 89524
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  89766 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 89669  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt-gtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |   |||||| |||| |  |||||||| |||||||  |||||||||    
T  89668 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacat-tgatgcaggcagagctgttattcttgtctt 89570  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  89569 gtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 89524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 10848567 - 10848808
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  ||| |||  ||    
T  10848567 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaat-gtcagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcacaaatgatc 10848664  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||   | ||||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||   ||||   |||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  10848665 ctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacat-tgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 10848763  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10848764 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 10848808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22586347 - 22586298
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22586347 atcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgaga 22586298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 312
Target Start/End: Original strand, 23488303 - 23488483
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  23488303 atcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaaagattcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 23488400  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||  || | ||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23488401 atgatcttctgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcagg 23488483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39799226 - 39799178
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39799226 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttgag 39799178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7746037 - 7745795
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || ||||  |    
T  7746037 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 7745940  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7745939 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 7745841  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745840 gtagcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 459 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21520099 - 21520012
Alignment:
Q  459 gttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  21520099 gttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 21520012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26120178 - 26120103
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| || |||||||||||    
T  26120178 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttgttgattgtcagcacttcaaaagagtcgtt 26120103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 15516762 - 15516803
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516762 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 15516803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25097172 - 25097131
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25097172 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 25097131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25155142 - 25155101
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25155142 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 25155101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3245784 - 3245744
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245784 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 3245744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 4886985 - 4887057
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4886985 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4887057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13736477 - 13736437
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13736477 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13736437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 20550687 - 20550930
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  || ||||  |    
T  20550687 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtaaatttccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 20550784  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatct-tgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtct 331  Q
    | |||||||||| |||   |  |||| ||||| || |  |||||||  ||||| || | |||||| ||||  | |||||| | ||||||| | |||||||    
T  20550785 cttttgcctgatatggttattttcctatgaaggatcaatttcaaatcgattccaatttgtgaaggaacatcgt-tgcaggaaaagctgtttttcttgtct 20550883  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20550884 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20550930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21100048 - 21100008
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100048 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21100008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21199346 - 21199306
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21199346 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21199306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23413319 - 23413279
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23413319 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 23413279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25930498 - 25930458
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25930498 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 25930458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 28139401 - 28139441
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28139401 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 28139441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31145978 - 31145938
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31145978 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 31145938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 33933230 - 33933302
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33933230 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 33933302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 6499033 - 6499072
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499033 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 6499072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 25740917 - 25740956
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25740917 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 25740956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31589349 - 31589302
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31589349 atcttcaagtcatcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 31589302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19536642 - 19536604
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19536642 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 19536604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 30742775 - 30743015
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  |||||||  ||    
T  30742775 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatc 30742872  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||   | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  | |||| ||||  | |||||| | ||||| || ||||||||||    
T  30742873 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaagtatcaatttcaaatgcattcccattgtaaaggaacatcgt-tgcaggtagagctgtttttcttgtcttg 30742971  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30742972 tagcagagac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30743015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 33022460 - 33022699
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |  ||   |||||||| ||||   |||||||||  |||||||      
T  33022460 aagtcttcactcctttaaatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaatagagtcgtctgaa--gctttgatcaatcaccaatga 33022557  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 332  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| |||   | |||||||||    
T  33022558 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagc---tttcttgtctt 33022653  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33022654 gtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 33022699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Original strand, 24019403 - 24019452
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24019403 atcttcaggtcttcactcctttaaataaaggtgtgaaagagacgttgaga 24019452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 643046 - 643006
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  643046 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 643006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 11993682 - 11993722
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11993682 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga 11993722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 11993851 - 11993923
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11993851 tgcaggcatagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 11993923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22000401 - 22000361
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22000401 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 22000361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 23880860 - 23880900
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23880860 aagtcttcactcctttatatagagctgtgaaagagacgttg 23880900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 28139570 - 28139642
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28139570 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28139642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29138749 - 29138709
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29138749 agtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttga 29138709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35932345 - 35932309
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35932345 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 35932309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2156626 - 2156591
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156626 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 2156591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12353138 - 12353103
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 12353103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13545855 - 13545816
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13545855 agtcttcactcctttatatagaggtttgaaagagacgttg 13545816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17263077 - 17263030
Alignment:
Q  133 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17263077 cttcaagtcatcgctcctttatatagatgtgtgaaagagacgttgaga 17263030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 31488042 - 31488081
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31488042 agtcttcactcctttttatagaggtgtgaaagagacgttg 31488081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3245597 - 3245543
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3245597 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 3245543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 9088950 - 9089004
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9088950 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 9089004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14086695 - 14086641
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14086695 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacactt 14086641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 20567599 - 20567645
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20567599 atcttcaagtctttactgctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 20567645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 165
Target Start/End: Original strand, 34638242 - 34638276
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34638242 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 34638276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 4886815 - 4886856
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4886815 aagtcttcactcctttatatagaggtgtcagagagacgttga 4886856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 15516971 - 15517004
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516971 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15517004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21072582 - 21072541
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatata-gaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21072582 aagtcttcactcctttatataggaggtgtgaaagagacgttg 21072541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30116011 - 30115942
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30116011 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 30115942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35932145 - 35932108
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35932145 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35932108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 42243682 - 42243715
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42243682 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 42243715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 178
Target Start/End: Original strand, 9088767 - 9088803
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9088767 ttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga 9088803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14086881 - 14086841
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14086881 agtcttcacttctttatatagatgtgtgaaagagacgttga 14086841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21203989 - 21203949
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21203989 aagtcttcactccattatatagatgtgtgaaagagacgttg 21203949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 175
Target Start/End: Original strand, 23589500 - 23589544
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 175  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23589500 atcttcaagtcttcgctcatttatatagaggtgtgaaagatacgt 23589544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25096999 - 25096928
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25096999 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25154969 - 25154898
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25154969 tgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25154898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 26784146 - 26784186
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26784146 aagtcttcactcccttatacagaggtgtgaaagagacgttg 26784186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 31117670 - 31117710
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31117670 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagggacgttg 31117710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 33933062 - 33933102
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33933062 agtcttcactcatttatatagaggtgtgagagagacgttga 33933102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 42243475 - 42243515
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  42243475 agtcttcactcctttatataaaggtgtgatagagacgttga 42243515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13545668 - 13545614
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13545668 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacactt 13545614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 383
Target Start/End: Original strand, 16607518 - 16607552
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16607518 cagagtagtggagatagtggttgtacacttgtact 16607552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 26758943 - 26759184
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |  |||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||  ||    
T  26758943 agtcttcactctattatatagaggtgtgaaagagacgctga-attttcagcacattaaaaatagagtcgtttgaaactttttgatcaatcaccaatgatc 26759041  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||   | |||||  |||  || |  ||||||| |||||| ||  |||||| | ||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26759042 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctattatgaaggaatattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 26759140  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26759141 tagcagagacaaaat-agagtagtggaggtagtggttgtacactt 26759184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 26765292 - 26765533
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |  |||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||  ||    
T  26765292 agtcttcactctattatatagaggtgtgaaagagatgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaaactttttgatcaatcaccaatgatc 26765390  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||   | |||||  |||  || |  ||||||| |||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  26765391 ctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 26765489  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26765490 tagctgagacaaaa-cagagtagtggaggcagtggttgtacactt 26765533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29138562 - 29138508
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29138562 tcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 29138508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 31117858 - 31117912
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31117858 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacactt 31117912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21099843 - 21099806
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099843 gacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21099806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26119959 - 26119922
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26119959 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 26119922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30116180 - 30116140
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30116180 aagtcttcactcctttatatagcggtgt-aaagagacgttga 30116140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 34637356 - 34637393
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34637356 tcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 34637393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23413148 - 23413076
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23413148 tgcaggcatagctgttatttttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 23413076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Original strand, 26784353 - 26784389
Alignment:
Q  342 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26784353 acacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 26784389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35986406 - 35986334
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35986406 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 35986334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35986574 - 35986534
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35986574 agtctccactcttttagatagaggtgtgaaagagacgttga 35986534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 189)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 15888787 - 15888242
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15888787 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttg 15888688  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| | | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15888687 gcgctttttaacttgtgtgtctctatctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 15888588  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888587 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 15888488  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888487 caaattctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 15888389  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888388 cgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 15888289  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15888288 gatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 15888242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14746128 - 14745582
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14746128 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttg 14746029  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746028 gcgcttttgaacttgtatatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 14745929  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14745928 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagggca 14745829  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14745828 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaa 14745729  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  14745728 cgaaggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacatctactttg 14745629  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14745628 gatcttcagtttgaataaatgaattaaatgtagcatctggtgatgat 14745582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 1367471 - 1368016
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1367471 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 1367570  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1367571 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 1367670  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367671 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 1367770  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367771 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 1367869  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1367870 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 1367969  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  1367970 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 1368016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 44280336 - 44280882
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44280336 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 44280435  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44280436 gcgctttttaacttgtgtatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 44280535  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44280536 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaagg 44280635  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280636 cacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 44280734  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44280735 aacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactt 44280834  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44280835 tggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 44280882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 3165576 - 3166120
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3165576 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 3165675  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3165676 gcgctttttaacttgtgtatgtctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 3165775  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3165776 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggca 3165875  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165876 caaattctgcagacatacctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 3165974  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  3165975 cgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacaactactttg 3166074  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3166075 gatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 3166120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 20490848 - 20491392
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20490848 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20490947  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20490948 gcgctttttaacttgtatgtctcactgcacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 20491047  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20491048 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggca 20491147  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491148 caaattttgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 20491246  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20491247 cgaaggacaaatgctcagcgttgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttg 20491346  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20491347 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 20491392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 589054 - 589599
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  589054 atacaatacgttaaagactctaaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 589153  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  589154 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 589253  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  589254 gtcgtttgaaatcctttgatcaatcaccagtgatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 589353  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  589354 caaattctgcaggcctagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 589452  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  589453 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttg 589552  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  589553 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 589599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31116969 - 31116424
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31116969 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 31116870  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| |||| || ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31116869 gcgctttttaactagtgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 31116770  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116769 gtcgtt-gaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcttgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 31116671  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31116670 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgctaa 31116571  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116570 cgaaggacaaatacttagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 31116471  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  31116470 gatctttagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 31116424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21770401 - 21769856
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21770401 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 21770302  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21770301 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 21770202  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770201 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 21770102  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770101 caaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 21770003  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21770002 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 21769903  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  21769902 gatctccagtttgaatttacgtataaaatgtagcttctggtgatgat 21769856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Original strand, 9170038 - 9170571
Alignment:
Q  12 taaagactctagactttgaa-tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  9170038 taaagactctagacttttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaa 9170137  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  9170138 cttgtatatctctctttca-atcttcaagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcangtctaaagagtcgtttgaaa 9170236  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9170237 tcctttgatcattcaccagtaatcntttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttnaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9170336  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9170337 ggcatagctgttgtnttgtcttgtagcgtagacagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9170435  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9170436 tactcantgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcctcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgaattttcagtt 9170535  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  9170536 tgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 9170571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Original strand, 9159583 - 9160116
Alignment:
Q  12 taaagactctagactttgaa-tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  9159583 taaagactctagacttttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaa 9159682  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9159683 cttgtatatctctctttca-atcttcaagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 9159781  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9159782 tcctttgatcattcaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagctttaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 9159881  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9159882 ggcatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 9159980  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9159981 tactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcctcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgaattttcagtt 9160080  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  9160081 tgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 9160116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 546
Target Start/End: Original strand, 9170863 - 9171372
Alignment:
Q  35 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatct 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  9170863 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctctttca-atct 9170961  T
Q  135 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  9170962 tcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcatgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatc 9171061  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171062 ctttgcctgatttgggtgtagtccttttaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 9171161  T
Q  335 agtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccg 434  Q
    || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  9171162 agcgtagac-agaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccg 9171260  T
Q  435 ttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagct 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  9171261 ttgatacctccctttcaattcttcgttcctcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgaattttcagtttgaatttacggattaaatgtagct 9171360  T
Q  535 tctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||    
T  9171361 tctggtgatgat 9171372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 5685360 - 5685872
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5685360 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 5685459  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685460 tgcttttgaacttgtatatctctatctcatatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5685559  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5685560 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 5685659  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5685660 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5685759  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  5685760 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 5685859  T
Q  500 gatcttcagtttg 512  Q
     ||||||||||||    
T  5685860 aatcttcagtttg 5685872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 9433105 - 9433646
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9433105 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9433204  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9433205 cgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9433304  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  9433305 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 9433404  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9433405 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9433504  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  9433505 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgaaaatcagctactttg 9433604  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9433605 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9433646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 20989494 - 20990035
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20989494 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 20989593  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989594 cgcttttgaacttgtatatctctatattcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 20989693  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20989694 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgcagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 20989793  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20989794 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 20989893  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||||    
T  20989894 cgagagacaaatgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagtcagctactttg 20989993  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  20989994 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 20990035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 9443701 - 9444242
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9443701 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9443800  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443801 cgcttttgaacttgtgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9443900  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  9443901 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 9444000  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9444001 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9444100  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  9444101 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgaaaatcagctactttg 9444200  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9444201 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9444242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 21003467 - 21002926
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21003467 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 21003368  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21003367 cgcttttgaacttgtatatctctatattcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagat 21003268  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21003267 tcgtttgaaatccattgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtag 21003168  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21003167 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 21003068  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||||||||    
T  21003067 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagtcagctactttg 21002968  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  21002967 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 21002926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24931062 - 24930521
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24931062 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24930963  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930962 cgcttttgaacttatgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24930863  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24930862 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 24930763  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24930762 aaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24930663  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24930662 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 24930563  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24930562 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 24930521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 468040 - 467499
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  468040 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 467941  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||||||||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  467940 tgcttttgaacttatgtatctctatttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 467841  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  467840 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 467741  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  467740 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 467641  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  467640 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 467541  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  467540 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 467499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 540926 - 541467
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  540926 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagattcaaattgacagagttttgg 541025  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  541026 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcacacctttatatagaggcgtaaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 541125  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  541126 tcgtttgaaatcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 541225  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  541226 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 541325  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  541326 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 541425  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  541426 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 541467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6867684 - 6867143
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6867684 atacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6867585  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867584 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6867485  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6867484 tcgtttgaaattctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 6867385  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6867384 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6867285  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6867284 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 6867185  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6867184 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6867143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6878316 - 6877775
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6878316 atacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 6878217  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878216 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 6878117  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  6878116 tcgtttgaaattctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccaacttgaatgtac 6878017  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6878016 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6877917  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6877916 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 6877817  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6877816 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6877775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 37344041 - 37344582
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37344041 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 37344140  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37344141 cgcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcacacctttatataagggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 37344240  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37344241 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcttttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 37344340  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37344341 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 37344440  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  | ||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  37344441 cgagaggcaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 37344540  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  37344541 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 37344582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 11095895 - 11096437
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagt-ttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  11095895 atacaatacagaaaagactctggactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaaattgacagagttttg 11095994  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11095995 gcgcttttgaacttatgtatttctcacttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 11096094  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
T  11096095 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgta 11096194  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11096195 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 11096294  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  11096295 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 11096394  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  11096395 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 11096437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 455258 - 454717
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  455258 atacaatacaaaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 455159  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||||||||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  455158 tgcttttgaacttatgtatctctatttttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttaagataatcagcacgtctaaagag 455059  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  455058 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 454959  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  454958 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 454859  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  454858 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 454759  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  454758 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 454717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26700113 - 26699572
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26700113 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26700014  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700013 cgcttttaaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26699914  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26699913 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaac 26699814  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26699813 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26699714  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  26699713 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttg 26699614  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     |||||| |||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  26699613 aatcttccgtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26699572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 542
Target Start/End: Original strand, 9085128 - 9085665
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9085128 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 9085227  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085228 ttttgaacttatgtatctctctctgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 9085327  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  9085328 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 9085426  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9085427 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacga 9085526  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
      |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || ||||||||||| ||    
T  9085527 gagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaat 9085626  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  9085627 cttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 9085665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 542
Target Start/End: Original strand, 9094842 - 9095379
Alignment:
Q  4 caatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgc 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9094842 caatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgc 9094941  T
Q  104 ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 203  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094942 ttttgaacttatgtatctctctctgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcg 9095041  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  9095042 tttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtaca-a 9095140  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9095141 ttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacga 9095240  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
      |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || ||||||||||| ||    
T  9095241 gagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaat 9095340  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  9095341 cttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 9095379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 8617227 - 8617768
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8617227 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 8617326  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8617327 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 8617426  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  8617427 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 8617526  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8617527 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 8617626  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  8617627 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 8617726  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  8617727 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 8617768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26653784 - 26653243
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26653784 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26653685  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653684 cgcttttaaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcacttctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26653585  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26653584 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgaac 26653485  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26653484 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26653385  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  26653384 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttg 26653285  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     |||||| |||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  26653284 aatcttccgtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26653243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 40042567 - 40042027
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40042567 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40042468  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042467 cgcttttgaacttatgtatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40042368  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  40042367 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 40042268  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40042267 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 40042169  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  40042168 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 40042069  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  40042068 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 40042027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 40053116 - 40052576
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40053116 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40053017  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053016 cgcttttgaacttatgtatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40052917  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  40052916 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 40052817  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40052816 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 40052718  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  40052717 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 40052618  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  40052617 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 40052576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 48710950 - 48710409
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48710950 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 48710851  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48710850 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 48710751  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  48710750 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 48710651  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48710650 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 48710551  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  48710550 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 48710451  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  48710450 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 48710409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 4222461 - 4222992
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4222461 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 4222560  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222561 tatgtatttctctatatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 4222660  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  4222661 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 4222760  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  4222761 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4222860  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4222861 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 4222960  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4222961 ttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4222992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 8627790 - 8628331
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8627790 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 8627889  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627890 cgcttttgaacttatgtatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 8627989  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  8627990 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 8628089  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8628090 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 8628189  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||| |||||||||||    
T  8628190 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataggactgaattgagaatcagctactttg 8628289  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  8628290 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 8628331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 11005026 - 11005567
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  11005026 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 11005125  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005126 cgcttttgaacttgtgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 11005225  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  11005226 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 11005325  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11005326 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 11005425  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  11005426 tgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 11005525  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  11005526 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 11005567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 4211862 - 4212393
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4211862 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 4211961  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211962 tatgtatttctctatatgtaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 4212061  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||    
T  4212062 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcatttccatcttgagtgtacaaattctgca 4212161  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  4212162 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 4212261  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4212262 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 4212361  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4212362 ttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17950577 - 17950064
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17950577 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17950478  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17950477 cgcttttgaacttatgtatctctgtctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgcgataatcagcacgtctaaagag 17950378  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17950377 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17950278  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17950277 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17950178  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  17950177 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 17950078  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  17950077 aatcttcagtttga 17950064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17961183 - 17960670
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17961183 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17961084  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961083 cgcttttgaacttatgtatctctgtctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17960984  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  17960983 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 17960884  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17960883 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17960784  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  17960783 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 17960684  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  17960683 aatcttcagtttga 17960670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40055211 - 40054666
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  40055211 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctatgtagaatcaaattgacagagttttg 40055112  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40055111 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 40055012  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  40055011 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaa 40054913  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgtta 398  Q
    ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40054912 cat-ttatgcaggcatggttgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgtta 40054814  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40054813 aagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaacgagaaacagctacttt 40054714  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | |||| |||||| ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  40054713 gaatctccagtttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 40054666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 22088964 - 22089505
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22088964 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 22089063  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089064 cgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22089163  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22089164 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 22089263  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22089264 aaattctgcaggcatgactgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22089363  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  22089364 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 22089463  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22089464 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22089505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 22099579 - 22100120
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22099579 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 22099678  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099679 cgcttttgaacttatgtatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22099778  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22099779 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 22099878  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22099879 aaattctgcaggcatggttgtcgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22099978  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  22099979 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 22100078  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22100079 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22100120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 1987381 - 1987923
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  1987381 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 1987480  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987481 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 1987580  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  1987581 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 1987680  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1987681 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 1987780  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  1987781 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 1987880  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  1987881 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 1987923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 1998002 - 1998544
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  1998002 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 1998101  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998102 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 1998201  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  1998202 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 1998301  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1998302 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 1998401  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  1998402 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 1998501  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  1998502 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 1998544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 30049361 - 30049906
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30049361 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 30049460  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30049461 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaagcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 30049560  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30049561 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaatgaa 30049659  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049660 cat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 30049758  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | || ||   | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  30049759 acgaaggacaagtacttagttttctccaaatgactgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctaattt 30049858  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | |||| |||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  30049859 gaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 30049906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2706059 - 2705530
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2706059 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 2705960  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||  ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2705959 tatgtacctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 2705860  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  2705859 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcagg 2705760  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |    
T  2705759 catggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagt 2705660  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2705659 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagttt 2705560  T
Q  512 gaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || || | | || ||| ||||||||||||||    
T  2705559 gatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 2705530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2716663 - 2716134
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2716663 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 2716564  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||  ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716563 tatgtacctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 2716464  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  2716463 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtacaaattctgcagg 2716364  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |    
T  2716363 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactctattaacgagagacaagt 2716264  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2716263 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagttt 2716164  T
Q  512 gaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || || | | || ||| ||||||||||||||    
T  2716163 gatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 2716134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8002524 - 8001982
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  8002524 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 8002425  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002424 cgcttttgaacttatgtatttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 8002325  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  8002324 tcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 8002225  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8002224 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 8002125  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  8002124 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 8002025  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | |||||||||| || || | | || ||||||||||||||||||    
T  8002024 gaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8001982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8013169 - 8012627
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  8013169 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 8013070  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013069 cgcttttgaacttatgtatttctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 8012970  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  8012969 tcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 8012870  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8012869 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 8012770  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  8012769 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 8012670  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | |||||||||| || || | | || ||||||||||||||||||    
T  8012669 gaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8012627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24734594 - 24735135
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24734594 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24734693  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734694 cgcttttaaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24734793  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24734794 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24734893  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  24734894 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataa 24734993  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  24734994 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 24735093  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24735094 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 24735135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 24744541 - 24745082
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24744541 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24744640  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744641 cgcttttaaacttatgtatctctctcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 24744740  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24744741 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 24744840  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  24744841 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataa 24744940  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  24744941 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 24745040  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24745041 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 24745082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26390555 - 26390014
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26390555 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26390456  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390455 cgcttttaaacttatgtatctctatctgaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26390356  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26390355 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 26390256  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26390255 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26390156  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  26390155 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 26390056  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  26390055 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 26390014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 26401197 - 26400656
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26401197 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26401098  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401097 cgcttttaaacttatgtatctctatctgaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26400998  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26400997 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgaattgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 26400898  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26400897 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26400798  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  26400797 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 26400698  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  26400697 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 26400656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 42865668 - 42866210
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  42865668 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 42865767  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865768 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 42865867  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  42865868 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 42865967  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42865968 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 42866067  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  42866068 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 42866167  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  42866168 gaatcttcagtttgatta-aagaatcaaatgtagcttctggtga 42866210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 42876294 - 42876836
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  42876294 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 42876393  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876394 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 42876493  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  42876494 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 42876593  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42876594 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 42876693  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  42876694 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 42876793  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  42876794 gaatcttcagtttgatta-aagaatcaaatgtagcttctggtga 42876836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 18441036 - 18441582
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  18441036 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 18441135  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  18441136 ggcgctttt-aacttgtgttgatttctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 18441234  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18441235 agagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 18441334  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18441335 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 18441433  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| || ||    
T  18441434 taacgaaggacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacaactcct 18441532  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  18441533 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 18441582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 18418955 - 18419501
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  18418955 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 18419054  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  18419055 ggcgctttt-aacttgtgttgatttctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 18419153  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18419154 agagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 18419253  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18419254 gaacat-ttctgcaggaagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaa 18419352  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| || ||    
T  18419353 taacgaaggacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacaactcct 18419451  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  18419452 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 18419501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 166736 - 167236
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  166736 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaa-------------ttcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 166822  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166823 cgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 166922  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  166923 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 167022  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  167023 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 167122  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  167123 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 167222  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     ||||| |||||||    
T  167223 aatctttagtttga 167236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 177328 - 177828
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  177328 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaa-------------ttcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 177414  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177415 cgcttttgaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 177514  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  177515 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 177614  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  177615 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 177714  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  177715 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 177814  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     ||||| |||||||    
T  177815 aatctttagtttga 177828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26294488 - 26294064
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26294488 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26294389  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    | ||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294388 cacttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 26294289  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26294288 tcgtttgaaatcctttgattatacaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 26294189  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26294188 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 26294089  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatc 424  Q
     ||  ||||| ||||||| ||||||    
T  26294088 tgagagacaagtgctcagtgctatc 26294064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 3476800 - 3476255
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  3476800 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 3476701  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
     |||||||| ||||||| |  || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  3476700 agcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 3476602  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3476601 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaa 3476503  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3476502 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 3476405  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | |  |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||  |  ||||| |||||||| |    
T  3476404 tcagagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttctt-ttagacgagaatataatgaaaaacagctcc 3476306  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  3476305 tttgaaacttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgat 3476255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26210008 - 26209463
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  26210008 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttataagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttgacagagtttt 26209909  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26209908 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctttccaatcttcaaatctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 26209810  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  26209809 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 26209711  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26209710 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 26209613  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  26209612 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 26209514  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  26209513 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 26209463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 214 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19986058 - 19985729
Alignment:
Q  214 tttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggc 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19986058 tttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggc 19985959  T
Q  314 atagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgc 413  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19985958 atagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgt 19985859  T
Q  414 tcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcag-tttg 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  19985858 tcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcatttcttcgttcctcttagataagattgaattaagaaacaactactttggatcttaagttttg 19985759  T
Q  513 aatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||  |  ||||||||||||||| |||||    
T  19985758 aataacttgattaaatgtagcttcgggtga 19985729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 546
Target Start/End: Original strand, 29589834 - 29590378
Alignment:
Q  2 tacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  29589834 tacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttg 29589933  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    |||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  29589934 gcgctttt-aacttgtgttgatatctcttacaaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaa 29590032  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| | ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  29590033 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaag 29590131  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29590132 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-t 29590229  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
     || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  || || ||| || ||||| || ||    
T  29590230 caatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttctt-ttagacgagattaaaacgaaaaacaactcct 29590328  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| | ||||||||| ||| |    || || |||||||||||||||||||    
T  29590329 ttgaaacttcagtttaaatgtcctgatcaactgtagcttctggtgatgat 29590378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 13682160 - 13682706
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  13682160 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttt 13682259  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttctt---atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    ||||||||| ||||||| |   ||| | |||    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  13682260 ggcgctttt-aacttgtgttgatctgtctctaccaatcttcaagtcttcactcctttaaatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtct 13682358  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13682359 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatattttgcctgatttgggtgtagtcttgtgaaggattaacttcaaattcattcccattttga 13682457  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13682458 aggaacat-ttctgcaggaatagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13682556  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | |  |||||||||   | ||| | | | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||| || ||||||||     
T  13682557 -tcagagaaggacaagcacccagtgattttcaaatgaacgttggtacctcccttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttaaaacgaaaaacagctc 13682654  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  13682655 ctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 13682706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 15216157 - 15216702
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  15216157 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 15216256  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15216257 ggcgctttt-aacttgtgttgatttgtcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 15216355  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| |||   || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  15216356 aagagtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatctattgcctgatttgggtgtagtcctatgacagatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 15216454  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15216455 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgtcaactct- 15216552  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || || ||| || ||| |||| |    
T  15216553 tcaaagaaggacaagcacccagtgcttctcaaatggccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttaaacgagattaaaacgaaaaatagctcc 15216651  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  15216652 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 15216702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38403670 - 38403331
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  38403670 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 38403571  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgt----atatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    ||||||||| |||||||    |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  38403570 ggcgctttttaacttgtgttgatatctctttttttaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtct 38403471  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38403470 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttga 38403372  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 336  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38403371 aggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtag 38403331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12734624 - 12734116
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||| ||    
T  12734624 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaataagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtgtt 12734525  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||  | | | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  12734524 ggcgctttt-aacttgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtagaaagacgttgagatttttagcacgtctaaa 12734426  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12734425 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctcttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatttattcctatcttgaagg 12734327  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  12734326 aacat-ttctgcaggcagagttgttgtcttgtcttatagcgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tc 12734229  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |  |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |||    
T  12734228 agagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttaaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctt 12734130  T
Q  498 tggatcttcagttt 511  Q
    || | |||||||||    
T  12734129 tgaaacttcagttt 12734116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 38593921 - 38593648
Alignment:
Q  272 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38593921 cttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctgcaggcatgactgttatcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttg 38593823  T
Q  372 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  38593822 tacacttgtactttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttattagac 38593723  T
Q  472 aaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     |||||||||  |||| ||||||||||| |||| || | | ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  38593722 gaggttgaaacaagaaccagctactttgaatctccaatataaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 38593648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24882880 - 24882485
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  24882880 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 24882781  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     || |||||| ||||||| |  || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  24882780 gggtgctttt-aacttgtgttgatgtctctta-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggttagtagagagacgttgagatctttagcacgtct 24882683  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  24882682 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 24882584  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24882583 aggaaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 24882485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 272 - 546
Target Start/End: Original strand, 8933634 - 8933906
Alignment:
Q  272 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933634 cttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 8933732  T
Q  372 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  8933733 tacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc-tcttagac 8933831  T
Q  472 aaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||| || |||||||| | ||  | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  8933832 gaggttgaaacgaaaaacagctccattaaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 8933906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 316 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 6044354 - 6044125
Alignment:
Q  316 agctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |    
T  6044354 agctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtaccc 6044255  T
Q  416 agagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
    || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  6044254 agtgcctttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaat 6044156  T
Q  516 atatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  6044155 ttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 6044125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38594170 - 38593943
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||     
T  38594170 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtacagaaattcaatgtgctttttggaatcaaattgacagagttttt 38594071  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38594070 gcgctttttaacttgtatatctcaatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 38593971  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||    
T  38593970 gttg-ttgagttcctttgatcatccacca 38593943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 48382028 - 48382297
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca---gtttgacagagtt 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||| |||||||    
T  48382028 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttttggcagagtt 48382127  T
Q  97 ttggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtc 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||| |||    
T  48382128 ttggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcatgtc 48382226  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaag 265  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48382227 taaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaag 48382297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 8933404 - 8933631
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  8933404 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaattggcagagttttg 8933503  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    |||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8933504 gcgctttt-aacttgtgttgatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaa 8933602  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccac 226  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  8933603 agagtcg-ttgagttcctttgatcatccac 8933631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 318 - 546
Target Start/End: Original strand, 48382304 - 48382532
Alignment:
Q  318 ctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaa-acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctca 416  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||    
T  48382304 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcaccca 48382403  T
Q  417 gagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaata 516  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||     
T  48382404 gtgcttttcaaatgaccgttgatacatcccttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatt 48382502  T
Q  517 tatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||   |  || |||||||||||||||||||    
T  48382503 tactgagcaattgtagcttctggtgatgat 48382532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11087475 - 11087110
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttg-tatatt-tctc 124  Q
    ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||| | | || ||||    
T  11087475 gaatttctaagatatatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgatgtcttgtctc 11087377  T
Q  125 tttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcat 222  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||     
T  11087376 ttt-tgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaa 11087279  T
Q  223 ccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt 322  Q
      ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||| |||| |||| || |||||||| |||||||    
T  11087278 ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtt 11087180  T
Q  323 gtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 392  Q
     |||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11087179 atcttgtcttgtagtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 11087110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8999384 - 8998998
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt--gta-gaatcag-tttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||    
T  8999384 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgtatgaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt 8999285  T
Q  108 gaacttgtatatttctctttctt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaa-gagtcg 203  Q
     ||||||||   || |||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | |||| || ||| |||| |    
T  8999284 -aacttgtagtattgtctcccatgatcttcaagtcttcacttctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacatccaaaagagttg 8999186  T
Q  204 tttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacata 303  Q
    ||   || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||||     
T  8999185 ttgagaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat- 8999089  T
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8999088 ttctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8998998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13174932 - 13174668
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  13174932 atcttcaagtcttctctcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaa 13174834  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  13174833 tgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagtaacat-ttctgcatgcaaagctgtttttcttg 13174735  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13174734 tcttgtagtgtagagacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13174668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 374
Target Start/End: Original strand, 602553 - 602796
Alignment:
Q  133 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt--tgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | || ||||| ||||||||||| |   | || |||||||  ||||||    
T  602553 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaaattgttagtacgtc-aaagagtcgttgttgtagcc-ttgatcaagcaccaa 602650  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttg 328  Q
    |  |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||   ||||||| |||||  |  |||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  602651 tgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttcttg 602749  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaa-aacagagtagtggaggtagtggttgtac 374  Q
    || ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  602750 tcctgtagcgtagacaaagaacagagtagtggaggaagtggttgtac 602796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26290378 - 26290297
Alignment:
Q  432 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26290378 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttga 26290297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23280324 - 23280081
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |   |||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||  || ||||  |    
T  23280324 aagtcttcactcctttatatagatgtgttaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcagcaatgat 23280227  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  23280226 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 23280128  T
Q  333 gtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23280127 gtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 23280081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21283738 - 21283496
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaaga--gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || ||| |  ||||||||||   |||||||||  | |||||  |    
T  21283738 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaagtcgtttgaag--ctttgatcaatctccaatgat 21283641  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| ||   || || ||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21283640 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaattgagaggggacatagt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 21283542  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21283541 gtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21283496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33692077 - 33691835
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   || ||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  || |||| ||    
T  33692077 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcatcaatggt 33691980  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||  ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  33691979 cttttgcctgatatggttattgtcccatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 33691881  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33691880 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacactt 33691835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4412334 - 4412088
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtc-taaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||||||||  | ||||||||| |||||||  |||||||  ||||    
T  4412334 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcagagagagtcgttctgaaatc--ttgatcaatcacc 4412237  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ct 326  Q
    |||  || |||| |||||||||  || ||||| ||||| || |  ||| ||||| ||||||   | ||   ||||  | |||||||| ||||||| | ||    
T  4412236 aatgatcttttgtctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcgaattcgttcccaatgtaaataaacattgtttgcaggcagagctgttttcct 4412137  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4412136 tgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtaca 4412088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 24787935 - 24788176
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  ||||||| ||    
T  24787935 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaat-gt 24788031  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
      |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| || | || || ||||  | || ||||| |||| || | ||||||||    
T  24788032 attttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaatttagagggaacatcgt-tgtaggcagagctatttttcttgtctt 24788130  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788131 gtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24788176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 44467027 - 44467099
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467027 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44467099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7488275 - 7488229
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7488275 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 7488229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9261723 - 9261677
Alignment:
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9261723 ggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 9261677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16308087 - 16308041
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16308087 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 16308041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 28409020 - 28409074
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409020 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28409074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2265882 - 2265841
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2265882 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 2265841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 1292824 - 1292864
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292824 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1292864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2266687 - 2266647
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266687 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 2266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9098599 - 9098559
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098599 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9098559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9099405 - 9099365
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9099405 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9099365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 11319198 - 11319238
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319198 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 11319238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 11792700 - 11792740
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11792700 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 11792740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12174704 - 12174664
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174704 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 12174664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13260980 - 13260940
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13260980 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13260940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 14425241 - 14425281
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425241 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 14425281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16112249 - 16112007
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataat--cagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |  ||| || || |||  ||||||||||||   |||||||||  || ||||  |    
T  16112249 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgtgaattttccagtacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcatcaatgat 16112152  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-ttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||     ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| || |||||||    
T  16112151 cttttgcctgatatggttaatgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttccttgtctt 16112053  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16112052 gtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 16112007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19339612 - 19339572
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339612 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 19339572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 27871511 - 27871551
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27871511 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 27871551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30944518 - 30944446
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944518 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30944446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30945721 - 30945479
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   || ||| |  ||   |||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  30945721 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacattgtgaattgccaacacattcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 30945624  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| | |   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  ||| || |||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  30945623 cttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattctgagggaacat-tgttgcaggcatagctgtttttcttgtctt 30945525  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30945524 gtagctgagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 30945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32265083 - 32265043
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32265083 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 32265043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35952883 - 35952811
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35952883 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacactt 35952811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5001190 - 5001151
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5001190 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 5001151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13472872 - 13472833
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13472872 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 13472833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48237269 - 48237230
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48237269 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 48237230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 4821455 - 4821509
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821455 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4821509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10254700 - 10254654
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10254700 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 10254654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 14426528 - 14426582
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426528 tcttatcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14426582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 27871699 - 27871753
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27871699 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27871753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28622721 - 28622481
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   |||||| |  ||   ||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |    
T  28622721 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttgtgaatttccagcacattcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 28622624  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||| ||||| |||   | ||||| ||||  || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  28622623 cttttgtctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 28622525  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 376  Q
    ||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28622524 gtagcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacac 28622481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48237130 - 48237025
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48237130 ttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttg 48237032  T
Q  372 tacactt 378  Q
    |||||||    
T  48237031 tacactt 48237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22578181 - 22578144
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578181 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22578144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 1292993 - 1293065
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1292993 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1293065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 2499830 - 2499866
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499830 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 2499866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 4494370 - 4494410
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494370 aagtcttccctcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 4494410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 9069355 - 9069391
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9069355 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 9069391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 13683388 - 13683428
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13683388 aagtcttcactcctttatatagaggagtgaaagagacgttg 13683428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 15467710 - 15467750
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15467710 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttg 15467750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15704853 - 15704813
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15704853 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 15704813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16314905 - 16314865
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16314905 aagtcttcactcctttttatagaggtgtgaaagagacgttg 16314865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16316922 - 16316882
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16316922 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttg 16316882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19711208 - 19711136
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19711208 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacactt 19711136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21381792 - 21381752
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381792 agtctccactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21381752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 21692081 - 21692121
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21692081 aagtcttcactcctttatatagtggtgtgaaagagacgttg 21692121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 28408832 - 28408868
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28408832 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 28408868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 30025698 - 30025738
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30025698 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 30025738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 33605478 - 33605518
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33605478 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagacacgttg 33605518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39284759 - 39284687
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtctt-gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284759 tgcaggcatagctgttatctttgtcctgtagtagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 39284687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48063184 - 48063144
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48063184 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 48063144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 173
Target Start/End: Original strand, 11015738 - 11015785
Alignment:
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11015738 ttctaatcttcatgtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagac 11015785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13034204 - 13034169
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13034204 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 13034169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 14426341 - 14426380
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14426341 agtcttcactcctttatatggaggtgtgaaagagacgttg 14426380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16105341 - 16105306
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105341 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 16105306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2501409 - 2501363
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2501409 atcttcaagtattcattcctttatatagaggtatgaaagagacgttg 2501363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 8182911 - 8182965
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8182911 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 8182965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 9069543 - 9069597
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9069543 tcttgtcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 9069597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13172725 - 13172679
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13172725 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgagagatacgttg 13172679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16556953 - 16556915
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556953 agtctacactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 16556915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Original strand, 16608709 - 16608747
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16608709 agtctacactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 16608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18056623 - 18056577
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18056623 atctccaagtcttcactcctttatatagacgtgtgaaagagaagttg 18056577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19237401 - 19237363
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19237401 aagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgt 19237363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13018867 - 13018834
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13018867 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 13018834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 14193112 - 14193149
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14193112 gacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 14193149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 14425445 - 14425482
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14425445 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 14425482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16310273 - 16310232
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16310273 caagtcatcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttg 16310232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19237203 - 19237166
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19237203 gacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24794875 - 24794838
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24794875 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 24794838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29935708 - 29935675
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29935708 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 29935675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2265713 - 2265642
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2265713 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagac-aaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 2265642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 4494540 - 4494612
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4494540 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacactt 4494612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 8182724 - 8182764
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8182724 agtcttcactcctttatatagaggtgcgaaagagatgttga 8182764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10883538 - 10883498
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10883538 aagtcgtcactcctttatatagagttgtgaaagagacgttg 10883498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12367113 - 12367073
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12367113 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaatagacgttg 12367073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 14187484 - 14187524
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14187484 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagatgttg 14187524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 15088342 - 15088382
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15088342 aagtcttcacttctttatatagagttgtgaaagagacgttg 15088382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22579582 - 22579542
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22579582 aagtctttactcctttatatagagttgtgaaagagacgttg 22579542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35953051 - 35953011
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35953051 agtctttactcctttatatagaggtgtgaaagagacattga 35953011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284889
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39284929 aagtcttcactcctatatatagaggtttgaaagagacgttg 39284889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13894154 - 13894123
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894154 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 13894123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 16412518 - 16412569
Alignment:
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16412518 ttctaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggaattaaagagacgttg 16412569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18361937 - 18361894
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18361937 aagtctttactcctttatatagaagtatgaaagagacgttgaga 18361894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41842633 - 41842598
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41842633 ttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttg 41842598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1878616 - 1878570
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1878616 atcttcaagtcttcattcctttatatagagatatgaaagagatgttg 1878570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5000999 - 5000945
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5000999 tcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 5000945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7488061 - 7488023
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7488061 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacagttgtact 7488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11572572 - 11572526
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11572572 atcttcaaggcttcatttctttatatagaggtatgaaagagacgttg 11572526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Original strand, 16411783 - 16411825
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  16411783 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtatgtgagagacgtt 16411825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22494169 - 22494111
Alignment:
Q  453 ttcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22494169 ttcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagttt 22494111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48806056 - 48806002
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48806056 tcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 48806002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Original strand, 11319387 - 11319440
Alignment:
Q  325 cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11319387 cttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 11319440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13172502 - 13172465
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13172502 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 13172465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19339402 - 19339373
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339402 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19339373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 21692285 - 21692322
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21692285 gacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21692322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32264895 - 32264842
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacact 377  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32264895 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacact 32264842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 33605683 - 33605720
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33605683 gacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacactt 33605720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 331608 - 331680
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  331608 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacactt 331680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 5035172 - 5035220
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  5035172 atcttcaagttttcactcatttatatagagatgtgagagatacgttgag 5035220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9709997 - 9709925
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9709997 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacactt 9709925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9710168 - 9710128
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9710168 aagtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagatgttg 9710128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 376
Target Start/End: Original strand, 15467846 - 15467949
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15467846 ttcaaatccattcccattttgaaggaacatcgt-tgcaggtaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaattcagagtagtggaggtaatggttg 15467944  T
Q  372 tacac 376  Q
    |||||    
T  15467945 tacac 15467949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30944688 - 30944656
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30944688 agtcttcactcctttatatggaggtgtgaaaga 30944656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41842468 - 41842396
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41842468 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacactt 41842396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 44466856 - 44466896
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44466856 aagtcttcacaactttatatagaggtatgaaagagacgttg 44466896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 157)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 19224802 - 19225347
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  19224802 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaattgacagagttttg 19224901  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19224902 gcgctttttaacttgtgtatctctatctactatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 19225001  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225002 gtcatttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgttgtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 19225101  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225102 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 19225200  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225201 cgaaggacaaatgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 19225300  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19225301 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 19225347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 30315108 - 30314563
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30315108 atacaatacaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 30315009  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30315008 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 30314909  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30314908 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 30314809  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30314808 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 30314710  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30314709 cgaaggacaaatgctaagcgctatccaaatgaccgttggtacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttg 30314610  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30314609 aatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 30314563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20161643 - 20161097
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20161643 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20161544  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20161543 gcgctttttaacttgtgtatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 20161444  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20161443 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaagg 20161344  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161343 cacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 20161245  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20161244 aacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactt 20161145  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20161144 tggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 20161097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 20195824 - 20196370
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20195824 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20195923  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20195924 gcgctttttaacttgtgtatgtctctctcttcaatcttcaattcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 20196023  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20196024 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaagg 20196123  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196124 cacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 20196222  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20196223 aacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactt 20196322  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20196323 tggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 20196370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23469873 - 23469326
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23469873 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 23469774  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23469773 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 23469674  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469673 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 23469574  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469573 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 23469474  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23469473 cgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccctttcaattcttggttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttg 23469374  T
Q  500 gatcttcagtttgaa-tatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23469373 gatcttcagtttgaattttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 23469326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6318928 - 6318388
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6318928 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 6318829  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6318828 cgcttttgaacttgtatatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagaacgtctaaagag 6318729  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6318728 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaggacac 6318629  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318628 aaattatgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 6318529  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||     
T  6318528 gagggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttggtacatccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaccagctactttga 6318429  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||| |||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  6318428 atcttcagattgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 6318388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 19428795 - 19429342
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19428795 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 19428894  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19428895 gcgctttttaacttgtatgtctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 19428994  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428995 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 19429094  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19429095 caaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 19429194  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    |||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19429195 acgaaggaaaaatactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctacttt 19429294  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  19429295 ggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 19429342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 31214880 - 31215428
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagact-ttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt- 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  31214880 atacaatataataaagactctagactattgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttt 31214979  T
Q  99 --ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
      ||||||||||||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  31214980 ttggcgcttttgaacttgtgtatatctttctacagtcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaa 31215079  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215080 agagttgtttgaaatcttttgatcatccaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 31215179  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215180 gcataaattatgcaggcatagctgttgtcttgtcttatagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 31215279  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31215280 taatgaaggacaaatgctcagtgctat-caaatgacagttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaaagagaaacagctact 31215378  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31215379 ttggatcttcagtttgaatttatggattaaatgtagcttctggtgatgat 31215428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 19418220 - 19418765
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19418220 atacaatacgttaaagactgtagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 19418319  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19418320 gcgctttttaacttgtatgtctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 19418419  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418420 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 19418519  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418520 caaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 19418618  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19418619 cgaaggaaaaatactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttg 19418718  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  19418719 gatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 19418765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 16746868 - 16747414
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16746868 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 16746967  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16746968 gcgctttttaacttgtgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 16747067  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16747068 gagtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcatttccatcttgaagg 16747166  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747167 cacaaattctgcaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 16747265  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16747266 aacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactt 16747365  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  16747366 tggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 16747414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 3220500 - 3221041
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3220500 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 3220599  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220600 cgcttttgaacttatatatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3220699  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3220700 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 3220799  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3220800 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 3220899  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  3220900 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacttccctttcaattcttcgttcttcttgaataagactgaattgagaatcagctactttg 3220999  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  3221000 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 3221041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 18158124 - 18158637
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18158124 atacaatacaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 18158223  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18158224 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 18158323  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18158324 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaa 18158422  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18158423 ca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagagtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactccgttaa 18158521  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18158522 cgaaggacaagtactcagttctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacatctactttg 18158621  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  18158622 aatcttcagtttgaat 18158637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 18153605 - 18154117
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18153605 atacaatacaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 18153704  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18153705 gcgctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 18153804  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18153805 gttgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcctatcttgaaggaa 18153903  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153904 ca-att-tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 18154001  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  18154002 cgaaggacaagtactcagtgctctccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttg 18154101  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  18154102 aatcttcagtttgaat 18154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 19139148 - 19139689
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19139148 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 19139247  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    || |||| ||||| | ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19139248 cgatttttaacttatgtatgtctattatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcaacacgtctaaagag 19139347  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19139348 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 19139447  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19139448 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 19139547  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  19139548 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 19139647  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  19139648 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 19139689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18769549 - 18769004
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18769549 atacaatgcaataaagactctagactttttaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 18769450  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18769449 gcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 18769350  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769349 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 18769251  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769250 caaattctgcaggcatagctgttgtcttatcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 18769151  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18769150 cgaaggacaaatactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccctgtcaattcttcgttcttctaagacgaggttgaaatgttaaacaactactttg 18769051  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  18769050 aatcttcagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 18769004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 19128616 - 19129129
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19128616 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 19128715  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19128716 cgctttttaacttatgtatgtctattatttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcaacacgtctaaagag 19128815  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19128816 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatccttttcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 19128915  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19128916 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 19129015  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||| |||||||||||    
T  19129016 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagacagaattgagaatcagctactttg 19129115  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  19129116 aatcttcagtttga 19129129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36292789 - 36293328
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36292789 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36292888  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292889 cgcttttgaacttatatatctctgttt--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36292986  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36292987 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 36293086  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36293087 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36293186  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  36293187 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 36293286  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36293287 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36293328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36303392 - 36303931
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36303392 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36303491  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303492 cgcttttgaacttatatatctctgttt--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36303589  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  36303590 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 36303689  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36303690 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36303789  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  36303790 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 36303889  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36303890 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36303931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36077805 - 36078345
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36077805 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36077904  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077905 cgcttttgaacttatatat--ctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36078002  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  36078003 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 36078102  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36078103 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 36078202  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  36078203 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 36078302  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36078303 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36078345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 36088391 - 36088931
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36088391 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36088490  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088491 cgcttttgaacttatatat--ctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36088588  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  36088589 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 36088688  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36088689 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 36088788  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  36088789 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 36088888  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36088889 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36088931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 29076599 - 29077139
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29076599 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29076698  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076699 cgcttttgaacttatgtatttctctatattatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 29076798  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  29076799 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 29076898  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29076899 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 29076997  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  29076998 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 29077097  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  29077098 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 29077139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 32088681 - 32088141
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32088681 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 32088582  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088581 cgcttttgaacttatgtatttctatctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 32088482  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  32088481 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 32088382  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32088381 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 32088283  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  32088282 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 32088183  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  32088182 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 32088141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 32078108 - 32077568
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32078108 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 32078009  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078008 cgcttttgaacttatgtatttctatctattatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 32077909  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  32077908 tcgtttgaaatcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 32077809  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32077808 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 32077710  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  32077709 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 32077610  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  32077609 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 32077568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 210565 - 210025
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  210565 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 210466  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210465 cgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 210366  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  210365 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 210266  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  210265 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 210167  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  210166 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 210067  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  210066 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 210025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 252277 - 252817
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  252277 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 252376  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252377 cgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 252476  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  252477 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 252576  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  252577 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 252675  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  252676 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 252775  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  252776 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 252817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 724188 - 723648
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  724188 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 724089  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724088 cgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 723989  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  723988 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 723889  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  723888 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 723790  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  723789 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 723690  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  723689 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 723648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 849379 - 848839
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  849379 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 849280  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849279 cgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 849180  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  849179 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 849080  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  849079 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 848981  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  848980 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 848881  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  848880 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 848839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 6150948 - 6151480
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6150948 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgtcagagttttggcgcttttgaact 6151047  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6151048 tatgtatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 6151147  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  6151148 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6151247  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  6151248 ggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6151347  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-ttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcag 508  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6151348 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccatttcaattcttcgttctttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcag 6151447  T
Q  509 tttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6151448 tttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6151480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15791711 - 15791170
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15791711 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 15791612  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| |  || ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15791611 cgcttttgaacttatgaatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatactcagcacgtctaaagag 15791512  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  15791511 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 15791412  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15791411 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 15791312  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||   ||||||||||    
T  15791311 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagttagctactttg 15791212  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  15791211 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 15791170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 18449238 - 18449779
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18449238 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 18449337  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18449338 cgcttttgaacttatgtatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatagtcagcacgtctaaagag 18449437  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  18449438 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccattttgagtgtac 18449537  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18449538 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 18449637  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| |||||| |||||||||||    
T  18449638 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttgaataggactgaattgagaatcagctactttg 18449737  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  18449738 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 18449779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Original strand, 6160903 - 6161434
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6160903 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 6161002  T
Q  113 tgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    | | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6161003 tatgtatttctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 6161102  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  6161103 tcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgca 6161202  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 409  Q
    ||||| | |||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  6161203 ggcatggttgttgttttgttttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaa 6161302  T
Q  410 ctgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagt 509  Q
     ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6161303 gtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccatttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagt 6161402  T
Q  510 ttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6161403 ttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6161434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 26111099 - 26111641
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26111099 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaactcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26111198  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtct-aaaga 199  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26111199 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtcttaaaga 26111298  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26111299 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgta 26111398  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26111399 caaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggttgtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 26111498  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  26111499 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctctctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttt 26111598  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  26111599 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26111641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 26120777 - 26121319
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26120777 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 26120876  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtct-aaaga 199  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26120877 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtcttaaaga 26120976  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  26120977 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaatttattcccatcttgaacgta 26121076  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26121077 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 26121176  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| || |||||||    
T  26121177 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcaactacttt 26121276  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  26121277 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 26121319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 9341012 - 9341553
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9341012 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9341111  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341112 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9341211  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9341212 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9341311  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9341312 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9341411  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  9341412 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 9341511  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9341512 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 9341553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 9368156 - 9368697
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9368156 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9368255  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368256 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9368355  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9368356 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9368455  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9368456 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9368555  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  9368556 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 9368655  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9368656 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 9368697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9856884 - 9856343
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9856884 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcggtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9856785  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9856784 cgcttttgaacttatgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9856685  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9856684 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9856585  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9856584 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9856485  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  9856484 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatatctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 9856385  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9856384 aatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9856343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13688980 - 13688438
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13688980 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 13688881  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688880 cgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 13688781  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  13688780 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 13688681  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13688680 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 13688581  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  13688580 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgtccttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 13688481  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  13688480 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 13688438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3349039 - 3348498
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3349039 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 3348940  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3348939 cgcttttgaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3348840  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  3348839 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 3348740  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3348739 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 3348640  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  3348639 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 3348540  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     |||||||| |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  3348539 aatcttcagattgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 3348498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 3359636 - 3359095
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3359636 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 3359537  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359536 cgcttttgaacttatgtatctctgtctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3359437  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  3359436 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 3359337  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3359336 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 3359237  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  3359236 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 3359137  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     |||||||| |||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  3359136 aatcttcagattgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 3359095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15781122 - 15780581
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15781122 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagctttgg 15781023  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| |  || ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15781022 cgcttttgaacttatgaatctctatctataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatactcagcacgtctaaagag 15780923  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  15780922 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 15780823  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15780822 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 15780723  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| | ||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||   ||||||||||    
T  15780722 cgagagacaagtactcagtgctatccatatatccgttgatacatccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagttagctactttg 15780623  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||| ||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  15780622 aatcttcagtatgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 15780581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 29086850 - 29087390
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29086850 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29086949  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086950 cgcttttgaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 29087049  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  29087050 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattccttcccatcttgagtgtac 29087149  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29087150 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 29087248  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  29087249 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 29087348  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  29087349 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 29087390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 241692 - 242232
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  241692 atacaatacagaaaagactctagactttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 241791  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241792 cgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 241891  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  241892 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 241991  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  241992 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 242090  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||| |||    
T  242091 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatctgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacattg 242190  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  242191 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 242232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 43248193 - 43248726
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43248193 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 43248292  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctt-tcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248293 cgcttttgaacttatgtatctcttttctcaaatcttcaagccttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 43248392  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  43248393 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgta 43248492  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43248493 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacaga---------gtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 43248583  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  43248584 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttt 43248683  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  43248684 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 43248726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40213572 - 40213036
Alignment:
Q  10 aataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttg 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  40213572 aataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttt 40213473  T
Q  109 aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttga 208  Q
    ||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  40213472 aacttgtatatctctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatgattagcaggtctaaagagtcg-ttga 40213374  T
Q  209 aatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctg 308  Q
      |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40213373 gttcctttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttctg 40213275  T
Q  309 caggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-tttgtcaactctgttaacgaaggac 407  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40213274 caggcatgactgttgtcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggac 40213175  T
Q  408 aactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttca 507  Q
    || | | ||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  40213174 aagtacgcagtgctcttcaaacggccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctcca 40213075  T
Q  508 gtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| |||  |   ||||| |||||||||||||||||||    
T  40213074 gtttaaattcactgattaattgtagcttctggtgatgat 40213036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 464
Target Start/End: Original strand, 44480959 - 44481423
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44480959 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 44481058  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44481059 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataaacagcacgtctaaagag 44481158  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  44481159 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 44481258  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44481259 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 44481358  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttctt 464  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44481359 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttctt 44481423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 464
Target Start/End: Original strand, 44491575 - 44492039
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44491575 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 44491674  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44491675 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataaacagcacgtctaaagag 44491774  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  44491775 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 44491874  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44491875 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 44491974  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttctt 464  Q
     ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491975 tgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttctt 44492039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 186 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23457530 - 23457170
Alignment:
Q  186 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457530 agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtactcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattc 23457431  T
Q  286 ccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457430 ccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 23457332  T
Q  386 gtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgag 485  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23457331 gtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccctttcaattcttggttcttcttagataaggttgaaatgag 23457232  T
Q  486 aaacagctactttggatcttcagtttgaa-tatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23457231 aaacaactactttggatcttcagtttgaattttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 23457170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 3843389 - 3843934
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  3843389 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 3843488  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  3843489 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 3843587  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  3843588 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 3843686  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3843687 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 3843784  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  3843785 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 3843883  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  3843884 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 3843934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 233 - 510
Target Start/End: Original strand, 1750194 - 1750471
Alignment:
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1750194 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgttttgtctt 1750293  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgac 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1750294 gtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgac 1750393  T
Q  433 cgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1750394 cgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggctgagttgagaaccagctactttaaatcttcagtt 1750471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 795047 - 795381
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  795047 atacaatacagaaaagactctagactttaaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 795146  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795147 cgcttttaaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 795246  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  795247 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 795346  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag 336  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  795347 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtag 795381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20260031 - 20259486
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||  ||||||||    
T  20260031 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttataaaatcaaatttggtagagtttt 20259932  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20259931 ggcgctttt-aacttgtgttaatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 20259833  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    || ||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||  |||||||||| ||||||||    
T  20259832 aaaagtcgtt-gatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaa 20259734  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20259733 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct- 20259636  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  20259635 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 20259537  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  20259536 tttgaaacttcagtttaaatttactaatcaactgtagcttctggtgatgat 20259486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21046661 - 21046116
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||  ||||||||    
T  21046661 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttataaaatcaaatttggtagagtttt 21046562  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  21046561 ggcgctttt-aacttgtgttaatatctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 21046463  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    || ||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||  |||||||||| ||||||||    
T  21046462 aaaagtcgtt-gatttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaa 21046364  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21046363 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct- 21046266  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  21046265 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 21046167  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  21046166 tttgaaacttcagtttaaatttactaatcaactgtagcttctggtgatgat 21046116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 191 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30325473 - 30325227
Alignment:
Q  191 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325473 gtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatc 30325374  T
Q  291 ttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325373 ttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgaggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaa 30325275  T
Q  391 ctctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttga 438  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30325274 ctctgttaacgaaggacaaatgctaagcgctatccaaatgaccgttga 30325227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 23370420 - 23370960
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  23370420 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttt 23370519  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
     |||||||| ||||||| |  || |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23370520 tgcgctttt-aacttgtgttgatatctcttttcaatcttcaagtcttcactcatttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 23370618  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||  |||| || | |||  |||||||||| ||||| ||    
T  23370619 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctttttcctgatttgggtgtagtcctacgaaggatcaactttgaattcattcctatcttaaa 23370717  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23370718 ggaacat-ttctgtaggcagaggtgttgtcttgtcttgtag-----acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 23370810  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| | ||| || |||||||| |    
T  23370811 tcaaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctcccttttaattcttcgtt-ttctcagatgaggataaaacgaaaaacagctcc 23370909  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| |  |||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  23370910 tttgaaatttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 23370960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7018794 - 7018400
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  7018794 atacaatgcaataaaaactctagacttaagaatttctaagatacatcaaatcagagcagaaattcaaattgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 7018695  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  7018694 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgaatagagagacgttgagatttttagcacgtcta 7018597  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  7018596 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaa 7018498  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7018497 ggaacat-ttctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 7018400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 233 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6576700 - 6576391
Alignment:
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtctt 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6576700 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtctt 6576601  T
Q  333 gtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatga 431  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||      
T  6576600 gtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaaatgctcagtgctatccatatat 6576501  T
Q  432 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgta 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||   |||||||||| ||||||||||||| || | | || ||| |||    
T  6576500 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagttagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgta 6576402  T
Q  532 gcttctggtga 542  Q
    |||||||||||    
T  6576401 gcttctggtga 6576391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22136271 - 22135877
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  22136271 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttt-tagaatcaaatttggcagagttt 22136173  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||  | |||||||||    
T  22136172 tggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagacacgttgagatttttagcacgtct 22136075  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  22136074 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttga 22135976  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135975 aggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22135877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22167436 - 22167042
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||  |||||||    
T  22167436 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttt-tagaatcaaatttggaagagttt 22167338  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  22167337 tggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtct 22167240  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  22167239 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttga 22167141  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22167140 aggaaca-attctgcaggcaaagctgttatcttatcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22211803 - 22211407
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  22211803 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagattgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 22211704  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    ||  |||||| ||||||| |  || |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  22211703 tgatgctttt-aacttgtgttgatgtctctg-ctgatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtct 22211606  T
Q  195 -aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  22211605 taaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttg 22211507  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22211506 aaggaaca-attctgcaggcagggctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 22211408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 421 - 546
Target Start/End: Original strand, 28691189 - 28691314
Alignment:
Q  421 tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatg 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |    
T  28691189 tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttagatcttcagtttgaatttacg 28691288  T
Q  521 aattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  28691289 gattaaatgtagcttctggtgatgat 28691314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23271621 - 23271223
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagactttgaa-tttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgcttt--gtagaatcagtttgacagagtt 96  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||  ||  | ||||||||||||    
T  23271621 atacaatgcaatgaaagactctagacttaaaaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgtgaaacaaatttgacagagtt 23271522  T
Q  97 ttggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat-aatcagcacgt 192  Q
    | ||||||||| |||||||    || |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||   | |||||||    
T  23271521 tgggcgctttt-aacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagttttcactcctttatatagaggtgggtagagagacgttaagatctttaagcacgt 23271424  T
Q  193 ctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctt 292  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||    
T  23271423 ctaaagagtcg-ttgagaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcctatctt 23271325  T
Q  293 gaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaac 391  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23271324 gaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaac 23271226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 8031817 - 8032081
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   ||||    
T  8031817 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaatacca 8031915  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  ||||    
T  8031916 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaagcagagctgtttatctt 8032014  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8032015 gtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 8032081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 28903244 - 28903507
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||| | ||||| |  |||||||   ||||    
T  28903244 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgctgtgaaacc--ttgatcaattacca 28903341  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  28903342 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 28903440  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28903441 gtcttgtagcgtagacaaaa-cagagtagtggagctagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 28903507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 40003013 - 40003277
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | |||| || | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  40003013 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 40003110  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || |||| |||||||||  || |||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||    
T  40003111 atgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaagaagaattacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 40003209  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40003210 gtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 40003277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17519425 - 17519161
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  17519425 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaa 17519327  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| | ||||    
T  17519326 tgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggaagagctgtttttcttg 17519228  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17519227 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgttaactct 17519161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 21540730 - 21540997
Alignment:
Q  125 tttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcat 222  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||   | |||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||     
T  21540730 tttctgatcttcaagttttcactcctttatattgagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaa 21540827  T
Q  223 ccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-t 321  Q
     |||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||| |    
T  21540828 tcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtt 21540926  T
Q  322 tgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 391  Q
    | ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21540927 tttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 21540997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45568270 - 45568021
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||    
T  45568270 ttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcac 45568173  T
Q  227 caatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtc 325  Q
    ||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  45568172 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttc 45568074  T
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45568073 ttgtcttatagcgtagacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacactt 45568021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 475 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 30325231 - 30325160
Alignment:
Q  475 gttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30325231 gttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 30325160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19460835 - 19461045
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca-gtttgacagagttt 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| || ||||| ||||||||    
T  19460835 atacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaagtttggcagagttt 19460934  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat-aatcagcacgtc 193  Q
     ||| ||||| |||||||    || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||    
T  19460935 gggcactttttaacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtc 19461033  T
Q  194 taaagagtcgtt 205  Q
    ||||||||||||    
T  19461034 taaagagtcgtt 19461045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 19558513 - 19558723
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca-gtttgacagagttt 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| || ||||| ||||||||    
T  19558513 atacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaagtttggcagagttt 19558612  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat-aatcagcacgtc 193  Q
     ||| ||||| |||||||    || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||    
T  19558613 gggcactttttaacttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtc 19558711  T
Q  194 taaagagtcgtt 205  Q
    ||||||||||||    
T  19558712 taaagagtcgtt 19558723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 29379363 - 29379626
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  29379363 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaat-accaa 29379460  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  ||  |||||||||||    || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||| | ||||    
T  29379461 tgatctgttgcctgatttcaaagttgtcctatgaaggattatgttcaaatccattcctatcctgaaggaacat-ttctgcaggcagagatgtttttcttg 29379559  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29379560 tcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttctactttgtcaactct 29379626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15425515 - 15425273
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa-gagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||| |||||||  |    
T  15425515 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcattcaccaatgat 15425418  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    |||||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15425417 cctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 15425319  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425318 gtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15425273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 459
Target Start/End: Original strand, 19461090 - 19461274
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 372  Q
    |||||||  ||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  19461090 ttcaaatctattcctatattgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 19461188  T
Q  373 acacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcg 459  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||    
T  19461189 actcttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttttaatccttcg 19461274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 459
Target Start/End: Original strand, 19558768 - 19558952
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 372  Q
    |||||||  ||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  19558768 ttcaaatctattcctatattgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttgtcttatagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgt 19558866  T
Q  373 acacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcg 459  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||    
T  19558867 actcttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttttaatccttcg 19558952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15336450 - 15336208
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa-gagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||||  |    
T  15336450 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcagtcaccaatgat 15336353  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    |||||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15336352 cctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 15336254  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336253 gtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15516819 - 15516577
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa-gagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||||  |    
T  15516819 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcagtcaccaatgat 15516722  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    |||||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15516721 cctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgt-tgcaggcatagctgtttttcttgtctt 15516623  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516622 gtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30421792 - 30421549
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |  ||   |||||||||||||   |||||||||  |||||||      
T  30421792 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatga 30421695  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 331  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| ||||  | |||||| | ||||| || ||||||||    
T  30421694 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacat-ctatgcaggaagagctgtttttcttgtct 30421596  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30421595 tgttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaactt 30421549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 16437026 - 16436931
Alignment:
Q  446 ctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | | || ||||||||||||||||||    
T  16437026 ctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagacagctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgtagcttctggtga 16436931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 378
Target Start/End: Original strand, 21932679 - 21932914
Alignment:
Q  144 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgc 240  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |   |||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||  |||||||  || |||||    
T  21932679 cactcctttatatagagttatgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgatcttttgc 21932776  T
Q  241 ctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgt 339  Q
    ||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||||       
T  21932777 ctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcag 21932875  T
Q  340 ggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932876 agacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 21932914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 12193697 - 12193744
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12193697 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 12193744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 12438125 - 12438172
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12438125 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgttga 12438172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 19943024 - 19943266
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  19943024 aagtcttcactcctttatataacggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 19943121  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| ||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  19943122 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctggttttcttgtctt 19943220  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943221 gtaggagagaccaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19943266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17917187 - 17917141
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17917187 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 17917141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18121468 - 18121235
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  || ||||  |    
T  18121468 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcatcaatgat 18121371  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||| ||||| |||   | ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  18121370 cttttgactgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 18121272  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggt 369  Q
    ||||    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18121271 gtagcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt 18121235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 18557805 - 18557851
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18557805 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 18557851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 17267258 - 17267303
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267258 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 17267303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18321526 - 18321481
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18321526 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18321481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 1744947 - 1744987
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1744947 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1744987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 6407516 - 6407556
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407516 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 6407556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13430820 - 13430748
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13430820 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 13430748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13430989 - 13430949
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13430989 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 13430949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14990422 - 14990382
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14990422 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 14990382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 16188772 - 16188812
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16188772 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 16188812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18152007 - 18151967
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18152007 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 18151967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19956700 - 19956660
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956700 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19956660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20255873 - 20255833
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255873 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20255833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20382756 - 20382716
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20382756 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20382716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22461999 - 22461959
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22461999 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22461959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 22673568 - 22673608
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22673568 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 22673608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23263974 - 23263934
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23263974 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 23263934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 33082653 - 33082693
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082653 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 33082693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45538631 - 45538559
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538631 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 45538559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40845748 - 40845709
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40845748 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 40845709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 24551251 - 24551305
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24551251 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 24551305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 17797416 - 17797453
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797416 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17797453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 174
Target Start/End: Original strand, 19707296 - 19707333
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707296 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 19707333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12758125 - 12758085
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12758125 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12758085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16681665 - 16681625
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16681665 aagtcttgactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 16681625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 18679603 - 18679643
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679603 aagtcttcagtcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18679643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18685758 - 18685718
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685758 aagtcttcacccctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18685718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18731352 - 18731312
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731352 aagtcttcacccctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18731312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19156031 - 19156071
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19156031 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 19156071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23185452 - 23185346
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt--cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 370  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||| | ||||||| |  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23185452 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggaagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggtt 23185354  T
Q  371 gtacactt 378  Q
    ||||||||    
T  23185353 gtacactt 23185346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 24551064 - 24551104
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24551064 agtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttga 24551104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 36105154 - 36105226
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36105154 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 36105226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 43639572 - 43639612
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639572 agtcttcactactttatatagaggtgtgaaagagacgttga 43639612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 45292625 - 45292665
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45292625 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 45292665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 17701530 - 17701569
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17701530 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 17701569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 17797211 - 17797250
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797211 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 17797250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Original strand, 1237563 - 1237668
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1237563 ttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttctcttgtagcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttg 1237661  T
Q  372 tacactt 378  Q
    |||||||    
T  1237662 tacactt 1237668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 6407703 - 6407757
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6407703 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 6407757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 12541421 - 12541467
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12541421 atcttcaagtcttctttcctttatatagaggtgtgaaagaggcgttg 12541467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14989811 - 14989773
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14989811 agtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgtt 14989773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 16207283 - 16207337
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16207283 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 16207337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 172
Target Start/End: Original strand, 22662906 - 22662940
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22662906 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 22662940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Original strand, 26833034 - 26833072
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26833034 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttatact 26833072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 9320566 - 9320599
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320566 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9320599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14989643 - 14989574
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14989643 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 14989574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 26832821 - 26832866
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26832821 tcttcaggtctttagtcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 26832866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40845544 - 40845507
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40845544 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 40845507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 168
Target Start/End: Original strand, 2810593 - 2810629
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2810593 tcttcaagtattcactcctttatatagaggtgtgaaa 2810629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 25163859 - 25163895
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25163859 aagtcgtcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 25163895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25850371 - 25850323
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  25850371 atcttcaagttttcactcctttatatagaaatgtgaaagatacgttgag 25850323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45538800 - 45538760
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45538800 agtcttcaatcctttatatagagatgtgaaagagacgttga 45538760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 178
Target Start/End: Original strand, 9320364 - 9320399
Alignment:
Q  143 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9320364 tcactcctttatatagaggtgagaaagagacgttga 9320399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 16207095 - 16207134
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16207095 agtcttcagtcctttatatagaggtgtgaaagtgacgttg 16207134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18151820 - 18151769
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18151820 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtaca 18151769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 173
Target Start/End: Original strand, 17687759 - 17687801
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  17687759 atcttcaagtcttcattcctttatatagagatatgaaagagac 17687801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Original strand, 18772478 - 18772516
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18772478 gtcttcactcctttatatggaggtgtaaaagagacgttg 18772516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 22673755 - 22673809
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22673755 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacactt 22673809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12757936 - 12757883
Alignment:
Q  325 cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12757936 cttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 12757883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 15598532 - 15598577
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15598532 tcttcaagtcttcaatcctttatatagaggtagaaaagagacgttg 15598577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18685550 - 18685517
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18685550 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 18685517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18722799 - 18722766
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18722799 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 18722766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18731144 - 18731111
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18731144 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 18731111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 43639741 - 43639814
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaa-acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43639741 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 43639814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 43644890 - 43644927
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644890 gacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacactt 43644927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Original strand, 1745115 - 1745190
Alignment:
Q  305 tctgcaggcatagctgttgt--cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1745115 tctgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagtagatacagaaacagagtagtggaagtagttgttgtacactt 1745190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 462 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13596496 - 13596417
Alignment:
Q  462 cttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  13596496 cttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 13596417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17525921 - 17525849
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17525921 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactt 17525849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 383
Target Start/End: Original strand, 17687986 - 17688018
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17687986 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 17688018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18321351 - 18321279
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  18321351 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacactt 18321279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 177
Target Start/End: Original strand, 18718801 - 18718829
Alignment:
Q  149 ctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18718801 ctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18718829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23263768 - 23263732
Alignment:
Q  342 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23263768 acaaaaacatggtagtggaggtagtggttgtacactt 23263732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 27739661 - 27739705
Alignment:
Q  133 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27739661 cttcaagttttcattcctttatatagaggtatgaaatagacgttg 27739705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 36104986 - 36105026
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36104986 agtcttcacttcttaaaatagaggtgtgaaagagacgttga 36105026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 39693494 - 39693566
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39693494 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 39693566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 171)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 4250986 - 4250441
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4250986 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 4250887  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4250886 gcgctttttaacttctgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagatgttgagataattagcacgtctaaaga 4250787  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250786 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 4250687  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250686 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 4250588  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4250587 cgaaggacaaatgctcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttg 4250488  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4250487 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 4250441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 154710 - 154166
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  154710 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttg 154611  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  154610 gcgctttttaacttgtgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 154511  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  154510 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggca 154411  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  154410 caaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttgtactttgtcaactctgttaa 154312  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  154311 cgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttg 154212  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154211 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 154166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 39194515 - 39193970
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39194515 atacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 39194416  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39194415 gcgctttttaacttgtatatatctatcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 39194316  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194315 gtcgtttggaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 39194216  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194215 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 39194117  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194116 cgaaggacagatactcagtgctatccaaataaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 39194017  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  39194016 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 39193970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 148635 - 148091
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  148635 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttg 148536  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  148535 gcgctttttaacttgtgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 148436  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  148435 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccactttgaaggca 148336  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148335 caaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 148237  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  148236 cgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatactttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttg 148137  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  148136 gatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 148091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23580748 - 23580207
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23580748 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 23580649  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580648 cgcttttgaacttgtatatctctatctcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 23580549  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23580548 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtac 23580449  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23580448 aaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 23580349  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  23580348 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 23580249  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  23580248 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 23580207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 5973543 - 5974094
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5973543 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 5973642  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca------gcacgtc 193  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||    
T  5973643 gcgctttttaacttgtgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattataattagcacgtc 5973742  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973743 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 5973842  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973843 aaggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 5973941  T
Q  394 tgttaacgaaggacaactgctcagagctatcc-aaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagc 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  5973942 tgttaacgaaggacaaatgctcagcgttgtccaaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacaac 5974041  T
Q  493 tactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5974042 tactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 5974094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7689881 - 7689334
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7689881 atacaatacagaaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 7689782  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgt-gaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7689781 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcatagaaagagacgttgagataattagcacgtctaaag 7689682  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7689681 agccgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcacatcttgaaggc 7689582  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689581 acaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 7689483  T
Q  399 acgaaggacaact-gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7689482 acgaaggacaaataactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgagaaacagctactt 7689383  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  7689382 tggatcttcagtttgaatttacggattaattgtagcttctggtgatgat 7689334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 542
Target Start/End: Original strand, 35012710 - 35013248
Alignment:
Q  3 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35012710 acaatacaataaggactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttggcg 35012809  T
Q  103 cttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 202  Q
    |||||||| |||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012810 cttttgaaattgtatatctctatattttatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 35012909  T
Q  203 gtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35012910 gtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggtacaa 35013009  T
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35013010 attctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacga 35013109  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
      ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  35013110 gagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaat 35013209  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  35013210 cttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 35013248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20441738 - 20441193
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20441738 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 20441639  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    | |||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20441638 gtgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgataagcacgtctaaaga 20441539  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441538 gtcgtt-gaattcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 20441440  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441439 caaattctgtaggcatagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 20441340  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  20441339 cgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgatgttgaaatgagaaacagctactttg 20441240  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||| | || |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20441239 aatctttaattagaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 20441193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 19187623 - 19188137
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19187623 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 19187722  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187723 cgctttttaacttgtgtatctctcacttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 19187822  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19187823 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 19187922  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19187923 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 19188022  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| || |||||||    
T  19188023 cgagagacaagtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcaactacttt 19188122  T
Q  499 ggatcttcagtttga 513  Q
    | |||||||||||||    
T  19188123 gaatcttcagtttga 19188137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 4167044 - 4167585
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4167044 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 4167143  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167144 tgcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 4167243  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4167244 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 4167343  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4167344 aaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 4167443  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  4167444 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 4167543  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4167544 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4167585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 4177700 - 4178241
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4177700 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 4177799  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
     |||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177800 tgcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 4177899  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4177900 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 4177999  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4178000 aaattttgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 4178099  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  4178100 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 4178199  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4178200 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4178241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 12730332 - 12730873
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12730332 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12730431  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730432 cgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12730531  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12730532 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12730631  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12730632 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12730731  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12730732 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 12730831  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12730832 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12730873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18382325 - 18381811
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttg--aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18382325 atacaatacaataaagactttagactttgtgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttt 18382226  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18382225 ggcgctttttaacttgtatatctctatctatattcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattaacacgtctaaag 18382126  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18382125 agtcgtt-gagttcctttgatcatccactagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagga 18382027  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18382026 acat-ttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 18381928  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  18381927 acgaaggacaagtactcagggctctccaaatgactgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctacttt 18381828  T
Q  499 ggatcttcagtttgaat 515  Q
    | |||||||||||||||    
T  18381827 gaatcttcagtttgaat 18381811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 21894988 - 21895528
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21894988 atacaatacaagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 21895087  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21895088 gcgcttttgaacttatatatctctgttt--tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 21895185  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
T  21895186 gtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgta 21895285  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21895286 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 21895385  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  21895386 atgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 21895485  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  21895486 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 21895528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 19178744 - 19179286
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  19178744 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttga 19178843  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178844 cgctttttaacttgtgtatctctcacttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 19178943  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19178944 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagagtaagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 19179043  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19179044 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatattaa 19179143  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    |||  ||||| |||| || ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  19179144 cgagagacaagtgcttagtgctatccaatatatccgttgataactccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttt 19179243  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  19179244 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 19179286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 12740925 - 12741466
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12740925 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12741024  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12741025 cgcttttgaacttatgtatctctcactttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12741124  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12741125 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12741224  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12741225 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12741324  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12741325 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 12741424  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||| ||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12741425 aatcttcaatttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12741466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 33084347 - 33084888
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33084347 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 33084446  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    | ||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084447 cacttttgaacttatgtatctctatctcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 33084546  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33084547 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 33084646  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33084647 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcatagacagaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 33084746  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  33084747 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 33084846  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || |  ||| ||| ||||||||||||||    
T  33084847 aatcttcagtttgatta-aaaaatcaaacgtagcttctggtga 33084888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12898403 - 12897864
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  12898403 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 12898304  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898303 cgcttttgaacttatgtatctctgttta--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12898206  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12898205 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12898106  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12898105 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12898006  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12898005 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 12897906  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12897905 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12897864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5640132 - 5639591
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5640132 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgttttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5640033  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640032 cgcttttgaacttatgtatctcttttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5639933  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5639932 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 5639833  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5639832 aaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5639733  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  5639732 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 5639633  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5639632 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 5639591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 21877552 - 21878093
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21877552 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 21877651  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877652 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 21877751  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21877752 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 21877851  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21877852 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 21877951  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  21877952 cgagagacaagtgctcagtgctatctatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 21878051  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  21878052 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 21878093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5650689 - 5650148
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5650689 atacaatacagtaaagaccctagactttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 5650590  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650589 cgcttttgaacttatgtatctcttttttcaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5650490  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5650489 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatacgcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 5650390  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5650389 aaattctgcaggcatggttgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 5650290  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  5650289 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 5650190  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  5650189 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 5650148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35649113 - 35648571
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35649113 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 35649014  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649013 cgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35648914  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35648913 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35648814  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35648813 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35648714  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35648713 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35648614  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35648613 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35648571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 47195047 - 47195592
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47195047 atacaatacgataaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 47195146  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47195147 gcgctttttaacttgtatatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 47195246  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  47195247 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatccttcgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggaa 47195345  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47195346 cat-ttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 47195444  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  47195445 acgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctacttt 47195544  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | |||| |||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  47195545 gaatctccagtttaaatttatggatcaattgtagcttctggtgatgat 47195592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 7507087 - 7507628
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7507087 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 7507186  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507187 cgcttttgaacttatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7507286  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  7507287 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 7507386  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7507387 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 7507486  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  7507487 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 7507586  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||    
T  7507587 aatcttcagtttgatta-atggatcaaaagtagcttctggtga 7507628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 7517684 - 7518225
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7517684 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 7517783  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517784 cgcttttgaacttatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7517883  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  7517884 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 7517983  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7517984 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 7518083  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  7518084 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 7518183  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||    
T  7518184 aatcttcagtttgatta-atggatcaaaagtagcttctggtga 7518225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12624203 - 12623662
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12624203 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12624104  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624103 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12624004  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12624003 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12623904  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12623903 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12623804  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12623803 tgagagacaagtgctcagtgatatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 12623704  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12623703 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12623662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 21863446 - 21863987
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21863446 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 21863545  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863546 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 21863645  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21863646 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 21863745  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21863746 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtaaacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 21863845  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  21863846 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 21863945  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  21863946 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 21863987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 39586755 - 39587297
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39586755 atacaatacgatacagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 39586854  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39586855 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacattcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 39586954  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39586955 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgagtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaa 39587053  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587054 cat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 39587152  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39587153 acgaaggacaagtacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctacttt 39587252  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgat 543  Q
    | ||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||    
T  39587253 gaatcttcagtttaaacttatggatcaattgtagcttctggtgat 39587297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 5833003 - 5833545
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  5833003 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 5833102  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5833103 cgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5833202  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  5833203 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 5833302  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5833303 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 5833402  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  5833403 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 5833502  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  5833503 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5833545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 5843605 - 5844147
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  5843605 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 5843704  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843705 cgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 5843804  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  5843805 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 5843904  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5843905 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 5844004  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  5844005 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 5844104  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  5844105 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5844147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 2538321 - 2538861
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2538321 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctatgtagaatcaaattgacagagttttgg 2538420  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538421 cgcttttaaacttatgtatctctatattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 2538520  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  2538521 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 2538620  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2538621 a-aaactgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 2538719  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  2538720 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 2538819  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  2538820 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 2538861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12614738 - 12614197
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12614738 atacaatacagaaaaaactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12614639  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614638 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12614539  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12614538 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12614439  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12614438 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12614339  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12614338 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 12614239  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12614238 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12614197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 47608353 - 47607811
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47608353 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 47608254  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608253 cgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 47608154  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  47608153 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 47608054  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47608053 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 47607954  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| | || |||||    
T  47607953 aagagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatccgcaacttt 47607854  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  47607853 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 47607811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 47618961 - 47618419
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47618961 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 47618862  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47618861 cgcttttgaacttatgtatatctctatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 47618762  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  47618761 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 47618662  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47618661 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 47618562  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| | || |||||    
T  47618561 aagagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatccgcaacttt 47618462  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  47618461 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 47618419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36236851 - 36236311
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36236851 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36236752  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36236751 cgctttttaacttctgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36236652  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  36236651 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgtac 36236552  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36236551 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36236453  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||| ||||||    
T  36236452 cgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagcaactttg 36236353  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||    
T  36236352 aatcttcagtttgatta-aaggattaaaagtagcttctggtga 36236311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36247398 - 36246858
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36247398 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 36247299  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247298 cgctttttaacttctgtatttctctcttttatcttcaagtcttcactcctttttatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 36247199  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  | ||    
T  36247198 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaatttcaaattccttcccatcttgagtgtac 36247099  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36247098 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 36247000  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||| ||||||    
T  36246999 cgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagcaactttg 36246900  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||    
T  36246899 aatcttcagtttgatta-aaggattaaaagtagcttctggtga 36246858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 51629609 - 51629068
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  51629609 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 51629510  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629509 cgcttttgaacttatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 51629410  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  51629409 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 51629310  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51629309 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 51629210  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  51629209 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 51629110  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  51629109 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 51629068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 51656870 - 51656329
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  51656870 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 51656771  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51656770 cgcttttgaacttatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 51656671  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  51656670 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 51656571  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51656570 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 51656471  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  51656470 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 51656371  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  51656370 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 51656329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10998194 - 10997693
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10998194 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 10998095  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10998094 tatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacttctaaagagtcgtttgaaatc 10997995  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcagg 312  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  10997994 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaattctgcagg 10997895  T
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaact 411  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |    
T  10997894 catggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagt 10997795  T
Q  412 gctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10997794 gctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagttt 10997695  T
Q  512 ga 513  Q
    ||    
T  10997694 ga 10997693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 3171407 - 3171949
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3171407 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 3171506  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171507 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3171606  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  3171607 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 3171706  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3171707 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 3171806  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  3171807 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 3171906  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  3171907 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 3171949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 3182009 - 3182551
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3182009 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 3182108  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3182109 cgcttttgaacttgcgtatattcctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 3182208  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  3182209 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 3182308  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3182309 caacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 3182408  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  3182409 atgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacttt 3182508  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  3182509 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 3182551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 13 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35404802 - 35404272
Alignment:
Q  13 aaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaact 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35404802 aaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaact 35404703  T
Q  113 tgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatc 212  Q
    | | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35404702 tatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagtacgtctaaagagtcgtttgaaatc 35404603  T
Q  213 ctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcag 311  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||    
T  35404602 ctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcag 35404503  T
Q  312 gcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||     
T  35404502 gcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaag 35404403  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  35404402 tgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtt 35404303  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    ||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35404302 tgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35404272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35638461 - 35637919
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  35638461 atacaatacagaaaagactctagacttttaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgaccgagttttgg 35638362  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35638361 cgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcaggtctaaagag 35638262  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35638261 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35638162  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35638161 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35638062  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35638061 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatctgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35637962  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | || |||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35637961 gaattttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35637919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 38094861 - 38095403
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38094861 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 38094960  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094961 cgcttttaaacttatgtatttttctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 38095060  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  38095061 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 38095160  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38095161 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 38095260  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||  ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  38095261 atgagagacaggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 38095360  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | |||||||||| || || | | || ||||||||||||||||||    
T  38095361 gaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38095403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 38105486 - 38106028
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38105486 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 38105585  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105586 cgcttttaaacttatgtatttttctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 38105685  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  38105686 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 38105785  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38105786 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 38105885  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||  ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  38105886 atgagagacaggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 38105985  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | |||||||||| || || | | || ||||||||||||||||||    
T  38105986 gaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38106028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9050893 - 9050363
Alignment:
Q  16 gactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9050893 gactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttg 9050794  T
Q  115 tatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcct 214  Q
    ||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9050793 tatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaagtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcg-ttgaattcct 9050695  T
Q  215 ttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggca 314  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9050694 ttgatcatccaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaaatagcttcaaattcattaccatcttgaaggaacat-ttctgcaggca 9050596  T
Q  315 tagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtac-tttgtcaactctgttaacgaaggacaactgc 413  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| | |    
T  9050595 tggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactttgttaaagaatgacaagtac 9050496  T
Q  414 tcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttga 513  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  || |    
T  9050495 tcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaatgagaaccagctactttgaatctccaaattaa 9050396  T
Q  514 atatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  9050395 atttactgattaattgtagcttctggtgatgat 9050363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 17957025 - 17957571
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17957025 atacaatgtaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagggttttg 17957124  T
Q  100 gcgcttttg-aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  17957125 gcgcttttttaacttgtatgtctctatctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatgattagcacgtctaaag 17957224  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17957225 agtcgtt-gagttcctttgatcttccaccagtaattctttgcctgatatgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagga 17957323  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgtt 397  Q
    |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  17957324 acat-ttctgcaggcatggttgttttcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtaaactctgat 17957422  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17957423 aaagaaggacaaatactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaatgagaaacagctactt 17957522  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||| |||||| |||  |   ||||| |||||||||||||||||||    
T  17957523 tgaatctccagtttaaattcactgattaattgtagcttctggtgatgat 17957571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 35401565 - 35401045
Alignment:
Q  23 gactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttc 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  35401565 gactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagtatcaaattgacagagttttggcgcttttgaacttatgtatatc 35401466  T
Q  123 tctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcat 222  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35401465 tctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagtacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgattat 35401366  T
Q  223 ccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggcacatattctgcaggcatagctgt 321  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||    
T  35401365 ccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgt 35401266  T
Q  322 tgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagc 420  Q
    ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |     
T  35401265 tgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgt 35401166  T
Q  421 tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatg 520  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || | |    
T  35401165 tatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aag 35401067  T
Q  521 aattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  35401066 gatcaaatgtagcttctggtga 35401045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11195490 - 11194972
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  11195490 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttatgagaagtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 11195391  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  11195390 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 11195292  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  11195291 agagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgagtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 11195192  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11195191 gaacat-ttctgcaggcaaagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtaatggttgtacacttgtactttgtcaactctga 11195093  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||| ||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  11195092 taacgaaagacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 11194994  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatata 518  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  11194993 ttgaatcttcagtttaaatata 11194972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20196114 - 20195667
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  20196114 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 20196015  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  20196014 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgaaagagacgttgagatttt-agcacgtctaa 20195917  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |    
T  20195916 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgatg 20195818  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20195817 gaaca-attctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 20195719  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 448  Q
    ||||||||||||| | |  || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20195718 taacgaaggacaagtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctt 20195667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14388549 - 14388003
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca-gtttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||    
T  14388549 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttgtaatcaagtttggcagagtttt 14388450  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
     |||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14388449 agcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 14388351  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  14388350 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 14388252  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388251 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 14388153  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     ||| |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  || || |||||||| |    
T  14388152 ataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttctt-ttagacgaggttagaacgaaaaacagctcc 14388054  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  14388053 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 14388003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 675230 - 675775
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  675230 atacaatgcaataaagactctagacttgagaatttctaagatgtatcaaattagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 675329  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  675330 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactgctttatatagaggtgagtagaaagacgttgagatttttagcacgtcta 675428  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  675429 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaa 675527  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  675528 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 675625  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   |  || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  675626 tcaatgaaggacaagcaccgagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcg-tcctcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 675724  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| |||||     | || |||||||||||||||||||    
T  675725 tttgaaacttcagtttaaatattctgttcaactgtagcttctggtgatgat 675775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 41133039 - 41132493
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  41133039 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttt 41132940  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtct 194  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | | ||| ||||    
T  41132939 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagattttaaagcatgtct 41132841  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  41132840 aaagagtcatt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttga 41132742  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41132741 aggaacag-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 41132643  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
     | || |||||||||   | ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || ||||||||     
T  41132642 -tcaaagaaggacaaacacccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctc 41132545  T
Q  495 ctttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  41132544 atttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 41132493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18311395 - 18310849
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  18311395 atacaatgcaataaggactctaaacttaagaatttttaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 18311296  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    || |||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18311295 ggtgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 18311197  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  18311196 aagagtcgtt-gagtttctttgatcattcaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 18311098  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18311097 ggaacat-ttctgcaggtagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 18310999  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
     ||| |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| |    
T  18310998 ataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatatcttcctttcaatccttcgttctt-ttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcc 18310900  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | |||||  || ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  18310899 tttgaaacttcaaattaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 18310849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 20798723 - 20799118
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  20798723 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 20798822  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgag-ataatcagcacgtct 194  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || || |||||||||    
T  20798823 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagaattat-agcacgtct 20798920  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |  || || | ||||||||||||||| |||||||    
T  20798921 aaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatagaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 20799019  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799020 aggaaca-attctgcaggcagagctgttattttgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 20799118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22610397 - 22610002
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  22610397 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 22610298  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22610297 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 22610199  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| || || || ||||||||||||| | |||||||| | ||| || |  |||||||||||||| ||||||||    
T  22610198 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgagtgtagtcctataaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaa 22610100  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22610099 ggaaca-attctgcaggcagagctgttatattgtcttgtagcgaggacatgctcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22610002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46181302 - 46180907
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  46181302 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 46181203  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtatatttctctttctt-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
     ||||||||| ||||||| |   | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  46181202 gggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctcttgatcttcaagtcttcactcctttatatagtggtaagtagagagacgttgagatctttagcacgtcta 46181104  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  46181103 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 46181005  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |  |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46181004 ggaaca-attctgcaggcagagctgttaacttgtcttgtagcgaagacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 46180907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20884305 - 20883910
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  20884305 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 20884206  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||   | ||||||||     
T  20884205 tggcgctttt-aacttgtgttgatttctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagacttttagcacgtcc 20884108  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  20884107 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatctgttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 20884009  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| | | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884008 aggaaga-attctgctggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagctaatggttgtacacttgtactttgtcaactct 20883910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 23926730 - 23927112
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||| ||||||| ||    
T  23926730 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagttttgacgctttt-aa 23926828  T
Q  111 cttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
    ||||| |  || ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |    
T  23926829 cttgtgttgatatctctatcag-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcgtt-g 23926926  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    |  |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||| | ||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  23926927 agttcctttgatcatccactagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttct 23927025  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927026 gtaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacatactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23927112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 318 - 511
Target Start/End: Original strand, 12946818 - 12947010
Alignment:
Q  318 ctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcag 417  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  12946818 ctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggataaatactcag 12946917  T
Q  418 agctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12946918 tgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagttt 12947010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 44200683 - 44201066
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctt-tgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||  | |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  44200683 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttatgtgaaacaattttggcagagtttgggcgctttt-aa 44200781  T
Q  111 cttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
    |||||    || |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||      
T  44200782 cttgttgtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcattcctttatatagtggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttga 44200880  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
     || ||||||||||   ||||||  || ||| ||||||||||  || ||||| ||||  || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  44200881 gaaacctttgatcaat-accaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttct 44200978  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44200979 gcaggcaaagttgttatcttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 44201066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 5929376 - 5929757
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  5929376 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcacagtgcttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aa 5929474  T
Q  111 cttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
    |||||    || |||||   | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||      
T  5929475 cttgttgtaatgtctctag-tgatcttcaagtcttcattcctttatataggggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaaagagtcgttga 5929573  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
     || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  5929574 gaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttct 5929670  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5929671 gcaggcagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 5929757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 17370833 - 17371097
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  17370833 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 17370930  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |||| || | |||    
T  17370931 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcatgaaggaacat-ttctgcaggcagagctatttttctt 17371029  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17371030 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 17371097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 28473898 - 28474281
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagttt-gacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||| || ||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  28473898 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaacgtgcttttgagaaacaattttggcagagtttgggcgctttt-aa 28473996  T
Q  111 cttgtatatttctcttt-cttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
    ||||||   || |||   || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||| ||||||   | | ||||||||||||||||||| |    
T  28473997 cttgtagcattgtctccactgatcttcaagtcttcactcctttttagagaggtgtgtagaaagacattgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt-g 28474095  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    | | |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  28474096 agaacctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacat-ttct 28474194  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28474195 gcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 28474281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Original strand, 22655259 - 22655532
Alignment:
Q  123 tctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |   |||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||    
T  22655259 tcttttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatcttttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgat 22655356  T
Q  220 catccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagct 319  Q
    ||  |||||||  || ||||||||||||||  || |||||  |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||    
T  22655357 cagtcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagaact 22655455  T
Q  320 gttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| | |||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22655456 gtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22655532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45070900 - 45070681
Alignment:
Q  173 cgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagc 272  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || | |    
T  45070900 cgttgagatcttaagcacgtctaaagaatcgtt-gagttcctttgatcattcaccactaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaac 45070802  T
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  45070801 ttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgt 45070703  T
Q  373 acacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  45070702 acatttgtaatttgtcaactct 45070681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 394
Target Start/End: Original strand, 19037693 - 19038061
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgt-atatt-tctc 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||||||||  ||||||| | |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  19037693 gaatttctaagatatatcaaatcaacaaagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-aacttgttatattgtctc 19037791  T
Q  125 tttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcat 222  Q
    |  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||     
T  19037792 ta-ctgatctgcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaa 19037889  T
Q  223 ccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgtt 322  Q
      ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| | |||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  19037890 ataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtt 19037988  T
Q  323 gt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
     | |||||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19037989 tttcttgtcttgtagcgcagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19038061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19170626 - 19170360
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaa-agagtcgtt-tgaaatcctttgatcatcca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| || || ||||| ||| ||||| |  |||||||  ||    
T  19170626 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagacgttgagatcttttagcacttcaaatagagtagttgtgaaacc--ttgatcaatca 19170529  T
Q  226 ccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt- 324  Q
    |||||  || ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |     
T  19170528 ccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaacgaacat-ttctgcaggcagagctgttttt 19170430  T
Q  325 cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactc 393  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19170429 cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactc 19170360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 28379786 - 28380049
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   ||||    
T  28379786 atcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaatacca 28379884  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 328  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  28379885 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttg 28379983  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28379984 tcttgtagcgtagacacaattagagtcgtggaggtactggttgtacacttgtactttgtcaactct 28380049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 22019127 - 22019391
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  22019127 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaa 22019225  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||  |||||    
T  22019226 tgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggaagagctgtttatcttg 22019324  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22019325 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22019391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 20251566 - 20251828
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   ||||    
T  20251566 atcttcaagtctttactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaat-acca 20251663  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 328  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  20251664 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcttg 20251762  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    | ||||||  | |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20251763 ttttgtagcatagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacccttgcactttgtcaactct 20251828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 52351094 - 52350712
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||| | |||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |    
T  52351094 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaacacagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttggcagagtttgggcgctttt-a 52350996  T
Q  110 acttgtatatttctctttctta-tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||  | || ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |  | | ||||||| |||||||| ||     
T  52350995 acttgttgaattgtctctaataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgttgagagacgttgagttctttaagcacgtc-aaagagtcattg 52350897  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
      || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||    
T  52350896 agaaacctt-gatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacat-ttc 52350800  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52350799 tgcaggcagagctattatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 52350712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 21543820 - 21544084
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  21543820 atcttcaagtcttcattcctttatatagtgatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 21543917  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| | |||||| |  ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||| |||||| ||||||| | |||    
T  21543918 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaaggaacat-ttctacaggcagagctgtttttctt 21544016  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  21544017 gtcttgtagcgtagacaaaagcaaagtagtggaggtagtggtcgtacatttcttactttgtcaactct 21544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20867263 - 20867068
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  20867263 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttttggcactttt-aa 20867165  T
Q  111 cttgt--atatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtt 205  Q
    |||||    ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  20867164 cttgtggtgatttctc-taccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtccaaagagtcgtt 20867068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 22642685 - 22642950
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  |   || ||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||    
T  22642685 atcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagtggttgagatcttttaagaacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacc 22642782  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tct 326  Q
    |||  || ||||||| ||||||  || |||||  |||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||  |||    
T  22642783 aatgatcttttgccttatttggatgttgtcctaagaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttatct 22642881  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22642882 tgtcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22642950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22465093 - 22464851
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||  |||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  22465093 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 22464996  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||| || |||||||||    
T  22464995 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 22464897  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22464896 gtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacactt 22464851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25448849 - 25448608
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  || ||||  |     
T  25448849 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcatcaatgatt 25448752  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 333  Q
    ||||||||||| |||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  25448751 ctttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttg 25448653  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448652 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30292066 - 30291985
Alignment:
Q  432 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  30292066 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttga 30291985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 394
Target Start/End: Original strand, 23064935 - 23065003
Alignment:
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064935 ttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23065003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26548546 - 26548282
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||| | |||||| || |||||  | || || |  |||||    
T  26548546 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtccttgtgaaa--ccttaattaaacacca 26548449  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  |  ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||| | |||| || ||||| || ||||| || || |    
T  26548448 atgatcttttgcctgatttggatgctgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaacat-ttatgcagacagagctgtttatcct 26548350  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| |  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26548349 gtcttgtagcgtagacagaggcagtgtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 26548282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 45071051 - 45070942
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||| ||||||||    
T  45071051 atacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 45070952  T
Q  98 tggcgctttt 107  Q
    ||||||||||    
T  45070951 tggcgctttt 45070942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 20909199 - 20909279
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||| || ||||||||||||||||    
T  20909199 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgttgattgccagcacatcaaaagagtcgtttgaaa 20909279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 1900141 - 1900383
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  1900141 aagtcttcattcctttatatagaggtgcgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 1900238  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| ||| |||||  |||||| | ||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1900239 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatccccattgtgaaggaatattgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 1900337  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900338 gtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1900383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24028974 - 24028751
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  ||||||    
T  24028974 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcaccaa 24028877  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagct-gttgtcttg 328  Q
    |  || |||||| |||||||  || || || | ||| || |  |||||||  ||||  | |||||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||    
T  24028876 tgatcttttgccagatttggatgttgttctataaaggatcacgttcaaatctattcataacttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctatttttcttg 24028778  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagta 355  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    
T  24028777 tcttgtagcgtagacaaaaacagagta 24028751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7745378 - 7745328
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745378 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 7745328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 2266885 - 2267127
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatc-agcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   || ||||  || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  2266885 aagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaaaagacgttgtgaatttccagcaaatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 2266982  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||  || |  ||||||| |||| ||||  |||||| |||| || ||||| || ||||||| | ||||||||    
T  2266983 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctt-tgcagacaaagctgtttttcttgtctt 2267081  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2267082 gtagtagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 2267127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Original strand, 35039964 - 35040204
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  ||   |||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||    
T  35039964 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatggtc 35040060  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagc-tgttgtcttgtcttg 333  Q
     |||| ||||| | |   | ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| || |  | |||||||| ||| | || ||||||||||    
T  35040061 ttttgtctgatatagttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacgtcgt-tgcaggcagagctttttttcttgtcttg 35040159  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040160 tagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35040204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18130300 - 18130254
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18130300 atcttcaagtcttcactcctatatatagaggtgtgaaagagacgttg 18130254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34255806 - 34255756
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34255806 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgagat 34255756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 2834485 - 2834525
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2834485 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 2834525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 10250783 - 10250823
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10250783 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 10250823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12624839 - 12624799
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624839 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12624799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21135443 - 21135403
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135443 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21135403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21205156 - 21205116
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205156 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21205116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 21984392 - 21984432
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984392 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21984432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22427641 - 22427399
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||| |  |||   ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  22427641 agtcttcacttctttatatagagatgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 22427544  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | ||||| |||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  22427543 cttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcaaagctgtttttcttgtctt 22427445  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22427444 gtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 22427399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 29215592 - 29215632
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29215592 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 29215632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33256635 - 33256595
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33256635 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 33256595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33276807 - 33276767
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33276807 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 33276767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 36134156 - 36134228
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134156 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 46088786 - 46088826
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46088786 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 46088826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48570514 - 48570474
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48570514 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 48570474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Original strand, 37642215 - 37642286
Alignment:
Q  308 gcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37642215 gcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 37642286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 9346563 - 9346609
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9346563 atcttcaactcttcactcctttatatagaggtgtgaaggagacgttg 9346609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 22153841 - 22153895
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153841 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22153895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 23054158 - 23054204
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23054158 atcttcaagtcttcactcctttgtatagagatgtgaaagagacgttg 23054204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 21702610 - 21702651
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21702610 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttga 21702651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32786222 - 32785979
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |  ||   |||| ||||||||   |||||||||  || ||||      
T  32786222 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttgtgaattgtcagcgcattcaaaatagagccgtttgaa--gctttgatcaatcatcaatga 32786125  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 331  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  32786124 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaagcagagctgtttttcttgtct 32786026  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    | ||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32786025 tttagcggagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacactt 32785979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 2268327 - 2268367
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2268327 aagtcttcactccattatatagaggtgtgaaagagacgttg 2268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 12284219 - 12284259
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284219 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 12284259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16235580 - 16235540
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16235580 aagtcttcactcctttatatggaggtgtgaaagagacgttg 16235540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21121347 - 21121307
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21121347 agtctacactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21121307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21192149 - 21192109
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21192149 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 21192109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21214960 - 21214920
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21214960 agtcttaactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21214920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 21702780 - 21702852
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21702780 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22202020 - 22201980
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22202020 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22201980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22600466 - 22600426
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22600466 aagtcttcactcctttttatagaggtgtgaaagagacgttg 22600426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26702413 - 26702373
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26702413 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgttg 26702373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 36133985 - 36134025
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36133985 aagtcttcactcctttatatagaggtgtggaagagacgttg 36134025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 38282363 - 38282403
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282363 aagtattcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 38282403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39201070 - 39201034
Alignment:
Q  342 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39201070 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39201034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 42284425 - 42284465
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42284425 agtcttcactcctttatatagagttgtgaaagagacgttga 42284465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48570345 - 48570273
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48570345 tgcaggcatagctgtttttcttgtcctgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 48570273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18517451 - 18517404
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18517451 atcttcaagtcttcactcatttatatagagatgtgaaagaggcgttga 18517404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 175
Target Start/End: Original strand, 18614707 - 18614750
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18614707 tcttcacgtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagatacgt 18614750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 2268515 - 2268569
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2268515 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacactt 2268569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2327536 - 2327482
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2327536 tcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 10250970 - 10251024
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10250970 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacactt 10251024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14263527 - 14263493
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263527 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14263493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 17018370 - 17018416
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17018370 atcttcaagttttcactcctttatatagacgtgtaaaagagacgttg 17018416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20110239 - 20110193
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20110239 atcttaaagtcttcactcctttatatagagttatgaaagagacgttg 20110193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22600329 - 22600224
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| || |||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22600329 ttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttg 22600231  T
Q  372 tacactt 378  Q
    |||||||    
T  22600230 tacactt 22600224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23935379 - 23935333
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23935379 atcttcaagtcttcattcttttatatagaggtatgaaagagacgttg 23935333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 174
Target Start/End: Original strand, 10757219 - 10757256
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757219 aagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagagacg 10757256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14263737 - 14263696
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14263737 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaagagacgttga 14263696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18896872 - 18896839
Alignment:
Q  144 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896872 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18896839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21191944 - 21191907
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191944 gacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21191907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21206909 - 21206876
Alignment:
Q  145 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21206909 actcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 21206876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 46088990 - 46089027
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46088990 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 46089027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 7309615 - 7309655
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7309615 aagtcttcactcctttaaatagaggtgagaaagagacgttg 7309655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 19215578 - 19215650
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19215578 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 19215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 21028590 - 21028626
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028590 aagtcatcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 21028626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21135274 - 21135202
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21135274 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacactt 21135202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 22153653 - 22153693
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153653 aagttttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22153693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 30571994 - 30572034
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30571994 agtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacattga 30572034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Original strand, 30572199 - 30572235
Alignment:
Q  342 acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30572199 acaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 30572235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 30892889 - 30892929
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30892889 aagtcttcattcctttacatagaggtgtgaaagagacgttg 30892929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44824045 - 44824005
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44824045 agtcttcactcctttatatagaagtttgaaagagacgttga 44824005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7745207 - 7745132
Alignment:
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745207 ttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcatgtagcgaaggcaatagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17025246 - 17025207
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17025246 aagtcttcacttatttatatagaggtgtgaaagagacgtt 17025207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21121143 - 21121108
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21121143 gacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 21121108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23036790 - 23036751
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23036790 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagaaacgtt 23036751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26280346 - 26280271
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-gataatcagcacgtctaaagagtcgtt 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| || |||||||||||    
T  26280346 atctttaagtcttcactcctttattttgaggtgtgagagatacgttgaggattgtcagcacatcaaaagagtcgtt 26280271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2819607 - 2819561
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2819607 atcttcaaatcttcatttctttatatagaggtatgaaagagacgttg 2819561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 23024772 - 23024826
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23024772 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacactt 23024826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 31359111 - 31359157
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  31359111 atcttcaagtcttcattcatttatatagatgtatgaaagagacgttg 31359157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 35401813 - 35401847
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35401813 aaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 35401847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44821641 - 44821587
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44821641 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacactt 44821587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12613893 - 12613856
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12613893 gacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacactt 12613856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18896672 - 18896639
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18896672 aaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 18896639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21204998 - 21204965
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21204998 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 21204965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 388
Target Start/End: Original strand, 23054373 - 23054414
Alignment:
Q  347 aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23054373 aacagagtagtgaaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 23054414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 180
Target Start/End: Original strand, 26703351 - 26703395
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttata--tagaggtgtgaaagagacgttgaga 180  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26703351 agtcttcacttctttatatatagaggtgtgaaagagacgttgaga 26703395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 29215798 - 29215835
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29215798 gacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacactt 29215835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16235410 - 16235338
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16235410 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacactt 16235338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21684355 - 21684323
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtg 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21684355 atcttcaagtctttactcctttatatagaggtg 21684323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 30893058 - 30893130
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30893058 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacactt 30893130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33256465 - 33256393
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33256465 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 33256393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33276637 - 33276565
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33276637 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 33276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 373
Target Start/End: Original strand, 38282568 - 38282600
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38282568 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 38282600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7302 - 6758
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7302 atacaaaacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 7203  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7202 cgctttttaacttgtgtatctctatctca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7104  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7103 tcgtttgaaaacctttgatcatccaccagtaatcctttgcctggtttgggtgtagtcctttaaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 7004  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7003 aaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 6904  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgg 500  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  6903 gaaggacaaatgcttagtgctatccatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacagctagtttgg 6804  T
Q  501 atcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6803 atcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 6758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 154)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18769302 - 18768758
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18769302 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 18769203  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18769202 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 18769103  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769102 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 18769004  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769003 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 18768905  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768904 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 18768805  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  18768804 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 18768758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21172861 - 21172318
Alignment:
Q  3 acaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggc 101  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21172861 acaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggc 21172762  T
Q  102 gcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagt 201  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21172761 gctttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagt 21172662  T
Q  202 cgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172661 cgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaattctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcaca 21172562  T
Q  302 tattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 401  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21172561 aattctgcaagcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacg 21172463  T
Q  402 aaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 501  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172462 aaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 21172363  T
Q  502 tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  21172362 tcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 21172318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 2561319 - 2561865
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2561319 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 2561418  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
     ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2561419 acgctttttaacctgtgtatgtctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaa 2561518  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  2561519 gagtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattatcttcaaattcattcccactttgaagg 2561618  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561619 cacaaattctgcagacatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 2561717  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2561718 aacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaagtgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactt 2561817  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2561818 tggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 2561865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28721702 - 28721168
Alignment:
Q  12 taaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  28721702 taaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcaaaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaa 28721603  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28721602 cttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 28721503  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28721502 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 28721403  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28721402 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaga 28721304  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28721303 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttgagtt 28721204  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28721203 tgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 28721168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28732288 - 28731756
Alignment:
Q  12 taaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  28732288 taaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttttaa 28732189  T
Q  111 cttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 210  Q
    ||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28732188 cttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaaa 28732089  T
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28732088 tcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttggatgtagtcctttgaggaattaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattctgca 28731989  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28731988 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggt--tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaa 28731892  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28731891 tactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagatgatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 28731792  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28731791 tgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 28731756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24415418 - 24414874
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24415418 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 24415319  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24415318 gcgctttttaacttgtgtatgtctatctacaatcttcaagtcttcactccttcatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 24415219  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24415218 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattctcatcttgaaggca 24415120  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24415119 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaa 24415021  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24415020 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 24414921  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  24414920 gatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 24414874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 29244053 - 29244594
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29244053 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29244152  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29244153 cgctttttaacttatgtatatctgtcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 29244252  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29244253 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 29244352  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29244353 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 29244452  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||| |||||||    
T  29244453 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagttactttg 29244552  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  29244553 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 29244594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 29254632 - 29255173
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29254632 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 29254731  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254732 cgctttttaacttatgtatatctgtcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 29254831  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29254832 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 29254931  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29254932 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 29255031  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||| |||||||    
T  29255032 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagttactttg 29255131  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  29255132 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 29255173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 7006204 - 7005663
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  7006204 atacaatacagtacagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgatagagttttgg 7006105  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006104 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7006005  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7006004 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 7005905  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7005904 aacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 7005805  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  7005804 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagattgaattgagaatcagctactttg 7005705  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  7005704 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 7005663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 26866903 - 26867417
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26866903 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 26867002  T
Q  100 gcgcttttg-aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26867003 gcgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaag 26867102  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26867103 agtcgtt-gagttcctttgatcatccaccaacaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagga 26867201  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867202 aca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 26867300  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  26867301 acgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatgcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctacttt 26867400  T
Q  499 ggatcttcagtttgaat 515  Q
    | |||||||||||||||    
T  26867401 gaatcttcagtttgaat 26867417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17857834 - 17857293
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17857834 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 17857735  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857734 cgcttttgaacttatgtatctctgtctccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 17857635  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17857634 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 17857535  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17857534 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 17857435  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  17857434 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 17857335  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  17857334 aatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 17857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9897971 - 9897430
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9897971 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9897872  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9897871 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9897772  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9897771 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9897672  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9897671 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9897572  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  9897571 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 9897472  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9897471 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9897430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9908559 - 9908018
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9908559 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 9908460  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908459 cgcttttgaacttatgtatctctatctgcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9908360  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9908359 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9908260  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9908259 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9908160  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  9908159 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 9908060  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9908059 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9908018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11389206 - 11388665
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11389206 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 11389107  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389106 cgcttttgaacttatgtatctctctcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 11389007  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  11389006 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 11388907  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11388906 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 11388807  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  11388806 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 11388707  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  11388706 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 11388665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24328131 - 24327590
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24328131 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24328032  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24328031 cgcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagag 24327932  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24327931 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 24327832  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24327831 aaattctgcaggcatgactgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24327732  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24327731 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 24327632  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24327631 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 24327590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36252239 - 36251700
Alignment:
Q  3 acaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36252239 acaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcg 36252140  T
Q  103 cttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 202  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252139 ctttttaacttatgtatctctctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtc 36252040  T
Q  203 gtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacat 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||     
T  36252039 gtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtacaa 36251940  T
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacg 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36251939 attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacg 36251840  T
Q  402 aaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgga 501  Q
    |  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |    
T  36251839 agagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaa 36251740  T
Q  502 tcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    |||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  36251739 tcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 36251700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 21650928 - 21650388
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21650928 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 21650829  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650828 cgcttttaaacttgtgtatctctatattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 21650729  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21650728 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 21650629  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21650628 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 21650530  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  21650529 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 21650430  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  21650429 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 21650388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24338801 - 24338260
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24338801 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 24338702  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24338701 cgcttttgaacttatgtatctctatctttaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcatgtctaaagag 24338602  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24338601 tcgtttgaaatcctttgattatccatcagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 24338502  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24338501 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 24338402  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  24338401 cgagagacaagtgctcaatgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 24338302  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||| ||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  24338301 aatcatcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 24338260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 38586475 - 38585938
Alignment:
Q  9 caataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgctttt 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38586475 caataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttggcgctttt 38586376  T
Q  108 gaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
     ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  38586375 taacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcccttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtt-g 38586277  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38586276 agttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttct 38586178  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaagga 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  38586177 gcaggcagagctgttgtcttgtcttttagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactatgttaaagaagga 38586078  T
Q  407 caactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttc 506  Q
    ||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  38586077 caagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctac 38585978  T
Q  507 agtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  38585977 agtttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 38585938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 34477760 - 34478300
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34477760 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 34477859  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477860 cgcttttgaacttatgtatctctatatgttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 34477959  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  34477960 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 34478059  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34478060 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 34478158  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||    
T  34478159 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttg 34478258  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  34478259 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 34478300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34790614 - 34790073
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34790614 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 34790515  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| |  ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790514 cgcttttgaacttatgaat--ctctttcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 34790417  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |     
T  34790416 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgt 34790317  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34790316 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 34790217  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  ||||| |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  34790216 aacgagagacaagtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactt 34790117  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  34790116 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 34790073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 43354854 - 43355394
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43354854 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 43354953  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354954 cgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 43355053  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  43355054 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 43355153  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43355154 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 43355252  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  43355253 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 43355352  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  43355353 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 43355394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 10277402 - 10277943
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  10277402 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacagagttttgg 10277501  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277502 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10277601  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10277602 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10277701  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10277702 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10277801  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  10277802 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 10277901  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  10277902 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 10277943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34804757 - 34804216
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34804757 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 34804658  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| |  ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34804657 cgcttttgaacttatgaat--ctctttcttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcaccacgtctaaag 34804560  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |     
T  34804559 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgt 34804460  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34804459 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 34804360  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||  ||||| |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  34804359 aacgagagacaagtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactt 34804260  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  34804259 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 34804216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 40222164 - 40222705
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40222164 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40222263  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40222264 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40222363  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  40222364 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 40222463  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40222464 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 40222563  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  40222564 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 40222663  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  40222664 aatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 40222705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 40251025 - 40251566
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40251025 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40251124  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40251125 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40251224  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  40251225 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 40251324  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40251325 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 40251424  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  40251425 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 40251524  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  40251525 aatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 40251566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 4220312 - 4220827
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4220312 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 4220411  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220412 cgcttttgaacttatgtatctctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 4220511  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |     
T  4220512 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgt 4220611  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4220612 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 4220711  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  4220712 aatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactt 4220811  T
Q  498 tggatcttcagtttga 513  Q
    || |||||||||||||    
T  4220812 tgaatcttcagtttga 4220827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 43093094 - 43093601
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43093094 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 43093193  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43093194 cgctttttaacttatgtatctctatattttatcttcaagtc-------ctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 43093286  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43093287 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 43093386  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43093387 aacttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 43093486  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  43093487 cgagagacaagtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttt 43093586  T
Q  499 ggatcttcagtttga 513  Q
    | |||||||||||||    
T  43093587 gaatcttcagtttga 43093601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 10266825 - 10267366
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  10266825 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttttagaatcaaattgacaaagttttgg 10266924  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266925 cgcttttaaacttatgtatctctctctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 10267024  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  10267025 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 10267124  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10267125 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 10267224  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  10267225 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 10267324  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  10267325 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 10267366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22915261 - 22914720
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22915261 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 22915162  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    || |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915161 cgtttttgaacttatgtatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22915062  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22915061 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 22914962  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22914961 aaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22914862  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  22914861 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 22914762  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22914761 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22914720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 32217705 - 32218246
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32217705 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 32217804  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217805 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 32217904  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  32217905 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 32218004  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32218005 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 32218104  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  32218105 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 32218204  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||| ||||||| || ||| || |||  |||||||||||||    
T  32218205 aatctttagtttgattaaatg-atcaaacatagcttctggtga 32218246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 43345239 - 43345779
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43345239 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 43345338  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345339 cgcttttaaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 43345438  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  | ||    
T  43345439 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcatttccatcttgagtgtac 43345538  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43345539 a-attctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 43345637  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  43345638 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccattgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 43345737  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  43345738 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 43345779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1099592 - 1099079
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1099592 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 1099493  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099492 cgcttttgaacttatgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 1099393  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  1099392 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 1099293  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1099292 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 1099193  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  1099192 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 1099093  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     ||||| |||||||    
T  1099092 aatctttagtttga 1099079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 43082485 - 43082992
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43082485 atacaatacaataaagactctagactttgactttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 43082584  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082585 cgctttttaacttatgtatctctatattttatcttcaagtc-------ctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 43082677  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  43082678 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 43082777  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43082778 aacttctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 43082877  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    |||  || || ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  43082878 cgagagataagtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttt 43082977  T
Q  499 ggatcttcagtttga 513  Q
    | |||||||||||||    
T  43082978 gaatcttcagtttga 43082992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 27221212 - 27221754
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27221212 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 27221311  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27221312 cgcttttaaacttatgtatatctctgttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 27221411  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  27221412 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 27221511  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27221512 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 27221611  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  27221612 acgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 27221711  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  27221712 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27221754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9773701 - 9773162
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  9773701 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtaaaatcaaattgacagagttttgg 9773602  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773601 cgcttttgaacttatgtatctctgttt-taatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9773504  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9773503 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9773404  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9773403 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9773304  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  9773303 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 9773204  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9773203 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9773162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11395569 - 11395028
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11395569 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 11395470  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395469 cgcttttaaacttatgtatctctctcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 11395370  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  11395369 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 11395270  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11395269 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 11395170  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  11395169 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 11395070  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  11395069 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 11395028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11405885 - 11405344
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11405885 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 11405786  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11405785 cgcttttaaacttatgtatctctctcttgaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 11405686  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  11405685 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 11405586  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11405585 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 11405486  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  11405485 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 11405386  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  11405385 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 11405344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22960729 - 22960188
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22960729 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 22960630  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    || |||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960629 cgtttttgaacttatgtatctctatatacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 22960530  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||    
T  22960529 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattctcatcttgagtgtac 22960430  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22960429 aaattctgcaggcatggctattgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 22960330  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  22960329 tgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttg 22960230  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  22960229 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 22960188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27978779 - 27978269
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27978779 atacaatgcaataaagactctagacttatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 27978680  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
     ||||||| ||||| | |   ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27978679 acgctttt-aacttatgttgatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 27978581  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  27978580 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaagg 27978482  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27978481 aacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgat 27978383  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27978382 aacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactt 27978283  T
Q  498 tggatcttcagttt 511  Q
    || |||||||||||    
T  27978282 tgaatcttcagttt 27978269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 4209720 - 4210263
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  4209720 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttga 4209819  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209820 cgcttttgaacttatgtatctctgtctctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 4209919  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |     
T  4209920 agtcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcatttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgt 4210019  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4210020 acaaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatt 4210119  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    || ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  4210120 aatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactt 4210219  T
Q  498 tggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    || ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  4210220 tgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 4210263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 39170492 - 39169979
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39170492 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 39170393  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170392 cgcttttaaacttatgtatctctatctaaaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 39170293  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  39170292 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 39170193  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39170192 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 39170093  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  39170092 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 39169993  T
Q  500 gatcttcagtttga 513  Q
     |||||||||||||    
T  39169992 aatcttcagtttga 39169979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 35252813 - 35253355
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35252813 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 35252912  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252913 cgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35253012  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35253013 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35253112  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35253113 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35253212  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35253213 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35253312  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35253313 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35253355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 35263422 - 35263964
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35263422 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 35263521  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263522 cgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35263621  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35263622 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35263721  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35263722 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35263821  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35263822 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35263921  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35263922 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35263964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 35274047 - 35274589
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35274047 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 35274146  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35274147 cgcttttgaacttatgtatatctctattttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 35274246  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  35274247 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 35274346  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35274347 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 35274446  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  35274447 atgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 35274546  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  35274547 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35274589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9763165 - 9762626
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  9763165 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtaaaatcaaattgacagagttttgg 9763066  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763065 cgcttttgaacttatgtatctctgttt-taatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 9762968  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9762967 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 9762868  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9762867 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 9762768  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  9762767 agagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 9762668  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  9762667 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 9762626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18393034 - 18392493
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18393034 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 18392935  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18392934 cgcttttgaacttatgtatatttctctcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatagtcagcacgtctaaagag 18392835  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  18392834 tcgtttggaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 18392735  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18392734 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 18392635  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
     ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  18392634 tgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 18392535  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  18392534 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 18392493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28065308 - 28064798
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28065308 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 28065209  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa 197  Q
     ||||||| ||||| | |   ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28065208 acgctttt-aacttatgttgatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaa 28065110  T
Q  198 gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagg 297  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  28065109 gagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaagg 28065011  T
Q  298 cacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtt 397  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28065010 aacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgat 28064912  T
Q  398 aacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactt 497  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28064911 aacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactt 28064812  T
Q  498 tggatcttcagttt 511  Q
    || |||||||||||    
T  28064811 tgaatcttcagttt 28064798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 26879492 - 26880006
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  26879492 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaataagtgcagaaattcagtgtgctttgttgaatcaaattgacagagttttg 26879591  T
Q  100 gcgcttttg-aacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaag 198  Q
     |||||||  ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26879592 acgcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaag 26879691  T
Q  199 agtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggc 298  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26879692 agtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagcaatcctttgtctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaagga 26879790  T
Q  299 acatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26879791 aca-attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgtta 26879889  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | |||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||    
T  26879890 atgaaggataagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctaattt 26879989  T
Q  499 ggatcttcagtttgaat 515  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26879990 gaatcttcaggttgaat 26880006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30489221 - 30488679
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  30489221 atacaatacagaaaagactctagactatgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 30489122  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489121 cgcttttgaacttatgtatatctctatataatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 30489022  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||   | |    
T  30489021 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcgttcccatcttgagttgta 30488922  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30488921 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 30488822  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  30488821 atgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 30488722  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||| ||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  30488721 gaatctttagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 30488679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 16768774 - 16769198
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16768774 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttga 16768873  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768874 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatataaaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 16768973  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16768974 tcgtttgaaatcctttgattattcaccagtaatactttgcctgatttgggtgtggtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 16769073  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16769074 aacttctgcaggcatgactgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 16769173  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatc 424  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  16769174 cgagagacaagtgctcagtgctatc 16769198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 36785196 - 36784657
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  36785196 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 36785097  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  36785096 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctgaccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 36784998  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  36784997 agagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatttgagggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 36784898  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||       |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36784897 gaaca-attctgcaggc-------ttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 36784806  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    || |||||||||| |   ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||    
T  36784805 tagcgaaggacaagtatccaatgctttccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagatgaggttgaaacgaaaaacagctcct 36784707  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || || || ||||||||||||||||    
T  36784706 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgat 36784657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 967901 - 967356
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  967901 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcatatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttt 967802  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    | ||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  967801 gacgctttt-aacttgtgttgatgtctcttaccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 967703  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||| | || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  967702 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 967604  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  967603 ggaacat-ttctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 967506  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  967505 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 967407  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  967406 tttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgat 967356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 17969607 - 17969146
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  17969607 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttatagaatcaaatttggcagagtttt 17969508  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17969507 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 17969409  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17969408 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaa 17969310  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17969309 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgttttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 17969212  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 461  Q
    | || ||||||| |   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969211 tcaatgaaggacgagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 17969146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24427983 - 24427667
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24427983 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 24427884  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  24427883 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttaagatgattagcacgtctaaaga 24427784  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24427783 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgactgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 24427685  T
Q  300 catattctgcaggcatag 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  24427684 caaattctgcaggcatag 24427667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 24274856 - 24275400
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||    
T  24274856 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattaaaagtgttttatagaatcaaatttggcagaatttt 24274955  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  24274956 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 24275054  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||| | || |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24275055 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgacggatcaaattcaaattcattcctatcttgaa 24275153  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24275154 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 24275251  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||| || |||||||| |    
T  24275252 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcc 24275350  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  24275351 tttgaaacttcagtttaaat-tactgatcaactgtagcttctggtgatgat 24275400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 22774189 - 22774736
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||     
T  22774189 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatttgacagagttta 22774288  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  22774289 ggcgctttt-aacttgtatgttgtctcttatcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggttagtagagagacgttgagatcctttagcacgtcta 22774387  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22774388 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaa 22774486  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22774487 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 22774584  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
    | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||     
T  22774585 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctc 22774683  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| | ||||| |||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||    
T  22774684 ctttgaaacttcaatttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatgat 22774736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 22763485 - 22764032
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||||||     
T  22763485 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcacagtgctttatagaatcaaatttgacagagttta 22763584  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagat-aatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||    || |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||   | ||||||||||    
T  22763585 ggcgctttt-aacttgtatgttgtctcttatcaattttcaagtctttactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatcctttagcacgtcta 22763683  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||| ||| | || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22763684 aagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttggatgttctcctatgacggatcaagttcaaatccattcctatcttgaa 22763782  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22763783 ggaacat-ttctgcaggtagagctggtgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactct- 22763880  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagcta 494  Q
    | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||     
T  22763881 tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctc 22763979  T
Q  495 ctttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||| | |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||    
T  22763980 ctttgaaacttcagtttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatgat 22764032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 205 - 513
Target Start/End: Original strand, 4099819 - 4100128
Alignment:
Q  205 ttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  4099819 ttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtacaaat 4099918  T
Q  305 tctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaa 403  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  4099919 tctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgag 4100018  T
Q  404 ggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatc 503  Q
     ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || ||||||||||| |||    
T  4100019 agacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatc 4100118  T
Q  504 ttcagtttga 513  Q
    || |||||||    
T  4100119 tttagtttga 4100128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 313 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24425635 - 24425403
Alignment:
Q  313 catagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactg 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24425635 catagttgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaata 24425537  T
Q  413 ctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttg 512  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24425536 ctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttg 24425437  T
Q  513 aatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  24425436 aatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 24425403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19498389 - 19497843
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  19498389 atacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcacagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 19498290  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     |||| |||| ||||||| |  || ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  19498289 gggcgttttt-aacttgtgttgatgtctcttaaa-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtct 19498192  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||| |    
T  19498191 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcatgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaattcattcctatcttaa 19498093  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498092 aggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagagtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19497994  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc-tttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagct 493  Q
     | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||  ||||||| ||| | | ||||||| ||||||||   | || ||| || ||||||||    
T  19497993 -tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctccctttttagtccttcgtt-ttcttagacgggattaaaacgaaaaacagct 19497896  T
Q  494 actttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||| | ||||||||| ||||||   || || | |||||||||||||||||    
T  19497895 cctttgaaacttcagtttaaatatactgatcaactatagcttctggtgatgat 19497843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28374595 - 28374397
Alignment:
Q  317 gctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28374595 gctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactca 28374496  T
Q  417 gagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28374495 gtgctctccaactgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 28374397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 19356163 - 19356545
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaa-ttcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||| |    
T  19356163 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggtagagttttggcgctttt-a 19356261  T
Q  110 acttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    |||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||     
T  19356262 acttgtgttgatttctctttg--atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtctaaagagtcgtt- 19356358  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
    ||  ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  19356359 gagttcctttgatcatccatcagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attc 19356457  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||  | ||| | |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19356458 tgcaggcagagctgttaacttgtcttgtaacgaggagacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgccaactct 19356545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19313416 - 19313020
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| ||||||||    
T  19313416 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcagagttt 19313317  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||||   || |||||  || |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  19313316 gggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactttcttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtct 19313219  T
Q  195 -aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
     ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||| | ||||||    
T  19313218 taaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatttctatcttg 19313120  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19313119 aaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacactcagagttgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 19313021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 4099645 - 4099822
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4099645 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 4099744  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4099745 cgcttttgaacttatgtatctctgtctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttga 4099822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19300409 - 19299959
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||  |||| ||  |||| || |||||    
T  19300409 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgtagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcaaagttt 19300310  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||||   || |||||  || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||  | |||||||||    
T  19300309 gggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtattcacttttttatatagaggtgtgtggagagacgttgagatcttaagcacgtct 19300212  T
Q  195 -aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
     ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  19300211 taaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggataaacttcaaattcattcctatcttg 19300113  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19300112 aaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtctggtagcgtagacacactcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 19300014  T
Q  394 tgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
    | | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  19300013 t-tcaatgaaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 19299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20646873 - 20646610
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  20646873 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatccacca 20646775  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttg 328  Q
     || || ||||||| ||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  20646774 gtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgcaggcagagctgttttcttg 20646676  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646675 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 20646610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 273 - 546
Target Start/End: Original strand, 22779842 - 22780114
Alignment:
Q  273 ttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 372  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22779842 ttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgt 22779940  T
Q  373 acacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  22779941 acacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttc-tcttagac 22780038  T
Q  472 aaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt-gaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||| || |||||||| ||||| | ||||| |||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||    
T  22780039 gaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcaatttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatgat 22780114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 391
Target Start/End: Original strand, 1083798 - 1084061
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||  ||||    
T  1083798 ttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaagcctt-gatcaatcacc 1083896  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ct 326  Q
    |||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||    
T  1083897 aatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 1083995  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaac 391  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1083996 tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 1084061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 1041980 - 1042063
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1041980 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatca 1042063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23392982 - 23392735
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | | ||||||| |||||||  |||||||  |||||    
T  23392982 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaatc--ttgatcaatcacca 23392885  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtc-tt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||| | ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  23392884 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatttctattctgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatcatt 23392786  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||    ||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23392785 gtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacactt 23392735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24814813 - 24814633
Alignment:
Q  215 ttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggca 314  Q
    |||||||  |||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| |||||||||||    
T  24814813 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggca 24814715  T
Q  315 tagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
     ||||||| | |||||||||||| || || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24814714 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 24814633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 542
Target Start/End: Original strand, 16777117 - 16777226
Alignment:
Q  432 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgta 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | | || ||| |||    
T  16777117 ccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgta 16777215  T
Q  532 gcttctggtga 542  Q
    |||||||||||    
T  16777216 gcttctggtga 16777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 22755254 - 22755516
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||||| || | |||| |||||  ||||||    
T  22755254 atcttcaaatctttactcctttatatagaggttgaaaagagacgttgggacctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctt-gatcagtcaccaa 22755351  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || |||| |||||||||   | ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||| | ||||    
T  22755352 tgatcttttgtctgatttggatattgtcatatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcagacagagctgttatacttg 22755450  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca-cttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22755451 tcttgtagcgcagacaaaa-cagagtagtggaagtagtggtcgtacaccttgtactttgtcaactct 22755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28712007 - 28711765
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |  ||   |||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  28712007 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtaaattgtcagcacattcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 28711910  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| | |   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  28711909 cttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 28711811  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
     |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28711810 ttagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28711765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 445 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28379806 - 28379736
Alignment:
Q  445 cctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28379806 cctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 28379736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24801864 - 24801814
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24801864 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagat 24801814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 176
Target Start/End: Original strand, 44880954 - 44880999
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44880954 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 44880999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 22317384 - 22317626
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |    
T  22317384 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatgat 22317481  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | ||| |||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| |  |||||||| ||||| || |||||||||    
T  22317482 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacat-tgttgcaggcagagctgtttttcttgtctt 22317580  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    | ||    || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22317581 gcagcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatactt 22317626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6574435 - 6574191
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   || ||| |  ||   |||||||||||||   |||||||||  |||||||      
T  6574435 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccaacacattcaaaatagagtcgtttgaa--gctttgatcaatcaccaatga 6574338  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 331  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||| || |||||| |    
T  6574337 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctt-tgcaggcagagctgtttttcttgttt 6574239  T
Q  332 tgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574238 tgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6574191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 20567920 - 20567966
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20567920 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaatgagacgttg 20567966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 21845934 - 21845980
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845934 atcttcaggtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21845980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 24575821 - 24575866
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24575821 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 24575866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 181
Target Start/End: Original strand, 1089149 - 1089201
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1089149 ttatcttcaggtcttcactcctttatatagaggagtgaaagagtcgttgagat 1089201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1587340 - 1587300
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587340 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1587300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 6392426 - 6392466
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6392426 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 6392466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9015677 - 9015637
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9015677 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9015637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19114875 - 19114915
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114875 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 19114915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22455297 - 22455257
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455297 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 22455257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22785962 - 22785922
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22785962 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 22785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Original strand, 24157629 - 24157701
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||    
T  24157629 ttcaagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttgttgattgtcagcacatcaaaagagtcgtt 24157701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24850975 - 24850935
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24850975 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 24850935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28551226 - 28551186
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28551226 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 28551186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 33074018 - 33074058
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33074018 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 33074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34322244 - 34322204
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34322244 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 34322204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 40331879 - 40331919
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40331879 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 40331919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41122027 - 41121987
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41122027 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 41121987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 44840226 - 44840266
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44840226 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 44840266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Original strand, 22383266 - 22383341
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg-agataatcagcacgtctaaagagtcgtt 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  22383266 atcttcaagtcttcacttatttatatagaggtgtaaaagagacgttgtagattttcagcacatcaaaagagtcgtt 22383341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23184612 - 23184573
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184612 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 23184573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23595875 - 23595836
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23595875 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 23595836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Original strand, 24843992 - 24844035
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24843992 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 24844035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28701521 - 28701482
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28701521 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 28701482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Original strand, 18702533 - 18702571
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18702533 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 18702571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 22271918 - 22271964
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22271918 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtttgagagagacgttg 22271964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 175
Target Start/End: Original strand, 24376895 - 24376933
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376895 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgt 24376933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30557626 - 30557588
Alignment:
Q  140 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557626 tcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 30557588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31801195 - 31800954
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  |||||||  ||    
T  31801195 agtctttactccgttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaatgatc 31801098  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
     |||||||||| |||   | |||||  |||  || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  31801097 ttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 31800999  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31800998 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 31800954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10010065 - 10010020
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010065 tctttaagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 10010020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18431252 - 18431207
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18431252 tcttcaggtcttcactcctttatatagatgtgtgaaagagacgttg 18431207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21025575 - 21025530
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025575 cagagtcgtggaggaagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 21025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39037952 - 39037911
Alignment:
Q  136 caagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39037952 caagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 39037911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20152308 - 20152268
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20152308 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20152268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20569059 - 20569019
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20569059 aagtcttcactcttttatatagaggtgtgaaagagacgttg 20569019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21537559 - 21537519
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537559 aagtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21537519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 24779165 - 24779205
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24779165 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgtaagagacgttg 24779205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 25189189 - 25189229
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25189189 aagtcttcactcctttatatagaggtgtaaaagagacgttg 25189229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28140911 - 28140871
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28140911 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 28140871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28551057 - 28550985
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28551057 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 28550985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31328104 - 31328033
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31328104 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31328033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31334825 - 31334754
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31334825 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 33074187 - 33074259
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33074187 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 33074259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 40782268 - 40782308
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40782268 aagtattcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 40782308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 383
Target Start/End: Original strand, 20568134 - 20568173
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20568134 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 20568173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26619406 - 26619372
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26619406 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 26619372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28701350 - 28701296
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28701350 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacactt 28701296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31968164 - 31968110
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31968164 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 31968110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31968351 - 31968317
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31968351 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 31968317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 22802460 - 22802493
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802460 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 44840430 - 44840467
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44840430 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 44840467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15670932 - 15670888
Alignment:
Q  133 cttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15670932 cttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagatacgttg 15670888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19540207 - 19540247
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19540207 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagaaacgttg 19540247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 22257992 - 22258032
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22257992 aagtcttcagtcctttatgtagaggtgtgaaagagacgttg 22258032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22776427 - 22776355
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22776427 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22776355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22781805 - 22781733
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22781805 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22781733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 22802253 - 22802293
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22802253 agtcttcactcctttatatatagttgtgaaagagacgttga 22802293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30557459 - 30557388
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557459 tgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagac-aaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30557388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39037781 - 39037709
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39037781 tgcaggcatagctgttatccttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 39037709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13964282 - 13964247
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13964282 ttcactcctttatatggaggtgtgaaagagacgttg 13964247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41121856 - 41121789
Alignment:
Q  309 caggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 375  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41121856 caggcatagctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 41121789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10898838 - 10898792
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10898838 atctttaagtcttcaatcatttatatagaagtgtgaaagagacgttg 10898792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19320722 - 19320676
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19320722 atcttcaagttttcattcctttatatagaggtatgaaagatacgttg 19320676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 22683165 - 22683211
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22683165 atcttcaagtcttcattcatttatataaaggtatgaaagagacgttg 22683211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 27939766 - 27939812
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27939766 atcttcaagtctttattcctttatatagtggtatgaaagagacgttg 27939812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1587133 - 1587100
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1587133 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1587100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24440826 - 24440789
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24440826 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 24440789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24441027 - 24440986
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24441027 aagtcttcactccttcatatagaagtgtgaaagatacgttga 24440986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26619201 - 26619168
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26619201 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 26619168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 40332083 - 40332120
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40332083 gacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacactt 40332120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22188241 - 22188169
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22188241 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 22188169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22785794 - 22785722
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||   || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22785794 tgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagataaagacagagtagtggagatagtggttatacactt 22785722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 24377062 - 24377134
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24377062 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 24377134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 24575996 - 24576068
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24575996 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 24576068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 38781189 - 38781229
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  38781189 aagtcttcactcctttatatatagttgtgatagagacgttg 38781229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 54541 - 53997
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  54541 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttg 54442  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54441 gcgctttttaacttgtatatctcacttctcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataattagcacgtctaaaga 54342  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54341 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 54242  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54241 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcatggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 54143  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  54142 cgcaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttg 54043  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatga 545  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54042 gatcttcagtttgagtatatggattaaatgtagcttctggtgatga 53997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 14421 - 14934
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14421 atacaatacaattaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaacttgacagagttttg 14520  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14521 gcgcttttgaacttgtatatctctatatcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 14620  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14621 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggta 14720  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14721 caaattctgcaggcatggctgttgtcttgtcttgtagcgtagacagaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 14820  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  14821 acgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctacttt 14920  T
Q  499 ggatcttcagtttg 512  Q
    | |||||| |||||    
T  14921 gaatcttccgtttg 14934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5915 - 5674
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| |  ||   ||||||||||| || | ||||||||  ||||||   ||    
T  5915 agtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga-attgccagcacattcaaaatagagtcgtttg-aagcttttgatcaatcaccaacgatc 5818  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
    |||||| |||| |||   | ||||  ||||| || || || |||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||| | ||||| || ||||||||||    
T  5817 ctttgcttgatatggttattgtccaatgaaggatcagtttaaaatgcattcccatagtgaaggaacatcat-tgcaggtagagctgtttttcttgtcttg 5719  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5718 tagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 42938 - 42393
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  42938 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagtttcg 42839  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42838 gcgctttttaacttgtgtatctctttctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaggagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 42739  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42738 gtcgtttgaaatcctttgatcattcaccaataatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaggaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 42639  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42638 caaattctgcaggcatagctgatgtcttgtcttgtagcgaggac-aaaacagagtagtggaggtagtcgttgtacacttgtacgttgtcaactctgttaa 42540  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42539 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 42440  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  42439 gatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 42393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 30970 - 31511
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30970 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 31069  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070 cgcttttaaacttatgtatctctatcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 31169  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  31170 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagtgtac 31269  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31270 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 31369  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  |||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||||    
T  31370 cgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttg 31469  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  31470 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtga 31511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 2636 - 2091
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2636 atacaatacgttaaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 2537  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2536 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgatttgcacgtctaaaga 2437  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2436 gtcgtttgtaatcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgattttggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 2337  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2336 caaaatctgcaagcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggac-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaa 2238  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2237 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacatctactttt 2138  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2137 tatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 33320 - 32776
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33320 atacaatacaataaagactataaacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 33221  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33220 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 33121  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33120 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 33022  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33021 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 32923  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32922 cgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccctttcaattattcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttg 32823  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  32822 gatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 32776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 40871 - 40330
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40871 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 40772  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40771 cgcttttgaacttatgtatatctctatttaatcttcaagtcttcactcttttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 40672  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  40671 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 40572  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40571 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 40472  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  40471 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 40372  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  40371 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 40330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 9701 - 9737
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9701 aagtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagac 9737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11019 - 10505
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11019 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 10920  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10919 gcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 10820  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10819 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 10721  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 10621  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | || || | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10620 cgaaggacaaatacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacagctactttg 10521  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  10520 aatcttcagtttgaat 10505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8172 - 7658
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  8172 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtataatcaaattgacagagttttg 8073  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8072 gcactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagaggattagcacgtctaaaga 7973  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7972 gtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 7874  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7873 caaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 7774  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||||||||| | ||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7773 cgaaggacaaatactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacaactactttg 7674  T
Q  500 gatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||    
T  7673 aatcttcagtttgaat 7658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 6719
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  7260 atacaatacagtaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagtatcaaattgacagagttttgg 7161  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7160 cgcttttgaacttatgtatctctatcttttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 7061  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7060 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaacgtac 6961  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6960 aacttctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 6861  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6860 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 6761  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  6760 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 6719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 37152 - 36607
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37152 atacaatacaataaagactctagacttttgaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttg 37053  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaaga 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37052 gcgctttttaacttgtgtatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaaga 36953  T
Q  200 gtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggca 299  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36952 gtcgtt-gagttcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaa 36854  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36853 cat-ttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgttaactctgtta 36755  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  36754 acgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctacttt 36655  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | |||| |||||| ||| || | || || |||||||||||||||||||    
T  36654 gaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 36607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 12195 - 12735
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12195 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 12294  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12295 cgcttttgaacttatgtatctctgtttttaatcttcaagtcttca-tcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 12393  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcac 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12394 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgattctttgcctgatttaggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgagtgtac 12493  T
Q  301 atattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaa 399  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12494 aaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagagtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaa 12593  T
Q  400 cgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttg 499  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  12594 cgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttaaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttg 12693  T
Q  500 gatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
     ||||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||||    
T  12694 aatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 12735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 7799 - 8341
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7799 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 7898  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7899 cgcttttgaacttatgtatatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatagtcagcacgtctaaagag 7998  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  7999 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 8098  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8099 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 8198  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  | ||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  8199 atgagaggcaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 8298  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  8299 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 37376 - 36834
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37376 atacaatacagaaaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgg 37277  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagag 200  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37276 cgcttttgaacttatgtatatctctatcaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatagtcagcacgtctaaagag 37177  T
Q  201 tcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga-aggca 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |    
T  37176 tcgtttgaaatcctttgattatccaccagtgatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgta 37077  T
Q  300 catattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtta 398  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37076 caaattctgcaggcatggctgttgttttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatta 36977  T
Q  399 acgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    | ||  | ||| ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  36976 atgagaggcaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 36877  T
Q  499 ggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtga 542  Q
    | ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  36876 gaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 47778 - 47468
Alignment:
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag-gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtct 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47778 tcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataaacttcaaattcattcccatcttgagttgtacaaattctgcaggcatggctgttgttttgtct 47679  T
Q  332 tgtagtgtggaca-aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatg 430  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||||| | |||||| ||     
T  47678 tgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgttatccatata 47579  T
Q  431 accgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgt 530  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || | | || ||||||    
T  47578 tccgttgatacctccctttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgt 47480  T
Q  531 agcttctggtga 542  Q
    ||||||||||||    
T  47479 agcttctggtga 47468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 35 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13989 - 13511
Alignment:
Q  35 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  |||     
T  13989 ctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtgaaatcaaattgacagagttttggcgctttttaacttgtatatctctatctccaatcc 13890  T
Q  135 tcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || ||    
T  13889 tcaagtcttcactcctttatatagaggcgtgaaagagacgttgagatgattaccacgtctaaagagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatc 13791  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13790 ctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaataagcttcaaattcattcccatcttgaaggaata-attatgcaggcatagctgttgtcttgtcttgt 13692  T
Q  335 agtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccg 434  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||    |||||||||    
T  13691 agcgtggacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaggacaaatactcagtgcttctgaaatgaccg 13592  T
Q  435 ttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13591 ttgatacctccctttcgattcttcgttttccttagatgaggttgaaatgagaaacaactactttgaatcttcagtttgaat 13511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 187 - 546
Target Start/End: Original strand, 2824 - 3182
Alignment:
Q  187 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2824 gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtactcctttgaagaataagcttcaaattcattcc 2923  T
Q  287 catcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttg 386  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2924 catcttgagggcacaaattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaa-cagagtagtggaggtattggttgtacacttgtactttg 3022  T
Q  387 tcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgaga 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3023 tcaactctgttaacgaaggacaaatgctaagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttcttcttagattaggttgaaatgaga 3122  T
Q  487 aacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3123 aacagctactttggaccttcagtttgaatatatggattaattgtagcttctggtgatgat 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 2528 - 2610
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12535 - 11989
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  12535 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctgagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaatgtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 12436  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  12435 ggcgctttt-aacttgtgttaatgtctctggccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaaatttttagcacgtctaa 12337  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  12336 agagtcgtttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 12237  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12236 gaaca-attctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 12138  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  12137 taacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 12039  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  12038 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 11989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 272 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16092 - 15820
Alignment:
Q  272 cttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16092 cttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attctgcaggcggagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgtaggtagtggttg 15994  T
Q  372 tacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||| |   ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15993 tacacttgtactttgtcaacttttatattgaatgacaagtatccattgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-ccttagat 15895  T
Q  472 aaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||   || || || ||||||||||||||||    
T  15894 gaggttgaaacgaaaatcagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgat 15820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 5133 - 5643
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  5133 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 5232  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5233 ggcgctttt-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 5331  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5332 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 5430  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5431 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactctga 5529  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||    
T  5530 taacgaaggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcct 5628  T
Q  497 ttggatcttcagttt 511  Q
    ||| |||||||||||    
T  5629 ttgaatcttcagttt 5643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 511
Target Start/End: Original strand, 12896 - 13038
Alignment:
Q  368 gttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12896 gttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc-tctt 12994  T
Q  468 agataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagttt 511  Q
    |||  ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12995 agacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagttt 13038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 67 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 52457 - 51974
Alignment:
Q  67 tgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52457 tgtgctttgtagaatcaaattgacagagttttgacactttttaacttgtatatctctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtga 52358  T
Q  167 aagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaaga 266  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52357 aagagacgttgagatgattaacacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcattcatcagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaga 52258  T
Q  267 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtag----tgtggacaaaaacagagtagtggagg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||     || ||||||||||||||||||||||    
T  52257 attagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgttatcttgtcttgcagcgtaggtagacaaaaacagagtagtggagg 52159  T
Q  363 tagtggttgtacacttgtac-tttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 461  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52158 tagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 52059  T
Q  462 cttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||  |||||||||||||||||||    
T  52058 cttattagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaatttactgattagttgtagcttctggtgatgat 51974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 175162 - 175707
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactt-tgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  175162 atacaatgcaataaagactctagacttgtgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagacattcaaggtgctttgtagaatcaaatttgacagagtttt 175261  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  175262 ggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttgccaatcttaaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacgtctaa 175360  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  175361 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaag 175459  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  175460 gaacat-ttctgcaaacaaagctgttgtcttgtcctgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 175558  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    | | ||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| |||| ||    
T  175559 tgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagactaggttgaaacgaaaaatagctcct 175657  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || || || ||||||||||||||||    
T  175658 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgat 175707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40632 - 40369
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||    
T  40632 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggttgtagagagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatttaccaa 40534  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  40533 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcaaagctgttatacttg 40435  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40434 tcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 40369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 350 - 546
Target Start/End: Original strand, 180424 - 180619
Alignment:
Q  350 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  180424 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 180523  T
Q  450 caattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||   || || || ||||||||||||||||    
T  180524 caattcttcgttc-tcttagactaggttgaaacgaaaaatagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgat 180619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 59178 - 58915
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||    
T  59178 atcttaaagtcttcactcctttatatagaggttttagagagacgttgagacctttaagcacgtctaaagagtcgtt-gagaacctttgatcatttaccaa 59080  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  59079 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgttatacttg 58981  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||||||   ||| || |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  58980 tctcgtagtgcaaacacaagcagattcgtggaggtagtgattgtacaattgtactttgtcaactct 58915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 10706 - 10161
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  10706 atacaatgcaataaattctctagacttgagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttgtagaatcaaatttggcagagtttt 10607  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |  || ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  10606 ggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttggcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttagcacatctaa 10508  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  10507 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttaaag 10409  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10408 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctga 10310  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |  | |||||||| ||    
T  10309 taacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttatacgaggttgagacaaaaaacagctcct 10211  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||   || |  |||||||||||||||||||    
T  10210 ttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 10161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 224 - 546
Target Start/End: Original strand, 1 - 323
Alignment:
Q  224 caccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg 323  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1 caccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaatttattcccatcttgaaggcacaaattctgcaggcatagctgttg 100  T
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctat 423  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  101 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctat 200  T
Q  424 ccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaat 523  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  201 ccaaatgaccgttgataccttcctttcaattcttcatttttcttagactaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaatatacgaat 300  T
Q  524 taaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  301 caattgtagcttctggtgatgat 323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 6)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 57201 - 56691
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  57201 atacaatgcaataaagactctagacttgagtaattctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttgacagagtttt 57102  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
    ||||||||| ||||||| |  || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  57101 ggcgctttt-aacttgtgttgatatctcttttcaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcta 57003  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  57002 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaa 56904  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56903 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctg 56805  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaa-cagcta 494  Q
     |||||||||| || | | | | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| |||||     
T  56804 ataacgaaggaaaatttccccgtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaaccagctc 56706  T
Q  495 ctttggatcttcagt 509  Q
    ||||| ||| |||||    
T  56705 ctttgaatcgtcagt 56691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 691 - 464
Alignment:
Q  130 tatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||    
T  691 tatctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcacc 594  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtct 326  Q
    |||  || ||||||||||||    || ||||| | ||| || |  ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  593 aatgatcgtttgcctgatttacttgttgtcctataaaggatcaagttcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 495  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagt 357  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  494 tgtcttgtagcgtagacataaacagagtagt 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 32282 - 32322
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32282 aagtattcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 32322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 49129 - 49169
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  49129 aagtcttcactcctttacatagaggtgtgaatgagacgttg 49169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 454 - 417
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  454 gacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 32452 - 32524
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32452 tgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 32524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 214 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 6423 - 6092
Alignment:
Q  214 tttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggc 313  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  6423 tttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatctttaaggcacaaattttgcaggc 6324  T
Q  314 atagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  6323 atagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaatac 6224  T
Q  414 tcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttga 513  Q
    |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6223 tcagtgcttttcatatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagattatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcag-ttga 6125  T
Q  514 atatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  6124 atttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 6092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 546
Target Start/End: Original strand, 19089 - 19638
Alignment:
Q  26 tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtg-cagaaattcagtgtgcttt-gtagaatcag--tttgacagagtttt-ggcgc---ttttgaacttgtat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||    |||| |||||||||    
T  19089 tttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgacagaaattcagtgtgcttttgtagaatcaaaatttgacagagtttttggcgtctttttttaacttgtat 19188  T
Q  118 atttctctttcttatctt-caa--gtctt-cactccttt---atataga-ggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaa 209  Q
    || ||| | |   ||||| |||  ||||| |||||| ||   ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19189 atatctatctacaatctttcaaaggtctttcactcccttttaatataaaaggtgtgaaagagacgttgagatgattagcacgtctaaagagtcgtttgaa 19288  T
Q  210 atcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtccttt-gaagaatt-agcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19289 atcctttgatcattcaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtccttttgaggaatttaacttcaaattcattcccatcttgaaggcacaaattcg 19388  T
Q  308 gc----aggcata-gctgttgtcttgtcttgtagtgtgg--acaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaac 400  Q
    |     ||||||| | |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19389 gtgtcgaggcataaggtgttgtcttgtcttgtagcgttggaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaat 19488  T
Q  401 gaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttc-aattcttcg-ttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19489 gaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttctaattcttcgtttcttcttaaataaggttgaaatgagaaacagctacttt 19588  T
Q  499 ggatctt-cagtttgaa-tatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19589 ggatcttacagtttgaattttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 19638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17373 - 16828
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaa-gatgtatcaaatca-gtg-cagaaattcagtgtgctttgtagaatcagt-ttgacagagt 95  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17373 atacaatacgttagagactctagacttttgaatttctaaagatgtatcaaatcaagtgtcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaaaattgacagagt 17274  T
Q  96 tttgg-cgc--ttttgaacttgtatatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagata-atcagcacg 191  Q
    ||||| ||   |||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  17273 tttgggcgtcttttttaacttgtatatatctatctacaatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttgagattgattagcacg 17174  T
Q  192 tctaaag-agtcgtttgaaat-cctttgatcatccaccaat-agtcctttgcctgatttgggcgtag-tcctttgaagaattagcttcaaa--ttcattc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||    
T  17173 tctaaagtagtcgtttgaaattcctttgatcattcaccagttaatcctttgcctgatttgggtgtaggtcctttgaggaattaacttcaaaatttcattc 17074  T
Q  286 ccatctt-gaaggcacatattc---tgc-aggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgt-ggacaaaaacagagtagtggaggtagt-ggttgtac-act 377  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17073 ccatctttgaaggcacaaattcgtgtacgaggcataggtgttgtcttgtcttgtagcgttggacaaaaacagagtagtggaggtagtgggttgtactact 16974  T
Q  378 tgtactttgtcaactctgtt--aacgaaggacaactgctcagagcta-tccaaatgaccg-ttga-tacctcc-ctttcaattcttcgttcttcttagat 471  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16973 tgtactttgtcaactctgttaaaacgaaggacaaatactcagtgctattccaaatgaccgtttgattacctcctttttcaattcttcgttcttcttagat 16874  T
Q  472 -aaggttgaaatgagaaac-agctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16873 aaaggttgaaatgagaaacaagctactttggatcttcagtttgaat 16828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 35375 - 35919
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  35375 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 35474  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
     |||||||| ||||||| |  || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  35475 agcgctttt-aacttgtgttgatgtctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgactaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 35572  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35573 aagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaa 35671  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35672 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 35769  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| |  ||||| |||||||| |    
T  35770 tcaaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttc-tcttagacgaggatataatgaaaaacagctcc 35868  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| |  |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  35869 tttgaaatttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgat 35919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 211 - 546
Target Start/End: Original strand, 117148 - 117482
Alignment:
Q  211 tcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgca 310  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  117148 tcctttgatcatccaccagtaatcctttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggaaca-attttgca 117246  T
Q  311 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  117247 ggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagcggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaag 117346  T
Q  411 tgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtt 510  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  117347 tactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacatccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaccagctactttgaatcttcagtt 117446  T
Q  511 tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | ||| ||   || ||||||| ||||||||||||||    
T  117447 taaatttactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 117482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 475569 - 475305
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  475569 atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttaagaaacctt-gatcaaataccaa 475471  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  475470 tgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttg 475372  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  475371 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 475305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 482089 - 481825
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  482089 atcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttaagaaacctt-gatcaaataccaa 481991  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  481990 tgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatcttg 481892  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  481891 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 481825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 156945 - 156681
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  156945 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 156848  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| || ||||    
T  156847 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggtagagctgtttttctt 156749  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||  || |||  |  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  156748 gtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 156681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 140642 - 141105
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  140642 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 140741  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgt-atatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    | ||||||| ||||||| ||  || ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  140742 gacgctttt-aacttgtgatgattgtctcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaa 140840  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtccttt-gaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  140841 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtccttttgaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaa 140939  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  140940 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtaaact-tt 141037  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttct 463  Q
    | || |||||||||   | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  141038 tcaatgaaggacaaacacccagtgctttttaaatgactgttgatacctcccttttaattcttcgttct 141105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 127484 - 128028
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttga-cagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | |||||||||    
T  127484 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttagcagagtttt 127583  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtatat-ttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    | ||||||| ||||| | |   || ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  127584 gacgctttt-aacttctgttgattgtctcttaaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtctaa 127682  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||    
T  127683 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcgtttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaag 127781  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  127782 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttagtcaaatct-t 127879  T
Q  397 taacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctact 496  Q
     || |||||||||   | ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| || | ||| || ||    
T  127880 caatgaaggacaagcacccagtgctttttaaatgaccgttgatacctcccttttaattattcgttc-tcttagacaaggttgaaacgaaagacacctcct 127978  T
Q  497 ttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| | |||||||||  || ||   || || |||||||||||||||||||    
T  127979 ttgaaacttcagtttagatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 128028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7937 - 7674
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||  |||||    
T  7937 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcg-ttgagaacctttgatcatttaccaa 7839  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  |||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  7838 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaacat-ttctgcaggcagagctgttatacttg 7740  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| |  |||| |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7739 tcttgtagcgcagacacactcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 7674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 16443 - 16508
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattca 65  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16443 atacaatgcaataaagactctcgacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattca 16508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 215810 - 215770
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215810 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 215770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 215641 - 215569
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215641 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 215569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 303 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8178 - 7935
Alignment:
Q  303 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8178 attctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacga 8079  T
Q  403 aggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggat 502  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8078 aggacaaatactcagagctaaccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggat 7979  T
Q  503 cttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||| ||  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  7978 cttcagtttgaatttacaaatcaattgtatcttctggtgatgat 7935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 1831 - 2376
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  1831 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatccgtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagtttt 1930  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtcta 195  Q
     |||||||| ||||||| |  || | | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  1931 agcgctttt-aacttgtgttgatgtttttttttaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggtgagtaaagagacgttgagatttttagcacgtcta 2029  T
Q  196 aagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaa 295  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||| |||||||| ||| | || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2030 aagagtcgtt-gagttcctttgatcattcaccattaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaa 2128  T
Q  296 ggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctg 395  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2129 ggaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct- 2226  T
Q  396 ttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctac 495  Q
    | || |||||| |    | ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||| |||| |||  ||||| ||| || |||||||| |    
T  2227 tcaaagaaggaaaggcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatcctacgtt-ttctcagacgaggttaaaacgaaaaacagctcc 2325  T
Q  496 tttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| | ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  2326 tttgaaacttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgat 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Original strand, 40339 - 40749
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||    
T  40339 atacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaatatgtatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagaatttt 40438  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||||||| | ||||||| |  || |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |     ||    
T  40439 ggcgcttct-aacttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcctcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagatttttaaaaaaaaaaa 40537  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    | |     ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  40538 aaaaaaaattgagttcctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaag 40637  T
Q  297 gcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgt 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40638 gaacat-ttctgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctga 40736  T
Q  397 taacgaaggacaa 409  Q
    |||||||||||||    
T  40737 taacgaaggacaa 40749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 484
Target Start/End: Original strand, 15577 - 16049
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgt-agaatcagtttga-cagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  || | |||||||||| ||||||| |    
T  15577 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttgagaaacaaatttagcagagttttgacgctttt-a 15675  T
Q  110 acttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    |||||| |  || ||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||     
T  15676 acttgtgttcatgtctctctttaatcttcaagtctttactcctttaaatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagaacgtctaaagagtcgtt- 15774  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
    ||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | |||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  15775 gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttctaattcattcctttcttgaaggaacat-ttc 15873  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaagga 406  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  15874 tgcaggcagagatgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtaccttgtcaactct-tcaatgaagga 15972  T
Q  407 caactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatga 484  Q
    |||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  15973 caagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattgaaatga 16049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13158 - 12698
Alignment:
Q  85 tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagat 181  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||    
T  13158 tttggcagagttttggcgctttt-agcttgtgttgatgtctcttgccaatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgggat 13060  T
Q  182 aatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattc 281  Q
      | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13059 ttttagcacgtctaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggttgtagtcctttgaagtatcaacttcaaattc 12961  T
Q  282 attcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 381  Q
    ||||| |||||||||| |||| || | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12960 attcctatcttgaaggaacatttttt-catgcatagctgttgtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgta 12862  T
Q  382 ctttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaa 481  Q
    ||||||||||||| | || || ||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  || || |||    
T  12861 ctttgtcaactct-tcaaagagggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgtt-ttcttagacgagattaaaa 12764  T
Q  482 tgagaaacagctactttggatcttcagtt-tgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
     || |||||||| ||||| | ||||||||   ||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  12763 cgaaaaacagctcctttgaaacttcagttcaaaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgat 12698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 59710 - 59316
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  59710 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 59611  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||| |  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  59610 gggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctt-ctgatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtct 59513  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  59512 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttaggtgtagtcctatgaaggatgaacttcaaattcattcctatcttga 59414  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||| |  ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  59413 agg-aca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcctgtagcgaggacacactcagggtcgtggagataatggttgtacacttgtactttgtcaactct 59316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 385
Target Start/End: Original strand, 142894 - 143143
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||| ||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  142894 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcatttgaa--gctttgatcaatcaccaatgat 142991  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || | || ||||    
T  142992 cttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgttttttttttctt 143090  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 385  Q
    ||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143091 gtagcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 143143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1437
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1055 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgacagagtttgggcgctttt-aa 1153  T
Q  111 cttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
    ||||||   || ||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    
T  1154 cttgtagtaatgtctctta-taatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagattttaagcacgtctaaagagtcgtt-g 1251  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    |  ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||   ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  1252 agttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attct 1350  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1351 gcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 1670 - 2052
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaa 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1670 aaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttgacagagtttgggcgctttt-aa 1768  T
Q  111 cttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttg 207  Q
    ||||||   || ||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    
T  1769 cttgtagtaatgtctctta-taatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagattttaagcacgtctaaagagtcgtt-g 1866  T
Q  208 aaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattct 307  Q
    |  ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||   ||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  1867 agttcctttgatcatctaccagtaatcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attct 1965  T
Q  308 gcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1966 gcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 29310 - 29707
Alignment:
Q  1 atacaatacaat-aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  29310 atacaatgcaatgaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagcgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 29409  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtc 193  Q
    |||| ||||| |||||||||  || |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||||||||    
T  29410 tggcactttt-aacttgtattgatgtctctacca-atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttttagcacgtc 29507  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcct-ttgaagaattagcttcaaattcattcccatctt 292  Q
     ||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  29508 caaacagttgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctattgaaggatcaacttcaaattcattcctatctt 29606  T
Q  293 gaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 392  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29607 gaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 29705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 394
Target Start/End: Original strand, 58170 - 58533
Alignment:
Q  31 atttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttttggcgcttttgaacttgtatatttctct-ttc 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | | | ||| ||     
T  58170 atttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgctttttagaatcaaatttggcagagttttggcgctttt-aacttgtgtttatgtctctta 58268  T
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  58269 tgatcttcaagtcttcgctcctttatatagaggtgagtagagatacgttgagatctttagcacgactaaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccacc 58367  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt 327  Q
    | || || |||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  58368 agtaatcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaaca-attctgcaggcagagctgttatctt 58466  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| | ||||| |   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58467 gtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 58533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29217 - 28820
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  29217 atacaatgcaataaaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaattagtgcagaaattcagagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 29118  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc-agcacgtc 193  Q
     ||||||||| ||||||| |  || |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||||||||    
T  29117 gggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctg-ctgatcttcgagtcttcactcctttatatagaggtgagtagagagacgttgagattttttagcacgtc 29020  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||     
T  29019 taaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccaatctta 28921  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggagg-tagtggttgtacacttgtactttgtcaact 392  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28920 aaggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtagaggatagtggttgtacacttgtactttgtcaact 28822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 324 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1533
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctat 423  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| | | |    
T  1755 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataatgaaggacaagtactcagtgttct 1656  T
Q  424 ccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaat 523  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||    
T  1655 tcaaatgaccgttgatacctcccttttaattcttcgttcttcttagatgaggttgaaacgagaaatagctactttgaatcttcagtttaaatttactgat 1556  T
Q  524 taaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  1555 taattgtagcttctggtgatgat 1533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2758 - 2601
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaagactctagactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagttttgg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2758 atacaaaacaataaagactctcgactttgaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcaatttgacagagttttgg 2659  T
Q  101 cgcttttgaacttgtatatttctctttctt--atcttcaagtcttcactcctttatat 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2658 cgcttttgaacttgtatatctctgtttttttaatcttcaagtcttcactcctttatat 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 344 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 35233 - 35031
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||    
T  35233 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtct 35134  T
Q  444 ccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgat 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || | || || ||||||||||||||||    
T  35133 ccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgat 35034  T
Q  544 gat 546  Q
    |||    
T  35033 gat 35031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 307 - 546
Target Start/End: Original strand, 7375 - 7613
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaagga 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7375 tgcaggcagagctgttgtcttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaagga 7474  T
Q  407 caactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttc 506  Q
    |||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| | ||||    
T  7475 caagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttcaatttttcgttc-tcttagacaaggttgaaacgaaagacagctcctttgaaacttc 7573  T
Q  507 agtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||||  || ||   || || |||||||||||||||||||    
T  7574 agtttagatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 7613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 419 - 546
Target Start/End: Original strand, 26995 - 27122
Alignment:
Q  419 gctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatata 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26995 gctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatctttagtttgaatata 27094  T
Q  519 tgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  27095 tggattaaatgtagcttctggtgatgat 27122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 483 - 932
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||  ||||||||    
T  483 atacaatgcaataaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaattttgcagagttt 582  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||||   || |||||  || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||||  | ||||||| |    
T  583 gggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactttcttatatataggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgttt 680  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||    
T  681 aaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttga 779  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  780 aggaaca-attctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 878  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
     | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  879 -tcaatgaaggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 4863 - 5312
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| ||  |||  ||||||||    
T  4863 atacaatgcaataaaagactctaaacttaagaatttctaagatatatcaaatcaatgcagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaattttgcagagttt 4962  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
     ||||||||| ||||||||   || |||||  || |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||||  | ||||||| |    
T  4963 gggcgctttt-aacttgtagtaatgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactttcttatatataggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgttt 5060  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||    
T  5061 aaagagtcgtt-gagtacctttgatcatccaccagtaatcttttgcttgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttga 5159  T
Q  295 aggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5160 aggaaca-attctacaggcagagctgctatcttgtcttgtagtgtagacacgctcagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 5258  T
Q  395 gttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
     | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  5259 -tcaatgaaggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctcccttt 5312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 555 - 950
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||| ||  |||| || |||||    
T  555 atacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtacagaaattcaaagtgcttttgagaaacaaatttggcaaagttt 654  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgt-at-atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcag-cacgtc 193  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||   | |  ||||||    
T  655 tggcgctttt-aacttgtgatgatgtctctg-cagatcttcaagtcttcactccttt-tatagaggtgtgtagagagacgttgagacctttaaacacgtc 751  T
Q  194 taaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttg 293  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  752 caaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttg 850  T
Q  294 aaggcacatattctgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 393  Q
      || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851 tgggaaca-attctgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 60893 - 61276
Alignment:
Q  13 aaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgta-gaatcag-tttgacagagttttggcgcttttga 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| |||||||| ||||||||| |    
T  60893 aaagactctagacttaagaatttctaagatttatcaaatgaacacagaaattcaaagtgctttgtatgaaacaaatttggcagagtttaggcgcttttta 60992  T
Q  110 acttgta-tatt-tctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgttt 206  Q
    ||||||  |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||     
T  60993 acttgtcgtattgtctcta-ctgatcttcaagtcttcactcctttatataaaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtc-aaagagtcgttg 61090  T
Q  207 gaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattc 306  Q
      || |||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||    
T  61091 agaaacctt-gatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacat-ttc 61188  T
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61189 tgcaggcagagctgttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 61276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 212154 - 212393
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgaga-taatcagcacgtctaaa--gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||  ||||||||||||   |||||||||  |||||||  |    
T  212154 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaatagagtcgtttgaag--ctttgatcaatcaccaatgat 212251  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtctt 332  Q
    | ||| |||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| ||||    |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  212252 ctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacat----tgcaggcagagctgtttttcttgtctt 212347  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212348 gtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38417 - 38120
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagactttgaatt-tctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcag-tttgacagagttt 97  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||||||    
T  38417 atacaatgcaataaaagactctagacttaaaaatgtctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaatcaaatttggcagagttt 38318  T
Q  98 tggcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtct 194  Q
    |||||||||| ||||||| |  || |||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  38317 tggcgctttt-aacttgtgttgatgtctctg-ctgatcttcaagtcatcattcctttatataaaggtgagtagagagacgttgagatctttagcacgtct 38220  T
Q  195 aaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttga 294  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  38219 aaagagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttga 38121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 391
Target Start/End: Original strand, 4909 - 5170
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||   |||||||||| | ||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  4909 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgggagagtcgttgagatctttcagcacgtcaatagagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcacca 5006  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    || ||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  5007 atggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 5105  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaac 391  Q
    ||||||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5106 gtcttgtagcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaac 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20695 - 20432
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||||   ||||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  20695 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcagtagagtcgttgtgaaa--cattgatcaatcacca 20598  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| | |||    
T  20597 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg-acat-ttctacaggcagagctgtttttctt 20500  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20499 gtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 425 - 546
Target Start/End: Original strand, 2550 - 2671
Alignment:
Q  425 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatt 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||     
T  2550 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttaaaaatc 2649  T
Q  525 aaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  2650 aattgtagcttctggtgatgat 2671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7431
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 7431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7261 - 7228
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7261 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 7228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18127 - 17861
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatc--agcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |   |||||||||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  18127 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgtagagagacgttgagatcttttaagcacgtctataaagtcgtt-gagaacctttgatcattcacc 18029  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tct 326  Q
    | |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  18028 attgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcaggcagagctgtttatct 17930  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17929 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 17861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3043 - 2802
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaaa---gagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  |||   ||||||||||||  | ||||||||  |||||||  ||    
T  3043 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-attctcagcacattcaaaatagagtcgtttgaag-cttttgatcaatcaccaatgatc 2946  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttg 333  Q
     |||||||||| |||   | |||||  |||| || |  |||||||  || |||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  2945 atttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtatccccattgagaaggaacattat-tgcaggcagagctgtttttcttgtcttg 2847  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2846 tagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 2802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10210 - 9912
Alignment:
Q  1 atacaatacaataaa-gactctagactttg-aatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatcagtttgacagagtttt 98  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||  | |||| ||||||||     
T  10210 atacaatgcaataaaagactctagacttaggaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgcttttgagaacaaatttggcagagtttg 10111  T
Q  99 ggcgcttttgaacttgt-atatttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    ||  ||||| ||||||| ||| |  |  | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10110 ggtactttt-aacttgtgataatgtttctactgatcttcaagtcttcacttccttatatagaggtgtgtagagagacgttgagatcttaagcacgtctaa 10012  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaag 296  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  | |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10011 agagtcgtt-gagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttagatgcagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaag 9913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 61524 - 61788
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||   || |||| |||||   |||||    
T  61524 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtcaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaaataccaa 61622  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttg-tcttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || || ||||| |||||||  |||||    
T  61623 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttt-tgtaggcagagctgtttatcttg 61721  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61722 tcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 61788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1254 - 990
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  1254 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 1157  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| | ||||| | |||    
T  1156 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttttctt 1058  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1057 gtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1447 - 1183
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  1447 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 1350  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| | ||||| | |||    
T  1349 atgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacat-ttctgcaggcagaactgtttttctt 1251  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1250 gtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 350 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4568 - 4405
Alignment:
Q  350 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||    
T  4568 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctcccttt 4469  T
Q  450 caattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttga 513  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  4468 cgattctttgttcttcttggataagactgaattgagattcatctactttgaatcttcagtttga 4405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 16349 - 16599
Alignment:
Q  2 tacaatacaataaagactctagacttt-gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatc-agtttgacagagttttg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  16349 tacaatgcaataaagactctagacttaagaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtactttttagaatcaaatttggcagagttttg 16448  T
Q  100 gcgcttttgaacttgtat--atttctctttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg-aaagagacgttgagataatcagcacgtctaa 196  Q
    | |||||| ||||||| |  || |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | |||||||| ||    
T  16449 gtgctttt-aacttgtgttgatatctctaccat-tcttcaagtcttcactcctttatatagtggtgagtagagagacgttgagatttttagcacgtcaaa 16546  T
Q  197 agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttggg 250  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  16547 agagtcg-ttgagttcctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttggg 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 350 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6278 - 6130
Alignment:
Q  350 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  6278 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctcccttt 6179  T
Q  450 caattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttt 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  6178 caattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt 6130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38403 - 38157
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtc-gtttgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | ||||||  |||||||||  |||||||  |||||    
T  38403 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtctttttgaaatc--ttgatcaatcacca 38306  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| || |||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  38305 atgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattttgatggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttctt 38207  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38206 gtcttgtagcatagac-aaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 38157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1991 - 1727
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||   || |||| |||||   | |||    
T  1991 atcttcaaatcttcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgagaaacctt-gatcaaatatcaa 1893  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-cttg 328  Q
    |  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| || |  ||||| ||||||| | ||||    
T  1892 tgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacattttttt-aggcagagctgtttttcttg 1794  T
Q  329 tcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1793 tcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtactttgtcaactct 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 11553 - 11816
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||    
T  11553 atctttaagtcttcactcctttgtatagaggtgtgaaagagttgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcacca 11650  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  || ||| ||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||| | |||    
T  11651 atgatcttttacctgatttggtagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggatca-attctgcaggcagagctgtttttctt 11749  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
     |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11750 atcttgtagcgtagacaaaa-cagagtagtggaggtagtggttttacactttgtactttgtcaactct 11816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 428 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2306
Alignment:
Q  428 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||   ||||||    
T  2424 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacggctactttgaaacttcagtttaaatttactgattaaa 2325  T
Q  528 tgtagcttctggtgatgat 546  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  2324 tgtaacttctagtgatgat 2306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Original strand, 7076 - 7324
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  || ||||  |||||    
T  7076 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttcatcaatcacca 7173  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-ctt 327  Q
    ||  |  ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||| | |||    
T  7174 atgatattttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaactt-ttctgcaggcagagctgtttttctt 7272  T
Q  328 gtcttgtagtgtggacaaaaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7273 gtcttgtagcgtagacaaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacactt 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 429 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19208 - 19122
Alignment:
Q  429 tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaat 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19208 tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 19122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 390
Target Start/End: Original strand, 16745 - 17007
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatca-gcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccac 226  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  | | ||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||  |||    
T  16745 ttatcttcaggttttcactcctttatatagaggtgtgaaagattcgttgaggtctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaacc--ttgatcaatcac 16842  T
Q  227 caatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgt-c 325  Q
    ||||  || ||||| ||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| || |||||||| ||||||| | |    
T  16843 caatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttatgcaggcagagctgtttttc 16941  T
Q  326 ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaa 390  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16942 ttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaa 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4215 - 3967
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||| | | ||||||| |||||  | |||||||  || ||    
T  4215 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacgtcaataaagtcgttgtgaaa--ccttgatcaatcagca 4118  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtctt 327  Q
    ||  |  ||||||||||||||  || ||| | ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||| | ||||| || ||||    
T  4117 atgatattttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaac-ttttctgcaggtagagctgtttttctt 4019  T
Q  328 gtcttgtagtgtggac-aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4018 gtcttgtagcgtagacgaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacactt 3967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6757 - 6577
Alignment:
Q  215 ttgatcatccaccaatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggca 314  Q
    |||||||  |||||||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| ||  |||||| |||| |||||||||||    
T  6757 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacat-ttctgcaggca 6659  T
Q  315 tagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 394  Q
     ||||||| | |||||||||||| || || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6658 gagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 6577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 466 - 546
Target Start/End: Original strand, 53339 - 53418
Alignment:
Q  466 ttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53339 ttagataaggt-gaaataagaaacagctactttggatcttcagtttgagtaaatggattaaatgtagcttctggtgatgat 53418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26289 - 26249
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26289 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 26249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 181
Target Start/End: Original strand, 20410 - 20462
Alignment:
Q  129 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20410 ttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagat 20462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Original strand, 10511 - 10629
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||  |||||    
T  10511 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcattgagatctttaagcacgtcaatagagtcgttgtgaaatc--ttgatcaatcacca 10608  T
Q  229 atagtcctttgcctgatttgg 249  Q
    ||  || ||||||||||||||    
T  10609 atgatcttttgcctgatttgg 10629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 373
Target Start/End: Original strand, 84191 - 84429
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||| | |  ||   ||||||||||||||  |||||||||  |||||||      
T  84191 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgtgaatatccagcgcattcaaaatagagtcgtttgaaa--ctttgatcaatcaccaatga 84288  T
Q  233 tcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtct 331  Q
    || |||||||||| |||   | ||||| ||||| || |  ||||||| || ||| ||  |||||| ||||  | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  84289 tcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccaatccaattgtgaaggaacatcgt-tgcaggcagagctgtttttcttgtct 84387  T
Q  332 tgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 373  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  84388 tgtagtagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgta 84429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 268572 - 268618
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268572 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 268618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 492 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20700 - 20646
Alignment:
Q  492 ctactttggatcttcagtttgaatatatgaattaaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20700 ctactttggatcttcagtttgaatacatggattaaatgtagcttctggtgatgat 20646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 176
Target Start/End: Original strand, 59349 - 59394
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59349 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 59394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 165093 - 165018
Alignment:
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  165093 ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 165018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 65718 - 65678
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65718 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 65678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 144763 - 144723
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144763 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 144723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1324 - 1119
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaa-agagacgttgagataatca-gcacgtctaaa-gagtcgtttgaaatcctttgatcatccacc 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||| ||| ||||||||   || |||| |||||   |||    
T  1324 atcttcaagtcttcactcctttttatagaggtgtgtagagagacgttgagatctttaagcacgtccaaaagagtcgttgagaaacctt-gatcaat-acc 1227  T
Q  228 aatagtcctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctgttgtctt 327  Q
    |||  || ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  1226 aatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacat-ttctgcagacagagctgttatctt 1128  T
Q  328 gtcttgtag 336  Q
    |||||||||    
T  1127 gtcttgtag 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2117 - 1869
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagat-aatcagcacgtctaaagagtcgtt-tgaaatcctttgatcatccaccaa 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||| || | ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||    
T  2117 tctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagtcgttgagatctttaagcacatcaatagagtcgttctgaaaac--ttgatcaatcaccaa 2020  T
Q  230 tagtcctttgcctgatttggg-cgtagtcctttgaagaat-tagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtct 326  Q
    |  || ||||||| |||||||  || ||||| ||||| ||  |  ||||||| |||||| ||  ||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  2019 tgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacat-ttctgcaggcagagctgtttttct 1921  T
Q  327 tgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1920 tgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacactt 1869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25737
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25809 tgcaggcagagctgcttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35117 - 35077
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35117 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 35077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34930 - 34876
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34930 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25973 - 25938
Alignment:
Q  143 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25973 tcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 25938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36501 - 36455
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36501 atcttcaagtcttcacttgtttatatagaggtgtgagagagacgttg 36455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 394
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9352
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 394  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9281 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2012 - 1771
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgagataatcagcacgtctaa---agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||  ||   ||| ||||||| || | |||||||   |||||||  ||    
T  2012 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga-atttccaacacgttcaaaatagaatcgtttg-aagcttttgatctatcaccaatgatc 1915  T
Q  235 ctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtcttg 333  Q
     |||||||||| |||   | |||||  |||| || |  ||||||| |||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  1914 ttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacat-tgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttg 1816  T
Q  334 tagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1815 tagcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacactt 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 9698 - 9744
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698 atctttaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 9911 - 9945
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9911 aaaaacagagtagtgcaggtagtggttgtacactt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32106 - 32060
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32106 atcttcaagtcttcactcctttaaatagaggtgtgaaagagacgttg 32060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31890 - 31851
Alignment:
Q  344 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890 aaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 31851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 29585 - 29631
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29585 atcttcaagtcttcacacctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 29631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 99331 - 99277
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  99331 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 99277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 99518 - 99478
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  99518 agtcttcactcctttatatatacgtgtgaaagagacgttga 99478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1198 - 1153
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1198 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 948
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  980 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 176
Target Start/End: Original strand, 2451 - 2496
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2451 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaaagacgtt 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3720 - 3672
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3720 atcttcaagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaagatacgttgag 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 546
Target Start/End: Original strand, 15129 - 15249
Alignment:
Q  425 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatt 524  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||   ||     
T  15129 caaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttct-cttaaacgaggttaaaatgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatatactgatc 15227  T
Q  525 aaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  15228 aactgtagcttctggtgatgat 15249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1833 - 1792
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 546
Target Start/End: Original strand, 69860 - 69979
Alignment:
Q  426 aaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatta 525  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || |||  |||||  || || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || |    
T  69860 aaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttct-ctcagacgaggttataacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttgaatatactgatca 69958  T
Q  526 aatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  69959 actgtagcttctggtgatgat 69979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4332 - 4285
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  4332 atcttcaagtcttcactcctttatacagaggtgtgagagatacgttga 4285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 272 - 312
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 165
Target Start/End: Original strand, 6131 - 6165
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6131 atcttcaagtcttcactcctttatatagagatgtg 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 5804 - 5844
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5804 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 5844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 5991 - 6043
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 376  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5991 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2306 - 2266
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2306 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 2266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 9766 - 9806
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9766 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 9806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 9954 - 10008
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9954 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 7348 - 7420
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7348 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6004 - 5964
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6004 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 5964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 1093
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1133 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 926 - 893
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  926 aaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 14445 - 14485
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 14485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 14615 - 14687
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 5426 - 5466
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5426 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 5633 - 5666
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5633 aaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 5666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22444 - 22404
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 22404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 378
Target Start/End: Original strand, 18828 - 19070
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttgag-ataatcagcacgtctaa--agagtcgtttgaaatcctttgatcatccaccaatagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   |||||| || ||  |||||||||||||    ||||||||  |||||||  |    
T  18828 aagtcttcactcctttatatataggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatagagtcgtttgaa--gatttgatcaatcaccaatgat 18925  T
Q  234 cctttgcctgatttgggcgtagtcctttgaagaattagcttcaaattcattcccatcttgaaggcacatattctgcaggcatagctg-ttgtcttgtctt 332  Q
    | ||||||||||  ||   | ||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||   ||||| ||||  | |||||||| ||||| || |||| ||||    
T  18926 cttttgcctgatacggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgcgaaggaacatcat-tgcaggcagagctgtttttcttttctt 19024  T
Q  333 gtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19025 gtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 19070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 9545 - 9599
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9545 tcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 9599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22275 - 22203
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22275 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacactt 22203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 8953 - 8993
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8953 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 9122 - 9194
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9122 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacactt 9194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 14914 - 14954
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14914 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5637 - 5597
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 5597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 1487 - 1527
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1487 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 1657 - 1729
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1657 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 7723 - 7763
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7723 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 7763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 59813 - 59853
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59813 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 59853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 211198 - 211238
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211198 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 211238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 220035 - 220075
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  220035 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagatgttg 220075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 211365 - 211437
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  211365 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatactt 211437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 244388 - 244356
Alignment:
Q  346 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244388 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 244356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 244595 - 244555
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  244595 aagtcttcacttctttatatagaggtttgaaagagacgttg 244555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 90369 - 90329
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90369 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 90329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 90199 - 90127
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90199 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacactt 90127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 1230 - 1281
Alignment:
Q  126 ttcttatcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1230 ttctaatcttcaagtcttcattcctttatatagaggaattaaagagacgttg 1281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 176
Target Start/End: Original strand, 495 - 537
Alignment:
Q  134 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  495 ttcaagtcttcactcctttatatagaggtatgtgagagacgtt 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 19863 - 19910
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19863 atcttcaagtcttcacttctttagatagaggtgtgaaagagacgttga 19910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15769 - 15694
Alignment:
Q  304 ttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15769 ttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacactt 15694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Original strand, 37199 - 37238
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37199 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 37238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Original strand, 135259 - 135298
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  135259 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgtt 135298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 37387 - 37441
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37387 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 37441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 135447 - 135501
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  135447 tcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 135501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 158906 - 158946
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  158906 aagtcttcactcctttatatagaggtatgaaagagatgttg 158946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 60601 - 60640
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60601 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 60640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 60805 - 60842
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60805 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 60842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 860 - 806
Alignment:
Q  29 gaatttctaagatgtatcaaatcagtgcagaaattcagtgtgctttgtagaatca 83  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  860 gaatttctaagatatatcaaatcagtgcagaaattcaaagtgctttttagaatca 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 781 - 727
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  781 tcttatcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 968 - 929
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  968 agtcttcactcctttatattgaggtgtgaaagagacgttg 929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1864 - 1827
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1864 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6426 - 6388
Alignment:
Q  356 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6426 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 417 - 379
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3624 - 3582
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3624 atcttcaagtcttcattcctttatatagaggtatgaaagagac 3582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 546
Target Start/End: Original strand, 8 - 128
Alignment:
Q  425 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatgaatt 524  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |  || || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||     
T  8 caaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttct-cttagacgaggatataacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttgaatatactgatc 106  T
Q  525 aaatgtagcttctggtgatgat 546  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  107 aactgtagcttctggtgatgat 128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 2067
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 tcttcatgtcttcactcatttatatagaggtgtgaaagagacgttg 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 7617 - 7662
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7617 tctttaagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagagacgttg 7662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Original strand, 22050 - 22095
Alignment:
Q  349 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22050 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 22095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27538 - 27501
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27538 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27743 - 27703
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27743 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 27703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 3271 - 3343
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3271 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactt 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3143
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3103 agtcttcacttctttaaatagaggtgtgaaagagacgttga 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 13368 - 13404
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13368 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 13404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 9923 - 9995
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtc-ttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9923 tgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 9995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Original strand, 9752 - 9787
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 9787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17837
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17909 tgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 17837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18078 - 18038
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078 agtcttcacttctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 18038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 1457 - 1497
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1457 aagtcttcactcctttatatagatgtgtgaaagagacgttg 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 1662 - 1699
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1662 gacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 1699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21115 - 21043
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21115 tgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 21043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21285 - 21245
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285 aagttttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 21245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2287 - 2246
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2287 aagtcttcacacctttatatagagatgtgaaagagacgttga 2246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 87913 - 87873
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  87913 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaggcgttga 87873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 87709 - 87672
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  87709 gacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 87672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 74378 - 74418
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  74378 aagtcttcactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 74418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Original strand, 3021 - 3056
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3021 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 177
Target Start/End: Original strand, 40441 - 40476
Alignment:
Q  142 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40441 ttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 40476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 40639 - 40676
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40639 gacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacactt 40676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 373
Target Start/End: Original strand, 2951 - 3016
Alignment:
Q  307 tgcaggcatagctgttgtcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 373  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2951 tgcaggcagagctgtttt-ttgtcttgtagcagggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 2781 - 2820
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2781 agtcttcactcctttgtatagaggtgtgaaagagatgttg 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 5807 - 5841
Alignment:
Q  139 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5807 gtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10506 - 10474
Alignment:
Q  351 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10506 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15865 - 15811
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15865 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25525 - 25471
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25525 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 25471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16052 - 16012
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16052 aagtcttcactcctttatatagcggtgt-aaagagacgttga 16012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25712 - 25672
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25712 aagtcttcactcctttatatagcggtgt-aaagagacgttga 25672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 374
Target Start/End: Original strand, 22661 - 22711
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 374  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22661 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 22711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 174
Target Start/End: Original strand, 22473 - 22509
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacg 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22473 agtcttcattcctttatatagaggtgtgaaagagacg 22509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16444 - 16410
Alignment:
Q  144 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444 cactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 16410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36901 - 36847
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36901 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 36847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 42104 - 42158
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42104 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 42158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37048 - 37012
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37048 aagtcttcactcctttatatagagatatgaaagagac 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41993
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41957 aagtcttcactcctttatatagagatatgaaagagac 41993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2800 - 2763
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2800 gacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacactt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 144698 - 144743
Alignment:
Q  132 tcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  144698 tcttcaggtcttcactcctttttatagaggtgcgaaagagacgttg 144743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Original strand, 144911 - 144949
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  144911 aaaacagagtagtggaggtagtggatgtacaattgtact 144949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 11996 - 12036
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11996 agtcctcactcctttatatagaggtgtgagagagacgttga 12036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7054 - 7014
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7054 agtcttcactcctttatatataggtgtgagagagacgttga 7014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6849 - 6812
Alignment:
Q  341 gacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6849 gacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacactt 6812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44233 - 44193
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44233 aagtcttgactcctttatataaaggtgtgaaagagacgttg 44193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 103369 - 103408
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  103369 aagtcttcactcctt-atatagaggtgtgaaagagacgttg 103408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Original strand, 4061 - 4100
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaaga 170  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4061 atctttaagtattcactcctttatatagaggtgtgaaaga 4100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10421 - 10386
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10421 aagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagaga 10386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15085 - 15050
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagaga 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15085 aagtcttcactcctttatacagaggtgtgaaagaga 15050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10234 - 10180
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10234 tcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14898 - 14844
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14898 tcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacactt 14844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 31528 - 31575
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttga 178  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31528 atctttaagtcttcactcatttatatagaggtgtgagagatacgttga 31575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5073 - 5019
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5073 tcttgtcttgtagcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacactt 5019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 5178 - 5224
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  5178 atcttcaagtcttcattcctttatatagagatatgaaagaaacgttg 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 177
Target Start/End: Original strand, 7878 - 7924
Alignment:
Q  131 atcttcaagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7878 atcttcaagtctttattcccttatatagaggtatgaaagagacgttg 7924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 78492 - 78438
Alignment:
Q  324 tcttgtcttgtagtgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||||||||||||    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  78492 tcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacactt 78438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 78680 - 78650
Alignment:
Q  138 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78680 agtcttcactcctttatatagaggtgtgaaa 78650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Original strand, 1323 - 1356
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1323 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 1356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 1115 - 1155
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1115 aagttttcacccctttatatagagctgtgaaagagacgttg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 55
Alignment:
Q  345 aaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  88 aaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 55  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 256
Alignment:
Q  137 aagtcttcactcctttatatagaggtgtgaaagagacgttg 177  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  296 aagttttcacccctttatatagagctgtgaaagagacgttg 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 378
Target Start/End: Original strand, 7710 - 7742
Alignment:
Q  346 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7710 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactt 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University